3VETA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with tobramycin, carbamoyl phosphate and adp
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
567
structure length
567
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
total genus 192
structure length 567
sequence length 567
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vetA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vetA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vetA03
1BG3A 3O1BA 4CD3A 5FPDA 3O5BA 3L6QA 4I6MB 4IO8A 2QM1A 3IFRA 3IMXA 3R6MA 3SK3A 3VETA 3ID8A 2ASOA 2V51B 2ZGZA 3MMVA 2A6AA 4H0VB 2ZF5O 5KQDA 4H5TA 5BPMA 3MCPA 2P9IB 1WUAA 2FSJA 4CBWA 3UB5A 3LDOA 5CE3A 3VGMA 3VEYA 1R59O 3FE1A 2AA4A 1H1VA 4FOIA 5AZIB 4DB3A 1GLFO 3HBTA 2A5XA 2VCPA 3GL1A 1JCFA 4M7YA 4BRPA 5BPNA 4XH5A 4BR2A 4BRNA 5FPNA 3M1FA 4BR4A 4CI6A 4BR7A 2HMPA 2P9SA 1BU6O 1C0GA 4AM7A 4RWTA 4ISFA 3H1VX 2E1YA 5AQTA 2VYPA 3TPQA 3CHWA 5LJVA 3QBWA 2ASMA 4PL8A 2P9NA 3L0QA 4YDUC 1KAXA 1BDGA 2EWSA 2IVNA 2D1KA 3I8BA 3AAQA 2CGJA 2QWNA 2GELA 3ULEA 3CJ1A 2Q0RA 4BROA 3DXKA 3CQYA 1GLEG 3A8YA 3H1QA 4FWOA 4K41A 4CZJA 4L3QA 4RCHA 2FF6A 1NGEA 1Z05A 5AQFA 2P9SB 2D0OA 4CBXA 3IUCA 4CZIA 4BRFA 2Q2RA 4H5VA 1QHAA 3R8EA 3FZHA 3QDKA 4FO0A 4EAHD 4A61A 1WOQA 2P9NB 2GWJA 2HOEA 4BG9A 1NGGA 4H5RA 3LM2A 3ZETA 3QBXA 2FSNA 3VEVA 3ULEB 3FZFA 2QWMA 4FWPA 4B9QA 3EO3A 4B1WB 3WQTA 4M63C 3HTVA 5AQXA 3UKRB 3LL3A 4BVPA 4JD2A 1EQYA 4GNIA 5BPLA 1QQOA 3QFUA 3D7EO 1NGBA 3WT0A 2GEMA 4MO4A 1ZXOA 3U9ZA 4WQ4C 3CJBA 4WQ5C 1S3XA 4BREA 5ELZA 2D0PA 1TUUA 2E8AA 4MLHA 1X3MA 4PL7A 4J8FA 1HPMA 4I6MA 2H3GX 3U4LA 4H5WA 3ATUA 3ZX2A 4CBUA 2ASPA 3LDNA 4K42A 1HX1A 3I33A 3ZETB 1NLVA 4IJAA 4BRCA 3ENOA 3SMPA 4FSVA 5E84A 4YDUA 4FWSA 4JD2B 2UYTA 4H5NA 4JNEA 2ZWHA 4K25A 1QQMA 2YI1A 5LY3A 3M3ZA 2QWOA 4XH4A 1T6DA 3ATVA 1DGKN 5EX5A 1HKGA 3LM9A 4BG8A 3C7NA 4BGBA 3VEZA 1Y64A 4CZFA 2CH6A 4MLEA 3IDHA 3EL2A 3CERA 4JAXA 5AFUA 4CZKA 2P9UA 3B8AX 1BO5O 2PBDA 3D2FA 4Y0WA 1OKJA 5FPMA 2V7ZA 1XC3A 2Q0UA 1GLJO 2QWQA 3HSCA 3KHYA 4RTFD 5AQLA 3SJHA 4DHYA 1J6ZA 3A0IX 1SZ2A 