5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
b'SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
3JXUA 4IXCA 3AAQA 1HLUA 4DCHA 4BG9A 3LDNA 1TYQA 2FSNA 2Q2RA 1U2VA 1ATNA 1T6CA 3VGKA 4RWTA 1KAZA 2E1YA 3H46O 3MN5A 4NB4A 3L0QA 4KBOA 4BG8A 2YCHA 3EKUA 5EXWA 2V51B 2VWBA 4YDUC 3A0IX 4A2AA 2Q0UA 3A5LC 4FPAA 3O1BA 3VEXA 1CZAN 4CZFA 3WQUA 4BRHA 3VETA 5AQZA 5AQUA 4FWKA 1NBWA 3D2FB 4FOEA 4H0PA 4C23A 2NLXA 4JHDA 1NWKA 3WQTA 2HF4A 2P9KB 2YI1A 2P9SB 3MN6A 2UYTA 4K42A 2P9IB 5BR9A 3A5MC 3CETA 4NO7A 3VF6A 3EL2A 4IJNA 2I7PA 1TUYA 3C7NB 1H1VA 1BOTO 4RTFD 3UB5A 4JAXA 4EHTA 3H1QA 2F9WA 4H5RA 2YHWA 2GUPA 1DKGD 5CE3A 3ATUA 3KZBA 5LJWA 1T6DA 5EX5A 4B9QA 4BGBA 1DGKN 1BUPA 2AA4A 1QQNA 3CQYA 5AQOA 5BPMA 3BF1A 3F9MA 3MN9A 3O5BA 4CD1A 4H5VA 5AQWA 2AP1A 3H1VX 2QWMA 1JCEA 3A5NC 3VF4A 2PBDA 3D7EO 4H5NA 2W41A 3IDHA 4FWOA 4FSVA 2WUSA 3FZMA 5JLHA 4PKGA 3M1FA 4BRKA 5AQPA 3ZX0A 1NGJA 3D2FA 3QB0A 4PL8A 1NGBA 5KPZA 2CH5A 2FLOA 3H3NO 4H0VB 1NGAA 4CZEA 1R59O 2P9KA 2P9SA 4M7XA 3FGUA 1J6ZA 3DXMB 1YXQA 2OANA 4DB3A 4BR4A 3QFUA 1S3XA 1BA0A 2E2OA 5ADXA 3ENOA 4B1UB 1WUAA 2YHYA 2ZF5O 2IVPA 4JHDB 4CJ7A 2FF3B 2Q36A 2QXLA 5AQSA 3KVGA 5AQTA 2A3ZA 1G99A 3FZHA 4BRIA 4BRCA 1NGFA 3QBXA 5ADXH 4GNIA 3GL1A 5KQ8A 1X3NA 4ISEA 4A62A 2H3GX 4AM6A 1MWMA 3WXJA 2IIRA 4BGAA 3CI5A 4BC3A 4H5WA 2A42A 3FLCO 2Q97A 3O1WA 3SJHA 3FZFA 3I8BA 1JCFA 4QS8A 1NGCA 1GLDG 2GTDA 3GBTA 2BUPA 3CJAA 1XUPO 4K43A 3VOVA 1NMDA 3P4IA 5F0XA 4FWMA 3VENA 3W3DA 4CBUA 1NM1A 3WXLA 3VEYA 1LOTB 1E4FT 1MA9B 3DAWA 1NGDA 5ELZA 5JLFA 2P9NA 3H45C 2V7ZA 4I6MA 3MMVA 2D0PA 4B1VA 3ZETB 3R8EA 1XC3A 2GEMA 3VPZA 3QMLA 2A40A 4A2BA 3FZKA 2QW9A 4BVPA 3W0LA 3DXMA 2GWKA 3MCPA 5EY4A 3VEZA 5I9EB 4WYBA 4XH5A 1NGHA 3KHYA 5AZJB 3LDOA 1S22A 5BN8A 4HWIA 