1ESVA

Complex between latrunculin a:rabbit muscle alpha actin:human gelsolin domain 1
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords GELSOLIN
publication title Latrunculin alters the actin-monomer subunit interface to prevent polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 112
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1esvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1esvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1esvA04
3CJAA 4RCHA 3TPQA 4FSVA 4BQLA 3H46O 4CD1A 3ULEA 1NWKA 5EOYA 2D1KA 3VF6A 4QS7A 4JAXA 5AQGA 4WYBA 5EVZA 4DQ8A 3RSEB 3ZX2A 4BVPA 3M1FA 5AR0A 4QS9A 3H3NO 3HI0A 1SQKA 3UKRB 3VENA 5JLHA 2H3GX 1NGFA 4BC4A 3CETA 1HKBA 1E4FT 4M63C 4H0PA 1BUPA 1NGAA 1GLCG 1NLVA 5TKYA 3GL1A 4H0TB 4BRPA 2P9KA 4PKIA 3EKUA 4IWVA 3DJCA 4MO5A 2GEMA 3ZETA 1MA9B 4I6MA 4O5FA 5BPNA 1BOTO 2ZF5O 3UKUB 4EAHD 1V4SA 2BUPA 1K8KA 4CZEA 5JICA 3A5LC 3D2FB 3C0BA 3ZX0A 2FF3B 3VERA 3CERA 4EIAA 3ZX3A 5AQPA 3WQUA 3VF4A 5AQTA 1R59O 1NM1A 4BC5A 4BRHA 2P9IB 4ISEA 3D7EO 4NO7A 2P9LB 2VYPA 2VWBA 1TUUA 4BRLA 1GLLO 5CE3A 3UKRA 4FO0A 1LCUA 4CD3A 1SAZA 2VCPA 3MN9A 2QWMA 3FR0A 2YHYA 5JLFA 3BUZB 2NRHA 2P9SB 4BRIA 5FPMA 2D0OA 4WQ4A 4A62A 5KQ8A 2DPNA 2YCHA 1YAGA 4BC2A 4FWMA 3EL2A 1HLUA 2V51B 2QWNA 1BU6O 1NGHA 3H3OB 5AFUH 3VETA 4BRGA 4DCHA 1SZ2A 4JNEA 2GWJA 3G25A 1IG8A 4WQ4C 1X9JA 2D4WA 2P9UA 5AQQA 3WXJA 4BQZA 2QM1A 4CZLA 2CGLA 3HM8A 4BREA 2ASMA 2QWRA 3LDPA 4JD2B 3H1VX 3H6EA 4BRAA 3SMPA 3UKUA 3WUHA 1WUAA 2E2QA 3D2FA 4MLHA 4B1UB 2IVPA 4XH4A 4BR7A 2Q0UA 2FF6A 4FWOA 1Z6RA 2I7PA 3CJCA 3QBWA 4RTFD 3VGLA 2P9IA 1TYQA 2ITMA 2P9LA 3WXKA 5AQIA 2GWKA 3BEXA 3C7NB 3SK3A 1DGKN 4M7YA 2PBDA 4IZ9A 4BR9A 3D2EB 1BWFO 4CBXA 4HWIA 1HUXA 1ZBSA 1QZ6A 2E2NA 2ZGZA 2WUSA 3BP8A 3QFUA 1IJJA 3VEXA 1MWKA 4ISFA 1C0GA 3JS6A 4J8FA 4B1WB 2A5XA 2ASOA 4FWPA 1XQSC 1Z05A 5AZIB 4B1VA 3EZWA 3J8AA 3CJ9A 4JD2A 1GLFO 3A5MC 2E2PA 3KHYA 4JHDB 4B1YB 2Q97A 1BO5O 1U2VA 3SJHA 3SLCA 5BR9A 4CZGA 5BRHA 4CI6A 3FE1A 2GELA 3U9ZA 1T6CA 4IO8A 2E1ZA 