4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
4UY8O 3CF5L 1KQSM 1KD1O 5GAHP 3CD6N 1W2BM 1VQ6N 3J7ZO 3CCVN 4WFBL 3CXCM 1YJWN 1VQON 1YITN 5JVHL 5JVGL 3CMEN 5GADP 1YIJN 5H1SQ 1YJNN 5MLCQ 4WFAL 3PIPL 1VQ8N 3CCEN 1YI2N 1VQ4N 1QVGM 1Q82O 5DM7L 1K9MO 1VQPN 2OTJN 1VQMN 3G6EN 3CMAN 2ZJRL 1YJ9N 3CCQN 5GAGP 1M90O 1VQ5N 3I56N 3G4SN 3CC4N 3PIOL 4WFNL 3CC7N 2QA4N 1Q86O 3OW2M 5GAEP 4WF9L 1K8AO 1VQ7N 3CCUN 3CC2N 1JJ2M 4IO9L 4WCEL 2ZJQL 1Q81O 1VQNN 2QEXN 2ZJPL 4U67L 1S72N 1QVFM 3CCSN 3CCJN 1OVYA 5HL7L 3CPWM 1ILYA 1M1KO 3I55N 2OTLN 4IOCL 3CCLN 4IOAL 3CCMN 3DLLL 3CCRN 1Q7YO 1VQ9N 1VQKN 3G71N 1K73O 1KC8O 1N8RO 1VQLN 5DM6L 1YHQN 1NJIO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QAGA 4RTFD 3HJFA 4DTJA 5KQDA 5GAHP 1RGIA 4BRAA 1JLQA 3D2EB 1IBMK 2E20A 3J7ZO 1QSLA 4FL9A 4YY3K 4F4KA 4F2RA 3SUOA 5ELZA 1IG8A 4EFHA 4IFVA 2P9LB 4K43A 1UWBA 4WYBA 3VPZA 1VSFA 4CZGA 3G25A 2O8FA 2DY4A 3CJAA 2JWLA 3THWA 3MN5A 3O9SA 5BR9A 1RBTA 4DQIA 3IDHA 4BRFA 3AVAA 2FSNA 3JAMO 3TPQA 3MXMA 3H6EA 4N5SA 3A2FA 4FJ8A 3L0QA 1EKEA 2ASMA 4O0IA 3ZT1A 5AQGA 3OHRA 3C7NB 3AA2A 3DWLA 4JI3K 1JLEA 1O13A 3RWUA 4PA1A 4F3OA 3G4SN 4HUFA 4YORA 1LV5A 1HJRA 4BRGA 2IVNA 2ASOA 1S3XA 3IMXA 4X66K 4FJLA 2Q0RA 1IKYA 4FJ5A 4FZYA 4BWJA 4HWIA 3CC2N 1VSJA 3M8QA 4F8RA 3BUZB 4ELVA 1S1WA 4B9UA 2F8TA 3K5OA 4KHSA 3QEVA 1XMOK 1VQNN 2NLXA 3M3ZA 2GUPA 1VSDA 3F73A 3P5JA 4QS8A 4M3XA 1KFDA 4FK0A 1ILYA 3VQCA 5LMUK 1BO5O 3BP8A 4IO8A 1U04A 2BH1A 2HHTA 1DGKN 4MLHA 5CYQA 5SWMA 3M1FA 4OGCA 2RHKA 3AGRA 4M3ZA 3OYHA 3G71N 1KC8O 4AM7A 4CHNA 5AFUH 3VA0A 4YOWA 1WNSA 3NBPA 1L3SA 4FJKA 3TTDA 5K14A 4C8OA 2HHQA 4ILGB 1FKOA 2VYPA 3UKUA 1YVUA 2HF3A 3AGKA 4H5WA 3UKRA 3L2WA 1C0MA 4EAHD 1TK0A 4DHYA 3GBTA 3F9MA 3VQ9A 3FZMA 3AVFA 3O9TA 3V1OA 4ILHA 5AQSA 5C42A 4JEPA 1G15A 4JNEA 4M3UA 4WFAL 4DV0K 4RCHA 1YI2N 2HF4A 2LSNA 3CQ8A 4W5RA 1RDAA 1N32K 5DM7L 3AVKA 3MCAB 5A2QO 4FK2A 1B9DA 3JXUA 3T1AA 5KRSA 4CEBA 2HBKA 4E7JA 2G8KA 2HNDA 4H5TA 5EVZA 3WQUA 5C0YA 4YHHK 2KZZA 2O8CA 3NVKA 3FFIA 5AQVA 1TAQA 4EHTA 1RNHA 3NF6A 2XY5A 