3BF1A

Type iii pantothenate kinase from thermotoga maritima complexed with pantothenate and adp
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
MDPMYLLVDVGNTHSVFSITEDGKTFRRWRLSTGVFQTEDELFSHLHPLLGDAMREIKGIGVASVVPTQNTVIERFSQKYFHISPIWVKAKNGCVKWNVKNPSEVGADRVANVVAFVKEYGKNGIIIDMGTATTVDLVVNGSYEGGAILPGFFMMVHSLFRGTAKLPLVEVKPADFVVGKDTEENIRLGVVNGSVYALEGIIGRIKEVYGDLPVVLTGGQSKIVKDMIKHEIFDEDLTIKGVYHFCFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate binding and the catalytic mechanism of type III pantothenate kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 73
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2007-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf1A01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf1A02
3WXLA 4BRFA 5AZJA 4ISGA 4H5NA 1K8KB 3L4IA 5BRHA 5JLHA 2NZTA 3TPQA 3GG4A 3VEWA 3VF6A 1KAYA 2NRHA 4FWMA 3HBTA 2A41A 4BRHA 1BU6O 3EKUA 5FPNA 3ZX0A 3FZMA 4H0VB 3VEXA 1QZ6A 4FOEA 3DXKB 4CZGA 2IVOA 4CZLA 4IJNA 3LDPA 5AQZA 2FF6A 1GLBG 3QICA 3D2EB 2E2NA 5AQHA 4H0OA 3FZFA 3KVGA 1YXQA 2E1YA 4BRIA 3EL2A 2GELA 2NLXA 3BF1A 2UYTA 3DAWA 4IO8A 3O5BA 4M7YA 4BR4A 3VGMA 4H5WA 1NGHA 1IJJA 2YJEA 3CHWA 5AQUA 5AFUA 2F9TA 4BR7A 3AARA 2Q97A 2D1KA 2ZWHA 3O08A 2V52B 2VYPA 1HPMA 5LJVA 4DB3A 3AAQA 4EFHA 1GLCG 4BR9A 1ATNA 3UKRB 3H45C 1NGGA 3JS6A 3SLCA 3VEOA 2Q0UA 3KZBA 1NGDA 3HI0A 2EWSA 5AFUH 5FPEA 3I33A 1GLDG 5AQJA 4CBWA 3MCPA 4GY2B 4BQZA 4PL7A 3FGUA 1YAGA 4XEIA 4K42A 4AM6A 1BA0A 2YHXA 3U4LA 1BWFO 4XH1A 3BP8A 4BR2A 5AZJB 4K41A 4H5RA 3WXJA 1EQYA 2GEMA 4QS7A 3M1FA 4PKIA 4XH5A 4BRNA 2HF4A 2ZF5O 5CE3A 2OANA 2I7NA 2W41A 3AY9A 5AQRA 1TYQA 3BEXA 3IMXA 4FWOA 3WEEA 3HTVA 4HWIA 1HUXA 2E2PA 2PAVA 4B1XB 2YCHA 4FWNA 4B1YB 5KQDA 3ATUA 2A42A 3SMPA 4BGAA 2ASMA 1LCUA 1ATSA 1RFQA 3W3DA 4ISEA 2P9UB 4BROA 4JD2A 2A6AA 1G99A 3CQXA 3UB5A 4BC3A 4CZMA 3RSEA 3GE1A 3FZKA 2P9NA 4CZHA 4H0TB 5AR0A 4B1WB 2QWNA 5B8HA 3ZX2A 4A62A 4BRAA 4BQLA 2I7PA 5EOYA 4IWVA 2E88A 3FZHA 1E4FT 2J4RA 5AQVA 3KHYA 5AZIB 2CGLA 3VPZA 5FPMA 4WQ4C 4CD1A 3R9PA 4CJ7A 3EO3A 3IDHA 4ISFA 3VEYA 1HKCA 4BRKA 3ZEUA 