2ASPA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide c
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
370
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 128
structure length 361
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aspA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aspA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2aspA03
3WXIA 3SLCA 2BTFA 1GLFO 2NZTA 5F2RA 3WQUA 4BR7A 1BDGA 3ZX2A 3MK6A 3IFRA 3QMLA 3H3OB 1YXQA 2P9IB 1DEJA 4WYBA 5BPLA 4EIAA 2E2PA 3DWLA 4DCHA 1S22A 3WEEA 1WOQA 3MDQA 1U6ZA 3MN9A 4B1ZA 3G25A 5BREA 5FPEA 2Q1NA 1QZ5A 1DGKN 1KAZA 3VF4A 2IVNA 2WUSA 4DHYA 4CZEA 3H3NO 3TPQA 1T44A 3BP8A 4BRCA 1V4TA 4ISEA 3GDQA 1QZ6A 2FSJA 1R59O 3C7NB 3FZFA 3OHRA 3CERA 5EVZA 4FWSA 3UE5A 1YVNA 1SQKA 4EAHD 3D2FA 4BR2A 1J6ZA 4CZFA 5FPMA 1BO5O 3IUCA 2E2NA 2E20A 4B1UB 3ENOA 5AZJB 3QDKA 4CBXA 4LC9B 1NWKA 3U8XA 2GELA 4XH4A 5AQXA 4I6MB 3ZX3A 3ZEUA 3ZX0A 3IMXA 4PKGA 4QS7A 2P9UA 1NGJA 1ZBSA 4YDUC 4FWQA 4WQ5A 2E88A 2YHYA 4M7YA 3EN9A 3FFKB 1RDWX 2QXLA 3DAWA 4FWLA 1BUPA 4PKHA 2CH5A 3P4IA 1GLCG 1ESVA 2QW9A 1NGDA 5LJVA 3FR0A 3KHYA 3QB0A 5EY4A 5AZIA 2FSNA 3LL3A 4BREA 3ENHA 3O80A 3H6EA 4BQLA 3A0IX 3L0QA 1BOTO 2P9LA 4CZLA 2P9IA 3VESA 4JNEA 2V51B 3ATVA 4BR9A 5AFUH 3KZBA 2GEMA 2F9TA 3O4WA 1GLLO 3LDNA 4A61A 3JXUA 4BRGA 4FWPA 1QQOA 1BA0A 3WXKA 1BG3A 2QWQA 3AAQA 4JD2A 4WQ5C 3W0LA 5BPMA 3L6QA 5AQSA 4CD3A 4K41A 1TYQB 4B1VA 4BVPA 3ZETB 2PAVA 3FGUA 4H03B 4H0VB 4DB3A 3CQYA 2QWNA 4IZ9A 5AQOA 2YHXA 2Q36A 4A2AA 4L3QA 2W41A 2P9SA 5BRFA 5E84A 4J8FA 4FWKA 4QS8A 2Q0RA 2A42A 3O08A 4PL8A 4FSVA 1U2VB 2Q97A 3LDQA 4B1WB 1K8KB 5AQYA 2UYTA 4IXCA 3DXKA 4EHTA 4H5NA 5JLHA 3MCPA 2E1YA 2A3ZA 2FF6A 2P9NB 3HI0A 2A5XA 2AP1A 4RCHA 4H0OA 4BGAA 4B1YB 3H1VX 5EXWA 5EX5A 2NRHA 2V7YA 5BRHA 3O6WA 3A8YA 3CJ7A 4RTFD 