3UB5A 3VGKA 1Y97A 4A57A 4FVUA 2VWJA 1BA1A 5CHIA 1VQ5N 2O8DB 1EWRA 3Q7CA 4GNIA 3TABA 3N4QA 3CC7N 3SV4A 3WNHA 3RVCA 5ADXH 1HNVA 3CJBA 4CZLA 3KD1E 4J2DA 1RBUA 4FM1A 1IG9A 4BY9C 2D0CA 1E3MA 2EHGA 3HVTA 4CK3A 4NYNA 5AQQA 3D2FB 4CZEA 3ZX3A 4R79A 5KGXA 5CZ1A 3HBTA 3J80O 1KVCA 1FKPA 1NK6A 4Z4FA 1WSJA 3P38A 4LF7K 4V19S 1ASWA 3SUPA 4GV6A 3W0LA 2YHWA 1OH8A 1TK8A 2I7NA 4RW4A 3L8BA 3AV9A 1NGFA 4A5BA 4KREA 4O0JA 4AF1A 3DLHA 1XC9A 4L8RB 2P1JA 4EP4A 3CCMN 3CCRN 4KB1A 3O3GA 4H0VB 2P51A 3QLHA 4O55A 3AO3A 3LWLA 5DM6L 1KVAA 2ITMA 1RTHA 3C6TA 1QSSA 4PWDA 3WNFA 4ID1A 3MEGA 3QEPA 3RMAA 4NXNK 2OCEA 4EZ9A 3QMLA 4AQYK 3F9KA 1B92A 2FSKA 3CM6A 4N76A 4DFKA 4JI1K 2E4LA 4AHSA 3D0PA 4A2BA 3GOIA 1CZBA 5H1SQ 4B9SA 3DAWA 4JKDA 3J81O 4DF4A 5FRMA 4C8KA 2F96A 1IV0A 4FLWA 2D5RA 2HHVA 2O8FB 1ASVA 3VOVA 3THWB 4LH5A 3LZJA 2OTJN 2QW9A 3AO5A 1FXXA 2P9KA 3VMFB 4A2AA 1J9AA 4KTQA 4K8ZA 1UA1A 1ESVA 2VG7A 2XRIA 3A5LC 5I42A 5BRFA 3ZSVA 2G8WA 3KJVA 4KHUA 1NK4A 3O4WA 4MLEA 3O3HA 3K5NA 4IKFA 3HP6A 3GE1A 2DFFA 3THXA 4FYDA 1NK0A 2IOCA 5FDLA 4FOIA 5HROA 3UE5A 2FF3B 1QQOA 2ETJA 2QWOA 1QZ5A 3WXJA 3VGLA 2DFHA 1LAVA 1TAUA 1LCUA 3A5MC 1VQ7N 4PKGA 4CJQA 4HCBA 1NJZA 1EX4A 3C0BA 4O8KA 5SZTA 1JJ2M 4IO9L 3DXKA 3QBWA 1ZBUA 3SJHA 3QNNA 4BWMA 1SS6A 1QSYA 4PL8A 4L3QA 2RE2A 2Y1IA 4U67L 4NB4A 1ZBLA 2P5OA 5KTQA 4ISGA 1HQUA 4C23A 3SBGA 3I55N 3ZT3A 1GLAG 4BRPA 2KHOA 3VQ6A 5J2PA 2QXLA 3ZT4A 4H8KA 3K5LA 1Q18A 4FJIA 2GWJA 4DQ8A 1YVNA 4J8FA 4DR7K 3UKUB 3UKRB 2Q0UA 3M8RA 3V9ZA 4H0TB 4OPKA 4DV2K 5HLFA 1YITN 3SJJA 2QWMA 4MO5A 5AQXA 2XY7A 2HNZA 1RT6A 3S3NA 4B9VA 3LAMA 1JLBA 5KPZA 4FJHA 1BI4A 3MEDA 3FZKA 2WFBA 3VF6A 4B1WB 3QETA 3TAGA 5B8HA 3KLFA 2OPQA 5KPRA 4DB3A 3MCPA 3A5OC 4CVNE 4BVPA 2QKBA 2O8CB 4BRQA 5AQOA 1YJ9N 3QEIA 4QCLA 1CXUA 4E1JA 4FWSA 4YOXA 4OGEA 1XHXA 3EZWA 4RWTA 3T19A 1XI1A 3IFRA 1NG9A 3KWGA 3C95A 3L3UA 4YOYA 4GY2B 1BWFO 3NGIA 4CEZA 1YTAA 2G8VA 3KIOA 4B3TK 4KFBA 3DRRA 1HUXA 3HP9A 4C8MA 1MDUB 2YJFA 2JGUA 4KTWA 2KTQA 5M1KA 4JV5K 2CGJA 4K8XA 4LF8K 1IO2A 1IKVA 1WLJA 2BANA 3KK7A 1NGGA 