1ESVA

Complex between latrunculin a:rabbit muscle alpha actin:human gelsolin domain 1
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords GELSOLIN
publication title Latrunculin alters the actin-monomer subunit interface to prevent polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1esvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1esvA04
4H5RA 1GLEG 2YHWA 2UYTA 3W3DA 2YHXA 5I9EB 1S22A 4BRHA 2E2NA 5BPNA 3CHWA 2P9NA 4JN4A 3VERA 1HX1A 3MN6A 3MCPA 5E84A 3GG4A 3ZEUA 5JLFA 4NO7A 2YJEA 2P9NB 1BO5O 2CH6A 4DHYA 2E2OA 1NGCA 1GLFO 3RSEA 1NGBA 4BR2A 1NLVA 3ZEUB 4H5TA 2V7YA 4A2AA 2KHOA 2GWJA 3CIPA 3M3ZA 5KPRA 1C0FA 3O08A 3RSEB 4BGAA 3GL1A 1T6CA 3UKUA 5AR0A 3IMXA 2A42A 5BR9A 2GWKA 1DEJA 4IXCA 4JAXA 5JICA 5AQRA 3IFRA 4QS8A 1HLUA 4FSVA 1QHAA 2HMPA 3VEZA 1BA1A 2IVNA 3LDOA 5FPDA 2DPNA 5BPLA 4BRGA 2Q2RA 3O4WA 5ADXH 4H0TB 1NWKA 1E4GT 4CZHA 1C0GA 4AM7A 1V4TA 3KHYA 5E26A 4CI6A 3D2FA 3ZX3A 2NLXA 2FF3B 2H3GX 3DXKA 3EO3A 3U8XA 3DWLA 3HBTA 5AQLA 3VOVA 3L0QA 3QDKA 3VGKA 4H0VB 1ATRA 3FLCO 2QWQA 3D2FB 2A3ZA 4GNIA 4GY2B 3VEWA 1MA9B 3DXMA 3DXKB 4PKIA 3S41A 3GOIA 3HSCA 1P8ZA 1SAZA 4WQ4C 1U2VA 4ISEA 5LJWA 3J8AA 4CBWA 5CE3A 2FXUA 3DXMB 4H0OA 5F2RA 4CZKA 4IJAA 1U2VB 5AQWA 1H1VA 1MDUB 2A40A 2Q97A 3EZWA 1X3NA 3WEEA 4WQ4A 4BRNA 5BRDA 5EVZA 1NGFA 2VWBA 4PL8A 3H3OB 3ULEA 2EWSA 3W0LA 5LY3A 3GDQA 4BR7A 3MMVA 3WXJA 3GBTA 4CJ7A 2D0PA 1Y64A 3BP8A 3WEEB 3UKRA 1KXPA 4BRMA 3A5NC 3BF3A 4FWPA 3A5MC 5AQTA 1NGHA 3ULEB 5AQZA 2FSKA 5FPNA 2D4WA 3CJCA 3AARA 3C7NA 5AQMA 1BOTO 4CZEA 3H1VX 1YAGA 3UKRB 3MN7A 3ZETA 4DQ8A 3FE1A 4CZFA 5BN8A 1NGAA 5JLHA 3ENOA 4AM6A 3CI5A 3U4LA 2P9KB 2E1ZA 1HJOA 3C7NB 2P9SA 1EQYA 2OANA 4BR9A 2QXLA 2CH5A 4BRCA 2PBDA 3AAPA 1QZ5A 2GEMA 2QWOA 4EHTA 2D1KA 3ZX2A 4Y0WA 2E2QA 4IWVA 5AQSA 1GLLO 5LJVA 1KAZA 1ATNA 2P9SB 3O6WA 5BN9A 4BRDA 4HTLA 3IUCA 4BGBA 2P9IA 3ATVA 2ZGYA 4BRFA 2W41A 3WUHA 4FWQA 5AQJA 2YJFA 2AP1A 5AFUA 3CJ7A 3DJCA 1GLDG 3C0BA 3LM9A 4H0PA 2ITMA 4CZJA 3CJAA 2P9IB 4MO4A 2VCPA 4YDUC 4HWIA 4ISFA 4IZ9A 