1MDUB

Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (gs-1)
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of an F-actin trimer disrupted by gelsolin and implications for the mechanism of severing
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
molecule keywords gelsolin precursor
total genus 113
structure length 360
sequence length 369
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1mduB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1mduB04
1GLAG 5KQ8A 4BRCA 1GLBG 1BWFO 3VF6A 1GLDG 4PKGA 4H5VA 1RGIA 2FSJA 3IMXA 3B8AX 5AQLA 4CZGA 3BEXA 2YHYA 5E84A 4E1JA 3CETA 3U9ZA 4FWOA 4CZKA 5AQKA 2QWNA 2F9TA 1X9JA 2E2NA 3ID8A 4GY2B 3GOIA 4JD2A 1Q18A 5BRDA 5JMVA 5JLFA 2VYPA 3F9MA 5BREA 4DCHA 3BF1A 4BQLA 1S3XA 3LDLA 5AQOA 3H1QA 3FFKB 2E88A 3FE1A 2UYTA 3HSCA 4CZIA 2A5XA 4JHDA 2FF6A 3EL2A 4J8FA 2DPNA 1G99A 2YCHA 4JNEA 5FPNA 3VGMA 4DHYA 3UKRB 4H0VB 3SMPA 5EXWA 3O5BA 2HF3A 4ISGA 2A3ZA 3EN9A 2YJEA 3L0QA 3MDQA 4BR2A 2GWJA 1CZAN 4BRMA 1BUPA 3A5OC 4WQ4A 5AQSA 4C23A 3D2FB 1ZC6A 2BUPA 4EIAA 4BGAA 3ZX2A 2Q31A 5F2RA 4BC5A 3MN6A 1BA0A 5AFUH 2YHXA 3CERA 2IVPA 3H3NO 1TUYA 4QS9A 4BR0A 2A41A 2F9WA 1NBWA 2P9LB 4H0YB 3ZEUA 4BVPA 5ELZA 2D1KA 4YDUC 1KAYA 1NGIA 2VCPA 4H5RA 2QWQA 4ISFA 5AZIB 1YUWA 3G25A 2IVOA 3HBTA 3MCPA 3EZWA 2CGLA 1S22A 4BRHA 3HM8A 3O08A 1YAGA 3VEXA 3LDPA 4DQ8A 3SMSA 4AM7A 2I7NA 3GL1A 1ATRA 4BRNA 4BRFA 5AQFA 3DJCA 3LM2A 3QICA 2V7ZA 5KQDA 3EKSA 3WXJA 4CJ7A 4F9OA 1U2VB 1BG3A 5AQVA 4MO5A 2PAVA 4FSVA 1LCUA 5AQXA 4BR4A 3H6EA 1E4FT 4NB4A 3HI0A 2A42A 3WXLA 4B1ZA 4XH4A 5F1XA 2YI1A 4PKHA 3FZFA 1Z05A 3O8MA 4BRKA 4B1UB 1QZ6A 2QWRA 4FWNA 2P9NA 4IO8A 5AQJA 3ENOA 3AAPA 5AR0A 3VENA 4BRQA 3ZEUB 3VESA 3U8XA 2PBDA 1NGBA 3WXIA 3VEZA 1NGDA 5KPZA 3C7NA 1ATSA 2IVNA 1YXQA 2W41A 3EKUA 1HPMA 4A61A 1RDWX 4BRAA 3SLCA 4ISEA 3ATUA 1DGKN 5AQQA 4A62A 1WOQA 2GTDA 3D2FA 3I33A 5AQPA 2QXLA 4BC3A 2GWKA 3DXMB 5EY4A 1GLJO 2GELA 3LDOA 1XC3A 3GBTA 2ITMA 2HF4A 3ZX3A 4CD1A 5AQUA 3R6MA 1ATNA 3VGKA 1MA9B 2A40A 3O80A 5B8HA 1J6ZA 