3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
b'ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium avium
molecule tags Transferase
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
4AM6A 1C0FA 4B1VA 3VF6A 4BVOA 1H1VA 3QBXA 4MLHA 2ZWHA 4B1WB 5AQLA 3L0QA 1NM1A 1GLFO 3GL1A 2CGKA 4A61A 2E2QA 3IMXA 3RSEA 3VETA 2D0PA 3U4LA 5BPLA 4JHDA 4HTLA 3ZEUA 4FL9A 3SMSA 4BC3A 2HF3A 5E84A 1U2VB 4BREA 2P9IA 2FSJA 4BR5A 3FLCO 3SMPA 3O6WA 2PAVA 3ATUA 3FE1A 4GNIA 4H03B 4LC9B 2CH5A 2YHWA 1BOTO 2FLOA 3LM2A 4XH1A 3VGKA 5FPDA 4JD2A 4BRAA 1OKJA 3LDQA 1GLEG 5KQDA 3EZWA 5AR0A 3ZX0A 3O1WA 5EVZA 2E88A 3C7NA 1MWMA 2P9KB 5TKYA 1E4GT 1YAGA 3O8MA 4CZHA 3ID8A 5AQPA 3EKUA 2QWRA 2ASMA 4BR9A 3ZX2A 5AZJA 5AQZA 3I33A 1BDGA 3UKUA 3OHRA 3EO3A 2P9PB 4IXCA 2VWBA 5JLHA 3MN6A 4BR2A 5KQ8A 1LCUA 5BRHA 1Y64A 4F9OA 1NGAA 3TPQA 3A5NC 3D2EB 4FWRA 5AQSA 3CJAA 1TYQB 4JN4A 5BPMA 3O80A 3AAQA 5AQTA 2VCPA 1NGDA 1RFQA 3WXJA 2WUSA 5F2RA 4FOIA 4BR7A 3H45C 1HKGA 1NBWA 3AAPA 4CZKA 1CZAN 4IO8A 3MCPA 4M7YA 2IVNA 4WQ4C 1C0GA 1QZ6A 5AQOA 1GLJO 4IZ9A 3AARA 1SZ2A 4BVPA 3VEYA 1IG8A 2Q31A 4EAHD 4PKHA 5KPRA 3DJCA 4BRLA 3UB5A 4H5VA 2GEMA 1QQOA 5AFUA 5BR9A 3D2FB 1K8KB 1XQSC 1T6CA 2Q0RA 2YJEA 2FXUA 5AQXA 2P9SA 3WUHA 3A5LC 1DGKN 3VGMA 2F9TA 5BN8A 1QZ5A 3WEEA 3MN9A 5EOYA 3H3OB 5AFUH 2A40A 3DXKA 2HOEA 3MMVA 4J8FA 1RDWX 3RSEB 3IUCA 4B1UB 2ZGYA 3VEOA 4EHTA 5EX5A 1GLDG 3O1BA 5EY4A 5FPMA 4BRPA 2D1KA 4JHDB 5ADXH 2NZTA 3ZEUB 4FWSA 3VEVA 4K43A 2D4WA 4YDUA 2ASPA 2A41A 4BRMA 3HZ6A 2P9IB 3EN9A 5BN9A 1BWFO 1X9JA 1YUWA 4ISGA 1KAYA 5BRFA 2QWNA 2E2OA 4CBXA 2P9NA 2EWSA 2I7PA 4JD2B 4WQ5C 5FPEA 1S22A 1G99A 3P4IA 3BEXA 5AZIA 4B9QA 2P9UA 3VEXA 3LDLA 4WQ5A 2KHOA 5EXWA 1ATSA 4CJ7A 1NMDA 1GLBG 2E1YA 3C7NB 4C23A 5AQIA 1Z05A 2CH6A 4KBOA 2P9LA 2E8AA 3CI5A 3GBTA 2IIRA 5I9EB 2H3GX 2QWQA 5AZJB 1NGIA 4Y0WA 1JCEA 1HLUA 4ISFA 3UKUB 3M6GA 4AM7A 1SAZA 5KPZA 3A5OC 5AQVA 1NLVA 4MO4A 2E2PA 4K41A 3IDHA 4FWLA 1WOQA 1ZBSA 