3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
2BUPA 3VEVA 3F9MA 4RTFD 4M63C 4CD3A 4EHTA 3G25A 3O4WA 3QB0A 3WEEA 3ZETA 1NGDA 4BRKA 1MWMA 4CI6A 1TUUA 5TKYA 2P9LB 4BQZA 2P9SB 1NGHA 3AARA 4A2AA 5AQTA 2P9KA 2Q0RA 3ID8A 2HF4A 3UKRA 4CZLA 1GLAG 4H0YB 2IVNA 3CJ7A 2FXUA 5AQZA 3DJCA 1GLCG 2FSKA 3W3DA 3CJAA 2PBDA 3OHRA 3CQYA 4XEIA 3TPQA 4H03B 2A6AA 2ZGYA 3FZLA 1NBWA 5AQKA 3WXIA 3LM2A 3I8BA 1GLLO 5AQLA 3U8XA 5I9EB 1R59O 3EN9A 1BO5O 2A42A 4M7YA 4RWTA 4B1VA 3WUHA 2Q2RA 5F2RA 5AQPA 3RSEB 1K8KA 2E2PA 5KPTA 4QS8A 4FWMA 3WXLA 3A5MC 5JLHA 2GELA 2QWLA 3QMLA 3MN6A 3HZ6A 2I7PA 3MDQA 5AR0A 4O8KA 3QDKA 3BEXA 2A41A 2QWMA 2YHWA 2V7YA 4CZIA 2NLXA 3D7EO 4BC5A 3C7NA 4EFHA 4DCHA 3SMSA 4FWNA 5EXWA 4C23A 2QWNA 4B9QA 4M7XA 3VGMA 3D2FA 1BG3A 5BREA 1TYQB 5BRDA 3I33A 5BR9A 3ZX2A 2W41A 3H3OB 1NMDA 3HBTA 3VF2A 1ATSA 3KZBA 1HKBA 1G99A 4I6MA 1SQKA 1E4FT 3VEYA 3DXMB 3CETA 4JHDA 3WT0A 4BRPA 2NZTA 2YJEA 5AQFA 1ZC6A 3FGUA 4NB4A 1Z05A 2P9IA 3DAWA 2YJFA 3ZX3A 5AQRA 5EOYA 1QQOA 2D0OA 3VEOA 5AQQA 3LDQA 4K25A 2QWQA 4B1UB 4BG8A 3JS6A 5AQGA 2ASPA 3A8YA 4MO4A 1KAYA 2A3ZA 3DXKA 4H5TA 5ADXH 1DKGD 1OKJA 4BR9A 3CJ1A 3HM8A 3UB5A 2BTFA 5AQYA 3R8EA 1QZ5A 4BROA 3D2EB 4BRLA 4BR5A 3LDOA 1C0GA 2FSNA 2P9SA 1GLJO 2P9LA 2QW9A 4PL8A 1KAZA 2GWJA 1LOTB 3SJHA 2KHOA 3ENHA 1U6ZA 1HX1A 2UYTA 3O80A 5AQSA 2PAVA 3EKSA 4NO7A 4H5RA 2P9UB 3GL1A 1GLBG 4CZMA 2E1ZA 2ZF5O 3AAQA 2YHXA 1NGFA 4CBWA 3ZEUB 3MN7A 3LM9A 1DEJA 4HWIA 4H5WA 3IMXA 4PKHA 1HJOA 1JCEA 5AQXA 3GG4A 2ZGZA 3O1WA 3RSEA 1C0FA 3DWLA 4AM7A 4BVPA 4MO5A 1NGCA 3QBXA 3J8AA 3O1BA 1T6CA 2VCPA 4FWKA 3U9ZA 2QWOA 3VEXA 3R6MA 5AZIB 3A5LC 3L4IA 3O08A 4CJ7A 3CI5A 2ASOA 5BPMA 4WQ5A 3A0IX 2GEMA 4BRCA 4BRHA 4BR7A 4BRGA 1HLUA 1V4SA 3FZFA 3CJ9A 3WXJA 1NGEA 3UKUB 4FPAA 2E8AA 4H0OA 2YI1A 4KBOA 2HF3A 3HSCA 3MN5A 4FSVA 1XQSC 5CE3A 3UE5A 1TYQA 3WQTA 4L3QA 4BG9A 5ADXA 5EY4A 1BU6O 5AFUA 4FPBA 5KPZA 5BN8A 2P9PB 5ELZA 1YAGA 