3FZMA

Crystal structures of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitors
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel adenosine-derived inhibitors of 70 kDa heat shock protein, discovered through structure-based design
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 115
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fzmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fzmA04
3MN9A 3GE1A 1T44A 1GLLO 3RSEA 3F9MA 1JCEA 2DPNA 2FSJA 2GUPA 2HF4A 3H3NO 4H0VB 4BC5A 2F9TA 4EHUA 4B1WB 4K25A 4BR7A 3W3DA 4J8FA 3FZMA 4M7YA 3G25A 4EIAA 4FOIA 1X3MA 5E26A 1C0FA 1NM1A 3EO3A 5AQQA 5AQRA 4FWNA 2P9IB 4F9OA 4ISGA 3O8MA 4CZHA 2D0PA 5JMVA 1ZXOA 2IIRA 4NO7A 2OANA 3MK6A 2QWMA 5AZIB 1BU6O 1DKGD 5AFUH 2P9NA 3CETA 3ZEUA 3BF3A 3ZX2A 1HKCA 1BO5O 2P9SA 1X3NA 2A40A 4WQ5A 4K42A 3O5BA 3ATVA 3VF4A 1HJOA 3W0LA 2QM1A 1EQYA 4QS9A 2BTFA 3P4IA 4BRNA 5KQ8A 5EY4A 2VCPA 3KZBA 4BRQA 4YDUA 1MDUB 5BRDA 5KQDA 4B1UB 5LJVA 3C0BA 1U2VA 1JCGA 2HOEA 3BP8A 5FPEA 1Z05A 2ZGZA 4FO0A 4O5FA 2E2NA 2A6AA 3KVGA 4H0PA 5AQLA 5BN8A 3DXMB 2ASPA 3KHYA 3A5NC 2FSNA 2P9LB 5BR9A 1U6ZA 3UKRB 3IMXA 1ESVA 3QMLA 4E1JA 2QWNA 3D2FB 3WEEA 3GOIA 1SQKA 3HI0A 2Q97A 2VYPA 2A41A 3BF1A 4H5NA 3FZLA 4ISEA 3QICA 4BVPA 2V7ZA 1CZAN 4I6MB 1NGIA 4GY2B 4H0OA 5LY3A 5AQYA 1HPMA 4MO5A 3A5MC 1SAZA 4JD2B 3LDOA 4FWRA 3HM8A 5BPMA 2AP1A 3WXJA 3FR0A 3H6EA 2HMPA 3B8AX 1DGKN 2ASMA 4JN4A 4PL7A 3M3ZA 3CJ1A 1IJJA 4EHTA 1HLUA 2QW9A 1KAXA 4BROA 2QWPA 3WXKA 2QWQA 3ZETB 2KHOA 3QBXA 3VENA 4IXCA 4CJ7A 3DXKB 3TPQA 4QS7A 3I33A 1YUWA 2YI1A 1TYQA 2AA4A 4RTFD 4HTLA 4B9QA 1BG3A 2EWSA 4YDUC 4AM6A 1NGEA 3BUZB 3H3OB 4IWVA 4JNEA 2P9PA 1Q18A 4BRHA 3CJ9A 5JLHA 1RGIA 3WXIA 3EKUA 1WOQA 4FWKA 3VEOA 3CI5A 5EXWA 5AQFA 4PKIA 1NMDA 3M1FA 1GLDG 5AQZA 2W41A 5AQKA 2YHWA 3H45C 3IDHA 3UB5A 2NZTA 3WQUA 