5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
1U2VA 1Q18A 3WXLA 2CGJA 2I7PA 2ASPA 3H1QA 5AQLA 4WQ5C 4IJNA 3W0LA 3GOIA 1D4XA 5AQXA 2E8AA 2V51B 4H0OA 4BVPA 3FZKA 3UKUA 1GLCG 2E88A 1GLLO 3J8AA 3R8EA 1HJOA 1NGDA 5AQRA 4FWMA 5AQTA 4MO4A 1BA1A 3ZEUB 3ATUA 4BR9A 3LM2A 4I6MB 3VF2A 2P9KA 3A0IX 5AZIB 3QMLA 4B1ZA 3CETA 4CZIA 1NBWA 5EVZA 2P9UA 5AQPA 3TU5A 2P9NA 4FSVA 4C23A 5AQIA 2A42A 4MO5A 1KAYA 4JNEA 4E1JA 4M63C 3LDQA 3VGLA 3VEZA 4FPBA 3UKUB 2QWRA 2YJFA 2PBDA 4YDUA 4FWRA 1MWKA 1V4TA 4K41A 3DWLA 4FOEA 4BR2A 2FF6A 1S22A 3SLCA 4BRAA 2NLXA 4BRIA 4H0VB 2YCHA 4AM6A 5BRDA 1ZXOA 2PAVA 3L4IA 2P9UB 1T6DA 1NGAA 2Q2RA 5KQDA 4MLHA 5AQQA 3DJCA 4IO8A 1QHAA 2P9IA 3AAQA 5LJWA 4A61A 3A8YA 2HOEA 4H5TA 4QS9A 5AZJA 4PKHA 3DAWA 2YHYA 4BRFA 3VEXA 1QQNA 4JN4A 4GNIA 1SQKA 2E2NA 2E2QA 2YHWA 3LDOA 1HKGA 4QS8A 4XH5A 1ZBSA 5EX5A 4H5VA 4A2BA 3MCPA 4J8FA 1HKBA 3VGMA 4O5FA 4DHYA 1YVNA 3O4WA 3GBTA 2QWOA 3AY9A 3FZLA 5BN8A 1GLEG 3KZBA 4CZFA 2ASMA 4NO7A 2A40A 5F2RA 4BRDA 2YI1A 3LM9A 4BQLA 4B1YB 4FWKA 4B1XB 2A6AA 3L0QA 3C0BA 2KHOA 2QWPA 5AQGA 3HTVA 2QWQA 3BEXA 2BTFA 2P9SA 1MDUB 3IUCA 3O1WA 2ZF5O 1YUWA 2P9LA 2VCPA 2HMPA 2V52B 5I9EB 3MN5A 3F9MA 5JLFA 1TUUA 3ZEUA 4M7YA 1XUPO 1NGCA 5AQWA 4HWIA 2GWJA 1HKCA 2D0OA 4BC2A 2J4RA 1TYQB 4HTLA 5AFUA 5AQZA 4BRGA 5JICA 2E20A 4BC5A 5AQHA 1NM1A 1MWMA 4RTFD 2P9LB 1NMDA 5BRFA 1ESVA 4XH1A 2NZTA 5AZIA 1GLDG 1KAZA 4CZHA 1YXQA 2QWLA 3KVGA 2H3GX 3KHYA 4FWLA 3RSEB 2IVPA 2IVNA 5LJVA 2QM1A 3H3NO 4CD3A 3WEEB 4IXCA 4FWSA 4Y0WA 3A5MC 5ELZA 1KAXA 3A5NC 4PKIA 4BROA 3M1FA 1NWKA 4FOIA 3I8BA 4BGBA 2Q31A 3C7NB 3CJ9A 3VGKA 5LY3A 4XH4A 4CI6A 3U9ZA 1G99A 1MA9B 2F9TA 2ZGZA 3LL3A 1BUPA 4JHDB 1RFQA 1LOTB 2HF4A 4IJAA 1NGEA 3H3OB 3ZETA 4CZJA 2YJEA 5F0XA 2VWBA 