1KAYA 4DHYA 2E2NA 3I33A 3SMPA 3DWLA 3O08A 3SMSA 4BRAA 5AZIA 3ZX3A 4BRLA 5BRFA 2QWNA 3BF3A 1ATSA 1NGEA 3UKUA 4BQLA 3DXKA 4WQ5A 2F9TA 1HPMA 3WEEA 4LC9B 4M7YA 2D0OA 3CQXA 4CZGA 4L3QA 4CI6A 4FO0A 1KAXA 3ZX2A 3O4WA 2QWQA 4H5TA 4WQ4A 1HKBA 3L6QA 3B8AX 5JMVA 2ASMA 2HOEA 1ZBSA 4PL7A 4JD2B 2YJFA 2GWJA 4MO5A 5E26A 5AQIA 2J4RA 3HTVA 3LDQA 2ZGZA 3ULEB 1C0GA 4CZLA 4H0OA 5AQXA 1V4SA 4BRFA 5AQYA 3CJ1A 1Z6RA 1SAZA 1EQYA 1BU6O 2VYPA 3C0BA 3RSEA 3A8YA 3ZETA 2E8AA 4WQ5C 4FWQA 1BDGA 4FPBA 3G25A 3O6WA 1RFQA 3IMXA 4Y0WA 1C0FA 4JN4A 4QS7A 3HM8A 1GLAG 5AQRA 4F9OA 5E84A 3WUHA 5AQQA 1DEJA 5AQGA 1GLJO 1GLLO 2P9NB 3BUZB 4FWSA 5TKYA 4I6MB 5AZJA 4IWVA 2E1ZA 1Y64A 2P9UB 5BN9A 2QM1A 2CGKA 4CZHA 3U9ZA 2A5XA 2ASPA 1Z05A 1GLFO 1ATRA 4FWLA 2YJEA 5EOYA 1HJOA 5B8HA 5AQFA 4IO8A 2D1KA 1ZXOA 2I7NA 3FR0A 5AQHA 3VEOA 3VEWA 4BR2A 5AZIB 3UKRA 1QQMA 1YUWA 5AQVA 2ZGYA 1X9JA 4HTLA 4JD2A 3UKUB 2QWRA 3D2EA 3ZEUA 3DXKB 4E1JA 1XQSC 1TUUA 3FE1A 3WXKA 3EZWA 1SZ2A 3WEEB 3ULEA 5AQNA 5JICA 4K25A 4EHUA 3J8AA 5FPDA 3VF2A 4FL9A 1MDUB 3DJCA 3CJ9A 3LM9A 4BC2A 2VCPA 5KPRA 3M3ZA 3VERA 4CBWA 5BRHA 5AQLA 5BPNA 1T44A 2ASOA 4FOIA 1LCUA 3AAPA 2Q1NA 2YHXA 2NRHA 4CBXA 3FFKB 4CZKA 4BVOA 3RSEB 4B1YB 3SK3A 3WXIA 1HUXA 1MWKA 5EVZA 3CHWA 1ESVA 4K41A 2V7YA 3LDPA 3GDQA 2P9UA 5BPLA 4RCHA 5AFUA 2V52B 3VGLA 1K8KB 1SQKA 3ID8A 3L4IA 4XEIA 2CH6A 3QFPA 3ATVA 4BR7A 5AFUH 2FSJA 3U4LA 3A5OC 2FF6A 4BRMA 3QBWA 3WT0A 2P9LA 4FWRA 2E88A 4BR0A 3U8XA 4B1XB 5AR0A 3M6GA 2QWPA 4A61A 5FPEA 2ZWHA 3TPQA 3MK6A 2IVNA 3SLCA 4IZ9A 5BRDA 3QICA 1QHAA 2E20A 4XH4A 5AQMA 3LDLA 3EN9A 1U6ZA 4MLEA 4PKIA 5F1XA 1RDWX 4H0XB 3UKRB 2CGJA 4BRGA 5FPNA 4DQ8A 3D2EB 4FWNA 4MLHA 3ZEUB 4B1WB 2A41A 2NZTA 4XH1A 3O8MA 3AY9A 2BTFA 2HF3A 4Z94A 2EWSA 3H6EA 1HKCA 2Q31A 