3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium avium
molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
1S22A 2DPNA 2D1KA 3D2EB 3HZ6A 5KQ8A 4FPAA 5AR0A 2Q97A 4CZFA 4WQ4C 3A5NC 3LDNA 4CZJA 1JCGA 4CI6A 3H3NO 1NBWA 3B8AX 4BRLA 3G25A 3ID8A 2YHXA 2F9WA 2FF6A 4BVPA 1TYQB 3CJAA 2V7YA 2WUSA 2CH5A 4YDUA 3FFKB 4BRDA 2P9LB 1SQKA 4XEIA 2FSJA 4JHDA 1DEJA 5AQIA 2P9SA 5BPNA 1RDWX 3ZX0A 2IVPA 3H6EA 1HUXA 3JS6A 3CETA 2D0PA 2E20A 5AQQA 3SMPA 2GELA 4HWIA 4A2BA 3M6GA 3VPZA 2FXUA 5AQKA 4B1VA 2IVNA 3MN5A 4IO8A 3RSEB 4NB4A 1MWMA 4BG8A 2ZGYA 1HKCA 1NGGA 3SK3A 4DB3A 2FLOA 2A40A 4DQ8A 3OHRA 3BP8A 1C0FA 3FZFA 3ENOA 1ATRA 1NWKA 2KHOA 4H5WA 3UKRB 4L3QA 4EIAA 2P9IB 2CH6A 5AQSA 4F9OA 3LDQA 3S41A 2GTDA 3R8EA 2QW9A 2YHWA 3O1WA 1GLJO 2YHYA 1OKJA 2A41A 4QS9A 3KHYA 3FE1A 1E4FT 3O6WA 2CGLA 4FSVA 4H0PA 5E84A 3HI0A 4EAHD 5AQRA 2UYTA 4MLHA 3WEEB 3HBTA 3W3DA 3QBWA 1NLVA 1GLAG 1HKGA 4AM7A 2D4WA 2P9UB 3O4WA 3ZETA 1T6DA 3MDQA 3GDQA 4H0OA 3VEWA 2AP1A 3EKSA 4WQ5C 1XUPO 5ADXA 3FZKA 1RFQA 2Q31A 4BRGA 3GL1A 4RCHA 3U9ZA 1E4GT 4BQLA 2Q36A 2PBDA 2A5XA 4CZGA 5AZIB 3EL2A 3QICA 1KAXA 1BUPA 3FZLA 1H1VA 4I6MB 3AAPA 4BRAA 4BC4A 4BROA 1YAGA 3ZETB 1X9JA 3CIPA 1GLDG 5JMVA 1TUYA 2P9PB 4M7XA 1IG8A 5EY4A 1WOQA 5AQHA 5AFUA 4BGBA 3VEYA 5F1XA 3QFPA 2FSNA 5LY3A 3VEOA 1BOTO 1QQNA 3O5BA 1EQYA 3H3OB 2YCHA 3ATVA 3AY9A 1GLLO 5AZJA 2GUPA 4H03B 4JNEA 4FO0A 4B1YB 3FZHA 3EN9A 2HOEA 3VGKA 3H46O 3JXUA 4FWMA 1XQSC 3A8YA 3A5MC 3D2FA 3U9DA 3FGUA 5AQFA 4BRPA 5FPEA 4FOEA 4BR7A 1GLBG 4PKHA 4IWVA 4BC3A 2OANA 4JD2B 3VERA 1ZC6A 2V7ZA 1HKBA 4BRNA 3QBXA 1QQMA 2E2QA 2P9PA 4YDUC 4ISGA 1ZXOA 3U4LA 1QQOA 1XC3A 1BG3A 2A42A 5LJVA 4BRHA 2H3GX 1RGIA 4J8FA 2E1ZA 2QWPA 3WXJA 3GE1A 3O1BA 2NRHA 1TYQA 3VESA 5AQXA 3DXKB 4PL7A 1DGKN 2FF3B 2I7PA 1QZ6A 5BPMA 1J6ZA 3IDHA 3SJHA 3SMSA 3A0IX 3MK6A 2A3ZA 3EO3A 3DXKA 1SAZA 4M7YA 3LDPA 2E2PA 4H5NA 5ADXH 4BREA 4FWRA 1KXPA 4EHTA 5AQUA 3D7EO 3W0LA 1KAZA 