1JCEA

Mreb from thermotoga maritima
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
KDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
total genus 100
structure length 333
sequence length 333
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jceA03
4ISEA 4BRMA 4L3QA 1KAZA 2YHXA 3CJ1A 3VGMA 4IO8A 4O8KA 3I33A 3HBTA 3LL3A 1Q18A 1T6CA 5AQKA 5EVZA 4CZHA 2FXUA 2ZF5O 2P9IB 3L6QA 3LDQA 1Z05A 4J8FA 2IVOA 3BEXA 3WXJA 5CE3A 3BF3A 5AQJA 4LC9B 4WYBA 2A41A 3P4IA 4BC2A 3SJHA 1GLEG 4H5NA 4Z94A 4NB4A 3VENA 4YDUC 3W3DA 4JD2A 1HLUA 3A8YA 1QQOA 4NO7A 1R59O 4FOEA 4E1JA 2CH5A 5AQYA 2E8AA 3O1BA 3H3OB 5AQMA 4RWTA 3KZBA 2D0OA 2A40A 3L0QA 4B1UB 2Q1NA 3ATUA 1DGKN 3UKRA 4BRNA 4CZJA 3FGUA 3VEZA 1BG3A 5KPZA 3VF4A 3R8EA 1V4TA 3MN6A 5ADXH 3H46O 1DEJA 1ESVA 3ULEA 3B8AX 1IJJA 1NLVA 4KBOA 3UKUB 3WXLA 4BGAA 4DHYA 3HZ6A 5BN8A 1BA0A 2FF3B 5AQWA 4BRHA 2W41A 4BG8A 4PL8A 1HUXA 3UB5A 3CQYA 3FZHA 3VGKA 1ZXOA 3SLCA 3VESA 3CIPA 4H0OA 2YHYA 3LDOA 3O5BA 3DWLA 5I9EB 3SK3A 3IFRA 1NGGA 2WUSA 3IDHA 5FPNA 2ASPA 1GLFO 1SQKA 1G99A 4FWMA 5BRDA 1OKJA 2GEMA 4I6MB 2QWOA 5BPNA 4EHTA 1QQMA 3CJBA 2AP1A 1ATNA 5AQRA 2Q0RA 3HTVA 3FZFA 1HKCA 4BC3A 5FPEA 1Z6RA 4CZIA 2QWNA 1GLBG 3D2EA 4Y0WA 3W0LA 3MCPA 3DXKA 4MO4A 5JMVA 3BP8A 3WEEB 3CETA 1TYQB 4H5RA 3R9PA 4MO5A 1KAXA 3CJCA 4CBXA 4BC5A 3FZKA 2GWJA 1EQYA 4H0PA 2PBDA 3C7NA 4HTLA 5AQGA 3GBTA 3CQXA 4ISGA 5AQLA 3U9DA 1HPMA 4K41A 3UE5A 2F9TA 3CJ7A 5LJWA 4FWRA 4BRGA 3GDQA 1NGAA 3CJ9A 5AQZA 2A3ZA 3IMXA 3AAPA 3JXUA 3F9MA 2ZGZA 4BR7A 4FWNA 2YJFA 2P9IA 2IVPA 4AM7A 2IVNA 4M63C 4B1WB 2QWLA 4CZGA 4PKHA 2BTFA 5AFUA 4K42A 4BR9A 4BREA 4GNIA 3WT0A 1BO5O 3VEWA 2P9NB 1U6ZA 4FL9A 4FWKA 1WOQA 3U4LA 3RSEB 2E20A 5EXWA 4JNEA 4BRQA 3H6EA 1NGCA 4FWPA 3LDNA 2VCPA 3GG4A 1QZ6A 4BRCA 3FFKB 2ITMA 5BRHA 4MLHA 5KPRA 5JLFA 5KQ8A 1RDWX 4BVPA 1X9JA 3MN5A 3H45C 1BWFO 2DPNA 3U9ZA 3JS6A 5AQXA 3O4WA 4BRFA 2D1KA 3O1WA 4K25A 3ENHA 1E4GT 2CH6A 1C0FA 2P9UB 3FR0A 2CGLA 4PKIA 1NGBA 2QWPA 