4CJ7A

Structure of crenactin, an archeal actin-like protein
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
426
structure length
426
Chain Sequence
SDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
publication title Crenactin from Pyrobaculum Calidifontis is Closely Related to Actin in Structure and Forms Steep Helical Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
molecule tags Structural protein
total genus 105
structure length 426
sequence length 426
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A02
1HKBA 4BR7A 4B1UB 4BG9A 1OKJA 3UE5A 3O1WA 2V51B 4H5VA 1SZ2A 1MA9B 3ATUA 3QFPA 3I33A 3B8AX 1GLLO 3C7NA 4LC9B 1MDUB 1HPMA 3DXKB 4PKGA 1GLBG 3AARA 5BPNA 3R8EA 5B8HA 2QWNA 5EXWA 4CZGA 1NGIA 4BR9A 3DWLA 4JD2A 3EO3A 2FF6A 2A40A 2GWJA 2P9UB 3CQXA 3DXKA 1ZBSA 3M1FA 3FZHA 2FLOA 2QWQA 2E8AA 4BG8A 2HF3A 4EFHA 1NGAA 1YVNA 4BRPA 4CZHA 3VF2A 4BR2A 3CHWA 1S22A 4BQZA 2ITMA 2VWBA 3LDNA 5AQVA 3D2FB 1NGFA 2FXUA 3H1VX 3WXLA 1NGCA 4GY2B 5JLFA 2P9IB 4WQ5A 4A62A 3DXMB 3VEOA 5F1XA 2YJEA 3U9ZA 1H1VA 1TUYA 5FPEA 1HKCA 5KPTA 1GLFO 1T6CA 1WUAA 1BG3A 1K8KB 3QBXA 1C0FA 4XH5A 2P9IA 4FWOA 5LY3A 3LL3A 3DXMA 5E26A 4H5RA 4PKHA 4JHDB 4DCHA 3A0IX 3CIPA 3ATVA 3SJHA 3SMPA 3S41A 2ZGYA 3WT0A 5AZJB 4CZFA 2GEMA 2BTFA 2HF4A 3VENA 3ZEUB 2CH5A 4JHDA 4FOEA 3ULEB 2GUPA 2IVNA 3HI0A 3DAWA 3HM8A 3WXIA 2QWMA 4A2BA 5FPDA 4FOIA 3CJBA 5KQ8A 5AZJA 2D0OA 1XQSC 2P9LB 3VEWA 1TYQB 2Q97A 1ATNA 4BQLA 3CJ7A 1U6ZA 2PBDA 1E4GT 3ULEA 1GLEG 2E2PA 5AZIB 5AFUA 3C0BA 2NLXA 4L3QA 1Q18A 3D2EB 1U2VB 4MO4A 4CD3A 1GLDG 3VF6A 5ADXA 1XUPO 2GTDA 2QWOA 4RCHA 3VGLA 3ZETB 1X3MA 1BO5O 5AQYA 2CH6A 4JAXA 3FGUA 2IIRA 4BRHA 3CERA 4BRLA 3D2EA 3MN9A 2H3GX 4WQ4C 1U2VA 3MN5A 2D1KA 3M3ZA 4H0PA 1HKGA 2ZF5O 1Y64A 1BA0A 3ZETA 3VEYA 3P4IA 1NGHA 5AQUA 2E88A 4B1WB 2QWLA 1X9JA 3D7EO 5KQDA 3O6WA 3IUCA 1JCEA 3GE1A 5TKYA 4BROA 3EZWA 4YDUC 1NGEA 2Q0RA 3IFRA 4B9QA 4KBOA 2E20A 4FWRA 2F9WA 3FZMA 1ESVA 5FPNA 1BDGA 2GELA 4BVOA 4H5WA 3MK6A 5KPZA 4RTFD 3EN9A 1GLAG 1T6DA 3H1QA 2V7YA 4JNEA 