1HX1A 3ATUA 5AQPA 4CZMA 1ZBSA 1MWKA 2W40A 3LM9A 3UKUA 3VEXA 4CBXA 4H5VA 3TPQA 5KPTA 3CERA 1BA0A 3FLCO 4BRQA 5AFUH 4ISEA 3RSEA 1NGAA 3CQXA 4BR0A 4BRIA 3CHWA 1JCFA 1Z6RA 2Q0RA 3ZX2A 2HF3A 3CJ9A 4WQ5A 4EHUA 4H0VB 5F0XA 2Q0UA 1G99A 1D4XA 4CD3A 3M1FA 5AQVA 5AQJA 5KPRA 1NGDA 2I7NA 2P9KA 4KBOA 2CGKA 3LDOA 1IJJA 5CE3A 2BUPA 2VWBA 5KPZA 5AZJB 2QWQA 2W41A 4FL9A 4BRMA 3ULEA 4H0XB 5B8HA 3I33A 2HMPA 1NGHA 1BA1A 3UKUB 1LCUA 3O08A 3DAWA 2QWLA 4IZ9A 5AQMA 3BUZB 2YJEA 4WQ4A 4BRCA 4MO4A 1NMDA 4CZLA 5LJWA 1Y64A 4A62A 1NGEA 4JD2A 5FPNA 4NO7A 4FWOA 2E8AA 3SLCA 5I9EB 3M3ZA 3J8AA 5ELZA 1V4TA 4FWSA 4ISFA 4JAXA 1LOTB 3C7NA 3CJ1A 4BRKA 4FWKA 2GEMA 2Q1NA 2VCPA 3A5OC 3WT0A 4XH4A 3UKRA 3MN9A 3O80A 4IXCA 2CGJA 4CZHA 3ULEB 1SZ2A 1BO5O 3GG4A 3I8BA 3ZEUA 3VGLA 2Q2RA 1C0GA 3UB5A 5AQNA 4DCHA 4BG9A 3LDLA 2P9SB 3TU5A 4JHDB 4GY2B 2P9LA 2F9TA 3DJCA 1NGCA 3LL3A 3VENA 3C7NB 4LC9B 2QWMA 4FWPA 4RTFD 5JLHA 5BN8A 1ESVA 3HSCA 1U2VB 4BR2A 4O5FA 4B1XB 1V4SA 1T44A 3UE5A 1NGFA 5AQLA 3ZX3A 3CJCA 3DWLA 4Z94A 1QZ5A 2ASPA 2IIRA 3MN7A 1ATSA 2P9UA 1U6ZA 1NGJA 4H0TB 4XH1A 1GLFO 2ZF5O 4PKGA 5FPMA 4B9QA 4H5TA 4A2AA 3QB0A 2P9NA 5JICA 3U8XA 4IJAA 3HTVA 4H5RA 1JCEA 5AQOA 4PL8A 1T6CA 4K42A 2E1YA 3C0BA 4FWLA 5JLFA 3CJ7A 2J4RA 1U2VA 4I6MA 3FZMA 3WQUA 2YI1A 3F9MA 1X3NA 1Q18A 3VEVA 5EXWA 4CBUA 4GNIA 4B1ZA 4Y0WA 2QWOA 2PAVA 4MO5A 4O8KA 3VGMA 3QDKA 3R6MA 3BF1A 4FOIA 3VEZA 4A61A 1GLEG 1QHAA 3H45C 4K41A 5EOYA 3CQYA 5BRDA 2NLXA 2ZGZA 2BTFA 1MDUB 2QWRA 3VOVA 3DXMB 4MLEA 4E1JA 3ENHA 4DHYA 2V52B 2YJFA 2HF4A 1R59O 1NGIA 2VYPA 3A5LC 3P4IA 4XH5A 4HTLA 3ZEUB 4BGAA 3H1VX 3IMXA 3VF6A 4B1UB 1K8KA 4CZIA 5BRFA 2ASOA 3GBTA 5EX5A 3IUCA 5AQZA 4BR5A 5BRHA 2V51B 3H1QA 4BQZA 5FPDA 3WUHA 1NM1A 3WXKA 3FR0A 2D0OA 3L6QA 2FSKA 1YXQA 5EVZA 5AQWA 2QM1A 2P9IA 2IVOA 1HJOA 4B1WB 3VETA 3AARA 3BF3A 5KQDA 5AQGA 1S3XA 4CZKA 3D2EA 4M63C 3L4IA 3VF4A 5BR9A 4RWTA 2A6AA 1K8KB 5BN9A 1YVNA 2QXLA 3R9PA 5AQTA 1KAYA 