1TYQB

Crystal structure of arp2/3 complex with bound atp and calcium
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
VLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 57
structure length 208
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1tyqB02
4BC4A 3H46O 5AQXA 4B1WB 4F9OA 3P4IA 4I6MA 4BRAA 5F0XA 4FOIA 5AQPA 3IMXA 4FPAA 2GEMA 4BR2A 3QFPA 1WOQA 2P9KB 4FWLA 1S3XA 2Q97A 5TKYA 4NB4A 3O08A 3UB5A 3OHRA 4GNIA 1D4XA 3VOVA 2A5XA 3M3ZA 2A3ZA 4H5WA 2IVNA 3L0QA 3VF4A 3KZBA 2D4WA 2P9NB 4A2BA 1GLBG 4PKIA 3D2EA 5AZJB 1QQMA 3GG4A 1NGCA 2P9KA 4H0VB 5AR0A 4WQ4A 3ENOA 3DXMB 3VEZA 4FWKA 3I33A 3VEOA 3VGKA 4WQ5C 3EO3A 3CIPA 4BQZA 2A40A 5BN8A 3VESA 4E1JA 3QBWA 5I9EB 2E20A 3C0BA 4B1VA 4BQLA 2V51B 4JD2B 2V7YA 4BREA 3GL1A 4PL8A 3C7NB 4CBWA 4FSVA 2QM1A 3VEVA 2WUSA 5LJVA 5BPNA 1SAZA 3CERA 3HM8A 3HBTA 3R6MA 4FWMA 1RDWX 4B9QA 5KPRA 3SLCA 4JD2A 3CJ1A 1JCFA 4BGAA 3MCPA 4CZEA 3C7NA 1GLFO 1J6ZA 4JN4A 3FR0A 3FZKA 4Y0WA 5AZIA 3A5OC 4QS8A 2NZTA 3ID8A 3IUCA 3O6WA 1NGFA 2P9IB 3VEWA 1NGAA 4M7YA 5ELZA 2Q2RA 4O5FA 3AAPA 2Q1NA 5AQUA 2ZWHA 3O8MA 5ADXA 5AQRA 3B8AX 4FPBA 2HF3A 4L3QA 4RTFD 1DGKN 1C0FA 3GE1A 4MLEA 3FZMA 3A5LC 3D7EO 3IDHA 3LDNA 5BPMA 3BF1A 1YUWA 3FGUA 5F2RA 4BRHA 4BRCA 1KAYA 1C0GA 3ZEUB 4RCHA 2VWBA 3CQYA 1SQKA 5KQDA 2Q36A 1BU6O 1E4FT 4WQ5A 3F9MA 2AA4A 2IIRA 1X3MA 3TPQA 5ADXH 4BG8A 1NGBA 5AQQA 5FPEA 2QXLA 4FWOA 4BGBA 3ZEUA 1Z05A 4XH4A 2IVOA 2A41A 2QWLA 1K8KB 3D2FB 3KHYA 4FWNA 4JHDB 4XH5A 4J8FA 2IVPA 3W3DA 4ISGA 1S22A 2I7NA 5AQFA 4PKHA 5AQNA 3RSEA 3FZLA 3DAWA 4I6MB 1BDGA 3I8BA 4GY2B 2ZGYA 4K43A 3FZHA 3QDKA 5AQYA 1HKBA 1YAGA 4H0XB 3VGLA 4BRLA 5AQMA 3WXLA 1HPMA 3UKUA 3U8XA 2F9WA 1XQSC 1QZ5A 3EN9A 2QWPA 3GOIA 2VYPA 5AQSA 5F1XA 1NLVA 2BTFA 4CD1A 1ZC6A 3D2EB 4FWRA 4DQ8A 5AQHA 5AQGA 1TUUA 1NGDA 4FWPA 4CZIA 2D0PA 1SZ2A 3EL2A 1HUXA 2E1ZA 4DHYA 3A8YA 4B1ZA 2P9SA 2PBDA 4H0PA 1XUPO 3BF3A 3CHWA 4H0OA 3QB0A 3FFKB 5CE3A 2GWJA 2UYTA 2YHWA 3ULEA 4BVPA 5KPZA 4MLHA 4K41A 