3VEXA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz h14n variant in complex with carbamoyl adenylate intermediate
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
MRVLGLNGWPRDFNDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule tags Transferase
total genus 193
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vexA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vexA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vexA03
4BRCA 3LDOA 5ELZA 4PKHA 2A3ZA 1HX1A 2FF3B 4JHDB 2P9SA 1GLBG 1XC3A 3VGLA 3KZBA 1X3NA 4HTLA 2ZGZA 3FZMA 4H0VB 3VEWA 2HF4A 3FZKA 5AQMA 3ATUA 3D2FA 4I6MB 2Q2RA 4M63C 4EFHA 4FWLA 3D2EA 4BRQA 1MDUB 1HJOA 4KBOA 2F9WA 4QS9A 3FZHA 5JLFA 2WUSA 2P9KB 4BC3A 1QZ6A 1NGEA 4FPBA 3CETA 2YI1A 1SZ2A 5ADXA 1KAYA 3GG4A 3H1QA 3VEXA 4XEIA 1R59O 4IZ9A 3A5OC 3H45C 3ZX0A 1BDGA 2AA4A 1ATRA 5JICA 3S41A 1NWKA 4JD2A 4BRPA 3WQUA 4F9OA 2YJFA 5AQPA 1HKBA 3LDNA 3FGUA 4E1JA 3RSEB 1MWKA 5EVZA 3VPZA 5AZJB 1RGIA 2P9PB 3QBWA 2FF6A 1LOTB 3LM9A 4H0XB 3R8EA 1YUWA 2PAVA 4JNEA 2D1KA 4CZKA 4DCHA 4IO8A 3VEYA 5F1XA 4FSVA 4BR7A 5JMVA 2EWSA 3O6WA 2H3GX 4L3QA 5AQUA 1K8KA 1QQOA 2A5XA 2QWPA 2V7YA 3DXKB 1K8KB 3VENA 4CZJA 2ASPA 3TTFA 2E88A 3BEXA 4A62A 3QMLA 1ATNA 3U8XA 4ISFA 5FPEA 3G25A 3WT0A 1BG3A 4A2AA 5KQ8A 4IWVA 3LDLA 3L6QA 3UB5A 3VESA 1G99A 4PKIA 2CGJA 5AQXA 4XH5A 4B1ZA 4K42A 3CJ7A 1BO5O 5BRFA 1QHAA 3VEOA 1ZBSA 4BGBA 2Q0RA 2NRHA 4CZIA 2E1ZA 4CJ7A 2FSNA 3L4IA 5BN8A 4H5VA 2YJEA 4GY2B 1T6CA 1TYQB 5LY3A 4Y0WA 2D4WA 4AM7A 4B1WB 1BA0A 3LL3A 3O5BA 1LCUA 2YCHA 1KAXA 1Q18A 1ZC6A 1WOQA 4K25A 4MLHA 1T44A 3MN6A 1HPMA 4H5TA 2DPNA 5AQRA 3DWLA 3TSQA 3TPQA 3WEEB 3LDQA 3CQYA 1JCFA 1NMDA 2NZTA 4FWSA 3WXIA 3FE1A 4IJAA 3WXKA 3B8AX 1Y64A 4QS7A 5KQDA 5EX5A 3CJ9A 1HLUA 3CJ1A 5KPRA 3H46O 2QWMA 1E4GT 4BR5A 2E2NA 3EKUA 4H0YB 3H3NO 4JHDA 3CHWA 3KHYA 3TTCA 2QWRA 3HI0A 3O08A 3BF3A 3MDQA 4K41A 4CBUA 2IVNA 1GLCG 3IUCA 2CH6A 2P9UB 2KHOA 3MN7A 1BWFO 4BRDA 5F2RA 4B1YB 3EZWA 4I6MA 3VERA 2QWOA 3AAQA 1TUUA 2V52B 3WXJA 4FWMA 2V51B 5KPZA 