4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
3CCEN 5GAEP 3G4SN 5GAHP 3OW2M 1VQ7N 4WFAL 3CF5L 1YITN 3CCLN 1VQ6N 1VQMN 4WCEL 1KD1O 3CCSN 3I56N 3CCQN 1YI2N 3CCRN 3CCVN 1YJWN 1Q81O 1VQPN 1N8RO 3G71N 3CC7N 2ZJRL 5H1SQ 5DM6L 3PIPL 4IO9L 3J7ZO 1M90O 3CC2N 3CMEN 2ZJPL 3CMAN 5DM7L 1VQ4N 1QVFM 1K9MO 3CXCM 1S72N 4IOCL 4WFBL 1OVYA 1VQ8N 3DLLL 1KC8O 1VQNN 1NJIO 3CCUN 1Q86O 2ZJQL 3CD6N 5GAGP 3CCJN 1Q82O 2QA4N 1YIJN 1JJ2M 5MLCQ 5JVHL 1YHQN 4U67L 1QVGM 2QEXN 2OTJN 3PIOL 1VQKN 1W2BM 1M1KO 1KQSM 4WF9L 4WFNL 1K73O 1K8AO 1YJNN 5JVGL 5GADP 3G6EN 1VQ5N 3I55N 5HL7L 2OTLN 3CC4N 1Q7YO 1VQLN 1YJ9N 3CCMN 4UY8O 1ILYA 3CPWM 1VQ9N 4IOAL 1VQON
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HP6A 2IVNA 1TV6A 4M3XA 3DOKA 4E1MA 1Z26A 1FJGK 4IZ9A 3LP0A 3QO9A 3P38A 3T3FA 2QWNA 3RR7A 3KD5E 3GG4A 4DSKA 4JS5A 2XY6A 3CF5L 4WCEL 4R5PA 4I9QA 2BE2A 4DSIA 4RW8A 1ASWA 4OKKA 1HMVA 5CR4A 2XRIA 4ID5A 3D2EA 5LMNK 2O8FB 1TK8A 2FSJA 3JYTA 1U6ZA 3DXKB 3KWGA 3LAKA 4IFEA 3WXMB 2CGLA 3AO2A 1W9HA 1WOQA 3DRRA 2BTFA 5KGXA 3VEZA 4FWOA 3KKSA 2OZSA 2D0PA 1XHXA 2VWJA 4Z4IA 2BANA 1RBRA 1RDDA 2QTDA 5JS2A 4B9NA 1IV0A 3ZSVA 2Q31A 4FWMA 1C0MA 3OYLA 1WSIA 2PFUA 1S9GA 3QEWA 4GKJK 3BGRA 4DFMA 3LP3A 4GNIA 1D5AA 4JKCA 5BR8K 4C23A 3DXMB 1NJZA 4PQUA 1JXBA 3I0SA 4JKEA 1CLQA 3PUFA 4DLGA 1QQNA 1NJWA 1HR0K 3ZT4A 1X9SA 1TKTA 4AM6A 2UUBK 1SL0A 5ELZA 1TAUA 4ISFA 3MMVA 5BN8A 3AO5A 1ASUA 3R1XA 4KTWA 5JICA 3U8XA 3HSTB 4NYNA 4I7FA 4QS8A 4FJIA 3AVNA 3IMXA 3M5RA 3IS9A 3CC4N 2OPSA 3CG7A 2NRHA 4M3YA 5EY4A 5AR0A 3WXIA 4CJWA 2VCPA 3O4QA 2OZMA 1LV5A 1G15A 1RTJA 4KTZA 2UU9K 2P9SB 5KPRA 4AF1A 2P5OA 3KK7A 4DTNA 1XMOK 4KV8A 4LH5A 4BRMA 3HBTA 3OYHA 3D2EB 3SZ2A 3RMCA 5AZIA 4PHTX 4ELVA 5LY3A 4M3WA 1KTQA 3T1YK 1JLQA 1L3SA 3GDQA 3LPTA 4BR9A 2JWLA 2WTUA 1YT3A 4IO9L 4CZJA 3VGMA 2Q3SA 3C7NA 3VEWA 4JD2A 4YOVA 3V9ZA 1S1UA 4ELTA 4BRDA 3NH2A 2DPNA 4M7YA 1QQMA 2P51A 3VQCA 3G10A 3KTQA 3WXKA 4JS4A 1TUYA 4DCHA 3MEGA 3OYIA 3BF3A 4JV5K 1NGCA 1I3AA 4I6MA 3NH0A 3SQ0A 2ETJA 1YHQN 3QEXA 2D4WA 3ID6A 1L3VA 1J5EK 