3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
4H0PA 4O5FA 5LJWA 3ZX2A 4BR4A 1NLVA 4IJAA 1SQKA 2FSNA 4FOEA 4QS9A 4YDUA 5AQIA 5ADXA 3QFPA 4EAHD 4BR7A 2A6AA 2F9TA 3ZEUA 2AA4A 4WYBA 3CQXA 5BRFA 1QQOA 4IJNA 2GWKA 3ID8A 3VF4A 3VEYA 1NBWA 3HI0A 5BRDA 4BRQA 3VF6A 1JCFA 3CIPA 1HJOA 1HKBA 2P9SA 3QMLA 5LY3A 5BR9A 2IVNA 2FF6A 2W41A 2CGKA 3WXIA 5BRHA 3MMVA 3ATVA 3WXJA 4BR5A 3FR0A 5AQPA 4B1XB 3GOIA 1QHAA 3A5MC 3WEEA 3ULEA 5JMVA 3VESA 2QWMA 3TPQA 3O1BA 4B1UB 4K43A 2OANA 4JHDA 2J4RA 4BR2A 3ZX3A 1HUXA 3ZEUB 3WXKA 1TUYA 4CBXA 3H3OB 3JS6A 3ZX0A 4EIAA 1E4FT 5AQJA 3A0IX 4JHDB 3QICA 3RSEB 3C7NB 5AQXA 3D2EA 3R6MA 2A40A 1LOTB 1K8KA 4ISGA 2A42A 4MLHA 1NGBA 2GEMA 4FWLA 4KBOA 3SMPA 4FL9A 2YI1A 3H1QA 1S3XA 3M1FA 3U8XA 3FZKA 2P9KA 3FZLA 3UKRA 3LDLA 4DQ8A 1H1VA 2E1ZA 2ASOA 4BRPA 5FPEA 2CGJA 3EKUA 3RSEA 1NGDA 4BRMA 1KXPA 3DXMB 4L3QA 3B8AX 3CJCA 3VOVA 3CERA 3ENHA 2Q0RA 1G99A 2V7YA 3O5BA 4CZGA 2P9UB 3EN9A 1HKGA 4NB4A 1NM1A 3FFKB 3CI5A 4DHYA 1BWFO 1BU6O 2E1YA 2HF4A 3I33A 1KAYA 5BN9A 4CZLA 3DAWA 4JNEA 3LM2A 1U2VB 4BR9A 3HSCA 3SLCA 1JCEA 5E26A 3WQUA 3A5NC 1BOTO 1NGCA 1NMDA 2QWLA 2V7ZA 3EZWA 4AM6A 2P9UA 2IVPA 3OHRA 4H0OA 5BPNA 1TYQB 2D0OA 3MN5A 4XH4A 2YHYA 5TKYA 3WUHA 4BRAA 3VEXA 5BPLA 4H5TA 5AR0A 1NWKA 2P9LA 3DXMA 1ATNA 2BUPA 2IIRA 2HF3A 4BGAA 4M63C 4H0VB 3MK6A 1R59O 2CH5A 2D1KA 4Y0WA 3DXKA 4CBWA 2W40A 3S41A 1ZXOA 5ADXH 3LL3A 1BUPA 1YVNA 1K8KB 4CBUA 5JLFA 4DB3A 5AQTA 1RGIA 3A8YA 3H46O 3CHWA 4WQ5A 1HPMA 4PKIA 2QWOA 1QZ5A 4WQ4C 3GL1A 1X3MA 1MA9B 1BG3A 2Q36A 4CZMA 2PAVA 3WT0A 3VENA 1QQNA 2P9LB 4FPAA 3SJHA 3ZETA 2F9WA 4BQZA 1WUAA 5BREA 4CJ7A 3ULEB 3HTVA 4BRLA 3QFUA 1ZC6A 4K25A 3FGUA 2DPNA 4H0XB 1YUWA 1ESVA 1S22A 2P9PB 3CQYA 5EX5A 3U9ZA 1BDGA 2NLXA 3LDQA 2Q31A 3GBTA 3JXUA 5AQUA 5AQSA 2P9SB 1DGKN 3LDPA 4PL8A 5CE3A 3W3DA 4FO0A 3VGMA 1NGIA 2CGLA 1U6ZA 1YXQA 1MDUB 2P9NA 2QXLA 2ZWHA 4B1VA 1BA0A 1NGFA 3EO3A 4BC5A 4DCHA 4PKHA 