3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
3CJ1A 1E4GT 3BF3A 3FZLA 4BGBA 1JCGA 2GWKA 3S41A 2HMPA 4EAHD 1BO5O 3GE1A 5AQPA 4BC2A 2YI1A 3RSEB 1IG8A 3IDHA 2QWPA 4H5VA 4Y0WA 4A61A 2CH5A 4ISGA 3O5BA 2CGLA 3VEVA 2V7ZA 4WQ4C 5AQZA 4CJ7A 1BG3A 3QFPA 1NGJA 3VEYA 2Q2RA 4RTFD 4ISEA 1HX1A 3A5LC 4MLHA 5E26A 4FPAA 3A0IX 4K25A 4L3QA 2E1ZA 4B1VA 4H5WA 5AQQA 5AQRA 1J6ZA 3M6GA 1K8KA 2P9PA 4M63C 5FPEA 1EQYA 2E20A 3SMSA 5JMVA 4ISFA 3FR0A 2A41A 4IWVA 3L0QA 3EZWA 1MA9B 1U2VA 5AQFA 4CZGA 2V51B 2ASPA 2FF3B 3A5OC 2GELA 4BR5A 2YHYA 3IUCA 5CE3A 4BRPA 3UB5A 1NGGA 2ASOA 3LDOA 3WQTA 4IZ9A 5BPMA 5AQNA 4K41A 2I7NA 3WXKA 3U9ZA 2CH6A 1QQMA 2V52B 2P9LA 4BRDA 2GEMA 4WYBA 4B9QA 4BREA 3TU5A 5AZJA 3EL2A 1ATRA 5KQ8A 2ZGYA 4PKIA 2P9SB 3EKSA 4CBUA 2P9KB 3M3ZA 3HZ6A 2P9IB 1JCFA 1NGFA 3M1FA 1MWMA 1NGBA 2YHXA 2DPNA 4FWKA 2A6AA 3ZEUB 2ZWHA 3QMLA 4B1UB 5BN8A 1TYQA 4A2AA 3H1QA 4O8KA 2QM1A 3WXJA 2AP1A 5EY4A 1BWFO 4PKHA 4I6MA 1CZAN 3FFKB 2CGKA 3U4LA 1QQOA 2A42A 3FLCO 4BGAA 3G25A 3VETA 1S22A 4JD2B 4CI6A 5BPNA 2D4WA 4BRIA 1NGEA 2ITMA 3GOIA 3SMPA 5AFUA 1NWKA 1LOTB 1DGKN 4JNEA 4QS8A 4JHDA 3CERA 1E4FT 4O5FA 4B1ZA 5LJWA 3SJHA 4DB3A 3P4IA 1ZBSA 3R9PA 5AQHA 2FXUA 4CBXA 3C7NB 3DXKA 5EOYA 4BR2A 1SQKA 4BR9A 3ULEB 2YJEA 3A5MC 2IIRA 4AM7A 1D4XA 4BC5A 5FPDA 1KAYA 4BQLA 5AQXA 4Z94A 3ENHA 4DHYA 5ELZA 3D2FA 3GL1A 4FWNA 4NB4A 4BRQA 1P8ZA 1SAZA 1GLEG 4CZHA 3F9MA 1RDWX 3IMXA 4EHUA 3B8AX 3ZETB 3GBTA 5AQVA 1YUWA 3WUHA 3DXMB 5EVZA 1NLVA 2P9NB 2PBDA 3CETA 3H1VX 4PKGA 1HKGA 2GWJA 3VGMA 3VEXA 4K43A 5AQOA 3W0LA 3RSEA 4B1WB 5ADXH 1YVNA 2FLOA 2D1KA 4CZEA 3WEEB 3U9DA 2W41A 3EKUA 2QW9A 3CJ7A 3KHYA 4H5RA 5JICA 3FZKA 3LM9A 1WUAA 5KPZA 4BRMA 3LDNA 4BC3A 5AZIB 1X9JA 2CGJA 4BG8A 4BROA 2GUPA 3UKUB 4M7XA 4BRAA 4J8FA 4FOEA 2QWQA 3QB0A 1NGAA 3GG4A 3EN9A 3CJBA 4MLEA 2QWOA 4BRNA 1T6CA 1NGHA 4RWTA 3R8EA 2OANA 3VEWA 2I7PA 2V7YA 4NO7A 3EO3A 5AQMA 3CIPA 4F9OA 3CI5A 1MWKA 