1TYQB

Crystal structure of arp2/3 complex with bound atp and calcium
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
VLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 57
structure length 208
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1tyqB02
3JS6A 4K41A 4B1WB 4CZMA 1V4SA 3DWLA 3ZETA 5KPZA 2P9KB 5AQGA 3D2EA 4JNEA 1T6CA 4WQ4A 4CZKA 4BR5A 3A5LC 4A2BA 4M63C 3O4WA 3EL2A 5AQWA 4BGAA 1P8ZA 3FLCO 1NGIA 4FOEA 1ATRA 5AFUA 5LJWA 2E2PA 3KVGA 5AQXA 3SK3A 1KAXA 4K25A 3HSCA 3QB0A 2D0OA 3CIPA 3VETA 4J8FA 1T6DA 1YXQA 2D0PA 3GBTA 4BR4A 4FPBA 2GWKA 2QWPA 2A5XA 4CBXA 3MK6A 2IVNA 2E20A 4BRLA 1IG8A 4CI6A 1K8KA 2P9LB 5BREA 1H1VA 3CJBA 1WUAA 1YAGA 5FPEA 1NGFA 1NLVA 2P9UB 1MWKA 2GWJA 3UKUA 1NGBA 5EX5A 4I6MB 3D7EO 2A3ZA 4FO0A 5AQHA 2H3GX 3QBWA 3ENHA 4CZJA 3VEZA 2CGLA 3ID8A 1WOQA 1U2VB 3CJ1A 2YJFA 3H46O 3P4IA 4ISGA 1NGAA 2PAVA 3SJHA 4CBUA 3CHWA 2GEMA 5EVZA 4H5NA 1X3MA 4H5TA 2E1ZA 2FXUA 3B8AX 4FWNA 5AQLA 3OHRA 5AQRA 1HJOA 3SMSA 1BG3A 2Q97A 3QMLA 4XEIA 2F9WA 5TKYA 4NB4A 5BPNA 5KQDA 4A62A 4DB3A 3H1QA 1NGDA 4BRHA 3ZX3A 4BR7A 4CZIA 1G99A 3VF6A 1QZ6A 4JAXA 3LDPA 5CE3A 3GL1A 1LOTB 3MN6A 1E4GT 2GUPA 1GLJO 5AQOA 1JCFA 3VEWA 4MLHA 5AZIA 2DPNA 1HKBA 5KPTA 4BRNA 5ADXA 4H5WA 4IO8A 3SMPA 3FZMA 3CJ7A 5AQUA 4FWRA 4B1VA 4EIAA 2FSKA 4CD3A 4IXCA 4HTLA 3VEVA 4QS7A 1HKGA 2AA4A 1SZ2A 3GDQA 4B9QA 4MO4A 3U9DA 1GLFO 5AQKA 3ZEUB 1YUWA 1BUPA 3MMVA 2EWSA 3WQTA 1V4TA 3VOVA 1ZBSA 4BRKA 5AQZA 4AM6A 1X9JA 3IMXA 4YDUC 1XQSC 2P9KA 2Q1NA 4IWVA 1C0FA 1NGJA 4K42A 3WXIA 4BRPA 3DJCA 3DXKB 2Q0UA 4PKHA 2NRHA 3LDOA 3EKUA 3LDLA 3EN9A 2PBDA 2IVOA 4FWKA 4FPAA 4EHTA 1QQMA 4BQZA 5JMVA 1NMDA 3IFRA 3R6MA 4CZFA 4H0TB 4NO7A 3BUZB 2NLXA 1XC3A 3CJAA 2D4WA 3CJ9A 1HLUA 4BR0A 4FSVA 4QS9A 4BR2A 3LM2A 2CGKA 1XUPO 1BWFO 3O1WA 2QM1A 3G25A 1LCUA 1NM1A 2P9SB 4BC4A 3HBTA 2P9LA 4WYBA 4JHDB 1Z05A 4FWSA 3C7NB 1OKJA 3AAPA 3L0QA 1RGIA 2Q2RA 3J8AA 1Q18A 2P9UA 2YJEA 1Z6RA 3M6GA 2P9NB 4MO5A 4XH5A 5AQFA 4I6MA 4JD2B 