3VEXA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz h14n variant in complex with carbamoyl adenylate intermediate
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
MRVLGLNGWPRDFNDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
molecule tags Transferase
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 193
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vexA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vexA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vexA03
5ADXH 4J8FA 2P9SA 1NMDA 3QMLA 1BWFO 3WEEA 5KPTA 3EKSA 3WUHA 1NGBA 3SMSA 4MO5A 3R9PA 5EOYA 3RSEA 2CH6A 3BF3A 4BR5A 2QXLA 2E20A 4CZJA 2QW9A 3ENHA 1MWMA 5JMVA 3D2FA 3LDNA 3UKUB 1IG8A 2P9KB 1NGDA 4H0YB 3WQTA 4CJ7A 2BTFA 3R8EA 3VESA 4AM7A 2E1ZA 5FPNA 3O4WA 2AP1A 3FZKA 1V4SA 4K43A 2QM1A 2YHYA 1Z05A 5ELZA 3VETA 2PBDA 3LL3A 4H5NA 4CZMA 5BR9A 3QBWA 2P9KA 1IJJA 4BQZA 2HMPA 2ZF5O 1QQNA 5AZIA 4BRQA 3C7NB 3CJAA 2VWBA 2E8AA 3MK6A 2YJEA 3VGLA 1HJOA 2ASMA 4H0OA 4JAXA 5AQXA 4CBWA 3L4IA 3TSPA 5AQQA 2H3GX 4BR4A 3VEYA 3TSUA 2FSKA 4L3QA 4BGAA 3JS6A 1LCUA 3C7NA 4FOIA 4CZFA 3KVGA 3W3DA 3ULEA 1P8ZA 4H03B 3GE1A 4BREA 4BVOA 5BPNA 1GLBG 1T6CA 4BR9A 4CZLA 2A5XA 5AFUH 4FOEA 1TUUA 4IJAA 3FLCO 3U4LA 5CE3A 2Q31A 3H6EA 3U9DA 1YAGA 4WQ5A 3MN6A 1C0GA 1S22A 3FZFA 4DB3A 5KPRA 4FWKA 1TUYA 2E2QA 3U8XA 3TTCA 3DWLA 3CJBA 2IIRA 4O8KA 1G99A 3CI5A 3WXJA 1T6DA 3DJCA 4FWLA 3VOVA 5LY3A 1BA1A 5AQSA 3S41A 1MDUB 1Q18A 4GY2B 5JICA 1D4XA 2WUSA 2V7YA 5AQRA 2F9TA 3MCPA 5KQ8A 4IZ9A 3HSCA 4B9QA 3GBTA 1DKGD 3TTDA 2YHWA 4JNEA 3KHYA 1NLVA 3GL1A 2P9LB 4PKIA 4EIAA 3TPQA 2V52B 3P4IA 3JXUA 4JHDB 1HKGA 1NGFA 4MLEA 2Q1NA 2Q0UA 4XEIA 5LJWA 3IFRA 4WYBA 3GDQA 3ZX0A 5BPLA 2YI1A 2HF4A 2P9IA 3DAWA 3UB5A 3DXKA 2ASPA 4B1YB 3SJHA 3ZX2A 4B1UB 3C0BA 1KAZA 2FSJA 3I8BA 1EQYA 2I7PA 3OHRA 4K25A 4JN4A 1QQOA 4RTFD 3WT0A 3VEOA 2FXUA 4DQ8A 3LDQA 5EVZA 3EL2A 1YUWA 5AZJA 1Y64A 2E88A 2GELA 5EX5A 3EKUA 4BRPA 3CQYA 3A5MC 4WQ4C 3MN7A 4CZHA 3VEVA 2VCPA 4BRFA 4YDUC 1QHAA 1GLAG 3O5BA 1QZ6A 4FL9A 1V4TA 1NGHA 