3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
3VENA 1NLVA 3B8AX 5ADXH 5EOYA 4RWTA 2ASMA 4H0OA 3D2FB 2ASOA 3HI0A 3H3NO 3GG4A 5AQNA 5AQKA 3D7EO 2QWOA 3R9PA 3CJ7A 3W0LA 4A2AA 5BPNA 2A42A 3GBTA 5EY4A 1E4FT 2CH5A 4CI6A 2ZGZA 3A0IX 2CGLA 1NGBA 4EHTA 3HZ6A 3CIPA 4QS8A 1YXQA 3BF3A 3WXKA 4NO7A 5BRHA 2W41A 4I6MB 3ZEUA 3VF4A 2ITMA 2GELA 3CERA 2J4RA 2Q36A 1NGIA 4JAXA 3QB0A 3QFPA 4FWPA 3DXKB 4BG8A 4F9OA 2BTFA 2NRHA 1GLBG 2QWPA 1HX1A 4GNIA 2P9NA 4BC2A 4CZKA 3EL2A 2E2QA 3VETA 3GE1A 4JNEA 3A8YA 1GLFO 4BQLA 4E1JA 5BPMA 3CQXA 2E1ZA 2FSKA 2Q97A 3J8AA 4FOIA 4PKGA 4PL7A 4PL8A 1J6ZA 4BGBA 4PKIA 4CD3A 1ATNA 5I9EB 3LM2A 5AQGA 2ZF5O 3ZX3A 2V7YA 3LDPA 4ISGA 2H3GX 4O5FA 5F2RA 3FE1A 1NGHA 5AFUA 1SQKA 3TU5A 3WQTA 4H0YB 4J8FA 5AZJB 4GY2B 3O1WA 4CBWA 4IXCA 4CD1A 3U4LA 4H0VB 4BGAA 1X3NA 4RCHA 1JCFA 1NGFA 3A5MC 3ATVA 5BR9A 3CHWA 4NB4A 1K8KA 2A41A 1GLJO 2PBDA 4B1YB 4B9QA 3MN5A 1ZBSA 1MWMA 2I7NA 2FF3B 4BC5A 1NGAA 3SMPA 5BRFA 2P9PA 5KPTA 4DB3A 3ENHA 4AM6A 4L3QA 4FSVA 4WQ4A 2HF3A 2IVNA 3AARA 3UE5A 5AZIA 4H0PA 5AQIA 5AFUH 4A62A 1XUPO 3FZFA 4JHDA 4FL9A 4CBUA 2V51B 1X3MA 3VEZA 4H03B 1BA1A 2P9KB 3U8XA 2YJFA 3CJ1A 4ISFA 3GOIA 4CZHA 1S22A 3MN6A 1EQYA 4LC9B 3CQYA 2D0OA 3FR0A 4DHYA 2FXUA 3ZETA 2A3ZA 4IWVA 1KAZA 3LDNA 4ISEA 2Q0UA 3UKRB 1ATRA 3ATUA 1RGIA 2E8AA 4M7XA 2IVOA 3BEXA 3EZWA 3QBWA 1T6CA 2A6AA 5AQRA 3BF1A 1ATSA 1KAYA 2Q2RA 2QWRA 5LJWA 2IVPA 3FGUA 3R8EA 3I8BA 1KAXA 5EVZA 3OHRA 1NBWA 3HM8A 3DXMA 2PAVA 3UB5A 2QWQA 2NLXA 3C0BA 2QM1A 2YHWA 1GLLO 3GL1A 4WQ5A 3VEYA 3VESA 5AQXA 4B1WB 2IIRA 2V7ZA 2P9IA 2P9PB 2Q31A 3MK6A 4Y0WA 3WXIA 4CZJA 1V4TA 3UKUA 2P9LA 3CJ9A 5AR0A 4HTLA 3WXJA 3SMSA 3O8MA 1RDWX 2P9UB 1X9JA 5AZIB 2E2OA 1Z05A 4XH1A 4JN4A 4JHDB 1R59O 2CH6A 1MWKA 1GLEG 2QXLA 5AQWA 1LCUA 2Q0RA 4YDUA 5AQYA 3MCPA 1MDUB 4BR9A 3A5OC 4FOEA 5JICA 4PKHA 4BRHA 5CE3A 2YHXA 3AAPA 2ZGYA 4HWIA 1SZ2A 2YI1A 3WEEB 2WUSA 2ASPA 4FO0A 5EXWA 1T6DA 