4CJ7A

Structure of crenactin, an archeal actin-like protein
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
426
structure length
426
Chain Sequence
SDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crenactin from Pyrobaculum Calidifontis is Closely Related to Actin in Structure and Forms Steep Helical Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
molecule tags Structural protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 105
structure length 426
sequence length 426
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A02
1HLUA 4IWVA 3H6EA 3EL2A 5AFUH 1Z05A 5AZJA 1GLDG 2IIRA 1QQMA 1BUPA 3CJBA 1R59O 3ULEB 4EIAA 3B8AX 4AM7A 5BR9A 3O08A 4FOEA 4BRCA 4FWSA 2CGLA 3VGKA 5JLFA 3DXKB 1NWKA 3D2EA 1IJJA 2A41A 5JLHA 3AAQA 3SMPA 2E2PA 4H5VA 2P9KA 3CJ7A 1Y64A 4H03B 1WUAA 1XQSC 3UKRB 5KPTA 4CZEA 3R9PA 3LDNA 2ASPA 4HWIA 5E26A 4CJ7A 4PKIA 2F9WA 1MWKA 5AQZA 4EFHA 1DKGD 4K25A 3QICA 4MLHA 2FSKA 2A3ZA 1T6DA 3D7EO 4FPAA 3MN5A 5I9EB 1NGGA 4IXCA 3GE1A 4H0PA 3D2FA 3LDQA 1QQOA 1ATSA 4CZMA 2E2OA 2E1YA 4ISEA 2HMPA 3KVGA 1GLFO 1NGAA 3QFPA 4H0YB 2NRHA 3ZETA 4F9OA 2E1ZA 4CI6A 3GDQA 4YDUC 3U9ZA 3VPZA 1SQKA 4BRGA 5AQVA 3ATUA 2QWPA 2P9UA 3C7NB 1NGEA 4ISFA 1NGHA 2I7PA 2Q36A 4BR4A 4GNIA 4NO7A 3CJCA 1X9JA 1LCUA 4O5FA 3IDHA 3RSEB 1S3XA 1KAXA 4IZ9A 3UKUB 4LC9B 3WUHA 3MMVA 3H3OB 3ENOA 3UB5A 3U8XA 3VESA 3S41A 4BC5A 2IVNA 5AQPA 4BVPA 2HF4A 4EHTA 5KQDA 1T6CA 5AQNA 2E2NA 3WXLA 2P9IB 5BRHA 4A61A 4GY2B 4IJAA 3BP8A 3BEXA 2V7YA 2Q0RA 5BPLA 1V4SA 3VF4A 3BF3A 3M1FA 2CGJA 3ZEUB 5E84A 2GEMA 3M3ZA 3GOIA 2QWRA 4FWPA 5AQQA 5ADXH 5LY3A 5F2RA 4RCHA 2PBDA 2A5XA 1QZ6A 4K41A 3VEZA 1LOTB 3LL3A 2NLXA 2FF6A 3AAPA 4JD2A 4JHDB 2P9LA 4FO0A 2D1KA 4PKHA 1XC3A 1NGBA 3BF1A 4XH1A 2P9SB 4BRKA 3MCPA 4BROA 1C0FA 1HX1A 2ZF5O 3P4IA 2YJEA 2VWBA 5AZIB 3GG4A 3WXJA 3MK6A 4JAXA 4BRLA 4CZLA 2E20A 3AARA 5AQWA 2FSJA 3UE5A 2A6AA 4WQ4A 3IFRA 2GWKA 3L6QA 3VETA 3VENA 5BRDA 4FWQA 3ULEA 2V51B 3VEYA 3FZMA 4FOIA 4H0OA 3DXKA 1HKBA 3WXKA 2CH5A 1KXPA 1JCGA 4A62A 3WEEB 1KAZA 1HUXA 