3FE1A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 6 (hsp70b') atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 6
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fe1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fe1A04
3LDOA 5E26A 1NGFA 2H3GX 3O6WA 3FFKB 5AQFA 1TYQA 5AQSA 1D4XA 3IFRA 1YVNA 4FWRA 2P9SA 3ZETA 3QBXA 3HM8A 1NGHA 5AQUA 4O5FA 3U9DA 4PL7A 3FZHA 3VERA 3H46O 2J4RA 4WQ5C 2QWNA 2P9NB 4BC3A 3WT0A 2CH6A 3BUZB 2D4WA 1BG3A 3EZWA 3MN9A 3HSCA 4BRNA 2EWSA 1C0GA 2QWMA 1J6ZA 1OKJA 1T6DA 4EIAA 5BREA 2ITMA 5BR9A 1KAYA 3BF3A 3CERA 1SAZA 4JD2A 1JCEA 3ZX2A 1DGKN 1NMDA 5AQPA 2GWJA 3H45C 3HBTA 4H0TB 5BRHA 2E2PA 2ASPA 2E1ZA 1NGJA 1SQKA 3L6QA 5AR0A 3C7NB 3O80A 4CZKA 3O1WA 4WQ5A 4H5RA 4H5VA 1RDWX 1LCUA 4FWOA 4ISEA 3WXJA 4BGAA 1BOTO 3A5MC 1BO5O 1T44A 4RCHA 3VENA 1RFQA 3RSEB 4BC2A 2E8AA 5F1XA 3ENHA 3MK6A 1DEJA 4CBUA 5AQJA 4BR9A 1WUAA 1V4SA 5AQXA 3ZX0A 4JAXA 2QW9A 2BTFA 1GLLO 3FZKA 3ZEUA 4BGBA 3KVGA 4J8FA 4FWMA 5EXWA 4XH4A 2NLXA 4H5WA 4B1UB 3AAPA 4YDUA 5KQ8A 1V4TA 3MN7A 3A5OC 3ULEA 3SLCA 1NGBA 1U2VA 1Z05A 2E88A 3CIPA 3ZETB 4FWLA 4BVOA 2Q0UA 1G99A 3AARA 1S3XA 3VGMA 2V7YA 4YDUC 3FGUA 2QXLA 4BR2A 4H0VB 3LDLA 5EY4A 3R9PA 1KAXA 2VYPA 1X3NA 4A61A 5JMVA 4FPAA 4DHYA 2VWBA 3QMLA 3KZBA 3VEXA 4FWKA 4AM7A 1WOQA 3MN6A 4IXCA 1IG8A 4ISGA 3VEOA 1LOTB 1YXQA 1R59O 3GBTA 3MMVA 2A6AA 1YAGA 3DXKA 2YCHA 4B9QA 3D2EA 3MCPA 4CZJA 2V51B 3JXUA 4DCHA 5AZIA 3VOVA 4JHDB 5LY3A 2IVOA 5AZIB 5FPDA 2YHXA 4EHUA 4FWPA 3VF2A 2P9UA 3ATUA 3CETA 2A5XA 3IMXA 1HX1A 1EQYA 4CI6A 1GLDG 3EO3A 1HKGA 3RSEA 3VF4A 2UYTA 3FZFA 2QWOA 4NO7A 5AZJA 5KPZA 2GWKA 1QZ6A 3O5BA 5EX5A 5BPMA 3LM2A 5ADXA 1Q18A 4CZEA 3A5LC 3D2FB 3W0LA 4BRFA 4JD2B 2Q97A 3O08A 2E2OA 2GUPA 4QS8A 2DPNA 5LJWA 5E84A 1ATRA 3ATVA 3TU5A 2NZTA 4BR4A 