3FE1A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 6 (hsp70b') atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 6
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fe1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fe1A04
5FPEA 1QQNA 3S41A 2D4WA 5JLHA 3D2EB 4IJAA 1JCFA 1GLBG 3CJ9A 3VGMA 4CBUA 4KBOA 3UKUB 5AQTA 4CZFA 4BRGA 5AQZA 2P9LA 1NGIA 3D2FB 4BC3A 2PAVA 3HBTA 4CZJA 5AQLA 3CIPA 5AFUA 2YJEA 1T6CA 5AQMA 2OANA 2QWMA 3O08A 3QFUA 5E26A 1V4SA 1J6ZA 3GE1A 2D1KA 3ZETA 3KZBA 4QS8A 1WUAA 2P9UB 3H6EA 3EL2A 3HTVA 3WUHA 2E88A 3LDPA 5AFUH 3UKRA 3LDQA 2P9SA 2AA4A 3FZHA 3FFKB 5BPMA 1RDWX 1JCGA 3F9MA 3L0QA 4IJNA 4BR2A 3RSEB 3QFPA 3ZEUB 1GLCG 3CETA 3LDNA 1X3NA 4K25A 3M3ZA 3EN9A 3CI5A 3FR0A 3O1BA 1YVNA 2QM1A 3WXKA 4XH4A 4QS9A 4RTFD 5FPMA 3CJAA 3FZLA 3GOIA 4ISGA 1NGCA 1EQYA 2Q1NA 2FXUA 1HX1A 2P9LB 2FSJA 1DGKN 1OKJA 4FWQA 4MLHA 4PKHA 2ASOA 3HSCA 3WQTA 2CGJA 1GLJO 3ZETB 4BR0A 4PKGA 4MLEA 5AZJA 2E1YA 5AQRA 5EOYA 1XQSC 3ZX3A 4BRQA 3DJCA 3EKSA 4AM7A 5BPLA 3UKRB 2W41A 3GBTA 4H0YB 4A62A 4Y0WA 5JLFA 1NGDA 2I7NA 2P9SB 1U6ZA 5BPNA 4FPAA 3EZWA 4BC4A 1KAZA 4ISEA 1MDUB 5JICA 1HUXA 5AQPA 4PKIA 1BOTO 5BRFA 1IG8A 2D0OA 2PBDA 3M6GA 4WQ5A 3IDHA 3VEWA 1BA0A 1LCUA 3VOVA 1X9JA 4CI6A 1QHAA 5EX5A 4F9OA 3GL1A 2WUSA 3P4IA 3QDKA 5EXWA 3VEXA 3AY9A 4CZGA 4RWTA 4MO4A 5AQHA 1NGEA 4JHDA 3O1WA 1X3MA 1P8ZA 4H5WA 1ZXOA 4BQLA 3CJBA 3VETA 4BRDA 2NLXA 3C0BA 3ID8A 4IO8A 4BRMA 4DB3A 4XH1A 5BN9A 1WOQA 1BA1A 3EO3A 2IVNA 3ENHA 4BG8A 1NGBA 1T44A 1BUPA 5AQKA 4L3QA 3UB5A 2QWPA 3KVGA 3DXMA 3BUZB 4GY2B 4O8KA 5AZJB 1NGJA 4B1ZA 4B1YB 1KXPA 1T6DA 4K42A 4BG9A 4BR5A 4BVOA 2QWOA 2Q31A 1GLDG 4CD3A 1QQOA 1ATSA 4EAHD 3QB0A 2GTDA 3FZMA 4A2AA 5BREA 2VYPA 1YAGA 4H0XB 2BTFA 5AR0A 3G25A 1NBWA 1TUUA 3H46O 3LL3A 1Q18A 1HPMA 