4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
4WFBL 1K73O 1JJ2M 1W2BM 3CCQN 3CMEN 1M1KO 5JVHL 1VQPN 4IOCL 5H1SQ 1Q7YO 2ZJRL 1VQNN 1YJ9N 1VQ9N 1OVYA 3CC4N 1VQLN 3CCLN 3CCRN 1VQON 1KQSM 1VQMN 3CD6N 1Q82O 3CCEN 5HL7L 2ZJPL 1VQ8N 4WFNL 3J7ZO 3DLLL 5DM6L 4UY8O 2OTJN 5DM7L 1K8AO 3G4SN 1VQ6N 1YJNN 3CCSN 3CF5L 3CPWM 3CC7N 1Q81O 3PIPL 1YIJN 3CC2N 4WF9L 1VQ7N 1NJIO 3G71N 5GAGP 3CCMN 1KC8O 4U67L 5GADP 1YI2N 3I56N 5GAEP 4IOAL 1QVFM 1M90O 3CXCM 3PIOL 5JVGL 1S72N 1YJWN 5MLCQ 1ILYA 3CCJN 4IO9L 3I55N 3CMAN 2QA4N 1YITN 1QVGM 3G6EN 1N8RO 5GAHP 3CCVN 1VQ4N 1YHQN 3CCUN 2OTLN 4WFAL 4WCEL 1Q86O 1KD1O 1VQKN 3OW2M 1K9MO 2ZJQL 2QEXN 1VQ5N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QIPA 5AZJB 3QBXA 1BQNA 3HP6A 4CGHA 5FPDA 4E89A 2O8CB 5JVHL 4GNIA 5ADXH 4FWKA 3E9LA 4KI6A 1S1TA 4DTSA 3SMSA 1CZAN 4XEIA 1NK6A 2YHWA 3HJFA 1NG9A 2V7YA 1IKWA 4FM1A 4BRFA 4FJJA 3ENBA 4OPJA 2IDOA 4B9LA 3JSMA 4KHWA 3EZ5A 2A3ZA 3AO3A 3EKUA 4IKFA 3ZSXA 4CJEA 2Q1NA 3IS9A 4HUGA 1QQNA 3AVFA 5HRRA 3F73A 3RTVA 3EL2A 1BG3A 3QICA 3KKRA 3TTDA 5BR8K 3NH2A 1HPZA 2PAVA 4LSLA 3VGKA 4B1VA 1YJNN 2KTQA 3DLRA 2V51B 4DV0K 1S6PA 4W5OA 3SMPA 2FBTA 1KTQA 1U04A 4K8XA 4NO7A 2ASMA 4CZHA 4FJ7A 2Q0UA 1BHLA 4HUEA 2KFZA 2QWPA 3RMBA 2HNDA 2XHBA 4DFKA 1UOCA 3HZ6A 4OPKA 4Q0BA 5B8HA 5GADP 3QEWA 5AZIA 3MXIA 2E2PA 4XH1A 4FJMA 3OYLA 3KTQA 1BQMA 1P8ZA 3CM5A 3SBTA 2WUSA 3ATUA 4RW6A 4FJLA 4GY2B 3OHRA 5E84A 4J2DA 1VSMA 3QMLA 4YFUA 1IBLK 4ELTA 3SAHA 3DAWA 4CESA 1ATNA 4YOWA 2QWNA 4CGIA 3VA3A 1KLNA 1HKBA 4FSVA 3O4QA 3BZKA 4IBNA 3EKSA 1YHQN 3KLHA 3OYMA 2O8DB 3PO4A 5K14A 1BI4A 4DF8A 4FOEA 3SV4A 2VWKA 4B9NA 3GE1A 3M6GA 1HNVA 4XIUA 4B9TA 3TAQA 4JNEA 2BDPA 5AQXA 3HSCA 4A62A 3F2KA 5FRNA 3WEEA 3MEDA 4J2AA 3BP8A 3QFPA 4F3TA 4JKHA 4B9SA 5AQRA 2W41A 4AH9A 2ZJRL 3OY9A 5AQQA 3CCLN 1HX1A 2F9TA 3LANA 4JKDA 4BRLA 3ENHA 1JCGA 2HVHA 1WSHA 3H45C 1B9DA 1YVNA 4RW4A 5KPRA 2YJFA 2QXFA 3OJSA 4NLBA 4WYBA 4FCYA 4IFYA 2VQEK 3SYZA 1S1UA 1LOTB 5ELZA 1K8AO 3ULEB 1A5XA 3CC7N 2PYLA 5GINA 5AQOA 1A5WA 2V7ZA 3CG7A 1XC3A 2NLXA 