3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
5CE3A 3JS6A 3CJ7A 4BC3A 2V7YA 3WXKA 5LY3A 5AQTA 2P9KB 3QFUA 4JN4A 4BQLA 4H0PA 3F9MA 5AQWA 3ZEUB 3VF4A 1RGIA 5BRDA 3AAPA 1ZXOA 4IO8A 4B1VA 5KPTA 1QZ5A 1C0FA 4H0XB 2P9KA 2KHOA 2YI1A 3ENHA 1T6CA 3QMLA 2YCHA 3GG4A 3BP8A 2ZWHA 3C7NB 3HSCA 1U6ZA 3VF2A 5AQRA 3MDQA 2YJFA 3CJCA 1NGFA 2FXUA 2VYPA 3QICA 5AQGA 3A0IX 1Q18A 4ISEA 4XH1A 3A5NC 3R8EA 3D2FB 4FOIA 4BC5A 5LJVA 2P9NB 3H45C 2PAVA 3WXJA 4J8FA 4BQZA 4RTFD 4JHDA 4WQ4C 1MWKA 2E1ZA 3FZKA 4H5NA 4EAHD 3QFPA 1GLBG 3ULEB 2P9LA 2VWBA 4GY2B 4H5TA 2W40A 3WT0A 4B1YB 3IFRA 4MO5A 5AQIA 2A6AA 1E4FT 2YHWA 1CZAN 4DHYA 1DGKN 1P8ZA 3ULEA 4BRLA 4ISGA 4FWQA 2A40A 3U8XA 5E26A 4PL8A 3J8AA 2QWQA 4FO0A 3VEVA 3EKSA 1BA0A 3SMPA 4WQ5A 3W0LA 1BWFO 3CETA 3MN5A 4I6MB 2J4RA 2DPNA 1ATRA 3S41A 4YDUC 3ZETA 2AA4A 1G99A 3WXIA 2CGJA 2Q0UA 2Q97A 4JD2A 1NGCA 1NGAA 3WEEA 3DAWA 2YHYA 3U9ZA 4CZKA 5AQLA 5BRFA 4NO7A 4QS7A 2V51B 2FLOA 4Y0WA 1HJOA 3ZETB 3U4LA 3IUCA 4JAXA 3ENOA 3CIPA 3HTVA 4M63C 4FWOA 3WEEB 4FWSA 2E20A 2HOEA 4BRDA 3CQXA 1BUPA 3M6GA 4BC4A 1BU6O 1BG3A 4MLHA 4CD3A 5F2RA 4WQ5C 4WYBA 2V7ZA 1QQNA 4FWKA 4BVOA 1C0GA 1OKJA 1V4SA 1SAZA 4IXCA 3O1WA 4H5RA 3UE5A 4CZJA 3MN7A 5EOYA 2A41A 3ID8A 2GTDA 3MN9A 4PKGA 4CD1A 3SMSA 4DB3A 4BG8A 1RFQA 4H0VB 4H0OA 3VGKA 1XC3A 3CERA 5JLHA 3L0QA 2I7PA 4BRCA 3IDHA 3SJHA 5E84A 4F9OA 5EXWA 1YXQA 5KQ8A 2Q36A 1HKCA 3AAQA 2GWKA 3EL2A 4FWRA 4HWIA 5F1XA 2E1YA 5AQMA 5BPMA 3O5BA 2P9UB 4CZLA 3WQUA 4K43A 1NGGA 1U2VB 5AQXA 3EN9A 1MA9B 2E88A 3LDOA 4FSVA 5AQYA 3ATVA 1JCFA 3VERA 3HI0A 3D2EB 1HPMA 3FR0A 4XH5A 4CZFA 5I9EB 1K8KA 4BGBA 3L4IA 2A5XA 3D7EO 3OHRA 3H1QA 3VETA 3QB0A 3BUZB 3UKRB 1K8KB 5TKYA 3VENA 1NGDA 3RSEB 3DXMA 3FZLA 1HLUA 1TUUA 4A2AA 2IVPA 2QWNA 3FZHA 4RWTA 4M7XA 4IWVA 1KAZA 2Q2RA 4EFHA 2FSNA 5KQDA 3H6EA 3VEXA 3RSEA 1NGHA 2IVOA 4FOEA 2YHXA 3UB5A 3FZMA 3QBWA 4BR0A 2FSKA 1R59O 2D0PA 2NLXA 1DKGD 3QDKA 3VPZA 