3FE1A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 6 (hsp70b') atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 6
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fe1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fe1A04
2YHWA 5AQLA 3O5BA 4AM6A 3H1QA 5BPNA 5BR9A 4BGBA 3J8AA 4BC3A 5AQVA 2I7NA 4H0YB 3CHWA 3MK6A 3UKUA 2I7PA 3P4IA 1BDGA 4RCHA 3ENOA 4DB3A 4M63C 3HTVA 2D0OA 3UE5A 1T6CA 5AQKA 1TUUA 5AQGA 5JLHA 3VGLA 4BRHA 4H5WA 5BREA 2HF3A 4B1WB 2A42A 3FFKB 2FXUA 3HBTA 3SMPA 4QS9A 4WYBA 3QDKA 4K42A 5KQ8A 4CZHA 4B1XB 1U2VB 4EAHD 1GLAG 1ATRA 4AM7A 3HI0A 3A8YA 3IDHA 2ZF5O 5AFUA 2QXLA 3A5NC 3KVGA 3VERA 5FPEA 4MO4A 3AAPA 2P9KA 3FZHA 3QBWA 4I6MA 3TU5A 2VCPA 4GNIA 3GE1A 4M7XA 2V7ZA 1Q18A 3I33A 5BPLA 4BRLA 3RSEB 3CQXA 5AQYA 1QQOA 3DJCA 1XC3A 4BVPA 5BN8A 3S41A 5KPTA 5ADXA 1X3MA 3DWLA 3WXLA 1XQSC 1KAYA 2P9UB 3ULEB 2HMPA 2ZGZA 2FSNA 4O5FA 1HLUA 3M1FA 3UB5A 3JXUA 3B8AX 3WXKA 3G25A 3VESA 4CBUA 5BRHA 1U6ZA 1TYQB 1MDUB 2A5XA 3ATUA 1BG3A 2A40A 1ZXOA 5BN9A 4A62A 2QWRA 3DXMB 4H03B 2ZGYA 4CD1A 1MWKA 3U9DA 5EXWA 2YJEA 2GWKA 3R6MA 2E2OA 3JS6A 4RWTA 1BU6O 2YI1A 4CZIA 5B8HA 2ASPA 2BTFA 5AZIB 4EHTA 4B1VA 1NGDA 1X9JA 1QZ5A 3O4WA 1GLFO 4BR4A 4BRDA 3ATVA 1HX1A 4B9QA 2QWNA 3D2FA 4DHYA 3O8MA 4RTFD 1GLCG 3HSCA 4K25A 3QMLA 3EKUA 3FZKA 2P9SB 2ASOA 4BVOA 1NGEA 3LDQA 5EY4A 3D7EO 4WQ4C 2E2QA 2PBDA 3CJCA 1HKBA 1NLVA 2E2PA 5TKYA 3LDNA 2E1YA 3VETA 5EX5A 1NGIA 4H0OA 2NZTA 3VGMA 3FZMA 1DKGD 3SJHA 4H5VA 4YDUA 3SLCA 4MLHA 4H0TB 4ISGA 1Z05A 3AY9A 4IXCA 4QS8A 4FWLA 4WQ5A 4PKGA 1NM1A 1YXQA 5EOYA 3VPZA 1C0GA 1Y64A 4BR0A 1D4XA 4FOIA 2P9IB 1R59O 3BEXA 3CETA 3VF4A 4CBWA 1LOTB 1G99A 4QS7A 4DQ8A 2V7YA 4JD2A 5AQNA 3MN5A 4WQ5C 3AARA 3WXIA 1NGFA 3EO3A 5AQQA 5AFUH 1RFQA 4IWVA 3LDPA 4A2AA 3EN9A 3VEWA 5AQZA 4JD2B 