2AA4A

Crystal structure of escherichia coli putative n-acetylmannosamine kinase, new york structural genomics consortium
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
289
structure length
289
Chain Sequence
MTTLAIDIGGTKLAAALIGADGQIRDRRELPTPASQTPEALRDALSALVSPLQAHAQRVAIASTGIIRDGSLLALNPHNLGGLLHFPLVKTLEQLTNLPTIAINDAQAAAWAEFQALDGDITDMVFITVSTGVGGGVVSGCKLLTGPGGLAGHIGHTLADPHGPVCGCGRTGCVEAIASGRGIAAAAQGELAGADAKTIFTRAGQGDEQAQQLIHRSARTLARLIADIKATTDCQCVVVGGSVGLAEGYLALVETYLAQEPAAFHVDLLAAHYRHDAGLLGAALLAQGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Putative N-acetylmannosamine kinase
publication title Crystal Structure of Escherichia Coli Putative N-Acetylmannosamine Kinase
rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 85
structure length 289
sequence length 289
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2005-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2aa4A01
3VF6A 4K42A 2YHXA 4BRKA 2P9NB 3KZBA 4H5TA 4MO5A 5AQHA 5AQLA 2IVNA 2PAVA 3VEOA 5F0XA 3FFKB 4BR9A 4NO7A 1G99A 1DEJA 5KPRA 3AY9A 3WXJA 3R8EA 3O8MA 3RSEB 2BUPA 2QWPA 1ATRA 4IJNA 1HJOA 2A41A 3A8YA 3RSEA 1GLEG 1BO5O 1BDGA 1R59O 4B1ZA 1S3XA 4BROA 1X3MA 3QFPA 4LC9B 1LCUA 3A0IX 5AQJA 5KQDA 2KHOA 2E2PA 3MCPA 3VGLA 2HF3A 4Y0WA 3I8BA 3TU5A 5BRDA 1QZ6A 1DGKN 3VEWA 2CGLA 4FOEA 1WOQA 5AQVA 3LDPA 1HX1A 3BEXA 2GUPA 5AQIA 3DXMA 4B1YB 3H3OB 2A40A 1NGIA 4BR7A 3H46O 1NBWA 3GE1A 3CETA 1ZXOA 2F9WA 3EKUA 3BF1A 4XH4A 4FL9A 4RTFD 4BRFA 1U6ZA 1GLFO 5AQTA 2ASPA 2P9PB 2FSJA 3CJ9A 3LM9A 4K41A 4BRNA 4BGAA 3HI0A 2P9PA 4CZJA 2YCHA 3A5OC 4JAXA 1C0GA 1HKBA 4MLEA 2UYTA 4JNEA 3CQXA 4BRHA 2FF6A 1KAYA 3CERA 2E88A 3WQTA 2P9UA 3AAPA 1YAGA 4HWIA 5AQSA 4BRMA 4QS7A 1GLBG 2AA4A 2V7YA 1IG8A 3QBWA 1BG3A 4JN4A 1TYQB 3VEVA 1KAZA 2A6AA 3VGMA 4BR5A 1BU6O 5AFUA 5KQ8A 3HM8A 2Q97A 3C0BA 1TYQA 4HTLA 3ENOA 3VGKA 5AQNA 5JLFA 3SJHA 3FZHA 5AQUA 3L0QA 2V51B 5EXWA 1K8KB 1YVNA 3GBTA 3JS6A 2GWJA 1S22A 3FE1A 1K8KA 4DQ8A 4A62A 5AQRA 3L6QA 3LDNA 3H3NO 5AQGA 3CHWA 2Q1NA 3R9PA 1ATNA 2QWMA 2CH5A 5AR0A 2YI1A 1OKJA 3H1VX 4BC5A 3UKUB 2GELA 3VOVA 4BC3A 2VCPA 2E8AA 