1JCEA

Mreb from thermotoga maritima
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
KDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
source organism Thermotoga maritima
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 100
structure length 333
sequence length 333
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jceA03
2I7NA 3FZMA 1BOTO 3BF1A 2QXLA 4BQZA 3VGKA 3CERA 4BVPA 3FZLA 3FZKA 2D0PA 4A62A 4M7YA 4IJNA 2Q0UA 3ZX3A 1NWKA 4KBOA 4H0OA 3VF4A 3QBWA 1RGIA 3MK6A 5KQ8A 2Q97A 5BPMA 5FPDA 3LDQA 4GNIA 2A42A 5AQUA 5AQXA 2QWPA 4M63C 3D7EO 2BUPA 2GWKA 1GLJO 3VEXA 5F1XA 3GL1A 4FWSA 2I7PA 4PKHA 4GY2B 4XEIA 3CETA 4BRPA 5AQVA 3VGMA 3SLCA 1DEJA 4XH5A 4B9QA 3R6MA 5EOYA 4ISEA 3LDNA 3VEWA 4BRDA 3ZEUB 4FL9A 3S41A 5BN8A 1WUAA 1HKCA 3EZWA 5AFUA 2YCHA 3CQXA 3M3ZA 5KQDA 1MA9B 3BP8A 3P4IA 2HMPA 4BRLA 2ZF5O 5ELZA 4B1ZA 1QZ5A 1TUYA 5AQFA 4HWIA 2VCPA 2CGKA 3OHRA 4H0PA 2YHXA 1HX1A 1QQMA 1BUPA 2P9KB 3SJHA 3IFRA 4CZMA 2P9UB 3RSEB 1LOTB 1U2VB 2P9NB 4BC5A 4CD3A 3DXKB 4DCHA 1MDUB 2YJFA 2NRHA 4IO8A 4L3QA 3W0LA 2ZGYA 3O1WA 3O5BA 2V7YA 4CD1A 1BDGA 3CQYA 3D2FB 3QMLA 1NBWA 1NGBA 1IG8A 4BRNA 4PKGA 3ZEUA 2J4RA 4J8FA 5AQKA 1NLVA 1GLFO 4NB4A 4H0XB 4RCHA 4YDUC 1R59O 1V4TA 4CZHA 4CI6A 5JLHA 4IWVA 4BR9A 2P9KA 4FWKA 5F2RA 4NO7A 2NLXA 2YHWA 2ZWHA 4JN4A 2P9UA 3RSEA 1U2VA 2P9NA 3A5LC 4QS7A 3O08A 4H0VB 1DGKN 3CHWA 3DXKA 3HI0A 5AR0A 3VENA 5AZIB 4CBUA 1C0FA 5E26A 5JLFA 1BA1A 3VEZA 1LCUA 5AQZA 2Q31A 4WQ5C 1MWMA 2QW9A 3BEXA 4BRFA 1BWFO 1X3MA 2HF3A 3D2FA 2D0OA 3A5NC 4BC3A 1HPMA 1RFQA 2FLOA 4K41A 1HKGA 2P9PB 3L6QA 1SZ2A 4JNEA 3U4LA 3A0IX 4BRQA 3IDHA 1E4FT 1Z05A 2F9WA 3QDKA 3WEEB 1H1VA 4JD2B 5JMVA 1NGEA 2FXUA 3VEOA 3LM2A 4CBXA 1E4GT 4FWNA 3R9PA 1T6DA 1DKGD 4LC9B 3HTVA 5AQLA 5AQTA 1BA0A 3CJCA 3UKUA 2NZTA 1WOQA 2OANA 3BF3A 5AQQA 2F9TA 3O1BA 5AZIA 3W3DA 1OKJA 4O5FA 1TYQB 4FSVA 3ATUA 1JCEA 1XC3A 2CGJA 3H46O 4MLEA 4A61A 1X9JA 3U9ZA 2DPNA 2KHOA 4H0TB 4O8KA 2P9PA 1JCFA 1T6CA 3ID8A 5LJVA 4DB3A 1KXPA 