3MN5A 2OTJN 1VAZA 1U49A 2BUPA 4CEOA 4FOIA 3CJ7A 3OYAA 4WF9L 2HBJA 3CFPA 1WSHA 2HHWA 4CJSA 1BI4A 4PL8A 2WC9A 3SCXA 3HM9A 3KKRA 1BISA 1T6DA 2FBXA 4ILGB 1XMQK 3LL3A 2WOMA 1NK8A 1Q9YA 1BO5O 2O8DA 4BRPA 4CVNE 3VQPA 3E9LA 4BRHA 1BQMA 1W0HA 4CGJA 1MWMA 3CCMN 1HJRA 3O1WA 5KGWA 3MN7A 1C1BA 4JKDA 5D3GA 3O4WA 1RDUA 4QCLA 3OYKA 3E9OA 3LDOA 4Z4HA 4DR2K 2V7YA 2D5RA 4CHYA 4JI8K 2PBDA 4BY9C 4GV3A 2A1RA 5AZIB 4CZFA 4BC2A 1SUQA 5F2RA 2UYTA 3O5BA 4N5SA 4H0TB 3H3OB 3HJFA 3U3GA 2ZD1A 4DF8A 4GW6A 3VOVA 5H1SQ 3ZETA 4YNQA 2FBYA 3F9KA 1F21A 3C7NB 2X6SA 3ZSOA 1OH5A 4CJ7A 5AQWA 5M1FA 2H3GX 5M1KA 4JD2B 4YDUA 5AQLA 1NGDA 4H0OA 4CCHA 4XH4A 3UKRA 3CXCM 2YHXA 2JGUA 5KQ8A 3RRGA 1DT9A 3K58A 5AZJB 3FGUA 1TYQA 4CF9A 2ATQA 4N47A 4I6MB 1Q82O 4FWQA 4LFBK 4TSXA 5A2QO 3HL8A 1XI1A 3PY8A 2BGGA 1TUUA 4DTSA 4L3QA 4DR5K 2KFZA 3L6QA 3PIOL 2B6AA 1BCOA 1BI4B 1A5WA 1D8YA 1EX4A 1W2BM 4BQLA 4YOXA 3DLRA 3ZCMA 2WUSA 4PKHA 1XNRK 3N4PA 5T7BA 3NMUA 3THVA 3B6PA 2O8DB 5BPMA 1UWBA 3J7AP 3EKSA 4JAXA 3LWLA 4BR0A 4DQQA 1E4FT 4FK4A 4YY3K 2OTLN 5BRDA 1BIUA 2KZZA 3R8EA 1C0UA 4U7BA 3VF4A 4UY8O 1ILYA 2D0AA 2W42A 4DSJA 2OPRA 1YXQA 5EOYA 2Q36A 3KLFA 4DUYK 3KZBA 1IBKK 4YDUC 2IOCA 5GAHP 2PYLA 3IKMA 1WLJA 4DQSA 1TKDA 3TABA 4CK3A 5AQRA 3O1BA 4BRGA 4CJEA 5AFUA 2OYQA 3BDPA 5AQOA 4M3UA 2HVHA 5CYMA 3VQAA 4MDBA 3ZSRA 4H5RA 2NNWA 3ZETB 3KK1A 4B1UB 4IFVA 1QSLA 3HTVA 3SUQA 4CZEA 3VTIA 3BF1A 3WT0A 3M3ZA 1YTAA 3ZSQA 3HVTA 3KD1E 1RDWX 4B1YB 4LFCK 3L4IA 3G0ZA 4J8FA 2KHOA 1JKHA 1IKVA 3ZT3A 3UKRB 3SQ4A 4O55A 2ZJPL 5AQYA 3AVLA 3WQUA 1DGKN 4GV9A 3QB0A 4GV6A 3M8RA 3CETA 1IH7A 4W5NA 5F1XA 1S72N 1GLLO 1HKCA 1TYQB 3QFPA 4JI2K 3IFRA 4DKWA 1VQ8N 2F8TA 4XH5A 3O80A 5AQIA 4OPKA 5BPLA 3VENA 4CF0A 4BDZA 4NCGA 3TANA 5C15A 3DAWA 3QBXA 4B08A 5AQXA 4DQIA 1QSSA 4KHSA 2E2NA 4CJKA 4H0XB 1JJ2M 2ZGYA 5MLCQ 1NGEA 3E1YA 3CJCA 1GLBG 3FFKB 2HHUA 4J2AA 2G8WA 2I7NA 2WBNA 4CECA 5M1PA 5KRTA 3JXUA 1NK6A 4JNEA 5AQFA 1EXQA 3QEPA 2D0CA 3P4IA 4CHQA 4CHPA 2O4IA 3VQDA 4FXDA 4CFCA 4A59A 4DTJA 2F4VK 5C25A 4AM7A 4Y1CA 3OS2A 1J53A 1KAZA 5J2NA 