3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
2E1YA 3L0QA 4CBXA 4FWMA 4ISGA 3CJ7A 3QB0A 4EHUA 2E20A 3TU5A 2A42A 3M3ZA 4B1ZA 1X9JA 4M7XA 4M7YA 3UKRA 3ID8A 1BG3A 4MLEA 3MN5A 2P9UB 2V52B 2YI1A 1BWFO 2CH6A 3LM9A 2QM1A 3SLCA 3VEVA 1HX1A 2WUSA 3ATVA 5EXWA 3WEEB 4CBWA 4CZGA 3VGMA 4K25A 3HI0A 4FWSA 4IJNA 4PL7A 2NRHA 3O1BA 4JAXA 3UKUB 4JHDB 2QW9A 4PKGA 2HMPA 3MN6A 1NBWA 4BRDA 3U4LA 2Q97A 4BR0A 3CQYA 4PKIA 3MDQA 4RWTA 4FO0A 3VERA 1NMDA 3MMVA 3GDQA 4WQ4A 1RGIA 2I7NA 3H3NO 4FWNA 4FWRA 2ASPA 5F2RA 3QDKA 1J6ZA 2KHOA 4PL8A 2F9WA 3RSEB 2YJEA 1ZBSA 5KQ8A 2IVOA 3F9MA 4IJAA 4L3QA 3WXLA 2GTDA 2CGLA 1NGEA 2HF4A 2QWLA 1P8ZA 2HOEA 2P9NB 1MDUB 3IDHA 3CQXA 3GL1A 4FSVA 1IG8A 3R8EA 5LJVA 2P9IB 3C7NB 1GLEG 4MO4A 3VF2A 1V4SA 4K42A 5BRDA 3A5OC 3CJBA 3U9ZA 1QZ5A 4XEIA 2P9SA 4BREA 3VEXA 4QS8A 1NGDA 4BC5A 2IVPA 3I8BA 1X3MA 4K41A 1HLUA 2AP1A 1EQYA 2FSNA 3H46O 3ZX3A 4B1WB 1GLLO 3O6WA 3R9PA 1LCUA 1X3NA 3SMPA 1NGBA 4IXCA 5AQUA 4BRGA 3DXMA 4BR9A 2FXUA 3W0LA 1HPMA 4CD1A 5AQJA 1BA1A 2FF6A 4DQ8A 2ZWHA 1BUPA 4KBOA 4FWQA 5TKYA 1NGAA 5F1XA 4DCHA 3FLCO 5BREA 4CZMA 1C0GA 5ELZA 3IUCA 4H5NA 3UKRB 2NZTA 3BF3A 2P9IA 3HBTA 3FGUA 3MN9A 4BQLA 2YJFA 1RFQA 2HF3A 3LM2A 3HM8A 2VCPA 5FPMA 4H5VA 3TPQA 2E1ZA 3QBWA 3UE5A 3W3DA 4BROA 4BR2A 1NGHA 4I6MB 1NM1A 3I33A 4BRCA 4BQZA 1IJJA 5AR0A 1WOQA 2F9TA 4CZEA 2E2PA 3A5LC 3H1QA 4IWVA 1T6CA 4BRLA 3MCPA 3VESA 1G99A 4H5RA 4YDUA 3FZKA 1Q18A 4BGBA 2GELA 2BTFA 4WQ5C 4BRHA 2W41A 3H6EA 4A62A 4CZLA 4BR4A 4AM6A 5AQKA 5EOYA 2QWRA 3QMLA 1SQKA 2D1KA 4AM7A 4IZ9A 3ZEUB 5AQLA 3WXJA 1TUYA 1JCEA 3ULEA 1V4TA 3H3OB 2ASOA 2I7PA 4H5TA 5E84A 5BN9A 4Z94A 3VEZA 3KVGA 4I6MA 4BRQA 3GG4A 5B8HA 3O5BA 4H5WA 4JN4A 4B1YB 3VOVA 4WYBA 3VETA 4H0VB 1GLCG 1BA0A 2P9SB 4H0PA 1XC3A 1Z05A 3FR0A 2Q0RA 1HKGA 2D0PA 2Q31A 2QXLA 2A3ZA 2PAVA 1T6DA 1KAYA 5BRHA 4BRFA 2E2QA 3FZHA 1NGIA 3VF6A 3DXMB 2D0OA 1YVNA 2H3GX 2V7YA 5EVZA 3ZEUA 3FFKB 5AQQA 