3CQXA 3GL1A 3ZEUB 3TSPA 4CZLA 1ZXOA 2FLOA 2GEMA 2QWLA 5KPTA 2P9KA 3CJBA 3SLCA 2E2OA 3ZX2A 4H03B 4BGAA 2ZWHA 1YAGA 2QM1A 4WQ4C 1D4XA 4CZEA 4HWIA 3TTDA 5F0XA 5ADXH 5CE3A 1IJJA 3SK3A 3DXMB 2P9LB 4JAXA 5AQHA 5AQIA 1E4FT 2YHWA 2QWQA 4BROA 3U4LA 1NGCA 3TSUA 3VETA 4A2BA 3ATVA 4BRIA 1V4SA 1RDWX 3A0IX 1U2VB 1BU6O 2VWBA 3H6EA 3RSEA 4FOEA 5AZIB 1QQNA 3FR0A 5BRHA 2J4RA 5AZJA 1NGFA 3M1FA 2P9PA 1QZ5A 1X3MA 4BRMA 2Q36A 5I9EB 3MN5A 3SMPA 4DB3A 2GWJA 1JCGA 1QQMA 2GUPA 2W41A 3C0BA 2ZF5O 3H3OB 4BRKA 5AQOA 5BPLA 4BC4A 3DXKA 3QBXA 4RWTA 2HMPA 5JLHA 3A5LC 4BVOA 3AY9A 4B1XB 4QS8A 3ULEA 4A61A 3ULEB 2D0OA 1DGKN 4ISEA 3O1BA 3MMVA 4BQLA 3JS6A 2E1YA 2GWKA 3QICA 3VGMA 2HOEA 4B1VA 1GLAG 1MA9B 2IVPA 1NLVA 4RTFD 4BRHA 1BA1A 2A42A 1HUXA 4FL9A 4BR0A 1XUPO 3I8BA 1TYQA 2ASOA 1H1VA 2E2PA 1TUYA 4PL8A 4BC2A 3HM8A 3EKSA 4IXCA 5BREA 4NB4A 3ZETA 2P9NB 1S3XA 2UYTA 4CD3A 2A41A 3ZETB 3UKUB 1NGDA 2QWNA 5AQLA 1BUPA 3WEEA 3EL2A 4K43A 3A8YA 3UKRA 4MLEA 3UKRB 1OKJA 1S22A 3QDKA 2D0PA 2HF3A 4BRGA 4BRFA 5FPDA 4B1UB 3HBTA 3WQTA 3LM2A 1HKCA 1YXQA 1NGJA 5FPMA 4FWPA 4BRLA 4Z94A 4WQ5C 1RFQA 3JXUA 1NBWA 3M3ZA 4BR4A 2I7NA 3BF1A 1BOTO 3A5MC 1GLEG 2GTDA 2Q31A 2Q1NA 1U6ZA 2W40A 3EN9A 4BG8A 4EHUA 1HKGA 3FZFA 1ATSA 5AQSA 3IDHA 2BUPA 2P9UA 4H0OA 3AARA 3VGKA 5AQNA 4RCHA 4H5RA 3C7NB 5AQZA 3VOVA 1SQKA 2P9IB 3W0LA 3EO3A 3ZEUA 5AR0A 5B8HA 1J6ZA 4H0TB 1CZAN 2IVOA 3MN9A 3VF6A 4C23A 2E20A 5AQTA 4WQ4A 2IIRA 1MWMA 3F9MA 5EOYA 3GE1A 4CZHA 3KVGA 2NLXA 5AQFA 1IG8A 5LJWA 1C0FA 4YDUC 3WUHA 5BPNA 2QXLA 1X9JA 4XH4A 4BRNA 1NGBA 5FPNA 5AQWA 3GDQA 2P9SB 3O4WA 4BVPA 1NGGA 3DXMA 2P9LA 3CIPA 5AQQA 3MCPA 1C0GA 1JCEA 4FWKA 5BR9A 3D2FB 4FO0A 5E26A 4PKGA 2FXUA 4CZGA 3D2EB 1U2VA 2PBDA 3SMSA 2CGLA 4BG9A 3IMXA 1NGIA 3BP8A 4JN4A 2I7PA 5AZIA 1Z6RA 2YHYA 2Q0UA 3A5NC 1Z05A 3FZLA 4LC9B 4B9QA 4PL7A 1KXPA 2V7ZA 4H0PA 3O8MA 1T6DA 5AQVA 1EQYA 4BR2A 5AQYA 4IJNA 3U9DA 4M7YA 5BRDA 3LDPA 4O8KA 4M7XA 3CJCA 3TU5A 5EXWA 3VTHA 2FSKA 2QW9A 3CERA 3FFKB 2YHXA 3ENOA 4JD2B 3BUZB 4NO7A 4J8FA 3ENHA 3O1WA 1ESVA 3DAWA 