2GUPA 2CGKA 2E8AA 2IVPA 2QW9A 5BN8A 2P9PB 4B1XB 1NGCA 3TU5A 4A2AA 4WYBA 3I33A 3EN9A 1TUUA 1YXQA 4DCHA 3A5NC 2BTFA 2W40A 1GLEG 2QWQA 1XUPO 1ZC6A 1X3MA 5AZJB 1BO5O 2YHYA 5AR0A 3JXUA 4CZIA 1BWFO 1CZAN 3D2EB 4O8KA 3SMSA 4FWNA 4DQ8A 4BR7A 4CD1A 1C0GA 5LJVA 1JCEA 3VGLA 3EKSA 2P9KB 1HJOA 1V4TA 4Y0WA 3VOVA 3ID8A 3ZX2A 4CBWA 1YUWA 3MN6A 5KPRA 3A5LC 1YVNA 2ZGZA 5AQKA 3CHWA 3IMXA 5CE3A 1RDWX 5BREA 3VGMA 4FL9A 1K8KB 4H5TA 5FPNA 3QB0A 2DPNA 4WQ5A 1KAYA 2EWSA 4BQZA 3H1QA 2QM1A 3MDQA 4MLEA 3RSEA 1X3NA 5EX5A 3HI0A 3UKUA 3FZFA 1ATRA 4H0VB 3FLCO 3LDLA 2QWLA 5BPMA 1NGDA 3ZX0A 3CIPA 1NLVA 2V7ZA 1T44A 1U6ZA 4JN4A 4BRFA 1NGJA 4B9QA 2KHOA 1NGIA 3A8YA 2OANA 3O1BA 5AQLA 1G99A 2GTDA 2P9UB 3CQXA 2D0OA 3CETA 1TYQA 3EZWA 4K43A 2YHWA 2F9TA 4M7XA 2ASOA 2ZWHA 5AQGA 3ZEUA 1SAZA 4QS7A 1ZXOA 3R6MA 1HPMA 1MDUB 5AQYA 3U9DA 4FWRA 5JMVA 1GLBG 1OKJA 3DJCA 1MA9B 2VYPA 4JHDA 1NM1A 3WXIA 4H0XB 1E4GT 4FPBA 3MN7A 2PAVA 1U2VB 5KQ8A 3CQYA 3I8BA 2D0PA 1EQYA 3O4WA 3DXMA 3SJHA 2ZGYA 3L0QA 2YI1A 3H1VX 4BRDA 3WQTA 5KPZA 3SK3A 2QWNA 4MO4A 5AQHA 4DHYA 4I6MB 3FR0A 4IO8A 4WQ4C 1MWMA 3VEXA 2QXLA 1GLJO 2WUSA 2AP1A 3CI5A 3H45C 3R8EA 1Z6RA 3VF2A 3HZ6A 5AFUA 1JCFA 4H5RA 3H3NO 4BR0A 4JD2B 5AQUA 4RWTA 2P9LB 4H5WA 1HKGA 3WEEA 2P9NB 4ISGA 2ITMA 5EXWA 4PL8A 4CBUA 3W0LA 5AQFA 3J8AA 2E88A 3VERA 4QS8A 1Q18A 3UKRA 5FPMA 1RGIA 4M7YA 4B1VA 4B1UB 1S22A 3M6GA 1DGKN 3CJ1A 4BG9A 5BRFA 4BR5A 2AA4A 2Q97A 4NB4A 4A2BA 3ATVA 4FWKA 2HOEA 4BRIA 3FZKA 4BRAA 5TKYA 2UYTA 3EKUA 5AQSA 3KHYA 3FZLA 1GLCG 4BRNA 4H5NA 3TPQA 4BC3A 5B8HA 3QFUA 3KZBA 4CD3A 2W41A 3A0IX 3VEOA 4BRQA 4B1YB 1BU6O 1GLAG 3FGUA 2FSNA 5BPNA 4FWOA 4BGBA 3GL1A 4XH4A 3QBXA 3LDOA 5AQJA 3C0BA 2IVOA 4H0TB 3EO3A 4BRPA 4EAHD 4CZJA 4FWMA 4L3QA 2BUPA 1J6ZA 1BA0A 3HSCA 3O6WA 5JICA 1K8KA 3C7NA 4WQ5C 3SLCA 5AQOA 3HBTA 5ELZA 3L4IA 4BREA 1WOQA 4EHUA 3A5MC 3D2FB 3O80A 4BR2A 1P8ZA 2D4WA 3VF6A 2V52B 1H1VA 3CERA 3W3DA 1RFQA 1DEJA 2Q0UA 2GWJA 2NZTA 5FPDA 4CZKA 5AQIA 3DAWA 3OHRA 3ZETB 1YAGA 3O5BA 4QS9A 2A40A 1NMDA 3F9MA 1IG8A 4HTLA 3WQUA 3QBWA 4BC2A 