4H03B

Crystal structure of nad+-ia-actin complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 122
structure length 357
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h03B03
3SK3A 1C0GA 2P9PA 3MCPA 3ZETB 1MWMA 1NGIA 1U6ZA 5F0XA 2CH6A 5KPZA 1U2VB 1BU6O 1WOQA 4CZFA 5AQRA 4JHDB 1DEJA 1C0FA 2QXLA 4MO5A 1K8KA 4K42A 4BRHA 5KQ8A 3MN5A 4MLHA 2HOEA 2QWMA 4BRAA 3DJCA 3WXJA 4CI6A 5AZJA 4H5NA 5KQDA 3HSCA 4XH4A 1YVNA 2BUPA 3I8BA 3MMVA 2ZF5O 1LOTB 3I33A 1RGIA 5AQJA 2NLXA 3VPZA 1BUPA 1DKGD 3HTVA 3DXKA 2A6AA 3HI0A 4FSVA 4B1ZA 3FZLA 1E4GT 5F1XA 2I7NA 1S3XA 2Q97A 5BRHA 2FSKA 3C7NA 1GLFO 3AAQA 2ASMA 2QWRA 4BR0A 4EHUA 3QFPA 4JN4A 3WUHA 3VGMA 2QWLA 4FWRA 2Q36A 2VYPA 2W41A 1KAZA 3O5BA 4BC2A 4ISGA 3VEWA 3O6WA 3JS6A 5AR0A 4JD2A 4B1XB 4CZIA 5FPDA 4AM6A 1QQNA 2BTFA 4RWTA 5BPNA 4FWPA 3DXKB 3A5OC 2PAVA 3HBTA 3AY9A 5AQIA 2KHOA 5E84A 4GNIA 3C7NB 3CJBA 2AA4A 3L6QA 2A3ZA 2FF3B 5EY4A 2E20A 5AQLA 2J4RA 4CD1A 3LDNA 3JXUA 4AM7A 3IMXA 3SMPA 4XH5A 5AQWA 4FOIA 4EAHD 4DQ8A 4DHYA 3WXIA 4CZEA 3FFKB 3RSEA 4F9OA 4BRMA 4BR4A 3H6EA 2PBDA 3QFUA 4WYBA 3FR0A 5AQOA 3QBXA 4H0OA 2WUSA 5CE3A 4B9QA 2V7ZA 3CJ9A 4FPAA 3EN9A 5B8HA 1GLAG 3BP8A 4BRKA 4DCHA 3VEXA 4CZJA 5KPRA 3R8EA 4A61A 2HF3A 3WXLA 4BC4A 4L3QA 2YHYA 3VESA 3GE1A 3RSEB 1T6DA 3CJ1A 2GEMA 1T44A 3KHYA 3EZWA 2P9SB 3MN7A 5AQXA 1KAYA 3WEEA 4XH1A 2CGKA 1NMDA 4FWOA 5BN8A 3ID8A 4QS7A 3A5LC 4FPBA 3GOIA 4H5TA 1S22A 3M6GA 5BPLA 4H5WA 4BVPA 1CZAN 4PL7A 2QWOA 3A8YA 4BREA 4BG8A 4DB3A 1Z05A 5AQUA 2E1ZA 5AQHA 5AQSA 2D0PA 4EHTA 3QDKA 4CZGA 4PL8A 4B1YB 3C0BA 1NGJA 2ASPA 2EWSA 3ZX3A 2FLOA 5AQKA 2IVPA 1D4XA 4A62A 3WEEB 2NRHA 4BR7A 4E1JA 2QWQA 1XC3A 2P9KB 1JCGA 4FWMA 4B1UB 3MK6A 4IWVA 1ZXOA 4CZLA 2ZGZA 3KZBA 3U9DA 5JLFA 1GLJO 1GLDG 2Q2RA 1HLUA 5ADXA 4CZKA 3GDQA 4BRCA 4CBUA 3CETA 3H46O 3KVGA 3FZMA 4H5RA 3ULEA 1T6CA 4KBOA 4EFHA 3QBWA 5EX5A 5AFUA 1HJOA 2P9PB 4BVOA 2GELA 2CGLA 1BA0A 2YCHA 2VCPA 4FWNA 3O08A 4BGAA 2D1KA 3QB0A 5AQYA 