4CJ7A

Structure of crenactin, an archeal actin-like protein
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
426
structure length
426
Chain Sequence
SDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crenactin from Pyrobaculum Calidifontis is Closely Related to Actin in Structure and Forms Steep Helical Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
total genus 105
structure length 426
sequence length 426
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A02
2I7PA 4K41A 1NM1A 4FOEA 4H0VB 2Q0RA 3MCPA 1NGGA 3O08A 5AQMA 3O4WA 2FF3B 4A2AA 4FPAA 1BOTO 4BRIA 5AQSA 4XH1A 2IIRA 3I33A 3UKRB 5FPMA 3ZETB 1EQYA 3MN9A 1D4XA 3ZEUB 5AQXA 1TUUA 4BR2A 3WXKA 2UYTA 2GELA 5KPRA 4H5VA 5BPMA 2E88A 3SK3A 3H45C 4BR7A 2HOEA 4F9OA 3R6MA 3QICA 3H1QA 4HWIA 3WXJA 3VETA 2P9UB 1CZAN 3J8AA 1NGBA 3SJHA 3VERA 3GL1A 5JMVA 2QW9A 2PAVA 2P9LB 4CZMA 3FLCO 5AQLA 3QB0A 2IVPA 4NB4A 1NGCA 4J8FA 1NGAA 4BRDA 1ZBSA 3KHYA 3ENHA 2Q97A 4H0OA 2VYPA 3FZMA 3LDLA 3TPQA 5AQNA 1J6ZA 3WXIA 2FF6A 2Q1NA 1LOTB 2V7ZA 4PL7A 5EY4A 1NBWA 3VF6A 1SAZA 2E1ZA 3OHRA 1QQOA 3RSEB 2W41A 4JD2B 3CERA 5AQPA 5F0XA 2ZWHA 3CJCA 3WEEA 2A41A 4CZKA 4CI6A 3GDQA 3EKSA 2FXUA 3S41A 4FWRA 2W40A 1YVNA 2NRHA 3H6EA 4ISEA 2Q0UA 3CJAA 3UKRA 3ZETA 3WT0A 3ZEUA 2HF3A 4PKIA 2E1YA 3CJBA 5AQZA 2EWSA 2E2QA 4CJ7A 4BR5A 2VWBA 4KBOA 2ZGZA 5AQTA 4BRQA 3DWLA 5AFUA 1Z6RA 5AQFA 3O1WA 4BRFA 4M63C 4H0TB 5ADXH 3QMLA 2GEMA 1R59O 1KAYA 4IZ9A 2FLOA 1QQNA 4EAHD 1MA9B 3M6GA 3U4LA 4DHYA 2ASOA 2P9LA 3LDQA 3DXKB 5I9EB 5KPTA 2ZGYA 4BR0A 1ZC6A 4PKGA 1Z05A 3CJ1A 4IJNA 3D2FA 4MLEA 3AARA 1X3MA 4O8KA 4FWSA 2AP1A 2YI1A 2CGLA 3LDPA 1MWMA 4FWPA 3SLCA 1QQMA 4FSVA 3U8XA 2A42A 3AAQA 4PKHA 3VEVA 4B1VA 4I6MB 1NGDA 5AQRA 5EX5A 2CH5A 3MDQA 3M1FA 1NGHA 1DEJA 2P9SA 3RSEA 3A0IX 2P9IB 2QXLA 3FZLA 1GLLO 4RCHA 3CHWA 4CBXA 3ENOA 3MN6A 1T6CA 3MMVA 1TYQB 3A5MC 2E8AA 2HMPA 4BC4A 3LM9A 3UKUB 1V4SA 1U6ZA 4O5FA 3IUCA 2QWQA 4EIAA 4H0PA 4Z94A 3EKUA 5CE3A 4JNEA 3CJ7A 5AZIB 3L0QA 5E84A 3DXMB 4BRPA 4BVPA 3U9DA 4BC3A 2QWRA 