4BRHA 5F0XA 3GBTA 3CHWA 5AZIA 1NLVA 4BR9A 1IJJA 1HUXA 4H0TB 4B1UB 2E2NA 3VOVA 1GLJO 3O80A 2ZF5O 3VF6A 4CZEA 4A62A 5AZIB 3WXLA 2P9PA 2E2QA 4B1WB 2ZGZA 4IZ9A 3CJBA 2A42A 2E2OA 3ATUA 5JLFA 3FGUA 1D4XA 3LDPA 4KBOA 4BRQA 2H3GX 1ATSA 4CBWA 2F9WA 3GE1A 3WQTA 1GLCG 5AFUA 3MK6A 1DEJA 2NRHA 5AQQA 5JMVA 3FZFA 3VESA 3ZEUA 4PL7A 5KPRA 3LDNA 4AM7A 1NM1A 4MO4A 5AQUA 4MLEA 5AZJA 1TYQB 3R9PA 3O1BA 1T6DA 3M1FA 2ASPA 1X3MA 2BTFA 3L6QA 1IG8A 1NGEA 3MN6A 5ADXH 1NGJA 4XH4A 4JNEA 1ESVA 5AQSA 3DXKA 4E1JA 3DWLA 5AZJB 2FF6A 3P4IA 4EHTA 4FWLA 2IVNA 5AQOA 3CQYA 4BR5A 4BRGA 3BEXA 4CBUA 1V4TA 1QHAA 3DXKB 1KXPA 5EY4A 2QWPA 4BR4A 4ISFA 2P9IA 5AQHA 3C7NA 1YAGA 1S22A 4H5VA 3CJAA 2OANA 2P9LB 3WUHA 3IMXA 2GUPA 1TUYA 2P9IB 4IJNA 5LJWA 1BOTO 1GLLO 1Z6RA 3D2FA 5AQVA 1KAYA 3VGMA 4DQ8A 1H1VA 2P9NA 4BRPA 4O8KA 3LDLA 5AQKA 4H5WA 4BR2A 4JHDB 1QQMA 1YUWA 2BUPA 4FWMA 4BREA 4BRAA 4FL9A 2QWLA 2E2PA 4I6MA 2EWSA 4WQ4A 5FPNA 4IJAA 3VEWA 5BRHA 2W41A 2Q31A 4PKHA 3ZX2A 3EZWA 5ELZA 3AARA 2QWRA 1HKGA 4Z94A 2VCPA 2QW9A 3VEOA 3O08A 3A5OC 4HTLA 4O5FA 4A2BA 3SK3A 3W3DA 4LC9B 2AP1A 3O6WA 2YJEA 5AQPA 4EHUA 3CI5A 1BA1A 4JD2B 2ASOA 5BPLA 1X3NA 1ZC6A 2GEMA 3VGLA 1NGIA 5B8HA 4CZMA 4FPBA 1NBWA 2NZTA 3CJ9A 5AR0A 1XUPO 1BO5O 1WOQA 1MDUB 4RCHA 5FPMA 4XEIA 2CGKA 5AFUH 1GLEG 4DCHA 3HM8A 4L3QA 5KPZA 4B1XB 3GDQA 4K25A 2A3ZA 3VEZA 3VEYA 3C0BA 1Y64A 2V52B 4CJ7A 4BRKA 1MWMA 3GL1A 3MCPA 2HMPA 2GELA 2P9SB 2QM1A 1NGBA 3B8AX 5ADXA 1JCEA 4QS9A 3LDQA 2FSJA 1QQOA 2GWJA 4AM6A 3A5MC 1HX1A 2P9SA 5BPNA 4BROA 3H3OB 3EKUA 3KHYA 2P9UA 2QWOA 5BN9A 4BR7A 1YVNA 1U2VA 1NMDA 2HF3A 3HBTA 4M7YA 1SZ2A 3JXUA 3KZBA 4EIAA 2D1KA 3G25A 1KAXA 2CH6A 4BC2A 2HF4A 3H46O 3LM2A 3LL3A 4BRFA 3D2EA 5BR9A 4CZIA 3ZX3A 4B1ZA 2F9TA 4GNIA 5BN8A 3M3ZA 2E8AA 1J6ZA 2D0OA 3UKUB 4BRIA 2QXLA 3BF1A 1RDWX 3AY9A 4CZHA 4BVPA 2ITMA 3U9DA 5AQZA 2CGLA 3FLCO 4CI6A 4NB4A 3H3NO 3DJCA 3UKUA 5BREA 1GLFO 3DXMB 5FPDA 3FFKB 1JCGA 