3MN7A 3IFRA 4CZIA 1DKGD 3WUHA 1Q18A 5AQMA 5JLHA 2BUPA 2HMPA 4BC4A 1NGCA 4K25A 1YUWA 3LDLA 2AA4A 4O8KA 1IJJA 5KQDA 4BRKA 2E20A 2F9TA 4IJNA 4CZFA 1TUUA 3HTVA 4RTFD 3L6QA 2QWLA 3QBXA 5KPZA 3IUCA 3EKUA 2GTDA 3DXMB 2GEMA 2CGJA 3D2EA 2ZWHA 2P9IB 2E88A 3QICA 4JD2A 4BQZA 1E4GT 2QWNA 4BRLA 4FPBA 2P9LB 3WXLA 5AQVA 1YAGA 1BG3A 3LM9A 2F9WA 1NM1A 3LDOA 4BROA 4BR0A 1HLUA 3CJAA 1CZAN 5B8HA 1QZ6A 2HF4A 3WQUA 1P8ZA 3KVGA 3ZEUB 1GLDG 1ZXOA 3MMVA 1U2VA 2GWJA 4AM7A 3M3ZA 3O5BA 1NGGA 1V4SA 4B1VA 1NGDA 4H0XB 4C23A 5FPEA 4Z94A 3H1VX 3CETA 5AQTA 4BRCA 4BR7A 1TYQA 3CJCA 4FWNA 3L4IA 3O4WA 2P9NB 3VF2A 5FPDA 3C7NA 4FWLA 1BOTO 2GUPA 4EAHD 2KHOA 3FZLA 1BO5O 3FZMA 1GLCG 2VWBA 3MN9A 3GDQA 1C0FA 2YHYA 3DJCA 4BRGA 3VEVA 5TKYA 1ZC6A 4M7YA 4BRPA 3SJHA 3CI5A 3O1BA 4FPAA 1NGJA 1GLAG 2FLOA 4QS7A 4DCHA 4FWMA 3I33A 3O08A 2D1KA 3SK3A 3DWLA 5AQLA 3H1QA 1JCGA 4BRQA 3EN9A 3ZX0A 4BC3A 1U6ZA 3R6MA 3D2EB 4JD2B 4FWRA 4I6MA 3U9ZA 5F1XA 2YCHA 4H5RA 2GWKA 3VGMA 1Y64A 4WQ4C 4CZGA 1BU6O 1QZ5A 3QMLA 3M6GA 1YVNA 2V52B 1K8KB 3DXKA 3FZKA 3L0QA 3LL3A 4K42A 4DQ8A 4K41A 4BRNA 4H5WA 2W40A 1C0GA 1TUYA 3G25A 5F0XA 3H6EA 3ID8A 2VCPA 1TYQB 4M63C 1QQOA 4K43A 2AP1A 3C7NB 1XC3A 3A5NC 2UYTA 3HSCA 4BR5A 1T44A 3JS6A 3W3DA 1HKCA 1D4XA 1OKJA 1BDGA 2FSJA 3DAWA 3H45C 3JXUA 3U9DA 4B1XB 4BRMA 4BRIA 5BREA 3VEXA 2E1YA 5BN8A 3CJBA 4H5NA 4BG9A 1NMDA 3BP8A 3P4IA 4IO8A 1LOTB 4EIAA 1BWFO 5BRDA 4CBXA 4KBOA 2CGKA 4BVOA 5AZJA 1ESVA 3TPQA 4MO4A 3ZETB 4IJAA 2A5XA 2A40A 1DGKN 2EWSA 4XEIA 4CZLA 1RFQA 1WOQA 4H0TB 3HBTA 5EX5A 4MO5A 3IMXA 4WQ5C 5E26A 3AAQA 3ULEA 1HPMA 4CZEA 2D4WA 3O6WA 3VERA 3QFUA 1KXPA 4CJ7A 3EKSA 2I7PA 1BA0A 5JMVA 3SLCA 5E84A 5AQJA 1XQSC 3BUZB 3S41A 1H1VA 2D0PA 4CZMA 1QHAA 4BREA 5KQ8A 5AQQA 4YDUC 5BPLA 1Z6RA 4H5VA 1QQMA 3F9MA 5LJVA 3UKUB 2QWMA 5AQHA 2P9KA 4BR4A 4MLEA 2QW9A 3H3OB 3RSEA 5LY3A 1WUAA 2HOEA 4BRAA 4FWKA 1NGEA 3IDHA 1S3XA 2P9SA 3UKRA 4EFHA 4H5TA 4A2BA 1G99A 