5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
3GG4A 4MO4A 5KPZA 4CD3A 2V51B 4YDUA 2Q97A 3UKUB 1RDWX 1BOTO 3H6EA 3VEYA 1GLLO 3VF2A 3HTVA 3B8AX 4K25A 3HM8A 3AARA 3ZETB 3F9MA 1HPMA 5E84A 5JICA 2YI1A 3IDHA 5ELZA 4H0TB 4H5NA 3UB5A 1YXQA 4GNIA 4BREA 4BGAA 4XH5A 3VGMA 4BRPA 3CJ7A 4MLHA 1HJOA 4JN4A 4PKHA 2ASPA 1KAYA 4IJAA 2F9WA 3EO3A 4FWQA 4DHYA 3IMXA 2P9SA 5AQOA 1T6DA 3DAWA 1U2VA 4BRFA 4EHTA 3AAPA 2ASOA 3EZWA 2P9PB 1ZBSA 1TYQA 4NB4A 3WXIA 2A41A 1K8KA 4CZMA 5AQWA 3VERA 3MN5A 4BR2A 1NGGA 2ITMA 4H5RA 4BG8A 4E1JA 4BQLA 3D2EB 3WQTA 3W0LA 1NGAA 2GEMA 4FL9A 5BREA 3VGLA 1C0GA 3OHRA 1RGIA 2GTDA 4AM7A 3SLCA 4BVOA 2Q0UA 4CZIA 3WT0A 3WUHA 5AQLA 2QM1A 4WQ5C 5AQJA 1S3XA 2GELA 5EX5A 1BA1A 3A5LC 4JAXA 1NGDA 4WQ4C 4CBUA 3GOIA 3RSEB 4BR5A 2V7YA 4PKIA 3AAQA 1JCFA 3EL2A 3LDOA 4K43A 4IXCA 4MLEA 4XEIA 3KVGA 4YDUC 1GLEG 3H1VX 2QWQA 3U9DA 4H5WA 4BRDA 2QWLA 4FWMA 3UKUA 4B1UB 3D7EO 3BF3A 5AQSA 4AM6A 4BRQA 2FF3B 5BRHA 3SMSA 5AQHA 2EWSA 4M7XA 2P9LB 3EN9A 5FPEA 2Q36A 4JD2B 1YAGA 2P9KB 5EVZA 2QXLA 3HSCA 4BR0A 3LDPA 4B1ZA 4BGBA 3BEXA 3C0BA 3P4IA 2E1ZA 3CJBA 4FWLA 1X3MA 4FWKA 3J8AA 4BRCA 1RFQA 2I7PA 3IUCA 4DQ8A 3A5OC 2V7ZA 3VETA 3A0IX 5E26A 5FPMA 1SAZA 5AQNA 5AZJB 2IVNA 2GUPA 5EOYA 5TKYA 2P9PA 2UYTA 3U9ZA 1GLBG 4O8KA 4BQZA 2FSJA 3A8YA 3VENA 3A5MC 4JHDB 4H0YB 4CZJA 4FPBA 3R9PA 2YJFA 3H45C 1SZ2A 2CH5A 3QB0A 5AQUA 1HX1A 1MA9B 4FOIA 3O1BA 2GWJA 4MO5A 1Z05A 3R8EA 2QWOA 4FWSA 1MDUB 3BF1A 3HZ6A 3DXMB 3LDNA 2PBDA 5AQMA 2NRHA 4IZ9A 4CBWA 1NM1A 4BR9A 3CETA 3QFUA 5I9EB 2NZTA 2VCPA 4GY2B 4C23A 2P9NA 4H0OA 4H5VA 1ZC6A 5LJWA 3WEEA 3GDQA 5AQYA 1Y64A 1ZXOA 4LC9B 1NGJA 1QQNA 3LM2A 3RSEA 3MMVA 1TUUA 5BN9A 1YUWA 1S22A 3DJCA 4I6MB 4B9QA 2YCHA 5AZIA 2P9UA 3JXUA 2ZGZA 3H1QA 3U4LA 1YVNA 3SJHA 3BUZB 1LOTB 