5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
b'SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
4J8FA 4I6MB 1X3NA 3I33A 4B9QA 1HJOA 4FWLA 2Q36A 2HF4A 2P9NB 1ATRA 4FOEA 2GWKA 4H5NA 5AQPA 1GLDG 3SJHA 2V7YA 3CJ9A 2IVOA 2PBDA 3MN7A 5AQJA 1Z6RA 1BG3A 4BG9A 3TU5A 4AM6A 3LM9A 3GOIA 4CZJA 2P9PA 4JAXA 4K43A 4BGAA 4CZHA 3DWLA 3J8AA 2P9KA 3VGKA 4PL7A 4BR7A 2HF3A 4BRIA 4BRKA 2FF6A 3VETA 4KBOA 3L4IA 1SQKA 1KAXA 4FWQA 4BQLA 3GE1A 4HWIA 2QWMA 3O08A 3O1BA 1NMDA 3CHWA 3C7NB 3BF3A 3EO3A 2A6AA 5AQYA 4MLHA 4H5VA 2E88A 4O5FA 3UKUB 3VF6A 5AFUH 2FXUA 3A0IX 1D4XA 2QM1A 2ZWHA 3MDQA 4BRNA 3QBXA 1YXQA 3IDHA 5BPMA 4A61A 4BR9A 4FWRA 4L3QA 3ATUA 1OKJA 5AQNA 5EXWA 2E20A 4B1YB 2WUSA 2QW9A 4Y0WA 5AQTA 3WXJA 1NGHA 3CJ1A 4DHYA 3BP8A 3HBTA 3LDOA 1T6CA 4M7XA 1BU6O 1C0GA 4BRHA 1QQOA 3D2FB 1GLAG 2AP1A 3LDQA 4WYBA 1SZ2A 5EVZA 1DGKN 3GBTA 3MCPA 2DPNA 1JCGA 4F9OA 3OHRA 5F0XA 1LCUA 4WQ5A 4BROA 4CZGA 4H0TB 1JCEA 1E4FT 2D0OA 5AZJA 5ADXA 4EAHD 5KQ8A 2A40A 2FSJA 5AQWA 3FR0A 4JHDA 3ZX3A 2Q97A 3JS6A 5F1XA 1S3XA 3HTVA 1HKBA 3VESA 1RGIA 1QQNA 3FZFA 3O8MA 3O6WA 4PKGA 3VERA 4WQ4C 4BG8A 2P9SA 3IUCA 2P9UB 4BVOA 5CE3A 4CZLA 3RSEA 5BRDA 2V51B 1NGJA 4B1ZA 1RFQA 1HX1A 3WEEA 4CBUA 3AY9A 2ZGZA 3DXMA 2BUPA 1K8KA 1RDWX 5FPDA 3BF1A 4DB3A 2P9LA 1X3MA 5KQDA 3S41A 1HLUA 4IXCA 1GLCG 3GDQA 5F2RA 5AQSA 5AQHA 4JD2A 2I7NA 3EKUA 3R8EA 2FF3B 2E1ZA 1S22A 4HTLA 4BC3A 2W40A 4CZMA 5BRHA 4QS8A 3DXKB 2PAVA 3H45C 4E1JA 5AQZA 2E1YA 4FSVA 4H0VB 4C23A 1BA1A 2A41A 4XH4A 4BR4A 5JLHA 3M1FA 3MN6A 3FLCO 4FOIA 2Q0RA 3BUZB 3CETA 1HKGA 3AAPA 4BRGA 3QICA 1ZBSA 2V52B 4ISEA 2CH5A 2BTFA 5KPTA 4JNEA 3ZEUB 1ATNA 3QBWA 2J4RA 4FWNA 2AA4A 1BOTO 2P9IB 3IFRA 2CH6A 3AAQA 5AQQA 3L6QA 3VEWA 4CD3A 1GLJO 4CZEA 2ITMA 1T44A 2KHOA 1T6DA 