4DCHA

Insights into glucokinase activation mechanism: observation of multiple distinct protein conformations
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
461
structure length
434
Chain Sequence
EAAKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 165
structure length 434
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dchA01
3MN5A 3FE1A 5AQQA 2A42A 1H1VA 3LDLA 3ENOA 4XEIA 3WQTA 4WYBA 1MWMA 4MLHA 5JMVA 5I9EB 3LDOA 4BRFA 3EZWA 1U6ZA 4YDUA 3HM8A 4FWMA 4XH4A 4QS9A 1KAXA 4BGBA 4BRAA 3EKUA 1GLCG 2EWSA 4FPAA 1G99A 1QQOA 3FZKA 4HWIA 2OANA 3H6EA 1NGEA 3DJCA 4IXCA 4K43A 5BPMA 1X3MA 2V7ZA 5AQXA 1E4FT 1TYQA 3DXMB 3WEEB 5JLHA 3VEOA 1GLAG 4H03B 4BR2A 5AQSA 3QB0A 1NMDA 1NGGA 4EIAA 1MA9B 4FWRA 3AAPA 1ATRA 3O1BA 4H0YB 4B1YB 5FPMA 2DPNA 2Q0RA 4CZJA 4MO4A 5F0XA 3HSCA 5FPNA 3RSEA 3VOVA 4EAHD 4RWTA 2BUPA 2QWNA 4B1WB 3AY9A 4XH1A 3SMPA 3VF6A 3BF3A 4PL8A 5BN8A 5BREA 5BRDA 2VYPA 1U2VA 3D2FB 3J8AA 3CERA 3L6QA 1GLDG 4BQZA 1S22A 3P4IA 1GLLO 1DKGD 1JCGA 1NBWA 1NGBA 2PBDA 4BRKA 4CD1A 2IVNA 4DHYA 3S41A 4BR0A 2P9KB 3A5OC 5AZJB 1CZAN 3UKUB 3CJBA 3FZHA 2FF6A 1D4XA 1BU6O 3HZ6A 3H45C 3KHYA 5E26A 3LM9A 1NGCA 5CE3A 1NWKA 4L3QA 4B1VA 2J4RA 5AQMA 5ADXA 3A8YA 4B1XB 4PKHA 2P9PA 4EHTA 1KXPA 4H5WA 2E2OA 5KQDA 2E2QA 4MO5A 4QS7A 3ATUA 1YUWA 4BC4A 4H0TB 4B1ZA 2Q36A 4BVOA 4FWQA 3HI0A 3QDKA 5AQOA 3A5LC 4I6MA 3EL2A 2ASOA 2E2PA 2VWBA 3WXLA 2F9WA 1NLVA 3WXJA 4A2BA 1ZC6A 3EKSA 4H0OA 1Y64A 1YAGA 4K25A 4EHUA 3F9MA 3C7NB 1T6DA 3FFKB 5ELZA 3GBTA 1K8KA 3TU5A 5KPZA 4GY2B 2Q97A 3MCPA 4BQLA 3QBXA 2E8AA 1JCEA 2E1YA 5EXWA 5LJWA 1BDGA 3ZEUA 3IUCA 3CETA 1X3NA 4BRIA 2HF3A 2ZGYA 3CJ7A 4WQ5C 3VEWA 2PAVA 2P9NA 1BO5O 2QWLA 3H1QA 2HOEA 3CQYA 3WXIA 4JHDA 3AAQA 2WUSA 2YHYA 1X9JA 4JD2B 4BRMA 1NGIA 2YHXA 3O80A 4BVPA 2W41A 