3HM8A

Crystal structure of the c-terminal hexokinase domain of human hk3
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
SRRLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLALDLGGTNFRVLLVRVTTGVQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAVELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCVVTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Hexokinase-3
publication title Crystal structure of the C-terminal Hexokinase domain of human HK3
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 157
structure length 441
sequence length 441
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2009-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hm8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3hm8A01
3C0BA 3L6QA 4L3QA 3H46O 2AA4A 3A5OC 4BC2A 2NRHA 3ZETB 4K41A 1ZC6A 1BG3A 1KAZA 1R59O 3D2FB 3BUZB 1IJJA 4FWQA 4JHDA 2EWSA 1MWKA 1U6ZA 3CJAA 4K25A 4XH5A 4H5TA 4J8FA 1BO5O 3H1VX 5AQVA 4CZLA 3WEEA 2E2QA 3BF1A 3GDQA 3JS6A 4PKGA 2D0PA 2P9SB 4M7XA 4FSVA 4IJAA 1Z6RA 2D0OA 2CGKA 2BTFA 4WQ5C 1WUAA 1XQSC 4AM7A 3I33A 3FE1A 5JICA 5F2RA 1C0FA 2A41A 3MN5A 1TYQB 4DCHA 4CZGA 4FWPA 3WXLA 1S22A 2VWBA 2P9IA 3VF2A 2E2PA 1NBWA 3D7EO 1HJOA 4H03B 4YDUA 4K42A 3DXKB 4H5WA 3CJ7A 1GLFO 1HKGA 3DAWA 4EFHA 5KQ8A 3KVGA 3AAQA 4BC3A 4BG9A 4BRIA 1BWFO 5E26A 5TKYA 5JLFA 4BR9A 5ADXA 3AY9A 2GWJA 2CH6A 3CHWA 3WQUA 3DXMB 3UKUA 4DB3A 3FZKA 1KXPA 5LJVA 2Q36A 4RTFD 3BF3A 5BPNA 1NMDA 4RCHA 5BN8A 1LOTB 5AZJB 4CZMA 3W3DA 2QWOA 5BR9A 5AQGA 3LDQA 1WOQA 2P9PA 4BRCA 2Q97A 1E4GT 2QWPA 5BPLA 5AQLA 3FFKB 1DEJA 3CJCA 4O8KA 2GELA 5BRFA 5AQPA 2ASMA 3O1WA 4BQZA 2P9NA 4A61A 4JHDB 2FF6A 3FR0A 1X3MA 4BRQA 3FZFA 1T6DA 3QFUA 4H0OA 4MO5A 3WEEB 2GTDA 3EN9A 5AQJA 3AARA 2A42A 3L0QA 4H0VB 4FWMA 1JCGA 3SLCA 4FWLA 5B8HA 1Q18A 3SJHA 3CERA 1V4TA 2FXUA 4QS8A 4FWKA 4B1WB 2A3ZA 1D4XA 3HTVA 2E1ZA 3MN9A 5AQHA 2P9IB 3KZBA 3EZWA 4FWNA 1Y64A 2FSNA 3VETA 5AR0A 1ZXOA 2D1KA 5I9EB 1NWKA 3O8MA 4CZIA 2IVPA 2VYPA 2Q0UA 5AFUA 1QQNA 4LC9B 4MO4A 4EIAA 3BEXA 3SMPA 2Q31A 4JD2A 2E88A 3B8AX 1T6CA 2E8AA 5BPMA 4CBUA 4H0YB 