4DCHA

Insights into glucokinase activation mechanism: observation of multiple distinct protein conformations
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
461
structure length
434
Chain Sequence
EAAKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 165
structure length 434
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dchA01
4MLHA 5FPDA 1QZ5A 3W0LA 2YHWA 3O6WA 2AA4A 2PBDA 1G99A 4IO8A 4BRMA 1ZBSA 2P9NB 4A62A 4CZKA 4BRIA 5AZIB 3CQXA 4JD2A 4WQ4A 2H3GX 4HWIA 2P9IB 5E84A 3R8EA 4CBWA 4BQZA 4C23A 4BR7A 5FPEA 4FWQA 4BROA 1QZ6A 5AQPA 5EY4A 3VF4A 3GDQA 2HMPA 5AQOA 3ENHA 3TU5A 5ADXH 3GBTA 5BN8A 3QBXA 1YXQA 3QDKA 4BG9A 5BR9A 4FWLA 4YDUA 4H03B 4PL7A 3B8AX 5JMVA 3VEWA 2HF4A 4CZFA 3SMPA 3DJCA 5AFUH 1U2VA 2NLXA 2E8AA 4BGAA 1P8ZA 3SLCA 3ULEB 1JCFA 2EWSA 2P9KA 2VYPA 4K25A 3A8YA 3VGLA 4BRQA 5AQZA 4M7YA 4B1ZA 4JD2B 3MMVA 1IJJA 3I33A 2QWNA 1NGGA 2P9PA 3F9MA 2AP1A 4FOEA 4IJNA 2ZWHA 4BC5A 4EFHA 3U9DA 1SAZA 1HUXA 2D4WA 2A6AA 3D7EO 2QWMA 5F0XA 3EO3A 4BR2A 3QBWA 3ZX2A 2VWBA 1T6CA 4F9OA 1NBWA 1NMDA 1Y64A 2Q0RA 1X3NA 3A0IX 5F2RA 2Q2RA 3WQUA 3ZEUA 4BRNA 3H3NO 3CJ1A 1HKGA 1LCUA 4CZLA 1U2VB 4H0OA 2ZF5O 2GTDA 2P9LA 3ATUA 2P9KB 3FZMA 4FPAA 3VGMA 3CHWA 4FWNA 3H45C 3FZFA 3QB0A 1JCGA 2IVNA 5KPTA 2D0PA 4IZ9A 1E4GT 2IIRA 2Q1NA 2P9PB 2DPNA 4CBUA 1R59O 4EHTA 3MN6A 1QQNA 3H6EA 1HX1A 3O80A 3FZLA 1GLBG 4JN4A 1BA1A 1TYQA 2W41A 4B1WB 2V7YA 2IVOA 5AQYA 5AQLA 4H0XB 3ZEUB 3L4IA 3MN9A 4DHYA 5EVZA 4XH4A 3WXJA 1NGFA 2IVPA 3UKRA 1DGKN 4IWVA 4BG8A 2P9LB 3UKUA 3VPZA 1IG8A 2FLOA 4FWKA 2A41A 1OKJA 4FWMA 5AQSA 3C7NA 3CERA 3W3DA 2A5XA 3IDHA 3R9PA 2E2PA 2ZGYA 2Q36A 2Q0UA 4MO4A 1X9JA 5EXWA 4BC2A 3A5MC 3VEVA 3CIPA 4BRAA 2QWQA 1NGIA 3CJAA 3AARA 3GL1A 4NB4A 5AQGA 5AQXA 2V51B 4O5FA 4YDUC 1HKBA 4Y0WA 3QICA 3DAWA 1ATRA 3H46O 3M6GA 4B1YB 3C0BA 3DXKA 1GLDG 1TYQB 1YAGA 1YVNA 3ATVA 3AY9A 4XEIA 5LJVA 1D4XA 1K8KA 5AQQA 3BUZB 3WXLA 2YCHA 1XC3A 2D1KA 1NLVA 3LDLA 3UKRB 3UKUB 4CBXA 5AR0A 3WQTA 3CJCA 1NGAA 2PAVA 3C7NB 