2ASPA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide c
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
370
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
total genus 128
structure length 361
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aspA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aspA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2aspA03
2EWSA 3H3NO 1QZ5A 2IVNA 5KPTA 4YDUA 2CGKA 1P8ZA 1D4XA 1E4FT 3VENA 4WQ4C 3GG4A 3O80A 3VEVA 3A5OC 1NGIA 3S41A 2V51B 3CJ9A 3SJHA 2QWQA 3GDQA 1BOTO 4QS7A 3U8XA 4HWIA 2QWNA 3CJBA 3UKRA 4CBXA 1NGCA 1ESVA 2YJFA 3WEEB 5AQYA 2FSJA 4C23A 3VEXA 3ATVA 2CH6A 4XEIA 2QWMA 4NB4A 5BRFA 3GL1A 1CZAN 4PKHA 3O1BA 3R6MA 3L4IA 1IJJA 5AQGA 2V7ZA 4EIAA 3AARA 1QQNA 3LM2A 3D2FB 4MLHA 3LDLA 5ADXA 2YJEA 4BC5A 5F0XA 3CJAA 2IIRA 4FWRA 4K42A 3ATUA 4B1ZA 5BR9A 1U2VB 1TUUA 4B1XB 4PKGA 4M7YA 2P9NA 4BRMA 5LJVA 2P9SB 3ZX3A 1GLJO 3SMSA 5AQIA 1ATRA 1TYQB 4J8FA 3WT0A 2I7NA 2CH5A 4IZ9A 5AQVA 2QWRA 3VGMA 5EY4A 4DQ8A 4ISFA 2NLXA 4ISGA 4BRGA 4JHDB 1QQMA 3M3ZA 3LDQA 2QM1A 3VEWA 1GLAG 4JNEA 1Y64A 4CZFA 3IMXA 1NGJA 5F1XA 4O8KA 3AAQA 3H1QA 2E88A 4H0XB 5AQOA 2UYTA 4F9OA 3CJ7A 5BPNA 4LC9B 1GLLO 3ID8A 1GLBG 1R59O 1WOQA 2QWLA 3QB0A 3DWLA 3BP8A 3GOIA 5EX5A 4JD2B 5E26A 1T6CA 4XH4A 4FWPA 4BRQA 5ELZA 1MWMA 3UB5A 3A5MC 3MN5A 3FFKB 4B1YB 1NLVA 5F2RA 1NGHA 4BRAA 2P9SA 3GE1A 4L3QA 5BRHA 3F9MA 5BPMA 2DPNA 4XH5A 4BR7A 4BROA 1KXPA 2E20A 1NWKA 1SAZA 3B8AX 5BN8A 4JHDA 4BRIA 4IO8A 2Q0UA 3D2EB 3O4WA 3TPQA 2GTDA 2E2QA 1BU6O 5KPRA 4FWOA 1YVNA 3G25A 1V4TA 1X3MA 4HTLA 4BC3A 3GBTA 5AQNA 2P9LA 3CIPA 3FZLA 3DXMB 1S3XA 2F9WA 3EZWA 3LDOA 1ATSA 4BRFA 4CZLA 1RDWX 3A0IX 3FR0A 4JD2A 4MO5A 2ASMA 4GY2B 4CZMA 1BDGA 4CZHA 2FSKA 2ZGZA 5FPEA 2GELA 4BR4A 1Z05A 5AQJA 3WXLA 5LY3A 2P9NB 5LJWA 1YUWA 2A42A 3WQTA 2P9KB 4IJAA 4IJNA 3MN6A 4BQLA 3IFRA 4A2BA 1NBWA 4ISEA 2P9IB 2VWBA 3ZETA 3ZX0A 4BRKA 4BRNA 1HKCA 2Q1NA 4A62A 5CE3A 2D0PA 5AQWA 4BVPA 3D2EA 1X9JA 3CJCA 3R8EA 4JN4A 2FXUA 3WQUA 