1TYQB

Crystal structure of arp2/3 complex with bound atp and calcium
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
VLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 57
structure length 208
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1tyqB02
2VYPA 4A62A 3WEEB 3M1FA 5AFUA 3CJ9A 2I7PA 2W41A 4GY2B 4PKHA 2CGLA 3DWLA 3I8BA 3HBTA 3VGKA 3CI5A 2QWLA 2H3GX 3BP8A 4BR2A 2P9SB 2FF6A 1TYQB 3I33A 4BC5A 3ZEUA 4BVPA 2P9NA 3GE1A 3VETA 2QWPA 5EOYA 1WUAA 4JHDB 3ZX3A 3ZX0A 1S3XA 4WYBA 3MN5A 4M7YA 4BR4A 3O80A 2E8AA 1P8ZA 1RGIA 4CBWA 4PKGA 2CH5A 3CJAA 3JS6A 5TKYA 3VEWA 5AQNA 3W3DA 3EZWA 3CJBA 1MDUB 1U2VB 2QWMA 1XQSC 3SJHA 4PL8A 5AZJA 1C0GA 1X3NA 1Y64A 1HKGA 3WXKA 1JCFA 2FLOA 2P9KA 3AARA 3QBWA 4M7XA 3VEXA 2YJFA 2YHWA 3CQXA 5BR9A 2FSKA 2P9LA 2QW9A 3CJ7A 2E1YA 3DXKA 4GNIA 1TUUA 3OHRA 3BUZB 2NZTA 3U9ZA 3QDKA 4BR7A 3ULEB 3VF6A 4BGAA 4NB4A 5F0XA 2E88A 3QMLA 5FPDA 5KQ8A 1S22A 4BR0A 1LOTB 5AZIA 4FWSA 4H0VB 5AQVA 5E26A 2QWOA 3IMXA 2P9PB 2YJEA 2ASMA 1GLCG 3H3NO 1G99A 2I7NA 4CBXA 4B1ZA 3S41A 4FPAA 3U8XA 2AA4A 1GLBG 3A5OC 1DKGD 5B8HA 4ISEA 2F9TA 4IO8A 2FSNA 4BG9A 3L4IA 4CZMA 4H0TB 3LDLA 3O5BA 4BG8A 4MO5A 1X9JA 5FPMA 3UKUB 1BWFO 4ISFA 4Z94A 4F9OA 5ADXH 3GG4A 3O8MA 5BPNA 5KQDA 1BU6O 5E84A 2E1ZA 3VF2A 3FR0A 3ATUA 4CJ7A 3VGLA 2P9UA 4C23A 4EIAA 2ZF5O 1DGKN 4CD3A 5LJVA 4EAHD 1KAZA 4YDUA 2HMPA 3KHYA 4B1VA 5EY4A 1K8KB 1YUWA 5AQPA 3ENOA 5EXWA 1E4FT 4IWVA 2V51B 4B1XB 4B1WB 4BC4A 4BRCA 3H45C 3LDQA 3BEXA 3WEEA 5EVZA 4WQ4C 3AY9A 3EL2A 4K42A 2E20A 5AQRA 4BREA 1WOQA 4CD1A 1Z05A 4I6MB 4BGBA 3L6QA 4JNEA 2D1KA 1YAGA 3SMSA 3ENHA 2BUPA 5KPTA 2P9SA 3HM8A 4JN4A 3HZ6A 1TYQA 4FSVA 3VOVA 4L3QA 3R6MA 3O08A 3TPQA 3FGUA 2A40A 5I9EB 4A61A 1BA1A 3H1QA 1X3MA 3AAQA 4JHDA 5F1XA 1NGHA 3EN9A 1U6ZA 4RWTA 3O4WA 1NGDA 4FWQA 1JCGA 1ATNA 4QS7A 3MN9A 4IXCA 4CBUA 2CGJA 5AQFA 2PBDA 2YI1A 3C7NB 4K41A 3A8YA 3U4LA 1NGAA 1U2VA 3MMVA 1ESVA 1SQKA 1CZAN 2J4RA 4FWNA 1NM1A 3O6WA 2ASPA 2D0PA 2FXUA 2KHOA 