4ILHA

Crystal structure of an aar2p c-terminal deletion mutant in conplex with prp8p rnaseh
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
GAMNSSNYAELFNNDIKLFVDDTNVYRVTVHKTFEGNVATKAINGCIFTLNPKTGHLFLKIIHTSVWAGQKRLSQLAKWKTAEEVSALVRSLPKEEQPKQIIVTRKAMLDPLEVHMLDFPNIAIRPTELRLPFSAAMSIDKLSDVVMKATEPQMVLFNIYDDWLDRISSYTAFSRLTLLLRALKTNEESAKMILLSDPTITIKSYHLWPSFTDEQWITIESQMRDLILTEYGRKYNVNISALTQTEIKDIILGQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Pre-mRNA-splicing factor 8
publication title Structural basis for the Aar2p-mediated regulation of Prp8p interactions with Brr2p and U4/U6 di-snRNA
rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Splicing
total genus 88
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.80.40 Mainly Alpha Up-down Bundle Acyl-CoA Binding Protein Acyl-CoA Binding Protein 4ilhA02
3.30.420.230 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ilhA01
4JKGB 3E9LA 4JKBA 4JK7A 4JK8A 4JKDA 3SBGA 4JKHA 4JK9A 3SBTA 3ENBA 4JKCA 4ILJA 4ILHA 4JKAA 4JKFA 4ILGB 4JKGA 3E9PA 3E9OA 3E66A 4JKEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TTFA 3IAYA 2FJ9A 1ZXOA 1QQMA 2Z1JA 3CHWA 4FWQA 4BGAA 4BRIA 3LDSA 2D0CA 1EP4A 1YVUA 1M1KO 1JL1A 4HUFA 2F8TA 1ASUA 2QWNA 3WNFA 4LH5A 1VQ8N 1D5AA 1RBUA 5HRPA 3L8BA 3OYDA 4IDKA 4CJEA 4B9LA 1S9EA 3AVHA 2Q36A 4M3YA 3T3FA 4C23A 2O8BB 3I8DA 5C2DA 4FJGA 1RT6A 1IBKK 1A5WA 3AGRA 5EXWA 3LWLA 3C7NA 1T05A 3CI5A 4FLZA 1ZBHA 4DQRA 1SL2A 5M1FA 4Q5VA 4CHYA 2ITMA 3CFPA 2JWLA 2HHVA 1NJYA 1E5WA 3MXMA 2O8DB 3AGKA 2VGMA 4FJ7A 1WBDA 1UAXA 3HPGA 3DM2A 4AHVA 1K8KA 3TTDA 3SNNA 4FJIA 3GBTA 4CK3A 4O5FA 1EWQA 2YHBA 2KFZA 1RBSA 3VEOA 5AQUA 3QIJA 1HBKA 1X1PA 4G9ZA 1GC6A 4AILC 1BQMA 5AZJB 2Z1HA 4RW7A 3OYBA 1LAVA 4CJSA 3ULEA 3P31A 3VQDA 3CC4N 5J2MA 4RTFD 5F1XA 4CVNE 4FOIA 4CZLA 