2HHTA 2FBTA 4DQPA 2QWOA 3H46O 3O6WA 3K5LA 2QM1A 2NRZA 2GV9A 3ENOA 1NK7A 2YHAA 2CGKA 1OVQA 5C10A 4Z94A 3GL1A 3VETA 4LC9B 3FFIA 4CGFA 5GAEP 2G8UA 3WUHA 1TK0A 3SBGA 5JS1A 3WEEA 4FLWA 1Z05A 3L0QA 3L3UA 3FR0A 4IJNA 3TTFA 4MFBA 4M3RA 3UE5A 2GTDA 4HCBA 4FW2A 4FJHA 3DRSA 3FLCO 4DTPA 1N8RO 3G71N 3NCIA 3K5OA 1C1AA 4H8KA 1HX1A 1VK0A 1W97L 2Q0UA 3JS6A 3S9HA 4DTRA 1ZBLA 4O0JA 4JI1K 4E7HA 4FK2A 5TKWA 4A5BA 2IS3A 3KLIA 2XHBA 1NKBA 3QIPA 5E84A 1RT6A 3PO4A 4J2BA 4CJ3A 4FWRA 3L3VA 4XEIA 3MWPA 1B9FA 1ITGA 3CFOA 3LZJA 2YI1A 3MK6A 3MWTA 2KKZA 1NKCA 4K42A 4ZTFA 4FJMA 1XWLA 1SL1A 3AVMA 4DR3K 4DTMA 4MLHA 2YCHA 1ATSA 5AQKA 3HI0A 4DQ8A 1TL3A 5CYQA 4FW1A 4DFPA 3ATUA 1XC9A 2F96A 2IVPA 5AQTA 4OPHA 3NGZA 3A5MC 3OBWA 2QWMA 4BC5A 4DHYA 1RBUA 1FK9A 4IJAA 1HRHA 1P8ZA 4HVJA 1JLGA 3DRPA 2PAVA 2ITMA 4WFNL 4CZLA 3V4IA 5DMRA 4DV3K 3ITHA 3WXJA 1DTQA 3L2UA 3AA4A 3I55N 3SK3A 3TAGA 2ZE2A 2PY5A 1GLFO 1HUXA 1R59O 3GOIA 1XHZA 2E2QA 2QWQA 2YKMA 4JK7A 4DS4A 3WXLA 5LMUK 3CCEN 2P9LA 3MCPA 3LDQA 3VGLA 1HPMA 5FLXO 1GOCA 4YOWA 3OW2M 1YITN 4BR7A 4CJ5A 1ASVA 2HNYA 3I8DA 4FWLA 2XO7A 4KHQA 1Y97A 3WNFA 1S5JA 2X74A 1NWKA 3AVJA 1J54A 4NLCA 3SMPA 3RRHA 4CJVA 3RR8A 2O8EA 3QESA 4FM1A 4B1VA 4JRPA 3L4QA 2P9NA 2W41A 3IDHA 3ZT0A 4M7XA 3OYGA 4JI4K 2HSTA 3L8BA 2X78A 2F9TA 3J8AA 3J7ZO 2P9SA 2DY4A 3H08A 4OPJA 2A1SA 4DF4A 4B1ZA 4FJNA 3RSEA 4CGDA 1NLVA 4IDKA 3O4NA 3C6AA 3NVMA 1B9DA 4CGIA 3U9ZA 1FKPA 4KB0A 5SZTA 5EU7A 4Y1DA 4L8RB 3R3LA 1T44A 2FSKA 2RN2A 3HXMA 3TR8A 3TARA 3R6MA 4CZGA 5C2FA 3E01A 1VSLA 3DLEA 4G9ZA 1RT7A 3DMJA 4WYBA 5JVHL 3DM2A 3MCAB 2HMPA 3U9DA 3V1RA 3K5NA 1JLBA 2DTUA 2HBLA 4FPAA 2YNHA 5BRHA 1QSYA 1NK0A 1TKZA 4QOZB 4GY2B 5CY4A 1JCGA 2HHXA 1BL3A 1U2VA 4NXNK 1UA0A 1VSEA 4BWJA 4CHZA 1GLDG 1C0FA 3FZHA 4CEQA 3OHRA 3VQ4A 4DTXA 3HSCA 4CD1A 4K43A 2P9LB 5E26A 2RHKA 3ULEA 2HHQA 5DK5A 3AARA 2HMIA 2IIRA 4Z4CA 3G4SN 3LDSA 3PX4A 4CZIA 2QW9A 4NB4A 4DSEA 3KK3A 3HPOA 4YFUA 1EWRA 3CCSN 4BACA 3GBTA 4WQ5A 2O8EB 4A5AA 2UUCK 1NOYA 1BGXT 4JI6K 3D0PA 2P9NB 3VPZA 1Y64A 4KAZA 3AY9A 3CQXA 1NGJA 