2HF3A 3KZBA 3CERA 3O80A 5BPMA 3EN9A 3DXMA 1NGEA 1XQSC 1ATRA 3O1BA 3QB0A 3WXLA 2A41A 1HX1A 3HTVA 4A61A 4CZKA 3ID8A 1OKJA 4CZEA 4HTLA 1GLDG 2QWPA 1QQMA 3FZHA 4BRLA 2CGLA 2P9PB 2E2NA 4H0PA 4CZGA 5LJVA 2FLOA 1RGIA 3BP8A 5AQGA 5ADXA 3UKUA 5AQIA 4FWPA 4E1JA 3CJ1A 4H5VA 3UE5A 5BN9A 1DEJA 1R59O 2Q36A 2FF6A 2F9WA 3UKRB 2IVPA 4BR7A 4BROA 4LC9B 2P9UB 1WOQA 3VENA 2A40A 2KHOA 5BREA 1HKCA 2ZGYA 1GLJO 2GEMA 2GWKA 3HBTA 1HUXA 3M6GA 3FR0A 3TU5A 3LDOA 2P9NB 3VF2A 4BRKA 3D2EB 5AQTA 2V51B 2FF3B 3ZEUB 3A0IX 2A3ZA 1T44A 1Z6RA 2QWOA 1KAYA 2E2OA 4CD3A 3MN9A 3QICA 4BRAA 5AQUA 3TTFA 2D4WA 4H5TA 3ZX3A 1YXQA 4ISGA 4B1ZA 3VEZA 5AQHA 3CIPA 5AFUA 5I9EB 3VF4A 1BO5O 1XC3A 1SZ2A 5FPEA 5F1XA 4RCHA 5AQNA 1MWKA 4M63C 4FWNA 5E84A 3H1VX 4I6MB 4CBUA 1X9JA 3G25A 4H0VB 3SK3A 2IVNA 3ZETB 2QWMA 4QS8A 4YDUA 3U9ZA 3WXIA 5F0XA 4XH1A 3BF1A 4H0TB 1BUPA 2PAVA 3H46O 5AQFA 1GLLO 4BG9A 2IVOA 2P9LA 3SLCA 3MMVA 4FSVA 1NGCA 4FWQA 2A42A 5KPZA 3QDKA 1ATNA 1YVNA 3GG4A 3J8AA 4JHDA 1DGKN 5FPDA 4EHUA 4B1WB 1X3NA 2NRHA 4IXCA 1K8KB 3VF6A 3A8YA 5AQVA 1JCEA 2E2PA 2Q2RA 3VERA 4ISEA 5AQLA 2V7ZA 4C23A 3FZMA 1ESVA 2Q97A 3VGMA 3CHWA 2EWSA 4FWSA 3CJ9A 5AQMA 5B8HA 4WQ5C 4FPAA 5BRFA 2YHXA 2ZGZA 1QZ5A 4NB4A 3O08A 5AQOA 1HLUA 2YJFA 2DPNA 4PL7A 3ATVA 1RDWX 4MLHA 4BGBA 4NO7A 3A5OC 1BU6O 3H45C 3CQXA 5TKYA 1TYQB 3QFPA 5AQPA 2CGKA 3A5LC 3ENOA 2CGJA 1U6ZA 1GLEG 3M3ZA 4BC4A 5AR0A 5AQKA 2NLXA 3CJ7A 3HZ6A 4EAHD 1GLCG 3F9MA 4K41A 3WEEB 3R6MA 3H3NO 4Y0WA 4DCHA 1S3XA 3ATUA 3SMPA 1TYQA 3RSEB 3BUZB 3M1FA 3MDQA 4A2BA 4CZIA 1CZAN 5E26A 1ZXOA 3D2FB 1NGIA 2BUPA 1KXPA 5AQJA 4QS9A 1H1VA 5BN8A 2P9PA 3VEWA 3BEXA 4B1XB 2J4RA 5AQWA 3GOIA 5JLFA 4PL8A 4HWIA 2D0OA 5AZIB 1J6ZA 4BRIA 3QFUA 2W41A 1BOTO 5KQDA 3I33A 4H5WA 4BC5A 3UKRA 3AAQA 3AY9A 4H0XB 2OANA 1BA0A 4H5RA 3TSQA 1E4GT 2FSNA 2P9UA 3EO3A 3ULEB 1X3MA 4B1VA 2W40A 4FO0A 3AAPA 3FGUA 3VGKA 3VTHA 4A62A 1NM1A 3LDLA 3HM8A 4DHYA 3AARA 4ISFA 2E1YA 2P9NA 4PKHA 1RFQA 3D2EA 1U2VB 4BR0A 5EY4A 4GNIA 4XH5A 3ZEUA 1ATSA 3WXKA 3CETA 3QBXA 3W0LA 4CBXA 1SAZA 4BRDA 2D1KA 3O8MA 