3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium avium
molecule tags Transferase
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
1IG8A 3AARA 4K42A 4BRHA 3I8BA 3O6WA 2EWSA 4JN4A 2GEMA 3H3OB 4FSVA 5AQUA 3ZEUA 1HKCA 2VYPA 1XUPO 1NGAA 1U2VA 2QWRA 2P9PB 4FL9A 4WQ4C 2Q1NA 3EKUA 5AQRA 4FWOA 4H0XB 2QWNA 3L0QA 3DXMA 4BRMA 2E1ZA 3EO3A 4JHDB 5KPRA 4CD1A 4J8FA 1EQYA 1Z6RA 4BRLA 2Q97A 4B1XB 4L3QA 3IDHA 2P9UA 1GLBG 3QMLA 4CZHA 5AQWA 3FZMA 5LJWA 2IVOA 3MK6A 2A42A 3UE5A 3A5MC 3MMVA 3M1FA 3FR0A 3QICA 3M3ZA 2FF6A 2ZWHA 4IWVA 4DB3A 3A5LC 3HI0A 3LM9A 2GWJA 4CBXA 4FWRA 2HF3A 3FGUA 1BOTO 5ELZA 1NGHA 2E2QA 3CJCA 3D2EA 3LM2A 5AQXA 5I9EB 5AZJA 1YXQA 1BA1A 4CZFA 4EIAA 2A5XA 1BG3A 1HKBA 4BR4A 4B1UB 4RWTA 4WYBA 5AFUA 5KPTA 4AM6A 3LDNA 5AQTA 2KHOA 4IJAA 2HOEA 2F9WA 4RCHA 5AZIA 3CIPA 4FPBA 3ZETA 1CZAN 2E88A 2P9KA 4DCHA 2FF3B 3GE1A 3A0IX 2F9TA 4AM7A 3EN9A 4FO0A 5AR0A 1ATSA 1T44A 1NGFA 4M7YA 2Q0UA 3MN9A 1T6CA 1ATRA 3CERA 3S41A 3UKUA 3WEEA 1K8KB 4M7XA 4C23A 3L6QA 5EVZA 3VF4A 3P4IA 3F9MA 4JD2A 4WQ5C 5AQKA 4BRAA 4CZLA 5BRFA 5FPEA 2Q31A 3CI5A 3VEVA 1GLCG 3BEXA 3ULEA 4CZJA 2Q36A 3TU5A 3MN5A 1SZ2A 2DPNA 4I6MA 4B1YB 1BWFO 5AQIA 4BC3A 3CQYA 1DKGD 1HUXA 1T6DA 5KQDA 3L4IA 3C7NB 5KQ8A 3H6EA 1HKGA 2ZF5O 4H5NA 1TUYA 2P9LA 4CJ7A 4A2AA 1QQOA 4CI6A 2I7NA 3I33A 4BR2A 3QFUA 1X3NA 2BUPA 3HZ6A 3WXIA 3VEWA 3RSEB 1C0GA 4H5TA 3W3DA 2BTFA 1KAZA 3GBTA 4YDUA 4B1WB 1GLLO 4A61A 1BA0A 1HX1A 3EZWA 1P8ZA 4A2BA 3CJAA 5JLFA 1TYQA 3FFKB 4ISFA 5BN9A 3D2FA 2P9SB 4IXCA 4BREA 1X9JA 2VCPA 4CBUA 3VF2A 1ZXOA 3CJ1A 1MDUB 3UB5A 1SAZA 1RDWX 1WUAA 1HPMA 1U6ZA 3CHWA 4QS7A 3ZX2A 5AQHA 2QWLA 4FWMA 4BR7A 3FZLA 4EHUA 1GLJO 3HTVA 3J8AA 2P9NB 3O1WA 5BRDA 3VETA 2I7PA 3W0LA 1S3XA 3LDOA 3LDQA 2IIRA 5AQJA 1ZC6A 1MWKA 1NLVA 1GLFO 4F9OA 1KAYA 1NGDA 3JS6A 4PL8A 5AQPA 4H0OA 1X3MA 2AP1A 2W41A 1DEJA 4CZEA 3JXUA 2CGKA 4B1VA 3VOVA 1BU6O 2Q0RA 3O8MA 3CETA 3ENHA 5AQNA 2CH5A 3BP8A 3C0BA 3WXLA 