1BIUA 4PKGA 3AA2A 1IV0A 2WFBA 3C0BA 4I7FA 4BRHA 1W7AA 3CC2N 4BRPA 1T6CA 1HNVA 3ZEUB 1YIJN 2OZSA 3J81O 2PY5A 3NH2A 1BISA 1NK9A 4BQZA 2YVCA 4RWTA 3X23A 1BU6O 4CI6A 5DM7L 4DFMA 2NNWA 3DOLA 4JD2A 5C10A 3ZSVA 4WQ4A 2PYJA 3VQ9A 4BGBA 5E41A 5GINA 1HB8A 1IH7A 5BRDA 3NVMA 5AJ3K 4Z4GA 2YHYA 1HKCA 4OO1J 2P51A 5KQ8A 1HPMA 4AQYK 4DV0K 1L3VA 4TKNA 4P7IA 4BE1A 1KQSM 4B08A 1OH6A 3LDLA 2E6MA 3SUNA 2DY4A 5D3GA 2QI2A 2P9SA 2D0BA 4IJNA 3NF7A 2YKNA 3RMBA 1VBHA 1J19A 4MO4A 4BDZA 2FSNA 1XMOK 3GE1A 4IJAA 4E0DA 1QVGM 2GTDA 1TK0A 4CHZA 3TR8A 1LW0A 3V81A 4AHSA 2ZQBA 4DMNA 1Q7YO 3H45C 4EAHD 4ISFA 4JRQA 1MA9B 4OGCA 2QWOA 4WYBA 4CF0A 5FROA 4CIFA 3LPTA 5TKYA 4NCAA 4ZTJA 2A1RA 3QNNA 4I9LA 1C0UA 4V19S 3HL8A 1C1AA 1XMQK 3A5MC 4KTWA 2HHQA 3PLAA 4KB0A 2ZF5O 4U67L 3T1YK 2NLXA 4DXAB 4IEIA 3CMEN 3MXIA 1T3VA 1OH8A 4JKGA 1BL3A 1SV5A 1X3NA 5AFUH 3O1WA 5FDLA 1NMNA 2KQ2A 1VSFA 3KK7A 5JVGL 5C0YA 4JN4A 2H3GX 2I7NA 3JAMO 4HDOA 3BZKA 1C0GA 2XY7A 1N34K 2HNZA 4Z4CA 5AQQA 3SCXA 3T1HK 3THYB 1U2VB 2YI1A 3MEEA 3HPHA 4HTLA 4E19A 4CEDA 1L5UA 1L3UA 2RN2A 3L4IA 1K73O 2AA4A 1QZ5A 3H6EA 3JXUA 5C15A 3LAKA 4KO0A 4DCHA 3A5NC 1TKDA 3C6UA 4FJLA 2HMPA 4HCBA 1HNWK 3QERA 1RNHA 5BRFA 4HHTA 4YHHK 2FBTA 3T69A 1VSLA 1QSLA 2VQFK 4ILGB 4K41A 2CH6A 1MWMA 2I7PA 2UUCK 3GL1A 3DLRA 4MO5A 1HB6A 4KH5A 3QFUA 1B9FA 3FZHA 2QKKA 1GGOA 2YKMA 4EFHA 4EHUA 4JI5K 4KHPK 4BY9C 1KTQA 2HE7A 5AFUA 3L0QA 1KLMA 4B9VA 4F8RA 4JLHA 1EKEA 3RSEA 4IFVA 1S1UA 1QZ6A 1BQNA 4U7BA 4O4GA 1RDAA 4DR7K 2QXFA 2P9PB 4WCEL 1VK0A 4MFBA 5CE3A 2UU9K 3J80O 1MK7B 2O8EB 3MN5A 3SK3A 4QAGA 2CH5A 3AVCA 4YOUA 3MDQA 1QS4A 4AH9A 4KBOA 2HB5A 1HPZA 5HRSA 3C6AA 4FWRA 3ZYYX 4CEZA 3KLFA 2NUBA 1RT2A 3VQ7A 4PL8A 3J8AA 4FM1A 3ENOA 3MN7A 3TAPA 3CFRA 4LSLA 4KHUA 3LANA 1I3AA 2HHXA 2CGLA 3P39A 4NO7A 1NGHA 4IFYA 1J5OA 5LJWA 4DTOA 3SPYA 