1ZBSA 4Y0WA 2E1YA 4FL9A 3DXMA 1X3MA 1V4TA 2ZWHA 1NGJA 4FOEA 4BGAA 1Z6RA 2QWPA 3FE1A 4BC2A 1T6DA 3BF1A 3VGLA 3U9DA 4WQ5C 4BVOA 4B1XB 1LCUA 5AQMA 1YVNA 3IFRA 3W0LA 2Q31A 1JCFA 1NGGA 2FF6A 4H5NA 3ZETB 2I7NA 3FZMA 3VPZA 4BRQA 3HTVA 1JCGA 1XUPO 2D0PA 3ATVA 3CIPA 4FWOA 2E2NA 3FLCO 4IO8A 5AQJA 1P8ZA 5AQIA 4FWLA 4EIAA 4B1ZA 1Y64A 5FPMA 4BREA 1U2VB 3VGKA 3GBTA 1DGKN 2NRHA 3D2EA 1XC3A 3H3NO 4JN4A 3EZWA 5AQHA 3SMPA 3BP8A 2VYPA 1MWKA 4BC4A 3VERA 5LY3A 4ISFA 1GLEG 3MN9A 2CH5A 5EVZA 1WOQA 4PKIA 1BA0A 4B1YB 2P9UA 3KVGA 5E84A 2D4WA 1HPMA 1J6ZA 4JD2A 4A62A 2CGLA 1YXQA 5FPNA 3S41A 3GDQA 5BRFA 1BUPA 5AQUA 3ZEUA 2FLOA 4CZHA 4FWPA 2A40A 4JNEA 4BGBA 2YHYA 3QFUA 2F9TA 1RGIA 2QXLA 3O6WA 3O8MA 1H1VA 2E20A 1WUAA 1NM1A 4DB3A 4FOIA 5FPEA 3ATUA 3CJBA 1BOTO 1SZ2A 2E88A 1CZAN 2HOEA 2YCHA 4YDUA 5AZJB 2GTDA 4XH1A 5AZIA 3VETA 5AQWA 4LC9B 5JMVA 4CZGA 1D4XA 3C0BA 2IVPA 3JXUA 2V51B 3L0QA 1NLVA 3GE1A 4JAXA 4BRFA 3BUZB 4BRAA 3LDLA 3UKUA 3FFKB 3O5BA 4MLHA 3VF4A 3QICA 1QHAA 3L6QA 3H6EA 2P9PA 1X3NA 5LJVA 2D1KA 4BC3A 4IWVA 4CZFA 2FF3B 4YDUC 1NGIA 4E1JA 2P9NB 3ULEB 4CZJA 2GWKA 2H3GX 4H0TB 4H0PA 5AQNA 3FR0A 4FWSA 2WUSA 3FZKA 2Q97A 2IIRA 4RCHA 1MDUB 4XH4A 2V7ZA 5AQOA 3H1QA 3B8AX 2CGJA 1ATRA 2A5XA 4H0VB 1X9JA 2GUPA 2Q36A 4DQ8A 1ZXOA 1RFQA 1E4GT 1U2VA 2CGKA 3IUCA 3SK3A 3VOVA 4WQ4A 4FWQA 4WYBA 4CZKA 1IJJA 1Q18A 2CH6A 3EKUA 3EL2A 3LDPA 1MA9B 1IG8A 1SAZA 3AAPA 3LDNA 3A5OC 4CBXA 4BRIA 1NWKA 1S22A 3VEZA 3WEEB 3ZX0A 3M3ZA 1EQYA 2V52B 4A2BA 4BR0A 4IJAA 4BRMA 3GOIA 3TU5A 4CD1A 5JICA 5KQDA 2P9KB 5BPLA 3UKRB 4BRNA 4BR2A 3AY9A 3CHWA 1HUXA 3MK6A 4XH5A 4GY2B 2AP1A 4WQ4C 4F9OA 3LL3A 5EX5A 1KAXA 2W40A 4H0XB 2E2OA 4MLEA 3WQUA 5KPRA 2FSJA 4B1WB 1NGBA 5LJWA 1HKGA 2F9WA 3BF3A 3MMVA 4K43A 3CQXA 1YUWA 2EWSA 5AZJA 1T44A 4ISEA 1GLFO 2Q1NA 3VEWA 1K8KB 1NGAA 2QM1A 5BPNA 3R9PA 3VF6A 1GLDG 2QWRA 5JLFA 1ESVA 2DPNA 4CBUA 4GNIA 3WXKA 4CZEA 5F0XA 3QBWA 5AQVA 1RDWX 1KXPA 