4WQ5A 3D2FB 1LOTB 4BRLA 3MDQA 5AZJA 2GELA 4CJ7A 3A5OC 4A2BA 4BR4A 3UKUA 3O80A 3QB0A 1HKGA 4CD3A 5E26A 2E1ZA 3WXIA 4B1VA 1E4FT 1BA1A 4BG9A 1KAYA 2FF6A 5AQUA 4HWIA 3M3ZA 4WQ4A 4BQLA 3QICA 1MA9B 5BPLA 3ZX0A 5AZJB 2ZWHA 1JCGA 3QMLA 3WXKA 3EKUA 3CI5A 2I7NA 1X3NA 2P9SB 2YHWA 3KHYA 4H5TA 4I6MA 3DXMB 3A5LC 4BRAA 1V4SA 4EFHA 4BRIA 4H0YB 1TUUA 1NGIA 3M1FA 2P9PB 3H3NO 2ASOA 5AQFA 3VEOA 4BGBA 5LY3A 4QS8A 2FSNA 3L4IA 4DCHA 4EAHD 2H3GX 2Q0UA 1YAGA 1NMDA 1YXQA 1TYQA 3WEEA 1NBWA 3BF1A 4IWVA 2HF3A 1IG8A 4ISFA 1K8KB 4O5FA 3HI0A 4BC4A 3VEYA 5AQOA 1TUYA 3VETA 5AQSA 4MLEA 3WQUA 4YDUA 1ATSA 3FZMA 2J4RA 3ZETB 2QXLA 4XH5A 3SMSA 1QQNA 4IZ9A 3ZEUB 2VWBA 4A61A 4CZFA 2UYTA 3ZX3A 4CBWA 1U2VB 4JN4A 3ID8A 1RGIA 3KVGA 2GWKA 1NWKA 3CERA 1MDUB 3QBXA 1ATRA 4M7XA 4A2AA 4FOIA 2QWRA 1QZ5A 3U8XA 1Y64A 4FWOA 3EO3A 3VF6A 5KQDA 2P9NA 4M7YA 2P9KB 3LM2A 1RFQA 2V51B 3RSEA 3O6WA 5AR0A 2EWSA 4PL7A 2GUPA 2D4WA 4BROA 1T6DA 2CGKA 4F9OA 4RTFD 1GLCG 3M6GA 2KHOA 4PKGA 4JHDB 1T44A 3ATVA 5FPMA 2I7PA 3SMPA 4CI6A 1C0GA 3LDPA 4BRPA 1JCFA 1S22A 5F1XA 4H0XB 3MK6A 2W40A 1JCEA 2P9UA 5ELZA 3DAWA 3D2FA 2P9LA 3GOIA 3EZWA 4CZMA 2E88A 1P8ZA 3H1QA 3VEXA 4BR2A 4XEIA 3LM9A 1XQSC 2E1YA 2V7ZA 1XC3A 1BU6O 3VEVA 4B1YB 2PAVA 5KPTA 3A5MC 5BR9A 5AZIA 1LCUA 5B8HA 5AQPA 2NRHA 3HM8A 1S3XA 5AFUH 2P9LB 3EL2A 4BR0A 1KXPA 2HMPA 3MN7A 3C0BA 5BPMA 5ADXA 3O8MA 4DB3A 1NGEA 5JLHA 1YUWA 4QS9A 2V7YA 3IUCA 3QFUA 4BVOA 2NLXA 4IJNA 1BDGA 2QWQA 4H0VB 2FSKA 1ZC6A 1MWMA 2P9SA 5JICA 3AARA 2AA4A 3DXMA 5AZIB 1GLAG 4CZEA 5F0XA 2Q97A 2Q2RA 3VPZA 1MWKA 5LJVA 1NGFA 5BRFA 2HOEA 1SZ2A 4FWLA 3TU5A 4H0TB 2P9PA 3I8BA 2A42A 1NGDA 3GE1A 3EKSA 4FPBA 4JD2B 3H1VX 3ZX2A 2QW9A 3AY9A 4CD1A 2GTDA 3QBWA 5EX5A 2NZTA 1GLDG 4A62A 2ASMA 4H03B 4EIAA 5EY4A 1J6ZA 2Q36A 1NGHA 1K8KA 2OANA 3GL1A 3A5NC 1X3MA 3OHRA 2VYPA 2FSJA 3UKRB 3HSCA 4EHUA 5AQNA 4XH4A 1BUPA 3CJAA 4B9QA 3ZETA 5AQTA 4H5WA 5BREA 1HJOA 4FWSA 5EOYA 3MN9A 4BR5A 3ZEUA 2A6AA 5BN9A 2FLOA 3O08A 2E2QA 1DKGD 