3HM8A

Crystal structure of the c-terminal hexokinase domain of human hk3
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
SRRLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLALDLGGTNFRVLLVRVTTGVQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAVELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCVVTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-3
publication title Crystal structure of the C-terminal Hexokinase domain of human HK3
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 157
structure length 441
sequence length 441
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2009-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hm8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3hm8A01
3CJCA 2KHOA 3GDQA 3CJ9A 3WQUA 3QB0A 1SAZA 4FPBA 5F0XA 3SLCA 1NGAA 3ZEUA 4B1XB 2D4WA 4FPAA 5I9EB 2I7NA 3CQYA 1JCEA 2GUPA 4QS9A 3ZX3A 3WXJA 3CJ1A 4H0TB 5BRDA 3D2FA 3ZETA 3ZEUB 3O8MA 1E4FT 1GLJO 3WXLA 5AQSA 1KXPA 3DXKA 3VF2A 3IDHA 4IO8A 2YHWA 1NBWA 3JS6A 4MO4A 5AQYA 4BRHA 2E1ZA 3H6EA 3D2FB 5EVZA 4FSVA 3ZETB 3CI5A 3VERA 1KAYA 4Y0WA 1BDGA 3VEZA 3CETA 2ZWHA 3CQXA 4BRGA 4H5NA 4BR5A 1QQMA 4JN4A 2ASOA 3VF4A 1GLFO 5LJVA 4WQ5A 3GG4A 5AZJB 2I7PA 3M1FA 2V52B 1BA1A 3BEXA 2YJEA 3H1VX 4EAHD 5AR0A 2QWLA 3DJCA 5E84A 1P8ZA 2YHXA 4JNEA 3UKUA 2QWQA 4FWSA 4BRMA 2E2QA 3GL1A 3A8YA 4FWRA 3J8AA 5AQPA 2E88A 4CJ7A 3QBXA 3W0LA 5JMVA 3RSEA 1XC3A 3QICA 5BN9A 3MN6A 1C0FA 1QQNA 2E2OA 2FF6A 4DB3A 5BPLA 5ADXH 1GLEG 4BQLA 4DQ8A 2GEMA 3LDLA 3HBTA 4FWPA 2PBDA 1XQSC 4XH1A 1SZ2A 4EHTA 3FE1A 3H45C 3TPQA 5KPZA 5AFUH 4GY2B 3BF3A 4B9QA 4MLHA 1ZC6A 3RSEB 3LDQA 2ASMA 3BP8A 4BG8A 3ATVA 3LDPA 4ISFA 4B1VA 5AZIA 4A2AA 3D7EO 1RFQA 3UE5A 2YCHA 4O8KA 4K41A 2QW9A 4EFHA 1MA9B 5BN8A 4CD3A 3MK6A 3AAQA 1R59O 3AY9A 5AZIB 1NGDA 3R6MA 1GLDG 1Z05A 4HTLA 5F2RA 3IUCA 3EO3A 5ELZA 1X3MA 3CJ7A 3EKUA 2CGJA 5JICA 3A5MC 4PKIA 3M3ZA 5EY4A 4CD1A 1DEJA 2ZF5O 2ITMA 3LL3A 4XEIA 2BTFA 1NGJA 1QZ6A 1Q18A 4PL8A 1U6ZA 1CZAN 2HF4A 2QM1A 4GNIA 5ADXA 3H46O 1RDWX 3WT0A 3VOVA 4ISEA 5FPMA 4F9OA 2FSNA 1JCGA 1NGGA 2F9WA 