3DXKA 2FSKA 5EVZA 5E26A 4JN4A 4K41A 3LDQA 3M1FA 4FWPA 2QWMA 4GNIA 4B1XB 3R8EA 3AARA 4JD2B 4BGBA 3W0LA 2E8AA 2GUPA 5LJVA 5KPTA 4RCHA 1SZ2A 1NGEA 3QFUA 5AQMA 4B1VA 2D0OA 3DWLA 5EOYA 4CI6A 1X3NA 1IG8A 1XUPO 4BRLA 1V4TA 2QWPA 1NLVA 1HUXA 2CH5A 2HMPA 4EHUA 3W3DA 1Z6RA 2V51B 4BRIA 2CH6A 3IFRA 1NMDA 3WEEB 1BA1A 5AQZA 3UB5A 1D4XA 2V7YA 1BU6O 4MLHA 5BRHA 4IWVA 3CQYA 5AZJA 3VF4A 3D2EB 3GG4A 3M6GA 3SK3A 1QZ5A 4FPBA 4H0TB 2QM1A 2D0PA 2P9LA 1MDUB 4PL7A 2FXUA 2E20A 3IUCA 4PL8A 3WQTA 4H5NA 3GDQA 4CZLA 1GLFO 2EWSA 2H3GX 2YHWA 3O1WA 2ZGYA 4FOIA 2E1YA 3S41A 1MWKA 3TU5A 1MWMA 3UE5A 5BPNA 4H5TA 4BRPA 2FF3B 1HKCA 4H0OA 3FZLA 5F0XA 3VEVA 4BROA 1C0FA 1QQOA 1BO5O 4WYBA 2IIRA 4O8KA 3WT0A 4A2AA 4M63C 3JXUA 4M7YA 3M3ZA 3CI5A 3UKRA 5ADXH 2V52B 3CJ7A 4Y0WA 3EO3A 4CBWA 3LM9A 2W40A 3OHRA 1YVNA 2ASMA 3RSEB 3IDHA 4JHDB 2A6AA 4B1WB 3MN9A 5CE3A 4XEIA 3FLCO 4CZJA 2NLXA 2OANA 1HX1A 2AA4A 3J8AA 3UKUA 3ULEA 1NGHA 1NGJA 4I6MB 1DKGD 3U4LA 4IXCA 1JCFA 2Q0UA 3FGUA 3LDNA 4M7XA 5AQNA 2BTFA 3O1BA 1K8KA 2FSNA 4H03B 4BVOA 3A5MC 1HJOA 2Q2RA 2Q36A 1ZXOA 2KHOA 3ENHA 4YDUA 1HKBA 5BRFA 2P9UB 3GE1A 4XH1A 3DXMA 3CJBA 2CGKA 3TPQA 1E4GT 2P9PB 1QQMA 3L4IA 3JS6A 4FWQA 4FWKA 1T44A 4H0PA 4KBOA 4BQZA 3ATVA 4CBUA 3CIPA 3VPZA 1BOTO 4FWSA 2ZWHA 4FO0A 3ZETB 1HLUA 4B9QA 1JCGA 4CZMA 3WQUA 5AQIA 4BG8A 3CJ9A 4CZEA 4H0XB 5EX5A 1BDGA 3AY9A 4QS8A 2FLOA 1EQYA 3C7NB 3HTVA 3VEOA 5LY3A 5AQYA 3MN5A 4BR9A 5BPMA 1U2VA 3L6QA 3DAWA 3QDKA 4EFHA 5FPEA 2WUSA 1T6CA 2ASPA 1GLEG 2ASOA 1XQSC 3CJCA 4FWRA 3MK6A 1U6ZA 3R9PA 1QQNA 2AP1A 2P9KA 1X3MA 1ZBSA 2E1ZA 2QWOA 1TYQA 2P9SA 2ZF5O 3LL3A 3QBWA 4L3QA 4MO4A 4BR7A 4CD3A 4K25A 1IJJA 4WQ4C 3WXKA 4FOEA 4I6MA 4WQ5A 4FL9A 3KZBA 4NO7A 3SJHA 3CJ1A 4CZHA 4A2BA 2P9SB 1TYQB 5AQGA 3BP8A 3U9DA 5AQWA 4PKIA 5AQTA 3VEWA 3A5NC 3DXKB 2VWBA 4FWLA 4RWTA 3QFPA 1TUUA 3O4WA 1KAZA 3D7EO 1GLLO 2NRHA 4RTFD 3A8YA 4BR5A 4XH5A 3HZ6A 4O5FA 5I9EB 1KAXA 2HOEA 2QWLA 3FZHA 4H5WA 4MLEA 1DEJA 1ESVA 4BRDA 4WQ5C 4BREA 4AM6A 4BC4A 5AQRA 2E2PA 4K43A 1V4SA 1WUAA 4HTLA 4CZFA 