4BRNA 3VGLA 1Z6RA 3C0BA 1KAZA 3AAQA 3GE1A 4CD3A 5AZJA 3ATUA 1ATNA 5BPNA 5F0XA 5AQNA 3UB5A 2IIRA 3S41A 4BG8A 1MA9B 2A6AA 2Q0UA 4FWLA 4B1XB 1TYQA 4A2BA 5ADXH 5KPZA 2DPNA 4H0YB 5JLHA 2CH5A 2QWQA 5AQWA 3CI5A 1QQNA 4BG9A 1QQMA 3FZFA 3AY9A 3VEYA 5JICA 4H0XB 4BRPA 3CIPA 2YHWA 1QZ6A 5JMVA 2QWPA 5ADXA 2NLXA 3JS6A 5AQYA 2V51B 3O4WA 3FE1A 4LC9B 2J4RA 5AQOA 2A5XA 4NO7A 3CJ1A 3A5MC 4Y0WA 5I9EB 3EKUA 2IVNA 3ZX0A 2YHXA 3R6MA 1U6ZA 3DXKB 3QFPA 1TUUA 4B1UB 2Q1NA 1NWKA 5AZIA 3U8XA 4CZJA 4FL9A 4QS7A 3EZWA 3LDQA 1JCGA 3AARA 4FOIA 5LY3A 1YXQA 3ENOA 4BR5A 3CJCA 3DAWA 3BP8A 5AFUH 4BRIA 4H0TB 1E4FT 2YHYA 3ULEB 5FPEA 3AAPA 1H1VA 1HKCA 3MN7A 1XQSC 4CBUA 5AFUA 2QWNA 3QICA 5JLFA 5EY4A 3D7EO 2VWBA 4JD2B 3LDOA 5AQHA 4BC3A 3EO3A 4ISEA 3EKSA 1ATSA 1MWMA 2V7ZA 3MK6A 5LJWA 1WUAA 3P4IA 5AQMA 3IMXA 2QWMA 3DXKA 3SJHA 3CJAA 3ZETA 3WXKA 3FZLA 1HUXA 4XH1A 2AA4A 3VPZA 4BGAA 4CZIA 3CERA 4EAHD 4B1VA 4BRMA 3DJCA 2GUPA 3WUHA 3DWLA 1Y64A 1LOTB 1CZAN 2FSJA 1SAZA 1YUWA 2A41A 2Q2RA 3GBTA 1K8KB 4JNEA 4MLHA 2UYTA 3WQUA 2ZGYA 3D2EA 5FPNA 4RTFD 3J8AA 2CGKA 1DEJA 5AZJB 4BC2A 4CZHA 4A2AA 2GWJA 4WQ4C 3D2FB 1TYQB 3VF4A 4JD2A 2FSKA 4H03B 3KZBA 1ATRA 1D4XA 2GEMA 1ZC6A 4B9QA 1C0FA 3SMSA 5AQXA 5BRFA 2QWOA 3HSCA 4BVOA 2ZGZA 2P9LA 4O8KA 4RCHA 4WQ5A 3H1VX 3FZMA 1KAXA 3L4IA 4MO5A 5AQSA 1K8KA 1NGGA 3WXIA 4FPAA 3M6GA 4J8FA 5AQVA 3O8MA 3BUZB 3O08A 1U2VB 5AZIB 4DB3A 1BDGA 1RDWX 3EN9A 3QBXA 3A0IX 3O1WA 1GLBG 4IO8A 3O80A 5EX5A 3KHYA 3LDPA 3LL3A 4HTLA 4BR7A 3D2FA 3CHWA 4FWPA 1R59O 2OANA 3ZX2A 4EIAA 3B8AX 2ITMA 3L6QA 4CZFA 3LDLA 3CETA 2D4WA 2P9PB 5E26A 1XUPO 2P9UA 3BF1A 4GY2B 4E1JA 4C23A 4CJ7A 2A40A 1GLFO 5AQIA 1E4GT 1HJOA 3VGKA 4H0OA 1MWKA 4DHYA 3WEEA 4QS9A 1BOTO 3A5NC 5CE3A 3M1FA 1BU6O 1GLDG 4CI6A 2E2OA 5AQRA 4GNIA 5KPRA 3SK3A 3UKUA 5BPMA 4BRKA 4JHDA 3ZETB 1U2VA 3WT0A 4ISFA 5FPDA 1NLVA 2CGJA 2P9KB 3OHRA 3HTVA 3H45C 4BVPA 1OKJA 1NGJA 1KXPA 1HKBA 5BR9A 5KQDA 1GLAG 