3ATUA 2CGKA 4H0PA 5AFUA 5BPNA 4KBOA 1WOQA 4IJAA 1NGCA 2P9LA 5AQLA 1Y64A 5LY3A 3MMVA 4CZHA 4B1ZA 3G25A 4FWMA 4M7YA 4BRCA 1S3XA 1D4XA 3QMLA 2QWMA 4FOEA 4ISGA 1MDUB 1NGFA 4K42A 1YAGA 3O4WA 2GWJA 3VEOA 5BPMA 2P9LB 2Q97A 3KHYA 3SK3A 2YI1A 2PAVA 3OHRA 2P9UA 4XH4A 1Z6RA 2Q31A 2V7YA 1BWFO 3LDOA 1BG3A 2IVPA 3MDQA 2IVNA 1NGBA 5F1XA 3FR0A 3FLCO 3DXKB 2W41A 1TYQA 3VF6A 3LDNA 5CE3A 3L6QA 5AQMA 2CH6A 1GLLO 2P9UB 5AQVA 3VEYA 2GELA 4M7XA 3O08A 3KVGA 1MWMA 1T6DA 1GLAG 3VEVA 3R8EA 4AM6A 4FWOA 3O80A 5AQRA 1TYQB 4PL7A 2P9NA 1YUWA 3DXMA 2A42A 3D2EA 4H5WA 1NWKA 3QDKA 3AAPA 1IJJA 3HM8A 4H5RA 5KQ8A 4WQ4C 3GE1A 4C23A 1MWKA 3EKSA 2A41A 3SMPA 4BC2A 4IXCA 3BF1A 1HKCA 2FSKA 5AQKA 2E2NA 2P9NB 3DXMB 3I8BA 3C7NA 3D2EB 1NGIA 5AQHA 2WUSA 1T6CA 3UKUB 4FWKA 1BA0A 1NLVA 3DWLA 3VEWA 4FOIA 2HOEA 2E20A 3TU5A 2P9IA 4K25A 1OKJA 3U8XA 2A3ZA 4BVPA 3MCPA 3SJHA 3C7NB 4BC4A 2ASPA 3ENHA 4O5FA 2P9IB 1WUAA 4IWVA 4M63C 3U9ZA 3VETA 1K8KA 1TUUA 3ID8A 1BU6O 3HTVA 3FZMA 5BR9A 3ULEA 3FZHA 2IIRA 1BUPA 3H3NO 4FWLA 3DAWA 2GTDA 3WEEA 5JLFA 1JCFA 2VYPA 3WXIA 4LC9B 4E1JA 4BVOA 1DKGD 3M6GA 3ULEB 3VGLA 3U9DA 3U4LA 4JHDA 3W3DA 4BGAA 1E4GT 4RCHA 4A61A 3VESA 3VEXA 3WEEB 4BR4A 4BR0A 2HF3A 1LCUA 3SMSA 2GWKA 1U2VA 3IMXA 5AQOA 5AQGA 4BR9A 2BUPA 3A0IX 3FZFA 1YXQA 4CZIA 2NRHA 4CZJA 1EQYA 4BR7A 2QWOA 5AQXA 4BRDA 3LM2A 2CGLA 4PKGA 4JHDB 1XUPO 3EL2A 1NGHA 3H1QA 4CBWA 4CBXA 3WUHA 5AQIA 2AA4A 4BRKA 4IJNA 1QHAA 2W40A 2P9SA 3L4IA 5LJWA 4EHUA 4BROA 2Q2RA 3MN7A 3I33A 1QQOA 4BRAA 1LOTB 2Q0UA 3EN9A 4BRQA 3CIPA 1DGKN 4FWQA 1NGEA 4YDUC 1HKBA 3VGKA 5E26A 4AM7A 2P9SB 4QS8A 3ZX2A 5FPNA 4BRPA 2E8AA 3BUZB 5KQDA 1J6ZA 3F9MA 4MO5A 5EX5A 4RTFD 3P4IA 1ZBSA 2YHYA 1HPMA 1V4TA 5EXWA 1SQKA 3FZLA 3CERA 2AP1A 3O1WA 3WXKA 4CZMA 4H0YB 4H5TA 4BGBA 3UKRA 4JAXA 3S41A 2FXUA 4CBUA 4NO7A 5AQQA 3H3OB 4XH5A 5KPTA 4J8FA 3O1BA 2Q36A 2D0OA 5BRHA 1BOTO 2D1KA 3UKRB 4HWIA 1YVNA 5AQTA 3QFPA 4BRNA 2F9TA 5AZJA 4EIAA 1T44A 1HJOA 2FLOA 3HI0A 2DPNA 2Q0RA 1ZXOA 2P9KA 2UYTA 2NLXA 2QWPA 2H3GX 4IZ9A 1C0GA 3MN5A 2YJFA 1V4SA 3QBWA 4NB4A 5TKYA 1S22A 4BG9A 1X9JA 2OANA 4CZGA 2P9KB 5AQWA 