5AQZA 3A5LC 5AQPA 2YJEA 4B1UB 1QQNA 2E2PA 1NWKA 5AQFA 3D2FA 1HUXA 5AQUA 3VOVA 3M1FA 1HKBA 3FFKB 3FLCO 5AQOA 4XH4A 3VGKA 2OANA 3ZX2A 1HKGA 4BRDA 3ULEB 4B1ZA 4FWOA 4A61A 2DPNA 3VEWA 4XH5A 4FWQA 3VPZA 3H46O 2P9UA 1IG8A 3O80A 3EO3A 4BR2A 2FF6A 1DEJA 5AQSA 3KZBA 4FWSA 5ADXA 5BN9A 3ENOA 3AY9A 3QDKA 3VGLA 1HJOA 4EHUA 3VEOA 5ELZA 2Q1NA 3MDQA 1JCEA 1SAZA 4MLHA 3KHYA 4WYBA 5FPNA 5FPMA 3WEEA 4IZ9A 4BRFA 4BVPA 3RSEB 2VYPA 3LDQA 3FZHA 2FSNA 1MA9B 5JLFA 4QS9A 2P9SB 1U2VB 3VF6A 2NZTA 5KPRA 1BUPA 3WT0A 2E2NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJJA 1R0AA 1C0UA 4RWTA 2WOMA 4I7FA 5C15A 5DM7L 1OVQA 4CJSA 4KH4A 2G8FA 4F2RA 3PSIA 3PLAA 1TL3A 5JS1A 3OYMA 4A2AA 4IFEA 3KK3A 3GBTA 2O8BA 4JI0K 5EY4A 3QETA 1X9MA 1E4FT 4CI6A 2F96A 2ZGZA 1J5OA 3NDKA 2WBNA 4DV1K 4DQIA 4O5BA 2W41A 2DFHA 4I6MB 2FBXA 4DUYK 4DTUA 4J2AA 1BI4B 1LWEA 1ZBLA 4K0KK 2J4RA 3HO1A 4JI5K 4OGEA 3VQ4A 2BTFA 1VK0A 4EZ6A 1L3UA 3SAHA 4CZKA 4LSNA 3EE9A 2E2QA 3GE1A 4JNEA 1GLFO 1WSJA 1UWBA 2ZE2A 4CJLA 4CJKA 1RTJA 4LF7K 3J8AA 4PL8A 2Z1HA 4AHSA 4BGBA 2YKMA 5E41A 4YOWA 2B4JA 3TSPA 2NRTA 4ILHA 2IC3A 3SNNA 3LM2A 4PY5A 4H4MA 4OKKA 4B3TK 3ZX3A 4CF9A 3TARA 1KVAA 4CJ5A 1YJNN 2HW3A 3FE1A 5FRMA 4KREA 3TU5A 1L3TA 4J8FA 2HNZA 3O1WA 4CBWA 4CD1A 1RILA 2PFUA 1EWRA 3PUFA 3CC7N 4A5BA 4DV3K 3CHWA 1K8KA 2D0CA 3CFRA 2B5JA 4LFAK 1A5XA 3E9LA 2HHXA 3CCEN 5BRFA 4ZTFA 4DV4K 3NF8A 4AM6A 4FSVA 3KD5E 2HF3A 3AARA 1ZBUA 4MQ3A 4CF8A 3LWLA 4DQSA 2DTUA 3NF9A 4AHVA 4CBUA 3T1YK 3VEZA 4H03B 2P5OA 2YNHA 1U49A 4ISFA 4CZHA 1N5YA 3K2PA 4Q5VA 3HXMA 2O8DA 1CXUA 3CQYA 4IDHA 4AH9A 4MDBA 4ISEA 3E01A 2ETJA 1DLOA 3SBGA 4Z4FA 3AVFA 3R3LA 4M7XA 1RDUA 4CGGA 3QBWA 5AQRA 1HRHA 1ATSA 3BF1A 4OPKA 2QWRA 2XHBA 2IVPA 1RDDA 3I8BA 5EVZA 2PZSA 1I39A 3OHRA 1S5JA 4DV0K 2QWQA 4K8ZA 4J2EA 1BQMA 3GL1A 3OJSA 4WQ5A 1HNXK 5AQXA 4CVNE 2KZZA 5CY4A 2P9PB 1JJ2M 3UKUA 5AR0A 1QE1A 4HTLA 4CW7B 2P9UB 5AZIB 1S6PA 4DTNA 