1K8KB 2E2OA 1QZ6A 4BC5A 3O8MA 5LY3A 1NGCA 3O80A 3D7EO 5AZJB 2D4WA 3D2EA 1NGFA 4ISEA 5EXWA 1NGHA 5BPMA 4BRNA 3BF3A 3A5MC 3MDQA 4K41A 1HKCA 4K25A 3ATVA 2A5XA 4H0XB 3UB5A 3W0LA 5BN9A 3SJHA 3VEVA 1ATSA 2P9IA 4M7YA 3U4LA 1IJJA 3M3ZA 2YHWA 2D0OA 1NLVA 3WT0A 3UE5A 1RDWX 4A2AA 3HM8A 5AQGA 4BRGA 3ZX2A 4YDUC 1QQMA 5KPTA 1NGBA 3B8AX 3D2EB 3ZX0A 3WQTA 1TUYA 4CJ7A 5AQQA 2ASOA 3VEYA 4JD2B 1NBWA 1H1VA 4XEIA 2IIRA 5FPEA 3F9MA 5E26A 5ELZA 3WXKA 5EOYA 4BROA 1HKGA 1DGKN 4BRDA 5AZIA 2CGJA 1X3MA 2P9IB 3WQUA 4RCHA 4Z94A 4QS8A 4BRPA 4IJNA 3VGKA 3H3NO 1MA9B 3ZEUA 2V7YA 2H3GX 3CJAA 1WUAA 2HMPA 1GLLO 2E1YA 3FZKA 2UYTA 5F2RA 4B1WB 4MLEA 1ATNA 1SZ2A 3IFRA 1NGGA 3UKUA 4H0TB 4BQLA 2QW9A 3L4IA 2P9NA 1EQYA 3O1WA 1YUWA 3ENHA 4HTLA 4BRIA 4H5VA 1OKJA 3U8XA 3VF6A 1TYQA 1V4TA 1GLEG 4JNEA 5AZIB 1BWFO 1NGAA 1ATRA 1BO5O 1JCEA 2YJFA 3MN6A 3CQYA 4CBWA 2E8AA 4J8FA 4RTFD 4A2BA 2A42A 2IVNA 1HPMA 1YAGA 4IXCA 4K43A 2YHXA 4PKHA 1GLBG 2VWBA 2A40A 2HF4A 3VERA 2P9NB 4PKIA 1Y64A 3ZETA 1X3NA 3GBTA 4BRQA 4CBXA 1Q18A 3DXMA 4IO8A 4O8KA 5AQVA 3UKRA 3SLCA 1ZBSA 3GG4A 4M63C 4BR5A 5LJWA 3H1QA 2QM1A 2ZWHA 3EL2A 3H3OB 5AQPA 4BRFA 5AQTA 3HZ6A 3J8AA 4YDUA 4FOEA 2OANA 1NM1A 2FXUA 4FWQA 4HWIA 5BRFA 1JCFA 1BOTO 4FL9A 2ZGYA 3U9ZA 3FZFA 1QQOA 3FE1A 4H03B 2YJEA 2FF6A 2QWNA 4WQ4C 3DXMB 3M1FA 3UKRB 4GY2B 1V4SA 3FLCO 4M7XA 3A0IX 3QMLA 3ATUA 3IUCA 1ESVA 2E88A 4WQ5C 3L0QA 4BGBA 2P9LA 4ISFA 4BR2A 4NO7A 3VEOA 2GUPA 2AP1A 1MWKA 5JLHA 1NGDA 3ULEB 5AQMA 3H1VX 3TU5A 4FWLA 5JICA 2P9UA 4QS9A 2GWKA 5EVZA 1LCUA 3VF2A 2E2QA 3LDQA 3LM9A 4Y0WA 5FPNA 3VOVA 1GLCG 3W3DA 2F9TA 3G25A 1RFQA 3EO3A 2I7PA 2Q31A 3A5NC 2P9LB 1SQKA 3R6MA 5FPMA 2A41A 2GWJA 4BR9A 3CIPA 4FWSA 4FWKA 3VF4A 2P9UB 1IG8A 3QICA 1MDUB 4LC9B 4BRLA 3GL1A 3P4IA 2Q0UA 5AQNA 1G99A 3CHWA 4IJAA 1KXPA 4PKGA 3OHRA 4H0VB 3IDHA 3LM2A 1XUPO 4IZ9A 5ADXH 4O5FA 3S41A 3O1BA 2CH5A 1SAZA 2Q0RA 3EKSA 2FSNA 3LDPA 3R9PA 3LL3A 2P9SA 4H0YB 5JMVA 2IVOA 2ITMA 4WQ4A 