1JCEA

Mreb from thermotoga maritima
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
KDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 100
structure length 333
sequence length 333
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jceA03
4BC3A 5AQRA 3SMPA 1T44A 5AQQA 2A3ZA 3DAWA 1P8ZA 3EO3A 3GE1A 2VWBA 4Y0WA 1NGJA 5AQYA 4BQLA 4FWPA 1QQOA 2ASPA 4BVOA 4JNEA 3HM8A 3J8AA 2CH6A 4I6MA 4K25A 3FZHA 3BP8A 5AR0A 2QM1A 1TYQA 3ENHA 3WEEA 4EHTA 2ITMA 4CI6A 4FPAA 5EXWA 4RWTA 3CJ1A 1GLJO 3D2FA 5F0XA 3ZX3A 1GLAG 3QB0A 3OHRA 4BVPA 4M7XA 4CZFA 2GWKA 5TKYA 2PAVA 3EL2A 4BRAA 1GLFO 2A6AA 2FSNA 3VEYA 3HI0A 3SMSA 5LY3A 2Q97A 4BGBA 2QXLA 5AQWA 3U8XA 4CZEA 4AM7A 4BG9A 1DEJA 4BRNA 3IUCA 3VF6A 4CZMA 2GTDA 3ID8A 4JD2B 3LDLA 2QWOA 3GDQA 4HTLA 4EAHD 1BG3A 3ZEUB 3C0BA 2YHXA 3U9DA 3VGLA 1ZBSA 4H0YB 4C23A 3A0IX 1BDGA 2P9IA 4NB4A 1KAZA 1LOTB 4BRDA 4H5RA 3BEXA 1SZ2A 2J4RA 2IIRA 3F9MA 4FWMA 1HKGA 2NRHA 2P9KB 3UKRA 5FPEA 3MDQA 4FWOA 3UB5A 3CJBA 3HTVA 1Q18A 4M7YA 3UE5A 5KQDA 4ISFA 2E2OA 4H5WA 3TPQA 3G25A 3AY9A 2IVNA 3CERA 3HZ6A 3VEXA 3RSEB 2D0OA 1IG8A 2FSKA 4O8KA 1T6CA 3VEZA 5AZIB 4H0VB 3A5MC 4BQZA 3DXMA 4B9QA 3VF4A 2FF6A 3LDNA 5AZJB 5F1XA 4B1WB 3CJ7A 5AQJA 4K41A 4IXCA 3ATUA 1Y64A 4CZIA 4H5VA 2QWMA 3BF3A 4WQ5A 2BTFA 2P9PA 4MO4A 2Q36A 3WQUA 2A42A 3VEVA 1ZXOA 2EWSA 3CJCA 1GLCG 2CGJA 4EFHA 3IMXA 5F2RA 3QICA 4ISGA 2W41A 1GLDG 4XEIA 3VENA 2P9SB 4H03B 3VGMA 4B1XB 2Q0UA 2QW9A 5BPLA 3O1BA 5FPDA 1K8KA 1NGFA 5AQHA 3VESA 3CJAA 3UKUA 4XH4A 4BRMA 1X3NA 3O8MA 2QWRA 2PBDA 4FWLA 3QBXA 4BC5A 3FZKA 2Q2RA 3H45C 3R9PA 3S41A 5I9EB 1TUUA 2P9LB 3LDPA 3O08A 4WQ4C 2OANA 2V7YA 5EX5A 4BRPA 5FPMA 5AQMA 3FFKB 3I33A 3SK3A 1CZAN 5BRFA 5BR9A 2P9UB 3LDOA 1U2VB 4BR2A 1NBWA 3WXIA 5ELZA 3CIPA 4H5TA 3O80A 4BROA 2P9NB 4FWSA 3CI5A 4BC4A 2ZGZA 4AM6A 2Q0RA 2A5XA 2GWJA 3ULEA 3HBTA 5JLHA 3GBTA 4IWVA 3WXJA 3FLCO 1C0GA 2D0PA 3W3DA 3KZBA 4FPBA 4JD2A 2ASMA 4BC2A 2V52B 1QZ6A 1U6ZA 3BF1A 4H0OA 5EY4A 4BR4A 3WXLA 