1SQKA 4PL8A 4XH4A 4FPAA 5AZJA 4H0XB 3IFRA 3GL1A 2IVPA 3DAWA 1NWKA 3U4LA 1ZC6A 4BR5A 1IJJA 3VEXA 1XUPO 1MWMA 2D0PA 3VEVA 5FPNA 4CZFA 4WQ4A 2ITMA 5AQJA 4Z94A 3GOIA 3O80A 2QWQA 3HM8A 3O1WA 4B1YB 5AZJB 1JCGA 2ZWHA 5BRFA 5FPMA 4BGAA 3KZBA 5AZIA 3CJBA 5CE3A 3SK3A 4B1ZA 3L4IA 4CJ7A 3M6GA 4PKIA 5LJVA 3H1VX 4FWMA 1E4GT 3WQUA 2A6AA 4BC2A 4YDUC 4BQZA 1TYQA 3C7NB 3MMVA 2CH5A 4JN4A 2CGJA 4FL9A 2W40A 3QFPA 4FWSA 4XH1A 3BUZB 5AQFA 4IO8A 5AQWA 1BO5O 2Q36A 3QFUA 3ULEA 4EFHA 2P9UA 3R9PA 1YUWA 5AQRA 2VYPA 1YAGA 1V4SA 2NLXA 5KPZA 3WXJA 3D2FB 1HKGA 2P9LB 2BUPA 1SAZA 2IVNA 4CZLA 3GG4A 1TUYA 2Q31A 3VF6A 4CBXA 4BRAA 2CGLA 1J6ZA 3QBXA 3DXMA 1YVNA 3FR0A 4IJNA 1QHAA 3O08A 5AQUA 3A0IX 4FWOA 3MN7A 5ELZA 4H0PA 3OHRA 4BRQA 2F9WA 3O1BA 2DPNA 3H46O 3VGKA 5AQIA 1MA9B 4J8FA 4CD3A 3FZFA 1P8ZA 4LC9B 3CI5A 3UKRA 2GELA 1KAZA 1C0FA 2VWBA 1BUPA 5BRDA 3EKSA 2F9TA 1ATNA 2CH6A 1HPMA 3GBTA 3UKUB 3FGUA 2YJFA 2IVOA 5AQXA 2P9KB 1NMDA 4ISEA 1EQYA 4BG8A 4ISFA 5FPDA 2P9PA 5AQSA 4A61A 1JCFA 4XH5A 4HTLA 4BRFA 3CJAA 3DXKB 1HJOA 4I6MB 2CGKA 3QB0A 2Q0UA 4GY2B 1OKJA 2GWJA 2P9NB 2FLOA 2P9IA 4JHDB 1BA0A 1NBWA 4PL7A 2H3GX 3ZEUB 1U2VA 1ZBSA 3H45C 3R8EA 4CZGA 1IG8A 1WUAA 5AQOA 4BRNA 3M3ZA 3MCPA 4FOEA 3VF2A 1QQNA 4FWQA 2E88A 2Q2RA 3LDLA 2YHXA 3IUCA 3ENHA 3WT0A 4CI6A 1BWFO 3F9MA 3WQTA 1T44A 2YHYA 4DCHA 2E8AA 3ZX2A 2FSKA 4B1UB 1V4TA 1S3XA 4BC5A 3VEOA 4E1JA 5AQTA 5F0XA 2QWPA 4FSVA 3O6WA 1BA1A 3ZETA 4BR9A 3HZ6A 3L6QA 5JLFA 3I8BA 4BRMA 4BREA 3GDQA 2NRHA 2P9SA 1RGIA 1BOTO 1GLEG 2FF3B 1S22A 2IIRA 5LJWA 5E84A 1CZAN 3CJ1A 3CJ7A 2ASMA 3L0QA 2E1ZA 3EZWA 3RSEA 3H3NO 3VEYA 1RDWX 3A5MC 3MDQA 4M7YA 3BP8A 2GTDA 1SZ2A 3H3OB 4K41A 3W0LA 4BG9A 1QZ6A 3CIPA 1NGJA 3TPQA 5AQPA 4BRIA 4H5TA 3LM2A 1DEJA 1H1VA 1JCEA 4FO0A 4MLEA 3A5LC 3FZLA 2FF6A 5E26A 4H5NA 2V52B 2QW9A 