5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
2P9KB 1LOTB 4BGBA 4BR4A 3W3DA 1LCUA 3LL3A 1SQKA 4CJ7A 3CHWA 1SZ2A 3ULEB 2E88A 4K42A 4EHTA 4CZKA 3DXMA 4BR5A 3HZ6A 2A41A 3H45C 5AQFA 4GNIA 2GELA 2YCHA 3TPQA 4YDUC 4B1XB 3ATVA 1XQSC 5AQGA 4EAHD 4BR7A 2IVNA 2I7PA 3F9MA 3DXMB 5AQSA 4FWSA 1HX1A 1GLAG 1C0GA 2FF3B 3CJBA 1S3XA 1QZ6A 4DQ8A 5AR0A 4K43A 2QW9A 1JCEA 4PKHA 2FF6A 2D0OA 3O6WA 4EHUA 1NGJA 2ZF5O 1G99A 3VOVA 3TU5A 5KQ8A 2YHWA 3WXIA 2NRHA 3FZLA 4H0XB 3BP8A 2P9LB 2H3GX 1QQNA 4H0OA 4O8KA 1BOTO 5KQDA 3L4IA 3LDQA 2YHYA 4FWNA 4EFHA 3O1WA 2Q36A 3ENHA 3O8MA 4H0VB 2Q31A 3FGUA 2P9PA 2CGKA 3IFRA 3UB5A 4BRKA 3CJ9A 3D7EO 3WXLA 1Z05A 4BRLA 2P9PB 3CIPA 4BRCA 1T6DA 4NO7A 5F0XA 1U6ZA 4IXCA 2NLXA 3L6QA 1QHAA 1P8ZA 5AQQA 5FPNA 4JNEA 5AQJA 1XC3A 1BG3A 1ZC6A 4JHDA 4CZLA 5I9EB 2ZWHA 4FPAA 3C7NA 2D1KA 1NBWA 3ZX3A 4WQ5C 3LM2A 4BC2A 2ZGZA 3VENA 3FLCO 3QBWA 3D2EA 4BVOA 2BTFA 3C7NB 3AAQA 4CBUA 5ADXA 1BU6O 2D4WA 4FL9A 1V4TA 3R9PA 3D2EB 3R6MA 4BRMA 3QFUA 1NGHA 1GLBG 3VGMA 3ZETA 4BR0A 2EWSA 1IG8A 2A5XA 3BF3A 3CERA 3EO3A 1GLFO 2CGLA 2QWLA 3QB0A 4BG8A 5CE3A 3HSCA 3CJAA 1IJJA 3H46O 4B1UB 3EKSA 3L0QA 1GLCG 3ZETB 5AQNA 4LC9B 4DB3A 2GWKA 2V51B 3QICA 4MO4A 3HBTA 4WYBA 5AZJA 3WXJA 3RSEB 2DPNA 2A42A 5LY3A 1HJOA 1SAZA 2W40A 3CJCA 3MN9A 4FWQA 3VF2A 5EOYA 3ZX0A 1X3NA 2FSNA 3A5OC 5ELZA 4BC4A 2P9NA 3A5NC 4MLHA 5AZJB 5AQOA 5BREA 1U2VA 3EKUA 4BRQA 4H5NA 5TKYA 3ULEA 1TYQA 2VWBA 2FLOA 3FFKB 3SK3A 2P9NB 4A2AA 1U2VB 1NGIA 2FSKA 1YVNA 1ZBSA 5BR9A 2ITMA 4QS7A 1TYQB 3CI5A 4FO0A 1BUPA 4H5RA 3SMPA 3R8EA 1NGAA 1S22A 4H0YB 3CQYA 3DXKA 4WQ4A 2ASOA 1NGFA 2V7ZA 4BRIA 4CZIA 5BPLA 4PL7A 4FOIA 3BEXA 1Z6RA 5FPMA 4A62A 4QS9A 3ENOA 2QWRA 2HF4A 3DXKB 5EXWA 1Q18A 4FWMA 5AQTA 2IIRA 3VEWA 4I6MA 