1GLAG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 157
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glaG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glaG01
2E8AA 3WXKA 4CZHA 2IIRA 4WQ4C 1ATNA 4ISFA 1HJOA 4DHYA 1YAGA 3LDNA 5EXWA 5AQJA 4BRKA 3VEZA 2OANA 1MDUB 4M7YA 1GLFO 1HX1A 4JN4A 1BDGA 4ISEA 4BQLA 3UKUA 1BA1A 1H1VA 2YCHA 4EFHA 3TU5A 3IFRA 4FOEA 4BR7A 1HKBA 3UB5A 2BUPA 2HMPA 3A5MC 2A40A 3R6MA 4BG8A 3H6EA 3CJBA 3WUHA 3O6WA 3VGKA 3O80A 2D4WA 3QB0A 3WXIA 4EHUA 4MLHA 2NZTA 5LJVA 2Q0RA 2FF6A 1OKJA 2VYPA 2YJEA 5AQRA 4I6MB 2GELA 4HWIA 2YHXA 3ULEB 2FLOA 4FOIA 2WUSA 4BRDA 2BTFA 1ATSA 5AZJB 4IO8A 1NGFA 5JLFA 4FWSA 5AQQA 2A42A 3FZLA 2E1ZA 3FZFA 4QS8A 4EIAA 4XH4A 5ADXH 1LCUA 2P9NB 3TPQA 1KAZA 4LC9B 1ATRA 4E1JA 2P9KB 2AA4A 4FWQA 1NGCA 2ZF5O 2E2QA 3EKSA 4CZMA 3H45C 3ATVA 3H1QA 4FWMA 3U8XA 4WQ5C 3MMVA 2CH5A 2Q0UA 2P9UA 1GLBG 3DXMB 3IDHA 4XH5A 3SLCA 4BQZA 1C0FA 2P9SA 1K8KB 4BRQA 4BRGA 4WQ4A 3CJ9A 2ITMA 4BRAA 4H0VB 3WXLA 1KAYA 1RGIA 3ZX0A 4AM7A 1GLDG 4FO0A 3JS6A 4CBUA 4H5WA 4Y0WA 1X9JA 3GL1A 2GTDA 3D2EB 3RSEB 2P9LA 3MN5A 1XQSC 2V52B 3DXKA 3F9MA 3QBWA 5BRHA 1KAXA 1T44A 1HPMA 3B8AX 1NGAA 5AQHA 4BC3A 4FSVA 4BGAA 1HKGA 3GDQA 3ZETA 3L6QA 2IVNA 2IVPA 4JHDA 3VF4A 4BROA 4CI6A 3HTVA 5FPNA 3L0QA 2ZWHA 1MWMA 3AY9A 3ZEUA 4GY2B 3VERA 3P4IA 1TUYA 4PL8A 3SJHA 2YJFA 1P8ZA 2E2PA 2ASOA 3FFKB 1JCEA 1Z6RA 1NLVA 1QZ5A 4JNEA 3MCPA 1XUPO 4RTFD 4WYBA 4BVOA 5EOYA 5BPMA 1SQKA 4BRLA 5TKYA 4H5TA 1BO5O 3H3OB 3CIPA 5FPMA 3A0IX 4PKGA 1QQMA 5BRFA 2V51B 2ZGYA 3CETA 4BC4A 5BREA 1EQYA 1SAZA 2GWKA 2HOEA 3H3NO 3HSCA 3L4IA 3LDPA 4H03B 5KPZA 5F1XA 5AQVA 4M7XA 4Z94A 1XC3A 1TYQA 1TUUA 1U6ZA 3O5BA 3QFPA 1LOTB 4WQ5A 4A62A 4CBWA 2QWNA 4H0OA 2GWJA 5AQXA 3R9PA 2V7YA 5AR0A 1Y64A 3BF3A 3EO3A 4CD1A 1U2VB 