4OKEA

Structure of rnase as, a polyadenylate-specific exoribonuclease affecting mycobacterial virulence in vivo
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
VRYFYDTEFIEDGHTIELISIGVVAEDGREYYAVSTEFDPERAGSWVRTHVLPKLPPPASQLWRSRQQIRLDLEEFLRIDGTDSIELWAWVGAYDHVALCQLWGPMTALPPTVPRFTRELRQLWEDRGCPRMPPRPRDVHDALVDARDQLRRFRLITSTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Function of RNase AS, a Polyadenylate-Specific Exoribonuclease Affecting Mycobacterial Virulence In Vivo
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords 3'-5' exoribonuclease Rv2179c/MT2234.1
total genus 52
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.13.-:
pdb deposition date 2014-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4okeA00
1WAFA 3MXIA 1HJRA 2DFFA 2EHGA 3ZSRA 4Z4GA 1A5WA 1RDAA 3RWUA 3ITHA 3DM2A 4CEAA 4KTQA 2OYQA 4DS4A 4F8RA 3K59A 4ZTFA 3PO5A 1HNIA 3OYLA 2FBXA 2FBVA 2YKNA 3O4QA 1TKXA 3ZT1A 4AH9A 4B8CA 5C42A 5SWMA 3SUQA 1QS4A 4FJ8A 1IO2A 1C1BA 1JLAA 2XO7A 3TR8A 4PA1A 3IAYA 3NAEA 3QLHA 1QSSA 4RG8A 3DRPA 4RW9A 1HQEA 4CGIA 3KLHA 4Z4FA 4EP4A 4AHUA 2PYLA 1JXBA 1L3TA 4DTNA 3CYMA 2W42A 1CXUA 3DMJA 1MU2A 1TV6A 3AVBA 3KKRA 3SQ2A 4JRQA 4C8OA 1QQCA 4KI4A 4C8LA 1RDDA 2HVHA 3VQPA 1GOCA 4O0IA 4HCBA 5HLFA 3HK2A 3OYBA 4KV8A 2EX3A 3VQ9A 1Y97A 3QIPA 4H8KA 2BGGA 4OLBA 2LSNA 1T05A 3C94A 4CGDA 1CZBA 3V9SA 3VA3A 4M3ZA 3QESA 3U3YA 1ZBIA 1Q8IA 3O3HA 2KFNA 3MEDA 4O55A 5CYQA 2VWJA 4LSNA 4TSXA 3LP1A 2RPIA 1EXQA 3ZSQA 3SV4A 3SQ0A 1NJWA 3VQEA 3SV3A 2A1RA 3CM6A 4CK2A 4KB0A 1EETA 1VSMA 3RRHA 1FK9A 3PX4A 1TL3A 3HT3A 3LP0A 3ZSXA 3NBPA 3OYFA 1JXEA 3ZT4A 1FKOA 4I7FA 3DLGA 4C8NA 4KAZA 3AA3A 4CF1A 4DFMA 4FJ9A 4FJMA 4RW7A 4CIGA 2XY7A 4CFAA 1CXQA 3V6DA 4AHVA 1WSJA 2HNDA 3I0SA 3MEGA 4KI6A 3P5JA 4JS5A 1WN7A 