4B1XB 4BRDA 3FZLA 4AM6A 3ULEB 3WUHA 4XH1A 1U2VA 2QWMA 2IIRA 2CGJA 3VF2A 1CZAN 3VOVA 3D7EO 4BQZA 2ZGYA 3TPQA 1GLJO 3ENOA 4FSVA 2A5XA 2E2OA 3VGLA 4FPAA 4IJAA 3J8AA 5AQIA 1D4XA 5F2RA 3VERA 5AQQA 3A0IX 2P9KA 3LDLA 2F9WA 5AQVA 4RCHA 3S41A 1NM1A 2YJEA 4B1ZA 2YCHA 3BUZB 4WQ5C 2QM1A 2YI1A 1H1VA 1SAZA 3AAQA 4FO0A 3G25A 4K43A 3EN9A 4JHDA 3DJCA 4CZLA 5TKYA 2HF4A 1ZBSA 5AQHA 1HKBA 1NGJA 4CBUA 1HX1A 3FE1A 3CHWA 3QFPA 3D2EB 4H5VA 4WQ4C 2Q31A 3MMVA 1GLLO 3DXKB 4DQ8A 5E84A 1QHAA 1XUPO 2E2PA 3QDKA 5FPDA 2E2NA 3FLCO 1YVNA 4CZKA 3C7NB 3WQTA 4QS7A 3R6MA 2V52B 2D0PA 4IXCA 1WUAA 1BOTO 4GY2B 4C23A 4BRKA 4JAXA 4FWQA 2BUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HROA 4BRMA 4CERA 3WNHA 1WNSA 1JXBA 3ZSVA 1A5WA 1XNQK 3R1XA 2KFZA 1KVCA 2ZF5O 4DTRA 4JK9A 2WOMA 3OS2A 3WXJA 3BEXA 3VQ9A 3LAKA 5CE3A 4C8OA 1RT1A 1HNXK 4CCHA 4E19A 3P4IA 3DOLA 4DV1K 3K5LA 1GLEG 4NB4A 1IV0A 1VQ8N 1KC8O 3OS1A 3OYNA 1VSFA 1TL3A 4FOEA 4E1JA 2CH5A 1HYVA 2NRVA 5AQMA 4RWTA 3KZBA 2R7YA 4BY9C 3L0QA 2D0BA 3K58A 3V9WA 4CZJA 4IG0A 4KH4A 4B3SK 3V81A 3G71N 1BG3A 4CIEA 3R8EA 3MN6A 4C1NI 3LP1A 4I7FA 4A5AA 4GKJK 3KWIA 4KBOA 3SQ0A 3I56N 2Z1HA 1BI4B 4AHUA 3HZ6A 5C10A 1J5OA 2FF3B 1YJ9N 4BRHA 3ZSQA 3O3HA 1VQ5N 3HSTB 4N47A 3CQYA 1U49A 1E3MA 3SLCA 4WE1A 1W2BM 4FLUA 3TABA 3DWLA 4JKDA 3SK3A 4G1QA 2VQFK 4YOVA 2ASPA 4IG3A 3M8SA 3AVGA 2XY5A 2QWOA 4CJLA 5C42A 2Q0RA 5GINA 3HXMA 5M1NA 3DLRA 1Z6RA 3THVA 3LPUA 4CZIA 4KB0A 1KLNA 1IG9A 1GLBG 2KQ2A 4Y0WA 4W5TA 3W0LA 3QEIA 4CHOA 1S1XA 3CCJN 1TYQB 4DS5A 5LMUK 4CBXA 1EQYA 1EXQA 3C95A 3MXMA 4R5PA 3O9SA 4ISGA 5AQLA 3U9DA 2Y1JA 4IO9L 2F9TA 1SL1A 3K5NA 4KB1A 4JLHA 4BRGA 3GDQA 2WBNA 3DYAA 3K2PA 3AAPA 3AVMA 3JXUA 3F9MA 4B3TK 2ZQBA 3VQEA 3E66A 3NF6A 4FWNA 2YJFA 4AM7A 1ITGA 3KD1E 4ZTFA 4F3OA 4M63C 3RMAA 2ZD1A 3TAPA 1T8EA 1SV5A 4K42A 1YJNN 4PY5A 1JL2A 3P83D 4BECA 1VHXA 4CEAA 1BO5O 1TKDA 2F8TA 1RNHA 4DUZK 4JNEA 1OH7A 1W0HA 1YJWN 3DLGA 3SI6A 1NGCA 3SYZA 3TSPA 2ITMA 3PX6A 5KGWA 5KPRA 