2ASPA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide c
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
370
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 128
structure length 361
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aspA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aspA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2aspA03
4H0VB 4CZIA 3I33A 2ITMA 4BC2A 3CQXA 5AQJA 5F0XA 4AM7A 3CETA 3H3NO 2A40A 5AQTA 3H46O 3VF2A 2A41A 2ZF5O 4CJ7A 5AQYA 2PBDA 3EL2A 3RSEA 4A62A 3FZHA 4B1VA 1X9JA 3VETA 4F9OA 3MDQA 1BA0A 3A5NC 5AQUA 5BN9A 1XUPO 3VGKA 5AZJA 2ZGYA 2ZWHA 4BQLA 3D7EO 2YHXA 5AQLA 2KHOA 3D2FA 3A8YA 4K42A 2IIRA 3ZX2A 1BUPA 3U9ZA 2W40A 2E2PA 3DXKA 3CJBA 5AQPA 1BWFO 3HBTA 3O1BA 4H0YB 4JAXA 5BRHA 4BR5A 4MO4A 3CHWA 3O6WA 3FR0A 3BEXA 4I6MA 4CZFA 4H0XB 3ATUA 4BRCA 2Q2RA 3CJCA 3SJHA 3UB5A 4CZGA 3ULEA 3VESA 4BRQA 3GOIA 2P9NB 4O8KA 4IJAA 1ZC6A 4RCHA 4BR4A 2FSNA 3KZBA 1H1VA 4BR0A 2A5XA 5AFUH 3IDHA 2I7NA 4K43A 3SK3A 3MN5A 4BRHA 3UKUA 2FF3B 4M7YA 2FLOA 2Q97A 1R59O 3QBWA 1HJOA 3AARA 3LDQA 3DAWA 2YI1A 2E2NA 4BROA 3AAPA 3CIPA 3MN6A 4WQ5A 2E8AA 3A5MC 1YUWA 1BO5O 1WUAA 4IZ9A 3VEVA 4FWOA 3G25A 1KAXA 2CGJA 3FZFA 1BOTO 3L0QA 3LM9A 1GLAG 3U9DA 1NGAA 5ADXH 3ID8A 1Z05A 3WT0A 5TKYA 3WXJA 4L3QA 5KPZA 3ZX3A 4BRNA 5EX5A 1G99A 2BUPA 5BN8A 2Q1NA 4H03B 3WXIA 4EAHD 3A5LC 4A2AA 2FSKA 4H0TB 1T6CA 5AQGA 3I8BA 1NBWA 4BG9A 4FWPA 5EOYA 4AM6A 2QW9A 1NGHA 3HM8A 4PL8A 4JD2B 2HOEA 4BC5A 5BR9A 3MK6A 5EXWA 1KXPA 3O1WA 4FWNA 2P9NA 1MWMA 1ATSA 3HTVA 3VF6A 4FWLA 2HMPA 3ATVA 3H1QA 2P9UB 3EZWA 1DGKN 1IG8A 1BU6O 3U8XA 4IWVA 4BRDA 1NMDA 2QM1A 5AQRA 2P9SB 4O5FA 4IO8A 5LJWA 1QZ5A 3L4IA 1QQMA 1U2VB 4XEIA 3CI5A 1X3NA 3FE1A 4IXCA 4B1ZA 5CE3A 2Q36A 3FGUA 4BRGA 1HKCA 1XQSC 3CQYA 2P9KB 1K8KB 2YJEA 2D0PA 1NM1A 3R6MA 4BR9A 4MLEA 4YDUC 2IVPA 3W0LA 5AFUA 3S41A 4DHYA 1ZBSA 1EQYA 2IVNA 1SAZA 4NO7A 5BRDA 3FZLA 1U6ZA 4CZKA 1HKBA 2GWJA 2Q0RA 1HX1A 5JLHA 2W41A 4CZJA 4EHTA 2EWSA 2HF3A 4CZEA 2IVOA 