3M6GA 2CH5A 3BUZB 1MDUB 1NGDA 5KPRA 1J6ZA 1Z05A 1GLBG 3CI5A 3CJ1A 3D2EB 5AZIB 4F9OA 3KZBA 1NGJA 4IZ9A 3EN9A 4DQ8A 4IJAA 3FLCO 4Z94A 1XUPO 3WEEA 1E4GT 1EQYA 1QQNA 2FSKA 4B1UB 4JN4A 2ZWHA 2FSNA 3IDHA 4FWKA 4BROA 4ISEA 2P9IB 4WQ4C 2A40A 2CGLA 2FSJA 3BEXA 4CZFA 3UE5A 3W0LA 4RTFD 3FR0A 2QWOA 4LC9B 4BR7A 3DXKB 3HTVA 4FWLA 4XH5A 3QFUA 5AQTA 1ZXOA 3CJCA 1XC3A 2FF3B 3VGKA 1YXQA 3ENHA 4FSVA 3WXKA 3D2FA 3ZETA 4BGAA 2CH6A 3CHWA 2P9SA 4A2AA 2Q2RA 4H5NA 2ITMA 1V4SA 2QM1A 4PKIA 3I8BA 1S3XA 5AFUA 5AZJA 2E2NA 3FZFA 4H5TA 3VPZA 3UKUA 4FOEA 4YDUC 5TKYA 3O4WA 3CQXA 3U9DA 3JXUA 4B9QA 4CBXA 4BC2A 1BA0A 1HKGA 5F1XA 1IG8A 1GLFO 4CZGA 2CGKA 3MK6A 4BRHA 4O5FA 2NRHA 3RSEB 3A5MC 4CZIA 3VGLA 5AQJA 3L0QA 5AQLA 2E20A 2E88A 3VEVA 4HTLA 3VGMA 2YJFA 3U8XA 3UKRB 3VEYA 1HPMA 2YI1A 3C0BA 5ADXH 4CZEA 2P9LA 1RFQA 4BRPA 3EO3A 3W3DA 3UB5A 5F2RA 4CI6A 5EX5A 2ZGZA 4BRDA 3GOIA 1JCFA 4FPBA 4FWPA 2GTDA 2BTFA 3MN9A 3U4LA 2H3GX 4FWNA 2AP1A 2P9UA 4ISFA 3QMLA 3R9PA 4MLEA 3SMSA 3DWLA 3H3OB 3QBWA 3C7NA 1WUAA 2W40A 4CZLA 1OKJA 2QW9A 4BG8A 1ESVA 2D1KA 2D0OA 2D4WA 2P9PB 3H46O 3TPQA 3M1FA 5AQUA 3ATVA 3LDQA 4NO7A 3G25A 2QWRA 3VENA 1ATNA 1Z6RA 2GWKA 5JLFA 2AA4A 3GL1A 4CBUA 3H1VX 3ULEA 3O6WA 5AQGA 2I7NA 1C0FA 4ISGA 1RGIA 4JAXA 1KAZA 3R8EA 1HLUA 2V51B 5BPNA 3WUHA 4CJ7A 3U9ZA 2UYTA 3ZX0A 2CGJA 4BRLA 3A0IX 1QZ6A 3SK3A 3D2EA 2GUPA 5EOYA 3BF1A 4E1JA 1K8KB 3GG4A 1BA1A 3FGUA 3SLCA 2V52B 3MDQA 1IJJA 4BR4A 2QWQA 1SAZA 5AQNA 4CBWA 3VEZA 4KBOA 2I7PA 4BR9A 5E84A 3ZEUB 5BPLA 3DAWA 3DXMA 4PL7A 3SJHA 3A5NC 4FWSA 3LM2A 2P9IA 4H5RA 3VF4A 4O8KA 2P9NB 4K42A 2A41A 4H0PA 1T44A 2FXUA 2ASMA 4CZHA 4BR5A 1Q18A 3DXKA 4JHDB 3MN6A 2YCHA 4H5VA 3CJAA 3GDQA 4PKGA 2F9TA 3CIPA 2ASPA 1BG3A 3KVGA 1V4TA 4FL9A 1SZ2A 1BUPA 2GEMA 1BOTO 2GWJA 2ZF5O 2QWPA 3JS6A 1R59O 