2AA4A

Crystal structure of escherichia coli putative n-acetylmannosamine kinase, new york structural genomics consortium
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
MTTLAIDIGGTKLAAALIGADGQIRDRRELPTPASQTPEALRDALSALVSPLQAHAQRVAIASTGIIRDGSLLALNPHNLGGLLHFPLVKTLEQLTNLPTIAINDAQAAAWAEFQALDGDITDMVFITVSTGVGGGVVSGCKLLTGPGGLAGHIGHTLADPHGPVCGCGRTGCVEAIASGRGIAAAAQGELAGADAKTIFTRAGQGDEQAQQLIHRSARTLARLIADIKATTDCQCVVVGGSVGLAEGYLALVETYLAQEPAAFHVDLLAAHYRHDAGLLGAALLAQGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structure of Escherichia Coli Putative N-Acetylmannosamine Kinase
rcsb
molecule keywords Putative N-acetylmannosamine kinase
total genus 85
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2005-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A01
2EWSA 3IUCA 2NRHA 4Y0WA 1KAXA 4MO5A 2FXUA 2OANA 2Q31A 2FLOA 5BRFA 1YAGA 3O8MA 2W41A 5KQ8A 2Q2RA 2P9SA 2ZGZA 5AQWA 5BR9A 5JMVA 5EXWA 4B1WB 2VWBA 2YI1A 3J8AA 2QM1A 2IVNA 5TKYA 4FO0A 4BRKA 3A0IX 3LDPA 4PKGA 2P9PA 2F9WA 2W40A 4DCHA 5F2RA 1T44A 3R8EA 5AQYA 3C0BA 4FWSA 2BUPA 4FWKA 2P9LA 3LM2A 3W3DA 2D4WA 2GEMA 3ZEUA 5AQFA 3FZMA 4BRQA 1HJOA 1QQNA 3FLCO 3SK3A 4JD2A 5AQRA 4BGAA 3VENA 1DKGD 3DXMB 4FWLA 3VF2A 4M63C 5AQKA 3VOVA 2NLXA 4DB3A 1ATNA 4PL8A 2AA4A 1LOTB 2Q1NA 3BF1A 4EIAA 3W0LA 3DXKA 3VEVA 3SJHA 4IJNA 3VGLA 3I33A 2P9UA 3AY9A 4CBUA 1X3MA 1NGEA 2ZWHA 3VEYA 4CI6A 1V4SA 2P9SB 4PKIA 3WXIA 2A6AA 5LJWA 5ELZA 3VEWA 5JICA 4CZMA 4FWPA 1JCGA 4B1YB 3ZETA 3LL3A 3QFUA 1BU6O 4FL9A 4IXCA 3WUHA 4BREA 2P9PB 3SLCA 3B8AX 1GLEG 4IWVA 2QW9A 5JLHA 1ZXOA 4BRMA 4K25A 2QXLA 5EX5A 4EHUA 4O5FA 4B1VA 2P9LB 3ZEUB 3CHWA 3H6EA 5B8HA 3H1VX 4JD2B 4BRGA 3BUZB 5AFUH 5KPTA 2GELA 5FPDA 3ID8A 3GBTA 1HKCA 1WUAA 4E1JA 3D2EA 4FSVA 2FF3B 1BDGA 3LDLA 1OKJA 3QFPA 1Y64A 4BVOA 1NGCA 5EOYA 3DXKB 5BN9A 3EN9A 1YXQA 5F1XA 1T6DA 1BG3A 1XC3A 1GLJO 4BR2A 2DPNA 3ZX0A 4BRLA 3ZX2A 4MLHA 4MLEA 3H1QA 3L0QA 3BP8A 3VESA 4B1UB 2QWPA 5AR0A 4BGBA 5AQZA 3D2FA 5AQIA 1Z05A 3ZETB 4QS7A 3KZBA 3UB5A 1GLBG 4QS8A 4WQ5C 3R9PA 4BRIA 2E8AA 4CZJA 1MDUB 4FPAA 4BQLA 2FSKA 2AP1A 3CJ9A 5LY3A 