4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
5JVHL 1JJ2M 3PIOL 3CCVN 3CCEN 1VQ5N 4WFAL 1Q82O 1KC8O 1QVGM 3I56N 5H1SQ 3J7ZO 1ILYA 2ZJQL 1Q86O 1QVFM 5DM6L 4UY8O 1YIJN 4WF9L 5GAGP 1K8AO 1VQ7N 3G4SN 3CCMN 2QA4N 1YJNN 1YJWN 1VQNN 1VQ9N 1VQ8N 1VQLN 3CCJN 1VQPN 1Q81O 5GADP 1KQSM 3OW2M 2OTLN 1M90O 3CCUN 1YJ9N 2QEXN 3CMAN 4IO9L 5MLCQ 2ZJPL 4WCEL 1N8RO 3CXCM 3CMEN 5JVGL 4WFNL 1VQ4N 2OTJN 1K73O 1K9MO 1M1KO 1YI2N 5GAHP 5GAEP 1VQON 2ZJRL 1YHQN 3CC2N 3CF5L 1S72N 1VQKN 1Q7YO 3G71N 1NJIO 3CCLN 3PIPL 3CC7N 1OVYA 4WFBL 3CC4N 1VQMN 4IOCL 3CCQN 1VQ6N 5DM7L 4U67L 3CCSN 3CPWM 3CD6N 4IOAL 3I55N 3DLLL 1KD1O 3CCRN 3G6EN 1W2BM 5HL7L 1YITN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YNIA 4PKHA 4JKFA 3TAMA 1HYVA 4JS5A 2ZWHA 4CJTA 1S9GA 1OH5A 3D2FA 1RTDA 1ZBHA 4I2PA 1C1CA 2OPPA 3LPTA 4KHNA 2YNHA 1NWKA 2W41A 3ZLJA 4C23A 4DTMA 4DS4A 2Q31A 4CI6A 4NCBA 1C0FA 1K8AO 3LDSA 4CJUA 1JLBA 4GMJB 3HPHA 1LWFA 3E66A 3FZLA 3HZ6A 4H0TB 1YJNN 1YTUA 1S1UA 1TK0A 5F0XA 2EX3A 4FJ7A 3KLIA 3QB0A 2P51A 1RBRA 3QEVA 4AHCA 1RBSA 4FWKA 4DR1K 5HP1A 4JHDA 4IBNA 2QXLA 1HYZA 1T44A 2JGUA 4IEIA 3AVHA 3OJSA 4KRFA 3ZSWA 4CD3A 2OTLN 3BGRA 1EKEA 1TVRA 2BDPA 4EP4A 2VG6A 4DLGA 1LV5A 4OKJA 1DGKN 5A2QO 4LFCK 3SPZA 4AF1A 4WFNL 3IFRA 1IKWA 1KVBA 1VQ4N 2F8SA 3HPOA 4Z4EA 4CIEA 1N5YA 3ZSVA 1XMQK 1S1XA 2UYTA 4CJKA 4DV1K 3CETA 5C24A 5GAEP 4OLBA 1C0MA 2QKKA 3R1XA 3S3MA 4KB1A 1L3TA 4H5WA 2GWKA 4DKWA 2ITGA 3FR0A 3OYAA 2HSTA 3LM9A 1Y97A 4CEFA 4AQYK 4PA1A 4KV8A 2HF4A 4BE1A 2JLEA 1TK5A 5FLXO 2RHKA 3A5NC 1H1VA 1WBBA 3CPWM 3MECA 1JCGA 2E88A 2QWRA 4WE1A 5AQTA 3ZSXA 1R0AA 3AGRA 1JJ2M 3DJCA 4JI7K 5LMUK 1VSKA 4AHUA 1N36K 3C95A 5HRNA 4DB3A 4B9UA 1YT3A 3A8YA 3OA9A 5FPNA 1X9MA 3TI0A 2QXFA 3H6EA 3J7ZO 3VOVA 3H1QA 2NRTA 4RW4A 3FZKA 4QS9A 3T1HK 2FF6A 5C15A 3CQXA 5C25A 4BC3A 1QSYA 4ISGA 4BG8A 2NZTA 3M1FA 4KFBA 1Q18A 2CGJA 1VQ7N 4CZEA 4B3SK 2A42A 3FGUA 1C1AA 1JLFA 3WNGA 3GOIA 5AQJA 4GV9A 2XRIA 4F2RA 4ZHRA 3MXMA 1NMNA 2P9UA 5EY4A 4FOEA 1C1BA 3G0ZA 3O9QA 2W40A 3SLCA 2F4VK 3SUNA 2X6SA 4NYFA 