4CJ7A

Structure of crenactin, an archeal actin-like protein
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
426
structure length
426
Chain Sequence
SDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
publication title Crenactin from Pyrobaculum Calidifontis is Closely Related to Actin in Structure and Forms Steep Helical Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 105
structure length 426
sequence length 426
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A02
1T44A 3GDQA 4CBUA 4M63C 2P9IB 3KHYA 4LC9B 3U4LA 1JCFA 4BGBA 1ATNA 3G25A 2GUPA 2A42A 2I7PA 2P9KA 4FWOA 4B1VA 3FR0A 4BQZA 3UKUA 5FPNA 1BDGA 4FWKA 3MMVA 3OHRA 3GE1A 5AQTA 1SQKA 3S41A 5F0XA 2FSJA 3W3DA 4BRKA 3MCPA 3ENOA 2D4WA 1J6ZA 2E8AA 3O1WA 3A8YA 1RFQA 2HOEA 4H5NA 5EY4A 3VETA 3M3ZA 4H0XB 1U2VB 2FXUA 4B1WB 3QBXA 1GLCG 1X3MA 1NWKA 2GELA 1DEJA 2Q0UA 5F2RA 4C23A 4L3QA 4BRNA 4DQ8A 1XUPO 1KAZA 2QWLA 2CGJA 4B1YB 3IDHA 5AQLA 1RDWX 4KBOA 2P9PB 4CI6A 1BU6O 5JLFA 5JMVA 1LCUA 1BA1A 3DXMB 3VEWA 3JXUA 4BRIA 1T6DA 4H0VB 4J8FA 3LDNA 3R6MA 4O8KA 4M7XA 4RCHA 2ZWHA 1NMDA 2E2NA 3VGKA 3L0QA 1Q18A 3VOVA 1DKGD 2FF3B 3ID8A 1TUUA 4BR9A 4O5FA 3BUZB 2E1YA 2CH6A 1BO5O 1MDUB 5AQVA 3CJ7A 1OKJA 5AQXA 1U2VA 4IJNA 1KAXA 2HMPA 4H0PA 3U8XA 1ZC6A 2VCPA 2A40A 1HKGA 3I8BA 4BRHA 1NM1A 3IUCA 2V7ZA 3HZ6A 4EFHA 4MLHA 2ZGZA 3ENHA 4CBWA 1GLAG 5CE3A 2E88A 2IVOA 4PL7A 3GBTA 3HBTA 3EN9A 5BPLA 5LJWA 3BF3A 3ZETB 2A41A 2GTDA 2Q36A 2P9PA 3W0LA 3FZFA 3TU5A 2D0OA 1MWMA 1NGEA 3D2FB 3LDOA 2A6AA 3DXMA 3IFRA 5AQUA 4CZJA 3A5LC 4HTLA 5KPTA 4IWVA 2VWBA 4K25A 3DXKB 3FZHA 3JS6A 5AZIB 1S22A 3C7NB 5JICA 2KHOA 3IMXA 4CD3A 2FSKA 3BP8A 5TKYA 3GOIA 4B1XB 3DAWA 4PKHA 2OANA 4B9QA 1QQMA 2FLOA 5BN8A 4BG8A 4JHDB 3VERA 3C0BA 5F1XA 2FSNA 1QZ6A 1NGGA 3R8EA 2NRHA 4BVOA 1S3XA 4QS9A 3QBWA 5AQWA 2YJEA 5AQMA 1HPMA 2P9SA 3VGMA 4H0YB 3ZETA 1TYQB 4K43A 3F9MA 5AZJB 4BG9A 4BRGA 3LM2A 1NGJA 2Q97A 3D2FA 2AP1A 1GLLO 2ASOA 3UE5A 3A5NC 3VEOA 4H0OA 1X9JA 3DXKA 2YHYA 4GNIA 5AQQA 3VEYA 3VF4A 4BR7A 3O6WA 2GWJA 