4Z94A 4FOIA 1NGJA 2QM1A 4BRIA 2Q1NA 2FSJA 1TYQA 3O08A 4FWRA 2HMPA 3MCPA 2E2NA 3GE1A 4ISFA 4RWTA 4B1ZA 4ISEA 1E4GT 1GLEG 5AQLA 5F2RA 3M6GA 2FF3B 2D4WA 3G25A 2ASMA 1DKGD 2IVOA 5FPNA 5ELZA 3I8BA 1GLAG 3QBWA 3H3NO 5AQKA 3O8MA 1HLUA 1MWKA 4XH1A 5AQZA 3VETA 4M7YA 5AQFA 1SAZA 3VGKA 5AFUA 3QB0A 2PBDA 4MO5A 2E88A 3HZ6A 4A2AA 3VEVA 5AQNA 4CZJA 1XQSC 3QBXA 5I9EB 1HKCA 3UKUB 2P9IA 4BVOA 1Z6RA 1X3NA 2YHXA 5AZIB 3FZMA 3MN7A 1LCUA 4BRFA 1GLJO 4XEIA 3D7EO 3U4LA 5KPZA 1GLBG 2Q0UA 3VPZA 4YDUC 4WQ4A 2ITMA 5BPMA 2A41A 1WOQA 2Q2RA 3L4IA 2QW9A 4WQ5C 4BRGA 4B1WB 4BG9A 1RFQA 4CZFA 2FXUA 5AFUH 2ZGZA 2GWJA 4H5VA 2P9IB 1KAZA 3C7NA 3ZETB 2YCHA 1QZ6A 2I7PA 3UKUA 4JAXA 4HWIA 4H5RA 4IZ9A 2D0PA 5AQQA 2YHWA 1NGGA 2QWPA 4QS7A 4F9OA 1Z05A 4IO8A 4B9QA 1NGEA 3L0QA 4FWMA 3F9MA 4PKGA 3WXLA 4PL7A 3LDOA 4FWOA 3H1VX 5FPDA 4E1JA 2CH6A 4IWVA 3KHYA 1TUUA 1C0GA 5EVZA 4EHTA 4GNIA 3VEWA 3UE5A 3SK3A 3CJ1A 1YAGA 1BA1A 4C23A 4FPBA 5JLHA 3W0LA 1Y64A 2QWQA 4JD2B 4BRHA 4BVPA 5EY4A 3MDQA 2AP1A 2E2OA 5F0XA 4H0YB 4I6MB 4FSVA 4IXCA 4BC4A 2E8AA 3CJBA 1ATSA 3CJ9A 4O8KA 4BR0A 3IFRA 2A3ZA 5LJVA 4AM7A 3FLCO 1D4XA 4BREA 2QWNA 2P9KB 3BF3A 1SZ2A 2V51B 2FSKA 2E20A 3D2FA 1X9JA 4CD1A 3AAPA 4QS8A 5KPTA 4XH5A 2GELA 3VF2A 3R8EA 3DWLA 5F1XA 3VERA 1ATRA 4B1YB 3U9DA 3GDQA 3IMXA 5E84A 3VEOA 2GTDA 5KQDA 2A5XA 5AQGA 4NO7A 5B8HA 1IG8A 3A5LC 2NZTA 4FWSA 3L6QA 1KAXA 3ATUA 1QQMA 3A5OC 3CJ7A 2P9NB 3GG4A 4BRCA 4BRDA 1V4TA 2Q97A 2WUSA 4FWPA 3UKRB 3LM9A 5AQRA 1V4SA 1T6CA 1BO5O 3H45C 5AQOA 4BROA 3D2FB 3O1WA 4K41A 5EXWA 2QWRA 3BF1A 3BP8A 3DXKB 1ZBSA 3D2EB 5AZIA 1DEJA 3KVGA 2FLOA 2ASPA 1GLLO 4CD3A 3VEZA 5BN8A 3P4IA 4H0TB 3MN9A 5AZJA 4BRNA 3H6EA 5EOYA 5FPMA 1OKJA 1P8ZA 2GUPA 4MO4A 3KZBA 1T44A 2H3GX 1XC3A 4BC3A 4I6MA 1XUPO 1EQYA 3WEEB 3AY9A 4FWNA 4A61A 4JD2A 3EL2A 2EWSA 3ENOA 3HBTA 3FZHA 2YJEA 4RTFD 3QDKA 2E2QA 1RDWX 2UYTA 3O6WA 4BG8A 1C0FA 3FE1A 2ZGYA 5KQ8A 2VCPA 5AQHA 4BQLA 4CI6A 