2WUSA 5JICA 4EAHD 2W40A 2I7NA 3VOVA 1QQMA 2CGKA 3EKUA 5LJWA 1HJOA 2QWOA 4KBOA 4MO5A 2VCPA 4M7XA 4H0PA 3O1BA 5ADXA 1GLJO 2P9SA 3M1FA 4XH1A 3MCPA 4JHDA 4CZGA 1NGDA 3MN5A 2E2NA 1NWKA 3O08A 5I9EB 3DXKB 4FWOA 3AAQA 3VEZA 4NO7A 1K8KB 2ASPA 4QS8A 5FPNA 3VETA 1KXPA 4CZIA 2CGJA 1RDWX 5BREA 4H0VB 3LDOA 4BRGA 2QM1A 3O5BA 5AQNA 3GG4A 2GUPA 4CZHA 4PKHA 1EQYA 1RGIA 3LDPA 5BPMA 3WEEA 2A40A 2QXLA 5AZJA 1GLLO 3IUCA 4FWPA 1GLEG 1Z6RA 3LM2A 4I6MA 2I7PA 2GEMA 4B1UB 1NGHA 1GLFO 5AQHA 4O8KA 3EZWA 2P9SB 4JNEA 2FF3B 4JHDB 1LOTB 3DXMA 4CI6A 2QWPA 3EN9A 1GLCG 4RCHA 1V4TA 4ISFA 1KAZA 4PL8A 3P4IA 3ID8A 4Z94A 2Q31A 3FZHA 2CH5A 3UE5A 1T6DA 3OHRA 3QMLA 3UB5A 2J4RA 4H5VA 5E26A 2P9UA 3SMSA 3VEOA 5LY3A 1BG3A 4B9QA 4BRDA 3HSCA 4CD3A 4H0YB 2QW9A 1JCEA 5KQDA 3CI5A 3WEEB 5AQWA 5TKYA 1BDGA 1BWFO 5AZJB 1J6ZA 3FZKA 1KAXA 3H3OB 1RFQA 3BEXA 3CJ7A 4FSVA 1WUAA 4BC4A 1MWKA 2A42A 4BC3A 5BPLA 5JLFA 3GOIA 5B8HA 2NRHA 5KPZA 3SJHA 4K43A 2E20A 3DXMB 2YHXA 3M3ZA 1NM1A 1ZXOA 5KPRA 1DEJA 4EHUA 1BO5O 5JLHA 2E88A 1BA0A 4BREA 2YJEA 4CZJA 3QFUA 2CH6A 2P9UB 4H0TB 1E4FT 1SZ2A 2GWJA 3MK6A 3R6MA 2FF6A 3FR0A 1HKCA 4WQ5A 3U9ZA 4BRPA 1ATNA 4DCHA 4MLEA 2V52B 4ISEA 1C0GA 4BQLA 3HZ6A 1Q18A 4E1JA 5AQJA 2HF3A 1S22A 3VGKA 2GWKA 4FO0A 2GELA 1NGBA 3O8MA 4AM6A 2V7ZA 5BRDA 3A5LC 4FWSA 2E2QA 5EX5A 3EL2A 3ULEA 4CD1A 3JXUA 3BP8A 1ZC6A 3WUHA 4BVPA 1X3MA 4LC9B 3H1VX 2HOEA 4BR9A 1KAYA 4FPBA 1NGCA 3J8AA 1V4SA 4BRHA 1DKGD 4CJ7A 4IJAA 5AQIA 3KZBA 3WXIA 3BF3A 1T44A 3SK3A 5AFUA 4FL9A 4CZMA 1MWMA 5AQUA 4FOIA 3L0QA 4QS9A 4DQ8A 3ENOA 2BTFA 4A2AA 1TUUA 4H5RA 1MDUB 1ATSA 4L3QA 3A5NC 2E1YA 4BGBA 4GY2B 3I8BA 3D2FA 3IFRA 2CGLA 2QWRA 2ASOA 1SQKA 3QFPA 4K42A 1C0FA 3ZX0A 3S41A 3FFKB 1TUYA 5AQMA 4FWRA 2A3ZA 3A5OC 3FLCO 2E2OA 1HLUA 3DWLA 2YJFA 1HPMA 2KHOA 3ZETA 3U8XA 4AM7A 4H5WA 4IXCA 3D2EA 3O4WA 5BRFA 3EKSA 5AQRA 1BU6O 3LL3A 1WOQA 3CJBA 4BRFA 3KHYA 4RTFD 2YI1A 4H5NA 5BPNA 3CETA 2YHYA 2UYTA 3WT0A 1XUPO 3RSEA 1BOTO 4DB3A 4XH5A 3VENA 4BR0A 3HBTA 1QQOA 3AAPA 