3FZMA

Crystal structures of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitors
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel adenosine-derived inhibitors of 70 kDa heat shock protein, discovered through structure-based design
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fzmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fzmA04
4BRDA 3JXUA 5BN9A 3VGLA 3TU5A 4F9OA 5ADXA 4IXCA 1P8ZA 1KAXA 2YI1A 4BC5A 1JCFA 2F9TA 4DCHA 5KPTA 3HM8A 1E4GT 3LL3A 3RSEB 4E1JA 4Z94A 5FPDA 5AQMA 4GNIA 1X3MA 3DXMA 3MCPA 2OANA 1Q18A 3DAWA 4O8KA 4WQ4A 2IVNA 1JCEA 4H0PA 2E88A 2KHOA 3WT0A 3FZLA 2Q36A 2E1ZA 5KPRA 5FPMA 4IWVA 1ZC6A 1ZBSA 3HSCA 1IJJA 2H3GX 3ID8A 1DKGD 4A2AA 5BPMA 4QS8A 3QDKA 3EZWA 5ADXH 1BUPA 2P9LA 2NZTA 3CJBA 3GG4A 3O80A 3AAQA 3BF1A 2CGKA 3AARA 4BRPA 4M7YA 5AQJA 5LJVA 1TUYA 2A6AA 4H0XB 4JHDA 3LM9A 2GWKA 4H0TB 4PKGA 5AQTA 3FLCO 3SJHA 4WQ5A 2IVOA 3RSEA 4CZIA 3O4WA 3U9DA 1SZ2A 3H46O 4FL9A 3W0LA 2AP1A 3ZX3A 3R9PA 4BRIA 3VESA 4CZJA 4FWLA 3KVGA 5AQHA 4BRNA 2QWNA 1BA0A 2ZWHA 4B1WB 4RWTA 2FF3B 2D0PA 2Q0UA 4BRCA 4NO7A 4DB3A 4I6MA 1QQOA 4H0YB 3H1VX 4B1XB 2Q0RA 3LDNA 4CD1A 2FF6A 1Z6RA 5AQPA 2QM1A 3LM2A 1XQSC 1T6DA 4H5WA 4MO5A 2J4RA 2F9WA 5AQSA 3CETA 1NGHA 4HTLA 1S22A 4HWIA 2YCHA 3O5BA 4ISGA 1QZ6A 4BRMA 1RDWX 5AQIA 5BN8A 1OKJA 2P9UB 5JLHA 3SLCA 2GELA 3ZX0A 2GWJA 5CE3A 1KAYA 3IMXA 5AFUH 4H5NA 2GUPA 4GY2B 4WYBA 2NLXA 3O08A 3MK6A 3AY9A 5FPNA 3M6GA 3EKSA 2A41A 1ATNA 4H5VA 2W40A 5AZIA 4BR4A 1NGAA 1ZXOA 3M1FA 2IVPA 5BRHA 2EWSA 3JS6A 4FWOA 3U9ZA 4J8FA 2I7NA 4JNEA 4BG8A 1SAZA 1QHAA 2E2QA 3CJAA 4H0OA 2A5XA 3ZX2A 2P9UA 3VGKA 4BQZA 4FWSA 5F1XA 3H3NO 1RFQA 3VPZA 4IZ9A 2P9IA 2E20A 3ENHA 3BEXA 4PL7A 2E1YA 3ENOA 2HOEA 2ASPA 3VEXA 4MLEA 3WXKA 2FXUA 2QWMA 4IO8A 1HUXA 1TYQA 1K8KB 1NGDA 4ISEA 2FLOA 3LDOA 4DHYA 