1JCEA

Mreb from thermotoga maritima
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
KDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Structural protein
total genus 100
structure length 333
sequence length 333
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jceA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jceA03
3HM8A 5CE3A 5LJWA 2HMPA 4JN4A 3VF4A 1TUUA 5KPZA 1KXPA 1SZ2A 1ATSA 3D2FA 4PL8A 1KAZA 4XH4A 5FPMA 4PKHA 2E1YA 3O1WA 5AQIA 3OHRA 5AQFA 2Q36A 3FZLA 4FWRA 4CZEA 3RSEB 2P9IB 2FXUA 1NGBA 3AARA 1R59O 3D7EO 1NWKA 1Y64A 2P9KA 1C0GA 2QWQA 4LC9B 4BVPA 3R6MA 4YDUC 3SMPA 3HI0A 3L4IA 3DWLA 1OKJA 4BQLA 3BP8A 1RDWX 1NGAA 2WUSA 5AQKA 4BVOA 3IDHA 3VEWA 1SAZA 4J8FA 1BOTO 4IJAA 1NGFA 3A8YA 4HWIA 3CERA 2ITMA 3VEYA 2P9NA 4FWOA 4CZFA 1HUXA 3CQXA 3LDPA 3O8MA 3H6EA 4BGBA 5FPEA 2CGJA 4FWNA 3QFUA 5AQTA 2VCPA 3BF3A 1YXQA 3VOVA 5BPLA 2IVOA 4FWPA 2ZF5O 5AQMA 5B8HA 2I7NA 4EFHA 3KZBA 5KPRA 3H45C 3AY9A 2FSNA 2GEMA 5AR0A 4Y0WA 3IUCA 4B1YB 1DEJA 3SMSA 2E2NA 1MA9B 3MN5A 3I8BA 4RCHA 1ATNA 3ID8A 1NGEA 3W0LA 2NLXA 2A40A 4BG9A 4BR5A 4CZLA 4WQ4A 3U9DA 1DGKN 1G99A 2UYTA 1QHAA 1X3MA 4HTLA 2P9UB 4MO4A 4CD3A 4CBUA 5AQXA 4BRPA 5AQJA 1YAGA 3LM9A 2P9SA 1NM1A 3MN6A 1NGJA 5AQQA 4BRHA 3JS6A 1T6DA 4FSVA 2V52B 3WUHA 1MWMA 2HF3A 4F9OA 2A3ZA 2A41A 4B1ZA 2E2PA 1RFQA 1ZBSA 3LDLA 5AZJB 1XQSC 1J6ZA 4FPAA 3U4LA 5AQPA 4H5WA 4BRQA 2FLOA 3CQYA 5AQHA 3AAPA 3D2EB 2QWMA 5E26A 2E1ZA 4RWTA 3EKSA 4FO0A 5AQZA 5FPNA 3MN9A 2F9WA 4K43A 1NGGA 1NBWA 5AQSA 1BWFO 3O6WA 3QFPA 2P9PB 2P9IA 3BUZB 3EL2A 4ISFA 3WT0A 4M7XA 3UKUB 4GNIA 2FSKA 5AQOA 1GLEG 4WYBA 4FWKA 3S41A 4FOEA 2E2QA 4H0OA 2BUPA 4CZGA 2AA4A 5JLFA 1QQNA 2P9LA 3FLCO 4BRNA 4BREA 4FOIA 3CI5A 4CZHA 3A5MC 2YJFA 1BG3A 4PL7A 2Q1NA 3GOIA 1BDGA 2E8AA 3VERA 2H3GX 5BRFA 1U2VB 2EWSA 3QBXA 1KAYA 1NMDA 1IJJA 1K8KB 5BN9A 4CD1A 3A5OC 1XC3A 3EZWA 3VPZA 3DXMB 4CZJA 2V51B 1LOTB 1GLJO 4GY2B 1D4XA 1HX1A 4DQ8A 4FWLA 3EKUA 5AQGA 2IVPA 2Q0RA 5AZIB 1HLUA 3VENA 3J8AA 3DJCA 