5LJWA 4BGBA 2A3ZA 2V51B 4MLEA 4BR5A 4FPAA 3O08A 4IJAA 4BRIA 2NLXA 4IJNA 4CI6A 5AZJB 1X9JA 2P9IA 1V4SA 3HSCA 1KXPA 5BREA 4FWLA 3QFUA 2GWJA 5AZIA 3VF6A 5AFUA 1QQOA 4H0TB 4M7XA 3SJHA 4MO4A 5ELZA 4CBXA 3ID8A 1HX1A 3AAQA 1NGAA 3C7NB 3AARA 2YHYA 3H1QA 4FWMA 3WT0A 3SMPA 4EAHD 5F2RA 2E88A 5KPTA 3L4IA 2E2OA 4DQ8A 4BQZA 3UE5A 4FOEA 2QWLA 4BRPA 4CZEA 1TUYA 2D0OA 2Q0UA 3H1VX 4CZGA 5BN9A 5JLFA 4BQLA 5AQXA 5BRFA 1H1VA 4BR4A 3A5LC 2YCHA 2GWKA 2Q31A 1HKBA 3OHRA 4CD3A 3U4LA 3D2EA 4H5WA 1QQNA 3CJ7A 3FE1A 1DEJA 3QDKA 2E2QA 3VEXA 4RCHA 2CH6A 3GBTA 3U9ZA 1NGJA 2P9NB 4A62A 2P9SB 2ITMA 3ULEB 4CZIA 1GLJO 1QQMA 2GELA 3O6WA 4WQ4A 3L6QA 3QBWA 3FGUA 3AAPA 2P9UB 4JHDA 4C23A 3LM9A 3CJBA 1QZ5A 1YVNA 5TKYA 3U8XA 3UKUA 4BRLA 4RWTA 4EFHA 3LDPA 4PKGA 3LDNA 1BWFO 3ENOA 1MWMA 2ZF5O 1GLCG 4JD2A 4XH4A 4CBUA 4BRCA 4BRKA 5AQJA 3I8BA 3HZ6A 3O80A 1ATRA 4FWSA 1MA9B 3CIPA 1GLFO 3LM2A 2P9KB 4XH1A 4GNIA 2E1ZA 3ZETA 3AY9A 2I7PA 4BRDA 3LL3A 3BEXA 3DXKA 1XC3A 3FZKA 2E2PA 4K43A 2ZGYA 2UYTA 3WEEB 1E4FT 4JAXA 2H3GX 3HBTA 3VEYA 1RDWX 1K8KB 3GG4A 5F0XA 4A61A 4H0XB 2HF3A 1BOTO 1S3XA 1C0GA 2Q0RA 5E84A 4H0YB 5AQPA 2FSKA 1BDGA 2FLOA 5FPNA 5AQVA 4BR9A 3IUCA 5ADXA 2PBDA 3FFKB 2FF6A 3FLCO 3VEWA 5I9EB 2ASOA 3A5OC 4BRAA 4ISFA 1NGDA 3D7EO 1QHAA 4FWOA 2IVOA 5ADXH 4KBOA 4Z94A 1JCFA 3DWLA 2PAVA 2CGLA 3VGLA 5AQNA 3MN7A 2A5XA 2D1KA 1GLEG 5AQIA 4WQ4C 4PL8A 5AZJA 5BPNA 5BPLA 4LC9B 3CJCA 3EKSA 2Q36A 3MMVA 1NGBA 5EX5A 5FPMA 4H5TA 1NGCA 1NLVA 4Y0WA 4CZKA 2P9PB 3R9PA 4CZLA 5F1XA 1BA1A 3SLCA 3MN5A 1V4TA 3C7NA 4IO8A 3DAWA 5KPZA 3LDQA 4BG8A 4FPBA 3MN6A 3SK3A 4FL9A 4AM7A 3RSEB 1QZ6A 2FF3B 3ENHA 3HTVA 3VEVA 3A8YA 2QXLA 3GDQA 3QB0A 4CZJA 1GLAG 4BR0A 1T6CA 2J4RA 1Y64A 2IVPA 2YJEA 2ZWHA 3A0IX 3EL2A 4BC3A 4CD1A 5FPDA 2QWRA 4BREA 4H5VA 5AR0A 3CQXA 1ZC6A 1Z6RA 4DB3A 3TU5A 1D4XA 1KAZA 5AQSA 3EN9A 