3MN7A 3LM2A 4ISFA 3O80A 4M63C 1HKGA 2P9PB 2QWLA 4BC4A 3MDQA 1D4XA 1QZ6A 3CIPA 1K8KA 4JNEA 3OHRA 1HX1A 4QS9A 1NLVA 1BG3A 4H0YB 4WQ4C 1KXPA 3HZ6A 3GE1A 2W40A 4CZJA 5AQJA 1BWFO 3BP8A 3IUCA 1GLCG 1RGIA 1YVNA 3R9PA 4MO4A 4B1ZA 4BRDA 4BROA 2ITMA 4FWPA 3R6MA 3UE5A 3HI0A 1GLBG 1TYQB 4BC5A 3ENHA 1U2VB 1JCGA 1OKJA 4BRQA 3CJBA 3LL3A 2Q0RA 3AARA 1BA1A 2P9LB 5FPMA 2HMPA 4BRNA 4EIAA 3FZLA 5KPTA 2GELA 3CJCA 4H0TB 4CD3A 2CGLA 2IVOA 3HBTA 4GY2B 3S41A 2KHOA 4O5FA 5F2RA 4AM7A 1P8ZA 4CZMA 4EFHA 3CJ7A 2P9IA 3EO3A 3IFRA 1Q18A 1QQOA 4ISGA 1GLEG 3C7NA 2A6AA 3CERA 3GOIA 3EKSA 4J8FA 4BR9A 3VESA 4O8KA 1IJJA 1QZ5A 1IG8A 1V4TA 4BRPA 5BREA 4BQZA 3U9DA 1X3MA 2P9PA 1NGGA 3QDKA 2FSKA 3VEVA 2D4WA 3H3OB 1E4GT 1BO5O 2PAVA 3HSCA 2FXUA 4YDUA 4IJAA 1WOQA 4CZIA 5LJVA 1ZC6A 1NGIA 2E2QA 3JS6A 5AQKA 5KQDA 4BR5A 3BEXA 3TU5A 2E2PA 1YAGA 4H03B 4BREA 5LY3A 3GG4A 4EAHD 2QWOA 4PKHA 3VGMA 2DPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JXUA 4IXCA 4YFUA 4GV3A 4IEEA 1HLUA 1L4VA 4QCLA 3K5OA 1TYQA 2FSNA 2Q2RA 4RW4A 1ATNA 4CHNA 2HW3A 1T6CA 3ULDA 2OPPA 4CFCA 3CFOA 1LWFA 3SAGA 1Z26A 3L0QA 4BG8A 2HBLA 2V51B 3KKRA 4RW9A 1P0AA 4C8MA 4A2AA 4HVJA 1FKPA 3A5LC 4CJEA 3T1AA 3L2QA 4DTOA 3VEXA 3AO5A 3RMAA 3V9XA 4BRHA 5AQUA 5JVHL 4DFKA 5M1OA 1TK0A 1TAUA 2YILA 3MEGA 3GKUA 3M8PA 4JHDA 1NWKA 2YNFA 3DRSA 2HF4A 3FFIA 4KTWA 3WQTA 4G9ZA 1ILYA 1QSLA 2YHBA 3SCXA 1OH7A 3CYGA 1BCOA 2P9IB 4K42A 3D45A 4NO7A 4B8AB 5HRRA 4RW6A 3ASMA 1BRZA 1KCFA 1FW6A 1BL3A 1MR4A 3H1QA 4JAXA 2F9WA 4H5RA 4EHTA 2XHBA 1XC9A 4KTQA 5KI6A 2YHWA 5CE3A 2K35A 1HQEA 2NRXA 4JI5K 3K5LA 3ATUA 4MDBA 4CFAA 3KZBA 1ITGA 3IG1A 4UAFE 5EX5A 4E3SA 4YOWA 4B9QA 1B3CA 4E0DA 3R1XA 2O8FB 1BUPA 3TTFA 2PZSA 4NCBA 1QQNA 3O5BA 3BY5A 3MN9A 2WONA 4H5VA 3O9SA 2HNDA 