4CD3A 4H0TB 5KPTA 1MWKA 3GG4A 5AZIA 2A41A 2D1KA 3A8YA 1NGJA 2HF3A 3VETA 2QWQA 5AQUA 1BG3A 2EWSA 2P9PA 1X3MA 1YXQA 1RFQA 3QDKA 1S3XA 4JD2A 1C0GA 4BR2A 2NRHA 2AP1A 2FSKA 1IG8A 4H0PA 2CGKA 3I33A 4H0XB 3O08A 3BP8A 4CJ7A 3O1WA 3AAPA 2FF3B 4QS7A 4BR0A 2I7NA 3FE1A 4BVPA 4BC5A 4IJNA 1V4TA 3VEWA 2ASPA 4BRNA 5B8HA 3G25A 4A2AA 1QHAA 2UYTA 3VEXA 3VEOA 3U4LA 4QS9A 4B1WB 3HM8A 3SMSA 5FPDA 3H46O 3UKRA 2VWBA 4I6MA 1GLCG 3BF1A 2QWPA 3ULEA 4EAHD 2YHWA 4C23A 5I9EB 5KPRA 5AZJA 3QBXA 3C7NB 3FR0A 4H5RA 2I7PA 3D7EO 2P9UB 4FWOA 5LJWA 3H1VX 2E1YA 2YI1A 2P9NA 1IJJA 3D2FB 3LDQA 2FXUA 1JCFA 2P9KA 2QWRA 3MN7A 1ZC6A 3VF6A 4CZIA 4HTLA 1RDWX 3J8AA 3VEVA 3A5OC 5BN8A 1BUPA 4BRCA 1KXPA 3LDOA 5CE3A 4YDUC 3U9DA 4B1YB 3VF2A 5E26A 3FLCO 4BG9A 4CZJA 1E4GT 3DJCA 1QZ6A 3FZKA 1QQOA 3W3DA 5ADXA 1D4XA 5ELZA 2E2NA 1ZBSA 1T6CA 2QW9A 3D2EA 3RSEA 5EVZA 3R8EA 4L3QA 5AQZA 3GBTA 3M6GA 3SMPA 1NGDA 3MK6A 2PAVA 4XH1A 4B1ZA 2A5XA 5BR9A 4FPBA 5AFUH 1WOQA 3ENHA 4PL7A 3CJCA 1GLEG 4K25A 4AM6A 5F2RA 4J8FA 5AQKA 2F9WA 1BOTO 3EL2A 2H3GX 3HBTA 5AQMA 1ESVA 4XEIA 4B9QA 1YVNA 2Q36A 4B1UB 4IZ9A 1E4FT 3MN6A 4NB4A 2A6AA 3GE1A 3WQTA 4A2BA 2Q31A 3CJ7A 5AQTA 5BN9A 3WEEB 3O1BA 4K42A 2D0PA 1HKCA 1S22A 3VGMA 3CQXA 3FZHA 5AZIB 3LM2A 2A3ZA 2Q1NA 3WXJA 2P9IA 4CZLA 3VPZA 2P9PB 3ENOA 1HLUA 3UKUB 2E2OA 4YDUA 5AQLA 5KQDA 3JXUA 3M1FA 3ATUA 2F9TA 1QQNA 3W0LA 1U2VA 2D0OA 3KHYA 1BU6O 3KZBA 5JMVA 4MLEA 2FSJA 3QICA 3IUCA 4RWTA 4DB3A 2QWOA 3LM9A 4BRFA 4K43A 4K41A 3HZ6A 4DQ8A 4EHTA 5BRDA 2VCPA 3MN9A 4CBXA 3AAQA 4BRHA 3ZX2A 3WT0A 1SZ2A 2NLXA 1NGIA 4FWLA 5JLHA 1Z05A 4FWPA 4ISGA 3OHRA 2QXLA 3LDLA 1BWFO 4BRIA 4PKIA 3LL3A 3EZWA 1JCGA 4F9OA 2CH6A 2YHYA 2W40A 2J4RA 3VOVA 4FWNA 4M63C 1Q18A 4DCHA 5AQNA 4BRMA 3UKRB 2W41A 2PBDA 3CJ1A 2CGJA 4MO5A 5AQPA 1GLAG 4H5NA 