1GLAG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 157
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glaG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glaG01
2Q36A 3M6GA 4H0OA 5E26A 1NGCA 2YJEA 3MN5A 3ZEUB 3ZX2A 4BR0A 1YUWA 1GLFO 1K8KB 2P9LA 2QWNA 5F0XA 3H6EA 2NZTA 3BF3A 1GLAG 5TKYA 5AQLA 2QXLA 3TPQA 4B1WB 4L3QA 1NM1A 3VEVA 3M3ZA 4Z94A 3FR0A 3H45C 4K41A 2FF3B 1NGFA 2QWOA 2A42A 4BC3A 5FPEA 2ZGZA 3H3OB 4RTFD 3QB0A 4A2BA 3MDQA 4C23A 3UE5A 1BOTO 3VPZA 2P9PA 4RWTA 4XH4A 4CZJA 1TUUA 1ZXOA 1Z6RA 4K25A 4CBUA 1NGEA 2CGLA 4BGAA 4FWOA 2YHYA 5AQRA 2J4RA 4JD2B 1IJJA 5AZJA 3BF1A 2Q31A 4WQ4C 4NB4A 2P9IB 4BRKA 3VF2A 5BRFA 2EWSA 2ASOA 3MN9A 4BC4A 3CIPA 2P9SB 1GLJO 1H1VA 3A5LC 3OHRA 3VGLA 3U4LA 2AP1A 2E20A 3L0QA 5BPMA 4BR4A 3FE1A 4H5WA 3A5NC 3FZMA 3ID8A 1GLDG 2QW9A 4MLEA 2BUPA 2P9KB 2A41A 1CZAN 3ATVA 4BG9A 1GLBG 3VEYA 3GL1A 3IMXA 2P9LB 3WXLA 5AQXA 4GNIA 3VEZA 1SQKA 2FF6A 4BQZA 5AQPA 1NGAA 1HKGA 2YI1A 3A5MC 3CJCA 4CZHA 4EAHD 3QFPA 1WUAA 3R6MA 2P9PB 4IZ9A 4XH5A 4BRPA 4FWRA 3VF4A 1YVNA 1NBWA 4BR5A 1IG8A 5BPNA 5AQNA 2YHXA 3B8AX 5AQFA 5CE3A 5AZJB 3IDHA 3HM8A 2ITMA 2P9NA 3DXKB 5AR0A 2F9TA 2E88A 2QWQA 4RCHA 2E1YA 1ATNA 1KAYA 2I7PA 1XQSC 1U2VB 3VGKA 4BVOA 4CZMA 4CD1A 2A40A 3FLCO 2PAVA 4FL9A 3HZ6A 1NMDA 2QWRA 4DB3A 5JLFA 2CH5A 3UKUB 5BN9A 1ATSA 3U9DA 3CJ1A 3FZFA 3W3DA 2E8AA 4CBXA 5AQSA 3ENOA 2FLOA 1BWFO 1DEJA 4WQ5A 4CZKA 3GOIA 2GUPA 5LY3A 4QS7A 1BO5O 5EX5A 1G99A 2Q2RA 4O5FA 2ASPA 1ATRA 4KBOA 2P9UA 5KPTA 2UYTA 4BR2A 1BA1A 2CGJA 5F1XA 3CI5A 5AQYA 4BRQA 3MN6A 2GWJA 3S41A 4PKIA 3EN9A 3LM2A 2PBDA 5AQIA 4FWSA 3LDPA 5AQQA 3U8XA 3WXKA 4AM7A 3MMVA 5AQZA 2P9NB 4A61A 4BRAA 3O1WA 1U6ZA 2H3GX 2FSJA 3QICA 2W40A 3CERA 1Z05A 3ZETA 1NGJA 2E2OA 2YJFA 3UKRA 2V52B 3MN7A 3QDKA 4E1JA 2IVPA 2YHWA 1SZ2A 2IVNA 1XC3A 1QQMA 4XH1A 3DXMA 4CZEA 1GLLO 3AAPA 3JXUA 4AM6A 3FZKA 4JAXA 2DPNA 3VGMA 2QWLA 3SMSA 4IO8A 4NO7A 3EKSA 1Y64A 2E2QA 4JHDA 4FWQA 3A5OC 4H0TB 