4LC9B 4DSJA 3CM5A 4NLCA 1A5XA 4H0OA 1RDBA 2A1SA 2NRRA 4F9OA 2YNHA 3LL3A 1S5JA 2DFEA 3EO3A 1ZBFA 3H45C 3E66A 3ZEUA 4A5AA 4AHVA 4LD0A 4FW2A 1M1KO 1JCFA 1RBSA 4YFUA 4M3TA 2HVHA 4FWLA 5KRTA 1VQLN 1QHAA 1OH7A 2BGGA 3DOKA 4DLGA 1I3AA 3QERA 1JL1A 4FWKA 4B8CA 4DS5A 4JI8K 3PX6A 1EO1A 3SK3A 3HSTB 3IG1A 1BISA 5JVHL 3I8DA 1A5VA 3OY9A 2BE2A 1S1VA 1WSGA 3KK2A 4YOTA 3AVNA 3BDPA 1C0TA 3ZSXA 4OLBA 4M7YA 1XNRK 4DQPA 3ID6A 5BN9A 3U9DA 3VQEA 4LF5K 3CPEA 3NGYA 4DUZK 2P9KB 2YHBA 4JKHA 3NFAA 4BRCA 4O5FA 3G6EN 2FBYA 5I3UA 3K9JA 2E6MA 3CMAN 1DTTA 3C6HA 1XC3A 3ZT0A 3THXB 3KLEA 3H3OB 1Q8IA 3OYMA 2NNWA 4CGFA 3NH2A 3U8XA 3OJUA 3HT3A 4B9QA 4BR0A 2B4JA 2IDOA 3PIOL 3HTVA 4FWRA 4IFEA 4CF2A 3KLIA 1NGCA 4CF8A 3QINA 3VEZA 4W5TA 4DUYK 1UOCA 1GOCA 4BG9A 3ZSYA 1O1WA 3T1YK 4FWNA 1TKXA 3QESA 3HK2A 4IBNA 4ICLA 4XIUA 4I9LA 4H0XB 4ISEA 2W40A 4Y0WA 2NRXA 5EY4A 3HOTA 2IS3A 2GX9A 3L2VA 1EWQA 2ASPA 4MQ3A 3FZHA 3E9LA 3CCLN 4H5RA 3OYBA 2A1RA 4DMNA 4M63C 1N8RO 4B9TA 5CYMA 2ITGA 1ASUA 1YF5L 3CI5A 3MMVA 3KD5E 1RCHA 3QIPA 5BPNA 3SUQA 4OO1J 4CEOA 3EN9A 2NRTA 4JKGB 4DV3K 2CH6A 4FLVA 4ZTJA 3E9OA 4AH9A 3LAKA 3TAQA 2ATQA 2D0AA 3MN6A 1YJNN 1BI4B 4JKFA 4FJMA 1NJYA 1NK8A 2UXCK 3K0SA 4E19A 2F4VK 4CECA 3NE6A 1Q82O 1VSIA 4NO7A 4DU1A 4OX9K 2BDPA 4FJNA 3V1QA 4CK2A 2YNIA 1RTIA 3QICA 4IFYA 1T05A 2HHSA 3UIQA 2FF6A 1RILA 4DCHA 4DFJA 4K0KK 4OJRA 1OH5A 5GIOA 1SZ2A 4DU3A 4BQLA 3HO1A 2D4WA 2P9IA 3SMPA 1IBLK 4GW6A 4C1NK 3OS0A 3VGMA 3G0ZA 1VSKA 4CJ3A 3I56N 4CIGA 2G8FA 1SQKA 3OTOK 2AJQA 1TUUA 2NRZA 2E88A 3KLGA 3DLBA 1X9SA 4YDUC 1JLAA 5TKYA 2A6AA 2CH5A 2X6SA 1MWKA 3E01A 4RW6A 3ZETA 2VQFK 2ZJQL 2O8EA 1SL0A 4DSIA 4BGAA 3ISNC 4G9ZA 1YT3A 3ZEUB 4CHQA 4GVMA 3U6FA 5AFUA 2KQ2A 1KAXA 4FJXA 3OVNA 3SLCA 4FLUA 2HMIA 2HHWA 4KTZA 1ZBIA 4E0DA 1VRUA 4CEAA 3V9XA 4NXMK 2VWBA 4IOCL 2QKKA 4KB0A 2BTFA 1HNZK 4M3RA 4M42A 3QNOA 2D0BA 4CK1A 3L2RA 3FZLA 2F7TA 4J2AA 4UY8O 3CD6N 4DR5K 4E7KA 2CGKA 4OPJA 3BZKA 5HRSA 1E4FT 4WQ5C 1N36K 4B3SK 1T6CA 4C1NI 3V81A 4B08A 4KPYA 3FR0A 4DR4K 1D8YA 2CGLA 4BREA 1HX1A 3VQAA 3IS9A 