1BMRA 1JCEA 3H1VX 3VF4A 1J5EK 4XIUA 3KP1A 3BK3C 2D0BA 2W41A 4FWOA 4FJLA 2BE2A 3FZMA 3SAHA 4CJ4A 3IAYA 3M1FA 4DTRA 4N47A 1YHQN 2UUAK 2CH5A 1NOZA 2GL1A 3E66A 4JI2K 1NGAA 1RBVA 4BE2A 4CZEA 1OH8A 2NUBA 2P9SA 3OS2A 2OYQA 4M7XA 3FGUA 1IH7A 4ELTA 1M1KO 4CK2A 3DLGA 4DB3A 3E9OA 4HCCA 5ADXA 3ENOA 5HRPA 3T69A 4Z4IA 5AQSA 3L3UA 4A59A 3KC6A 2FC0A 4CK3A 3OYNA 4JV5K 4GNIA 3OYJA 1U45A 4BDYA 1T3VA 4A62A 4AB0A 5C25A 1YTUA 3WXJA 2IIRA 3OS0A 3C95A 1WAFA 4BWJA 4B9SA 5JENA 2ZJPL 3DLHA 3V9ZA 4BY9C 4QS8A 3CJAA 2N66A 1XUPO 3V81A 4X62K 5F0XA 1JXCA 5J2QA 4DSFA 4FWMA 1RBTA 4CBUA 3K5NA 1NM1A 5GIOA 4M3RA 4AEIA 3VEYA 5M1KA 1VSKA 4OPHA 1NGDA 5ELZA 5JLFA 4XJXA 3H45C 3I55N 2D0PA 1N4NA 3CG7A 3ZETB 3G4SN 1XC3A 2GEMA 3VPZA 4A2BA 4CF1A 2QW9A 3FZKA 3PIOL 3VQPA 3DXMA 4E72A 5EY4A 1F21A 4DV5K 1NGHA 3HP9A 1IBMK 2YIOA 1A5VA 1HPZA 4LF4K 3T1YK 1S6PA 4DHYA 3NH2A 3T3FA 2E2NA 4FJIA 4CHYA 4DTJA 3O08A 2ZD1A 4BRLA 3ZYYX 4FJ7A 1RTJA 4UAEF 4DSJA 3HOSA 3PO5A 4CCHA 2FBXA 4DFMA 4LC9B 5BR8K 1KLNA 3CQXA 2KFNA 4YOXA 4CI6A 3O4WA 2KJAA 2SN3A 1LWCA 4WQ4A 4WFNL 1BQMA 4CF8A 4IFYA 3L6QA 1T7PA 3CCJN 4LF6K 2ASMA 4E7LA 2YJFA 3RWUA 3DM2A 3T1HK 2MBKA 1NJWA 3C6TA 4BRFA 4X65K 4FZZA 3CJ1A 1SAZA 2HHVA 4W5RA 2G8WA 3MX5A 3C0BA 1SUQA 2GMOA 3KJVA 3M8SA 1L3SA 1TGOA 5E41A 2O8CB 1TKXA 4EP4A 3G25A 4WE1A 3QEWA 1RFQA 1WWNA 3VN5A 3QNOA 4Y0WA 1C0FA 3VMFB 4QS7A 2VG7A 1QS4A 5E84A 1QVFM 5TKYA 2HBJA 4JK8A 4FWSA 5AZJA 4I6MB 3R2VA 4YOVA 2E1ZA 3I0SA 1Y64A 2P9UB 4C1NI 3LAKA 2QM1A 3A2FA 3V9SA 2JWKA 4CIFA 5I3UA 4CEOA 1LWEA 2ASPA 4CGGA 4C8KA 1OZZA 4KH4A 3EE8A 4IO8A 4DV3K 3PSIA 3ZSRA 3THWA 1UA1A 4WFBL 2ZGYA 4DQRA 4JD2A 5C2FA 3ZEUA 3DXKB 4Z0UA 3FE1A 1SZ2A 3L3VA 4FJHA 5AQNA 4OO1J 3LWLA 5JICA 1QSYA 1SL1A 1GPTA 1X9MA 1MDUB 3DJCA 4J2AA 4KO0A 