5AFUH 4A61A 4WQ4A 3H6EA 5BPNA 3J8AA 4FWNA 4DB3A 5AQGA 4BR4A 1HKBA 1BWFO 3RSEB 3CQXA 1CZAN 4QS8A 4IXCA 3WEEB 1V4TA 4JN4A 4WYBA 2F9WA 4JHDA 4HWIA 4XH1A 3CJ9A 2QXLA 4WQ4C 3SK3A 2YCHA 5AQNA 3LDLA 3A5OC 3KVGA 3UB5A 4A2BA 4EAHD 3MN7A 4BGAA 5BN9A 1ATSA 2GWKA 3HSCA 1TYQA 2Q0RA 3H3OB 3WQUA 3CQYA 5AQHA 4H5VA 4BR2A 5AQKA 3FFKB 1Y64A 2P9IA 3EZWA 2P9LB 4B1UB 2Q31A 4BR5A 3SMPA 2J4RA 4NO7A 2QWQA 2IVNA 1HJOA 2ZGYA 5BPMA 3R9PA 3L4IA 1Z6RA 4BC5A 2D0PA 3RSEA 3I33A 4IO8A 3ATVA 3QB0A 3H1QA 4M7YA 4BRQA 3WEEA 2E20A 3WUHA 3QFPA 4BRLA 4RTFD 3SJHA 3L6QA 4XH5A 4BRPA 3VEXA 3MN6A 3O8MA 4CZFA 5B8HA 5I9EB 3AAPA 1K8KB 5KPRA 3HTVA 4YDUA 2FF6A 5FPDA 4EIAA 3MK6A 1NGBA 1U6ZA 1YAGA 5ADXA 1EQYA 2P9NB 1YUWA 1C0GA 2P9LA 5ELZA 4FWPA 4FWMA 3A5MC 3ZX2A 2ASMA 3WXKA 1ZXOA 2BUPA 4XH4A 2NLXA 2Q1NA 3D7EO 3ULEB 5AQOA 4BC3A 4H0TB 4K42A 4CD1A 4YDUC 4JD2B 1LOTB 4DCHA 1JCGA 1DGKN 2GEMA 1HX1A 3CJAA 3AY9A 3MN5A 4FWRA 1MWKA 4FOEA 5EOYA 5E26A 1ATRA 2E1ZA 4CJ7A 4CZKA 3LDPA 3O80A 3CJCA 5AQIA 4CZIA 2AA4A 5AQSA 1BA0A 4BRFA 2E2PA 1GLDG 2YI1A 1ZBSA 3BEXA 4BRMA 3QFUA 5AQJA 4FSVA 4BRDA 4IJAA 4B1ZA 4BQLA 1K8KA 3VESA 1QQNA 1G99A 2CH5A 3HM8A 3D2EB 3MN9A 3CJBA 4CBXA 2P9NA 3O5BA 2E2OA 3WXIA 2NZTA 2BTFA 3VF2A 4FL9A 4BROA 3DJCA 2IVPA 3FE1A 1KAYA 3O08A 3AARA 5KQDA 3ULEA 2UYTA 1WOQA 5AQFA 2HF4A 4K41A 2PAVA 2V51B 1MA9B 5AZIA 2A5XA 3MDQA 4E1JA 3C7NA 3CJ1A 5BRDA 4BRAA 3BF1A 5KPZA 5LJVA 2V52B 3EKSA 1RGIA 4PKIA 1C0FA 4FWSA 2EWSA 2ITMA 4AM7A 1R59O 5BR9A 1P8ZA 1NGAA 4DHYA 2V7YA 4BVPA 3WT0A 3CERA 4MLEA 1Z05A 4A2AA 4EHUA 1YXQA 5AQYA 1BUPA 2Q2RA 3FZKA 5JLHA 1NGFA 1JCEA 2I7NA 3ZEUB 4CZLA 3GG4A 3O1BA 2ZF5O 3AAQA 3M6GA 3SMSA 3D2EA 5AQZA 2QWPA 3WXLA 1HKCA 2YJFA 3ZX0A 4EHTA 2W41A 1XQSC 5AZJA 3VF6A 1NBWA 4PL8A 3H45C 1GLEG 1XC3A 1HUXA 3VPZA 2HF3A 2QWRA 5AFUA 1IJJA 1TUYA 2F9TA 5BREA 4FWLA 3CHWA 1H1VA 2W40A 3WQTA 3KZBA 4QS7A 4H5TA 5FPEA 1BOTO 3ZX3A 1GLFO 4GY2B 1GLJO 4BC2A 2DPNA 2A3ZA 3WXJA 2YHXA 4BC4A 1QHAA 3EKUA 4H5WA 3FZMA 4CZHA 2QWMA 4BREA 1X3NA 2QW9A 5EXWA 2QM1A 2P9UB 5ADXH 1T6CA 3ZEUA 