2YHWA 5AQZA 3O08A 4JHDA 5BRFA 4EIAA 3CJ7A 4AM6A 1X3NA 3HZ6A 2NLXA 3GOIA 4A2BA 1IJJA 1BA1A 2D4WA 3C0BA 5AQJA 3WXKA 4CJ7A 1NMDA 2FF3B 2Q1NA 5AFUH 5BN8A 3BEXA 3C7NB 4BQLA 3VF4A 2P9UB 1HKBA 4WQ4A 4WQ5A 3AARA 3D2FB 5FPEA 3WXJA 1TYQB 3VTHA 5AQGA 4ISGA 3ZX0A 4BC5A 3QFPA 3AY9A 5AQSA 2E2NA 3FZLA 2ITMA 3S41A 4FOEA 3AAPA 1ZC6A 4JHDB 4BRGA 4B1YB 4CD1A 5LJWA 2QW9A 1GLLO 2FLOA 1ATRA 2CH5A 2YCHA 3QB0A 3H6EA 3BF3A 1NGIA 3RSEB 5TKYA 5AQPA 2YHYA 3WXIA 2CGKA 3UKRA 5AQRA 1YVNA 1G99A 4HTLA 2I7PA 2IIRA 3VERA 5ADXH 5BRDA 2IVPA 3EKSA 3J8AA 5AQMA 3JS6A 3WEEA 4BRQA 2W41A 1GLBG 4JN4A 1Z6RA 3JXUA 2PAVA 4FWKA 3MK6A 4DCHA 2QWLA 3A5MC 3GDQA 1Q18A 2KHOA 3VGLA 4BR0A 3TTDA 3FZKA 4PKIA 1HJOA 3VEWA 2AP1A 4CZGA 5F2RA 3DWLA 1NGAA 3G25A 3QMLA 4B1XB 4Z94A 3VF2A 1YXQA 3QICA 2V52B 4MO5A 1T6CA 1YAGA 4F9OA 3HI0A 1HKCA 4H0TB 4M7XA 4BRDA 1ESVA 2ZGYA 5AQNA 3WEEB 3ENHA 4LC9B 3VGKA 5EVZA 4QS9A 5B8HA 1E4GT 4BC2A 3W0LA 3LDPA 3UKUB 2IVOA 1MWMA 2A40A 4NB4A 4NO7A 4XH1A 4DQ8A 1V4TA 5AQQA 1NGCA 2QWPA 4FWQA 3H3OB 3CIPA 3FGUA 4O5FA 3M6GA 2WUSA 3ZEUB 4B1UB 2A3ZA 5AQVA 3TTCA 3SLCA 2NZTA 3DJCA 1IG8A 2QWRA 5BN9A 1MWKA 3CJAA 5AZJA 3WUHA 2E2QA 1C0FA 1D4XA 4PKHA 1DEJA 4B1VA 1K8KA 1SAZA 1TYQA 3GG4A 1RDWX 2F9TA 3GE1A 3A5NC 3A5OC 2FXUA 3CI5A 1ATSA 3O6WA 5AQHA 1V4SA 3OHRA 3EN9A 1LOTB 3MN6A 4A62A 1U6ZA 1U2VA 4HWIA 2P9LA 1QZ6A 3CJCA 5AQKA 4EHUA 3RSEA 4BR5A 2I7NA 1JCGA 4BRHA 3TSPA 1BA0A 1X9JA 3LDLA 4FWMA 1ZBSA 2DPNA 5BREA 2OANA 1HLUA 4QS8A 3VEOA 5AZJB 3WQUA 2Q36A 1P8ZA 2V7YA 3KVGA 2VWBA 1ATNA 2E20A 1K8KB 5BRHA 4H0PA 1BWFO 3GBTA 4E1JA 5ADXA 5AR0A 1CZAN 3UE5A 3EKUA 2YJEA 4BRLA 1GLDG 1MA9B 1E4FT 3VF6A 3H46O 5I9EB 1SQKA 1BOTO 3WXLA 1U2VB 4EFHA 3MN9A 1RGIA 4KBOA 2P9LB 4FWLA 2GTDA 1NGFA 1NGHA 3FLCO 3F9MA 4EHTA 1MDUB 3MDQA 2CGLA 3MN5A 4O8KA 4BRAA 3P4IA 3O4WA 1S22A 2Q97A 4PKGA 1NM1A 2F9WA 3TU5A 3L4IA 4H0XB 3FZMA 4FPBA 3U8XA 3CJ9A 4FWRA 4BRKA 3VPZA 2P9PA 3TSUA 5AQWA 4C23A 1TUYA 1KXPA 2BTFA 3ZX3A 2W40A 3LDQA 4BGAA 2HF4A 3VESA 2P9KA 3D2EA 3O1WA 4FL9A 3UKUA 2A42A 4CZLA 3CETA 4IJNA 4A2AA 4K43A 5E26A 5AQOA 1GLAG 5JICA 