4BC3A 4PL7A 2ZGZA 3M6GA 1C0FA 2E2NA 1ATRA 3LM9A 2V7ZA 1V4TA 1MA9B 2IVOA 1HX1A 1BO5O 5BRFA 3WQUA 2Q97A 3ULEA 3CERA 3FZKA 1HJOA 2Q0RA 5AQIA 5JMVA 3CQYA 3FLCO 1GLEG 2ZGYA 2W40A 4CZKA 1KAXA 3ZX2A 3DXMB 4FOEA 1JCEA 2P9PA 2F9WA 3O1WA 3CHWA 4XH5A 5AQXA 3H46O 1QQOA 3GBTA 1NWKA 4HWIA 4BRPA 4JD2B 4CZEA 1H1VA 3VEVA 3VPZA 2DPNA 5AQTA 2A5XA 5AQWA 1KAYA 4B9QA 4FWRA 4FWOA 4A2AA 4E1JA 1QQMA 3M3ZA 4FWKA 4H5RA 3RSEB 5BN8A 4IZ9A 3UKUA 1HUXA 2GWKA 2Q2RA 1NGJA 1YVNA 2IIRA 3QFUA 3IFRA 4FWMA 4XH1A 1HPMA 2GTDA 2QWNA 3FZMA 4H0OA 1Q18A 2FSJA 3D2FB 1Z6RA 2QWQA 3CETA 3ID8A 3KZBA 3A5LC 3O1BA 3MCPA 3D2EB 2YHXA 1GLAG 3LDNA 1QZ5A 4WQ4A 3W0LA 2ZWHA 2NRHA 5AQMA 5AQGA 2WUSA 2A6AA 3FZFA 1K8KA 5AQSA 1GLJO 4BVOA 3U9DA 4DQ8A 2D0OA 3LDOA 4MLHA 3AAPA 1BG3A 5AFUH 3HTVA 5AQQA 3F9MA 1R59O 1T6DA 2NLXA 3LL3A 3CJCA 1NGFA 3JXUA 4B1UB 2Q0UA 4O5FA 4I6MA 3UB5A 2Q31A 3EKSA 1EQYA 5FPEA 1GLFO 1BOTO 1T44A 1XUPO 5BPMA 1HLUA 5AQOA 4BRHA 4J8FA 4BRFA 3ATVA 5BRHA 5KPZA 2YCHA 4BQLA 5LY3A 1BA0A 3QB0A 4QS9A 5JLFA 5AQHA 4BRGA 2E2OA 2AP1A 2IVNA 4BRIA 4M63C 5ADXA 1SZ2A 1BDGA 2P9IB 1NGBA 2GUPA 5KPRA 4H03B 3VERA 4BC2A 3C7NA 4IJAA 3UKRB 5AR0A 1RDWX 5JLHA 2ITMA 3SMPA 2D4WA 3VENA 3ZETB 1NBWA 1IJJA 3H1VX 1XC3A 3A0IX 3QICA 4NO7A 3SLCA 3DAWA 2A42A 3QBXA 3BF3A 1GLLO 2OANA 4YDUC 1ATSA 1ZXOA 4DB3A 1QHAA 5BPLA 3GDQA 1OKJA 3J8AA 2HF3A 4DCHA 3MN7A 1ZBSA 4RTFD 4H0PA 4H5VA 3LDPA 4O8KA 5AQUA 5FPNA 4HTLA 4FPBA 3TU5A 3P4IA 4MLEA 1T6CA 4BROA 3DXMA 3FFKB 1NLVA 3WUHA 2ASOA 4H0XB 2A41A 3QFPA 3WXLA 3FE1A 2GELA 2GEMA 1E4GT 4WQ5C 3ZEUB 2P9NB 4H5TA 3VESA 3WQTA 4JD2A 4BQZA 4H5NA 3UE5A 4B1YB 3CJ1A 3WXJA 3GL1A 4PKIA 1QQNA 1ZC6A 2E2PA 3L0QA 2PAVA 3CIPA 3RSEA 2VCPA 5AQYA 3MDQA 3R8EA 5AQLA 2Q36A 2EWSA 2QXLA 4H0YB 4BRNA 2YHYA 1GLDG 5AZJB 3VEOA 5BN9A 4FOIA 2P9KB 3EKUA 2V7YA 4EHUA 2E2QA 3VEZA 3D2FA 2A3ZA 1DEJA 2P9LB 3WT0A 1LCUA 4BR5A 3DXKB 1NGCA 3D2EA 3G25A 1IG8A 3MN6A 4K43A 2GWJA 5LJWA 5AQJA 1NGGA 4BRLA 2IVPA 1MWMA 4K25A 4CZLA 4A2BA 1HKCA 