4H5TA 5LY3A 1BDGA 1NM1A 3ATUA 3LM2A 2E2PA 2ZF5O 2YCHA 3MCPA 4JD2A 2IVOA 1HKCA 3ENOA 3QMLA 1K8KA 5F2RA 5ADXA 1MA9B 3GG4A 4EIAA 4FWMA 4BVPA 1GLAG 5AQFA 4BRFA 3LM9A 2GEMA 4CZEA 1C0GA 3J8AA 2FLOA 4JHDB 1HKBA 2IVPA 3U8XA 2P9IA 5ADXH 3GDQA 3A5MC 4CZKA 2HF4A 3EKUA 4BR7A 4M63C 2BUPA 4M7XA 3BP8A 1S3XA 4YDUC 3JXUA 1RFQA 3IFRA 5FPDA 5LJWA 2QWNA 1IJJA 4H0VB 3DXMB 1QQMA 1TYQA 3QBXA 5AQUA 3FZKA 1D4XA 3WT0A 5AQYA 4BRPA 1GLFO 2QWRA 2E1ZA 1DEJA 2CH5A 1ZC6A 3FLCO 3MK6A 1SAZA 4C23A 3SMPA 5AQSA 1NLVA 1NGHA 2V7YA 5TKYA 3TU5A 4BGAA 4H03B 4JD2B 3CHWA 1K8KB 3WXJA 2ZGZA 1HJOA 3BF3A 3WEEA 3CERA 5AQJA 2E2OA 2Q0RA 3JS6A 2Q2RA 3H3OB 2AP1A 3CJ7A 2ASPA 3A0IX 2P9IB 5KPRA 4CZHA 4ISFA 5AQGA 2H3GX 3A5OC 3SMSA 1MWMA 3HI0A 4IXCA 3WQUA 1ZBSA 3U9ZA 1QZ5A 2F9TA 3W0LA 2A42A 1TYQB 2GWKA 4O5FA 4E1JA 4FWLA 4HWIA 1MWKA 2W40A 5F1XA 3VESA 3HZ6A 3HM8A 4A2BA 3FZFA 3KHYA 2FF6A 3CQYA 5EVZA 2E2NA 2Q36A 1KAXA 3MMVA 4FPBA 3VGKA 4WQ4C 4BREA 5BRDA 4NO7A 3L4IA 1SZ2A 3I8BA 1NGGA 3BEXA 3O8MA 2CH6A 4H0TB 3WEEB 4JN4A 3CJCA 2YJFA 5AQVA 1HLUA 3AAQA 2YI1A 2KHOA 4JAXA 1YXQA 4NB4A 2ZWHA 4DHYA 4FOEA 4IWVA 1G99A 2D0PA 5AZIA 4GNIA 4BQZA 2I7PA 4BRAA 3D2EA 1NWKA 3H1VX 4DCHA 5KPZA 4BRIA 5B8HA 2DPNA 2UYTA 3AARA 2ITMA 3L6QA 5AQOA 4FWOA 4EHUA 5BN8A 2FSKA 1NGAA 4IZ9A 4CJ7A 2A41A 4BR4A 3VF4A 3R6MA 2E8AA 5KQDA 5AQWA 4FO0A 1NGFA 5AQNA 2YHYA 1Z6RA 3I33A 4BGBA 4WYBA 3D7EO 3VENA 3QICA 1ESVA 4FOIA 3DXKA 3UE5A 3QBWA 2P9NA 2EWSA 4HTLA 2NZTA 3SJHA 3TPQA 4H0PA 3FE1A 5AZIB 4BR9A 3R9PA 5KQ8A 4YDUA 4CZIA 3LDLA 2A5XA 1KAYA 4FWPA 2ASMA 3H3NO 5JMVA 3FGUA 1LOTB 1ATNA 1DKGD 2E20A 3U4LA 4EHTA 3CJ1A 1S22A 4J8FA 2QWQA 4RCHA 1GLLO 4CZLA 4K41A 2ZGYA 4CBXA 1GLEG 4BRLA 2A40A 5E84A 4B1XB 3MN6A 4BRKA 2YHWA 4FL9A 3BF1A 4H0OA 4BC2A 3A5LC 3U9DA 3WXIA 2QWLA 4B1WB 4AM6A 