3CQXA 1BDGA 1NBWA 5KPRA 3LDQA 3EN9A 4BRLA 4A2BA 1K8KA 2ZWHA 1NLVA 2GTDA 3CJ1A 4BRKA 4CZHA 2Q0RA 4FWQA 3VESA 4M63C 2P9KA 5AQTA 3WEEA 3SMPA 1SZ2A 5JLFA 2D0OA 1QHAA 2ZGZA 5AQYA 2F9TA 5BPNA 3KHYA 4IJNA 3AY9A 1X9JA 2FSNA 3LDNA 3HTVA 3WQTA 4BRMA 4CZLA 5I9EB 3W3DA 3QDKA 2I7PA 4MLHA 4L3QA 3MN5A 4ISFA 5BN8A 1E4FT 1BUPA 3VF6A 2Q1NA 4Z94A 4JNEA 4BR0A 1JCGA 5CE3A 2PAVA 3QBWA 1NGEA 3ULEB 4MO4A 4EAHD 3CJCA 4FWSA 1TUYA 3U4LA 4B1WB 3S41A 4BR7A 5F0XA 1TYQB 3J8AA 1ATSA 1GLCG 4M7XA 2CGKA 4FSVA 2QWRA 2YHWA 1ZBSA 2P9LA 2QWLA 1NGDA 4BRCA 3GG4A 5BRFA 5AQWA 3SMSA 4BRQA 3CJBA 1T6CA 5AQNA 2V7ZA 3CI5A 4B1YB 3UKUA 3H1VX 1GLJO 2ASMA 4C23A 3H1QA 3GL1A 4H0PA 2FSKA 3I33A 4IZ9A 5AFUA 3GDQA 2E2NA 5AQZA 3CHWA 1NWKA 1BWFO 2E2QA 4H5TA 5AQMA 3WXLA 4K41A 3D2FA 2ZGYA 3O1BA 2A3ZA 5EOYA 1ATNA 5JLHA 4K25A 4BRGA 2IVNA 2KHOA 2CGLA 3U8XA 3CJ9A 4H0YB 3AAQA 4IO8A 3QICA 4BROA 2QWPA 3LM9A 1XQSC 5ADXH 2W41A 2P9KB 3F9MA 3ID8A 3WXIA 2YI1A 4BR5A 5BRDA 1TUUA 3CQYA 3R6MA 3R8EA 2Q31A 3O8MA 4A62A 4RWTA 4AM6A 2E20A 4BC5A 5AQLA 1ZC6A 3FZMA 2P9IB 3UKRA 4DQ8A 1IJJA 1ZXOA 3DJCA 5AQHA 1K8KB 1HUXA 2FF6A 3UKRB 4O8KA 2CH5A 2QM1A 5KQDA 3I8BA 1MA9B 4QS9A 3B8AX 3QB0A 4MO5A 1QQMA 5AQKA 1GLFO 4B1VA 1C0FA 2D1KA 1XC3A 4WQ4C 2FLOA 3C7NA 3DXMB 3BP8A 1HKCA 3DAWA 2Q2RA 2OANA 4BRAA 2YHYA 4HWIA 3UKUB 2P9IA 4KBOA 3HZ6A 3SK3A 3HI0A 4BG8A 2HF4A 4BQZA 4BRDA 4FPBA 4Y0WA 3WXKA 1QQNA 2E1YA 1NGGA 3FE1A 3MDQA 1NGAA 2WUSA 3M6GA 4H0OA 3VGLA 3GOIA 4EHTA 5FPEA 2VCPA 5AQIA 3EKSA 4K43A 4F9OA 4EFHA 3L0QA 1HPMA 4RTFD 4CBXA 4IWVA 4WQ4A 4BQLA 1DKGD 2GELA 3TPQA 2GEMA 2P9UB 3CJAA 2PBDA 1E4GT 4CD1A 2YJEA 5AQOA 2ZF5O 3D7EO 2ASOA 2CGJA 2NRHA 3A8YA 4JN4A 4HTLA 1Z6RA 5LJVA 2F9WA 4BRHA 2D0PA 3L4IA 1HLUA 2P9SB 1GLEG 4XEIA 4PKGA 3P4IA 4PKIA 3WEEB 3VGKA 5AQGA 3ZX3A 5BN9A 