1NGHA 3FZFA 4MLEA 4CZHA 4EHUA 3BEXA 1JCGA 4M7XA 2HOEA 3AAQA 4FWQA 4H5NA 4HTLA 1J6ZA 3TU5A 4CZKA 3SMSA 4JN4A 2VYPA 2BTFA 1MWMA 1GLFO 1Q18A 4BC2A 3CJAA 3EKSA 2V52B 4GY2B 5AQWA 2YJFA 2VWBA 4LC9B 1IJJA 3R9PA 3WQTA 2P9PA 3C0BA 3IUCA 4J8FA 2KHOA 4H03B 3BUZB 4FWKA 1NGAA 5AQVA 2I7NA 3MN6A 3CETA 4H5WA 5KPRA 3O80A 1HX1A 2NRHA 3VGLA 5AQYA 3HM8A 2ZF5O 5AZJB 5JICA 2E2PA 1CZAN 3AARA 4A62A 3M3ZA 4BGBA 4EFHA 4CZIA 3J8AA 3DJCA 4RCHA 3UB5A 3O4WA 3IDHA 4BRKA 3LDNA 5AQMA 1T6DA 4CZEA 4K42A 1GLDG 1GLCG 1U2VA 4A2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C10A 3QEWA 3SQ2A 4DTPA 4C1NK 1NLVA 1S72N 1SQKA 2O8EA 4CJWA 3KK2A 4FJJA 5AQIA 4EAHD 2HBKA 2F9TA 2AA4A 1WLJA 4I2PA 5BRFA 1IBKK 3VQDA 1XMQK 4KHYA 3PIOL 1NBWA 3HI0A 3THXA 3AVCA 4JRQA 4HTUA 4CE9A 2WTUA 4RW6A 4FLZA 1JCFA 1N8RO 2X6SA 1RDUA 2W6LA 5BRHA 1DTQA 3MMVA 5J2MA 1YJNN 4E7HA 5AQPA 4CJLA 3AV9A 3A5MC 2RPIA 5JMVA 4I9QA 3O3GA 4DUYK 1VQMN 3V6DA 1ZBUA 4KRFA 4OLAA 3CFRA 2KZMA 3L2UA 3OYNA 1YT3A 4EIAA 4B8AB 4FJ5A 5GIOA 3A0IX 4JHDB 3QICA 4JI2K 4EZ6A 3OS0A 1JLGA 4LH5A 4FJXA 3D2EA 3AVBA 4E89A 5C2FA 4ISGA 3KTQA 1VSHA 3SMPA 4DTMA 4PWDA 2YI1A 3I56N 1S3XA 4DQQA 3U8XA 2WFBA 1LW0A 3K5NA 3HT3A 4B3OA 3UKRA 3CMEN 2XY8A 3VN5A 3KIOA 5I3UA 3EKUA 3C6AA 4HUGA 4BRMA 2Z1GA 3CXCM 1JLQA 3B8AX 3OYIA 4IO9L 3CERA 3ENHA 3SUQA 4O4GA 4CZGA 2EX3A 2F8SA 4BE2A 1HKGA 4NB4A 3G10A 4MDAA 3PX4A 3CI5A 1BU6O 4IOCL 5HBMA 4CK2A 3DM2A 2VG5A 3BZKA 3ZT3A 3K59A 3SJJA 3RR7A 5DK5A 3LM2A 4Z4GA 2LSNA 3A5NC 1NGCA 1WAJA 1NMDA 2DFHA 2V7ZA 3K5OA 4CJEA 1IKVA 4IFVA 1TKDA 3OHRA 1KFSA 2E6LA 1TYQB 2D0OA 2GX9A 2F96A 2HSTA 3WUHA 4BRAA 5BPLA 5AR0A 2P9LA 1JKHA 1Q86O 1XHXA 2BUPA 4CHPA 4O5BA 3EEQA 4DSKA 4M63C 4H0VB 1R59O 3KWIA 4DQRA 4DR3K 4LF5K 4FK4A 3NF6A 5CY4A 1YJWN 1C6VA 5JLFA 1VAZA 3L3UA 3CHWA 4WQ5A 3QNNA 4PKIA 3GL1A 1VSLA 4C8NA 5HRPA 4JLHA 2G8FA 3HJFA 3WT0A 3SJHA 3ZETA 1EXQA 4B3RK 2FBYA 1T05A 2VG6A 2UUAK 3ASMA 1BISA 