The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
124
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structure length |
124
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Chain Sequence |
MIIAIPVSENRGKDSPISEHFGRAPYFAFVKVKNNAIADISVEENPLAQDHVHGAVPNFVKEKGAELVIVRGIGRRAIAAFEAMGVKVIKGASGTVEEVVNQYLSGQLKDSDYEVHDHHHHEHH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
conserved hypothetical protein
|
| publication title |
NMR structure determination of the conserved hypothetical protein TM1816 from Thermotoga maritima.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Thermotoga maritima
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| total genus |
23
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| structure length |
124
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| sequence length |
124
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-04-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02579 | Nitro_FeMo-Co | Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RE2 A; 1O13 A; 2KLA A; 2YX6 A; 1RDU A; 1P90 A; 2WFB A; 1T3V A; 2QTD A; 1EO1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZJR L; 1RTD A; 4BQL A; 2KZZ A; 2KW4 A; 5JLF A; 1GLC G; 1IKY A; 3TSQ A; 3PSI A; 3CET A; 4AHT A; 4QCL A; 4JRQ A; 1WSH A; 3AVG A; 2O8B A; 2V7Y A; 3TAQ A; 2IDO A; 5DM7 L; 3K5N A; 2O8B B; 1WSE A; 2HMI A; 3MEC A; 4AH9 A; 4B3S K; 1UA0 A; 1XI1 A; 1ASV A; 2CH6 A; 4BDP A; 3WEE B; 1BQM A; 4JI6 K; 3HI0 A; 5KQD A; 4CEC A; 4FVM A; 1WSI A; 5AQX A; 2D0P A; 4M3X A; 1EXQ A; 4F9O A; 2ZM6 K; 4ICL A; 3M8S A; 4DQR A; 4Z4H A; 1W7A A; 3CQX A; 4E7L A; 2A5X A; 4DTS A; 3QEI A; 1DKG D; 4BDY A; 1BI4 A; 2Q2R A; 4FJ5 A; 5FPD A; 3MEE A; 1BI4 B; 1NBW A; 4HUG A; 1IG8 A; 4GW6 A; 1LCU A; 3MXJ A; 3PX6 A; 1M90 O; 2O8F B; 5MLC Q; 3MCP A; 3HP9 A; 3DJC A; 3D45 A; 4EP5 A; 2CGJ A; 3L3V A; 1CXU A; 5T7B A; 4H0P A; 3SCX