4RWTA 3CI5A 4H03B 2PBDA 3VENA 5BRFA 4IZ9A 5AQRA 4PKGA 1NGHA 5KQ8A 1NGDA 2D1KA 3UKRB 3H3NO 2CGKA 5LY3A 5E84A 3U9ZA 1SZ2A 4F9OA 1NGCA 1WUAA 1E4FT 1SAZA 3TPQA 2QWNA 2VYPA 4JNEA 3P4IA 2CGLA 4JAXA 4AM6A 3A0IX 3FLCO 4NB4A 4FO0A 4Y0WA 3B8AX 3QMLA 4A62A 1NLVA 3M1FA 1ESVA 3ATUA 3CIPA 1HLUA 2H3GX 1D4XA 3FGUA 4CZGA 5FPMA 1NGIA 3CETA 3SLCA 4Z94A 4ISGA 2P9SB 3QICA 4I6MB 4ISEA 2YHWA 1QZ5A 3VEVA 1YVNA 2P9UA 3GL1A 3LM9A 1GLBG 1KXPA 3HI0A 5AQPA 3U9DA 2E2QA 4BR0A 1IG8A 2P9KB 4FOIA 3UKRA 2IIRA 4ISFA 3EL2A 2ASPA 3UKUB 1E4GT 5EVZA 3EO3A 4WQ5A 5EX5A 4FPAA 1QQOA 4FPBA 5AR0A 5BRHA 3DWLA 3LDQA 3QDKA 2WUSA 1BG3A 4CZMA 4FWQA 3LL3A 4JD2A 3VGLA 3VEZA 4CZEA 3H46O 3O4WA 4MO5A 4WQ5C 1V4SA 4H5RA 4BRCA 4MO4A 4I6MA 2QWOA 3FZLA 4XEIA 3H1VX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HP1A 1T44A 4ELVA 1BI4B 3G0ZA 4BGBA 1U49A 3O4QA 4A5BA 5KGWA 3AVKA 4FWOA 1FXXA 4RW4A 3L2RA 4PUOA 3UKUA 3MMVA 1Q8IA 3GE1A 4E1NA 3EE8A 1L3TA 3W3DA 1RDCA 4JI4K 3M8RA 1RDDA 3A8YA 1YIJN 1Z25A 4JK9A 5EY4A 5FDLA 1U2VB 3QBXA 4CIEA 4KRFA 2D5RA 3RMBA 4CFBA 3M8PA 2ZJRL 1XNRK 3PIPL 2KLAA 3J7AP 4BRNA 1BI4A 1VQMN 4M3TA 1RDAA 1WSIA 1VSKA 1RDWX 4X64K 3SQ1A 4EZ9A 3HK2A 4B9LA 4JKDA 3O4NA 2ZD1A 3SI6A 4KB1A 1ITGA 2E2NA 3DM2A 3VGKA 3KTQA 2FF3B 1RT6A 4DU1A 1HRHA 3KD5E 3VTHA 3U6FA 3Q7BA 2E1YA 4KHPK 4JKHA 1MDUB 4CE9A 1U48A 1VSMA 5AQXA 1U2VA 1KAXA 2HMPA 4CJVA 4IBNA 3V1OA 1ZC6A 3I8BA 3JSMA 1ZYQA 5AJ3K 2D0AA 3IUCA 5GAGP 4KH5A 2ZGZA 3ENHA 3OYNA 2E88A 1W7AA 5LJWA 3EN9A 3ZETB 2GTDA 4DV1K 4C8NA 4CZJA 5KPTA 4YOUA 3OYKA 4FM0A 4OVLA 2KHOA 3HT3A 2ZE2A 4JI7K 1QHTA 2FSKA 1K9MO 5TKYA 4B1XB 3AA4A 4WFAL 4B9QA 1QQMA 4FLYA 3THYB 1VRTA 3C0BA 3P31A 5F1XA 1WSHA 1VK0A 4C8LA 1QZ6A 1IKWA 2HHHK 1RBSA 4BVOA 1S3XA 3CXCM 1BCMA 3QBWA 4B08A 5IT9O 1M90O 3ZETA 1TYQB 4X62K 4K43A 3F9MA 5CR4A 1TKZA 3O9SA 3LM2A 3CCJN 1VHXA 1GLLO 3CG7A 3A5NC 4ELUA 3E9LA 1X9JA 3VQQA 1NJXA 3VF4A 3ITHA 3O6WA 1D5AA 2DFHA 5C24A 2NRXA 4DFJA 3P38A 4FJXA 2UUCK 1RBRA 2PYLA 4EP4A 1O13A 4HTUA 1BWFO 1QS4A 3I55N 2XY6A 3TTCA 3L3VA 4IXCA 