4AM6A 4BRAA 5BPNA 3R6MA 3UKUA 2E1YA 4E1JA 2D1KA 4YDUC 1J6ZA 2Q0RA 2GWKA 3LDQA 4FWQA 5AQPA 2QWRA 5I9EB 3FZLA 1T6DA 3VETA 5JLHA 1GLAG 5F1XA 4F9OA 5BRFA 1TUUA 4CD3A 3FZFA 4BRQA 1KAXA 2QXLA 3IUCA 4YDUA 4B1VA 1HKCA 3QMLA 1BOTO 3VEXA 1P8ZA 4PKIA 2P9SA 1QHAA 4FWKA 3SLCA 1NGFA 3O1WA 2Q36A 3EN9A 1ATSA 2P9NA 2YHWA 4BR4A 3B8AX 4QS9A 4C23A 4FWNA 3ZX2A 5ADXA 1Y64A 4A2BA 2OANA 2QWOA 5AQQA 3SMSA 3IMXA 4I6MB 3CJAA 1H1VA 3O08A 3VERA 1NLVA 4QS8A 4B9QA 1NGJA 2ITMA 1RDWX 1T6CA 3EL2A 2CGJA 5AQXA 2GTDA 3WT0A 3VF2A 2J4RA 3VESA 3ID8A 3ZX3A 2ZGYA 4H03B 4GY2B 1JCGA 4NB4A 2Q2RA 2ZWHA 3D7EO 1Q18A 2ASOA 4BRGA 3GL1A 4A61A 2D4WA 4IO8A 4BG8A 4CBXA 2WUSA 3GG4A 3BP8A 5B8HA 1SQKA 3GDQA 4JHDB 1NGGA 3HZ6A 3MDQA 2W41A 5E84A 5AZIB 3MN7A 4FWLA 4JHDA 2A3ZA 2QWLA 4O5FA 1NGDA 4BC4A 4EIAA 4ISGA 1ESVA 2ZF5O 2P9LB 5LJVA 5LJWA 2D0PA 2I7PA 3QBXA 2P9LA 4BR2A 3EO3A 3LM2A 4CZHA 4RWTA 3DXKB 1XUPO 4H5RA 4EFHA 2Q31A 2VYPA 3MK6A 4M7YA 1DKGD 4FWRA 4XH1A 3MMVA 4JD2B 3VPZA 3DXKA 4FWPA 4CZIA 3EZWA 2E1ZA 4BQZA 4K25A 4B1UB 4WYBA 3VF4A 2GEMA 3O5BA 3U4LA 4CZKA 3CIPA 2VWBA 1NGHA 1TUYA 5BPMA 4A2AA 1E4GT 3WXKA 3HBTA 4FWMA 3ATVA 3MN5A 4FSVA 3CJCA 3VEZA 4IZ9A 2AP1A 5AQFA 4FWSA 2NRHA 5F2RA 3WEEB 1MWMA 3WXIA 4FPAA 1BA1A 1NM1A 1NMDA 4DHYA 3KHYA 3WEEA 1V4TA 4CJ7A 3DAWA 5AQWA 1MWKA 1BA0A 2NLXA 3ULEB 1NGCA 1GLLO 1ZBSA 3CQYA 3D2FB 3SK3A 3ULEA 3O6WA 3QDKA 1BWFO 3LL3A 5AFUH 3D2FA 4BREA 2YHYA 2ZGZA 4IXCA 2FSKA 3CJBA 3A5LC 4GNIA 4CZLA 5BN9A 3H1QA 3J8AA 1YXQA 3D2EB 3UE5A 2IIRA 1XC3A 2CGKA 5BPLA 3UB5A 2QWQA 4WQ5A 1C0FA 3I33A 4BG9A 4BRCA 5CE3A 3BUZB 3SMPA 4K43A 5JMVA 5BREA 3M3ZA 3WQUA 1QQOA 3FGUA 1E4FT 2D0OA 2E20A 4H0YB 2YJEA 4H0OA 4BRLA 3FZKA 1SZ2A 4BR0A 1GLCG 1NGBA 3P4IA 3TPQA 5BN8A 5E26A 4H5WA 1BUPA 2P9IB 3LDLA 3H45C 3ZETB 4IJAA 2P9IA 2QW9A 2Q0UA 3QICA 3VEYA 1KXPA 4DCHA 1NGAA 3VENA 3MN6A 4I6MA 1NWKA 2W40A 4EHUA 1HLUA 1X9JA 3OHRA 3C7NB 5AZJB 4MO4A 4CBUA 3QFUA 5FPEA 1MDUB 2IVOA 1EQYA 2E2NA 3GOIA 3U8XA 2PBDA 3C7NA 5AZJA 4BVPA 1LOTB 4WQ4C 3HTVA 3MN9A 3WXLA 5ADXH 4ISFA 2QWNA 3ZX0A 1JCEA 5TKYA 4EHTA 5KPZA 5ELZA 1WUAA 3U9DA 3BF3A 3DWLA 4IWVA 4CI6A 3A5MC 1QZ5A 