3H1QA

Crystal structure of ethanolamine utilization protein eutj from carboxydothermus hydrogenoformans
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
271
structure length
268
Chain Sequence
NAMELEQKLNLLNDLIVREIVNPLPPPYKVGVDLGTADIVLVVTDQEGIPVAGALKWASVVKDGLVVDYIGAIQIVRELKAKVERLLGSELFQAATAIPPGTNAEACGHVVAGAGLELVTLVDEPVAAARALGINDGIVVDIGGGTTGIAVIEKGKITATFDEPTGGTHLSLVLAGSYKIPFEEAETIKKDFSRHREIMRVVRPVIEKMALIVKEVIKNYDQTLPVYVVGGTAYLTGFSEEFSRFLGKEVQVPIHPLLVTPLGIALFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of ethanolamine utilization protein EutJ from Carboxydothermus hydrogenoformans
rcsb
molecule keywords Ethanolamine utilization protein EutJ
molecule tags Structural protein
source organism Carboxydothermus hydrogenoformans z-2901
total genus 68
structure length 268
sequence length 271
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14450 FtsA Cell division protein FtsA
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h1qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h1qA02
3WEEA 2VCPA 1ZBSA 5AQNA 4FSVA 2ZGZA 3A5LC 4MO4A 5AQOA 5AQZA 3UKUA 1U6ZA 4K25A 3MCPA 3IUCA 2E2NA 5AQTA 3VEVA 2Q31A 3SJHA 3VEZA 2P9IB 4BRLA 4BRIA 1JCGA 1T6CA 2FSJA 2NLXA 3R6MA 3DJCA 1YUWA 3HTVA 4BGBA 3C7NB 4O5FA 3DXMB 2AA4A 2E2OA 1KAZA 4LC9B 3DWLA 3H46O 4RTFD 1J6ZA 3HSCA 3U9DA 3ZX2A 1HX1A 4BRHA 1SQKA 4H0TB 4BRFA 4CI6A 2D1KA 3AAPA 3VF4A 1YVNA 3EZWA 5AR0A 1NWKA 3IDHA 3FR0A 2V7ZA 1X3MA 4BREA 3WQUA 1HLUA 1MWMA 2QWPA 3VGLA 1NGJA 5AQSA 3AY9A 5EXWA 3G25A 4JHDA 1ATNA 4IO8A 1NMDA 3CJBA 4BR2A 3FZMA 5LJWA 4BQLA 3WQTA 5AZJB 4IJNA 1NLVA 3O08A 4L3QA 1NGHA 2HF4A 1ATSA 1KAYA 3MN5A 4FWQA 4DQ8A 3VF6A 3EKSA 1HJOA 2IIRA 4M63C 1ATRA 2VWBA 3D2EB 1ESVA 5AQJA 3TPQA 5JLHA 3LM9A 4B1XB 3B8AX 3QFUA 1LOTB 5AQWA 4M7YA 3CJ1A 4WQ5C 3O5BA 3CJ7A 4BRKA 3R9PA 4BQZA 3ZETB 5AQLA 3ZEUB 4BRMA 2GELA 3VOVA 4BG8A 4BGAA 1KXPA 4GNIA 3R8EA 5KQDA 1HKGA 4H5WA 2CH6A 4CZIA 4FWMA 1NGBA 2CH5A 3ID8A 3MN6A 2CGKA 2HMPA 3AARA 5AZIA 2P9PB 3U8XA 3A5MC 4B1VA 2IVPA 4JNEA 1HKBA 2D0PA 2Q1NA 3VF2A 4BR9A 4BROA 4H5RA 3UKRA 5AQPA 4BC3A 3LDQA 3EO3A 4H0YB 1NGDA 4PKHA 4CD3A 