4FWOA 5LJVA 4CBXA 3R6MA 5AQGA 3W3DA 4EIAA 3M6GA 3UE5A 4AM6A 4WYBA 4DQ8A 3HZ6A 4FPAA 3R9PA 5BPMA 3HSCA 2FSJA 4O5FA 4FWNA 5EY4A 4ISGA 3VEVA 3P4IA 3QFUA 1KAZA 3VEZA 2AP1A 3L0QA 4BREA 3GOIA 1SAZA 2VYPA 1NGHA 4CZFA 1NGAA 2GELA 4EHTA 2VCPA 2ITMA 2A40A 3IFRA 5TKYA 5AQJA 3H1VX 2P9NA 4FWRA 2A6AA 3WXLA 1P8ZA 2OANA 3UKUA 3CJAA 4H5WA 1V4TA 5BN9A 2CGKA 1DKGD 3QB0A 3SJHA 4FWQA 3D7EO 2E8AA 5E84A 3FLCO 2F9TA 3J8AA 5AQKA 4WQ5A 2ASMA 4MO4A 3AAPA 1GLDG 1NM1A 3ID8A 5AFUH 4CZMA 3VF4A 4CBWA 1GLFO 1WUAA 5AFUA 3VF2A 3MK6A 1GLJO 1GLLO 2ZGYA 1YVNA 4EAHD 1XQSC 4MO5A 3HTVA 3O80A 3U9ZA 4FOIA 4BQZA 4BC5A 4CI6A 1DEJA 2Q97A 4GNIA 4XH1A 4BRAA 3C7NA 2E2QA 2P9IA 2CH5A 3OHRA 4DHYA 2BTFA 4YDUA 3CI5A 3QFPA 4H5NA 3I33A 3DJCA 4BR9A 4CD1A 3ZX3A 3GBTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WFNL 4CFDA 5C15A 2ETJA 2D0CA 4LF7K 3F73A 1G57A 1L3VA 4X64K 2R7YA 1KCFA 1VSKA 3VGLA 1X3NA 3I0SA 1ASWA 3LP3A 2X78A 3CFOA 3FZMA 1ILYA 1ASUA 1LW2A 2OTJN 4IOCL 4DV0K 2KFNA 1MDUB 4OVLA 1KTQA 4KO0A 4QS9A 2HBKA 2WUSA 4CEDA 3TAGA 3CETA 1OH6A 4P8EA 1K4IA 3RR8A 4J2AA 3VEXA 4NLBA 3S41A 1ZBLA 1F21A 2YJFA 4DQQA 1WAJA 1IKXA 3NE6A 3NGIA 1EX4A 1T3VA 4RW6A 4O0IA 1T05A 3U3YA 3T19A 2OZSA 4PWDA 1VSJA 3KWGA 5M1FA 3QBWA 1A5WA 3CG7A 4ZTJA 3K5OA 3AA5X 1YUWA 2D1KA 4CZKA 3QIPA 3NVMA 5F1XA 4FJMA 4BR7A 2EWSA 5KGXA 1NK5A 1QVFM 4DR1K 4L3QA 3B6OA 3DXKB 1K8KB 2YKNA 3KLHA 1NOZA 3BEXA 3J7YP 1BHLA 3U8XA 3OVNA 1T7PA 1WSGA 4BE2A 1NK6A 3EE8A 4JK9A 4A2AA 2O8DA 4IWVA 4LF5K 2O4GA 4I14A 4FVMA 3RRGA 2CGJA 4CE9A 3OYLA 5M1NA 4JYAK 5AQXA 1UA1A 5BRFA 4FLYA 1TAQA 4CJ5A 1ZBSA 4DS5A 1S1WA 2Q0RA 2NRHA 2E1ZA 5HRRA 3QESA 5C0YA 2YJEA 2F8TA 1TYQB 5LY3A 3LDSA 2D4WA 1KRPA 1BA0A 3CXCM 1K4OA 4HUGA 1YHQN 3TR8A 4F3TA 2YCHA 1KAXA 1Q18A 4OJRA 1HR0K 4N5SA 4H5TA 3V9XA 2DPNA 4FZZA 5AQRA 1S6QA 4FLZA 2ZE2A 1TKDA 1RBSA 3OYKA 2F8SA 4IEIA 4FFJA 2NZTA 4FWSA 3T1HK 1DTTA 2O8CA 1QSLA 4YNQA 3FE1A 1SNNA 3IRXA 2E4LA 4LFBK 4KTWA 3WXKA 5KQDA 1BIUA 5EX5A 1K6YA 5KPRA 4NXMK 1U45A 3PIOL 1BCMA 3KHYA 3O08A 3HJFA 4J2BA 2PYLA 2IVNA 