3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium avium
molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
1WOQA 3LDPA 2P9KB 3SLCA 2V7ZA 1BO5O 2YHXA 3O6WA 3ULEB 1S22A 5B8HA 3MCPA 2CH6A 3CJBA 2GWKA 1HLUA 3MMVA 3AAQA 4ISGA 4BRLA 2QM1A 1E4FT 5AQTA 5BRFA 1XC3A 3CI5A 3TU5A 5F0XA 3HTVA 3O4WA 3VF4A 2YI1A 4MLHA 1HJOA 1BA1A 3C7NB 3JXUA 1NGDA 2QWPA 3F9MA 3SK3A 1X9JA 4BR5A 1R59O 4RTFD 4M63C 2ZGZA 4XH5A 1OKJA 1NGJA 2HF4A 1U2VA 2GEMA 3H3NO 3VGKA 5BR9A 4JHDB 1Z6RA 1D4XA 3VENA 2QWLA 3FZFA 4H0VB 2E8AA 2E1ZA 2D1KA 1SQKA 5AZJA 5JLHA 4CBWA 2CGLA 4JHDA 2P9UA 4CZIA 3KVGA 5AQUA 2E2PA 4FWRA 5ADXA 1GLDG 2E2QA 4FPAA 1QQMA 1IG8A 1HPMA 3QFUA 4BRPA 4B1ZA 1IJJA 1MA9B 4EHTA 3QMLA 1RGIA 4IJNA 1GLEG 4KBOA 1U6ZA 2QXLA 4XH4A 3ATUA 4BR7A 4Z94A 2A3ZA 2D0PA 4EIAA 4H0OA 3SMSA 1V4TA 1ESVA 3DWLA 4H03B 5AQJA 5FPDA 4FSVA 3WXIA 1T6CA 5KQ8A 5AZIB 4WQ5C 3LDQA 3AY9A 3WEEB 3FFKB 3W3DA 3G25A 5AQVA 3QFPA 5BRDA 2FXUA 2V52B 2Q0UA 4GY2B 4BR4A 5EXWA 2GELA 2IVPA 3EL2A 4WQ5A 1HKBA 3D7EO 2AA4A 4QS7A 3UB5A 5JLFA 1NGEA 2P9KA 4FOIA 4QS8A 3QBXA 4BRKA 4BRNA 4M7YA 1JCFA 5AQRA 3HBTA 4JD2B 4CBXA 2ZWHA 4H0PA 1TYQA 3D2FB 4A61A 4YDUA 2I7PA 2QWNA 3ZX2A 4A2BA 1G99A 2ASOA 2FSKA 3UKUB 1KAYA 1BA0A 4GNIA 4BGBA 2ASMA 1BG3A 3H45C 4AM6A 4EHUA 5AR0A 1GLAG 3VEXA 3WT0A 2YHYA 4FOEA 3IDHA 1J6ZA 4RWTA 3DXKA 4BREA 3CJAA 4B1VA 2FF3B 5BREA 2P9LB 1NM1A 4PL7A 1QQOA 1QZ6A 5E26A 5LJVA 2Q1NA 3HSCA 5AFUA 3W0LA 3LDOA 4NB4A 3MN9A 5KPRA 2QWQA 4BRMA 5AQKA 3VEVA 4AM7A 3D2EB 1NGHA 1MWKA 2Q31A 5F2RA 2P9SA 3O08A 3U9DA 2VYPA 2ZGYA 3U9ZA 2E2NA 4F9OA 4H0YB 3H1QA 4H5VA 4Y0WA 2BTFA 2QWOA 3M6GA 1LCUA 3EKUA 4FWMA 4BVOA 3SMPA 1ZC6A 2A40A 1C0GA 4B9QA 5AFUH 5LY3A 3BF1A 1GLLO 1TYQB 1V4SA 1ZBSA 3JS6A 2KHOA 2ITMA 4A2AA 3ZEUB 4BC5A 5BRHA 3DXMA 3GOIA 4JD2A 4CZGA 5AQGA 5KPZA 3A8YA 3VETA 2P9SB 5FPEA 1SAZA 2QWMA 3BUZB 4DB3A 2WUSA 4PKHA 4DHYA 1GLBG 1KXPA 5AQNA 1GLFO 5TKYA 4PKGA 4BC4A 1SZ2A 4CZKA 4B1UB 3WUHA 