4RCHA 1MWKA 3FZLA 4Y0WA 4ISGA 5AZIB 3VEYA 4DHYA 4BRKA 4EHTA 3A5MC 3BF1A 1YXQA 3VGMA 2UYTA 4CZIA 5EX5A 2HF4A 4XH4A 5AQKA 1SAZA 3HI0A 1V4SA 4CZHA 3MK6A 3KVGA 4XEIA 5JICA 4QS8A 3GOIA 1BUPA 1D4XA 1NGIA 2BTFA 1HKBA 3IDHA 4LC9B 1QZ6A 3EO3A 2VWBA 5BRDA 2Q1NA 3WXIA 4CZJA 2CH6A 3B8AX 3H3OB 2V52B 1KXPA 3FZHA 2CGKA 1NGEA 3C0BA 4AM7A 4CI6A 4AM6A 5BREA 4BR9A 4CZFA 4BRMA 2P9UB 5CE3A 4BRDA 5AQZA 2P9IA 3IUCA 1TUYA 4KBOA 4MO4A 3DJCA 4FL9A 3UKRA 4JAXA 2QM1A 3ZETA 2QWRA 4FWPA 1RFQA 3R9PA 4BRQA 3D7EO 4CZGA 3LM2A 5F2RA 3SK3A 4IJNA 3VF4A 4BRAA 2FF3B 3A5NC 4H5WA 2HOEA 4FO0A 4WQ5A 4EFHA 4FWLA 3H6EA 1NMDA 1J6ZA 3HSCA 5ELZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M1FA 5AFUA 1YJNN 4CJQA 3H08A 1YJ9N 2A1SA 3SAGA 3T69A 4LFBK 3S3NA 1N6QA 4AHCA 2HHXA 3AVNA 3ZYYX 1S3XA 4WYBA 3HJFA 2G8WA 4CBWA 5LMUK 5C24A 5FRNA 4GV9A 4OPJA 5TKYA 5AQNA 1VSMA 4PQUA 4BACA 1MDUB 1L3SA 1ZBIA 1NJYA 1HMVA 2QWMA 2FBXA 5AZJA 3TWHA 2NUBA 4JI8K 1Y64A 3SZ2A 1JCFA 1RT6A 4M7XA 2P51A 2O8CA 3LP3A 3CXCM 4B8CA 4I2PA 5BR9A 2QW9A 2E1YA 1W2BM 4WF9L 4BE2A 3LDSA 2IC3A 4KI4A 5KQ8A 4KHYA 3CYGA 1LOTB 4BE7B 1K6YA 4H0VB 4KTQA 3CM6A 5E26A 3IMXA 4J2BA 4IFVA 1GLCG 3H3NO 3ITHA 3NHGA 4CJ3A 3S41A 2AA4A 4E7JA 3A5OC 1X9WA 3AVJA 1DKGD 1RBTA 4M42A 2WTUA 2FSNA 4AF1A 3SV3A 4BG9A 4FXDA 3QEPA 2BDPA 3M8QA 1VQKN 3HPGA 3HVTA 5M1QA 3MX5A 2O8FB 3GG4A 4H4MA 5E84A 2HB5A 4IEIA 3VGLA 3CYMA 1RBVA 1DGKN 4CD3A 1EWRA 5C12A 4EAHD 3VQQA 3P31A 3THYA 2FC0A 2RPIA 5C42A 1WN7A 3E66A 4Y1CA 1J54A 3VQEA 1YUWA 4B1XB 3IRXA 4L8RB 3V1QA 5CHIA 4BRCA 1SL1A 4FLVA 4GV6A 3WEEA 3ZCMA 3C65A 3TABA 1FW6A 4WQ4C 5AQRA 3RMDA 3BZCA 1BIZA 4EP5A 1O13A 2HSTA 1YAGA 3ENHA 2BUPA 5KPTA 2P9SA 3HM8A 4O0IA 3J7ZO 2KTQA 4FSVA 4C8MA 4LY7A 3CCSN 1XMOK 4CIEA 2D0BA 4AHUA 1YT3A 1JLBA 1JCGA 3KK3A 4QS7A 3MN9A 4IXCA 3HYFA 3EE8A 4K41A 4KH5A 4E7HA 2HHVA 4PA1A 3MMVA 4DV4K 3I0RA 2J4RA 5CYQA 3KLGA 2RF2A 4JK9A 4JI0K 3S9HA 1VQMN 2YKMA 5KTQA 2WOMA 1OH8A 4N41A 4OX9K 3V6DA 2KHOA 3TSUA 1ATRA 