2FSNA 3AARA 3ATUA 1V4SA 1Z05A 4MLHA 2ASMA 3EKSA 1RGIA 2V52B 4WQ4A 2HF4A 3ZEUB 5AZIA 4J8FA 4BC2A 3FR0A 4BGBA 1X3NA 1IJJA 3ZEUA 1ZC6A 1HPMA 4ISEA 2EWSA 3UKRB 2QM1A 3DXMB 3S41A 5BR9A 1QQNA 1GLJO 3UKRA 4O8KA 4DB3A 1QQMA 4KBOA 3O80A 4RCHA 4CZEA 2E2QA 4H0TB 3FLCO 4JD2A 4Z94A 3M1FA 2HOEA 5EX5A 3HSCA 4CZMA 4PL8A 4PL7A 5AQYA 3DJCA 4H0XB 4H0VB 2DPNA 2HMPA 2FXUA 2I7NA 5KPTA 1MA9B 2CH6A 2IVPA 2A5XA 5FPDA 5EY4A 3L4IA 2E2OA 4XEIA 5JICA 4BQLA 3FZMA 1XQSC 2P9UB 3W0LA 1NGEA 1HUXA 3U9ZA 1RFQA 4H5VA 4BRDA 1HKGA 4B1XB 3KVGA 5EOYA 1GLDG 3O1BA 2F9TA 3M6GA 2FF3B 4H5NA 3IDHA 4WQ5C 4BVOA 5AQMA 4FOIA 2V7ZA 2YJFA 5AQOA 1Z6RA 3O4WA 3IFRA 4M63C 3JXUA 5FPNA 5AQZA 2NZTA 3D2EA 4L3QA 4B1WB 3A5NC 3H6EA 1T44A 4H0PA 1YUWA 4CBWA 3LDOA 4EAHD 3CJ1A 3G25A 3WUHA 4BRIA 4M7XA 4CZFA 4FO0A 3ENHA 3AAQA 5BRHA 2H3GX 3QB0A 1U2VB 4XH5A 4CD1A 3CJ7A 4BRPA 4PKHA 1U2VA 4FPBA 3CI5A 5LY3A 4CZGA 4PKGA 4FWOA 5EVZA 2BTFA 2FLOA 3F9MA 3W3DA 2P9KB 1D4XA 1JCFA 5FPMA 2P9SB 3ZETA 2P9KA 5AQKA 1SAZA 1CZAN 4AM7A 2A42A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BHLA 1WAFA 4GV6A 1VSLA 4BRKA 1X9MA 3KZBA 3CXCM 1GOCA 4MO5A 5AQLA 4KAZA 3QEVA 2PAVA 3FFKB 4U7BA 4BR9A 4RW9A 4XIUA 4DTMA 2G8UA 3AY9A 4ILJA 4GMJB 3VQ7A 1KD1O 1HR0K 2FBXA 1BDGA 3LP1A 1S3XA 4BROA 4RW6A 1LCUA 1Y97A 2E2PA 1QSYA 1RBSA 4CF9A 3KD5E 3LDPA 3SUPA 1QVGM 3OYHA 3VQQA 3CCSN 4CFAA 3CCVN 1LWFA 2F9WA 2PYJA 1J5EK 2O4GA 3BGRA 4FJ7A 3KLFA 5AQTA 1E3MA 2P9PB 1SKRA 3LM9A 4BRNA 1BIUA 4BACA 3HI0A 1WN7A 4LSNA 1C0GA 4CEZA 3O9SA 2OCEA 1HKBA 2E5LK 2UYTA 2E88A 2P9UA 4HWIA 2WBNA 1QSLA 4FW2A 2AA4A 3V9ZA 2ZD1A 5AFUA 3I55N 3L2QA 2G8HA 3HM8A 1NG9A 3KKSA 3OTOK 1TYQA 4KTZA 1VQ9N 3K58A 3V9UA 1KFSA 3SJHA 4E1MA 4YOVA 5AQUA 5EXWA 4ILGB 5E41A 4CE9A 3QEPA 3J7ZO 2GWJA 1S22A 3FE1A 1SKWA 4KH6A 2Q1NA 3L2RA 1ATNA 3P38A 2CH5A 1ITGA 1D9FA 1IH7A 1U48A 3VTIA 3D6RA 4OKEA 4BC5A 4BC3A 3TAMA 2B4JA 3J7YP 4BRAA 3R6MA 2D1KA 4DLEA 5DM7L 3PX0A 3C65A 1J6ZA 3LDQA 5AQPA 4PY5A 1HMVA 4CD3A 1KAXA 2QXLA 2X6NA 3IUCA 4IOXA 4ZTFA 2YKNA 2Z1HA 1BOTO 3VEXA 2PZSA 4KH4A 3MEDA 1Q86O 4LY7A 3SLCA 2Q36A 4E19A 3NHGA 5BR8K 4BR4A 3D45A 3ZX2A 