4BC2A 4KBOA 3IMXA 3VPZA 1JCGA 1XUPO 2Q0RA 3LM2A 3CJCA 1U2VA 3H3OB 4FWMA 2ASOA 1BG3A 2ZWHA 1NGAA 4FPBA 2CH5A 3A5NC 3H1QA 1KAXA 3FE1A 4BRMA 4WQ4A 3EZWA 2VYPA 4BR2A 2NZTA 3LM9A 2A6AA 1ZC6A 4F9OA 5FPMA 2YCHA 2GWJA 1HPMA 4EFHA 3FZLA 1JCFA 3D7EO 3IDHA 3B8AX 4I6MA 4K42A 4M7XA 1GLFO 3WQUA 4BQLA 3L0QA 3ZETA 4A2AA 3O6WA 4EHTA 3IUCA 4M7YA 5AQZA 4BG8A 4BRHA 2QWNA 2QWQA 4AM6A 4RWTA 2P9IB 1NBWA 2HOEA 1E4FT 1BDGA 4O5FA 3L6QA 5BRDA 2I7NA 3DXKB 5AQYA 2GTDA 3O1WA 2D0PA 4BRGA 1WUAA 1K8KA 3MN5A 4BRCA 4QS7A 1LOTB 1C0FA 1NWKA 5BRHA 4JD2B 2ITMA 3VEXA 3HI0A 4BVPA 5F2RA 2GUPA 1MA9B 1SQKA 4FWRA 4MO4A 2AA4A 4BRNA 2QWRA 5AZJB 4Z94A 4JD2A 4IWVA 4PKGA 5JLHA 4IO8A 1NGGA 5EXWA 4CI6A 4BC3A 2P9SB 2UYTA 1ZBSA 4FWOA 4XH4A 1NGJA 4CD1A 1HKBA 4IJNA 3DXMB 2QWLA 3FFKB 3LDPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E6LA 3P38A 3QESA 4J8FA 3M8SA 4G1QA 1NMDA 4DUZK 5FRNA 3E1YA 4JK9A 3SMSA 4CJVA 4E7LA 4EP4A 4BR5A 2XO7A 2B4JA 3I0SA 4OGEA 1RBVA 1IBLK 1TL1A 3UKUB 1IG8A 4H0YB 3ENBA 3CXCM 2BTFA 3ZLJA 4AM7A 2E1ZA 3MX2A 5FPNA 1S1WA 1JL2A 2YHYA 2IDOA 5ELZA 1EETA 3AA2A 3LL3A 4DTOA 1NU0A 2P9KA 1JLAA 3ZT1A 1WSHA 1Q81O 2VWBA 5DM7L 5I3UA 1OH6A 1YJNN 4RW9A 1HJOA 5J2NA 4H0OA 4JAXA 5KRSA 4CBWA 4WF9L 3G4SN 3L4IA 3TSPA 5AQQA 4O8UA 1BL3A 4MFBA 3JAMO 2FSKA 4DSKA 5C25A 3KVGA 3DOLA 4K0KK 1P8ZA 4H03B 5BPNA 1GLBG 2XY7A 3LZIA 4PHTX 1TUUA 1C0TA 4IJAA 3L2WA 5CE3A 1NJWA 1L3TA 3V9ZA 3FZFA 1TUYA 1D9FA 3U8XA 3G71N 4CGJA 2EQAA 3DWLA 4YORA 2IIRA 4O8KA 3NE6A 3WXJA 3DJCA 5LY3A 3E9OA 1BA1A 5AQSA 2BE2A 1LAVA 1S9GA 2V7YA 4DTJA 2QA4N 4P6CA 2F9TA 3PO4A 4IZ9A 4CF0A 3LWMA 2VG7A 4CJ3A 4PKIA 5GAHP 4GVEA 4DFMA 3P4IA 3JXUA 3OJUA 4JHDB 1HKGA 2Q1NA 2FBXA 4XEIA 2E4LA 4AILC 3OYFA 2YI1A 1GOAA 3DAWA 4CJPA 4JI1K 3TR8A 1B9FA 2BGGA 2X74A 4B1YB 4FK0A 1EQYA 2I7PA 4CEDA 4PQUA 4K25A 4RTFD 3WT0A 3LPUA 4W5QA 1K9MO 4C8LA 3VQ5A 2FXUA 4DQ8A 4KV8A 5EVZA 3OY9A 4KHSA 1FKPA 2HHVA 1YUWA 2E88A 3M8RA 4J2BA 2F7TA 4ID1A 3MN7A 3SAFA 4FFJA 4B3OA 3K5MA 4IO9L 1C1AA 3ZYYX 3O80A 3KZBA 4QAGA 4Z4GA 1KCFA 4W5OA 4DQIA 1ATRA 4MQ3A 