4CZKA 4Z94A 4PKHA 4BQZA 2A6AA 4H0XB 2E1YA 3UB5A 2VWBA 2J4RA 4FO0A 4H0OA 1RGIA 2FF3B 4BREA 3VPZA 1HKGA 2ZGZA 3GOIA 4BC5A 1X3NA 5AQUA 3A5NC 2VCPA 3CJAA 1ATNA 4FWNA 4BRIA 4CZEA 4DHYA 4FL9A 4DCHA 2NZTA 1ATSA 5FPDA 4K43A 3O5BA 3AARA 4YDUA 1BO5O 4B1YB 2EWSA 3O6WA 5AQNA 3ENOA 4WYBA 3IFRA 2V51B 3VGMA 3KZBA 5AQZA 3GBTA 4CZLA 3VENA 1ESVA 3A5LC 4H03B 1K8KB 2V7ZA 3CJBA 3CHWA 4B1UB 3LM9A 4BRLA 3L0QA 2A40A 1NMDA 3WQTA 4B1WB 4CI6A 1GLCG 5B8HA 4H5VA 2FSJA 4JD2A 2A5XA 2QWNA 4L3QA 2P9PA 4I6MA 4BC3A 2QWRA 4QS7A 3B8AX 3JXUA 2E2PA 1H1VA 4BR2A 5BREA 4WQ5C 1NM1A 3MN9A 1HUXA 1KAZA 4JD2B 4MLEA 5FPEA 5KPRA 2P9PB 4I6MB 3QFUA 1KAXA 2QXLA 4CZFA 2HMPA 3FFKB 5AQJA 5JLHA 2D0PA 2ZGYA 5AQFA 1U2VB 2CH5A 4RWTA 4WQ4A 3R9PA 1ATRA 3C0BA 1G99A 1TUYA 2Q1NA 3FZKA 5EOYA 3ZX0A 4A2BA 4A62A 1IG8A 3FGUA 3A5OC 1QZ5A 4H0VB 2IVOA 4BRFA 3HSCA 1GLBG 3EZWA 1HX1A 3HZ6A 1HLUA 5BRFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GDQA 3SCXA 3H08A 4N76A 5F0XA 1XHXA 1NK9A 4M3WA 3ZEUA 2D4WA 2I7NA 5T7BA 2GUPA 1NKCA 1VRUA 3CG7A 1A5WA 5HRRA 5JVHL 3MXJA 3DMJA 1Q7YO 2O8BB 2W6KA 2RE2A 3WXLA 4CF8A 1ASWA 3SPYA 5J1EA 3JS6A 1RBSA 4B9MA 1NOZA 4CHNA 2HHVA 5EVZA 5HLFA 1NMNA 1BDGA 3CQ8A 1M1KO 2ZWHA 4BRGA 2ETJA 3V1QA 2KFNA 2QTDA 4FJ9A 4E7HA 4E89A 1YVUA 4DMNA 2HSTA 3K5MA 4CEEA 1SV5A 4N41A 2YHXA 2RF2A 2QI2A 2HBMA 2XY8A 4CEAA 3HVTA 1YHQN 3RR8A 4BRMA 3ZSVA 5AQPA 2G8WA 2E88A 3F73A 2OPQA 5JVGL 3DOLA 2XY6A 3THVA 1N8RO 3RSEA 3QICA 4CEBA 1XWLA 2E2OA 3PO4A 4DB3A 1RT5A 4O8UA 3KD5E 1P90A 3QEWA 4FWPA 5GAEP 3M8QA 4EHTA 3H45C 4WCEL 4CJKA 1ZC6A 2AJQA 1ZBHA 3TSQA 4BG8A 4ISFA 4H8KA 5AZIA 3CF5L 4DQSA 1C0UA 3P31A 1W2BM 2YCHA 4MFBA 3OYLA 3L8BA 1XMQK 1D9FA 2QW9A 3CPEA 4B3OA 3V1RA 2E6MA 2Y1IA 4H4OA 3OA9A 3MK6A 1R59O 1NGDA 1TK8A 4HTLA 5F2RA 3WNEA 1O13A 4F2RA 1Y97A 5EY4A 4CJRA 3TR8A 1WB9A 4B9UA 1JL2A 1NGJA 1QZ6A 5CR4A 4PL8A 4BE2A 1QSYA 4JRPA 4O44A 4M3YA 4JS4A 4DV4K 5TKWA 3LAMA 4GNIA 3PUFA 3EYZA 4QOZB 3H46O 3QERA 1FW6A 1D5AA 3VQCA 1L5UA 4ISEA 1NGGA 3CPWM 3ATUA 3BGRA 5AFUA 3OTOK 4E1MA 4DU1A 1WOQA 3PIOL 1S5JA 4IJAA 1D8YA 1L3TA 2P9LA 5AQLA 5LY3A 3AA2A 