2CGKA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in an open uncomplexed conformation.
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
478
structure length
478
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords L-RHAMNULOSE KINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
total genus 163
structure length 478
sequence length 478
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgkA02
4WQ5C 3MN5A 3O1BA 4L3QA 5BPMA 3WXJA 1ATRA 2CGKA 2H3GX 1SQKA 1RGIA 3MCPA 2E2OA 4BRCA 3MDQA 1XC3A 2E2PA 2FSNA 5AQUA 4BG9A 1LOTB 5AQSA 2YI1A 4O8KA 4H5VA 3C7NA 4EHUA 3HM8A 5BREA 1KXPA 2YHYA 4WQ5A 4IWVA 3D2FB 3RSEA 1BA1A 1KAYA 2P9LA 4EIAA 4IZ9A 4BRQA 4CZKA 2OANA 1GLDG 2I7NA 3M6GA 5ADXA 4BGBA 4BREA 4BGAA 1HX1A 4JNEA 5AQKA 3FZFA 2BUPA 2HMPA 4NB4A 2Q1NA 5AZJB 4EHTA 5CE3A 3QFPA 5EVZA 3H3NO 2YJFA 3LM9A 3S41A 4BRPA 2VYPA 3AAPA 3EN9A 3ZEUB 2ITMA 5LJVA 3KHYA 5FPNA 3GDQA 1P8ZA 3O08A 1MWKA 2FSKA 2PAVA 4FOIA 2D0PA 3LM2A 3TU5A 4CZIA 3EKSA 5EOYA 2ZGYA 4B1WB 4BVOA 1Z05A 3UKRA 2W40A 4CZMA 4IJAA 3QB0A 4QS9A 3FZHA 1BDGA 1BU6O 1TUUA 2P9UA 1HKBA 3FLCO 4H5NA 2FXUA 3GL1A 4CBUA 2P9SB 4QS7A 1NGGA 2FF6A 1OKJA 3ATUA 3R9PA 3D2FA 4B1YB 1RDWX 3DAWA 5AQOA 1NGCA 2HF4A 2P9IA 3ULEB 4CZHA 2P9KB 2CGJA 4NO7A 4BC5A 3U8XA 5JICA 2E2NA 1NGFA 2E88A 3ZX3A 3CJBA 2QXLA 4B9QA 2YJEA 3HZ6A 5AQFA 2ASMA 3A0IX 3FFKB 3O80A 2F9WA 4JN4A 5AQPA 2Q31A 4FWPA 5AQZA 2V7ZA 5BRFA 1HKCA 1G99A 1C0GA 3IMXA 4BRAA 4MO5A 2A5XA 3WT0A 4I6MA 3GBTA 2WUSA 3WXLA 3H46O 4DCHA 4H5WA 4RTFD 5FPEA 3C7NB 3H1QA 3QMLA 1MDUB 3M1FA 3LDQA 4BR2A 4CJ7A 2QWNA 4DQ8A 1GLFO 2F9TA 3RSEB 4M7YA 3MN7A 1C0FA 1T6DA 2NLXA 2P9LB 4H0PA 4AM6A 3B8AX 4FOEA 1HPMA 4BG8A 5FPMA 1JCGA 1NGJA 3JXUA 1GLJO 3L0QA 4FWLA 1HKGA 4HTLA 2CH6A 4FWRA 5BR9A 4IXCA 3SK3A 4CZEA 4FWSA 4ISEA 5ADXH 2ZWHA 2EWSA 1QQNA 4FL9A 3H45C 4XH5A 3O1WA 1KAZA 5AZIA 3HSCA 4A2AA 2UYTA 3ZX2A 2AA4A 4ISFA 3H3OB 3GE1A 1NGAA 1ZBSA 3AAQA 3GG4A 4WQ4C 3TPQA 3VETA 4FPAA 3UKRB 4JD2A 5LJWA 5EXWA 3SJHA 2Q2RA 1HUXA 4XEIA 1X9JA 