4M63C 1ESVA 3KHYA 1JCGA 1TYQA 3QFUA 1DGKN 5LJVA 3ULEA 2E2NA 3D2EA 1D4XA 3HTVA 3HI0A 2I7NA 1NGBA 4WQ5C 3GG4A 3WEEB 3WQUA 2D0OA 1R59O 4ISFA 4CJ7A 3D2FA 3H1QA 3QBWA 4K42A 4WYBA 4BRGA 3RSEA 5BN8A 3SK3A 3VERA 2W41A 3WQTA 4XEIA 3GBTA 2GEMA 2HF3A 1C0GA 3UKRB 4B1ZA 1YXQA 1NGIA 4I6MA 1X3MA 3VEXA 5AQKA 3L6QA 1OKJA 1V4TA 4FWLA 5EXWA 4FOEA 4H5NA 3C7NA 1SAZA 2E2PA 2A5XA 2GTDA 2Q0UA 1WOQA 3UB5A 3BEXA 4BVPA 4FWPA 4CI6A 4H0YB 2CGKA 4H5TA 4CZGA 3O6WA 4FOIA 3CJBA 3AARA 3SJHA 4BREA 1RGIA 1MWKA 1C0FA 4BRLA 1GLEG 3O1BA 4FWMA 4B1VA 3SLCA 1NGGA 3WXJA 5FPDA 4MO5A 5B8HA 4B1XB 4H0VB 2A3ZA 1DKGD 3MCPA 4FWNA 1QQNA 5AQGA 3IFRA 5AQUA 5EY4A 4GY2B 3O80A 2V7YA 3LDNA 3WEEA 3SMPA 1MA9B 1RDWX 1TUYA 2V7ZA 4BC5A 3VETA 3ZEUA 3FGUA 1NGDA 4I6MB 5ADXH 5BREA 3HBTA 5BRHA 4B9QA 3L4IA 4ISEA 3CQXA 5AFUH 2AA4A 3DJCA 1S3XA 5FPNA 5ADXA 4A62A 3KVGA 4BC2A 4CZLA 2BTFA 3C0BA 5AFUA 4YDUA 5EOYA 1J6ZA 1Q18A 4QS9A 2A6AA 2CH6A 5BR9A 3A8YA 3DWLA 5JICA 1QZ6A 4HWIA 2Q97A 4BRMA 1HUXA 4JN4A 3I33A 4B1UB 4IXCA 1T6DA 3TU5A 4CZIA 4QS8A 3VEWA 5E84A 4BRIA 1JCFA 3JS6A 3LDOA 4PKGA 2P9SA 3HSCA 3A0IX 4CD3A 3O8MA 1T44A 2ZF5O 4HTLA 3VOVA 1HX1A 3CJAA 4FPAA 3LM9A 2GELA 3U9ZA 1KAXA 1KXPA 2P9KA 5AQWA 3MK6A 4BRDA 3BP8A 5AQVA 1NGHA 5FPMA 3CHWA 3CJ7A 3I8BA 4A2AA 5AQHA 2QWPA 5JLHA 2FSNA 2HOEA 2P9UB 5LJWA 2IVOA 3F9MA 3H1VX 5AQTA 2NRHA 2D0PA 2IIRA 3KZBA 4J8FA 2D4WA 3FZLA 4BR7A 4IWVA 1BDGA 1KAZA 1BU6O 4CZFA 3IUCA 2OANA 3ATUA 3VEOA 1HLUA 3CQYA 3P4IA 5AQMA 5BRDA 4MO4A 4Y0WA 2VCPA 2NLXA 3ZETB 5ELZA 1S22A 1E4GT 3DXKA 4BRCA 3R8EA 5F2RA 1QZ5A 3AAQA 1NWKA 2F9WA 2FXUA 3VESA 4YDUC 5JMVA 3VF6A 2GWKA 4LC9B 1U2VA 2ZGYA 4H5RA 1LOTB 4PL8A 3GE1A 3O08A 3DXMB 3CETA 3J8AA 3UKUA 4O8KA 3WUHA 1EQYA 3EL2A 4BG8A 4FWKA 2WUSA 1QQOA 3BUZB 4EHTA 5AZIA 4JHDB 3EO3A 1HJOA 2E1ZA 4FPBA 4F9OA 5BPLA 2D1KA 5KPZA 1X3NA 2VYPA 5KPRA 3WT0A 1TYQB 3GDQA 2QWMA 4FSVA 1LCUA 3H3NO 5EVZA 3ULEB 1BUPA 4FO0A 4H0PA 3R9PA 3O5BA 3D2EB 4BRHA 2V51B 2KHOA 