5F1XA 2P9LB 3UE5A 4RTFD 3TU5A 3U4LA 4K25A 4IJNA 1GLEG 1HLUA 3O80A 1DKGD 3WXLA 4QS7A 1NGJA 2A3ZA 2P9UA 4FWQA 4H5VA 4HTLA 1Q18A 2A42A 5AQFA 4XH1A 4CBXA 1C0FA 3DXMB 5BPNA 2UYTA 1U2VA 3D2EB 3HSCA 1NWKA 5E26A 4EHUA 2DPNA 4ISFA 1SQKA 1RDWX 3TPQA 5BPMA 1S3XA 2F9TA 3VPZA 4JHDB 1MA9B 1YAGA 1K8KA 4BREA 1GLCG 3O8MA 3UKRB 1QHAA 3O4WA 3OHRA 1KAYA 5AR0A 4FOIA 3SMSA 5AQNA 4A61A 3QFUA 4E1JA 3M6GA 1YXQA 4H5RA 1NGDA 3QBXA 5KQ8A 3H45C 1V4TA 3DJCA 3AAQA 5AQHA 5AQSA 4FL9A 5AQKA 1ATRA 1CZAN 2QWPA 3VF4A 4BG8A 5JLFA 4YDUA 1GLDG 1QQOA 4BR7A 2P9LA 2E20A 3GG4A 3VERA 3WQUA 1V4SA 1Y64A 3MN9A 2D0OA 5KQDA 3ZETB 4B1YB 2J4RA 4BRKA 4WQ4C 4FSVA 3QICA 2ASMA 4PKHA 3IFRA 3QB0A 3H3OB 4CD3A 1E4GT 5BRFA 5EY4A 3H6EA 4QS9A 4CBWA 4FPAA 4WYBA 3CJ1A 5AQWA 1RGIA 1RFQA 4EFHA 3A5OC 2FSJA 4BRPA 2HF4A 3LL3A 2NRHA 2CH6A 3FLCO 2YJFA 2D1KA 4BRMA 4PL7A 3MMVA 2OANA 3CJ7A 3KHYA 3SMPA 3R8EA 3C0BA 3JXUA 1LOTB 2QWRA 4LC9B 5AZJB 3SLCA 4BQZA 3HZ6A 1NGFA 3WUHA 3BF3A 3UKRA 2PAVA 4H5WA 3EO3A 1HPMA 2I7PA 3D2FB 5FPEA 1YVNA 2H3GX 1C0GA 5LJVA 4Y0WA 2P9PB 3M1FA 3MCPA 2YHWA 4PKIA 3C7NB 4DCHA 1KAZA 3L6QA 1ESVA 4GY2B 1LCUA 3KVGA 1GLJO 3VGLA 2GWKA 4FWSA 2VCPA 2AP1A 2V51B 1DEJA 3O08A 3ULEB 1X3MA 2YHYA 4K41A 2V7ZA 3WEEB 4FWRA 4BRAA 2QWLA 2FXUA 2GTDA 4Z94A 4RWTA 2F9WA 4FWMA 3UKUB 4JN4A 3VGMA 3ENHA 1HUXA 5AQQA 3W3DA 2VWBA 4PKGA 4GNIA 3M3ZA 4JD2A 2E2QA 4A2BA 4B1UB 3FFKB 4B9QA 2D4WA 5AZIB 3GL1A 4WQ4A 5FPNA 3AY9A 4H0OA 4FO0A 4FWKA 3FZMA 5ADXA 3VEXA 2P9SA 5JMVA 5FPDA 4H0PA 2E1ZA 5BREA 2YCHA 2NZTA 4JNEA 3VOVA 4DB3A 2V7YA 4XH4A 5I9EB 2NLXA 4BC4A 1XC3A 2P9PA 3H1VX 3VEOA 4FOEA 4XH5A 4BRLA 3C7NA 3ZEUB 4BRFA 5BPLA 2P9KA 1S22A 1E4FT 3JS6A 2QWNA 3GDQA 2P9IB 4J8FA 3ZX0A 1JCGA 4CZMA 2GUPA 3VENA 3CERA 4BGBA 1TUYA 4DQ8A 5JICA 1GLLO 5AQVA 3CJAA 3LDNA 3VEYA 2QXLA 4B1WB 3IMXA 3F9MA 4H5NA 1QQNA 2E2OA 4ISEA 3WEEA 5FPMA 3B8AX 2QWOA 3O5BA 2E1YA 3ENOA 2FF6A 1BDGA 1OKJA 3R9PA 1Z6RA 4HWIA 1D4XA 2AA4A 3GE1A 2V52B 3IUCA 1TYQB 1BA1A 2QWQA 5AQIA 1TUUA 1T6DA 3GBTA 1NGGA 1WOQA 