2AA4A

Crystal structure of escherichia coli putative n-acetylmannosamine kinase, new york structural genomics consortium
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
MTTLAIDIGGTKLAAALIGADGQIRDRRELPTPASQTPEALRDALSALVSPLQAHAQRVAIASTGIIRDGSLLALNPHNLGGLLHFPLVKTLEQLTNLPTIAINDAQAAAWAEFQALDGDITDMVFITVSTGVGGGVVSGCKLLTGPGGLAGHIGHTLADPHGPVCGCGRTGCVEAIASGRGIAAAAQGELAGADAKTIFTRAGQGDEQAQQLIHRSARTLARLIADIKATTDCQCVVVGGSVGLAEGYLALVETYLAQEPAAFHVDLLAAHYRHDAGLLGAALLAQGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Escherichia Coli Putative N-Acetylmannosamine Kinase
rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
molecule keywords Putative N-acetylmannosamine kinase
total genus 85
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2005-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A01
2GELA 3D2EB 3AARA 2ASPA 1IG8A 5AQXA 3MK6A 2CH5A 4EHTA 3A0IX 5EY4A 5AQWA 3BP8A 5BREA 3EKSA 3HZ6A 3QDKA 4H0YB 4CD3A 5AFUH 2A5XA 3O1WA 4FWNA 2VYPA 2HOEA 1Z6RA 4JAXA 3QB0A 3O4WA 3I33A 1HUXA 4K25A 4WQ4A 2W40A 2P9PA 3UKUB 1T44A 2Q0RA 3C7NA 4B1XB 4BRNA 3H3NO 3D2EA 5AZIA 3M1FA 1DGKN 3DXKB 3W0LA 4EFHA 1XQSC 4BC4A 3IDHA 5AQIA 1NGIA 4H0PA 3WXJA 2FSJA 3MN5A 2J4RA 2D1KA 4I6MA 1GLDG 4ISEA 4IJNA 1RFQA 3H45C 4CZFA 2IVOA 4A2AA 1ESVA 2P9UB 4DB3A 3D7EO 1T6CA 1R59O 4L3QA 4MLEA 4MO4A 1SAZA 4FOIA 4QS9A 4BGAA 3C7NB 3SLCA 3U8XA 2P9NB 3M3ZA 5FPNA 4H5RA 2QWNA 3WQUA 2P9SA 2P9IA 5AZIB 2OANA 3LDNA 3DXKA 1NGAA 3CJ7A 3LDPA 3R9PA 1ZC6A 3MN6A 3VEXA 1HPMA 3VERA 5AQVA 2ZWHA 4GY2B 4BRHA 5AQHA 2YHWA 4FO0A 2QM1A 2ASOA 2GEMA 3BUZB 3MMVA 3EO3A 4NB4A 3ZX2A 5LY3A 1NBWA 4JHDA 3CJBA 5BN9A 1NGDA 5F0XA 2AP1A 3O8MA 4PL8A 4DHYA 5FPDA 1MDUB 4WYBA 2P9IB 2D0PA 5LJWA 3ID8A 4PKIA 5FPMA 3VEWA 2YJFA 4M7XA 5AFUA 4CZIA 2IVPA 2QXLA 2E1ZA 1MWMA 3W3DA 1HX1A 3CJAA 3SMPA 3LDOA 3U9DA 3U4LA 3VGMA 2ZF5O 3WUHA 4CZEA 2EWSA 1S22A 2YHXA 4RWTA 1XUPO 5JMVA 3HI0A 3J8AA 3GG4A 1S3XA 4JHDB 1KAXA 5AQNA 2CGJA 2E2PA 2FXUA 2A6AA 2E88A 1MWKA 1QZ6A 3KVGA 1GLCG 4O5FA 1SQKA 4JNEA 4CBWA 3GL1A 3CJCA 1BO5O 3BF1A 4B1UB 4CD1A 4IO8A 3SK3A 1K8KB 4B1YB 1QZ5A 1QQMA 5AQMA 