3AVLA 1BQNA 2BANA 4CJRA 4BACA 4FM2A 2P5OA 1RT2A 5FRNA 3V1RA 3VQAA 2DTUA 3OYJA 2KFZA 4OJRA 4Z4EA 2D0BA 4B8AB 4YFUA 4AHSA 4CF2A 4B9VA 3O3FA 5HRNA 4BDYA 3IS9A 4CF0A 4FZZA 4J2BA 3VQCA 4AHRA 3O3GA 4HUFA 4W5OA 5HRSA 3V4IA 4GVMA 4IFYA 1Z25A 3OJSA 5J2PA 3SUPA 1VSFA 3AO1A 4AHCA 1SKSA 2G8VA 1BHLA 4DLGA 2HHQA 4I2QA 1S1VA 4CHYA 1TK5A 3BDPA 2RKIA 1KVBA 4N76A 1VSLA 3TAMA 3OY9A 1HRHA 3T1AA 4E7IA 4E7HA 4FZXC 2KZZA 3NGYA 1S6PA 2B6AA 3M8PA 1D8YA 1TK8A 2G8FA 4DQIA 3THVA 3M8SA 5J2MA 5CYMA 5CY4A 1CZ9A 3V1OA 4CJPA 4CIFA 3VQ4A 3V9WA 4ID1A 3M8RA 3QEWA 4FW1A 1S9EA 4DTOA 3WNHA 5HROA 1D9DA 4L8RB 4OKJA 3VQ8A 4B08A 4KREA 4E7LA 4KHNA 3M8QA 3ZT0A 5C25A 3OS1A 3QNOA 3HL8A 4Z0UA 1U48A 4M3TA 1YVUA 3T3FA 4CFBA 4QAGA 1ZBUA 5KRSA 4BDZA 5HP1A 4FJXA 1YTUA 3CM5A 1IKVA 4OPKA 3OYHA 3K5LA 4CGHA 3ISNC 1UA0A 1W9HA 3LP3A 3P1GA 2GV9A 4OGEA 3QEIA 2HMIA 3K5OA 1YTAA 2Z1IA 1NK4A 4CFCA 2DFHA 4CEDA 4HTUA 4E19A 1EX4A 4O4GA 4OKKA 1GOAA 4CEBA 4CGFA 2OA8A 2F8TA 4KKOA 2HHVA 4H4MA 3VQQA 1C1CA 1VSHA 4E1NA 3K2PA 4CF8A 3OYGA 1NK0A 3AVGA 3KD5E 4N47A 4DTJA 1NKBA 4ICLA 1BL3A 1NJXA 2HHTA 2D0CA 2QXFA 3LALA 4I9QA 1RNHA 1XHXA 4CHQA 1NJYA 4CK3A 4CJVA 2HNYA 3TARA 3DYAA 1WNSA 1NJZA 3P83D 2OPRA 3S3OA 1KFDA 3LANA 5FDLA 4DSEA 4FK4A 3AVIA 1TVRA 4DS5A 5KTQA 4FJ5A 3NF9A 4M45A 1S1XA 5I42A 1TL1A 4AHTA 1EP4A 1RBVA 3B6OA 1ITGA 1F21A 5EU7A 4O44A 4RW8A 5J2NA 3RMDA 3DRRA 3OYEA 2R7YA 3ULDA 1IH7A 2OZMA 4CK1A 1JLQA 1S1TA 4H4OA 4C8MA 2BDPA 4PUOA 3E01A 4O0JA 1C0TA 3HP9A 4OVLA 5FRMA 4FJKA 5C24A 3SZ2A 4B9SA 4EP5A 2IDOA 3ZT2A 1UWBA 3VQBA 4CJEA 4OGCA 1RILA 3OS0A 1B9DA 4FLYA 3G0ZA 3WNFA 4CFDA 2YNIA 2WONA 3HPOA 1VRUA 3HVRA 4DTXA 3KTQA 1SUQA 4N41A 1Q9YA 1X9SA 1CLQA 1RTJA 1LWCA 4Y1DA 3NF6A 1NK5A 1K6YA 3MXMA 2G8KA 3SPZA 4B9TA 4CJSA 3LP2A 2NUBA 1SL0A 4DTPA 2G8UA 4PQUA 1G15A 