4H03B

Crystal structure of nad+-ia-actin complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 122
structure length 357
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h03B03
4H5NA 4BREA 2QXLA 4IZ9A 1JCEA 2P9PA 3TPQA 3HBTA 2E2OA 3IUCA 3VEWA 4H0PA 4CBUA 3RSEA 3WEEB 5AQUA 3VPZA 3LDPA 4BQLA 2GTDA 1LOTB 2HF3A 4IXCA 1NGBA 3DXMA 2ZGYA 4FOEA 1CZAN 1XUPO 3WT0A 4ISFA 4CZLA 5FPDA 3CIPA 3C0BA 5AQIA 4H5TA 2QWLA 2P9UB 3JXUA 3WQUA 2ASMA 4BG9A 2QM1A 2FSJA 4C23A 2E1YA 3QICA 2PAVA 1BO5O 2A3ZA 4XH1A 3UKRB 2D0OA 1XC3A 4WQ4C 3UB5A 1X3MA 3LM9A 3QFUA 3CQYA 3VEXA 4I6MA 3VF6A 2P9LB 5AQJA 3M3ZA 5KPTA 4CI6A 4QS8A 3U9DA 3BUZB 5AQVA 4BRMA 1T6CA 5BR9A 2QWPA 3ATUA 1YVNA 2ASOA 1BA1A 3LDQA 1DKGD 3CHWA 2Q0RA 1NLVA 5LJWA 1RDWX 3U4LA 3CJ7A 2YCHA 3WXKA 3IFRA 2CH6A 1V4TA 1YUWA 2V51B 3FLCO 5KPZA 4BRDA 3EZWA 4K43A 4CD1A 1Q18A 3BF3A 1NGJA 1GLJO 4H5RA 3L6QA 1NGCA 1BDGA 1DGKN 1Z6RA 3VEZA 4RCHA 1C0GA 2E8AA 1TYQA 4BRIA 3FZKA 4EFHA 3TU5A 3QB0A 3WXJA 3D2EA 3IDHA 4WQ5A 5AQQA 4RTFD 5LY3A 3QBWA 2NRHA 4BRKA 5BRFA 3P4IA 1QQNA 2Q0UA 4BC2A 1KAXA 4L3QA 3LL3A 4M7YA 5AQSA 2YJEA 2ZF5O 5BRHA 2P9NA 4WQ5C 2GELA 2HMPA 4CZJA 4RWTA 4FWNA 5AR0A 2D4WA 5BREA 2P9IA 1GLAG 4BVPA 4A61A 1QZ6A 3HM8A 3LM2A 1S22A 5FPEA 4BR2A 2H3GX 3ZEUB 3MN7A 1YXQA 2CGJA 4BQZA 2FF3B 1E4GT 3FR0A 3O80A 3FZMA 5AQZA 4IJAA 1RGIA 4H0TB 1MA9B 3GBTA 3ZX3A 1T44A 5AZIB 4WYBA 3O5BA 4FL9A 5AQPA 1LCUA 4FWRA 4J8FA 5TKYA 3WEEA 5EX5A 5AFUA 3QMLA 3SMPA 3OHRA 2HOEA 2YHXA 1KAYA 2Q2RA 2Q97A 4B1VA 2CGLA 1MWMA 2YI1A 3AARA 1P8ZA 3B8AX 2P9UA 3W3DA 3M1FA 3CERA 1RFQA 3L0QA 2FSKA 2FXUA 4A62A 3I8BA 2Q31A 3GOIA 4EHTA 3SMSA 3MMVA 4AM7A 4H0VB 5AFUH 4BR7A 4M7XA 5E26A 2P9SB 3W0LA 4K41A 4O5FA 5EOYA 4WQ4A 2P9LA 2ITMA 5JMVA 3CJAA 5E84A 3ZETB 3MN5A 5KQ8A 4IO8A 1Y64A 1H1VA 4BR4A 3CQXA 5ADXA 3ATVA 3MCPA 3VEOA 4B1ZA 2P9KB 2KHOA 2QW9A 5AQTA 3SJHA 1TUYA 2AP1A 1BWFO 2ASPA 3CI5A 3O4WA 4FWPA 5CE3A 4JN4A 1ATSA 3VF4A 5BPLA 3R6MA 4B9QA 1U2VB 3EO3A 