2AA4A 3HI0A 2VWBA 3M6GA 4HTLA 3CJCA 3IDHA 3KHYA 2OANA 3FZHA 3VENA 4ISGA 4IXCA 4BR4A 4K42A 3C7NB 4EHUA 4IJNA 5E26A 4PL7A 4K41A 5FPDA 4AM6A 2P9NA 3MCPA 3ULEA 4PKGA 3D2FB 4EAHD 2IVOA 1QQNA 1BWFO 2J4RA 4FWRA 5BN9A 3H46O 5AFUH 4DHYA 3M1FA 4I6MB 4QS7A 3ENOA 2ASMA 3H45C 4BQLA 3EO3A 4JHDB 1BA1A 2HMPA 4H5VA 2P9IB 4Z94A 3H1VX 3U4LA 5F1XA 3P4IA 3SLCA 3A5NC 5BRHA 4A61A 5KQ8A 4QS9A 5B8HA 1TUYA 1ATNA 2Q0UA 1QZ6A 4BRDA 4J8FA 1HKCA 4JD2B 2ITMA 4FO0A 1QQMA 1BDGA 3DXKB 3QFPA 4O5FA 4IZ9A 3CERA 1S3XA 2E2QA 3VESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGDA 1BI4A 3AA4A 3O4WA 4F2RA 1NGDA 1MWMA 4CHOA 4GV3A 1HNVA 2P9LB 2OTLN 3AARA 2XRIA 3MEDA 4EZ6A 3UKRA 5M1QA 4F3TA 4LF6K 4H4OA 3OYIA 3OYLA 3NMUA 1D9FA 3K9KA 4W5TA 2VGNA 2YHBA 1GLLO 1VQ5N 1B9FA 2HHXA 1RBUA 4BWJA 5AQPA 3RSEB 2XY5A 5JLHA 3PSFA 1W9HA 2UUBK 4E1NA 4NCGA 4JI2K 4O8KA 4F3OA 4FJHA 2FBXA 2HHTA 4G9ZA 4I9LA 3THYA 4Z4HA 3C7NA 4EP4A 4WF9L 4B3SK 2QWNA 4B9QA 3KLFA 5D3GA 4B8AB 3I33A 2DFHA 3ZT4A 3H3OB 3ZSXA 4ID1A 1NMDA 3HBTA 3VF2A 4ILJA 3HP9A 2W6KA 3DXMB 3AA2A 4LF4K 3NCIA 5CYQA 1Z05A 3OJSA 3DAWA 3ZX3A 5AQRA 2D0BA 3NH2A 4JLHA 5AQQA 1UA0A 3OYEA 4W5NA 2ASPA 3TSPA 3NBPA 3PV8A 1JLGA 2O8FB 2PYLA 3IAYA 4PHTX 4GV6A 2BGGA 5CY4A 4JI4K 2YKMA 1OKJA 1LAWA 3R8EA 1S1WA 4KREA 4JI0K 3C6AA 3HL8A 5GAEP 1C0GA 2P9LA 2QW9A 1HYVA 3L2UA 2GWJA 1U6ZA 4AHUA 4B3OA 1QSYA 5AQSA 2PAVA 4CHNA 4CJPA 1HYZA 2ZJRL 1GLBG 4DFKA 2PFUA 3VN5A 4NYFA 4KB1A 3NGYA 2YHXA 3BGRA 1NGFA 2IC3A 3H08A 3LM9A 3MCAB 1VSFA 3TAFA 1B92A 1LWCA 2FBTA 1NK6A 4PKHA 2NRTA 5DK5A 5AQXA 2KFNA 3GG4A 3RSEA 3DWLA 1HNWK 1FKOA 4AM7A 3DLRA 4OO1J 1JXEA 4MDAA 1CXQA 3QBXA 1N36K 1WSIA 3CCUN 3TSUA 3TI0A 2AJQA 1T6CA 4JS4A 3T1AA 4FWKA 2O8BB 3R6MA 1LW0A 3A5LC 1N5YA 4CJ7A 2ASOA 4W5QA 4NLBA 3AVHA 4BRCA 4RW4A 2NRXA 4BR7A 3CYMA 3FZFA 3WXJA 4LFAK 2Z1IA 3J7ZO 5M1KA 3K58A 4K8XA 3NF7A 4DR2K 4CFAA 1XQSC 4ELUA 2RKIA 3WQTA 4A5AA 1YIJN 4O55A 2O4IA 