4FWRA 5AQXA 2V52B 3MN9A 4DQ8A 2HOEA 1Z05A 2HF3A 5I9EB 3A5NC 4EFHA 1BWFO 3B8AX 3DAWA 3OHRA 4QS7A 4XEIA 5EY4A 3DXKB 2P9NB 1R59O 3SK3A 3VEVA 3CQXA 2A3ZA 3IUCA 3VF2A 4CZMA 4B9QA 1XC3A 1RGIA 3MN5A 4M7YA 3AAPA 2GELA 3ZX0A 1V4TA 2Q97A 3SLCA 4XH5A 5FPNA 2F9WA 5CE3A 3ZX2A 4JNEA 3O5BA 1H1VA 1XUPO 5AQQA 1NMDA 4WQ4A 3O80A 1SQKA 5ELZA 1BO5O 3IMXA 1TUYA 1ATRA 3VEOA 2YHXA 3ATVA 4I6MA 1E4GT 2VCPA 2V7ZA 4LC9B 4BRHA 3VF6A 3A8YA 2P9KA 2FSNA 3C7NA 4H5VA 1E4FT 3WXLA 4PL8A 1BG3A 4BRNA 3H45C 3W3DA 4WQ5C 1QZ6A 2V51B 4CD1A 3ULEA 5F0XA 2IIRA 2P9PA 1U2VA 5AQIA 4MO5A 4FWSA 2VWBA 1JCEA 3DWLA 3UKUA 1C0FA 2GWJA 3D2FA 3MN7A 4H5RA 3MDQA 4B1VA 4H5NA 3O4WA 1Y64A 2E2QA 3M1FA 4K43A 4PL7A 3VEZA 2QXLA 3VERA 2NRHA 3R8EA 2GUPA 2CGLA 2P9UA 3VEYA 4CBWA 4BROA 3O6WA 2QW9A 3LDOA 5KPTA 4BC5A 4A61A 2J4RA 2Q0UA 5BRHA 2HMPA 3H1QA 1CZAN 4Z94A 4BRCA 5LJVA 4I6MB 2FF3B 4FSVA 4FWKA 3RSEA 4B1UB 2P9KB 3ZEUA 3C7NB 1BU6O 4FWNA 5BR9A 2CGKA 1YUWA 3VGLA 2A6AA 3ULEB 3VPZA 2P9PB 1U2VB 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FPEA 1QQNA 5C42A 4UY8O 1BQNA 3P5JA 3K2PA 4JV5K 4M3WA 3D2EB 1N5YA 4NCBA 1GLBG 3CJ9A 4KBOA 2P1JA 1S1WA 5AQZA 3IG1A 2YX6A 4BC3A 2PAVA 3HBTA 2RE2A 3CIPA 4KH4A 5AFUA 4WCEL 1S1TA 2QWMA 3QFUA 4ZHRA 1J6ZA 3ZT0A 1OVQA 1SKRA 2P9UB 3VTIA 1BI4A 3HTVA 3NH2A 1JLCA 3UKRA 1Q9XA 4FJ5A 3RR8A 5HROA 1NKCA 3RSEB 3QFPA 3KOXA 3F5TA 3ZEUB 2O8EA 3NMUA 2OTJN 4W5RA 4DR4K 3LDNA 4CGIA 3O9RA 3OTOK 4H4OA 3L3UA 3VQ7A 4LF6K 2O8CA 3EN9A 3CI5A 1DTQA 4JKEA 1N6QA 2QM1A 2JLEA 3NF6A 4E7KA 4W5QA 4QS9A 1RT5A 5FPMA 3V4IA 4IOCL 4YOVA 3QEXA 4PA1A 3R2VA 2ATQA 1D9FA 4ISGA 2I61A 1NGCA 5IWAK 4YY3K 2FXUA 1HX1A 2XY7A 2FSJA 4CEFA 4A59A 2YC1C 1W7AA 1IBLK 4PKHA 2C1GA 3I55N 4BR0A 3ZETB 4OPHA 3K58A 3P83D 1NNEA 1TKZA 1W9HA 3AVMA 5AZJA 5AQRA 1XQSC 3DJCA 