3WEEA 1Q18A 4JD2A 1SQKA 2GEMA 2W41A 3A5OC 3CJ1A 5KPTA 1ZBSA 2QWNA 4F9OA 3KHYA 1HUXA 3VEVA 5BR9A 1U6ZA 4FOIA 3LDOA 1HKBA 4E1JA 2GUPA 1BU6O 4BGAA 2IIRA 2QWOA 3SMSA 3WQUA 4A2BA 1XUPO 3HSCA 3MMVA 4RWTA 4FWRA 1S22A 1KAZA 1TYQA 2A6AA 1JCGA 1J6ZA 3H3NO 1P8ZA 3J8AA 3M1FA 1C0GA 5CE3A 4AM7A 5AQOA 3GOIA 3VOVA 4BR0A 3CJ9A 4IXCA 5AQRA 3MN9A 3LDLA 4B1UB 4Z94A 5FPMA 3LM9A 5ADXH 1NM1A 3MN5A 1EQYA 3FFKB 4EFHA 4EHTA 2ASPA 3AAPA 3HM8A 4K42A 3FR0A 1V4SA 3LDPA 3WT0A 2FSNA 4CJ7A 1NGIA 3CJBA 4BR7A 3L4IA 4B1YB 4BRMA 4WQ4A 3DAWA 5AQNA 3WXKA 3IMXA 3M6GA 3CI5A 3TPQA 4IZ9A 3B8AX 4CZJA 2E2OA 4EIAA 3DWLA 3WQTA 4BC2A 3KVGA 4EHUA 1TUUA 4EAHD 2ASOA 3QBXA 2YJEA 4M7XA 2P9SA 3GE1A 3JS6A 4H5NA 3WXIA 2CGLA 4Y0WA 1GLCG 1YUWA 3UKUB 4AM6A 5LJWA 4BRHA 4BR4A 3UKRB 1NGFA 1GLLO 3FLCO 2AP1A 5AQHA 1NMDA 3FE1A 1ESVA 3UE5A 1NGJA 2A5XA 5EVZA 2GELA 3QB0A 4ISGA 4FWQA 4QS8A 2CH6A 5BRHA 2V52B 4XH4A 5EXWA 4MO4A 4MLHA 5FPNA 4XH1A 4BRCA 4BQLA 2ZGZA 3AARA 3A8YA 4PL7A 3VETA 4BRAA 5B8HA 4FPAA 1SAZA 2QM1A 4B1XB 2PBDA 3AAQA 3ENHA 5E84A 5BPNA 4FWMA 1ZC6A 5BPLA 3JXUA 4A2AA 1YAGA 3D2EB 3BUZB 2BTFA 3UKRA 3A5MC 3VGLA 4CZEA 4K25A 5KPZA 5F0XA 2H3GX 4FWLA 5EX5A 4BRKA 1NGAA 4FWPA 2E1ZA 4I6MB 4JAXA 4CBWA 3WUHA 3DXMB 4BVOA 5LY3A 2WUSA 2VYPA 1QQNA 3L0QA 4CZGA 1NGHA 2A40A 4QS9A 5KPRA 5AZJB 2FSKA 3KZBA 3O80A 2Q36A 3H3OB 1KAYA 2E1YA 4FO0A 3GDQA 4BC4A 4ISFA 5AQYA 4PKIA 3EN9A 1MWKA 3WXLA 5AQSA 2FSJA 3H1VX 3LL3A 3VESA 3F9MA 1QQOA 2YHYA 1K8KB 3CIPA 3QFUA 4CZFA 2QWMA 2E88A 4BRIA 5BRFA 4IJAA 3FGUA 3ZETB 5BN9A 3CJ7A 3EL2A 5BREA 3D2EA 2P9IB 4YDUA 3HBTA 3SK3A 1GLBG 3VERA 1NGGA 4RTFD 2PAVA 1Z6RA 2P9SB 1T44A 2GWJA 2E2NA 3ULEB 4BRGA 4I6MA 2IVOA 3GBTA 3R8EA 4BROA 3DXMA 1IJJA 3IUCA 2W40A 5FPEA 4BR5A 4DQ8A 3C7NB 5AQWA 4H5TA 1HJOA 5AZJA 2EWSA 3TU5A 2ASMA 3C0BA 3O4WA 5AQGA 2Q1NA 3VEYA 2AA4A 3CJAA 1ATRA 4WQ5A 2Q2RA 3I33A 3GG4A 1YVNA 4B1VA 4BG8A 4FPBA 1QZ6A 3G25A 1G99A 5AQPA 4DHYA 3H6EA 5EY4A 5AQMA 3SMPA 2E8AA 1S3XA 3MN7A 1K8KA 1D4XA 4JHDB 1RDWX 3ENOA 