1MDUB

Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (gs-1)
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords gelsolin precursor
publication title Structure of an F-actin trimer disrupted by gelsolin and implications for the mechanism of severing
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 360
sequence length 369
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1mduB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1mduB04
4CZKA 4CD3A 4L3QA 4BRPA 1NGFA 5CE3A 3EN9A 3FZMA 1XQSC 5JLFA 4JAXA 3HSCA 3QFUA 5AZIA 3SJHA 2QWOA 2QWNA 4BR4A 5BN9A 1LCUA 5AFUH 5BRFA 2ZGYA 3ZX2A 2A41A 3DAWA 4JD2A 1S3XA 1GLJO 1QQMA 1WOQA 1HKCA 5FPNA 2GWKA 1X3NA 3LDLA 3VETA 2A42A 2CGKA 3A0IX 1LOTB 4PKGA 1GLCG 2E8AA 1RFQA 4EAHD 1TUUA 3H45C 3MMVA 2Q36A 3GOIA 4GY2B 1HPMA 2BUPA 2A40A 4AM6A 3F9MA 3ZETA 3D2FB 3WEEA 1HJOA 1GLFO 5FPEA 3MN7A 5F2RA 2HF4A 1HKGA 3UKRA 2FXUA 3FGUA 2E20A 1ATNA 3DJCA 5B8HA 2GUPA 4BC4A 5F0XA 3A5LC 3ID8A 1NBWA 3QDKA 1NMDA 3ATVA 4FWQA 4B1ZA 3IFRA 1GLEG 2IVPA 5F1XA 2GWJA 4CZIA 4GNIA 1NGAA 1X9JA 2F9WA 3H3OB 4FWSA 3WQUA 2V51B 4H0VB 4BRNA 2P9KB 5AQVA 3VEWA 5EXWA 4RTFD 2FF6A 1TYQB 2FLOA 3CERA 3LDOA 3J8AA 1BA0A 3FR0A 1NLVA 2I7NA 2Q1NA 3U9ZA 1NGHA 2E2QA 3D2EB 1YXQA 2P9NB 2P9UB 1YAGA 3O1BA 3W3DA 3WT0A 2UYTA 5AQPA 4FWNA 5BR9A 4BQZA 3C7NA 4BQLA 4C23A 5EVZA 4Z94A 1KXPA 2QWMA 3UE5A 3S41A 1NGGA 1BA1A 4K42A 4BR5A 3QFPA 3EL2A 2YHYA 2HF3A 4BRAA 3MN6A 3QBXA 2ZF5O 5E84A 3FLCO 4BG8A 1S22A 1BWFO 1R59O 3DWLA 5AQNA 2E2NA 3W0LA 4WQ4A 3MDQA 4QS7A 5AQMA 3O1WA 3VEXA 1RGIA 3DXMA 3IMXA 3EKSA 3IDHA 4B1UB 1ZC6A 3FZHA 5BPMA 4H0TB 3C0BA 3KHYA 4CBUA 2VCPA 3DXKB 4JHDB 1WUAA 2YJFA 4H0XB 4M7XA 3HZ6A 1KAYA 2EWSA 2V52B 5ELZA 1T44A 1U2VB 4WYBA 3CJCA 1ZBSA 3A5OC 4H0YB 5BRHA 3WXLA 4CZFA 5AZJB 5AQIA 3GE1A 1K8KB 2CGJA 3U9DA 1BUPA 5EY4A 4BC2A 2AA4A 3CQXA 4A2BA 4BROA 2YJEA 4HTLA 4WQ5C 3WQTA 5AQUA 1QQNA 3CI5A 3LDPA 5KPTA 3TU5A 3ULEA 2P9SA 4AM7A 1GLAG 1BOTO 2A3ZA 3AARA 4XH4A 3SLCA 4BVOA 4DQ8A 4H5NA 3JS6A 4BVPA 2VYPA 3ZX3A 