4E7HA 3FLCO 4CJRA 2ZGYA 1SGHA 3TSPA 4Y0WA 4LF4K 4CJ4A 4YOVA 1ACAA 2BGGA 4AM7A 4LFCK 3MEGA 2VCPA 1ASVA 3RR7A 4QS7A 3ZX3A 2ABDA 3MXJA 4KV8A 3EN9A 5AQNA 2HVHA 1IO2A 3ID8A 1R0AA 2YNFA 1UWBA 3UKRB 2XY5A 2NRZA 3U3YA 4JKDA 3KJVA 4FJ8A 3QMLA 4FZYA 3DYAA 1NOZA 4CJ7A 4CE9A 4DF8A 1NJWA 1W97L 3V9UA 4BG8A 1VAZA 2FSJA 3CCQN 3I33A 1NGJA 1DLOA 2HHUA 2P9KB 2F96A 4O8KA 5BR9A 4JEPA 4CF2A 4HVJA 5HOOA 4E7LA 3DLHA 5AQHA 4QS8A 1J5EK 4FCYA 3U6FA 2YHAA 5AQYA 1FXXA 5AQGA 3WEEB 3V1QA 4KREA 2J0KA 2D0AA 2IOCA 3Q7BA 3ENBA 4QOZB 2Q0UA 1EX4A 3OBWA 3RMDA 1SKRA 3G6EN 2O8CB 3IKMA 1OH5A 4CJKA 4WQ5A 4DSIA 3SQ0A 2HMIA 2KZZA 4FOEA 3DMJA 4CZHA 2EHGA 2DFEA 3WNEA 4GV9A 3CIPA 1X3MA 4CECA 1KAYA 4FPAA 4R79A 2OZMA 3L2UA 1MU2A 3LDOA 4GV3A 2CGJA 4I2QA 5A2QO 1IKYA 3O5BA 5CZ1A 2PBDA 1GLEG 2XY8A 3JSMA 3ZSRA 4LC9B 4B9UA 2YX6A 4CHQA 4OGEA 2ITGA 2F8SA 1VQNN 1NBWA 4ELUA 4I2PA 3OYFA 5AZIB 3VQQA 3CQYA 3TABA 1QSSA 4HCCA 5JMVA 3TTCA 4ILJA 4M3TA 1C0FA 3ZETA 3OYEA 1S5JA 4ICLA 3JS6A 1NGBA 4KHQA 3NFAA 3S41A 4Y1DA 3OS2A 4A61A 3G9WA 3BEXA 2OTLN 3VEYA 1OH7A 1BG3A 4BR9A 3A5OC 3ZT2A 4PHTX 3C6HA 4GW6A 4JI3K 4C8LA 2RE2A 1T7PA 2Q97A 2F9TA 3HP9A 3SZ2A 1RDBA 1BO5O 1QSYA 4JKBA 2KFNA 2CQUA 1CZAN 1BI4B 1JLBA 1WN7A 4AHTA 4IDHA 3E01A 1NGIA 4CEAA 3M8SA 3VERA 3N4QA 3U7DA 2E20A 1GLBG 4W5QA 1N5YA 4FK4A 3I55N 4M7XA 2Y1IA 3TWHA 4I6MB 2YCHA 3TANA 5BN8A 4GVEA 3BZCA 4BC2A 3SAGA 3NH0A 4BR2A 1N36K 5IWAK 3RMAA 2IVPA 5IJMA 4FLYA 1NNEA 4K0KK 4Z0UA 3QDKA 1HLUA 2NZTA 1NK8A 3A0IX 2KHOA 4NLCA 4JYAK 1IJJA 2CB8A 4B3OA 3I0SA 3M1FA 1HKGA 3QEIA 3K59A 2HVIA 1TK8A 2I1KA 4BWMA 4DFKA 4B3TK 3R6MA 1QHTA 4K43A 2W6KA 2VG7A 4EP4A 3DXKB 2P9IB 4B9TA 2WC9A 1Q9YA 3G25A 1WUAA 3LM9A 4CJPA 2WTUA 1NJIO 4IEEA 1KBLA 4ELTA 4XH4A 2IIRA 4BG9A 1H1VA 1P90A 2VGNA 3CJ1A 3AVAA 4FPBA 1QE1A 2OPSA 4KHWA 3EY1A 3THWB 4FWKA 5AQIA 2UYTA 