1RGIA 4K42A 4M7XA 4YDUC 5BPLA 4A2BA 5BREA 4BRHA 5BN9A 4BGAA 2QWLA 4BRGA 1JCGA 3VESA 1HJOA 1GLFO 5AZJB 4H0YB 2P9PB 1XC3A 4AM6A 5BN8A 5AR0A 4CZFA 2I7NA 4WQ5A 1Y64A 2ITMA 1BU6O 4FWQA 3O6WA 4RTFD 4BC2A 3H3OB 5TKYA 4BRNA 4BR4A 4IJAA 2A40A 2CGJA 3KZBA 3TU5A 1HKGA 2ZF5O 3IFRA 4FO0A 3I8BA 3VGLA 3CIPA 1BUPA 1OKJA 3CJ9A 1GLJO 3FZKA 4H5WA 4EHTA 1U2VB 1TUYA 5FPDA 5JICA 3HBTA 4BGBA 3O1BA 3JS6A 3BUZB 5E26A 1ESVA 4B1XB 4I6MA 2YHYA 3QDKA 3M3ZA 2IVNA 3IDHA 1BDGA 4DCHA 2D1KA 2P9IA 2YHWA 4WYBA 1S3XA 4MO5A 1YUWA 3D2EA 4FWMA 4NO7A 5AQUA 3H1VX 3R9PA 2D0OA 2A3ZA 1QZ5A 2YJFA 4BRLA 5BPNA 1T44A 1K8KB 4E1JA 5AQIA 3BEXA 4H5NA 3U9ZA 1C0FA 3GE1A 3VF2A 4DQ8A 5KQ8A 2F9WA 4CBUA 4BROA 4GNIA 3FR0A 1Q18A 3VEYA 5AQVA 5AFUH 1BG3A 4FWOA 2CH6A 2P9KB 4MLHA 4PL8A 1IG8A 2GWKA 4RWTA 4WQ4A 3VEWA 4C23A 2A6AA 5AQGA 3QBXA 2P9UA 2Q31A 3JXUA 1E4FT 4BVOA 5BRDA 3W3DA 1HPMA 2P9PA 3UB5A 3HTVA 3VOVA 3WXLA 3MN5A 2P9NB 5EOYA 2YJEA 3GG4A 3MK6A 2GUPA 4ISGA 1ATRA 3EO3A 3B8AX 3EN9A 1V4TA 5FPEA 3F9MA 2BTFA 5EVZA 3AY9A 4L3QA 1ATSA 3L4IA 4XH5A 1U2VA 4H03B 4FWLA 2FSNA 4BC5A 4FWNA 4LC9B 1GLBG 5F2RA 3O80A 1YAGA 4M7YA 4IWVA 4A62A 4EHUA 1JCFA 2FSJA 4JD2A 2FSKA 3O5BA 2YCHA 3D7EO 3WUHA 1E4GT 3DAWA 4FL9A 5AQJA 2AA4A 1NGFA 5JLFA 3C7NB 4H0XB 4CD1A 5AQWA 3P4IA 3A5NC 1ATNA 2BUPA 5KPZA 1K8KA 1ZXOA 4BRAA 4A61A 5ELZA 4CZGA 3H3NO 5BRHA 5F1XA 2J4RA 3ATVA 3CQYA 5AQYA 1GLEG 4CZIA 2F9TA 3C0BA 4JHDB 3VENA 1GLDG 5JLHA 3MN7A 1RFQA 1BWFO 2P9KA 1X3NA 2PBDA 1H1VA 3CQXA 3BP8A 1T6DA 3ZX0A 3HM8A 2GTDA 3O8MA 1QZ6A 4BRMA 3DJCA 1NGJA 2QWOA 4DB3A 5KQDA 1GLCG 3CETA 1KAZA 5B8HA 3SMSA 1C0GA 2IVOA 1MDUB 4EFHA 1IJJA 3DXKA 2P9NA 4AM7A 4CZJA 2KHOA 2Q36A 5LY3A 3KVGA 1BA0A 4BRKA 4BREA 1DGKN 3HI0A 3QBWA 3WQTA 3QFPA 3CI5A 3FZHA 3EL2A 5AQOA 3SMPA 1JCEA 1X9JA 3VGMA 4B1UB 5LJWA 2E20A 2WUSA 1NWKA 2V52B 4BQZA 1WUAA 3ULEB 3VGKA 4CBWA 1HKCA 4CZHA 4IXCA 3A8YA 4BRCA 1P8ZA 1KAXA 1XUPO 3HSCA 5EXWA 4BQLA 3C7NA 3D2FB 1TYQA 3GBTA 3W0LA 3BF3A 3LM2A 3UKUA 4B9QA 1MWKA 1GLAG 3VF4A 3A5OC 5AZIA 3R8EA 2GWJA 3DXMA 2DPNA 