1ESVA

Complex between latrunculin a:rabbit muscle alpha actin:human gelsolin domain 1
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords GELSOLIN
publication title Latrunculin alters the actin-monomer subunit interface to prevent polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 112
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1esvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1esvA04
3H45C 1BO5O 3RSEA 4JHDB 1RGIA 4B1UB 4EHUA 5BN8A 5BN9A 1GLBG 3EO3A 5B8HA 4YDUA 5AQRA 4B1VA 5AQXA 4BRPA 5BR9A 4YDUC 3JXUA 3ID8A 5E84A 2GWJA 1KAYA 5AZIB 2KHOA 2Q2RA 4CZMA 3VF6A 3H1QA 3H6EA 5AQFA 5KQ8A 3KHYA 2GUPA 4B1WB 5KQDA 2ZGZA 5EX5A 3CIPA 4H5WA 3QFUA 2BTFA 3O08A 4QS8A 3WQUA 3A5OC 2FXUA 4K43A 3RSEB 1X9JA 2QWQA 5FPEA 2YHXA 2H3GX 5AQGA 5AQVA 5KPRA 3CI5A 3I33A 3EN9A 1KAXA 4GY2B 4BQZA 5LJVA 1NM1A 4WQ5C 2ZF5O 3H3OB 4MO5A 1X3NA 4J8FA 1SQKA 4IO8A 4CZKA 5E26A 2IVPA 3GG4A 4L3QA 4M63C 3HBTA 2F9WA 1GLLO 2E2QA 1ATRA 1EQYA 4ISGA 4A2BA 3G25A 1GLFO 2AP1A 4BRDA 3SK3A 4H0OA 1T6CA 3MK6A 2IVNA 1SZ2A 4EFHA 3BEXA 4FO0A 5ADXA 5BRDA 3EL2A 3LDPA 1V4SA 1GLAG 4RWTA 3ENOA 4IWVA 3VEOA 4BRIA 3FZMA 1MA9B 3LM9A 4H5NA 4DHYA 3MN6A 2QWPA 1LCUA 2ZGYA 2CH6A 2E20A 1ZBSA 4I6MA 3LDLA 5AZJA 4BVPA 5I9EB 2A6AA 4K42A 2NLXA 3J8AA 3D2FB 4CZLA 4B1XB 3A5LC 2P9LA 3CJ1A 3VESA 3L0QA 1C0GA 4BREA 3HI0A 3ULEA 1GLEG 2I7PA 4BC3A 3HZ6A 4PKHA 1Z05A 3M6GA 3OHRA 5AQUA 1K8KA 2ZWHA 2CGKA 3FZKA 4M7YA 3R6MA 1BOTO 3U9ZA 4XH1A 4BQLA 1OKJA 3CERA 1T6DA 5AZJB 4BVOA 1V4TA 1ZC6A 5F2RA 4DCHA 1NGCA 2D0OA 3IFRA 1HLUA 2D0PA 1QHAA 2NZTA 1NGDA 2QWOA 4BRNA 1MDUB 2P9LB 4WYBA 2VCPA 2NRHA 3M3ZA 4IXCA 3ULEB 2E1YA 4BC5A 4H5VA 4AM6A 3ZETA 2CH5A 1BWFO 4BR7A 1QZ5A 3WXLA 2PAVA 4BGAA 3VGKA 4JN4A 5AQYA 2GELA 2VWBA 3C0BA 1E4GT 3VEWA 2P9KB 4WQ4A 2AA4A 2CGLA 1BG3A 4WQ4C 2QXLA 3VF4A 1C0FA 3CETA 1KXPA 2V51B 2WUSA 3WXJA 3D7EO 2QW9A 5AQPA 3ENHA 2W40A 4IJAA 1NGAA 4FOIA 4O5FA 3FR0A 3MN5A 3ZETB 4HTLA 1NGBA 3MCPA 1GLJO 3MN9A 4BG9A 3EZWA 4WQ5A 3WXKA 3EKUA 5AR0A 4BC4A 