5ADXH 4Z94A 3H3NO 4LC9B 3H1VX 4JAXA 5F1XA 3GG4A 3MN6A 3H45C 4BRAA 4BR5A 2BUPA 3FFKB 4BRPA 5BN8A 1QQMA 4FWKA 3WXIA 5AQWA 4MLHA 1BUPA 5LJVA 1MDUB 1U6ZA 3VESA 4B1XB 3R9PA 3A0IX 2GWJA 4H0YB 1IG8A 3ENHA 2NZTA 3G25A 1NGAA 4ISEA 5AZJB 4XEIA 1EQYA 1BU6O 5AQGA 3EKUA 1ZXOA 4FPAA 5EY4A 1HKBA 2A42A 2QWMA 3L4IA 1DEJA 3WQTA 3FZHA 4K25A 1V4SA 3BF1A 2W41A 1NGHA 3UE5A 2DPNA 2PBDA 2HF4A 1QZ5A 2GEMA 1ATRA 3ZEUA 3S41A 3VGKA 1GLCG 5EVZA 4PKHA 3D2FB 4I6MB 5AQYA 2A41A 2E88A 4YDUA 3IMXA 4CZMA 1JCFA 2CH5A 2YJFA 3CETA 5AZIA 3VEVA 1ATNA 2GUPA 4JHDB 4JD2B 1BA0A 4FOIA 5AQRA 4BRHA 4QS7A 3DAWA 3HZ6A 1NMDA 5JICA 3A5MC 1C0FA 3VERA 5BPNA 2A40A 3C7NB 4YDUC 4FWMA 1R59O 2QWOA 3O6WA 3ULEB 4H0XB 3J8AA 3M6GA 4XH5A 3H46O 5BN9A 3QFPA 2P9SA 1IJJA 4EAHD 3MK6A 1BG3A 1BOTO 1NGFA 2YHYA 4BRNA 1WOQA 2IVNA 2ZWHA 4IWVA 3ZETA 3I33A 4BRQA 1SQKA 2E2PA 2P9KA 4BG8A 4E1JA 3BP8A 3DJCA 3GL1A 3GE1A 4HWIA 3AAQA 3VGMA 4PL7A 1YAGA 1K8KB 2UYTA 4XH4A 3UKRA 3D7EO 4FSVA 3UKUB 5AQHA 3H6EA 1U2VA 4CZGA 4CD3A 4QS9A 4A2AA 5BPMA 2QWRA 4PL8A 5KPRA 3LDOA 3KZBA 4EHUA 1NGDA 4FO0A 5JLHA 4B1WB 1QHAA 3AAPA 4CBWA 3BEXA 2ZGZA 4FWSA 4CZHA 2IVOA 2QWNA 3ENOA 4BRCA 1TUUA 1KAZA 3VETA 2E2QA 2D0PA 1GLEG 3A8YA 1GLBG 3HI0A 4H03B 1XQSC 2E2NA 3DXKB 3FGUA 3WXLA 2BTFA 1ZBSA 4CZFA 2I7PA 1G99A 3ID8A 2W40A 4B1YB 2A5XA 1Z05A 1NGEA 5AZJA 4DHYA 3HSCA 1JCGA 1NGIA 1HLUA 3F9MA 1HX1A 5AQOA 5B8HA 2AA4A 2EWSA 5AQLA 2FSNA 3VOVA 1HPMA 4CBXA 1NBWA 1HUXA 2VWBA 2P9PB 4CZKA 4DB3A 2YHWA 4H0OA 4KBOA 3EKSA 3D2FA 5EXWA 5FPNA 5F2RA 4O8KA 3HTVA 3RSEB 3VGLA 2I7NA 1ESVA 2WUSA 4PKIA 5ELZA 1HJOA 3DXMB 4FWLA 4BRLA 3CJBA 2V52B 3R8EA 2F9WA 4H5VA 4NO7A 1HKCA 1S3XA 4MO5A 3SLCA 4JHDA 3MN9A 4JD2A 1NWKA 4F9OA 2OANA 3FZLA 2GWKA 4K42A 1D4XA 4DCHA 3C7NA 1SZ2A 4CJ7A 3ULEA 4IJNA 4MLEA 2V7YA 3MDQA 3GDQA 4CZEA 3CJ1A 2IVPA 4BR9A 1QQOA 1HKGA 3VEYA 2E20A 4BRGA 2VYPA 2VCPA 4NB4A 4B1UB 4MO4A 4HTLA 3LDLA 1T6DA 3FE1A 3EL2A 4BROA 3AY9A 3O08A 1X9JA 3U9ZA 2Q1NA 3JS6A 