4H03B

Crystal structure of nad+-ia-actin complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 122
structure length 357
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h03B03
3UKRA 3M6GA 5AQVA 1T6CA 2YJFA 2YHXA 2D0PA 3EKSA 3SMPA 5AQKA 3IMXA 4B1VA 5AQLA 3W0LA 2QXLA 4CBWA 1NGJA 1Z05A 3WXJA 2H3GX 2P9KB 3VEZA 3CQYA 1Y64A 2P9LB 5AZJB 3A5OC 2QW9A 4GY2B 5E84A 5AQNA 1BA0A 4BROA 4FPBA 5LY3A 3R8EA 5JLFA 5JICA 3O5BA 4JAXA 3SJHA 4F9OA 2GTDA 4E1JA 1NGEA 1ZBSA 3DXKB 1BDGA 3HSCA 3EKUA 3LDPA 4FOEA 3AY9A 2Q0RA 5F0XA 2GUPA 4FWMA 4BVOA 3HZ6A 3MN5A 4FOIA 2Q36A 2QWOA 3FZMA 4CZLA 3GL1A 3BF1A 4EFHA 3QFPA 3P4IA 1JCEA 3WXIA 2EWSA 1NLVA 4H0PA 2VCPA 5B8HA 2ITMA 4B1WB 2OANA 4K42A 2PBDA 3UE5A 1P8ZA 5AQXA 4BVPA 4QS7A 4PL8A 4PKHA 1GLAG 3WXKA 1GLDG 1NMDA 1QQMA 3OHRA 3A5NC 3MCPA 3O6WA 3EO3A 4BRKA 2ZF5O 5JMVA 5AZIB 3KZBA 2ASOA 3I8BA 4FWSA 4RCHA 4H0TB 3H45C 2QWMA 5FPMA 2QM1A 2P9IA 5AR0A 1QQOA 2IIRA 4BRGA 4BRPA 3ZX2A 2CGLA 3CERA 5KPRA 4DHYA 1BWFO 3LDNA 1T6DA 4H5NA 4C23A 1QQNA 2E1ZA 2NZTA 1TYQA 1MWKA 2A41A 5AFUA 3VEYA 4QS8A 3SK3A 3JXUA 4IWVA 4NB4A 1U2VB 3EL2A 3ID8A 3U9ZA 1K8KB 2FLOA 3WT0A 3H3NO 1NGHA 3CETA 5KQDA 2NRHA 1HJOA 2W40A 2P9PB 2V7ZA 3ENHA 4O8KA 1HKBA 1GLFO 2D4WA 4BC2A 3C7NB 4CBXA 4WQ5C 1CZAN 3DAWA 2IVOA 4FWRA 1NGDA 4H0YB 5AQPA 3BP8A 4BR4A 5AFUH 4CZGA 3H1VX 5KPZA 4BRCA 4XH5A 4CZIA 2Q97A 5BRFA 3LL3A 2QWQA 1YVNA 2P9SB 5AQOA 1GLBG 3ULEB 4JD2B 5FPNA 3ENOA 1TUUA 3CIPA 3O8MA 4GNIA 2FSKA 4XH1A 3WEEB 3ZEUA 1J6ZA 5BREA 2FSNA 3EN9A 1DGKN 2PAVA 5FPEA 2A5XA 4FWOA 1ATNA 3QFUA 2GWKA 3ATVA 3TPQA 1HLUA 3MN7A 2FXUA 4YDUC 5I9EB 3VF4A 3M3ZA 4WYBA 3VENA 3F9MA 3DXMA 5AQRA 1ATRA 4BG9A 2KHOA 1NGFA 2CGJA 3BF3A 4I6MB 5AQJA 3RSEB 2QWLA 4BGBA 4BRAA 4BRMA 3MK6A 5AQYA 3VETA 4DCHA 4BRHA 4CD3A 1YUWA 3BEXA 3O80A 1KXPA 1ESVA 1X9JA 3MN9A 3VEXA 3KVGA 3VGMA 4IJAA 5BPLA 4H03B 5BRDA 2BUPA 3HM8A 2ASMA 5E26A 3DXKA 4H5RA 1C0FA 3C0BA 3O08A 4QS9A 4PL7A 1GLCG 2A42A 1NWKA 3TU5A 3D2FA 