1NMDA 4FWLA 4B1ZA 3O08A 3ATUA 3TPQA 4K41A 5AQMA 2P9PA 1Z05A 2OANA 1NGJA 1E4FT 2H3GX 3AAQA 3VEOA 4DHYA 3LDLA 5AQSA 4BRFA 3IUCA 4BRQA 5FPDA 4H03B 1YVNA 4JHDA 2D0OA 1RGIA 3H1QA 3O1BA 1KAXA 3UKUB 1ZBSA 4HWIA 3H46O 1Y64A 5EOYA 2QWMA 2D1KA 3SMPA 4HTLA 3FE1A 4BQLA 2FLOA 3EL2A 3GG4A 4BR9A 3FLCO 1SQKA 5JMVA 4XEIA 4BG9A 3A8YA 4BVPA 1E4GT 3O80A 4H5WA 4BRGA 2QWOA 4E1JA 4BGBA 3HSCA 4Z94A 2FSKA 5EY4A 1RFQA 4CZMA 2P9IB 1H1VA 3UKRB 3KHYA 3M6GA 3SJHA 5F1XA 1MA9B 2QXLA 4CBWA 3DAWA 3ENOA 2J4RA 3FZKA 3DXKB 4QS8A 4RTFD 4M63C 5JICA 1NGEA 3IMXA 4MLEA 2D4WA 5AQYA 3DWLA 1XC3A 1NGIA 2CGLA 3VEZA 4BG8A 2V52B 3IFRA 3FZHA 2E2NA 4H5VA 5E84A 2YJEA 4FWPA 4O5FA 5CE3A 3QDKA 1QQNA 3H1VX 5AQZA 2W40A 4JAXA 3ZEUB 2V51B 4CZIA 3VGLA 1G99A 4BC4A 2E8AA 1BDGA 1U2VB 5BRHA 1S22A 3QBXA 2ASMA 4BRPA 3HBTA 4K43A 2IVPA 1TUUA 2A6AA 5FPNA 3DXMB 4MO4A 1D4XA 1K8KA 2E20A 5AQGA 3KVGA 3VGMA 1QZ5A 4YDUC 3AAPA 1JCFA 2YHWA 1V4TA 4B9QA 1DGKN 4H0VB 2AA4A 4XH4A 3WQTA 5ADXH 3R9PA 3CJ7A 2P9UB 3GL1A 4BC5A 3VGKA 3VPZA 4GY2B 4FWNA 4CZKA 3D7EO 4FOIA 1NGBA 5BREA 1BUPA 2NLXA 1J6ZA 3ATVA 3H3NO 2YCHA 4NO7A 2NRHA 1GLAG 2QW9A 5LY3A 2ITMA 4H0TB 4FWQA 3QBWA 2CH6A 2ZGZA 3U8XA 5AQFA 3C7NA 3U4LA 3OHRA 4EHTA 1JCEA 3D2EB 4WQ4A 1Q18A 4LC9B 5AZJB 4EAHD 5FPMA 1JCGA 4MO5A 5BPNA 4PKIA 3RSEA 5BN8A 1GLDG 4BR5A 4IZ9A 2ZGYA 1ESVA 1HLUA 4CD3A 4PL7A 4NB4A 1NM1A 5AZIB 4K25A 2P9SA 5AQVA 3R8EA 3ZETB 4FOEA 3EKSA 4ISEA 4BROA 2P9KB 4BRCA 4FWKA 3WT0A 3LL3A 2WUSA 1NBWA 2Q2RA 4H0YB 4IO8A 2NZTA 4BRKA 3R6MA 3SMSA 5EXWA 4FWSA 2YHYA 3VF6A 3ID8A 5F2RA 1KXPA 3GDQA 2HMPA 2P9NA 5AQQA 3WUHA 4KBOA 3WEEB 1QQMA 2V7YA 3KZBA 2FSNA 3VEYA 4EFHA 1LOTB 3G25A 3MN7A 3WXJA 5BPLA 2UYTA 1GLEG 3WXKA 5LJVA 4JD2B 2GWKA 1QHAA 4XH1A 2YHXA 2CGJA 3SLCA 1IJJA 5TKYA 4ISGA 3ULEB 3H45C 5KPZA 1HJOA 3VERA 1OKJA 3CJ9A 3A5OC 4I6MB 3GOIA 3LDPA 3BUZB 3DJCA 3U9ZA 2YJFA 5BPMA 1NWKA 1QZ6A 4BGAA 2A3ZA 1C0FA 3BF3A 2E2OA 3ZX0A 2A41A 4H5RA 5AFUH 3VENA 4BRNA 