1MDUB

Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (gs-1)
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords gelsolin precursor
publication title Structure of an F-actin trimer disrupted by gelsolin and implications for the mechanism of severing
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 113
structure length 360
sequence length 369
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1mduB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1mduB04
3H3NO 3CHWA 3R8EA 1ATRA 4B1YB 2E88A 1SAZA 4QS8A 2P9SB 4CZIA 3A0IX 2VWBA 2CGJA 3ENHA 3TPQA 2KHOA 3LDOA 4BC2A 3SMSA 2P9SA 4BR0A 2D1KA 5TKYA 1V4SA 5BRFA 5BREA 3EKSA 3VENA 3BUZB 3QICA 3A5OC 3R9PA 1GLAG 1RFQA 3UKUB 3VERA 4IXCA 4BGAA 1JCFA 3U9DA 1S3XA 2E1ZA 4ISEA 5FPMA 3DXKB 4BC3A 3UKUA 1KAXA 4DB3A 1QQNA 4DQ8A 1S22A 3H1VX 1QHAA 4HTLA 3U4LA 3DXKA 1YXQA 3VGMA 5AQVA 4WQ4A 3LDLA 1U6ZA 3A5NC 5AQTA 3P4IA 3CJAA 2FSNA 4NO7A 4BR9A 3BP8A 4BRQA 3MK6A 2BTFA 3QBWA 5FPDA 3FZHA 4Y0WA 4I6MB 1E4GT 3FLCO 3EO3A 5BR9A 2HF3A 5F1XA 3UKRB 1GLEG 1CZAN 3A8YA 4I6MA 1NGAA 4BRKA 3ULEB 5AFUH 3AY9A 3UKRA 2E2QA 2P9IB 2QM1A 3L4IA 3WUHA 1YUWA 1V4TA 3FZKA 2D0PA 3C0BA 1DEJA 1Z6RA 3ULEA 3GDQA 2P9IA 3FZMA 2HMPA 2IVOA 2ZWHA 1R59O 5AQKA 3CJBA 4MO4A 1P8ZA 1MWMA 2FF6A 2ZGYA 3GG4A 5AQNA 3ZX0A 3JXUA 3O80A 4BC5A 4BRGA 3FGUA 4K25A 4FWNA 2Q0UA 2A42A 1KAYA 2E1YA 3AARA 5AQPA 3KHYA 3O5BA 3H6EA 5AZIB 3FE1A 3G25A 4IWVA 1NGFA 4MLHA 4DHYA 3C7NB 2A3ZA 4BQZA 2VYPA 5AZIA 2YJFA 3LDQA 1NLVA 4PKIA 3VEZA 2YHWA 3M6GA 2ZGZA 3C7NA 3I8BA 2GWKA 3WXIA 1BO5O 3GL1A 4BRHA 3UB5A 3AAQA 5FPNA 4B1XB 4AM7A 2CH5A 3DAWA 3RSEB 3CJ1A 4M7XA 4EHUA 2W41A 4JD2B 3CETA 1NBWA 4M7YA 4H0VB 4AM6A 3FFKB 3ID8A 3RSEA 4O8KA 4RWTA 2PBDA 4JD2A 5AQYA 2A5XA 2A41A 5KPZA 4LC9B 2Q36A 2CH6A 3MCPA 2QWPA 1GLJO 4XH4A 3H3OB 1X3MA 1Q18A 1BA1A 4J8FA 1QQOA 3WXJA 1NGHA 4KBOA 5AQFA 3EZWA 1EQYA 2D4WA 4WYBA 2P9LB 3IMXA 2YCHA 4EIAA 1MA9B 4K43A 5KPTA 2P9LA 5AQZA 5F0XA 1HX1A 3FZLA 5AR0A 3H1QA 1NGBA 5E84A 4NB4A 1GLFO 2YJEA 4CZFA 3QFPA 1GLLO 