5AQRA 3EO3A 1T44A 4CZIA 4RTFD 4ISGA 3WXKA 3VETA 2E88A 1YVNA 4H5RA 3WEEB 4H5TA 3VEOA 2FF3B 2BTFA 4WQ5A 4BRGA 4A2AA 3ULEA 3I33A 4NO7A 2AP1A 2QWLA 5ADXA 3A5NC 5EXWA 2VYPA 5ELZA 3C7NA 2FSJA 2I7PA 1QZ5A 4IXCA 2P9UA 1NLVA 4ISEA 3DXKB 4MO5A 3QICA 5JMVA 4XEIA 4BC5A 1NGDA 3B8AX 3HZ6A 1E4FT 4O5FA 2W41A 4BR2A 2YHWA 4JHDA 1S22A 4M63C 3VF6A 2Q0UA 3D2FB 4JD2B 1GLDG 3ZEUB 3ZX0A 2YCHA 3U8XA 4BC3A 4EAHD 1X9JA 2IVNA 3VESA 3UE5A 3G25A 2HF4A 4BQZA 3KVGA 1E4GT 1WUAA 1TYQB 5LJVA 3QB0A 1BU6O 3H3NO 2D4WA 3CHWA 2D1KA 4XH1A 3DAWA 3CJ7A 2YJEA 5AQYA 3VGMA 4BC4A 4BRKA 4H0XB 5JLHA 4EHUA 4B1VA 2F9TA 4H5VA 3MCPA 1JCEA 3CJ9A 2NZTA 2P9PA 4AM7A 3ZETB 1JCGA 4DHYA 1H1VA 3UKUA 4CBWA 3WQTA 4B1XB 2HOEA 4I6MB 5ADXH 1Q18A 4BRDA 1HKBA 4FL9A 1WOQA 2J4RA 1GLBG 2V7YA 3A5LC 1YUWA 4QS9A 1NGIA 4EIAA 2ASMA 1U2VA 1BA0A 4BR4A 4NB4A 2PAVA 1K8KA 1LCUA 5BR9A 3SK3A 3DXMA 4BRCA 1S3XA 3FZHA 4H5NA 5AQUA 2CGKA 4A2BA 3RSEA 1NGHA 4BC2A 3R9PA 1SQKA 4WQ4C 5EX5A 5AZIA 3JXUA 2NRHA 3GE1A 1GLCG 3H46O 4BRLA 2QW9A 3GL1A 2V7ZA 3WXIA 3TU5A 3WQUA 3WEEA 4YDUA 5F0XA 1HKCA 1QQMA 3QDKA 2KHOA 2CGLA 5BRDA 1JCFA 3O80A 3FZMA 5E84A 2Q2RA 5I9EB 3FZFA 1HJOA 3FGUA 3VF2A 3MN7A 2QXLA 4IWVA 3DXKA 2YHYA 4BR7A 4CZKA 4BR0A 1EQYA 4C23A 3CJBA 2GUPA 3GG4A 4BG8A 2D0OA 2W40A 5JICA 5LY3A 4PKIA 3KHYA 1U6ZA 3HTVA 4JD2A 3ZEUA 1Z6RA 4B1WB 2GTDA 3FR0A 1GLAG 1ZC6A 3H1VX 2E2OA 4L3QA 3TPQA 3CJCA 3IMXA 4AM6A 5AFUA 1DKGD 3BEXA 4FPBA 1ESVA 1KAXA 3BF1A 3LL3A 4MLHA 2VWBA 4FWQA 4Z94A 1TYQA 3O4WA 1V4SA 4M7YA 1V4TA 3ENHA 2YHXA 2P9LB 3CIPA 3MMVA 2D0PA 3O5BA 2IIRA 2CH6A 4H0VB 3VGKA 3UKRB 3M3ZA 1HKGA 3H1QA 3O08A 4KBOA 1MDUB 2ZGYA 1NGCA 4BRIA 3QMLA 4H0PA 3ZETA 1HPMA 4K41A 4JNEA 3R8EA 3VEXA 3LDNA 4I6MA 1BUPA 4IZ9A 3LM2A 5AZJA 3U9ZA 4BROA 2A6AA 4QS7A 2ASOA 1TUYA 3UB5A 1ATRA 4CBXA 1C0FA 4DB3A 2P9KB 2YI1A 3D2EA 3ATUA 4JAXA 3VEZA 3H3OB 1IG8A 2QWRA 5FPDA 4WQ5C 4H0YB 2DPNA 3CJ1A 4FWSA 1GLLO 4B1UB 2GELA 4E1JA 4FWMA 5EOYA 3WXJA 4H03B 1CZAN 2GWKA 3QBWA 4K25A 3ULEB 3VGLA 5AFUH 2Q97A 