3QDKA 1YVNA 3HTVA 3U4LA 3CETA 5BPMA 2P9IB 4Z94A 5AQTA 3ULEB 4BRGA 2IIRA 3D2FB 3TU5A 1U2VA 3R8EA 4BRDA 5LY3A 1TUYA 4CZLA 1T44A 4BRQA 5AQSA 2E8AA 3KZBA 3CERA 4WQ4C 4B1ZA 4B1XB 4JN4A 2W40A 4BC2A 1QHAA 2V52B 4B1YB 5AQQA 1X3NA 3I33A 4XH4A 3ZX0A 4Y0WA 2VCPA 2ITMA 2QWOA 4A2AA 2E88A 1BU6O 3C0BA 2QWMA 5BRHA 3CI5A 3VESA 3GE1A 3WXLA 2FLOA 3UKRB 3A5NC 5AQPA 1HPMA 3HZ6A 4HWIA 4CZEA 2A42A 3KHYA 3EZWA 1GLBG 4EFHA 1R59O 3MCPA 1BO5O 3MN9A 4F9OA 4CZGA 4PKIA 3WXJA 5I9EB 3VF2A 3FE1A 3WXKA 1J6ZA 2E2OA 5F1XA 3ZEUA 1ESVA 4EHUA 1EQYA 3W3DA 1DKGD 2E2NA 1ZXOA 3O5BA 5FPNA 2Q31A 2OANA 5FPDA 3AY9A 3VGMA 3BP8A 2CH5A 4YDUA 3DXKA 2E2QA 4IJAA 3MN7A 1NGHA 1ATSA 3ZX2A 1MA9B 2HOEA 3O6WA 2ZGZA 2ZGYA 4FWLA 5AZJB 3IDHA 2YHWA 4KBOA 3VERA 2HF4A 3WEEB 1NWKA 1DEJA 1GLCG 3MN5A 4BG9A 3JXUA 4O5FA 4WQ5C 4BGBA 1KAZA 3VPZA 3A0IX 3GG4A 2A6AA 3ATUA 1KAYA 4K43A 3HM8A 4IZ9A 3TPQA 3WT0A 2ASOA 3FZLA 3SLCA 2P9SA 5FPMA 2Q0RA 5BN9A 4B1UB 2QXLA 2IVPA 2FF3B 4JHDA 1E4FT 3LDQA 2YCHA 3VGKA 3C7NA 4BR9A 2P9PB 1BA1A 1S22A 1JCGA 2P9NA 5AQMA 4BRIA 5BR9A 3DXMB 4JD2A 3UE5A 3AARA 3RSEB 4O8KA 3O08A 4E1JA 1D4XA 2P9IA 3EO3A 3UB5A 5BRDA 1KXPA 3ULEA 3D2FA 2QWLA 2CH6A 5AFUH 5LJVA 2ASMA 3M1FA 1QQNA 3H6EA 2V7ZA 2YHYA 1BOTO 4FL9A 4BRMA 3U8XA 3O8MA 2QWRA 2I7PA 3GOIA 4H0VB 4FWQA 3WUHA 2HF3A 3VEXA 2VYPA 5F0XA 3H1VX 3CQYA 1IJJA 3FZKA 4H0PA 4XH1A 3VEOA 5AQJA 4L3QA 1RDWX 2HMPA 1BDGA 1JCEA 3H45C 1SAZA 3FZHA 3UKRA 1TYQB 3VEYA 2ASPA 2E1YA 3A8YA 5AQIA 3CJCA 3ZETB 3D2EB 5B8HA 2UYTA 2I7NA 3CQXA 4FWPA 4ISFA 4BC5A 2FF6A 4BROA 4H5VA 2CGJA 3LDNA 4MLEA 1GLLO 3FZFA 4EAHD 5AQNA 3L4IA 4DQ8A 3H3NO 3FR0A 4BVOA 5BPLA 4H0XB 5ELZA 3BF1A 3AAQA 3F9MA 1QQOA 2VWBA 3HI0A 4BG8A 1GLDG 1K8KB 3QBXA 4BRAA 5AQVA 1ZC6A 3M3ZA 5EY4A 4H03B 4IJNA 1GLAG 5BN8A 2GELA 3S41A 1NGGA 4PKGA 5AZJA 2ZWHA 3H3OB 3QFPA 4RCHA 3VF4A 5ADXH 1HKCA 3UKUB 1HUXA 4CJ7A 4CD1A 3WEEA 4BVPA 3BF3A 4C23A 1CZAN 2YHXA 5EOYA 1RFQA 2QW9A 2A41A 3FFKB 3VENA 4BRFA 2WUSA 2BUPA 2QWQA 2V7YA 4FWOA 