5BPLA 2KLAA 2W41A 4A62A 2P9SB 1UA0A 4KHUA 4LFBK 4Q0BA 4BC4A 3AO5A 4YOWA 5JICA 4M3YA 1RT6A 3CCEN 1HUXA 4PKIA 2D5RA 1BOTO 3HP9A 1IG8A 5BRFA 4DTRA 2PBDA 4DTUA 4JLHA 3TTDA 2ZJPL 3L3VA 3T19A 1R0AA 3T3FA 2WUSA 3P4IA 3QDKA 5EXWA 4IEEA 3S5TA 1EWRA 1RTHA 2HB5A 2A1RA 4FZXC 3KLFA 3SQ4A 4MO4A 4YOUA 3O9TA 4JHDA 4CHPA 1HNVA 1X3MA 1P8ZA 3EE8A 3CJBA 3C0BA 4OPKA 1SL2A 4BRMA 2G8VA 2GX9A 3CFOA 1U4BA 3EO3A 4CJFA 2PY5A 3TAMA 3ENHA 4BG8A 3AVFA 1NGBA 4CJRA 3UB5A 3SBTA 3ZSXA 1ASWA 1GOBA 3BUZB 3AA5X 4K42A 4BG9A 2X74A 2Q31A 3LPUA 1GLDG 3NF7A 4AHVA 1ATSA 4CHYA 3QB0A 5BREA 2VWJA 2Q3SA 3TAPA 4H0XB 5AR0A 4DQSA 4H5TA 2G8FA 4WFAL 3RMAA 1NM1A 1TKTA 2YCHA 2IVOA 1VQON 4OKJA 1SN4A 2YV0X 2HHXA 3GG4A 4FWMA 3AVAA 1GLAG 4LSLA 3LM9A 1NKBA 1C0GA 2YNFA 2P5GA 4CGJA 4GKJK 1ZFUA 2E6MA 1HKBA 2IVPA 3P1GA 4E3SA 5ADXH 4FLVA 3GDQA 3QINA 3EKUA 3KOYA 4NCGA 5J2MA 4M7XA 1NOYA 2O8FA 4PQUA 2DFEA 4BWJA 3DXMB 1BCGA 2HNYA 5JVGL 3OYMA 3OYEA 5CZ1A 2BGGA 3OYHA 4DR2K 1KTQA 3FLCO 4CJTA 1TL3A 4NYNA 3SMPA 2V7YA 4H03B 4X62K 3CHWA 1I3AA 2FBVA 1K8KB 3WXJA 2UXBK 4DV4K 3M8RA 2ZGZA 4IOAL 2VGMA 3CERA 5AQJA 3O3GA 3JS6A 2D0AA 4MDBA 2AP1A 5C0YA 3TTCA 1N4NA 4XIUA 2GV9A 3L8BA 4FLZA 3SMSA 3L2RA 4F3TA 5M1KA 1WSFA 2WOMA 2FBTA 1IKVA 3AGKA 4E7JA 4JI5K 3PX4A 3C6UA 4CE9A 3TAFA 1LQQA 1YJNN 2NUBA 2NY8X 5F1XA 3VESA 4IFVA 1I39A 3FZFA 3OYGA 3PSIA 3KHYA 4FPBA 2E2NA 1KAXA 4OVLA 4Q5VA 4BREA 1RDAA 4AILC 1ZYWA 1FJGK 1XWLA 2KBJA 3NAEA 3WEEB 3TTFA 5AQVA 1HLUA 3AAQA 2YI1A 2NRXA 4QCLA 4MFBA 4E1MA 1POIA 3CPWM 2D0PA 4GNIA 1AHOA 1RTJA 2KYQA 4BRAA 4HHFA 1XNRK 2LI7A 4BRIA 1TAQA 3AARA 3AGRA 5K14A 3QI7A 4PHTX 4CJVA 5BN8A 5KRTA 4B9NA 1C56A 2A41A 4BR4A 3OYAA 4E7HA 3AVIA 3NF8A 5AQWA 1NGFA 4AEIA 1IO2A 5FRMA 2YHYA 4CJSA 4FJ9A 4CK2A 2LR3A 5KGXA 3QICA 1TK0A 2NRTA 1FKOA 2ITGA 3K9KA 