2Q0UA 4XEIA 3O1WA 3HSCA 2H3GX 4H0XB 3U8XA 3MK6A 3BF1A 4DCHA 3DJCA 4A2BA 5FPNA 3W3DA 1RFQA 4CZFA 1BUPA 3BEXA 1NBWA 1WOQA 2E1YA 3QICA 1SZ2A 3H3OB 2IVOA 3ZX2A 3O1BA 2Q36A 5JLHA 4DQ8A 3QFUA 3HBTA 4H5NA 3BP8A 4YDUC 1GLCG 5BRFA 2P9SA 1R59O 3LM2A 2E2OA 1NGCA 2P9IA 4AM6A 4BQZA 3WT0A 2P9PB 3UKRB 4BR0A 1ESVA 4XH4A 3LDQA 3DWLA 4RCHA 4BRFA 2NRHA 4JN4A 1U2VB 1V4SA 1YXQA 2VCPA 2VYPA 1YAGA 1BA0A 1GLAG 3MN5A 2FSJA 2D0OA 4JD2A 3ID8A 5AQLA 4CZMA 4FOIA 5AQWA 1HLUA 2FSNA 3AARA 3TPQA 2P9LB 4FL9A 2HF4A 3H3NO 5F2RA 1TUYA 5AZJB 5F0XA 3QBWA 1BDGA 2ZGZA 4B1XB 4PL8A 2NZTA 3QBXA 1QHAA 3MMVA 3D7EO 2ASMA 3C7NA 2HF3A 4YDUA 3ULEA 5BRHA 4XH1A 5B8HA 2D0PA 3WXIA 4H0TB 4FWSA 1MDUB 4BRHA 1KAXA 4GY2B 2NLXA 1ZXOA 3FE1A 2IVPA 5AFUH 3ZETA 2Q97A 4FPBA 3ATUA 4CZLA 1C0GA 4BG9A 3DXMA 3LL3A 3JS6A 2F9TA 1NMDA 4MO5A 3VESA 4WQ5C 2P9UB 1U6ZA 3CHWA 1HUXA 1XUPO 5KPTA 4A62A 3O8MA 1V4TA 1GLLO 2QWRA 5AQSA 2HOEA 2A5XA 4JHDB 4BR7A 5KQDA 1BU6O 2FSKA 1KXPA 2J4RA 4BC4A 2YJFA 3O08A 4CBWA 3O4WA 5F1XA 3L4IA 2E2NA 2Q31A 4C23A 5AZIA 4FWOA 1XC3A 4LC9B 3MN9A 4H5TA 4FWQA 3R6MA 4B1YB 4H0PA 3AY9A 3UKUA 3VOVA 3IFRA 3LDLA 2W40A 3HM8A 4FSVA 1QZ6A 1OKJA 3D2FB 4EIAA 4E1JA 2A40A 3O80A 1LCUA 3FZMA 3SK3A 4EFHA 3SLCA 3UE5A 3D2EB 1GLBG 2FF6A 3L6QA 4K42A 2VWBA 3GDQA 1S3XA 3A5NC 2IVNA 1Z05A 1H1VA 4CZKA 2QWMA 5KPRA 3VPZA 3MN6A 3ZX0A 1QZ5A 1IJJA 5AQTA 1QQNA 2Q1NA 5AQYA 3WQUA 4H0YB 4WQ5A 5E84A 4JAXA 5AQUA 2AA4A 1C0FA 4M7YA 1Z6RA 2YCHA 2E88A 3MDQA 1GLJO 1ATSA 3H45C 2QWNA 4CD1A 3KVGA 3MCPA 3C0BA 4PL7A 4CZJA 1RGIA 1HJOA 5EX5A 2F9WA 4CZIA 1TUUA 1HPMA 3CJAA 3UKRA 1DKGD 2P9KA 5LJVA 3MN7A 4HTLA 5AQGA 3I33A 1GLFO 2PAVA 4H0VB 1BA1A 4HWIA 1K8KB 3VEOA 3ZEUA 4BRLA 1GLDG 3VGKA 2KHOA 2BTFA 4XH5A 1X3MA 4IXCA 3BUZB 3VGLA 5AQKA 2ZF5O 4KBOA 1T6DA 2GTDA 2A3ZA 2Q0RA 2QWLA 3FZFA 4FWLA 3WXLA 5AQIA 5AQJA 3ATVA 2WUSA 4BR4A 2E2QA 3CQXA 3DAWA 4H03B 4BRKA 2UYTA 4FWMA 1ATNA 4WQ4A 5BN9A 1NGIA 5BPLA 1NM1A 