5EOYA 3CJ1A 4FSVA 4FOIA 1JCFA 4Y0WA 4A2AA 3H46O 4CZMA 4CI6A 2QXLA 2HOEA 2VWBA 3AAQA 3JXUA 1EQYA 4DB3A 3UKUB 1CZAN 4FPAA 4ISEA 1DEJA 1YVNA 5LJVA 3VEVA 4RCHA 3VGLA 5BN8A 4BRLA 3BUZB 4MO4A 3H3NO 5AR0A 1DKGD 3ATUA 2P9IB 4BG9A 2ZGZA 3WXIA 5EX5A 1JCEA 3CETA 4XH1A 5JLHA 3VGKA 4EHUA 2D0PA 2FSKA 3D2FA 5BPLA 5E26A 3LDQA 5AQYA 2WUSA 2D0OA 4CJ7A 2Q97A 4HWIA 3GBTA 1DGKN 2H3GX 2P9IA 3VF6A 2I7PA 4CBXA 4H5WA 2J4RA 4BGBA 5LJWA 3R6MA 2P9PB 4MLEA 4BRDA 1IJJA 4H5VA 3WXJA 4BRFA 4CZEA 4K25A 4EIAA 4BC5A 2P9KA 3CQYA 2Q31A 3BF3A 1TYQA 1ATSA 3KVGA 5AQSA 3FE1A 2A5XA 2PAVA 4XH5A 1NGIA 1NGDA 3FFKB 4PL7A 3BEXA 1C0GA 3ENHA 3VF4A 3D2EA 4QS8A 3H1QA 2P9NA 3VPZA 2P9UA 5FPMA 3VGMA 3VESA 4BRKA 5FPDA 4B1WB 4FOEA 2GEMA 3EKUA 4FWRA 5I9EB 3VENA 3OHRA 2YCHA 3QBWA 4FWOA 4LC9B 4CZHA 2AP1A 3H6EA 2ITMA 4A61A 1ATRA 2P9LB 1HKBA 1QZ6A 1G99A 3ZEUB 1MWKA 4KBOA 1GLDG 3CJAA 2CH6A 3CHWA 2YI1A 3VEYA 2FSJA 4B1VA 4IWVA 3AAPA 2D1KA 5AQHA 2BTFA 4FO0A 3A5MC 3B8AX 4WQ5A 1BU6O 3WXKA 4FWKA 2IVNA 3LM2A 1NGCA 2Q0UA 3H1VX 2ZWHA 4DCHA 1SAZA 3O6WA 3ZX0A 4FL9A 4B1YB 3DXKA 1BDGA 4JHDA 1NGJA 4FWPA 5AQKA 5BPNA 3IUCA 4K41A 2Q0RA 2A6AA 1XC3A 5AQGA 4O5FA 5AQXA 2F9TA 2FF3B 3VEOA 4H0PA 4CD1A 1U2VA 3MN9A 3O5BA 1T6CA 4BRMA 4PKIA 1MWMA 3GDQA 5AQQA 4CZJA 4O8KA 5AZJA 3CJ7A 1U6ZA 4M7YA 4BR0A 2CH5A 4IZ9A 1K8KA 2NZTA 4F9OA 4K43A 3HI0A 3MK6A 4YDUC 3VEZA 4FWMA 1V4SA 4BREA 1QHAA 4ISFA 4J8FA 1GLBG 5AZIB 5KPRA 1E4GT 1MDUB 4BRCA 3CJBA 3HBTA 3FZKA 1OKJA 4JD2B 1NM1A 3QB0A 3A8YA 3L4IA 4H03B 4H5TA 1NWKA 2YHWA 3UB5A 5AQTA 4B9QA 1E4FT 3R8EA 5AQRA 1J6ZA 4DHYA 1SZ2A 3EO3A 1Z6RA 2GELA 3ZETB 4BRQA 4NB4A 3WEEB 3I8BA 4ISGA 1BO5O 1C0FA 2ASMA 3MCPA 5AQZA 3HM8A 3TPQA 3VOVA 2D4WA 1QQOA 1D4XA 2KHOA 1HLUA 3L0QA 4H5RA 3KZBA 3SK3A 3UKRB 3UKUA 4EHTA 1NGBA 1T6DA 4JN4A 1H1VA 3SMPA 4BC3A 3SMSA 2NLXA 1MA9B 3O4WA 1QZ5A 2E1ZA 2E2PA 3U8XA 3L6QA 2FSNA 5KPZA 1ESVA 1KAZA 1HUXA 5ADXH 2PBDA 4BR9A 4BR2A 3O08A 2YHXA 4BRIA 2HMPA 1Y64A 3BP8A 3I33A 3O80A 1Q18A 2E1YA 1XUPO 1HX1A 4XEIA 2QWRA 1NGEA 1BG3A 2Q2RA 2ASOA 