4JD2A 3GDQA 1BWFO 2D1KA 4M63C 2BTFA 2UYTA 3R8EA 5BPLA 5TKYA 3CQXA 3HI0A 2E8AA 1YAGA 2GTDA 1XUPO 1NGJA 4M7XA 3VF4A 2Q31A 3GOIA 4A62A 1S3XA 4YDUC 4CZGA 4BRHA 4BR5A 5BR9A 3O1BA 3VENA 1QQNA 1GLEG 2D0OA 3UB5A 3ATUA 3CI5A 2ASOA 2D4WA 5KQDA 3VEVA 1IG8A 4BR7A 1YUWA 3F9MA 5BRFA 2Q97A 3BP8A 5KPZA 3EO3A 2P9NB 5EXWA 1DGKN 2P9PB 2E2OA 4BVOA 5E84A 4XH1A 1MA9B 3ZETB 4CZEA 3C7NB 5AR0A 1MWMA 1K8KA 4A61A 3O6WA 2YHXA 4XH5A 5AQUA 4JAXA 3CJ9A 3R6MA 2HF4A 3WEEB 2ZGYA 5EY4A 4EIAA 2QW9A 1WOQA 4H5TA 4XH4A 5AQZA 1C0FA 3ULEB 2YHYA 2HF3A 4CBWA 4FSVA 3TPQA 4CBUA 5AQXA 3H45C 3WXIA 4Y0WA 4BRFA 5AFUA 1ESVA 3VERA 2VCPA 3D2FB 4AM7A 3AAPA 4BR2A 1GLDG 3VEWA 2P9PA 5BRDA 5AQQA 3WXLA 1MDUB 5FPEA 3ZETA 1GLFO 1GLAG 5AZJB 4K43A 1BO5O 3IDHA 5EOYA 1GLBG 1BA1A 2W41A 4NB4A 2VYPA 2VWBA 1U2VB 4PKIA 5KQ8A 4BQLA 3H6EA 1Z05A 3DWLA 1KXPA 3M3ZA 3KHYA 3BF3A 3MN7A 4B9QA 3QMLA 3ULEA 2YJEA 4FWPA 4BVPA 2NRHA 4EFHA 2FSNA 3DXKB 2HMPA 1RGIA 5JICA 3MN6A 3H1QA 4PL8A 3L4IA 1NLVA 4BRKA 1XC3A 5BPNA 1C0GA 3I8BA 2PBDA 2E2PA 3OHRA 5ELZA 1HPMA 3VEZA 4BRLA 3SMPA 5AZJA 2Q1NA 4EHUA 3WQTA 3CJ7A 4B1UB 2CH5A 3UE5A 5I9EB 2P9KB 4LC9B 1U2VA 3HBTA 2WUSA 3VEYA 4BC2A 4FWQA 2BUPA 2ASMA 4JN4A 1V4SA 3CJ1A 1QZ5A 4MLHA 1HKCA 3DJCA 1NGBA 3FZHA 2A3ZA 5E26A 1HKGA 5F0XA 3MN5A 2V51B 3DXKA 2V7YA 1BU6O 3VOVA 4EHTA 2QXLA 4YDUA 3VEOA 3BUZB 3LDLA 1NWKA 3O1WA 1NBWA 4FWNA 1LCUA 1EQYA 3B8AX 4FOEA 2YJFA 5JLFA 5AQKA 3FZMA 2QWOA 1YVNA 1BDGA 4AM6A 3L6QA 3A5LC 3HTVA 3I33A 4QS7A 5AQOA 2ITMA 3D2EB 5AQRA 3QBWA 3U8XA 4JHDB 1U6ZA 4B1VA 3FZKA 4BRGA 3QICA 1WUAA 1LOTB 2FSJA 4BGAA 1HLUA 4FOIA 5AQFA 4QS9A 3ATVA 4BRAA 4XEIA 3GL1A 3O8MA 3G25A 3WXJA 3WQUA 2CGJA 4B1ZA 3EN9A 1NGIA 3QFPA 3P4IA 4KBOA 3GBTA 3UKUB 2Q2RA 4I6MB 4L3QA 3WUHA 3C0BA 2GEMA 2DPNA 4IJNA 4FO0A 3H3OB 3LDPA 3D2EA 4WQ4C 3FR0A 3W3DA 4BC3A 