4MQ3A 2IIRA 4CZGA 2VQFK 3RR7A 2QK9A 2Q36A 4IJNA 4YFUA 5AFUH 1RDCA 1LCUA 4NYNA 4H4OA 1U49A 1GLFO 4KI4A 1NBWA 4EAHD 4FJKA 3E9LA 1BI4A 3LDQA 3BZKA 2CH6A 4ELTA 4LF9K 4B9VA 3RMBA 2Z1JA 3K5NA 1Y64A 2ZGZA 3AVBA 1OH8A 4HTUA 4JI6K 2A5XA 2YHBA 1VQKN 2O8FA 3G71N 2Y1IA 4DU4A 2O8BA 2DFHA 3NFAA 1RILA 1WN7A 2NRXA 1NGFA 3MX5A 4AM6A 3KK3A 3BUZB 4FLVA 2CH5A 2P9LA 5AQUA 3VA3A 4FJNA 2KKZA 5CYMA 4CFCA 3NGYA 4CD1A 4M7XA 4DV0K 3K5OA 3DLLL 1QE1A 2D0BA 2A1SA 2B6AA 4KTZA 4WQ5A 4EZ9A 3G10A 1HKBA 1NKBA 3RTVA 4IXCA 4LD0A 3HM8A 5BR9A 3O4WA 5JLHA 3LP2A 1LW2A 3RVCA 2D0CA 2E2OA 4W5NA 4X64K 1S6QA 4ELUA 4ICLA 3ZT0A 5KGXA 3J80O 3J81O 3OHRA 1QSLA 3IDHA 2AA4A 5J2NA 4CF9A 1TV6A 5KRTA 4JKGB 4IO8A 4JS4A 1QVFM 5AQZA 3O1WA 1S6PA 4CFAA 4PHTX 5GAGP 4M3UA 4CF1A 1FK9A 2D0PA 1SL2A 5HRPA 4KHQA 3LZJA 2FBYA 1WSEA 3N4QA 1QHTA 5BRHA 2D4WA 5LL6Z 4JYAK 5FDLA 4XH4A 3EEQA 4B9SA 1NGHA 2AJQA 4LY7A 3VQAA 1JL2A 4C1NK 3OTOK 4KHPK 4KAZA 5AZIA 1TGOA 3CM6A 3HI0A 3MN5A 3J7AP 4KH5A 3PLAA 3TANA 5BPLA 1NM1A 4CEOA 4DQPA 4O4GA 2E6MA 3WXMB 2Q97A 1ASVA 4BE0A 2DTUA 4FYDA 3P39A 4DSLA 1YHQN 1BIZA 3TAEA 4NO7A 3OVNA 2WUSA 2IDOA 4I9QA 3CC7N 1NOYA 3VEVA 3RRGA 4O55A 3ID8A 3G25A 1LWEA 3VESA 2O4IA 1BL3A 5J1EA 4B8CA 3ZT3A 4IOXA 3OYLA 1HNVA 3K0SA 3QFUA 4B1XB 2PAVA 2HVIA 2X78A 3U4LA 4I6MA 4GKKK 3O08A 4IJAA 1FXXA 4KH6A 4DSKA 1ASWA 5EVZA 3E1YA 3LPUA 2VCPA 3T1YK 4O5FA 3HOSA 3CJBA 2Q1NA 3ATUA 1GLAG 3PX4A 2WONA 2VG5A 3L3UA 2WOMA 3ULEA 5H1SQ 1SUQA 4AH9A 1N34K 2Q0UA 1GOAA 5M1FA 2G8IA 5M1KA 4BR5A 2E20A 3C6TA 1HMVA 1YIJN 5AQNA 2RE2A 3VEWA 3VQ5A 1NKCA 4J2EA 4Z4FA 3LP1A 3RWUA 1VK0A 3UKUA 4DR4K 4CIGA 1JLGA 4FL9A 2ZM6K 4I2QA 4LFBK 3M3ZA 3VQDA 3L2WA 1BA0A 1NK5A 2ZF5O 4ID5A 5AQQA 2P9NB 3M5RA 5IWAK 3V6DA 3GBTA 3AA3A 1DEJA 1NU0A 4CERA 3CMAN 1N8RO 5MLCQ 3IRXA 3QMLA 4BRHA 1U6ZA 2YHXA 3NHGA 3AO1A 3THXA 1HJRA 4HUGA 4DQ8A 3AA5X 4FJIA 1K9MO 1UOCA 4DTUA 1BDGA 3FZMA 2XO7A 3UE5A 5IT9O 3V9XA 2O8CA 4FWRA 3V4IA 1VSHA 3KKSA 4BRAA 4DU3A 3KTQA 5AR0A 4CFBA 1KXPA 3CC2N 3BDPA 3THWB 5SZTA 1WSFA 4B3MK 4BY9C 5JS1A 4RW6A 4N5SA 