4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
b'DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
1Q81O 1K73O 3J7ZO 5DM6L 5HL7L 2ZJRL 5GADP 1VQ4N 1ILYA 1KC8O 1YJ9N 2ZJPL 3CMAN 4WF9L 2OTJN 3CC2N 5MLCQ 2OTLN 5GAEP 3CC4N 5JVHL 1Q86O 3CCEN 1VQ6N 1NJIO 3CCSN 5GAHP 4IOAL 1YJNN 1Q7YO 4WFNL 1QVGM 1VQKN 3PIOL 1VQ5N 1M90O 1JJ2M 1S72N 2ZJQL 4UY8O 3G6EN 4U67L 1N8RO 1YITN 3G4SN 5H1SQ 3CPWM 4IO9L 5JVGL 3CCQN 1K8AO 1VQMN 3CCMN 3CCJN 4IOCL 2QA4N 4WCEL 1W2BM 1KQSM 3PIPL 3I56N 3G71N 3CC7N 5GAGP 1VQ7N 1VQNN 1K9MO 3CCRN 4WFBL 3I55N 3CD6N 1VQON 3CCLN 3CXCM 1VQ9N 1VQLN 3CCVN 1M1KO 1VQPN 1YIJN 1YJWN 1YI2N 1Q82O 1YHQN 3CMEN 3DLLL 5DM7L 3CCUN 2QEXN 1VQ8N 1QVFM 4WFAL 1OVYA 3OW2M 1KD1O 3CF5L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK9A 3J7AP 3P5JA 3NHGA 2H3GX 1ASVA 5AQWA 1D8YA 4CJ3A 1SV5A 5C15A 3CMAN 2E5LK 4FWQA 1HNIA 5LMUK 1S1XA 3OYMA 4JD2B 1NMNA 1DLOA 4HTLA 2DFFA 4CJ5A 3NDKA 4EHTA 4X62K 3VGMA 3SQ2A 4LF7K 4DTNA 3O9TA 2QTDA 2O8CB 1WB9A 3CETA 3MXJA 4QAGA 3ZSVA 1BIZA 4DFJA 5HBMA 4X65K 1Z05A 4H0YB 5AQYA 3ENBA 2ASPA 5FPEA 1LW0A 3H46O 3E66A 4FLUA 3OTOK 2XY8A 1N33K 3G6EN 3A5MC 1TAUA 4F3OA 4Z4HA 4JI7K 3KWIA 1MWKA 3THXA 4O0JA 2OCEA 5EY4A 3THVA 2FBTA 4FJLA 4JHDB 1SL2A 5HLFA 4LFCK 5AZJA 4L8RB 4FOEA 1TL3A 4B3RK 3QIOA 4A5AA 4Z4EA 2P51A 3ZSOA 4WFBL 5ADXA 1QTMA 2QKKA 4PL7A 4R5PA 3OYDA 3TPQA 4CCHA 4H5VA 3PSIA 4JI5K 1BA1A 2G8UA 1NOZA 3B6OA 4PKGA 3AV9A 2CGLA 2ASOA 3J7ZO 3A2FA 2HNZA 5M1KA 2A41A 2YHWA 4IWVA 3VF2A 4LSLA 3CC2N 3J8AA 4A5BA 3DYAA 3SAGA 3CPEA 3VQ8A 2VG6A 3HSTB 1S1UA 3LWMA 1TK8A 1HNVA 4JLHA 3LDNA 1T6DA 3MN7A 3R6MA 3L2UA 2XHBA 5AZIA 4DV2K 4YOXA 3HOSA 4QS8A 2OZSA 1ZBSA 4NLBA 3DXKB 4IG0A 4BWJA 1XNQK 1NM1A 3LM9A 4RW4A 4DG1A 3VEWA 3KHYA 3K0SA 3THXB 3LDSA 2YX6A 3H3NO 3E1YA 1EWQA 1WSIA 3P39A 2QWQA 3AVJA 2JWLA 2KHOA 4CE9A 2EX3A 2QM1A 1BIUA 4NXMK 3MX5A 1RBSA 5AZJB 2BGGA 3TTDA 3ZX2A 4PL8A 3ISNC 4CVNE 4M3WA 1DT9A 3MEEA 4AM7A 3SMPA 4JI4K 2KZZA 4CIGA 3NH2A 1YT3A 4GV6A 2F96A 4HTUA 2FXUA 2Q0UA 3KVGA 4Z0UA 3OS1A 4KHQA 4CD1A 2GWJA 3DRRA 1HNXK 1OKJA 1HPZA 1NK6A 