1NOZA 1RT4A 4CGJA 3QEXA 3HPHA 3DLBA 4NCGA 2A1SA 4CJFA 1RTHA 2FBTA 2F96A 3OJUA 4JS4A 4CHNA 4B9NA 2PY5A 1LWEA 3NCIA 2RN2A 4LH4A 4DQSA 2PZSA 3ZSOA 3KLGA 2KZMA 4K8XA 3NE6A 1VSDA 3OYNA 3RR7A 3VQ7A 4FK0A 1HPZA 3AO3A 2IOCA 1S5JA 1BI4B 2D0AA 3HP6A 4M3UA 2FC0A 1C6VA 4DG1A 1X1PA 3DOKA 3FFIA 1RDBA 4CJTA 1BISA 4E1MA 3L2QA 3S9HA 2ETJA 4CE9A 4CCHA 4KB1A 4DSKA 3SPYA 2O4GA 4WE1A 1X9MA 2GUIA 5KGXA 2HHSA 4HHTA 4DU4A 1ZBLA 1VSIA 1NKCA 4F3OA 1BCOA 4DQPA 1XI1A 2P51A 3K5MA 4PY5A 4FXDA 2JGUA 3CFRA 4CHPA 4MFBA 3O4NA 4FLTA 2VWKA 1D5AA 3PO4A 4NCAA 4DWIA 1ASWA 1BQMA 1S1UA 3CFOA 1RBTA 1J54A 4FVMA 4NYNA 2P5GA 2OZSA 2RF2A 1BI4A 3LPUA 1RT7A 1U04A 4FCYA 3AA2A 3QETA 3TAQA 1RT6A 3DLRA 3DRSA 1VK0A 3TI0A 1S6QA 1T7PA 2Z1HA 3KD1E 1QSLA 1QHTA 2G8HA 3UIQA 4GW6A 1TKDA 5I3UA 4IBNA 2ZE2A 4FLXA 4W5NA 4DMNA 1U4BA 3C6TA 4ZTJA 2DFEA 1XWLA 3HPGA 3D0PA 4FLWA 1U45A 3D45A 3DLKA 1HNVA 2XY8A 4OKEA 1C0MA 3SCXA 4IFVA 1SKRA 5CZ1A 3TAGA 2HHXA 4NYFA 3I8DA 1HYZA 1XHZA 2WOMA 4ID5A 4CF9A 4FW2A 3QEPA 1EKEA 3NH2A 3EZ5A 3S3MA 3DLHA 4QCLA 3LPTA 3ZSZA 4DTMA 1WLJA 1KVAA 4HUGA 4UQGA 1L3UA 5HRRA 1VRTA 2Z1GA 1NK8A 4DSIA 3AVMA 3DI6A 4B3OA 2DY4A 1RTDA 3TWHA 3ASMA 1WSGA 4I9LA 4B9UA 1B92A 4G1QA 4DLEA 1N6QA 2AJQA 1KCFA 3PUFA 4BWJA 3B6PA 3QERA 3PX6A 3SJJA 1HYSA 4CJ3A 3RMBA 1RTIA 1Q9XA 4N5SA 3L2VA 4KHQA 4F4KA 1IKXA 3L3VA 1L5UA 4M3YA 2Y1IA 4W5TA 2QK9A 4Q0BA 3NGIA 1FKPA 5KI6A 4DF4A 4F2RA 4I2PA 4DFPA 1J5OA 5HRPA 1Z26A 1L3VA 1HQUA 2VG6A 4CEQA 5E41A 4BE1A 4FJLA 1JLFA 3VA0A 4B9LA 3C6UA 1RBRA 3ALYA 1WSIA 2OPQA 3WNEA 4KTWA 4CJUA 1JLBA 1REVA 4Z4HA 3L2UA 1NK9A 1NK6A 4F2SA 3HJFA 3U6FA 1J53A 2OPSA 3AVJA 1T8EA 3AO2A 3HVTA 2B5JA 4GMJB 4HVJA 3OS2A 3JSMA 1B9FA 4KO0A 4M41A 4Q5VA 1ZYQA 3I0RA 5D3GA 5CZ2A 1BIZA 3EYZA 1TK0A 4FJJA 1A5XA 4ELTA 2YNGA 4NCBA 2YKMA 3AA5X 5J1EA 