3FE1A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 6 (hsp70b') atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'MELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 6
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fe1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fe1A04
5AQLA 4BRAA 4FOEA 3MCPA 4BROA 1X3MA 2P9SB 2Q36A 2D4WA 2FSNA 2ASMA 3CJ1A 1NGGA 1RFQA 4MLEA 4K42A 2P9IB 4PKGA 1HPMA 3ZX0A 2QWMA 1Y64A 3CHWA 3RSEB 1QQOA 2GWJA 3QICA 4LC9B 2F9TA 3D7EO 4BRNA 1BUPA 4XH1A 2NLXA 4H5TA 4B1WB 3UKUA 5KQDA 3QMLA 4BRLA 3AY9A 2E1ZA 3WEEA 4BG9A 3FZFA 5LY3A 2YHYA 5ADXA 2Q0UA 2V51B 5AFUA 1SQKA 1IJJA 3EO3A 5JICA 3CJBA 4H5NA 4BR9A 5AQSA 4CZKA 2Q97A 3VENA 4ISFA 2W40A 4GNIA 1S22A 3ZX2A 1KXPA 4JAXA 4MO5A 3QBXA 2Q0RA 3H6EA 3AAPA 2QW9A 3F9MA 1XUPO 1KAZA 3M1FA 1Z05A 4EAHD 3VEZA 5B8HA 4RTFD 1CZAN 3ENOA 4DB3A 1NGHA 1NGCA 3ZEUA 5AQXA 2HMPA 4ISGA 4QS8A 1NLVA 2E88A 1BO5O 3MN6A 3GG4A 3VETA 4B1VA 2HF4A 4AM6A 3GOIA 5LJWA 1J6ZA 2QWOA 5EY4A 3VGMA 5FPNA 2V7ZA 1QZ6A 1E4GT 4BRPA 1ATSA 4BRHA 4IXCA 2FLOA 1BWFO 2E1YA 3BP8A 4FWMA 4H5WA 3UE5A 4A2BA 3MN7A 4A62A 2PBDA 4BG8A 5EVZA 5EXWA 3LM9A 1HKBA 2ZGYA 4B1XB 4FWLA 4CZLA 5FPEA 3FZLA 2P9KA 3VF2A 3H1QA 3VF6A 3ULEB 4BQZA 1C0FA 1BU6O 3QFUA 5FPDA 1U2VB 4B9QA 2FXUA 3HM8A 3D2FA 3D2EB 3DJCA 4H5VA 5BPMA 2P9UA 2PAVA 4QS9A 3SMPA 4DCHA 2ZGZA 1V4TA 4FWSA 2IIRA 2YCHA 5AQNA 2D0OA 1YUWA 2P9IA 1GLLO 3CERA 4XEIA 3WXLA 3R8EA 1IG8A 4H5RA 2WUSA 4BC5A 3KVGA 4BR5A 1TUUA 5AQMA 1NGIA 3GE1A 4WQ5A 1BA1A 3FZMA 4WYBA 2P9NB 4FOIA 5BRHA 4A2AA 3VGLA 1NMDA 3O6WA 1T44A 4XH5A 2QWRA 2P9KB 3CQXA 3U9DA 1QQNA 4CZJA 4RCHA 3CQYA 4H03B 4CZHA 4F9OA 1GLFO 4BC3A 2YJFA 1YAGA 3SJHA 3GL1A 3U8XA 2QWNA 5BPLA 2P9UB 3BF1A 1HLUA 1RGIA 3U9ZA 2E2QA 1K8KA 4H0VB 3O8MA 3R6MA 5AQFA 3OHRA 1Z6RA 5AQOA 1XC3A 1ZXOA 