3DXMA 5AQTA 3GL1A 3MCPA 3O1BA 4B1VA 1BUPA 1NGHA 3WXLA 4BG9A 2P9LA 3ULEA 4FWPA 3ZEUB 4BRGA 3CHWA 3UKRA 2P9UA 3VESA 4FWQA 4O8KA 3EZWA 3VPZA 4BR2A 3D2FA 2W40A 3IFRA 4CZMA 1LCUA 1WUAA 1NGGA 3VF2A 4DHYA 4M63C 3VETA 4NB4A 4HWIA 1R59O 4XH5A 4BRMA 5AQUA 4L3QA 5AQMA 2QWOA 4I6MA 3JXUA 1LOTB 1XUPO 2IVNA 5AQHA 1U2VB 3CERA 1NGFA 4XEIA 3D2EB 3U9DA 3JS6A 4MLHA 5CE3A 2P9KA 1ZBSA 2V7YA 1HKGA 3MDQA 5B8HA 3R6MA 2CGJA 1KAYA 3L0QA 4BC2A 1K8KA 2A42A 1SZ2A 1TUUA 3VOVA 3M6GA 1YAGA 4CBWA 3ZX3A 1NWKA 5AQWA 4B1XB 2YJFA 1HUXA 4JHDB 5AQGA 3WQTA 5KPRA 2D4WA 3R8EA 3ATUA 3DJCA 1E4GT 3VERA 3UKUB 3O4WA 2GTDA 1ATSA 3WUHA 4PKHA 1J6ZA 3VGMA 1ATNA 4H03B 4IZ9A 1GLBG 1XQSC 4B1ZA 4CZFA 1YXQA 2VWBA 3ZX0A 2E20A 2E8AA 2CGKA 1RFQA 2WUSA 1OKJA 3LDLA 2V52B 5JICA 2YHXA 2NRHA 3CQYA 4WQ5C 4FSVA 3FZHA 2Q2RA 4K41A 4BC4A 2FXUA 3SMSA 3FZFA 3O1WA 4BVOA 5AQOA 2GEMA 3VGKA 3VEZA 3QFPA 1IG8A 1BA0A 2BUPA 4BGAA 1TYQB 5EOYA 1T6DA 4WYBA 4H5RA 4A2BA 1P8ZA 5BRHA 5EVZA 2F9WA 2I7NA 4DCHA 1MWKA 1S22A 4QS8A 3H46O 4B1YB 1NBWA 3CJAA 1G99A 4A2AA 3J8AA 3S41A 2Q1NA 4BRFA 2E1YA 2CH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MN9A 1BIUA 3GE1A 1UAXA 3TWHA 1T44A 3RSEA 3F9MA 4I2PA 2DPNA 2HF4A 4QAGA 3QEIA 3CQ8A 4DKWA 2G8FA 2F9TA 3J7YP 1NKBA 5KRSA 1T7BA 4K25A 4IEIA 2I61A 3V4IA 4HCBA 3FZMA 4M7YA 3L2UA 3G25A 5GIPA 1A5WA 2UXDK 2N66A 4FOIA 2ZE2A 3EO3A 5AQQA 1MU2A 1S6QA 4L8RB 5HLFA 4FJLA 2P9NA 3LP2A 1HMVA 3ZX2A 1BO5O 2B6AA 4N5SA 4G1QA 2OZSA 4E7KA 4K42A 1O13A 3ATVA 3RMAA 4NLBA 4Z4HA 3P4IA 1CZBA 2KQ2A 5KQ8A 2VCPA 1TV6A 3KZBA 1ZVGA 3KD5E 3TTFA 1WAFA 3ZT2A 1J5EK 1Z05A 3CF5L 3RTVA 4OPJA 4KH5A 4E7LA 3PX0A 2F8TA 4UY8O 2BH1A 4M3RA 1YF5L 3KOYA 3AVLA 5CY4A 2P9LB 5BR9A 1J53A 2YILA 3S5TA 3KP0A 4JEPA 2QWNA 2YKMA 3D2FB 4OJRA 2HMIA 3AVIA 1QQCA 2VYPA 3HL8A 3NFAA 2A41A 4KAZA 3PLAA 4UJ0A 1NGIA 2F7TA 1RT3A 