4DTXA 3JYTA 4CZEA 1XMOK 3J7AP 1IO2A 1GLDG 3PV8A 1K4LA 1G58A 3F9KA 4WE1A 4N47A 3UKUA 5AQIA 4Z4CA 3V1RA 1DEJA 4M42A 4CEAA 3EYZA 3K9KA 3UKRB 2F9WA 4DR4K 3WNHA 3RRGA 4JI3K 1WBBA 1BIUA 3O9TA 1WOQA 3CMEN 2O4GA 4B08A 1K8AO 1HKCA 1RT4A 3AVIA 2D0AA 4KI4A 2GWKA 4B3MK 5A2QO 4P77A 3HBTA 2O8FB 3DRPA 1OVYA 2YV0X 3SUQA 3M6GA 3FR0A 4PUOA 1S1VA 1YF5L 5CR4A 2XY8A 2OPSA 4BRKA 2KW4A 3O3GA 3ZEUB 1PVYA 1VQ7N 3LS6A 2YKNA 1NNEA 1SS6A 1Z6RA 2QWOA 4FJKA 4CJWA 4Q5VA 4KHQA 3MN9A 4GVMA 1WN7A 4BRAA 1TAQA 4C8MA 3CFPA 2QTDA 3CFOA 1VQ8N 4B1ZA 3PO5A 4F3OA 1NOYA 2O8BB 4OPHA 3NBPA 3CIPA 2G8WA 2HHXA 5I9EB 2O8CB 1S72N 1BO5O 1C6VA 1S1XA 1SZ2A 3QNNA 4H4MA 3U3GA 1X9MA 3L3VA 3LP3A 4I6MB 3J80O 2HHWA 3PIOL 3MECA 3SPZA 2QWMA 3V6DA 1VAZA 3TI0A 5AQFA 3LWLA 1JLBA 3MMVA 4FM1A 4DQRA 4FSVA 4CIFA 4FZYA 3ZT4A 2A42A 2B6AA 4JHDA 5K14A 1JLCA 1DGKN 2PZSA 4EHUA 5LMNK 1K8KB 4DV5K 3A8YA 3ZSWA 4UY8O 2V7ZA 4C23A 4CEZA 2I5JA 3KWGA 3CHWA 2EWSA 3SAHA 4DSFA 4DU4A 3NGZA 3OYJA 3SUPA 1XNRK 2YJFA 2ITGA 4CVNE 3V9XA 4PL7A 5M1QA 3SYZA 5J2MA 3E9LA 1HNWK 4I9QA 1WSGA 3CQXA 3C95A 3A5LC 3ENOA 1WBDA 3J7YP 3EY1A 3M3ZA 2XY5A 1UOCA 1XI1A 3HZ6A 5AJ3K 4N56A 3WEEB 3F9MA 4K41A 4RW7A 1U49A 4DCHA 2O8DA 1S3XA 3ATUA 3KKRA 1K7JA 3RSEB 3BUZB 4DTRA 3AO5A 3MDQA 4A2BA 4YOYA 3RMAA 2RHKA 4M3RA 4C8KA 1H1VA 3RR7A 3AVCA 4ELVA 3AO4A 4B1XB 2VWJA 4Z4FA 4YOWA 3VN5A 1JLFA 4LFAK 1QVGM 4PL8A 3QEVA 4HWIA 3L2QA 5AZIB 4CEOA 5SZTA 2IAJA 4O44A 3ZT0A 4KB1A 2HBLA 4BRIA 1HPZA 4KFBA 4LD0A 4H5WA 1L3SA 4DR6K 4BC5A 3UKRA 4CGGA 4DQPA 3F2KA 1WSEA 3DI6A 5TKWA 2LSNA 2W6KA 1WAFA 4ZHRA 3ULEB 2W40A 3MAQA 2HHSA 4JKAA 4JKGB 3VTHA 2O8FA 4K8ZA 5J2QA 2FC0A 4X64K 1RT1A 2QXFA 3HM8A 4IG0A 2Z1IA 3V1OA 2Z1JA 3NDKA 3ZEUA 1ATSA 3QBXA 2IGIA 1SAZA 4BRDA 2G8KA 4BC2A 1A5WA 2E5LK 5C12A 1ZBFA 1NOZA 5C2FA 1U2VA 3C94A 3CPWM 3DLHA 4FZXC 4FJ5A 2ASOA 3A5NC 4E7IA 3FE1A 5C2DA 2YX6A 4A5AA 5FROA 2O8BA 4Z4HA 1JLGA 1ZC6A 1VSEA 2O8CA 4M3ZA 2MX1A 1TGOA 4EFHA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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