2W40A 2FSJA 1P8ZA 1MDUB 2HMPA 3M3ZA 2IIRA 1QQOA 1Y64A 4PKHA 3DWLA 3EL2A 1CZAN 3IUCA 2BUPA 4IJAA 5AQVA 3H3OB 3H6EA 4FOEA 3GE1A 1NGCA 4FO0A 3VEZA 1RGIA 3BEXA 3G25A 3M1FA 1U2VB 4B1XB 4CZGA 2FF3B 4BC4A 4BRPA 3ENOA 3VEYA 1NM1A 3H3NO 4K42A 1GLAG 1KAZA 3A0IX 5B8HA 3VEWA 1H1VA 1KXPA 2P9NA 4WYBA 4CZFA 2FXUA 2HOEA 3DXMA 3VPZA 1HJOA 3FZLA 1BU6O 3DXKB 4FWNA 2Q36A 2IVPA 1QZ5A 5EVZA 3JS6A 3U9ZA 2HF3A 3WQUA 4BG9A 5AQQA 4E1JA 1YUWA 2AA4A 2QWQA 2A41A 1JCFA 4PL8A 4BRIA 5F2RA 2AP1A 4JHDA 1MWKA 3O4WA 4A2AA 4H0XB 2P9PB 2V52B 5FPNA 4BVPA 3UB5A 4NB4A 5ELZA 2P9PA 3A5NC 4DB3A 5AQRA 1NGIA 2P9LB 5AFUH 2YJFA 3IDHA 3OHRA 5TKYA 4LC9B 3UE5A 1X3MA 4CBWA 1BA0A 3VEVA 2I7NA 4I6MB 5FPMA 5AZJB 1U6ZA 4H03B 1BA1A 4B1ZA 1HKBA 3QFUA 4I6MA 4CZIA 1S22A 3BF1A 3WUHA 3LDPA 4FL9A 5BPLA 1ESVA 3VETA 2A42A 4XH5A 4FOIA 4CD3A 3EKUA 4MLEA 1XUPO 3SJHA 3FLCO 4H5NA 3C0BA 1GLBG 2A40A 4GNIA 4M7YA 5JICA 3LL3A 1MWMA 4CZMA 3ZEUB 3QFPA 4CJ7A 4BREA 4QS7A 3FR0A 3CJ7A 4XH1A 4GY2B 5KPTA 3D2EB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF2A 3LDOA 5E26A 1O13A 1ZVEA 3O6WA 2A1SA 5KI6A 3IFRA 4OPAA 4FWRA 4BE2A 1WAJA 3IKMA 5AQUA 3P5JA 3DRPA 3SAHA 3ZCMA 1UWBA 3S3MA 4MDAA 3KTQA 4IDHA 1TL1A 2NRVA 4CHZA 2CH6A 3BUZB 3ZSYA 1VQ9N 3HSCA 4BRNA 2W6KA 3Q7BA 4B8AB 1WSGA 4CHQA 1BHLA 4EIAA 2ITMA 2HHIA 1RT7A 4DTMA 1TKTA 1ZYWA 4Z4EA 3KOYA 1B92A 1JCEA 5M1PA 3HK2A 1NMDA 3HBTA 3PSIA 1ZFUA 1FW6A 3LZIA 2ASPA 4FJIA 4DQRA 3SQ1A 1TK8A 1W7AA 1CXQA 3MEGA 3VQAA 1QS4A 4BE0A 3K5OA 4WQ5A 1CLQA 1WNSA 3SUPA 1VQKN 4KTQA 4BY9C 3HPGA 4FLTA 1RT5A 3DOLA 4CJSA 4BACA 3AVLA 4YOTA 1DEJA 1LQIA 4KHUA 3RRHA 2ATQA 4DUZK 4JAXA 3DLEA 4LF4K 4CIGA 3IRXA 5EXWA 2DFFA 5HL7L 4B1UB 4YNQA 2VG6A 4LFBK 4YDUA 1V4TA 3I0RA 4CHOA 1ZYVA 4CJPA 1F21A 2DFHA 4O5BA 4E19A 1NJXA 3OYBA 4GVEA 3K5LA 2ZE2A 