2CGKA 3KHYA 4BC5A 1K8KA 2FLOA 2V7ZA 3CJCA 4BRFA 5BRDA 5KQDA 3A5OC 4GNIA 5I9EB 2FF6A 3O1WA 3UKUA 3KVGA 3ZX0A 4H5WA 3VENA 4BVOA 3O1BA 1TYQB 4PKGA 3ZX2A 1NGGA 4JNEA 5AQNA 3D2EB 3QDKA 1ZC6A 5AQMA 2A6AA 4A2BA 5FPMA 1GLDG 5F0XA 4BC3A 1KXPA 1SAZA 1GLFO 3CJ9A 2IIRA 1MWKA 1NM1A 3A5LC 2E1ZA 5JLFA 3VF2A 1WUAA 3DWLA 1E4FT 1OKJA 3SK3A 3WUHA 2Q36A 2QWQA 5AQXA 2P9NB 2J4RA 3QBXA 4BGBA 1GLLO 1X3NA 2D1KA 3A5NC 2P9IB 3DXKA 3U8XA 4FWQA 4EIAA 3EN9A 4BC4A 1J6ZA 3FZFA 3H3OB 5AQKA 4Y0WA 4BGAA 4CZIA 3O8MA 2NLXA 4M63C 4GY2B 2F9TA 3LDNA 4BR0A 4ISGA 3H1QA 4DQ8A 4FWOA 4AM6A 5AQFA 4FPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BREA 2QXLA 4ELVA 2UU9K 1S9GA 2UUBK 3OVNA 3IUCA 3AVKA 3HXMA 4LF6K 1IKWA 3OTOK 4CBUA 4O0JA 5KRSA 3LDPA 4OKJA 2GTDA 1LOTB 4FOEA 1HNWK 4CHNA 3SPYA 2OZMA 3WT0A 3OYIA 4GV6A 1VQLN 3CIPA 4NXNK 1ASWA 5HBMA 3SQ1A 1XMQK 2P9UB 3M8SA 3C6TA 4C23A 4GKJK 3QICA 3UKRB 2D0OA 4WQ4C 4JEPA 4DQPA 1B92A 3LM9A 3SZ2A 2KFZA 3VEXA 2ZD1A 4IOXA 3VF6A 5DK5A 3NF6A 2X78A 3K9JA 4CF2A 4OKEA 4CEOA 4YOTA 5C12A 1T6CA 2Z1HA 3MXMA 1YVNA 3LDQA 4JKHA 3HM9A 3CHWA 5LJWA 3U4LA 2YCHA 3P39A 2O8CA 3IFRA 4E72A 1W2BM 2CH6A 5C15A 1C6VA 3CCEN 5KPZA 3IAYA 4FJXA 4K43A 3BF3A 4C8LA 4OGCA 4GW6A 4EZ6A 1BDGA 1Z6RA 1JL1A 1C0GA 1TYQA 4RW4A 3T1AA 5FRNA 3ASMA 4N56A 5AQQA 1U48A 3QINA 1HYVA 1JXEA 5BRFA 1RBTA 4LFBK 4GV3A 4FK0A 1S1TA 3TAGA 1O13A 3PX4A 4CIGA 2E5LK 3NE6A 1LWCA 4W5TA 4CVNE 4CZJA 2P9IA 4AHSA 4H4MA 1QZ6A 2AJQA 4J2EA 4CW7B 1S72N 4KHUA 4JKGA 1LW2A 4H4OA 2FF3B 3CM6A 3FR0A 4KH6A 2HHUA 1OVQA 5DM7L 3KTQA 1XNQK 1MA9B 5IT9O 2D5RA 1D5AA 5M1OA 4J8FA 2G8FA 3TAQA 5AFUA 4F2RA 3EY1A 3P38A 1L3UA 4M45A 2Q2RA 3U3GA 2GUIA 2A1RA 2CGLA 4UY8O 1YTAA 2YI1A 1Q81O 2VG7A 3VQQA 2FXUA 4EHTA 1WNSA 4M3YA 1SL2A 3MAQA 5AFUH 3V9ZA 3SYZA 1BISA 3V1QA 4DG1A 4B9VA 4ZTJA 3SUOA 5EOYA 1I3AA 2GV9A 2ITMA 2P9LA 3SQ4A 3CJAA 3R1XA 4CFCA 5E84A 3S3MA 1H1VA 4GVMA 5ADXA 3K0SA 1RDBA 4B1ZA 4CEQA 1W9HA 4E19A 2KHOA 2QW9A 