4E7KA 4F4KA 4B9QA 5LJVA 3PSIA 5C2FA 1RDBA 2VQEK 1V4SA 1B9FA 2F9TA 3NMUA 1FKPA 4H0YB 3SUPA 4ILJA 4CF8A 2IGIA 1N6QA 4CZJA 3HVRA 3I55N 2FSJA 1ZXOA 3V9WA 2XY7A 2RPIA 4CK2A 2QI2A 5D3GA 4J2DA 3IS9A 1QQOA 4HTLA 4OPJA 4CJQA 3O9UA 4DV5K 4EZ6A 3MX2A 3VN5A 4OKKA 4CGFA 4DFMA 4CEDA 3CCEN 1RBUA 5CZ2A 4M3ZA 4MLEA 1QVGM 3C65A 4JI2K 1BCMA 1NJYA 4H0PA 4JKBA 4H5VA 5EOYA 2NLXA 2NRHA 4UY8O 3HXMA 3SQ4A 3WXKA 4DCHA 2FLOA 2EHGA 5J2QA 4BRPA 3V1QA 2P9KA 1NK7A 4M3YA 3GG4A 3DAWA 4ZTJA 4YOTA 3BP8A 4DV7K 4DSFA 4C8NA 3F73A 4JD2B 1A5WA 3EZWA 2ASPA 1C6VA 5LY3A 1SKWA 1MU2A 5CY4A 1BO5O 3O1BA 3TR8A 2E2NA 3ZEUB 3I0SA 3OW2M 2OA8A 2GUIA 1KRPA 5CE3A 5M1OA 3CCUN 3VQ4A 3SAFA 3U6FA 4JI1K 4L3QA 4J2BA 5JVGL 1HYSA 1D9FA 1CXUA 3OS0A 3WQTA 4BRNA 3T7ZA 3L4QA 2VYPA 2OTJN 3AVMA 2F96A 3K58A 3LP0A 3A0IX 1EWRA 1R59O 3B8AX 1IBLK 4IG0A 2LSNA 3KZBA 1HPMA 4DQQA 2YHWA 4H5TA 3ZETB 3DRPA 1RDAA 4BRCA 1VQON 1J5OA 4YDUA 1HKCA 3DLEA 1WOQA 3R3LA 1I94K 3AARA 4DTOA 1K8KB 1IV0A 2ATQA 5FRNA 1C0TA 4MFBA 4BR2A 1IO2A 1JXEA 4BDYA 3TTCA 4U7BA 4FZZA 3Q7CA 5DM7L 2KHOA 4G1QA 3LDPA 2O4GA 1BWFO 3VQ6A 2KW4A 4YY3K 4DQSA 1DTQA 3G6EN 4M42A 4NXNK 1YITN 1HNXK 3WEEA 4ISEA 1VSIA 3NH2A 3KLFA 4YDUC 2DPNA 4B9MA 4A5AA 4PKGA 4PUOA 1RT6A 1IG9A 5DMRA 1J53A 3HVTA 1XC3A 3AO4A 3ZYYX 4JRQA 1U48A 4CHYA 3VA0A 3DLRA 3UKRB 1NKEA 2PY5A 1QQNA 4F9OA 3PX6A 2YJEA 1GLLO 1LAVA 1GLJO 2PFUA 1S1WA 3E9PA 4CZMA 4DQIA 4GV3A 4AHTA 4CHZA 3CCMN 1NJZA 1VQNN 3JYTA 4IZ9A 1Z26A 4CZFA 3KK1A 5AQWA 4FLUA 2D0OA 1VQLN 1MWMA 3HPGA 3KLGA 4BQLA 1HNIA 3HL8A 1TL1A 2X74A 4W5TA 4CK3A 5GIOA 1CZAN 1X3MA 4ZTFA 4FJHA 3MCPA 3C7NB 2HMPA 1VSEA 1RDWX 3O80A 2P9IB 4FVMA 4QAGA 3DLHA 3KHYA 1QQMA 5JLFA 3QEPA 4E7HA 1EX4A 2FF3B 4BGBA 1XMOK 5I3UA 5AQMA 4K8XA 2QWMA 4FWLA 3C6HA 1EQYA 5BR8K 4BRQA 2NRVA 2B5JA 1GLDG 2P1JA 5GINA 3KWGA 4M3RA 4BR4A 4JEPA 1NJIO 3C6AA 4NB4A 1Z05A 3PIPL 1SAZA 3RSEA 4N47A 5FPDA 1RT4A 4KO0A 5AZJA 3NE6A 3I8DA 2YI1A 3K5LA 4GW6A 3OYDA 4BWJA 4A62A 3O8MA 4A2AA 3MXIA 4CBWA 4YOVA 1GOCA 3IUCA 3VGLA 3K9JA 4LF6K 3U3YA 1HJOA 2HVHA 2NRWA 1SL0A 