1SAZA 4C23A 4H0XB 4F9OA 3L6QA 2HF3A 3CJCA 5AQSA 2BUPA 5AQPA 3U9ZA 1T6DA 1MWKA 4JN4A 1JCGA 4J8FA 2Q1NA 3SJHA 4EIAA 1IG8A 3WXIA 1BG3A 4XH4A 4CBUA 5AQKA 1ZC6A 3CJ9A 4B1UB 5BPNA 4FL9A 3CJ7A 4PL8A 3WEEB 4FOIA 2GWKA 3C0BA 3QBWA 2Q31A 1TUUA 4LC9B 2QWOA 1GLJO 3LDLA 3AAPA 4MO5A 3O1BA 3DJCA 5FPDA 1NWKA 3ZX3A 2Q36A 4BRCA 4JNEA 1WUAA 4MO4A 1HX1A 2ASOA 4CZIA 1NGCA 3CJBA 1NGEA 4EAHD 4FWSA 2P9SA 4JD2B 4BC5A 2IIRA 4K25A 1JCFA 2P9NB 2A3ZA 3MN9A 3H3OB 3FZLA 3M3ZA 5BRDA 3OHRA 4BRMA 1HJOA 5LY3A 5AQFA 5BN8A 1NGJA 4CZFA 4BRGA 3FLCO 3B8AX 3WUHA 5BRFA 1CZAN 2VWBA 4O5FA 5AQYA 2V7ZA 1DEJA 4JAXA 1XUPO 1NLVA 5AQLA 3GBTA 4DCHA 4CZEA 3O80A 4FSVA 5AQIA 2P9IA 5AQNA 3ZEUB 1R59O 4BRQA 2FSNA 3D7EO 2ZGZA 3CQYA 2PBDA 1C0GA 1MWMA 3HM8A 5E84A 1X3MA 5BN9A 1E4GT 3L0QA 1ATRA 3H1VX 1OKJA 4A61A 5AQOA 4BRLA 2V51B 2VCPA 1X3NA 4FPAA 3U8XA 3GL1A 2GUPA 4BVOA 3FE1A 1Z6RA 1XC3A 5BREA 3CERA 2FSJA 4WQ4A 5F0XA 1GLEG 2FF3B 1RDWX 3WXKA 4BG8A 3MN6A 4DQ8A 4H5TA 1QZ5A 4MLHA 2ITMA 3LM2A 1BO5O 2IVPA 3H1QA 4M7XA 5JICA 3VF4A 2P9SB 5ADXH 1T44A 3VOVA 3ATVA 4BRPA 1T6CA 2FXUA 3MK6A 1J6ZA 1U2VA 2P9PA 1ZXOA 2Q0RA 3EN9A 3QFPA 3DWLA 4Z94A 1BDGA 3VGKA 1SZ2A 3O6WA 2IVNA 4CZKA 5JMVA 4O8KA 4BR0A 3ID8A 5BR9A 4EHUA 1D4XA 4RCHA 1ZBSA 2GWJA 3VEZA 2E1ZA 4EHTA 1SQKA 4WYBA 1QHAA 3WT0A 3C7NA 2QM1A 4QS8A 2ASPA 5I9EB 2A5XA 1NBWA 5EXWA 1ESVA 4B1VA 4BR5A 2HMPA 1S22A 2ZGYA 2V7YA 2E2OA 1MDUB 1U6ZA 3JXUA 3MMVA 2W40A 3O1WA 3VETA 1Q18A 2AP1A 3QFUA 4B1ZA 4B9QA 1TYQB 2E2QA 4BC2A 2E8AA 1NGFA 2KHOA 3ULEA 2P9LA 2WUSA 5EY4A 3MN7A 2E20A 3J8AA 3MDQA 4RTFD 1NGBA 3MN5A 4FPBA 4L3QA 2A40A 5AQXA 1NMDA 4YDUA 2D0PA 2QWPA 2QWLA 1NGIA 4CD3A 3A8YA 2QWMA 3R6MA 4I6MA 4H5VA 1BOTO 3O4WA 1GLLO 4A2BA 4PKHA 3DXMA 1HKGA 3QB0A 4FWQA 5LJWA 3RSEB 4FWLA 2YHYA 1KAXA 1U2VB 2CGJA 2P9PB 4BG9A 5KPZA 3D2FA 1QQOA 3HZ6A 4IJAA 3FR0A 1WOQA 5AQTA 1NGAA 3UKUA 4MLEA 3WQUA 3EZWA 1JCEA 2P9UA 3BF3A 2YHWA 1KXPA 4K43A 2P9KA 1C0FA 4NB4A 3CJAA 1V4TA 1DGKN 4H03B 4YDUC 1MA9B 1P8ZA 1BA1A 3IFRA 3H46O 1YVNA 4GNIA 4FWPA 4NO7A 5E26A 5KPRA 4KBOA 3IUCA 3C7NB 3VESA 5AQWA 2FLOA 4E1JA 4BRDA 3ZETA 3VERA 5BPMA 2FSKA 