2V7ZA 3BGRA 3KKSA 3AV9A 2D5RA 1XNRK 3OS1A 3J80O 3C6UA 3OVNA 3KK7A 3G4SN 3CQYA 3FLCO 1ZBHA 4FZYA 3AGRA 2W40A 1KAXA 3ZX2A 4FJXA 4CJVA 3JSMA 4JI6K 4UY8O 3O1WA 3CHWA 3CPEA 1UA1A 1RT2A 5AQXA 1NWKA 4U67L 2PYLA 4BRPA 1HRHA 3OY9A 3VEVA 3T7ZA 3VPZA 3CCLN 5AQTA 4YNQA 1KFSA 4W5NA 4H5RA 3ZT0A 4CGIA 4DSEA 3TAFA 5BN8A 2BH1A 3O9SA 1KTQA 1XWLA 2E6MA 3THXB 3V9UA 3IFRA 4M3TA 4XH1A 1HPMA 4M3WA 5FRMA 3FZMA 2F4VK 4H0OA 1Q18A 1VSLA 3O3HA 5J2QA 1Z6RA 1EP4A 2ZQBA 3ID8A 3KZBA 3O1BA 3MCPA 4CJPA 2F7TA 1QZ5A 4DFMA 2ZM6K 1M90O 3KLEA 2ZWHA 4DFJA 4CEQA 2A6AA 5GINA 4FJHA 2KLAA 4DV6K 3ZSVA 4BVOA 3LDOA 3TTCA 4CEZA 2QKBA 3AAPA 2YV0X 3WNHA 5AFUH 3SAFA 3HTVA 5GIOA 3HL8A 5J1EA 4FVMA 2C1GA 2WONA 4DR3K 3JXUA 4N76A 4B1UB 3ZSYA 4Y1DA 1XNQK 3THWB 1GLFO 1BOTO 1T44A 1WLJA 3J7YP 1HLUA 2JWLA 4CIGA 1A5VA 4DSFA 4KREA 5JLFA 3EE9A 4FJ9A 2QK9A 4DFPA 3G71N 4CJUA 5ADXA 3PX6A 4DUZK 2GUPA 5KI6A 4CF9A 5JLHA 3KK1A 1HYVA 1S1WA 1KRPA 4HCCA 1NBWA 3H1VX 4DF8A 4YOYA 4GV3A 4NO7A 5KRTA 3DAWA 2A42A 2HHIA 1J53A 3HM9A 4YDUC 2X78A 1QHAA 5C15A 3HP6A 4KRFA 5JENA 5CYMA 3L3UA 4LH5A 2EX3A 4B9VA 4OKJA 1W0HA 2HF3A 3MN7A 5FROA 1U49A 4NYFA 2A1RA 4O44A 3LDPA 1NNEA 3P4IA 3TTFA 1T6CA 2P1JA 4H0XB 3QFPA 3WXLA 2NRZA 4AHRA 2GEMA 3ZSOA 1E4GT 4WQ5C 2E5LK 4K8ZA 3K9KA 4FJ8A 4H5TA 4JD2A 1DTQA 2ZE2A 2YHBA 3ZSXA 1K8AO 1VHXA 2UXDK 1S6PA 3MDQA 3TAEA 4JV5K 4H0YB 3V9SA 4W5RA 2YHYA 5AZJB 3VEOA 1T03A 3J81O 3OYFA 3AO1A 1YI2N 3V81A 3OYCA 5CZ2A 3VEZA 2AJQA 1DEJA 3WT0A 1WSIA 3O9RA 3G25A 4DQQA 3MN6A 5AQJA 4O8UA 4OGCA 1MWMA 4CHQA 4ZTFA 1HR0K 5FLXO 2QKKA 1HKCA 1KVAA 4RCHA 1MWKA 3FZLA 4WE1A 3K9JA 2XY5A 3WNEA 3PIPL 3HP9A 3R1XA 1YXQA 3AA4A 2UYTA 4K8XA 1FXXA 1VSIA 4FJ7A 1BHLA 3IG1A 2XY8A 4CK2A 2GX9A 3SQ4A 3OYHA 4CZHA 5HBMA 4XEIA 3GOIA 4JKGA 4ID5A 3HPHA 4JKHA 2RHKA 1VRTA 3U3GA 1X9MA 4LC9B 3RR8A 3TARA 3ZSRA 4QOZB 1VQ7N 2VWBA 3B6OA 1WSJA 1JLQA 2CGKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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