The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| total genus |
25
|
| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4X66 K; 4B3T K; 4LF8 K; 4JI8 K; 1HNW K; 4JI0 K; 5A2Q O; 4X65 K; 4DV5 K; 1HNX K; 1N32 K; 1N36 K; 1I94 K; 3J80 O; 4JYA K; 1HR0 K; 5AJ3 K; 4JI7 K; 4DR1 K; 4LFB K; 4DV7 K; 5FLX O; 4DR6 K; 2VQF K; 3JAM O; 3J7Y P; 4B3R K; 4KHP K; 4JV5 K; 1XMO K; 5LMN K; 1N33 K; 4LF9 K; 3T1H K; 2ZM6 K; 4DV2 K; 2UU9 K; 5LL6 Z; 1XNR K; 1FJG K; 2UXD K; 4DV3 K; 4JI6 K; 2VQE K; 1N34 K; 2UXC K; 4CVN E; 1HNZ K; 2E5L K; 4LFC K; 4JI2 K; 4LF5 K; 1J5E K; 1XMQ K; 2UUB K; 4DV6 K; 1IBK K; 4B3M K; 1XNQ K; 4DV0 K; 4JI3 K; 5IT9 O; 4DUZ K; 4X64 K; 4JI4 K; 4NXM K; 3J81 O; 2UXB K; 4LF6 K; 2UUA K; 1IBL K; 4DV4 K; 4YHH K; 4OX9 K; 5BR8 K; 4DR4 K; 4V19 S; 4B3S K; 4DR7 K; 4DV1 K; 2UUC K; 4DUY K; 2F4V K; 4DR2 K; 4DR5 K; 3J7A P; 4NXN K; 4CW7 B; 4LF7 K; 3T1Y K; 4YY3 K; 4LF4 K; 3OTO K; 5LMU K; 4K0K K; 4JI5 K; 4AQY K; 4JI1 K; 5IWA K; 4GKK K; 4GKJ K; 4LFA K; 4X62 K; 4DR3 K; 2HHH K; 1IBM K; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VAZ A; 3P39 A; 3V6D A; 4DTR A; 2G8U A; 3LDP A; 5J2P A; 2I7N A; 3TPQ A; 2DFH A; 4CGF A; 3MEC A; 1J53 A; 2JWL A; 3QIP A; 3ULE A; 3VF6 A; 5KGW A; 1BA1 A; 1OKJ A; 3LAN A; 3OYD A; 3ULD A; 1C1B A; 2J4R A; 1HKG A; 3H1Q A; 3R8E A; 3QEX A; 3VTH A; 1K8A O; 3TSP A; 3J7Y P; 3DLK A; 1ATN A; 1NNE A; 2IVO A; 4JAX A; 3PUF A; 2KZM A; 3FE1 A; 5C2D A; 1CZA N; 3MCA B; 2IDO A; 4CEA A; 3D2F A; 4FJM A; 3G71 N; 3VN5 A; 3U9D A; 2HF4 A; 2HF3 A; 1TUY A; 3V9U A; 3PO4 A; 3SCX A; 4CJK A; 1RTD A; 4DFM A; 2YJF A; 4JKE A; 4RW6 A; 1B9F A; 1XMQ K; 5MLC Q; 3T1A A; 2P1J A; 4ISF A; 2HHV A; 1ITG A; 5CYM A; 1XC9 A; 4CGJ A; 1YUW A; 5JLH A; 3U6F A; 4FCY A; 2VG6 A; 4CZH A; 3QEV A; 3TAB A; 2NRR A; 3OBY A; 4RTF D; 3AA4 A; 4CGH A; 1JCE A; 2UXB K; 4F2R A; 4FXD A; 2YNF A; 5AQS A; 3CFR A; 3MK6 A; 3IG1 A; 5HBM A; 4FSV A; 4CF0 A; 5AZI B; 3G10 A; 3TWH A; 3VQD A; 2YNI A; 4G9Z A; 1XI1 A; 3SUP A; 4CJW A; 1X3N A; 5J1E A; 2CGL A; 2YKN A; 4LF4 K; 1R0A A; 2O8B A; 4K0K K; 4WQ5 A; 3B6P A; 3A2F A; 2OPP A; 3JSM A; 3E1Y A; 2BE2 A; 3BZK A; 3DWL A; 3RMB A; 3OA9 A; 4Z4F A; 1RTH A; 4LC9 B; 3HBT A; 4CFC A; 1SKW A; 3H08 A; 3R6M A; 3H3O B; 2P9S A; 3LPT A; 3LWL A; 2BH1 A; 4YOT A; 4GV3 A; 4N76 A; 1UAX A; 3F73 A; 1J6Z A; 3P1G A; 3M8P A; 