4YDUA 4C23A 4BC4A 1BOTO 2A42A 2P9IA 3G25A 4RTFD 1GLLO 2Q31A 3O8MA 3MN9A 1BA1A 1E4FT 4BVOA 4MO5A 2YHXA 1QQNA 5AQTA 3ENHA 4CZHA 1QZ5A 3DWLA 3WT0A 3QMLA 3H46O 4E1JA 5ADXA 3LDPA 4XH5A 4KBOA 3VEWA 4K42A 5FPEA 2QWMA 3O1WA 4BG8A 4BRHA 3LM9A 2CH6A 3VEVA 1U2VA 3AY9A 5EY4A 2J4RA 2Q2RA 5LJWA 1NGFA 4PL7A 4XEIA 4CBXA 2I7NA 3CJ9A 2P9SA 2QWOA 2FXUA 3A5OC 1QHAA 4I6MA 1TYQB 5AZIA 5F1XA 1TUYA 1BDGA 2E2QA 2YCHA 3GBTA 3QDKA 4J8FA 2VCPA 3HM8A 1BG3A 1HKCA 1D4XA 4FSVA 5AQMA 2GELA 3FZHA 3JS6A 5BN9A 4BQLA 3HTVA 1NBWA 1ESVA 3IUCA 2FF3B 2YJFA 5EVZA 2FLOA 4BR9A 5AQXA 4PKGA 2P9NA 3FFKB 3BUZB 3U4LA 3LM2A 3DXMB 1ATNA 2Q1NA 4JNEA 4BGAA 2P9PA 2ASMA 3ZX3A 1SZ2A 4M63C 3FE1A 5AQRA 3CJAA 5F0XA 2HF3A 4DB3A 4Z94A 5EOYA 4BRMA 1ZBSA 2H3GX 4AM6A 4CZGA 4B1ZA 4FWLA 4CZFA 4B1WB 4IJNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H6EA 4O4GA 5AFUH 1GLDG 4JI6K 2P5GA 4C8NA 3MAQA 4U7BA 3I0SA 3B8AX 3O08A 3CG7A 4FWSA 2CGLA 3D2EA 4DV1K 4N41A 1EO1A 1IJJA 3P5JA 5JLHA 1M90O 3AGKA 4BE1A 2XY8A 4XIUA 2GV9A 1WUAA 1UA0A 1NJIO 4FJJA 5E26A 5M1NA 2BE2A 4EFHA 1DKGD 4MLHA 1T8EA 2FSKA 4FPAA 3NMUA 4H0PA 2O8BA 3EE8A 3RMDA 5HRNA 4ISEA 2HMPA 1VK0A 1KFSA 3QFPA 4H0YB 3ZETA 3VPZA 1SQKA 4CFCA 5M1OA 3RR8A 4OVLA 2QWPA 3MEEA 1TL1A 4JI7K 3C7NB 1ASWA 2IOCA 1KVAA 5C10A 1RT2A 3C65A 4NO7A 4WFBL 2VQFK 4KHUA 4IOAL 1SKSA 4IZ9A 4R5PA 3WUHA 3H3OB 1VRUA 3UB5A 3VESA 3S41A 3O9RA 2Z1HA 1A5XA 5SWMA 4FJMA 3NDKA 1T6CA 4KRFA 2WC9A 4KHYA 1XMOK 1N32K 3M8PA 1RBVA 4IJAA 4OKEA 3NH0A 4O0IA 2JLEA 3VQEA 2JGUA 3VF4A 3LP3A 4E89A 3GOIA 5LY3A 3KWIA 3C6AA 4AH9A 5F2RA 4X64K 2PBDA 1QZ6A 1M1KO 3JSMA 2NLXA 4NCAA 1A5WA 1YITN 4JD2A 3HT3A 2OCEA 1XC3A 1WSHA 4DSEA 5K14A 3TTDA 4BROA 4JK8A 1C0FA 5E41A 3KWGA 1T03A 4CHPA 1K73O 2VWBA 1ZBUA 5AZIB 3WXJA 2FC0A 1W9HA 2E20A 4ICLA 3I8DA 4CEDA 4NLCA 3ENBA 3ULEA 4CK3A 2V51B 3FZMA 3L2QA 1HKBA 2UXBK 1KXPA 1VQ9N 3HPGA 1RT5A 4DTNA 1HUXA 1RT6A 2GUPA 2VGMA 4IFYA 3CCSN 1IBLK 3PUFA 3G71N 4A2AA 1YF5L 4E7JA 1YJNN 4GV6A 3I33A 5HL7L 4J2DA 4PUOA 1TUUA 3AVJA 2W40A 1XUPO 3EZ5A 3J7ZO 1X3MA 3LP2A 1GOCA 