1WOQA 3ZETB 2BTFA 5FPMA 1P8ZA 4JHDA 4WQ4A 3B8AX 1HX1A 5AQHA 2D1KA 4JN4A 3QDKA 3MN9A 3H1VX 3H46O 3VERA 4GY2B 3HZ6A 1YVNA 5KPTA 5KQ8A 2KHOA 2ASPA 1GLBG 1EQYA 1TUYA 4IZ9A 4WQ5C 2CGJA 4BC4A 3A0IX 3H3OB 3C7NB 4CZEA 5ADXH 4BRQA 3LDLA 5AFUH 1MDUB 1HKCA 1GLEG 2IVOA 2GEMA 1K8KB 1LCUA 4IJAA 4BVPA 3QFPA 5JLHA 4CBXA 1KAXA 3MDQA 5AQUA 3AARA 2FF6A 3JS6A 4CJ7A 4JHDB 3A5OC 3VESA 3L6QA 2QWPA 3ULEA 1QZ5A 2Q31A 1U2VA 3KHYA 4HWIA 4FPAA 3FZHA 5BRDA 2ZF5O 4K25A 3D2EA 1NWKA 5F2RA 4WQ4C 4EHUA 5JMVA 4FL9A 1SAZA 4FPBA 1OKJA 1QHAA 1R59O 2YJEA 4DQ8A 1GLDG 2E2OA 3EKSA 3WQTA 2V7YA 4EIAA 2I7PA 2QM1A 4I6MA 3FE1A 3A8YA 1Q18A 5AQKA 4H0PA 2YI1A 4FO0A 5AQZA 2YHWA 3J8AA 2F9WA 3SLCA 3FFKB 1D4XA 1KAYA 1RDWX 4Z94A 2P9NA 5AQJA 3EL2A 3ZX3A 4NB4A 3DXKB 4BR0A 4PL7A 3LDOA 3O5BA 1BG3A 4A61A 3C0BA 3KZBA 5EOYA 2OANA 1U6ZA 1NGAA 4JD2B 4CBUA 1HJOA 4H0XB 2GWKA 2QWQA 4H0TB 2QXLA 4BR2A 4AM7A 3P4IA 1MWMA 3O1WA 5LJVA 3IUCA 5KPZA 3VEXA 4MO4A 4BRCA 3ID8A 3VEYA 3TU5A 4BRDA 1NBWA 5AQVA 3ATUA 4L3QA 5I9EB 3BEXA 3GDQA 4I6MB 3M6GA 3ZETA 1MWKA 3HI0A 4PKIA 3HBTA 4H0YB 4H0OA 2VWBA 1MA9B 3LM2A 2P9LA 3UKRB 1X9JA 4BRGA 1ATNA 4FWPA 5AR0A 3DXMB 4RWTA 4FWQA 3CI5A 4FWRA 4E1JA 4IWVA 3EN9A 4BRFA 5AQQA 2FF3B 5BN9A 4BR4A 1QQMA 3C7NA 3WQUA 1T6DA 2IVPA 5AQTA 3BF3A 2NRHA 3VF4A 5JLFA 4CD1A 4C23A 1BDGA 3A5LC 3CETA 5AQRA 3CJAA 3W0LA 3VPZA 1ESVA 2IVNA 2FSJA 3CJ7A 3IDHA 2QWLA 2P9PB 2J4RA 5AQPA 4NO7A 2P9LB 3EKUA 1X3NA 4QS7A 3MK6A 2E8AA 5AQIA 3EZWA 3UB5A 3M3ZA 1GLCG 2HOEA 1NGFA 2BUPA 4BGBA 1YXQA 2FSKA 3FR0A 3BUZB 2E20A 3IFRA 5EX5A 5F1XA 2YHXA 3H3NO 3WXJA 2Q2RA 1TYQA 2Q1NA 3W3DA 2GTDA 3DWLA 3VEWA 3R9PA 1JCGA 3O08A 1T6CA 3MN5A 1JCEA 3IMXA 3DXKA 2HF3A 4CD3A 1H1VA 5ELZA 3WT0A 1C0GA 4O8KA 2DPNA 4JD2A 4M7YA 3CJ9A 1S3XA 4O5FA 3A5MC 3SMSA 1BA0A 3LL3A 4BGAA 2GELA 3ATVA 4YDUA 2I7NA 