4DCHA

Insights into glucokinase activation mechanism: observation of multiple distinct protein conformations
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
461
structure length
434
Chain Sequence
EAAKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 165
structure length 434
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dchA01
3CJ9A 3EN9A 4A62A 4WYBA 5AQIA 3EZWA 1DEJA 3ZX3A 4FWNA 5LY3A 1NWKA 3D2FA 4YDUA 1QQOA 3WUHA 3CHWA 4H5VA 2IVPA 1NMDA 1GLEG 5JICA 1NGDA 4B9QA 2P9PB 3C7NB 4DQ8A 1XC3A 1BG3A 3O80A 3KVGA 4JHDA 3A5NC 2IVNA 4FO0A 4B1WB 3TPQA 4DCHA 2YHYA 1ZBSA 3FZKA 1CZAN 1NGAA 2FXUA 5FPMA 4IJAA 4M63C 3HTVA 4B1UB 3ZETA 4AM6A 1MA9B 5AQXA 1ATSA 2E2NA 3CIPA 2A42A 1SAZA 3WEEA 1T44A 1HKGA 3BF1A 3M1FA 3IDHA 1TUYA 3ENOA 4F9OA 5FPDA 4H5TA 5BR9A 3MMVA 3MN5A 4IXCA 2V7ZA 4CZEA 2HMPA 3QMLA 3WXKA 4L3QA 3JS6A 3DXKB 2ITMA 3A5MC 1GLFO 3A0IX 2UYTA 1U2VB 1WOQA 3H6EA 2P9UA 4FPAA 4I6MA 4BR4A 2AP1A 5BPNA 3EO3A 3VEWA 2VWBA 4EHTA 1LCUA 4FWLA 5BN9A 2ZGZA 4HWIA 1HJOA 3UE5A 5B8HA 1ZC6A 5KQ8A 2YJFA 1TUUA 4FWSA 1NM1A 4H5RA 3GOIA 3I8BA 3LM2A 5AQRA 1Y64A 3ULEB 3A8YA 4NB4A 4EFHA 3U9ZA 1C0FA 4CZLA 5E84A 5FPEA 3H45C 2Q0UA 3QFUA 3MDQA 3CI5A 3GE1A 3QICA 3FZHA 3VEOA 1QQNA 2A3ZA 3CETA 2CH5A 2D1KA 4CD1A 5AQPA 5AQMA 4XH5A 3OHRA 3VEXA 4B1YB 4H0PA 4DB3A 3ATUA 2GWJA 5BREA 1QQMA 1SZ2A 3VGLA 4ISEA 3UKRA 4BRQA 3BP8A 4A61A 3FGUA 4CBUA 1H1VA 2CGLA 5F1XA 1HKBA 5LJWA 3FZFA 3VETA 2A5XA 2KHOA 2AA4A 2E2OA 4BRHA 4IO8A 4BG9A 4IZ9A 3B8AX 2E1ZA 1MWMA 3VESA 4CZGA 2GWKA 4BGAA 2P9LB 1QZ6A 2F9TA 2ASPA 3LDQA 4MO5A 3GBTA 3R6MA 4FWKA 4WQ5C 1BA0A 1HLUA 1QZ5A 3WQUA 5AZJA 2P9IB 3ZX0A 3SLCA 1XQSC 3S41A 1IJJA 2NLXA 4H0XB 5FPNA 1JCGA 1Q18A 1RGIA 3O1WA 1TYQB 3O8MA 1X9JA 5AQTA 4BREA 1T6DA 4QS7A 4E1JA 2CGKA 2H3GX 4B1XB 4B1ZA 4BROA 3AY9A 4BRIA 4FPBA 1WUAA 3ZEUB 3DAWA 2ZF5O 3VGKA 1JCFA 3H46O 4LC9B 4QS8A 2E8AA 3CJBA 3VEZA 4FWPA 1ZXOA 1Z6RA 1T6CA 1HUXA 1G99A 4BQLA 4BRPA 4BRFA 2PBDA 1C0GA 1IG8A 3J8AA 5ELZA 3D2EB 4JNEA 3O5BA 