4B1VA 5AFUH 5AQFA 1ZC6A 3CERA 4BG9A 2QWPA 1P8ZA 3ENOA 4NB4A 3VETA 1KAXA 2E2NA 1YXQA 4I6MA 4BQZA 3ZEUB 4WQ5A 3FZHA 4MO4A 3CI5A 1QHAA 2FSJA 3FGUA 5LJVA 3D2FA 1HKBA 1HX1A 2DPNA 3CJ7A 2YI1A 3DWLA 5TKYA 3CQXA 3VEZA 5BRDA 3UKUB 5BR9A 2V52B 3VGLA 1BA1A 2F9WA 3TPQA 4EIAA 1NWKA 1NGEA 3BF1A 3BUZB 3LDOA 3CJCA 3EKUA 1E4FT 3LDLA 4H0PA 2Q1NA 1QZ5A 2V51B 4JAXA 1U2VA 1TYQB 4BC3A 4CZHA 3AAPA 4JHDA 3MN9A 1BG3A 2P9KA 5AQZA 5I9EB 4FO0A 4I6MB 1XQSC 1HUXA 4C23A 2NZTA 1BDGA 2E2PA 3BEXA 3VENA 3D2FB 1R59O 4CD3A 3DAWA 2W40A 1Z6RA 1TUUA 5BREA 3SMSA 1X9JA 4CZMA 2GTDA 3H45C 3O4WA 1J6ZA 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C1BA 1VSHA 1NK4A 3O9TA 2P9PA 1NGIA 2RN2A 1TKDA 2CH6A 1U2VB 4DTPA 4DFJA 1RTIA 1NK9A 1DEJA 4BECA 4WFBL 1ZYQA 1K8KA 1A5VA 1C1CA 4H5NA 4E0DA 4FZXC 5AQJA 4FLXA 1DKGD 3T1HK 4FJNA 1KVCA 3DXKA 3AVKA 3BZCA 1C0TA 3DLGA 4LH4A 2I7NA 4B9VA 4OKKA 5BRHA 3M8SA 1M1KO 3UIQA 3ULDA 4Y1CA 2PYJA 4YY3K 1XNQK 2HHIA 4OGCA 4FWRA 3O5BA 3VEWA 4DF4A 4DQIA 2F7TA 4BACA 4B1XB 4AM6A 4CJ3A 5BPNA 3U3YA 3E9PA 4BDYA 4FJJA 5J2QA 1NOYA 2E6MA 4NYFA 3CCSN 5E84A 3NGIA 3NCIA 3CCLN 1K9MO 2ETJA 3CJBA 3L6QA 4OX9K 3VQEA 4O0JA 3CMAN 3LDNA 3D45A 4XH5A 1X9WA 3CPWM 4X62K 4PQUA 4FOIA 4DQ8A 3SAGA 4CZEA 5HRNA 1QS4A 4F9OA 3U3GA 3QFUA 4WYBA 4DR2K 4DQQA 3TTCA 4C8NA 1RTHA 3CJ9A 4E7JA 4CEAA 3DLLL 4AHRA 1BQMA 1GLAG 1HRHA 4BRKA 3F2KA 2QTDA 2HSTA 5KPRA 3WXLA 2P51A 3G6EN 3IG1A 4H4MA 3RSEB 5A2QO 4CGGA 3O4NA 1T44A 4AHSA 4CJ5A 3VA0A 3LWLA 3PSIA 4XH1A 2CGKA 1YJNN 4FWOA 5BN8A 1WAJA 4QS7A 3P83D 4BDZA 4WE1A 4H5WA 1CZAN 4FM2A 3CD6N 1Z05A 1VRTA 2QKBA 3C0BA 3V81A 3P1GA 2P1JA 3ZSXA 3KLHA 1YHQN 3V9WA 2FLOA 5AQKA 4N5SA 2YKNA 4RW8A 2O8BA 1HR0K 4IOAL 4A62A 2NRTA 4YOYA 3HRGA 4QAGA 3T1YK 5HLFA 2KKZA 4NLCA 2RF2A 2P9KB 4FWMA 2ZJPL 4B1UB 4Z0UA 3VQ7A 3RMAA 5ADXA 1HQUA 3PIOL 3FFIA 3ULEA 4AILC 4EFHA 5EX5A 4FLZA 1FJGK 1FK9A 2CGLA 1BA0A 2PY5A 4BGAA 3TAGA 2D1KA 3QB0A 3EY1A 1N34K 3NF9A 1NGCA 4YHHK 4LY7A 1QE1A 