1T44A 2ZGZA 3WT0A 1ESVA 3VGLA 1Q18A 5AQYA 2V51B 1BU6O 3F9MA 3ATUA 3L4IA 3LM2A 3H6EA 2CGKA 3AY9A 4PL7A 1HKGA 4YDUA 5AQVA 4JHDA 2E20A 3LDNA 4FPBA 3P4IA 4BREA 1R59O 4CZIA 2P9LA 4BG8A 3O1BA 4FWNA 2HOEA 2Q1NA 3SK3A 2IVOA 3UKUB 2ZWHA 1CZAN 1QQOA 2E88A 5AQUA 4BC4A 1K8KA 3ZX0A 3HZ6A 4A62A 3ID8A 4WQ5C 4KBOA 2P9LB 1HPMA 2NZTA 4DB3A 3WQUA 1NGGA 4PKGA 4M7XA 1QQMA 3H46O 4FWOA 3D2EA 1RGIA 4M7YA 3CQYA 4LC9B 5AQFA 1WUAA 4H0YB 2D0OA 4FL9A 5KQDA 4WQ5A 3WXLA 4XEIA 3OHRA 3EKUA 2QWRA 2ZF5O 2Q0UA 3R8EA 5EXWA 1X9JA 1YXQA 3FR0A 4E1JA 5F1XA 4B9QA 4RCHA 4EFHA 5AQOA 4A61A 1U6ZA 1ZBSA 1IG8A 3EN9A 5BREA 1Z6RA 5KPZA 4B1WB 3BF1A 1OKJA 4XH1A 3MDQA 3VEXA 3QB0A 4K43A 1ATSA 1G99A 4EHUA 1DKGD 4H03B 4O5FA 3AAQA 2FSJA 1IJJA 1HUXA 3FFKB 3LDQA 3QBWA 1BG3A 4FO0A 1X3MA 1TUYA 1LOTB 5BPMA 2YI1A 1NGJA 3DAWA 4O8KA 4CZLA 5AQQA 5KQ8A 4FWKA 3R9PA 3SMSA 2HF4A 2A5XA 2WUSA 1NGDA 1BUPA 1WOQA 2Q31A 4ISGA 5ADXA 2J4RA 3LDPA 5AQHA 3R6MA 4MLEA 1ZC6A 4BVPA 3M1FA 3VEYA 3ZETB 1SQKA 4B1ZA 3A8YA 4J8FA 4BC5A 3A5OC 4CD3A 2F9WA 5BRFA 3CERA 4H5WA 2A6AA 3A0IX 3SJHA 3O8MA 2HF3A 3A5LC 3D7EO 4XH4A 5BRHA 4H5NA 4BRQA 3O5BA 3KZBA 4RWTA 4M63C 1KAXA 4MO5A 3VF6A 2ASOA 4F9OA 4B1XB 3ENHA 2A41A 3QFPA 1Z05A 1DGKN 2AA4A 4B1UB 4BQZA 2QWNA 4BQLA 3JS6A 3U9DA 1JCGA 4JNEA 2FF6A 3SMPA 1S3XA 3H1QA 1HKBA 5AQIA 2QW9A 4FPAA 2P9UA 1NGEA 4CBXA 3QFUA 1GLCG 2YCHA 4JD2A 1GLBG 3L6QA 3VETA 4QS7A 4IJNA 3VESA 3LDLA 4MLHA 2P9UB 2GTDA 2GUPA 4B1VA 4FWLA 3EKSA 3FZLA 4JD2B 3TU5A 2NRHA 3QMLA 2I7NA 4BR0A 3IDHA 3TPQA 3WXKA 4DCHA 4JHDB 3I33A 3CETA 4IO8A 5F0XA 4CD1A 4XH5A 4EIAA 1BWFO 1XQSC 4BR4A 3JXUA 5AQGA 2QWLA 1MWMA 2BUPA 3MN9A 3QBXA 1K8KB 1TYQA 3BUZB 1LCUA 3VENA 1BA0A 2E2PA 4H0XB 4K41A 5EX5A 2W40A 3B8AX 3FZKA 4BRIA 4PKHA 1XUPO 3O80A 1TYQB 3D2EB 2FSNA 3MN5A 1KAYA 4K25A 5EY4A 5AQXA 2QWPA 3WQTA 3WXIA 5ELZA 1GLJO 5AZIA 3QICA 3M6GA 4EAHD 3VF2A 5JMVA 1JCEA 2Q36A 4L3QA 2V7ZA 2P9PA 1NM1A 3CJ9A 4WYBA 3HI0A 5AZIB 4FWMA 5AQPA 4CBUA 1QZ6A 3VGMA 3CJ1A 4QS9A 2ASMA 3HM8A 5AZJA 3BEXA 2CGLA 1T6DA 2E8AA 1NGIA 