5F2RA 4C23A 4H0OA 4JD2B 1RDWX 2ITMA 1XC3A 2P9LA 3H1VX 3CHWA 1J6ZA 5AQLA 3WQTA 1NGHA 3HBTA 3LDQA 5AQOA 2D4WA 4EIAA 3VEVA 2BTFA 1OKJA 5AQSA 4BRLA 1NMDA 5AQKA 5BRDA 1BUPA 5EOYA 5JICA 1ATSA 3IUCA 1X9JA 5AQUA 5KPTA 2IIRA 3UB5A 4K42A 4H0XB 3M6GA 3MN7A 4M7YA 2A40A 3VENA 2QWOA 3QMLA 3HTVA 2HF4A 3EKUA 3DWLA 2P9KA 2V51B 2D0OA 4XH4A 5ADXH 4A62A 3BEXA 2H3GX 1RGIA 3CI5A 4FWRA 4HTLA 4ISGA 4BRPA 4BC3A 2HMPA 3MCPA 5AQGA 4E1JA 4Z94A 4MO5A 4YDUA 4B9QA 4H5WA 2NLXA 2W41A 3ATVA 5TKYA 5AQYA 3JS6A 4FSVA 1Z05A 4JN4A 4BC5A 3DXMA 3EZWA 2YJEA 2FLOA 4FWOA 4FWMA 3S41A 2P9KB 2E8AA 1LOTB 3FZLA 3FLCO 3KHYA 4PKGA 3ULEA 3VEZA 5ADXA 1TUYA 4ISFA 2FF6A 1X3MA 3A5NC 4J8FA 3LM9A 2NRHA 1QQNA 4Y0WA 3FE1A 1NM1A 1V4TA 5AQZA 5BPMA 5AQRA 2E2QA 1GLLO 2KHOA 4IJAA 2YCHA 3ZX0A 3FZKA 2E2OA 3WEEB 3ZEUB 2QW9A 3ULEB 2GTDA 1BDGA 2P9PB 3KZBA 4BRFA 1C0GA 3LDLA 4A61A 3H46O 4GNIA 3UE5A 4AM6A 2A3ZA 4PKHA 4BRKA 1QHAA 3VF4A 2DPNA 2IVNA 4B1WB 5B8HA 1E4FT 1HKGA 3FGUA 4BRAA 1NGEA 4EHUA 1ATRA 2BUPA 1NLVA 4CZJA 1V4SA 3VGLA 4B1VA 2P9UA 3D2FB 1LCUA 3SMSA 4CZLA 3CERA 3ENOA 3WEEA 5KQ8A 2Q2RA 1U6ZA 4QS7A 4BRGA 3AAQA 1X3NA 4IWVA 2P9NA 2I7PA 1YVNA 3WT0A 3H6EA 3GDQA 3B8AX 2V7YA 2VCPA 1D4XA 1TYQA 3A8YA 2CGLA 5AR0A 3H3OB 3EL2A 1JCFA 1YUWA 3MN9A 5KPRA 3FR0A 5I9EB 4DQ8A 2FSNA 3QFPA 5BPLA 3D2FA 4RTFD 3H1QA 1C0FA 1NGGA 1TUUA 2Q0UA 4XEIA 2FF3B 4BC2A 1P8ZA 3SJHA 4CZMA 5BN8A 1DKGD 1NGCA 1QQOA 4K41A 5CE3A 2QWQA 3L6QA 4BRIA 4IXCA 4CI6A 3L4IA 4FWPA 2GWJA 3A5MC 3QBXA 3UKRB 3DAWA 1TYQB 3CJ1A 3FZFA 4BVPA 1T6DA 1YAGA 4DCHA 2CGKA 5FPEA 4EAHD 2PBDA 3BF3A 4I6MB 4B1ZA 4BR5A 4FWLA 5JLFA 4BGBA 3ATUA 1HJOA 4BVOA 1GLBG 2ASMA 3WXIA 3TPQA 1KAYA 5KPZA 2FSKA 5AQFA 1BA0A 1G99A 5AQQA 4QS8A 1GLEG 5LJVA 1BU6O 3LM2A 3L0QA 3AY9A 3VF6A 2P9SB 3O6WA 4WQ4C 2HF3A 2QWRA 4PL7A 1JCGA 3UKRA 1WOQA 4BG8A 1BOTO 2GWKA 4HWIA 1BWFO 3LL3A 4H5TA 4JD2A 3GE1A 2P9LB 1GLJO 3ZX3A 2QWLA 4LC9B 3FZMA 4FPBA 4YDUC 2UYTA 4BQZA 5BR9A 3IFRA 3C0BA 3VESA 4FWSA 3VGKA 2YI1A 3VOVA 3CQXA 3HSCA 2A42A 3JXUA 3WXKA 1DEJA 3R8EA 4CZHA 2PAVA 5AQPA 4BRQA 3A5OC 3AAPA 4CZGA 4BR7A 1HLUA 5BRFA 5AZJA 3GOIA 2F9TA 1JCEA 4CBXA 2Q97A 