3HM8A

Crystal structure of the c-terminal hexokinase domain of human hk3
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
SRRLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLALDLGGTNFRVLLVRVTTGVQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAVELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCVVTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the C-terminal Hexokinase domain of human HK3
rcsb
molecule keywords Hexokinase-3
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 157
structure length 441
sequence length 441
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2009-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hm8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3hm8A01
4JNEA 5AZIB 3L4IA 2A6AA 1T44A 3O08A 4CI6A 4C23A 2E1ZA 2V52B 4BC2A 5AQVA 2D0OA 4BR4A 3UKRA 4B1ZA 4EHUA 4QS9A 4BRGA 3F9MA 3I33A 3CJBA 3D2FA 2P9KB 1GLAG 2P9IA 2QWQA 3FZMA 3DAWA 3IMXA 3ULEB 4BGBA 5AQNA 4BRMA 2E1YA 5F0XA 3GL1A 1JCFA 2FF3B 1HKCA 4B1VA 2FLOA 3MN7A 3CJ7A 4WQ5C 2Q0UA 5F1XA 4CZJA 1SQKA 1GLEG 5JMVA 1DEJA 3UE5A 5AZIA 3VGMA 2Q0RA 4LC9B 4ISGA 2QWNA 2YCHA 1QZ6A 4ISEA 3FZKA 4M7XA 3LM9A 1BDGA 4GNIA 5AQTA 4CJ7A 3U8XA 1E4FT 4CZMA 3FR0A 2P9KA 4CBXA 5BRDA 3LL3A 4A2BA 3FE1A 1EQYA 2F9WA 1TUYA 3WXIA 4CZEA 2W41A 3EN9A 3ULEA 1V4TA 1NBWA 1ZBSA 1NGDA 2YJFA 4FO0A 2Q2RA 1MWMA 4GY2B 4HTLA 3CQYA 3O1BA 3C0BA 3EO3A 4H0XB 5AQFA 4BR2A 4BQZA 5JLHA 2QM1A 2HF3A 4AM6A 4BRFA 5BPNA 1U6ZA 4FWSA 3EZWA 3J8AA 1NGEA 3FFKB 3GOIA 5AR0A 4J8FA 4FWLA 1V4SA 2ZGZA 3VGLA 3FZFA 4WYBA 4B9QA 2V51B 5AQKA 3D2EB 1TUUA 4BRCA 1KXPA 1LCUA 3BUZB 3VF4A 1BOTO 4RTFD 3EKUA 5TKYA 5BRFA 4BVOA 1GLBG 5EX5A 5AQIA 3VEOA 1E4GT 1KAYA 2NLXA 2GELA 1ZXOA 3MMVA 2FSKA 4DCHA 2Q97A 1XC3A 2VWBA 2QWMA 4DB3A 3D7EO 2Q31A 3VOVA 2ZF5O 1XUPO 4BR9A 3O8MA 1ATNA 4H0PA 4BRKA 4CBUA 3VETA 1YVNA 4BG9A 3MDQA 4IJNA 5EY4A 5BPMA 3MCPA 4QS8A 3VF6A 2E2PA 4MLHA 3SLCA 4BC3A 2HMPA 3D2EA 1IG8A 3H3NO 2NZTA 2D0PA 3AAQA 2CGKA 2PAVA 2PBDA 1RGIA 1NGHA 3VEZA 1C0GA 1NGBA 3MN9A 1HLUA 2D1KA 5JLFA 5AQSA 5FPNA 3WXJA 2HF4A 1GLDG 2YHYA 4B1XB 