1SZ2A 4QS9A 4Z94A 4FL9A 3O6WA 4PKGA 5B8HA 3H3NO 2QWLA 3O1BA 4PL8A 5AQMA 3FZFA 1RDWX 4C23A 1HPMA 4CZKA 2P9LB 2P9KB 1BA0A 1JCEA 3CJCA 1BU6O 3H3OB 3O80A 3IFRA 3O4WA 1HKCA 2E1YA 4K42A 3VETA 5AQIA 3ULEB 5BRDA 4A2BA 2GTDA 4XH1A 5F2RA 4H5NA 3FFKB 3WXKA 3WT0A 1MWKA 3DXKA 1HUXA 4WQ4A 5JLFA 3WXJA 1NM1A 3J8AA 5BPLA 3BUZB 5BRFA 1MDUB 4BRQA 2A6AA 4NB4A 3AAQA 2P9UB 4DB3A 5AQVA 5BRHA 3ZX0A 1EQYA 2W41A 3DAWA 1V4SA 1TYQB 4JD2B 4CJ7A 1BG3A 3SMSA 4RCHA 4J8FA 1NGIA 3CI5A 4H5TA 1U2VB 3A0IX 2YHXA 3VEWA 4F9OA 3L4IA 4QS8A 1X9JA 4FO0A 4ISGA 1GLJO 4JN4A 4NO7A 4YDUC 2E2PA 2F9WA 5AQKA 2Q36A 2P9NB 4IXCA 2E8AA 4EFHA 4FWPA 1NBWA 3BF3A 1H1VA 2PAVA 1C0GA 4I6MA 3L6QA 2QM1A 3WEEB 3UKUB 3ATUA 2Q0RA 3GBTA 4B1ZA 1GLCG 2I7NA 2VYPA 3JXUA 2P9SA 4EAHD 4FOIA 2YHWA 4CBUA 2CGLA 3TU5A 4O8KA 3VPZA 3S41A 3EN9A 3D7EO 4BC5A 3HBTA 5KPRA 2BUPA 1ZC6A 3LDPA 1QHAA 1ZXOA 1GLAG 3LDOA 4A2AA 4CZMA 3ENHA 1BDGA 1BUPA 3F9MA 1E4GT 4CZFA 1K8KA 1NGGA 5TKYA 2GWJA 3D2FA 1BOTO 1V4TA 1T44A 2NZTA 5I9EB 5AQQA 2ZF5O 3GDQA 1QZ5A 2V51B 4BR4A 1DKGD 1P8ZA 3QDKA 2QW9A 4FWKA 4BRNA 4B9QA 2J4RA 1NGAA 4FWNA 4JHDB 4MLEA 1QQMA 2V52B 2A40A 4K43A 3SK3A 3QFPA 1NGFA 3WUHA 4A62A 3MMVA 3P4IA 4HTLA 2Q97A 3OHRA 4KBOA 3VENA 1C0FA 1WUAA 3QB0A 3ENOA 3FLCO 2YJEA 5CE3A 4XH5A 2GEMA 3FZKA 2QWRA 1X3NA 1S22A 5E26A 3KHYA 4GY2B 4YDUA 3HI0A 3RSEA 2H3GX 4B1WB 1R59O 1YXQA 2ASOA 1GLLO 2QWOA 2QXLA 3C0BA 2I7PA 4IWVA 3H45C 4FPBA 1GLBG 4RWTA 5BPMA 4CZHA 5FPDA 4FWOA 2Q2RA 1IJJA 3LDLA 5AQFA 3H1QA 2FF3B 5AFUA 3GL1A 2AP1A 2A41A 4H0VB 5AZIB 5F0XA 4EHTA 1QQOA 3QMLA 4BR7A 5ELZA 4H03B 2GUPA 3MDQA 3BEXA 3VGKA 1BA1A 2P9IA 4ISFA 4H0PA 2GWKA 2QWNA 4BRAA 4CZJA 3UKRB 2A42A 4DHYA 4WQ5A 2ASPA 2YJFA 1BWFO 3EL2A 5AFUH 2E20A 3FZLA 5FPEA 3C7NA 3U4LA 3DXMA 3A8YA 3SMPA 3M6GA 2ZGYA 3ATVA 4JAXA 1QQNA 1CZAN 1DEJA 2IVOA 5LJVA 4BRDA 1SAZA 3FZHA 4MLHA 4EHUA 1QZ6A 4CZEA 1D4XA 5AQGA 1LCUA 5ADXA 3GOIA 4BC4A 3CIPA 3VEXA 4PL7A 4BC2A 4A61A 4B1UB 1GLFO 1RFQA 5AZJA 3DXKB 2HOEA 1OKJA 3BF1A 2A3ZA 1Q18A 3CJAA 3MN7A 2YI1A 2FLOA 4H5VA 1S3XA 3CQXA 5ADXH 5KPZA 3D2EA 2KHOA 2E1ZA 5AQUA 5JICA 3JS6A 4MO5A 2HF3A 3BP8A 1E4FT 3QBXA 5LY3A 2ASMA 4BVPA 1XUPO 