5LJWA 2QWQA 2CH6A 4PKHA 1MWKA 5EVZA 2QWPA 1R59O 2P9NA 4CZFA 4BC4A 4CZLA 2P9SB 3CERA 4BG9A 1NGGA 4IJAA 1V4TA 1Y64A 3C7NA 3QBXA 5F2RA 3MDQA 1KAZA 3IUCA 4H03B 3D7EO 1ATSA 3L0QA 3S41A 1HX1A 4MO4A 3UKRB 2V52B 4O5FA 2FSKA 4BRQA 3FZFA 4H5RA 4FPBA 3J8AA 3VETA 3ZEUB 3VGMA 3WEEA 3UKUA 1HJOA 5AQGA 5AQVA 3CIPA 4FWMA 4WQ5C 5EX5A 1BOTO 4BGBA 1E4FT 1TUUA 3SK3A 3A0IX 4BREA 4CD3A 3EL2A 5AZIB 1HKBA 3GE1A 2AA4A 2PAVA 1X9JA 4K25A 3MN9A 4C23A 2ZGZA 2YHWA 1H1VA 3D2FA 4BR9A 2E2NA 4DQ8A 5AQLA 2P9SA 3QFUA 2QWLA 5AQYA 1D4XA 4CZMA 3VF6A 3A8YA 3QB0A 4B1YB 2I7PA 3U4LA 2QWRA 1JCGA 2P9IB 3VF2A 1BG3A 3CJCA 4FWRA 5LY3A 3MMVA 3UKRA 1QQMA 1GLLO 3A5MC 5AQNA 4K41A 4RCHA 3FE1A 2V7ZA 2IIRA 1NGFA 3ZEUA 1T44A 1SQKA 1NGCA 2ZF5O 3CQYA 2A42A 3FGUA 1TYQB 1NMDA 4CBXA 3A5NC 1NGEA 4JD2B 3SMSA 3A5OC 1GLJO 4K42A 2A40A 4BROA 4ISFA 5AQWA 3HZ6A 3DXMB 4FWKA 4CZKA 5B8HA 1J6ZA 1CZAN 1NM1A 1T6CA 4FPAA 1ATRA 1DEJA 4EAHD 3KZBA 4A2BA 3CHWA 3IFRA 4CI6A 1GLCG 4H0VB 4CZHA 5BREA 2CGLA 2P9KA 1YXQA 3EKUA 4CJ7A 1G99A 3LDQA 1X3NA 2P9LB 4BR0A 5JMVA 4RTFD 3FFKB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RMAA 4CJQA 3VGLA 3VQBA 2OCEA 1P8ZA 4OKJA 5M1QA 1KAXA 4E1NA 4KHQA 1JCFA 2O8CB 4DUYK 4B3MK 1HYZA 3A2FA 1BQMA 4K0KK 1RT4A 1C56A 2LSNA 4GNIA 1X3MA 4DG1A 3MCPA 1Q18A 1Q8IA 2FBVA 3RVCA 2DFFA 4WQ4A 4FJXA 1TL3A 4DR5K 4CIFA 2UUBK 3NCIA 4KAZA 3FZLA 2Q36A 1VNAA 5FPMA 4ID1A 2NUBA 1VSMA 1ZBSA 3HSCA 1JLAA 1XMQK 3QDKA 3TABA 4DR6K 4LH5A 3GG4A 5FRMA 1LAVA 3AAQA 1HNZK 4W5OA 1HYVA 4BRPA 3THYB 2KFZA 5LJVA 3OYDA 4H0XB 3OYEA 3QINA 3V1QA 1VQLN 4H0TB 4A57A 2W00A 5AQTA 4I2PA 4CF0A 2VWJA 3SJHA 2IVOA 3RSEA 4GMJB 3U9DA 1RT7A 2E4LA 1BCOA 3KVGA 4B9TA 4FJGA 3C6HA 3RR8A 3V4IA 3AA5X 3EY1A 4PUOA 3MXMA 3BK3C 2D0PA 3DRSA 4DR1K 3CCRN 2PYLA 4BDPA 3J7AP 2G8WA 4NYFA 1GPTA 5JENA 4K8ZA 4X64K 