3KWIA 3VEWA 3TWHA 5KGWA 1WSEA 4JKCA 4BG8A 3EE9A 2E2NA 2XY8A 3DJCA 3VEOA 1NGJA 4BRIA 4AHCA 1LWEA 4H4MA 1HKCA 2NRWA 4BR2A 1BCMA 2HHHK 4KRFA 1RT1A 1WB9A 1DLOA 3VF4A 1JCEA 3H46O 4WQ4C 3K58A 2P5GA 4FPBA 2HHUA 2UUBK 1TL3A 5ADXA 1GLLO 1RT7A 1M90O 2YHAA 4A62A 2Q31A 5C12A 3O5BA 4TSXA 5AQLA 3LP0A 1Z26A 2H3GX 3JS6A 4IXCA 4JS5A 3C94A 3DRPA 5LL6Z 2UUCK 2HBJA 1W9HA 5DK5A 4CJKA 1BQNA 3QFUA 4MFBA 5EX5A 4NCBA 5LY3A 3GL1A 3AVJA 1NK5A 1T3VA 4BC4A 4WCEL 2YI1A 3PO4A 5GIPA 3M8PA 2NRVA 4JK7A 1Q81O 4CW7B 4OVLA 3HM9A 3DOLA 4LSNA 1VSHA 2ZJPL 4PKHA 1LOTB 4WE1A 1S72N 2FSJA 3SMSA 1TUYA 3EE8A 3P31A 2X78A 1NJXA 2HBMA 3VQBA 1NKBA 2F9TA 1QS4A 3ENHA 1N33K 1RBVA 4IOXA 4CERA 1BHLA 5EU7A 4CZJA 1RFQA 1Z25A 3MX5A 1NGDA 2OANA 3SI6A 1C6VA 2OPPA 4QS7A 2O8BA 5KI6A 4K42A 3HRGA 1JKHA 2E8AA 1U47A 2WUSA 4DFPA 4BQZA 4FJ7A 1OVQA 4JLHA 1XHZA 4CF9A 2PYJA 3DMJA 5D3GA 1VQON 1FJGK 4B9NA 2I7PA 4IEEA 5JVGL 3NCIA 3S3OA 5M1PA 2PYLA 5MLCQ 1U48A 3BF1A 4DR2K 1BA0A 2VQEK 4FCYA 4FVMA 1SL2A 3PX0A 5AQMA 4OKEA 1QE1A 3VQ8A 3HM8A 4PY5A 1K9MO 1VK0A 1RT4A 1KXPA 1LW2A 4KO0A 2V7YA 1NU0A 2GWKA 3IAYA 2V7ZA 1SKWA 2ZJRL 1BGXT 4YOVA 3LPUA 4ZTFA 3H1VX 1QTMA 3CCQN 2A5XA 1BIUA 3IRXA 2P9IB 3QEWA 1MWMA 4FJGA 1X9JA 3VQ4A 1R59O 1S9EA 3SPZA 4CJRA 2GUIA 4CJ4A 3ULDA 4JS4A 4FSVA 1ZC6A 4IZ9A 3PY8A 1P8ZA 2A41A 3SQ2A 3THYA 1H1VA 5M1NA 3CYMA 3SCXA 3ZETB 3VQPA 4M3YA 4I6MA 2O8EB 4CESA 3CERA 4GVEA 1HYVA 1HNIA 2IVOA 3K9KA 1WOQA 4FWPA 2IAJA 1UAXA 4C8NA 3DLKA 1T6DA 1NBWA 3H1QA 1TGOA 4YOUA 2XY6A 2GV9A 3AVGA 3VESA 4EHUA 4CEDA 5BR8K 5FPNA 1RDCA 2OTLN 4IOAL 2E2QA 4CGDA 3HI0A 4B1YB 4ZHRA 5E41A 1VQ9N 1D5AA 4A59A 4GMJB 1KTQA 3L4QA 4CEEA 5J2QA 4M45A 2YCHA 3FLCO 2WONA 1HQEA 1HR0K 3VQQA 1WSIA 1BL3A 2OPRA 1W2BM 5IT9O 3PX4A 1S6QA 4BRKA 1U45A 2OZMA 3OYLA 4CJEA 4DS4A 4PHTX 1RDDA 2ZE2A 4F3TA 5HOOA 1S9GA 4DKWA 1VQ8N 4Z94A 4XH4A 1YTUA 3OBWA 5FPMA 4Y1CA 3HSCA 3VTIA 3WUHA 2IVPA 4ID5A 4IDKA 3VN5A 3Q7BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UY8 O;  3CF5 L;  1KQS M;  1KD1 O;  5GAH P;  3CD6 N;  1W2B M;  1VQ6 N;  3J7Z