3JS6A 1HKCA 3WXKA 3LM9A 4BRHA 4QS7A 5BPMA 4RCHA 4CI6A 5AQZA 4PL8A 3CI5A 2P9LA 5AQPA 2YHYA 2E2OA 3QICA 4JD2A 4BC4A 2P9KA 2A6AA 2FLOA 2FF6A 3MN9A 1IJJA 4BC3A 4BROA 1G99A 5AQIA 2W40A 4ISEA 3LDLA 3FZHA 3CQYA 1SQKA 2IVOA 1BUPA 4M7YA 3VOVA 3HBTA 1HUXA 4M63C 3VEZA 1QZ5A 4XH4A 2VYPA 5JLHA 3S41A 5AQRA 4BRKA 3CERA 3FGUA 3O4WA 5AZJA 1GLJO 4IJNA 2P9NB 5FPNA 3WEEB 1NMDA 3QFPA 3IFRA 4BC2A 4JHDA 3VEOA 3O80A 3R6MA 3GL1A 4Y0WA 1NGIA 4HTLA 3FE1A 4QS8A 1BO5O 2AA4A 4BRIA 3D2FB 5AZIB 2P9UB 3GBTA 3ATUA 3H3NO 3FZMA 2IIRA 2IVPA 3AY9A 3DXMA 3MCPA 1KAZA 2QW9A 3FZKA 2HF4A 4DB3A 5LJVA 4B1XB 3M3ZA 1Z6RA 3FR0A 2QWPA 4DCHA 3UKRA 3O1WA 5KPRA 2E20A 4CZEA 1JCEA 4BVPA 3CHWA 2AP1A 2D1KA 4BR4A 1MWMA 3ATVA 2FSNA 1GLCG 1XUPO 3WXJA 3MN6A 2ASMA 4NO7A 4KBOA 1QHAA 4CJ7A 1C0FA 2YHXA 3VF6A 3L4IA 4BRLA 5KPTA 3FFKB 4I6MA 1BU6O 2E8AA 2E1YA 1BWFO 4EIAA 2VWBA 3VEVA 3H46O 3MDQA 1T6CA 3A5NC 2Q0RA 3CJ1A 4FO0A 2A42A 1CZAN 3O8MA 3FZLA 3CJCA 1H1VA 1J6ZA 4H0XB 3ZX2A 5KQDA 1LCUA 1MWKA 2GWKA 3UE5A 3I8BA 4CZHA 2HMPA 3H3OB 1WOQA 5F2RA 1DGKN 1EQYA 1NGEA 2H3GX 2P9IA 4CZKA 2CH6A 4FWPA 2A40A 5LY3A 1QQOA 3O08A 5F1XA 4J8FA 3VPZA 3DXKA 1NGHA 1NBWA 2FSKA 1IG8A 1OKJA 5AQVA 1QZ6A 3DWLA 1WUAA 4CZLA 3FLCO 2V52B 4FPAA 1E4FT 1ATNA 4XH1A 1GLAG 3ENHA 3M6GA 3U8XA 3WQUA 5BRDA 3C7NB 4BRNA 3UKRB 1T44A 2F9TA 3EKSA 5CE3A 2KHOA 5AFUH 5KQ8A 4BRGA 4A62A 2WUSA 3BP8A 1BDGA 1Q18A 2E2PA 4RWTA 1DEJA 2I7NA 2ZGYA 5AQGA 4EAHD 1XC3A 4A61A 2PAVA 3CJ9A 3D2FA 2Q2RA 1NGCA 2QWNA 2YJEA 3QMLA 1HKGA 2A5XA 3HI0A 2D0OA 2CGKA 3CQXA 3ZX3A 1ATRA 2A3ZA 4O5FA 4FWRA 3CJAA 4A2AA 1R59O 4JNEA 3SK3A 4QS9A 2NLXA 3VEWA 4K41A 5AQFA 2P9IB 4H5TA 1HLUA 3ENOA 3O6WA 2CGLA 3ZX0A 4CZGA 2QWMA 3QDKA 3DXKB 4H0PA 3QBXA 5AQKA 3VEXA 1ESVA 2E2QA 4BRMA 1QQMA 1U6ZA 2BUPA 2OANA 3TU5A 