4H5TA 3R6MA 2Q36A 3KVGA 3DXKB 4BVPA 5AQHA 3G25A 3QBXA 4O5FA 3OHRA 4FL9A 2YJEA 4YDUA 1X3MA 3LDOA 4H03B 4O8KA 3VERA 3AARA 3CJ1A 1RDWX 4WQ4C 3QMLA 4BRLA 3HBTA 3U9ZA 5KQDA 2QWOA 3ENHA 3KZBA 4BRNA 3JS6A 3IFRA 4A62A 3RSEB 2ASPA 1K8KB 4ISFA 3ENOA 4CZKA 5E84A 4CZIA 4MO5A 2E2NA 1BA0A 1Z05A 1HKBA 4JHDB 2EWSA 2P9LB 1GLLO 3H45C 1XQSC 4IO8A 1NM1A 3P4IA 2FF6A 2OANA 3EKSA 3AAPA 1TYQB 3DXKA 4PKIA 2UYTA 5JICA 4FWPA 1U2VB 4HWIA 3ZX3A 4Y0WA 4AM7A 1LOTB 4BROA 4XEIA 5F2RA 1X9JA 2GEMA 1MDUB 4CD3A 1HUXA 1C0FA 4H5WA 3SJHA 1S22A 4FWKA 2F9TA 1DGKN 3GBTA 4K41A 2VCPA 1SAZA 4RWTA 2E88A 1KAZA 4PKGA 1CZAN 3EL2A 1ATRA 4PKHA 5B8HA 1JCGA 3CIPA 1K8KA 4FSVA 1RFQA 2IIRA 5KPZA 4PL8A 2FXUA 2ITMA 3UB5A 1QHAA 4JHDA 2P9LA 3WQTA 5KQ8A 4H5NA 3H1QA 4BRPA 1NGFA 3AY9A 5BR9A 3H1VX 1G99A 3FGUA 2V7YA 3H46O 3C7NB 1TYQA 1BA1A 1BUPA 3VEYA 1U2VA 2BTFA 1D4XA 4K42A 4I6MB 3CI5A 3WT0A 3ZX0A 1ZC6A 4EHTA 4BREA 3W3DA 1QQMA 3U4LA 1NGJA 5AQRA 2CH6A 3M1FA 3IDHA 5ADXA 5KPRA 3GDQA 4A61A 3ATUA 5AQLA 3VPZA 2A5XA 4CD1A 3VEVA 1WUAA 5EXWA 1BU6O 3H3OB 4H0OA 2A42A 2CGLA 1NWKA 2HOEA 3DWLA 3FLCO 4PL7A 5AQUA 1BWFO 4QS7A 3TU5A 4B1UB 1DKGD 3FZHA 4MO4A 4EIAA 3A0IX 3WEEB 5AQZA 4A2AA 2ASOA 2GWJA 3CETA 3CQXA 3R8EA 3C7NA 3QFPA 5BN9A 1QQNA 4DHYA 2I7PA 2GTDA 3O1WA 4BRDA 2Q1NA 4I6MA 3DXMB 3WXKA 1GLJO 2QWLA 4H0TB 3H6EA 3CJCA 2IVNA 4KBOA 2QWRA 3VEWA 2DPNA 1Z6RA 3HSCA 5AFUA 4BC5A 5AQOA 1QZ5A 5EVZA 3BP8A 5AQXA 4BG8A 2VYPA 3ID8A 5EOYA 3S41A 1H1VA 2WUSA 4FWMA 4CZHA 1NGAA 3SK3A 4CZGA 3A5NC 3ATVA 3ZEUB 2E20A 3MN5A 4BR7A 1NLVA 3HI0A 4JD2B 5AQQA 3A5LC 4F9OA 3VENA 3GG4A 3WEEA 1P8ZA 2YI1A 4BRQA 5ELZA 2QW9A 1T6DA 4BRAA 4WQ5A 5LY3A 4B1WB 3QICA 4K25A 3IUCA 2P9PB 1ESVA 1KAXA 3DXMA 5E26A 3MK6A 3LDQA 3O5BA 4MLEA 4FWOA 2IVPA 2A40A 2P9NB 4DQ8A 5AQJA 2CH5A 2KHOA 3CERA 3O6WA 3L6QA 1HX1A 1T6CA 2CGJA 5ADXH 4IJAA 1NGIA 2QXLA 4K43A 3VGKA 4YDUC 4CZFA 3ZEUA 1IJJA 2NRHA 4FWNA 5BN8A 3A5OC 2V7ZA 4JD2A 1JCEA 5I9EB 4E1JA 2YHXA 3O80A 3HM8A 1ATSA 1YUWA 4JAXA 4H0VB 2P9SB 4EAHD 2GUPA 5KPTA 4FPAA 3WUHA 3LDNA 3M3ZA 5AZJB 1WOQA 2P9PA 3DJCA 3BF1A 3SMPA 1MA9B 3BEXA 4Z94A 4JN4A 