4KHPK 4IOXA 3AVBA 4WE1A 4WCEL 4FWRA 3KD1E 3TSUA 4FWKA 3TAEA 3TAPA 1NLVA 1CLQA 1IH7A 3RTVA 3VESA 3GL1A 3I8DA 1IKXA 5DK5A 5ELZA 1EO1A 5AR0A 1VQON 3SUPA 4ID5A 5M1FA 1REVA 5BRHA 4DSEA 2G8KA 4HVJA 3K59A 2LSNA 4NO7A 5KPRA 4BC4A 1Z26A 4HCCA 3VQQA 1BCMA 4O44A 3C95A 4CGHA 3ZT4A 3SK3A 3RMBA 2G8VA 5AZIB 2E2OA 3NBPA 4OJRA 1VRTA 4DF8A 3MMVA 5FPMA 2V7YA 5CYMA 4BR7A 1NK0A 3KK2A 1NGBA 2PYLA 1IG9A 4GW6A 2X74A 3G0ZA 3LM2A 3H6EA 4TSXA 4JYAK 4RW6A 2D1KA 1YJ9N 5C10A 3TSQA 1TAQA 3U3YA 1QSLA 3DRSA 1ZC6A 3FFKB 3MN6A 4CJSA 5JVHL 2IOCA 3LAMA 3CCEN 3CJAA 1A5XA 1NJIO 4RW7A 4B3SK 5C24A 1YVUA 4C1NK 4K25A 4E7LA 1TKTA 4GMJB 2OYQA 4KI4A 1KLNA 4DUZK 1NWKA 4IXCA 5AQGA 2E6MA 4NCGA 3AAPA 1LCUA 2A1RA 4H4MA 4MDAA 3GBTA 4W5QA 1ZBLA 1D5AA 3O4NA 3OYKA 5LL6Z 3SPYA 4JKBA 3HYFA 4OGEA 1LAWA 5GIOA 4J2DA 2NRZA 2KFNA 2P5OA 2X78A 3KK3A 4DQQA 3HO1A 4FVUA 5KRTA 4DWIA 3OYCA 3V9ZA 2QWMA 4DUYK 4YOYA 4ISEA 3Q7CA 2GWKA 4JEPA 3QETA 4FJ9A 2BE2A 4JK8A 4I7FA 3M5RA 4CEEA 3HK2A 3O3FA 1GOBA 1OVQA 1W2BM 3DXMA 3ZT3A 5JLHA 3IRXA 1W7AA 4DSIA 4E7IA 4OVLA 4M3ZA 4FL9A 4JI0K 3DRPA 3S9HA 4B1XB 3VTHA 3OY9A 1VQLN 4CHOA 4FWMA 5AQXA 4BWMA 1YJWN 4DV4K 4AHRA 3SBGA 4B08A 2PBDA 4FW1A 4BROA 1NJXA 3L2WA 3MCPA 3SQ1A 3L2QA 4YOVA 5AQTA 1VSKA 4OGCA 3L4QA 1K73O 4CFDA 5EXWA 1YF5L 4LD0A 2A5XA 3VEVA 3E9OA 3BZCA 5F2RA 2HHHK 3QERA 4CEOA 4FPBA 4G1QA 4CZIA 1VHXA 4CZGA 4CHNA 3AVIA 3QIPA 2X6SA 2HW3A 4H5TA 3VEYA 2ZWHA 1L3UA 1FW6A 2BDPA 2GELA 1Q18A 3D45A 1VQ6N 3VQPA 4X66K 4OLAA 2Q3SA 1QVGM 1S6PA 4NXNK 4H5NA 3PIOL 4OKEA 2OPRA 4CFBA 1FJGK 2HMPA 3VA0A 5KPZA 4YOWA 4FLTA 1WAFA 3DXMB 5KQDA 2FSKA 4A59A 2GBZA 4DTPA 5AQMA 2QXLA 4IJNA 2RE2A 4U67L 1BGXT 2FC0A 4CEQA 4B9NA 4YOTA 3T7ZA 2OPSA 1C1BA 4BVPA 3CCQN 1ZYQA 2QWOA 3OHRA 2P1JA 3UB5A 3I33A 1L3VA 1KFDA 3FZKA 4U7BA 2ZM6K 2HMIA 3C65A 4BRFA 1HYSA 2JWKA 1CXQA 4DR3K 2HNDA 1VQ7N 4CZJA 1QQCA 1RT2A 3V9UA 4H0PA 4WQ5C 1XQSC 4FZXC 3CCLN 1YIJN 2BTFA 1RTIA 3QEPA 4Z94A 3K5NA 4DTJA 4R79A 1X3MA 3I0RA 1CXUA 1OVYA 1BOTO 2UXCK 1S1TA 4I6MA 1S9GA 3QBXA 4NYNA 4KV8A 3EL2A 3VGKA 1SKSA 3V1QA 4CJQA 3BUZB 2NLXA 3TAQA 