2DPNA 4EIAA 5F1XA 3CHWA 2EWSA 3ZETA 3ZEUA 5FPNA 4AM7A 5AQRA 4AM6A 3KVGA 4FWLA 4HWIA 3FE1A 4IJAA 2D0OA 4BRGA 1YAGA 4CZLA 1Z6RA 1Y64A 2QWMA 2PBDA 3QBWA 1KAXA 1JCFA 5JMVA 3A5OC 3I8BA 1Z05A 2IVNA 5E84A 5AQHA 4BRPA 3CETA 4BR5A 2P9PA 3IMXA 4I6MB 2E88A 1RGIA 3GG4A 4PKIA 2BTFA 1DGKN 2YCHA 3LDNA 4BRCA 5AQXA 5BN8A 4XH4A 3M3ZA 3KZBA 2P9SB 4WQ4C 1TUYA 4DCHA 4IZ9A 3CJ9A 5BN9A 3UB5A 2FSNA 1IG8A 2FXUA 1BO5O 4H0XB 5EX5A 4E1JA 5BR9A 1NGCA 1WOQA 2P9LA 2ITMA 2P9KA 4FPAA 1XC3A 4CBXA 3HM8A 4Y0WA 3VESA 3L0QA 1K8KB 1T6DA 4FOEA 2UYTA 3H1VX 3MN9A 4QS7A 3M1FA 5BPNA 2QWQA 3I33A 3D2FB 3LM2A 2CGJA 2NRHA 3ULEA 2F9TA 2FSKA 4CZGA 4BG9A 3VGMA 2FF6A 4ISEA 3SLCA 1NGEA 2WUSA 2V7YA 3FGUA 4BR0A 3O1WA 5EOYA 2E2QA 4FWSA 2P9UA 3CQYA 3CERA 3HZ6A 5EY4A 3U9ZA 3W0LA 3A5NC 4CBWA 4H0OA 3RSEB 1TYQA 4JD2A 2W40A 3VEOA 1TUUA 2A5XA 4XEIA 5FPMA 1MA9B 3O8MA 3VERA 3WXIA 5AQYA 5KQ8A 1U2VA 3W3DA 3H6EA 1XQSC 2D4WA 4B1YB 3GE1A 3MK6A 1GLEG 4K41A 2OANA 4M7XA 4BVOA 1G99A 2Q0UA 3WXLA 5BREA 2YHYA 4WYBA 4CD1A 2ZWHA 3LL3A 1GLDG 4FWRA 3EKUA 3ZX3A 2P9NA 5KPTA 3QICA 3UE5A 5EVZA 3VEYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WEEA 2VCPA 3LWMA 1Y97A 5HRSA 3SQ1A 1B9DA 2AJQA 3F73A 4BE2A 3SJHA 2P9IB 4PWDA 4DR6K 2FSJA 2NLXA 1YUWA 3HTVA 2G8HA 3WNHA 1IBLK 4KB0A 4I9QA 3DXMB 2E2OA 1X1PA 4IDKA 3ZYYX 4RTFD 3LPTA 5H1SQ 3HYFA 3OYHA 4CFBA 4RW4A 1SQKA 3VF4A 5AR0A 4C8NA 2V7ZA 1X3MA 1HNZK 5CHIA 1NGJA 3I0SA 4HHTA 1VSEA 1A5XA 3L2RA 4JKDA 3AGKA 4BR2A 1CZ9A 5M1PA 1ATSA 4V19S 1G15A 1K8AO 4ZHRA 1BHLA 3AA5X 1IBKK 3HO1A 2VWBA 3VQ7A 1U48A 3AVJA 3HSTB 1VSDA 2B4JA 3V1QA 2QEXN 1VSKA 3PLAA 3EYZA 3O5BA 1P90A 4BRKA 4ICLA 1D9DA 3ZEUB 3V9XA 2B6AA 3OS1A 2G8IA 1VSJA 4GNIA 2A1SA 1HKGA 2HNZA 3SJJA 4J2BA 1ZBFA 4JS4A 1EETA 3V81A 2OZSA 2P9PB 2OPPA 4HCCA 4Z4GA 3Q7BA 4FVUA 2W6LA 2IVPA 3A2FA 2UXBK 3THXB 1J5OA 2Q1NA 4BROA 1JL1A 3R1XA 1O13A 3UKRA 5SZTA 4BC3A 3EO3A 2YV0X 1NGDA 1VSMA 4QS9A 3QNOA 4PY5A 2QWLA 4PL8A 2Z1IA 1X9WA 3OA9A 4KH4A 4DWIA 5MLCQ 1RTIA 3J7ZO 1HPMA 4WE1A 2DTUA 3CM6A 2P9LB 4Q0BA 4DTOA 1BA0A 1QE1A 3VQCA 3O80A 3KWIA 3VQQA 4K42A 4C1NK 3DLRA 2UUAK 1C1CA 1VQ5N 4JYAK 4IOAL 4XH1A 3HVTA 3WT0A 