2P9NA 2WBNA 3RMCA 4HTLA 3T1HK 3NF9A 5KQ8A 4DSIA 4FWPA 1LW0A 3H3NO 5E41A 4M3RA 4KTQA 4KH5A 4DV0K 1P00A 2YHAA 2QWQA 3MEGA 1B92A 3VA0A 1QS4A 2VG7A 2ZGYA 4NCAA 1GLEG 1KQSM 2GMOA 2A40A 1I2VA 1JLQA 3MN6A 1WSGA 1TAUA 4FL9A 4H0OA 1BQMA 2YIOA 3U9DA 3WXIA 1TGOA 3AO4A 2QWLA 3F2KA 4HUGA 4FLXA 4AM6A 4NLCA 5AQXA 4B08A 2V52B 5HRSA 3MN9A 5DM6L 2YIPA 1BCOA 3T69A 2F96A 3PSMA 1X1PA 2OPRA 4FXDA 4JI3K 4E0DA 2WC9A 1N33K 4DS5A 3KWIA 3O4NA 3PV8A 1MR4A 1KRPA 4JKAA 5HRRA 4B9QA 1HRHA 1RGIA 4M7YA 4Z4EA 2LY6A 1ASVA 5FPNA 3LANA 5CE3A 3SF4D 3V9SA 1OH5A 3LPTA 4JNEA 1VQMN 3DLLL 4YNQA 2QKBA 4WQ4A 4DS4A 1SQKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5FPE A;  1QQN A;  5C42 A;  4UY8 O;  1BQN A;  3P5J A;  3K2P A;  4JV5 K;  4M3W A;  3D2E B;  1N5Y A;  4NCB A;  1GLB G;  3CJ9 A;  4KBO A;  2P1J A;  1S1W A;  5AQZ A;  3IG1 A;  2YX6 A;  4BC3 A;  2PAV A;  3HBT A;  2RE2 A;  3CIP A;  4KH4 A;  5AFU A;  4WCE L;  1S1T A;  2QWM A;  3QFU A;  4ZHR A;  1J6Z A;  3ZT0 A;  1OVQ A;  1SKR A;  2P9U B;  3VTI A;  1BI4 A;  3HTV A;  3NH2 A;  1JLC A;  3UKR A;  1Q9X A;  4FJ5 A;  3RR8 A;  5HRO A;  1NKC A;  3RSE B;  3QFP A;  3KOX A;  3F5T A;  3ZEU B;  2O8E A;  3NMU A;  2OTJ N;  4W5R A;  4DR4 K;  3LDN A;  4CGI A;  3O9R A;  3OTO K;  4H4O A;  3L3U A;  3VQ7 A;  4LF6 K;  2O8C A;  3EN9 A;  3CI5 A;  1DTQ A;  4JKE A;  1N6Q A;  2QM1 A;  2JLE A;  3NF6 A;  4E7K A;  4W5Q A;  4QS9 A;  1RT5 A;  5FPM A;  3V4I A;  4IOC L;  4YOV A;  3QEX A;  4PA1 A;  3R2V A;  2ATQ A;  1D9F A;  4ISG A;  2I61 A;  1NGC A;  5IWA K;  4YY3 K;  2FXU A;  1HX1 A;  2XY7 A;  2FSJ A;  4CEF A;  4A59 A;  2YC1 C;  1W7A A;  1IBL K;  4PKH A;  2C1G A;  3I55 N;  4BR0 A;  3ZET B;  4OPH A;  3K58 A;  3P83 D;  1NNE A;  1TKZ A; 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