3M3ZA 3UKUB 1SAZA 4HTLA 4FO0A 3I8BA 3HI0A 3O6WA 4HWIA 4BRAA 3FZLA 5JMVA 1NGFA 4BRHA 4BC5A 5AQIA 1HX1A 3FLCO 2P9PB 2P9LA 4BROA 3A5NC 3VGLA 4BRGA 4I6MA 5ADXH 2Q2RA 2PAVA 1BDGA 2YHYA 3RSEA 2Q0RA 1QZ5A 2P9NB 4Z94A 1EQYA 3MMVA 3AAPA 5EVZA 1NGJA 3A8YA 4WQ5A 4BR0A 3OHRA 5AQXA 1C0GA 4B1ZA 5AZIA 3LM2A 3QMLA 3D2EA 3VF4A 1DGKN 2P9UA 3HM8A 4E1JA 2ZF5O 4FWOA 3QBXA 2FF3B 4C23A 1MDUB 2AP1A 3ULEA 3QICA 2A40A 5AQZA 4A62A 4H0PA 1BOTO 2QXLA 5AQMA 2H3GX 5JLHA 4XEIA 3ZX2A 5AQTA 1T44A 1ZBSA 4IXCA 1JCFA 5LJWA 2HMPA 4ISEA 1U2VA 1YUWA 2E20A 3LDPA 3ZX0A 3CETA 3R9PA 2GUPA 2Q1NA 4QS7A 4IO8A 4M7YA 3H3OB 3GG4A 4JD2B 3IFRA 2FSKA 4BRKA 1HPMA 2UYTA 3VOVA 2A5XA 3H6EA 4BR4A 5AQSA 1NGBA 5KQDA 3VEYA 4BQLA 2HF3A 4B1VA 2NLXA 1H1VA 3KHYA 1E4FT 2YJFA 2F9WA 3L4IA 5AFUH 3WQTA 1J6ZA 1HKBA 2HOEA 4IWVA 4JN4A 3VGMA 1Z05A 4WQ4C 2P9LB 5FPEA 3LDNA 2IIRA 1ATRA 1XUPO 3EO3A 4I6MB 3UKRA 2ZGZA 3EL2A 2I7NA 3CQYA 4BRLA 1YAGA 1GLJO 4H0TB 1QQOA 3RSEB 3H45C 2ZWHA 1DKGD 3F9MA 1K8KB 3GOIA 2IVOA 3IDHA 3TPQA 4BG8A 2VCPA 5AZIB 3U9DA 4BR2A 5BREA 1HUXA 1BA1A 3D2EB 4H0XB 5F1XA 2YCHA 3U8XA 4FWRA 3O5BA 2P9UB 2V51B 3HBTA 2V7YA 1GLDG 3ULEB 3VEZA 1RDWX 5LY3A 1YVNA 3WXIA 5F0XA 2QW9A 5ELZA 3LDOA 3MCPA 2V52B 1NGGA 2WUSA 4B1YB 5AQKA 3W0LA 3J8AA 4PL8A 3S41A 4FPAA 2ITMA 1ATSA 1QZ6A 2ASOA 1U2VB 3C7NA 3ENOA 3CJ1A 4XH4A 1NLVA 3EKUA 4CD3A 1NGEA 4EHTA 4B1UB 2ZGYA 5AQYA 3CIPA 1SQKA 4A2AA 5EX5A 2CGJA 3MN6A 1GLCG 3CJBA 4KBOA 4BGBA 4FPBA 4MLEA 4XH1A 3QB0A 3VESA 4NB4A 2YI1A 3VF6A 3ATUA 3VEVA 5CE3A 4BREA 2HF4A 1BUPA 4FOEA 3U9ZA 1X3NA 3IUCA 5AQOA 3WXJA 1QHAA 4BGAA 2DPNA 2I7PA 2YJEA 1X9JA 1HKCA 5FPDA 3O4WA 1G99A 3U4LA 3UKRB 3H3NO 4BRPA 1K8KA 3R8EA 4CZJA 3MDQA 1GLEG 2YHWA 4FL9A 4BRDA 2BUPA 3BP8A 1BA0A 4CZFA 5AQQA 2E2OA 4CBXA 4BRMA 1GLLO 4CZKA 1YXQA 5AQUA 2E2NA 3A5MC 2QWNA 3WXKA 4H5RA 4FOIA 1S3XA 4QS9A 4WYBA 4EHUA 1V4SA 4AM6A 2IVNA 1NGCA 2V7ZA 2GEMA 1CZAN 2A6AA 3FZHA 4CI6A 4PL7A 4ISGA 3VENA 5AQWA 2CGLA 1NM1A 4GNIA 2ASPA 3ZEUA 3MK6A 4RWTA 4CZEA 2E1YA 3ID8A 3GL1A 1P8ZA 4PKHA 1BU6O 4CJ7A 2QWLA 3VPZA 3C7NB 1MA9B 1NGIA 4CD1A 3VERA 3DWLA 4JNEA 3A5LC 3G25A 