3O4NA 3QESA 4MQ3A 4YNQA 3DXMA 5C15A 4FOEA 3CC7N 3LAKA 3HT3A 4B9SA 4JI3K 3L3VA 1LCUA 5C2FA 3ZSOA 4E7LA 1RBVA 2HBMA 1L3SA 3ZETB 3CD6N 1VSJA 1XUPO 3CIPA 4FWOA 3KKSA 3DOKA 5AQJA 4DTXA 1P8ZA 4LSNA 4BDPA 2KZMA 4BREA 5KRTA 4DV0K 2UUAK 1JLAA 4O5BA 2OA8A 1KVCA 2NRHA 5DMRA 5K14A 1U49A 1J54A 4ILGB 3EZWA 5AQHA 5J2QA 2ZD1A 3BP8A 2G8UA 4ISFA 1VQKN 1GLEG 4IG3A 5EVZA 1WOQA 5HRNA 4DV5K 4JEPA 2D4WA 1NNEA 4FK4A 2NRZA 1YXQA 5FPNA 5BRFA 4RW7A 4CZHA 4CJ3A 3L4QA 4QOZB 4CVNE 1I94K 2PY5A 1NK5A 1RGIA 1NK8A 5FRNA 1WBDA 2E20A 2IS3A 2QA4N 3WNHA 3E01A 3CJBA 1SZ2A 4KHQA 1W2BM 2O8BA 2GTDA 4XH1A 2YNGA 1S5JA 5AQWA 2VQEK 4LC9B 3S3NA 1D4XA 4YOTA 4E7KA 1NLVA 4BRFA 4M3UA 4OPHA 5CYMA 1HPZA 3L6QA 1RT7A 1KCFA 1IH7A 5LJVA 5J2MA 5GINA 4ICLA 3LPUA 4CGJA 4CJTA 3RR7A 3HK2A 4B9NA 3ZT1A 4CJWA 4FW2A 4E3SA 4B9VA 4FM2A 3SUOA 4H0TB 4CE9A 3EY1A 3FR0A 3SAGA 4BDYA 2KQ2A 4C8MA 4RCHA 1MDUB 2V7ZA 3O9SA 4M3XA 2GUPA 4O0IA 4E7IA 2Q36A 2CGKA 3IUCA 4B9TA 1ASWA 3KK7A 4CZKA 2QKKA 1Q18A 3VQ7A 5GIOA 3EL2A 4GVMA 4CGGA 4CJLA 1MA9B 4QCLA 1XHZA 1IG8A 4ZHRA 4FJKA 3ZX0A 3M3ZA 4DR5K 1S9GA 4IJAA 3ZYYX 2BE2A 4YHHK 4CD1A 1X9WA 5KQDA 2VG5A 4HTUA 1NKCA 3TTFA 3SQ1A 1U48A 2RE2A 3AVMA 1TVRA 1J5OA 2AP1A 4HUFA 3VQEA 2Z1HA 2W42A 4DV6K 4HCCA 4M45A 4PY5A 1NJZA 1SL2A 2E2OA 4MLEA 4J2BA 4DR1K 2FSJA 4B1WB 2Y1IA 3DLEA 1HKGA 3MMVA 1HQEA 1RCHA 1YUWA 1R0AA 1T44A 3VEWA 3OYMA 1K8KB 1FK9A 5BPNA 1NJYA 2E5LK 5JLFA 1RNHA 1VRTA 5AQVA 1KXPA 1Q86O 3G6EN 4PA1A 4DTNA 4DR3K 3FZHA 3VENA 4FJGA 3EZ5A 2X74A 3K9JA 4OLAA 5E26A 2VQFK 4PL7A 4OPKA 5FPDA 4PKGA 5A2QO 4KH4A 1BWFO 5LMNK 2J4RA 4MFBA 5BN9A 3AO4A 4W5RA 3TR8A 4IFEA 1BISA 1YJNN 2O4GA 1TKDA 4IFVA 4Y1DA 3HOSA 1BGXT 4JRQA 3G0ZA 4JHDB 4CJ5A 3OTOK 1M1KO 2Z1JA 4KAZA 4H5VA 2P9IB 4Z94A 5FLXO 4NXMK 3AO5A 3TANA 2OPSA 1IKYA 4HCBA 3AVIA 4FJMA 3CCJN 4JK9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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