4GVMA 4C8MA 4B3OA 4M3XA 3V4IA 4OX9K 1NU0A 3TANA 2BUPA 3MWPA 1VRUA 1NM1A 2RF2A 3K58A 4JI0K 4DS5A 4U67L 2VGMA 4JI6K 2D0OA 4KHNA 1DTTA 5IT9O 4E7JA 4KHPK 2AA4A 3HVTA 3SCXA 1SL2A 4DR1K 4B3SK 4FJ5A 2UXBK 3U9DA 1IG9A 1T6CA 3THYA 3C6UA 2I5JA 5EX5A 1DKGD 1VRTA 1WUAA 2IVNA 2YNGA 1HNXK 4KTQA 4CF2A 3CJCA 1VAZA 4FZXC 1R59O 3O3FA 3ZETA 4CGJA 4DTOA 3NF7A 1HYVA 4I6MA 2OTLN 2HHTA 3E66A 1U49A 3D45A 3ENOA 2NRWA 5JS2A 2VWBA 3QERA 2QEXN 2YJEA 3T1HK 3WT0A 1T6DA 1O1WA 4O4GA 2GUPA 1M1KO 1TUUA 3TSUA 1UWBA 2ZE2A 2CH6A 4IOCL 1R0AA 3H46O 5I42A 3P83D 1MDUB 4JRPA 1HKCA 1YJ9N 3VA0A 4WQ5A 5I9EB 3MN9A 3VOVA 3CFRA 1BCMA 2A41A 3HP9A 3MEEA 3R8EA 4A2BA 2ZJPL 2QW9A 2E2QA 2EX3A 3NDKA 1VSFA 3VGLA 1X1PA 4BREA 4DLEA 1I94K 5DM6L 4BC5A 3DOKA 4ZTJA 4M7YA 2XRIA 3FZKA 3AV9A 5KI6A 5AQJA 2HBMA 4E0DA 4ILJA 3D2FB 5FDLA 1WSIA 1YIJN 4G1QA 3KLGA 2E6MA 3JAMO 3THVA 3WNHA 5HRNA 1HUXA 4DLGA 3L4IA 3U3GA 1N34K 3W3DA 1HMVA 1FK9A 3L4QA 3CCMN 3AVIA 4FLYA 3OYIA 2D4WA 4YY3K 2HW3A 3GBTA 3MN5A 1FKOA 4FK2A 1VSHA 5KRSA 3BEXA 1SKSA 3PY8A 3GL1A 4PHTX 5JLFA 1EXQA 1CZ9A 2I7NA 1BI4B 3AVHA 2O8FA 3V9XA 5LMUK 2FBVA 2A5XA 1QTMA 3VF4A 1F21A 3CMAN 1GLDG 1SKRA 1C0FA 2D0PA 4BGBA 3LWMA 1J5OA 4BDPA 4BR9A 3SUNA 4IJNA 4Z4HA 4B1ZA 4B3MK 4AHVA 1J6ZA 2G8WA 1VQKN 2KKZA 4AHUA 3MX5A 3QEVA 2NRXA 3QO9A 3OJUA 1TKTA 4MLEA 1Z6RA 2YNIA 3BF3A 4CHYA 3SNNA 3KHYA 1QE1A 5FPNA 4K8ZA 5BPLA 4FJXA 2NRZA 4CHPA 3AO4A 3IKMA 1HQUA 4KRFA 3MN6A 4CZFA 2QXLA 3VQEA 1HRHA 3ZX2A 1HNIA 3QEPA 3VETA 1TK5A 3F9MA 1LW0A 2OPQA 5EXWA 4FJ9A 5T7BA 1ZBSA 1WSGA 3VEVA 1RDUA 5AFUA 2OTJN 3RMCA 4BVPA 1VQ6N 4JK8A 1TYQB 4DQQA 4JHDA 4CJRA 2ZQBA 2IC3A 5AQVA 5AZJA 3HSTB 1NJIO 3PX0A 2A6AA 4QS8A 4JI4K 2P9UA 2B6AA 2QK9A 3OVNA 5FLXO 4UQGA 1T44A 4CGDA 4CZJA 3NH1A 3THYB 1YI2N 4B3TK 2DFHA 4IOAL 3O8MA 3ZSWA 4BRNA 1D8YA 4PY5A 2IS3A 3MEGA 1XC9A 4LF7K 5JS1A 2PZSA 5TKWA 3OYAA 2BH1A 4E7HA 3ZETB 3RR7A 5KPZA 2WFBA 1S72N 4FWNA 3SUPA 4NYNA 1RT2A 2H3GX 1RBUA 1B92A 2W40A 5DMRA 3SJHA 4CK3A 4FM0A 3L2VA 3C0BA 4BRHA 3THXB 1XMQK 3M8SA 1V4TA 2FSKA 4CEAA 4JKFA 2FF3B 4EP5A 