3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium avium
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
4H0VB 1BU6O 1X9JA 3D2FB 1NGIA 5AQMA 3MK6A 2F9TA 3HM8A 4FWKA 5AQZA 3CJBA 4B9QA 3VEZA 1EQYA 1KAZA 2IVPA 3BEXA 2A6AA 4IZ9A 2E2PA 3O6WA 3A8YA 5E84A 3GE1A 4FL9A 2QWPA 3VGMA 3FZKA 4MLHA 2FLOA 5ELZA 3D2EB 1QQOA 4CD1A 3QMLA 4ISEA 1BA1A 3MMVA 2E1YA 4CZLA 2W41A 4Y0WA 5AZJB 3ENHA 2GWKA 3KVGA 1BG3A 2HOEA 4JNEA 4B1WB 5AQOA 5AQHA 2D0OA 4BR5A 4PL8A 5AQQA 3UKUA 1Z05A 5AZIB 5BR9A 3QBXA 2QW9A 4BRLA 2IVOA 1WUAA 2AP1A 1QZ6A 1NGGA 1MDUB 3ZX0A 3H46O 4E1JA 5AQRA 1HUXA 3A5MC 4IO8A 3FGUA 1V4SA 2P9KB 1GLDG 3QBWA 3WXLA 4I6MA 3HSCA 5JMVA 3DXKA 4PL7A 1DKGD 4IJNA 3M6GA 1S3XA 3A0IX 1JCEA 3VEVA 3ZEUA 3ZX3A 3JS6A 4BROA 2A42A 2Q0RA 3DAWA 1T44A 2F9WA 3ULEB 2E20A 4BREA 2YHYA 2HF4A 3DWLA 4BRAA 2P9LB 2V7YA 1GLEG 2A40A 3O1BA 2FSNA 4PKIA 5AQYA 1YVNA 3EO3A 4JD2A 1BDGA 1KAXA 4BRCA 2WUSA 2AA4A 5ADXA 3ZETA 4FO0A 3BF1A 2FF3B 1BOTO 5JICA 3W3DA 1NGFA 3IUCA 4FWRA 3GG4A 4BRKA 3KZBA 3WXKA 3FLCO 4BG8A 4A2BA 4CZKA 3EKSA 2I7NA 5BRFA 3A5LC 3VETA 5I9EB 4GY2B 3LM2A 3MN7A 1E4FT 1ZXOA 2D1KA 5AQJA 5FPDA 4BVPA 3R8EA 5AQVA 3GBTA 1GLCG 4FWNA 3MDQA 4FWOA 4KBOA 4WYBA 3CJ1A 2IIRA 4BRDA 1BA0A 5KQDA 2Q31A 5AQUA 2YHXA 4MO4A 3VESA 4CZFA 2FXUA 1T6DA 2PBDA 1TYQA 3ZX2A 3JXUA 3GOIA 4CZHA 4FWLA 3EKUA 3LM9A 4FWSA 3C7NA 3VEXA 5EOYA 3L6QA 5AQIA 5AQXA 1NBWA 3UB5A 3VEWA 4XH4A 1ATSA 3IFRA 5FPEA 2P9IA 3EN9A 2BTFA 4H0OA 4BG9A 4BR0A 4K41A 1XQSC 1JCGA 4FPAA 5JLHA 3HI0A 4FOEA 3CJ7A 1NMDA 3WXJA 3CQYA 3MN6A 2GEMA 4I6MB 4PKHA 1C0GA 3SMPA 3LDNA 3DXKB 4FWPA 5BPLA 2J4RA 2YI1A 4FPBA 3LDLA 4AM6A 3DXMA 5LJWA 1MWKA 3ZEUB 2P9UB 2V7ZA 3TU5A 2QWOA 3CERA 2IVNA 1U2VA 4A2AA 1DGKN 2QWMA 3RSEB 1MWMA 4BRQA 4K43A 2HF3A 3ZETB 1QZ5A 3U4LA 3M3ZA 1RDWX 5B8HA 4CJ7A 3UE5A 1SAZA 4BRNA 5BRHA 4YDUC 3G25A 1GLFO 5AQWA 5TKYA 5AFUH 4J8FA 2OANA 3UKRA 4A61A 3SJHA 2Q1NA 5BPMA 4BR2A 1NGAA 3I8BA 4PKGA 4QS8A 