3ZETA 5LJWA 1NM1A 3CQXA 3CHWA 1SAZA 5TKYA 5FPDA 3FR0A 2P9NB 3D2EA 3VETA 4IZ9A 4BRGA 5BPLA 1NGCA 3VF2A 1T6DA 3AAQA 4QS7A 3WEEA 1LOTB 2ZGZA 4CBXA 1K8KB 2Q0RA 2P9IB 1JCEA 5BN8A 1QHAA 3MMVA 4FPAA 1SQKA 2GEMA 2Q1NA 3O6WA 2CGJA 2P9UA 3BF3A 4DB3A 3H3OB 4EAHD 3H45C 3VGLA 1C0GA 3FZMA 3ULEB 3H1VX 3UKUB 3WUHA 1NWKA 4LC9B 5FPMA 3CJAA 1R59O 2NZTA 5BR9A 2P9KB 1P8ZA 3C0BA 5AQHA 2P9IA 1GLCG 1Y64A 3P4IA 3VERA 1H1VA 5JICA 1HKGA 3BUZB 4Z94A 3FZKA 5AZIA 5JLHA 4HWIA 4JAXA 5AFUA 2YJFA 1RFQA 3I8BA 3A0IX 3H46O 4FWMA 3RSEA 3ZX0A 3QB0A 2J4RA 4K42A 5KPRA 5ADXA 5BN9A 3QBXA 3KVGA 3MN7A 1KXPA 2QW9A 1NGFA 2E2OA 4IJAA 3VEYA 4BG9A 4BC2A 1NGAA 4IJNA 3KHYA 2I7PA 5AZJB 1OKJA 2E2QA 2Q97A 4EHTA 4B1YB 3QMLA 3VOVA 1NGGA 3A5LC 2D4WA 2P9PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CFOA 4BRCA 4KH6A 4B3MK 3VF6A 1HR0K 4CF8A 3AVFA 4CGJA 2FSJA 3B8AX 3T7ZA 2D0BA 3DOKA 4E1JA 3U9ZA 1LWEA 5BRDA 4L8RB 4H4MA 3GOIA 3K5NA 1YTUA 5JMVA 3HPHA 3NH2A 4MDBA 4CHZA 3BF1A 3O9TA 2X6NA 4CEEA 3H1QA 4HTUA 4LFAK 1WSGA 1KFSA 4CJEA 3QEWA 3C94A 3M5RA 3KK7A 2FBTA 2FF6A 1N36K 2DPNA 1G99A 2YCHA 2OPRA 2FBXA 1VSMA 4DV4K 4H0VB 3SMPA 2HF3A 2Q3SA 3PX6A 3EN9A 3L0QA 2E5LK 4BWMA 1Y97A 4DR2K 2VWJA 3A5OC 4DTPA 3D2FB 1ZC6A 3KKSA 1U49A 1T03A 4FZYA 2A1RA 3OYEA 5CY4A 3DI6A 3MN6A 3V1OA 1BA0A 1LW0A 1GOCA 4JK9A 3ZT1A 1VSHA 4QS9A 3O9UA 3ALYA 4BVPA 5J2QA 3ZEUA 5ELZA 1NGIA 3ZSWA 4H5RA 4ISFA 4O0IA 3TWHA 4UY8O 3G25A 2HBKA 2IVOA 3ZT0A 3MCPA 3EZWA 4CJPA 3HP9A 3I56N 4BRHA 5IT9O 1R0AA 2G8WA 4Q5VA 3LDPA 4DQ8A 3HJFA 4DR5K 3SMSA 1W2BM 1X9SA 3DLGA 3SAFA 3P38A 4BRNA 3DRPA 3QICA 2KKZA 3EKSA 4JYAK 3CCLN 4QAGA 3ZCMA 4CJ7A 1U2VB 4B9MA 4ILGB 4FJLA 5DM6L 3OYNA 1E4FT 2VGNA 4NB4A 4FVMA 5CHIA 4PKHA 4OLAA 3FZFA 1HMVA 4KTQA 1QZ6A 2QWRA 4BACA 4YOUA 3ZSZA 4IO8A 5AQJA 1LWFA 5AR0A 3V1RA 3VENA 4BRQA 4YOYA 1NK8A 3U8XA 1NGBA 3OYMA 4JKCA 3C7NA 4DQSA 4DSJA 1ZBFA 2IVNA 2W41A 2YKNA 1S1WA 2KLAA 3ATUA 3JAMO 3L3VA 3VQ5A 3OY9A 3I33A 2PYLA 4CJ4A 2ITMA 2GELA 2HF4A 3ZX3A 4K8ZA 5AQUA 3OYKA 1T8EA 3SV3A 3CFPA 1TL3A 