5KPRA 2BUPA 2FSJA 2VCPA 4FWQA 3FZLA 2ZF5O 3A5LC 3QDKA 4BRIA 2E1YA 5AQPA 4CBUA 1WOQA 4IJNA 1NGBA 5AQKA 3CHWA 1GLLO 3JS6A 4BRHA 2W40A 3KVGA 4DCHA 1HJOA 1YAGA 3O5BA 2P9KA 3IDHA 1NM1A 2Q31A 3DJCA 2GUPA 2V51B 3VGKA 4PKIA 1EQYA 2DPNA 3GOIA 4DQ8A 3DXKB 2WUSA 4FL9A 4XH1A 3D2FB 1GLEG 3WQTA 4RTFD 3CETA 4CZJA 2CGLA 5AZIA 3C7NB 1T6DA 2A40A 1V4TA 1S22A 2YHYA 2GEMA 4Z94A 4BRGA 4F9OA 3VEWA 3W0LA 4HWIA 3H3OB 3D2EB 2E2PA 4BGAA 4LC9B 1V4SA 4KBOA 3AAPA 1HKBA 2YJFA 3MN6A 4H0XB 4BR9A 1DGKN 2D1KA 3P4IA 1YVNA 5AQTA 4MLHA 1QQNA 5CE3A 1HUXA 1G99A 3H6EA 3FE1A 5AQFA 3MN9A 2D4WA 2E1ZA 4M63C 4PKHA 1J6ZA 4MLEA 3HSCA 2P9SA 5EVZA 2FF3B 3M1FA 3MN7A 1E4GT 3I8BA 3FZFA 5BREA 1MWKA 2QWNA 4L3QA 3KHYA 3WUHA 5KQ8A 5JMVA 1C0FA 1HPMA 4BR7A 4EHUA 4JHDB 3L6QA 3GL1A 4A61A 1BOTO 3QFUA 2NLXA 2V7ZA 1QQMA 2UYTA 4O5FA 2I7NA 3JXUA 5AQSA 4NO7A 2F9TA 3H1VX 1BA0A 4MO5A 4PL8A 4B1VA 5LJVA 5LJWA 1HX1A 3L0QA 4GNIA 4PL7A 3EKSA 5AQNA 5FPNA 1QZ5A 2P9UA 3D7EO 1ZC6A 1KXPA 1ATSA 2KHOA 4DB3A 5BRHA 5AQUA 1MA9B 2P9NA 1ATRA 2E8AA 1NMDA 3H3NO 5EOYA 3ZX2A 1HLUA 1SQKA 1WUAA 4YDUC 1JCFA 3QBWA 4CD3A 5AQLA 5BN8A 2CGKA 4FOIA 4A2AA 1D4XA 1NGHA 1ESVA 1JCGA 5AQIA 5KPTA 3BUZB 1NGGA 1YUWA 3ZETB 3B8AX 3ATVA 4B1UB 4A62A 3TU5A 4CD1A 1BUPA 4FOEA 1X3MA 4CJ7A 1NLVA 3U4LA 3MK6A 1BO5O 1K8KB 3ZX0A 2NZTA 3CQXA 3H1QA 3UKUB 3VEOA 3ZEUA 1H1VA 2AA4A 5E84A 3O6WA 4QS9A 4K42A 2HF4A 4CZKA 2H3GX 3AAQA 4GY2B 3CJ9A 4BRQA 4QS8A 4E1JA 4BRFA 4B1ZA 1MDUB 2I7PA 3SJHA 2E2NA 2IVPA 3DXKA 3MCPA 1MWMA 5AFUA 1SAZA 3EKUA 3QMLA 1RGIA 1Z6RA 3ENOA 3L4IA 3C7NA 2HOEA 1BWFO 4I6MB 5AQOA 3LM9A 4A2BA 1TYQB 1LCUA 5AFUH 3WEEB 2HMPA 1S3XA 5E26A 1XC3A 3LM2A 5AQXA 1IJJA 1E4FT 4RCHA 3D2EA 5AQGA 1RDWX 2YHWA 1NGEA 3RSEA 4K43A 2E2QA 3EZWA 2HF3A 3ULEB 3A8YA 2ZGYA 2F9WA 4CZLA 2YI1A 5AZJA 2QWLA 2A41A 2AP1A 3VF2A 1KAYA 5KPZA 5BRDA 3DWLA 2ZWHA 1KAXA 3U9ZA 4CZGA 3LDQA 4CBWA 1ATNA 3O1WA 3VOVA 5ADXA 1Z05A 3A5NC 1NGAA 4BR0A 1BU6O 2CH5A 4JN4A 3A5OC 3EN9A 3GG4A 4IZ9A 2E88A 