4FL9A 1KAZA 2E20A 4H5NA 3CQYA 4NO7A 4KBOA 4BRCA 4BR9A 3A5LC 2CH6A 3O08A 2QWMA 5EVZA 3O5BA 2F9WA 3EN9A 4BG9A 4FPAA 4K43A 4M63C 5EX5A 1U2VA 3VF2A 3F9MA 4F9OA 4A2BA 2QWPA 4O8KA 1ZXOA 4H0TB 3HM8A 2NZTA 5E26A 1K8KA 2VWBA 5AZJB 4BREA 3P4IA 4AM7A 3VETA 3ZETB 3O80A 1ZBSA 4XH1A 1IJJA 1ATNA 1Y64A 2YHYA 4XH5A 4FWQA 2I7NA 4RCHA 1YXQA 4H03B 4BRDA 1BA1A 3RSEA 2ZGZA 3G25A 3IMXA 5F1XA 2E1YA 4FOEA 3I8BA 3QFUA 5EXWA 5BRHA 3CETA 3TU5A 3QICA 1U2VB 1HKBA 3O1BA 2V7ZA 3R6MA 5KQDA 3CJ9A 4CZKA 1GLFO 3MDQA 4H5VA 1BG3A 4BR4A 4CBUA 4CJ7A 1WUAA 3VEOA 1MA9B 4MLHA 4BR2A 3VPZA 3ZETA 5AQJA 4H0VB 1NGFA 5ELZA 3ZEUA 1Q18A 3ENHA 2E2NA 4FWKA 3RSEB 4WQ5A 1NGBA 4BQLA 2V52B 1KXPA 1E4GT 2AA4A 2GUPA 2A41A 3CIPA 4BROA 1SZ2A 2Q1NA 3FZHA 3GBTA 5BPNA 3QBWA 3VEYA 5JLHA 1NWKA 2Q31A 3OHRA 4BR0A 3FFKB 1NGJA 5E84A 4WQ5C 1GLAG 3DXMB 3U9ZA 1CZAN 1EQYA 4IZ9A 2WUSA 2ZGYA 5AQTA 4BRMA 3WXLA 3DJCA 1HKCA 3UKUA 1H1VA 2Q36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E6MA 3NGYA 1OH7A 1BIUA 4F4KA 2O8EA 5AQXA 3LZIA 3U3YA 2HHQA 3LZJA 2XY8A 4Q5VA 5D3GA 5AFUH 1JLFA 3C6UA 4JAXA 2O8CB 3I33A 1YJNN 3Q7BA 3ZSYA 2W40A 3HPOA 1BGXT 1N5YA 3NF7A 5IT9O 3HPGA 4KO0A 3OA9A 2Q0RA 1RDCA 4B1XB 1UAXA 5AZIA 4CJKA 3HRGA 1VQLN 3ZT1A 4JKHA 4CFDA 4NLCA 3OS0A 4H0PA 3WXJA 2FSJA 2KFNA 2J4RA 3SUQA 4I6MA 1GLDG 4ISEA 5GAEP 4M3RA 1RFQA 3KLGA 2P9UB 3QEPA 1QS4A 3O3GA 1REVA 3AVIA 5HRNA 1KQSM 1F21A 4RW9A 3NGIA 3TAMA 1I3AA 4ZTJA 4BGAA 1Q9XA 5FPNA 1KLNA 2UUBK 3PV8A 3PX0A 2P9SA 2P9IA 3VQ7A 3DXKA 1ZC6A 1C1BA 4CHPA 5AQVA 3CC7N 4GY2B 4FO0A 2DY4A 3M8PA 4GV6A 4NB4A 5LY3A 1NBWA 2D0AA 4HVJA 4FZXC 4AHSA 1NGDA 1IKWA 3OYCA 2AP1A 3AO5A 4PL8A 3KJVA 4KHWA 3PIPL 1S72N 2PYLA 5LJWA 4NCAA 4PKIA 2YJFA 4FJGA 4FLWA 1GOCA 4NYNA 2E1ZA 4F2SA 1B9DA 4OLBA 1MWMA 3W3DA 4JKEA 1KVCA 3D0PA 4JKBA 3U4LA 3QETA 2EWSA 3DOLA 1NKEA 4DTPA 4CF0A 2DTUA 4J2BA 3J8AA 4JHDB 1U48A 4X64K 2CGJA 1OVYA 1MWKA 2FXUA 4O0IA 1GLCG 5C24A 3TWHA 4CERA 3BZCA 4CBWA 4XIUA 1QSYA 4IEEA 3HOSA 4NXNK 1EKEA 1MU2A 5CR4A 3THXA 3SK3A 1ILYA 1K8KB 5F2RA 4C23A 1RDDA 1NK4A 1SKSA 3P31A 1RDWX 3L2QA 1XC3A 2P9LA 2UXDK 5M1FA 3ZSXA 1NGHA 3S3NA 