5BREA 4CZJA 3L6QA 4PKIA 1R59O 1BA0A 2QWPA 3VENA 4IJNA 4CD3A 5BPNA 1D4XA 2QM1A 3DXMA 2A3ZA 2GUPA 3WQTA 3L4IA 4H5TA 3MN5A 3U9ZA 2V7ZA 3U9DA 4O8KA 4EFHA 3U8XA 3CQXA 1Z6RA 2PBDA 3ULEA 4FWMA 5AQQA 4EHUA 2AA4A 2FF6A 3FZLA 3LL3A 3ZETA 3CJCA 4RCHA 1Q18A 2I7NA 3CJ7A 4H0OA 2NRHA 3O08A 2YCHA 3FZHA 1GLLO 4FOEA 4QS7A 4BGBA 5LY3A 4WQ4A 4BROA 2AP1A 3VEZA 1DEJA 2GWKA 3G25A 4PL8A 4DCHA 4DHYA 2BTFA 3CJ9A 3ZX3A 5AQWA 3CIPA 5AQYA 3H1VX 3BF1A 3QFPA 3CERA 4JNEA 1NGBA 3DXKB 4FWQA 5AQHA 3H6EA 3QBWA 2A42A 3LM9A 4BRKA 2GWJA 4H5RA 2J4RA 2F9WA 4H5NA 1HJOA 3VESA 4BC5A 4CZMA 3QFUA 4IJAA 1XC3A 1T44A 4FPAA 3UKRB 2ZF5O 2V52B 5JMVA 3FFKB 5JICA 3HTVA 1QQMA 5ADXA 4QS9A 4L3QA 1DKGD 1QQNA 2CGJA 1ZXOA 3EKSA 2Q1NA 3GE1A 4DB3A 3O4WA 2P9NB 1QHAA 3J8AA 2ZGZA 3IFRA 4H0YB 3A0IX 3VERA 1KAXA 5AZIB 1NWKA 1KAZA 1MA9B 2P9UB 4JAXA 3AY9A 4H0PA 3GG4A 3FZKA 2W41A 3KVGA 3WXKA 1LOTB 4GY2B 5AQUA 1XUPO 1BO5O 2A5XA 3C0BA 4B1XB 4BG9A 2IVPA 1J6ZA 2P9LB 3LDPA 3KZBA 1HKBA 4BG8A 2A6AA 1KXPA 3VGLA 1P8ZA 1SQKA 1TUYA 4I6MA 2YHXA 4CZLA 2D0OA 3VF4A 1MDUB 2CGLA 2W40A 4E1JA 1NGGA 5LJVA 5AQKA 5F0XA 3D2FA 4BQLA 2ASOA 2Q0UA 3CHWA 2V7YA 2BUPA 3H3NO 3MN7A 3WXIA 2DPNA 3FZMA 1WUAA 1NGCA 1NGFA 2ITMA 1BU6O 3LDNA 3TU5A 4BRDA 3W0LA 2QWMA 4FPBA 3DXMB 3MK6A 4A2AA 2QWOA 4CBWA 4XH4A 1E4FT 2FF3B 3QB0A 4RWTA 1ATRA 3CJBA 5CE3A 4QS8A 1X3NA 2OANA 3BUZB 4ISEA 4DQ8A 3ENOA 1V4SA 3DAWA 1HPMA 3ULEB 3HM8A 4MLEA 2Q2RA 4B1ZA 3ZETB 3CJ1A 3GDQA 3HSCA 2HMPA 4FWNA 2GELA 5BRDA 3FZFA 2E1ZA 3H1QA 4H5WA 1ATNA 4K25A 1TUUA 1S3XA 3EL2A 3HI0A 1U2VA 2UYTA 4H0TB 4BRGA 3WXLA 4BRHA 1T6DA 1HKCA 4O5FA 1HUXA 3SJHA 4BGAA 4BRCA 1GLCG 2IVOA 3ATVA 3UE5A 4Z94A 4CZIA 4CZGA 3VOVA 4RTFD 2NLXA 1YXQA 3HBTA 3BF3A 3ENHA 4H0VB 4B1YB 1MWKA 1NGHA 4BR0A 4NB4A 3O5BA 1IJJA 1V4TA 4PKGA 2QW9A 5AQMA 1RGIA 2GTDA 2P9KA 3VEWA 4CBUA 3CETA 2QXLA 5KPTA 4M63C 2P9SB 1ESVA 3MDQA 4CI6A 1BG3A 4CZEA 3WEEB 1U6ZA 4BQZA 4K42A 2QWLA 3I8BA 3JS6A 1ZC6A 1NGEA 3R9PA 5ELZA 2Q36A 4XH5A 