3CJBA 4CZEA 4DB3A 3VEOA 3LDPA 2ZWHA 3JXUA 3O8MA 5AQFA 2GEMA 2Q97A 2VYPA 1E4FT 3H46O 1YAGA 1X3MA 3O5BA 1HX1A 3DXMB 3EKUA 1H1VA 3VENA 1P8ZA 2GELA 2FSKA 3CI5A 4F9OA 4YDUC 3ZETB 1HPMA 3VEYA 2UYTA 4H0YB 3CJAA 3CQXA 4BREA 2YHXA 3HBTA 3VETA 4BVOA 2FLOA 3HSCA 4B1VA 3GL1A 5EY4A 2E2OA 2P9PB 3I33A 3EN9A 3O08A 5KQ8A 4XEIA 2E2PA 3IDHA 3U9DA 4BQZA 3JS6A 1Z6RA 4CBUA 2CGLA 3U8XA 1QQMA 2F9WA 4B1UB 2DPNA 1EQYA 1BO5O 5EOYA 3DXKB 4H03B 3CJ1A 3EO3A 1BWFO 1DKGD 3FGUA 3VESA 5AR0A 4CZGA 3D2FB 2D1KA 3QBWA 1ZC6A 1BA0A 2ITMA 4H0PA 4RWTA 1TYQA 3R9PA 3FZMA 4K43A 3WQUA 2ZGYA 4EHUA 3EKSA 3VF6A 4BR7A 2Q0UA 3O80A 5AQOA 4BRNA 3H6EA 2FSNA 2CH5A 3ZX3A 4IWVA 4WQ4A 3VPZA 4BC3A 5BREA 3AARA 3UKRA 2AP1A 3RSEA 3BUZB 4FL9A 4PL7A 4H5RA 5KPRA 3A5OC 4EHTA 5BN9A 4KBOA 5JMVA 1NGFA 1K8KA 3WEEA 3WUHA 1Z05A 2Q1NA 3FFKB 1WUAA 4FO0A 3SJHA 3VEVA 3U4LA 3M6GA 1CZAN 3ENOA 4JD2B 3C7NA 3CJ7A 1GLFO 2FXUA 3QFPA 4FPAA 5E26A 4NB4A 2AA4A 4JHDA 3GE1A 4A62A 4CZLA 4BRLA 4CJ7A 2A5XA 1HUXA 4BR4A 4BRKA 3MN9A 3UKRB 4PL8A 3SK3A 1BDGA 3MN6A 3WQTA 3QICA 4L3QA 5F1XA 3O6WA 4K25A 5AQMA 3SMPA 3WXKA 1DEJA 1K8KB 5JLHA 3FZFA 3AAPA 1DGKN 3MDQA 3WXJA 5BR9A 4MLEA 5AQSA 1T44A 2D4WA 1RDWX 3ULEB 3L6QA 5AQNA 4WQ5A 1Y64A 3D2EB 3DXMA 2W41A 1JCGA 3QDKA 1XQSC 2QXLA 3EL2A 2A41A 3VOVA 1U6ZA 1S3XA 4CZMA 1JCEA 3ZX2A 2ASOA 3CHWA 2WUSA 3UB5A 3D7EO 3GDQA 3H1VX 3ID8A 5AFUH 5AQKA 4WYBA 2GTDA 4O8KA 4A2AA 2P9PA 1NGHA 3VERA 2A3ZA 1BG3A 3G25A 3FZHA 3FR0A 4BR0A 1SAZA 1IG8A 4CZKA 3SMSA 3MN7A 1GLJO 3ENHA 1NGGA 5AQJA 3O1BA 4K42A 1U2VB 3OHRA 1C0FA 1KXPA 4B1WB 2OANA 4H5NA 3HZ6A 1NLVA 3DXKA 1NGJA 4DCHA 2W40A 4H0XB 5KPZA 3D2FA 1GLAG 1JCFA 4FWOA 2V7YA 1NGIA 4RCHA 1BOTO 1WOQA 1ATNA 5FPNA 4B9QA 2QW9A 5BPMA 4LC9B 2P9KB 3HM8A 2HF3A 3S41A 2GWKA 