4JK7A 4K25A 2ITGA 2OPPA 3KK7A 2OYQA 5KTQA 3PO4A 3I0RA 4CCHA 4CJSA 3LDQA 1DGKN 4OJRA 5CE3A 3W3DA 3VQ4A 1WN7A 5C2DA 4OLBA 5GIPA 2OTLN 1U6ZA 1D9DA 4B1VA 1NGFA 3EO3A 4BC5A 1EP4A 3V1QA 4G9ZA 3CFPA 4H4OA 1S1XA 1N36K 4AHVA 1TAQA 4B3TK 4M3XA 3LPTA 5SWMA 4DQPA 4FWRA 1TKZA 3NH1A 4Z0UA 4ILHA 2E2NA 4ISFA 1WBDA 4OO1J 4ISEA 4CGIA 5AQLA 1J9AA 2HBLA 2FF3B 2ASMA 3LAKA 4Q5VA 1MWKA 2YV0X 3MWPA 3DLBA 2IOCA 5AQFA 1SAZA 4E19A 3VGKA 4CJTA 4Z4HA 1BIUA 4KB0A 1Q82O 4IKFA 4DTXA 3CCLN 5FDLA 5I9EB 2UXDK 1HKCA 3UKUB 4B08A 3KKRA 4FK0A 3OTOK 3OBWA 3FZMA 3MN7A 3K5LA 1J54A 1RT6A 4BRFA 1SV5A 4DTRA 3D7EO 4BWJA 4AHUA 3CCQN 4HUFA 2YNHA 4AH9A 4EP5A 1SKSA 5KPZA 1GLBG 4CFBA 3TANA 3VPZA 4YDUC 4ELVA 1VQNN 3T1HK 3L4IA 3PX6A 1S9GA 4CZFA 1W7AA 3QEIA 1OH7A 3L4QA 2ZGZA 4QAGA 3ZETB 2YCHA 3UKUA 2I7PA 4HWIA 5HP1A 5AQQA 2YHWA 1LW2A 3T1YK 2QWPA 4QS7A 1B9DA 1D9FA 3DLLL 3AVLA 4GV9A 1NGEA 3L0QA 4YOYA 4E7JA 5A2QO 5HL7L 1XC9A 1C0GA 3VEWA 3SK3A 1T8EA 3CJ1A 1YAGA 5JLHA 4IBNA 1VHXA 3OYGA 3SZ2A 4MQ3A 4YOTA 3WNGA 2JWLA 4JD2B 3QERA 2HHTA 2AP1A 2E2OA 3HOTA 3SPYA 4DF8A 4O0IA 4C8KA 4CGFA 1GOAA 3V9ZA 1ATSA 3CJ9A 3ZSQA 4GV3A 3OS1A 1GOCA 3QIOA 4KHUA 2O8BB 1BI4A 3FLCO 4BREA 3S3OA 2HHVA 2UU9K 2UXCK 1BL3A 2QWNA 4E3SA 2DFFA 2P9KB 4YNQA 1Y97A 5GINA 1VQ9N 3CYMA 4KTWA 2PZSA 4FJIA 4DR2K 5LMUK 5J2QA 3VF2A 1OVYA 3IMXA 4CJVA 2NRZA 3VEOA 5KQDA 2HHWA 1OH8A 1IG8A 3A5LC 1YF5L 1KAXA 1QQMA 1NK4A 2Q97A 4IFYA 5GAEP 1N33K 5AQRA 3OYHA 3PSFA 3MEGA 4JKGB 1NNEA 4UY8O 1RDCA 5C42A 2O4IA 4ELTA 1Q9YA 3NF7A 2B5JA 2QWRA 1JL2A 1GLLO 4FVMA 3VEZA 2X6NA 3P4IA 3MN9A 4BRNA 5FPMA 1Q9XA 3RMCA 2O8FA 4CIFA 1XNQK 2VWJA 4MO4A 4JKCA 4OKJA 3KD5E 4CK1A 1I3AA 1VSDA 2QKKA 3MX5A 3EL2A 4KTQA 3HBTA 3ZSOA 4I2QA 4R5PA 3G71N 4ICLA 4BG8A 3O3FA 2UYTA 3O6WA 1C0FA 3KD1E 1RBUA 4LFBK 3WXMB 1TL1A 3LWLA 3OYAA 1J5OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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