3KHYA 2HOEA 3CJ9A 4HWIA 1K8KA 3AAQA 4XEIA 3WEEB 5LY3A 4H0VB 5F1XA 4FWRA 4CZKA 4H5RA 1Z6RA 4L3QA 2WUSA 4JNEA 1NGBA 2Q0RA 4FWNA 2HF4A 2GEMA 3QICA 4BC4A 2W41A 5AQHA 3WUHA 1GLLO 2QWLA 5BPMA 4FWPA 4CZEA 5ADXH 2FSJA 4EHUA 3LM9A 3D2EA 3H6EA 1NGAA 4BRGA 2Q97A 3ID8A 4NO7A 1GLDG 4FWKA 3EL2A 3ZEUA 5JMVA 4O8KA 2E20A 1HUXA 4BQLA 4Y0WA 3CQYA 2AA4A 3D2EB 3ZX3A 4EIAA 4F9OA 3FLCO 3ZETB 2E2NA 2QM1A 3DXKA 3LL3A 2P9PB 2UYTA 2QWMA 3LDOA 2OANA 3A5OC 3MN9A 4NB4A 3U9ZA 4FPBA 5KQDA 3CERA 3U8XA 2Q1NA 2KHOA 3W3DA 1GLBG 2D4WA 1KAXA 2EWSA 2GUPA 3VEZA 3BF3A 5AR0A 3WEEA 4IZ9A 3BF1A 2J4RA 2YCHA 4A2BA 5JICA 1WOQA 5F2RA 4BR7A 1K8KB 3C0BA 1T6DA 1NGHA 4JHDA 1E4FT 1NGGA 3FE1A 3ZX0A 4CZJA 4MO5A 4BR2A 3VOVA 2QWOA 5AQMA 4JAXA 4BRKA 5I9EB 2PAVA 1ATSA 2A3ZA 2A41A 3MN6A 2P9LA 3IMXA 4BRPA 5KPRA 4CZMA 1QQMA 3VENA 3SMSA 4C23A 4PKHA 1HKCA 1X3NA 1GLJO 2V51B 1ESVA 4KBOA 1LCUA 2AP1A 1NGCA 3UKRB 4BRCA 3C7NA 2D1KA 2P9NA 1KXPA 4BROA 5EVZA 1DGKN 4K43A 4IJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HOOA 4AM6A 3MX5A 3NHGA 2VWKA 3CCQN 1YJ9N 3E9LA 4B9LA 4IFVA 5BR9A 3TAMA 5AQVA 4GV3A 3TAGA 3LP1A 3UKUA 2ZM6K 2XHBA 3HVTA 4JV5K 5JVHL 1BDGA 1YITN 1WWNA 4DTXA 2YNGA 2D0OA 1U45A 1T6CA 1EKEA 3AVLA 3HVRA 2HNZA 4NCBA 5JLHA 1VRTA 5BREA 3ITHA 1UOCA 3FFKB 3NGIA 4DR5K 1K8AO 4LF7K 4KH5A 2RPIA 3H08A 3J80O 3ZT3A 4CZHA 1JKZA 1GLAG 3HI0A 1C0MA 3D45A 3QERA 5AFUA 3A5NC 1IG9A 4MO4A 3AAPA 2P9KA 3RWUA 3TU5A 2VCPA 3B6OA 3VQ5A 3GE1A 4M7XA 4KB0A 2OZSA 4N76A 3CQXA 5AQYA 2ZJRL 3S41A 4C8OA 3CFPA 4JKEA 1E3MA 5DM6L 1DLOA 2ZGZA 4KYPA 1HLUA 3M1FA 3B8AX 3G25A 3G71N 5HROA 1U6ZA 3HYFA 1TYQB 3MWPA 4A62A 2QWRA 4WFAL 4DV2K 4H03B 4DTNA 3KD1E 3KJVA 3AVJA 3U9DA 5EXWA 4M41A 2KFNA 3R6MA 2E2OA 3JS6A 3HOTA 1P0AA 1N32K 4CZIA 3AA4A 3M8SA 1VSDA 1ZBHA 1X1PA 1HQEA 2BTFA 2EHGA 