1HUXA 2CGKA 4B1UB 5BREA 4I6MA 1TYQB 3MK6A 3VF4A 4BRCA 3WXLA 4B1VA 2E8AA 2P9NA 4FL9A 5LY3A 3H3OB 4IJNA 3SLCA 3ZETB 4MO5A 1Q18A 1NGAA 1HKCA 3VEYA 3SMSA 3FZKA 1MWMA 3QB0A 4QS9A 3CJAA 2ASPA 2GEMA 4FPAA 3U9ZA 3LL3A 2Q31A 1P8ZA 2W41A 3CERA 3ULEB 3H1QA 4H03B 3L0QA 3M3ZA 3EL2A 2NLXA 3C7NA 3DAWA 4WQ5C 3G25A 2IVPA 2QXLA 1Y64A 3F9MA 5LJWA 3UKUA 4YDUC 2HMPA 2VCPA 2VWBA 5AZIB 4Z94A 2E2OA 3EZWA 1WUAA 4BRQA 1Z05A 1ZXOA 4H5WA 2F9TA 4PL8A 5AQKA 4CBXA 5AQUA 3CQYA 3KVGA 5FPEA 2QWNA 3O5BA 2YHXA 1KXPA 1NWKA 2ZF5O 4XH5A 1J6ZA 2GTDA 3VENA 1HPMA 3VPZA 3UKRB 1ESVA 4PKIA 4BC5A 3H6EA 3A5OC 3KZBA 3FZMA 5AQVA 5E84A 2QWRA 5KPZA 1CZAN 1QZ6A 1C0FA 1X9JA 4A62A 3D2FA 2I7PA 3D7EO 3FZHA 2QWPA 5BPLA 2A3ZA 1DKGD 1XC3A 1U2VB 4K25A 4GY2B 3QFUA 4B1XB 3KHYA 1BDGA 3HSCA 5JMVA 3EKSA 4H0OA 3D2EB 4PKHA 2YHYA 4B1WB 4LC9B 2YJFA 3GG4A 3H46O 4EHUA 3B8AX 4M63C 1NGCA 1R59O 2P9UA 3U9DA 4IWVA 4RCHA 1NGEA 3FGUA 4XH1A 2E2NA 3A8YA 1G99A 2YHWA 2FLOA 2QWLA 2Q0UA 5EY4A 1GLLO 5ADXH 3LDPA 1GLFO 1GLBG 2NRHA 2CGLA 3P4IA 2GELA 4WQ4A 3DXKA 3QFPA 3FFKB 1V4TA 3O80A 4RTFD 3WQUA 4MLEA 4BRMA 4BVPA 1TUUA 2Q2RA 2ASOA 4MO4A 3ATVA 3DJCA 4CD1A 4CZFA 4BC4A 4EHTA 5AR0A 3MN9A 3VEOA 4CZIA 4IZ9A 5AQFA 1NM1A 4GNIA 5AQGA 4H5RA 1YVNA 3M6GA 2H3GX 5AFUA 2P9PB 1U6ZA 2YI1A 2P9KB 4BR0A 5BPNA 4K41A 1BO5O 2YJEA 1XQSC 3ZEUA 5BN9A 5AQXA 4H0XB 3CJBA 3ZX0A 5TKYA 2P9IA 3HM8A 3QMLA 1SAZA 3VEVA 5AQMA 5ELZA 1BUPA 1ZC6A 4CZKA 3IMXA 4CBWA 4A2AA 5AQIA 1MDUB 2EWSA 3WXIA 2D0PA 5LJVA 3FZLA 1TYQA 3H3NO 3ID8A 3MN5A 5FPMA 4FWMA 1XUPO 1WOQA 1GLEG 3CJ7A 3O1WA 3WT0A 3A5NC 4M7YA 3HZ6A 2OANA 3BEXA 4FWSA 4H0YB 3U4LA 3ZETA 1DEJA 4BRDA 1QZ5A 1H1VA 1V4SA 4A2BA 1NGGA 3LDNA 4ISGA 2F9WA 1MA9B 3LDLA 1QHAA 3C0BA 4FWPA 1ATSA 5JLFA 5BRFA 3W3DA 2ASMA 3VGMA 2A5XA 