4FOIA 4BR7A 4ISGA 1KAZA 5JMVA 2QWRA 4JD2A 1BUPA 2Q36A 4WQ5A 1GLDG 1KAXA 2IVOA 1EQYA 3TU5A 3HI0A 2P9KB 4O5FA 1X3NA 5AQUA 5AQQA 2E88A 1P8ZA 3QB0A 3CQXA 1YVNA 3LL3A 5ADXA 4K42A 4EAHD 4JAXA 4PKGA 1GLJO 3F9MA 4H0YB 4BRDA 5BRHA 3I33A 3O08A 2QWMA 1ATNA 3CERA 3D7EO 5EY4A 2I7PA 4GNIA 3D2FB 4FWOA 1OKJA 4DHYA 4Z94A 3L6QA 1BOTO 1YUWA 3DXMA 4BRNA 2QWNA 2DPNA 2FF6A 1E4FT 2VYPA 4CZFA 2ASOA 2HF4A 3UKUA 5AQWA 4C23A 5AQLA 4JHDB 1NGJA 2P9SA 4BC3A 4BC4A 4K41A 3H1QA 4JD2B 2D0OA 2V51B 1BO5O 2V52B 3C0BA 3ZETB 3CJ1A 5LJVA 2NZTA 3CJCA 3BF3A 4EIAA 2D0PA 1BU6O 1XUPO 2W41A 3WEEB 3EKUA 4ISFA 4BC2A 5AZIA 4HTLA 2EWSA 3W0LA 4BVPA 1V4TA 2Q97A 4MLHA 1K8KA 3SJHA 4EHUA 5EX5A 4CBWA 3CQYA 3WQTA 2GELA 1NGIA 4H03B 3HBTA 4FWMA 3FZMA 4BC5A 3O6WA 1DKGD 4WQ4C 2QWQA 1HKCA 4Y0WA 2QWPA 1J6ZA 3U4LA 4CD3A 3MK6A 2P9UB 3M6GA 3O1BA 4I6MB 5AQZA 2E2PA 4BGBA 1GLAG 2FSNA 2GTDA 4CZHA 2QWOA 5BPMA 3G25A 3H1VX 5AQGA 4CZIA 4H5WA 3WXJA 4IJNA 1LOTB 3FR0A 2A41A 5AQJA 1GLLO 4M7YA 3M3ZA 5AR0A 3VF4A 1SQKA 2QW9A 3CJAA 3HZ6A 1RFQA 4BRAA 1S22A 3LM9A 3VENA 3QFPA 2E1YA 4BR9A 4A2AA 4CZMA 2GUPA 2P9PA 5BPLA 4YDUC 3WXLA 1HX1A 5ADXH 2PAVA 2E2QA 3RSEA 4BG8A 2P9NA 1HPMA 2HOEA 2QM1A 4GY2B 3HSCA 5AZIB 3MN9A 3ID8A 1KXPA 3KZBA 4WQ4A 5AFUA 5KPTA 2Q0RA 4K25A 5AQKA 4CJ7A 2BTFA 4CI6A 3ENHA 2CH6A 5EXWA 3FZLA 4RCHA 3UB5A 2D4WA 4H0VB 5E26A 3MN6A 3HM8A 1NGFA 4IWVA 5BRDA 5KPZA 1BWFO 3UKRB 3FE1A 3FLCO 5AQHA 1YXQA 4FOEA 4PKIA 3LDOA 4BRLA 3IMXA 2GEMA 1JCEA 3DXKA 4XEIA 4BR5A 1U2VA 3KHYA 5AQNA 2YI1A 2QWLA 2FLOA 3WXIA 4AM7A 1NLVA 3CJ7A 1NGBA 5AQFA 5CE3A 4BRCA 2E20A 3AARA 2I7NA 3BUZB 4XH1A 1BDGA 3FFKB 2IIRA 3RSEB 3AAQA 4BRGA 5AZJB 4J8FA 2P9NB 4A2BA 1Z05A 2W40A 2FSKA 3L0QA 4K43A 3ZX2A 3VGMA 3VERA 1R59O 4BVOA 1MWKA 1GLBG 3ULEA 4M7XA 1NGEA 4H0OA 2ZWHA 4BRKA 4JN4A 4CBXA 5AQSA 3VF2A 2A40A 1MDUB 5TKYA 1X3MA 3LDPA 1U6ZA 2HF3A 3A5LC 3IFRA 3GG4A 2BUPA 5F0XA 5AQVA 3R8EA 4RTFD 5EVZA 2F9WA 3IUCA 4QS9A 3H3OB 1NGHA 3DWLA 1NBWA 5AFUH 4CZJA 2WUSA 1DGKN 4RWTA 3LDLA 5KPRA 