4ILHA

Crystal structure of an aar2p c-terminal deletion mutant in conplex with prp8p rnaseh
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
GAMNSSNYAELFNNDIKLFVDDTNVYRVTVHKTFEGNVATKAINGCIFTLNPKTGHLFLKIIHTSVWAGQKRLSQLAKWKTAEEVSALVRSLPKEEQPKQIIVTRKAMLDPLEVHMLDFPNIAIRPTELRLPFSAAMSIDKLSDVVMKATEPQMVLFNIYDDWLDRISSYTAFSRLTLLLRALKTNEESAKMILLSDPTITIKSYHLWPSFTDEQWITIESQMRDLILTEYGRKYNVNISALTQTEIKDIILGQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for the Aar2p-mediated regulation of Prp8p interactions with Brr2p and U4/U6 di-snRNA
rcsb
molecule keywords Pre-mRNA-splicing factor 8
molecule tags Splicing
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 88
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.80.40 Mainly Alpha Up-down Bundle Acyl-CoA Binding Protein Acyl-CoA Binding Protein 4ilhA02
3.30.420.230 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ilhA01
3SBTA 4JK7A 4ILHA 3E9PA 3SBGA 3E66A 4JKGA 4JKFA 4JKBA 3ENBA 4JKEA 4ILJA 3E9OA 4JKGB 4JK8A 4JKAA 4JKCA 4JK9A 4JKHA 4ILGB 3E9LA 4JKDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NMUA 3AVKA 1N8RO 1SL2A 2ZGYA 1KBLA 1C1AA 1HQUA 4FM2A 1XQSC 1GLAG 3ZLJA 4EP4A 1V4SA 1CLQA 1WSEA 1HQEA 1A5WA 5B8HA 4DR5K 4DR6K 1HRHA 4CJEA 4L8RB 3AVNA 1XHZA 3G6EN 4YL8A 4OGCA 3ZEUA 3RMDA 4IG0A 2FXUA 5BPLA 4DR2K 2HHSA 1RT1A 3KIOA 4IG3A 1DIKA 3I56N 2WC9A 4KB1A 3WT0A 4F4KA 4OLAA 3KK1A 3EZWA 4FM1A 3EYZA 4JKFA 4ID1A 3OW2M 4CFDA 3ASMA 4WE1A 4CZJA 4W5TA 1HB6A 3THWB 4JI5K 2P1JA 1NGIA 1VSIA 3DRRA 3SQ1A 2E2PA 4M3XA 3VQ7A 3PSFA 4LSLA 2D2QA 3EKUA 3V9WA 4FLYA 3VMFB 3R1XA 4CJFA 1Y97A 2R82A 3CJCA 2HVHA 1GOAA 1RT6A 2Z1GA 4BQZA 4FJJA 2I5JA 4YFUA 4GW6A 4H5WA 4FLZA 1HPMA 1X9WA 1EX4A 1HYSA 3FZLA 3NF7A 4E1NA 1WLJA 2Y1IA 4WQ4A 4JI7K 