4CZLA 2ASOA 3BUZB 2FSNA 1ATNA 3SK3A 1KAZA 2FSJA 1IG8A 1QQNA 1ZXOA 3CJ9A 3GDQA 4MO4A 4BG9A 1T44A 1DKGD 5AQZA 4BRQA 3HSCA 1ESVA 2YCHA 3MN7A 1TYQB 4EIAA 1QZ6A 3G25A 5AZIB 4BROA 4CZJA 2NRHA 2VCPA 1BA0A 3LM2A 1V4SA 2W41A 3O5BA 1G99A 3AAQA 4FL9A 4BRPA 4Z94A 3EZWA 2CGKA 3IFRA 4XEIA 4B1YB 4H0TB 3ZX3A 1KXPA 2FXUA 1TYQA 3L6QA 4C23A 2E1YA 3EKSA 2E88A 3ZX2A 4A2AA 2QWRA 4H5VA 3WXIA 3ZETB 3VEYA 1BA1A 2P9PA 5AQOA 3A5NC 5EXWA 3H1VX 1BG3A 3M1FA 2CGLA 3U4LA 4K42A 4K25A 4FWSA 1NMDA 2E2QA 1X9JA 4HWIA 3WEEA 2KHOA 4BC5A 3ZETA 3FZFA 1MA9B 4AM7A 1NM1A 2GWKA 4B1XB 4O8KA 5E84A 1BWFO 3H3OB 3CETA 3R8EA 2CH6A 3U9ZA 1RGIA 4BRGA 3CJAA 3VGMA 3WQUA 5B8HA 2YJEA 1MWKA 4FO0A 1HKGA 3O1WA 5EVZA 3RSEB 2CH5A 4H5TA 4EFHA 1GLEG 1BUPA 2ASPA 2PAVA 2W40A 1NWKA 3LM9A 4YDUC 1JCGA 4PKGA 5AQKA 4CZKA 4B1UB 2J4RA 4XH1A 3SMPA 1HX1A 3UKUB 1E4GT 3VEXA 3DXKA 4EHUA 3S41A 2GELA 4DB3A 3AY9A 2QWNA 2NLXA 3WXKA 5AQIA 3ATUA 3CJCA 1ZBSA 2V52B 2GTDA 2YHXA 2CGJA 1HKCA 2Q31A 3JS6A 3O4WA 1GLDG 3MMVA 3MK6A 2HOEA 4CZFA 3H45C 4M7XA 2P9UA 1HLUA 1NGJA 1QQOA 1EQYA 3H1QA 3WQTA 1GLAG 2OANA 4FWQA 3UKRB 5BRFA 3WT0A 4LC9B 3A0IX 5EY4A 2P9SB 4IJNA 3HZ6A 1U6ZA 5BREA 4H5NA 4CZHA 4PL7A 4BR4A 3UE5A 3ULEB 3WXJA 4IWVA 3UKRA 1KAXA 1LOTB 5AQJA 4BR7A 5LJWA 2Q0UA 4BVOA 2Q0RA 3BP8A 3FLCO 1MWMA 4CZMA 2E2NA 3ZX0A 4DCHA 3LDPA 3A5MC 3CQXA 3MN5A 1DEJA 4BR9A 4M63C 1HJOA 3O1BA 2GUPA 3CJ7A 4CBUA 3CJBA 5FPDA 3AARA 1YXQA 5AFUH 4WYBA 4ISFA 3VENA 4ISEA 4CBXA 5KQ8A 4JNEA 3QMLA 4MO5A 4BRFA 5AQLA 3WUHA 1T6CA 4YDUA 4BRIA 2ZF5O 2YI1A 3J8AA 4QS9A 5BR9A 2QW9A 2E2PA 4BRMA 5BPLA 2AP1A 3MDQA 5JMVA 3H6EA 3ATVA 3L4IA 4CD3A 3VPZA 2V7ZA 2P9PB 1NBWA 5JICA 2P9NA 1YVNA 5AZJA 2YHYA 1H1VA 3DJCA 4BC3A 2A42A 3CI5A 1LCUA 2A6AA 4RWTA 3DXMA 3WEEB 3LDQA 2H3GX 3M6GA 2QWMA 1U2VB 5AQVA 3LL3A 2P9LB 5AQTA 4BR0A 4A61A 1V4TA 1NGGA 3U9DA 2E2OA 2ZGZA 3JXUA 1GLLO 2FSKA 3GBTA 2EWSA 5AQWA 1OKJA 5FPNA 1ATSA 5BN9A 3LDOA 3ENHA 1MDUB 3MN6A 2E8AA 3VETA 1U2VA 3BEXA 2P9LA 3H3NO 2HF4A 