3ULEA 3WXKA 2FSKA 4BC2A 1IJJA 4BRAA 1IG8A 5AQLA 5BR9A 3JXUA 1EQYA 4FWKA 2QWQA 3LM2A 4BR5A 3CJCA 4DQ8A 3HI0A 1YAGA 4NB4A 2Q1NA 3O4WA 5AZIA 5AZJB 4BQZA 5EX5A 1NLVA 3ZX2A 4JHDB 3VOVA 4H0PA 3TPQA 4JN4A 2QWOA 4BRFA 4EIAA 3UB5A 3A5LC 1E4GT 3WQTA 4BRPA 4BGBA 1BWFO 2P9SB 2E2PA 4ISFA 1LOTB 3RSEB 3UKRA 4AM7A 1QQMA 2A42A 3SK3A 3W0LA 3WEEB 3QDKA 5EOYA 2NZTA 4YDUA 1NGBA 3DXMB 4EFHA 2IVNA 1K8KB 5I9EB 3AARA 3CI5A 3UE5A 5AQRA 2VYPA 2P9LB 4BRLA 1NBWA 1BA0A 2V7ZA 5FPNA 3WUHA 5BN8A 2FSNA 2CGJA 2D1KA 1U2VA 1MWKA 3R6MA 4JD2B 4K42A 2GUPA 4BREA 3MMVA 5B8HA 3I8BA 3U8XA 3FE1A 4CJ7A 3EN9A 5JICA 3VF2A 3D2EA 1YUWA 2HOEA 3A5MC 2D4WA 2YCHA 3GL1A 1JCFA 3VEZA 4NO7A 5AQOA 4IO8A 4IJAA 5E26A 3VEXA 2IIRA 3ENOA 4RWTA 3ENHA 3VGLA 4FPBA 1TUYA 3SMPA 4DCHA 3R9PA 3H1VX 1NGIA 4H5TA 4O8KA 4QS7A 5KPRA 1KAYA 4FWOA 4BR2A 4XEIA 2UYTA 2E2QA 3CIPA 4FO0A 2ZGYA 1NGFA 1NGDA 2GWJA 1KAZA 4CI6A 3CQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z1IA 2G8KA 3I33A 1JLFA 5FDLA 1ATRA 4M3TA 3HP6A 1VSLA 3K5LA 3VQ6A 3I0SA 3MN7A 5AQJA 4JI7K 2LSNA 3M5RA 3T1YK 4KB0A 1UGLA 4BG9A 3LM9A 3GOIA 1CXQA 2P9PA 1BRZA 4K43A 4CZHA 1ZBFA 3OYCA 2OTLN 3VGKA 4WFBL 4PL7A 4BRIA 4H4OA 4CJUA 4BRKA 4EP4A 3SV4A 3AO3A 3VQ8A 4KBOA 2IDOA 4OKKA 4Z4CA 4OGEA 1B9DA 1SQKA 4KHWA 2VQFK 2AJQA 3EEQA 1VSFA 3O1BA 1NMDA 1I2UA 3CHWA 3CCMN 3C7NB 3BF3A 3MXMA 5M1FA 4FLVA 2C1GA 2FXUA 4OO1J 1P0AA 1JZBA 3MDQA 4WCEL 1NRAA 3THYA 1IO2A 4AHRA 1Q8IA 2X78A 1C6VA 4FJMA 5CZ2A 4FWRA 4L3QA 5J2MA 3ATUA 1OKJA 1A5VA 1HRHA 2E0HA 3O4QA 1UA1A 4YOYA 3JYTA 2OA8A 2NRRA 1S1TA 2X6SA 3VQCA 4Y0WA 5AQTA 4E1MA 1NGHA 4DHYA 4FJGA 3BP8A 3HBTA 3BK3C 3LDOA 1QHTA 4CGHA 1SL1A 1T6CA 2O8CB 2YNIA 2C1IA 3AVGA 3PSMA 1QQOA 1GLAG 5JVHL 3SAHA 1F21A 3MCPA 4F9OA 3OS0A 4B9MA 4BROA 1C1CA 