3FZKA 4NB4A 2GEMA 1BG3A 3VEWA 1ZXOA 5AQOA 2E88A 5F2RA 5AZIA 5AQMA 2WUSA 5KPRA 1JCEA 1MWKA 3P4IA 2CGLA 5LY3A 1NGEA 2Q0UA 4B1XB 4CZHA 1NGCA 1NGIA 4BR2A 4BC3A 4BVOA 2VYPA 4C23A 2ZGZA 3HI0A 3LDOA 3DXMA 2CH5A 3EKUA 1HKGA 3D2EA 1GLBG 3LM2A 4H5TA 5EVZA 3MN7A 5AQZA 4BVPA 3BF1A 5E84A 2A6AA 3QDKA 3RSEB 4MO5A 1QZ6A 1SZ2A 4QS8A 4FPBA 4JHDA 1GLFO 3ZEUA 3WXKA 2P9IA 5ELZA 2Q31A 1J6ZA 3LDPA 1ATNA 1MDUB 2BTFA 1NLVA 4CD1A 3CJ9A 2QWMA 2ASPA 1IJJA 3LDLA 1P8ZA 3DXKB 3EKSA 3WQTA 1T44A 2CGKA 4MLHA 1JCFA 4BGAA 4ISGA 4CBUA 4M7XA 4M63C 3QFPA 4I6MB 4CZLA 1TYQA 2ASOA 3EN9A 4KBOA 5B8HA 4EIAA 5KPTA 3QMLA 3ZETA 3BP8A 5AQXA 3A0IX 4BRIA 4WQ5C 3J8AA 3DWLA 1NGBA 3BUZB 4CI6A 3VEZA 2GELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3I33A 1S6QA 1EO1A 4BC2A 4HUFA 1NK9A 4LY7A 5F0XA 2KKZA 2A40A 1JLEA 3H46O 4HTUA 3UIQA 1IH7A 2HVIA 2W6KA 3OYIA 3TARA 2PBDA 3EL2A 1ZBIA 3OYFA 1YIJN 1Q9XA 2O8EB 4A62A 2OTJN 1WSGA 4F9OA 4ELUA 3LWLA 3A5NC 5AQUA 5BN9A 4YFUA 5AZJA 3C65A 2ZWHA 4JK7A 5HLFA 1HYZA 2BGGA 3D2FA 4M3RA 2W40A 4OPKA 3J81O 3LP0A 4PA1A 4W5QA 1M90O 1TL3A 5AQPA 1BWFO 3NGYA 4H0YB 3I56N 1IKXA 4BR5A 4MO4A 1FXXA 3BEXA 3CQ8A 4H0XB 1C1AA 4XIUA 3EE8A 3O9TA 4DTPA 3ULEA 3VESA 1YITN 3GOIA 4O8KA 4RCHA 1H1VA 5AFUH 3IDHA 2O8FA 1L3UA 3E01A 3MN5A 4FJIA 3KKRA 2NRXA 1R59O 3QBWA 3DAWA 1KD1O 2F96A 3AAPA 3NAEA 1R0AA 3MN6A 1YT3A 1S1VA 3EYZA 2E8AA 4V19S 1JXEA 2GBZA 1BO5O 3R1XA 4FWOA 3G25A 1Z26A 3L0QA 2OPSA 3LM9A 3KLHA 1NNEA 3TR8A 2O8DB 5ADXH 3Q7BA 3VQCA 4O55A 5KPZA 3ZX3A 2ZM6K 2BUPA 1IKVA 3A5LC 4A2AA 5GADP 4EP4A 1SKRA 3NFAA 4FWPA 1O1WA 1JLFA 3K5LA 3QESA 3SI6A 4PL8A 5M1PA 2HOEA 4BC5A 1KXPA 3O1WA 4FWNA 2P9NA 5M1OA 1EWQA 1MWMA 1W97L 1DGKN 2OTLN 2VQFK 4IWVA 4A57A 3THXB 2QM1A 1RT7A 3ULDA 2KFNA 1SKWA 1XHXA 4IO8A 5C25A 4AHUA 5KGXA 1U2VB 1NJWA 2OPPA 4B1ZA 4DQIA 4UY8O 1ILYA 5CE3A 5SWMA 3CCJN 4BRGA 3L2UA 2P9KB 3KLFA 2X74A 5MLCQ 2D0PA 1NM1A 3CMEN 2OZSA 4KHNA 4CERA 5AFUA 1VSEA 3RMAA 4B9UA 3V81A 1GOAA 4NO7A 3I0SA 3A2FA 1JLBA 2O8CB 3OBWA 1EKEA 