1NGEA 2QWNA 3A5LC 2P9SB 3EZWA 4JHDA 1BA1A 4K25A 3IMXA 4H5TA 2D0PA 2HF4A 4QS9A 3G25A 2E2NA 1WOQA 3VEOA 3LDOA 2V7YA 2YHXA 3QFUA 1SZ2A 1G99A 2Q2RA 3GOIA 4MO4A 4QS8A 4CD3A 4CZEA 2ASPA 3L6QA 2ASMA 2A5XA 3ID8A 4WQ5C 4BG8A 5AZJA 2QWMA 4QS7A 4B1YB 2D4WA 4H5RA 4B1WB 4FPBA 3ATUA 5FPNA 4XH4A 5AQQA 3VPZA 1SQKA 2E2OA 4FWKA 1LCUA 3ZX2A 4B1ZA 3FZFA 3LL3A 4YDUA 3LDNA 1KXPA 3FE1A 4HTLA 1NMDA 1HLUA 4BR9A 5ADXA 1NLVA 1NGIA 1RDWX 3ULEA 2VCPA 2NLXA 5BR9A 2NZTA 2QWPA 3WQUA 1XQSC 2OANA 2E2PA 4CZLA 1HUXA 3FGUA 3UE5A 5AQHA 1HKBA 5LJVA 3FFKB 1DKGD 2V51B 1BO5O 4FOIA 3VEZA 2CGKA 3HZ6A 1QHAA 4JN4A 1YXQA 3VEXA 4BG9A 2H3GX 1HX1A 4GY2B 5BRFA 2QM1A 4WQ4C 4ISFA 3H46O 3BF1A 3ZX3A 3D2EB 4K43A 4JAXA 4Y0WA 3AAPA 3WEEB 4XEIA 5AQKA 1S22A 4IO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FOEA 1IKVA 4DLEA 3AGKA 4U67L 4OO1J 2FF3B 4DV4K 4FPAA 5M1KA 1BOTO 1EETA 2IIRA 4FLZA 3MN9A 1D4XA 4Z4FA 1KFDA 4FJKA 2NRZA 1D8YA 1SL0A 4H5VA 1RT3A 3H45C 1RBTA 2D5RA 3R6MA 1NK0A 3QICA 4HWIA 5HROA 2PFUA 4NXMK 4RW7A 5CY4A 5KGXA 2QW9A 2NRXA 4CEEA 1Q81O 1HNIA 2WBNA 1XNQK 1J54A 3NFAA 3WNHA 2YNGA 4UY8O 4BRDA 2F7TA 3ENHA 4H0OA 3C6AA 1S6PA 3TPQA 4PA1A 4NYNA 3AA4A 1J6ZA 2FF6A 1LOTB 4CJFA 1N36K 5EY4A 4F4KA 1NOZA 2E1ZA 3JAMO 1QQOA 3RSEB 3HPOA 2HHHK 1IBLK 4JD2B 4CJLA 1W7AA 3WEEA 2A41A 4HVJA 3O3FA 4KHNA 1TKDA 5CZ2A 4FWRA 3KIOA 1ZBLA 2W6LA 2Q0UA 3UKRA 3ZETA 4AH9A 5HL7L 5FLXO 1K9MO 4FJ8A 5AQZA 1HQEA 2VWBA 4DQIA 3TABA 5C15A 4PHTX 4KBOA 3OBWA 4I9LA 4CF2A 3CPEA 5AQFA 3O1WA 4H0TB 1R59O 1WSJA 4IZ9A 2FLOA 2AJQA 3U4LA 3CQ8A 2XRIA 4X64K 3T3FA 5JVGL 3ULDA 3G71N 3V6DA 2ZGYA 1ZC6A 5I42A 4PKGA 1A5VA 4C8NA 1JXBA 2E5LK 2CGLA 3SLCA 4FWPA 4FSVA 1NK9A 3ENBA 3NF6A 4NXNK 5AQRA 3PX0A 3A0IX 2P9IB 2QXLA 2Y1IA 3DYAA 4RCHA 4CBXA 5CR4A 4QAGA 3OYBA 1KFSA 3MN6A 3MMVA 1TYQB 3KLHA 1T05A 1CXUA 4O5FA 3IUCA 3NF9A 3EKUA 3LZIA 4JK8A 4DV6K 1T7PA 5AZIB 4BRPA 3DXMB 2DFHA 2O8BB 1JKHA 2PY5A 3S3NA 2QWRA 3J7AP 1C1CA 3PIPL 4M7XA 1YTAA 1OH5A 4CJUA 1RT1A 3K5MA 2KZMA 2O8FB 4BRGA 4CFDA 3THYB 4C1NI 3I0RA 1GLFO 