4IOCL 1Q9XA 1NGDA 1SZ2A 4OKJA 1QSYA 2PFUA 1Z25A 3QIOA 1C0FA 4BC5A 3A0IX 1YVUA 2G8IA 3CIPA 3KLGA 4B1WB 4TSXA 3HBTA 4BGBA 3W3DA 4KAZA 4DTMA 4BDPA 1D9DA 1KAZA 3O6WA 3L2QA 3SV4A 3QEVA 2NRVA 2YHYA 3VEOA 1JLCA 2QWMA 3M6GA 4JKEA 4BWMA 2BANA 4CEOA 3N4QA 1JXBA 2GUPA 3AA5X 3B8AX 2FBYA 4DUYK 4AHTA 1IBMK 1EWQA 4QS9A 4OO1J 2GBZA 3CD6N 3R6MA 3I55N 1LWEA 4M3YA 3ULEA 3NF6A 5AFUH 3K2PA 2IOCA 4I6MA 3VF4A 4CHNA 1VRUA 3U3GA 2LSNA 4FK4A 2HB5A 3VQQA 3F73A 2IVNA 4O4GA 3HK2A 3U8ZA 4AQYK 2XRIA 2FF6A 3HPHA 2O8CA 2RKIA 1KXPA 2HE7A 3NH2A 1L3VA 2XY8A 3ID6A 4N47A 3VENA 3THVA 5DM7L 4BQLA 4FK0A 4OLBA 4OJRA 2V7YA 1HLUA 3JYTA 3L4IA 4CZMA 1ILYA 5KQ8A 2XY6A 1NJWA 4FWPA 3KKRA 4A62A 4B1ZA 4DSEA 4KHUA 3V9ZA 4DU4A 4ISEA 3MEDA 3A5LC 4CIGA 5GAGP 3T19A 2GWKA 4KHQA 4M7YA 4QS7A 4QAGA 3QERA 1C1BA 1LWFA 4YOVA 5CHIA 3LM9A 3IFRA 3T7ZA 3LDOA 3KK7A 3LAMA 4IO8A 2HW3A 3S3OA 3AVIA 1W2BM 1IG8A 3GOIA 4FZXC 1RBRA 2GUIA 3V9UA 4YORA 4DR4K 4JKBA 1UAXA 3OYEA 5ADXH 3S9HA 3HM8A 4OGEA 4DSKA 1HMVA 2HBKA 3VGMA 1IKWA 4K8XA 3OY9A 1HNVA 1NU0A 2YJFA 2QKKA 3QLHA 3BF3A 4E1MA 4EP5A 1CXUA 2Q0UA 4DQIA 4AM6A 2XO7A 2Z1JA 3B6OA 1RBSA 1J5OA 1NK7A 4O5FA 2VGNA 3ZT4A 3K5OA 2QWRA 4QCLA 4R5PA 3VERA 3TSUA 3RRGA 2I7PA 1IG9A 4IXCA 2UXBK 2F4VK 3WUHA 4DTOA 1J54A 3CHWA 3CPEA 3K57A 1D4XA 1XNRK 1JLAA 4LFCK 4LF8K 2VWBA 5DMRA 3THYA 3JS6A 1LCUA 4B8CA 3AVCA 1Z26A 3SQ0A 3JAMO 4CW7B 1C0GA 3WQUA 3K9JA 1P8ZA 2YCHA 2QM1A 4MQ3A 1JLBA 3S3MA 2EX3A 3TANA 1Y19B 3HYFA 1O1WA 3LP1A 4FLUA 1RBTA 3HPOA 4M3UA 2DFFA 1WUAA 1IH7A 2J0KA 2A1SA 2GV9A 1ATSA 2AP1A 4DTXA 3VA0A 5FPDA 4NXNK 3VEWA 4KRFA 1XHXA 3WXLA 4LY7A 3Q7CA 4MLHA 3L2VA 1XI1A 3M8RA 1VQLN 3AVLA 1K9MO 4JRQA 2E2OA 4KB0A 4FZYA 4FJ8A 5HROA 2HMIA 4NCBA 1CZAN 3TR8A 4JI6K 3ZSZA 4JV5K 1Q82O 3G10A 4CEFA 4CJKA 3OYLA 3VF6A 3DYAA 