4BG9A 3QBXA 1XQSC 1S3XA 3O4WA 5FPEA 2D4WA 3LM9A 1LOTB 1GLDG 3UKRA 4CBXA 2I7NA 5JICA 3GOIA 4FPAA 4B9QA 4CZGA 3I8BA 4A61A 4K41A 2Q0RA 3A5LC 1WUAA 2QWMA 1NWKA 3HZ6A 4FWNA 1T44A 2ZGYA 2UYTA 3BF3A 3SLCA 4BRMA 3CJ1A 3R6MA 1HKBA 3KVGA 4H0YB 2FF3B 1X9JA 3O8MA 2Q1NA 4C23A 1EQYA 3A8YA 4H03B 4K42A 2CH5A 2IIRA 2PBDA 4YDUA 3TPQA 3FE1A 4QS8A 5AQNA 1BDGA 3MMVA 2ASMA 1GLAG 3TU5A 3ZX0A 4FWPA 5AQJA 3I33A 3EO3A 5AQFA 1QZ6A 4BGAA 1ZBSA 1E4GT 1SQKA 1ATNA 3H1VX 4BRNA 2P9PB 1TYQA 2WUSA 1LCUA 5EX5A 5EVZA 1Z05A 4PKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2VA 3JS6A 1VHXA 1JXBA 3HP9A 4BC3A 3PY8A 4J2BA 1YJWN 1T03A 3NVKA 2OTLN 4JN4A 3F9MA 2O8BA 4M3ZA 1UWBA 3VF4A 1ZXOA 1BIZA 4ILJA 3EEQA 4RW9A 1Q9YA 1C0TA 2RN2A 3ZT3A 1FKPA 1T6CA 3QMLA 3GG4A 3I56N 4KO0A 3VQ9A 3PO5A 3MDQA 1RTIA 2HHHK 4JI2K 1NGFA 3QERA 5JS1A 4B08A 2KQ2A 1YTUA 2JGUA 3A5NC 1JKHA 3R8EA 3TAGA 4DTOA 5KRTA 3AVHA 1TK0A 3O9UA 4FCYA 4DQIA 4BQZA 1VQMN 4WQ4C 3HJFA 2E1ZA 4EAHD 5EU7A 3ULEB 3SYZA 3WT0A 4GY2B 4IOXA 4CJSA 4MO5A 3HXMA 4GV6A 3LWLA 3J7AP 1JLGA 3T1YK 4HTUA 4DSJA 3K9KA 3ULEA 4B3MK 4QOZB 4ISGA 4CEZA 5E26A 3OYMA 1JXEA 4BACA 5KGWA 4AQYK 2HBJA 3EKSA 3SMPA 4CGJA 1L3VA 3CPWM 4CFBA 4AHUA 1DTTA 2D0CA 1G99A 2Q0UA 2Q97A 2F7TA 3WEEA 3ZT1A 3U9ZA 4CJUA 2V51B 2AJQA 1HNZK 4B3SK 2RF2A 3K2PA 3U4LA 4PY5A 4JAXA 3ENOA 3AO3A 4JKBA 3WEEB 1LAWA 3U3YA 4FWSA 1VRTA 2E20A 1U45A 3CQXA 3SBTA 2QK9A 1YVUA 2UXDK 2V7ZA 4FZXC 4W5OA 3J80O 1S5JA 3AVIA 4KHWA 4DSKA 3O1WA 3Q7CA 4H5RA 4W5QA 3MN7A 4WF9L 3KJVA 4O44A 3NHGA 3ID8A 1K8AO 3KWGA 4DQQA 4M41A 4BG8A 5HRRA 4OPKA 1EWRA 3VQBA 3SAFA 3LAKA 4H0OA 3VGKA 3L2WA 4E1NA 3EY1A 5JLHA 3T1HK 4FJXA 4IOAL 5E84A 5EXWA 2X78A 2Q36A 1Q82O 1BCOA 3ID6A 4HWIA 4GKKK 2P9UB 1XI1A 1U2VB 1RT6A 1T8EA 2GV9A 5AQXA 1MA9B 4CIEA 2PZSA 2X6NA 5AQYA 1SS6A 3TWHA 1LWFA 3T3FA 3D2EB 4AILC 1B9FA 1X1PA 5I9EB 3E1YA 3TARA 3V9WA 2WTUA 3HPOA 1ZYQA 3E9OA 4YOWA 2F96A 3VQAA 1ZBUA 