2A41A 3RSEA 4CBWA 4EFHA 2AP1A 4H5RA 2P9NA 3HZ6A 3U9DA 3QBWA 2E2QA 1NMDA 2QWPA 1NGCA 3A5MC 5LJWA 1HJOA 2H3GX 1Y64A 5AFUH 3I8BA 1S3XA 3CHWA 4BQLA 3TPQA 4NO7A 5AQPA 5FPMA 3W0LA 3WQUA 4BRHA 4M63C 3CJAA 1BO5O 1HKGA 3MN6A 2P9SA 1HPMA 3A8YA 5BRHA 3VESA 2FSJA 3UKUB 5AZJA 2J4RA 3CJ9A 2ASMA 4FPBA 1GLCG 1YAGA 3ZX2A 4H0YB 5FPEA 3HTVA 3WXLA 4FWRA 3JXUA 5LJVA 1MWKA 4FOIA 4IWVA 2GWKA 2ZWHA 4BRIA 5AQMA 5CE3A 1YXQA 2E8AA 3ZETB 1GLFO 2BUPA 1R59O 3KHYA 2W40A 1OKJA 4XH4A 4RCHA 2P9UB 2FSNA 3R9PA 4FOEA 2E2OA 2I7NA 1NGGA 3LM2A 4FWQA 4IXCA 3VF2A 3LDPA 3QDKA 2ZGYA 4NB4A 2AA4A 3VEXA 4M7YA 4BGAA 4L3QA 5BPLA 3UKRB 1X3NA 3O4WA 4XH5A 3UKUA 5AQYA 3QB0A 3B8AX 1J6ZA 3D2FB 3QFUA 4IZ9A 2P9IB 5BREA 4CZLA 4B1YB 3BF3A 1SZ2A 3GE1A 5FPDA 4BC4A 3L0QA 3M6GA 2A3ZA 2YHWA 4H5VA 4WQ4A 1BG3A 3SMSA 3FZLA 4XH1A 4BR0A 2IVOA 3ZETA 4BR5A 2D4WA 1QQOA 3LDLA 5AQWA 1Q18A 2P9UA 5AQGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L4IA 4CECA 3IAYA 4LF8K 2PFUA 1VQ6N 4HUEA 5AQVA 4IO9L 3KLHA 4IFVA 3QEIA 4DTXA 1YITN 3L2RA 2ZM6K 4C8MA 4BGBA 5J2MA 1RDDA 4K8ZA 2FF3B 4DQSA 4DV6K 2Q3SA 3NF8A 3PV8A 2HSTA 4FZXC 4I7FA 4B3RK 2Q0UA 4OGEA 4CZJA 5F1XA 1GLEG 5JMVA 3J80O 3CYMA 5CZ2A 5HP1A 4F2SA 2NUBA 1UA1A 4Z4CA 1RNHA 3AO5A 4CJ7A 5FRNA 1E4FT 2Y1IA 4FLZA 1IBKK 4OPKA 4E7LA 1N32K 4EP4A 1EQYA 4CFCA 3WXIA 3K58A 2I5JA 2W41A 4I2PA 4H8KA 4JI5K 1ZBSA 1ZYQA 3S3NA 2Q2RA 1SL1A 1MWMA 4GY2B 2WC9A 3CQYA 4YOXA 1JLGA 2XY5A 3TWHA 4DV2K 3C0BA 4FVMA 3VQQA 3NMUA 2VG5A 4CEZA 1JXBA 5JLHA 2QM1A 2HF3A 1XHZA 2D0CA 4ILJA 3OBYA 3EZWA 3J8AA 3L3UA 2ZGZA 1XMQK 1IV0A 1JLFA 4JI1K 3EEQA 3FZFA 1RT1A 1C1BA 4LF5K 2V51B 1TVRA 3OTOK 4BRCA 4RTFD 1A5VA 5BRFA 3S9HA 4BVOA 2O8CB 3VEOA 2IDOA 4CJ3A 2GELA 1S1TA 4EP5A 3OYMA 3KK2A 3JAMO 3VOVA 3SAGA 3M8RA 4W5RA 1XUPO 4NCBA 3O8MA 4KKOA 1KRPA 2Z1GA 4K0KK 4CBUA 1FKPA 3MAQA 1JL2A 3PO4A 5EY4A 4N47A 4LY7A 3CM5A 4BDPA 3C6AA 5JS2A 4M3XA 5K14A 3Q7CA 3I0RA 2O8CA 4YOTA 2PBDA 4Z4FA 4FZZA 1NGHA 1C0GA 1NGBA 2D1KA 2E4LA 2YKMA 3OY9A 3V1QA 1C1AA 4BWMA 4U67L 3ALYA 3WXJA 1ITGA 3MXMA 3R6MA 2VQEK 2F8SA 1YTUA 4E1MA 3I56N 3THWB 3G25A 3QBXA 2A1RA 4FL9A 