3CQXA 3O4WA 2P9LB 4DQ8A 3VEXA 5AQLA 4QS9A 5EX5A 2HF4A 3U9DA 4BQZA 4O8KA 2FSJA 4BVOA 5JLHA 4BRIA 2YI1A 3MN6A 5F0XA 2E2PA 2QWPA 1MWMA 1ATNA 2VWBA 3A5NC 1YUWA 4GNIA 4WQ5A 3O5BA 4CZGA 4BC2A 2GELA 3QFPA 5AQOA 3ZX3A 3FZFA 1TYQB 4FPAA 3D2FB 3QB0A 1R59O 4BR0A 2PAVA 2QM1A 3AY9A 2GTDA 2QWQA 1NGGA 2PBDA 5BR9A 2V7ZA 3MCPA 1V4SA 3SK3A 5ADXA 4XH5A 3WQUA 3HM8A 4H0PA 1NGCA 2P9IA 4JNEA 3UKRA 4A62A 4MLHA 4BRDA 3MDQA 2IVNA 4PKHA 1LCUA 1YAGA 2A40A 2GUPA 4PKGA 5E26A 3DXKA 2FXUA 2E1YA 3CJBA 4IJNA 2D0PA 1XQSC 3VESA 1WOQA 3B8AX 2ASOA 2ASPA 4Y0WA 3BF1A 1BO5O 5B8HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GBZA 2G8IA 4FLYA 4WCEL 3C65A 1LWFA 1NKBA 2OCEA 4DWIA 5AQUA 1HKCA 1RBRA 2DFHA 1XUPO 3QEIA 3OS2A 1NGAA 1YJ9N 3EEQA 1VSLA 3OYMA 1BIZA 5KRTA 2ETJA 4O5BA 4FM0A 4IOAL 4FWOA 4H0XB 2F7TA 3OY9A 3P83D 1O13A 3KWIA 4JHDB 4OVLA 1KQSM 3NH0A 1J5EK 1EQYA 2QXFA 3MX5A 3EE8A 3K5LA 2Q97A 4LF8K 4JS4A 1A5XA 4ICLA 2NRXA 1XMOK 1N5YA 3G10A 4J2DA 4E1NA 1TKZA 3MK6A 4FLTA 1BQNA 3J80O 3RTVA 4FZXC 2HNYA 3M3ZA 3CCRN 4DB3A 2ZWHA 3A5LC 3HI0A 4KAZA 4FWRA 4MDAA 2NRVA 1TV6A 2WC9A 1Q9YA 3HOSA 3LM2A 4O55A 4EIAA 3V81A 1TAUA 1JLEA 1BG3A 1HKBA 1RDAA 1S1WA 3KKSA 4B1UB 4RWTA 1WSFA 4DV0K 1C6VA 4DF4A 2KHOA 1RBUA 4JK9A 3PO5A 3ZSWA 2KFNA 2QA4N 1CZAN 3RMCA 1HJRA 2P9KA 4DCHA 1SKSA 3G71N 1JJ2M 3A0IX 1NJWA 3EN9A 1SKRA 4JI0K 1LAWA 1J9AA 1ZBHA 1T44A 3AVLA 2Q0UA 2O8FA 3S41A 4GVEA 4Z4GA 3L6QA 5EVZA 3VF4A 1WSGA 4DTUA 4WQ5C 1L3SA 2E6LA 4BRAA 4CZLA 5DK5A 1XC9A 3VEVA 3ULEA 4Z4FA 4CHNA 1S1TA 1OH8A 2P1JA 1SZ2A 2DPNA 4I6MA 4IO9L 2FBYA 3AVAA 3I8DA 1OH6A 1LW0A 1DKGD 1TKDA 1T6DA 3TTFA 4PUOA 4O0IA 3BGRA 4A2AA 1S72N 4CI6A 2I7NA 4NCBA 3ZT2A 3CM5A 3QFUA 5IWAK 4F2RA 1S1VA 3VEWA 3SUQA 4CHQA 4NCAA 4DV6K 1XHZA 4CERA 3SPZA 3CJAA 3T3FA 1KVAA 1TYQA 3FFKB 5BN9A 2XY6A 1S1UA 1VSJA 4CBUA 3PY8A 3CJ1A 3LP0A 5HP1A 3VQ6A 5M1FA 1WUAA 1YTAA 2O8DA 1I39A 1RDDA 3ASMA 1RTIA 3CHWA 1ZBLA 2VG6A 5FLXO 4DR6K 5JS2A 5KTQA 