2KHOA 2A5XA 2UYTA 2YJFA 3A5NC 1S22A 3GL1A 2FSJA 4JHDB 4WQ5A 4B1UB 2NZTA 3LDPA 4FSVA 1XC3A 4ISGA 2P9PA 5AQLA 5KPZA 4FOIA 2CH5A 4K25A 5JLFA 2ZGYA 2A41A 3HBTA 3U9DA 1XUPO 1WOQA 3VF2A 4CBUA 1TYQB 4BRGA 3P4IA 4BGBA 5FPNA 1HPMA 3HZ6A 2Q97A 3C7NB 1NLVA 4NB4A 3WXIA 5AR0A 3CJAA 4O8KA 2E2QA 5LJVA 1BUPA 2P9IB 2QM1A 2E2OA 3AY9A 1IG8A 4H5RA 1LOTB 1NGHA 2GWJA 1ZC6A 3QB0A 2CGJA 3SLCA 3KHYA 4QS9A 3DJCA 1QQMA 3LL3A 4MLEA 5LY3A 4JN4A 2E2NA 3FR0A 3H1VX 5AZJA 3WQTA 3ATVA 1ATNA 1QQNA 2GTDA 4LC9B 5F2RA 3DXMB 1GLJO 2YCHA 1K8KA 1KAYA 3VGLA 3BUZB 5AQPA 1GLBG 3VGKA 1P8ZA 3MCPA 3H3NO 4EFHA 2QWRA 2A3ZA 1GLLO 4CZGA 4A62A 3VEOA 1TUYA 3VOVA 3O8MA 3H6EA 3WQUA 4HTLA 2ZGZA 3A5OC 3WUHA 5BREA 1C0FA 2D4WA 4YDUA 2ZWHA 1Y64A 2VYPA 3UKUB 3O5BA 3UKRB 2H3GX 1RGIA 4DQ8A 3F9MA 1H1VA 3CJCA 1RFQA 1X3MA 3I33A 4GNIA 4HWIA 5AQTA 5E26A 1YUWA 4H0XB 3HTVA 1TUUA 1NGBA 1HKCA 1SQKA 5EVZA 2FSKA 3BF3A 4CBXA 4NO7A 2Q36A 4XH1A 4H03B 4H0YB 4WQ4C 1HLUA 4IXCA 1NM1A 4C23A 4BGAA 3D7EO 2ITMA 1ESVA 1Q18A 2Q0UA 2P9PB 4CD3A 1R59O 2QWNA 2NRHA 2YJEA 1E4GT 3VF4A 4EIAA 1G99A 4MO5A 4EHUA 3FZLA 4CI6A 5F0XA 4XH5A 1T6CA 4FWQA 4K42A 1QHAA 4B1ZA 3FZHA 5F1XA 2W40A 3GDQA 2E1ZA 3CETA 3EZWA 4JD2B 3W0LA 3VERA 2E88A 3ID8A 3BP8A 3IMXA 3WT0A 2V52B 5KPTA 4BVOA 2P9SA 2V51B 3CIPA 2ZF5O 3O08A 1HKBA 1SZ2A 5BPNA 4IWVA 5BRDA 1X3NA 4BRHA 4RTFD 1JCFA 4BR9A 5ADXH 4BC4A 1IJJA 3CHWA 4FWMA 2GELA 4BQLA 3WEEA 3B8AX 1HX1A 2VCPA 3ENOA 3O80A 2P9NA 3R6MA 4JAXA 3U9ZA 1HKGA 2CGKA 3H1QA 5BN8A 1NGJA 1K8KB 1MA9B 1BO5O 5KPRA 4EAHD 1U6ZA 1OKJA 4H5VA 3EL2A 4AM7A 2EWSA 3L0QA 4QS7A 3IDHA 2CH6A 2ASMA 3FZMA 1GLAG 3FE1A 3J8AA 3L4IA 3VF6A 3D2FA 3CQXA 3FFKB 1LCUA 1DEJA 3VEYA 4CZEA 5AQNA 3R9PA 1HJOA 2QWLA 3H45C 4EHTA 1NWKA 1NGCA 3C0BA 4H0TB 3OHRA 4M7YA 5EX5A 5CE3A 1NGEA 4B1VA 4Z94A 3QFPA 4RWTA 4BC2A 2P9UA 2BUPA 4DCHA 1ATRA 4H5WA 3D2EA 4WQ4A 3SK3A 3O1WA 3LDOA 3LDQA 5EY4A 3ATUA 3RSEA 1V4TA 2FF6A 4CZIA 3AAQA 2Q2RA 3AAPA 4M63C 