4DV5K 2PYJA 1IG9A 4E7IA 1YI2N 5C42A 4CEEA 2CH6A 1MWKA 4CGDA 5FROA 1JL2A 4YDUA 5AQYA 1FW6A 2YHXA 5MLCQ 1SZ2A 2YI1A 5KGXA 3ISNC 1VSKA 4Y1DA 3K9KA 3R1XA 2ASPA 2ZJQL 4IEIA 4PUOA 4IFYA 4OLBA 3THWA 3PX4A 1DKGD 3WUHA 5AQMA 1ZBFA 1N32K 4CGJA 1XMOK 3LDLA 5HL7L 4BRKA 2F9TA 4IJNA 4NCGA 3ZSVA 5HOOA 3KWGA 4RTFD 3BDPA 3ENBA 3L6QA 4H8KA 4YOTA 2GTDA 3DXMB 1NK6A 1JLAA 4U7BA 3QICA 4BQZA 1WBBA 2G8UA 2O4GA 3SUQA 1BG3A 3VQ9A 2F9WA 4FJ9A 1LWCA 3E1YA 3CJAA 4A59A 2FBTA 1P8ZA 3D45A 3ZEUB 4V19S 1J53A 1QSSA 1S9EA 1ZXOA 1T3VA 3MMVA 1ASWA 2P51A 4CF2A 4CHYA 3KK2A 1V4SA 1L3VA 1NU0A 3AO5A 1U47A 4B1VA 4CEOA 1NKEA 3NMUA 4QOZB 3H1VX 4BR7A 1WAFA 3VF2A 3P5JA 2IAJA 4M3TA 1D8YA 1RTHA 2XRIA 5IT9O 1ZC6A 3ZCMA 2QXFA 1SUQA 2X74A 3O3HA 3L2UA 3VQQA 3DLHA 1TV6A 1NGJA 3RVCA 1A5WA 2RN2A 3TAFA 5C0YA 4YHHK 4DTRA 3SK3A 5SWMA 1HJRA 5AQLA 1JCGA 3ZSXA 4DR1K 4B9LA 4JD2B 4J2BA 4FJ8A 2HVHA 4I6MA 4M3ZA 3U9ZA 5F1XA 4Z4EA 4H5RA 2GWKA 3ZSZA 1BI4A 1Y64A 4CEBA 3J7YP 4HCBA 1WSEA 1YVNA 3DOKA 4E19A 4BDZA 4M3UA 3KLHA 3M5RA 4W5RA 2IOCA 4LH5A 2W40A 3AA5X 3PIPL 5F0XA 3H6EA 1Q9YA 1YT3A 3NE6A 1TYQB 4M63C 1QQOA 3TTDA 3A5NC 3HSCA 2UXDK 3RR8A 4GV6A 3JS6A 1S1WA 3W3DA 1D4XA 2FSJA 3DAWA 3VMFB 4B1XB 3LANA 4C8NA 3ITHA 4BE0A 2E1YA 3F73A 3HVTA 5BRDA 4IFVA 4CBXA 4KBOA 1K9MO 3TPQA 3M8SA 4CESA 2A1RA 3K0SA 2A40A 2EWSA 4FJMA 2NUBA 3CQ8A 1Q82O 3EZ5A 3HBTA 2HSTA 4AHCA 4CJQA 2D4WA 1K8AO 4OPHA 3UIQA 3QFUA 3OTOK 1KXPA 4FLXA 3EKSA 4FJXA 1NOZA 5JMVA 3MXMA 3BUZB 1H1VA 4YFUA 4CZMA 5DMRA 1QHAA 4BREA 4WFBL 5BPLA 3L4QA 1FK9A 2Z1GA 4FLVA 3AVGA 1EWQA 5J2PA 1RBVA 4AHTA 3KLFA 4CEFA 3KK7A 2GUIA 1YJWN 5LY3A 2OPRA 1HYSA 1VQKN 3CFOA 4DFKA 1E3MA 1YJ9N 1NJIO 1K6YA 3QLHA 3I0SA 1UA1A 2P9SA 4H5TA 1HNZK 5M1QA 1MU2A 1Q9XA 5AQPA 4B1UB 1CZ9A 3AO4A 1IKVA 1NWKA 3T69A 5AQUA 1VQ4N 3QINA 4HUGA 2KFZA 5AQOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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