4BC4A 4CBWA 5FPNA 4YDUC 4BRFA 3JXUA 3VEWA 4FWSA 3CI5A 5BRHA 3O1BA 4EAHD 3ZX3A 3CQXA 3GE1A 3IMXA 3SK3A 2QWQA 3EKSA 1TUYA 2P9KA 4WQ4A 1IG8A 4B1XB 1NGAA 1TUUA 3O08A 3P4IA 4H5VA 1ATNA 4CZHA 5EY4A 3SMSA 3ZETA 2W40A 4ISFA 4BVPA 3GBTA 4PKIA 2FLOA 3QDKA 2QWMA 1MWMA 3CJ9A 3D2FA 3UB5A 4DQ8A 2QWRA 4NO7A 1SZ2A 2YHXA 1OKJA 4K43A 5BN9A 3QFPA 2KHOA 1KAXA 2D4WA 1GLBG 1RFQA 2F9TA 1NGDA 3O80A 3WUHA 4F9OA 2P9SA 1NGHA 4Y0WA 5AQRA 4BRNA 5FPMA 5KPZA 3WT0A 5KPRA 1ESVA 2PBDA 4B9QA 3LM9A 3TU5A 2OANA 1KAYA 4A2BA 3ATVA 5BRDA 2W41A 3VEOA 1QQMA 3HSCA 1TYQA 5AQFA 5AQNA 4BVOA 4O5FA 3UE5A 3ZEUB 3R6MA 2CH5A 3M1FA 4JAXA 2J4RA 1RGIA 3DXKA 3LL3A 1XC3A 3H1QA 2GWKA 1GLAG 5EOYA 5EXWA 5E84A 1JCEA 2QM1A 3A0IX 4IZ9A 5KPTA 3FGUA 3DJCA 3FZMA 4MLHA 4BR7A 3HZ6A 4M63C 4GY2B 1HLUA 3DXMA 3M6GA 3VEXA 4BR5A 3LDLA 4IJNA 1LCUA 2P9KB 3MN7A 4H5NA 3QBWA 4DHYA 2NZTA 5AZJA 2FSJA 3ENHA 3VGKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DV3K 1JLGA 3L6QA 1IBLK 4CECA 3AVBA 4QOZB 2F8TA 5LMNK 4UY8O 1ZC6A 2FBTA 4B3TK 4C8NA 3VQ5A 4K25A 5M1KA 1D8YA 4FJNA 1I3AA 3AVCA 3F2KA 4KHYA 3JS6A 5FLXO 5KGWA 4C8LA 4DTSA 5EU7A 2BTFA 1N32K 4WQ5C 3I33A 3WNEA 4B3RK 3H08A 5JICA 3QEWA 1KFSA 4B9SA 2A41A 2HHSA 1SL1A 1IV0A 3SQ0A 4B3SK 4ZTFA 4RW6A 3PUFA 4JI8K 2GV9A 4FWPA 3WXLA 4CZGA 4ID1A 3P38A 4O8UA 3CCVN 4HCCA 2E2PA 4EZ6A 1WSHA 4Q0BA 3O9RA 1SUQA 4OVLA 4H5WA 3OS1A 2FC0A 4DS4A 1HKGA 3AVAA 4DLGA 2OYQA 3THXA 2IGIA 5HRPA 4AHRA 1S1WA 5ADXA 4F3OA 4CGGA 3CHWA 3WQUA 4DB3A 4EZ9A 2Q36A 4NCAA 1NMDA 4RCHA 4KHPK 1LOTB 1TKXA 4CZMA 3ULDA 1E4GT 2QWPA 5AQLA 4CJPA 3CJCA 5CY4A 5BRFA 5JS1A 5AQPA 3O1WA 2VG6A 4HCBA 2KZZA 1RBUA 2VGNA 3HT3A 1U45A 4U7BA 4MO5A 2RKIA 4WFNL 4GVEA 3BDPA 1KFDA 3AVJA 4CIFA 4ELVA 2GTDA 3P83D 5DM7L 3AARA 2A42A 4FWMA 1JCGA 2HNDA 1Q18A 3SJHA 3E01A 3OA9A 1V4TA 2FXUA 3E66A 1FXXA 4M41A 3C6AA 4JI2K 4B1WB 3TAGA 1RDCA 1SKWA 4FM0A 3OVNA 3HTVA 4QAGA 4FWNA 4FVMA 5AR0A 2D1KA 4ID5A 1QHTA 2Q0UA 1QQNA 3THXB 1VSKA 3SBTA 2Q31A 4JD2A 1LWEA 1TL1A 4DTJA 3M3ZA 3I0SA 4HTLA 4FO0A 1NK8A 4C1NI 1NGFA 4BC5A 4LSLA 4BRGA 4I6MA 2NRWA 5FDLA 5ADXH 3QEIA 4AQYK 3ZT4A 5HROA 