4H0TB 3V6DA 1E4FT 4JK9A 1RTIA 4C8LA 4AB0A 3AV9A 1GOBA 1OH5A 2YHBA 3VA0A 4ZTFA 1N5YA 3JS6A 3RRGA 2Z1GA 1JLBA 1RGIA 3VERA 3HPHA 4E89A 3NGZA 2P9SA 1FH3A 3VQ7A 5BRDA 4B1ZA 4CGFA 4UAFE 1HX1A 3WEEA 4CBUA 1JXCA 4O44A 3O3FA 3K5MA 1FKOA 3AVIA 5KQDA 2NNWA 3S41A 3LALA 2G2KA 1GLCG 1QVFM 3TSUA 1BIZA 1WAFA 1SNBA 5AQHA 2NRXA 3OVNA 3ZSYA 3EKUA 4DV2K 1S72N 2O8FA 1DT9A 3QIOA 1ZVGA 3HOSA 5LMUK 5DK5A 5J2NA 4DTPA 3U3GA 4C23A 4I7FA 2VGNA 1NKBA 2A41A 1NK4A 4XH4A 4FJNA 3M1FA 1C56A 3MN6A 4FOIA 1CLQA 2UUCK 1HKGA 1T05A 4BRGA 2LY5A 3TWHA 4B3TK 2CH5A 4KH4A 2BTFA 3I56N 1YJWN 4Z0UA 5C24A 3ZSQA 1BOTO 2RPIA 3IFRA 4DR1K 3AAQA 4QAGA 2UUBK 4CD3A 3L6QA 4JYAK 1T44A 1T6DA 3P83D 2CGKA 3TANA 5H1SQ 1NNEA 1VSJA 1TYQB 4B1VA 5IT9O 2HVHA 4JS5A 4NLBA 1EWQA 4X62K 3ZETB 4MO5A 3TAGA 2VG5A 4CECA 3VEYA 4CJ4A 3QB0A 4QS9A 3CCSN 3F2KA 1LV5A 2RE2A 3U9ZA 1T0ZA 2Q31A 3VQBA 4PHTX 4ILHA 5GIOA 1VQ8N 2B4JA 3AO1A 2NRVA 4OPJA 4RW7A 3PSFA 1J5EK 3G25A 1OMYA 4KHQA 2QXLA 1W0HA 1Y64A 3F9MA 4FW2A 5LJWA 5HRRA 3HOTA 3UKUA 4YDUC 2HMPA 2E3GA 1VQPN 3VQDA 3MAQA 4KYPA 4NXNK 2F9TA 1LAVA 4PL8A 4WE1A 5MLCQ 4DQSA 5C2DA 3OYKA 5FPEA 1Q86O 2KGQA 3O9RA 1XI1A 4XH5A 3UKRB 4RW6A 1NJZA 3MX2A 2JWLA 5LL6Z 4C1NI 1LW2A 1RT3A 5E84A 4CJ5A 3HVRA 3N4QA 5KPZA 4A5AA 5GIPA 4U7BA 1KFSA 1NK6A 1N32K 4A62A 3D2FA 2I7PA 3OW2M 5BPLA 3E9PA 1T8EA 4K25A 1Q81O 1S1UA 1JLGA 3AGKA 4DFKA 3HYFA 4PA1A 4CF8A 1Q9YA 3EKSA 3C65A 3D2EB 3J7ZO 1SEGA 3T3FA 3SUNA 4PKHA 2D56A 2YHYA 1ZBUA 3LP3A 3LPUA 3JSMA 4IOCL 3O4NA 4E7KA 4ILJA 3GG4A 2RKIA 3H46O 3B8AX 1TKTA 1R59O 4LF8K 4CIGA 4CCHA 4PUOA 1NK5A 1U47A 2IOCA 3FGUA 1S9EA 2E2NA 1VQMN 1G99A 4UADE 3CCRN 2QWLA 1CXUA 3OYLA 1WWNA 4CEBA 4BDPA 4JI0K 5EY4A 5HLFA 2YNGA 2NRHA 1RT6A 1OH7A 1V4TA 1SN4A 1DTTA 3DI6A 2VWJA 2Q2RA 3QESA 