A; 1RDB A; 2OPP A; 1RTI A; 5AQO A; 3VMF B; 4DV6 K; 4YOY A; 4TSX A; 4OKE A; 2ZD1 A; 3FFI A; 3LP0 A; 2D0C A; 4DTM A; 1VSI A; 4KHW A; 1NK7 A; 3R6M A; 4DQS A; 3AVJ A; 5HRP A; 1SZ2 A; 4WYB A; 3EN9 A; 3AVI A; 3F2K A; 4KH4 A; 1GLL O; 1ILY A; 3S3N A; 3IMX A; 4MFB A; 2Q0R A; 4B08 A; 4CF1 A; 4A5A A; 4ILJ A; 1VQ8 N; 1NOZ A; 5AQR A; 2IVN A; 2Y1J A; 1D5A A; 3QIP A; 3ZX0 A; 3TAR A; 4J8F A; 5E41 A; 2CGK A; 4DTX A; 5ELZ A; 1OKJ A; 3E9O A; 1RGI A; 4HTU A; 3DAW A; 3S3O A; 3KLH A; 3UKR A; 4LF5 K; 1ASW A; 3THW B; 3OW2 M; 4O8U A; 1GLF O; 5AQV A; 3V9W A; 1D8Y A; 2Q0U A; 4JI5 K; 2KQ2 A; 3NGZ A; 3P39 A; 2NRH A; 1ZBI A; 1HNI A; 3AO4 A; 5BR9 A; 2IVO A; 4FJX A; 1G99 A; 3HVR A; 3BF1 A; 1BQN A; 1RCH A; 2EWS A; 1Q86 O; 3HM8 A; 3C7N A; 3GOI A; 4CZK A; 4E1J A; 3C7N B; 4OVL A; 3CME N; 4PL8 A; 3VEZ A; 3P4I A; 3CI5 A; 4DLG A; 2BDP A; 1NGG A; 2F8S A; 4F3O A; 3KHY A; 3OYI A; 1KXP A; 2D0B A; 4E1M A; 4FK2 A; 2HHV A; 2O8C A; 4H0T B; 1S1X A; 4CZI A; 4CIE A; 4HUF A; 4JLH A; 2RPI A; 2HOE A; 4O0I A; 2FF6 A; 4HWI A; 3SQ1 A; 2O8C B; 4NYF A; 4IO8 A; 3CM6 A; 5AQL A; 3WXI A; 4BE0 A; 1QTM A; 1YTU A; 5CZ2 A; 3AO1 A; 3WUH A; 4NLC A; 3O8M A; 2OPS A; 1QHT A; 3NH2 A; 3CER A; 3MXI A; 4BR5 A; 3MEG A; 4BVO A; 2DFE A; 4DFK A; 2NRW A; 1ATS A; 1C0G A; 4GY2 B; 3QEW A; 1NNE A; 5HLF A; 4RCH A; 3PIO L; 4DS4 A; 3HO1 A; 4B9M A; 1Q82 O; 3R1X A; 4LC9 B; 2F9W A; 2YJE A; 3BZK A; 3TPQ A; 2CH5 A; 2PY5 A; 4RTF D; 4DB3 A; 4K43 A; 3CCJ N; 3NCI A; 1S1V A; 2VG6 A; 1NGH A; 3C6T A; 3CJ9 A; 2RF2 A; 4EHU A; 3WXM B; 1S72 N; 1QE1 A; 3L2R A; 3J7A P; 1TUU A; 2HVH A; 1GLA G; 3HT3 A; 1BWF O; 4FXD A; 5SZT A; 4XIU A; 5BRF A; 2Q97 A; 4LF8 K; 3LDL A; 1VQ6 N; 3C6A A; 4I7F A; 2E4L A; 3ZSV A; 1BDG A; 3OVN A; 1D9F A; 3DLK A; 2OZM A; 4CZM A; 4CFC A; 2FBX A; 2VQF K; 1UA1 A; 1X9S A; 1N36 K; 1BA1 A; 4CCH A; 1BUP A; 4H5R A; 5KQ8 A; 1ZYQ A; 4RWT A; 2XY5 A; 5CYQ A; 1WBD A; 2JLE A; 1VSD A; 5K14 A; 4DLE A; 