4WQ5A 5AQYA 5KQ8A 1DGKN 1NBWA 1U6ZA 4GNIA 4BQLA 3IUCA 3QICA 3QFUA 4DCHA 3L6QA 3O80A 3W0LA 1NGEA 2J4RA 1HX1A 2P9PA 2ZF5O 4FOIA 2D1KA 1ATNA 2V51B 1MDUB 4H5RA 4ISEA 4BREA 5EXWA 1GLEG 3LL3A 4BRCA 4CBWA 5JICA 4M7YA 1TUUA 4H0YB 3A5MC 3BEXA 3DXMA 2A40A 4M7XA 4RTFD 5E84A 5BRFA 3RSEA 3VGLA 4PL8A 1S3XA 2BTFA 3I8BA 2FSJA 5AR0A 3DAWA 3EKSA 5AZIB 3ENOA 2Q36A 5E26A 4BC3A 2F9TA 2QWNA 3LM9A 4GY2B 2FSNA 4H0OA 3WQUA 5JLFA 1QZ5A 2W41A 4CZHA 3O1BA 4QS8A 3FGUA 2KHOA 3ATVA 4RWTA 2YI1A 1BA0A 3MDQA 4AM7A 4DHYA 4A61A 5JLHA 3A5OC 1SQKA 2NZTA 5F2RA 1NGCA 3R9PA 5KPRA 1MWMA 1C0GA 3U9ZA 4PL7A 2GTDA 4FWMA 1Y64A 2AP1A 1TYQA 4LC9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JS6A 4K41A 4CZMA 4FVUA 1V4SA 3ZETA 5KPZA 2P9KB 2G8WA 4N76A 4JNEA 4Q5VA 1N33K 4CZKA 4A2BA 4NCAA 3EL2A 5LL6Z 1IV0A 1ATRA 3TTCA 3KVGA 3SK3A 2HBJA 1U49A 2D0OA 2VWKA 3DRSA 5FROA 2D0PA 4OKEA 4KRFA 4KH6A 1Q86O 2QWPA 1ITGA 4CEBA 3V4IA 1CXQA 4O5BA 3VTHA 1FKPA 4BRLA 1K8KA 4CJUA 3OS2A 2NNWA 1S1WA 4UQGA 3RMCA 4C1NK 3CJBA 3KK7A 1YAGA 5FPEA 2QA4N 1JLBA 4FCYA 3MECA 3CCQN 4YHHK 1U47A 2GWJA 3UKUA 1NGBA 4I6MB 3T3FA 3NFAA 3DYAA 1IG9A 1GOAA 3C95A 4FO0A 2QKBA 5AQHA 2H3GX 4B3RK 5M1QA 4CZJA 3VEZA 4UY8O 3AVNA 1WOQA 2YJFA 4ZTJA 4CBUA 1NKCA 3CHWA 4B8AB 4I7FA 5EVZA 3KIOA 4H5NA 4HCCA 4DR6K 1TAUA 4H5TA 1WBBA 2E1ZA 3TAGA 4CK3A 4BEBA 5AQLA 5AQRA 1TKZA 3AA2A 4ILGB 3NDKA 5KQDA 3Q7CA 1HQEA 3ZX3A 1G99A 3NAEA 1JCFA 4FM1A 3KK2A 2YX6A 3LZJA 4LF7K 4MLHA 2HNYA 2JWLA 4KB1A 4FLXA 3JAMO 1I3AA 4YOTA 5AQUA 3U3YA 4B1VA 1E3MA 2FSKA 3O4QA 2ZJQL 4HTLA 3V9SA 1KVBA 3VEVA 4FLVA 1HKGA 5EU7A 2ZM6K 3S3MA 1SZ2A 2P1JA 2KTQA 1BI4B 2VQFK 4MO4A 3TAEA 1TL1A 5AQKA 1VQKN 2EHGA 1Z26A 5HRPA 3MMVA 2OPPA 3KWIA 3WQTA 3AVJA 1ZBSA 1IKYA 3VQ7A 1EWRA 3MXIA 3IMXA 4JKHA 1XQSC 3AVCA 3RWUA 1J9AA 4BRPA 1A5XA 3ZT1A 3L2UA 1VQ4N 5GAHP 4JI1K 3EN9A 3HRGA 3NMUA 4CJPA 2PBDA 2IVOA 1QSYA 4FWKA 3F73A 4EHTA 4BQZA 4GV6A 4X62K 1LWCA 3CMAN 5KI6A 1HLUA 4A5BA 3CYMA 1BWFO 2FBTA 3O1WA 2W42A 