5KPRA 1FK9A 1ASUA 1RBSA 2LY5A 1VRTA 4PUOA 1KLMA 3NBPA 4EP5A 1T44A 3B6PA 4BDPA 2NRVA 4CHOA 2NRHA 3CCEN 3FFKB 3HK2A 3CM6A 3CC2N 4BVOA 2HVIA 2AJQA 4B1YB 4KTZA 3WXIA 4DV1K 3PUFA 1MWKA 2F7TA 3GDQA 4YOUA 1RNHA 4UJ0A 3CD6N 2DFFA 1WB9A 1C0MA 2QI2A 5C2DA 4DR3K 4B08A 3LP2A 2E3FA 4BR7A 4OPAA 3OYCA 3A5OC 3ZT1A 3L2RA 3LANA 3ZT0A 3QBWA 1PX9A 3LALA 1T7EA 1DT9A 2E88A 4BR0A 3DRPA 1R0AA 3M6GA 1REVA 5HP1A 1SS6A 5FPEA 4B3MK 1JLEA 2IVNA 3NH0A 4YOYA 1GOCA 3L2VA 3CFPA 4XH4A 1BIZA 3VQ5A 4KB0A 1RDDA 3K9JA 4PHTX 2GX9A 3SQ1A 3ZSVA 4BE1A 4DQ8A 3D2EB 3QO9A 2C1IA 3IS9A 2KYQA 3AA5X 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3JXU A;  4IXC A;  4YFU A;  4GV3 A;  4IEE A;  1HLU A;  1L4V A;  4QCL A;  3K5O A;  1TYQ A;  2FSN A;  2Q2R A;  4RW4 A;  1ATN A;  4CHN A;  2HW3 A;  1T6C A;  3ULD A;  2OPP A;  4CFC A;  3CFO A;  1LWF A;  3SAG A;  1Z26 A;  3L0Q A;  4BG8 A;  2HBL A;  2V51 B;  3KKR A;  4RW9 A;  1P0A A;  4C8M A;  4A2A A;  4HVJ A;  1FKP A;  3A5L C;  4CJE A;  3T1A A;  3L2Q A;  4DTO A;  3VEX A;  3AO5 A;  3RMA A;  3V9X A;  4BRH A;  5AQU A;  5JVH L;  4DFK A;  5M1O A;  1TK0 A;  1TAU A;  2YIL A;  3MEG A;  3GKU A;  3M8P A;  4JHD A;  1NWK A;  2YNF A;  3DRS A;  2HF4 A;  3FFI A;  4KTW A;  3WQT A;  4G9Z A;  1ILY A;  1QSL A;  2YHB A;  3SCX A;  1OH7 A;  3CYG A;  1BCO A;  2P9I B;  4K42 A;  3D45 A;  4NO7 A;  4B8A B;  5HRR A;  4RW6 A;  3ASM A;  1BRZ A;  1KCF A;  1FW6 A;  1BL3 A;  1MR4 A;  3H1Q A;  4JAX A;  2F9W A;  4H5R A;  4EHT A;  2XHB A;  1XC9 A;  4KTQ A;  5KI6 A;  2YHW A;  5CE3 A;  2K35 A;  1HQE A;  2NRX A;  4JI5 K;  3K5L A;  3ATU A;  4MDB A;  4CFA A;  3KZB A;  1ITG A;  3IG1 A;  4UAF E;  5EX5 A;  4E3S A;  4YOW A;  4B9Q A;  1B3C A; 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