4H0TB 5BPNA 3GBTA 2CH5A 3C7NB 4IJNA 4BRMA 2P9NB 3M1FA 4BGAA 4DCHA 5BRHA 3GDQA 3M6GA 3LDOA 2ZGZA 5TKYA 5AQLA 2PBDA 1Z05A 2Q31A 2ZWHA 1BO5O 3L6QA 5AQVA 4JHDB 1BA1A 4A61A 5KQ8A 2QWOA 3SJHA 3L0QA 4MLEA 4PKGA 1QQOA 3C0BA 3MDQA 4BRAA 4CZMA 3O1BA 2OANA 1ZXOA 4CI6A 5KPTA 3CJAA 4A62A 3HBTA 2GWJA 1X3NA 1GLFO 5KQDA 3FZKA 3IFRA 3FE1A 5EVZA 2FF6A 3P4IA 3MK6A 4BR9A 5BPMA 3ZX2A 3ZX3A 1T6CA 1MWKA 5EY4A 3FFKB 4BRFA 3LDQA 4K42A 2P9SB 3AAQA 1P8ZA 4XH5A 4EHTA 4O8KA 5F1XA 3W3DA 2ASPA 3VEVA 3SLCA 2A42A 2E20A 4IO8A 5BREA 5F2RA 3ATVA 3EN9A 1QZ6A 3HSCA 5BN8A 1RGIA 4B9QA 2QWNA 2QWPA 5AQWA 3ENOA 3CETA 3F9MA 4QS8A 3A0IX 3UKRA 4CJ7A 5AQNA 3WXLA 2QM1A 1XUPO 2A5XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HMPA 4JN4A 3VF4A 1SKRA 3OYJA 3I0RA 1VQMN 4F4KA 5C0YA 1ATSA 1JLAA 1TK5A 2VGMA 1VSKA 3VQ9A 3P39A 4CJKA 4FZZA 5CYQA 5HBMA 4H4MA 5AQFA 2B6AA 2FXUA 2OTJN 1R59O 1VQKN 1C0GA 3KK3A 3HM9A 5M1QA 4YDUC 3DWLA 4CJPA 3V9SA 4HUFA 3NFAA 1RDWX 4JI8K 2W00A 4OGEA 2WUSA 1SAZA 4J8FA 1BOTO 4IJAA 1M90O 4KHYA 3OYLA 3TSUA 3H6EA 4BGBA 4B3RK 4X64K 5FPEA 2CGJA 4DTMA 2UXCK 1IBMK 2VG7A 3VOVA 4A5AA 3KZBA 2HBJA 3KLEA 2VWKA 2OA8A 3LAMA 2GEMA 4Y0WA 4PQUA 4JRQA 1MU2A 1P90A 2E2NA 1TAUA 3MN5A 1L5UA 4DV5K 1SL0A 2NLXA 1HNIA 4BG9A 3OJSA 3KWIA 4BR5A 3U9DA 1DGKN 1G99A 2DFHA 1X3MA 4CD3A 2P9UB 3NH2A 4KHWA 1LW0A 4BRPA 4KHUA 2OYQA 1YAGA 3LM9A 1BQMA 2P9SA 4DKWA 4KH4A 3NF8A 2HVHA 1NGJA 1RCHA 1BIZA 4DV0K 2V52B 3KLFA 3T1YK 2A3ZA 4DR6K 3CG7A 2O8DB 2E2PA 3AV9A 4JKBA 3PIPL 4BECA 1TL1A 2VGNA 4JV5K 1Q9XA 1EXQA 1Q86O 4BEBA 4CF9A 3AAPA 4CF2A 3D2EB 5AQZA 3QERA 4F3TA 5FPNA 1KTQA 4K43A 1YTAA 4M7XA 3S41A 1S1XA 4FOEA 4J2BA 4JKGB 1FJGK 2P9LA 3QINA 3P83D 3MCAB 3FLCO 4CJQA 3O4QA 5J1EA 4B9UA 4ILGB 3UIQA 5C2FA 3A5MC 3OVNA 2YJFA 3TSQA 2G8KA 2E6LA 2E8AA 3VERA 4DFMA 1U2VB 2EWSA 4FLXA 1K8KB 3AVGA 1ITGA 4F3OA 3EZWA 3VPZA 4CZJA 3SAHA 3LWMA 4E7LA 4JI6K 2ITGA 4B9VA 4KI6A 1W2BM 2RF2A 3VN5A 3MECA 3J8AA 3OYIA 2WTUA 1OH8A 5FRMA 2W42A 3RR8A 1RBTA 4M3TA 3WXKA 