4E7LA 2GWJA 1ZBUA 3CG7A 2Q0RA 3EY1A 1RT4A 2EWSA 4CECA 2HF3A 2IVOA 3F5TA 1RTDA 2ZJPL 4M3UA 4RTFD 2XRIA 3U4LA 1S72N 4PY5A 5FRMA 1GLEG 3SQ1A 3I0RA 2UUBK 3I55N 4LD0A 1N33K 4H5VA 2HHHK 5AQFA 3ZT1A 3CCLN 4DSIA 4XH1A 3K5NA 3DXMB 5BPNA 2UYTA 3PUFA 3D2EB 3HSCA 4FJLA 4DV7K 1IBKK 3QEXA 4CJ5A 2F9TA 4DS5A 1HRHA 4KB1A 3PY8A 1U49A 1MA9B 3OYDA 4DV3K 4F3OA 3ALYA 3O8MA 3RMBA 3O4WA 5C24A 3IG1A 4A5AA 1QE1A 4FJGA 4DTRA 3OY9A 2HB5A 3M6GA 1BQNA 3NF6A 5KI6A 4QCLA 2KZMA 3OYAA 3MAQA 5AQKA 1ATRA 3SPYA 1KLMA 1NU0A 2YX6A 1IV0A 3OYEA 1YJ9N 4OGCA 1BCOA 3SUQA 2UXDK 3AA5X 4F3TA 1HQEA 2D0OA 2HBLA 5KQDA 3KIOA 1TL1A 4DTNA 4BRKA 4PKHA 3AO2A 3TSQA 1E4GT 5EY4A 4QS9A 4CF8A 4CBWA 4OPHA 3CJ1A 3DLBA 1XNRK 5JVGL 3NF9A 3MXJA 1UAXA 3A5OC 4BRPA 2HF4A 4DQQA 3TI0A 1EETA 3T69A 4AQYK 4CHZA 3FLCO 3O3GA 4OJRA 2YJFA 2DFEA 3EE9A 3LP2A 2B5JA 1OH6A 2OANA 3CJ7A 3R8EA 2R7YA 3DYAA 3C0BA 5CY4A 1LOTB 3SLCA 3NE6A 3E1YA 4GVMA 3HZ6A 5JVHL 3WUHA 3R3LA 3UKRA 2PAVA 2YNHA 5M1FA 1RDBA 1YVNA 2H3GX 2VGNA 2HHIA 1L5UA 3MCPA 1NG9A 1NK0A 4O4GA 1KAZA 1JL2A 4E7IA 4FLUA 3KVGA 2NRZA 4FWSA 1N36K 4L8RB 3O08A 1OH8A 3HRGA 5LMNK 4OX9K 1X3MA 4JKAA 2V7ZA 1E3MA 5BR8K 2BH1A 4BRAA 2FXUA 1TKZA 4RWTA 4FWMA 3VGMA 1T03A 3K5OA 3TAQA 2ZD1A 5CZ2A 5AQQA 3HOSA 3THWB 4PKGA 4O0IA 5AJ3K 3OYKA 3SNNA 4A2BA 4I9QA 1L3SA 5FPNA 3QEVA 3V6DA 4JI3K 3QEIA 1HNZK 4FO0A 4YOYA 1NK4A 3VEXA 4B8CA 3THYB 4FZXC 1BHLA 3MECA 4JK8A 4TSXA 3DRPA 3KKSA 3ZYYX 5BREA 4E3SA 4JI5K 5FDLA 1T7PA 4BC4A 2P9PA 3VEOA 2A1RA 1N32K 3NH0A 1S22A 4J2BA 1VQ7N 2C1GA 2P9IB 3LP1A 4CJUA 4CJTA 4CZMA 4M3YA 4DQRA 5TKWA 2QK9A 1GLLO 3P31A 5AQVA 4CIFA 3T7ZA 2XHBA 1S1WA 4DU4A 1TK8A 2KZZA 3F9MA 5CR4A 2QWOA 3U6FA 4BWMA 1LV5A 4DV1K 1OKJA 4HWIA 1TKDA 3LAMA 1TYQB 1BA1A 4DUYK 4C8OA 2GEMA 4CEEA 3VEWA 5AQOA 1ITGA 2GUIA 5AQMA 5KPRA 4OPAA 3QLHA 4B1XB 4FM0A 1NGCA 2X78A 4BC3A 4C23A 3BZCA 3CMAN 2CH5A 3HO1A 3EKUA 3T1YK 5CYQA 4BECA 1UWBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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