4BRC A; 1HX1 A; 2IVP A; 3OYL A; 4BR9 A; 4OLB A; 2KFZ A; 1HR0 K; 4M7Y A; 4JNE A; 4M63 C; 3C95 A; 3VQP A; 1YAG A; 4AHU A; 4AM7 A; 3VEX A; 1GOB A; 3F9M A; 4CHQ A; 4A2B A; 4CZJ A; 3ZSZ A; 5JLH A; 3CFR A; 4FJJ A; 1VAZ A; 1VQ7 N; 2VGM A; 2HW3 A; 1IJJ A; 3HRG A; 3QEP A; 2P1J A; 4BVP A; 1T6C A; 1VQK N; 3V1Q A; 5JVG L; 4CGJ A; 3CD6 N; 1KTQ A; 3ID8 A; 4FM0 A; 1O1W A; 4JKE A; 4E1N A; 4MQ3 A; 1SL0 A; 2KHO A; 1VQP N; 2Z1G A; 3A2F A; 3C0B A; 3F5T A; 3DRP A; 4FPA A; 1C1C A; 4DCH A; 4B1Y B; 4Z4G A; 4H0X B; 1RBS A; 2KFN A; 4KKO A; 4BRO A; 4KPY A; 5FPN A; 3CPW M; 3O9T A; 4DG1 A; 1NKC A; 4EFH A; 3DWL A; 1M1K O; 3H1V X; 2E5L K; 1QQM A; 2XO7 A; 3HK2 A; 1S22 A; 4HTL A; 3CCS N; 4H5T A; 2P9K A; 3TAP A; 2NUB A; 1Q7Y O; 3KWG A; 3NF9 A; 2P9K B; 3NDK A; 1JCE A; 3GL1 A; 4BG9 A; 1WSF A; 4OGC A; 1V4T A; 2A3Z A; 1N5Y A; 3OYF A; 2HNZ A; 1EKE A; 1SQK A; 4DTR A; 3SUO A; 2GWK A; 3N4Q A; 5CZ1 A; 4GKK K; 4NYN A; 3VPZ A; 3LAN A; 3QLH A; 5M1O A; 4XH5 A; 2AP1 A; 4FJM A; 4FLW A; 5H1S Q; 1SS6 A; 2E2O A; 4DR5 K; 4LFC K; 4PKH A; 4IKF A; 3WQU A; 4B3O A; 4DV1 K; 2P9N A; 4CZE A; 3SQ0 A; 4M3R A; 2P9N B; 2B5J A; 3FZM A; 1HJR A; 5J2M A; 2Q31 A; 4YOR A; 1CZA N; 1A5V A; 1ZXO A; 1NJI O; 4A5B A; 3DLE A; 3ATU A; 4JD2 B; 5KRS A; 2VQE K; 1VRU A; 3ZSY A; 1YJ9 N; 2P9U A; 4JHD A; 4CHY A; 1MWK A; 2HBM A; 1B9D A; 5ADX A; 3O1W A; 2P9U B; 4YHH K; 4DR1 K; 2BAN A; 4M45 A; 1QZ6 A; 2ASP A; 4IOX A; 4JAX A; 5ADX H; 1Q81 O; 1HQE A; 3G4S N; 3T19 A; 3BDP A; 1NLV A; 2D1K A; 4WCE L; 3U3Y A; 2YKM A; 1TKT A; 3KLF A; 3EKU A; 2QWO A; 1XUP O; 2IIR A; 2YHX A; 2P9I A; 4B8A B; 4WQ5 C; 2GEL A; 1J53 A; 3O4N A; 4K25 A; 2QTD A; 3HSC A; 3TU5 A; 1WLJ A; 1D9D A; 3QBX A; 2E2Q A; 3O4Q A; 4IDK A; 3AVA A; 4CD1 A; 1U04 A; 5AQN A; 4W5O A; 3AA2 A; 2WON A; 4BC5 A; 4B9Q A; 4F2R A; 4CF2 A; 2IC3 A; 3DOL A; 2E6L A; 2FF3 B; 1QQN A; 4OPA A; 4C8N A; 3H45 C; 1BGX T; 3OY9 A; 3PLA A; 4F3T A; 4BRI A; 4GVM A; 1VQL N; 