4HTLA 3SMSA 4AM6A 3R9PA 5JLHA 4JAXA 3LDLA 1CZAN 5JLFA 2DPNA 1WUAA 2HMPA 2QWQA 4CJ7A 1NGIA 3SJHA 3DXKB 2FLOA 3HI0A 2YJFA 5EX5A 1Q18A 4FOEA 5FPMA 1TUYA 1XC3A 3VF2A 5BRDA 4IZ9A 2P9IA 4BRKA 1RFQA 4H0YB 4NO7A 3QICA 1JCEA 4IXCA 1Y64A 4IO8A 4WQ4C 3VERA 2FF3B 4H5RA 3VF6A 4H03B 3MN9A 3O80A 1R59O 2ITMA 4CI6A 2FF6A 2P9UB 2QWOA 3HTVA 3QBXA 3KVGA 3TU5A 1GLCG 4BRDA 5E26A 4IJAA 1IJJA 4KBOA 4BRNA 1NGEA 1BO5O 4CZGA 3W0LA 5LY3A 1GLJO 1QHAA 1Z6RA 2F9TA 5KPTA 4QS7A 1NGHA 2D1KA 2I7PA 4A62A 5EOYA 3FE1A 2BUPA 3QFUA 1P8ZA 1X3NA 4BC2A 3DWLA 1T6DA 2ASMA 4EAHD 4EHTA 5BRHA 3EKUA 5AFUA 4JHDA 1K8KA 3D2FA 1ATRA 2D0OA 4BR5A 1BOTO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T1YK 4OPAA 4DV6K 4B1WB 2D0CA 4K8XA 4JLHA 3O9UA 4I6MA 3F5TA 4FOIA 3NBPA 5AQPA 4FJ8A 3OYLA 4FM2A 4FWLA 1S3XA 3TTFA 2G8HA 4GNIA 1RT4A 3HPOA 2A5XA 1EP4A 3M3ZA 1YT3A 4KTZA 3VF4A 5C10A 4IFYA 4KH4A 4PKIA 4DV7K 3GG4A 1NGCA 2P9KA 1NOYA 4CVNE 5AR0A 4DLGA 4DU1A 2UXCK 2OTJN 1YTAA 3D0PA 2A40A 4E1JA 5C12A 4FJGA 5I9EB 3QEWA 1KSPA 3PY8A 1DTTA 2E20A 3NVKA 2V51B 4O44A 5CYMA 4BREA 2OPSA 1U4BA 3NMUA 4BACA 1ILYA 5LJVA 4CK2A 4U7BA 2NRZA 3HM8A 1FKPA 1S6QA 4FWMA 4RW6A 1RDWX 3ZSQA 2G8WA 4JD2A 3CJ1A 4CERA 1JCFA 2F96A 1JLAA 1GLFO 1WSJA 4JN4A 3FR0A 3LPTA 5HOOA 2O4GA 3A5OC 2NZTA 4J2EA 3ID8A 3K9KA 2P9IB 3SAHA 1Q86O 4FLVA 4M7YA 5ELZA 2Q2RA 4U67L 4O5FA 3H08A 2Q1NA 4LSLA 3V1RA 5ADXA 3AVNA 3VTIA 3GE1A 4MLEA 1O13A 2VWJA 3CMAN 2VG5A 3V6DA 2B6AA 3BF1A 3FGUA 2HHXA 3CCJN 5FLXO 4FJMA 4BRCA 3ZEUB 3T1HK 3CQYA 1SQKA 5I42A 1BU6O 2PFUA 4UY8O 3L8BA 4OKEA 3HJFA 4FXDA 4BGBA 3V1QA 2AJQA 3HRGA 4NCAA 2A41A 2KQ2A 1K8KB 2JWKA 3NGYA 2IVPA 4ISGA 5AQFA 3SCXA 3OYHA 3ZSWA 3VQBA 3RSEA 3DAWA 4I9QA 4DTRA 3P83D 5D3GA 4BRLA 4OX9K 1FJGK 1KTQA 2DY4A 2O8BA 1U48A 1WB9A 4Q0BA 1HNZK 4CHQA 1XQSC 4CHPA 3M5RA 1QZ5A 1W97L 3GOIA 1U04A 2BE2A 1KLMA 2OA8A 5AQHA 1VQON 4FWPA 1NGDA 3KKSA 3NE6A 2NRRA 4KREA 1JLGA 1HUXA 4DTOA 2E1ZA 4FM1A 3A8YA 4CFDA 3AO3A 2PBDA 4H0PA 3QB0A 3EE9A 