4DWIA 1U04A 1NOZA 3PLAA 3P83D 1T8EA 3K57A 4YOYA 2IGIA 4B3RK 3J80O 3RSEB 4KH6A 4BRFA 4HTUA 5IT9O 3ZX0A 4CJUA 1LWEA 4PKIA 4X62K 1TK5A 2P9IA 4W5RA 1CZAN 1A5VA 3CJ9A 2DFEA 4E7KA 4JKGA 3H3NO 5CHIA 3EE9A 3ZX3A 3FZKA 1TKXA 3SYZA 2HNZA 4RW9A 4J2DA 5E41A 3AA2A 2E6MA 4BC4A 3MX2A 1RT1A 1SKRA 4C1NK 4DV0K 2YHYA 4CHOA 4HUFA 1NGAA 4LF5K 1YIJN 1VSMA 3KJVA 1SS6A 3CJ1A 2E2OA 3H1QA 3QIOA 4IXCA 1KSPA 5HRPA 5J2QA 4KHPK 1U2VB 3MN9A 5FRNA 3L2WA 3NFAA 4CK2A 5ADXH 4B3OA 3K9JA 4BWMA 3WNHA 4O5FA 4X64K 3VQ9A 3SUOA 4WQ5C 2HNDA 4KHYA 3MXMA 4H5TA 1FW6A 5GADP 2CH5A 5AZJA 1J9AA 1GOBA 3ZSZA 4M42A 1WB9A 4QAGA 4CJPA 1KXPA 3ULEB 1T05A 3JSMA 1SZ2A 3ULDA 4KRFA 3NF6A 4KKOA 3J81O 4FO0A 1QZ5A 2HVIA 3AO1A 4DLEA 4IEIA 2IC3A 1NJXA 1N34K 4LH4A 4JI3K 4W5QA 3OBYA 1GLAG 5KI6A 3VEXA 3B6OA 3R9PA 1VQ6N 4FK0A 3TTDA 3CPEA 2FF3B 1VSFA 4AHSA 1WN7A 1VSKA 3K59A 3EKUA 1VRTA 3HVRA 1NGHA 5FROA 2OPQA 3LAMA 3KK2A 4FJ9A 3MN6A 1DTTA 1U45A 2HBKA 3PO5A 1BUPA 4KHNA 4B3SK 2P9IB 1CXUA 4CZHA 4DFJA 4JKGB 4B9SA 4ILJA 3SAGA 2WONA 4B9LA 4LF4K 2P5GA 3AVBA 2E8AA 3P39A 1K9MO 5J1EA 1BWFO 1HNWK 3EL2A 4C8LA 1HYVA 4ISGA 1IBLK 3VQQA 4IFYA 3O9SA 4PY5A 1JLAA 5AQPA 2VQFK 3MEEA 4JI0K 5GAGP 1FXXA 1XC3A 2EX3A 3O08A 1MA9B 4ICLA 2QA4N 2G8VA 3FZLA 4M45A 3SUPA 2E4LA 2KQ2A 3C6HA 4BVOA 3EEQA 4EIAA 4BDYA 3FE1A 4PWDA 4M63C 3DWLA 3VGKA 3VQ5A 2VWBA 2GUPA 4NLBA 3AAQA 2VG6A 3VQBA 4JRQA 2GBZA 3OYCA 2B4JA 4F4KA 1BOTO 1VHXA 1X9WA 1EO1A 2OANA 3RVCA 3SAHA 1VQ5N 3NF7A 4H4MA 2QKKA 3LZIA 3AGKA 1Q7YO 5SWMA 2IAJA 2FBVA 5I9EB 5AQJA 5HROA 4BG9A 1NMNA 4ID1A 3I33A 4JKAA 3SJHA 2YJEA 3EE8A 1CZ9A 1UA1A 3ZT2A 4DFKA 4NXMK 4J2EA 3EYZA 4OO1J 3SQ2A 2G8KA 3DLKA 1RDCA 4MQ3A 3QEVA 2KW4A 3O3GA 1S1VA 4HUGA 3THXA 1CZBA 2NRXA 3O9TA 1S1TA 3I56N 4Q0BA 1RCHA 4CBXA 3H45C 3Q7CA 1YJWN 5BR9A 1Q81O 1J5OA 1JL1A 3HOTA 1E4GT 3EZ5A 3CC7N 3LDNA 1TGOA 2NLXA 4JKHA 2E2PA 3CJBA 1R0AA 1HNIA 2NUBA 1MU2A 3CJAA 1BIZA 4KH4A 3C0BA 2FF6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCE N;  5GAE P;  3G4S N;  5GAH P;  3OW2 M;  1VQ7 N;  4WFA L;  3CF5 L;  1YIT