4JKAA 3MN7A 3CCSN 3CM6A 5F2RA 3IS9A 5JS1A 3VERA 4DV1K 5GIOA 5FDLA 3AAQA 1RDAA 3CQXA 4CJUA 3DM2A 3OYEA 1NG9A 3HT3A 1VK0A 1ZXOA 4OKEA 2GEMA 2QWLA 5CZ2A 3AVJA 4DSFA 1O1WA 3ZX2A 4FZXC 2G8FA 4KH6A 4J2DA 4PY5A 3VMFB 3L2VA 1VQ6N 2RF2A 2P9LB 4JI3K 4CJKA 1E4FT 2QWQA 4B9UA 3ATVA 4KB0A 2HHXA 3OYGA 5CYQA 1REVA 5DMRA 3KK3A 3K57A 1VSFA 3RSEA 3JYTA 3CCRN 3VQ8A 2HB5A 3HP9A 2P9PA 3QLHA 4LH5A 2O4IA 1X3MA 1C1CA 5I9EB 3MGZA 3SMPA 2GWJA 2W41A 2GBZA 2GUPA 1QSSA 2HHWA 5BPLA 2JWKA 4OGEA 4RWTA 4U67L 4CJPA 4HHTA 4LSNA 4JKDA 4FW2A 2B6AA 4CJTA 4IOAL 1DGKN 1RT7A 3DOLA 1K4PA 3NF9A 2HBLA 3M5RA 4BQLA 4FK0A 1HYVA 4B1VA 3MXMA 4RW4A 4O44A 4A5AA 4RW8A 4DLGA 3J7ZO 3OS0A 3PO4A 1NLVA 3RTVA 4M3XA 4WFAL 3AO1A 1IV0A 4P6CA 3AGKA 3NF7A 3AVLA 3M8RA 4FJHA 1TUYA 2HHVA 4PL8A 3G4SN 4ZTFA 1TL3A 1JXBA 3EKSA 5BREA 2E6LA 3OS2A 1S3XA 4CD3A 2A41A 4B9NA 3ZETB 2RIUA 2BGGA 5AQLA 1SKWA 4CF1A 3OYCA 3WEEA 4DLEA 1N6QA 4HUFA 2O8BB 5C2DA 3OJUA 1S1XA 5DM6L 4B1UB 4Q0BA 5M1QA 1TKZA 1YXQA 3ZSRA 4HTUA 4OX9K 2O8EA 1BQNA 3KK2A 3M3ZA 4JRQA 3G0ZA 3BF1A 4CF8A 1JXEA 2Q1NA 4CVNE 2W40A 1ATSA 3THXB 1NK9A 3PSIA 4Z4IA 4FJNA 3AARA 2YHAA 4DSEA 3VOVA 2ZJQL 3T69A 4CEEA 1L3SA 3EO3A 4DQIA 4H8KA 3VF6A 4RW9A 4C23A 4JS4A 5AQTA 1C1AA 3MEGA 3AVHA 3OW2M 3GE1A 4H4MA 2HNDA 5LJWA 1X9JA 1LAWA 4KB1A 3HP6A 2W6LA 3DRSA 3ZSVA 3CIPA 5AQQA 1Q8IA 4A5BA 3OYFA 5JVHL 5E26A 1SL2A 4CZGA 4JI7K 4JI6K 3IMXA 5EU7A 2I7PA 3CMAN 3OA9A 2Q0UA 3DI6A 4IDHA 1K9MO 4QCLA 4KTQA 3LP0A 3TAFA 4CGDA 4BR2A 4Z4GA 4GKKK 5AQYA 4IJNA 1VSIA 4O4GA 4RG8A 3SV4A 1FW6A 3LDPA 4JKFA 3DLKA 4AHRA 2QA4N 3TU5A 3VTHA 4P8JA 2QEXN 2YHXA 3ENOA 3ZSYA 3BUZB 3SUQA 4DTRA 3ENHA 3O1WA 2RPIA 4FWOA 3SZ2A 3LPUA 3HL8A 4EIAA 1RDCA 1U4BA 3M6GA 2PFUA 4WYBA 4DQ8A 1RTDA 4DSKA 4JV5K 4FPAA 3U3GA 5BPMA 3O4NA 4O5FA 1U04A 5TKWA 1J9AA 3V1OA 1TAUA 3VEZA 2AP1A 1N34K 4OLBA 3O3GA 2X6SA 4JKGA 1SAZA 1NGAA 4EHTA 4CFAA 2VCPA 5C12A 1CLQA 1RILA 4JK8A 3NFAA 4B3TK 3L2QA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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