4BRCA 4C23A 2AP1A 3CETA 2BUPA 3GG4A 5BRDA 2DPNA 3IDHA 2ZGZA 4JD2B 2P9SA 2E2NA 5ELZA 4A61A 5AQZA 2W41A 4FWSA 2Q31A 2A42A 3H6EA 1J6ZA 5AQWA 5JMVA 2EWSA 2QM1A 4B1ZA 3VEXA 4IJAA 3GL1A 1NM1A 3SLCA 5BR9A 3ENOA 4K25A 4EHUA 3UKUA 3U4LA 3MN6A 1RGIA 2NZTA 4BGBA 4M7YA 4H0TB 1V4TA 3A5LC 4FO0A 1X3NA 3LDQA 3ZX2A 4XEIA 3HSCA 5AR0A 4AM6A 4BR4A 5AQJA 4BC4A 5AQGA 4FWLA 5JLHA 2E2OA 3KVGA 4QS8A 4FWNA 3MDQA 3IMXA 1HUXA 1QQMA 1D4XA 3VF4A 4BC5A 5AQTA 3ZX3A 2AA4A 1DKGD 3VESA 3FZFA 3VGMA 3WEEB 2ASOA 4CBXA 3A5MC 4CZIA 3WXKA 1KXPA 3HBTA 4XH4A 4EIAA 5BRHA 3VOVA 3DJCA 3WEEA 4BRDA 4I6MA 5AQFA 1QZ6A 3LDPA 3O1BA 4K43A 4WQ5C 5BRFA 1JCGA 3BUZB 3HZ6A 5AQXA 3GOIA 2YI1A 1GLCG 3VGKA 1QHAA 3FZLA 1XC3A 3O8MA 4K41A 1QZ5A 1YUWA 2IVOA 4H0VB 2OANA 4FWKA 3KHYA 4IWVA 3A8YA 3WQUA 1NGBA 3CJAA 1KAZA 1S3XA 3U9DA 4DHYA 1IG8A 4FWPA 4IXCA 2UYTA 4FPBA 4ISFA 2FF3B 5EX5A 2PAVA 5AQIA 3UKRA 4BR0A 4CZEA 1ZC6A 2QW9A 2D4WA 4MLHA 5BPLA 3BP8A 1SAZA 3CJ9A 3EKUA 4H0XB 2QWRA 1T44A 3H3NO 5AQHA 4BRGA 1Z05A 2P9PA 4BRFA 1NBWA 3HTVA 3O08A 4A2AA 4CBWA 3MN7A 2ASPA 3VETA 2QWPA 5E84A 3WUHA 3W3DA 1ATRA 4O5FA 5AQSA 2QXLA 3LDLA 4YDUA 5AQMA 3TU5A 4BR5A 1BWFO 3FLCO 4FPAA 4CJ7A 3I8BA 4PL8A 5FPMA 1IJJA 1KAXA 2W40A 3RSEA 5EY4A 1BA1A 2IVPA 3CQYA 3QFUA 4XH1A 4DQ8A 2Q2RA 3SMSA 4QS7A 1C0GA 2P9SB 4CZMA 1BU6O 4ISEA 1NGGA 3FE1A 5KPRA 2P9NA 4JN4A 2CGLA 5AQKA 3ZX0A 2YJFA 2FSKA 2CGKA 2A6AA 3W0LA 3EKSA 4ISGA 2D0PA 2VCPA 3FZKA 1ZXOA 3MMVA 3UKUB 1KAYA 5F2RA 3VERA 3O5BA 4BGAA 4FWQA 1NGJA 4H0YB 5EOYA 2YHYA 1MWKA 4H5TA 1NMDA 4B1YB 5AQNA 3QBWA 1HJOA 4IZ9A 3U8XA 1HLUA 2E2QA 3VEZA 2NRHA 2A41A 4IJNA 2WUSA 3M6GA 5AQRA 2FSJA 3MCPA 5BREA 3WQTA 4AM7A 1MWMA 5BN9A 1CZAN 2A5XA 4BRMA 1RFQA 4NO7A 3FFKB 5CE3A 5AQLA 3H46O 2J4RA 2E1YA 4K42A 4DB3A 2YCHA 1NGDA 2A3ZA 3O80A 1P8ZA 4FL9A 2FSNA 3EL2A 1TUUA 4M7XA 5I9EB 2I7NA 3CJCA 2HOEA 3LDOA 3LM9A 4I6MB 2Q36A 1DGKN 1SQKA 2CGJA 2ASMA 3A5NC 2P9UA 4O8KA 5BPMA 5AQQA 3BF3A 3QDKA 3BEXA 3TPQA 5AQOA 1ATSA 4BC3A 1BUPA 3D2FA 4RWTA 1HX1A 4BRIA 4MLEA 2E1ZA 3JS6A 1EQYA 4MO5A 1R59O 4J8FA 3UKRB 