4B1XB 5KQ8A 4PL8A 3LL3A 3EZWA 2QWLA 3O8MA 3QICA 2P9PA 3GG4A 4FWLA 1X3MA 3M3ZA 3WUHA 4EFHA 5TKYA 3M6GA 5BREA 3U4LA 5AQLA 4PKHA 3LDNA 2DPNA 2IIRA 3C7NB 2ASPA 3VERA 5JMVA 3LM9A 4IXCA 1YUWA 3G25A 4BRGA 4IJNA 2W41A 5JICA 4CZGA 1KAXA 3BF1A 1SQKA 4FPBA 5AQOA 4M63C 3CIPA 1TUYA 4NO7A 5AQWA 3VF2A 4QS9A 4I6MB 3ENOA 1Z05A 1RDWX 3A5NC 2QWPA 2QW9A 4CZLA 1JCGA 3DXMB 5KQDA 1P8ZA 5LY3A 2QWQA 4BR7A 1IG8A 4H0OA 2OANA 3CJ9A 5AFUA 3D7EO 2P9LA 4I6MA 3ZEUA 3R9PA 5AQJA 3HTVA 2E88A 4YDUA 5AQFA 3FZLA 4BGAA 3P4IA 3RSEB 3QMLA 4JNEA 2V7YA 4CBWA 4E1JA 2V7ZA 1ZXOA 1V4TA 2GTDA 3GL1A 2CGLA 2NRHA 3FZFA 3MN5A 4WQ4C 4BRHA 4IO8A 3AY9A 3M1FA 5BRDA 1GLLO 5ADXA 2QM1A 2E2OA 4MO5A 2IVOA 3RSEA 3ULEB 2P9SB 4IJAA 4RWTA 4A62A 4MLHA 2W40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NCGA 4CD3A 4CHNA 1Q82O 1LV5A 3NDKA 1C6VA 2O8FA 1S6QA 4JI4K 3MWPA 4FJIA 2WTUA 2BE2A 3N4QA 2QWNA 4BR4A 5BN9A 1EO1A 4AHTA 3ZX2A 4CF2A 3SAHA 3CFOA 3L2RA 3RMDA 1GLJO 1QQMA 2WC9A 1HKCA 2OTLN 4CHQA 1X3NA 2A42A 2CGKA 3KK1A 2XY6A 4C8NA 1JXEA 5SWMA 2UUCK 1TUUA 3H45C 2Q36A 2A40A 1HMVA 3SQ0A 3WEEA 1NJYA 1NK8A 1A5WA 3R1XA 3LDSA 3HPGA 4CEZA 5JVHL 3E01A 4OKJA 1HKGA 1SS6A 1SUQA 3UKRA 2FXUA 3FGUA 5B8HA 3K5NA 5MLCQ 3ZYYX 4F3TA 1NBWA 3QDKA 1EP4A 4X66K 2UUAK 3IFRA 4OGCA 4GKKK 4CZIA 3KWIA 1WSFA 1QSLA 3VQAA 4BRNA 5GIOA 1HNVA 5EXWA 1XI1A 3J8AA 2HBKA 2I7NA 1NGHA 3JSMA 3L4QA 1C1AA 2P9UB 3O1BA 1TL3A 3THYA 3TAMA 4RW8A 4NYNA 5BR9A 5J1EA 4CJEA 5EU7A 4CJRA 4M3WA 3C7NA 5EVZA 5CY4A 2QWMA 1NGGA 1BA1A 4K42A 3QFPA 3QBXA 4AHRA 4YOUA 3OYMA 2ZF5O 3OYFA 4BG8A 3T69A 1YVUA 4JI1K 2ZJRL 1R59O 4X62K 4OKEA 3SBTA 1S9GA 1Q7YO 2WONA 1RTDA 4GKJK 5AQMA 4JS5A 4ID1A 4KB1A 3S9HA 3DM2A 1T05A 4JHDB 3HT3A 4FZYA 1EWQA 2W42A 2YJFA 2EWSA 4B9LA 5C25A 3MXIA 4CGDA 1WAFA 1T44A 4YOXA 4WYBA 2IOCA 4DSEA 3A5OC 3MECA 3V9XA 5BR8K 4N47A 1KTQA 3AGRA 3G10A 3GE1A 1K8KB 1S5JA 3F2KA 3MXMA 5EY4A 4CF9A 4E72A 4BC2A 2AA4A 4IOXA 4BROA 2NRTA 3J7YP 3PO4A 4KHYA 1BCOA 3ZSRA 3TU5A 1J54A 2BH1A 3ULEA 1JLEA 4I2PA 4PY5A 4K8XA 4CF1A 3KKSA 