2ASOA 4Z4GA 3MWTA 4EHTA 3MN9A 1KD1O 1NKEA 5HRNA 1EP4A 1MYNA 4IG3A 1NM1A 1YITN 4FJJA 4HUGA 2DY4A 3THXA 2P51A 2E2FA 3ASMA 2MZ0A 3M6GA 4IFVA 2YNHA 2HHWA 3DOKA 1KFDA 2P9KB 4BR0A 1FK9A 1BO5O 2E5LK 4W5OA 4OLBA 3KLEA 4YOUA 1HQEA 2SN3A 4DR7K 5ELZA 4CZKA 2WTUA 2O8BA 1YT3A 3OYIA 1MDUB 2EWSA 4FXDA 4DSJA 3ID8A 5FPMA 1C0TA 1LQIA 3OS1A 1GLEG 3CJ7A 2A1RA 4FLTA 3LANA 1YTUA 1T03A 3NF7A 1QZ5A 4BY9C 1N33K 1FKPA 1RBRA 3RRHA 4CHPA 1VSEA 2F9WA 2WONA 2VWKA 2NRWA 4FWPA 1ATSA 4ID5A 3UIQA 3C6AA 5JLFA 4FLXA 1VQON 1BI4B 1QTMA 3PO4A 5BRFA 4KHSA 3WNGA 3ULEA 1TL3A 1IJJA 4C8NA 1O13A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2Z1I A;  2G8K A;  3I33 A;  1JLF A;  5FDL A;  1ATR A;  4M3T A;  3HP6 A;  1VSL A;  3K5L A;  3VQ6 A;  3I0S A;  3MN7 A;  5AQJ A;  4JI7 K;  2LSN A;  3M5R A;  3T1Y K;  4KB0 A;  1UGL A;  4BG9 A;  3LM9 A;  3GOI A;  1CXQ A;  2P9P A;  1BRZ A;  4K43 A;  4CZH A;  1ZBF A;  3OYC A;  2OTL N;  3VGK A;  4WFB L;  4PL7 A;  4BRI A;  4H4O A;  4CJU A;  4BRK A;  4EP4 A;  3SV4 A;  3AO3 A;  3VQ8 A;  4KBO A;  2IDO A;  4OKK A;  4Z4C A;  4OGE A;  1B9D A;  1SQK A;  4KHW A;  2VQF K;  2AJQ A;  3EEQ A;  1VSF A;  3O1B A;  1NMD A;  1I2U A;  3CHW A;  3CCM N;  3C7N B;  3BF3 A;  3MXM A;  5M1F A;  4FLV A;  2C1G A;  2FXU A;  4OO1 J;  1P0A A;  1JZB A;  3MDQ A;  4WCE L;  1NRA A;  3THY A;  1IO2 A;  4AHR A;  1Q8I A;  2X78 A;  1C6V A;  4FJM A;  5CZ2 A;  4FWR A;  4L3Q A;  5J2M A;  3ATU A;  1OKJ A;  1A5V A;  1HRH A;  2E0H A;  3O4Q A;  1UA1 A;  4YOY A;  3JYT A;  2OA8 A;  2NRR A;  1S1T A;  2X6S A;  3VQC A;  4Y0W A;  5AQT A;  4E1M A;  1NGH A;  4DHY A;  4FJG A;  3BP8 A;  3HBT A;  3BK3 C;  3LDO A;  1QHT A;  4CGH A;  1SL1 A;  1T6C A;  2O8C B; 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