2D4WA 3QICA 1X3NA 5AFUH 2KHOA 4DB3A 3QBXA 1NM1A 4FWMA 4WQ4A 3IDHA 4NO7A 2A3ZA 3W3DA 5AQKA 2YI1A 1E4GT 1HPMA 1LCUA 3DXMA 5B8HA 1EQYA 3CERA 2ASPA 4EFHA 3A5NC 4RCHA 2Q0RA 3H3OB 4DCHA 4H5RA 3VF2A 4B1VA 4FWQA 3R9PA 3FZFA 3P4IA 5AQQA 3SLCA 4K43A 3VEZA 4FOEA 2WUSA 4BRLA 5TKYA 2Q97A 1JCFA 2Q36A 3D7EO 2P9KA 4GNIA 4Z94A 1ATNA 2YCHA 4CZGA 2P9IA 5FPDA 4B9QA 5E84A 3TU5A 1DGKN 5BRDA 1XC3A 1NGFA 2BUPA 1WUAA 3DXKB 4BREA 1ZXOA 2FSNA 3CETA 4FOIA 1H1VA 1MA9B 1Z6RA 3EKSA 5KPZA 4PL7A 1S22A 3FLCO 2P9LB 3CQXA 3JS6A 3O5BA 4AM7A 3WXKA 3DAWA 3U9DA 4E1JA 3BEXA 3CI5A 2W41A 5FPNA 2ITMA 4BRDA 1SZ2A 4A61A 3DJCA 3L6QA 4H5NA 4JAXA 3UKUB 3IUCA 3FGUA 4FPBA 3C7NB 5KQDA 4EHUA 3H1VX 3VEOA 2ZGYA 2PAVA 4CZJA 2GEMA 2E1YA 1V4SA 1U6ZA 2I7PA 3H6EA 4BC2A 2P9PB 4Y0WA 2NZTA 4FWNA 4H0VB 3MK6A 3ZETB 3C0BA 3KZBA 2CGLA 2D1KA 3HBTA 4XH1A 2A41A 2A5XA 4BGBA 3CHWA 2H3GX 2QW9A 5AQLA 2A6AA 4IXCA 1BUPA 1IG8A 3DXKA 4I6MB 4CD1A 1MWKA 5AQUA 4FL9A 4A2AA 1QQOA 2P9UB 2YHWA 1NGAA 3CJ1A 3FZKA 4RWTA 2HF4A 3MN9A 3HI0A 4CBWA 4KBOA 3MCPA 4WYBA 1C0FA 2HF3A 4H0TB 1HLUA 1C0GA 2VYPA 2ZWHA 5AQTA 3BF3A 4FO0A 2FLOA 1ZBSA 4FWSA 1JCGA 5AR0A 3UKUA 4BR0A 3C7NA 1OKJA 4CD3A 2E8AA 3EKUA 1GLFO 3SK3A 3ULEB 3I8BA 4QS8A 2ASOA 4WQ5C 2P9PA 2GUPA 4BRHA 4MLEA 3EN9A 3OHRA 3M1FA 4IWVA 1YAGA 3WXIA 2Q31A 1HUXA 4EAHD 1NGEA 5AQXA 3ENOA 3LM9A 3ZEUB 4FWKA 3VEYA 1TUYA 5AQZA 1KAYA 4I6MA 1ZC6A 4WQ5A 5KQ8A 3RSEB 5AZJA 2P9UA 1MDUB 2A40A 5EOYA 3VOVA 2QWOA 4M63C 3VF4A 4FPAA 4H0YB 1BO5O 2OANA 1K8KB 5AZIB 5ADXH 4H5WA 2V52B 4EHTA 3A8YA 3H46O 5EVZA 3QFPA 3BF1A 4CZIA 3J8AA 2FF6A 1HKGA 3O1WA 3ULEA 3A5LC 1XQSC 3WUHA 2AP1A 1GLEG 1Q18A 2F9TA 1GLCG 5AFUA 4BR2A 3H45C 4PKIA 3L0QA 1KAXA 2VCPA 5FPMA 4B1UB 4BVOA 4MO4A 1BA0A 4K41A 3VGKA 3QDKA 4BR9A 4CJ7A 2YHYA 4DHYA 1XUPO 2Q2RA 2QXLA 3ZEUA 2D0OA 5BN9A 5JICA 3LL3A 4PL8A 4BQZA 4FSVA 2NRHA 4M7XA 4CBUA 1RGIA 3I33A 3QMLA 5BPLA 5JLHA 3RSEA 3ENHA 2QWPA 1NGGA 4H5TA 3EO3A 3O08A 3VGLA 4CI6A 2GWKA 2E1ZA 2FF3B 3JXUA 3CQYA 1K8KA 5AZIA 2ZF5O 1GLDG 3ZX2A 