1S3XA 1DKGD 3LDOA 5AZIA 2Q2RA 2D0OA 2HOEA 3G25A 4JHDA 4CZJA 4AM7A 2YI1A 3LDQA 1TUYA 5AQMA 5AQGA 4A2AA 4WQ5A 3VEVA 5ADXA 3A5LC 4CBXA 3ULEB 1K8KA 2P9LB 4PKGA 3HSCA 2GTDA 4QS9A 1HKBA 3CJ1A 2QWQA 2D4WA 3LM9A 3CI5A 5F1XA 2DPNA 4FWKA 3DXKA 3F9MA 3LL3A 4I6MB 4HTLA 1BUPA 1GLFO 4BC4A 1Y64A 2F9WA 3R8EA 2QXLA 4Y0WA 3DXMB 3D2EA 3VENA 4RWTA 4BGBA 3CIPA 3VF2A 2CH6A 1QQMA 5ELZA 3D2FB 1NM1A 5EVZA 3U9DA 3LDNA 3QMLA 1QQNA 1H1VA 3QBXA 5F2RA 3SMSA 3UKUB 4WQ5C 1KAZA 2AA4A 2CH5A 3A5MC 2BTFA 3A0IX 4IZ9A 1RGIA 2P9KB 5EX5A 3UE5A 4IXCA 3FFKB 5BPLA 3GOIA 5TKYA 5AQQA 1YUWA 3UKRA 5KPTA 1LOTB 1GLAG 3A5OC 4H0YB 3SK3A 5JLFA 2P9IB 4FO0A 3M6GA 3BUZB 4M63C 2CGKA 3ZETB 3A5NC 2QW9A 3ENOA 1HLUA 3H6EA 3O8MA 3QDKA 3VGLA 3WQTA 4BVPA 4DHYA 1V4SA 4H0PA 1Z05A 3ENHA 3TU5A 1X9JA 2QWRA 3S41A 3GDQA 5KQ8A 1XQSC 3W0LA 4JHDB 3H3NO 4FWRA 3P4IA 3I8BA 4CI6A 2YJFA 2H3GX 3CETA 4BREA 3EKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AZJA 2YNGA 1JLBA 1LWCA 4Y1CA 1XHZA 2HNZA 1YJ9N 3VEWA 4FWMA 3AVCA 1TL1A 4CJTA 5HLFA 3HBTA 2A41A 1BU6O 3EKUA 2YX6A 4KKOA 3FZMA 4LH4A 5FPNA 3ZX0A 4H0VB 3ZSXA 4B9MA 4CZGA 1J53A 2IVOA 4IJNA 3OYAA 3LDPA 3ZT0A 4YFUA 1JLEA 2FF6A 1NK4A 1RT6A 3E1YA 2E2NA 4KHWA 1QE1A 1RT5A 3L2QA 3ZT1A 2IC3A 1KSPA 4BRIA 4CHOA 4EZ9A 2NLXA 4IO8A 3BF1A 3HK2A 4EZ6A 1TAUA 4CF2A 3OYEA 4H5WA 1NGHA 2YJEA 1Q9YA 5AFUA 3LP3A 2F9TA 4BR7A 2Q97A 2D1KA 2ZWHA 4V19S 4GV6A 5LJVA 5KRTA 4ID5A 1S1UA 4KH5A 4WE1A 1JLFA 4C8NA 1SV5A 2G8VA 1FKPA 3VEOA 2B4JA 1QSSA 4ELUA 1D9FA 3ZYYX 5AFUH 2JGUA 1YJWN 1KLMA 4BQZA 4KHSA 3VQPA 4WFNL 4K42A 4AM6A 4JS5A 1C6VA 3MX5A 4CJ5A 4K41A 4W5OA 4JKFA 2HBLA 3P31A 4CJEA 2VWJA 3M1FA 4M45A 3PO5A 3KLGA 3SBTA 1FKOA 2OANA 5J2PA 3CC2N 4C8OA 1NK9A 4B08A 4U67L 3EZ5A 3TAGA 3CM5A 3SQ2A 3AVBA 1P90A 4CIFA 1RDBA 2E2PA 2HHVA 4KB1A 2JWLA 4FWNA 4B1YB 4KV8A 3ATUA 4RW7A 5JS2A 4WFAL 1ATSA 2WOMA 5HL7L 5C12A 3QO9A 1XMQK 1WSEA 4X65K 4ISEA 3MWTA 3OYLA 3CCLN 1FK9A 2DFHA 1A5VA 3NE6A 1KFDA 2A6AA 4K8ZA 3CCEN 4OKJA 4FJGA 3RSEA 3GE1A 2B6AA 2P9NA 1S72N 4Y1DA 2HBMA 4B8CA 3ZX2A 4H4OA 4KHNA 4Z4FA 3CCQN 4DLEA 1HNXK 4BQLA 3VQ5A 2I7PA 3HVTA 