5FLXO 4FLXA 2E2QA 3DLKA 1ST7A 4FLVA 4JI7K 1YAGA 1C1BA 4KHSA 1T44A 2Q1NA 5KGWA 5AQFA 3K5MA 1JKHA 3OYCA 3IVFA 2ZM6K 1G15A 1HNZK 2RPIA 1NKBA 2GELA 2QTDA 4FVUA 4EZ9A 3EPYA 3U4LA 2EWSA 3OYGA 2QWLA 2BTFA 2E8AA 3L6QA 1YF5L 5HBMA 1XI1A 4JS5A 3FR0A 1YVNA 3EYZA 1K8AO 1NGAA 1A5VA 1Z25A 4BACA 3DRSA 3CCJN 4GY2B 2YNGA 1D4XA 4OPHA 2V7ZA 2BE2A 5ADXH 1NK4A 1GLAG 1NU0A 3G0ZA 4JK8A 4H5NA 2QA4N 3PX4A 1Y97A 4JD2B 2COPA 5H1SQ 1WNSA 2GEMA 2EX3A 3L4QA 4I9QA 3NVKA 1NKEA 4H0XB 3D0PA 3CMAN 4JKAA 3SQ1A 4DV7K 1SAZA 3UKUA 1BHLA 5C25A 2QW9A 4N47A 2QXLA 3ZSXA 4DKWA 3QO9A 4UY8O 4CGGA 4DSLA 1BA0A 1TK5A 4M42A 4YORA 4EIAA 4DS5A 4A2AA 1U49A 3D2EB 1NG9A 1LWCA 3LL3A 4E7JA 2VG6A 5AQOA 1QQOA 3CCUN 4C8OA 4DTSA 3LPUA 3K2PA 3VETA 4CW7B 3D2FB 2KZMA 1YHQN 4BRGA 3J7YP 1R59O 4FO0A 4CZFA 3M8QA 4TSXA 4FZZA 3L2RA 3VQAA 1G99A 4JI4K 3IRXA 4A62A 3UIQA 3BDPA 1VRTA 1W2BM 2P5OA 4FVMA 4JRPA 3KIOA 3V1OA 4DU1A 1X9MA 3ID6A 3HT3A 3M3ZA 1TUYA 3HZ6A 4O0IA 1JLAA 3O4WA 4ILHA 1QHAA 1DEJA 3SYZA 1U4BA 5FRNA 3OVNA 2XRIA 4KHNA 4IO9L 5CYMA 3MAQA 3S3MA 4Z94A 4N5SA 4H0VB 2Q2RA 4JKEA 1UOCA 4Z4IA 3EE8A 4CHNA 4IOCL 1GLCG 2FXUA 1Y19B 2LSNA 3O9UA 1NTIA 3T19A 4BRMA 3HSCA 3DRRA 3CF5L 1OVYA 4DU3A 1SKWA 1QQNA 3ASMA 4FJXA 3DXMB 2QEXN 2A3ZA 3U9DA 1QQCA 1M90O 4ISGA 2D11A 1NGDA 3HK2A 2JLEA 4FM0A 4B9MA 1CLQA 1DKGD 4JS4A 1NOYA 1VSEA 2HHSA 2GBZA 3CCMN 2E6LA 4K8XA 4X64K 4DV3K 1Y64A 5IT9O 4H0PA 1VQ5N 3BUZB 2HF4A 1KCFA 2R82A 5EVZA 4CFDA 3P1GA 3V9ZA 4CZIA 3PY8A 3D7EO 3AVKA 3AA4A 1ATNA 5C42A 3TPQA 2UUAK 4CHPA 4CJ5A 3PSIA 4BRAA 5KTQA 5M1PA 4UQGA 2D0OA 3VGLA 2HBJA 3AVLA 1Z26A 4EHTA 2GV9A 1KFSA 1ATRA 3O6WA 4CGFA 3ENHA 1RCHA 3PZDA 2J0MA 5KPTA 3HOSA 1X9WA 4CJTA 3F9KA 3Q7CA 3NDKA 3O9TA 4A57A 2O8BA 4DHYA 4ID1A 2A41A 3H1VX 4CESA 1CZBA 2UXBK 3LZJA 4AHCA 5EU7A 1S1XA 4O8UA 1RT4A 3TAMA 1ZBIA 2D1KA 4FW2A 1S1WA 