2FLOA 1TUYA 3QFPA 2A5XA 5KPTA 3VERA 2Q1NA 1MWKA 1TYQB 2YJEA 4H0XB 2P9KA 4M7YA 5JICA 1GLJO 1C0GA 3ID8A 3IMXA 1QQMA 2VCPA 5LJVA 5AFUH 2E1ZA 5B8HA 2IIRA 2YHWA 1NM1A 5AR0A 3M3ZA 2A6AA 3CJ9A 1ATSA 3LL3A 1NGAA 1BWFO 3B8AX 4JNEA 1QHAA 1YVNA 4EFHA 2NLXA 3UKRA 3QICA 3ZETB 5AQPA 2P9SB 5BRFA 3I33A 2NZTA 4DB3A 3BP8A 1U2VB 5AQYA 1HX1A 1KAYA 3O8MA 2IVPA 4RCHA 4CZMA 3LDPA 4FO0A 2Q31A 4A61A 5BN9A 1NGHA 4QS8A 5EY4A 4DCHA 1HKCA 3LDNA 4BG9A 3O08A 5FPDA 4M63C 1DEJA 3ZX2A 3ZX3A 5AQWA 5AQHA 4WQ5A 3VESA 2A3ZA 3D7EO 4NB4A 4BREA 5AQFA 2V7YA 3VETA 3IFRA 1HJOA 1LOTB 5KQ8A 1T6CA 3GE1A 5FPEA 3R6MA 5AQKA 3L4IA 1XQSC 2QWMA 1DGKN 2Q0UA 5EVZA 3H3NO 5AQIA 2HF4A 4J8FA 2P9LB 2IVOA 1P8ZA 4FOIA 3OHRA 4FWOA 3HBTA 3ULEB 1ZBSA 4BC3A 4Y0WA 5AQVA 2KHOA 4IO8A 3O1WA 4BRQA 2P9UB 4BC5A 1LCUA 1SQKA 4BRGA 3MMVA 3AARA 4I6MB 5LY3A 4H0VB 3VEXA 5AQRA 2HMPA 4C23A 5BR9A 3MN7A 4GNIA 3WQUA 1HKBA 4CZKA 4CD3A 5BRHA 4K41A 4IJNA 4JD2A 4IWVA 1HUXA 4WQ4A 4BRCA 2GELA 3O5BA 1GLEG 2QXLA 4M7XA 5AZIA 5AQZA 4AM7A 3FZMA 1QZ5A 4AM6A 1NGFA 1RDWX 3VF2A 4A62A 3WT0A 2D0PA 3FZLA 1TUUA 1WOQA 4BRNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OYQA 3MN5A 3FE1A 3V6DA 4A5BA 4LFAK 1GOAA 1EP4A 1NOYA 4FZYA 1QSLA 1Y97A 2P5OA 4GKJK 2NRWA 4I7FA 2QI2A 4FWMA 4LH5A 1TVRA 4HCBA 4W5QA 4QS9A 4BGBA 3AVHA 2ZD1A 4FYDA 4BRAA 1F21A 4W5RA 1UOCA 1G99A 4BE1A 2IGIA 2EX3A 4LF6K 4NCAA 4IXCA 1EXQA 1UA0A 5BPMA 5M1KA 1E4FT 3RMDA 3E66A 4BDZA 3HJFA 2HHXA 5C15A 5M1OA 3AVMA 4BR2A 3VMFB 4V19S 1OVQA 4DR5K 3N4QA 1ATRA 3HK2A 3NH2A 1T03A 3SQ4A 2E4LA 3D6RA 3NHGA 5J1EA 4YOXA 4RG8A 4CZJA 1S9GA 3SPYA 3CFRA 1VQ5N 5M1QA 5HRSA 4DQSA 4EAHD 3ZLJA 3DLEA 2QWNA 4G9ZA 4XH1A 3VF6A 3BF3A 4PL8A 5BN8A 3SAFA 5BRDA 2VYPA 3AV9A 1U2VA 1C6VA 1QHTA 4DF8A 4KHPK 4BQZA 4YOVA 1YI2N 4KH5A 2IVNA 3KJVA 4I9LA 