4C23A 5ADXA 1Y64A 3NH0A 4FZXC 4FJ9A 4Z4GA 3O9QA 5AQQA 4E3SA 1RT6A 4CEFA 2G8IA 2OPRA 1WB9A 1IKWA 3ZYYX 1WSHA 4OVLA 3BY5A 3S3MA 4RW8A 1RDWX 4DQPA 1T6CA 4CGHA 1ILYA 3VF2A 4Z4IA 1RT2A 1TK0A 3FFIA 1M90O 1JCGA 1N5YA 3NF7A 1VRUA 4BRGA 3GL1A 2FBVA 4IO8A 3I0RA 2P5GA 1GOAA 4HUGA 1XC9A 1JLAA 5A2QO 4JHDA 4DSEA 3V81A 3SI6A 4DLGA 4ISGA 1NKEA 1S1UA 3QBXA 1EX4A 3LP2A 4EFHA 3MK6A 4XH1A 3DXKA 3LP3A 3QNNA 4M3YA 1DLOA 3EZWA 1S1TA 3QIOA 1VSMA 3ZSRA 1VQ6N 4DF4A 1B9DA 1U45A 1S1VA 2VGMA 3D0PA 4WYBA 1N34K 2GEMA 3O5BA 3CIPA 1NGHA 3P31A 3HBTA 1JL2A 4KHNA 4IG0A 4FSVA 3CJCA 5C2DA 4E1NA 3WEEA 1TL1A 4LF4K 3DAWA 4FM1A 1HNIA 2B6AA 3AO5A 3SK3A 3CQYA 4C1NI 1EKEA 3QDKA 4E7IA 3LL3A 2PY5A 3VA3A 5AFUH 1WAJA 3D2FA 3CJBA 3QEWA 3J81O 3A5LC 2QK9A 1EP4A 3J80O 1YXQA 3J7AP 3RMBA 2HVHA 1TVRA 4WFAL 1L5UA 3O4QA 1RT5A 4JKGB 5CE3A 1ZBUA 4A5AA 3THWB 3BUZB 1HQEA 2O8FA 3OYFA 5BREA 4HCCA 4GVEA 1VQ5N 1FK9A 1RT1A 1IG9A 3N4QA 3WQUA 3DM2A 3HJFA 3Q7BA 4H0OA 1SZ2A 2ETJA 3AVFA 4O0JA 4BR0A 1DTQA 3IG1A 4FLUA 3P4IA 3TPQA 5E26A 2RHKA 1VSEA 3ZETB 4DKWA 3ZT1A 3SQ4A 4B3RK 2HHXA 3OJUA 2Q0UA 3CCLN 3VEYA 4CEEA 3KLIA 3AVKA 5DMRA 3VENA 4EHUA 4FCYA 3C6UA 4CBUA 3VQ5A 3PX6A 4B9NA 4WQ4C 3NF8A 5ADXH 3E9LA 1YHQN 4QCLA 3DRPA 5KPZA 1NK9A 4CF8A 1WUAA 2QKBA 3BF3A 4DTNA 3CCUN 3A5MC 2G8VA 3AARA 4CIGA 4FLVA 4CEBA 1Z05A 3K5NA 2XY5A 1RILA 4CK3A 4WQ4A 4CF1A 2HF4A 2Z1GA 2D0BA 3OBYA 4DV4K 3NGIA 3VMFB 1TAQA 4M41A 4DQRA 5HLFA 1C1CA 3TAEA 3UKRB 2QM1A 4NYNA 3DXMB 5IT9O 1QQNA 3T19A 1GLJO 3QEIA 4M3XA 4PHTX 3O80A 1QSSA 3E9PA 4FYDA 1N32K 2IDOA 5J1EA 4OJRA 2HHWA 3FLCO 2HOEA 5EX5A 4B9VA 4F2RA 5AQYA 4H0XB 4FK4A 3K2PA 2F8SA 2R7YA 5KPTA 1YI2N 4AHSA 2XHBA 4XEIA 4BQLA 3FZMA 1KVAA 4N5SA 1YIJN 1NGEA 4BRDA 1RFQA 4H5VA 3OYEA 1HKGA 2UUAK 3NVKA 4JI8K 5K14A 1QE1A 2F9TA 1L3UA 2O8BA 4ID1A 4E7KA 3DRRA 1ZYQA 4DR3K 4DTRA 2V7ZA 2YJFA 4FLXA 1Z6RA 4F3OA 3O4WA 1JKHA 5I42A 2OPSA 3THXA 3T69A 4Y1DA 4M63C 3CD6N 3JXUA 3ZLJA 2NRRA 5CYQA 5AQZA 4PUOA 2A1SA 1C1AA 3QETA 3A5NC 3H6EA 4CJFA 3SUQA 3V1RA 3LDOA 4DR5K 2VQEK 4KB1A 1NOZA 4YOXA 4CZFA 5C25A 4K8XA 5BRHA 4CJTA 3MEGA 1U2VB 3QB0A 5LL6Z 