5AQYA 3LDNA 4CZMA 1DEJA 4BC2A 2EWSA 3O4WA 1GLAG 3DAWA 1DKGD 1SZ2A 4FWOA 2A40A 2CGKA 3A5NC 3FGUA 4IJNA 3L4IA 2A5XA 3QB0A 3VGKA 4M63C 1TYQB 3FLCO 2E2PA 1XQSC 3WXIA 2NZTA 3WUHA 1NM1A 1ATRA 1V4SA 3UKRA 4FWNA 3DXMA 1GLJO 3L0QA 3O80A 3AAQA 3UKUB 3SK3A 2V52B 3H45C 4DHYA 3WEEB 4B1ZA 2CGLA 2CH5A 4B1YB 4KBOA 4BR7A 1G99A 1HUXA 2UYTA 5F0XA 4BRMA 4MLHA 3GBTA 1DGKN 2A41A 4EHTA 5AQWA 3G25A 4J8FA 5AZJA 4FWKA 3HTVA 5BR9A 3ENHA 1ZC6A 4K43A 3TPQA 4YDUC 1NGBA 3CJCA 4CZGA 3S41A 2ITMA 5BRFA 3U4LA 1NGJA 5CE3A 3FZKA 4FSVA 2P9PA 4BRIA 4CZIA 2A3ZA 5AZIA 4IO8A 2CH6A 4CBWA 1HKGA 3ZEUB 4B1UB 4BQLA 3HSCA 4ISEA 2A6AA 4PL8A 5E26A 3I8BA 1NGDA 3JXUA 2VCPA 2AP1A 2P9SA 4M7XA 1NGEA 4CI6A 4EFHA 5BPNA 3VEOA 1LOTB 2D0PA 2VYPA 3RSEA 3WXKA 5BREA 2E2NA 5E84A 3I33A 5AZJB 2GUPA 1JCFA 3CIPA 4JNEA 3LDQA 3O1BA 2ASOA 4CZFA 5BN8A 2W41A 4BRKA 3MMVA 2A42A 3VOVA 2ZWHA 4Y0WA 1E4FT 2AA4A 4BREA 4K41A 3VEVA 1WUAA 4PKHA 5AZIB 4XH4A 3D2FB 5AQGA 4HTLA 1ZBSA 3QBWA 1BOTO 2H3GX 5TKYA 3LDPA 5KPRA 4BVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E5LK 1AHOA 2P9SB 2D4WA 4XJXA 3AO4A 5C2FA 1RFQA 4MLEA 1NRBA 4F4KA 1BI4A 3AV9A 2QWMA 2ZD1A 1Y64A 4B9LA 3CHWA 3QICA 4B3OA 4BRNA 4NYNA 3KC6A 2JDQD 4Z4IA 4B1WB 3QMLA 2KW4A 3NVMA 4DQRA 1LWEA 3HXMA 3G71N 1CHZA 2Q0UA 2YILA 2KBKA 4DUYK 1A5VA 5M1FA 4H5NA 5AQSA 4KREA 3VENA 3KIOA 1T05A 4JI3K 1KXPA 2N66A 1BI4B 3OS1A 1KAZA 1WSHA 3VEZA 5B8HA 2GMOA 1GOCA 1VQ5N 1HYVA 1RILA 3CCRN 1ZUTA 3ENOA 1NNEA 1NGHA 2VY6A 1HQEA 3ZEUA 5AQXA 3EYZA 3K2PA 1LV5A 2G8VA 4JI0K 2AJQA 2HMPA 1Z26A 3R3LA 1RT2A 4DSEA 4OGCA 4XIUA 3KWGA 3ZT3A 1HNVA 3GG4A 4AHTA 2HF4A 4JI1K 4WFNL 3SI6A 4IOAL 4AM6A 3HOSA 1NU0A 2G8FA 2QWOA 5EY4A 3VGMA 1QZ6A 4EZ6A 2O4GA 5J2QA 1B7DA 3GKUA 4BRPA 1CZBA 2OTLN 3OYEA 3HJFA 1ZBIA 2E1YA 4A2BA 3MN7A 4CVNE 3LM9A 1HKBA 4CZLA 4E7HA 