4GV3A 4FWMA 5K14A 1D4XA 4AHSA 4G1QA 3SQ1A 1EXQA 3QIPA 4YOVA 4FVUA 2GWJA 3VEOA 2Q97A 4WF9L 3KHYA 3ALYA 2Q31A 3V9SA 4QAGA 2IVPA 3VQBA 4CFCA 3FR0A 4IDHA 3DLBA 3KIOA 2CH6A 4IG0A 3AA3A 4M7XA 3V9XA 1VSMA 3AVJA 1RTJA 1MWMA 4CGDA 3LP1A 1BI4B 3VEVA 4FWOA 4DR4K 3O80A 4X62K 3VN5A 1YIJN 1YF5L 1NWKA 3QDKA 2YHAA 3GE1A 4C23A 4BC2A 3SMPA 1J53A 4IXCA 1TL3A 1HKCA 4JV5K 1DTTA 2FSKA 5AQKA 2E2NA 3I8BA 4CFBA 3O9TA 2WUSA 4AHVA 4AF1A 4BY9C 3VEWA 3THWB 3VQ5A 4AH9A 3TU5A 4W5QA 4FW1A 5A2QO 1UA1A 1BIUA 2A3ZA 4YOXA 3I0RA 3C7NB 4BC4A 2ASPA 3DRPA 2A1SA 3DLGA 3TTFA 2P9IB 4M3ZA 1TUUA 3ID8A 4KV8A 2UXCK 3PV8A 1TK0A 1NK6A 4Z4FA 1NG9A 3VQAA 4FJMA 4FJ5A 2YNHA 3H3NO 3ZSXA 3OVNA 4FJNA 3DAWA 3WEEA 3OYJA 4CEDA 3CC7N 2O8CB 3WXIA 4LC9B 3JYTA 4BVOA 1BISA 1S9EA 2B6AA 1CZBA 4B08A 2QEXN 3W3DA 1CLQA 4A61A 4OLBA 3QLHA 3VEXA 3AO5A 4HTUA 3SMSA 4BR9A 5HRNA 2BDPA 4YOTA 4W5OA 5HL7L 4FK2A 4CJVA 4OPJA 4JHDB 3PIPL 1VRTA 3IRXA 3HJFA 4U7BA 2E4LA 2AA4A 3HPOA 5C10A 3KLIA 2F8TA 3AA4A 3C6AA 2Q2RA 5C15A 1WLJA 3EN9A 4BRQA 3CIPA 1DGKN 4ID5A 3VGKA 3SUQA 4DG1A 5E26A 3AVCA 3ZX2A 3NF8A 1U47A 1TGOA 4C1NI 1J6ZA 3F9MA 5M1PA 1YJNN 1IBLK 3P4IA 2O8BA 2Y1JA 2JWKA 3FZLA 3CERA 2AP1A 4CJEA 4H5TA 4BWJA 3RRHA 4JAXA 4CJFA 4WFBL 2FXUA 4WE1A 3ZSQA 3HXMA 3H3OB 4FM1A 5C2FA 4FLYA 4XH5A 5KPTA 3KKRA 2HHXA 1JLQA 1QSSA 3R1XA 4DS5A 2UUAK 4IFVA 4YORA 2Z1JA 5DK5A 4Z4CA 4BRNA 2ZD1A 5KRSA 2G8FA 1IH7A 3CMAN 2FLOA 2D0BA 3AVHA 3ZT1A 1RT7A 2P9KA 1UA0A 3CFRA 1HNVA 2DY4A 3NH2A 1SL1A 1LWCA 2H3GX 3P83D 5TKYA 4CK2A 2HHTA 4J2BA 3D45A 4BG9A 4JI4K 4CZGA 3V6DA 1U4BA 1WSFA 4PKHA 4O5BA 4BQZA 2A6AA 2E1YA 2J4RA 2OPSA 4FO0A 4H0OA 4DF8A 1GOAA 3VPZA 1JXEA 1KRPA 4FJGA 1QVGM 5AQUA 3A5NC 2WBNA 3CJAA 4CW7B 4BRIA 3HOTA 3DOKA 5C0YA 1KLMA 5FPDA 4YDUA 2NRZA 2YNFA 2V51B 3HOSA 3KZBA 5HBMA 3L2QA 1T8EA 3WXMB 2GV9A 3VENA 4JK8A 4MDBA 2VQEK 1FK9A 3T1YK 1K8KB 3E9OA 3S3NA 3L2VA 3U6FA 3AVIA 2RHKA 4BRLA 4YHHK 1NMDA 3WQTA 4CI6A 1C6VA 4JD2A 5AJ3K 3EY1A 1TKXA 2A5XA 2QWNA 4L3QA 5KRTA 2IDOA 3MEEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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