4CJ4A 3C65A 5LMUK 3WEEB 3VEOA 3G71N 1OH6A 2FF3B 4CFDA 5KI6A 2D0AA 3ULEA 2YHAA 4IDHA 3HRGA 3JAMO 4HUEA 3PLAA 1QZ5A 2P9UA 4ISEA 1C0TA 4MO5A 3DMJA 1G15A 4BC5A 4CECA 4CFAA 3SI6A 2HW3A 1IKXA 4JYAK 3DRRA 2IOCA 3V1RA 1A5WA 1TKXA 2Q0UA 3OYGA 4DF8A 1GLDG 3CCVN 1R0AA 3N4PA 4BC3A 4FLYA 4CHQA 5JVHL 3U6FA 1QSYA 4BQZA 3G25A 2HF4A 4JRPA 3CYMA 1W97L 1WUAA 5LJVA 2D4WA 3HT3A 4KB1A 4XH1A 3DAWA 1N6QA 1L3VA 5AQYA 1XMOK 4EHUA 1BCMA 4H5VA 5SZTA 3MCPA 3BZCA 4CJLA 3ZETB 3C94A 3OYFA 4CBWA 3PV8A 2HOEA 4I6MB 2XY7A 4O0JA 4JKGA 4FL9A 1JLQA 2YKNA 3WNEA 4J2EA 1WAJA 2OZMA 3QIOA 3A5LC 3MEEA 2WONA 4E89A 1TKZA 1U2VA 3OJUA 1BA0A 1RNHA 5C10A 2KKZA 1K8KA 1LCUA 1YHQN 3PY8A 1BL3A 4BRCA 3FZHA 4CGHA 1LWCA 4JI5K 3K5MA 1B92A 4FLTA 3K5NA 1U47A 3R9PA 3SUQA 3J80O 5KRSA 1J5EK 1RTJA 4YOUA 3NVMA 2QW9A 3SQ0A 3LPUA 3OS1A 2ZJPL 3TU5A 4DWIA 3WEEA 2NRWA 3MAQA 1JCFA 3QNNA 3FZFA 1XWLA 5EU7A 4NXNK 1YTUA 1FK9A 1RDAA 3OBYA 1RTHA 4JLHA 3LWLA 3F2KA 4CZKA 4IBNA 4CGIA 3L2RA 1JLEA 1KD1O 4M3WA 2GUPA 4BG8A 2D0OA 1JLCA 4PKIA 2Z1IA 4GMJB 2BE2A 3HTVA 3QEVA 1ZC6A 2D0BA 3VTIA 2OPQA 3TPQA 3M8QA 3WNHA 5KGXA 1RBVA 4Y1CA 4B9MA 4FJIA 3MEDA 2IAJA 1ESVA 1KAXA 5HRSA 2VWBA 3ZLJA 4NCAA 4BE7B 3MMVA 4CJVA 3T1AA 2IIRA 4H0VB 3U3GA 1HKGA 2QKKA 3H1QA 1NK5A 2DTUA 1B9FA 4B8CA 1NGCA 4C8KA 3ZETA 4HCCA 4K41A 3I8DA 3HPGA 3AVHA 4BACA 4JNEA 4FW2A 4RW6A 4I6MA 3DOLA 3EYZA 3LANA 3U9ZA 4BROA 4CE9A 1HRHA 2ASOA 4CIGA 4PUOA 3HK2A 1TUYA 4C1NK 2Z1GA 1LAVA 3VEZA 3VQAA 1K9MO 1EO1A 1IO2A 3C95A 3AVKA 3WNFA 4DUZK 4N76A 2BDPA 2HNDA 4F2RA 4FCYA 3I0SA 4KV8A 3PIOL 3O3FA 5HOOA 4O44A 5AJ3K 4OO1J 4FWMA 3VGLA 4JI7K 4H0TB 3K9JA 3GBTA 5LMNK 4LFBK 3C7NB 4BRMA 2UXBK 4W5NA 3TANA 2HHWA 3JYTA 3O9UA 4DLGA 3D45A 2PBDA 1Z05A 3L6QA 4JHDB 1BA1A 4CK3A 1TL3A 2XRIA 4CIEA 3MWTA 5KQ8A 3L0QA 1ASVA 4FVMA 3NGIA 3O1BA 4DSJA 1ZXOA 2QK9A 3K57A 4CI6A 3VMFB 3CJAA 1HNWK 1NK9A 3CFPA 3O3GA 2ZM6K 4E3SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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