4FJHA 1JXCA 3SV4A 2O4IA 1FXXA 1X9JA 3VTHA 4BR4A 3O9QA 4DQRA 5GIOA 4RTFD 3UIQA 1S6PA 4FJMA 4FK2A 3PSFA 4OVLA 4DSKA 1EWQA 1L3TA 3QMLA 1NKBA 2ZQBA 2XY5A 4DV6K 3O4QA 1POIA 2ASOA 1TI5A 1VRUA 1HRHA 2PBDA 4DTRA 1HKBA 3NF9A 1NLVA 1XHZA 4E7LA 1QSYA 3VQCA 2HNDA 2E2PA 2E1YA 2HHHK 3TTCA 4O55A 4AQYK 3VQAA 4B9NA 3L8BA 1C56A 1NOZA 4H5VA 4PHTX 4CQKA 1Z05A 3VA0A 3OS2A 1ASVA 1YXQA 1C0GA 3LWLA 4Y1CA 2KLAA 3CETA 1N33K 2F7TA 4DQ8A 2V7YA 1YIJN 3LAMA 3P38A 4I7FA 1UA0A 3TAFA 3C6AA 3LDPA 4WCEL 3VEWA 2E6LA 3PUFA 3CC7N 1RBUA 5J1EA 2YV0X 4CFDA 5C10A 1J54A 1ZC6A 3QETA 2C1GA 4AB0A 3QI7A 1MWMA 3KHWA 2ITMA 4J2AA 5AQJA 3GOIA 4OJRA 3HM8A 4LFCK 1JCGA 1L3VA 4KPYA 4DV7K 4WFBL 3CJBA 1ZYQA 3SK3A 2HBKA 4JKHA 1X9SA 3KLEA 1RNHA 3OBYA 3DRRA 4YDUC 3LP2A 3THXB 1JKHA 4JI4K 4DUYK 3MMVA 2CH5A 1RTHA 2IS3A 4KHPK 4FLXA 2W40A 3QFPA 1BO5O 4ELVA 5GAGP 1VAZA 1WSJA 1SKRA 4UQGA 5AQRA 4H4OA 3O9SA 1ZVEA 2VYPA 4HCCA 2NLXA 3ISNC 3WXJA 3WNEA 3QEXA 4FJGA 4DFKA 4Q5VA 4CZLA 1TKXA 3GG4A 2RE2A 4OLAA 3OYDA 4DTSA 2P5GA 4CJFA 3VF6A 3VMFB 4DTUA 4CBXA 4BRAA 4QOZB 1WN7A 3MXMA 3DLGA 5AQUA 1GPSA 4K8ZA 4BY9C 3PIPL 3OYHA 1GOBA 1S1WA 3VGKA 1Y97A 1IBKK 4CF8A 3L2RA 5AQIA 4KRFA 2LJ7A 3M8QA 3PO5A 1J5OA 2PYLA 4LH4A 1KSPA 4JKCA 3V81A 1W2BM 4M3XA 3AA5X 2Z1IA 1HPMA 3GBTA 3UKUB 3RMDA 3MWTA 5C2FA 2P9KB 1TK8A 4OGCA 1O13A 1JCFA 4DFJA 3CJAA 4DS4A 2WBNA 1KVCA 3IG1A 1HJOA 3QB0A 5C25A 5HRPA 3TSUA 1NK8A 2P9NB 4CJLA 2OTLN 2E5LK 3KWGA 3ID6A 2H3GX 3H45C 1PTXA 1IG8A 2IDOA 4BE1A 2JLEA 2E88A 2Q2RA 2YKNA 1I6GA 2YNFA 3IUCA 2NRWA 1J53A 3F9MA 3WQTA 4BE7B 1L3UA 4CHOA 2NRVA 3C95A 4CEZA 4ID5A 3T69A 5AQTA 5F0XA 4DV3K 4LD0A 2D0CA 4DFMA 1BA1A 3LZIA 3KK7A 4ZHRA 4CJ4A 3VQPA 4BR9A 3QESA 4DV0K 4UY8O 3OYJA 4KHNA 2I5JA 2FF3B 4CJPA 1YTAA 3F9KA 3WXMB 3L0QA 4HTUA 2E1ZA 3MEDA 1LAWA 1RDWX 4H4MA 