1VQ8N 3LDOA 1XHXA 3CJ1A 1RDWX 5GAHP 3SV4A 4JLHA 1IBMK 3U9ZA 1W2BM 1X9WA 3PX4A 5GIPA 3IFRA 5CHIA 1HYSA 2ASPA 3ENOA 2KKZA 3TAPA 4OPAA 2E2NA 4RG8A 1HKBA 1GLLO 3SBGA 4IO8A 3LANA 1NM1A 2FF6A 2OANA 2AJQA 2YNIA 4J2AA 4CJUA 4RW9A 1TYQB 3V4IA 3THWA 1U2VB 4CF1A 4DSIA 1LOTB 5A2QO 3K9JA 4HCBA 1X9JA 2GEMA 4KHUA 4G9ZA 3U6FA 4Z4HA 3LWMA 3CM6A 2F9TA 1VSLA 3DLLL 3EL2A 5M1QA 1QHTA 4PKHA 2PZSA 2IIRA 4PL8A 2ITMA 3UB5A 3OA9A 3SI6A 1TAQA 5KGWA 4H5NA 3H1QA 2X74A 3AY9A 5BR9A 1RTDA 3H1VX 1TYQA 4AHRA 3NF7A 3I0SA 1XC9A 1LAVA 1U2VA 3THYB 4GV6A 3M8PA 4GV9A 1B9DA 3ZX0A 4EHTA 5BR8K 2YX6A 4CHZA 5HOOA 4F8RA 4IDKA 1QQMA 1Z26A 3WXMB 4DS4A 1BGXT 3ISNC 2RKIA 4ID5A 1HYZA 3GDQA 2GUIA 3G10A 3PLAA 4FJ9A 3VPZA 4FM0A 2FBXA 3VEVA 1ZBIA 3DLRA 3NF9A 1NWKA 1U04A 3L2VA 5AQUA 1NKCA 2XRIA 1G15A 4OLAA 4DS5A 3LDSA 4E1NA 1S1XA 1QSSA 3BZCA 1ASUA 4AHTA 3AGRA 4HHTA 4JI7K 4DSLA 3NAEA 1QQNA 3THYA 4BRDA 3UIQA 1BHLA 2BH1A 2HBLA 1Z25A 4CJ4A 2QKKA 4H0TB 1NU0A 2IVNA 3VEWA 3TTDA 3HSCA 4BC5A 4B3MK 2FC0A 1FJGK 1TK5A 1QZ5A 5AQXA 4BG8A 1VSHA 2VYPA 5EOYA 1U45A 1H1VA 2WUSA 4JKDA 4DV5K 3CFOA 3TTFA 4OGCA 3R1XA 3RRHA 3A5NC 1XWLA 3ATVA 3CMAN 3E9LA 1NLVA 1KQSM 3HI0A 5AQQA 1T8EA 3VTIA 1KLMA 4F9OA 3GG4A 1T6DA 4W5OA 4CEFA 4B1WB 3QICA 4K25A 3Q7BA 4CGHA 1ESVA 1TKZA 3WNEA 1NG9A 2HHUA 1EKEA 3MK6A 1D9DA 3CF5L 2BGGA 4CEBA 3PIOL 2EHGA 3V6DA 1QVGM 2ZJPL 4ELVA 3ZT2A 2KQ2A 3O3GA 3NDKA 2FBVA 4K43A 3OW2M 1Y97A 4JI8K 4IG0A 5LMUK 3U3GA 1C6VA 4E1JA 4JKHA 2YHXA 3HP6A 1HPZA 1ATSA 3JYTA 4EAHD 3D0PA 5KPTA 4FPAA 4FJMA 1WSIA 1MA9B 4FJ5A 4JN4A 4Q5VA 2G8KA 1D5AA 1VQLN 3ZT1A 4AHSA 3HZ6A 1NGCA 2JGUA 4KFBA 1HJOA 2H3GX 1Y64A 3ZT3A 1BI4B 2OPSA 1CZ9A 2HHQA 5LL6Z 3LZJA 3J7AP 5FPMA 3W0LA 3WQUA 2VG7A 3TAMA 1GOBA 4DQRA 1L5UA 2UUCK 2VWKA 2F96A 1HPMA 3A8YA 3E9PA 4Z4GA 4DUZK 4WE1A 4FM2A 2A1SA 3ZX2A 4YORA 2HHSA 5J2NA 2NNWA 4X65K 1BCMA 3T7ZA 5FPEA 3SBTA 3QIPA 1VHXA 1J5EK 3JXUA 3HL8A 2ZWHA 1VRUA 2UXDK 1BI4A 3ZETB 3OYKA 3DRRA 3KHYA 1OKJA 2YNFA 4XH4A 4RCHA 4CGJA 4IDHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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