3ULEA 3VESA 3ZEUB 4PL7A 3G25A 1ATSA 1BA0A 3CIPA 2QWRA 1NLVA 5AFUA 5AR0A 3MN7A 4ISGA 5EY4A 4CZFA 2CGJA 5BPLA 3EKUA 4FSVA 5AQQA 2W41A 2D0PA 1XQSC 4FWNA 4CBXA 5BN8A 1TUYA 5BR9A 2DPNA 4EHUA 4PKGA 2BTFA 3O5BA 5EXWA 3FZFA 3C7NA 1V4TA 1X3NA 2FXUA 2Q31A 4BRAA 3W3DA 2HF3A 4F9OA 4RTFD 5ADXH 1V4SA 3QBWA 1KAXA 2E2NA 4B1YB 2J4RA 4BR7A 2ZWHA 3TPQA 5FPDA 4B1VA 1KXPA 4BC5A 2P9SB 4A2BA 1P8ZA 1U2VB 1JCGA 5BRFA 5F0XA 3L0QA 1TYQB 3VF4A 3ULEB 3LL3A 1K8KB 3ZETA 3SMPA 4WYBA 4Z94A 4H0VB 4H03B 2YHWA 2D4WA 4EFHA 2HOEA 1D4XA 4CD1A 1HKBA 3ID8A 4FWOA 4K42A 4BG9A 4L3QA 3KZBA 4HWIA 3GE1A 4B1WB 5B8HA 5JLFA 5AQXA 4IWVA 3M1FA 4IO8A 3MK6A 3VGKA 3KHYA 1GLDG 3L6QA 4WQ5A 1GLFO 2Q1NA 2ZF5O 5BPNA 1BG3A 3LDQA 1NWKA 3ZEUA 1DKGD 2E88A 3I33A 5JMVA 1E4GT 1NGFA 4WQ4A 1NGBA 1X9JA 5ADXA 4ISFA 3D2EA 4FOEA 5AQTA 3WXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J2NA 2NUBA 4WFAL 1JLAA 5KPZA 1CN2A 4CD3A 4CHZA 2RF2A 2V51B 1M1KO 1WBBA 2NRZA 3RVCA 5CZ2A 4IG3A 2EHGA 3NF6A 1T7BA 3HTVA 1KVCA 4K25A 3HM8A 3C6AA 1HPMA 1C0UA 5HBMA 2E0HA 1G15A 3VGMA 4MLHA 2BDPA 4DTPA 3T1YK 1HJOA 4JN4A 4JKGB 2KQ2A 3J7ZO 1T1TA 4EP5A 4J2BA 2P9SA 4ID5A 1U2VA 3B6PA 4JV5K 2HVIA 5C0YA 2P9PB 4O0IA 4DLEA 1K8KA 4KFBA 2ITMA 1S1VA 4BQLA 5GINA 3D2EB 3W0LA 1NGAA 4FL9A 5HOOA 2IC3A 1MU2A 4DTRA 4DQRA 3RRGA 1RT6A 5DM7L 3KLHA 1JJ2M 3OHRA 3VQAA 1KC8O 2GTDA 3SLCA 4LF7K 5KGXA 1NU0A 3KK1A 4CGFA 4WF9L 4LSLA 5AQLA 3ZSWA 3CXCM 5CY0A 2BE2A 1S3XA 1BI4A 1VSFA 3A5LC 3THVA 1DT9A 4WQ4C 1REVA 3VA3A 3KD5E 3RSEB 4BR5A 4DTUA 3V1QA 4NLCA 4DTJA 4IXCA 2DY4A 4DV4K 4YDUC 3U9DA 3H1VX 2QWQA 4ZHRA 4FWMA 3LZIA 4BE1A 3CPEA 4B1UB 3SUOA 3SI6A 2UU9K 3BF3A 5AQSA 4AM6A 3KK3A 3CCLN 4HUFA 1B9FA 3KKSA 2G8VA 2NRRA 3OYLA 3NGZA 3HSCA 4B1ZA 2FBXA 2HVHA 3BEXA 3CMEN 1N4NA 1NPIA 3J8AA 