5AQHA 2XHBA 3TAEA 2P9NB 1JLCA 3VQPA 3ENBA 3HSTB 4QCLA 1NJZA 3O3FA 1BHLA 1NGDA 4OPAA 2VG7A 4B08A 1TKXA 4CZEA 4DQIA 3JXUA 2CGKA 2OPPA 5HOOA 3DOKA 3VOVA 4CGHA 1BU6O 3O8MA 2JWKA 3DYAA 3VQ8A 4AF1A 4DS5A 1KD1O 4B9MA 2G8HA 3WXLA 1NMDA 3DI6A 1XNRK 3K9JA 5J2QA 3V6DA 4KO0A 3TPQA 2RN2A 5AQMA 2OANA 1NGJA 3V9SA 1HNXK 2QKBA 4BRFA 4MFBA 4E19A 4JKAA 4JHDA 3QINA 4M45A 2D0OA 3AO5A 3L2QA 3DOLA 3ZYYX 3AVCA 3PV8A 3GG4A 4ZTJA 4BVPA 4BDZA 2R7YA 2HSTA 4ELVA 4E1JA 3O3HA 1RDBA 4YOTA 4LF7K 1H1VA 2KTQA 2HHTA 3M6GA 3VQAA 5F1XA 2QXLA 5HBMA 3ZT0A 3ZT1A 3ENOA 3ZSVA 3MAQA 3SZ2A 4QS8A 5JICA 3O9SA 3IMXA 2I5JA 5AQYA 1YIJN 4H8KA 2PY5A 4GKKK 1WAFA 4U67L 4HUFA 5M1KA 3R3LA 4DTMA 3DLLL 4FK2A 3E01A 1T7PA 2YNGA 1XNQK 1TKTA 2W40A 1QSLA 4OJRA 4JAXA 1G99A 5HLFA 2E8AA 1SUQA 1TK8A 3SJJA 1S22A 2Z1HA 3P38A 4BRPA 3HBTA 3HXMA 1NK4A 3LANA 3HPGA 3RWUA 3MWPA 1JL1A 4JKEA 1QZ5A 3L2RA 1X9WA 2DTUA 5C0YA 1NOZA 3HPOA 1GOAA 2AA4A 2P9UB 4KHYA 4BC5A 4DS4A 3KD1E 1Z26A 3KIOA 3C6AA 4KHUA 5BREA 1BUPA 2JLEA 1J6ZA 2NLXA 3JYTA 2YCHA 1RILA 4Q0BA 4JI5K 5AJ3K 3U8XA 3U4LA 3CM6A 1Q18A 4DV2K 3IKMA 5AZJB 3CF5L 4QOZB 2VWKA 4CESA 4DSKA 1O1WA 4FLXA 4DTRA 3S3NA 3ZCMA 1QTMA 1NNEA 4BR5A 3SI6A 4IZ9A 1KFSA 2VGNA 1ESVA 1RT6A 4JI2K 2B6AA 4MQ3A 4JKDA 4N56A 4K25A 3Q7BA 5CZ1A 5JS1A 3ZETB 4BRCA 4ZTFA 4FWKA 2Z1IA 3WT0A 3M5RA 4LD0A 4W5OA 3ZSYA 2Q2RA 3KK7A 3I55N 1QS4A 3AVKA 4BRKA 3T7ZA 1JXEA 5EXWA 2P5GA 2FBXA 3VF6A 3ID8A 4LY7A 2HMPA 2P9NA 1B9DA 5KGWA 4DR3K 4DFMA 1VRUA 3VN5A 3HT3A 3T1HK 4JD2B 2GWKA 3S3OA 4H4OA 1BQMA 1S9GA 3C6TA 2OZMA 4E3SA 4O44A 2X6SA 3VERA 1OKJA 3CJ9A 1REVA 4CFAA 4IBNA 1ITGA 3KLIA 3BUZB 4E7KA 3U9ZA 2YJFA 2O4GA 3BZCA 3KK2A 2A3ZA 1C0FA 3ZX0A 3PX6A 3CPWM 2A41A 4H5RA 1RT3A 3K2PA 4BRNA 3QIPA 2Y1IA 1ASUA 3WNHA 4CK3A 4DSEA 1NK5A 2HF4A 4O8KA 1T05A 4K8XA 4BRIA 2HVHA 3PX4A 1FKOA 2ZD1A 2B5JA 1RTHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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