3DJCA 3VF4A 1DGKN 4XEIA 4BRDA 2I7PA 2FXUA 4FOEA 4JHDB 3HTVA 3BF3A 4CD1A 3AAPA 2EWSA 2IVPA 4FPBA 3VEYA 3WT0A 1GLBG 5AQOA 5AFUA 4JHDA 1K8KB 1QZ5A 2E2OA 3MN5A 1NGJA 1IG8A 4B1WB 2QXLA 3VEVA 3VEWA 3H45C 3WXKA 3VGLA 1K8KA 1SZ2A 2YI1A 4B1UB 4CBXA 1XC3A 3U8XA 2P9UB 5AQGA 4JAXA 5EXWA 1T44A 5AQSA 2Q31A 5AQIA 2NLXA 1MDUB 2H3GX 4B9QA 4BVPA 2P9UA 4BREA 4CZHA 2ASMA 3HZ6A 4Z94A 5AQQA 5BPLA 3VEOA 4O5FA 2GTDA 1GLDG 3CIPA 3WQUA 3WEEB 1T6DA 5BRHA 4MLEA 1BU6O 5F2RA 3EL2A 1Y64A 1NMDA 4FWQA 3WEEA 5EX5A 5JICA 1BG3A 4BRLA 5JLHA 4BRPA 1BDGA 1BWFO 3TU5A 3D2EB 1YAGA 4H0OA 4BR7A 5BPMA 1WOQA 4K42A 3D2EA 2GWJA 3MDQA 3R6MA 1TUUA 4PL7A 2ASOA 5ELZA 3M1FA 2PAVA 2V7ZA 4BRFA 3L0QA 1QQMA 3D7EO 3ZX2A 1TYQB 4GY2B 4IZ9A 5FPEA 4GNIA 3CQYA 4A61A 1QZ6A 4CJ7A 1NGGA 3W0LA 5B8HA 2AP1A 4EAHD 4WQ5C 1TYQA 2GUPA 3VPZA 3IUCA 1HPMA 3A5MC 5I9EB 3O1WA 3IDHA 5JMVA 2YHXA 3MMVA 5JLFA 4QS7A 3MN9A 2E2NA 2V51B 4FO0A 2QWRA 3MN6A 4A2AA 2NRHA 4CZEA 3QFUA 4CZKA 4FL9A 5AQXA 3HSCA 3BF1A 3GE1A 2YHYA 2UYTA 4PKGA 3KZBA 4MO5A 2FSJA 2QWOA 2ASPA 3ENOA 4H03B 4K41A 4H0XB 5LJVA 3DWLA 3ATVA 4A2BA 2FF3B 5AQRA 3ZETB 3MN7A 3O1BA 4FWOA 3SK3A 5BN8A 4XH5A 1LCUA 4CZLA 3GOIA 2IVNA 1ATNA 3J8AA 4RCHA 4CBUA 3HI0A 2ITMA 3ZETA 3DXMB 4BRCA 3SMPA 3B8AX 1BOTO 5EOYA 3DXMA 4FPAA 4IJNA 3CERA 3VGKA 3H46O 4CZMA 4IO8A 4WQ5A 1NGEA 2NZTA 1NGIA 3CI5A 3CJ7A 5AQMA 2E8AA 4BRMA 2V7YA 2QW9A 5AQWA 4BG8A 3A5LC 3M3ZA 3VOVA 3GBTA 2HOEA 5KQ8A 1RDWX 3O4WA 4H0PA 4CI6A 4BR2A 1X3NA 1XQSC 1GLCG 4RTFD 3CJ9A 1T6CA 2J4RA 3LDNA 4FWKA 3LM2A 2W40A 1TUYA 1ZBSA 5AQLA 3SJHA 3O08A 4E1JA 3WQTA 5KQDA 2A40A 2QWNA 3IFRA 4H5NA 5ADXA 3HM8A 2D0OA 5EY4A 3ZX3A 4BROA 3L6QA 3CQXA 1HKBA 1ZC6A 4FOIA 4PL8A 2QWLA 3LL3A 3S41A 4HWIA 1Z05A 4FWMA 5BPNA 4BVOA 2GELA 3VF2A 4BR4A 2QWMA 1NGDA 1YVNA 2CGKA 4DCHA 4YDUC 4H5WA 3VETA 2Q2RA 5AZJB 4F9OA 4CBWA 1C0FA 1G99A 2Q97A 4ISFA 2Q1NA 5AZJA 5BN9A 4BRAA 2A6AA 3O8MA 1J6ZA 5EVZA 2OANA 1C0GA 3WXLA 1LOTB 1KAZA 1NGCA 2AA4A 1ESVA 3BEXA 4QS9A 5CE3A 1HJOA 3EN9A 3O6WA 5ADXH 3I33A 4EFHA 5KPRA 1KXPA 1WUAA 