3FE1A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 6 (hsp70b') atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 6
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fe1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fe1A04
1ATRA 1T6CA 2HMPA 3QBWA 2Q97A 2DPNA 2P9PA 5FPDA 5AQYA 3CHWA 5E26A 4LC9B 1GLDG 4QS7A 4XH5A 1NGCA 5AQQA 1ATNA 2P9UA 3ZETB 1ATSA 3EL2A 3ZX0A 1HKCA 4ISGA 3VF4A 1GLCG 1BOTO 2ZWHA 2E20A 1KAYA 1NGIA 3AY9A 5CE3A 3O08A 2PBDA 1YUWA 3LM2A 5LJVA 3WEEA 2D1KA 5JICA 3AAQA 4B1XB 4BRPA 4BC5A 1V4TA 3VEXA 3CQXA 3CJ1A 4BRFA 1Y64A 3TU5A 1BA0A 2BUPA 5FPNA 1MWKA 2P9SA 5AZJA 1BWFO 1X3MA 3D2EA 4BQZA 3DJCA 3L6QA 3S41A 5AQHA 1QQOA 3FGUA 3JS6A 2YJFA 2VWBA 2QWPA 4K43A 5BREA 1RDWX 4BGBA 3L4IA 3D7EO 4JD2B 3SMPA 1GLBG 1Q18A 2A6AA 4IWVA 3VERA 2QWQA 5BN9A 5KPZA 4IXCA 3G25A 4FWKA 3R9PA 4CBXA 3CI5A 4WQ5A 1GLJO 2E2PA 2FLOA 5BR9A 3ULEA 2GEMA 5F1XA 2Q0UA 5LJWA 2P9PB 1BDGA 2YI1A 2GWKA 4PL8A 4FOIA 4A2BA 4B1WB 2P9UB 2FF3B 2FSKA 4BC4A 3GG4A 3QBXA 5AQWA 2IVOA 4DB3A 4M63C 4MO4A 1QQMA 3QICA 5ELZA 5TKYA 3SMSA 3H6EA 3H45C 5JLFA 4RCHA 2CGLA 1NGDA 1NGFA 2PAVA 4BVPA 1KAZA 2D4WA 4XH1A 3VEOA 3DXMA 1X9JA 3O8MA 4O5FA 2CGKA 5F2RA 2V51B 1MA9B 1TUUA 1TYQB 2V7ZA 3GOIA 4M7XA 4NB4A 4XH4A 3D2FA 4H0OA 2P9NB 4BR5A 2ZGZA 3LDLA 2W40A 2P9SB 3D2EB 4H0YB 3U4LA 3QDKA 3WQUA 3QMLA 3EN9A 5KPTA 5AQJA 4GNIA 4CD1A 1HUXA 5AQNA 4ISEA 1GLFO 1T6DA 2GUPA 2FSJA 3C7NA 4FWNA 3ZX2A 3CERA 4K25A 4CZFA 5BRFA 3HM8A 2I7PA 2E2QA 4BRHA 1KXPA 2J4RA 4BRKA 1DKGD 3CJ9A 1YXQA 3KVGA 3ULEB 5EXWA 4BRDA 4H5WA 1BA1A 1NWKA 3MK6A 5EX5A 4CZEA 4NO7A 3ATVA 1QZ6A 1SZ2A 2YCHA 3QFUA 4BGAA 4WQ5C 4C23A 2OANA 2GTDA 3U8XA 3UB5A 4FOEA 4BC3A 3AARA 3BEXA 1NGJA 2CGJA 3A5LC 1BU6O 1NGAA 1C0GA 5EY4A 3C0BA 2W41A 4EFHA 3OHRA 2ASOA 4PL7A 3CJAA 1CZAN 