3ZETA 2HF4A 3HZ6A 4WYBA 4CZKA 2V7ZA 5AQIA 4HTLA 3MN6A 2P9IA 4FWOA 3ZX0A 4K43A 3FZFA 4BGBA 1ATNA 2E20A 3ULEA 3H1QA 2UYTA 4CZIA 2P9LB 3MCPA 3C7NA 1CZAN 4CZLA 3ATVA 3VF2A 5I9EB 1NGDA 3AY9A 3EO3A 3O8MA 2FF6A 3O6WA 2HOEA 2YI1A 3I8BA 5TKYA 2D4WA 5BRDA 4BG9A 4C23A 4H0YB 2QWLA 1BG3A 3FZHA 3U8XA 4B1WB 5JICA 2GTDA 4H5VA 5AFUH 2ITMA 1GLEG 1HLUA 4JHDA 3U9DA 2E2PA 3MDQA 2CH5A 2QWRA 2IVNA 4PL8A 2QWQA 1YXQA 1Y64A 1QHAA 3ZX2A 2IVPA 2V51B 2VWBA 3EKSA 1GLDG 3QICA 4FOEA 4MO5A 4H5WA 4BR2A 1ATSA 1ZXOA 3VPZA 2A3ZA 1KAXA 2P9LA 2E2QA 5AQJA 2FF3B 1XQSC 2D1KA 3H45C 1NGCA 1GLAG 2Q0RA 3VF6A 3WXJA 5ADXA 4H5RA 4BREA 4H03B 1BO5O 3DJCA 3UB5A 4WQ4C 3QFPA 1X3NA 3EKUA 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X6SA 3FZMA 1NJZA 4YOYA 4C8NA 3RVCA 3OYAA 1RDCA 4MDAA 4IEEA 3VGKA 3A2FA 3DMJA 5GAHP 2JLEA 5GIOA 2D0CA 2VG6A 1Z25A 4DQIA 4JI2K 1VQMN 3ZX3A 2Q0UA 4H0OA 3VF4A 5J2NA 1T05A 1RGIA 3MK6A 2Q97A 3JAMO 4DFPA 5BPMA 4GNIA 1YITN 5AQUA 4JI5K 3SQ2A 3E66A 1J5EK 3VTHA 1GLJO 4QOZB 1CXQA 4LSNA 2UXCK 2O8BA 3VEXA 1S6QA 2KZZA 5F1XA 3GL1A 4RW8A 4PKHA 4XEIA 5AQVA 4V19S 3E01A 3J7ZO 3R6MA 4GV9A 3VEWA 4BRDA 3ZEUB 4FL9A 3S41A 1KVAA 5BN8A 5GIPA 2YCHA 3O9TA 4C1NK 1MA9B 3SV4A 3KKSA 2ZF5O 3DLEA 2OTJN 3IAYA 1NMNA 2YHXA 2I5JA 3RSEB 2P9NB 2EHGA 3KK2A 5MLCQ 1S5JA 3OJUA 3HO1A 4BC5A 3DOLA 4OGCA 4FM1A 4CGDA 5M1QA 3OYIA 1I94K 4DWIA 4E72A 3OYHA 4HUGA 4OVLA 4DLEA 4JI0K 2NRHA 3E9LA 1WBBA 4IO8A 4L3QA 3W0LA 1ZBFA 4CF1A 4LF7K 4CD1A 2GV9A 4YOWA 3J81O 1NGBA 4KHSA 4BRNA 3ZEUA 3D0PA 4JI6K 3HYFA 4HCBA 4J8FA 2DFFA 3M8PA 4NB4A 4H0XB 4BE0A 4Z4GA 4CJVA 1UA1A 1SL1A 2PY5A 4CI6A 4BR9A 4DUZK 4ELTA 4B3SK 3RSEA 1S1UA 1FXXA 2P9NA 4H0VB 5CY4A 2C1GA 1SKWA 5HBMA 2KZMA 3CPWM 1RBUA 1C0FA 2D5RA 3ZT4A 4FJJA 1X1PA 3VEZA 1IO2A 4WQ5C 2A1SA 3CCMN 2QW9A 3SQ4A 2D0OA 1HPMA 4K41A 3SCXA 3ZSZA 2NRZA 3HOSA 4BE1A 3MXIA 1Z05A 3QDKA 5FDLA 1EKEA 4YOXA 3LM2A 3SV3A 1TKTA 3K5OA 1XHXA 3CJCA 3SUPA 1B9DA 2NZTA 3N4PA 3LPUA 1WOQA 4PY5A 4F4KA 1XMQK 4DTNA 3LAKA 4EP5A 4X62K 