2GWJA 4KI6A 3TAFA 3CXCM 4OGCA 2UYTA 1J54A 5KPZA 1ZBIA 2ASOA 4I2PA 5J1EA 2FSNA 4DWIA 2FSJA 4B3MK 1IG8A 1X9WA 1ZXOA 3AVBA 1U45A 1WSGA 4DQRA 1RDCA 4CGDA 1T44A 2B5JA 4CEOA 2YCHA 4M3YA 1NKEA 1HNIA 2G8KA 4EIAA 1QZ6A 3ZT1A 1BA0A 1OVYA 2GV9A 3O5BA 1G99A 1RDDA 1IKYA 4DMNA 4BRPA 3SQ4A 4Z94A 3P39A 4I9LA 4H0TB 4OLBA 4DTXA 1J5EK 2QKKA 4C23A 1TYQA 4H4OA 3G4SN 3EKSA 1XNRK 1BQMA 2D0BA 3NVMA 3ZX2A 3MEDA 4H5VA 4LD0A 3WXIA 3ZETB 5CHIA 4JRQA 4YFUA 5HP1A 3M1FA 1WAJA 3K0SA 2WFBA 4FWSA 4K25A 4ID5A 1X9JA 2I5JA 3VQPA 3ZSYA 2OPRA 3FZFA 1NM1A 5CZ1A 3OYMA 1VRTA 3O3GA 5M1QA 1BWFO 3QEPA 1OH5A 4DR6K 3U9ZA 4LY7A 4FJXA 1BCMA 4ILHA 2HHVA 3BZCA 4BRGA 4EZ9A 2QK9A 1Q8IA 4FO0A 1KRPA 1GOBA 3RWUA 4M45A 3O3HA 4M41A 1JLCA 1GLEG 2PAVA 2W40A 2JLEA 1NWKA 4DR5K 1YHQN 4PKGA 5AQKA 4B1UB 5KRTA 4E0DA 2JWLA 3UKUB 1RTJA 4E7LA 1L5UA 2F7TA 4DB3A 1I39A 4N56A 1IKXA 3ZLJA 2NLXA 4LH5A 2XY8A 3OYFA 3ATUA 1RBUA 3CJCA 2V52B 4JV5K 2CGJA 1HKCA 3CG7A 1VSLA 2HOEA 3H45C 3SNNA 4CJVA 1QSLA 3H1QA 2Y1JA 3V9SA 1HPZA 1NG9A 5BRFA 3WT0A 3A0IX 3F2KA 4B9LA 4DV5K 4IJNA 1BI4B 4HHTA 4DFJA 3LALA 3PO5A 2F8TA 4BE2A 1W0HA 3K58A 2VGNA 4PL7A 3WXJA 1KAXA 1LOTB 4BR7A 3DYAA 3KLGA 2Q0UA 5TKWA 4JS4A 3ZX0A 3LDPA 3A5MC 3QIPA 3S5TA 4B9UA 2OTLN 1DEJA 4CEFA 4CHYA 3QEXA 1C0UA 5FPDA 4DLEA 4WYBA 4IOCL 1WSHA 2HSTA 4ISFA 3VENA 3PX4A 3HK2A 3VA0A 5KQ8A 4JNEA 4O4GA 3WUHA 5LL6Z 3LANA 2P51A 4QS9A 5BR9A 3SUQA 5BPLA 2AP1A 4AH9A 3MDQA 1YJWN 3L4IA 4WFAL 4DUYK 2V7ZA 4MQ3A 1VQ7N 3IKMA 1L3UA 2G8IA 2YHYA 4MDBA 1H1VA 3DJCA 3CYMA 2A6AA 4KV8A 3WEEB 3LDQA 2H3GX 3HL8A 3M6GA 1Q9XA 3TAGA 1U2VB 4M3RA 4K8ZA 2PYLA 3LL3A 3PIPL 3RMBA 3NH1A 2G8UA 1C1CA 3T3FA 2FSKA 3QIOA 2EWSA 1UOCA 1SS6A 2KW4A 1NKBA 3IRXA 5JS1A 2E8AA 1N34K 4W5QA 2P9LA 3OTOK 3R9PA 4J2BA 1XNQK 2FBVA 3ZCMA 1LWEA 2DPNA 2QWQA 1JL2A 1CXUA 2QEXN 3E66A 3DXKB 3OYBA 3HVTA 2OZMA 2DFFA 2P1JA 4FOEA 1XC3A 2ZE2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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