2VWBA 4H0XB 1E4FT 5I9EB 4IJAA 2YCHA 5KQDA 3M1FA 3VENA 4DCHA 3D2FB 1MWMA 3RSEB 4H03B 1QHAA 3LDQA 4BQLA 1NLVA 2ZWHA 3H46O 3DAWA 4WQ4A 1K8KA 1P8ZA 3D7EO 4BRNA 3CJ9A 2HF4A 3EKUA 4DQ8A 1HPMA 4M7YA 3C7NB 5AQJA 4IJNA 1HKBA 1ZC6A 3ZX3A 4EFHA 3QBXA 1MDUB 3G25A 3QMLA 4CBWA 1YAGA 4BRFA 2FSKA 2QM1A 3AY9A 2Q1NA 3FFKB 4PKHA 5AZIB 1BG3A 3ZX0A 4PL7A 4H5VA 4JD2A 4MLHA 4EIAA 1JCEA 2P9IA 3LDLA 4M7XA 4B1YB 4BGBA 2ASMA 1V4SA 3WXIA 2HMPA 2Q0RA 4JNEA 4K43A 1RFQA 1GLCG 4BR9A 4DHYA 1XUPO 1BA0A 3FZHA 1X9JA 4EHUA 1T6CA 4BROA 1ZBSA 3O4WA 5KQ8A 1HKCA 3LL3A 4ISGA 3ENHA 5AQOA 3W0LA 3EZWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BZCA 4H0OA 5E26A 3VTIA 1NGCA 4GKJK 4IKFA 5C42A 1GLFO 2P9LA 3CFOA 3H08A 5HP1A 3TPQA 5TKYA 4B1WB 4FVMA 1CXUA 1NM1A 3B6PA 2AJQA 3LP1A 3H45C 4K41A 2QK9A 4BC3A 3JYTA 5JVHL 4IG0A 1VQ8N 4A2BA 3RR8A 4GVMA 1VQ4N 3AVFA 2LSNA 1N33K 4B9VA 1ZXOA 4DTUA 4K25A 1NGEA 5AQRA 2W6LA 4JD2B 4CF9A 1NJYA 4NYFA 4DFPA 2Q31A 4WQ4C 4AQYK 4KI4A 4FCYA 1TKZA 1BQMA 2G8KA 1D9FA 1GLJO 1C1BA 1H1VA 3OYKA 4LFCK 3A5LC 3U4LA 4YOYA 3L0QA 4BR4A 3FE1A 1TV6A 3ID8A 4MDAA 4DR2K 4RW6A 3U3YA 2KLAA 3ATVA 4BG9A 4G9ZA 3R1XA 1C6VA 4NXNK 1GLBG 1REVA 5AQXA 4GNIA 1QTMA 1VQMN 3VEZA 1SQKA 1NU0A 5M1OA 5LMUK 2XO7A 2JLEA 4H4OA 1VQKN 4YOVA 4CZHA 3A5MC 5AJ3K 4B08A 4CJPA 2P9PB 5CY4A 4BR5A 2OPQA 5BPNA 5M1PA 3B8AX 3VQBA 5AZJB 3ZT1A 3L2RA 4DQQA 2W42A 2F9TA 3PUFA 2E88A 1N8RO 5HRRA 2QWQA 2E6MA 4HTUA 3OYJA 1KSPA 1RTIA 2I7PA 2O8FA 1U2VB 2BDPA 4FZYA 2KTQA 4M3RA 2HB5A 4FL9A 3HZ6A 2QWRA 2OZMA 4ZTFA 2CH5A 3TTFA 3W3DA 4RW7A 1BCOA 5FROA 1KVBA 4JEPA 5C2FA 1WSIA 3ENOA 2FLOA 4WQ5A 1QQCA 5LY3A 1BI4B 4QS7A 2HBKA 4DFJA 4PQUA 5KPTA 2UYTA 4CVNE 3C6TA 3NBPA 3MN6A 3K5MA 3S41A 4YY3K 4DTNA 2YNGA 1VQLN 3F9KA 4AM7A 3JAMO 2VG5A 3KIOA 1U6ZA 1ZBHA 2FSJA 3ZETA 1WAFA 3HK2A 3MCAB 2XRIA 2X74A 2DY4A 2E2OA 2VG6A 3M5RA 3E66A 1NMNA 4E1JA 5E41A 2IVPA 1TAQA 1P90A 3CYMA 1VSMA 3I0RA 1SZ2A 1UA0A 4CJWA 2IVNA 1XC3A 5FRMA 4BDPA 