1QSSA 3OYBA 3TSUA 1BWFO 2IC3A 3T1AA 2D1KA 3O1WA 4J2EA 4K25A 1HPZA 3RR7A 3DLLL 1NGBA 2QWPA 4FK0A 4BRLA 3NH0A 1XC9A 2GELA 4CJ7A 4Y1DA 4A2BA 2UUAK 4DFMA 5JS2A 1BI4A 3M8QA 3OYAA 5GAGP 5AQUA 1HNWK 4FCYA 1MA9B 2W6LA 3VQ5A 4DQQA 3RVCA 3CI5A 3AA3A 3E1YA 3ZSZA 3P39A 3WXMB 1FKPA 1VSIA 4H0YB 2LSNA 3PIPL 3VEOA 3K5MA 3TR8A 3VQBA 4DV2K 1NMDA 3M5RA 1TYQA 4FJIA 3MXJA 1RDCA 4CJRA 4CGHA 1WSHA 4CFDA 5HLFA 4FJXA 1JLFA 4WFNL 4AF1A 4NXMK 5AQOA 4X65K 3CYGA 1BL3A 3TAGA 4B3OA 4NCGA 3BY5A 3ZETB 4BWMA 4XH5A 2B6AA 3ZEUB 3T1HK 2UYTA 3ZX3A 4JN4A 1EWQA 1RGIA 2GWKA 3NDKA 3HPHA 3KK7A 4M7XA 1VQPN 2DFHA 2BE2A 3U8XA 4DQIA 4FK4A 3L2QA 3KWGA 1M90O 1KVBA 3J7AP 4KTWA 2XO7A 3EO3A 3C94A 3IAYA 2G8WA 3LALA 4M7YA 3CFOA 3NBPA 1VSKA 2HMIA 4LFAK 3SNNA 4YHHK 3TAEA 1T6DA 3KLEA 1YF5L 3MECA 4DV0K 2FBXA 3K9JA 1TVRA 3KLFA 4CHYA 3M6GA 2XHBA 4JHDB 3CC2N 3MWPA 5FPMA 4KH5A 4AHVA 4CI6A 4MQ3A 1F21A 3LDPA 2P5OA 1S22A 2IGIA 4NYNA 4CJEA 1NKCA 4CJSA 2NNWA 4IBNA 5ELZA 1R0AA 2BGGA 3D0PA 2RF2A 1DTQA 2P9LA 4DKWA 4MDAA 3AV9A 4XEIA 4CFCA 1XC3A 1BU6O 1TKTA 2KZMA 5BR9A 4LSNA 3PUFA 1LCUA 4EZ9A 1S3XA 1KVAA 4BR0A 1KXPA 1RT4A 5ADXA 2Z1IA 4CIFA 5HRSA 2A1RA 3C6HA 3AO2A 3V1QA 5JICA 4CE9A 1Z25A 2HHUA 3V9ZA 5AZIB 1GLAG 1N6QA 5F0XA 2Q97A 2OTLN 3HRGA 3ZT2A 4HHTA 5BRFA 2YV0X 4GV9A 4OGEA 4UY8O 3S3MA 3I8BA 2A42A 4JD2B 3H1VX 3ZX2A 4DTXA 1VAZA 1SS6A 3AY9A 4CGJA 3PX0A 5EX5A 2DFEA 3J7YP 4KHYA 1GLDG 1RTDA 1VQ4N 4EIAA 3C6AA 3VA3A 2Q36A 1LW0A 3A5NC 3J7ZO 2FSJA 4RW9A 3TAMA 3UKRB 4F8RA 1B92A 4XH4A 3HP9A 4B9QA 3ZETA 2P5GA 4H5WA 4KHUA 3ZEUA 2A6AA 4ZHRA 2FLOA 4FLTA 3NF9A 5C2FA 4RG8A 1VQKN 1VSEA 2QWMA 2IIRA 2ZJRL 3AA2A 1QSLA 3D7EO 2ZJPL 4JKAA 3LWMA 5A2QO 1YHQN 4LH5A 5AQQA 4DTUA 3A0IX 3T69A 3LDLA 3ZT1A 3VTHA 3QEXA 4B1ZA 1BCOA 1KRPA 1NK8A 4CFBA 3AAQA 4FO0A 2HBKA 4JHDA 4CZLA 3MEDA 3NFAA 5MLCQ 1HKBA 1NGJA 1RBSA 3AVHA 4O55A 3TI0A 3CHWA 3QFPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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