3QBW A; 2V7Z A; 4JI4 K; 3L2W A; 2NRR A; 3VF4 A; 4BRG A; 4F4K A; 1U49 A; 3QO9 A; 5EVZ A; 3AAQ A; 1O13 A; 2G8F A; 3KLE A; 3OYJ A; 1RT7 A; 1TAQ A; 4KRE A; 3OBY A; 3TI0 A; 1JCF A; 3ASM A; 3SPZ A; 2FLO A; 3U4L A; 1LOT B; 1H1V A; 1NJZ A; 2QWQ A; 2J4R A; 3OYN A; 1KVA A; 4PL7 A; 3DRR A; 1VQN N; 1NK0 A; 1EWR A; 1KLN A; 5FPM A; 3LPU A; 1HLU A; 2WBN A; 1RT3 A; 4RW4 A; 1LW2 A; 1F21 A; 1NJX A; 3ZT2 A; 1XMO K; 4LH4 A; 1NK5 A; 3VQ5 A; 4JYA K; 4PWD A; 3RMC A; 1BIS A; 4OPH A; 3OYK A; 3SBG A; 1RBU A; 2HBK A; 3MN5 A; 3SK3 A; 1ZBF A; 4DF4 A; 2D5R A; 4NCA A; 4JI0 K; 1J9A A; 4BRK A; 3NBP A; 4CFD A; 1JCG A; 1S5J A; 3ID6 A; 4FO0 A; 1NU0 A; 4H5N A; 4KHU A; 3OBW A; 4JI7 K; 2F7T A; 2XY8 A; 1GLE G; 4EHT A; 3LPT A; 3VES A; 1VQO N; 2A40 A; 1FXX A; 3F9K A; 5BRH A; 4BR0 A; 3O80 A; 3KJV A; 4G9Z A; 3MAQ A; 1WB9 A; 3RR7 A; 3K2P A; 1VSM A; 3ZSW A; 1RT4 A; 3ENB A; 2FSJ A; 2F8T A; 4JI8 K; 3PY8 A; 4JK9 A; 2HMP A; 4Z94 A; 4EP4 A; 4GNI A; 1B92 A; 1V4S A; 4HHT A; 1U6Z A; 2OAN A; 1FW6 A; 4KO0 A; 1JLF A; 2FSK A; 2YCH A; 2F96 A; 3L4Q A; 1QZ5 A; 5M1F A; 5LJV A; 1L3T A; 4WFB L; 3EZ5 A; 1KCF A; 1Z6R A; 5IWA K; 4O8K A; 1JJ2 M; 1HKB A; 3VTH A; 1WAJ A; 1SL2 A; 2E2P A; 2ZGY A; 3K9K A; 4KTZ A; 5KPR A; 1FKO A; 4WQ4 A; 4O44 A; 2P9P A; 4H03 B; 1HNW K; 3ENO A; 3CCU N; 4DTN A; 2P9P B; 3VEN A; 1VSK A; 4FJ8 A; 3V1R A; 3IUC A; 1BIU A; 1IBK K; 4MLH A; 4CF8 A; 3HVT A; 3RSE A; 1LAW A; 1BO5 O; 2Z1J A; 3RSE B; 3THY A; 1UOC A; 1IO2 A; 4IOC L; 4O4G A; 4DTP A; 4MO4 A; 4IO9 L; 4C1N K; 1J54 A; 1REV A; 1Z26 A; 1LW0 A; 3PO5 A; 3VQQ A; 4DU3 A; 3UE5 A; 1IH7 A; 1VQ4 N; 3TAG A; 3ATV A; 3OA9 A; 2P9S A; 1QSY A; 3MN7 A; 2HF4 A; 5GIP A; 2O8D A; 4B9S A; 4IOA L; 2O8D B; 3SLC A; 4B1V A; 1NGF A; 3HP6 A; 1MU2 A; 3OYM A; 3V6D A; 1XC3 A; 1HUX A; 3JXU A; 4CZF A; 1BU6 O; 4N76 A; 2XY7 A; 4FZX C; 2HHH K; 2NZT A; 2VWB A; 4C8M A; 3DM2 A; 4JKF A; 5M1N A; 4U67 L; 3F73 A; 1NM1 A; 3BZC A; 3AAR A; 2YHB