1RDWX 3GG4A 2Q0UA 3I33A 3DWLA 2P9IB 3W0LA 2A6AA 5AQPA 4XH5A 4B1YB 2P9LA 2Q2RA 2YJFA 1YUWA 5AQIA 2QWQA 5AQRA 2E20A 3QDKA 4I6MB 4BC5A 2P9SA 4F9OA 4BRDA 1NGCA 1EQYA 1HUXA 4ISEA 4YDUA 5EY4A 5AQMA 1GLEG 4IZ9A 4M63C 2P9SB 5AQYA 2FSJA 3H1VX 1X9JA 3VESA 5AZIA 2E2OA 5KPRA 3A8YA 1QQOA 2GTDA 2E8AA 3U8XA 2QWPA 3JXUA 5AZIB 3P4IA 1MDUB 1JCGA 1NGGA 2A3ZA 2CH5A 2VCPA 1GLJO 2F9TA 5JLHA 3EN9A 2HMPA 3AAPA 4RCHA 3ZX2A 1D4XA 3VERA 1J6ZA 3I8BA 4DCHA 3H6EA 4E1JA 2GWJA 2NZTA 5BRFA 2AP1A 3VEZA 5LJWA 1HKBA 1T6CA 4L3QA 4BGAA 3D2FA 1DGKN 3SLCA 4HTLA 3FZHA 2HF3A 5JICA 5LJVA 3BF1A 4M7YA 3D2FB 2E1ZA 4BROA 4NB4A 5BPNA 3MK6A 4KBOA 2IVPA 3ZEUA 1NM1A 1RGIA 4IWVA 3U9ZA 5AQXA 1YXQA 3MMVA 3WUHA 3ZEUB 1CZAN 1BWFO 3HI0A 4PKGA 4JD2B 1H1VA 1OKJA 4PKIA 3RSEA 2HOEA 4GY2B 3VF6A 4WQ5A 4H5VA 3MN7A 5EX5A 2GUPA 3J8AA 1TUUA 5AQHA 3MN6A 4FWPA 3CQXA 3VPZA 3UKUA 4XEIA 4CZJA 4O5FA 5E84A 3U4LA 4B9QA 3GDQA 2F9WA 4C23A 3KZBA 2BUPA 1DEJA 3UKUB 4BQLA 4BVPA 4AM6A 1JCFA 5JMVA 4XH4A 1BA1A 3GL1A 1NLVA 5AQKA 5BN8A 4BQZA 5AFUH 4BRNA 2YHXA 3UE5A 3EZWA 4K25A 1GLLO 3IMXA 3GBTA 5AQUA 1QZ5A 5JLFA 2W41A 2ASPA 1HKGA 4QS8A 1C0FA 3WQUA 2WUSA 3FZMA 5ADXH 3O80A 4BG9A 4CZGA 4JAXA 3G25A 1QQMA 2CGJA 3MN5A 2P9IA 3FE1A 4M7XA 4CZMA 2CH6A 1BA0A 1ATSA 5AQLA 2A40A 4MO5A 3O4WA 1GLDG 1V4SA 3VF4A 1E4FT 1Y64A 4CZHA 1TUYA 3WQTA 4BC3A 1BDGA 3ID8A 4FWOA 5AQZA 4CD1A 2ASMA 4BRGA 4BRHA 3VGKA 2Q1NA 3U9DA 4FWRA 3SJHA 4AM7A 4A2BA 4PL8A 3KVGA 3LDOA 4MLEA 1KAYA 4H03B 4ISGA 2PAVA 5B8HA 1RFQA 3A0IX 3DAWA 1HPMA 2P9UA 3H3OB 3KHYA 5EVZA 4K41A 5AQVA 2KHOA 1MWMA 2I7NA 4ISFA 3H1QA 5BRHA 3LDLA 1NGBA 2OANA 2IVOA 3VEOA 2P9UB 3GOIA 2V7YA 3FZKA 5AQWA 1YAGA 3EL2A 3WXKA 3H3NO 2YJEA 3WEEA 1ESVA 4RTFD 4A61A 3QFPA 3UKRA 3FR0A 3O1BA 1NWKA 5FPDA 