4M42A 3L4QA 3CJBA 1R0AA 1VSHA 1X1PA 2FF6A 3LALA 5M1FA 3HZ6A 3H45C 1ZBLA 1RT3A 3VQ7A 3CD6N 4B1VA 1JJ2M 5AQMA 3AVAA 3A8YA 3K5MA 2OTLN 1HRHA 3OBYA 1KXPA 4O55A 3CCRN 2E2QA 1WBBA 3ATUA 4B1ZA 1I39A 4FWQA 4FW2A 1RT7A 3QDKA 5AQOA 3BY5A 4DR2K 3V81A 1FJGK 1HMVA 4A2BA 4H0OA 3HVTA 2Y1IA 3FFKB 1VHXA 1VRUA 4IG0A 3HSTB 3V1OA 4HVJA 4CIEA 4CECA 4OGCA 4JI2K 2O8EA 4U7BA 3P31A 1HR0K 3CETA 4CIGA 5KI6A 2YX6A 3OYCA 2P9NA 4B3SK 3P83D 5GADP 3K5OA 3H1QA 2HOEA 4CJ3A 2IDOA 3AAQA 3LP1A 4BRMA 1NGIA 3O80A 2W41A 3CC2N 1WB9A 2CH5A 3BUZB 4KHQA 4JKFA 3L3UA 1RTIA 4CCHA 3EN9A 4DV4K 4Z94A 1XUPO 4FJGA 4NLBA 2X74A 3L2UA 1E4GT 4XIUA 4IFEA 3PIPL 4JN4A 2ZWHA 1HQEA 2FSNA 3E1YA 3TANA 3VQCA 4CF2A 2P9IB 2CGLA 3BEXA 3UE5A 4GVEA 3FR0A 2PFUA 3QFUA 1XC3A 2WFBA 4WE1A 1QE1A 3AVNA 2XY5A 4ZTFA 4B9LA 3CHWA 2P9SA 3FFIA 1CZ9A 1Q7YO 4FZZA 3M8RA 4DTUA 5GAGP 1YJ9N 2ITMA 4DG1A 3WNEA 1S3XA 2YNHA 3T19A 1ASUA 3VPZA 3UKUA 5TKYA 3O4WA 3S9HA 4Z4GA 4CEEA 4O4GA 1GLFO 2VWKA 5I3UA 4GVMA 1VSDA 4O5FA 3A5MC 4B08A 3VGLA 5AQJA 4DR3K 4CERA 3MAQA 2AJQA 1S6PA 1GOBA 4N41A 1BHLA 2KLAA 3V9ZA 1HPMA 2YI1A 4CZEA 4BRPA 2OA8A 2G8HA 3EO3A 1BCMA 4B8CA 5EX5A 1KFSA 1YIJN 4MQ3A 3O3GA 3MN9A 2F8TA 1NK5A 1ZBHA 3E9LA 3QMLA 3SZ2A 1CXQA 3J7YP 2KW4A 1HYSA 3SMSA 4CHYA 3QBWA 4OPAA 4DTOA 2ZJQL 1OKJA 4KI4A 1Q8IA 3VQ4A 1VQKN 4M45A 1ESVA 1XMOK 2D1KA 1KVAA 3H46O 3TPQA 3M1FA 3CCMN 3ATVA 4C8KA 2AA4A 3GL1A 1VQ9N 3D0PA 1WNSA 1CLQA 5FDLA 3LPUA 3HOSA 2HMIA 5C0YA 3CCQN 2YHBA 2UUCK 1YT3A 3QESA 1YJNN 3WUHA 3VQ8A 2F7TA 2O8FA 1TAQA 3THWA 3QLHA 1X9MA 3A0IX 4YOUA 4Z4CA 4AHSA 2GUPA 3BZCA 4RW7A 3CM5A 1IJJA 4BR4A 4CGFA 3CCEN 1SAZA 3C6AA 5AQNA 4KBOA 2O8EB 4PY5A 3DXMA 3LAKA 3K57A 3A5NC 3PX0A 2XY7A 3LM2A 4H5RA 3Q7CA 2P9NB 1D9DA 4H0PA 2O8CA 4AQYK 2E5LK 3PO5A 4KREA 2ASMA 4E7HA 3LWMA 1Q18A 5SWMA 