5KPZA 3ZEUA 3TTFA 5AQYA 2QXLA 3U9DA 2A41A 5EXWA 3BF1A 1XUPO 2P9PB 3VEXA 3O80A 3FFKB 2FSKA 2E2OA 2E88A 3HM8A 5KPTA 3H45C 1HUXA 5KQ8A 1LCUA 3BUZB 1T44A 3DAWA 2HF3A 4IXCA 3DXKB 2P9KB 3D2EB 1YUWA 3CQXA 4IZ9A 1BUPA 3O8MA 4ISEA 1QQNA 5EY4A 4BR9A 3TSQA 3DXMA 4GY2B 3KZBA 5KPRA 2YHXA 3R9PA 1DKGD 2E1ZA 1JCEA 3EZWA 1NWKA 4WYBA 2E2PA 2BUPA 5AQIA 4BRIA 5F1XA 5JLHA 4H03B 2YJFA 1NBWA 1NGJA 5JLFA 3SMSA 2NRHA 3MN7A 4CZHA 4H0OA 1XQSC 4FWNA 4BQZA 3VENA 4FPAA 4BRMA 1GLCG 5EOYA 1KAZA 5BR9A 2P9IA 2J4RA 4B1ZA 1KAYA 2GWKA 1NGDA 5JMVA 3FR0A 4CZMA 5F0XA 4IWVA 3VOVA 5AQUA 4XEIA 4BC4A 4BVOA 5AZIA 4CZEA 2Q31A 4H0YB 1QZ5A 2GUPA 3DXMB 4QS7A 1RFQA 4BC3A 3BP8A 3W3DA 3H3NO 3A5LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJ3A 1BG3A 2HSTA 1KK9A 1KCFA 3L6QA 1G57A 2QM1A 3OYGA 3S3MA 3IFRA 3T19A 2YHBA 3IMXA 2O8EA 3TAFA 2ASOA 4FZYA 3HT3A 1JJ2M 3U3GA 3P39A 1BHLA 3BZCA 4IEEA 4YOTA 4JI5K 4FJHA 1WUAA 1S9EA 2E4LA 1RDBA 3M8RA 4DUZK 2F96A 3VGMA 3VEYA 2Y1IA 3SUNA 4DLGA 3KK2A 4FJGA 4CJTA 2A5XA 1JCFA 4KTWA 3L2RA 4LF8K 5FPNA 3FFIA 3HVRA 4MFBA 4BR7A 1QTMA 3V9ZA 3EYZA 1JXEA 5LMUK 5C0YA 4ISFA 4QOZB 3AVKA 4A57A 4JRQA 4PL8A 1BI4A 3HSTB 3L0QA 4KHSA 3O9SA 3I8BA 4ZHRA 2OPQA 5MLCQ 1JLAA 4HVJA 4LSLA 3HPOA 2HHTA 1U48A 1QVFM 4JKAA 5SWMA 4K41A 1C1CA 3OYEA 1S6QA 4L3QA 2NRWA 4LD0A 4DV0K 4I9LA 4Z4GA 1WB9A 4CGDA 2P9SB 4CBXA 3VQEA 3OYLA 4B9MA 3FZHA 3AVHA 1N6QA 3ZSYA 4KH5A 4AH9A 2P9NB 1HRHA 4FLUA 1MU2A 1NGGA 2JWLA 2HB5A 3LM2A 3ZETA 4DTXA 3QEWA 1HYVA 2YV0X 3ZT4A 4KTQA 3HTVA 4ZTFA 3UKRB 2VWKA 3LAKA 4PWDA 3KK1A 3TAQA 1NGBA 2KW4A 1W97L 1NKEA 3M8QA 2PY5A 1VQMN 4KFBA 4WQ4C 1NG9A 2UXDK 4JS4A 4O8UA 2P1JA 3SCXA 2ZJPL 1I3AA 4IDHA 4CFAA 3J7ZO 1HPMA 4I6MA 4CGJA 4DQPA 4CBUA 1HX1A 3I33A 1TVRA 4FSVA 4B8CA 4YDUA 4DSIA 2UYTA 4CVNE 2P5GA 2G8IA 2QWOA 1N34K 3QEXA 3ATVA 1DGKN 3O3FA 5D3GA 3LM9A 4BG8A 4BGBA 2HHVA 1Y64A 3VA3A 4UQGA 4MLEA 3IDHA 3EL2A 3CERA 2YNIA 4H8KA 3V9XA 1KFDA 1BO5O 1U4BA 3D2FA 4Y0WA 4KHPK 1OKJA 3TAGA 1XC3A 3AVGA 3NF8A 1IKWA 1LW2A 4JI0K 2WC9A 3TAEA 4CGGA 4LH4A 3O08A 4EIAA 2YNHA 1X3NA 1VSKA 3HZ6A 1BA1A 