4ILGB 4CE9A 5FDLA 1I3AA 4CJUA 1GLLO 1EETA 4F3TA 1VQON 4DF8A 2QWLA 2WTUA 1Q9XA 4IO8A 4NO7A 4KH6A 3MAQA 4FLVA 3LWMA 3A5OC 2FBVA 1UOCA 4B3MK 3OYDA 4FJ5A 3V9UA 4DSKA 1RBSA 1TYQA 1XMOK 3QFUA 4DSJA 1SL0A 3D6RA 4WQ5C 4KKOA 1NNEA 3A2FA 4E7HA 3V1RA 1LWFA 4K42A 4BRGA 3MXMA 3RSEA 3SK3A 2W41A 4CHZA 3GBTA 3QINA 1IKVA 1C0GA 1SS6A 4MQ3A 4B1ZA 1ILYA 3NVKA 1X3MA 3LZIA 5AQKA 3L6QA 5HROA 4FWLA 1IG9A 4AHSA 2OZSA 3C7NA 4OPKA 3QEXA 4DQPA 2Q0UA 3DI6A 1JLGA 1X1PA 2DFHA 4JI7K 4DU4A 4FWPA 3N4QA 2RN2A 4FYDA 4FOIA 3CJBA 3KLIA 1GOAA 4KV8A 1RGIA 1HPZA 3QIPA 4DTMA 3MEDA 3DLLL 3TAQA 3NH1A 4B1VA 3LANA 4CJEA 1UAXA 1DKGD 3MCPA 1QQNA 4CJQA 3IFRA 1Z26A 2OPPA 3NMUA 4DTXA 3O80A 3RRHA 1JXEA 4C8MA 3QEVA 1RDWX 3PSFA 1U4BA 1TKDA 4DQRA 3KD1E 1IBMK 3BDPA 2V7ZA 3ZEUA 1NGDA 4A5AA 5BRHA 1QSLA 1KRPA 2NRTA 4ISEA 1N6QA 1FKOA 5ADXA 2AA4A 5FPNA 4CEBA 4CGHA 3OYAA 3DLRA 3K58A 3C0BA 5AFUA 2A6AA 5BR9A 1CXQA 3IRXA 2Q97A 1LAVA 2ZD1A 4CZIA 4PWDA 4X64K 4KHUA 4QS8A 3JS6A 1TK5A 1Q7YO 2O8FB 5GIOA 1KLNA 1BCMA 1VQ6N 2VWJA 4LFBK 2VGMA 3PLAA 4DF4A 3L2VA 2GELA 4ILHA 1YHQN 1KXPA 1TL1A 2O8BA 2P9KA 4BRDA 3BP8A 4JI3K 3CHWA 4UQGA 5AQHA 2W6KA 3EEQA 2HOEA 5LJWA 2IVOA 3AO1A 2OYQA 3NFAA 5AQTA 3V4IA 4KHYA 4CJFA 4FLYA 3WNFA 4JKGA 3FZLA 3KLHA 4CZFA 3IUCA 3P39A 4OJRA 1NKBA 1HLUA 3ZYYX 1UWBA 3RVCA 2OCEA 3VQDA 1TKXA 5ELZA 3ZETB 1S22A 1E4GT 3TAGA 3RMDA 2YHBA 3R8EA 3SZ2A 3DRRA 5F2RA 3AAQA 2WFBA 2F9WA 3VF6A 4LC9B 1VAZA 3AVIA 3VMFB 4CK2A 3CC7N 4JS4A 5SWMA 3K9KA 4CGDA 3UKUA 3I55N 4K8ZA 3WUHA 1HNWK 1RNHA 1ASVA 5M1QA 3RTVA 4I9LA 3J80O 4EHTA 5AZIA 1FKPA 2E1ZA 4FPBA 5BPLA 1WB9A 5KPRA 1TYQB 4FSVA 1LCUA 1BUPA 4Z4HA 2V51B 1IH7A 2KHOA 4H0XB 3TTCA 4IJAA 2R7YA 3ZSWA 3OYGA 2ZJPL 3RSEB 4EP5A 1JL1A 2ZWHA 1VSFA 5C0YA 4ID1A 4DR1K 3EE8A 1EO1A 4DQ8A 3DLEA 1W2BM 3C7NB 4XIUA 3PX6A 5SZTA 1HKBA 4OKEA 4JI0K 4KHNA 1KTQA 4CBWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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