2ETJA 1JLQA 1E4FT 5AQVA 3KHYA 2NRWA 4IG3A 4JKBA 4PA1A 4Z4CA 3LZIA 1TV6A 5KTQA 3DOKA 4ISFA 3THWB 1HKCA 1ZBUA 4DU3A 5AQPA 2QA4N 3PIPL 2P5GA 3HRGA 2F96A 3SJHA 4FCYA 1IG8A 1NJWA 3CCUN 3CG7A 3O3FA 4KREA 3CJ9A 4DR3K 2E5LK 4FL9A 4PUOA 3LP0A 4CJWA 4FOIA 4DFMA 4DSFA 3PV8A 1ZBFA 3NH1A 3NAEA 3MXMA 3AAPA 3QERA 4MO5A 3VQBA 1BL3A 2HHXA 3TABA 2WC9A 1WUAA 3DRPA 3SPZA 2ASOA 4CZIA 3KLHA 1TKZA 1NGEA 2IS3A 4BC5A 1JJ2M 1JCFA 2ZM6K 2A3ZA 3H3OB 1IBMK 1RCHA 3DRSA 3OHRA 1HJOA 4BRMA 3CMAN 3EE9A 5BN8A 3V1RA 3B8AX 3WUHA 4CEBA 5AQYA 4JAXA 3BGRA 4W5NA 2HBKA 1UA0A 4DCHA 2RN2A 2NRRA 3O80A 5HRSA 4BE1A 5AQNA 1R59O 4BRQA 2ZGZA 1DTQA 3CQYA 4GKJK 1MWMA 1T8EA 2ZE2A 3L0QA 1TK5A 2QKBA 3ZT4A 1ILYA 3SI6A 2EX3A 1HNWK 2VCPA 1SL0A 1W0HA 5HP1A 4NCBA 1BI4B 2HSTA 2VGNA 1N34K 4IKFA 1XC3A 4WCEL 5BREA 3HSTB 3QEXA 3P5JA 3LPUA 4B9UA 1RNHA 3LM2A 3IS9A 4DR5K 2Z1IA 3U3GA 1VSFA 1T44A 3V6DA 3AGRA 3VOVA 4K8XA 1UAXA 1YIJN 4ELVA 3EN9A 1B9FA 1EWQA 1TK8A 1K9MO 3VGKA 1LW0A 1SZ2A 4O8KA 1D8YA 4FW1A 3B6OA 4KPYA 3KKSA 4M3TA 1I94K 3QEPA 3M8SA 4DSKA 4EHTA 1NOZA 4RW9A 4EP5A 3PX0A 1QHAA 4W5TA 3OYHA 1UWBA 1NJZA 3MEGA 1RILA 4CJ3A 2QKKA 1ESVA 1TAQA 2UUBK 3CFRA 1FJGK 3KWGA 1MDUB 2OA8A 3AVFA 5C24A 3O1WA 3KK1A 3TTFA 3VETA 1Q18A 3MX2A 3QFUA 2E2QA 3QESA 3HT3A 3NF9A 4FLZA 2OTLN 1NGBA 3F9KA 3OBYA 1SL1A 3QINA 4KH4A 5AQXA 5HBMA 4YDUA 3ALYA 2QWLA 4CD3A 3L2RA 3CPWM 4H5VA 1BOTO 3O4WA 4A2BA 3SAHA 3JSMA 3QB0A 4TSXA 4FWQA 3TTCA 3SUOA 4AHVA 1KAXA 1TVRA 2BGGA 1K73O 1VQMN 2FC0A 1NGAA 3OBWA 3TR8A 2XY6A 3K58A 3NCIA 2VQFK 3ISNC 4DSLA 4DSIA 5I3UA 1IBKK 4YDUC 1P8ZA 2VWKA 1HMVA 3IFRA 5KPRA 1YVNA 4GNIA 1EETA 3LWLA 4KBOA 3V1QA 3C7NB 3VESA 5AQWA 4B9LA 4CF8A 2F4VK 3V9UA 4DTJA 3RTVA 1RDCA 2GBZA 3K59A 3SQ0A 4AM7A 2UXDK 5FLXO 2BH1A 3AA5X 1HNZK 3K9JA 3ULEB 4B3RK 3T3FA 1Z25A 3HSCA 1J5EK 2GTDA 4IEIA 3NBPA 1BCOA 1HKBA 3RR7A 2QWQA 2D4WA 4E7LA 3LM9A 3CI5A 3CC4N 3NVMA 4G9ZA 4DV7K 3F9MA 4NLCA 1BUPA 1GLFO 4JK7A 1KC8O 3K5OA 1RDUA 3DXMB 3HPOA 3THXB 5FDLA 2CH6A 5ELZA 4LD0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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