3A5NC 3M1FA 3H3NO 3JS6A 1DGKN 4YDUC 1HKBA 3WQUA 1X3NA 5LJVA 2A3ZA 4DQ8A 4H0VB 3LDQA 2YHYA 5AQTA 5E84A 1SAZA 4NB4A 3U9DA 2QWNA 3FZKA 3OHRA 4I6MB 3D2EB 2IIRA 2P9IA 3MN9A 3DAWA 3ATVA 4H0XB 4H5WA 1C0GA 4A61A 5AQVA 4BR5A 1XQSC 4H0TB 1HLUA 1DEJA 2J4RA 3ATUA 4CBXA 3HBTA 4BROA 5AQSA 4RWTA 3D2FB 4BR7A 4ISFA 2A41A 4CJ7A 2GWJA 1NWKA 5JLFA 4BG8A 2WUSA 3VGMA 3O6WA 3FZFA 2YHXA 2HMPA 3MDQA 3SMPA 2I7NA 3CERA 4H0YB 3WQTA 1R59O 1RDWX 2V7ZA 3A5LC 5AQXA 4EHTA 1QHAA 4BRAA 2HF3A 2P9IB 3CIPA 4BVPA 3EKSA 4FPBA 4HWIA 3UE5A 3ULEA 1HX1A 4WQ4C 1CZAN 4CZKA 3VGKA 1HPMA 1IG8A 3KHYA 3MN6A 3FR0A 2BTFA 2D1KA 5FPNA 1K8KA 3ZX3A 3CJBA 4M7XA 2Q0RA 4H5VA 3RSEA 4BRCA 1E4GT 2Q97A 2F9TA 1J6ZA 1V4TA 5E26A 4H5TA 1NGAA 1SQKA 3FE1A 5AFUA 5AZJA 1NGBA 4BRNA 4RCHA 4HTLA 3BEXA 5I9EB 1RFQA 4H0OA 5BN8A 4IZ9A 5EVZA 4K43A 4JHDA 4BC3A 2VCPA 4DHYA 1ATRA 4BR4A 3CQYA 5F0XA 1GLLO 1GLDG 3FFKB 4I6MA 1BA0A 2E88A 2QWMA 2ASMA 3WXLA 2ZGYA 2D0OA 4A2BA 1JCFA 1NGGA 3L4IA 2V51B 3SMSA 4JAXA 1BA1A 1KAZA 5KPZA 1G99A 4FWNA 3CJAA 4CZEA 2ZF5O 3EKUA 3ULEB 4Z94A 1U2VB 3ENOA 3U4LA 1QQMA 4BC2A 3ENHA 1K8KB 1XUPO 3QICA 5FPEA 3RSEB 2CGKA 3DWLA 1MA9B 3VETA 1JCEA 2A40A 4NO7A 3D7EO 5CE3A 4BG9A 3QDKA 4ISEA 4ISGA 4H5RA 3P4IA 5AQLA 5AZJB 4B1XB 1C0FA 2V52B 3UKUB 3HTVA 1T6CA 3LDNA 4CZGA 4JHDB 3QBXA 1BUPA 3LM9A 2IVOA 3F9MA 3WXJA 2UYTA 1NGIA 3WT0A 4XH5A 3O1BA 4H03B 5AQOA 3U9ZA 3WEEA 4CZIA 3M6GA 3HZ6A 5AQQA 3U8XA 3JXUA 4O8KA 3QB0A 5AQMA 3EZWA 3GE1A 4M7YA 1E4FT 1S3XA 3CQXA 4WQ5A 5BREA 2E2QA 1BOTO 4LC9B 4BRPA 1ZC6A 4FOIA 3H46O 5FPMA 2CGLA 3FGUA 1BWFO 3C7NA 3MK6A 4A62A 4YDUA 1NGDA 2NZTA 3G25A 4BRFA 2GWKA 3VEZA 5KPRA 3MN7A 3R6MA 3O1WA 4H5NA 3A5MC 5AQJA 3VEOA 5ADXH 3VF6A 2HF4A 1ATSA 5AZIA 3VERA 2D0PA 4BR0A 1YVNA 3GL1A 4F9OA 1NMDA 3A8YA 3FZHA 1P8ZA 1TUYA 1TYQA 2CH6A 3EL2A 5AQHA 3UKRA 1IJJA 1QZ6A 3IMXA 2A5XA 4QS9A 3CJ7A 3AAPA 3HSCA 4EFHA 2E2NA 3LDOA 4FOEA 2CGJA 3CI5A 3QMLA 4WYBA 5AQGA 3WEEB 4C23A 2PBDA 3GDQA 2E2PA 1X9JA 2GUPA 4B1ZA 4BC4A 4B9QA 4BR9A 1U2VA 1NBWA 1WOQA 4K42A 2KHOA 2H3GX 3QBWA 3GOIA 2E1ZA 2P9KB 1EQYA 3C7NB 1GLAG 3CETA 3A5OC 2E2OA 4PKHA 4KBOA 3VPZA 