2VYPA 2P9PB 4C23A 4FWSA 2QWMA 5AFUH 4BRPA 3VF4A 4BVOA 4H5VA 3CJBA 1GLAG 5AZJB 2FLOA 1RDWX 1ZXOA 3MK6A 3FZHA 2E1YA 3FZFA 3UE5A 2Q0RA 1JCFA 2CGJA 2BTFA 2QM1A 5AQNA 3FZMA 4I6MA 1NMDA 3KVGA 3I8BA 5B8HA 3CQXA 4A2BA 4BC3A 1MWKA 4BROA 4BRKA 3EL2A 3G25A 1YVNA 1D4XA 3UB5A 2IIRA 3H45C 3VEOA 1NBWA 4I6MB 3HTVA 5FPMA 5TKYA 1BDGA 3O1WA 5EOYA 4NB4A 4FOEA 2P9KA 3VPZA 4Z94A 4K42A 1E4FT 1V4SA 1QQNA 4B1YB 4FOIA 1RFQA 2ASPA 4CZGA 1J6ZA 3GE1A 2PAVA 4BRLA 2GELA 4BG9A 2IVPA 1XC3A 2YHYA 3U9ZA 4CZMA 1TUUA 3LL3A 1SZ2A 4RTFD 2F9TA 3FGUA 2I7PA 3H3NO 2V52B 5FPEA 3VEVA 3SLCA 4BC2A 4BR5A 5KPTA 1YUWA 5AQKA 1HKCA 4FWRA 4BRAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLEG 2C1GA 1WSFA 1HYVA 2OPSA 3O9TA 4CVNE 3IG1A 5I9EB 4DTXA 1OVQA 4M3ZA 3NH1A 4BRHA 2DTUA 5BPNA 4JRQA 2OCEA 3RR7A 1S6PA 4HCBA 3GG4A 3S5TA 4NO7A 2WBNA 4FYDA 1NG9A 2RN2A 4CHPA 1YI2N 2ZJPL 1NLVA 1JLCA 2GWJA 3TAMA 4QCLA 1C0FA 1XC9A 3HOSA 4BGAA 3GL1A 4YOUA 3BDPA 3AVGA 3IMXA 2A42A 4A59A 3N4PA 4FLXA 4DTRA 4LFAK 5KRTA 1WN7A 3V9UA 3KK3A 1HLUA 3NGYA 1QHAA 4CJRA 2IVNA 3SPZA 3B6OA 2HNYA 2Q2RA 5HROA 3CCJN 1C0GA 1TKTA 1IBLK 4LH5A 1K8AO 1Q9YA 4OPHA 3KHYA 4CI6A 5JS1A 3LZJA 1VSDA 2KLAA 3C6AA 1RT5A 3EO3A 2R7YA 4DU4A 1JXBA 1QSSA 3VOVA 3L0QA 1LAWA 1SL2A 3FLCO 2E4LA 3P83D 5KI6A 3DXKB 1OH7A 1O1WA 3CYMA 1DT9A 3OYDA 2QKBA 5LJWA 1VQNN 4CK1A 5J1EA 3ZSXA 2FXUA 4AHRA 4H0OA 4CZKA 3NAEA 1U2VB 1RT3A 4E7JA 4Y1CA 4KH4A 3WEEA 2Q97A 4CGHA 1X3NA 3SAGA 4I9LA 1NK0A 4E72A 2VWBA 5LY3A 1C0UA 4Y1DA 3KLHA 3WXJA 3GBTA 1Y64A 3V9SA 3QERA 1KXPA 1VSMA 4BRMA 4ELUA 4CEQA 3BF3A 3A5MC 3ULEB 4OPJA 1VRTA 5AQZA 5FPNA 2D4WA 3CJCA 3C7NA 4B9SA 4FJXA 1BISA 4KHNA 4LSNA 3LP3A 3TAQA 3FE1A 1NGAA 3ENOA 5TKWA 2E1ZA 3MX2A 3ZSYA 4FJ8A 2P9SA 4BRCA 4HUGA 1IG9A 1QZ5A 4IEIA 4EHTA 3LANA 3MXIA 2BH1A 2E2QA 3JYTA 1IKVA 4C8KA 4WFBL 1JLFA 1T7PA 4EZ9A 4I7FA 4KHPK 1IO2A 5JS2A 4DV4K 4BGBA 5C2FA 3ATVA 2ZGYA 5J2NA 1RBSA 2W41A 1BIZA 2YJFA 4JV5K 2AP1A 1HRHA 4ICLA 1SS6A 4H0PA 2LSNA 3NCIA 1N32K 4IZ9A 1OVYA 2G8FA 1JJ2M 1YVUA 1T44A 2HHXA 3WT0A 