5HRSA 4BE1A 2OPRA 4X64K 4DR6K 1HYSA 2O8CB 4EP4A 2JWKA 1S3XA 2W6LA 3CCQN 4DQSA 2HNZA 3KWGA 2QXLA 2WBNA 3J7ZO 1RT2A 4B9NA 4JK9A 3LDLA 1KTQA 4FLZA 1KAXA 1C1BA 5JMVA 3QEIA 3O9UA 1IBLK 2BGGA 3BK3C 4AEIA 3KZBA 4CGDA 1YTUA 3VEXA 2AJQA 4CHPA 4FWKA 4GMJB 1WOQA 4IXCA 4ISGA 1LOTB 3WNGA 4E7KA 3D2EA 1ILYA 4CZJA 4DR3K 3TABA 3OYDA 1KV0A 4AHSA 2YHXA 3HJFA 1NRAA 4BE7B 3ULDA 2A5XA 3C6UA 1VSIA 4HTUA 1WSHA 4PA1A 2O4GA 4CI6A 3NH0A 4QAGA 3V9ZA 2ATBA 3RSEA 5AZJA 4Z4IA 3ZT4A 4DSLA 3O5BA 1BIUA 2Z1JA 5EX5A 3LM2A 1IKXA 2BANA 4CZEA 1NOYA 1I6GA 1WSIA 3P83D 3M8SA 5I3UA 4BR4A 3CQXA 3PSMA 4B9UA 3AVMA 5KRTA 1C55A 4V19S 3KLHA 1XNQK 1K8KA 3MAQA 3CCUN 1U04A 3ZSXA 2GTDA 1RT6A 5JVHL 2F96A 2ZJRL 4FVMA 3VESA 4FK4A 4M63C 2P9KA 2HB5A 3NFAA 3SMPA 4BDPA 3ZSRA 4KKOA 2F9TA 2KFZA 3KHYA 5CZ1A 1X9JA 2FSNA 5I9EB 3QDKA 1UA0A 4ISFA 1S1XA 1JLFA 3LDSA 4FJMA 5KK4A 4R5PA 1U4BA 4OO1J 2Q1NA 3TSQA 1Q8IA 4BR0A 1JCGA 3K9KA 2NRXA 4EAHD 1TK0A 4I2PA 3U4LA 1TUYA 5CR4A 4B1WB 3S41A 3OYMA 4B08A 2KGQA 5F0XA 3VQBA 3VQDA 1ZBHA 2CGKA 3UIQA 2QWRA 2YHWA 3LWLA 3AO3A 5GAGP 4CERA 1D9DA 4AILC 2JGUA 4BRCA 3GG4A 3CC2N 1JL2A 3SMSA 3MXMA 1NJIO 1MR4A 3RMCA 5AQNA 3L2UA 4CQKA 3CM5A 4ICLA 4V1DC 1EX4A 2A1RA 3CFPA 5SWMA 3GL1A 4OVLA 1NK7A 1NRBA 3O9RA 4DR2K 3JSMA 1S1VA 1QQCA 3CHWA 1LQQA 4W5OA 5AQMA 2NUBA 4DR7K 3PO4A 4K41A 3AA5X 2A3ZA 2MN5A 4DSFA 2KHOA 3U8XA 2XHBA 3CJ9A 4H0YB 3CPWM 4E7JA 2QA4N 4IO8A 3QICA 4IEEA 4DTPA 1C1AA 2QWPA 4DFMA 5C0YA 1RBVA 2O8CA 2YV0X 5ADXH 4Q5VA 2QXFA 3KHWA 4JKBA 3P38A 3AVNA 1S6QA 1RILA 4DS5A 3R6MA 3R8EA 2Q31A 3O3HA 4LFCK 2FBTA 2IDOA 3SBTA 4RWTA 2G8WA 2YHAA 4JRPA 1K8AO 1P0AA 3NHGA 3THYB 1ZXOA 3EYZA 2GX9A 4KHNA 4CGIA 3I8BA 4LF6K 2IC3A 3B8AX 3QB0A 3TSPA 1TAQA 1GLFO 3PUFA 4W5QA 3NVKA 1S5JA 2D1KA 2P1JA 3SZ2A 3DAWA 4FYDA 2OANA 1QTMA 