3BP8A 1HX1A 4M7XA 3A5MC 4BRIA 3WT0A 2P9PA 3JXUA 5E26A 1BA1A 3LDOA 4CD1A 1BUPA 2FSKA 5AQNA 4MO5A 1JCFA 3S41A 4NO7A 5AQJA 3QMLA 4FSVA 4PL7A 2YHYA 3QDKA 3VF2A 4EIAA 2FSNA 3D2EA 4CZFA 1TYQA 4FWKA 4XEIA 4I6MB 3VPZA 1YVNA 2E2NA 1GLAG 5AQRA 5FPNA 2VYPA 3M3ZA 5LJWA 5AQGA 1EQYA 4HWIA 5AQFA 4A2BA 3A8YA 3B8AX 4BRQA 4WYBA 3W3DA 2E20A 2V51B 3CQYA 4IWVA 3H46O 4FWPA 4BRFA 5JLFA 1X3MA 3SK3A 4FO0A 2YJFA 3GOIA 4H0XB 3F9MA 4FWOA 3KHYA 3R8EA 5F1XA 3D7EO 4BC4A 5B8HA 3FR0A 3M1FA 1JCGA 2YI1A 4YDUC 3WQUA 4BC2A 3SLCA 2Q97A 3DWLA 2HF4A 3QICA 3FGUA 3UKRA 4A62A 1NGJA 4BRNA 3R6MA 4BR4A 1K8KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4V19S 3AGKA 4E7IA 4BVOA 2IOCA 3BZCA 1TKXA 3QBXA 2BE2A 4RG8A 4DTOA 2QTDA 1S9EA 4KAZA 1RBUA 5AQLA 3IG1A 4DTSA 4FLZA 4KTQA 1RBRA 4A61A 2YX6A 4W5NA 3VQEA 3OY9A 3U4LA 3L2QA 3K57A 5CZ2A 1BISA 5BPLA 4JHDA 5TKWA 1JLBA 4AF1A 5DM7L 1VQKN 2HF3A 1U2VB 4BREA 2P9IA 2FSJA 5AJ3K 1NK8A 4LC9B 2ZJQL 3THVA 2VG7A 2JGUA 3P39A 3ZLJA 3WXMB 3LM2A 3VGKA 4XH1A 3PY8A 1BIUA 3I8DA 2D0AA 4A5AA 4YFUA 4BE0A 3OYLA 4C8OA 4DR7K 3KJVA 2NNWA 2JWKA 2E4LA 5TKYA 2WC9A 4KHQA 5CZ1A 4DTUA 3KK7A 1E4GT 1YAGA 5BR8K 3AO1A 3ID8A 3AVBA 3EKUA 2QWRA 5AQPA 3VQCA 4LFBK 2ASMA 4BR9A 2HVHA 1Q86O 3I33A 1NJXA 1TKTA 3OHRA 2B4JA 4BR2A 3KTQA 3ZSRA 1WAJA 3SYZA 4F9OA 3TPQA 4J2EA 3A5NC 4CJEA 3MCAB 3G0ZA 3CJAA 4FJIA 1TYQB 3AAQA 1GOCA 1U45A 1NGDA 3NHGA 3V81A 4FOIA 4E19A 3H45C 4CZKA 1CZAN 4IO8A 3KD1E 5CHIA 1YJ9N 1C0GA 4ZTJA 3CM5A 4FJ7A 3CCUN 3VEYA 1C1BA 5HBMA 1WBBA 1JL2A 4RW8A 4B9NA 2XRIA 3U3GA 5KRSA 5KPRA 4DV1K 1DT9A 3DLEA 3DJCA 3HOTA 3MEGA 1GOBA 4CF8A 2BANA 3KD5E 2PYJA 3E9OA 3THXB 3D2FB 4DWIA 4FJJA 4E89A 3OYDA 1XQSC 4KHUA 3PIOL 5AQXA 2P9SA 3A5LC 1NG9A 1VAZA 1QZ5A 4JS4A 4ILGB 3NGIA 3LANA 3OS2A 1IKXA 2A40A 2HOEA 1KLMA 3NFAA 5SZTA 1RDWX 4BWMA 2ZGYA 4BRPA 2Y1JA 1RDDA 4JHDB 4F3OA 3VEVA 2D4WA 4I9QA 3TR8A 2P9IB 5BN9A 2OPRA 3L2RA 2QWNA 2DFHA 2E2OA 2P9NA 2EWSA 1VRUA 1YIJN 4B9QA 1HR0K 5EXWA 