3HI0A 4J8FA 4MLEA 3FLCO 1ATRA 2GWJA 5AQZA 4BRIA 4NO7A 3L0QA 4CZJA 3VGLA 4FWSA 1DEJA 1JCEA 3U4LA 3CETA 1MDUB 4CZHA 2NRHA 2P9IB 1RDWX 3FR0A 4FWQA 3J8AA 4LC9B 4PKIA 5JMVA 4FL9A 3VESA 4DQ8A 3MDQA 4FWPA 3M3ZA 3UKUA 4E1JA 2PBDA 2A5XA 3BEXA 3CJCA 5BPLA 2V7YA 1X3NA 2J4RA 3GE1A 3D2FA 2P9UB 3O1BA 3B8AX 2E1YA 2EWSA 4BGAA 3FZMA 2ZF5O 1BU6O 2VCPA 4BRFA 1YXQA 5F1XA 2E20A 4ISEA 5CE3A 4FWKA 4BC3A 3LM2A 1QZ5A 2AP1A 2P9PB 4IJAA 1NGCA 3LDLA 3ZETA 4B1XB 1U2VB 3VF2A 5AQPA 3CIPA 2CGKA 4JN4A 2W41A 3VEWA 4BRAA 3FGUA 3OHRA 2V51B 3C7NA 3AARA 3WQTA 2IVNA 3ID8A 3GDQA 4H5NA 5EY4A 3TPQA 3LM9A 4EFHA 2IVOA 5EX5A 1BDGA 4EAHD 1NMDA 1QQNA 4JAXA 1TUUA 1DGKN 4BR0A 4M7XA 3O80A 1NGIA 2Q2RA 1K8KA 4B1WB 2D0OA 3LL3A 2A42A 5JICA 1NGGA 2P9PA 3ULEA 1KAXA 4ISFA 3RSEB 3UKRB 5KPTA 2HF3A 1JCGA 4BC2A 4BQLA 3MN6A 1BWFO 5AZJB 3WQUA 3WXLA 3U8XA 4BRDA 5AQMA 5AQYA 4K25A 5BN9A 3KHYA 3ATVA 4BRHA 3RSEA 3UKRA 5AQXA 3CQXA 4XH1A 1HKCA 1YVNA 4H5TA 3L6QA 3ZX0A 3CERA 3QICA 4CD3A 5EOYA 1H1VA 2GTDA 1K8KB 2QW9A 3FZLA 1NGAA 2W40A 4CI6A 4H0XB 3I8BA 1ATSA 2A41A 3MN5A 4WYBA 2PAVA 3DJCA 4BG9A 3ENHA 4DCHA 3EO3A 3KZBA 1BUPA 1BOTO 3A5NC 2YCHA 4MO4A 4CJ7A 5EVZA 3UE5A 3EZWA 2FSNA 3FZHA 3A5MC 1NBWA 1E4GT 1T44A 3GG4A 3QDKA 4BR2A 2A6AA 2FSJA 3BF3A 2OANA 4BR9A 3ZETB 5AQIA 4B1YB 5LJWA 4H5RA 2GUPA 4FO0A 4FWOA 3R9PA 1EQYA 3M1FA 3C0BA 3ZX3A 2Q0RA 1HUXA 2CGJA 3BP8A 5KQDA 3ZEUA 3R8EA 1NGBA 2ASPA 4FWLA 3VF6A 5BPMA 2D4WA 5FPNA 3WXJA 4O5FA 1WUAA 2DPNA 1LOTB 2YHWA 4YDUC 3VGMA 2HMPA 4I6MA 3GBTA 4MO5A 2BUPA 3FZKA 3L4IA 4WQ4A 1Q18A 2VWBA 2FLOA 3D2EA 3EN9A 2P9IA 5AQSA 5BPNA 1NWKA 3VEYA 1HKGA 3O1WA 4C23A 1YAGA 3H1VX 3R6MA 4JNEA 5ADXH 1MWMA 1DKGD 3CJ1A 4BG8A 3ENOA 2F9WA 4BRGA 3S41A 3VPZA 2YJFA 3VEZA 2P9NA 5FPMA 4CD1A 1XQSC 2Q97A 5ELZA 3P4IA 2P9LA 4IO8A 1GLJO 3WXKA 1XUPO 4FPBA 3DAWA 2NLXA 5BN8A 2QWRA 1TUYA 1T6DA 1NGFA 2I7NA 4IWVA 2UYTA 4FWNA 3DXMB 5AQOA 4I6MB 2Q36A 1QHAA 2E88A 3CJ9A 4IZ9A 3CQYA 4A62A 