4PKGA 4B1XB 3ZX3A 3LDQA 5AQVA 1QHAA 4BR4A 3VEYA 2F9WA 3D2FB 3TPQA 2OANA 4RWTA 3LM9A 5CE3A 3VEXA 2QWLA 4WYBA 3WXKA 1ESVA 4EIAA 1MA9B 1Z05A 3MDQA 3H1QA 1U6ZA 2ASMA 5AQKA 5EOYA 5AQTA 4I6MB 3ZETB 5F1XA 3U4LA 4WQ5C 1BUPA 2FSKA 3FE1A 2ITMA 3D2EB 4GNIA 4CZEA 3CJ9A 5BN9A 4B1VA 2E1ZA 3BF1A 4J8FA 4K41A 3GE1A 3HM8A 5ELZA 1NGEA 1YUWA 1H1VA 2P9NA 1NGJA 4HTLA 3RSEB 4JAXA 3G25A 4H5TA 3KVGA 1CZAN 2D0OA 2FSJA 2NZTA 5AZIA 4PKIA 2ZGZA 4A2BA 3VF2A 2FXUA 2BUPA 3FGUA 2P9IA 3O1WA 4A61A 4BRKA 3CQYA 3HTVA 4QS7A 3VESA 5KQ8A 3IMXA 4BR5A 2FSNA 1XQSC 3MN7A 4ISGA 4WQ4C 5FPMA 4BRLA 4BRCA 1S3XA 5AQFA 3LDNA 2F9TA 5BRHA 3L6QA 3VF6A 1GLAG 3JS6A 4BVOA 4M63C 2Q97A 3HI0A 3VERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HNZA 1IKWA 4C8MA 4IO8A 4IOCL 1N33K 3G6EN 4A62A 3NBPA 4E89A 4JKGB 4ILGB 4WQ4A 2HHXA 4DTMA 4JRQA 4Q0BA 1NK4A 4BQZA 4CEZA 3SPZA 1BGXT 3IKMA 4NCBA 1OH5A 3GDQA 3DOLA 2G8FA 2HMPA 4WF9L 3KK2A 1VQNN 3TU5A 3LZJA 1YXQA 5HBMA 5M1KA 5BR9A 4FWLA 3QNNA 4DUZK 4DR6K 1KQSM 4CFCA 1KCFA 4CK2A 2YNHA 5T7BA 4DQSA 1KLMA 3O9UA 4JI7K 2XRIA 2P9KA 1D8YA 4K25A 4BRQA 1W0HA 5AQZA 4M7YA 4DQRA 1HQUA 1IJJA 3VTHA 4OPJA 2HHQA 3I33A 4FJKA 2P9PA 3HYFA 4R79A 3M5RA 4DTJA 4EFHA 3U9DA 1QVFM 4E3SA 1HUXA 2D4WA 3OYKA 2PY5A 1CZBA 4BR2A 3QBWA 3ZX2A 3PV8A 4CIFA 4DV0K 2Q0RA 1N6QA 4N41A 1X3NA 3KLHA 1U4BA 3OYHA 3H3NO 3CJ1A 4E7KA 4CZLA 3O9SA 2GTDA 4EZ6A 4DF8A 4FPAA 4IOAL 1FK9A 3VGMA 3N4PA 3SJJA 4FWNA 1W2BM 4KHUA 1JCGA 5C15A 2NNWA 1KTQA 4IZ9A 2IIRA 1ZBUA 4M3RA 4G9ZA 3LPTA 1S6QA 2VQFK 3QNOA 3DOKA 3H6EA 4W5RA 1WN7A 3CFPA 4CF9A 3SUPA 2YV0X 2W41A 4BACA 1LWCA 5H1SQ 1BIUA 5EVZA 3HPOA 3RR7A 3WXJA 1CZ9A 1NGFA 1DGKN 4FJ7A 1HNVA 3VPZA 1NU0A 4H8KA 3K5LA 1L3TA 1JLQA 3AVIA 3CD6N 4C1NK 4W5QA 3O9RA 5J2PA 1K73O 2I5JA 3ZYYX 3NF6A 2Q36A 4DWIA 3A5MC 4WFNL 5GADP 5GAHP 2QWQA 4AHTA 2P5OA 3GL1A 3Q7BA 3CCVN 4B3RK 4DFPA 1WNSA 4Z4FA 4O5FA 1JXBA 3QICA 4C8OA 3DXKA 3ATVA 1TL1A 1YAGA 2HSTA 4XEIA 3AY9A 4K8XA 2OPPA 3OW2M 3P83D 2O8FB 4KV8A 5TKWA 5AQQA 1R0AA 1KSPA 