A; 2EHG A; 3CPE A; 4BGA A; 2RE2 A; 2HST A; 2HB5 A; 4XH4 A; 4L3Q A; 1I3A A; 1EQY A; 4BC2 A; 3I0R A; 2HHX A; 3ZET A; 2YNF A; 1U48 A; 3U8X A; 5GAG P; 1IG9 A; 3ZET B; 4JV5 K; 2GEM A; 4CJK A; 2YX6 A; 4CEB A; 3J8A A; 3NFA A; 4JK8 A; 4CJ7 A; 3LM2 A; 4FWR A; 4B9V A; 1DTT A; 4FJI A; 4DQQ A; 1TV6 A; 4GVE A; 4WF9 L; 4KHP K; 5LY3 A; 4FZY A; 2QKB A; 3KD1 E; 1Z25 A; 4CJT A; 3OS2 A; 4CJW A; 3MK6 A; 4JN4 A; 5AJ3 K; 1QVG M; 3VQE A; 3VQD A; 2B4J A; 3KLI A; 4FM2 A; 3CC2 N; 3DRS A; 3LP3 A; 5C2D A; 4AF1 A; 2YHW A; 5AQJ A; 3EKS A; 1JL2 A; 4DV7 K; 2OYQ A; 3DI6 A; 2FC0 A; 3MED A; 5AQG A; 2DTU A; 1IKV A; 4C1N I; 1JLB A; 4JKH A; 3ZCM A; 4K42 A; 2GX9 A; 4YDU A; 1K6Y A; 1YI2 N; 4IZ9 A; 4PQU A; 4JEP A; 3AGR A; 3ZLJ A; 3RTV A; 4CED A; 4OO1 J; 1EET A; 3SYZ A; 4YOU A; 3V81 A; 3RMB A; 5LMU K; 5CR4 A; 4BQZ A; 1T05 A; 2FBY A; 4CJE A; 5J1E A; 4HCC A; 4MDA A; 4KB0 A; 3MWP A; 4CFA A; 1NGJ A; 1QQC A; 4I6M A; 3M8R A; 1N32 K; 3UKR B; 4I6M B; 3CHW A; 1Q18 A; 2I5J A; 3LDN A; 3E01 A; 4B1W B; 2JWK A; 2UUA K; 1N34 K; 4BRL A; 5HBM A; 1RDW X; 4E7K A; 4FJH A; 3FZF A; 3BF3 A; 5B8H A; 4CJQ A; 1RBR A; 4RW9 A; 4FJG A; 3N4P A; 4OPK A; 3CJB A; 1NMN A; 4KAZ A; 1YHQ N; 2IOC A; 4QS7 A; 1Y64 A; 2W41 A; 4CBU A; 4BAC A; 2Q36 A; 3FZL A; 2CGL A; 3MMV A; 5AQM A; 5BR8 K; 1BCM A; 3SJJ A; 3VEY A; 1IKX A; 3DYA A; 4DSL A; 4FJN A; 4FJ9 A; 2HBL A; 1QSL A; 2DFF A; 2QWN A; 4LSN A; 3D7E O; 5LJW A; 3ALY A; 1KFD A; 2JWL A; 4GMJ B; 3AVH A; 4CGD A; 4BE2 A; 4DU1 A; 2QWR A; 4XH1 A; 2G8W A; 4DV5 K; 1NOY A; 3M1F A; 4QS9 A; 3G71 N; 2OZS A; 5E84 A; 3HST B; 2A1S A; 4R5P A; 1W0H A; 2KZM A; 5EU7 A; 5KGX A; 3VF2 A; 2HHW A; 4CGI A; 3LP1 A; 3I55 N; 2XY6 A; 1KAX A; 3J81 O; 1Q9Y A; 5F0X A; 2YHY A; 5BPM A; 4NB4 A; 1U2V A; 3VER A; 3IS9 A; 1RT1 A; 4BWJ A; 1ATN A; 2QI2 A; 5EXW A; 1IKW A; 3FR0 A; 1RDD A; 1X1P A; 4FJL A; 2PAV A; 4BRQ A; 3HYF A; 3VQ6 A; 1VHX A; 2HHT A; 4FLU A; 1HRH A; 3KK3 A; 5LMN K; 