2D0PA 3P4IA 1IJJA 4CBWA 5AQVA 2P9NB 4CBXA 5E84A 4BG8A 2Q36A 2Q0RA 3VF4A 1TUYA 4Z94A 3CJCA 4BRPA 1LCUA 4FWQA 3CERA 4QS7A 4BG9A 4BR5A 1QZ6A 4H0TB 3CIPA 3WXIA 5ADXA 3A5LC 4AM7A 3ATVA 4EIAA 2EWSA 3EZWA 3UE5A 4GY2B 3QB0A 3M3ZA 4JD2A 2V7ZA 3IFRA 2CGKA 3FE1A 4CD1A 1X9JA 5AQYA 2IVOA 3HI0A 5B8HA 3LDNA 1XC3A 5BPNA 1HLUA 3GG4A 1V4SA 4EAHD 3QFUA 4BGAA 2CH6A 3QBXA 1R59O 2P9IB 1NGBA 4EFHA 2BUPA 2QWMA 4FWPA 5AZJB 3BF1A 4WQ4C 3B8AX 1ATSA 1ATRA 4ISGA 3BF3A 4BRCA 5BRHA 5BPLA 4BRMA 4FWNA 1E4GT 3LDLA 4PKGA 3IMXA 4ISEA 4BC4A 3ULEA 4H5WA 1J6ZA 1QZ5A 3TPQA 5FPEA 2E1YA 2FF3B 3D2EA 5FPDA 2GUPA 4JAXA 5CE3A 2I7NA 5EXWA 4DQ8A 2NRHA 5ADXH 1X3NA 2FSJA 4M7XA 5KPTA 1BU6O 1QQOA 5TKYA 2QWNA 3R6MA 1RGIA 4IZ9A 3VEWA 2P9SB 3BP8A 3MMVA 5AQUA 1GLBG 4ISFA 3MK6A 3ZX0A 4BRQA 3W3DA 3CQYA 4BRHA 1SZ2A 4I6MA 5FPMA 2E1ZA 1C0GA 1OKJA 2IIRA 3WT0A 1T6CA 3FLCO 3H45C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GKUA 3VTIA 1X9WA 3M8PA 1D4XA 1NK9A 1QQCA 3EYZA 2OTLN 5AQXA 3K5OA 2ZE2A 1KVBA 1NH5A 4KI4A 3J8AA 3E66A 3P38A 2MZ0A 1BHLA 4DV3K 1SUQA 4MO4A 3ULDA 1JZAA 2O8BA 2GMOA 4BR9A 3LM2A 1T0ZA 4DR1K 4I6MB 3A0IX 4X62K 5AZIB 2YKNA 1SN1A 3ZSOA 2QTDA 4FSVA 1YHQN 4MO5A 4CIFA 4JNEA 1K8AO 1VRTA 4DF4A 3K2PA 1JLCA 1VQ7N 4IDKA 1P0AA 4TSXA 2ETJA 2O4IA 1MWKA 3O3HA 3KOXA 1Q8IA 3WNHA 4E19A 1S22A 3DRPA 4JI2K 3CFPA 3CPWM 1KD1O 4JV5K 2Q2RA 1T6DA 4CEZA 2RPIA 5FRNA 4LF8K 1Q7YO 4W5TA 4JKDA 4LFAK 1T05A 1QHAA 5D3GA 2GUIA 5AZJA 1HNWK 3G6EN 2XY5A 3VEXA 4CK3A 4LSNA 4O0JA 1SQKA 4JKFA 1NJZA 2YHWA 3LDOA 4FLZA 4DV4K 3QEXA 3A2FA 1ZBSA 3ZCMA 1HKBA 1RT7A 4CGFA 2HBMA 3FZLA 5BN8A 2QA4N 2O4GA 3ZT0A 4DR6K 4RW9A 4NO7A 3CG7A 5C42A 4BQLA 1BI4A 3LM9A 4B1YB 3SAFA 1VQ5N 4CEDA 2BTFA 1MDUB 1FJGK 4LF4K 4KHWA 2ZF5O 4M3TA 4CW7B 