1LW0A 3LWLA 3KLEA 3TABA 2E6LA 1ASUA 3LAKA 3LZIA 5HBMA 1SV5A 2XRIA 3RR8A 2IAJA 1S1WA 2YNHA 2ZQBA 3TAFA 4CHZA 4JRPA 4E3SA 3V9ZA 3QIOA 3KLFA 4ELVA 4CJKA 2G8IA 1LW2A 2Y1JA 5J2QA 2G8WA 1KVCA 3RTVA 3V9UA 3AVNA 4LD0A 3DOLA 4M3RA 3V9XA 4M3WA 3CQ8A 4KRFA 1A5VA 4JLHA 3CG7A 3NF8A 2YHBA 3KLIA 3SI6A 1BCMA 1DLOA 2XY5A 2HNZA 4FM1A 1C0UA 1JLEA 3IG1A 3OYDA 3MECA 3RMCA 4EZ6A 4KPYA 3NHGA 2O4IA 4CIEA 2XY6A 3NH0A 2XHBA 1JL1A 1KTQA 2X74A 3SQ1A 3BGRA 2IGIA 1VSKA 4BDPA 3QO9A 3QNNA 3HO1A 4DSLA 1LWFA 2HB5A 3OYIA 1QTMA 4IKFA 4CESA 5FROA 4FJGA 4LY7A 4CEEA 3F73A 1N5YA 4KHYA 1RBSA 4CJ4A 3SUOA 1L3SA 2HW3A 2HVIA 4E89A 3G10A 4Z4CA 3PY8A 3HXMA 3K58A 3HYFA 5JS2A 1D9FA 2YV0X 4W5QA 3A2FA 1SL2A 3RRGA 4PWDA 3T19A 4CJLA 4DU1A 3RMAA 1JL2A 3ZSVA 1NK7A 1TKZA 5T7BA 3AO5A 4CJQA 1WSFA 1WSEA 3VN5A 3LAMA 4CHOA 4CEZA 3S3NA 1TAQA 3SNNA 4DQQA 1ASVA 4J2DA 1RDCA 1TGOA 4DSFA 4M42A 2BE2A 1QSYA 4DU3A 2HHWA 3L8BA 1KSPA 4XIUA 4LH5A 4FM0A 1VSJA 2VG5A 3V1QA 1KLNA 3AVHA 1JLGA 1HMVA 3C95A 3TAEA 1SL1A 4AILC 1RCHA 1UAXA 3ZCMA 3EY1A 1VSEA 1FXXA 5KRTA 3MAQA 3TAPA 4HCCA 3AVCA 4IDKA 4CEFA 3LZJA 1ZBFA 2KW4A 1RT3A 2X6SA 3VQDA 3K57A 3L2WA 3NDKA 4IG3A 1J9AA 1KLMA 4C8KA 4FLZA 3AO4A 4E7JA 3OYAA 3OVNA 4LSLA 3AVAA 1WSHA 2P1JA 4OLAA 4BWMA 1BGXT 1NKEA 5JS1A 4Z4IA 1XC9A 3U3GA 4DFKA 3AVKA 1U47A 3MXJA 4R5PA 3CFPA 2ZD1A 3MEEA 3HM9A 4DQRA 4DTUA 1T03A 1QE1A 1SKWA 4EZ9A 2KQ2A 1KFSA 2X6NA 1ZBHA 4HUEA 4CECA 2VG7A 4ZHRA 1TAUA 3KJVA 3SUNA 4FLVA 3PV8A 1NOYA 4FJ7A 2IS3A 4KHSA 1HYVA 2Q3SA 5KGWA 1I3AA 3VQ5A 1O1WA 4BE2A 1R0AA 4KHWA 4QOZB 2F8SA 4KFBA 1GOBA 4O5BA 3SQ4A 3JYTA 3OYKA 5DK5A 5SZTA 4FJHA 4CEOA 2D5RA 2X78A 3WNGA 4BE0A 4FZYA 3QINA 2QKBA 3KKSA 1JLCA 3NGZA 2FBYA 5DMRA 3NH1A 1IKYA 1C1AA 2JLEA 3IRXA 2HHUA 4DFJA 3VQ6A 2YHAA 4N56A 3PX0A 1LV5A 1KRPA 1JKHA 1UOCA 1BIUA 