4WFNL 5HRSA 1ILYA 2YHYA 2HHQA 3LP0A 3D2EB 4M3XA 4AHUA 2O4GA 3RMBA 1JCEA 4L8RB 4CIGA 1VSHA 3B6OA 1V4TA 5KRTA 4OLBA 3MN6A 2OZSA 1TKTA 3KLHA 4I7FA 1YVNA 1IBKK 3NF6A 5CE3A 4WFAL 1LWEA 3VGMA 1X9MA 4DTOA 4JKGB 1KAYA 4BQZA 3G4SN 2QM1A 5IWAK 1EWQA 2O8BB 3VQ9A 1WLJA 5EX5A 3TAFA 5C15A 4CF9A 2NNWA 3FLCO 4IFVA 4IOCL 2EX3A 3LDLA 3ZX0A 3VA3A 1NLVA 1NGJA 4CJ4A 2KHOA 5M1QA 3A8YA 4Z4CA 1JLAA 3NCIA 3HP6A 2KW4A 4NCGA 3QERA 4FJ5A 5C12A 3G10A 4CJ5A 5AQGA 4FJ8A 3LPTA 1HR0K 1HPMA 1MDUB 3U9DA 4JRPA 3VTHA 4JK9A 1MA9B 4JHDA 1TL3A 1U2VB 4CHQA 4M45A 5CZ1A 2BGGA 3PV8A 3DLHA 4LH4A 2YI1A 1J54A 1J5OA 4JKAA 1NK7A 2QWNA 1HMVA 4DHYA 1SKWA 2JWLA 4M3YA 4KPYA 2PZSA 5TKWA 4NCBA 4FJIA 4DR4K 4GV9A 1S5JA 1Z6RA 5AFUA 2HNYA 4JD2B 5AQUA 4IBNA 4KH6A 3WEEA 1VQ5N 2P9NB 4ISGA 5HRPA 4DU1A 3AA5X 5EXWA 2A1RA 4CBUA 3NAEA 4F2SA 2WBNA 2YX6A 3TAMA 3OYBA 5I42A 1Q18A 4CJTA 5FPMA 2G8VA 1W97L 3D6RA 4N76A 3M6GA 3CJ1A 5BRFA 4NB4A 4FWKA 3P38A 4CJQA 2AJQA 3FZKA 4BRAA 3KLIA 5TKYA 5AQSA 3TAGA 3SYZA 4CCHA 1JLFA 3IKMA 3OY9A 5B8HA 2XRIA 4CD3A 2W41A 3A0IX 3MXIA 4JKFA 4G9ZA 3V4IA 3GL1A 1C6VA 4XH4A 3QBXA 4Z4HA 3HJFA 5AQJA 3C0BA 4CECA 4H0TB 4BRPA 5FRMA 4EAHD 1S1TA 1OH6A 3OJSA 1TKZA 3MEDA 4B9LA 1LW2A 1W7AA 4RW7A 3MXJA 4E7IA 3TAPA 4CEBA 3IG1A 1WOQA 3DOKA 3MXMA 1LWFA 3BZCA 1S1VA 2D4WA 1K8AO 3VTIA 3O9SA 4F8RA 1RFQA 3IAYA 2NZTA 2F8SA 3DRPA 1IG9A 5AQIA 3DAWA 3V9XA 1YAGA 3DOLA 3O5BA 3AO4A 1RCHA 3O9TA 4HTLA 3TSQA 3WXMB 4BC2A 2PYJA 4CJVA 3CFRA 4KKOA 1OH8A 1GLLO 2Q31A 3M8QA 4B8AB 4CJPA 5HOOA 4HVJA 4BVOA 3ZT1A 4JKBA 1QQNA 4M42A 4E1MA 3QMLA 3UIQA 3VEWA 1N33K 4H4MA 4BRHA 4CJWA 4DTXA 4F3OA 2Q2RA 3T69A 5LJWA 2YHAA 4PA1A 2X78A 4H4OA 3ZT3A 3A5OC 4E7KA 2DTUA 4KAZA 1BHLA 4I6MA 4B9VA 5F1XA 3JAMO 4FCYA 4JKDA 1YVUA 3QDKA 2Z1IA 1HKCA 5GAHP 5GADP 3DLBA 3CM6A 1QSSA 3LAMA 3HTVA 3V9ZA 2B6AA 4DKWA 2ITGA 5EVZA 2HVIA 5AQXA 2YNHA 3BUZB 2Y1IA 4FJ9A 1GOBA 4Z0UA 3U4LA 1ATNA 4BGAA 4E3SA 2ASMA 3PX0A 1SZ2A 3SQ1A 2D0BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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