4BREA 4FL9A 3VEYA 3O4WA 2GUPA 5AQWA 3CQYA 1NMDA 1NM1A 3A5LC 3VESA 1BA0A 5JICA 3KVGA 3QMLA 3M3ZA 5EY4A 3VGLA 2Q97A 1GLLO 2P9SB 1GLJO 1V4SA 4O5FA 4CZFA 3FZMA 3EKUA 3DAWA 3MDQA 3FGUA 4CZEA 1MA9B 3C0BA 4B1VA 5EX5A 2P9LB 1J6ZA 4BR5A 3DXKB 4A61A 3C7NA 3DXMA 3WQUA 1DKGD 5AQFA 1WUAA 1NBWA 1K8KA 4JAXA 2HF4A 3D2FA 4BRPA 2KHOA 1NGEA 3O8MA 3ZETB 4JHDB 3EN9A 4IXCA 4MO4A 5FPEA 4BC2A 1NGHA 5AQOA 4H0YB 3ZEUB 1G99A 5KQ8A 2V7ZA 3SK3A 1CZAN 2IVOA 2QWMA 3A5NC 2ASMA 1T6DA 1DGKN 3IMXA 4BR4A 1NGGA 3DWLA 4CZKA 2E20A 3ZX3A 4BGBA 4IWVA 3UE5A 4GNIA 5BPNA 4PKHA 2QM1A 4FWKA 4B1XB 2QWLA 3AARA 1NWKA 4IJAA 5BPLA 4RCHA 3CHWA 1TYQB 1DEJA 1R59O 1ZXOA 2E88A 1YUWA 3ID8A 3QFUA 4CZGA 3S41A 3VENA 4NO7A 5AQSA 2DPNA 4FWRA 4BR9A 2CGLA 2GEMA 5LY3A 1NGBA 3BUZB 5E84A 3HI0A 3U9ZA 5AQGA 1HUXA 5AQIA 4O8KA 3CJAA 2P9IB 5AQYA 1X3NA 2ZGZA 4JD2B 2Q2RA 4KBOA 3BEXA 4FPAA 3WEEA 3CERA 5F0XA 2FSNA 5AFUA 3GOIA 3I8BA 4H5VA 3CI5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXKA 2A1RA 4CZHA 3VQ5A 4FLUA 4HCBA 4LH4A 4BRKA 1MDUB 4DV5K 1S5JA 1KLNA 1HX1A 4CK1A 4ISEA 4LSLA 3LAMA 1RILA 4PQUA 3TU5A 3CM5A 3K9KA 3CJBA 3TR8A 3O6WA 4B9SA 3WXIA 2BGGA 4JV5K 1D9FA 2NZTA 2VYPA 3TWHA 4I6MB 3AA5X 2FLOA 3CD6N 4BRDA 4HTUA 2KKZA 1ATSA 2ZE2A 4JI5K 4O8UA 1TKZA 2KW4A 1RDCA 2VG7A 4AHVA 3TPQA 1KAZA 4E1JA 1NGCA 1K6YA 4CERA 5KTQA 3THYA 4QOZB 1WSJA 3ATVA 4CGDA 4FWMA 1BISA 3MMVA 1GLBG 3DXMB 3MEDA 3NH1A 3DI6A 3MXJA 1C0FA 3RRHA 1K8KB 4BE1A 4BRGA 4X66K 3V81A 4DTOA 4DV3K 3N4QA 5KRTA 1C0UA 4Y0WA 3ZCMA 3OTOK 1WBBA 1VSDA 2GTDA 4KB1A 3D2EB 1XQSC 2V52B 5TKWA 5BRHA 3CCQN 4DTJA 1NU0A 1T44A 3HYFA 3BZKA 3ZSQA 4BC3A 2O4IA 4OGCA 4DR6K 3AA2A 3L6QA 3AO3A 4PY5A 4N5SA 4CI6A 3HTVA 5FPNA 1MWMA 2Z1IA 4GY2B 1TUYA 3SUOA 3ZSVA 1VQKN 2ASOA 1NLVA 1JCEA 3HT3A 2G8UA 4GVEA 