5B8HA 1YJWN 3TANA 3DXKA 4I9QA 4DSLA 1Q81O 4CGFA 3CYMA 4JN4A 4KV8A 1OH8A 1HYVA 4B1XB 3AARA 4CK3A 1JKHA 1RT2A 4BGBA 2GUPA 3C95A 3QFUA 3CC7N 5AQMA 2D0OA 4BRLA 1V4TA 1VSIA 3U3YA 1HUXA 2GV9A 5HRPA 1NJZA 2CH6A 3IFRA 1BA1A 3J7AP 1VRUA 1S72N 2NNWA 2WOMA 1S1XA 4IWVA 3O3GA 3GG4A 1T7PA 4C1NI 5GINA 4FLYA 3G0ZA 4B3TK 1IO2A 4PL8A 4CJTA 4CF1A 4I2PA 1GLFO 3EY1A 3KD1E 3SJJA 4E1MA 3ZSOA 3RWUA 3VQPA 2IS3A 1MWMA 3UE5A 3THXB 2FF3B 4I2QA 1S9EA 2HNDA 4V19S 3L3UA 1SV5A 1REVA 3VEVA 4FK4A 4CJ5A 1QQOA 3J7ZO 2IIRA 2PZSA 4A2AA 4M7YA 3UKRA 5ADXH 3EZ5A 2O8BA 4CBWA 1N5YA 3AGKA 4JHDB 1D5AA 3KLGA 4Y1CA 4B1WB 4E7IA 5CE3A 4BE1A 4YOTA 4A5BA 4CJ3A 2C1IA 2QTDA 3J8AA 3UKUA 3Q7BA 1HNVA 1NGJA 4I6MB 1JCFA 1X1PA 4M7XA 1ZBHA 1JLBA 2BTFA 2HVIA 4DFKA 3N4QA 2YNGA 4CJRA 5J2MA 1C0MA 3SQ2A 4GV3A 3IG1A 5KI6A 2G8UA 1HJOA 4A5AA 3ZSVA 1ZXOA 1BQMA 4W5RA 2XY6A 3CC4N 3Q7CA 3IAYA 3DXMA 3LP1A 4K0KK 1E4GT 2BDPA 4B08A 3THYB 4LY7A 4FLUA 4HCCA 3L4IA 3JS6A 1TK8A 5SWMA 1Q8IA 3PLAA 2HBJA 1EETA 4JK7A 1BOTO 4BDYA 3C65A 3G71N 1HLUA 3TAGA 4KRFA 4B9VA 4B9QA 3DOLA 4LSNA 4CZMA 5AQIA 2EHGA 4IEIA 4IDHA 4Z4GA 1LWCA 4JI7K 3C7NB 5BR8K 4M3WA 4ZTJA 4BR9A 3AO3A 2HNZA 1ASWA 2NRRA 4C8NA 3TTFA 4N76A 1IKXA 2ASOA 1FKPA 3MK6A 3R9PA 2AP1A 2P9KA 1LW2A 3CCEN 4MO4A 1TAUA 4X64K 4WQ4C 1YVUA 4FOEA 3OYGA 4RG8A 4FL9A 4X66K 1C6VA 4CZHA 5K14A 3LZJA 1HNZK 3BZKA 1IG9A 4CIEA 4W5TA 3HVRA 3SUOA 4LF8K 4M3ZA 2ZJRL 4AHVA 1KAZA 1QTMA 1A5XA 3QETA 3QESA 2WC9A 2XY8A 4OKEA 3OYLA 5M1KA 4DTSA 2QK9A 4BR5A 4XH5A 1RILA 2HOEA 3O9QA 2F7TA 2GBZA 3KWIA 4W5QA 4MLEA 4QOZB 4BREA 4BE2A 1QVGM 4BC4A 5CZ2A 3O3FA 1NJIO 4LH4A 3NHGA 4AF1A 4CZFA 4DG1A 4K8XA 1NOZA 3SAHA 4Y1DA 3FR0A 1VQON 3LP2A 3D2EA 3KLIA 3VETA 3VQEA 1N8RO 5HRRA 3V6DA 3VF2A 4DR3K 1WBDA 1K8KB 2Q0RA 4CIFA 1JCEA 3DLKA 1QHAA 1NK4A 4WE1A 4FPAA 4F3OA 4CJSA 5LMNK 3RMBA 4DS5A 1O1WA 3ULEB 3F2KA 1JXBA 1Z25A 1OH5A 1L5UA 2IDOA 1BI4A 3HO1A 3NVMA 1P8ZA 1XHZA 3C0BA 3AO4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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