4H0YB 4V1DC 3H1VX 2YNIA 1GOBA 1RBUA 4B1XB 1ZBFA 1VSEA 4NYNA 4J2EA 3CMAN 5HP1A 1BGXT 1NMNA 4MO5A 1VK0A 4JKEA 2LY6A 1RDWX 2XO7A 1OKJA 5JLHA 1FH3A 3KK7A 1VSIA 2GWJA 4AB0A 1KAYA 3IMXA 5MLCQ 4IOAL 5C15A 5JVHL 1TK5A 3S9HA 1S6PA 4GY2B 4WYBA 3AA4A 4JKGA 3KLFA 5E41A 4LH4A 3M6GA 1W9HA 3PIPL 3EKSA 1QVGM 4DSEA 2KBJA 1NU0A 5AZIA 1NGAA 1ZXOA 4M41A 2IVPA 3B6OA 3EEQA 3JS6A 4HUFA 4M3YA 4FWOA 3U9ZA 3HRGA 4J2DA 3MXIA 2FBTA 3OYHA 1I39A 3ZX2A 3SZ2A 1TKZA 2P9UA 3VGKA 3THVA 2W42A 4FWSA 3H3NO 3SAFA 2XHBA 3RWUA 1RFQA 3THWB 5C2FA 4KI6A 4KHYA 3P38A 3ENHA 4CHYA 4PL7A 2E1YA 3OYJA 4DTRA 1WB9A 1X9SA 1B92A 4MQ3A 1O1WA 4MLEA 3WXKA 1RTDA 1U45A 4LF5K 1IO2A 2DFEA 2O8EA 2B5JA 1NK7A 5C0YA 1Z25A 1NGDA 4YOWA 3LDOA 3QLHA 4B9UA 3I0SA 3R8EA 3BY5A 3RR7A 3J80O 3HI0A 2E8AA 4BE1A 1YAGA 2GTDA 4M3UA 3VF4A 3HP6A 5DMRA 1CXQA 4JS4A 4CZGA 4BRHA 4BR5A 4B9MA 5BR9A 3VENA 3V9ZA 2LR3A 3CI5A 2F8SA 5KQDA 1JKHA 1IG8A 3SV4A 1YUWA 3F9MA 2G8IA 2D0AA 3SBTA 5IWAK 5EXWA 1X9WA 2E2OA 4FVMA 4DLGA 3NAEA 3V9WA 3P31A 1WBDA 1CZ9A 4ILJA 4XH5A 4BWMA 1K8BA 4ZTFA 3CPWM 1YVUA 4DU4A 1UGLA 2HF4A 2ZGYA 3KLEA 4O0JA 2LJMA 5EY4A 1IKXA 1T03A 4FK2A 1EP4A 3SI6A 1VQ7N 1C0FA 4CBWA 3DI6A 3QIOA 4GV6A 4HHFA 5AQXA 4CJ4A 2OZSA 3VERA 3IAYA 2G8FA 3D2FB 4JKCA 1K9MO 1LAWA 1IBLK 3AAPA 4BR2A 4DQIA 3OYMA 1KD1O 3WXLA 1S1XA 2PZSA 1MDUB 3O9TA 1RTJA 3DYAA 3ZSVA 3NF7A 3AVHA 3KKSA 1VQPN 4X65K 3Q7BA 2I5JA 2ZE2A 4NB4A 4DQPA 4PKIA 1SEGA 1LWEA 4BQLA 3HOSA 4YORA 3OA9A 4GV3A 5KRSA 1KXPA 2HNZA 4AAZA 2D0CA 3M3ZA 3KHYA 3E9LA 3CCSN 1L3UA 3ULEA 2E5LK 4FWPA 1KRPA 2QKKA 2HMPA 1RGIA 3MN6A 4CGDA 4UY8O 1I3AA 3MEDA 4M3RA 3CCVN 3I8DA 1JXCA 2WBNA 1XC3A 4WE1A 4YFUA 1HR0K 3E1YA 1HPMA 1N32K 4BRLA 3SMPA 4M3WA 4BE2A 3DM2A 2Q1NA 2QXFA 4C8OA 3WQTA 1TAQA 1LQQA 3HO1A 3MAQA 1BI4B 3QEWA 5HROA 3DLHA 4LC9B 3HBTA 1RBVA 2UU9K 4CF1A 