3P39A 3RMDA 3C6AA 4N5SA 1RBRA 4A2AA 2QWNA 3FZHA 4RWTA 3VQ6A 3L2UA 3ZSYA 3O3FA 4JS4A 4FOEA 5CY4A 3KWIA 4CJ3A 4IFYA 4BR0A 3VPZA 2D0PA 2QTDA 4YNQA 3CPEA 3GBTA 3OS1A 2FBVA 3FFIA 4Q5VA 3OJUA 3CFPA 1SUQA 1GLJO 3AVLA 1N8RO 3AA4A 3C94A 2O8EA 3WXLA 2P9PA 3QO9A 1IKWA 3F5TA 4DMNA 4EP4A 2E2OA 3HT3A 5JLFA 1JLFA 1OVQA 3WQTA 1GLCG 3M8PA 3CC2N 3LDNA 1HMVA 4CECA 1L3SA 1J5EK 4KTWA 3R9PA 4FJJA 1X3MA 3VA0A 4CJWA 4DTPA 1NGEA 5ADXH 1NGJA 4XH4A 4JNEA 5AQSA 4DV5K 2O8FA 3K59A 3OTOK 5GAHP 1ZBFA 3CQYA 4WFAL 1IV0A 1QS4A 1RT3A 3G6EN 1KLNA 2ZJQL 3K5NA 5A2QO 2WONA 1W2BM 4M45A 3NH1A 2NRVA 2ZM6K 2P9IA 1BQMA 4FW2A 3CJAA 2P9LB 1VSFA 4BWJA 1TUYA 2P9IB 1IKXA 5LJWA 1GLLO 3NGIA 3VGMA 3ZSVA 1H1VA 4DR5K 4OLBA 3AA2A 3M8SA 4LF8K 3OYNA 5HRSA 4O8KA 1JL2A 3SUQA 4M3TA 2WFBA 5C2FA 4BR2A 3DMJA 4KTZA 1LW0A 2BUPA 4FWMA 4BREA 3IG1A 3HOTA 2EWSA 1OH6A 1VQ4N 3SV4A 5FPNA 4WFBL 2YNGA 4Y1DA 3KLFA 2HBKA 3EZWA 1YIJN 4B9SA 4NYFA 1HKGA 1FJGK 4NLCA 3VMFB 4JKAA 1EETA 4O5FA 4IDHA 1VSJA 5LMNK 3W3DA 2AP1A 1JLBA 3THYB 4C8OA 3QLHA 5AQPA 4EHUA 3LALA 2ASOA 4B9NA 4E7HA 2VWKA 3NF7A 1NGIA 2FBXA 4MDAA 1S9GA 3CJ9A 5AR0A 1XUPO 4PA1A 4CJEA 5AFUH 1HQEA 2FBTA 1HNXK 2WBNA 4K25A 1NJXA 2GX9A 3OVNA 1MU2A 4W5TA 3DLRA 4YOTA 4BRKA 3GL1A 1J53A 2HMPA 2EHGA 2GELA 2HVIA 4RW8A 3B8AX 1WN7A 4O0JA 1JCEA 5C2DA 4EZ9A 3LDQA 5H1SQ 4KHYA 3A5MC 3NH0A 4BROA 4CFDA 5FRNA 2DFEA 1E3MA 1RTJA 5BN9A 4QAGA 1NMDA 3G10A 4CVNE 3PO4A 2D1KA 1KAXA 4Y1CA 3CG7A 4BRFA 5BR9A 3OYIA 2NNWA 4GKJK 3MEGA 1QQCA 3M3ZA 2D0OA 4BRIA 2QXLA 3BF1A 4JKEA 3B6OA 4FZYA 3C95A 3CCMN 4NB4A 2UUCK 4IG3A 1VSMA 4U67L 3R3LA 1IBLK 3RVCA 5FPDA 1JCGA 3L2QA 1UOCA 1XQSC 1OH5A 1K9MO 1ZBIA 4OGEA 2D4WA 4FLVA 1TAQA 4CBXA 4AF1A 5JICA 1CXUA 3HPGA 1Q8IA 3LP2A 3OY9A 4J2AA 1NWKA 4DTRA 3SLCA 2UYTA 4BRMA 3ZT0A 4N56A 4H8KA 4FJ8A 1HKBA 2ZE2A 3OYLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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