4B1VA 1S3XA 4FSVA 3R9PA 3WT0A 3MCPA 3A5OC 3DJCA 1GLCG 4O8KA 3W3DA 1BA1A 1QHAA 4PL8A 4PL7A 2P9LA 4CZKA 3VPZA 1V4SA 2ZGYA 2YCHA 4FWRA 2YHWA 2ASMA 1ESVA 3QBXA 2P9IA 1D4XA 4BQZA 5AQYA 3DXMB 4KBOA 2CGJA 3EL2A 2YJEA 4BR2A 1TYQA 3O4WA 3L4IA 2Q2RA 3ATVA 3UKUB 4NO7A 3LDNA 2OANA 3EKSA 3JXUA 1YAGA 2FSJA 1ATRA 2P9SB 3U8XA 3ZEUA 5BRFA 1E4GT 1RDWX 4BR0A 5AQOA 4XH4A 3U9DA 5BN8A 2NRHA 2Q1NA 3AAPA 5JLFA 1NGGA 3C7NA 2YHXA 5JLHA 3SK3A 5I9EB 5F2RA 2V7YA 3QDKA 2FF3B 4H5NA 5KQDA 3H3NO 1NGCA 3GL1A 2J4RA 3D2EA 2A6AA 2QXLA 3SMPA 3GDQA 1K8KB 3BEXA 4PKHA 3QBWA 4BRMA 5EOYA 3SMSA 2P9KA 4FWQA 1KAYA 3VF6A 3VEVA 2Q31A 3VOVA 4MO4A 2VCPA 4H0TB 3MN7A 3P4IA 3VEYA 4FL9A 4MLEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P5JA 4JKDA 3SUNA 4KHSA 2HHSA 3THWA 3AVKA 4WYBA 3VQDA 2OYQA 3C95A 4FWNA 1NWKA 4ILJA 3IKMA 2IVPA 1NMDA 1YI2N 1GLEG 3ZT1A 5JICA 1SV5A 2P9PB 3ITHA 2ZQBA 1I39A 3NHGA 3KVGA 1S9EA 3V81A 5GINA 4OKEA 1NGAA 2FXUA 3TI0A 4B9NA 4FK4A 4A57A 2A1SA 2A42A 3T3FA 3IDHA 3ENOA 1SKWA 1RTJA 4DSFA 4DR6K 4FK2A 1WAJA 3SBGA 5BR9A 4JK9A 3MN5A 4IXCA 3AO2A 4CZEA 4Z4GA 1OH8A 3K5LA 3WXKA 5M1OA 2ITMA 4DQRA 2UYTA 2IAJA 3H6EA 5J1EA 3HOSA 3KWIA 3OS1A 5I3UA 4FJ5A 1KC8O 5JS2A 4ELVA 4YOUA 1ZBHA 3UE5A 1ZC6A 3VTHA 4B3OA 1TUUA 1HR0K 3I8BA 4C8LA 3ZT3A 2RHKA 3U9ZA 3V6DA 1WN7A 3DLRA 5GAGP 2KKZA 5FDLA 3FZHA 4JK8A 2LSNA 2A3ZA 3VQ8A 1T3VA 1UA0A 4CFCA 2CH5A 2NNWA 3HRGA 4XH5A 3I55N 3NE6A 1KRPA 3HM9A 3DLKA 4H0PA 3EE9A 3T7ZA 1QQMA 3VGLA 2VQFK 3KK3A 4FJ9A 1B9FA 4ISEA 1J5OA 4DKWA 3BP8A 4GW6A 3D6RA 1KLMA 2CGLA 4RW6A 1BCOA 3VETA 4I2PA 4BG9A 1HYZA 2WC9A 3B8AX 2E1ZA 4G1QA 3S3MA 4BGAA 4QAGA 2F9TA 1T03A 2ETJA 4MO5A 3E9LA 4WQ5C 1HLUA 2P9IB 3ZX0A 4DR1K 4WFNL 2X78A 1XMOK 5FPNA 5TKWA 1Q18A 1TYQB 3K5OA 1X9JA 1IKVA 5AQTA 4F4KA 2ZJPL 4AF1A 2ATQA 1BQNA 3ZSXA 1WUAA 3V4IA 1JCFA 4O0JA 3TAPA 3ZLJA 1K8AO 2E8AA 3AO5A 4GV9A 1NK8A 1RDUA 4BRFA 1UAXA 1NU0A 2PBDA 3J8AA 1ASVA 4RW8A 4YOTA 3O5BA 4FOIA 4DG1A 4KHUA 2QWRA 4O44A 1X9MA 1D9FA 3OYGA 3ENBA 2IVOA 5M1QA 