3A8YA 5LY3A 3HI0A 3O6WA 3I8BA 1G99A 3LDPA 5BRDA 4IJAA 5FPMA 2QXLA 1HKBA 1NGDA 4H0OA 4CD3A 3JXUA 4BRCA 4GNIA 1TYQB 3FGUA 1ZC6A 4BRGA 3OHRA 4BVPA 3VF4A 3FZHA 4I6MB 1X3NA 3VERA 5I9EB 5BR9A 2P9UA 3QDKA 3VF2A 1JCEA 3VENA 2P9NA 5JLFA 4QS9A 3AAPA 2YHWA 5TKYA 2EWSA 2E8AA 4IO8A 5AR0A 3WEEA 3H46O 4FWRA 3H6EA 4MO4A 4BVOA 3VF6A 3J8AA 3CQYA 1KAZA 5BREA 3KZBA 2E2PA 1Q18A 1XQSC 3AAQA 5ADXA 3ENOA 3DXKB 1DEJA 1T44A 4FO0A 4QS7A 1BOTO 3HTVA 2BUPA 4FWPA 3VEZA 1Y64A 3CJCA 1HKCA 3ZX3A 3D2EA 4EHTA 3CJ9A 5EXWA 4IJNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TK0A 1RILA 4EP4A 4ID5A 3Q7BA 4EAHD 1BO5O 3MWTA 3EE8A 2IS3A 4B9UA 4C8NA 2CH5A 1NK0A 3O5BA 3VEVA 2Y1JA 4CJ7A 5KRSA 1L3VA 3SZ2A 1NGJA 3B6PA 2HMIA 3VEYA 1LWEA 4RTFD 4ISEA 4XIUA 1YJWN 1HX1A 3ITHA 4IDKA 3PIOL 3DLBA 3A5LC 2OZSA 5E26A 4CESA 4B9TA 4F3OA 3A0IX 3G4SN 3KJVA 4JKAA 3M6GA 1SKRA 3AO5A 1HNIA 2P9PA 5FPEA 3CXCM 1EQYA 2HBLA 4ISFA 1LWCA 2PYLA 4CZGA 1N36K 2FF3B 4AHCA 3G6EN 3F5TA 4BR5A 3UB5A 2B4JA 2HHTA 2YKMA 4JKFA 2JWKA 5AQNA 1I3AA 4JI7K 3U9ZA 3L2UA 4OPKA 2Z1IA 4FJKA 4DFMA 4M3UA 3ZT1A 4FW2A 2KFNA 1WBDA 1ATRA 1RDBA 4BACA 5KQ8A 3TI0A 4ID1A 4CFCA 2ZGYA 2UUAK 3M5RA 4DQIA 1CXQA 4CBUA 2P9KB 4KTQA 3M3ZA 2VG7A 4N5SA 3MXJA 3HJFA 4B1UB 5BN8A 4FWKA 4A2AA 3VN5A 1CLQA 3U3YA 5HRSA 2YHBA 4PKHA 4I6MA 1CZAN 1FXXA 2VGMA 3K57A 3U4LA 3K58A 1RT6A 3V6DA 4ILHA 3TAFA 3FLCO 4CHZA 4CHNA 2D4WA 2B6AA 2ITMA 3DOKA 3GOIA 2O4GA 3VQPA 3VTIA 4CJUA 1RT7A 3TSQA 4B1ZA 1VAZA 4CECA 4M41A 4E0DA 4CGGA 1WSEA 4JYAK 1N8RO 4YOYA 2F7TA 2IIRA 1D4XA 3OBWA 3OJUA 5AQXA 3OYIA 4JS4A 4I2QA 3ZSVA 4CFBA 4W5OA 4HTUA 4CFAA 2KKZA 1EWQA 5AQVA 1X1PA 3TABA 5HOOA 3DXMB 4TSXA 1NLVA 2P9NB 4QOZB 4PKGA 4HUEA 4K43A 3W0LA 1JLBA 2HHWA 3KWGA 4LF5K 2D1KA 1RT4A 4DLEA 3DM2A 3U9DA 3TAGA 3EKUA 2WFBA 3CJ7A 2HHSA 4RW8A 3QO9A 3KKSA 5HP1A 3DLGA 4N76A 1NKCA 4BRMA 4BC3A 5AZIB 4ELTA 1X9JA 2HHHK 2OPPA 3UKUB 3HVRA 4BRAA 3RMCA 1NK5A 2QWQA 