2E88A 4BRFA 3LM2A 4BVOA 1ATNA 3DXMA 4AM6A 1X3MA 1TUUA 3WXLA 1P8ZA 2GWJA 3MCPA 1CZAN 4FPBA 1HLUA 4FWQA 3L0QA 3GOIA 5AQYA 3QMLA 2P9KB 2P9NB 5AZIA 5E26A 1WUAA 3CJBA 4PKIA 4JN4A 3MMVA 4IJNA 4WYBA 4K43A 1NGBA 1Z05A 3KZBA 3EKUA 1BDGA 4QS8A 1BU6O 3QFUA 3D2FB 4FWNA 4CZEA 1HPMA 2E2OA 2ASMA 5BREA 2E2NA 4C23A 5TKYA 2ITMA 2AA4A 2QWNA 3WEEA 4BC5A 3VF2A 3WQTA 3O8MA 3WXIA 4CD1A 2EWSA 3CI5A 2ZWHA 4BR9A 5BPLA 4CJ7A 3HM8A 1DKGD 2GWKA 1GLCG 4BR4A 1BWFO 4H0YB 4K25A 3AAQA 1MA9B 4QS7A 3KVGA 3IFRA 3MN6A 5F2RA 2NZTA 3EZWA 3BEXA 4EFHA 4CBWA 1YUWA 4BC2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DPNA 1NG9A 1W9HA 3HZ6A 2Q97A 3E9OA 3ZSRA 3RRGA 1RT5A 3A5NC 3THVA 4C1NK 4CI6A 3V9UA 4CJTA 1W0HA 1JKHA 2RHKA 1TYQB 1WSIA 1BCOA 2CH5A 5HOOA 4YDUA 1BQNA 4MQ3A 3FFKB 2HVHA 1SQKA 2FSJA 3SBGA 1A5XA 3HYFA 3OYJA 1EO1A 4HVJA 5BPNA 3OYMA 4JLHA 3JS6A 2E20A 1Q9XA 5AQQA 4O55A 2GELA 1YT3A 4B3OA 2VG5A 3N4PA 4AHUA 2FXUA 1SKRA 1T03A 2O8EA 1A5WA 3MN5A 4Z4IA 1JXEA 3RSEB 1MWMA 5FRMA 1TK0A 3SK3A 4DB3A 3OYFA 3BP8A 4E0DA 1HQUA 4H5WA 2KTQA 3KLFA 2CH6A 3DLBA 1KFSA 3PX0A 4F9OA 3S41A 2OCEA 3R8EA 3OYLA 3OVNA 1C0TA 1BI4B 3ZSWA 3NAEA 3KHYA 4AH9A 4DS5A 3O6WA 4DTRA 1S72N 1I94K 4CJUA 1K8AO 5E84A 1QSYA 3AVFA 3M8SA 3NCIA 3HBTA 1GLAG 4AM7A 3SQ4A 2D4WA 3O4WA 2AP1A 2NRXA 4JK7A 4GVEA 3V1RA 3DYAA 1VQ8N 2O8DB 3GL1A 4RCHA 3U9ZA 2Q36A 2PBDA 3FZLA 1H1VA 3AAPA 4CHNA 2YNHA 4FZXC 3ITHA 3HPGA 4LF6K 2O8BA 1IBLK 5EY4A 5AQHA 1WLJA 4WFNL 4DSLA 4KTQA 3CMEN 4B9VA 3UIQA 3H3OB 3RMCA 1GLLO 5AZJA 3CC7N 5J2QA 4B1YB 4C8KA 3VQCA 4CJEA 4BE0A 3CFRA 3AO2A 3VGKA 4E3SA 4LH5A 4YOUA 3A8YA 3D2FA 4BRPA 1NJWA 2RE2A 3AA2A 4BR7A 3ZCMA 1VSFA 1GLBG 4IWVA 1ZBLA 2HNZA 3AVBA 3NF8A 4DTSA 4W5QA 3JSMA 1KCFA 1HKBA 4CF0A 3QBXA 1WBDA 3SI6A 3VQAA 4RW9A 3U4LA 4IG3A 1SL1A 3J81O 4FZZA 3L2QA 4CJLA 3M5RA 4DV7K 1RDUA 4M45A 3O1BA 2NRHA 1SUQA 3VESA 3KKSA 2D5RA 4FM1A 3OYCA 4HHTA 3LANA 3ZT1A 1U04A 4BDYA 4A59A 4LSNA 3IDHA 3MEGA 