5HL7L 3K5MA 3VGLA 1VQ9N 1NOZA 2RF2A 4YOTA 3K59A 4CEAA 1BU6O 4OKEA 1D9DA 2O8DB 3H6EA 4DR1K 3AY9A 1BQNA 2KKZA 3DOLA 1TAUA 4E7KA 3KD5E 3LDNA 3P4IA 3KWIA 5D3GA 3F2KA 3QETA 1FXXA 3O1BA 2HOEA 4FK4A 2Q1NA 2IVOA 3ZSQA 1JLQA 3BGRA 3ZX0A 5H1SQ 1N5YA 4WQ5C 2P9LB 4C8LA 1RT4A 3K2PA 4YHHK 2YV0X 3ENBA 1HPMA 4CJSA 3P1GA 4DB3A 4M7XA 1QQMA 1WAFA 3D2EA 3LALA 3RMCA 2ZM6K 5A2QO 1WUAA 2VWKA 4WQ5A 3I0RA 3WXLA 2QEXN 4QAGA 2XY8A 3PIOL 2ZF5O 2Q0UA 3HL8A 5EXWA 2FBVA 5CY4A 5IT9O 3FR0A 4J2DA 4B9QA 4QOZB 3ZLJA 3D45A 3NDKA 5JENA 1W97L 5AQOA 3NH0A 4CEDA 4B8AB 3O9SA 4FLWA 1OH5A 2O4IA 4FW1A 2XY5A 4YY3K 1Z6RA 4CJ3A 5KPZA 3OTOK 4PUOA 3P5JA 4Z4CA 4B3TK 2PFUA 2OA8A 4EHUA 1DKGD 4O5FA 3NF6A 2FSJA 1IJJA 4CEZA 3WXMB 3OS1A 2PZSA 1TUYA 4FLYA 1C1CA 4XIUA 5KRSA 3L2RA 1W2BM 1NJXA 4O8KA 1N33K 3R9PA 4CHOA 1N34K 2WUSA 3LDPA 3TTDA 1IKXA 2WC9A 5KGXA 2HHSA 3M8QA 4ZTFA 1W7AA 4BVPA 3M1FA 2IGIA 3VA3A 3ZETB 4DQSA 4MQ3A 3A8YA 3QIOA 4DFPA 5GINA 4CD3A 3ZSWA 2BDPA 2F9WA 5JVGL 3CERA 4DV0K 2A6AA 3DLGA 5M1OA 2HF3A 1VQPN 4IEEA 5K14A 3KZBA 2QA4N 4E1MA 4NYFA 1KCFA 1TK0A 4MO5A 1L3UA 3KLFA 3LZIA 3THYB 1KVAA 3QFPA 3V9WA 1DGKN 4BQLA 4K0KK 1JCGA 3U3GA 1Y97A 4CHYA 4OLBA 3H1QA 2HNDA 5AQIA 1NGEA 4DQRA 3O3HA 3PX0A 2G8IA 3KJVA 3L6QA 3VETA 4QS7A 4AILC 4IJNA 2KW4A 4IDHA 5LMNK 1VSIA 3HYFA 4JD2B 3FZLA 4CECA 2ZE2A 5GADP 3TPQA 4M3XA 4BE1A 1B9DA 4IO8A 5F0XA 3K5NA 4EIAA 4OGEA 1L3SA 4ID5A 1E3MA 4BR4A 4A57A 2QWLA 5CR4A 2D5RA 3THWA 1S6QA 1NJZA 3P31A 1LCUA 3VENA 1BA0A 2E2PA 4H0XB 1VSLA 4K41A 3HXMA 3NVMA 2P5GA 1FJGK 3B8AX 4PKHA 3AVFA 3DMJA 3O80A 4E3SA 3TSPA 5AQXA 3WXIA 5ELZA 2O8BA 4KTWA 3CMAN 4NLCA 1NK4A 4FK2A 2Z1JA 4UQGA 1S1UA 3SNNA 2V7ZA 3HI0A 5HBMA 4CBUA 1QZ6A 5CZ1A 4HCCA 4QS9A 5AZJA 1T6DA 3CC4N 2E8AA 2VYPA 2VG7A 4FWSA 4OJRA 2QWMA 5M1NA 4BE0A 4KV8A 3VF4A 3EE8A 4LF5K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4GVM A;  3HT3 A;  4BRQ A;  3O5B A;  1RNH A;  3VA0 A;  4EP5 A;  4I9Q A;  4M63 C;  1Q86 O;  1KAX A;  3VF6 A;  3QEX A;  1ASU A;  2IAJ A;  3OW2 M;  2HVI A;  4ILG