1C0TA 4DS4A 3TABA 3ZX3A 3CCSN 4CFCA 1NGHA 2IAJA 5AQLA 4M3WA 1Q18A 4FJHA 2O8EA 2GTDA 1JL1A 3SUPA 2HNYA 3OS1A 2ZJQL 1RCHA 1JKHA 2FSNA 3KLIA 4C1NK 2V51B 4CESA 3J80O 5FDLA 3OYGA 4XIUA 4Z0UA 2GWJA 2QTDA 2FF3B 1IV0A 5AJ3K 2VG5A 4KTQA 1BA0A 1S1TA 4WCEL 2QKBA 3OVNA 3AV9A 3THWA 3DLEA 4IBNA 3VQBA 3MAQA 3MEGA 1LW2A 3ID8A 2OZMA 3NF8A 5AQFA 1WSGA 4FJ9A 1NI2A 1QQOA 4FWNA 1N34K 2E2QA 3P5JA 5AQHA 1JLGA 3V1RA 4NCAA 5M1QA 3I0SA 2XHBA 2F9WA 4E7LA 1VK0A 2QI2A 4JI4K 4E0DA 4WFNL 4DHYA 5BN9A 4CZHA 1QHTA 3WQTA 1TYQB 4EZ6A 3BF1A 1KFDA 5AQSA 1VQNN 2ABDA 2P9IB 4KHPK 3M5RA 5AQKA 1NGGA 1Q8IA 2AJQA 4H8KA 2HHHK 4MFBA 1KAXA 3DRPA 4IDKA 4JD2A 1NWKA 1LV5A 3C6AA 1EETA 1BCOA 4CZGA 3LWLA 2YNHA 2OPPA 3P38A 4W5NA 1T6CA 4ID5A 3SV3A 4CGIA 2PBDA 3WXJA 4H0PA 3PZDA 4CZLA 3SYZA 4YY3K 1S6QA 3HOTA 1BQNA 3VEXA 1DKGD 4Y0WA 3DLGA 4B9SA 3K5MA 3UIQA 3K5LA 2QWLA 3NVMA 4DV4K 1NBWA 3QMLA 4P7IA 4LC9B 4DV1K 4CJ7A 2OANA 4MO5A 1U45A 4HHTA 2AEHA 1MIXA 5KI6A 4CHOA 4Z4IA 3BP8A 2DTUA 1S72N 4OPHA 4C8LA 4EKUA 2E6MA 4J2AA 4C8NA 3V9SA 4ELTA 3LL3A 3PY8A 4YDUA 1CZBA 4PL8A 4HUEA 5JICA 1BWFO 3FZHA 3J8AA 4O44A 1KSPA 2O8FA 4FJIA 4CF8A 1SV5A 4AILC 1T7PA 3OYHA 3ZSXA 4ZHRA 2UXDK 2COPA 2EMTA 1TK8A 4GKKK 1GC6A 1EF1A 2HHTA 1HNWK 1OKJA 4GKJK 5GADP 3D45A 1RT2A 1GC7A 1RT4A 4F9OA 5GIOA 1SAZA 3CJBA 1J5EK 3UKUB 4DXAB 2YVCA 4BC2A 3PSIA 2Q3SA 3CXCM 3WXMB 1YUWA 4C1NI 5SZTA 3ZSWA 4HTUA 4JKAA 2D10A 1VBHA 1TUUA 4CVNE 2WONA 3I33A 4H0TB 2Q0RA 1RTDA 1VSKA 3AA3A 2E6LA 2O4IA 3DAWA 1W7AA 4M3TA 4PA1A 5BRFA 4BRLA 4RG8A 1U47A 4G1QA 3PUFA 2FBVA 3SUOA 3MN7A 2YNGA 1K73O 4F3OA 3MECA 1TV6A 2P9UB 5F2RA 1YIJN 4X65K 4FJMA 4E7IA 3QINA 4J2BA 4H4MA 4NLBA 1WSIA 2BTFA 4RW8A 4BDYA 3QNNA 5I42A 3NGYA 1HKBA 1K8AO 5F1XA 4FLWA 4F8RA 3LDNA 2QA4N 1MA9B 3TAQA 3GL1A 4JK8A 1NGEA 