4BROA 4BVPA 5AQFA 2IIRA 3HZ6A 3QBWA 1HX1A 2F9TA 4K43A 4PL8A 4CZFA 1Y64A 3LDNA 4BRCA 4H0TB 3O8MA 4H5WA 1P8ZA 4K41A 2YJEA 2HOEA 3MK6A 3CJ7A 1ATNA 3EKSA 1X3MA 4CZMA 1KAZA 4HWIA 1RFQA 4HTLA 3I33A 1S3XA 4CZLA 3A5LC 2P9NB 4IXCA 3WEEA 5AZIA 3O5BA 5I9EB 3IUCA 3H46O 4O8KA 2CH5A 3DXKB 4WQ4C 5AQHA 3VOVA 2FF6A 5AQQA 1C0FA 4CBUA 1CZAN 3FE1A 2H3GX 3H3OB 5AQLA 4XEIA 3IFRA 1GLCG 1ZXOA 4CZEA 3A0IX 2E2OA 2NZTA 1NLVA 4BQZA 4L3QA 3GL1A 3MN7A 1Z05A 3QB0A 3HM8A 3H6EA 3A5OC 3VEOA 1YUWA 3CHWA 5AQWA 3IMXA 3AAPA 3SJHA 4QS9A 4RCHA 4K42A 3VERA 5E84A 4BRQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KLHA 4O44A 2P9KB 3SLCA 3KLGA 4C1NK 3CF5L 3CJBA 3NFAA 4BRLA 1E4FT 5BRFA 1KD1O 4CCHA 3CI5A 1JLEA 4CF0A 5F0XA 3S3MA 3HTVA 4GW6A 4MLHA 2UXDK 3QESA 1A5WA 1X9JA 4BR5A 1N8RO 4RTFD 3I0RA 1NJXA 2IOCA 1YHQN 1VQON 4E7KA 4DSEA 4I9QA 4H8KA 1EO1A 1NJYA 1TK5A 3SUPA 2QA4N 3D6RA 2NRRA 2D1KA 1Q9XA 5JLHA 4CBWA 4FK4A 4JHDA 3AO1A 3MXJA 2HSTA 3KVGA 5AQUA 4CGDA 4JI5K 3NH1A 2X78A 3QFUA 1X9SA 4B1ZA 1IJJA 4AH9A 3V9XA 3E9OA 3E9PA 4O0IA 4IJNA 2QXLA 3PO5A 4BR7A 2X6SA 1WNSA 2A3ZA 3KD1E 4CEBA 4EIAA 4H0OA 3NGIA 3SMSA 5M1QA 5AQJA 3MXMA 4H03B 4B8AB 1RT7A 3QNOA 4FSVA 3WXIA 4HTUA 5CHIA 1SL0A 2OPQA 1Q7YO 3HK2A 4H4OA 3W3DA 3AV9A 3L2VA 2V52B 4JS4A 2OZMA 4GY2B 4BR4A 3CPWM 1OVYA 4FLVA 3ZSXA 3EL2A 1UAXA 3D7EO 2AA4A 3UB5A 3VQEA 1NGEA 3ALYA 5JLFA 4FOIA 4QS8A 3QBXA 1KTQA 3HPOA 2BGGA 5AQRA 3CC7N 3K2PA 4LSLA 1RT3A 2PY5A 5JVHL 1TK8A 3OYCA 3TTCA 4A61A 4YDUA 4X62K 2PYJA 2QWNA 2W6KA 4DWIA 4NLBA 3J7ZO 1TL3A 4RW4A 3UKUB 4CHZA 2ASMA 3PX4A 5AR0A 3VQCA 2O8BA 4IOCL 1XHZA 4FM0A 1J6ZA 3U6FA 4CHPA 3DXKA 4PA1A 1VSEA 4KAZA 1W2BM 5E26A 4CF9A 5LJVA 4B3TK 1S1VA 3LDOA 3MN9A 1U04A 4WE1A 3VEVA 1S1XA 1MWKA 2Q31A 5F2RA 3KJVA 2G8WA 1K9MO 3QEWA 3U9ZA 4CJ5A 4AHSA 3M8RA 3OYIA 4BY9C 2HNZA 3H1QA 4Y0WA 2BTFA 2QWOA 1L3UA 1FXXA 1WLJA 1ZBSA 3JS6A 4BC5A 3AO4A 4A2AA 3O9UA 2KZMA 4CZGA 5AQGA 2OCEA 3SQ4A 4DB3A 4PKHA 