3QINA 3PX6A 3F2KA 3MDQA 3BP8A 2GTDA 1SZ2A 1SL1A 4K41A 1IBLK 3A2FA 1QZ6A 1PE4A 3CIPA 4YFUA 3AVAA 4BRIA 1KLMA 2WFBA 5CR4A 4FO0A 1YJWN 4FJLA 4GV6A 1BCMA 3V4IA 3FZLA 3EE9A 2FF6A 3SNNA 4H5NA 2V52B 2QW9A 3KHYA 4HWIA 3K9KA 4H0VB 4DTOA 1VQ5N 4DWIA 1PX9A 3P83D 3RTVA 2HVIA 1LQIA 2N66A 2A7TA 5CHIA 4JI2K 4DR2K 2HHWA 2WUSA 4JNEA 1A5XA 2O8CA 2Y1IA 2HF4A 2GEMA 3QICA 3D0PA 4KHYA 2HHTA 1IBMK 1XHXA 4QAGA 3JAMO 2OYQA 3EYZA 2QEXN 4FWPA 4IEIA 3HXMA 1R0AA 2PZSA 1VQ7N 3PO4A 1F21A 4BRGA 4E7HA 1EX4A 1GLDG 1ZVGA 4OX9K 2WC9A 5JMVA 2VQFK 4LFBK 4NXMK 4JI8K 4AH9A 2G8IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5HOO A;  4AM6 A;  3MX5 A;  3NHG A;  2VWK A;  3CCQ N;  1YJ9 N;  3E9L A;  4B9L A;  4IFV A;  5BR9 A;  3TAM A;  5AQV A;  4GV3 A;  3TAG A;  3LP1 A;  3UKU A;  2ZM6 K;  2XHB A;  3HVT A;  4JV5 K;  5JVH L;  1BDG A;  1YIT N;  1WWN A;  4DTX A;  2YNG A;  2D0O A;  1U45 A;  1T6C A;  1EKE A;  3AVL A;  3HVR A;  2HNZ A;  4NCB A;  5JLH A;  1VRT A;  5BRE A;  3ITH A;  1UOC A;  3FFK B;  3NGI A;  4DR5 K;  1K8A O;  4LF7 K;  4KH5 A;  2RPI A;  3H08 A;  3J80 O;  3ZT3 A;  4CZH A;  1JKZ A;  1GLA G;  3HI0 A;  1C0M A;  3D45 A;  3QER A;  5AFU A;  3A5N C;  1IG9 A;  4MO4 A;  3AAP A;  2P9K A;  3RWU A;  3TU5 A;  2VCP A;  3B6O A;  3VQ5 A;  3GE1 A;  4M7X A;  4KB0 A;  2OZS A;  4N76 A;  3CQX A;  5AQY A;  2ZJR L;  3S41 A;  4C8O A;  3CFP A;  4JKE A;  1E3M A;  5DM6 L;  1DLO A;  2ZGZ A;  4KYP A;  1HLU A;  3M1F A;  3B8A X;  3G25 A;  3G71 N;  5HRO A;  1U6Z A;  3HYF A;  1TYQ B;  3MWP A;  4A62 A;  2QWR A;  4WFA L;  4DV2 K;  4H03 B;  4DTN A;  3KD1 E;  3KJV A;  3AVJ A;  3U9D A;  5EXW A;  4M41 A;  2KFN A;  3R6M A;  2E2O A;  3JS6 A;  3HOT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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