3KWIA 4B3OA 4OPKA 4DTNA 1QQNA 3VQDA 3DXMA 1GLBG 3C6HA 4JEPA 3CQYA 4HUFA 3NHGA 4GMJB 1ISNA 1NGFA 4DCHA 4DQRA 3IUCA 4A59A 1VSHA 2W41A 5AQVA 2YNIA 2E88A 3THYB 3HRGA 4CGDA 1GOCA 4QS8A 1TKZA 3CCLN 2QW9A 4O0IA 3E9OA 1KQSM 1S9GA 3ENHA 2UUBK 4JYAK 2NUBA 2EMSA 1MK9B 1EWRA 1DLOA 2ASOA 5C42A 3E9PA 2HF4A 3CF5L 4BGAA 4CEQA 1GLDG 1O13A 5M1NA 3VESA 3T1HK 4AM7A 4BRDA 2QWPA 3EY1A 1E3MA 2P9PB 3VEYA 3HSTB 2YJEA 3SQ4A 1N6QA 4FJLA 1FW6A 3ZETB 4DV2K 2DFEA 3O9RA 3L0QA 2FSJA 2ZM6K 1GLEG 3CQXA 4A2BA 4DV7K 3MEEA 5HP1A 2BDPA 4V19S 3LZJA 3AVMA 2OCEA 4ZTFA 3F5TA 1C1CA 2KLAA 4FCYA 2ZGZA 4I2QA 4B8AB 1J19A 3HVRA 3QEXA 2VQEK 2YHXA 1NMDA 1VSFA 2W6KA 3DLLL 3A2FA 2I1JA 4NYFA 5AQPA 1FJGK 1SQKA 2B6AA 1FK9A 2O8EB 1BA1A 2P9NB 3JSMA 1Q86O 2NRHA 1S5JA 3KKSA 4CD1A 3H6EA 4TKNA 4JI2K 3CFPA 3FE1A 4KH5A 3VQCA 3KD5E 3CPWM 3DLBA 4DV0K 4L3QA 4KKOA 2PYLA 5DK5A 3M8QA 3A5NC 5JS1A 3VETA 4AHCA 3PIOL 2E4LA 5AQRA 1TYQA 1NMNA 1TVRA 2P9IA 4B9QA 3ULDA 2RQ1A 4JI3K 1ZXOA 3D6RA 3MN6A 3LZIA 4MDBA 1D8YA 1HPZA 3BZKA 1NGJA 3ZX2A 3FR0A 4C8KA 1K8KB 1QQMA 3K5NA 2HHVA 4CHPA 4BR9A 4CZKA 3AARA 4CGJA 1KLMA 1MWKA 2NZTA 4KO0A 3CETA 1S9EA 3HZ6A 3NGIA 3TWHA 3CC2N 1BQMA 3VN5A 1BI4B 5JS2A 3MX2A 3FP5A 3RMAA 2OA8A 1RTIA 1J9AA 4AH9A 1JJ2M 4DTUA 2D0PA 3KK2A 1GGOA 4B9VA 4I9QA 4HCBA 3TU5A 4CJSA 3LP0A 3QETA 2GEMA 3KLEA 3SPZA 4ZRKA 1WBBA 4JD2B 4Z4GA 4JK9A 4N76A 3SJHA 3L8BA 3BUZB 3CC4N 3EO3A 3MMVA 3AU5A 3O3GA 2VWJA 3NAEA 1RDDA 3KJVA 3EPYA 2G8HA 4Z4EA 3LPUA 3AU4A 2OPQA 4GV3A 4YOXA 1RFQA 1JCGA 3QIJA 4OKKA 4BVOA 3O5BA 3QB0A 3PO4A 3AVAA 3NBPA 4CJ5A 4OVLA 4CBUA 4YDUC 3BZCA 4DFJA 2ASMA 3ITHA 3KD1E 4FWLA 3SI6A 4BR5A 4IOXA 1CZ9A 4DTSA 4GV9A 4BRNA 4BR2A 3CFRA 2ETJA 4K25A 3J7ZO 3HP6A 4LFBK 4G9ZA 3U4LA 3UKUA 1K6YA 1WAFA 3VQ6A 1ZC6A 4RW4A 1RGIA 4CBXA 2RN2A 4XH4A 