1HLUA 4CZEA 2QM1A 3A5LC 5E26A 1BO5O 1WOQA 3WEEB 3LDNA 3DJCA 3M6GA 3CETA 1NGEA 3A5MC 3UKRB 3VEYA 4H5TA 1NMDA 2D0PA 1MA9B 2PBDA 2AA4A 2UYTA 2E2NA 4Y0WA 5KPTA 1HKCA 3AY9A 4CD3A 5FPEA 3IDHA 3MDQA 1ATNA 1K8KA 3O08A 1NGDA 3QBXA 2QXLA 3M1FA 2GEMA 2QWMA 3O5BA 4IJAA 3VETA 4JD2A 3IUCA 1T44A 1K8KB 2E2PA 2E2QA 4CBWA 5AFUA 2QWOA 4EIAA 5BPMA 3SMSA 4XH1A 4H0PA 4BR2A 2QWNA 3GE1A 4FOEA 5F2RA 4IJNA 3S41A 3HM8A 2Q0RA 3CJ7A 4JHDB 2FXUA 4H5WA 4B1ZA 3LDPA 2V52B 4B1VA 4DHYA 2E1YA 2YI1A 1X3MA 3VGLA 3WT0A 4B1WB 1E4GT 1DKGD 2J4RA 3CJ1A 4CZFA 4BRFA 2Q97A 5BRDA 4H0TB 3M3ZA 3AARA 5KPZA 1ATRA 4FPBA 3HTVA 3QMLA 4BREA 1WUAA 3OHRA 4IO8A 4BRPA 3C0BA 3LM9A 1KAXA 3VEXA 4Z94A 4CBXA 4BRAA 3JS6A 4WQ4C 4RWTA 3BUZB 1MWKA 2VYPA 4FSVA 1R59O 3FZFA 1XUPO 4CI6A 4FWKA 3VEVA 4JN4A 4HWIA 2P9KA 5F1XA 4BR9A 1KXPA 3B8AX 1KAZA 5BN9A 2ZGYA 3ATUA 4J8FA 3MCPA 4FWLA 1ZXOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR4A 2B68A 1LCUA 2G8HA 1SQKA 3CPEA 1D9DA 4CJ7A 4JKHA 1N6QA 1SZ2A 5C24A 2E88A 3ULEB 3SV3A 4K42A 3SCXA 1HJRA 4CZKA 1JZAA 4CGFA 2GELA 2YCHA 2OYQA 4B1XB 3KLFA 4EAHD 2ITGA 4DU4A 3PX6A 2QTDA 1GLAG 1O1WA 3DLHA 4FLXA 4O8UA 4E7HA 2E0HA 3S5TA 4O0IA 1ZUTA 3HPHA 3VOVA 2HBLA 3WXIA 3DRRA 2NRHA 3FZLA 2VGNA 2YIPA 5HBMA 3T19A 2HVHA 2K35A 5AJ3K 4OPJA 1Q81O 3PUFA 3E01A 1TAQA 2BE2A 3K5OA 3J7ZO 3KTQA 1K6YA 3HO1A 2KFZA 1T7PA 4M3RA 3LAKA 1IV0A 3O8MA 1S5JA 2Q31A 2E3FA 5DM7L 4CJFA 2CGKA 3UB5A 3C6HA 3AO2A 3D7EO 1B7DA 3AA3A 1NK8A 3CG7A 1KLMA 3CIPA 4BRCA 4NO7A 3SUNA 2O8FA 2Z1IA 5J2PA 2NLXA 3HVTA 1P8ZA 4BEBA 4CK2A 1C56A 4CF8A 4JV5K 2DTUA 4JHDA 1WMTA 5H1SQ 2ZWHA 1N33K 3C7NA 3DLRA 4B3SK 1JXCA 4CGGA 4MDBA 2HHXA 4FM1A 3LM2A 3VENA 2BTFA 3C7NB 2LSNA 3CCLN 3AAQA 4IOAL 5ADXA 3OTOK 4CFCA 3R6MA 3SYZA 3DI6A 