2NUBA 1ZBUA 4X65K 2HSTA 1XUPO 1SL0A 2KFNA 3D0PA 1JL1A 1WB9A 1BU6O 1RCHA 2GV9A 3VEYA 1W0HA 5KRTA 4FJNA 2KZZA 4B8CA 3F5TA 4Z4FA 3QESA 4CEFA 4BRCA 3LAKA 4NCGA 4ICLA 3F9KA 1NMNA 1TGOA 2XY8A 3DWLA 5AFUH 3RR8A 2QKKA 4GMJB 2I7PA 4KB0A 3MXJA 4R5PA 5FRMA 4BRIA 2KW4A 2F4VK 3SLCA 4A5BA 1NGDA 3I8DA 4CZMA 4A61A 2HHVA 3FLCO 3DLGA 2VWJA 3MWTA 2QWMA 4H0YB 3P31A 1KFSA 3U4LA 1S1VA 1IKVA 1LW2A 2O8DA 4UY8O 5AQWA 4I2QA 4BDZA 1IJJA 1TK0A 3H3NO 3S3NA 3WQUA 2ASPA 3I8BA 4KI4A 5A2QO 3HM9A 1IG8A 3QETA 1NGCA 3UIQA 1C6VA 1KFDA 1NGFA 3QEXA 3HXMA 2HF4A 2D0BA 3QNNA 4PUOA 3CERA 3C7NA 1UA0A 1ASVA 2VG7A 4KBOA 2O8FB 3AVMA 3VQAA 1NK9A 4QAGA 4DFJA 3VGMA 4MQ3A 2CGKA 5C25A 1U4BA 3VF2A 3P1GA 4EIAA 4AILC 1C1CA 4I7FA 2HNZA 1NJYA 2GX9A 1K6YA 3WXLA 4OPHA 4FW1A 3CI5A 1WSJA 2QWOA 3BY5A 1BGXT 3PLAA 1RDBA 3AARA 3VQ9A 4B1WB 2OYQA 3CCUN 1L3SA 4W5NA 4M3RA 1YAGA 3G0ZA 4Z94A 3NCIA 4M3ZA 3VERA 1IBMK 4OVLA 3V1QA 3FZFA 3TSPA 1ASUA 3P38A 5F0XA 3H6EA 5HROA 2RE2A 3P5JA 4WE1A 4J2EA 3A5LC 3LP2A 5EU7A 3ZSRA 3B6PA 1ZYQA 1VQON 1D4XA 4PA1A 5JMVA 3SQ0A 2HMIA 4CJKA 3ZSYA 3JXUA 5CYMA 4XH5A 2BGGA 2ATQA 4JHDB 2G8IA 3ID6A 1Y64A 4CZGA 4ISGA 4CFAA 4CJQA 4Z4EA 5BREA 4GV3A 1SUQA 1KAZA 3LDNA 2P9UB 2P9NA 5E26A 2W6LA 3CCSN 2G8HA 4X66K 5J2PA 1QZ5A 1JLAA 2WTUA 3AO1A 3K9JA 1BCOA 2YKNA 4DG1A 3EN9A 3AA5X 2RHKA 4AM7A 2WONA 1RFQA 4YDUC 1NK8A 4CHOA 4RWTA 1C1AA 1YT3A 4DTRA 5E41A 1BDGA 3OS2A 1W7AA 3OYBA 4Y0WA 4CE9A 1QVFM 3ZSZA 1XWLA 2WC9A 3Q7BA 3R9PA 3W0LA 4CEOA 1Z05A 3OYHA 1BL3A 4ID5A 4EZ6A 3CCJN 3UKUA 4KB1A 4IZ9A 3V9UA 2D1KA 1WNSA 5C2DA 3BZCA 3IUCA 2Q36A 2X6NA 4MO5A 3VENA 4FM2A 1YUWA 3D2FA 3CCVN 2P5GA 1UAXA 4KTZA 1Z25A 4ZHRA 3O1WA 5J2NA 1YVUA 2QWLA 4OKKA 3MCPA 1RT3A 3M3ZA 1VQ5N 4CZEA 2GELA 3AAQA 2X78A 2IIRA 3A5OC 1SV5A 2NRVA 4CGFA 3IDHA 2HB5A 4EHTA 4X64K 1SS6A 1QHTA 4DFMA 2CH5A 4H03B 3ZCMA 3IG1A 1VQ9N 1HNWK 4L3QA 4B1YB 4CEQA 3K0SA 2YKMA 3TR8A 5FPMA 4YHHK 5EY4A 1N32K 3SZ2A 3AA4A 3O6WA 3J81O 4DTNA 4JS5A 1DT9A 1HYZA 5HL7L 3T7ZA 3M5RA 1X9MA 4OKJA 3HPHA 1VK0A 4AM6A 1NKEA 2HNYA 3SPZA 3C94A 4AHCA 3OA9A 