3QNOA 4H5NA 3S41A 1VQKN 3VOVA 5HOOA 4CIFA 4CEZA 4DMNA 4NY0A 2FJ9A 5AQQA 3CCVN 2O8FB 5BRDA 4DU1A 2NRXA 3RR7A 2CH6A 4BE2A 4PKIA 3FZKA 3NFAA 3QFPA 3BY5A 5AQIA 3RVCA 4B9NA 4KV8A 2J0MA 4DV6K 4DTRA 4JHDB 3OA9A 5LJVA 1NK0A 3I8DA 3LP3A 2A42A 4XEIA 2P9UA 4W5QA 1NJZA 2QXFA 4A2AA 3CJ1A 5C2DA 5TKWA 3GDQA 4M45A 3C65A 3BEXA 4Z4HA 1DTTA 3NCIA 3KWGA 2FBTA 1VQ8N 4CEAA 1RBUA 4K8ZA 1TGOA 2HNZA 3DOLA 1YVNA 4O8KA 1BL3A 2J0JA 4E7JA 3QEWA 4IO9L 2WOMA 2OYQA 4ZTJA 1A5VA 3JXUA 4W5OA 4EFHA 3LDSA 4FWOA 5C24A 3H3NO 4CERA 2EHGA 4DQSA 3M1FA 4FJNA 1SL1A 3ZSRA 2HVIA 1V4TA 4CZEA 1NNEA 3ZT0A 1FXXA 2CGJA 5CR4A 1ZBSA 3EN9A 1TAQA 4HUGA 1Q9YA 4DQPA 4JNEA 3D0PA 2RPIA 5HRPA 3AVBA 3NDKA 1CXQA 4CEEA 4CK3A 2PAVA 3PX6A 3TPQA 5FRNA 2ATQA 3WNGA 3CMEN 3SBTA 2JLEA 4CJQA 1WSHA 4ILHA 4JS5A 4DLEA 5JLFA 5HRRA 2HHXA 3DXMB 3AO4A 3TAGA 2P9PA 2VG6A 2ZD1A 4MDAA 4ELUA 1RDWX 3ZETA 4CJRA 2DFHA 2CH5A 4MO4A 4ILJA 1U4BA 1QZ6A 2G8UA 5GAEP 1X9JA 4F2SA 1RT3A 1S1UA 3M3ZA 2A1RA 5ELZA 5AQXA 5CY4A 4N56A 4DFPA 1MK7B 3HM9A 4Z4FA 2I1KA 3T69A 4CJPA 2YV0X 5AQUA 4BE1A 4DWIA 3O9TA 5FPNA 1U48A 3SZ2A 1HX1A 2FC0A 3AY9A 1I39A 2IGIA 4J2EA 4DR3K 1OH7A 3LALA 1TL1A 4KHNA 2P9NA 5CZ2A 4DG1A 5BR9A 3SMSA 4BROA 4CJLA 4A5BA 3VEZA 3O80A 3SPYA 1GOBA 4IEEA 2P9KB 1EQYA 4DFKA 3CCEN 3BGRA 4IFEA 3SQ2A 4AHSA 3ZDTA 1SL0A 3U3YA 2ZWHA 3CCRN 2Z1HA 3ZT3A 3GG4A 4WFBL 1TL3A 4BG8A 5BREA 3P1GA 1KLNA 2NRTA 1VBGA 1A5XA 4X66K 4DTPA 3PVLA 1K8KA 1IKYA 1GLLO 3LDLA 2UYTA 2HRJA 4FWQA 1KCFA 4LSNA 3TSPA 4BRPA 3SBGA 4FLTA 1KD1O 2O8BB 4DSFA 4E89A 2VGMA 4NLCA 1WOQA 1NM1A 1WBDA 5CYMA 1NTIA 1IJJA 2A40A 3DOKA 1BU6O 3VQEA 1YI2N 1NG9A 5HRSA 2AL6A 3EEQA 1P90A 3AVGA 1G99A 4H5VA 1YJWN 4FWSA 5KPZA 1BI4A 3L3VA 4PKGA 4FZZA 4H03B 3ZT2A 1XUPO 3AAQA 4PQUA 2I7NA 4K42A 3O3HA 4B1XB 1KVCA 3K0SA 3CM6A 