2F8TA 3K59A 3WXMB 1WWNA 2WFBA 4N76A 1TUUA 3HPGA 3VTHA 4I9QA 3WNFA 1HKCA 3KKRA 2YBRC 2D0OA 1T8EA 1S5JA 1BGXT 3KP1A 1ICAA 4HTLA 4B9UA 4GV9A 4WCEL 4ELVA 4JLHA 1UA1A 3MWTA 3ZT4A 4AHVA 2ZD1A 1LWFA 3P1GA 1YXQA 1N34K 3LALA 3RSEB 5LJVA 3DOLA 1ZBUA 3R3LA 3THXA 1JXBA 3HPHA 4IXCA 4FWSA 2E0HA 3VA3A 1KAXA 3A5NC 3TAPA 4PKIA 4BROA 1OH8A 4JI0K 3KK1A 3I8BA 4BGBA 2Q31A 3C7NB 1MA9B 4OVLA 3TTFA 2NRXA 2YV0X 3LL3A 4FJ5A 1BMRA 5BR8K 3U3YA 1NNEA 3SUPA 3SZ2A 3N4PA 4DU3A 2HHWA 4IEEA 4GMJB 1OVYA 1NGEA 5MLCQ 1RT1A 1K9MO 5F0XA 4FLUA 4WE1A 3OYFA 4KB1A 3MXMA 5M1PA 4OKJA 1KFDA 2Z1JA 1FXXA 2Q97A 1S9GA 1OH6A 4B3OA 1KCFA 1E4FT 1TKXA 1XC9A 1HX1A 1QVGM 4DTOA 3OYCA 3L2RA 3TAEA 1D9FA 5J2MA 1ASUA 3S5TA 2BH1A 2OZSA 1JJ2M 3VQBA 1ZFUA 3RR7A 1NOYA 3ZLJA 3VEYA 4O55A 3SPZA 4BDPA 1SNBA 4BREA 3OS0A 3CYMA 3VETA 2O8DA 4LD0A 3GL1A 5EY4A 4GVEA 4DSLA 1ZBHA 3AO5A 4CJTA 4CVNE 3OBWA 4XEIA 3V4IA 2C1IA 3UIQA 5DK5A 2A7TA 5GAGP 2G8KA 1T03A 3TANA 2CGLA 3C94A 2B5JA 3L8BA 3U8XA 1QQMA 5C10A 4FLWA 1S1TA 2VG6A 3ZSXA 4MQ3A 4B1UB 4DU1A 4DTSA 4Z4GA 3TAQA 3DLBA 4FJ9A 5IT9O 4HCCA 4H03B 3EO3A 2HHTA 4IFYA 1BWFO 1TKDA 4FZZA 4FK2A 2P1JA 3ZT2A 1NJYA 3VESA 2O8DB 3D2FB 3AGRA 1IO2A 1C0UA 3HT3A 2YEOA 2NRVA 3NMUA 3KK7A 1WSHA 1TYQA 4NLCA 3R9PA 1JXCA 3FZMA 4K43A 3C95A 4N41A 4ZTJA 4BRNA 1XI1A 5J2PA 4O8UA 4Q0BA 2KLAA 2CH5A 1DQ7A 1K8BA 4BC3A 2BDPA 5BREA 4A5AA 3PV8A 3UKRA 4CHNA 3LPTA 3CMAN 1VQLN 4JRPA 3A5OC 3CXCM 4FLVA 4FVUA 2PZSA 3HVTA 1NGFA 3WEEA 4CEFA 4BECA 4QCLA 3K9KA 1CZAN 3SAHA 1GLFO 5E26A 3IS9A 4JI8K 2KFNA 2A5XA 5GIOA 3F9KA 3UKRB 1U47A 4JI6K 2NNWA 1RTHA 3ZT3A 3MN6A 3CCJN 3LDSA 4HUEA 2ZQBA 1VSJA 3OS2A 1DEJA 2G8FA 1ASVA 1RNHA 3G4SN 3THWB 1E3MA 1HJRA 5BR9A 3N4QA 1T44A 2D4WA 1RDWX 1B7DA 3CCUN 3K9JA 5JVGL 4WQ5A 1C0MA 