4QS9A 2IVPA 3MN7A 3MMVA 2V7YA 3U9ZA 3AAPA 3HZ6A 3FE1A 3KHYA 3LDPA 1BA1A 4H03B 2YHXA 4BRPA 1NGDA 1NMDA 3WEEA 5AQHA 2IVOA 5EXWA 5AQRA 3W0LA 4CZEA 3HM8A 3KVGA 4BGAA 5AQPA 4BC4A 1JCEA 3D2FA 1BG3A 3BUZB 3M6GA 2E2OA 4CZKA 2J4RA 1HX1A 2HMPA 5AQSA 4AM6A 1DEJA 2HOEA 1HJOA 2PBDA 4H0OA 5AZJB 4BG8A 5BREA 1U2VA 1LOTB 1SQKA 3VF6A 2E2NA 1BWFO 4RTFD 5AQFA 3VERA 4BR5A 5I9EB 1TYQA 4O5FA 3O8MA 3U4LA 2BTFA 4BG9A 3QFUA 3LDNA 3HTVA 4B1WB 2GWJA 1J6ZA 4H0PA 3EL2A 3MDQA 1NGBA 3QBWA 3UKRB 3WXJA 1T6DA 2AA4A 5AQMA 1G99A 1DKGD 2CGJA 3UE5A 3FZHA 1T44A 3VPZA 4YDUC 3FZMA 3O6WA 3VETA 3SMPA 2E2PA 1RFQA 5JLFA 1QHAA 1YXQA 5JMVA 1KAZA 3HSCA 4K25A 3VESA 1QZ6A 3AY9A 4H5VA 4BRCA 2W40A 4FWLA 1HKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EWSA 2IVNA 5C25A 1C0UA 3CYMA 4OPHA 3AVGA 3CFRA 2LSNA 1D4XA 3ZSXA 3AVAA 4CEEA 4AHSA 3SPYA 3TAFA 4B8AB 4IOCL 2V51B 2QWQA 4C1NK 4QS7A 2G8WA 4CK2A 4CJSA 4DFMA 2ETJA 5M1QA 3CJBA 4CBXA 4KTZA 1DTQA 3WEEB 1LWEA 4C23A 4IDHA 4JKGB 1CZAN 4PKHA 3CM5A 1O1WA 3T1AA 3AARA 4YOWA 3D2FB 4WFBL 2XRIA 2YHAA 3O9SA 4JI6K 4K42A 4E72A 3SYZA 1U2VB 4M7YA 3R1XA 1NU0A 3AVLA 3MXJA 3SMSA 3TAEA 1BI4A 3RR7A 4FJJA 4JKCA 3K9KA 5C2DA 1IBLK 4ISFA 4B3RK 4DSJA 4JHDB 3HRGA 5M1PA 4DV1K 4E7JA 4JNEA 1TV6A 3DLEA 3VN5A 1NGJA 2NRRA 3K5LA 4CHPA 3EE8A 5IT9O 4ZTFA 3H1QA 1OH7A 4O44A 1NKCA 4JI1K 1RILA 5MLCQ 4DV0K 4HVJA 1KSPA 5CYQA 3J7YP 4DTJA 2XY8A 5E26A 2O4IA 4F4KA 4IO9L 4BRQA 3THYA 3CYGA 1HNZK 3FFKB 4B1YB 3QLHA 4BRAA 3GE1A 1JXBA 1L3TA 1HYVA 3F9MA 2QK9A 1LWFA 3OJUA 1KXPA 1MU2A 1ZYQA 3O3HA 1BIUA 4FLWA 4FWOA 3G25A 1X3MA 4DR7K 4BC3A 3GBTA 4A5AA 4WFNL 4CJEA 4YOYA 4G9ZA 3DLHA 2HSTA 4Y1DA 3SI6A 4KRFA 2NRWA 1ATSA 1ZBLA 4E7LA 4CJ5A 3FR0A 5DMRA 1KTQA 1YITN 1HMVA 1IO2A 2FSKA 2ZGZA 4KHUA 2GELA 5AQJA 4ILGB 4CVNE 1IG9A 2RPIA 1YI2N 4E89A 3ZETA 4AILC 2PYJA 1K6YA 2OPQA 1SKWA 4A62A 4FJ9A 4LSNA 3K2PA 3WNHA 5AQWA 4CEOA 1X9WA 4FJ8A 2OPRA 3HP6A 2G8VA 3D2EA 4RG8A 3THWB 4JN4A 1JLFA 2FXUA 2B4JA 1VQON 1K8AO 4IFYA 4E1NA 4DB3A 1NM1A 2W6LA 4CGJA 