N;  3CCL N;  1VQ6 N;  1VQM N;  4WCE L;  1KD1 O;  3CCS N;  3I56 N;  3CCQ N;  1YI2 N;  3CCR N;  3CCV N;  1YJW N;  1Q81 O;  1VQP N;  1N8R O;  3G71 N;  3CC7 N;  2ZJR L;  5H1S Q;  5DM6 L;  3PIP L;  4IO9 L;  3J7Z O;  1M90 O;  3CC2 N;  3CME N;  2ZJP L;  3CMA N;  5DM7 L;  1VQ4 N;  1QVF M;  1K9M O;  3CXC M;  1S72 N;  4IOC L;  4WFB L;  1OVY A;  1VQ8 N;  3DLL L;  1KC8 O;  1VQN N;  1NJI O;  3CCU N;  1Q86 O;  2ZJQ L;  3CD6 N;  5GAG P;  3CCJ N;  1Q82 O;  2QA4 N;  1YIJ N;  1JJ2 M;  5MLC Q;  5JVH L;  1YHQ N;  4U67 L;  1QVG M;  2QEX N;  2OTJ N;  3PIO L;  1VQK N;  1W2B M;  1M1K O;  1KQS M;  4WF9 L;  4WFN L;  1K73 O;  1K8A O;  1YJN N;  5JVG L;  5GAD P;  3G6E N;  1VQ5 N;  3I55 N;  5HL7 L;  2OTL N;  3CC4 N;  1Q7Y O;  1VQL N;  1YJ9 N;  3CCM N;  4UY8 O;  1ILY A;  3CPW M;  1VQ9 N;  4IOA L;  1VQO N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HP6 A;  2IVN A;  1TV6 A;  4M3X A;  3DOK A;  4E1M A;  1Z26 A;  1FJG K;  4IZ9 A;  3LP0 A;  3QO9 A;  3P38 A;  3T3F A;  2QWN A;  3RR7 A;  3KD5 E;  3GG4 A;  4DSK A;  4JS5 A;  2XY6 A;  3CF5 L;  4WCE L;  4R5P A;  4I9Q A;  2BE2 A;  4DSI A;  4RW8 A;  1ASW A;  4OKK A;  1HMV A;  5CR4 A;  2XRI A;  4ID5 A;  3D2E A;  5LMN K;  2O8F B;  1TK8 A;  2FSJ A;  3JYT A;  1U6Z A;  3DXK B;  3KWG A;  3LAK A;  4IFE A;  3WXM B;  2CGL A;  3AO2 A;  1W9H A;  1WOQ A;  3DRR A;  2BTF A;  5KGX A;  3VEZ A;  4FWO A;  3KKS A;  2OZS A;  2D0P A;  1XHX A;  2VWJ A;  4Z4I A;  2BAN A;  1RBR A;  1RDD A;  2QTD A;  5JS2 A;  4B9N A;  1IV0 A;  3ZSV A;  2Q31 A;  4FWM A;  1C0M A;  3OYL A;  1WSI A;  2PFU A;  1S9G A;  3QEW A;  4GKJ K;  3BGR A;  4DFM A;  3LP3 A;  4GNI A;  1D5A A;  4JKC A;  5BR8 K;  4C23 A;  3DXM B;  1NJZ A;  4PQU A;  1JXB A;  3I0S A;  4JKE A;  1CLQ A;  3PUF A;  4DLG A;  1QQN A;  1NJW A;  1HR0 K;  3ZT4 A;  1X9S A;  1TKT A;  4AM6 A;  2UUB K;  1SL0 A;  5ELZ A;  1TAU A;  4ISF A;  3MMV A;  5BN8 A;  3AO5 A;  1ASU A;  3R1X A;  4KTW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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