4CJPA 1XUPO 4RTFD 4WYBA 5GIOA 2ZM6K 4FK2A 1TV6A 1OH8A 4KHWA 4H5TA 1BO5O 3H3OB 3CIPA 2B5JA 4K8ZA 4FK4A 4BC4A 5BREA 3H3NO 2HOEA 3PV8A 1RCHA 4LD0A 3LP3A 1KSPA 4DF4A 1KD1O 2QKKA 3O4NA 3TTCA 1TUUA 1FJGK 1N32K 1LOTB 4CBWA 4DTSA 2BDPA 2IGIA 2HMIA 1QVGM 2WFBA 4DFKA 3QEVA 5AQXA 3VQ8A 1RBTA 1ZBUA 4DTPA 4F8RA 4F3OA 1MWKA 3GG4A 2A41A 3G0ZA 1W7AA 4Z0UA 1JLCA 2O8CB 3OYGA 2DFHA 2HF3A 3CC2N 1X3MA 4Y1DA 3OYIA 5C25A 3HO1A 4H0PA 4EZ6A 4DSKA 5J2NA 4H0XB 4DS5A 1GOAA 4FJJA 3DLEA 2FF3B 5GAHP 3T1YK 2I7NA 4FXDA 4RW8A 2E4LA 2OYQA 3OW2M 3LP1A 4BRNA 3G25A 1YJWN 1QHAA 1FXXA 4C8NA 4FJGA 4CF0A 4CK3A 3KTQA 3HM8A 3C6AA 3SMSA 3QEIA 4LF5K 4WE1A 1WLJA 1K73O 5H1SQ 1NJYA 2P1JA 4OPKA 1S1WA 3HOSA 1ZBHA 3KWIA 4CCHA 4L8RB 3KD1E 3CG7A 2I7PA 3D7EO 2P9UB 2F4VK 1QVFM 4JS5A 1U4BA 4KTWA 4JKGA 1KVBA 3LDQA 3DMJA 2QWRA 4GKKK 3SUNA 1IKWA 3NVKA 4JKCA 3Q7CA 4NLBA 4CJ5A 5CR4A 3VQAA 4CF2A 2RE2A 2Z1HA 3ZYYX 4JLHA 2EX3A 3K58A 2YNIA 4B1YB 5E26A 1U48A 1RT6A 3FLCO 1E4GT 3EYZA 1WBDA 3PO5A 5ADXA 1HJRA 5ELZA 2E2NA 3RRGA 1Q9YA 3KKSA 4RW6A 3E9LA 2VGMA 3PLAA 3GBTA 1NGDA 3VQQA 2PAVA 3BDPA 3TAEA 5BR9A 3P1GA 4FPBA 3J7YP 5JVGL 4EP5A 1YTUA 1G15A 1KCFA 1WSHA 1VQON 1GLEG 3HRGA 2IOCA 1D8YA 5F2RA 3MAQA 1WSIA 5AQKA 2DY4A 3EL2A 2H3GX 1TGOA 2HBJA 2X78A 3AVHA 1YVNA 2BE2A 3MN6A 4NB4A 4CIEA 3K59A 4NCBA 4A2BA 2Q31A 1U49A 3WEEB 3O1BA 3AVKA 4K42A 2D0BA 1NK5A 1HKCA 4DUYK 3OYEA 3RR8A 4HUEA 4CW7B 3PIPL 3O3GA 1KLMA 3R3LA 2D0AA 1KFSA 2ITGA 2YHBA 1ASVA 1ZYQA 1QQNA 3W0LA 3E01A 1U2VA 1DLOA 3ZSRA 4E0DA 3QICA 3IUCA 2B6AA 4DB3A 2JWLA 4UY8O 4RW7A 2F96A 4CBXA 2IDOA 3ZLJA 4CVNE 2WTUA 2PY5A 4M3ZA 5JLHA 4B3TK 4FWPA 2HHHK 1JLBA 3B6PA 4PKIA 4FJLA 3LL3A 3EZWA 2CH6A 1F21A 3ZT1A 4M63C 3T19A 4DCHA 3KKRA 2W41A 3NH0A 3OS0A 2PBDA 2CGJA 4M3UA 2QA4N 1VQMN 1NG9A 3VESA 2X74A 