3CJCA 3KZBA 4JHDA 1QQNA 4QS9A 3DXMB 4H5RA 2FF6A 3R6MA 3U9ZA 3A5NC 3O1WA 3J8AA 1KAXA 5AZIA 5AQOA 4CI6A 1ZBSA 3BF1A 2E8AA 3WQTA 1HPMA 1MWMA 3LDPA 5AQKA 3O1BA 4H0XB 3W0LA 3ZX3A 4A61A 4CD3A 2ASMA 2P9IA 1T44A 4JNEA 3GDQA 5LY3A 1D4XA 5AFUA 1EQYA 3VGLA 5AQSA 3CJ7A 5AQRA 2GWJA 2E2OA 4K41A 5AQIA 4K42A 3H46O 1BO5O 1ESVA 1GLLO 2H3GX 3EO3A 1GLEG 1SAZA 4RTFD 2D0OA 1GLAG 4BC2A 4WYBA 2Q0RA 4EAHD 5AQXA 1U2VA 5KQ8A 3HBTA 4FSVA 4DQ8A 2Q31A 3ID8A 2ASPA 4A2AA 1SQKA 2NRHA 3IDHA 3IFRA 3UKUA 2AP1A 4H5TA 3DXKA 4H0PA 2NLXA 3B8AX 5AQZA 2QW9A 2HF3A 3F9MA 1MDUB 4CZKA 4FWSA 2CH6A 3IMXA 3VGMA 4H0VB 3VENA 4PKIA 3UKRA 4CZIA 3FZLA 4JHDB 3HZ6A 1R59O 3VESA 4FWLA 5E84A 2QWOA 3H1VX 3LL3A 4FWQA 4CZLA 4L3QA 4BRIA 5BPMA 5EVZA 3GL1A 1RFQA 2IVPA 4HTLA 3A0IX 3A8YA 3SJHA 3WEEB 3DAWA 1NGEA 5AZIB 3MN9A 2Q2RA 4IZ9A 3HSCA 1XQSC 3ZEUA 4CZGA 1HJOA 4CZJA 5B8HA 3VEZA 4BVOA 3BF3A 1WUAA 4MLHA 3LDOA 2E2NA 3EKUA 4PKHA 3WXLA 1HKGA 3VEVA 3DWLA 2P9IB 5BRDA 4BG8A 5AZJB 4BROA 3QFPA 3WXJA 2IIRA 4FL9A 3TPQA 2A40A 2E1ZA 2P9KA 3VGKA 4AM7A 5ADXA 4BRLA 3CIPA 2YHWA 4PKGA 4Z94A 4BRAA 2AA4A 2QWLA 1HLUA 3FE1A 2IVNA 1NGHA 3MN7A 4BRQA 1U2VB 2VCPA 4EHTA 2A5XA 1IG8A 1ZXOA 4A62A 1J6ZA 4JAXA 4IO8A 3UKUB 4B9QA 3VF6A 3DXKB 4BR9A 2NZTA 1JCFA 5AQPA 4EHUA 3LM9A 1LCUA 5FPMA 3ENHA 4BQLA 2HF4A 4CBUA 3BUZB 3CQYA 5FPEA 1K8KA 2ZF5O 3FZMA 3W3DA 4CJ7A 1S22A 3HI0A 2QWMA 4JD2A 5AFUH 5BPNA 1JCEA 1JCGA 4J8FA 4WQ4A 2E1YA 3LDQA 2WUSA 1H1VA 3MDQA 4FWPA 3CJBA 2F9WA 3GE1A 2YHXA 4B1ZA 3QB0A 3D2FB 4IJAA 3M1FA 1NLVA 3M6GA 4FPAA 4XEIA 1NGBA 1Z6RA 3BP8A 4M7YA 1NBWA 1ZC6A 3FZFA 4BREA 3SK3A 5AQGA 3I33A 4BRMA 2P9KB 2A3ZA 1IJJA 3C7NB 4YDUA 5AQUA 3O5BA 3UE5A 3WXIA 4ISFA 1OKJA 3ATUA 5BPLA 2QM1A 4Y0WA 2E88A 3CETA 4H03B 1DGKN 1TYQA 4H5NA 2P9LA 2YHYA 3A5OC 3P4IA 4FO0A 3JXUA 4BRCA 