3GDQA 4H0VB 4PKGA 1MDUB 4FOEA 4IJNA 4FWKA 5AQYA 5BN9A 1ATRA 1S22A 4FWQA 3M6GA 3CJBA 4MO4A 5BRDA 1HKGA 5AQMA 3C7NA 1JCFA 3DWLA 3MN6A 3FFKB 3ZEUB 5KPZA 2P9NB 1DKGD 3QBXA 4IXCA 3VEYA 2OANA 3D2EA 3VEWA 5KPTA 4XEIA 3QMLA 1HKCA 2QWQA 2QW9A 4CZJA 2F9TA 2HMPA 2YI1A 3GOIA 1NGEA 2Q2RA 3R9PA 4BRMA 3TU5A 3UB5A 1DEJA 2FLOA 1ESVA 3VPZA 4H5TA 3RSEA 1LOTB 5AQVA 1CZAN 2P9PB 3MN5A 2NLXA 5AZIA 5F1XA 1RFQA 4F9OA 2IVNA 3L4IA 4FOIA 1NMDA 1KAXA 5FPDA 1D4XA 2YHXA 2V7ZA 4H5WA 4K43A 1E4GT 3GBTA 3DXKB 2ZWHA 4JHDA 5LJVA 1GLAG 4FWLA 4CZFA 1ATNA 1C0FA 1KAYA 3DAWA 2J4RA 4Z94A 2E8AA 4LC9B 5KQDA 3ATUA 2V7YA 4C23A 3ATVA 3HBTA 5ADXA 4K41A 1HX1A 2GTDA 4BRFA 3GE1A 4WQ5A 4BR0A 4PL8A 5EY4A 3ULEB 4CZHA 4H5VA 4BROA 2A41A 3ZEUA 2P9NA 1YVNA 2FSKA 3QDKA 1BA0A 2CGKA 1P8ZA 3AY9A 5LJWA 2FSNA 3FZFA 5AQNA 4B9QA 3WT0A 1U6ZA 3FZLA 5AQZA 3GG4A 3AAQA 4H0OA 4PL7A 4H5RA 1T44A 3WXLA 2NZTA 3L6QA 1RGIA 2W40A 3U4LA 3CHWA 3HSCA 2P9PA 2A6AA 3HZ6A 3QICA 3ENHA 3EKSA 3CIPA 4H03B 3AAPA 2P9SA 4XH1A 4MLEA 4EHTA 1NGIA 3CJ7A 4JN4A 3ZETB 2F9WA 3DXKA 3LDQA 3W0LA 3ENOA 2CH5A 4BVOA 5E84A 3AARA 1X3MA 3CI5A 4BRDA 3MMVA 4B1ZA 4M7XA 3MCPA 3VGKA 4BGAA 3O6WA 2YJEA 5AQRA 1K8KB 5AQOA 4BRKA 4BC3A 1KXPA 5AQJA 2E1YA 2PAVA 3FLCO 3I33A 2FSJA 4CBWA 1EQYA 2KHOA 3O08A 4BRQA 3KZBA 2QWLA 3O1WA 2QXLA 1BDGA 2V52B 5AQHA 5AQXA 4E1JA 3VESA 5FPEA 1XUPO 4BRCA 1ZC6A 4EFHA 5B8HA 4BR2A 4CBUA 4ISGA 5FPNA 2EWSA 3ID8A 5AQLA 4BRNA 4BR4A 1GLEG 1GLJO 1YXQA 2I7NA 5AQSA 3I8BA 5BPLA 3EO3A 5AQWA 2D0PA 3QFPA 4FWRA 4A2AA 2E20A 2HOEA 3R8EA 1ZXOA 1GLDG 4CZMA 5AQKA 1Q18A 4YDUA 3BF1A 3MDQA 4CJ7A 2YHWA 3IFRA 4A2BA 3FZHA 5EX5A 5JMVA 3O1BA 2E2OA 1H1VA 5AFUA 2P9UB 2FXUA 2IIRA 4O8KA 4BR5A 5BPMA 2CGJA 3A5NC 4DHYA 5KPRA 1QHAA 2Q1NA 3BF3A 3DXMB 4YDUC 2QWPA 5BRFA 2HF4A 2ASPA 3A0IX 1QQOA 5AQUA 4PKHA 5AZJB 2HF3A 1OKJA 5F2RA 1YUWA 4H0XB 1HJOA 1V4TA 4FL9A 1XC3A 1BA1A 3O5BA 3FZMA 4HTLA 3VEOA 5I9EB 3CQYA 2Q0RA 4GY2B 3LL3A 3UE5A 4RWTA 2CH6A 3LDLA 1X3NA 1TYQB 1RDWX 3VEZA 3JXUA 3FZKA 3O8MA 2AP1A 1QQMA 3LDOA 4K25A 2QWOA 3QB0A 