2D5RA 3O9UA 2OTJN 4CEAA 1EQYA 3MMVA 3D6RA 3A8YA 4WQ5A 1EETA 3LWMA 3DLRA 4FJ9A 5J2MA 4WFAL 1HNIA 2YV0X 4FWOA 4OPAA 2AP1A 3ULEA 4A62A 3ISNC 4KV8A 3NAEA 4KH5A 4CJEA 3MEGA 2Y1IA 5JVHL 2H3GX 1BQMA 2WBNA 5AQTA 5H1SQ 1T44A 3SQ4A 3JAMO 2DY4A 2KFZA 4ZHRA 3SV4A 3R9PA 5AJ3K 5I42A 2GUPA 2ZD1A 1RNHA 4QS7A 1C1BA 1YI2N 3H3OB 3R3LA 4JD2B 1NKCA 4BRKA 3F5TA 1XHZA 1NGBA 3DOKA 3M8RA 3L4QA 4BWJA 3AO5A 3CM6A 1REVA 3KHYA 3RWUA 3T1AA 2QA4N 1VQNN 4CFAA 2HOEA 4JN4A 4CJ5A 5C10A 1OH6A 3LDNA 3EO3A 4I6MB 4FZXC 3M8QA 2ZGZA 3EL2A 3CQYA 2KTQA 4BDZA 4W5RA 3H45C 1DKGD 3ZT0A 2IVOA 1KLNA 5M1QA 4B3OA 2XY8A 4E0DA 3OJSA 2QI2A 1BA1A 3D0PA 5F1XA 3U8XA 4FWRA 3SAHA 3O5BA 4O4GA 4OJRA 3K5MA 3LPUA 1GLDG 3ULEB 3L3VA 1RDWX 5IT9O 1YVNA 3KKSA 3VQ4A 1N33K 3WXIA 4OO1J 2QW9A 1VHXA 4E1MA 4BY9C 1VAZA 5C25A 3U3YA 4C1NK 1TL3A 3W0LA 3J8AA 2OZMA 1VSMA 1WSIA 1XNRK 3IKMA 2ASOA 1TKZA 3KLFA 1RTJA 4O44A 3KTQA 3ITHA 5C2FA 1NLVA 5CHIA 4CD3A 3OS0A 4DQRA 4B1UB 2ZGYA 3LALA 3CIPA 2HBJA 4RW7A 3NGZA 2G8UA 1LWCA 2EX3A 3CJBA 4DTRA 4FPBA 4KHNA 5CZ2A 3QNNA 3VF6A 3ATUA 4FLTA 4ILJA 3VEVA 4BREA 1BUPA 3OYIA 3HXMA 3IUCA 3B6OA 1LWFA 2YJEA 2UUAK 1ITGA 2VWJA 1HKCA 5A2QO 5FPDA 1G99A 3R8EA 4DV6K 3DOLA 3ZT3A 3MDQA 2YHWA 4FL9A 1N6QA 4CF0A 1DTQA 2BUPA 1FJGK 3I8DA 4GMJB 1BA0A 4CZFA 3QINA 4CJWA 3SAFA 1HYVA 4H5RA 4KI4A 1S3XA 1OVQA 1BGXT 2O8FA 2O8CA 4CVNE 4IEEA 4B9NA 1RCHA 1I39A 1L5UA 4DKWA 3SZ2A 1JXBA 3MK6A 3QESA 1OH5A 2E1YA 3ID8A 3NVMA 3KWGA 4FM1A 4CJ7A 3E9PA 3K59A 3OYKA 3HOSA 3ZSYA 3VERA 3A5LC 5GAEP 4HHTA 3G25A 4BC4A 5FPNA 2QK9A 2LSNA 3O1BA 4IFEA 4EAHD 3CQXA 3CC2N 4CF9A 3J7YP 4B9TA 4GKKK 2P9KA 4FJ8A 2A1RA 3P4IA 4WF9L 3O3HA 4F2RA 3SMSA 2YX6A 3VQ7A 4EP4A 3AA2A 5HRNA 1VSEA 4PKIA 4LF7K 3OYNA 2QWMA 2HHVA 4KTWA 4NO7A 4FLVA 4E7JA 4K43A 3VQPA 3CG7A 4F3TA 4CJRA 4JKHA 3NF9A 3CQ8A 4CJVA 4DV0K 3SUNA 2RE2A 4X62K 1LAWA 4X66K 4BDYA 2P9SA 4Y0WA 1WBBA 2XY5A 4FJHA 3OBYA 1EWRA 1S9EA 5KPZA 3S3OA 2O8FB 2VG5A 2PBDA 3B6PA 3VTIA 4EP5A 2O8CB 4A2BA 1O1WA 3DRPA 3LANA 4JI5K 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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