4G9ZA 1IH7A 2P9SB 4IEIA 2P9LA 3J7AP 4JHDB 1OKJA 3AAPA 4DR7K 4C8LA 2P9UA 3CC7N 4O0JA 2P9NB 1LAWA 4JD2B 3QDKA 3OTOK 3L2QA 1R0AA 2OZSA 3ZSOA 3ISNC 2KFZA 5AQTA 4FJNA 2PYJA 2IIRA 2HVHA 1FKOA 5LY3A 4Z4EA 1TUYA 4DG1A 4BRQA 2E8AA 1D8YA 4RG8A 2A1RA 4B1XB 4YOXA 1QHAA 2V52B 2FBXA 3RMDA 1RDUA 5AQQA 3WNEA 5LMNK 2WONA 4OJRA 1DT9A 4Y0WA 4BDPA 2VCPA 2ITMA 3KD1E 2YV0X 4K8XA 2UUAK 1RCHA 2E88A 1BU6O 1VSKA 4CF2A 2ATQA 2QWMA 3G0ZA 3ZLJA 3WXLA 1RTIA 2NRRA 3VMFB 3RMBA 3S9HA 4HWIA 1RBUA 4CZEA 2QKKA 4JI7K 4FXDA 3EZWA 3E9LA 4E19A 1GLBG 1VSHA 3HT3A 1Q9XA 1HR0K 2F8TA 3T1AA 1B9DA 1YVUA 3J81O 1J6ZA 4YOVA 3DLEA 1ESVA 4ILHA 4EHUA 4RW6A 1EQYA 3OS1A 2E2NA 4ID1A 3O5BA 1S1UA 3AO5A 4LFAK 3NGZA 4AF1A 4NYFA 5FPDA 2HHSA 4CFCA 2EX3A 3AY9A 1NJXA 1EX4A 3BP8A 2ZJPL 4DKWA 3MN7A 3P1GA 1ATSA 3I55N 3ZX2A 2HOEA 2ZGZA 4LF4K 2YHWA 4EP4A 2HF4A 3WEEB 3PSIA 4IEEA 4C8KA 4Q0BA 3S3OA 2O8CB 3HXMA 3ATUA 4U7BA 4K43A 4HTUA 3CCLN 2ASOA 1U4BA 5JS1A 4CGIA 4B1UB 3OA9A 3M5RA 3THVA 4DV4K 5FDLA 2VG5A 5HRSA 5DK5A 1BA1A 3CC2N 3LP1A 2GX9A 4BRIA 4W5NA 3O08A 5BRDA 5GIOA 4DFMA 2Q3SA 2QWLA 2CH6A 3MWPA 4X66K 1IKWA 5H1SQ 5AFUH 5LJVA 2ASMA 1OVYA 3M1FA 3E1YA 4F3TA 1JLQA 1VSMA 2KQ2A 2YHYA 1RT3A 1HJRA 4FL9A 4LH4A 4BRMA 1JLGA 1K6YA 1RT2A 2HF3A 3VEXA 1J5OA 5F0XA 4DF4A 2B4JA 3F9KA 3TARA 4BWJA 4XH1A 1RDBA 4GV3A 3SUNA 1JCEA 3VQ9A 1TYQB 2ASPA 4NLBA 5B8HA 1M90O 2X78A 2KZZA 4JKEA 2P51A 4FWPA 3THXA 3KKRA 2DTUA 1XI1A 4CJ4A 1LV5A 5TKWA 3NH2A 4JRPA 4BROA 4JLHA 3EE8A 2CGJA 4MLEA 1BQMA 4YOUA 5HOOA 1XHZA 3FZFA 4DV0K 3FFIA 3L4IA 1WAJA 1BISA 4CIEA 4H0XB 5ELZA 2XY7A 3VA0A 3AAQA 3V1OA 3HI0A 4J2DA 4BE1A 3THWB 4OPAA 3QBXA 2OPRA 2RPIA 3M3ZA 1GLAG 3TSUA 1WB9A 1BCOA 3S41A 1NGGA 4AILC 3C6UA 4FK2A 3VF4A 3V9WA 1IKVA 1HKCA 3ZT2A 4JRQA 4CJ7A 3LZIA 1CZAN 1NK0A 5EOYA 4CEZA 3VENA 3NVMA 3B6OA 3C6TA 4DTMA 1HYZA 4DV5K 2IDOA 4DTOA 3QEWA 1U6ZA 1SL0A 2E6MA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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