3R6MA 4QS8A 5ELZA 3VOVA 2BTFA 3WQTA 5E26A 3WEEB 3VEVA 3IMXA 4XH5A 1NGDA 4H5NA 1T6DA 1GLBG 1QQNA 3FGUA 4K42A 3LM9A 1JCGA 2A3ZA 4FWSA 3KVGA 1Y64A 1J6ZA 4FPBA 3F9MA 3U9DA 1NGJA 4NB4A 3O4WA 1NGBA 4B1XB 5EXWA 3LDNA 4BGBA 1MWMA 3CQXA 5BN8A 4EHUA 4WQ5C 3A8YA 3S41A 3IUCA 3P4IA 4CZIA 2UYTA 2GUPA 3B8AX 3A5OC 1NGGA 3VGMA 3DXMA 3IDHA 3L0QA 4CZKA 4BG9A 3EN9A 2YJFA 3SMSA 1QZ5A 1U2VB 2Q31A 1BG3A 2IVOA 5AZJA 4GNIA 2P9KB 3U8XA 1WOQA 3LM2A 1S3XA 4BG8A 2A42A 2AA4A 3MK6A 3H45C 4IJAA 5BREA 3O80A 5F0XA 2Q36A 1NGCA 3WXIA 3CJ1A 4FPAA 5LY3A 4A61A 1G99A 4H0YB 4I6MB 3W3DA 4KBOA 2W41A 2ZGYA 3MN7A 4Y0WA 5ADXH 1HPMA 3M3ZA 1KAZA 3WEEA 4AM7A 3HTVA 5AQFA 1NBWA 4L3QA 4AM6A 2A40A 1ATSA 3H1QA 3VF2A 1JCEA 1TUYA 4DB3A 2E88A 3OHRA 4FWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RCHA 3TPQA 3KLGA 4BQLA 2VQEK 3ZSRA 3OTOK 4DUYK 3CM6A 3QERA 2NRZA 3WNHA 3ZX2A 4BVPA 2EX3A 3CC2N 1VQPN 4HUEA 5JLHA 2WFBA 4EZ6A 4B3SK 4CJPA 2O8BA 3SQ2A 4EP5A 2YKNA 2Q3SA 4M63C 4JV5K 2HSTA 1BUPA 3SQ1A 3SV4A 3ALYA 3AA4A 4CECA 4YOWA 3G0ZA 3PIOL 4Z4CA 4J2BA 3JAMO 3HP9A 4IWVA 4CEBA 4AHUA 4R79A 1EWQA 3OA9A 2ATQA 2OCEA 4DWIA 4DR6K 1Q81O 4IG3A 1V4SA 4CZEA 5JICA 4FLWA 3A5LC 4LFBK 4C8MA 3AGRA 3ZX0A 4U7BA 3HT3A 2B4JA 1VRUA 1OH8A 2O4GA 5AQPA 1TL1A 4BC5A 4BRHA 2QK9A 1RILA 2X6SA 3MXMA 4ID5A 4O4GA 1VSDA 4LF7K 5DMRA 4YOTA 3UKRA 4YOVA 4JI5K 4BRIA 5FPMA 4CHPA 2D0OA 2DFHA 2ZE2A 1RDAA 1XMOK 5FRMA 3TR8A 1EXQA 5BR8K 4BDYA 1BU6O 3H3OB 3VETA 2ZQBA 3L8BA 4NCBA 2GWJA 4WQ4C 5JS1A 4BQZA 2QM1A 2CGLA 1TV6A 3K2PA 1KC8O 2QWRA 2Z1HA 1GOBA 1BI4B 3H1VX 5JVHL 2ITGA 3H6EA 1REVA 4TSXA 1NK8A 1X9SA 4FK4A 2UU9K 4KHYA 3LZJA 4DTOA 2Q0UA 3DLRA 4FWOA 2HHUA 3HPGA 1IKVA 2WOMA 4E1NA 4N76A 1ILYA 3KTQA 3WXKA 1J5EK 5AQIA 3BEXA 3IRXA 4CEZA 4FJ8A 2DFEA 4C1NI 4CBXA 4KREA 1HUXA 4DSLA 1ZBSA 3K0SA 1NJYA 4GVEA 4WF9L 4C1NK 3QNOA 1B92A 3QFUA 2VQFK 4OPAA 1MWKA 4ISFA 3ENBA 3JS6A 4B1WB 1YI2N 4FWPA 1Z05A 3EZWA 3VQQA 4JRQA 1RT3A 3CJ9A 4JD2A 3KHYA 2YNGA 3T19A 4M3YA 3SLCA 4PHTX 5BRHA 1NKBA 1HNVA 3GDQA 4BECA 4MQ3A 