2EWSA 3RSEA 1DGKN 1NGFA 1QQOA 1ZXOA 3GOIA 2W40A 4HWIA 1JCFA 4O5FA 3D2EB 3U9DA 2P9PA 4XH5A 2ZF5O 4YDUC 4FOEA 2VYPA 5BPLA 2YCHA 3WQTA 4FWOA 4PKHA 4K43A 1YAGA 2P9NA 4BC4A 3EL2A 3ENHA 4A61A 4F9OA 3BEXA 4BRAA 3VEOA 3VENA 3LDNA 5AQZA 3A8YA 4XH4A 4CZKA 5AQTA 4FWKA 5BN8A 5AQGA 3C7NA 5AQFA 1SZ2A 1S3XA 1QHAA 1NGCA 2E8AA 2P9LB 2PBDA 2P9KA 2FLOA 4FPBA 3IFRA 5KPTA 4EHTA 4EFHA 3CJ9A 1T44A 2BUPA 2E88A 1ESVA 2GWKA 5AQPA 2E2NA 1GLJO 2FF3B 3VEWA 4NB4A 3HZ6A 3G25A 3JXUA 1BO5O 2Q36A 3QFUA 4M63C 2ASMA 1S22A 1DKGD
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CBXA 4FLYA 3G10A 4WCEL 1N32K 3C6AA 2LSNA 4TSXA 2JWLA 4CECA 4O0JA 3QB0A 4OKJA 4KI6A 4JS4A 4KPYA 2E20A 2O4IA 2OPSA 1SS6A 3O3GA 3LWLA 1VSIA 4M7XA 4ILJA 2F7TA 3V4IA 4RW7A 2QM1A 3VEVA 2WUSA 3SBTA 3P39A 3OYGA 1NKBA 4FWSA 4IJNA 1RT3A 4PL7A 4FLXA 3J81O 3HRGA 3KLFA 4LF7K 3LAKA 3UKUB 4I9QA 4PKGA 1D9FA 2BGGA 4YORA 4Z4FA 3S3OA 4BR0A 3CQYA 3MDQA 1JLFA 4CHYA 3C6TA 3GDQA 3AO4A 1RGIA 2I7NA 1NK7A 4FWNA 4CF9A 4PL8A 1M90O 3RSEB 2YJEA 3KJVA 1KSPA 4EP5A 4CEFA 4FXDA 3F9MA 4IJAA 4L3QA 2CGLA 4FM2A 3MXJA 2Z1GA 2HF4A 3VQ5A 2QWLA 1LWCA 1HQUA 4JKAA 2P9NB 5CHIA 3CCLN 1Q8IA 4O0IA 5M1QA 3GL1A 4N56A 2Z1IA 4B3MK 1R0AA 1IG8A 3U3GA 1GLEG 1WSIA 4CFDA 1V4SA 2ZJRL 5CR4A 4K42A 1TK8A 3RMBA 4JKGB 1EX4A 4XEIA 4QS8A 1RTIA 3V9WA 1X3MA 5CZ1A 2FSNA 4KH6A 3ZX3A 2HHVA 1GLLO 1JJ2M 3PUFA 1X3NA 3OYIA 2OA8A 3E1YA 3AVMA 4GVEA 1WBBA 2O8FB 4B9NA 3BZKA 3DI6A 1NGBA 4IXCA 3DXMA 4BR9A 3JAMO 2FXUA 3W0LA 1NK0A 2UXCK 2O8DB 4CD1A 5AQJA 4CJVA 4FK4A 2HBKA 1JLAA 3K5MA 4FWQA 3TAFA 1NGAA 3CFPA 4DV5K 4CGHA 3OYKA 4CZMA 2IGIA 1C0GA 4OO1J 4H5NA 2IS3A 4CF0A 3RRHA 2WONA 2GX9A 1Z25A 2D0BA 3MN9A 5LMNK 3J7YP 3NMUA 2YKMA 3ZT4A 2RF2A 3TI0A 2VCPA 2RHKA 1RCHA 3ZSVA 2X6SA 1JLBA 1NMNA 2G8KA 4I6MB 3I33A 2YV0X 4BRCA 4DR1K 1KVCA 4IEIA 4CHZA 4W5OA 4DV1K 4CZEA 3LPUA 4IOAL 4BE0A 1K73O 2O8FA 2NRTA 1T6CA 4BRLA 3MCPA 3L2VA 3S3NA 4YDUA 2NRXA 