3SI6A 4FM2A 3KVGA 3QMLA 2VG5A 4LF4K 1ZBLA 3O3FA 1RT7A 4B3RK 4ILJA 3UIQA 3L2UA 2RKIA 4DLEA 1E3MA 3TAMA 4G9ZA 4C8OA 4CZEA 4FJ5A 4H4OA 2P9LB 3CYMA 4ILHA 3KK1A 2OTJN 4KH5A 4A57A 2EHGA 3IAYA 1VSEA 1NBWA 4JAXA 2XY5A 2HF4A 3D2FA 4BRPA 3SNNA 3RR7A 3ASMA 2KHOA 2P51A 4HUGA 1BIUA 4JHDB 3EN9A 4Z4EA 3RTVA 1S6QA 4MO4A 3V6DA 5C15A 2HVIA 4YOWA 4BDPA 1XC9A 4YFUA 4FJNA 4CJTA 1G99A 3V9WA 4W5OA 3R1XA 2O8EB 4DV1K 1VRTA 1CZAN 1OVYA 2IVOA 3A5NC 4M3TA 4BR4A 3SPZA 1JLEA 3AVGA 1NGGA 3DWLA 4I2QA 3NF6A 4CJWA 2HHSA 1NJIO 3AARA 2KQ2A 1NWKA 5BPLA 4RCHA 1TYQB 3VQDA 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3P4IA 3SJHA 4PL8A 1RDUA 2YJFA 2E2PA 1D9DA 4FJIA 4GKJK 4H4MA 1TKXA 1QZ5A 4O4GA 4OX9K 3E9OA 4BVOA 3NCIA 1C6VA 5EOYA 3ZSWA 3ZSXA 4BE2A 3MWTA 4BRLA 4LF6K 1QQMA 1EQYA 3HSCA 3O9TA 1ILYA 4Z4HA 2O8DB 4JI7K 3OYLA 4Z94A 2E6LA 3I56N 3THWB 3M8SA 4WQ5A 4A62A 2DFEA 1YHQN 5M1QA 2GWJA 1TVRA 4M3RA 4FM0A 1XMOK 1BI4B 3L8BA 2F8SA 4CD3A 4H0TB 4KTZA 5KPTA 1K8AO 3LALA 2D1KA 1UAXA 3A8YA 1S1VA 1M1KO 3RMCA 3VETA 3V9SA 4OLAA 3KD5E 2HB5A 4N56A 1VQLN 2P9PA 2FBXA 1RFQA 3RMAA 5LMNK 4DR3K 3E66A 3M5RA 1KC8O 1SL2A 3I33A 3LP2A 3AAPA 4QS7A 4BR0A 4DU4A 3MXIA 4G1QA 3FE1A 3T7ZA 4WF9L 1HQEA 4JKBA 5D3GA 3O3HA 4CEOA 1QS4A 4QAGA 2D5RA 1R0AA 5B8HA 1X9WA 4JI2K 3VQEA 3VEOA 3U4LA 4B3SK 1HNIA 4B9TA 3QIPA 2YNHA 3H46O 3UKRA 5MLCQ 4I6MA 2QWPA 1IBKK 4DG1A 3OYFA 5I9EB 3QBXA 4FWOA 5LJWA 3F5TA 1ASUA 1T7PA 3NAEA 1T05A 1C0TA 1IJJA 5M1OA 2W6KA 4YOUA 2FXUA 4IEIA 1O1WA 3CFOA 4FK0A 1N6QA 4YORA 4IOXA 4MDAA 1B92A 5HP1A 3CCRN 1RDWX 4W5NA 3A5OC 3NGYA 4JI1K 4E89A 3SAHA 3O9QA 4CJ3A 1NK6A 3VF2A 4LF9K 1FKOA 1WAJA 5KGXA 1OH6A 1QZ6A 3PY8A 1QQOA 2PYJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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