4JI6K 3QO9A 2OPQA 4CERA 4KAZA 4E72A 3DLGA 3PX4A 5C25A 3SUOA 4MO4A 5BRDA 5GAHP 4I9LA 3MN6A 5KPZA 4IXCA 1LW2A 3AVKA 3LP3A 2QXFA 2ZJPL 2HHIA 1NJZA 2JLEA 1HKCA 4FZXC 4FVUA 4B08A 4DTSA 2NRVA 3SPZA 1XMQK 4CIFA 3UB5A 1DEJA 4YFUA 3VPZA 3LP2A 4MDAA 1NK6A 1N36K 5CZ1A 3HYFA 1CZAN 4BDZA 4CHNA 2P9PB 3O3GA 5AZIA 2KZMA 3AA2A 4F9OA 3L4IA 1KAXA 3LAKA 4PA1A 1JJ2M 3DXKB 4FLVA 4DLEA 2YHBA 5HROA 1QVFM 2AJQA 2O8EB 4O0IA 3CCMN 1ATNA 3Q7BA 1OH6A 5DM6L 1YHQN 3ATVA 3L4QA 4FK2A 3HBTA 2RHKA 2HW3A 3TTCA 4KTZA 5J2MA 2HBLA 3C94A 4KHNA 4MDBA 5EY4A 3ULEB 1E3MA 3V1QA 2P9NA 5C0YA 2CGKA 1RBSA 1I94K 1BISA 4CGDA 1EKEA 3PX0A 5AQNA 1L3VA 4KPYA 5AQZA 1VQMN 3BDPA 2E6MA 1T44A 3WXLA 1YIJN 3HPOA 1OH7A 4FLTA 3L6QA 3U4LA 4KH4A 3HSCA 3CMEN 3EKSA 5MLCQ 1TK0A 4H03B 1UA1A 3AAPA 2P9SA 4EHTA 4K8XA 1C1CA 3NE6A 2RPIA 3VQ6A 4LF6K 4JN4A 4FJKA 4DSJA 3LDQA 4E19A 3RR7A 3CCQN 3LPTA 4FJGA 4BRDA 1QVGM 4M7XA 4CK2A 3K58A 4FJHA 1RCHA 1TGOA 4BGAA 3OYEA 4DFPA 1BHLA 3A2FA 4DU4A 4B3OA 1VQ8N 3FFIA 1TAQA 2W6LA 3FLCO 4PQUA 2FSJA 2YNIA 1YITN 3L3VA 2OTJN 3O08A 1OVQA 4BRQA 4FJNA 3V9XA 2QWLA 3CMAN 1RDBA 2QXLA 2V52B 3QIOA 5AQXA 5M1NA 3VESA 4E7LA 5FPEA 1XUPO 4NXNK 4OLAA 3HSTB 3P83D 3S9HA 3SJJA 2YX6A 1EX4A 3DOKA 4BRNA 1J53A 1GLEG 1GLJO 2G8VA 4DS4A 5FDLA 5GINA 3EO3A 5AQWA 2D0PA 2B6AA 3QFPA 5C24A 2E20A 1ZXOA 1JL2A 4RW4A 5AQKA 4E7JA 2QKKA 3AVIA 1D9FA 3MDQA 3IFRA 5EX5A 3DMJA 3O1BA 1VAZA 4JI7K 2E2OA 1H1VA 1HNXK 3HP6A 3SPYA 1Q8IA 4BR5A 2NNWA 2VGMA 1Q9XA 4DSKA 4ILGB 3TARA 2Q1NA 1G15A 4V19S 3LP0A 4YDUC 1IKWA 4DMNA 3CC7N 4BE7B 2HF4A 4Q0BA 4CEAA 1YUWA 1BIZA 4IO9L 1BA1A 1JLEA 2F8SA 4HTLA 3CQYA 3VQ8A 3LL3A 1NK9A 1HRHA 1T3VA 3IKMA 4CGJA 4RWTA 3IAYA 2QA4N 3LDLA 1TYQB 4DTJA 3VEZA 3JXUA 4L8RB 1WBDA 2BGGA 3OJSA 3R6MA 1VQON 5ELZA 4FLXA 5E26A 2FBVA 3WEEB 3VEVA 3CYMA 1D9DA 4JKEA 3DRRA 1T6DA 1HPZA 2XY6A 3FGUA 4K42A 3CCEN 2HHWA 2WONA 3LM9A 3KVGA 3NH0A 4C8LA 4KHUA 4NLBA 4FPBA 4WFBL 3F73A 3O4WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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