4N41A 2YI1A 1HPMA 1RT6A 1SL1A 5HRSA 3H3OB 3N4QA 4DCHA 5JVHL 4H5RA 3C6TA 3VF2A 4B1VA 5C12A 4HUEA 4DFJA 4EP5A 3U3GA 3V1QA 3VEZA 4RW7A 2QXFA 3SV4A 1JCFA 3AGKA 2Q36A 4DWIA 3PY8A 3QIPA 1VQ4N 1WSGA 4Z94A 3J80O 2OCEA 1QQCA 2P9IA 4M3ZA 3NGYA 4CCHA 3B6PA 4HUGA 3K58A 4DR2K 4WF9L 1XC3A 2X78A 4JI0K 3DXKB 3KLFA 5M1KA 4DTXA 1RBTA 1ZXOA 2FSNA 3QEVA 4W5TA 1GOBA 2HBKA 3S3NA 2X6SA 1L3VA 3CCQN 3FLCO 3CQXA 4DQQA 1C1AA 3AVNA 2OZMA 3NE6A 4AM7A 4E1JA 3BEXA 2ITMA 4N76A 4DMNA 4A61A 4H5NA 4JAXA 4GV9A 3IUCA 3VMFB 3KLEA 3G0ZA 3H1VX 1WAFA 4CZJA 5KGWA 3F9KA 1V4SA 4KAZA 3V81A 4B9VA 2IAJA 2Z1GA 3T1HK 3RR8A 4LFCK 3ZETB 2QKKA 4F8RA 3KZBA 1B92A 2CGLA 1Q7YO 2A41A 1EETA 2A5XA 4DV2K 2UUCK 2H3GX 4MFBA 2QW9A 4FW1A 4IXCA 3HOSA 4CD1A 1MWKA 2NRTA 5AQUA 4M3WA 3JAMO 1BCMA 2P9UB 4RWTA 3CJ1A 2KZZA 1Y97A 3HI0A 2IS3A 5HP1A 3P1GA 2ZJQL 4WYBA 1C0FA 4JK7A 4CFAA 2G8IA 1BQMA 4FO0A 2FLOA 4Z4IA 1ZBSA 4DV4K 3OW2M 4NYFA 3UKUA 4BECA 4DUYK 3CPEA 2WONA 2OPSA 4CF0A 3NF7A 4LFAK 1IV0A 3ULEB 1FKOA 4I9LA 4U67L 3RMBA 1N8RO 3P83D 3OYCA 2ASOA 4JI2K 3OHRA 4DF4A 1VQLN 3CC4N 4RW6A 3C94A 1RDUA 4LD0A 4E0DA 4F3TA 1TUYA 3RRGA 4CHQA 3RVCA 5A2QO 4LF9K 2O8FB 4KREA 3HP9A 5KQ8A 3NGIA 3AGRA 4NCGA 5LL6Z 5EOYA 4JK9A 3ZT2A 3MECA 4BE2A 2VWJA 3PIOL 2OANA 1UAXA 3O9TA 3OYLA 2VWKA 3H46O 5EVZA 3QFPA 5GAHP 3BF1A 2PZSA 2FF6A 1U4BA 4QOZB 3O1WA 2W00A 4KHPK 1NJIO 3CD6N 4BR2A 3L0QA 3CFOA 4Z4GA 4MQ3A 2KZMA 5FPMA 3VGKA 3QEWA 4IG3A 1JLBA 4CJ7A 3LPUA 1RTIA 2G8UA 1SUQA 3ZSYA 1WAJA 3C95A 1C0MA 3ITHA 1VQNN 4BQZA 5C0YA 4FSVA 2OYQA 4DR6K 3J7AP 3T7ZA 4BWMA 1NK6A 4CECA 3DRRA 2QWPA 4H5TA 3AVFA 3ZT0A 3VGLA 4CI6A 1NK7A 1CZ9A 2FF3B 3NVMA 3L2RA 1Q82O 4QS9A 4CE9A 5JS2A 3BY5A 3E9OA 2V7YA 3RWUA 3ENBA 3HT3A 1Q81O 3HZ6A 1S9GA 3OJSA 1VK0A 4LY7A 2YKMA 3TTFA 3I8DA 1NJZA 1B9DA 4GKJK 1BG3A 4CZKA 2J4RA 1HX1A 5TKWA 1DEJA 1XHZA 3ZT1A 4E7KA 2HBJA 2GV9A 5BREA 3TI0A 4FLTA 1WBBA 1NG9A 3VQEA 1BWFO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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