1BA1A 5AFUH 2Q0RA 2QWMA 4B1YB 2QWNA 3VERA 2HF3A 3FGUA 3IUCA 2D4WA 1NMDA 1KAZA 3SJHA 5EXWA 1E4FT 2V7ZA 5ELZA 4PKGA 2P9PA 4Y0WA 1U2VA 2A5XA 1ATNA 1P8ZA 5BREA 4FPAA 4E1JA 1DGKN 5JLHA 3VGLA 4XH4A 1MWKA 1ATSA 3ZEUA 1TYQA 4XH5A 2D1KA 3ATUA 1GLCG 2P9SA 4FWKA 2HOEA 3QBXA 1NGIA 3A5MC 1BA0A 1HPMA 3DAWA 5JMVA 1IJJA 2QWRA 3HSCA 1HX1A 3SLCA 3QFPA 3DXMA 2P9PB 1QZ6A 1U2VB 2GTDA 1D4XA 4BC2A 5JLFA 4ISFA 1XQSC 2GWKA 2YHYA 4B1ZA 3D2EA 4FWPA 1HKCA 3P4IA 4FPBA 1WOQA 3W0LA 4ISEA 3SMSA 3A8YA 2HF4A 3SMPA 1RDWX 4BRHA 4RCHA 3WQTA 3MN7A 4FWQA 3O5BA 4BRMA 3O4WA 3WXIA 4BR2A 2P9UA 3LDOA 5KPTA 3R9PA 1QQMA 3B8AX 3O8MA 3LL3A 1NGFA 3IMXA 4A2AA 1BDGA 3CJ7A 3DXMB 1LOTB 3DXKA 4FWRA 1HKBA 1NGGA 3C7NA 4MLEA 2P9IA 2E8AA 3FZLA 1NGJA 3D2EB 2P9NA 2YCHA 4CBWA 4EAHD 3BF3A 1G99A 4I6MB 4BRFA 4BRGA 4BRLA 4BR5A 3UKRA 3FLCO 4MLHA 4O8KA 1HJOA 4JAXA 3BP8A 1NGHA 4CBUA 2FF3B 2I7NA 2FSNA 1JCGA 1YUWA 3EKSA 3BF1A 4JHDA 2Q97A 3AAQA 5AQOA 3QMLA 4CZFA 1Z6RA 3QDKA 5BRFA 3DXKB 2J4RA 3ZX0A 5AQMA 3O1BA 5AQJA 2E2NA 4FWOA 2YI1A 4JD2A 3VEZA 4CZEA 5JICA 3QICA 3CQYA 2P9IB 5AZIA 3GDQA 4BROA 1K8KB 3H46O 3I8BA 4BR4A 2P9NB 3VPZA 3R8EA 1H1VA 4FWSA 1NGEA 4H03B 2PBDA 3FE1A 4BRQA 3TU5A 4F9OA 5EVZA 2DPNA 3ZX3A 2YJEA 5AQHA 3UB5A 4FSVA 5AQQA 2FLOA 5EOYA 3GOIA 5LY3A 4H0TB 4H5TA 4M7XA 4A61A 5AQIA 3L6QA 4PL7A 3WUHA 5CE3A 1TUUA 5F1XA 2A41A 2IIRA 1TUYA 2QWLA 5BPLA 2A3ZA 1YAGA 5AQTA 3VEXA 4BG8A 4JD2B 1HUXA 3UE5A 1MWMA 3W3DA 3QBWA 3O6WA 4BR0A 5FPMA 4DQ8A 2V52B 3CJBA 4FL9A 2Q36A 3CJAA 2FSKA 3DJCA 1X3MA 3WEEA 2A42A 4QS7A 2EWSA 4A62A 5FPNA 3H1VX 4H0PA 4B9QA 1S3XA 5FPDA 1WUAA 4FWLA 3LDNA 5EY4A 4BGBA 4GNIA 2Q31A 2FSJA 2W41A 5AFUA 3GBTA 4CBXA 3JS6A 2CGJA 3KZBA 5AQWA 1T44A 4HWIA 3VEYA 1YVNA 3CQXA 3VETA 4Z94A 2BUPA 3VENA 3VOVA 3WT0A 1J6ZA 4C23A 4KBOA 3WEEB 4CZJA 3VF2A 2Q0UA 3M1FA 2UYTA 3U8XA 1QQNA 4RTFD 5ADXH 1ESVA 3ZX2A 3MDQA 1JCFA 1ZXOA 3CJ9A 3AARA 4IZ9A 1DEJA 3GL1A 1HKGA 5AQKA 4CZGA 1BUPA 1NWKA 2HMPA 4H0XB 4BRCA 4K25A 2E2PA 4XEIA 5BRHA 4CD3A 1Y64A 2GEMA 1DKGD 3CJCA 3D2FA 