4CJ7A 3CFRA 1KLMA 3PO4A 2Q1NA 4FK0A 3I56N 3K5MA 4BQLA 4DS5A 2G8FA 1A5WA 2LSNA 1NK4A 3V81A 1HKBA 1C0MA 5HL7L 1Q9YA 1DTTA 5FPEA 1BIZA 4CEFA 5H1SQ 1X9SA 1TYQB 2DY4A 3VTHA 1TKSA 4ISGA 3VQBA 3QFPA 5AQSA 2OTLN 4Z4EA 2OZSA 3RRGA 1VSJA 4JK7A 3S41A 3CMAN 4JHDB 4BRGA 2HW3A 3U3YA 3NGYA 3RMDA 2F4VK 2QW9A 2CH5A 1OH5A 3QEPA 1RTIA 2PFUA 2VGNA 4NXNK 2D0AA 3RSEB 3OYHA 3HRGA 5AQRA 1K49A 4HUFA 3VERA 1Z26A 4NCGA 5BRDA 2UUBK 1WSJA 3EKSA 3MWTA 5FDLA 3JS6A 3LP1A 3WEEA 4WFBL 4X65K 4DU3A 3OYBA 3AA5X 4JN4A 4E7KA 1NJIO 4I14A 1B9FA 3MK6A 5CR4A 4DCHA 2QWLA 4DQQA 1JLFA 3A5MC 4CFDA 1Q18A 3VGLA 3TTDA 3FZKA 4PKIA 1HJOA 3AA4A 4KHUA 3T1HK 3DWLA 2ETJA 2BANA 2P51A 3NF9A 1JL1A 1KFSA 4Z94A 3T69A 3VF2A 4GKKK 2V52B 3SUQA 4P8JA 3C65A 4OKKA 1NK0A 1EWRA 4AHSA 3MXIA 4FVMA 3L3UA 2O8FB 4CJEA 5E41A 4P8EA 1A5XA 4NO7A 3VQ4A 4XH1A 3IS9A 3MX5A 4JKHA 4PQUA 1NGCA 1VQ8N 1K4PA 4JKFA 3ZEUB 4IG0A 4EP5A 3CCMN 4B1UB 4ILGB 3G0ZA 3EY1A 5JS2A 4F4KA 2YKNA 4WF9L 4K8XA 3CQ8A 4PY5A 5I42A 1CLQA 2QWRA 4CCHA 5AZJA 4PKHA 4B1VA 4OKEA 3GG4A 2F9TA 3O6WA 1V4SA 1VSIA 1YHQN 3CCSN 4A62A 1VRUA 4HWIA 2XY6A 2P9LA 3L3VA 4DG1A 4X64K 4FM2A 5AQKA 4J2EA 4YOVA 1U49A 1BA0A 1X9JA 1JLQA 3SV4A 2XHBA 2DPNA 2OANA 1HLUA 1VK0A 4LY7A 1FXXA 4M41A 2EHGA 3KVGA 3SJJA 5HP1A 2VWBA 4F2SA 4CF1A 1ATNA 1ZBIA 3R1XA 5C42A 3PY8A 1OVYA 4DTUA 4H0PA 4E1JA 5HRRA 4WE1A 5C12A 2HHQA 3CFPA 1UOCA 1RDDA 1SS6A 3Q7CA 4BE0A 1GLDG 1E4FT 1SQKA 4FJKA 1C0UA 4E19A 1U2VB 5LMNK 3MN9A 1S1TA 2DFEA 1TKDA 1NGHA 4EHTA 4CEBA 3EE9A 3MN5A 4KB0A 1BIUA 4BRAA 2DTUA 1K6YA 1S22A 3O4WA 2F9WA 3DLRA 3AA2A 3FZMA 3SQ2A 3CJ9A 3HPHA 3SQ0A 5AQWA 4KHWA 5FROA 1TUYA 1YITN 3KKSA 3ZX3A 1SUQA 4CFCA 3IG1A 4C8OA 2HF4A 5J2PA 3D2EA 3UKUA 1J5EK 1QQCA 4CJVA 4O0IA 3N4PA 4CHPA 2OCEA 2KQ2A 3ZSZA 3CETA 4DR2K 4BE1A 4ID5A 4MQ3A 4A5AA 1QS4A 4K43A 2BDPA 3VQCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4FLW A;  4IOX A;  1U47 A;  4QS7 A;  1RFQ A;  3RRH A;  3H3N O;  1DLO A;  3A5L C;  2HBM A;  3O1B A;  2G8H A;  1QSY A;  1I39 A;  4CED A;  4CEC A;  4IO8 A;  4EZ9 A;  2O4G A;  4M3T A;  2V51 B;  2ZGZ A;  