3SQ2A 3C7NB 4IDKA 3RSEA 1JCEA 1RDAA 1Q81O 2Q2RA 4BR4A 1JLEA 4BACA 4DSIA 4HTLA 3J8AA 4DQ8A 2GEMA 1OH6A 4ID1A 4CJWA 1EWQA 3SI6A 1TAQA 3B8AX 3IMXA 3O9SA 2E1YA 1LWFA 2E20A 3AAPA 4KHUA 1E3MA 4LFAK 4OLBA 1NOZA 4KH4A 5GAEP 1KLMA 3NFAA 4H5VA 4DTXA 2FF6A 3OYKA 3ITHA 3ZEUB 1TAUA 1J9AA 4DV2K 2LSNA 2VG6A 4CZKA 2IVOA 3HK2A 3VQ8A 3E01A 1YJWN 5LL6Z 5C42A 4BC4A 1WSFA 1Q9XA 4B9VA 4FO0A 4M41A 4C8OA 3U6FA 4OJRA 1XNQK 2HHQA 5KPTA 1K8KB 4K42A 4CIFA 1TYQA 4PKHA 5AQFA 4RTFD 4RG8A 3AO5A 4H0PA 1N8RO 5F1XA 5I3UA 2YNHA 3SK3A 4WFAL 2HHUA 2WOMA 2QTDA 3TAPA 3SQ4A 2ZD1A 3KLEA 2CGLA 1N36K 4C8KA 4B1UB 2EWSA 4FJIA 3JS6A 3VEXA 4HHTA 4N41A 1JJ2M 5CY4A 2A40A 2AJQA 4A5AA 1FKPA 4KPYA 1WBBA 1C0GA 5BPMA 5EOYA 2HHSA 3D2EA 4MDAA 3DRRA 3M1FA 4YDUA 1VQLN 4CFCA 1T05A 2P9NB 3NVMA 2KHOA 3VESA 3O80A 1EP4A 3DJCA 4BRQA 3LWLA 3QEIA 3CD6N 3NGZA 3WXKA 3BUZB 2DFEA 3O4NA 2Y1JA 1RTIA 2GBZA 4FLWA 4DQRA 4CJSA 3THXA 4B9MA 1QSLA 1NGJA 3J7ZO 5AQYA 1C0UA 1RGIA 5AQHA 2F8SA 4YOTA 4CJ5A 3LP3A 1C0MA 3K9KA 5M1FA 4DQPA 3H08A 1RT4A 2BANA 1VSDA 1JXBA 5M1OA 1EX4A 1D5AA 3KVGA 1VSJA 2HHHK 4MFBA 4GW6A 1WAJA 2D0CA 1NK0A 5CYQA 3LZJA 3VEOA 4ISEA 3K59A 1BA1A 1QZ6A 3SPYA 4DR6K 4BWMA 1U6ZA 3UKUB 3HOSA 3AA2A 5LJVA 1RDWX 3PUFA 2VYPA 3AA3A 2FSNA 2Z1JA 3VEZA 4PKIA 3ULDA 4I9LA 2ZF5O 4IWVA 4CECA 3E1YA 3KK7A 4OGEA 3WNFA 2O8BA 1VSLA 1KVBA 3CQ8A 4N47A 5MLCQ 2HBJA 4O55A 1S5JA 4PL7A 2E88A 3S3MA 3KZBA 1YITN 2HHWA 2DPNA 5J2QA 4FWRA 5BRDA 3TAGA 2OZMA 4CJVA 3HRGA 1MU2A 3RVCA 1EWRA 3FGUA 4KV8A 3UKRB 5JLHA 1FW6A 4EAHD 4DU4A 1D9DA 3T19A 1U2VA 4BG8A 4AHRA 3MECA 2ZJQL 3O9QA 1RTDA 1NKCA 2R7YA 4CF1A 1K73O 3AGKA 2A1SA 3TSQA 3TTFA 1VSIA 3N4PA 4EHUA 3TWHA 3SV3A 1EO1A 1JXEA 3SAGA 2YX6A 3KK2A 3RWUA 4FWPA 4CK2A 5H1SQ 1CZBA 3H1VX 3K2PA 1DGKN 3L6QA 3M8PA 4FWMA 3ZT4A 4CD1A 3DM2A 1IBKK 3C6TA 1HQEA 1RBRA 2Z1IA 1SL1A 3T1AA 3LDQA 4ILGB 3RSEB 4IFEA 3MAQA 3C65A 4FJKA 1E4FT 5HRSA 3CM6A 3A0IX 3HT3A 3DI6A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WFB L;  1K73 O;  1JJ2 M;  1W2B M;  3CCQ N;  3CME N;  1M1K O;  5JVH L;  1VQP