3FZHA 3M3ZA 1QHAA 2P9NA 1WOQA 3MCPA 4GY2B 2BTFA 3A5MC 1QZ5A 3FZKA 2VYPA 4FPBA 1E4FT 5JLHA 1V4SA 3HTVA 4E1JA 3MN5A 1K8KB 1X3NA 4I6MA 3ENOA 4RWTA 4BR2A 3VPZA 1HKBA 3WT0A 5BN8A 4MLEA 4H5VA 3FLCO 3EKSA 2A41A 2Q1NA 3O4WA 1XUPO 1BUPA 5AQLA 1NMDA 2Q36A 2I7NA 5ADXH 3O6WA 1U6ZA 3U9DA 4CZHA 1E4GT 4MO5A 3FFKB 3GBTA 2FXUA 5AQMA 4BR4A 1DEJA 3RSEA 3FR0A 4WQ4C 2V52B 3MN6A 2ITMA 4BR7A 2QWRA 4F9OA 3VF2A 5AQFA 2A42A 2ZGYA 2FSNA 3MMVA 4B1UB 1Z05A 2QXLA 4EIAA 1G99A 4BRNA 3VETA 4CZMA 1RGIA 5F0XA 1C0FA 2YJEA 3ZETA 2KHOA 3KHYA 2CH5A 4B1YB 1XC3A 2EWSA 3IUCA 4DHYA 3VEWA 3LDNA 5JMVA 1NM1A 2UYTA 2GELA 2P9LB 4YDUC 3VOVA 4FWOA 3L0QA 4JN4A 2QWNA 3AAPA 4H0TB 2V7YA 4HWIA 1BG3A 3EZWA 1YVNA 5AQVA 5KPRA 2D0PA 4I6MB 5EOYA 3H1QA 1TUYA 4BRGA 3O80A 3R8EA 3WUHA 3WXKA 1S3XA 4B1VA 5I9EB 5AR0A 4KBOA 5BRHA 3I8BA 4FWMA 1P8ZA 4O8KA 3UKRB 4BG9A 4BR0A 4FWRA 4QS8A 2F9TA 1YAGA 5AQTA 3H3NO 3H3OB 1HX1A 3SLCA 1NGGA 4CBWA 1LOTB 3RSEB 4AM6A 3ZEUB 5KQDA 4DCHA 4IJNA 2HOEA 3VEYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATRA 1WAJA 1BI4B 3CCQN 2DPNA 2YV0X 3AO5A 3OY9A 5FPDA 4W5RA 1DJTA 4XH5A 4KO0A 5AQQA 4I9QA 1ATSA 3EL2A 4FJNA 2ZWHA 4B3SK 1KAYA 3AY9A 4C8OA 1I3AA 1VSHA 2PBDA 3O08A 4X64K 1TK5A 2G8FA 1YUWA 2HBMA 1I2UA 1WBBA 2P5GA 1K8AO 2OZMA 3ALYA 4B1XB 4BC5A 1NE5A 1NJXA 4LY7A 1V4TA 3VEXA 3KK2A 4AHCA 3CJ1A 5BR8K 3VQ8A 1Y64A 4AH9A 1BA0A 1Q81O 1Z25A 2YNFA 1KTQA 2E2FA 1BWFO 3AGKA 2PYJA 4DV1K 5AQHA 2F8TA 2GL1A 1MYNA 2UUBK 3QEIA 4CESA 3CCUN 4CEFA 1LW2A 3E01A 3S5TA 3LP3A 4JKCA 1WAFA 5I3UA 5E41A 3SMPA 4V1DC 4FJMA 3L2QA 1VQNN 2ZQBA 1IO2A 3SUOA 4E72A 4CBXA 2HNDA 4DMNA 2GEMA 2UUAK 2QK9A 3R3LA 1NKCA 2O8BB 3PX6A 2PFUA 1T7EA 4DV7K 1VQMN 3TANA 5LJWA 3V1QA 1BDGA 3LANA 2UXBK 1EKEA 4CF1A 4F4KA 1K9MO 2P9UB 2FSKA 4K0KK 1XRSB 2ATQA 4M63C 