3ZSYA 4ELUA 1LAWA 3HSTB 3NFAA 2E6MA 4DTSA 4MQ3A 4J2AA 4RW4A 1UA1A 4FJIA 4IG0A 2E4LA 3L3UA 4RW6A 4Y1CA 3L2RA 4E0DA 2IC3A 1WAJA 3AV9A 3ZSWA 3LWMA 4DF8A 4FYDA 1RT5A 3K5NA 4CJWA 1YT3A 3SYZA 3KK1A 2QKKA 1RT1A 1LAVA 3F9KA 4FLUA 4DSJA 1TKTA 4YNQA 3AVFA 4W5RA 4E7KA 1X9WA 2ATQA 3QEVA 2PYJA 3KIOA 3KK3A 1W0HA 3NF7A 4FJNA 4DTRA 4CGGA 1U49A 2YNFA 4FK2A 3OYCA 2I5JA 3KK2A 3H08A 4KTZA 4CJ5A 4M3XA 1DTTA 1I39A 3LDSA 2ITGA 4J2EA 1IKWA 1RBUA 3AA4A 2B4JA 4B9MA 3TANA 1DTQA 1IG9A 5K14A 4K8ZA 4CERA 2KTQA 3OYMA 4KHUA 2GBZA 2Z1JA 3DLEA 4OPJA 3V81A 1S9GA 4F3TA 3ZT3A 2OPPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKDA 3MN5A 1A5WA 4F8RA 4ZTFA 3OYLA 2FBVA 1HX1A 4CZEA 3DWLA 3VEZA 4IO8A 3NAEA 1QSSA 4RG8A 4KH6A 3DRPA 4RW9A 3KLHA 3GDQA 2PYLA 4EAHD 5BREA 3K0SA 2W42A 1CXUA 3AVBA 4C8OA 5HOOA 1RDDA 5BPLA 1GOCA 1NGBA 3CJAA 4HCBA 3HK2A 4RCHA 1Y97A 4DR4K 3SMPA 1YIJN 1T05A 3VA3A 3VERA 1Q8IA 1TYQA 1NGHA 3MEDA 4O55A 4CBXA 4JI2K 3LP1A 3SV3A 4CBUA 4CZHA 4KB0A 4DR1K 3MCPA 2D4WA 2QW9A 3OYFA 3A5OC 1FKOA 3DLGA 4C8NA 4FJMA 4CIGA 1CXQA 2I7NA 3I0SA 3AVLA 1BQNA 4BACA 3R1XA 5AZIB 4JHDA 3OYJA 1NWKA 2D0BA 4LF6K 4B1WB 4BDYA 3AGRA 3VESA 4CZMA 1ZBSA 4W5OA 4GVMA 5GAHP 1SKSA 2HHQA 3VTIA 1TK5A 2HSTA 4IJNA 4N76A 1VSLA 3OY9A 2E2NA 2ASPA 3T1AA 5IWAK 3SBGA 4E7HA 3O9RA 4PHTX 2CGLA 3WXKA 3M8SA 5J2MA 5CY4A 2P9PB 4DTOA 3O9SA 3VETA 2GWKA 3VQ8A 4KREA 1ILYA 3VEYA 3M8QA 3ZT0A 5C25A 1U48A 4M3TA 1YVUA 2ITMA 3T3FA 1YTUA 3UKUA 2GELA 1QQOA 2F4VK 4O8KA 4OPKA 3OYHA 1YXQA 5AR0A 2QWNA 1UA0A 1W9HA 4DR6K 2WBNA 3QEIA 2HBJA 2DFHA 4CFCA 4UY8O 1VQMN 4E19A 1EX4A 2F8TA 4KKOA 4BRKA 2HHVA 1VSHA 3K2PA 3OYGA 1NK0A 3ENHA 2IVOA 2E88A 5AQJA 4Z94A 1NJYA 3TARA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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