5KGWA 3RVCA 3LP3A 1NKBA 3AVBA 5CY4A 3VF6A 1C0FA 3EEQA 3HM8A 1NJZA 1RNHA 4M3TA 1WSEA 4FZYA 1IBLK 1LQQA 1S1WA 1NKEA 1S6PA 4PY5A 2D0BA 4N41A 1KLMA 1RDBA 1IH7A 1RT6A 1QSSA 1Y97A 1YUWA 2LY5A 2D0OA 1XWLA 4E1NA 2LR3A 3K5MA 2O8EB 3CCLN 1UGLA 1CZ9A 4A2AA 3C6UA 1EO1A 5CYQA 3K5NA 1S1TA 2O8BA 4CK2A 1RBUA 2EX3A 4QCLA 3C6AA 2ZJQL 2HHWA 4RCHA 4CZHA 3RR7A 1U49A 1GLFO 3ZSXA 4B8AB 1IKXA 4BC3A 4OX9K 3U8XA 1X1PA 3I8DA 5BPLA 1KFDA 5C12A 2OZSA 1K8KA 4IFEA 5AQFA 3M8QA 1T0ZA 1QQCA 1XRSB 5AQOA 2HHQA 4C8NA 4CJ5A 4ID5A 4WQ4A 3B8AX 3E9OA 1HX1A 3ENBA 3PV8A 4KHPK 3H1VX 3ITHA 5DM6L 3CFPA 4C8LA 3H46O 4B3TK 2KHOA 3RTVA 4JKHA 2ASPA 3BK3C 3NF9A 1GLBG 2O8BB 1K6YA 1TUYA 2CGJA 4BC4A 1JKHA 3C7NB 2N2QA 2UUBK 3O9TA 4CZEA 4BACA 3ULDA 4JKEA 4M3XA 4AHUA 4F3TA 1J54A 1MDUB 3RR8A 1HKCA 1GOBA 1JLEA 3VTIA 4HHTA 4KKOA 2BDPA 1T1TA 3NH2A 1K8KB 4IJAA 2HHSA 4LF7K 4TSXA 1DTTA 3AVIA 4KO0A 2R7YA 4PQUA 2KQ2A 4KAZA 1CXQA 2QWPA 3G6EN 4HWIA 3T1AA 1LAVA 3AVFA 4X64K 1NRAA 4DFMA 1M1KO 5F2RA 4G9ZA 4UJ0A 1SAZA 1J5EK 3WQTA 4OKJA 4EIAA 4LH5A 1S9GA 3I0RA 3L2UA 4I6MA 3FE1A 2HW3A 2YI1A 4MQ3A 3K57A 1HNXK 3J8AA 4FXDA 2P9NA 3SQ0A 5AQJA 3EL2A 1QSYA 3ZX3A 3V1QA 3HO1A 4B8CA 4A61A 1BG3A 4GV3A 1TKTA 4DSFA 5C10A 1U6ZA 4F8RA 3PIPL 3BY5A 3LZJA 2QWQA 4H4OA 4M3RA 3P4IA 4CF8A 3IUCA 5KPZA 1WSIA 2W6LA 3P5JA 3ID8A 3DI6A 3TU5A 4BRDA 3KK7A 2F4VK 2X78A 5FRMA 3P38A 3GDQA 1WLJA 4I6MB 1YTAA 3V9XA 3HBTA 2E3GA 1TK5A 1N6QA 4H0YB 3ZT4A 1MA9B 3DLHA 3LM2A 4BE1A 2XY5A 3LAKA 4DR5K 2E4LA 3DXMB 3I56N 4FWQA 3OTOK 3NFAA 3CI5A 4FLTA 2PYLA 1L5UA 2YNHA 2D0AA 3MX2A 3K5OA 3WQUA 4MDAA 3D0PA 3BF3A 3DYAA 2O8DB 1NK4A 1LAWA 3A5LC 4B9VA 1DQ7A 3OS0A 3C94A 2HBMA 5E41A 3LZIA 3VPZA 5HRSA 3NAEA 1ESVA 4JKAA 4O44A 3LPTA 4FVMA 2IVNA 1OH6A 2FSJA 1SV5A 3C95A 3CJ7A 3T7ZA 1C0UA 4DKWA 1VQ4N 3V9SA 1QTMA 1KD1O 3ALYA 