3QMLA 1NGGA 3CJBA 3OVNA 4OPJA 3D6RA 4PQUA 3QB0A 3T1AA 3AVFA 4EZ6A 3MDQA 4RW9A 1XNRK 1TKXA 3ALYA 3E01A 4KTQA 3AAQA 1VK0A 2RHKA 3QEVA 4BRCA 1NGAA 4PY5A 3O80A 4DS5A 3DOLA 4KB0A 1XUPO 4I2PA 1YJNN 4OLBA 4BR5A 3THYA 4O8KA 3NAEA 3PLAA 4FWOA 1GLDG 4JKDA 3M6GA 4GVEA 2PYJA 1EKEA 1TYQA 3QINA 3KK7A 1JJ2M 3U8XA 3L2VA 1D4XA 4OKJA 3AO5A 4AH9A 3NF7A 3PUFA 4A2AA 1BA0A 5D3GA 2UU9K 4H5RA 1HLUA 4BRKA 2VG7A 3LP0A 4KTWA 3MEGA 5H1SQ 3PX0A 4J2AA 1ZBHA 3MXIA 1EETA 5HRSA 4EIAA 3JXUA 5C12A 1HX1A 1A5WA 4FO0A 1IV0A 3C0BA 5C2FA 4I6MB 1RDDA 3CYMA 5AQPA 1LWFA 4CJLA 3G71N 1N6QA 4K41A 5CY4A 3CCRN 3WXLA 5BR9A 4IDKA 2VWBA 3SUNA 1M1KO 2HSTA 4QS9A 4BR0A 3LP3A 4FJ8A 2RF2A 5CR4A 4KTZA 3OYHA 4BQLA 3LAKA 4IG3A 3WQTA 1I39A 4Z4FA 1T03A 4FLWA 4DTRA 3H08A 4QS7A 2Q36A 1D9DA 3SZ2A 3A8YA 3OYBA 4B3OA 3RRHA 4FOIA 2UXDK 4FW2A 2VYPA 1VSFA 5KPTA 2G8WA 1R0AA 4JV5K 4FJ5A 4DV0K 4HWIA 4AHTA 3B8AX 1IO2A 4B9QA 1TYQB 2PZSA 1H1VA 1RNHA 1XC3A 2HF3A 3HT3A 3P1GA 2B6AA 1JCEA 4Q0BA 4CZMA 1DEJA 3L0QA 5HP1A 4B3MK 3ULDA 2EHGA 4KFBA 1VSDA 4LSNA 2XO7A 2E2QA 5GAHP 3QNOA 1TUYA 1T7PA 4NYFA 4IOAL 1B9FA 5AQVA 1IG8A 1U45A 2A40A 1BQNA 5HRPA 3QDKA 3HM9A 2A1SA 4DFMA 4DTXA 4KH4A 1NGIA 1MA9B 4C8MA 4DTOA 4AHUA 3KIOA 1ZBFA 2I7PA 2OPPA 4BRDA 3DLRA 4DV3K 1S72N 4CF0A 3GDQA 5LJVA 4KHSA 1S1VA 4I9QA 1HYVA 2A42A 3O3HA 5GIPA 4M7YA 3RMCA 2HBKA 5E84A 4E1NA 4LF9K 3NMUA 1LWCA 3CPWM 4XH1A 4OX9K 1UOCA 2D0PA 5AQSA 1XC9A 3VEOA 1WSEA 4FM2A 3R3LA 3PIPL 4GY2B 2YV0X 4DTSA 3KD5E 5A2QO 1EWRA 4BRGA 1HKBA 4B1YB 1ESVA 4CJUA 2FSNA 3CD6N 3WEEA 2RKIA 1VQ9N 1U47A 1QQOA 1TKZA 4CIEA 1MDUB 3O1BA 1G99A 5BR8K 4F8RA 4FLXA 3ITHA 4GVMA 4FJXA 4WFAL 3UKRA 1P8ZA 3NVKA 5C0YA 1WSJA 1O13A 1E4FT 4ZTFA 1RFQA 1NK5A 4KRFA 4FVMA 2GTDA 1OH7A 1Q81O 4W5OA 1U4BA 1RDWX 2FBYA 4H0OA 3AGRA 1U48A 1J6ZA 3CM5A 4CK1A 2RPIA 3ZCMA 3WXJA 3LP1A 5FROA 3VF4A 1VSMA 1Q9YA 4CZFA 3RRGA 5CYQA 4WQ4A 3SMSA 2A6AA 2WFBA 4CD3A 4MLHA 4CF9A 4PWDA 2KTQA 2P9IA 3LDPA 4CF8A 4F3TA 4FXDA 3LPUA 3GE1A 4E19A 1HKCA 1BU6O 4B9VA 4WYBA 1HJRA 3FZHA 3L6QA 2W6LA 3KJVA 1QE1A 3NH1A 3F2KA 2YCHA 2YHYA 2YNIA 4C8NA 