2A5XA 3ZT2A 2QWLA 2VGMA 1IJJA 3E9PA 1J5OA 2F8TA 3S3NA 1GLCG 3NH1A 4DSLA 3OYMA 2Y1JA 3P38A 1SN4A 4GV6A 1B92A 4FW1A 1VSIA 2AJQA 5AZJA 5C0YA 5CR4A 3M8PA 5EOYA 4M41A 3V9XA 4UJ0A 1X3NA 4FJHA 5ELZA 5TKWA 2G8IA 1YJ9N 5AZJB 4X62K 3KLEA 2YNFA 5JS2A 4CK3A 5AQOA 3MXJA 3TWHA 4JRPA 5BREA 4JI8K 3EKUA 5GAGP 4M3YA 1I39A 2QI2A 4I7FA 1WWNA 2FLOA 4Z4CA 3CC7N 3L56A 3KD5E 4B8AB 1S1WA 2FSKA 3T1YK 4OKKA 3CI5A 1NK7A 1D9FA 1BUPA 1WAJA 1NOZA 1NGAA 4JI1K 2YNHA 3SPYA 4MFBA 1ITGA 2O8BA 2HHIA 1WSEA 4BRIA 4FOIA 4G1QA 4QS9A 4AHTA 3TAFA 1ZBFA 3DOLA 2O8BB 4C8OA 1Q18A 1RBVA 4FWMA 4FZZA 4CE9A 3GG4A 2Q0UA 3HPOA 3AVLA 3DWLA 3S3MA 2A6AA 4FJ7A 1RT2A 2P9LA 2YJFA 5AQRA 3QDKA 3TTCA 4DR4K 1NGCA 2VY6A 3OS1A 3ID6A 4ISEA 5EY4A 1BQMA 5J2NA 2OPRA 2G8KA 3K9JA 3SZ2A 3PO5A 1NRBA 3QEWA 2LJ7A 1NRAA 3T1AA 4F4KA 4IEIA 1RNHA 2GTDA 1XI1A 3V9UA 2XY7A 2ZQBA 3AVGA 3JXUA 4CJ5A 3P4IA 1VNAA 1JCGA 1VSLA 2IDOA 2VCPA 2XRIA 1GLJO 2F9TA 1Q9XA 3EN9A 4HE7A 1D4XA 3VERA 2P5GA 4E1JA 4DTPA 2GWJA 2NZTA 2AP1A 1ZBUA 1X9SA 2D56A 2PYLA 4B3OA 1KQSM 1HKBA 4CEZA 1HNXK 2UUBK 3KLHA 2QEXN 3T69A 3Q7BA 3FZHA 1CLQA 1X9WA 5LJVA 1LW2A 1VRTA 4GW6A 4M7YA 3QI7A 4DQRA 4NB4A 4KBOA 2IVPA 3PIPL 4BE0A 3CMAN 4N76A 1KSPA 4IWVA 1WSGA 1YXQA 1RDCA 4C1NK 1OVQA 4CEEA 1VQ7N 2ZD1A 1CZAN 1BMRA 2VG6A 3HI0A 4H4MA 3QNOA 4KO0A 4JD2B 5HROA 3K2PA 3THYA 4NYFA 3TAMA 4DSKA 2KBHA 2NRVA 1PTXA 3MN7A 3N4PA 2KLAA 3V1OA 3ZT1A 2C1IA 3J8AA 3NGYA 3MN6A 3C6AA 4CZJA 3THYB 4ZTFA 1C0UA 4ILGB 3LP1A 4O5FA 2GX9A 5M1PA 4JKFA 1JLCA 1T03A 1TV6A 4B9QA 4UAFE 2F9WA 1GOAA 2FBYA 2E4LA 4C23A 4A5AA 1YI2N 1RDUA 5C2FA 1IKVA 4LSNA 3GL1A 1NLVA 1XNRK 3VTIA 3PSMA 2X74A 1HQEA 2UUCK 3KLIA 4K25A 4MDAA 3VQ5A 4Y1CA 4BDZA 1K73O 1NJZA 3G10A 4CEAA 1KLNA 2LJMA 1IBMK 4FK4A 4DU1A 4OKJA 4QS8A 