2ASOA 4BR7A 5AFUA 3FZFA 4RCHA 2E8AA 1NGDA 4BRIA 2D0PA 2PAVA 2VWBA 3MN5A 1Z6RA 1U2VB 5AQSA 2QXLA 3CI5A 5EXWA 1YXQA 4CZJA 5AZIA 2QWQA 4H5TA 4BRFA 3QDKA 5AQGA 4BQZA 2GUPA 4BC5A 3QICA 4BR4A 2NLXA 1BWFO 5AQKA 2P9SB 5BN9A 4BC3A 4H5NA 3VPZA 3VENA 2HMPA 2CGLA 4O5FA 4F9OA 5KQ8A 4DB3A 2P9KA 2ASPA 5AQFA 4BRMA 4JHDA 4H0PA 1D4XA 2I7PA 4WQ5C 3U8XA 3WEEB 1ZBSA 1CZAN 3QFUA 4DHYA 4ISFA 4XEIA 1J6ZA 2P9NB 4IJAA 4M7XA 3TPQA 4BRPA 1KXPA 3ULEA 3CJ9A 2P9LA 4B1YB 4CBWA 4L3QA 4B1XB 3SMSA 3H3OB 3MN9A 1YAGA 2YHWA 3M1FA 5FPMA 2DPNA 3S41A 3O4WA 4CZMA 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HVTA 5AQMA 1X9JA 3MK6A 1UWBA 5KGWA 3CJBA 4B9QA 4IZ9A 4B8CA 3M8PA 1BCMA 1E3MA 4FVMA 3VGMA 4YOUA 3AVMA 5ELZA 3OVNA 1TVRA 3LWMA 3SV4A 3CFRA 2I5JA 5AZJB 3KVGA 3DLLL 4DV2K 4JNEA 4GKKK 2BDPA 1X1PA 5AQHA 4B9SA 4BR5A 2D0CA 1Z05A 5AZIB 1QSLA 3E01A 2QW9A 4JKGB 3THXA 4AH9A 3SUOA 4FK0A 1WBDA 4L8RB 1T03A 1NGGA 3T1YK 2O4GA 4FK4A 3OS2A 1S9GA 5AQRA 3QO9A 2F8SA 3A5MC 3HPGA 4IO8A 4DR7K 3FGUA 1X9SA 4DQPA 3QBWA 1RDBA 3ZT2A 2B4JA 4CJ4A 2XHBA 4IJNA 1S3XA 4Y1DA 1JCEA 3VEVA 3ZEUA 3T3FA 1ILYA 2EHGA 2A40A 5JS1A 2DFFA 1HYVA 4CFCA 1U04A 4O8UA 3V9XA 3KLGA 4OPKA 3RMBA 3C6AA 3THVA 3EO3A 4JD2A 3OYKA 2F4VK 4BRCA 4JRPA 2O8BA 3BF1A 4CJKA 1KVBA 3WNEA 4CERA 4K8ZA 5DM7L 3SBTA 4CZKA 1HNIA 3L2UA 3DYAA 4WFNL 4DS5A 3TAQA 3VQQA 2I7NA 3CYMA 3A5LC 3DOLA 4AHCA 3KK7A 3T1HK 3LM2A 4TSXA 3ZSXA 4E3SA 4U7BA 4WCEL 1KFSA 2A1SA 1KFDA 3GBTA 3AO4A 2D0BA 4WYBA 4JKCA 4B08A 5FRNA 2F8TA 4ILJA 3RMDA 1BA0A 4BE0A 4PY5A 5KQDA 2X74A 2Q31A 2KZMA 3KTQA 2YHXA 5E41A 4MO4A 4FJMA 2FXUA 4J2DA 4ZTFA 1HYSA 3GOIA 2D5RA 3EKUA 4FWSA 2YNGA 4A5AA 3I56N 3EZ5A 5AQIA 3ASMA 5AQXA 3UB5A 4R79A 4DV4K 4DTNA 3THXB 4XH4A 3V4IA 3EN9A 3Q7CA 4C1NI 3SQ4A 4IOXA 3LDSA 4NLBA 1JCGA 1NMDA 1FKPA 4CF8A 4PKHA 5H1SQ 5BPLA 1HPZA 3PX6A 5LJWA 3V1RA 3ZEUB 2V7ZA 4DV7K 3CCRN 5SZTA 1LW2A 3BDPA 1KD1O 5GADP 1Q9XA 3O9TA 4DTOA 2HHWA 2HF3A 2O8BB 1QZ5A 