1M90O 4M42A 2O4IA 3H45C 4M7XA 4H8KA 1QSYA 4FPAA 2WC9A 2HVHA 2YNFA 2X6NA 3EE8A 3SUOA 3WEEB 3O3GA 2OANA 1N8RO 4CECA 1X9SA 3L3VA 2VCPA 4LFBK 1BUPA 4N5SA 3VGLA 1IJJA 4H0VB 5AFUH 4IO9L 1RDAA 4XIUA 2VGMA 3UKRB 3V1OA 3DI6A 3NVMA 4E1MA 4CBXA 4BRNA 3DLGA 4AQYK 1WLJA 3AVNA 1GLCG 4KO0A 3BDPA 3CQXA 4E0DA 1BO5O 4KHWA 1S3XA 4DR1K 4E7KA 3WXKA 3VQ5A 3RMAA 1S1WA 2W6KA 4YOUA 1TGOA 1HR0K 5FDLA 3CMEN 1RCHA 1HQUA 4RCHA 4CJVA 4IFEA 2VQFK 5FLXO 4KH6A 2P5GA 3W0LA 1WBDA 1IBLK 1U6ZA 3L8BA 3TABA 4BR9A 4DSKA 3ATUA 1C6VA 2E8AA 3O9UA 4IKFA 4MO5A 3VF6A 1B9DA 4AHCA 1VSJA 1LV5A 3AA4A 2IC3A 2P9IB 3S41A 2ZJRL 5C2DA 4XEIA 4B9MA 1FKPA 2ATQA 3F9KA 1CZ9A 3IS9A 3ZT0A 3SNNA 2Q2RA 1HQEA 4JN4A 3P31A 1N5YA 4Z4CA 2D0CA 4O5BA 3W3DA 4IBNA 2R7YA 4OO1J 4FWPA 3WNHA 4J8FA 4IFVA 4CZKA 3R1XA 3C6UA 4X64K 3VQ4A 2E1ZA 5IT9O 1QQNA 3PSFA 4CJFA 1XI1A 4JKCA 1HYZA 3H3OB 4CBWA 3ASMA 4WQ4C 1J5OA 3KLHA 4EP5A 3CHWA 3S3MA 3DLHA 1U2VA 4CFCA 1T05A 1KVBA 3ZT1A 2I5JA 1NBWA 3V9XA 3QEWA 4DQIA 5TKWA 2HBLA 4DS4A 3RR8A 2A3ZA 4JNEA 2IVOA 2FBXA 3S3OA 3K5MA 4F2RA 3P83D 3SQ0A 3SPZA 3ENHA 4JI8K 2VGNA 1GLJO 3T19A 4CK3A 3K57A 1C0GA 3VERA 4CJWA 2NRWA 3FR0A 4CJRA 3KLFA 3A0IX 4F2SA 2G8IA 2WUSA 1B92A 2P9LA 3O1WA 2UUAK 1IBKK 4O55A 1HJOA 3KLEA 4BRHA 5I3UA 1ZBUA 4DSFA 2PY5A 3O4WA 2Q0RA 3MECA 1L5UA 3MN9A 2P9UA 2QEXN 4WQ5A 1C1AA 3ZETA 4DV7K 3V9SA 3TWHA 1VRUA 4BGBA 3DMJA 3D7EO 1KAYA 3R8EA 1NGEA 5DM6L 4B8AB 3U9ZA 4M3XA 3UIQA 2V52B 5M1NA 3CJCA 3CFPA 3HXMA 4HHTA 3ULEA 4QOZB 4PKHA 1K6YA 4XH5A 1NKBA 3CJ7A 4Z4GA 2XY6A 1NG9A 2F8TA 3DWLA 3VENA 3WXMB 2D0AA 4FJNA 4BC2A 3G10A 1JCFA 5M1PA 2YJFA 3TAGA 4O8UA 1N34K 5AQKA 2WBNA 1IBMK 1OH5A 5EU7A 2HHUA 1V4SA 4BRQA 5J2NA 4RG8A 3WQUA 3PX6A 3VN5A 3VETA 3D2FA 4CJ4A 3ZX0A 1HRHA 5BREA 4B9TA 4DV5K 4DR5K 2P9LB 4EAHD 2NRRA 1SUQA 4H4OA 3SQ4A 3AVHA 3DOKA 2AJQA 3QLHA 1YITN 3ENOA 4Z4IA 2P9KA 2DFHA 3TI0A 2NUBA 1VQMN 3CCMN 2CGJA 4KHUA 4C8KA 3ZETB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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 1Q81 O;  1K73 O;  3J7Z O;  5DM6 L;  5HL7 L;  2ZJR L;  