2QI2A 1IBLK 1ATSA 3M5RA 4OKEA 4CJ7A 1SKRA 3DYAA 3TTFA 2E1YA 1DLOA 4FJ5A 5JVHL 1Z05A 1M90O 3PSFA 4CIFA 2E8AA 3OW2M 3CI5A 3GBTA 4FJKA 4CIEA 2H3GX 1VQ4N 1VQLN 2VQEK 4LH5A 3THWB 3M6GA 1JXEA 2RHKA 5KPZA 4YHHK 3NCIA 2G8WA 2E2PA 4LSLA 1VQPN 3QINA 3CCSN 1N32K 1BA0A 4L8RB 3QEPA 2QM1A 3DXMA 4MDBA 3MN5A 2V7ZA 4FLYA 4CECA 4K8ZA 3ITHA 4JI4K 3LWMA 2PBDA 3ULEA 3CCJN 4FWMA 3U3YA 4RW4A 3G71N 2AA4A 1NOYA 1OH5A 2FF6A 1ZBUA 1VSIA 2B6AA 2DTUA 3LL3A 4YOTA 3CJCA 3AVKA 4KH5A 3J7ZO 3RMBA 4HUEA 3CJ7A 5HRNA 3KLEA 3BGRA 4QS7A 1LWFA 2AP1A 1NK9A 3PUFA 4DCHA 4DHYA 2BTFA 4YOWA 1QTMA 5AQWA 5C0YA 3BF1A 3DM2A 3NE6A 1NJWA 4JNEA 1TGOA 1NGBA 1N33K 3MEDA 3B6OA 1C1AA 4OPAA 4FJ9A 3LM9A 4BRKA 1SL2A 2J4RA 4CJPA 1HJOA 3SPZA 3F73A 1NKBA 3LALA 4B9UA 4FPAA 2V52B 1X9MA 4DTPA 5C24A 3SNNA 4CHYA 3TAFA 4JK8A 2OA8A 3O4WA 1NJYA 2P9NB 1Q9YA 4NCGA 3THYA 2FBXA 3IFRA 4U7BA 3A0IX 3VERA 4E7LA 2HHSA 1DTTA 1P90A 1KAZA 1K9MO 2HMIA 3PX0A 4BDZA 3R1XA 3KVGA 1D9FA 2RPIA 3HXMA 4Z4EA 3DRRA 3P1GA 1J6ZA 3LDPA 1EWRA 4F3TA 4BG8A 4W5QA 3VGLA 1P8ZA 3CPEA 1TUYA 4I6MA 4KB0A 3ZT2A 2VQFK 1MDUB 4DFMA 1WSHA 1NK6A 3C6TA 1U49A 3ZCMA 5LJVA 4FYDA 3O9UA 4FLUA 4DR4K 5KI6A 2O8CA 4H8KA 4BQLA 4DF8A 4Y1CA 2Q0UA 1U47A 4H4OA 1BIZA 2V7YA 3NGZA 3ULDA 3RTVA 1WSIA 3FZMA 4FM1A 2ETJA 4A57A 3NVMA 1BU6O 4M3RA 3TU5A 4FW1A 1OH7A 4M3TA 4FPBA 3DXMB 3MK6A 1WSEA 4CBWA 4AHCA 1E4FT 3QB0A 3QO9A 4JI6K 5CE3A 4DQ8A 2HBLA 3ULEB 4CEBA 1TK0A 3ALYA 2O8DA 4LD0A 1U4BA 1QS4A 3OYCA 2E5LK 1CLQA 2Q2RA 4XIUA 3RWUA 3B6PA 4FK0A 4HVJA 3GDQA 4KRFA 4JV5K 2E1ZA 1L3UA 3NDKA 4CGDA 3EL2A 4H0TB 4N47A 5HOOA 4BRHA 1VSLA 1HKCA 4O5FA 3G6EN 5HRRA 3SJHA 5T7BA 4BRCA 2IVOA 3UE5A 4E1MA 3MWTA 5LMNK 4CJWA 1KFSA 2YNGA 1TK8A 4JRQA 2AJQA 4B1YB 1MWKA 3L2WA 4GV9A 1NGHA 4O0IA 3O5BA 1V4TA 4PKGA 2GTDA 1WSJA 4B3TK 3V6DA 3C94A 2QXLA 3IS9A 4DSIA 4UY8O 4M63C 2G8VA 2UXCK 4DSEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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