N;  4IOC L;  5H1S Q;  1Q7Y O;  2ZJR L;  1VQN N;  1YJ9 N;  1VQ9 N;  1OVY A;  3CC4 N;  1VQL N;  3CCL N;  3CCR N;  1VQO N;  1KQS M;  1VQM N;  3CD6 N;  1Q82 O;  3CCE N;  5HL7 L;  2ZJP L;  1VQ8 N;  4WFN L;  3J7Z O;  3DLL L;  5DM6 L;  4UY8 O;  2OTJ N;  5DM7 L;  1K8A O;  3G4S N;  1VQ6 N;  1YJN N;  3CCS N;  3CF5 L;  3CPW M;  3CC7 N;  1Q81 O;  3PIP L;  1YIJ N;  3CC2 N;  4WF9 L;  1VQ7 N;  1NJI O;  3G71 N;  5GAG P;  3CCM N;  1KC8 O;  4U67 L;  5GAD P;  1YI2 N;  3I56 N;  5GAE P;  4IOA L;  1QVF M;  1M90 O;  3CXC M;  3PIO L;  5JVG L;  1S72 N;  1YJW N;  5MLC Q;  1ILY A;  3CCJ N;  4IO9 L;  3I55 N;  3CMA N;  2QA4 N;  1YIT N;  1QVG M;  3G6E N;  1N8R O;  5GAH P;  3CCV N;  1VQ4 N;  1YHQ N;  3CCU N;  2OTL N;  4WFA L;  4WCE L;  1Q86 O;  1KD1 O;  1VQK N;  3OW2 M;  1K9M O;  2ZJQ L;  2QEX N;  1VQ5 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QIP A;  5AZJ B;  3QBX A;  1BQN A;  3HP6 A;  4CGH A;  5FPD A;  4E89 A;  2O8C B;  5JVH L;  4GNI A;  5ADX H;  4FWK A;  3E9L A;  4KI6 A;  1S1T A;  4DTS A;  3SMS A;  1CZA N;  4XEI A;  1NK6 A;  2YHW A;  3HJF A;  1NG9 A;  2V7Y A;  1IKW A;  4FM1 A;  4BRF A;  4FJJ A;  3ENB A;  4OPJ A;  2IDO A;  4B9L A;  3JSM A;  4KHW A;  3EZ5 A;  2A3Z A;  3AO3 A;  3EKU A;  4IKF A;  3ZSX A;  4CJE A;  2Q1N A;  3IS9 A;  4HUG A;  1QQN A;  3AVF A;  5HRR A;  3F73 A;  3RTV A;  3EL2 A;  1BG3 A;  3QIC A;  3KKR A;  3TTD A;  5BR8 K;  3NH2 A;  1HPZ A;  2PAV A;  4LSL A;  3VGK A;  4B1V A;  1YJN N;  2KTQ A;  3DLR A;  2V51 B;  4DV0 K;  1S6P A;  4W5O A;  3SMP A;  2FBT A;  1KTQ A;  1U04 A;  4K8X A;  4NO7 A;  2ASM A;  4CZH A;  4FJ7 A;  2Q0U A;  1BHL A;  4HUE A;  2KFZ A;  2QWP A;  3RMB A;  2HND A;  2XHB A;  4DFK A;  1UOC A;  3HZ6 A;  4OPK A;  4Q0B A;  5B8H A;  5GAD P;  3QEW A;  5AZI A;  3MXI A;  2E2P A;  4XH1 A;  4FJM A;  3OYL A;  3KTQ A;  1BQM A;  1P8Z A;  3CM5 A;  3SBT A;  2WUS A;  3ATU A;  4RW6 A;  4FJL A;  4GY2 B;  3OHR A;  5E84 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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