5TKYA 3H6EA 5JLFA 4CHQA 4RCHA 2SN3A 4JK9A 2D4WA 1FW6A 3J7YP 3ZT4A 3VEOA 3L2UA 3DXMA 4LFAK 1MA9B 3GOIA 2WC9A 2WONA 3JAMO 1S9GA 3VQ9A 2YX6A 1GPTA 2P9NB 2Z1GA 2G8UA 1PTXA 2KBKA 3D2EB 3U4LA 4JI2K 5JENA 3QDKA 3WQUA 4CEZA 5KPTA 4JI1K 4IDHA 4YFUA 3LAKA 2FC0A 4ZHRA 1CZ9A 1GLFO 1T6DA 4JKGB 4CJFA 4FK2A 2GUPA 3HSTB 1JXCA 3WXMB 2RPIA 5LMUK 4DS4A 4PY5A 4DFKA 3LWMA 2J4RA 3KVGA 3NVKA 4JEPA 4H5WA 1BA1A 4MQ3A 2VQEK 2ZE2A 1CXQA 1S1TA 5EX5A 2LR3A 2ITGA 1RDUA 4O0JA 4KI6A 4DR3K 1BCGA 3QFUA 4O0IA 4CGIA 4WQ5C 5JS1A 2NUBA 5GIOA 2OANA 1NG9A 3UB5A 1E3MA 4FOEA 4JS5A 1YIJN 5EY4A 4MDAA 3C0BA 1KCFA 5CZ1A 2I5JA 3CCVN 4OKJA 4JLHA 1TK0A 5KRTA 1BCMA 1CZAN 2QXFA 1QQNA 2Y1JA 1QQCA 2ZJRL 3DLLL 2FF6A 2HHIA 1FKOA 4Q5VA 5IWAK 1KAXA 1YJWN 2ATBA 3LZJA 4CI6A 3U3GA 2PZSA 3MXIA 4DQIA 3EYZA 1RT1A 1U04A 5AQKA 1VQKN 3VQCA 1EETA 4CJUA 3ZX3A 4PQUA 3CXCM 4JNEA 1T44A 4Z0UA 3DI6A 2HHXA 5AQSA 3SAGA 2KZMA 2OPSA 4AHRA 4FM1A 4IFVA 2JDQD 1HYVA 1RT2A 1ZBHA 1P0AA 1D5AA 3H46O 1GLLO 3ENBA 5M1FA 4CF0A 4FZYA 1I94K 3VTHA 4WYBA 2Q0RA 4EAHD 2HVHA 3HM9A 4OPKA 4BWJA 3CM5A 1RNHA 1N33K 3ZSVA 2O4GA 3B6PA 5C24A 1ZU3A 3ID8A 3I8DA 1T7BA 1FKPA 2NRHA 3O4QA 4JRPA 4X62K 4BY9C 3SJJA 4KH4A 3UKUA 2O8FB 3K9JA 5AQZA 3F9MA 1MDUB 3SQ2A 3T3FA 3IMXA 1GOCA 5D3GA 1RBUA 3VENA 1BGXT 3KJVA 3J7ZO 2IDOA 1HNZK 3UKRA 1N32K 3CW4A 2VG5A 3S3OA 3FZLA 1R59O 4FWLA 5TKWA 3H1VX 3LL3A 2A7TA 1NPIA 2IVPA 3A8YA 1NGEA 2KLAA 2VGMA 4OLAA 3HSCA 1XQSC 3SYZA 3C6AA 1DT9A 1WUAA 3EKUA 3WXLA 5FRNA 4FK0A 1T7AA 3MX5A 1BI4A 4FLXA 2G8WA 3KK7A 4IBNA 1WNSA 3AV9A 1HNWK 1W9HA 3V9WA 3R2VA 5T7BA 4DQPA 4FL9A 1QSSA 3C65A 2P9KA 1BL3A 1QSYA 4H8KA 4CEDA 3CCMN 3KC6A 1KFDA 4AILC 1LWCA 4CJ5A 4YNQA 3AA4A 4KFBA 3SBGA 4K8ZA 4DKWA 3T1YK 1U2VB 4FJ7A 2A5XA 1IG8A 4DU4A 1IV0A 4CVNE 2KZZA 1VRUA 4JKAA 2NZTA 2O8EB 