1E3MA 3THYA 1WAFA 3HSTB 4XH1A 2VQEK 3U3YA 4KH6A 3SK3A 2YCHA 5AQNA 1RTJA 2HSTA 3KVGA 3MN7A 4BGAA 5CYMA 1HNIA 2Z1IA 1ATSA 5BN9A 1TYQA 3H3OB 3WQUA 2YV0X 3K5LA 1Y64A 2BH1A 4DTPA 2RKIA 1EO1A 3O9RA 1KLMA 3T1AA 3IAYA 3ZSRA 3THVA 2ZGYA 3CYMA 3OTOK 3G6EN 4FJIA 1RNHA 1OVQA 5KRTA 3PY8A 3WUHA 1WSFA 3KLHA 1Q82O 2OPSA 2A1RA 4XH5A 3OYMA 1Q9XA 2EX3A 3TR8A 5B8HA 4ELTA 4DSLA 3CCMN 4CERA 5DM6L 3HTVA 4YDUA 1LAWA 4FVUA 5FPDA 3DRSA 3MK6A 1U6ZA 1I94K 4ICLA 4HVJA 2FBXA 1DTQA 5M1PA 3A5MC 4X65K 3I56N 2F7TA 2ASMA 2DFFA 4KFBA 3AGKA 4KHWA 4CGGA 4XH4A 4Z4HA 2FBYA 4BC3A 2HBMA 3VQCA 4CD1A 1NK4A 4DQIA 5KGXA 3OVNA 3QO9A 1J53A 4DG1A 3TAPA 2NRTA 1DGKN 2FBTA 1XNQK 1MWKA 2ZJPL 4FJ9A 2E1ZA 1KCFA 5AQIA 4DSIA 1U04A 2YNIA 2AA4A 4NYFA 5GAHP 5AQSA 1JLBA 3AO2A 2YI1A 4AILC 4JK8A 4FSVA 5J2MA 4IJAA 4CCHA 4UY8O 1JLAA 3THWA 3MXIA 2X6SA 3NH1A 1BIUA 3MN9A 3CJBA 4CJEA 2P5GA 2ZQBA 1I39A 1J5OA 2E2OA 3SAHA 2BTFA 2IGIA 5FRMA 3OYCA 3VQ8A 4CJFA 4JKGB 3ZSXA 1K73O 4N41A 2RPIA 3ISNC 2G8KA 4OPKA 4K41A 1TL1A 4IOCL 4E1JA 3C7NA 3SPYA 2PZSA 4BRAA 3BF1A 4JEPA 4FLWA 2EWSA 5BR9A 1VSFA 1B92A 2VG5A 3MAQA 1X1PA 1RTIA 3AVHA 3WT0A 4OPHA 4FXDA 5LL6Z 3CERA 4MLEA 1Z05A 4A2AA 1W9HA 1VAZA 1EETA 3HP6A 1BGXT 4O55A 1OH5A 1ASWA 1X9WA 3L4QA 2UUBK 3GG4A 3SNNA 3VMFB 3SUOA 4M45A 3K2PA 4IOXA 4DFPA 4JKGA 4BE2A 1NBWA 3TANA 3G71N 1UA0A 4CEAA 4FLUA 3H45C 1HNWK 1XC3A 2HF3A 1TAQA 1RTHA 4OPAA 1TUYA 3RWUA 3THXB 3CPWM 4JV5K 3VQ9A 4RG8A 2HNZA 1GLFO 3OYAA 3IS9A 3MCAB 4BC4A 1QHAA 3QEPA 2RN2A 1X3NA 1HR0K 4AHTA 1T6CA 4H03B 4QOZB 4B3TK 1C6VA 1RDBA 5BRFA 4IZ9A 1NK8A 1SS6A 3CF5L 4N47A 2YX6A 2D1KA 5E84A 4AF1A 1VQON 5HRRA 3SPZA 1HYZA 1WUAA 2JGUA 3NF8A 1SAZA 4OPJA 3HYFA 3P4IA 4IFEA 4AM6A 3FLCO 4NB4A 1NJYA 3BGRA 3OYIA 1KLNA 2KZMA 3KKRA 5CZ2A 3P39A 3KK2A 2YKNA 1RT5A 3OS1A 4DF4A 1D4XA 1C1AA 5HLFA 2JLEA 3EEQA 1RCHA 4Z94A 4ISGA 4JI0K 4YOXA 4GV9A 2P9SB 3VEVA 3ZT3A 3GL1A 1J9AA 3ZT0A 1GLBG 4F8RA 1D9DA 4YOWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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