2P9UB 4Y0WA 3VGKA 1BG3A 4H0TB 3VERA 1ATNA 4O5FA 2NRHA 4WYBA 3VF2A 2QWOA 2QW9A 2A41A 4PKHA 2IVPA 3ENHA 4WQ4A 2P9IB 4CD3A 5AFUH 2FLOA 2PBDA 3WXKA 3FGUA 5KPRA 3CERA 4MLEA 3VEOA 4BVPA 4FPBA 2GWKA 2GEMA 3U9ZA 4CZJA 4BR0A 3D2EA 5JLHA 5ELZA 3WEEA 1NGBA 5BPLA 3BP8A 3QBWA 4PKGA 4BR9A 3A8YA 3FZMA 1Y64A 2A42A 1WUAA 2D1KA 3O6WA 4I6MB 3VEYA 4JHDB 1NLVA 2E20A 2E8AA 4A62A 1D4XA 1MA9B 1E4FT 2QWPA 3G25A 4QS8A 1J6ZA 3WUHA 3ZETA 2V52B 3CQXA 3A5LC 3CIPA 1GLAG 4MLHA 3VENA 1NBWA 1QQOA 4H0VB 4KBOA 4H5TA 4M63C 2I7PA 3F9MA 3JS6A 2IIRA 5F1XA 1TYQA 4JAXA 5TKYA 3MMVA 4HWIA 3FZLA 2P9PB 4K43A 2IVOA 3J8AA 3LDLA 5F0XA 3VOVA 1BOTO 4GNIA 2IVNA 3WQTA 2CH5A 4PL7A 3MK6A 5BRHA 3CI5A 3FZKA 1IG8A 1T44A 5BN9A 1GLBG 5AZIB 4AM7A 3LDOA 5JMVA 3SMPA 1NGIA 2QWQA 4K42A 4B1VA 4PL8A 2W41A 1QZ6A 1U2VB 3LDNA 5AQNA 5I9EB 4BR4A 4JD2B 2ZGZA 4FWOA 3CJ1A 1XUPO 3DJCA 4IJNA 5AQRA 4EFHA 4JHDA 1NGHA 5AQQA 5AQMA 4FWMA 2HOEA 3EL2A 2FSJA 3BEXA 4BR7A 3MN9A 1V4TA 3DXMA 4FO0A 2QWLA 4J8FA 5KQDA 1E4GT 1NMDA 2D0OA 3OHRA 4BQZA 4H0XB 5AQTA 1ZXOA 1SZ2A 3I8BA 5BN8A 3SMSA 2J4RA 4A2BA 3UE5A 4BRLA 5B8HA 3D2EB 2P9PA 1U6ZA 4C23A 3WEEB 3CJCA 3QFUA 3VESA 2NZTA 1JCEA 3UKUA 2E2QA 1RFQA 2A3ZA 3CQYA 5E26A 3BF1A 5AQJA 2ASOA 4BRMA 3VEWA 2ZF5O 4BRKA 1GLCG 4GY2B 2E1YA 2QWRA 1KAXA 3U9DA 1H1VA 4Z94A 3ZETB 3C0BA 4BRDA 3H1VX 1U2VA 3BUZB 4FSVA 2P9NA 4B1UB 5KQ8A 4BRGA 4CZGA 3CJAA 1SAZA 3WXIA 1K8KB 5FPDA 1TYQB 1EQYA 1QZ5A 1HLUA 3ID8A 4CBXA 4K25A 1JCFA 2D4WA 1X3MA 2Q0UA 5AR0A 5JLFA 3VEVA 4LC9B 1XQSC 4B1ZA 1DEJA 4XH4A 4YDUC 1ZC6A 4CZFA 1IJJA 3DXKA 1Z6RA 2GUPA 3L6QA 1WOQA 3LL3A 3O4WA 2GTDA 3QBXA 4FWKA 3CJ7A 4BC2A 4FWNA 3W0LA 4H0YB 2VCPA 3SLCA 5EX5A 1QQMA 2Q97A 1GLLO 4YDUA 1V4SA 4F9OA 3A5NC 4CZLA 5BRDA 2DPNA 3I33A 2CGLA 3DXMB 3CHWA 3HBTA 5AQVA 3KZBA 1NM1A 2HF3A 2GWJA 5BPNA 3VPZA 1NGEA 2QWMA 1K8KA 1DKGD 3H6EA 4EAHD 1NWKA 1YAGA 3M3ZA 5AQLA 3VF4A 1BWFO 5KPZA 3WQUA 2E1ZA 4DB3A 3UKUB 3A5MC 5F2RA 3ENOA 4RCHA 2ASPA 1DGKN 3QDKA 3A5OC 2A6AA 3QICA 4FWQA 3VF6A 4BRHA 2YHXA 2Q36A 5AQGA 