3QB0A 3J7YP 2P5GA 4CF8A 1T6CA 4I7FA 1KTQA 1VQON 5J2MA 2OANA 4JS5A 1YI2N 3V81A 3EO3A 5AQMA 3O3FA 1QSYA 1MWKA 1A5VA 4W5NA 4E7LA 3U8XA 2PYJA 4Q0BA 4DCHA 2G8WA 4DV2K 4B3SK 4J2DA 1Q9XA 5FPNA 3ZSOA 4CZFA 3QICA 1SZ2A 3HPOA 2NNWA 1JL2A 2RF2A 2X6SA 1WSFA 4CIEA 4DR4K 1R59O 3VA3A 1NGCA 4CEEA 1BCMA 4BQZA 5LMNK 1WN7A 3S3NA 3TTDA 1NK7A 1VQ6N 5C2FA 4FZZA 3PLAA 3LDQA 2A1RA 2HHUA 3NMUA 4DR2K 1U2VB 1V4SA 4OVLA 1OH8A 1J54A 3MN5A 1S1TA 4N56A 3PX4A 3T3FA 3AO2A 4IOAL 2D0OA 3ID8A 4YOUA 3AA2A 3IKMA 3TSUA 2FBVA 2P9LB 4I2PA 1TUYA 5F0XA 3QBWA 2ZGZA 3KLGA 1RTIA 1S5JA 3O9UA 1VQ8N 1BIZA 2ASMA 2HF3A 3B6OA 4CCHA 3AVKA 4DF8A 4YDUA 5BRHA 3C6TA 1X9WA 4FZXC 4CIGA 3E66A 3JSMA 4F2RA 1KAXA 4LSNA 2F4VK 4GY2B 2NLXA 4BY9C 2GV9A 1NMNA 2UXDK 2Q97A 3KK7A 2IDOA 2VQEK 4CZLA 3VTHA 3DXMA 1N33K 3QNNA 1ZBHA 3VESA 1BQNA 1TAQA 3CHWA 5J1EA 4KHQA 3V4IA 2HOEA 4JHDB 4JRPA 2BH1A 2FSKA 2J4RA 3O4WA 5C42A 2E2NA 2Q31A 4DTSA 4C23A 5AZIA 4FWOA 5T7BA 1ZBIA 3UKUA 3AY9A 4J2AA 3VOVA 3IFRA 3LDLA 3CC2N 3ULDA 3SQ1A 2WOMA 4FK2A 3D2FB 4EIAA 1U48A 1L5UA 4OJRA 1NKEA 2A40A 1K73O 3AV9A 1Z26A 4M3RA 4GV9A 4FLZA 3UE5A 1NK9A 1F21A 1N32K 2ZJPL 1S9EA 2VWBA 1IKWA 4HHTA 2GUIA 1BI4A 4N41A 1C6VA 1H1VA 5KPRA 2QWMA 5J2NA 4WFNL 2NRTA 3MN6A 1B9DA 3HL8A 3QERA 1QQNA 2Q1NA 3VA0A 4FJ8A 3WQUA 4H0YB 4WQ5A 5E84A 3S9HA 3OYJA 3PSFA 1QSLA 2PY5A 2E88A 2OCEA 3MEGA 2W6LA 1X9SA 4WCEL 3OYFA 3OS1A 1U47A 4GKKK 3CCVN 3C0BA 3DMJA 5TKWA 3NVKA 2F9WA 1YTUA 4CZIA 1XWLA 4JK8A 4W5RA 1HPMA 2NRWA 1GLFO 1NU0A 2OTJN 2PAVA 4H0VB 4NLBA 3ZEUA 1IKVA 4OPJA 3VGLA 3SUPA 1VSDA 3QNOA 1VSHA 1T6DA 4CJWA 2QWLA 2Q0RA 1RBTA 2WUSA 1HMVA 3OYEA 4JV5K 2UYTA 3EE9A 4LF7K 1VRTA 4X62K 5KGXA 3O6WA 3O4NA 3QLHA 3V9WA 1G99A 4JI5K 1ZBLA 1Q9YA 2DFEA 5FPMA 2QXLA 4CGDA 4LFAK 3SQ2A 3TAPA 3F73A 3AVJA 4JKGB 3OYHA 3CPEA 3OHRA 4DTMA 1W0HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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