3AU4A 3L3UA 1ESVA 2EMSA 1SL0A 2HHWA 3VQ8A 5EOYA 4ZRJA 4DTRA 2HBMA 3VQ6A 1ZBLA 4FJMA 3AO3A 2BANA 1IKXA 4JAXA 2ETJA 2O8DA 3MN6A 4BQLA 5HP1A 2VYPA 3TU5A 2UXCK 2OYQA 5I9EB 5AQTA 2ATQA 3CXCM 5AZJA 4ZHRA 2NRVA 1RT7A 2PZSA 4DB3A 1SL1A 4Z4HA 5JVLA 3VQPA 1EWRA 1NK5A 3QINA 4CGHA 3QEVA 3SJJA 4KAZA 4HUGA 1WSFA 3CQXA 1Q86O 1OKJA 4CFBA 5J2NA 3CFOA 3CCEN 1JDEA 3UB5A 4E3SA 1Z6RA 4DTPA 3ZEUA 2KKZA 3DLEA 3LWMA 1MWKA 2A1SA 4FLTA 4E89A 3MWPA 4IOAL 3DRPA 1BWFO 4CK1A 2E4LA 3K9JA 2JWKA 5HL7L 3HYFA 2HW3A 4LH4A 1GOBA 3O3GA 2P9NB 1FW6A 4JKFA 3A2FA 5FRMA 1DGKN 1Q81O 2P5GA 1JCFA 3S3OA 2I5JA 2A5XA 5TKWA 4DTMA 1I94K 1RTDA 4K25A 4EZ6A 3O3HA 3ITHA 4JHDB 1HJOA 4DTUA 1VSMA 1TVRA 3WQTA 3QEXA 4MQ3A 3CPWM 2X6NA 3KVGA 4IFEA 1Q9XA 4DSEA 3V9XA 4H0OA 4J2EA 2Q0RA 2DFFA 4FWNA 1UA0A 3D45A 3OJUA 4DUZK 3O1BA 4AF1A 1U48A 1S6QA 1JLGA 2D2QA 2NRXA 1WB9A 3ZT3A 3JYTA 2NRTA 1MK9B 1HQUA 4BR4A 2FBXA 1XNQK 5GAGP 1NGGA 2G8VA 1B9DA 3QIPA 1NM1A 4B1XB 1YITN 3B6PA 4LFBK 3LDQA 4H5VA 5BN9A 2Z1GA 3MCPA 4OVLA 1IBMK 1GLDG 3TAEA 1KD1O 1HKBA 2X78A 1SS6A 3CM5A 4OX9K 2P9UB 1Q18A 1RTJA 4DSFA 3DLGA 3KZBA 3SQ2A 1CXQA 5E84A 3CCSN 5BR8K 3AO5A 5HROA 2X6SA 3ISNC 4CJUA 1RT3A 3AV9A 1WAFA 3OYMA 4KI6A 2YHXA 3THVA 2ZJPL 3KKSA 3EZ5A 4NB4A 1U6ZA 2P9LB 4B1VA 2WONA 1NJZA 1HQEA 4DFPA 1GOCA 3KK1A 3E9PA 3THXB 4M7YA 3V1RA 3THYA 1U2VA 2FLOA 5KPZA 4DSJA 1LWEA 2DFHA 4QS9A 4CZEA 3OYAA 1VQ9N 1GG3A 4C8KA 3AARA 1W9HA 3VTHA 1RILA 4JKHA 3B6OA 3CERA 3TSUA 1RGIA 3DLBA 5BPNA 5F2RA 3VQEA 3H3NO 4CBXA 3MX5A 4DS4A 1KRPA 1S22A 2FDQA 3CCRN 3RWUA 2WBNA 3VEWA 4DWIA 3NAEA 4FJ5A 5HRNA 4LF6K 1JXBA 3LP1A 2VWKA 1NK0A 3TI0A 3PIOL 1L3SA 4DR6K 2HOEA 2LBBA 4PQUA 3LZIA 3U8XA 2E1YA 1NGEA 3RVCA 3QESA 3NF8A 4YY3K 4J8FA 3TAQA 1TKXA 3O3FA 4H4OA 4DR4K 4G1QA 1S3XA 1NI2A 2YNIA 5KI6A 3VEVA 1N33K 3G4SN 4B9SA 4FJKA 4BRKA 1U47A 4KRFA 