2BUPA 1Y97A 2KKZA 4JN4A 2OZMA 3ENBA 4Z4IA 4LF6K 1UA0A 1XRSB 3FZHA 4CJEA 3HL8A 4CEFA 3SQ2A 4GVMA 4CJ3A 1HKGA 2F96A 5F0XA 4A5AA 4DTMA 3OS0A 3MWPA 1PE4A 1YI2N 2MBKA 1OZZA 3VEOA 5HRRA 2KJAA 5CY0A 4HVJA 4FWNA 1HQUA 4IBNA 4Q5VA 4IG0A 5KGWA 4LFCK 4C8KA 1S1WA 3OJUA 3FZMA 3HYFA 3HVTA 1RT3A 3AVJA 3KOZA 1NK4A 4CE9A 4E7LA 1REVA 4KTZA 1U04A 4CIGA 2WC9A 3CCEN 2JLEA 3LDSA 1SKWA 4NCBA 3D2EB 3C6UA 2E6MA 3QBWA 5K14A 4OLBA 4N76A 5CYQA 3U8XA 1ASVA 2W6LA 4B1VA 3QICA 1N34K 1WUAA 4CJ5A 2UXCK 1RTHA 4FOIA 4DV7K 2B6AA 3ATVA 1RBTA 4BRAA 4XEIA 1SN1A 4JS5A 1NKCA 3GL1A 3VQQA 4CF9A 3OTOK 4N41A 2LN8A 4OPJA 4FJ5A 4KB1A 1W97L 3DLLL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RMA A;  4CJQ A;  3VGL A;  3VQB A;  2OCE A;  1P8Z A;  4OKJ A;  5M1Q A;  1KAX A;  4E1N A;  4KHQ A;  1JCF A;  2O8C B;  4DUY K;  4B3M K;  1HYZ A;  3A2F A;  1BQM A;  4K0K K;  1RT4 A;  1C56 A;  2LSN A;  4GNI A;  1X3M A;  4DG1 A;  3MCP A;  1Q18 A;  1Q8I A;  2FBV A;  3RVC A;  2DFF A;  4WQ4 A;  4FJX A;  1TL3 A;  4DR5 K;  4CIF A;  2UUB K;  3NCI A;  4KAZ A;  3FZL A;  2Q36 A;  1VNA A;  5FPM A;  4ID1 A;  2NUB A;  1VSM A;  1ZBS A;  3HSC A;  1JLA A;  1XMQ K;  3QDK A;  3TAB A;  4DR6 K;  4LH5 A;  3GG4 A;  5FRM A;  1LAV A;  3AAQ A;  1HNZ K;  4W5O A;  1HYV A;  4BRP A;  3THY B;  2KFZ A;  5LJV A;  3OYD A;  4H0X B;  3OYE A;  3QIN A;  3V1Q A;  1VQL N;  4H0T B;  4A57 A;  2W00 A;  5AQT A;  4I2P A;  4CF0 A;  2VWJ A;  3SJH A;  2IVO A;  3RSE A;  4GMJ B;  3U9D A;  1RT7 A;  2E4L A;  1BCO A;  3KVG A;  4B9T A;  4FJG A;  3C6H A;  3RR8 A;  3V4I A;  3AA5 X;  3EY1 A;  4PUO A;  3MXM A;  3BK3 C;  2D0P A;  3DRS A;  4DR1 K;  3CCR N;  2PYL A;  4BDP A;  3J7A P;  2G8W A;  4NYF A;  1GPT A;  5JEN A;  4K8Z A;  4X64 K;  4H0Y B;  4V1D C; 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