3FZKA 5C2DA 4CGDA 2GELA 3QINA 4A62A 4DV2K 4YOTA 3NVMA 1CXQA 1EETA 3TSUA 2RPIA 3DRSA 5C10A 1JCEA 1V4TA 1BISA 4JK8A 4DTNA 1UA1A 1W7AA 1ASVA 3AVJA 3U3YA 4L8RB 5BN9A 2YHBA 4Z94A 2ZD1A 1YT3A 2YNHA 4I6MA 2VG7A 3GG4A 1NU0A 4M45A 1TAUA 4JN4A 4B1YB 3VOVA 4WYBA 4WF9L 3QO9A 1O13A 1GLCG 1BA0A 4H0PA 1Z05A 1HKGA 2PFUA 2Q31A 5C15A 3RVCA 2O8BA 1BI4A 1B9FA 2XY7A 2PAVA 1NK9A 3NAEA 3IRXA 3VQAA 4MFBA 4IDKA 1WNSA 1YVNA 2H3GX 4CJFA 3ZSXA 1YI2N 3O9QA 3D45A 3TTFA 3F2KA 4DTRA 1HNWK 1ATNA 3UB5A 3MXMA 1T03A 2OTJN 2A6AA 4A2BA 2QWQA 1ZYQA 4Y1CA 1KQSM 3AY9A 4BRPA 2YHWA 3VQCA 4ILHA 2G8FA 3JS6A 3RMAA 3O4WA 1GOCA 1JLCA 2XO7A 5I9EB 1VSMA 2WFBA 3DXKB 3E01A 5AJ3K 4B1UB 4CGGA 3SUOA 1WN7A 2FBYA 3U8XA 3J7AP 1JCGA 2KLAA 1YXQA 3ENOA 1T05A 3AVLA 1IKXA 3BP8A 1RDBA 1T8EA 5AFUH 3IAYA 4BRIA 4H0TB 3SV3A 1HJRA 3AAPA 1H1VA 3QEXA 1XQSC 5HRRA 5AFUA 2QWNA 3QICA 1Q9YA 3EY1A 3LDOA 5AQHA 2VG5A 3PO4A 3U6FA 1X9WA 1MWMA 4JV5K 2V7ZA 1Q7YO 5LJWA 1WUAA 3SAFA 5FRMA 4CESA 2WOMA 5AQMA 2QWMA 3Q7CA 3DXKA 3SJHA 1SKWA 2AA4A 1NKCA 4NLCA 1XHZA 4E0DA 4BRMA 1REVA 1LOTB 4JKFA 3ZSZA 1CZAN 2A41A 2KTQA 1BQNA 4RW6A 4MLHA 4C8KA 3MXIA 5EU7A 4CJEA 5AZJB 4E1MA 4DLGA 2UUBK 4YY3K 4WQ4C 3OW2M 3KIOA 4DR5K 4JI8K 1NOZA 1KVAA 2FSKA 3O9SA 1VRTA 3KZBA 3SQ2A 3NF8A 1DTQA 4CE9A 3CC2N 4KB0A 3OJUA 2GEMA 3LP2A 1NNEA 4A59A 2QI2A 4PHTX 5LL6Z 2D5RA 2W42A 4FZZA 2QWOA 3HSCA 1VSHA 5JS1A 3H1VX 1BGXT 5HBMA 4CJUA 2VGNA 3KKRA 3TTCA 3M6GA 4J8FA 4I2QA 3BUZB 4CEEA 1VQ9N 4CCHA 1Q81O 3J80O 1BDGA 3EN9A 3A0IX 4RW4A 4M3RA 5EX5A 1JL1A 1N36K 4B3RK 3CHWA 1JLQA 1R59O 1WB9A 2G8WA 3OS0A 1RILA 1WSHA 2GUIA 1RT1A 2P9PB 3DOLA 1LW2A 3KKSA 5E26A 3OYMA 2P9UA 2WTUA 4E1JA 2B6AA 4C23A 2A40A 2VQFK 1E4GT 1A5XA 1TVRA 3WEEA 4Z4GA 3D0PA 1GLDG 1B9DA 5KPRA 4CJ3A 1J54A 1QQCA 1LAWA 5FPDA 1NLVA 1TKZA 2P9KB 4JEPA 3OHRA 5HRSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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