4BQZA 4CBUA 3D7EO 3HTVA 4M7YA 2F9TA 4A2BA 3CJ9A 3GOIA 1HKCA 3UKUA 1D4XA 4CJ7A 5AQMA 1Q18A 5EX5A 2ZGZA 4WQ5A 3VEOA 4ISEA 5F2RA 3AAPA 4BRLA 2YHYA 3EZWA 5BPMA 1YXQA 3FZLA 4MLEA 3L6QA 4BRFA 1NM1A 3CHWA 1EQYA 5ELZA 3AAQA 5LJVA 2A3ZA 1GLLO 4JHDA 2AP1A 2I7PA 4CZHA 4H0OA 4CZKA 1NGGA 1LOTB 1XQSC 3VGLA 3QICA 4A2AA 4BR7A 5AQSA 3ZX3A 4B1YB 1SZ2A 1XC3A 2J4RA 1NGBA 3SMSA 5EXWA 4L3QA 3HBTA 5AQUA 3VEWA 1BU6O 2QWPA 4YDUA 4BREA 3W3DA 1TUYA 3L4IA 1G99A 1HKGA 5EOYA 3U9DA 2Q2RA 4H0VB 2P9NB 1ZC6A 4WQ4C 1IG8A 2A40A 4XEIA 1U2VA 2CH6A 4H5WA 3U8XA 2V7YA 1K8KA 5BR9A 3FFKB 4CZMA 4CZJA 2VYPA 1ZXOA 3CJ7A 1GLJO 5JLHA 2P9UA 3KHYA 4BGAA 4EIAA 1QZ5A 2P9IB 3C7NA 3QBXA 5KPTA 1NGIA 3A8YA 4J8FA 3VPZA 3U4LA 2E2NA 1NGAA 5AQWA 2E20A 5AQTA 4B1UB 4M63C 3VESA 4BQLA 5ADXH 1WOQA 4A62A 1YAGA 3M1FA 3IDHA 1IJJA 3ULEA 4JD2A 4HTLA 1RGIA 2E1YA 2YHWA 4FWNA 3WEEA 2A6AA 4Z94A 3JS6A 3VEVA 1DEJA 2DPNA 4DB3A 3SLCA 4NO7A 4CD1A 2IVNA 1MWMA 3CJCA 4LC9B 2IVPA 1R59O 3WQUA 2AA4A 2BTFA 2V51B 4CZEA 4IZ9A 2GELA 1Z6RA 3CI5A 4BR9A 3RSEA 5BRHA 3QB0A 4BR2A 3ZETB 4BRNA 2P9KA 2D0OA 5TKYA 2P9LA 5AZJA 3FLCO 1JCFA 5KQ8A 3VERA 4M7XA 1QZ6A 1BG3A 2QWRA 1BOTO 3ZEUB 2WUSA 4WQ4A 4B1ZA 3D2EB 4BG8A 4XH4A 5EVZA 3R9PA 1E4FT 3B8AX 1NBWA 3LM2A 4FWLA 2YJEA 2ASPA 2E2QA 3UKRB 5FPDA 2GWJA 3VF2A 3FR0A 1RDWX 1X3MA 2E2PA 2HF3A 5AQIA 4BR5A 3A0IX 3GE1A 1HUXA 3O1WA 2GEMA 3IFRA 3VOVA 3CQXA 3H6EA 3G25A 3MN6A 4FPAA 1V4TA 1MDUB 3DXMB 4HWIA 3O4WA 3DJCA 3FZKA 4BR0A 4FO0A 3QMLA 3WUHA 1V4SA 2YCHA 4Y0WA 1S3XA 2HMPA 1HPMA 2Q31A 4BRDA 1BO5O 2FF3B 3WXLA 4MO4A 4H5VA 3QDKA 3O1BA 4K25A 3VF6A 3I33A 5F1XA 4ISFA 4FWPA 4EHTA 5AQZA 5AZIA 2QWNA 3ZX0A 3DWLA 3A5MC 1T44A 3D2FB 1KAXA 1E4GT 3VGKA 3R6MA 3AARA 2F9WA 3GBTA 3L0QA 3UKUB 4RWTA 5BN9A 4JNEA 3HI0A 3J8AA 3MDQA 1KAZA 2P9NA 3LDOA 3IUCA 2ZWHA 3LM9A 1H1VA 2D1KA 4MLHA 3BUZB 5AQGA 4FL9A 1BA1A 1MA9B 4AM6A 4B1XB 2V52B 4IO8A 1BUPA 3FZFA 5AQQA 1S22A 1GLEG 5BPNA 2E8AA 4H0XB 5LJWA 2E88A 2VWBA 5ADXA 