4XH1A 2Q36A 3H3OB 4A2AA 1D4XA 3BF3A 4L3QA 2HOEA 3UKUA 1U6ZA 3I8BA 3O80A 1Z6RA 4K41A 5AZIB 4EAHD 2YHWA 3IFRA 3TPQA 4FWQA 3TU5A 1ESVA 2FSNA 2CH5A 3H45C 1RGIA 2A42A 1TYQB 2P9NA 3UKRB 1GLCG 1Q18A 1ZBSA 5AQNA 4WQ4A 4GY2B 1MWKA 2PAVA 3AAQA 1S22A 3M3ZA 3FZLA 2V7YA 2FF6A 1BO5O 2IVPA 3MCPA 5AQPA 2YCHA 2YJEA 5BRDA 2QWOA 4FWOA 1NM1A 4BRHA 3DJCA 1KXPA 2QWRA 3O5BA 1SZ2A 2ASOA 3GG4A 2YJFA 4AM6A 4CZLA 3EO3A 3VF4A 5BRHA 3O08A 4J8FA 4XH4A 3KVGA 1H1VA 2ITMA 1YUWA 4H0PA 5AQUA 2GTDA 3AARA 3IDHA 2P9UB 3O4WA 4JN4A 1NLVA 3HI0A 4CZHA 3MN5A 4IJAA 5BPMA 1GLFO 1NGJA 4FWRA 2E20A 4BQZA 2E1YA 4BRDA 4CD3A 4XEIA 1QZ5A 4CZFA 2P9NB 1KAYA 3CJ1A 2ASPA 3VEXA 2VYPA 3CJCA 3HM8A 3S41A 1QQOA 5KQDA 3MMVA 4AM7A 4CBWA 4CD1A 2FSJA 4GNIA 4MO4A 1NGFA 4RTFD 2I7PA 1LCUA 3DXMA 3L6QA 5EY4A 5BPNA 4JNEA 4BC5A 5BPLA 1TUUA 1MWMA 4FWMA 2P9KA 2Q0UA 4IO8A 5ADXA 1HKGA 2QWQA 1NGHA 2QWLA 1HUXA 3WXKA 4PL7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI0K 4Y0WA 2QKKA 1KAXA 2HBMA 2HVHA 2OPQA 2OANA 2W41A 4DU3A 3AA3A 2Q2RA 3MEGA 2DFEA 4B1WB 2G8VA 3AVNA 1XMOK 1W97L 1TKDA 2JWKA 4FO0A 1M1KO 3V9UA 4PKGA 2P9PA 4EZ9A 5JVHL 4DWIA 5AQYA 3OYAA 1EKEA 4FWKA 3AVBA 4DMNA 1VSEA 2GEMA 5AQFA 3FZMA 1HJOA 4JK9A 4DV5K 4BGAA 3HPHA 3TAMA 4NCGA 4FWLA 1NJZA 5AQKA 4FJXA 3HSTB 3WNEA 4DTOA 3J7ZO 2R7YA 3O9SA 1ATNA 4CIEA 3U6FA 4E1NA 4Z0UA 3NFAA 4CE9A 4HHTA 1ZBUA 3OS0A 1WB9A 4MDBA 3S3NA 1X3MA 2ZWHA 4CI6A 1V4SA 2P9SB 2LSNA 5M1FA 1BQNA 5HROA 4J2AA 2O8CA 4KV8A 1RDUA 3VEWA 4DR5K 4OKKA 4CZMA 3ZETA 3LL3A 3QFUA 1UWBA 4FJJA 4ZTJA 5CHIA 1HNIA 1WNSA 1CZ9A 4KHYA 1ZXOA 4IEIA 4K25A 4QAGA 3MAQA 5EX5A 4CK2A 4B1VA 2WC9A 3MXIA 3H6EA 5B8HA 3AGRA 4JD2B 3P31A 5AFUH 1KVAA 5C42A 2GELA 2QI2A 4CEZA 2F8SA 1WUAA 4FM0A 3H08A 4EP4A 4FSVA 1ASUA 1OKJA 2G8WA 1A5XA 1Y64A 3KKRA 3DXKB 4EP5A 1YXQA 1GOAA 1T6DA 4YOWA 4FYDA 1Q7YO 2DPNA 3ZX2A 4YY3K 4FJLA 4MLEA 3HPOA 4ELUA 3NGIA 3AVCA 1WSHA 2NNWA 5HBMA 3O3GA 2NRXA 4CGDA 3PV8A 2E4LA 1XWLA 2E8AA 2KZMA 4HUEA 2AP1A 2KTQA 1JLCA 1VSMA 4G1QA 3PIPL 3CMEN 3JS6A 4YDUC 4B8AB 3OYMA 4KHPK 2A3ZA 4DQ8A 2WOMA 4H0VB 1SAZA 2HBLA 3OS2A 2QWNA 4CEDA 3OHRA 3D2EB 