3OYHA 1VRUA 4LFBK 1W0HA 5JS1A 4YY3K 4CEDA 4B3SK 2G8IA 2E8AA 1SUQA 3EZWA 3LANA 4CJWA 3NF7A 1JXEA 1GOAA 1NGFA 3SAGA 5AJ3K 3FR0A 4DF8A 5HLFA 3E1YA 2M8BB 3IFRA 5EX5A 3CCMN 2ZQBA 2UUCK 3A2FA 1TYQA 3KKRA 2HNYA 3RWUA 1WSGA 3V1RA 1Q82O 4CJEA 3W3DA 2GTDA 1D8YA 2JWLA 3LWLA 3R9PA 1JCGA 1T6CA 4CFAA 3MN5A 4JEPA 4FJGA 3IMXA 3S5TA 1BCMA 1H1VA 3WT0A 1C0GA 2WBNA 4DR4K 3KK2A 4CF0A 1UA0A 1P0AA 1HMVA 4M7YA 2DTUA 1NMNA 1ZYVA 2WFBA 4YORA 1XMQK 1ZYWA 4O5FA 1OH5A 3SMSA 2QKKA 2GELA 4M3WA 5AQYA 4CZMA 2X6SA 2EWSA 1E3MA 3CPEA 2N2RA 1XI1A 3FGUA 1MYNA 4IJNA 3L4IA 2XHBA 4M63C 1TYQB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E5L K;  1AHO A;  2P9S B;  2D4W A;  4XJX A;  3AO4 A;  5C2F A;  1RFQ A;  4MLE A;  1NRB A;  4F4K A;  1BI4 A;  3AV9 A;  2QWM A;  2ZD1 A;  1Y64 A;  4B9L A;  3CHW A;  3QIC A;  4B3O A;  4BRN A;  4NYN A;  3KC6 A;  2JDQ D;  4Z4I A;  4B1W B;  3QML A;  2KW4 A;  3NVM A;  4DQR A;  1LWE A;  3HXM A;  3G71 N;  1CHZ A;  2Q0U A;  2YIL A;  2KBK A;  4DUY K;  1A5V A;  5M1F A;  4H5N A;  5AQS A;  4KRE A;  3VEN A;  3KIO A;  1T05 A;  4JI3 K;  1KXP A;  2N66 A;  1BI4 B;  3OS1 A;  1KAZ A;  1WSH A;  3VEZ A;  5B8H A;  2GMO A;  1GOC A;  1VQ5 N;  1HYV A;  1RIL A;  3CCR N;  1ZUT A;  3ENO A;  1NNE A;  1NGH A;  2VY6 A;  1HQE A;  3ZEU A;  5AQX A;  3EYZ A;  3K2P A;  1LV5 A;  2G8V A;  4JI0 K;  2AJQ A;  2HMP A;  1Z26 A;  3R3L A;  1RT2 A;  4DSE A;  4OGC A;  4XIU A;  3KWG A;  3ZT3 A;  1HNV A;  3GG4 A;  4AHT A;  2HF4 A;  4JI1 K;  4WFN L;  3SI6 A;  4IOA L;  4AM6 A;  3HOS A;  1NU0 A;  2G8F A;  2QWO A;  5EY4 A;  3VGM A;  1QZ6 A;  4EZ6 A;  2O4G A;  5J2Q A;  1B7D A;  3GKU A;  4BRP A;  1CZB A;  2OTL N;  3OYE A;  3HJF A;  1ZBI A;  2E1Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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