2D0PA 2I7NA 4BROA 3H1QA 3FE1A 1T6CA 4CD1A 3F9MA 2A41A 3AY9A 4IJAA 3CJBA 4EFHA 2P9KA 4YDUA 2VWBA 2H3GX 3O8MA 3ATUA 2ASPA 1IJJA 2Q0UA 4B9QA 1D4XA 3FZHA 1T6DA 3CJAA 4BG9A 2VYPA 2HOEA 3MN6A 3TU5A 2YCHA 4H5TA 3I33A 1BA1A 3UKUB 3O1WA 5AQUA 2PBDA 5AQRA 2ASMA 1C0GA 2HF4A 3UKRB 5AQMA 1HPMA 5KPRA 2QWPA 1HX1A 3VEXA 3HTVA 3ULEB 3C0BA 4M7XA 5AQJA 5AQHA 3WT0A 1V4SA 5ADXA 1DKGD 3MN7A 1HKBA 1X3NA 3DXMA 1GLEG 3D7EO 4HTLA 5ELZA 4BR4A 5EOYA 1TYQA 2A6AA 2QWRA 1GLJO 1MWKA 4A2BA 2OANA 5BR9A 4BRNA 4CBUA 3HM8A 4H0YB 2D0OA 3D2EA 2P9PA 5KPTA 3VERA 3VEOA 3VPZA 4BC3A 1HKCA 5BRDA 2QWLA 4CZMA 2E2QA 3HSCA 1H1VA 3HZ6A 4BRPA 1NLVA 1LOTB 2CGKA 3LM2A 3UB5A 1GLBG 5FPDA 2GTDA 2FSKA 4BRAA 3VENA 1QQNA 5AQIA 5AQZA 2P9NA 4FWOA 2QM1A 3R9PA 4BC5A 3MMVA 2IVOA 1NGCA 3VF2A 2HMPA 4H0TB 4B1XB 3M1FA 3DJCA 5FPNA 3BF1A 1ATSA 4MO5A 2V7ZA 4A62A 4FPAA 4BR5A 2NLXA 2D4WA 1NGHA 1ZXOA 3CIPA 5CE3A 2GUPA 3JS6A 4IO8A 1RGIA 4AM7A 3WEEB 3B8AX 2IVPA 5F1XA 2Q31A 3GE1A 3C7NA 3VF6A 5AQPA 4BRQA 4IWVA 4BRHA 3WUHA 2V52B 3VGMA 3UKRA 4C23A 4H0PA 1HUXA 3A5MC 2CH6A 3VEYA 2CGLA 2VCPA 3HBTA 4XH5A 2AA4A 4XH1A 3VGLA 3W3DA 5KQ8A 1NM1A 1HKGA 3LDOA 5AZJA 2GWKA 4KBOA 4O8KA 4PKIA 4BC2A 1NMDA 1G99A 3GL1A 3MN5A 4I6MA 4HWIA 1Q18A 5AQGA 5BN9A 1LCUA 5BN8A 5BPNA 4Z94A 4BRLA 3ZEUB 4BVOA 4FPBA 2Q2RA 2YI1A 1BU6O 4AM6A 3VEWA 1MA9B 1Z05A 1XQSC 2GWJA 4IJNA 4CZIA 3CETA 4MLHA 5LY3A 1KXPA 1NGFA 1HJOA 3A5LC 5AQWA 2IIRA 2ASOA 1MDUB 2FXUA 5AQNA 3WXJA 3CI5A 3RSEB 4F9OA 5F0XA 5AZIB 4EHUA 4JHDB 1CZAN 1EQYA 3FZMA 4WQ4A 3A5NC 3O5BA 4CJ7A 1XC3A 1SAZA 1TUYA 3GG4A 2E1ZA 3EZWA 2P9LB 1E4GT 4H5WA 3U4LA 4CZHA 1C0FA 4JN4A 3CHWA 2FF3B 3KVGA 4JAXA 3LM9A 3SJHA 4CZKA 1YUWA 2CGJA 3CJ9A 3AARA 3FZLA 1JCEA 4BGBA 3M3ZA 3CQXA 4K43A 4FOIA 3O1BA 3ZETA 1TUUA 4GY2B 2A40A 4JD2B 5AFUA 4M63C 4O5FA 2QWMA 3L4IA 1BWFO 3I8BA 