5AQFA 1ATSA 4AM7A 1C0GA 4JHDB 4MO5A 4B9QA 2Q1NA 2P9PA 3H3OB 1LCUA 4O5FA 2HOEA 1OKJA 3ATUA 4FSVA 2ZGYA 4EHUA 3LDQA 4IJNA 3UB5A 4PKGA 1RFQA 1SQKA 2Q0UA 4FWQA 1SAZA 1QHAA 2E2OA 4H5TA 1U6ZA 3GG4A 1HX1A 1JCGA 4FWKA 4BRIA 4PKIA 2FF6A 2P9SA 4RTFD 5BN8A 4K41A 3MMVA 1DKGD 1TYQB 3FZHA 2NLXA 4ISGA 4EAHD 3GDQA 2P9UB 2W41A 5AQHA 3CJAA 4CI6A 4BRQA 4CZFA 4JN4A 4BC4A 2I7NA 2UYTA 2CGKA 2YI1A 2HF4A 3QBWA 4A61A 1NGCA 1WUAA 3ZETA 5EY4A 3FE1A 1XUPO 4I6MA 3CJ1A 3A5LC 3WQTA 4BC5A 3S41A 4K43A 2FSJA 3H1QA 3CJBA 3LDLA 2CH5A 3FGUA 1X3NA 3H46O 1KAYA 4KBOA 4BC3A 4DQ8A 3D2EA 5CE3A 4IXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SUOA 3QLHA 4B3MK 3EYZA 1W7AA 2YJFA 4XJXA 1RT7A 2D0PA 3EKSA 3MWTA 4IOXA 1VRUA 3EE9A 5AQLA 2QXLA 1RT4A 4AHSA 1Z05A 2R7YA 2IGIA 3PUFA 4ID5A 3TAEA 2P9KB 1NK7A 3DLHA 2PFUA 3FFIA 1A5WA 4CHYA 1TK0A 5LY3A 2D0AA 4O55A 4DR1K 1NK4A 4KI6A 3O5BA 4FM2A 3M8QA 3AVIA 4DR2K 2HHWA 3EKUA 2Q0RA 3S3OA 4FOIA 3MXIA 3FZMA 4CZLA 1SKWA 3P4IA 3THVA 4AHUA 5FROA 2LSNA 4F4KA 2OYQA 4K42A 3O9TA 5J1EA 3O9RA 4ID1A 3KKRA 5AQXA 4QS7A 1OH5A 4LF4K 3OHRA 2O4GA 4W5QA 4CIEA 3VQ4A 3U3YA 3OYGA 4JKBA 3VQBA 3A2FA 4H8KA 2F8TA 5FPMA 5CZ1A 3AV9A 3AO3A 3E66A 2O8DA 3C6AA 5SWMA 3QIOA 4FLUA 2IIRA 4BRGA 3CPEA 4BRPA 3AA5X 3AVAA 5KPRA 4AF1A 1BWFO 1NJZA 1U47A 1DLOA 2QK9A 3C6HA 3CCLN 2JWKA 5AFUA 2JLEA 4JI4K 1U2VB 1L3VA 3U9ZA 4JKDA 1K8KB 1RDUA 2FLOA 1ZBIA 1NGHA 3RMCA 3OS2A 3DRSA 4EZ6A 4M42A 3O4NA 3SAGA 1J53A 5D3GA 4FWRA 2VWKA 1KFSA 5AFUH 4KH5A 4CZGA 5KPZA 4BRCA 2Z1HA 3CCQN 3KK7A 1YVNA 1TL3A 3E9LA 4CJ4A 3VQ6A 2P9SB 4JD2B 4HHTA 4YOYA 3L2VA 1YITN 3AO5A 2FSNA 4E1NA 3PV8A 2A5XA 1ATNA 1S1UA 5KGXA 4KFBA 1JLEA 3QFUA 3TPQA 1HLUA 1VQ9N 4YDUC 5GIPA 3THWA 2DFEA 1IO2A 1ZBUA 3CC7N 4K0KK 3QEIA 2QTDA 5AQJA 2CGJA 3RSEB 3BF3A 3EEQA 4LSNA 1S9EA 4KTWA 4BRAA 3TSQA 1KVBA 3AO1A 4X62K 3MK6A 4DCHA 4BRHA 2PY5A 4CESA 1KVAA 1VSMA 1YUWA 2XY6A 3O80A 1IKVA 1ASVA 4IFEA 1ESVA 3SUNA 1I3AA 1KLMA 3MN9A 3VEXA 