3LM9A 3AVHA 2RN2A 4E89A 2AJQA 4FCYA 3ENHA 4BQLA 3LZIA 4CBUA 3CQYA 1SKRA 1N6QA 3FZMA 1J54A 3OS2A 2P5OA 4FJ5A 3HI0A 1NKBA 3MWTA 5AFUH 1JCGA 1SL0A 2IS3A 3TAQA 1H1VA 4JI4K 3MDQA 4EZ6A 2OPPA 1HJRA 5CZ2A 1I2VA 3SAFA 2O8BA 2YHXA 3T7ZA 4DTRA 3EY1A 4KB1A 1TKDA 3BDPA 5CR4A 4JYAK 4DLEA 4FPAA 1BIZA 4KHWA 3FZFA 1LQIA 1JL1A 3L4QA 5FDLA 3V6DA 4BRMA 4RW4A 3M8SA 5AQUA 4LFCK 3WXIA 1OKJA 3KOXA 3T1AA 4F2SA 3TAMA 4Y0WA 2E88A 5GAEP 1B3CA 1YI2N 1XWLA 3KTQA 3A5OC 4DV3K 4CEQA 1VRTA 3AO4A 2E0HA 2P9NA 1RBTA 4ICLA 1WSHA 1SUQA 4JS4A 2VYPA 5JLHA 4X65K 2VG7A 3ZT0A 1X3NA 4I6MA 2E5LK 3V1OA 4F2RA 4RWTA 4LF5K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1ATR A;  1WAJ A;  1BI4 B;  3CCQ N;  2DPN A;  2YV0 X;  3AO5 A;  3OY9 A;  5FPD A;  4W5R A;  1DJT A;  4XH5 A;  4KO0 A;  5AQQ A;  4I9Q A;  1ATS A;  3EL2 A;  4FJN A;  2ZWH A;  4B3S K;  1KAY A;  3AY9 A;  4C8O A;  1I3A A;  1VSH A;  2PBD A;  3O08 A;  4X64 K;  1TK5 A;  2G8F A;  1YUW A;  2HBM A;  1I2U A;  1WBB A;  2P5G A;  1K8A O;  2OZM A;  3ALY A;  4B1X B;  4BC5 A;  1NE5 A;  1NJX A;  4LY7 A;  1V4T A;  3VEX A;  3KK2 A;  4AHC A;  3CJ1 A;  5BR8 K;  3VQ8 A;  1Y64 A;  4AH9 A;  1BA0 A;  1Q81 O;  1Z25 A;  2YNF A;  1KTQ A;  2E2F A;  1BWF O;  3AGK A;  2PYJ A;  4DV1 K;  5AQH A;  2F8T A;  2GL1 A;  1MYN A;  2UUB K;  3QEI A;  4CES A;  3CCU N;  4CEF A;  1LW2 A;  3E01 A;  3S5T A;  3LP3 A;  4JKC A;  1WAF A;  5I3U A;  5E41 A;  3SMP A;  4V1D C;  4FJM A;  3L2Q A;  1VQN N;  2ZQB A;  1IO2 A;  3SUO A;  4E72 A;  4CBX A;  2HND A;  4DMN A;  2GEM A;  2UUA K;  2QK9 A;  3R3L A;  1NKC A;  2O8B B;  3PX6 A;  2PFU A;  1T7E A;  4DV7 K;  1VQM N;  3TAN A;  5LJW A;  3V1Q A;  1BDG A;  3LAN A;  2UXB K;  1EKE A;  4CF1 A;  4F4K A;  1K9M O; 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