5ADXH 3WXKA 5B8HA 1R59O 1NGDA 1XQSC 2P9IB 4JHDA 3VETA 4EIAA 5BPMA 4BREA 5JLFA 3R8EA 4FSVA 2Q1NA 3FR0A 3AARA 1NWKA 1XUPO 4ISEA 4FWRA 3WT0A 3SLCA 1HKCA 4H0TB 4CZHA 3CQYA 4H5NA 5AQZA 4H0PA 4CBXA 3UKRB 5BN9A 4BRLA 1NGCA 1TUYA 3FZMA 3MMVA 4WYBA 2GELA 4FWKA 1DKGD 2FXUA 2ASOA 1GLBG 3QFPA 3H46O 5JICA 4BRKA 4FWNA 4IO8A 2P9LA 4WQ5C 4XH5A 5BPNA 1RFQA 1QHAA 3FGUA 2YCHA 3IFRA 3MN5A 4J8FA 5AQVA 3DXMB 3LL3A 3R6MA 2QWQA 3O4WA 1U2VA 4QS7A 3VERA 2QWPA 4IJAA 1NGIA 4BRCA 2FLOA 3ZETA 4PKGA 1BA1A 2YJEA 4DHYA 3M6GA 1YXQA 1JCEA 1X9JA 3VPZA 2E20A 4BR5A 2VYPA 4FO0A 4WQ4A 2P9PB 4JAXA 4YDUA 4B1YB 2IVOA 4BG8A 1OKJA 3M3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SKSA 3S3NA 1NOYA 1VSHA 2VWBA 4Y0WA 4BQLA 3N4PA 4JRPA 4DUZK 3NGZA 1S6PA 4DV0K 4JNEA 3J8AA 1HRHA 3ZT2A 3OY9A 3K5MA 1TYQA 3RMAA 3ENHA 3WEEA 4EHTA 2ITMA 1FKOA 3L4QA 1OH6A 1K9MO 4CI6A 5DM6L 4FPAA 2UXDK 4GV9A 4ELTA 1C1BA 4JKGA 5CYMA 2NRVA 4LFBK 1GLJO 2PFUA 5F0XA 3ZX3A 3HJFA 1UWBA 1GLAG 4O0IA 1ZBUA 3OHRA 3SI6A 1JL2A 2WC9A 3QEIA 4CZFA 4LF8K 4HUFA 3VEYA 3HM9A 3HOSA 4WFAL 3I55N 2RN2A 3B6OA 3ZSWA 4B8CA 2ZQBA 3BDPA 2B4JA 4WCEL 3CPEA 4BRNA 4CZMA 4FW1A 1X9MA 3ID8A 3GDQA 3Q7CA 3OBYA 3ZEUB 5HROA 3L2VA 1VQ6N 1RDBA 3VGLA 3MAQA 3THVA 4NB4A 4FK0A 4BRDA 4H5RA 3C6TA 4FWMA 2IGIA 4EP4A 2UUAK 1Q9YA 3L3VA 3MDQA 4FWOA 4FCYA 1TGOA 4CHYA 1Q18A 1VQ4N 4H5WA 3K5OA 4CJSA 1SUQA 3RSEB 1BHLA 4CF8A 1TV6A 3NF9A 1T6CA 3VEZA 3DYAA 4H4OA 5AZIB 3PIPL 4FLZA 3A5MC 3DXMA 3VF4A 2FF6A 3LDNA 2W42A 1C0UA 4LFAK 4B1WB 3CCSN 2ZD1A 3TSPA 4IXCA 5SWMA 3ATUA 3BF3A 4B9NA 1IG9A 3VQBA 4MO4A 4C8LA 2A42A 3AO3A 1OH7A 4K8ZA 1I39A 3CJCA 2CGJA 3KWGA 4I9LA 3PSIA 4ISGA 3VENA 1KQSM 5BPLA 1U45A 5FPDA 4JKFA 5AQHA 3OBWA 3NH0A 3CJAA 3UKUA 4XH4A 4IEEA 1X3NA 2QWRA 4BC5A 2Q2RA 3NBPA 3S41A 4CK1A 5BR8K 3LDSA 3DLGA 3AVCA 3CC7N 2P9LB 3NGIA 4WQ4C 1NKEA 4Z4GA 2E5LK 3FFKB 3SK3A 1CZAN 2P9UB 1IBLK 1U2VB 5ELZA 1W97L 4FJIA 4KHUA 4H5TA 4M42A 3O80A 4BROA 3NE6A 3I0SA 3QO9A 2KTQA 2E6MA 4AM6A 