1HR0K 5KGXA 2QK9A 2ZE2A 3KLIA 3MX2A 3SUQA 1REVA 3B6OA 3O4WA 4FWPA 4XIUA 1ATSA 3VF4A 5BPLA 3R6MA 1U2VB 5M1KA 4IO9L 4FJJA 1Q86O 5ADXH 5C25A 2O8EA 1HYSA 3AA2A 1XMOK 2ITGA 4LC9B 3H1VX 3VQDA 4CF9A 4IG3A 3H45C 4KV8A 4DV4K 4DTRA 1I39A 1IV0A 3FFKB 4BRPA 3DLRA 4LF5K 4HCCA 4MLHA 1BUPA 2ZQBA 5LJVA 3VESA 4B9LA 1XC9A 5FRMA 2HB5A 4IDKA 3R9PA 3IS9A 4QAGA 4YFUA 1HQUA 4DV2K 1JLQA 4DTUA 1IBLK 1ZBFA 4CGIA 3HO1A 1NGAA 2G8WA 5AZJB 3T19A 5KI6A 1VK0A 4CGGA 4XEIA 4DTPA 3EKUA 2X6SA 5EY4A 4K25A 1V4SA 3BF1A 3MEEA 4MDBA 3ZEUA 3LPTA 3R3LA 1C0TA 1LW0A 1YF5L 5AQYA 3OJUA 3CFOA 4YDUA 5FLXO 4CZMA 2UXDK 3VA3A 5GINA 3VEVA 2QKBA 1IBKK 3PSIA 1KLNA 1EXQA 4BRHA 5AQRA 4KHPK 3HZ6A 1NMDA 5JICA 3VERA 2HHVA 3K5LA 1WAFA 3QEWA 3D0PA 3J8AA 4JI3K 3SQ0A 3H46O 5JVHL 2D0BA 3NF9A 1IJJA 4CF8A 3DRSA 3OY9A 3EE8A 2ZWHA 1RTHA 3I33A 4BRQA 1SQKA 1RDCA 1NJWA 3AVMA 1NKCA 2FBTA 3GL1A 3GE1A 3Q7CA 3AAQA 3VGMA 4UQGA 3AO2A 3L8BA 4CHOA 3I0SA 3UKUB 1YTUA 3V81A 5AQHA 4CZGA 2O4IA 4C8MA 1RDDA 4AHTA 1N6QA 3CCSN 4K0KK 3C95A 1F21A 4FJKA 3KZBA 4DTMA 1VQNN 4KB1A 3I55N 3QLHA 1QHAA 4CFDA 1A5XA 4CZHA 3CCQN 2RF2A 4FM2A 1RT2A 4Z4EA 1TUUA 2D0PA 3HP6A 2DFHA 2YKMA 3C94A 3KLGA 3K57A 2I7PA 3ID8A 4DS5A 3TTCA 3DLHA 2A5XA 1C0UA 1RT1A 1NGEA 1Z05A 3HSCA 3CCJN 1JCGA 1NGIA 2WC9A 3MEGA 3BZCA 4I2QA 2AA4A 5AQLA 1KD1O 4R5PA 1HUXA 5C10A 2VWBA 2P9PB 4CZKA 4DB3A 4DSJA 1U47A 4H0OA 3V9XA 4B9SA 3EKSA 3D2FA 3TTFA 4O8KA 3HTVA 2BDPA 4M3UA 1ESVA 1Z26A 3NFAA 4J2BA 4BRLA 1HNIA 4X64K 2D0CA 4H5VA 4LH5A 1HKCA 3OYHA 1S3XA 4F9OA 3K5OA 2BH1A 3ALYA 3I8DA 4DLGA 3THXA 1CXUA 3SAFA 3OYJA 4M42A 2JGUA 2OTLN 3AO5A 4IOAL 4CJ7A 1OH8A 1YJWN 4FLZA 1N32K 1GOBA 4DLEA 2O8EB 4ELTA 4CZEA 2NRWA 4DSLA 2IVPA 1KC8O 2E20A 4AHVA 4N5SA 4BRGA 4CEDA 5MLCQ 2WOMA 4MO4A 4HTLA 3EYZA 4GV9A 3O9RA 4ILHA 3HSTB 3FE1A 3VTIA 4BDZA 4JI5K 1XWLA 3CMAN 5C42A 3JS6A 2CGKA 2R7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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