3KVGA 3VGMA 4IJAA 1D9DA 4H03B 4CHNA 2ASMA 2UUCK 1QVGM 1C0UA 3O08A 1S1WA 3SV3A 3SYZA 3AVHA 4HUEA 4DKWA 4KPYA 3ALYA 4A2BA 4CFAA 4ICLA 3UKUA 1U45A 4CJ7A 1Q18A 5EX5A 3PSFA 4WQ5A 3VEOA 4ISEA 5CZ2A 3NCIA 1WSJA 3NVKA 1HPZA 4V19S 4A5BA 1NNEA 3AVNA 3JAMO 1VSLA 4MFBA 3KTQA 4M3WA 5LJVA 3F73A 3DLRA 1OH7A 1WNSA 3HOTA 2I7PA 1WBDA 4CZHA 1S9GA 5HROA 4CFBA 3QICA 3B6PA 4A2AA 4CIFA 4BR7A 4CJSA 3NAEA 1LWEA 5BR8K 2J4RA 2EX3A 4L3QA 3QETA 1BGXT 3HBTA 5AQUA 4CFCA 3VTHA 2X6NA 1J5EK 5EOYA 3PIOL 4C1NK 5KI6A 3NMUA 3K5MA 1IG8A 2GBZA 3I8DA 4O0IA 1U2VA 1YIJN 3U8XA 2V7YA 1K8KA 4DTOA 3NF6A 1T05A 1NMNA 3KHYA 1QZ5A 3O3GA 4GKKK 3VPZA 1HMVA 2DY4A 3KLEA 1VQON 4BQLA 3VESA 4CCHA 3MECA 4KHNA 1WOQA 4KRFA 5CYQA 2Z1IA 3SZ2A 4A59A 4JD2A 4FWNA 4PWDA 4DUZK 3R3LA 2G8IA 3C6TA 1DEJA 3G0ZA 2DPNA 5M1KA 1BCMA 2OPPA 3SLCA 3KD5E 1GOBA 2OPSA 1OH6A 2IVPA 4YOWA 4J2AA 2AA4A 4IZ9A 2GELA 3CI5A 2I5JA 4C8LA 3RSEA 5BRHA 4OPHA 3F9KA 5C15A 5HRPA 4BRNA 3TAQA 5AZJA 2DFHA 5MLCQ 3ZEUB 1BOTO 4KO0A 3TAGA 4WQ4A 4DQQA 1RT5A 3VA3A 4BG8A 1VSHA 3OY9A 3LM2A 3B8AX 3PY8A 1ZYQA 2ASPA 3UKRB 2ZM6K 3VF2A 4AHVA 4ZTFA 4BDPA 5AQIA 4BR5A 3HP9A 3JSMA 4AHRA 1Y97A 1JJ2M 5DMRA 3VOVA 3IFRA 3CQXA 3H6EA 4HWIA 3DXMB 3K0SA 1O13A 1KD1O 2G8HA 3KWIA 4BR0A 2VG6A 3QMLA 2IAJA 1S72N 4CERA 4JRPA 2HBKA 1NJXA 4FJHA 2ZJPL 2NRRA 4BRDA 1WN7A 2KQ2A 3J7ZO 4MO4A 3L4QA 5GINA 4AH9A 4JRQA 1EWRA 5CY4A 4OPJA 1N5YA 3NGYA 2HNYA 2YNFA 2B5JA 3D0PA 3G71N 2HBLA 3DWLA 1XHZA 1T44A 1JLGA 2O8BB 3OYFA 4DSIA 4RW9A 1HYZA 3R6MA 4OPAA 1YI2N 4DV4K 3M5RA 3L0QA 4RWTA 3NBPA 3ISNC 5AQGA 2ZWHA 1H1VA 4FJJA 4RG8A 3I0SA 4B1XB 4DFKA 4OVLA 1A5VA 4H0XB 3S5TA 1XWLA 2ZJQL 4AM7A 1C0GA 4MO5A 3M8RA 4E19A 3T1YK 1RDBA 4EZ9A 2P9PA 4O5FA 4F2SA 3ATUA 4W5NA 5M1QA 1TVRA 2O8FB 2W6KA 4CK2A 4CEQA 5I42A 2E2OA 1S1XA 1U6ZA 1HX1A 2NNWA 4F3TA 4PA1A 4BRIA 3LPUA 3P39A 2FF6A 3HVTA 4CHQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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