1D9FA 2Q0RA 1LAWA 2GWJA 4DU4A 4E72A 4KAZA 2OZSA 4A57A 3WXJA 1X1PA 2HHTA 2D0PA 4FPBA 4JD2A 2ASMA 4BC2A 3C95A 4H0OA 3WXLA 1Z26A 1ZBIA 1W9HA 2XY7A 5I42A 4UQGA 4FW2A 1OH5A 5AQPA 1EP4A 3MWPA 5AQKA 4G9ZA 4BRHA 2FBYA 3CQ8A 2W40A 1JLEA 1RBVA 2O8EB 2KFZA 2HHVA 2P9KA 3IDHA 1NM1A 2RPIA 4AHTA 1UA0A 3AVNA 2HVHA 3CCUN 1WN7A 1FW6A 2DPNA 2ETJA 3I8DA 3KLGA 2QXFA 3DXKB 4XH1A 4HTUA 4YOUA 2XHBA 1GLEG 4RTFD 4M45A 4CZJA 3QNOA 1XWLA 4J2AA 1NKCA 4E7LA 3DLBA 2YHYA 4AHUA 4F9OA 4I9QA 2PZSA 3OW2M 1O13A 3NVKA 4HWIA 3EYZA 3D2EB 4KHPK 4X64K 4C8KA 4E1MA 2RHKA 2D0BA 3AVAA 1V4SA 2YJFA 2KFNA 3AO2A 3HPOA 1GOCA 1YVNA 3QEWA 1JLAA 1HUXA 4DR2K 2D4WA 4PKHA 3ULDA 2GX9A 1C0TA 2YNHA 3LPTA 1E4GT 1X9SA 3FZFA 4CF2A 3Q7BA 3RWUA 3CG7A 4X62K 4Z4IA 3CMEN 1C0FA 2ZJPL 4EHUA 3C6AA 3THXB 3PX0A 4J2BA 2V7ZA 4JS5A 2P51A 4GW6A 3JXUA 5D3GA 2G8UA 3HP9A 2YHAA 5AQNA 3ASMA 3D7EO 1ZC6A 1YJWN 1S72N 1ASWA 5BRHA 1N34K 4NLCA 3E66A 1ATRA 2O8DA 1JCFA 3QBWA 1VQON 4MDBA 3VQCA 4FM1A 1NJZA 3K9JA 4A2AA 1NU0A 1JCGA 1NGGA 3K58A 1WSHA 4FZXC 3K57A 2ZM6K 4CD1A 3U4LA 3E9LA 3O4QA 4F8RA 1LWEA 4F2RA 1K8KB 1EXQA 3RRHA 3CQXA 3V1QA 3ZSQA 4JRQA 1RTHA 2AA4A 5E84A 4CE9A 4CK3A 2HF4A 3AAQA 4GY2B 4BE2A 5KRSA 3WNFA 4BRQA 2G8VA 4RW9A 3T69A 5KTQA 4DFMA 3V9ZA 1MWMA 5AFUA 4ID5A 1Z6RA 1S1VA 1BWFO 4YY3K 1HYZA 2GBZA 3K5NA 4FVMA 4HCCA 1J53A 3WNEA 2WFBA 4AH9A 1Q82O 4AHVA 2E2QA 3AVJA 3A8YA 2GV9A 2ZGYA 2F9WA 5AZJA 1DLOA 4B9TA 3CPWM 1XHXA 3EEQA 3VQ8A 4IOCL 3TAMA 3DWLA 3CC4N 2ZWHA 4CZGA 3C94A 3VQ5A 4PY5A 1ATNA 3O1WA 4B9VA 4R5PA 3A5NC 1BGXT 1L5UA 4BR0A 3HVRA 2CH5A 1KSPA 4IDHA 4JN4A 3ALYA 3SUQA 4M3UA 1HNIA 2E88A 2HNDA 2NRWA 4KI4A 5B8HA 1MU2A 4AILC 1J9AA 1OH8A 1XQSC 2YKMA 2Q1NA 3FR0A 2O8FA 4H5NA 5AQZA 4FVUA 5BN9A 1SL2A 4AQYK 2B5JA 1HQEA 3G4SN 1WSFA 1B9FA 1N36K 2ASOA 5SZTA 4E7HA 4NXNK 4OO1J 1RDCA 4FJMA 3D6RA 3IFRA 3MN5A 4J8FA 5AQVA 3R6MA 1SKRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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