4LFAK 2HNDA 3LP0A 4CF9A 4CW7B 1SV5A 3KK2A 4ZTJA 3VQQA 2A5XA 4H0XB 4OLBA 1VQ9N 3W0LA 5BN9A 3CCUN 4JI5K 1KFDA 4JKAA 4DV1K 2D0OA 4XJXA 4KFBA 1NLVA 3AV9A 3UE5A 3THWB 4A2AA 3U6FA 5AQGA 4BRGA 3ZX2A 4JI8K 3ZX0A 1TUYA 4FLVA 1S1VA 2Z1JA 4JS4A 1Q9XA 1BI4B 2ASOA 4DR1K 4IG3A 3O4QA 4TSXA 2VWJA 2Y1JA 3TR8A 1DGKN 3ZT2A 1BISA 5C42A 4WCEL 3CC4N 4BRPA 4DF8A 3AVJA 2E1YA 3FZKA 3PIPL 3HYFA 5HRSA 1W97L 2RPIA 1BGXT 5F2RA 3T7ZA 2AJQA 3UKUA 4H0TB 3L4IA 1LW0A 5HBMA 4KHQA 1YVUA 3O1WA 1LWFA 4DTXA 3ZT4A 1NOZA 3VF6A 1TYQA 3VQ5A 3NF8A 1GLEG 5AZIB 4EZ6A 4ILJA 4DTMA 3O9RA 2YJFA 3MN6A 2KFZA 3CQYA 4OPAA 3ID6A 3NF6A 4CBWA 5M1NA 4JKHA 3KIOA 4DSIA 4E19A 2O8FA 3M8QA 2IVNA 1K73O 1YAGA 4FJHA 4FK2A 2YV0X 4G1QA 4DTOA 4DUYK 4CJPA 4NLBA 4DV0K 1X3NA 2O8CB 4E3SA 3WXMB 1RT1A 4CFDA 4FK4A 1EO1A 5CY4A 4M63C 1VQMN 3H1QA 4W5NA 2QM1A 2ZWHA 3EL2A 2YKMA 4B9LA 3M5RA 3V9UA 4DWIA 1NM1A 4HUGA 4HWIA 1OH7A 4CJKA 3JSMA 2RHKA 1TK5A 1L3VA 3U9ZA 3FZFA 3C6TA 3SAHA 3FE1A 4OJRA 3O3GA 4JI0K 4G9ZA 1T8EA 4FJLA 2QWNA 3OYLA 2UUCK 5GINA 3M1FA 4GY2B 1L3SA 3OYDA 4B9SA 1NK0A 3A0IX 3QMLA 3D6RA 4FW2A 3NGYA 4NCGA 1CXQA 1SL1A 4JLHA 4YFUA 3NH0A 1W0HA 4ISFA 4IOCL 1HNVA 2GUPA 2AP1A 1X9SA 1RTDA 1NGDA 1U04A 3QINA 3OYNA 5JICA 2HW3A 1KLNA 2GWKA 4CGHA 1WSIA 5J2PA 5EVZA 4E1MA 4CHPA 3QO9A 2E2QA 3KLIA 4A59A 3NFAA 5M1FA 3A5NC 2P9LB 5FROA 4KO0A 3VQPA 4F2RA 3QIPA 4FWSA 2YX6A 3DOLA 1TKTA 2P9UB 1IG8A 1MDUB 3EE8A 2HMIA 4M3TA 3OYMA 4NYNA 2FBVA 2G8UA 5AQNA 1G99A 4CF0A 5FDLA 4IJAA 1YF5L 3CC7N 3L2VA 1KQSM 1EP4A 4LSLA 3LM2A 1IBMK 4E7LA 3SPYA 3SI6A 1X9MA 4OKJA 4R5PA 3MWPA 4O5BA 3SQ1A 1VQNN 3F5TA 3SQ2A 3LL3A 1KD1O 3THXB 1FKPA 1RNHA 2ITMA 3CCMN 4J2DA 4BG9A 4YNQA 2D5RA 4CFCA 1JKHA 4JS5A 3VQBA 4CF8A 3TSQA 4K8XA 1ILYA 1NG9A 2X6NA 4WQ5A 3FZHA 3ZCMA 1FW6A 4ILHA 4ZHRA 4E72A 1HX1A 2DPNA 3K9KA 2O8DA 3VTHA 3E01A 3LZIA 1RDAA 1VSJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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