3A5OC 1YAGA 4CI6A 1IG8A 4CZJA 4ISFA 1OKJA 5E26A 2J4RA 5AR0A 1NGIA 1S3XA 1U2VA 5JICA 4WQ4C 2P9SB 1K8KA 5I9EB 3VOVA 1RFQA 1P8ZA 3GOIA 3U9ZA 1HLUA 5AQVA 4H5RA 4BRDA 4H0XB 1JCFA 3EKSA 2ZGZA 3EO3A 1KAYA 3DXKB 3WQTA 4FO0A 4ISGA 4GNIA 4DQ8A 5B8HA 3BUZB 4BRFA 2E2OA 1XUPO 3VEVA 3EKUA 1NGBA 3SK3A 2DPNA 5AQFA 4FWRA 4BR0A 5KQDA 4FL9A 1JCGA 1Y64A 5AQQA 2FLOA 4BRIA 1QQMA 4MO4A 5JLFA 1GLDG 3CJCA 2F9WA 3BEXA 4XEIA 3J8AA 3R8EA 3H45C 3RSEA 3SMPA 1X3MA 5AQLA 3U9DA 3VEZA 5AQTA 3QICA 1X9JA 1Z6RA 4JHDA 1NGEA 5ADXH 4FOEA 4QS9A 5AQKA 5JMVA 2P9KB 3SMSA 2EWSA 4K25A 3LDLA 4NB4A 4BG8A 2HF3A 3QFPA 3UKUA 5LJWA 2ZGYA 4NO7A 4FWNA 4PL7A 3FZKA 3BF3A 4CBWA 3IDHA 3ULEA 2YJFA 4Y0WA 1NGAA 1SZ2A 3M6GA 1ATNA 3D2FB 3H46O 4CZGA 1NBWA 1QHAA 3LDPA 5KPZA 3FLCO 1GLAG 1WUAA 3DXMB 1MWMA 3R6MA 4RWTA 3ID8A 3QFUA 2ZF5O 1KAXA 2D1KA 2W40A 2I7PA 3QBWA 3D2EB 3VETA 2P9PB 3EL2A 2BUPA 3WXLA 3VGKA 2QWOA 4BC4A 2P9UB 5TKYA 4H5VA 1NGGA 4E1JA 2ITMA 3CJ1A 2ZWHA 2E8AA 4BRMA 3S41A 4BQZA 1ATRA 4K42A 2YJEA 3GBTA 3AAPA 3QBXA 4MLEA 1ZC6A 1E4FT 2KHOA 4FWMA 4BRKA 2YHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXIA 3SLCA 3SI6A 3AO2A 1B92A 1RBUA 1BDGA 4FJ8A 3MK6A 1YT3A 4F4KA 4C8OA 4F2RA 1YXQA 5SZTA 4CF9A 2WTUA 1VSKA 4WYBA 5BPLA 2HHIA 4IFVA 4DCHA 3DWLA 4E19A 3MDQA 1TKTA 2ATQA 5CR4A 2G8KA 3G25A 1U48A 5BREA 2Q1NA 1DGKN 3VF4A 2IVNA 4AHTA 4DHYA 3LAKA 4W5OA 4H4OA 1RILA 3TAPA 3RMCA 4BRCA 1QSSA 1V4TA 4Z4EA 4BDZA 3WNGA 4FWSA 4CGDA 1SQKA 4RW7A 3L2VA 3D2FA 3DRRA 3RVCA 4CEDA 1VQ8N 3M8QA 1YIJN 4BR2A 3HT3A 3HRGA 4CZFA 1GOBA 3C94A 3ID6A 4DTOA 1CXQA 1T8EA 4CE9A 4LC9B 1NWKA 3U8XA 2GX9A 3SJJA 4I9QA 2GELA 1BISA 4I6MB 2G8WA 2ZE2A 3AVJA 4QS7A 1WSGA 4WE1A 1NGJA 4FWQA 1N34K 4HUGA 1I94K 2FBVA 5MLCQ 2QXLA 4FK4A 3P4IA 4B9SA 3Q7CA 3THWA 1GLCG 2QW9A 1ASVA 1XNRK 3KHYA 4DUZK 3ALYA 1RT2A 4BREA 