B;  4E1N A;  1U45 A;  4B1U B;  1M90 O;  2AA4 A;  4K8Z A;  2PYJ A;  4CK3 A;  2HW3 A;  4CF1 A;  2OPR A;  3U9D A;  1U48 A;  3LPT A;  1L3T A;  4DSJ A;  1HKB A;  3MX5 A;  4KTZ A;  2QW9 A;  2UXB K;  3QFU A;  4KRE A;  4YOV A;  5C15 A;  3MAQ A;  3J7A P;  4B8C A;  4JD2 A;  4BDP A;  5HLF A;  4FJ9 A;  4FXD A;  3SUQ A;  1SUQ A;  3MXM A;  4CIE A;  1X9S A;  3VES A;  4NCA A;  4WFA L;  4HHT A;  4HTU A;  3VQ6 A;  4FVM A;  2GTD A;  3Q7B A;  3OYE A;  3NE6 A;  4DFJ A;  3AVA A;  4BY9 C;  4FWL A;  4DG1 A;  1VQ4 N;  1RDA A;  4DF4 A;  1CZ9 A;  3KKS A;  1SL0 A;  3NF9 A;  4DCH A;  1C0T A;  3CET A;  3HP9 A;  4CD1 A;  4XH5 A;  4A5B A;  1XNQ K;  3BUZ B;  3J7Y P;  1NK8 A;  3AVK A;  5DMR A;  4O0J A;  5EX5 A;  1UA1 A;  1U4B A;  3RR8 A;  4CGJ A;  3TTF A;  4RW7 A;  3FFI A;  2FSN A;  1RBU A;  4HUF A;  1KAY A;  4OGC A;  4X62 K;  4KHQ A;  1I3A A;  4CGF A;  4CGD A;  1GLJ O;  2OZM A;  1YIJ N;  3VF2 A;  4KTQ A;  1ZBI A;  2EHG A;  1Z26 A;  3AVL A;  5DM7 L;  1NM1 A;  2NRW A;  3CJ9 A;  4WYB A;  1BCO A;  5AQP A;  3HM8 A;  3BEX A;  1TVR A;  4N47 A;  3CC7 N;  1X1P A;  2P9P B;  4C23 A;  3AO2 A;  4C8M A;  4IO9 L;  4BVO A;  3AO5 A;  5HP1 A;  2B5J A;  3TWH A;  3FZH A;  3FZF A;  1LWC A;  3OA9 A;  3T1Y K;  1NMD A;  4CE9 A;  3SI6 A;  3T3F A;  1YT3 A;  3DLE A;  1S1V A;  1MWK A;  4BC3 A;  3CCM N;  1KC8 O;  3G25 A;  2D0A A;  4FLU A;  4DMN A;  3CM5 A;  4CEO A;  5BR8 K;  3F5T A;  3TAB A;  3MXJ A;  1S9G A;  3HTV A;  4DTS A;  1LW2 A;  5TKY A;  2WTU A;  3O1W A;  4FJK A;  1TKD A;  3PUF A;  4CCH A;  4FOE A;  4EP4 A;  4LF6 K;  3VQB A;  3J80 O;  2E5L K;  4OO1 J;  3NBP A;  3KD1 E;  4M3Y A;  1KSP A;  4H8K A;  3TAF A;  4CZG A;  2WFB A;  2YNH A;  1LAV A;  4CIG A;  3OVN A;  1S9E A;  2GEL A;  1X9W A;  1XC3 A;  2YHY A;  3U9Z A;  4CZM A;  4RTF D;  1U47 A;  1B92 A;  4FJM A;  3SLC A;  3TAR A;  4DTM A;  4BDY A;  3V9X A;  3C94 A;  1ILY A;  4W5Q A;  1HKC A;  4BRA A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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