2DY4A 3HVRA 1RT4A 4FLYA 5C25A 5GAGP 5CZ2A 4QCLA 4DU1A 4DSEA 5SWMA 1ZBUA 2AP1A 3DMJA 3H6EA 2HNZA 1DGKN 2ASMA 4JN4A 1T1TA 5TKWA 3CJ1A 3OBYA 2QW9A 1KVCA 4BROA 2QWQA 1P0AA 4OX9K 4CGIA 1DJTA 3QEXA 3THVA 2JWLA 1HYZA 1GPSA 3TAQA 4ZTJA 4B9QA 1B92A 4AM6A 3OYHA 1L3TA 2G8IA 1QSYA 3L2QA 1Q18A 2VGMA 3CJ9A 3ZSXA 2G8KA 1OMYA 4AHVA 4CK1A 1LAWA 4FWKA 3V9XA 1U45A 2P1JA 3CI5A 2O8EB 5AQFA 1L3UA 2BE2A 1NMDA 3M1FA 1GLDG 2W41A 4JYAK 3IDHA 1NJXA 4DSLA 4OGEA 3NH2A 4GV3A 1D8YA 2A3ZA 2V51B 3IRXA 4AH9A 1DTQA 1VSMA 4BR5A 3SAGA 3CM6A 1RDUA 3O08A 4DV0K 2NLXA 3AVFA 3KOWA 4JRPA 4LH5A 2EHGA 3P5JA 4PA1A 2W42A 3HSCA 2HBJA 5BREA 3QFUA 1XRSB 5AFUA 1QQOA 2E6LA 4C8MA 3ID8A 1UA0A 3AAQA 3Q7BA 2WBNA 1WAJA 3AGRA 4EAHD 4CHPA 1KV0A 4C8OA 2QEXN 3K5OA 3MX5A 4CZGA 3CCQN 4DTRA 3VQ4A 3C6UA 3PSFA 4E19A 4BR4A 3WNGA 2XRIA 3K5NA 2Q31A 2KZMA 4ID5A 4GMJB 1B7DA 3U4LA 3D2EA 3J81O 4A5BA 3PO4A 4CHYA 4DLGA 3GBTA 3D0PA 3U9ZA 1B9DA 4DV1K 4A62A 2C1GA 5JVHL 2P9SB 2ITMA 1EO1A 4DSIA 3MEGA 4WQ4A 3QBWA 1BRZA 1JL1A 5C12A 2KYQA 1HR0K 1BISA 5LL6Z 1Q7YO 3OJUA 3LM9A 3SQ2A 3RMDA 1LV5A 4K8XA 3ZYYX 2RHKA 3HK2A 3AA2A 3LDPA 4KHPK 3UIQA 4JD2A 3NDKA 4C1NK 4CJ3A 1YHQN 4DV3K 2HHQA 1ILYA 1BI4A 3I8BA 1KRPA 1TGOA 4CHQA 4KH6A 3ZSWA 2ITGA 1FXXA 1MA9B 1GLFO 4WFBL 5CY0A 2P9KB 4XH1A 3ZETA 4BRDA 1LAVA 1UWBA 3LL3A 2W00A 1XC3A 3O9UA 3EEQA 4BDZA 3DLHA 2E2PA 2IAJA 3DYAA 1RNHA 1QSSA 2UYTA 3WEEB 4B9MA 1POIA 1MYNA 4F2SA 4N56A 1C0GA 3VQ6A 1Q8IA 2KW4A 3I55N 1N4NA 1BDGA 2GL1A 1VQLN 1S9GA 4F3OA 1ZVEA 1WNSA 2PBDA 1TL3A 1X9MA 3FLCO 5I9EB 3SAFA 5C10A 1RTDA 1YTAA 1VRTA 3O3FA 3D7EO 4E7JA 5ADXH 4KBOA 4Z94A 1JCFA 3DWLA 4JI0K 4JK7A 4FJ7A 2PAVA 4B9UA 1VQKN 3CD6N 3VGLA 5AQNA 3MN7A 5I3UA 1RBTA 1GOCA 4DQPA 4WQ4C 5CYQA 4LC9B 3EKSA 4YOUA 1XNRK 2D56A 1FKPA 5EX5A 4E1NA 4OPKA 3HOSA 4H5TA 3MWPA 4CZKA 3G0ZA 2P9PB 3E9OA 1DLOA 4GVEA 