2XRIA 1HNWK 4BQLA 3BDPA 4MDBA 3KK2A 3CCLN 1VQ7N 4FYDA 4A5AA 3ATVA 3MWPA 2FC0A 4BR9A 2GEMA 2F9TA 1K6YA 4YOTA 2LSNA 4AHVA 4DFMA 1NKEA 2B5JA 1VAZA 3KIOA 1KRPA 1S6QA 4FWPA 3JAMO 1QQOA 4UQGA 3WXKA 3P5JA 3AAQA 4J2EA 4CD3A 1XMOK 4BVPA 4JK9A 3ZETB 2X6NA 1RBVA 3NGIA 4DB3A 5GAHP 3F2KA 4IEIA 3V1OA 2W41A 4B8AB 1N8RO 1NNEA 4NCAA 1ZBHA 2Q0RA 4YFUA 3K59A 4E7HA 1YTAA 4PL8A 4FSVA 5FDLA 3O9QA 1NK7A 2Q97A 1WAJA 5DMRA 1K8KB 5AQYA 2UYTA 3DXKA 4BDYA 3SZ2A 4EHTA 5JLHA 3MCPA 1SL0A 4O0IA 1CLQA 1YF5L 5IWAK 3HI0A 4RCHA 4DQPA 4B1YB 5EXWA 3CXCM 3LPUA 3P1GA 2V7YA 1TL3A 3D6RA 1FKOA 3OBYA 1TAQA 3E1YA 4CK2A 2DY4A 2NRWA 3TAMA 3HOSA 4BROA 4JYAK 4HHTA 5IT9O 3FE1A 4DTXA 1T6CA 2OPSA 3F9MA 1YJWN 5HRNA 1NJIO 1TL1A 1S9GA 4CVNE 3ATUA 2ASPA 1IJJA 1RNHA 2O8EA 3CYGA 1YHQN 3I56N 1T6DA 5GADP 3CJAA 4EP4A 4GKJK 4BG9A 2HOEA 2HVHA 3HYFA 4H5TA 3UKUB 3O1WA 5AQUA 2PBDA 5AQRA 3UKRB 1C0GA 4FK0A 2OPRA 3T3FA 1S1TA 5KPRA 3CC2N 2QWPA 1HX1A 4IFYA 4U7BA 1VSFA 3ULEB 3WT0A 4O8UA 3SPZA 3QEXA 1JLAA 1HKBA 5DM7L 3SBGA 1ASWA 1GOCA 4A2BA 4M42A 4KO0A 4JKEA 2HMIA 3D2EA 2P9PA 3ZSRA 5KPTA 4OKEA 3AO1A 1U47A 3OYNA 4DSLA 4CZMA 3CM6A 1H1VA 3CC4N 2ZJQL 3JSMA 1GLBG 1XWLA 3AVAA 1DTQA 4WFBL 2GTDA 1XMQK 4BRAA 3J7AP 4KRFA 3MECA 4E0DA 4DMNA 4BC5A 5H1SQ 2HHHK 4H0TB 1JLEA 4GV9A 3BF1A 4Y1CA 3PO5A 1BI4B 4MO5A 1WBBA 3R3LA 1E3MA 2NLXA 1HMVA 4X62K 2D4WA 1NGHA 3OW2M 5CE3A 4JK8A 3MXJA 4B3RK 3CF5L 5CZ2A 1RGIA 5K14A 4CK1A 3B8AX 3VQ6A 3AA4A 2Q31A 3MEDA 4F2SA 4BRQA 4C23A 4CJ4A 4DTMA 1LAVA 3QEWA 5C42A 5GIOA 4N76A 2C1GA 1LAWA 1REVA 2XY6A 4M45A 3OVNA 3N4QA 3LDOA 2GWKA 3TSUA 2HHUA 5TKWA 2UXDK 1NMDA 3LP2A 2E6MA 4I6MA 4HWIA 1Q18A 4CEFA 5EU7A 5BN9A 2JGUA 1XNQK 4IOAL 1KCFA 2O8CA 4IO9L 3ZCMA 2HB5A 3ISNC 1LW2A 1L3SA 4FJ9A 1RCHA 3MX5A 4E7KA 3DOLA 3UIQA 1WAFA 2IIRA 1IKYA 1O13A 2ASOA 2Z1IA 3G10A 1EQYA 