2Q1NA 4CZLA 3L0QA 3QB0A 3FR0A 1V4SA 3GBTA 1DEJA 4NB4A 4CZKA 4BREA 3QMLA 1K8KA 2VYPA 1LOTB 2HMPA 3AAPA 3WXJA 4Z94A 3R6MA 4IO8A 3GDQA 4BRKA 4E1JA 5LJWA 3JXUA 2P9PB 4CBUA 5BN8A 4CI6A 2YHXA 4QS9A 3AY9A 5AQPA 4WQ4A 3A5OC 1NWKA 1QQOA 1Z6RA 3G25A 1LCUA 1GLJO 4B1VA 5AFUH 3VEVA 4M63C 3L6QA 2F9TA 3ZEUA 3BF1A 3QICA 3RSEB 4BVPA 3UB5A 5ADXH 2KHOA 1WOQA 1G99A 4H03B 3O4WA 3LM2A 2P9LA 1TYQA 4FSVA 4HTLA 4CZJA 3F9MA 4EAHD 1RDWX 4BRQA 2P9NB 3H45C 1BOTO 5AZIA 3SK3A 2YHWA 4H0OA 5EVZA 3AAQA 4CD1A 4F9OA 4PL7A 2ZWHA 3H3OB 5F0XA 4H5NA 4FWMA 3CI5A 1YAGA 3KZBA 1E4FT 3CJ1A 4HWIA 5JICA 3L4IA 3VPZA 1JCFA 4BRNA 2I7PA 2P9KB 4PKIA 4B1XB 3ENHA 4BC2A 4WYBA 1YXQA 2V52B 4BRAA 3OHRA 2V7ZA 4EHTA 1QQNA 1NLVA 4GNIA 3J8AA 2GWKA 4Y0WA 3R9PA 3ID8A 2Q0UA 3C7NB 2P9KA 5LJVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TSUA 3IAYA 4O0JA 5M1FA 2QKKA 1OKJA 2V51B 4H5VA 1BIUA 1SZ2A 2D0BA 1RT2A 2VG5A 2VG6A 4CEDA 3TABA 1GLLO 4Y1DA 3DXKB 4GVMA 5BPNA 2BE2A 2ZQBA 3R8EA 4X66K 5B8HA 3CCLN 2QWNA 3S3NA 3SQ1A 2F7TA 1KVBA 2OPRA 5M1OA 1XNRK 3HT3A 4JD2A 2FF6A 2A40A 1N34K 3G10A 3LZIA 2QWQA 2HF3A 4OKJA 3ZSRA 4JI8K 3M8QA 4BR2A 3CHWA 1S22A 2ITMA 4Z4CA 2GBZA 3C6HA 3SAHA 3DLLL 1NGFA 3NDKA 1NGCA 3QLHA 4GY2B 1VK0A 2P9IB 4N56A 3K0SA 1N32K 1H1VA 1KD1O 1TUYA 2G8KA 2PYJA 5KPTA 3J80O 1GLFO 1JXBA 1WUAA 4FJXA 1L3UA 1BL3A 3JSMA 1SUQA 5M1KA 3OYMA 3DXMA 1YJNN 1KVAA 4PQUA 3ZSQA 1X9WA 3A0IX 3CIPA 2UXDK 3SMPA 3S41A 2ZGYA 1Q8IA 3PLAA 1M90O 3VENA 3ZEUB 3N4QA 4M45A 4IEEA 1UAXA 5FPDA 3CJBA 4I9QA 3VTHA 5AZJA 4LFCK 3OTOK 4AQYK 1XHXA 4BQLA 4DWIA 3ZT4A 1U6ZA 2PBDA 3ULEA 2E2PA 4JKCA 5AZIB 5AFUA 1NK0A 1XNQK 2NLXA 3KLIA 4BE0A 3E01A 3O3FA 4CHZA 3L2QA 4MO4A 4CD3A 2B6AA 3V81A 2JWLA 5ADXA 4A5AA 1XUPO 1S9GA 2E6LA 4JK8A 4O5BA 4RCHA 1X3MA 4MDAA 3OYBA 2CH6A 1EP4A 3AVNA 2IIRA 4BRHA 4DV0K 2OTLN 4V19S 3D2EA 3M3ZA 4CIFA 1JLEA 3AVHA 4I9LA 3VEYA 3NF6A 4B1WB 3JYTA 4Z4EA 4CW7B 1X9JA 4KV8A 1N36K 4CK1A 4UY8O 3EZWA 4R79A 1RBUA 2Q0RA 3IFRA 2UXCK 4B9QA 3FZMA 3ZT1A 4CHNA 4C8NA 5BR8K 2GELA 4H5WA 3MK6A 5KPZA 4KHUA 3C95A 