5M1NA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SMP A;  3WNH A;  4CGI A;  1NJW A;  4CES A;  3THW A;  2DTU A;  1F21 A;  4ILH A;  4B3O A;  1QQO A;  4BY9 C;  4H0Y B;  4FZZ A;  1HNZ K;  3C6A A;  1OH5 A;  1YF5 L;  1S5J A;  5GAH P;  4DQS A;  3OYB A;  2P9I B;  3LDL A;  4M3Z A;  4IJA A;  1WSF A;  3QIC A;  1NK0 A;  4DS5 A;  2UXB K;  2W40 A;  5AZJ B;  4MO4 A;  4CGF A;  3B6O A;  1MDU B;  2IVO A;  2WTU A;  4LSL A;  2E2N A;  3GOI A;  3U8X A;  2PBD A;  5C12 A;  3CPW M;  2HHU A;  2KW4 A;  1RTH A;  1LOT B;  2OPP A;  3MN9 A;  5EU7 A;  3G0Z A;  2QWN A;  3ZX0 A;  4H8K A;  3HRG A;  5TKY A;  4CJ5 A;  2DFE A;  3HT3 A;  1K8A O;  3AVH A;  4CJQ A;  5HRS A;  4I7F A;  4CI6 A;  5DM6 L;  1QZ5 A;  3ATU A;  1FKP A;  3EKS A;  2V52 B;  3EEQ A;  3KJV A;  2Q3S A;  5AZI A;  3LDS A;  3FR0 A;  3T1A A;  4FVU A;  3LAM A;  1ZC6 A;  4ISE A;  2FC0 A;  4CHP A;  3U3Y A;  5CZ2 A;  4IFV A;  2PYL A;  3UKR A;  3SZ2 A;  4CF2 A;  1IBM K;  4YY3 K;  2HHQ A;  2KFZ A;  1UAX A;  3IAY A;  4JV5 K;  1ZBH A;  1VHX A;  4O44 A;  1RTI A;  3L2U A;  3HSC A;  3KKR A;  4CZM A;  4CIE A;  1WSG A;  2QI2 A;  4YFU A;  2IOC A;  3KTQ A;  1N36 K;  3DJC A;  3RR8 A;  3RMC A;  2FXU A;  2I7N A;  3VQE A;  3VQA A;  1VQN N;  2A1R A;  2A5X A;  2FBT A;  5EY4 A;  3W0L A;  2P9U B;  4JI0 K;  1HUX A;  4PA1 A;  3JAM O;  2GV9 A;  4M3W A;  1GLD G;  1T05 A;  1CZB A;  1OH7 A;  1ZBI A;  3M6G A;  1Z25 A;  4IEI A;  3MXI A;  3TI0 A;  1TKT A;  4H5N A;  4WQ5 C;  5GIN A;  3SNN A;  4LFB K;  4FOI A;  5D3G A;  1W0H A;  2BH1 A;  4KHP K;  1WLJ A;  5J2Q A;  4L3Q A;  3G10 A;  1UWB A;  3QIP A;  4H0P A;  4CBW A;  1C0M A;  3LWM A;  2G8K A;  4RW7 A;  2PFU A;  3JSM A;  2BE2 A;  1K73 O;  3G25 A;  4LF6 K;  3ENH A;  3NE6 A;  4FJK A;  4XH5 A;  4A5B A;  1LWC A;  5FDL A;  3CCM N;  3I0S A;  4PKH A;  1G15 A;  1U2V A;  4FPB A;  4B9M A;  3TSQ A;  1YVU A;  5LY3 A;  4NCB A;  3PSI A;  2NRW A;  2Y1I A;  3KK7 A;  5CYM A;  2FLO A;  1NU0 A;  5FPM A;  4RG8 A;  4OX9 K;  1LWE A;  1HYZ A;  3V9S A;  3C6T A;  3ZSX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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