4BRCA 4DQ8A 2I7PA 1U49A 2V7ZA 1VSDA 3A0IX 3ISNC 1JLBA 3IAYA 3O9QA 1SAZA 4IG0A 5KRSA 5CZ1A 2P9PA 3H08A 3U9ZA 1SV5A 4FXDA 1SN1A 3TABA 3VQ8A 1XMOK 2FSJA 3SPZA 4IFYA 4JHDB 1Q7YO 1JLCA 4V19S 1RDDA 2CH5A 3QB0A 5AQUA 3TAFA 4B9TA 4FOIA 4LH5A 2OZMA 1PX9A 5C2FA 3G0ZA 4CHPA 1XHXA 1ZBLA 2NRHA 4IZ9A 2VGMA 4CBWA 2Y1JA 3P39A 2VG5A 5I9EB 4C23A 2HHTA 1ZC6A 1WNSA 4O4GA 2OTJN 5AQYA 1Y64A 4U7BA 2D0AA 3UIQA 1QQNA 3LM2A 3RSEA 1VSKA 4HTUA 2LY5A 3F9KA 4Z4FA 3C95A 3I0RA 1L3TA 1JXBA 2P9UA 4HHTA 5KK4A 3H1QA 4O0JA 3U4LA 3THYB 1TK8A 1LOTB 3MWTA 1M90O 4QS7A 3O9TA 4FLZA 1WSIA 1VQKN 4M41A 4CI6A 4FJGA 3ZSRA 1LV5A 3CI5A 2QEXN 1Z25A 3KOWA 3E9OA 1RBTA 3OYNA 1YIJN 3KOYA 2VG7A 1O13A 2FF6A 1HYSA 3LALA 1IJJA 3R1XA 4OGEA 2W40A 3RRHA 3LDLA 3K57A 3FZHA 2IVOA 3VOVA 2YILA 1HUXA 2Z1JA 4N76A 1EWRA 4B9UA 2VYPA 4CJEA 1FJGK 3RWUA 3AVAA 3CERA 1RNHA 2PFUA 4NCGA 3S3OA 3V9WA 4OPKA 4KI4A 1GLJO 3CMAN 2E3FA 4CF0A 1W7AA 5JS1A 4KH6A 3WEEB 1NMDA 4FZXC 5HROA 4QAGA 3DLGA 3SQ0A 4JHDA 3VEOA 2LKBA 3GL1A 4GV3A 1P90A 1RBVA 1NGIA 1EKEA 1C0TA 4KREA 3ZSZA 4JRPA 1EX4A 1NNEA 2IS3A 1MR4A 3NF7A 3H3NO 2QW9A 4B1XB 1QS4A 3C65A 4JK9A 3M3ZA 1Z6RA 4DCHA 5KPRA 3O1WA 3TAQA 2E20A 2A7TA 2YKMA 1KTQA 2WFBA 4N56A 4C8LA 4JK8A 2HHIA 4BR4A 1MWMA 1ILYA 2FSNA 3CM5A 3LPTA 3MN6A 3WXJA 2PY5A 4KBOA 1I6FA 4CJ7A 2YHXA 4YOWA 4PY5A 1C0MA 1RTDA 3WNGA 2P5GA 4PQUA 1BL3A 5J2MA 3THYA 3VEVA 3H46O 4GKKK 1T6CA 4BWMA 3VN5A 3KLGA 1T7PA 4FO0A 1VQ4N 3K5LA 4FJJA 3V1RA 3QEPA 2ZJPL 3ZX2A 5KQDA 3U6FA 4FJ7A 3CW4A 3I8BA 3D45A 4CZHA 3CYMA 2HMPA 3AVMA 3T1AA 1EQYA 1NGEA 5I42A 2YEOA 2H3GX 1IBKK 2CH6A 3CC2N 1RT3A 1QVGM 1QQOA 3IS9A 4MDBA 4EZ9A 4AHTA 5E41A 2KYQA 5AQVA 3KC6A 2QK9A 1HMVA 1RTHA 4FPAA 2V52B 3C7NB 3SQ1A 2B5JA 2F9TA 3EKSA 3KWGA 5AFUH 4AH9A 4JI7K 4JI6K 2ZD1A 4FJXA 