3VEVA 2VWKA 4CGDA 2FBTA 4DSLA 1NMDA 4DR3K 1Q9YA 1HNXK 5JICA 3VQPA 1TVRA 1EETA 1TAQA 3ALYA 4DQRA 4KAZA 1KFDA 4CHYA 4NYFA 4M42A 4FVUA 4DTUA 2O8FA 4CEEA 1X1PA 1NK0A 3AVNA 4FLVA 1WAJA 3BGRA 2V51B 2D0OA 4FVMA 4AH9A 1T05A 5ADXH 4ISGA 4FWRA 4HTLA 4BC3A 3T7ZA 3L2WA 1CZBA 2KQ2A 2KLAA 4Z94A 4KTWA 4YDUA 2HSTA 5AQYA 1Z05A 1S1VA 4O44A 4AILC 4DSKA 4FJHA 2OPQA 1U47A 2FLOA 4OKJA 3IAYA 1TGOA 2P9KB 3J7AP 2E8AA 1LOTB 4GMJB 3KHYA 4IOCL 5ADXA 4DTXA 3CQ8A 2F4VK 3QIOA 3KLEA 5CHIA 3HK2A 1RBSA 3VQEA 3MXIA 4K0KK 1BISA 2OPPA 3CD6N 5BPMA 3G4SN 2NUBA 4HTUA 1LWFA 3U6FA 1CXUA 4DSFA 1XC9A 4IJAA 3OY9A 3K0SA 3ZEUB 4B3OA 4Z4FA 3ULEB 1XHXA 2GTDA 3KZBA 3RMDA 1JLQA 4A61A 1HR0K 4E7LA 3M8SA 1UOCA 1JLBA 4BRKA 2RPIA 2YV0X 5J2NA 1SKRA 2BH1A 5B8HA 4B9VA 1RTIA 1HKGA 4NCGA 2BUPA 1NLVA 1VSKA 1XWLA 3PIOL 3NE6A 3D2FB 3C6TA 4KKOA 1YI2N 4CZLA 3ENOA 3WEEA 5GAGP 3AV9A 5J2QA 4QS7A 4BRGA 4FLTA 2RF2A 5C25A 1VRTA 2HVHA 1GOBA 4CHQA 4CJLA 1EO1A 3H6EA 3GDQA 4I2PA 3B8AX 4BE1A 2VCPA 4DV6K 2Q3SA 3K5NA 5AR0A 3EL2A 2WC9A 5KPRA 3VQ6A 1TL3A 4JI6K 2FSNA 3NMUA 1NMNA 3H1QA 2Q0UA 4XEIA 4CJWA 1TKZA 3ISNC 3LP3A 4FJIA 3VQ4A 2IAJA 3ZT4A 4DSEA 5LMUK 4CI6A 4FWPA 2IS3A 1GOAA 4JK7A 4IO9L 3OVNA 1S1TA 3CJ1A 3NF9A 2PBDA 4I6MB 4DV0K 4BR5A 5JLFA 3ATUA 4OPAA 4FJNA 3ZSVA 4BVOA 4BY9C 5FDLA 3SUNA 4FZZA 1YHQN 3T1AA 2A1SA 5AQFA 3DRSA 3TAQA 4CF8A 1T8EA 5LJVA 1BU6O 1EWQA 2X78A 1L3TA 3AY9A 3VF6A 2P9SB 4KH5A 1JCGA 3AA2A 4HUEA 4LD0A 3UKRA 1BOTO 1BWFO 3SNNA 1RBTA 1RT2A 3N4PA 3OYEA 4LC9B 3VQDA 1ASVA 3FZMA 4FPBA 3WNFA 3SJJA 1HRHA 5HL7L 2YI1A 4DR5K 4FJXA 3O9TA 3LAKA 4A5BA 1N34K 1DEJA 4H4MA 3R8EA 3T19A 2PAVA 1LV5A 3AA5X 3AAPA 2WBNA 4CZGA 4OPHA 2ZE2A 4IDHA 5BRFA 3HO1A 5M1OA 5AZJA 4I2QA 3V9UA 5DK5A 1A5XA 4CBXA 4DR2K 3THWB 1Q7YO 4B9TA 4FL9A 2DFFA 1RDAA 1KAZA 2E20A 3CFPA 3DLLL 2LSNA 4BR9A 2O8DA 3OS2A 1LAWA 1JL2A 4K43A 4FLXA 2QKKA 3F9MA 1WAFA 1NOYA 2QWPA 4JS5A 1VSIA 2G8UA 3SUOA 4BREA 1RDBA 3P4IA 3DLKA 3VETA 3ZETB 1ZBSA 1CXQA 3LDSA 3E9OA 1OVQA 1NJYA 2ZGZA 3IMXA 4W5RA 3VQQA 4FOEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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