4DSKA 3L4QA 5C0YA 4FK2A 4ICLA 3MWPA 4YFUA 3QEVA 3I8DA 4DV1K 3JYTA 4DU4A 3G10A 1QVGM 1YTUA 1NK8A 4NO7A 3VGLA 4FWSA 1DEJA 3OBWA 1JCEA 4KREA 3CETA 4CZHA 2P9IB 1D9FA 1RDWX 3FR0A 2HHSA 1OH7A 3J8AA 4HUFA 5HP1A 1KLNA 4AHCA 3AVIA 3VESA 4DQ8A 5M1KA 3M3ZA 3UKUA 4E1JA 3NMUA 3TAEA 4DF8A 3C6HA 5BPLA 3CJCA 4OLBA 1X3NA 3GE1A 2P9UB 1M1KO 3O1BA 3O4QA 5C42A 2EWSA 4Y1DA 4YOVA 1ZBFA 1RTDA 4FWKA 4KH4A 3LM2A 1C0MA 1BCMA 1IKYA 3SQ1A 1VQMN 1HNWK 2AP1A 1NGCA 1LAVA 3LDLA 3MX5A 4DR7K 3VF2A 3K57A 3AVMA 1BI4A 1LW2A 5AQPA 5E41A 4JYAK 4JN4A 1JKHA 4DTPA 3HL8A 4A5BA 4BRAA 3OHRA 4KHSA 3GDQA 4H5NA 5EY4A 1HQUA 5C2FA 3OYEA 5EX5A 3WNGA 4QAGA 3EYZA 1VQPN 1IH7A 3O80A 1NGIA 2Q2RA 1IV0A 4HCBA 2NRXA 5JICA 1NGGA 5IT9O 2IDOA 4I2QA 4CEEA 4ISFA 5KPTA 2HF3A 4DFKA 5AQMA 3N4PA 4BRHA 5D3GA 4F2RA 3ZX0A 3L6QA 5EOYA 4KHYA 1NGAA 1SKRA 4B3RK 2O8EB 3SNNA 1ATSA 5HRRA 2A41A 4BE0A 3DLRA 2BDPA 4DCHA 1VSIA 3EO3A 3NDKA 2JWKA 1BUPA 4DLEA 3M5RA 4B3OA 1CZ9A 5EVZA 3EZWA 2NRWA 1J53A 3B6PA 4O8UA 1E4GT 2E6LA 3VQ6A 2YNIA 4BR2A 1LAWA 3U3GA 3BF3A 4BR9A 3L3VA 1L5UA 1VSKA 2YX6A 4CHOA 5LJWA 3P1GA 2VWJA 4CF1A 4FJHA 1EQYA 3C0BA 3ZX3A 3K0SA 4IBNA 4BDZA 3QO9A 1RDBA 2HW3A 1EWQA 3TAPA 3G71N 1ASUA 4CJSA 1W97L 2OA8A 3KK3A 4FWLA 3VF6A 1NNEA 2D4WA 5GIOA 3RTVA 3HO1A 2UXCK 2YHWA 4I6MA 3MEEA 5KTQA 3D2EA 2FLOA 3EN9A 4CGIA 2P9IA 3OYLA 4YOWA 2QEXN 1HKGA 4JKFA 3O1WA 2HHHK 1S6QA 1Y97A 2B6AA 4LF4K 2F9WA 3S41A 1BISA 5FPMA 4CD1A 4CJKA 2Q97A 1BIZA 1S1UA 2BANA 1YJ9N 3NCIA 2OPPA 1N33K 1YJNN 5BN8A 4KHNA 2I7NA 3SAGA 4IWVA 2UYTA 5AQOA 2Q36A 1IBMK 1S1TA 4A62A 1P90A 4BROA 2OPSA 2IIRA 3HZ6A 3QBWA 3SQ2A 1T3VA 1VSFA 4K43A 4CZFA 1WB9A 4CJVA 1B9FA 2YKNA 4BRCA 4H0TB 4K41A 4MQ3A 4OKKA 4CIEA 3Q7BA 2XY8A 1X3MA 1RBRA 3RRHA 5M1FA 3LDSA 3I33A 3DLHA 4IXCA 5AZIA 1LV5A 3CFOA 3O5BA 5I9EB 4E1NA 4A59A 1TK0A 4O8KA 3VQ7A 3DXKB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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