4DLGA 3NVKA 3D2EB 3DXMA 4FK0A 3QDKA 4JS5A 3CMEN 2IAJA 4AHRA 3VOVA 4J2EA 2YX6A 4E7KA 4XIUA 1KFSA 4CF9A 3RR8A 4FYDA 3GDQA 1YI2N 1PX9A 2GTDA 2P9PA 5FDLA 1NGHA 1ITGA 2A3ZA 1YF5L 3QINA 3G25A 4DTPA 3MEDA 3NF7A 4DTRA 1RT4A 1ZBIA 3MN7A 3Q7CA 4QOZB 1S1VA 1WNSA 1HRHA 4X64K 1NGGA 1Q82O 4MDAA 3D6RA 4EP4A 4B9NA 3O9RA 4BY9C 2I61A 2XY8A 4M45A 4DCHA 2W40A 1RCHA 2UUCK 3OYGA 3HJFA 3QNNA 1NGIA 3MEEA 1BOTO 4CJFA 1TK8A 1KLMA 4Y1DA 3THYB 5M1NA 1L5UA 3HM8A 3KC6A 1RTJA 4CJRA 4DV1K 2D0PA 4YOYA 3OA9A 2LI7A 5CY4A 3VN5A 2Q36A 3PO5A 1JLAA 3CJCA 3DLRA 4OLBA 4BRPA 1LAWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GKU A;  3VTI A;  1X9W A;  3M8P A;  1D4X A;  1NK9 A;  1QQC A;  3EYZ A;  2OTL N;  5AQX A;  3K5O A;  2ZE2 A;  1KVB A;  1NH5 A;  4KI4 A;  3J8A A;  3E66 A;  3P38 A;  2MZ0 A;  1BHL A;  4DV3 K;  1SUQ A;  4MO4 A;  3ULD A;  1JZA A;  2O8B A;  2GMO A;  4BR9 A;  3LM2 A;  1T0Z A;  4DR1 K;  4I6M B;  3A0I X;  4X62 K;  5AZI B;  2YKN A;  1SN1 A;  3ZSO A;  2QTD A;  4FSV A;  1YHQ N;  4MO5 A;  4CIF A;  4JNE A;  1K8A O;  1VRT A;  4DF4 A;  3K2P A;  1JLC A;  1VQ7 N;  4IDK A;  1P0A A;  4TSX A;  2ETJ A;  2O4I A;  1MWK A;  3O3H A;  3KOX A;  1Q8I A;  3WNH A;  4E19 A;  1S22 A;  3DRP A;  4JI2 K;  3CFP A;  3CPW M;  1KD1 O;  4JV5 K;  2Q2R A;  1T6D A;  4CEZ A;  2RPI A;  5FRN A;  4LF8 K;  1Q7Y O;  4W5T A;  4JKD A;  4LFA K;  1T05 A;  1QHA A;  5D3G A;  2GUI A;  5AZJ A;  1HNW K;  3G6E N;  2XY5 A;  3VEX A;  4CK3 A;  4LSN A;  4O0J A;  1SQK A;  4JKF A;  1NJZ A;  2YHW A;  3LDO A;  4FLZ A;  4DV4 K;  3QEX A;  3A2F A;  1ZBS A;  3ZCM A;  1HKB A;  1RT7 A;  4CGF A;  2HBM A;  3FZL A;  5BN8 A;  2QA4 N;  2O4G A;  3ZT0 A;  4DR6 K;  4RW9 A; 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