4DFKA 4IDKA 5J2QA 2YHYA 1SKWA 3ZSOA 5HBMA 4E72A 3UKUB 1VNBA 4YOUA 4BG8A 2HF4A 3KK1A 1IG9A 4FPBA 1QQNA 3N4QA 1TGOA 2E3GA 3MDQA 1VSEA 1NGAA 2WUSA 1VSDA 4EHTA 3GOIA 2RPIA 2B6AA 3HVTA 4ILJA 4K43A 4OLAA 1HPMA 4RTFD 4DV1K 3PX6A 2DY4A 4O55A 1DQ7A 4UADE 3DLRA 1DKGD 4IG0A 2GELA 3TPQA 2GEMA 2P9UB 3LZJA 3SQ4A 1E4GT 3K57A 2YJEA 2OZMA 4HUEA 5C24A 3LPTA 4JN4A 2F9WA 1KVAA 3P39A 2D0PA 3LP3A 3J7AP 1IV0A 4N76A 3L3VA 2KFNA 5BN9A 3LP1A 1I3AA 1WSEA 2W40A 2FSJA 3LPUA 1QQOA 3EZ5A 3SUOA 1CZAN 4LF7K 1Z25A 3THXA 4CVNE 1WMTA 4FOEA 4CIEA 1VQ4N 1RGIA 4BECA 1VSJA 3BEXA 3M1FA 3NCIA 4B1XB 1Q86O 3VQCA 1VSMA 4DSJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CF2 A;  3LDO A;  5E26 A;  1O13 A;  1ZVE A;  3O6W A;  2A1S A;  5KI6 A;  3IFR A;  4OPA A;  4FWR A;  4BE2 A;  1WAJ A;  3IKM A;  5AQU A;  3P5J A;  3DRP A;  3SAH A;  3ZCM A;  1UWB A;  3S3M A;  4MDA A;  3KTQ A;  4IDH A;  1TL1 A;  2NRV A;  4CHZ A;  2CH6 A;  3BUZ B;  3ZSY A;  1VQ9 N;  3HSC A;  4BRN A;  2W6K A;  3Q7B A;  4B8A B;  1WSG A;  4CHQ A;  1BHL A;  4EIA A;  2ITM A;  2HHI A;  1RT7 A;  4DTM A;  1TKT A;  1ZYW A;  4Z4E A;  3KOY A;  1B92 A;  1JCE A;  5M1P A;  3HK2 A;  1NMD A;  3HBT A;  3PSI A;  1ZFU A;  1FW6 A;  3LZI A;  2ASP A;  4FJI A;  4DQR A;  3SQ1 A;  1TK8 A;  1W7A A;  1CXQ A;  3MEG A;  3VQA A;  1QS4 A;  4BE0 A;  3K5O A;  4WQ5 A;  1CLQ A;  1WNS A;  3SUP A;  1VQK N;  4KTQ A;  4BY9 C;  3HPG A;  4FLT A;  1RT5 A;  3DOL A;  4CJS A;  4BAC A;  3AVL A;  4YOT A;  1DEJ A;  1LQI A;  4KHU A;  3RRH A;  2ATQ A;  4DUZ K;  4JAX A;  3DLE A;  4LF4 K;  4CIG A;  3IRX A;  5EXW A;  2DFF A;  5HL7 L;  4B1U B;  4YNQ A;  2VG6 A;  4LFB K;  4YDU A;  1V4T A;  3I0R A;  4CHO A;  1ZYV A;  4CJP A;  1F21 A;  2DFH A;  4O5B A; 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