2OPRA 5AZJB 3ZT2A 4LH4A 5AR0A 1Y64A 4Q5VA 4XIUA 4FJ7A 1IV0A 4BC2A 4KREA 4BR4A 4IJAA 3TAQA 3KZBA 3TSUA 4ID5A 4CJPA 3PSIA 3V1OA 5HRNA 2OA8A 4FCYA 3K58A 2G8IA 4B9TA 3CIPA 5MLCQ 3EYZA 1XI1A 3SBGA 1HYVA 1VQLN 1GLJO 4H5WA 4R5PA 1TUYA 5FPDA 5C12A 2VQEK 5HP1A 3KJVA 5E41A 3QDKA 3M3ZA 2ZJQL 3IDHA 1U4BA 4JKFA 3LWLA 1KCFA 4B3MK 1TK0A 3R9PA 3H1VX 1K73O 3QNNA 4L8RB 4DTNA 3RR7A 3DRRA 1QZ5A 3TAPA 2YKMA 3AVCA 1YJWN 3G10A 1LWEA 4BE2A 5AQIA 3BEXA 4H5NA 3U9ZA 3GE1A 2F9WA 4BROA 3TARA 3SPYA 1A5XA 1YJNN 4FZXC 3SI6A 1JXEA 5AQVA 3SAHA 4OPHA 2NNWA 1SS6A 4M3UA 2QA4N 1IG9A 2CH6A 2P9KB 3B6PA 1IG8A 2GWKA 4WQ4A 4FM2A 1S1WA 2BE2A 1JLQA 4LF5K 3DI6A 3RVCA 3QBXA 2Q31A 2FBTA 4FJGA 2XY7A 3W3DA 3AGRA 5K14A 3CFRA 3PY8A 2P9PA 4CFCA 4E1NA 3TWHA 3K9KA 2QK9A 2QEXN 4PWDA 3L3VA 4OJRA 3GG4A 3T19A 3AA5X 5IT9O 2WFBA 4DR3K 1ATRA 1B9FA 2R7YA 1V4TA 3F9MA 3E9LA 4EZ6A 1J5OA 5DMRA 3RWUA 2EHGA 4OKJA 1GLBG 5F2RA 1YAGA 4DLGA 4M7YA 4IWVA 3QIOA 1RT7A 2FSKA 3MEGA 3O5BA 5GAGP 1BQNA 2YCHA 1E4GT 3DAWA 4IG0A 5AQJA 4IOXA 4OX9K 4CD1A 5AQWA 3P4IA 2BANA 3QETA 4M41A 3C6UA 1K8KA 2JGUA 2KZZA 4A61A 3H3NO 2J4RA 2X78A 3QEIA 4FLXA 5KRTA 3VENA 4JKHA 3ZSXA 1TK8A 1X3NA 1S5JA 5HRSA 2G8VA 4DQSA 1JLBA 1VRTA 3HM8A 1WSHA 2GTDA 3DJCA 4DUZK 5B8HA 1JLGA 4AHTA 2KFZA 4OGEA 4EFHA 3DOLA 3AO2A 2I5JA 4IDHA 4CZJA 3ZYYX 1NJXA 2ZJRL 1U48A 4IG3A 1DGKN 4IO9L 4E3SA 4EZ9A 4FK2A 3OYLA 4JI2K 2HHSA 3C6HA 3O4NA 1X9JA 3LAMA 3VGMA 4JS5A 2OCEA 1NWKA 4DV0K 3ULEB 3VGKA 1HKCA 4E7KA 1C0TA 2ETJA 1SKSA 4FJIA 4CIFA 3D2FB 3SZ2A 4IEIA 3CC2N 2KKZA 1NJZA 3W0LA 3P31A 1VSLA 1Z26A 4JKEA 1X9SA 3KK3A 3OY9A 1WAJA 1C1AA 3A5OC 1VQMN 4CIGA 3HPGA 2G8FA 2Z1JA 3V4IA 5CYQA 2WTUA 4ILGB 3IMXA 4H5TA 2D0PA 4W5NA 3VEOA 4MO4A 3KD1E 2FBYA 2ASPA 3EEQA 4AHCA 3ZT3A 1WLJA 1GOCA 5AQQA 4M3YA 3OYKA 3P83D 3CCRN 2HSTA 4JV5K 3ZX2A 1N34K 4JLHA 3O9QA 1HNXK 2HW3A 3LP0A 4R79A 4BR9A 3G6EN 4DSIA 1NLVA 1NGIA 1LV5A 1ASVA 2VCPA 2QWPA 1XQSC 2E2PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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