2IIRA 3EE9A 2G8IA 3ATVA 2IDOA 4FW2A 4B3SK 1RNHA 5AQVA 1HNXK 3L8BA 4BR5A 4H0TB 3ATUA 1DEJA 4FK4A 1EETA 3PO4A 3CCQN 5T7BA 3V4IA 4RWTA 3L2WA 3D2FB 2XRIA 3SAGA 3OYHA 3M8QA 1P90A 4CJRA 1TAUA 1NWKA 4BG8A 4BE1A 3VGMA 3FZFA 1KLMA 2Q3SA 3VQ5A 1WBBA 3MDQA 3P39A 2I7NA 2GV9A 3KLEA 3WQTA 4DQQA 1OVQA 4EHTA 1QHAA 3CIPA 4BVPA 5J1EA 1LWFA 4YOXA 4FZYA 3ULEA 1HX1A 1EP4A 4FJMA 3QINA 4B9UA 3VGKA 4H4OA 4DQPA 5FPNA 3TI0A 2D1KA 1A5VA 3THYA 1RDBA 1E4GT 3ZSQA 2GUIA 3HT3A 2Q97A 3N4QA 3ZT2A 4E7HA 3LPTA 1SQKA 2DFHA 1NGBA 4IFVA 2PZSA 3HRGA 4RCHA 1K9MO 4HTLA 1RFQA 1C1BA 3VTHA 2Z1IA 1RCHA 4JV5K 4RW7A 1GLDG 2WBNA 1J54A 1QTMA 2HBJA 4DV4K 3EZ5A 4KTZA 3N4PA 4IFEA 2RPIA 1JCFA 4A2BA 1NGGA 4CIFA 1R0AA 4C8NA 4JAXA 3O4QA 1IV0A 3BZCA 3AO1A 1BA1A 1KAZA 3SAFA 4FWNA 3CJAA 3AV9A 5DK5A 3MX2A 1U2VB 2HSTA 4NYNA 4CW7B 4M3ZA 4BC2A 1K8KB 3QICA 5TKWA 4GV3A 4B3RK 1NK8A 1MA9B 1J5OA 3TARA 4NO7A 4FLXA 1UAXA 3QDKA 4ISEA 3MWPA 4JKFA 1WSIA 3NF7A 4DUZK 1SKRA 2OZSA 4KB0A 2HNYA 4CZGA 2PYJA 4BDYA 4JHDB 1HYZA 5E41A 2G8KA 3WXJA 4KI4A 4DFPA 4KHWA 3KLGA 3DRPA 3L2VA 4H03B 3B6OA 3DLRA 3LAMA 3WEEA 4FLTA 3M6GA 2IOCA 2VG6A 5CZ2A 1RBTA 1SL0A 3VQ6A 5M1QA 1VSDA 3JSMA 3EZWA 1S6PA 3SPYA 3DRSA 4AHVA 4OJRA 1BOTO 4BRPA 4FOIA 3H46O 5FPMA 2OPRA 4CHPA 3DM2A 3G25A 1QE1A 4G9ZA 3VEOA 5AQJA 4LF9K 5AZIA 3VERA 2D0PA 3T69A 4BR0A 3C94A 3SV4A 3RRGA 4CGGA 3FZHA 1TYQA 5AQHA 1IJJA 4FJGA 3PUFA 4HCBA 3SNNA 4IO9L 4J2BA 1KFSA 4CF0A 1WBDA 3QMLA 5AQGA 3RR8A 1S6QA 1U4BA 1CLQA 4OPKA 1EXQA 3GDQA 3OYNA 1X9JA 3SZ2A 3ISNC 4BC4A 4FVUA 1HQEA 2HHWA 4YOUA 3AO5A 4DQRA 5A2QO 1S9EA 1EQYA 1GLAG 1XMQK 3A5OC 4CK1A 1BL3A 4PKHA 3CC4N 1IKWA 4JI7K 4JI8K 3O80A 1RBUA 1L5UA 4CK3A 4K41A 3CD6N 3MXJA 4DR2K 3L2RA 1Q82O 4RW8A 2FC0A 5GAHP 3UKRB 3F5TA 1GLCG 1Q18A 1ZBSA 5AQNA 4WQ4A 4GY2B 3E1YA 1S22A 3IAYA 3HL8A 3TR8A 3PO5A 3KLFA 4IDHA 2FF6A 4JRQA 4FJKA 3K59A 3THXB 1KQSM 3MCPA 4FZXC 5AQPA 2NRRA 3MECA 3BGRA 4GV9A 2QWRA 1N5YA 1SZ2A 2ASOA 4CZLA 3EO3A 4Y1DA 4CJ5A 3KVGA 2HNDA 1TVRA 4JI1K 2OZMA 3T1HK 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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