2YHWA 4CJ7A 4H0VB 4QS9A 1YXQA 3F9MA 2ITMA 3ZEUB 1TYQB 3O1WA 2FF6A 3A5NC 2YJFA 3LDQA 4PKIA 2P9SB 3LM2A 4K41A 5KPZA 4CI6A 1XUPO 5BPMA 4FWMA 2IVOA 1RFQA 4PL8A 2VYPA 4CD1A 3FZHA 4MO4A 4EHTA 4FWNA 1R59O 2ASOA 5F0XA 1QQOA 5AQLA 2F9TA 4LC9B 2ASPA 3FZFA 4CZIA 5LJWA 3TPQA 3UKUA 2OANA 3AY9A 2V7YA 1XC3A 3IDHA 1BU6O 3CHWA 2QM1A 3FFKB 1IG8A 3H3NO 3VEVA 1U6ZA 4NB4A 3VGMA 3O80A 5BPNA 1JCEA 1Q18A 4IJNA 3L4IA 2P9UB 1GLDG 4JNEA 1CZAN 1NLVA 3HTVA 5AQSA 2E88A 5AQNA 3MMVA 3QB0A 2E1ZA 4FOEA 2E2OA 3AAPA 4EIAA 3C7NB 2P9KA 3KVGA 3U4LA 1NBWA 5AQZA 4BRAA 3UKUB 3DWLA 1SAZA 4AM7A 3S41A 3A0IX 5TKYA 3BUZB 3HM8A 4H0YB 2ASMA 3GE1A 4BRKA 3UKRB 3U9DA 4H5RA 4DB3A 2A40A 2Q1NA 3ATVA 4CZHA 4NO7A 1S22A 4BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H45C 4B1UB 3I0SA 5BN9A 3DI6A 3CQ8A 4YDUC 4LFBK 2HW3A 3NBPA 3NAEA 3L4QA 2GWJA 3SYZA 1VQ9N 2Q2RA 2Z1IA 1U47A 1RBTA 4CZMA 3H6EA 2HB5A 3CPWM 3RMCA 3T1AA 2YNFA 3CIPA 5D3GA 4H5WA 2VG6A 3SPYA 3EE9A 3A5OC 2FBXA 2FXUA 2HHWA 4CJUA 5J2NA 4DWIA 3RWUA 4B3SK 4HCBA 3RSEB 4Z4EA 2W00A 1NK7A 1RBVA 2DTUA 1N5YA 5KPRA 4O0IA 5LJVA 4GKKK 1FXXA 4JI0K 2PZSA 4WQ5C 2D0AA 4HVJA 1VSLA 4J8FA 4CZKA 4OJRA 5LMUK 2GBZA 3ZT4A 1WSEA 1VAZA 4FJIA 5FROA 5GIPA 1EQYA 4ISGA 4DTNA 3TTCA 1A5XA 4HUFA 1GLFO 1WLJA 4BRDA 3SK3A 2NRZA 4TSXA 1XC9A 1NJWA 4LFCK 4LF9K 2IVNA 3DMJA 4FXDA 4HUGA 4IOAL 2AJQA 4JEPA 5ADXA 3EL2A 4H4MA 1HQEA 4RWTA 4B9VA 5DMRA 4IWVA 3VEOA 1DT9A 4KHPK 2RKIA 2RHKA 4BRIA 5LL6Z 4EP4A 2VQEK 4OLAA 2OCEA 4OPHA 1LCUA 2ZGYA 2E20A 4OKKA 3C95A 3LDLA 4BVPA 3J8AA 2XHBA 2B5JA 4AH9A 3MXIA 2KZMA 2OZMA 3A5LC 3CJ1A 1IG9A 1P90A 5CYMA 3QEIA 4E0DA 4BC3A 4C8LA 1HYSA 3G0ZA 3IG1A 4DFPA 1YT3A 5AQUA 4KV8A 1TK5A 3U9ZA 1BOTO 2IOCA 3PIOL 3RMDA 1OKJA 3CERA 3OYIA 2A1RA 3QETA 3QIPA 4BVOA 1V4TA 5F2RA 3CCEN 4DCHA 3P31A 2D0OA 3IFRA 2NZTA 2Y1IA 1QHAA 4DFMA 2KZZA 4FLZA 4BRNA 1IV0A 3ZSOA 4CJSA 4DV2K 3VQ8A 4NCBA 4B3RK 1SV5A 2UUCK 3QNNA 2F8SA 1QZ5A 3WXLA 2EHGA 5C2DA 2QI2A 2GELA 5FLXO 4DV6K 2P9KB 4WQ4A 3T1YK 1HR0K 1BG3A 1RTIA 3CCMN 