4FJ7A 1YJ9N 1TYQB 2IS3A 3ATUA 1X9MA 1JCEA 1XC3A 4Z4FA 3H46O 3FFIA 2DFEA 1X9JA 2HHUA 3RMAA 1RILA 3VQAA 3SUQA 4OPAA 1JCFA 4M3UA 3O9UA 4FW1A 4BEBA 4JKGB 1QE1A 4DB3A 1NK8A 2HNYA 1ASWA 1EXQA 4JI4K 3NH1A 4DTPA 4RW9A 3CJ1A 3A5OC 5KPTA 1NU0A 3AA4A 2QWNA 4B9LA 3K59A 1S1TA 4UQGA 4FLUA 3K9JA 4YORA 1HKBA 4JK7A 1BU6O 1CLQA 2YKNA 4JS4A 3WQUA 3CPEA 1LV5A 1BL3A 2DFHA 1S22A 1KAZA 4KB1A 1TYQA 3HP6A 1JCGA 4IBNA 5C25A 1BI4B 1BQMA 4HUEA 3MN9A 4X66K 4HTUA 2OPSA 4B1UB 4DV6K 3NVKA 1NM1A 1EQYA 4EFHA 4BACA 4JKGA 3DLKA 3HL8A 1NJIO 2O4IA 2HHWA 2QKBA 1T3VA 4M3RA 1K73O 3CC2N 3CJBA 3S9HA 3AVBA 5I3UA 3ZLJA 4LFBK 3SJJA 2G8VA 1JXEA 4B1YB 3TPQA 3M6GA 1C1BA 3B8AX 1VSLA 4LF9K 3DWLA 3WQTA 4KTZA 1TK5A 3QBXA 2YJEA 2QI2A 2P51A 4M7XA 3HJFA 1VQ4N 1T8EA 3VTIA 1JL1A 4FK0A 2CGLA 5LJWA 1YUWA 1Q8IA 1NGFA 3SAHA 3L2WA 3MCAB 1BI4A 4PWDA 1GLLO 3B6PA 3TWHA 4DQQA 1M90O 4EZ6A 2CH6A 3VQ6A 4XH4A 5HRNA 2IDOA 4FJMA 3QNOA 2QXFA 4XH1A 2HBJA 1HQEA 3KK1A 2Y1IA 1X9WA 4H8KA 3QO9A 4KV8A 4BRAA 2WTUA 2XY5A 5CYQA 2PBDA 3L3VA 3AAQA 1ASUA 3SBGA 1RTJA 5J2QA 1N36K 4FWMA 5A2QO 1RBVA 2G8KA 5BPLA 4A2AA 1HPZA 5KPZA 4CZEA 1BQNA 4NCBA 5F0XA 1ASVA 4PQUA 3KLEA 2WFBA 5KTQA 4H4MA 5K14A 3HVRA 4JAXA 4CBWA 4DFJA 3S3OA 5LY3A 4DR1K 2WUSA 2RHKA 5HLFA 2QKKA 4O4GA 5KPRA 2W00A 3H3OB 4DS4A 4ELUA 4MQ3A 3CC4N 1NK4A 1LW2A 4ISFA 3VQ9A 3S3MA 1KFDA 1RTDA 5AQSA 3H1VX 3VESA 3F9MA 3I0SA 2YKMA 3ZSVA 1VRTA 3QFUA 4BRIA 4IJAA 3ZETB 5BN9A 4CGJA 3CJ7A 5BREA 3DOKA 1WSGA 3V9UA 4LD0A 3ULEB 4BRGA 5FPEA 3IUCA 2W40A 3KIOA 3C7NB 1OH8A 1GOBA 4QAGA 5AQWA 3ZSQA 1CZ9A 2ASMA 4R5PA 3O4WA 3OYBA 4ZTJA 3VQ8A 3F2KA 1YHQN 4OO1J 3I33A 3GG4A 4BG8A 3QESA 4ZTFA 1WAFA 4WFNL 1S1VA 4Z4IA 3CCEN 1XNRK 1RT3A 3H6EA 3SAFA 4DSFA 3TAFA 3SI6A 3KTQA 3SMPA 4U67L 1S3XA 3MN7A 4NYFA 3ENOA 3ZETA 2XRIA 4WYBA 1TKXA 2V7ZA 4FWOA 2QEXN 3C6HA 1JLBA 5HP1A 4NXNK 3FZFA 1WSFA 4FJNA 4BGBA 2VQEK 4FJ5A 3ULEA 2VG7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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