4BROA 3L4IA 5AQIA 4RWTA 4IO8A 3O8MA 4BC3A 4DHYA 3FE1A 2V7YA 2YHWA 2GELA 4PKIA 1BUPA 2P9NB 4BRNA 3BF3A 1ATSA 3VEXA 1LCUA 3MN6A 4BRIA 3UB5A 5AFUA 5KPTA 3EO3A 1QHAA 1BA0A 1ESVA 1Q18A 3HI0A 3DWLA 3R6MA 3D7EO 4BC4A 5EY4A 5LY3A 4B1XB 1HJOA 4BR5A 5AQYA 2FF3B 2A40A 3FR0A 5AQHA 1BO5O 2Q0RA 2V51B 3O5BA 3P4IA 3IDHA 3VEZA 1GLEG 1YVNA 5AZJA 3DXKB 2VWBA 4E1JA 3EKUA 4K41A 4MO4A 2AP1A 3ZEUA 1T6CA 4CD1A 3CJ9A 3HTVA 4M7XA 1R59O 4ISGA 4A61A 1TUYA 3KVGA 1S22A 2KHOA 5E84A 3ZX0A 3ATVA 1S3XA 2YCHA 1YUWA 4H03B 4BQLA 5AQXA 1MWMA 3VGLA 1CZAN 3U4LA 3IUCA 3AY9A 3VGMA 1YXQA 2P9SA 3CETA 3GOIA 3R8EA 4CBWA 3LDPA 5AQWA 4BRFA 3AARA 2BTFA 3EZWA 4XH1A 2QM1A 3ULEA 4H0OA 2P9KA 3IFRA 1X3NA 3W3DA 1NGDA 4H5RA 4CI6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EU7A 1NK6A 1N34K 4WQ5C 4C8MA 2ETJA 1VQ9N 4BDYA 4A5BA 4FJJA 1R0AA 3ZSQA 3BZKA 3DLLL 3VQDA 3P5JA 1LOTB 5AQSA 2YHYA 4WQ5A 5FDLA 5C25A 2AJQA 4JV5K 1A5VA 3RRGA 1T8EA 4EIAA 3AA2A 4CZKA 4BREA 4QAGA 1NNEA 2HMPA 4NB4A 2Q1NA 4EHTA 3KLFA 4DU4A 4M41A 4GV6A 4DWIA 2ITMA 4CIFA 2YNFA 3E1YA 1P8ZA 1MWKA 4YOUA 2KLAA 3CMAN 1S1UA 2XY5A 3NF9A 3D6RA 1Q82O 3OYJA 2JLEA 1WSGA 3MX5A 4B1WB 3KKSA 4NCGA 3LAMA 4YNQA 2W40A 1YJWN 4OKJA 3VQ9A 3FZHA 2OZSA 3NE6A 1HRHA 1RBVA 1TUUA 2P9UA 4CJKA 2HHWA 2P9SB 3QLHA 3RMDA 1OVYA 2HHQA 5H1SQ 3SJJA 4B1YB 3DAWA 5AQOA 4CZHA 3QETA 4NO7A 3I56N 5JICA 4GV9A 2YKNA 3CJBA 1U4BA 4DV1K 3THYA 3A0IX 3S3MA 2F9WA 1WN7A 3N4QA 3TAEA 2OPRA 1NOZA 1NKBA 2HHXA 4CJEA 2A5XA 3ZSXA 1Q86O 3GBTA 1JJ2M 1IBLK 3H46O 5FPEA 3KK1A 1EP4A 2Z1IA 5C10A 3EE8A 4B3OA 1JLFA 4ZTFA 3C95A 2F9TA 3ZSZA 4YOYA 3ISNC 4M7YA 3UIQA 1C0FA 4CGIA 2EX3A 3P31A 3OYDA 4H0PA 3RMBA 4CW7B 2A1SA 1WBBA 4DLGA 4FJGA 3OW2M 1NGJA 1YJNN 4FWLA 4IFEA 5LL6Z 4FWRA 1NKCA 3SK3A 4FWSA 4CHNA 3DLGA 2EWSA 1QQNA 3QNOA 4FL9A 1BIZA 4G9ZA 1VSJA 1I39A 1KAZA 5AZIA 4LH5A 1XNQK 1S9EA 3HSCA 4A2AA 3ZX2A 4ISFA 4OPJA 1C1CA 4B08A 1ZBSA 3GG4A 4GKKK 1CLQA 2BGGA 4YOXA 2HNYA 3UKRB 5GIOA 4LF9K 1KTQA 3PSFA 4XEIA 1UAXA 1X9JA 4FJIA 1HJRA 4DFKA 4H0TB 4PWDA 