4GV6A 4DF4A 1RT1A 4C8NA 4OJRA 1HRHA 4A59A 3VF4A 5AQMA 3VGKA 1XC9A 4CF8A 1RBRA 2E1ZA 4BRCA 4NXMK 4PL7A 3NH1A 2FSKA 2P9PA 3WXMB 3CG7A 3HO1A 3J7ZO 1JLCA 1XQSC 4LF8K 3KK2A 1Q8IA 1RTHA 4FSVA 5M1KA 1EO1A 4FK2A 1YTUA 1K6YA 1Q82O 4B3MK 2O8EA 1XHZA 4NXNK 1IBLK 4ISEA 1L3TA 4FJNA 3SJHA 1TV6A 2F4VK 5B8HA 5C12A 1VQ4N 4B3RK 5J2QA 3HI0A 4NCGA 1DT9A 2ASMA 3VQ4A 1TYQB 3MEDA 3LP0A 5HLFA 4CZJA 3RRHA 1MIXA 5GIOA 2XHBA 4KTQA 3ZSYA 1GLLO 4B9NA 3C95A 1KLNA 1RDDA 2RKIA 1D9FA 2ZE2A 4YDUC 2YV0X 3SBGA 5M1NA 2OCEA 2W42A 3KD5E 2AJQA 1WSEA 4HUEA 3T7ZA 3K5LA 3CJAA 4KFBA 3S3NA 4Q0BA 4CJWA 3N4PA 2X74A 4CZGA 3FGUA 2ZJRL 1EXQA 1NK6A 1VQLN 4BDPA 3GOIA 5LL6Z 4YOWA 4NCBA 1KFDA 2VG5A 4LSNA 3QB0A 2IAJA 4QCLA 4ZRKA 2O8FB 1BOTO 1JCGA 1DIKA 2QM1A 3G71N 3CYMA 3HTVA 5DMRA 3WA0A 4OKEA 4OPKA 4IG0A 2G8IA 4DQSA 1TL3A 1I39A 1VQPN 3CETA 3TAGA 4FLUA 4FM2A 2P9KA 1TUUA 5AQKA 1WBBA 1HX1A 3HM8A 4K8ZA 3WNHA 3CJBA 5FPMA 4FWOA 4KKOA 3ZSOA 4F7GA 3VGMA 4L8RB 5M1QA 3NF6A 2E2PA 3PX0A 4MDBA 1D8YA 3WEEA 5J1EA 3WXJA 2Q31A 5JS2A 4IXCA 1NGCA 3W0LA 2HBLA 4CEBA 3EE9A 2QWRA 2O8CA 5BPLA 4M3WA 1EQYA 2OANA 3KD1E 4LY7A 2ASOA 4BC4A 3C7NB 4CGIA 3K5NA 4OLBA 3TAFA 4DR1K 1HNIA 4W5OA 1HYZA 4WFNL 3SUOA 3H08A 2QK9A 1B92A 3EKSA 5LY3A 3KWIA 4CGDA 4N56A 4GKKK 4CFAA 4YL8A 4GXBA 5AQLA 4E1NA 3SQ4A 1LV5A 4M3ZA 2J4RA 4JI2K 1BIZA 4R5PA 1K8KB 5DM6L 4X66K 1NGFA 1H4RA 3I8BA 5AZIA 2ZPYA 5AQVA 1HR0K 3FFKB 4FWPA 3AO4A 2BDPA 1ITGA 1C0MA 3WXKA 4CJ3A 4DV2K 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 4JKG B;  3E9L A;  4JKB A;  4JK7 A;  4JK8 A;  4JKD A;  3SBG A;  4JKH A;  4JK9 A;  3SBT A;  3ENB A;  4JKC A;  4ILJ A;  4ILH A;  4JKA A;  4JKF A;  4ILG B;  4JKG A;  3E9P A;  3E9O A;  3E66 A;  4JKE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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