5HL7L 2RE2A 3UB5A 1KVBA 1RBVA 2YKMA 3QO9A 3VQ8A 3O9QA 2UUAK 2Y1JA 4JKGB 3O08A 5LJWA 3OYBA 3VF2A 4HTLA 1KC7A 1IBLK 4OX9K 4CJ4A 4DQ8A 1Z6RA 3TAEA 3G0ZA 1QSSA 4UQGA 2IVPA 3J81O 4E3SA 3CI5A 3C6UA 3KTQA 4Q5VA 3OS2A 4BREA 3VQ4A 4CJTA 2BH1A 3TTFA 5AQWA 2PZSA 2EWSA 2FSKA 4GXBA 4Y1CA 1D9FA 3CFOA 4B9LA 4CBWA 3A8YA 2X6NA 4JN4A 1NGCA 1OH5A 3VQPA 4CF1A 2E1YA 3OYJA 1VQ7N 3PLAA 2Q36A 4IDHA 3BDPA 3KZBA 3L2UA 3MDQA 4CGHA 3HVTA 4W5RA 3ALYA 5KGWA 5BRHA 5BR8K 3HSCA 4K41A 3SUNA 3LM2A 3WNFA 3G9WA 1VQMN 5KPRA 2QWOA 4CI6A 2VQFK 4JKCA 3V1QA 1G15A 5C2FA 3SMPA 4KHSA 5H1SQ 3SNNA 4O8UA 1X9MA 4IFVA 4BVPA 4BR7A 4FW2A 1JDEA 3RMBA 4CFAA 3QDKA 1EXQA 4M41A 3LWMA 5LMUK 4FW1A 4JHDA 3OYFA 1F21A 3SK3A 4CYEA 4U7BA 3LP2A 4WQ5A 1QS4A 3L4QA 2VWKA 3QFUA 4DV5K 2NRZA 1VSMA 3FGUA 3PO5A 3G4SN 4CGGA 4EIAA 2IIRA 1JLQA 4LH4A 3QESA 4CF9A 1Y64A 4FWKA 3SCXA 1QHAA 3H3OB 3K58A 1EKEA 3MX5A 4WF9L 2F8SA 1OH8A 3CQ8A 5AZJB 2IC3A 1U2VB 1IBKK 4CFBA 3TARA 1XNQK 2VCPA 3NH1A 2KQ2A 4PL7A 4YOWA 3V81A 3K59A 2AA4A 1WNSA 4BC4A 2WBNA 4FOIA 2P51A 3VQ5A 3HP9A 1RT5A 1GLFO 2FDQA 3LANA 1S1VA 4B9MA 2HHWA 2XY7A 3CM5A 3ZX0A 2YNFA 4EHTA 3RWUA 4PUOA 2O8DB 1MIZB 4NO7A 2OTJN 1T8EA 4BR0A 3TAMA 3DLKA 3TAPA 2QWNA 1ZBIA 1U04A 1SUQA 3GBTA 4RWTA 5D3GA 4XH5A 3R8EA 3ZSVA 2RHKA 3W0LA 3R9PA 2FBXA 5IT9O 1KRPA 5C10A 3MCPA 1R59O 5E84A 3V9XA 1T03A 1HB8A 4CK1A 2OPSA 4CZIA 1HNIA 3U6FA 1IO2A 5EVZA 1NJXA 4DF4A 1ZBUA 2D0AA 5AQOA 5JVLA 1RILA 4FVUA 4WYBA 3OYAA 4YOYA 3S3NA 1UA0A 4WFAL 4B3TK 2IDOA 4A5AA 1XMQK 4F3TA 2KFNA 4OKEA 1N33K 2W6LA 4FOEA 1OVQA 1KVAA 5SWMA 3VTHA 4BR4A 3OYMA 4YNQA 4HDOA 3NF9A 1W9HA 4RW7A 1D5AA 4FXDA 5JVGL 2P9KA 2UUCK 1MU2A 4BRAA 3SLCA 3EL2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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