3CQ8A 4OVLA 2Z1HA 3ISNC 4PKGA 3GDQA 1BL3A 3OYMA 2F9TA 3CIPA 4N47A 4CEFA 1X9SA 2DFEA 1BUPA 1VSKA 2ZF5O 4EP4A 1NKCA 3VQ9A 3SI6A 1R59O 3SAHA 1TUYA 4EZ9A 3MX5A 4LSNA 4F8RA 1TYQB 1YTAA 3VQQA 5JICA 1C0GA 1QQMA 5IWAK 2VCPA 3PY8A 1Q81O 2E1ZA 5B8HA 5AR0A 4DTSA 1NGAA 2NRZA 3T3FA 3U6FA 3B8AX 3JSMA 2OTJN 4CF1A 1VQ6N 4CJQA 4BDPA 3DYAA 3IRXA 3EYZA 3KLFA 2P9SB 2O8BB 4LH4A 5BRFA 1OVYA 4JRPA 3BP8A 3C94A 3V9UA 5AQYA 1KAYA 1J5OA 4K8ZA 1T05A 3C65A 4KHWA 3LZIA 5C2DA 1XHZA 3O4QA 4KPYA 3MXMA 3NGYA 3O9SA 2OPRA 4PA1A 3OYAA 3V9SA 4O8UA 2A3ZA 3OVNA 3RMCA 3IFRA 1LOTB 1T7PA 3GE1A 3WNGA 3R6MA 1CXUA 3RVCA 3L4IA 2VG5A 3TABA 5C2FA 5EVZA 1A5WA 2B5JA 2JWLA 1K6YA 4EZ6A 4GW6A 2HF4A 4FLUA 3CCSN 3TAPA 2NRTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LDP A;  4B9M A;  3LP3 A;  4CHQ A;  4DSK A;  1NGH A;  4JKG B;  4DCH A;  3PV8 A;  4X66 K;  3E9P A;  3O08 A;  5FPD A;  2UXB K;  1U45 A;  3KKS A;  5AQW A;  5AQH A;  4Q5V A;  3D7E O;  5AQF A;  4KHS A;  4MDB A;  2ETJ A;  3KK3 A;  1HNZ K;  4FLV A;  4DSI A;  2P1J A;  3KKR A;  5KQ8 A;  5AQK A;  2X6S A;  4JKA A;  4CHN A;  4DFM A;  4CJW A;  4E7J A;  4B9V A;  2QKB A;  4H4M A;  1WAJ A;  5C12 A;  3R1X A;  5AQI A;  4DV6 K;  2IVO A;  1P8Z A;  3HBT A;  4JK7 A;  4BC3 A;  1C1B A;  5AQV A;  4LFC K;  4E1M A;  3AVI A;  3KIO A;  4A57 A;  4FVM A;  2HNZ A;  3AAR A;  4I6M B;  5LY3 A;  3QEV A;  2GX9 A;  5BR9 A;  4GNI A;  1HKB A;  4CD3 A;  5BRH A;  4K41 A;  3KD1 E;  1K8A O;  1IBL K;  4CJF A;  1ZBU A;  3C6U A;  3DLB A;  1GLE G;  2XY6 A;  3NF7 A;  2RPI A;  3ITH A;  4I2Q A;  2KTQ A;  3FZM A;  3OJU A;  3EE8 A;  1QZ5 A;  1VQP N;  1RBU A;  1NGF A;  2OPP A;  4IDH A;  4E3S A;  3KZB A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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