1VK0A 2FBTA 1NOZA 1REVA 4DSIA 5J2QA 3WXJA 1VQ6N 1OVYA 4M42A 1NM1A 3AV9A 4CF2A 3J8AA 1BI4A 1TVRA 2W6KA 4HTUA 3AAQA 3AVIA 2P9UB 4DB3A 4LSLA 3MXMA 1VQ4N 3ZX0A 4K8XA 2W41A 3OYGA 1V4SA 4JD2B 4FJ8A 4CGFA 3P39A 4H8KA 3CI5A 1JLBA 3IAYA 2O8BA 1L3UA 1WNSA 4F9OA 3K57A 3L4IA 3OVNA 4ISGA 4JN4A 1QVFM 4YOVA 4LH5A 2G8KA 3BF3A 1H1VA 4X64K 4B1ZA 4JKEA 2VYPA 3JXUA 4DF8A 4YORA 4XIUA 1D8YA 1YVUA 2CGLA 3TU5A 1L3VA 3S41A 4BC5A 1ZC6A 4FJLA 3SQ4A 1ZXOA 2D0AA 1T3VA 3CC4N 3ZSQA 4DSLA 4EP4A 3SAGA 2WOMA 1E4GT 1K8KA 3AA4A 3CFRA 4I9LA 1CZBA 2JWKA 4RG8A 3OBYA 4E19A 2ZF5O 3GDQA 3NBPA 2V51B 2PYLA 2DFHA 3J80O 2OYQA 1DKGD 4BRNA 3D0PA 1NGAA 4JHDB 4DUYK 1QQMA 3NF9A 1X9MA 3SK3A 3QFPA 1NGFA 2G8WA 3WUHA 4A62A 3IRXA 2Q97A 3HM9A 4ELTA 4IFEA 4E7JA 2GEMA 3FZKA 3QIOA 2QWRA 5E26A 4YDUA 1OH6A 1R59O 4BE1A 4GV3A 4G1QA 4HUEA 3VQPA 2O8DB 4J2DA 4CFCA 3EE9A 3PO4A 3RRHA 1NK9A 4KHYA 4CERA 4RWTA 4IOXA 3G0ZA 2NRRA 3VQ9A 1T8EA 1IJJA 1VSIA 2FC0A 3ISNC 1U49A 2A41A 4H0VB 4CEQA 5AZIB 1CXUA 3AO5A 3OS2A 1NMNA 1IKYA 5HL7L 1NK0A 2GUPA 2IC3A 3AVFA 3N4PA 1T03A 3OY9A 4CZJA 4JI3K 4KRFA 1EX4A 3AVHA 2NRWA 3C7NA 3RVCA 4FZXC 4DR7K 1NK6A 5C2FA 3M6GA 2HNYA 3TTFA 3E66A 4I2PA 4DF4A 4B3OA 1RILA 1DEJA 2KW4A 1L5UA 1B92A 3SYZA 1ILYA 3OJSA 1RT2A 4JI5K 1RT4A 1F21A 3NGYA 3B6PA 4W5QA 3THVA 2FBVA 1QZ6A 4CZEA 4CEZA 1XMOK 3MECA 5KRSA 3CCEN 4PL7A 3DXKB 3VMFB 1Q9XA 3LZIA 3CJAA 5KRTA 3RR7A 3O9TA 5T7BA 2FLOA 4JI1K 5KPZA 3CQXA 3PV8A 1NK4A 3HOTA 3M8SA 3D2EA 3OYEA 2KHOA 2E1ZA 5AQUA 1TL1A 5JICA 3TABA 4K0KK 5LY3A 1S1UA 4BVPA 2QTDA 4FLWA 1XI1A 3CPEA 2DPNA 2IAJA 1SKSA 1VQ9N 1ASUA 4FJNA 1EP4A 5AQRA 1TKXA 3KVGA 4HWIA 3FE1A 1YAGA 5K14A 1Z6RA 1CXQA 4C8OA 5CZ1A 2UU9K 2IVNA 4AHCA 5AQHA 4BRPA 3LAKA 2E88A 1RGIA 2BANA 5KGWA 4CJRA 1TK8A 3ZSWA 4CW7B 4I2QA 1WBDA 4OKEA 4CHNA 1J9AA 4HUGA 4KFBA 2EHGA 4F4KA 4WQ4C 1GOCA 4Z4CA 1S9GA 3I55N 3WNEA 1IG8A 4DFKA 4CECA 4AH9A 3QNNA 3ITHA 2QK9A 1NGCA 3D45A 2P9KA 4FPAA 1NKEA 4DTUA 3TR8A 1FXXA 4CBXA 4GVEA 1C0UA 3L0QA 3M1FA 5BPNA 1N6QA 4FK4A 3I33A 3D2FB 1RBRA 3LM2A 2CGJA 2F9TA 2FSKA 4QCLA 4C8MA 2WTUA 4DV7K 4B3MK 1KSPA 2FF6A 4JI8K 4GW6A 1NKCA 1IH7A 2HHQA 5J2PA 3CD6N 4A59A 4BR0A 4CCHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5ELZ A;  2HB5 A;  5M1Q A;  3THW B;  3N4Q A;  4ISF A;  3V1O A;  2GWK A;  3AVG A;  1HQU A;  2ASP A;  2HHS A;  4DMN A;  5FPE A;  4YOY A;  3KK1 A;  1SKW A;  2QKB A;  3A8Y A;  4FJX A;  2IDO A;  1RT3 A;  1LAW A;  1IKV A;  1VRU A;  1QQN A;  1OH7 A;  1NK7 A;  4IDH A;  4MLH A;  2W42 A;  2X6N A;  3T7Z A;  4JRQ A;  2PYJ A;  3SBT A;  3O9R A;  2HND A;  4CFA A;  3GOI A;  2DFE A;  3E1Y A;  1KRP A;  4DQP A;  4PHT X;  3CIP A;  3VEX A;  4BC2 A;  4A61 A;  1L3T A;  1GLF O;  4DQI A;  4OX9 K;  4B9N A;  1XNR K;  2P5G A;  2YI1 A;  4H5V A;  4BWJ A;  3TAR A;  5DK5 A;  3SAF A;  3AO4 A;  4BDZ A;  3JS6 A;  4MO5 A;  2G8F A;  4OPA A;  3KK3 A;  2ASM A;  4CGI A;  1VQL N;  4YOX A;  1K6Y A;  4EIA A;  3CHW A;  2EWS A;  4AM7 A;  2UXC K;  4FWL A;  3NAE A;  3KD5 E;  3K9K A;  1BGX T;  1WSI A;  2PBD A;  4KHU A;  4M3Y A;  3CCV N;  4MDA A;  5E84 A;  1QHT A;  4B9T A;  3EZ5 A;  3IMX A;  4I6M B;  4Z4I A;  4BRC A;  1QSL A;  1A5V A;  4DV2 K;  5BN9 A;  2F7T A;  2O4G A;  3UB5 A;  3OYN A;  3SUP A;  2FSN A;  2FXU A;  3OYB A;  3WNG A;  4FJH A;  3HJF A;  4LFC K;  3P31 A;  3L2Q A;  3VA3 A;  1VSL A;  5BR9 A;  1TL3 A;  1NK8 A;  3G4S N;  1XC3 A;  1HNX K;  1SS6 A;  3HM8 A;  3NF6 A;  4KH5 A;  3H1V X;  4YOT A;  1QSS A;  4DV5 K;  2NRH A;  5DMR A;  2ZJP L;  4B8C A;  2VGN A;  1B9F A;  3JAM O;  3KTQ A;  2KTQ A;  2XRI A;  2F96 A;  4O8U A;  4HUF A;  1W0H A;  4E3S A;  4DR2 K;  4LF9 K;  1NGE A;  4E7I A;  1YIT N;  2O8C A;  4B8A B;  2NRT A;  4U67 L;  4KHW A;  4IBN A;  2HBM A;  4MFB A;  4FLT A;  2RN2 A;  4FWS A;  3CQY A;  3V4I A;  1VQ8 N;  1HPZ A;  5EY4 A;  4YOU A;  1JLC A;  4CBW A;  2E4L A;  4XEI A;  4K8Z A;  3AVB A;  3VQ6 A;  4DFM A;  3NVK A;  5KQ8 A;  5IT9 O;  3LP3 A;  2LSN A;  3VQ5 A;  4DTP A;  2ZJQ L;  3GE1 A;  4JI6 K;  4NLB A;  3T3F A;  4M7X A;  4DFP A;  3WNF A;  4CGD A;  3HP9 A;  2FBX A;  3VTI A;  4OLB A;  2YHY A;  4CD1 A;  2ZWH A;  4GKK K;  1GLD G;  2P9N A;  4UQG A;  4CHY A;  3UE5 A;  3ULD A;  3VEY A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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