4M42 A; 4Q0B A; 3KD5 E; 1EWQ A; 2I7N A; 4IJN A; 1X9M A; 4E0D A; 2A6A A; 3DXM A; 1TL1 A; 3L4I A; 2FBT A; 1NG9 A; 2QWP A; 4E7J A; 1DEJ A; 2ZJP L; 3CYM A; 4FLX A; 3SMS A; 2FBV A; 2WUS A; 1KSP A; 2EX3 A; 3QES A; 3K0S A; 1MWM A; 3K5M A; 1IBL K; 1TAU A; 4ILH A; 3E1Y A; 2E2N A; 5M1P A; 3RR8 A; 2GUI A; 1XWL A; 4FW1 A; 3Q7B A; 5AQW A; 4CZL A; 5AZI A; 3TAF A; 1HPM A; 3IRX A; 4DV0 K; 5AZI B; 1YUW A; 2FXU A; 4BRA A; 4M3Y A; 3UKU A; 4E19 A; 3C6H A; 2QXF A; 1HJO A; 3UKU B; 2NRZ A; 1KLM A; 1VK0 A; 3THV A; 1Q8I A; 4QS8 A; 2E8A A; 4AM6 A; 3T69 A; 2BUP A; 4CD3 A; 4YOV A; 4IBN A; 4LF4 K; 1KAZ A; 1UWB A; 4M3Z A; 2W6K A; 3WXK A; 1ATR A; 4DHY A; 2VWJ A; 3V4I A; 4CEE A; 3ZSX A; 1N6Q A; 3HBT A; 2O4G A; 2VCP A; 5AQI A; 4DU4 A; 4C8O A; 4DFM A; 3QEV A; 3VQ8 A; 4OGE A; 1HYV A; 4A2A A; 2PFU A; 1ESV A; 5AR0 A; 1TKD A; 4A62 A; 4BRH A; 3B8A X; 4LY7 A; 4CEA A; 4IXC A; 4DSJ A; 1WN7 A; 5FRO A; 5C25 A; 4Y0W A; 1NWK A; 4R79 A; 1WOQ A; 1WAF A; 4WFA L; 1RBV A; 4M3U A; 5AQK A; 1TYQ A; 4CF9 A; 3SUQ A; 2UYT A; 1B9F A; 4CGG A; 4H0O A; 2GBZ A; 1A5X A; 1TYQ B; 3ZT0 A; 4E89 A; 1SAZ A; 3SV4 A; 3TWH A; 3SZ2 A; 1SUQ A; 3OHR A; 3NHG A; 3V9X A; 5M1Q A; 1UAX A; 2HHQ A; 1L3V A; 4KFB A; 4EZ6 A; 3AO3 A; 4C8L A; 4N41 A; 3VGK A; 3NF7 A; 2YHA A; 1NKE A; 2HVI A; 3AAP A; 1SV5 A; 4EIA A; 1S9G A; 4X64 K; 4FLT A; 4BRD A; 1JKH A; 3CIP A; 2AJQ A; 2E1Z A; 4A59 A; 2QEX N; 2X6N A; 4RG8 A; 3M8P A; 3ZX2 A; 4CIF A; 3U9Z A; 5GAD P; 4CJ5 A; 4DQI A; 3VEW A; 2KTQ A; 3D2E A; 3QIC A; 2ZF5 O; 4X65 K; 4IJA A; 2WTU A; 4CHO A; 1L5U A; 1GOC A; 3D2E B; 4E7I A; 4BRM A; 4YFU A; 4KH6 A; 2R7Y A; 5C10 A; 1VQM N; 5C24 A; 4CJU A; 2BE2 A; 4BGB A; 2UUC K; 3IKM A; 2PZS A; 4JHD B; 3VF6 A; 4CZG A; 3SAG A; 4AHR A; 1BHL A; 4DWI A; 3EL2 A; 3PX4 A; 4IDH A; 1XNR K; 1TUY A; 4DR2 K; 3J7Z O; 4W5Q A; 2VG5 A; 4CIG A; 3B6O A; 5AQQ A; 3NAE A; 3O9S A; 4A57 A; 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