4KHQA 2HHXA 1RT1A 4FM0A 4KTWA 3GG4A 1C1BA 3EZWA 2P9LB 3U4LA 1JL2A 3J81O 3TABA 2FF3B 4LFAK 3SJHA 3M8PA 2HBJA 2CGJA 3FZLA 4CJSA 1S1UA 3V1RA 4CFDA 3M3ZA 2OPPA 1OVQA 3ZETA 4E89A 5HRSA 1WBDA 3S9HA 4CF1A 2QXFA 3TR8A 1W97L 1BWFO 3HK2A 1YAGA 4CI6A 4CW7B 3I0RA 3C65A 2O8DB 1OKJA 2J4RA 5AR0A 4JI1K 1D8YA 2GBZA 1K8KA 4N5SA 3TAEA 3U9ZA 4KV8A 5AQVA 3KJVA 1Y97A 4A5BA 3HSTB 4X65K 3EKSA 4DLGA 2UXCK 3AA5X 3WQTA 4YOXA 1IKXA 2D5RA 5B8HA 4HVJA 4BRFA 3AVCA 2E2OA 2Q3SA 3EKUA 1RTIA 1NGBA 3NH1A 4LF7K 4ICLA 4BR0A 5KQDA 3NVKA 2YV0X 5AQQA 5JLFA 2FLOA 3SUPA 3AVFA 2HHQA 3BEXA 3RSEA 3H45C 5AQLA 3SAFA 3EY1A 3OYHA 4JHDA 4RW4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1FKP A;  3DXK B;  5JS2 A;  4GNI A;  3BUZ B;  5HL7 L;  1XUP O;  4Z0U A;  4LH4 A;  4PHT X;  4CJW A;  3TTD A;  4M3Z A;  3SK3 A;  2DPN A;  5AQF A;  4ELU A;  4CHO A;  1Y64 A;  5CHI A;  3J8A A;  1X3M A;  4DFJ A;  4OPJ A;  3CD6 N;  1X9J A;  1Z6R A;  1EP4 A;  4YOW A;  1NGE A;  3KWG A;  2XHB A;  2VQF K;  5HOO A;  4QS9 A;  2BGG A;  4M3T A;  3ITH A;  2EWS A;  3SMS A;  4MFB A;  4NB4 A;  4RW9 A;  3QFP A;  2O8E B;  4DSE A;  4NO7 A;  4F8R A;  3FZK A;  1L5U A;  3IDH A;  4W5T A;  1W2B M;  4Y0W A;  3M6G A;  3DLG A;  2HNY A;  2D0B A;  1ATN A;  3H46 O;  2VWK A;  3L3U A;  1IBL K;  3MEG A;  2RE2 A;  4CZG A;  3ZT1 A;  3V4I A;  4CFB A;  2Z1H A;  3VN5 A;  4FLY A;  3PSF A;  1WUA A;  3E9P A;  4JI5 K;  4FJH A;  3I0S A;  4DQI A;  5C10 A;  3LP0 A;  1IKW A;  4NXM K;  3QBW A;  3D2E B;  2P9P B;  3ZSZ A;  3WXL A;  1L3U A;  2QWO A;  2YNI A;  4BC4 A;  1VQ5 N;  1NGG A;  4JK7 A;  4AHR A;  4LSN A;  1D9D A;  1ZBF A;  1N36 K;  1RTJ A;  3AVN A;  3TAR A;  1ZC6 A;  3SAH A;  4LSL A;  1UA0 A;  3OYC A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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