O;  3CCV N;  4WFB L;  3CXC M;  1YJW N;  1VQO N;  1YIT N;  5JVH L;  5JVG L;  3CME N;  5GAD P;  1YIJ N;  5H1S Q;  1YJN N;  5MLC Q;  4WFA L;  3PIP L;  1VQ8 N;  3CCE N;  1YI2 N;  1VQ4 N;  1QVG M;  1Q82 O;  5DM7 L;  1K9M O;  1VQP N;  2OTJ N;  1VQM N;  3G6E N;  3CMA N;  2ZJR L;  1YJ9 N;  3CCQ N;  5GAG P;  1M90 O;  1VQ5 N;  3I56 N;  3G4S N;  3CC4 N;  3PIO L;  4WFN L;  3CC7 N;  2QA4 N;  1Q86 O;  3OW2 M;  5GAE P;  4WF9 L;  1K8A O;  1VQ7 N;  3CCU N;  3CC2 N;  1JJ2 M;  4IO9 L;  4WCE L;  2ZJQ L;  1Q81 O;  1VQN N;  2QEX N;  2ZJP L;  4U67 L;  1S72 N;  1QVF M;  3CCS N;  3CCJ N;  1OVY A;  5HL7 L;  3CPW M;  1ILY A;  1M1K O;  3I55 N;  2OTL N;  4IOC L;  3CCL N;  4IOA L;  3CCM N;  3DLL L;  3CCR N;  1Q7Y O;  1VQ9 N;  1VQK N;  3G71 N;  1K73 O;  1KC8 O;  1N8R O;  1VQL N;  5DM6 L;  1YHQ N;  1NJI O; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QAG A;  4RTF D;  3HJF A;  4DTJ A;  5KQD A;  5GAH P;  1RGI A;  4BRA A;  1JLQ A;  3D2E B;  1IBM K;  2E20 A;  3J7Z O;  1QSL A;  4FL9 A;  4YY3 K;  4F4K A;  4F2R A;  3SUO A;  5ELZ A;  1IG8 A;  4EFH A;  4IFV A;  2P9L B;  4K43 A;  1UWB A;  4WYB A;  3VPZ A;  1VSF A;  4CZG A;  3G25 A;  2O8F A;  2DY4 A;  3CJA A;  2JWL A;  3THW A;  3MN5 A;  3O9S A;  5BR9 A;  1RBT A;  4DQI A;  3IDH A;  4BRF A;  3AVA A;  2FSN A;  3JAM O;  3TPQ A;  3MXM A;  3H6E A;  4N5S A;  3A2F A;  4FJ8 A;  3L0Q A;  1EKE A;  2ASM A;  4O0I A;  3ZT1 A;  5AQG A;  3OHR A;  3C7N B;  3AA2 A;  3DWL A;  4JI3 K;  1JLE A;  1O13 A;  3RWU A;  4PA1 A;  4F3O A;  3G4S N;  4HUF A;  4YOR A;  1LV5 A;  1HJR A;  4BRG A;  2IVN A;  2ASO A;  1S3X A;  3IMX A;  4X66 K;  4FJL A;  2Q0R A;  1IKY A;  4FJ5 A;  4FZY A;  4BWJ A;  4HWI A;  3CC2 N;  1VSJ A;  3M8Q A;  4F8R A;  3BUZ B;  4ELV A;  1S1W A;  4B9U A;  2F8T A;  3K5O A;  4KHS A;  3QEV A;  1XMO K;  1VQN N;  2NLX A;  3M3Z A;  2GUP A;  1VSD A;  3F73 A;  3P5J A;  4QS8 A;  4M3X A;  1KFD A;  4FK0 A;  1ILY A;  3VQC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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