4M63C 2IIRA 4FSVA 4H0YB 3EKUA 2GEMA 3LM9A 4CZGA 1HKGA 2E2PA 4JNEA 2VCPA 1HUXA 4CD3A 4C23A 4CZJA 4H5TA 3QB0A 2WUSA 1NM1A 1E4FT 1JCGA 3QBXA 3FZFA 3KVGA 2CGLA 4H0TB 2F9WA 4FWSA 1X9JA 4FWLA 1BA0A 3F9MA 4BC4A 4BQLA 3UE5A 2DPNA 5AQJA 3CJCA 3FR0A 2HF4A 4A62A 1MWKA 2P9KB 1ZXOA 2FLOA 4JN4A 1IJJA 2E20A 3ZEUB 3QDKA 4YDUA 3HBTA 1BUPA 2P9KA 2I7NA 4EHTA 1RGIA 1XUPO 5E26A 3ZEUA 5AQHA 5AQUA 5LJWA 1NWKA 4FWRA 3W3DA 1HLUA 4H5VA 2ZF5O 5LY3A 1D4XA 2P9PB 2FSKA 4FWPA 4XH1A 1U2VB 2QWQA 2V52B 4BR5A 1SQKA 2P9NB 1OKJA 1H1VA 3LDPA 4WQ4C 2P9PA 4H5RA 5BRDA 3OHRA 3ATUA 3D2FB 4B1VA 2F9TA 3SLCA 1U2VA 4PKHA 2P9NA 1ATSA 2Q0RA 3QMLA 3VESA 4BRNA 3VEXA 2BUPA 4IJAA 3D2FA 3VF6A 4BG9A 4L3QA 4ISGA 1DKGD 4B1ZA 1HKCA 1JCEA 3U9ZA 4BRIA 4BGBA 3JS6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSIA 3CHWA 3VQQA 1BGXT 4BWJA 4JK8A 3LDSA 4JI3K 4ILGB 1V4SA 4JKBA 4CEDA 4YY3K 3VENA 3R9PA 4DUYK 1HNIA 3UKUB 3ZSQA 3L8BA 4IXCA 1JCFA 2NRVA 4HCBA 1WN7A 2Z1IA 4DU3A 3UKUA 4DB3A 1GOAA 5HL7L 1S22A 1EWRA 4DTOA 3U4LA 4DS4A 3VGMA 2VGNA 4DQSA 4LSNA 3HPGA 3CJAA 4AHRA 4C1NK 4K0KK 1T3VA 3MK6A 3ZSXA 2UUAK 1JXBA 3QBWA 1TV6A 5FPDA 3SPZA 3EO3A 2HHQA 2HF3A 1VQ6N 1UA1A 3HOTA 1YI2N 5SWMA 1FK9A 3C6HA 4JI0K 5I3UA 2P9IB 3L4IA 4HHTA 3WUHA 3K57A 1RTIA 2D0PA 1JKHA 2DFEA 3QEWA 1Z6RA 2PYLA 2P9IA 1F21A 1RDUA 2IVOA 4PY5A 5BR8K 3THYB 4CEFA 3GG4A 4W5NA 3AVBA 4GV9A 3V9SA 3THYA 4CGFA 3PLAA 2E1YA 4DF4A 2E5LK 4AHTA 3O5BA 5CZ2A 5AZIB 3G10A 4KHWA 4YORA 3G25A 3ALYA 3PIPL 4MLHA 4DHYA 3OS0A 2VYPA 4OKKA 5AZIA 3LDQA 1EKEA 4KHQA 3ZSZA 3TTDA 2ZGZA 2GWKA 4W5QA 1BO5O 3AVGA 3OYDA 1KLNA 1VSJA 3HT3A 5KGXA 4M7XA 2HHVA 5FRMA 4FW2A 2PZSA 4H0VB 3CCRN 4CHQA 3CPWM 1U04A 1S1WA 3TAMA 4RWTA 5KPZA 3CCEN 2HW3A 3ID6A 1RT6A 5C15A 1A5VA 1KQSM 4GKJK 3WXJA 5AQFA 5HRRA 3MAQA 3KK3A 4DTPA 1TL3A 4WYBA 2P9LB 3BGRA 1WSFA 4RW8A 1JLEA 4DWIA 3JAMO 3OYHA 1MA9B 4JKGB 4DFJA 2NRXA 3QIOA 2P9LA 4AQYK 4JKGA 2KLAA 3RMAA 4CZFA 3QFPA 4C8MA 3DJCA 3VF4A 4U67L 3CM5A 4DTUA 4B9NA 1CXUA 4FOEA 4JHDB 1Q9XA 1S1XA 3WT0A 4JRPA 2HHHK 5AQOA 