1BL3A 3NH2A 3HI0A 2G8FA 1QSYA 4HUEA 2E88A 4X62K 1YVNA 4FW2A 4KI4A 4FJNA 1NJXA 4JAXA 3HPGA 3ZSQA 5LL6Z 4H0YB 4M3RA 3AA3A 3I33A 4KHPK 3D7EO 1SS6A 5EY4A 3KK1A 4KI6A 4GNIA 1OKJA 1QE1A 4DV3K 1BOTO 1YUWA 2G8IA 4OLAA 2ASOA 2KZMA 4EZ9A 4IFEA 3IS9A 4DR3K 3SQ4A 4CJ5A 3M8RA 5AQWA 1FKOA 1X9SA 2OPPA 1S6QA 1TK8A 4NXNK 3T1YK 2OPQA 1WSHA 4CHOA 4K41A 2FBYA 1BO5O 2RN2A 1Q8IA 2NZTA 3CJCA 1QS4A 2W41A 3EKUA 4BY9C 4CF0A 1VQ6N 4J2BA 4HTLA 3HPOA 4GV6A 3BGRA 4FW1A 2Q97A 1TK0A 1K8KA 3CQYA 2GELA 4BC5A 3ZT4A 4GKJK 1DKGD 4DTUA 3P31A 4Y0WA 2QWPA 1J6ZA 3U4LA 3RTVA 3MK6A 3M6GA 3O1BA 2E2PA 1GLAG 4E7IA 5BPMA 5MLCQ 4FLWA 1QVFM 2E4LA 3TAMA 2UUAK 4KTQA 4H5WA 3WXJA 4RW9A 2OZSA 1LOTB 2HSTA 2QW9A 3CJAA 2XY6A 1EKEA 4BRAA 4CJQA 4JS4A 4A2AA 1RILA 1KLNA 3QLHA 4Z4CA 1HX1A 4CGIA 4DR2K 3P38A 3NFAA 4DU4A 4BG8A 2P9NA 2F4VK 4GY2B 3J7YP 5AFUA 3KZBA 1KXPA 4WQ4A 4DR7K 2Q0RA 4N56A 4K25A 1WSFA 3A2FA 1N36K 3J7ZO 3ENHA 3AA5X 2D5RA 5AJ3K 3OYEA 1S9GA 1NK9A 1U4BA 4B3RK 4DF8A 4Z4IA 2GX9A 3SPZA 4C8MA 3L8BA 1BWFO 3UKRB 5JS1A 3QEVA 3DXKA 1WLJA 1VQ5N 4FJGA 2XRIA 4BR5A 5AQNA 4AM7A 2BDPA 2O8CA 1NLVA 1YITN 4JEPA 3HL8A 3BUZB 3K0SA 1BDGA 3O9UA 2VG5A 3CMEN 3LPTA 3C6AA 3AVIA 2UXDK 4J8FA 3CC7N 2P9NB 3NGIA 2HHQA 2W40A 3ZX2A 3VGMA 3VERA 3NH1A 1GLBG 3CC4N 4K8XA 3AVNA 1XMQK 4M7XA 1QHTA 2YKNA 4CJSA 3DYAA 3V9WA 4F2RA 4KHQA 4FZZA 4DSLA 4H0OA 2ZWHA 4I9LA 3RMCA 1VQ4N 3HO1A 3VF2A 3SBTA 5CZ1A 3L2UA 4CF9A 4BDZA 1U49A 1IBMK 5IWAK 3ZCMA 1X3MA 5JVHL 1U6ZA 2O8BA 3A5LC 3IFRA 1VQ8N 1RBRA 2YV0X 1N33K 5CYQA 3ZSVA 5EVZA 3IUCA 3PIPL 3H3OB 1KFSA 1FW6A 1NBWA 5AFUH 4FLZA 1NKCA 1JXBA 3J80O 3R9PA 4JI6K 1HQUA 4FVUA 5C42A 1IG9A 2Y1JA 1ZYQA 3WNHA 5KGWA 1MU2A 2O4IA 1ASWA 2P9LA 2G8WA 3K5MA 3CYMA 1V4SA 2ZGYA 3F9KA 4FWRA 2I5JA 1D5AA 5M1FA 4JI5K 3UKUB 3HVTA 1NK0A 2OANA 1C0UA 3EKSA 4CVNE 1JJ2M 2BH1A 2OCEA 1XNQK 4ICLA 5LMUK 3THYB 4CJ3A 3ALYA 1E4GT 3BDPA 5AQOA 4XH4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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