3SLCA 3S9HA 4EZ9A 2G8WA 3C7NA 2KFZA 3QESA 3DAWA 3L56A 3LDQA 1CXUA 1KCFA 3MN6A 5HRNA 4AM7A 3RSEB 3ENHA 2JWKA 4RW6A 1NJZA 1HNXK 2HHIA 3EE9A 4KHWA 3QB0A 4WCEL 1I2UA 1DT9A 1GLAG 3M5RA 1Q82O 2NNWA 4BC3A 3A0IX 1JXEA 3CM5A 5K14A 1NKEA 2QI2A 1B3CA 3P1GA 1IKXA 4DB3A 4JK8A 2E6MA 3L3UA 3EN9A 1ZBIA 4DF4A 5AQTA 4FLXA 3SPZA 1E3MA 3HJFA 2VG6A 3HPGA 1JZBA 2P9LA 4WE1A 4FWPA 4B9TA 1I94K 3SQ1A 2P9UA 3VESA 1B9FA 2YIPA 4FWQA 4O8KA 1BGXT 3EZWA 3D2FA 2PY5A 1T0ZA 3KP1A 1NGGA 1R59O 4XH5A 1LW0A 5AQMA 4JI1K 2QWOA 3F2KA 4FJKA 3NF9A 5HRSA 1LOTB 1JLEA 3C6HA 5AQHA 4FM1A 2YHBA 4XEIA 4W5OA 3SUPA 4AQYK 2NRXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MN9 A;  1BIU A;  3GE1 A;  1UAX A;  3TWH A;  1T44 A;  3RSE A;  3F9M A;  4I2P A;  2DPN A;  2HF4 A;  4QAG A;  3QEI A;  3CQ8 A;  4DKW A;  2G8F A;  2F9T A;  3J7Y P;  1NKB A;  5KRS A;  1T7B A;  4K25 A;  4IEI A;  2I61 A;  3V4I A;  4HCB A;  3FZM A;  4M7Y A;  3L2U A;  3G25 A;  5GIP A;  1A5W A;  2UXD K;  2N66 A;  4FOI A;  2ZE2 A;  3EO3 A;  5AQQ A;  1MU2 A;  1S6Q A;  4L8R B;  5HLF A;  4FJL A;  2P9N A;  3LP2 A;  1HMV A;  3ZX2 A;  1BO5 O;  2B6A A;  4N5S A;  4G1Q A;  2OZS A;  4E7K A;  4K42 A;  1O13 A;  3ATV A;  3RMA A;  4NLB A;  4Z4H A;  3P4I A;  1CZB A;  2KQ2 A;  5KQ8 A;  2VCP A;  1TV6 A;  3KZB A;  1ZVG A;  3KD5 E;  3TTF A;  1WAF A;  3ZT2 A;  1J5E K;  1Z05 A;  3CF5 L;  3RTV A;  4OPJ A;  4KH5 A;  4E7L A;  3PX0 A;  2F8T A;  4UY8 O;  2BH1 A;  4M3R A;  1YF5 L;  3KOY A;  3AVL A;  5CY4 A;  2P9L B;  5BR9 A;  1J53 A;  2YIL A;  3S5T A;  3KP0 A;  4JEP A;  2QWN A;  2YKM A;  3D2F B;  4OJR A;  2HMI A;  3AVI A;  1QQC A;  2VYP A;  3HL8 A;  3NFA A;  2A41 A;  4KAZ A;  3PLA A;  4UJ0 A;  1NGI A;  2F7T A;  1RT3 A;  2DY4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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