4RTFD 5J2NA 5FRNA 1D5AA 3H1QA 2GX9A 1KLMA 2V7YA 4JNEA 4BRCA 2HW3A 4C23A 2AP1A 4LD0A 3RRGA 2DPNA 3KK7A 4E1MA 2P9SA 1RDBA 2E2NA 4A61A 4M3RA 2WTUA 5JMVA 3CC4N 2HNYA 4DTPA 4B1ZA 3VEXA 5E41A 4IJAA 1P90A 3ENOA 4FLXA 4ILGB 2LSNA 4B8CA 4BGBA 1V4TA 3E9OA 2HHHK 1Q9YA 3A5LC 4M3TA 4E7IA 1IKVA 3LDQA 3WNGA 3QEVA 4AM6A 2OYQA 4BR4A 2ATQA 5AQJA 4BC4A 4YOUA 1SS6A 4FWLA 2VQEK 3MDQA 1W9HA 3IMXA 1EWRA 1JKHA 2W6LA 5DM7L 1QQMA 5EU7A 1D4XA 3E1YA 4C1NI 3K5MA 3FZFA 3VGMA 5HBMA 1S1WA 2HHXA 3OYHA 1UWBA 5M1PA 4E0DA 5HRPA 3PIOL 3VOVA 2FBTA 2PZSA 1X1PA 4DV6K 3VQ5A 4I6MA 4WQ5C 3HZ6A 1HNIA 1KFDA 5AJ3K 2KZMA 1GLCG 2P5OA 3H08A 3FZLA 1XC3A 3O8MA 4K41A 5I3UA 4Z4GA 1YUWA 2IVOA 3HL8A 4H0VB 4FWKA 4IWVA 3OYAA 4CJTA 1UA0A 1KAZA 4JK7A 1S3XA 4DHYA 4FZZA 4C8OA 4FWPA 2UYTA 4CEAA 1BCOA 4O0IA 4ISFA 2FF3B 3ALYA 3LPTA 5J2PA 3BP8A 3CCEN 4JKHA 1LWCA 3WNFA 2B4JA 1NJYA 2YKMA 2P9PA 4GV6A 4OJRA 3MEDA 4NCBA 4A2AA 4CBWA 4AF1A 4E1NA 3VETA 4CJ3A 3PY8A 4DR1K 3VA3A 1FKOA 4DFJA 3IKMA 4NLBA 5AQMA 3OS2A 5C0YA 4BR5A 3DLGA 5HOOA 4FPAA 1BISA 1IJJA 3DLRA 4IDKA 2KLAA 4B9UA 4DQIA 2IVPA 4FK0A 4ID5A 3QFUA 4DQ8A 3SMSA 5FRMA 3WNHA 5DK5A 3SUNA 3DOKA 4DLEA 4M3YA 1WSFA 1SKSA 2YNFA 5AQKA 3ZX0A 2FSKA 2G8WA 1RTIA 2NRTA 4JKBA 2A6AA 2VWKA 2WOMA 3KLEA 1KAYA 4LFBK 2KTQA 3O5BA 3VQPA 4CEBA 1LW0A 1WSHA 5HP1A 3QERA 3VQ8A 4K0KK 3QEXA 3RMBA 1RBVA 4J2BA 3U8XA 4DU3A 1HLUA 4KH6A 3VEZA 1VRTA 4DSJA 2A41A 4IJNA 4IDHA 3DLEA 4JKGA 2WUSA 3RR8A 1WSIA 3MCPA 4PA1A 5BN9A 1CZAN 4BRMA 1VSIA 1RILA 3TTFA 4NO7A 5AQLA 4KAZA 1TAUA 2E1YA 3THXA 4K42A 4B9TA 4IKFA 2A3ZA 3RRHA 4KKOA 3O80A 1IBMK 4CJVA 3EL2A 4N47A 4M7XA 2QTDA 4E7JA 2I7NA 4CK3A 1SL1A 4FJLA 3J7ZO 2Q36A 1DGKN 3NGYA 4CF2A 4MDBA 2Z1IA 4KH4A 5BPMA 1REVA 2QK9A 3AVMA 3BF3A 5C2DA 4KTQA 3TPQA 2O8DA 3EEQA 3I0SA 2ZM6K 1HNVA 2AJQA 3ULDA 1BUPA 1KFSA 4JI7K 3D2FA 4RWTA 4JLHA 4MLEA 3JS6A 5JVGL 1NJWA 1EQYA 1N5YA 3M8PA 1VQMN 3BGRA 4J8FA 3UKRB 2Q1NA 3SUQA 3QB0A 3FR0A 4DLGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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