1C0FA 1XWLA 4FCYA 4XIUA 2WTUA 3E1YA 5ADXH 3O80A 4BG9A 4CZGA 3MXMA 2YV0X 2W42A 1VQKN 3FE1A 1JKZA 4CGIA 5KRSA 2CH6A 1BK8A 3CMEN 1BA0A 4LF6K 2ETJA 5AQLA 3DMJA 3WNHA 3AVFA 4ZHRA 1Y64A 3ID8A 5AQZA 4CD1A 4FLUA 1XRSB 4QOZB 3WNGA 4A5BA 4OJRA 4F2RA 4AM7A 4A2BA 1G15A 3LDOA 3ZYYX 2PAVA 5B8HA 1I6GA 4PWDA 2FBVA 4JKEA 3CCVN 3L2VA 1SL0A 1KTQA 5SZTA 5AQVA 4ILHA 4JK7A 1MWMA 1OMYA 2N66A 5GADP 1T8EA 1EWRA 4HUGA 5BRHA 3SBGA 3EE9A 3GOIA 4FLVA 2V7YA 5AQWA 3ZSOA 4E7IA 3D45A 4E1MA 2VQEK 3V1QA 3MX2A 3PY8A 1DJTA 3FR0A 5LMUK 5FPDA 4CZEA 1HYVA 5IT9O 1WOQA 1MU2A 3DJCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BR4 A;  2B68 A;  1LCU A;  2G8H A;  1SQK A;  3CPE A;  1D9D A;  4CJ7 A;  4JKH A;  1N6Q A;  1SZ2 A;  5C24 A;  2E88 A;  3ULE B;  3SV3 A;  4K42 A;  3SCX A;  1HJR A;  4CZK A;  1JZA A;  4CGF A;  2GEL A;  2YCH A;  2OYQ A;  4B1X B;  3KLF A;  4EAH D;  2ITG A;  4DU4 A;  3PX6 A;  2QTD A;  1GLA G;  1O1W A;  3DLH A;  4FLX A;  4O8U A;  4E7H A;  2E0H A;  3S5T A;  4O0I A;  1ZUT A;  3HPH A;  3VOV A;  2HBL A;  3WXI A;  3DRR A;  2NRH A;  3FZL A;  2VGN A;  2YIP A;  5HBM A;  3T19 A;  2HVH A;  2K35 A;  5AJ3 K;  4OPJ A;  1Q81 O;  3PUF A;  3E01 A;  1TAQ A;  2BE2 A;  3K5O A;  3J7Z O;  3KTQ A;  1K6Y A;  3HO1 A;  2KFZ A;  1T7P A;  4M3R A;  3LAK A;  1IV0 A;  3O8M A;  1S5J A;  2Q31 A;  2E3F A;  5DM7 L;  4CJF A;  2CGK A;  3UB5 A;  3C6H A;  3AO2 A;  3D7E O;  1B7D A;  3AA3 A;  1NK8 A;  3CG7 A;  1KLM A;  3CIP A;  4BRC A;  4NO7 A;  3SUN A;  2O8F A;  2Z1I A;  5J2P A;  2NLX A;  3HVT A;  1P8Z A;  4BEB A;  4CK2 A;  1C56 A;  4CF8 A;  4JV5 K;  2DTU A;  4JHD A;  1WMT A;  5H1S Q;  2ZWH A;  1N33 K;  3C7N A;  3DLR A;  4B3S K;  1JXC A; 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