3QNNA 5GIOA 3ZCMA 2VWKA 3ZSQA 2ZGYA 2YKNA 2PAVA 2Q2RA 1NJIO 2QWNA 4KKOA 3QMLA 4YY3K 3LZJA 2D0OA 4CE9A 4W5TA 2HHHK 2GBZA 3ZX3A 3PX0A 4M3UA 1OH8A 1CZBA 1NE5A 3TWHA 1QSSA 1FW6A 1NJXA 4KTWA 4FWRA 4A2AA 1R59O 4NXNK 3HJFA 2HBLA 3OJUA 4I2PA 2OCEA 4OLBA 4FJHA 4CGJA 4HVJA 5DM6L 3BZKA 4UJ0A 3HPGA 4ILHA 4FCYA 1BQNA 2CGLA 2QWMA 4FZZA 1XNQK 3QBXA 1ESVA 5LMNK 4O5BA 1IKXA 3TU5A 4W5NA 3VESA 4A5AA 1I2VA 4E7LA 1ATSA 1BIUA 1W97L 3MN7A 4WFBL 1VQ7N 1OH7A 3KLFA 5BPLA 3VQ7A 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3WXLA 2F7TA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5J2N A;  2NUB A;  4WFA L;  1JLA A;  5KPZ A;  1CN2 A;  4CD3 A;  4CHZ A;  2RF2 A;  2V51 B;  1M1K O;  1WBB A;  2NRZ A;  3RVC A;  5CZ2 A;  4IG3 A;  2EHG A;  3NF6 A;  1T7B A;  3HTV A;  1KVC A;  4K25 A;  3HM8 A;  3C6A A;  1HPM A;  1C0U A;  5HBM A;  2E0H A;  1G15 A;  3VGM A;  4MLH A;  2BDP A;  4DTP A;  3T1Y K;  1HJO A;  4JN4 A;  4JKG B;  2KQ2 A;  3J7Z O;  1T1T A;  4EP5 A;  4J2B A;  2P9S A;  4ID5 A;  1U2V A;  3B6P A;  4JV5 K;  2HVI A;  5C0Y A;  2P9P B;  4O0I A;  4DLE A;  1K8K A;  4KFB A;  2ITM A;  1S1V A;  4BQL A;  5GIN A;  3D2E B;  3W0L A;  1NGA A;  4FL9 A;  5HOO A;  2IC3 A;  1MU2 A;  4DTR A;  4DQR A;  3RRG A;  1RT6 A;  5DM7 L;  3KLH A;  1JJ2 M;  3OHR A;  3VQA A;  1KC8 O;  2GTD A;  3SLC A;  4LF7 K;  5KGX A;  1NU0 A;  3KK1 A;  4CGF A;  4WF9 L;  4LSL A;  5AQL A;  3ZSW A;  3CXC M;  5CY0 A;  2BE2 A;  1S3X A;  1BI4 A;  1VSF A;  3A5L C;  3THV A;  1DT9 A;  4WQ4 C;  1REV A;  3VA3 A;  3KD5 E;  3RSE B;  4BR5 A;  4DTU A;  3V1Q A;  4NLC A;  4DTJ A;  4IXC A;  2DY4 A;  4DV4 K;  4YDU C;  3U9D A;  3H1V X;  2QWQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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