4CHOA 4BVOA 2F8SA 3JS6A 4HHTA 3T1AA 2G8IA 4QOZB 2YX6A 3ZX3A 4X64K 4FOIA 3HM9A 1VSKA 4Y0WA 3CC2N 4A2AA 4KTQA 2X78A 4HUGA 3HOTA 2KW4A 2VWBA 3AAQA 4O0IA 3V9SA 4DTMA 2Y1IA 3LANA 4DB3A 1VQ9N 4BACA 1CZAN 4FPAA 1RNHA 2OPQA 1YVNA 4FK4A 3SYZA 4X65K 4BRLA 4DV6K 1JL1A 2FBYA 3H3NO 5AR0A 2XO7A 2F8TA 4DQPA 2PFUA 2ZGZA 3WXIA 5EX5A 3KD5E 3CPEA 3KD1E 3D2FA 3DLBA 1BI4B 4GMJB 3AA2A 5E26A 4CGHA 2XY7A 3O9QA 1K73O 4IBNA 1YTAA 3RR7A 1N34K 2HHQA 5LJWA 3R6MA 4MLEA 1IJJA 3O4NA 4F2RA 1U45A 3OYBA 5HBMA 1RT3A 1YJ9N 4LF9K 1JLCA 4M3UA 4E1MA 2VWJA 2DY4A 2PAVA 5GINA 3OYJA 5C15A 3A2FA 4PL7A 4DFJA 1W2BM 3OS1A 2PY5A 3AVHA 3M8PA 1VAZA 5FPMA 3VGMA 3CXCM 3MEGA 4FW2A 3RRHA 2GV9A 3LP2A 3V1OA 4B1WB 5K14A 4CHYA 3DOKA 4BE7B 5GAHP 1TKZA 3OHRA 4FWOA 4IG0A 3QEWA 2AP1A 3H6EA 1HNZK 2ITMA 3HVTA 1X9WA 2P9LB 4OJRA 1GLDG 3CJAA 2EHGA 4CJUA 3ULDA 3LPTA 4CVNE 3VEYA 2W6KA 3AAPA 4CFAA 3M5RA 5AQHA 2BTFA 4B3MK 4DF8A 4FWKA 1BL3A 3LM2A 1UWBA 3NVKA 2C1IA 3H1VX 1YT3A 4DQSA 3O6WA 4B1YB 4FWPA 5BPNA 3SCXA 4Z4CA 3LWLA 5AQGA 3VEOA 4O5FA 2F9TA 4NXMK 2F7TA 4LF7K 1U2VA 3L3UA 1T6CA 4BRMA 3HPOA 3HXMA 2LSNA 4V19S 5FROA 5AZJA 5CZ2A 3CJ7A 3VQBA 2ATQA 4IOAL 2YHBA 3TSUA 3J80O 1IH7A 1RT6A 4K43A 1KVBA 1QS4A 1V4SA 3AVCA 5AZIB 5KGWA 2HB5A 1BIUA 4B8AB 2DTUA 4EP5A 3F9KA 4PUOA 3HVRA 4B08A 3MWTA 3OYLA 4FM0A 1NWKA 3UB5A 3P39A 3KIOA 1E4FT 4Q5VA 3MAQA 3OBWA 3AO3A 4I7FA 1Z6RA 2GELA 4BRQA 4DTSA 1KQSM 3RR8A 4FJXA 3I8BA 4AH9A 1C0FA 3HM8A 3VOVA 4ELUA 2KHOA 1U4BA 1TK0A 3UKUA 3SK3A 3OYKA 1JKHA 3AVNA 3THVA 2FBXA 2X74A 4FJLA 2OCEA 2E1ZA 3VTHA 2E2PA 4JKDA 3L6QA 4CECA 4BR9A 4BR2A 4BRIA 4DTOA 2HMPA 3SPYA 3K2PA 1HNIA 3C6TA 4CJ4A 2ITGA 2XHBA 4K8ZA 2HW3A 4XEIA 4DMNA 3CC4N 2UXCK 2XRIA 4O0JA 2Q2RA 1Q86O 1REVA 3CCJN 4KRFA 3EZWA 2QK9A 4ILJA 1S1XA 2P9PA 3WUHA 1UOCA 4EFHA 4KHUA 4F4KA 1TGOA 5CYQA 2XY8A 3LDNA 4DV0K 1NKEA 1P90A 2ASPA 3OYCA 4C8LA 4BRGA 3IG1A 4JEPA 3WNEA 4ZTJA 1HNXK 3VA0A 3BF1A 4DV7K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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