4RW8A 4Z4HA 4NLCA 3VF2A 4FJMA 2IVPA 3O9TA 5IT9O 1FK9A 3FGUA 4WFNL 2I5JA 4FLYA 3RR8A 3CERA 3JSMA 2X78A 3U9ZA 1EX4A 5HRRA 4BR0A 2PY5A 5JLHA 4FJXA 4FK0A 5ELZA 3WEEA 2ZJPL 4FLWA 2W6LA 3BP8A 4E7IA 4PKGA 4CFBA 4DV0K 1REVA 1C0UA 3SBTA 1WUAA 4IDHA 1XHXA 2D1KA 4I6MB 4BE0A 1MA9B 3ZETA 1C6VA 1LAWA 1HMVA 2DFHA 3S3NA 3VENA 3Q7BA 3SCXA 3K9JA 3QEVA 1TYQA 3PSIA 3MMVA 2QTDA 3FZLA 2P9PB 1SL0A 3D45A 4O8UA 1NK8A 1LV5A 3SAHA 4GW6A 3CCQN 1YTAA 3TR8A 3EZ5A 1KVCA 3MK6A 4DV2K 3PX6A 3EYZA 5HRNA 3ALYA 3O3HA 3K59A 4AM7A 4DTXA 3LALA 3LDOA 3I0SA 1XWLA 4LY7A 2DY4A 1SKWA 4DSIA 2QWQA 1EXQA 4PL8A 2KQ2A 1U2VB 1D5AA 4JD2B 1XUPO 4EFHA 5AQQA 3IRXA 4O4GA 4BE1A 3EL2A 3HPOA 4BR7A 5KTQA 2FBYA 2QWLA 1NMDA 2D0OA 3OYFA 4E1MA 3OHRA 4CGFA 3OYBA 1NK7A 3AVIA 2OTJN 3HJFA 3ZLJA 4A2BA 3M8SA 5B8HA 2NRWA 3VQEA 3VESA 3BY5A 2DFFA 3KD1E 1RFQA 4DR5K 4ID1A 3CQYA 4NCAA 4BRMA 3CCSN 4DS5A 3LP3A 1VQON 1QE1A 3SUPA 4J2AA 4FLVA 3KWIA 4DQRA 4DF8A 4Q5VA 3CXCM 4DUYK 1IH7A 2E1YA 4JK9A 1OVQA 3NF7A 3IS9A 3OYEA 4JKEA 1O1WA 3NH2A 1VSEA 3VMFB 4AHSA 4HHTA 5KQ8A 4BRGA 4M42A 1S1VA 3LP0A 1J5EK 1EQYA 3E01A 3ID8A 4CBXA 4KHYA 1JCFA 1S5JA 1X3MA 4Y1DA 5AR0A 5JLFA 3LPTA 2EHGA 2HHUA 3H08A 4B1ZA 5M1OA 1TK5A 1ZC6A 4KHUA 2F8SA 1IJJA 4YORA 5M1KA 2R7YA 4CHQA 2GUPA 1ZBFA 1QHTA 1T3VA 3MXIA 3O4WA 4I9QA 1FKPA 1KFSA 4BC2A 3HPGA 4JK8A 2VCPA 3VA0A 4Z4IA 4IOCL 3CYMA 3CPWM 1CXQA 2Q97A 1XI1A 4JI3K 3TWHA 4FJ8A 3DI6A 1WSJA 4O55A 3CHWA 4OVLA 2QKKA 4CJQA 3C6HA 2QWMA 1BCOA 3H6EA 1YAGA 5AQLA 4DS4A 3KD5E 3O9SA 1BWFO 1F21A 2D0AA 3CFRA 2WC9A 4JRQA 4K8XA 3J80O 4ILGB 5K14A 3UKUB 4FM1A 2KW4A 3AVFA 3VA3A 2A6AA 1U45A 2YHXA 4O5BA 5AQGA 4BY9C 1VSMA 2GV9A 4RWTA 1KLNA 3P83D 4BC3A 4FW2A 4DV7K 3ZCMA 4DR7K 4N47A 2G8WA 2ZQBA 2GELA 1TKDA 2G8FA 1BUPA 2X6NA 1ATSA 2XY8A 3UB5A 1RT2A 2NUBA 2QXFA 2HBKA 3HI0A 3DWLA 2D0CA 2RE2A 5LY3A 2FF3B 2YHBA 3CCUN 5HP1A 3M5RA 1JLAA 3IG1A 2XY7A 4YFUA 2KZMA 1SKRA 3NGYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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