4JHDA 1TKZA 1IKVA 3T1AA 4I9LA 3F2KA 4B1WB 2QXLA 3H45C 4MFBA 5J1EA 3U8XA 4Q5VA 5AQGA 4GW6A 5EXWA 5AQSA 5AQIA 2UUBK 4O5BA 1LWEA 5KRTA 4F3TA 4CZHA 1K6YA 4IEIA 3N4PA 4Z94A 5KGWA 3CIPA 1N33K 1WSEA 1BU6O 4YOXA 3SPYA 3EL2A 1TKDA 1Y64A 1NMDA 4FWQA 1CZBA 3ZSVA 2IS3A 4CESA 4CJ4A 1M1KO 5BPMA 4K42A 3HO1A 2Z1GA 4CJEA 3OYEA 3R6MA 2ASOA 2PAVA 3M8SA 3RWUA 3SZ2A 1NK7A 3AVNA 3D7EO 3ZX2A 4CFCA 4GNIA 4A59A 4CJ7A 2QXFA 4DTSA 4WQ5C 3RVCA 4BEBA 4DU1A 3VQCA 4O0JA 2PFUA 4F4KA 1NKBA 1ZBUA 5I9EB 2DY4A 2O4IA 3IDHA 5LMUK 2YHXA 3TSQA 1ZYQA 3HVTA 2VG7A 5C42A 3Q7CA 2G8HA 4FO0A 3MN6A 1HNWK 4CZEA 4CZKA 1BCMA 3BF1A 2VQEK 5C12A 4MO5A 3I8DA 1LW0A 3AO4A 1WBBA 4E1NA 4K41A 4OKJA 4CJPA 4DKWA 4B8AB 5LJVA 2NRRA 3DWLA 4LFAK 1UA0A 5J2NA 1JL2A 3MN7A 3O1BA 4FWOA 5BN8A 2P5GA 3L2WA 1ATNA 4RCHA 3EE8A 4BRCA 1XC9A 1BOTO 5EOYA 1SUQA 3CERA 3VGKA 3DRPA 3S5TA 4IFYA 3L2QA 4IO8A 3T1YK 1Z25A 4WQ5A 3DOKA 4R5PA 2UUCK 4WFBL 1VSIA 1X9SA 5AQMA 4J2AA 3G0ZA 3TI0A 3THWB 2KFZA 1LAWA 1RNHA 2QW9A 4BG8A 3THWA 3O4WA 4H0PA 2FC0A 3CMAN 3AO2A 1GLCG 4M3UA 3ZSOA 3PX0A 3SCXA 3J7AP 4BE7B 1T6CA 2J4RA 3RR8A 2FBVA 1O13A 3MCAB 2OTJN 2F96A 1ZBSA 2HHSA 5AQLA 3P31A 3MX2A 2XRIA 3IFRA 2YHBA 5ADXA 2D0OA 3L2VA 3QNNA 2HVHA 4JYAK 3RTVA 1HKBA 4DV2K 4CJ5A 4LF5K 1Q86O 4FWMA 1YJWN 4BR4A 4M3ZA 1U47A 3D6RA 5GIPA 3VETA 4F9OA 3WNGA 4BDYA 2IDOA 1G99A 2Q97A 1HYVA 1JLFA 4CFAA 4HUFA 1UWBA 2KZMA 1KAZA 1B9FA 3DRSA 4MDBA 1LAVA 1CXQA 4QCLA 3I33A 4LF4K 1VAZA 5FDLA 3VQBA 2OCEA 1KXPA 1WUAA 2W42A 4E0DA 4M63C 5KI6A 2Q3SA 4AHCA 4CJLA 4CHPA 3C6UA 1K73O 2Y1IA 4JNEA 2VCPA 3AA4A 3THXB 3SQ1A 4DLGA 2P1JA 4LH5A 2BANA 3QBXA 3THXA 4ICLA 4FWSA 1X9JA 1I3AA 3THVA 4CJWA 4F2SA 1BA0A 4FLVA 4CHZA 3DMJA 4DQIA 3FR0A 2JWLA 2QK9A 2P5OA 1ZXOA 2NRZA 4Z4EA 4E7KA 2RPIA 3AVIA 1RGIA 1JL1A 3VA0A 3TANA 1NWKA 4FWRA 4FJHA 3TTFA 1X1PA 2E6LA 1L3SA 1NK9A 4C8LA 2ZF5O 4OX9K 1D4XA 4CK3A 2FSKA 4FWPA 4XH1A 2E6MA 4BR5A 3ZYYX 1SQKA 1QSYA 1FJGK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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