1TKZ A;  1YTU A;  2A1R A;  2RKI A;  2ZF5 O;  3MCP A;  2P9I B;  5JS1 A;  1NKC A;  3PSI A;  3OJU A;  3FE1 A;  2AA4 A;  5AZI B;  5BR8 K;  1BCO A;  1GOB A;  4CIE A;  1VQP N;  3GL1 A;  4CF2 A;  4CK3 A;  4BRP A;  5BPN A;  3J80 O;  4BR2 A;  1QVG M;  4JKG A;  2O8E B;  1XC9 A;  3WNG A;  3NH2 A;  5CZ1 A;  3LQU A;  1C0G A;  3VQP A;  4CHZ A;  1Q9X A;  4FM0 A;  2E1Y A;  3CPW M;  2VYP A;  4HHT A;  1J9A A;  1VHX A;  2ASM A;  3QBW A;  2VQE K;  2EWS A;  2NNW A;  1OH8 A;  3AAQ A;  1RIL A;  5GAE P;  1K8A O;  2E6L A;  2IGI A;  3CJ1 A;  3NMU A;  4FFJ A;  4BRO A;  1TAQ A;  4CGF A;  3H1Q A;  4LF4 K;  4CZJ A;  1KVC A;  3LWM A;  2UUA K;  3VQ7 A;  4RCH A;  2FF6 A;  4DR7 K;  4JI2 K;  1LWC A;  2QKB A;  3D45 A;  3CFO A;  4BRF A;  2Q2R A;  4H5V A;  2BGG A;  3R8E A;  3QDK A;  1BQN A;  4EAH D;  4MDA A;  3RR8 A;  1BI4 B;  2ZD1 A; 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 2YKM A;  1TK8 A;  5EVZ A;  4QS9 A;  2ZE2 A;  5C10 A;  3OYD A;  4DTM A;  3KKR A;  2IVO A;  2A40 A;  2BE2 A;  4BDZ A;  4DQ8 A;  4KKO A;  4HCC A;  3CCR N;  2O8B B;  4FJM A;  3H3O B;  4O5F A;  2WUS A;  3PIP L;  4LF7 K;  3KLH A;  3UIQ A;  2DFF A;  3SAF A;  4G9Z A;  3S3O A;  3TTC A;  3AVA A;  3L2U A;  4CK1 A;  4P6P A;  3DJC A;  5M1P A;  1IG8 A;  3CJA A;  4JI6 K;  1RT2 A;  1D4X A;  2O8D B;  1DEJ A;  3LPT A;  1K8K A;  5KI6 A;  1SAZ A;  3AVJ A;  4LFC K;  3GE1 A;  3A5N C;  3A5O C;  1FJG K;  3RR7 A;  5AQH A;  4C1N K;  3ITH A;  1LOT B;  4H4O A;  4XIU A;  1F21 A;  1O13 A;  3OJS A;  4KRE A;  2XRI A;  1N36 K;  4YNQ A;  4BR5 A;  3QLH A;  3SNN A;  3ZT0 A;  1KLN A;  3VA0 A;  5EU7 A;  4RW8 A;  3C6T A;  1CZ9 A;  5T7B A;  5AZJ B;  3WQU A;  2Z1I A;  5GIN A;  2E20 A;  3KLG A;  3GBT A;  3ALY A;  5ADX A;  2QKK A;  1VQ9 N;  3UE5 A;  3EKU A;  4BRL A;  1MA9 B;  3VMF B;  4IO9 L;  3H46 O;  4E1M A;  1Q86 O;  4JYA K;  4C8N A;  3OYC A;  3ZSO A;  4EFH A;  2WFB A;  1RGI A;  4KBO A;  3SPY A;  2P9L B;  1KVB A;  4FZZ A;  4FW2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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