5GAD P;  1VQ4 N;  1ILY A;  1KC8 O;  1YJ9 N;  2ZJP L;  3CMA N;  4WF9 L;  2OTJ N;  3CC2 N;  5MLC Q;  2OTL N;  5GAE P;  3CC4 N;  5JVH L;  1Q86 O;  3CCE N;  1VQ6 N;  1NJI O;  3CCS N;  5GAH P;  4IOA L;  1YJN N;  1Q7Y O;  4WFN L;  1QVG M;  1VQK N;  3PIO L;  1VQ5 N;  1M90 O;  1JJ2 M;  1S72 N;  2ZJQ L;  4UY8 O;  3G6E N;  4U67 L;  1N8R O;  1YIT N;  3G4S N;  5H1S Q;  3CPW M;  4IO9 L;  5JVG L;  3CCQ N;  1K8A O;  1VQM N;  3CCM N;  3CCJ N;  4IOC L;  2QA4 N;  4WCE L;  1W2B M;  1KQS M;  3PIP L;  3I56 N;  3G71 N;  3CC7 N;  5GAG P;  1VQ7 N;  1VQN N;  1K9M O;  3CCR N;  4WFB L;  3I55 N;  3CD6 N;  1VQO N;  3CCL N;  3CXC M;  1VQ9 N;  1VQL N;  3CCV N;  1M1K O;  1VQP N;  1YIJ N;  1YJW N;  1YI2 N;  1Q82 O;  1YHQ N;  3CME N;  3DLL L;  5DM7 L;  3CCU N;  2QEX N;  1VQ8 N;  1QVF M;  4WFA L;  1OVY A;  3OW2 M;  1KD1 O;  3CF5 L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NK9 A;  3J7A P;  3P5J A;  3NHG A;  2H3G X;  1ASV A;  5AQW A;  1D8Y A;  4CJ3 A;  1SV5 A;  5C15 A;  3CMA N;  2E5L K;  4FWQ A;  1HNI A;  5LMU K;  1S1X A;  3OYM A;  4JD2 B;  1NMN A;  1DLO A;  4HTL A;  2DFF A;  4CJ5 A;  3NDK A;  4EHT A;  4X62 K;  3VGM A;  3SQ2 A;  4LF7 K;  4DTN A;  3O9T A;  2QTD A;  2O8C B;  1WB9 A;  3CET A;  3MXJ A;  4QAG A;  3ZSV A;  1BIZ A;  4DFJ A;  5HBM A;  4X65 K;  1Z05 A;  4H0Y B;  5AQY A;  3ENB A;  2ASP A;  5FPE A;  1LW0 A;  3H46 O;  3E66 A;  4FLU A;  3OTO K;  2XY8 A;  1N33 K;  3G6E N;  3A5M C;  1TAU A;  4F3O A;  4Z4H A;  4JI7 K;  3KWI A;  1MWK A;  3THX A;  4O0J A;  2OCE A;  5EY4 A;  3THV A;  2FBT A;  4FJL A;  4JHD B;  1SL2 A;  5HLF A;  4LFC K;  5AZJ A;  4L8R B;  4FOE A;  1TL3 A;  4B3R K;  3QIO A;  4A5A A;  4Z4E A;  2P51 A;  3ZSO A;  4WFB L;  5ADX A;  1QTM A;  2QKK A;  4PL7 A;  4R5P A;  3OYD A;  3TPQ A;  4CCH A;  4H5V A;  3PSI A;  4JI5 K;  1BA1 A;  2G8U A;  1NOZ A;  3B6O A;  4PKG A;  3AV9 A;  2CGL A;  2ASO A;  3J7Z O;  3A2F A;  2HNZ A;  5M1K A;  2A41 A;  2YHW A;  4IWV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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