3CFPA 3CD6N 3MK6A 4JI2K 4M7YA 4DG1A 3O3GA 4N41A 2KFNA 3D7EO 4QAGA 5M1QA 5BR8K 2OTLN 1KAZA 5AQPA 2ZQBA 4BDZA 1ZBSA 1MWKA 4CF2A 3ID6A 1XNQK 3VEXA 3TPQA 1FXXA 2O8BB 3RMDA 3CERA 2VGMA 1YJNN 3FLCO 1RT4A 5AFUH 4ISEA 3RSEA 2HNDA 4GW6A 4BRIA 4RG8A 3ZX2A 1VQ7N 3HJFA 4JS5A 5M1KA 3KLEA 2Q0UA 4JI8K 1G99A 1TAQA 4BY9C 3EE8A 3M1FA 4R79A 1VQ4N 4GVMA 1NGDA 3QEIA 2I7NA 3KKRA 3VQDA 5GAEP 2I5JA 1RTJA 5HRNA 2Z1HA 5KPZA 3OYGA 1UA1A 4NYNA 2W41A 3ZYYX 1S5JA 3SZ2A 4JI4K 3UKUB 3O08A 3DAWA 1U4BA 4LD0A 4IZ9A 3CPWM 2EX3A 4V19S 1BGXT 1C0UA 2HBLA 4DR7K 3CCSN 3THWA 1ASWA 4CZLA 1C1BA 4KKOA 3K9KA 1NGEA 5FPNA 1NKEA 4A5AA 4Z4FA 1KRPA 3SLCA 5I9EB 1BISA 4GV3A 3AO5A 2WOMA 1LOTB 1KVAA 3C7NA 1JJ2M 3MEDA 3A5OC 4XH4A 3UKRA 3MN9A 3CMAN 4IXCA 2VQFK 3QEWA 4NXNK 2RN2A 3ULEB 3P83D 3GG4A 3SQ2A 1C0GA 1LV5A 2DTUA 1TK5A 1BQMA 3LDLA 1N8RO 5CZ1A 3DRSA 3TU5A 3VTIA 3QNOA 3TSUA 2R7YA 3C7NB 2QWMA 5BN8A 3ZSYA 3AGRA 3R3LA 3OTOK 1Q81O 1RBRA 4O5FA 1V4SA 3EY1A 1NGFA 4DFMA 3SNNA 4FJ8A 3U3YA 1LW0A 2JLEA 5JVHL 4DTXA 3MN7A 2PYLA 4JKFA 3JYTA 5J2MA 1ASUA 1RTDA 4JV5K 3AVMA 1BIUA 3THYA 1GLFO 3L3UA 3B6OA 4FLWA 1HPZA 4J2BA 3ULDA 1JLCA 4KTZA 5JICA 2P9NA 5DK5A 4ELUA 4AHVA 1ZBFA 2YHBA 3U8XA 3HTVA 1N33K 5T7BA 4PL8A 3ZLJA 3TAEA 4E7IA 2J4RA 4JKDA 1S1TA 1KVBA 3P1GA 3M8RA 4DV5K 4KHSA 2UXBK 3LWLA 1KSPA 4BWJA 1P90A 4MO5A 1IH7A 3BF1A 1QHAA 4TSXA 2WFBA 2NLXA 1MDUB 1NKBA 4MLEA 4DFJA 4CEFA 4E1JA 3A5LC 3ZEUB 4HTLA 4W5OA 3DM2A 3H1VX 4FK0A 5BRFA 4CZIA 4X62K 4DV1K 3QNNA 3CCEN 2WTUA 1X9SA 4L8RB 2X6SA 1LWEA 1VHXA 1NM1A 3ZT4A 3KD1E 2D0OA 2OPPA 2FSKA 5AQWA 1ITGA 2QK9A 3PO5A 4DTJA 1S3XA 1RBUA 2VWKA 1C0MA 5C25A 4M63C 3CCVN 2W42A 3L4IA 1LAWA 1QHTA 3CPEA 3ZT2A 1K8KB 4FJGA 5BN9A 4K8ZA 1YVNA 5AQTA 3LM2A 4BVOA 4NXMK 1D8YA 3J7ZO 3TARA 4PA1A 4LF5K 3WXLA 2HHVA 2GWJA 4HUEA 3HK2A 5AZIA 2XY8A 3AVNA 3CJBA 3LALA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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