1SZ2A 1N32K 4KHSA 5C12A 1Q82O 4JI0K 4KHWA 1TYQB 1MWKA 1RFQA 1NGGA 3CJAA 4NXMK 2YHAA 1T03A 4FWMA 4O0IA 1T05A 2HHSA 4CJ3A 3SQ0A 4B3OA 1D8YA 5DM6L 1TUUA 4IDKA 2QWOA 4DTPA 3H46O 2HBKA 1J9AA 4FJJA 3ALYA 1VQ9N 1ATRA 1T7PA 1L3SA 3V9ZA 3KD1E 3VQQA 2HHWA 3T1AA 4JK8A 2OZMA 5EU7A 1J54A 3VGKA 3P1GA 4K43A 5AQSA 4DFJA 5HROA 4DTNA 4K8ZA 4RG8A 3OYEA 3NH1A 4B1ZA 3QETA 2ZJPL 4FPBA 4DS5A 4IKFA 1ZBLA 3QFPA 1DTTA 3KVGA 5BPNA 5J2MA 2G8WA 2HHTA 1LWCA 1RBVA 3HP6A 3LDLA 4B1UB 1OH7A 3P38A 2ASOA 3TSPA 3OYJA 1RDUA 2DY4A 4BQZA 3V1RA 4PWDA 1RT3A 3GL1A 2NNWA 1B92A 1NGBA 3IMXA 2GX9A 2HNYA 3OYKA 4DLEA 1O13A 1NG9A 3RR8A 4M3TA 2HBJA 1VQMN 4R79A 4YORA 1HX1A 3CI5A 1RBTA 4M7YA 2HB5A 3M8SA 1RT2A 4FM2A 4JKGA 4DR2K 4DV4K 3WXJA 4DF4A 1P8ZA 4KTQA 3QERA 3JXUA 4AHSA 1GLCG 1B9DA 2IVPA 4E3SA 5BRDA 4CZHA 2F7TA 3SAHA 3CCVN 4HUEA 3AVAA 4BC2A 4FK4A 1SQKA 3DXMB 4DFPA 3JSMA 4LF8K 1U45A 3ZT4A 1KC8O 1W7AA 1Q9XA 1KAZA 1U2VA 5T7BA 4B08A 4OX9K 1T6DA 4BRGA 3CJ7A 1ILYA 4DSIA 4CHOA 3VTHA 4BACA 3HO1A 3M8QA 5GIPA 4IFVA 2FSNA 1TAUA 5KRSA 4DR5K 3MWPA 4H0VB 3EY1A 4K25A 4CF2A 1NOZA 3ITHA 5KPTA 4JI4K 5BN9A 2J4RA 3S9HA 3ISNC 4FPAA 2HNDA 2ZQBA 5AQYA 3D7EO 4PKIA 4Z94A 3I8BA 1SL1A 2ASMA 4LF7K 3U9DA 3BF1A 3VF2A 1VAZA 1YJ9N 1JLAA 1JXBA 3OBWA 4CK1A 1XNQK 1RTHA 3VTIA 3CXCM 2I5JA 4LSLA 2ITMA 5BN8A 4WQ5C 3OYGA 1SKSA 4I7FA 3RRHA 1BI4B 4CJ5A 3EZ5A 3P83D 3NVKA 1LAWA 2G8UA 1Q8IA 3LP3A 2IAJA 4EHTA 1BQNA 1D9DA 5GAHP 4GVEA 5E41A 1NGJA 1TUYA 1NNEA 2O8FB 3Q7BA 3D2EB 4GNIA 4FM0A 2Y1JA 2O8BB 3QEIA 5AQXA 1TKZA 3EKUA 1Z6RA 4O8KA 1ZYQA 2GUPA 4OGCA 3S3NA 3HM9A 3IG1A 4CJ4A 1KVCA 4M45A 2WFBA 2GEMA 3KWIA 3CD6N 1RGIA 1WUAA 3DLBA 4NLBA 4JRPA 4M3XA 2O8DB 4DTJA 3FZHA 1N33K 4XEIA 4G9ZA 1S1VA 3MN6A 1JLCA 1NGIA 4BR0A 1VSLA 4JK9A 3AV9A 4YNQA 4HVJA 3LAMA 3QIPA 1WNSA 1KLNA 3VETA 4ILGB 2V51B 4B9LA 1QZ5A 4WFAL 4CEBA 3V81A 3GDQA 4Z4HA 3QO9A 4BR9A 2Z1IA 2P9NA 3FFIA 4NCGA 1GLBG 4CHPA 3OYBA 5HLFA 3EKSA 4Y0WA 4PL8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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