3LP1A 3LDLA 1NLVA 3NE6A 3J7ZO 4CBXA 5AR0A 1J5OA 3CJCA 4KPYA 2PAVA 3C6HA 1XMOK 1Q7YO 2G8IA 2WUSA 5JICA 1NJIO 2HNDA 4OKKA 4B9LA 4CGDA 2QWOA 3ENBA 4HVJA 2OA8A 4M7XA 4H0PA 5ADXA 2P9SA 4XH1A 1T7PA 1NGDA 2OYQA 2YHAA 4DF4A 3O08A 1X9WA 1C1BA 5SWMA 5FRNA 2ASPA 4QS8A 3BY5A 1KXPA 1HNIA 1RBRA 3S3NA 4FW1A 3LDOA 4ILJA 4CJ5A 3C6AA 2QM1A 3O5BA 4DU1A 1GOAA 3BZCA 4KKOA 4IFEA 2WFBA 1VK0A 4FLZA 1VQ6N 3LDPA 4DU4A 5C25A 3CXCM 4PQUA 3VQ5A 5AZJA 3CCRN 2KW4A 3QINA 4DSFA 1GLEG 3O9QA 2KQ2A 2RKIA 3D0PA 1U45A 3VMFB 2ZJPL 1GLFO 1N36K 5AQHA 1UOCA 2FF3B 2QWPA 2NRRA 1GLCG 3OYFA 1V4TA 4PL8A 4GV6A 4DTXA 4KB1A 3HK2A 2CH5A 4V19S 4EZ9A 1VSDA 4LFBK 3VEOA 4DSLA 1JCEA 5KQDA 4FZYA 3WXMB 3PIPL 4C8LA 2GX9A 4JI5K 5TKYA 1BDGA 3HL8A 4LF7K 1TK8A 4CEBA 3BEXA 3L3UA 2DTUA 4FZXC 1WUAA 2FC0A 5B8HA 4QCLA 3DXMB 4CK3A 1DEJA 4Z4IA 4HHTA 3SCXA 3O3FA 2BH1A 4FJJA 1BA0A 1NNEA 4A5BA 1LW0A 3QFUA 2YNFA 4CZJA 1NK7A 3VQDA 4IEEA 4XIUA 1NOZA 4FM2A 3MK6A 3R6MA 3JSMA 2FF6A 3M8PA 3FR0A 4Q5VA 3BDPA 4WQ5A 3CCQN 5GIOA 3SPYA 3OYGA 2QKKA 1Z26A 2UUCK 3V9SA 4OPAA 3THXB 1C0GA 1M1KO 1O1WA 3TWHA 4YY3K 2QXFA 4JKHA 3VQEA 4O5BA 2GELA 3DLRA 1NGBA 5CYQA 2V7ZA 3PUFA 3TAGA 1RDBA 3K0SA 1VQPN 4AHVA 1HJRA 2VWJA 4B8AB 3L2VA 2P1JA 4DU3A 3MEEA 2NRTA 4BRHA 4CEDA 1WSGA 3G0ZA 3SQ0A 1DKGD 4KI4A 4IJAA 1W97L 5AQIA 2F8SA 3SK3A 4CJWA 4A59A 4Y1DA 5AFUA 3ZT0A 3AO2A 3L0QA 2JWLA 5M1FA 3SZ2A 3E66A 4A2AA 3MX2A 4CGJA 4L3QA 5HRNA 1Q9XA 4DV3K 3HXMA 1NK9A 1K6YA 3D2FA 2O8BB 3IFRA 3QFPA 4CJTA 2HHWA 3ZX0A 3S41A 3RWUA 1TUYA 4C1NI 2OPRA 4FWRA 2A3ZA 3FLCO 4DS4A 3DWLA 3TAPA 4IKFA 4N56A 4GVMA 5AQRA 2X6NA 5C2DA 2GBZA 1WOQA 4B3TK 3CJBA 4BRFA 1UWBA 4WCEL 3KK1A 4LF4K 1IKYA 5BPNA 3WT0A 3AA2A 1TKDA 4FJNA 3NCIA 3AVLA 3L8BA 1OVQA 3OJSA 4LF9K 4PKGA 1QQOA 3AAPA 3G71N 2P5GA 3KK3A 3NVKA 1QHAA 3E9LA 3P38A 4BDZA 1SL2A 3MX5A 3OBYA 3VEYA 1FKOA 1ZBIA 1FKPA 4FXDA 2OANA 4FLVA 3A2FA 1NKCA 4RWTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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