3U4LA 4CEZA 1TAQA 3E9OA 3SBGA 3IKMA 4KH4A 1SAZA 4M3XA 4BRNA 4YHHK 3TANA 4FYDA 1HYZA 3UKRA 1U48A 3SJHA 1TK8A 4CCHA 5BPMA 3TSQA 3O9RA 4FK2A 1A5WA 1X9MA 1S22A 2FSJA 2NZTA 1TAUA 1NJXA 2OYQA 3CFPA 1VSIA 3HBTA 3U9DA 2G8KA 1XUPO 4Z0UA 5FPNA 3HZ6A 2W6LA 1TL1A 3J7ZO 4CK2A 5AR0A 2HB5A 4AILC 3CF5L 3THYA 1VQNN 5I42A 4B3RK 1IKVA 4A59A 1IG8A 2E4LA 5J2PA 4BDYA 1ZC6A 4ELVA 1RDUA 4N47A 3AVFA 4CK3A 3OBWA 1K6YA 3DJCA 4AHTA 1WSFA 5J2MA 1RBRA 5IWAK 1OVQA 2PYJA 1SL2A 3WNGA 1GLJO 2YCHA 4DTSA 3HL8A 1A5XA 3VGLA 4CGGA 3C94A 2NRXA 2QKBA 4CECA 3KK2A 2NRTA 4DTMA 1GLLO 1BL3A 3NF8A 4AQYK 4FJXA 3H6EA 3WQUA 4HTLA 2ZGZA 3ZSYA 4CEQA 3U6FA 5GIPA 4BACA 1Y64A 4CJQA 4MQ3A 4O4GA 3UKRB 3WNFA 4DFJA 3S3NA 3CJCA 3I33A 3AVJA 3HK2A 3LALA 4H0XB 1S1WA 1W97L 1BIUA 4Y1CA 1S1VA 1SQKA 5EVZA 3QEXA 4H03B 1Q7YO 4WQ4C 2XY8A 1HLUA 1HNWK 1RDCA 1KSPA 3D7EO 4CJUA 1KVCA 4B3OA 1RT5A 2ITMA 1ESVA 1Q18A 1VSMA 2IOCA 1WB9A 2WOMA 1R59O 4FJNA 4CEEA 2QWNA 2HVIA 4DU1A 1YHQN 3MECA 2O8CA 3VF4A 3CC4N 1NK6A 3IS9A 4FZZA 5F0XA 4XH5A 4FWQA 4FJ7A 1HNZK 1JL2A 3GDQA 2E1ZA 3V1QA 3VERA 1I94K 3ID8A 3THYB 4DTXA 4JYAK 3TI0A 5KPTA 1VSHA 4BVOA 2P9SA 1HKBA 3VQ9A 1X3NA 5LMUK 4BRHA 5ADXH 3OYIA 1P90A 1RBVA 3P5JA 4KFBA 1ASVA 1N8RO 1TV6A 1KLMA 4FWMA 2GELA 3F2KA 1HX1A 5J2NA 2Z1JA 4H4OA 1Y97A 2P9NA 3R6MA 2HBKA 2Y1JA 1K73O 3O4NA 4E0DA 5KPRA 1U6ZA 5CY4A 1YVUA 1OKJA 4H5VA 4QS7A 3IDHA 2YNIA 4CEDA 3CQXA 3FFKB 1LCUA 3BZCA 3VEYA 5BR8K 3TSPA 2HNDA 4ILGB 3MEEA 4JI1K 4DV5K 2YNFA 4JKFA 3VN5A 1VAZA 4JKBA 2QWLA 2HHQA 3C0BA 4CJRA 4BE1A 4LY7A 3L3VA 1S1UA 4V19S 2XY5A 3QFPA 4RWTA 4GV3A 2Z1GA 2P9UA 4BC2A 3OYMA 2UXCK 1RDDA 3EE9A 3RSEA 3ATUA 4F2RA 3QIPA 4W5TA 1Q86O 4F2SA 1YITN 4BR7A 4BWJA 4CGJA 5AFUA 4RCHA 2E8AA 4E1MA 1VQMN 1S9EA 1ZBIA 4BRIA 3SNNA 1TGOA 3K9JA 5AQSA 2O8CB 3O9QA 5EXWA 3K5OA 4CZJA 3VQBA 2KQ2A 3T69A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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