4CVNE 4LD0A 1Q86O 3EEQA 3VTHA 2WUSA 3KIOA 3BDPA 3D7EO 4DV5K 1NGAA 4O5FA 4O55A 1VQ7N 1LV5A 1NNEA 4KHUA 1C1BA 4HTLA 5CZ2A 1NKCA 3CMAN 3TTFA 1WBDA 4C8OA 3TI0A 2HBJA 3TAGA 3EKUA 1N8RO 4EZ9A 1BA1A 5AFUH 3S3OA 2HF3A 3IUCA 5EXWA 3OS2A 1VSMA 2HMIA 4FLWA 1RT6A 3HPGA 3CFPA 3S3MA 2V7ZA 3ISNC 4Y0WA 2P5GA 1U2VA 1RT1A 1XWLA 2HHTA 4ZTFA 3L2WA 1NJIO 4DTUA 4ILJA 5BREA 4FJXA 3G10A 1DGKN 5JLHA 3PO4A 4F8RA 1CXQA 4XH4A 1TYQA 3E01A 1NK0A 3KLGA 1ZBIA 3V9WA 4BDZA 2P9SA 4FWKA 2HOEA 3QBXA 1NGIA 4FJNA 1TAQA 4CHNA 5JMVA 3T69A 4KREA 1HX1A 3SLCA 3AA3A 4E1MA 4I7FA 4B3TK 3CCSN 4O8UA 4ISFA 4B1ZA 3CG7A 3NF9A 4DR5K 4KRFA 3I0RA 3W0LA 5AJ3K 3SMSA 3WQTA 4CJFA 3NHGA 1XHXA 2HNDA 2P9UA 3LDOA 3N4PA 5KPTA 4CJ4A 3HT3A 5JS2A 1VSFA 3O8MA 3B8AX 4A2AA 3LL3A 3IMXA 5A2QO 4DTJA 3ZSZA 4DF4A 3I8DA 4JK8A 3OYGA 2PYJA 4RW7A 3SJJA 4FJHA 1DLOA 4EAHD 5DM7L 3HYFA 1HNIA 2OPSA 4KHWA 3UKRA 3ZCMA 4CGGA 2NRRA 4O8KA 1NK5A 1NK4A 3BP8A 3TAEA 2I7NA 2YV0X 2KW4A 3BF1A 3V9UA 4EP5A 3OJUA 3RVCA 2O8BB 2RF2A 3QMLA 4CZFA 3AO3A 2O8DB 1WSIA 4AF1A 4BE2A 4CW7B 4MQ3A 3KD1E 4J2EA 4FVUA 1K8KB 4BR4A 2JGUA 3R8EA 5IT9O 1EWQA 3FE1A 4F9OA 3TU5A 5EVZA 2E6MA 4FSVA 3B6PA 5K14A 3LANA 5AQQA 4CF2A 4CIFA 5EOYA 1W2BM 4PQUA 3NE6A 4CESA 5H1SQ 4I9LA 1VQLN 4CGIA 3SQ4A 4Q0BA 1C1AA 3SBGA 4J2BA 1N36K 3NDKA 3WUHA 1D8YA 4YOXA 1TUYA 2QWLA 3CM5A 4B9MA 3K57A 1YAGA 3BY5A 3K5NA 4CEZA 3DLEA 4YFUA 4B3OA 3UE5A 4M3YA 3QBWA 3O6WA 1WBBA 4OPKA 3CFOA 3CJBA 3K2PA 4DU4A 1S1UA 3MEGA 2YHBA 1TKDA 2X6SA 2EWSA 4A62A 2QA4N 3ZSWA 4IO9L 4FWLA 1LWEA 3S9HA 3P38A 2RPIA 3WNFA 2FSJA 4GW6A 4B9TA 3B6OA 5C2FA 1ASUA 1KVCA 3MX5A 2QTDA 3KZBA 4JI8K 3AA5X 3VETA 4B9LA 1NK9A 3VOVA 4CJTA 5JENA 1J6ZA 3WEEB 4A5AA 3TARA 3U8XA 3LPUA 4X62K 1HMVA 4IG3A 2RE2A 4IDKA 5ADXH 3ZX2A 5M1PA 2G8HA 1C0TA 5AQKA 1BQNA 2EX3A 4BRCA 1Q8IA 2HMPA 1KVAA 3OYLA 4DTXA 1S1WA 1L3VA 2E2PA 4XEIA 4CD3A 4NLCA 3CM6A 4HHTA 4BEBA 2YHWA 2ITMA 2O8EA 1YI2N 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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