3TTC A; 1FK9 A; 1WNS A; 1ZBI A; 3J80 O; 3AVC A; 1JKH A; 3TTF A; 5EVZ A; 3K0S A; 5GAD P; 3HVR A; 4JHD B; 4DR6 K; 1KLM A; 3P31 A; 2VGM A; 3IFR A; 3OYF A; 1S9E A; 1GLE G; 5AQZ A; 3QDK A; 1LWF A; 5LMN K; 2V7Z A; 2CGJ A; 1K73 O; 2V7Y A; 5SZT A; 2ASP A; 3V4I A; 4DS4 A; 3CC7 N; 4DU3 A; 4DV3 K; 1ZC6 A; 4E7L A; 4CEC A; 1IG9 A; 4MDA A; 4OPA A; 1NGE A; 1IV0 A; 1KFS A; 5KGX A; 3DRP A; 3M8Q A; 3GDQ A; 1RNH A; 4CZL A; 3PX0 A; 2H3G X; 4M3U A; 2B4J A; 3AVB A; 3JS6 A; 1BU6 O; 3DLG A; 3OW2 M; 3RR7 A; 4CJS A; 4OKK A; 1SKR A; 1L3T A; 1L3U A; 1HYV A; 4ILJ A; 4H0Y B; 3MEG A; 3PIO L; 4BRF A; 3ITH A; 4ELU A; 3DM2 A; 1Q86 O; 4IO8 A; 1Z6R A; 4O5F A; 1NKE A; 2HHT A; 1U48 A; 3NGY A; 1CLQ A; 2Q1N A; 4I2P A; 1NK8 A; 3IDH A; 3JYT A; 1NU0 A; 5AQV A; 4BR9 A; 3NGZ A; 3V9Z A; 4BG9 A; 4AQY K; 5ADX H; 3NAE A; 3SAF A; 5BPL A; 4GY2 B; 2Z1G A; 3PO5 A; 3DRR A; 4BRA A; 1IKY A; 4DLG A; 1X9M A; 3KLF A; 3S9H A; 1L5U A; 4DSF A; 4XH1 A; 2W41 A; 4JD2 A; 4NCG A; 2OYQ A; 3R3L A; 3ID8 A; 1WBB A; 4DQR A; 1GLD G; 1LWC A; 2NZT A; 4KAZ A; 4B3O A; 2EHG A; 5EX5 A; 1VK0 A; 4DQP A; 2KZZ A; 3QNO A; 1VRT A; 3VEZ A; 1VRU A; 2P9L B; 2YI1 A; 4A59 A; 1ZBH A; 2NLX A; 4BRP A; 5KRS A; 1HQU A; 2NUB A; 2W6K A; 3O4N A; 4FJH A; 3RMD A; 2Q0R A; 3S41 A; 3K58 A; 3G0Z A; 4FWK A; 2YHA A; 2UU9 K; 3WXK A; 2E20 A; 3K5O A; 3QBW A; 4JI6 K; 2A42 A; 2E88 A; 1NJX A; 3DLH A; 1JLB A; 4KTW A; 4IBN A; 4FK4 A; 3ZET A; 1BQN A; 3ZSO A; 4FLU A; 1HQE A; 3D6R A; 1RDC A; 4IJA A; 3LWM A; 3O3H A; 4DV0 K; 3OYL A; 5I9E B; 4O55 A; 3I56 N; 5FPN A; 5J2Q A; 4FWR A; 3O9T A; 2YHB A; 3BGR A; 2KFZ A; 3N4Q A; 3LDS A; 4LF6 K; 1BQM A; 3BEX A; 3IS9 A; 3KZB A; 4Y1C A; 4DU1 A; 3AO5 A; 1T3V A; 3L2Q A; 1QQM A; 4U67 L; 1S72 N; 1Q82 O; 3LP1 A; 4K8Z A; 1IKW A; 2RF2 A; 3I0R A; 4B9N A; 1E4G T; 1XC3 A; 1YJ9 N; 4PKG A; 1QSS A; 1WBD A; 4CFA A; 3PY8 A; 4BRG A; 4JK9 A; 3KVG A; 4WFB L; 2F4V K; 4IOC L; 1EQY A; 2QW9 A; 1TKZ A; 4M7X A; 5BN9 A; 1WN7 A; 2P9K A; 2O8D B; 3SAH A; 4I7F A; 2Q97 A; 1NG9 A; 4O5B A; 4NLC A; 4RW8 A; 4FPB A; 3UKR B; 1VQ7 N; 4GKJ K; 2D5R A; 3K59 A; 1RFQ A; 4CIE A; 4QOZ B; 4JN4 A; 4DTN A; 4FM2 A; 4C8N A; 2VWK A; 4FOI A; 4PL8 A; 4M3Z A; 1C1A A; 4JI8 K; 3KKS A; 4DTS A; 4QAG A; 3FZL A; 4Z0U A; 1BOT O; 4X65 K; 1U45 A; 3O9S A; 4K25 A; 2EX3 A; 1I94 K; 1LW2 A; 4BR2 A; 1RBT A; 4Z4G A; 4IO9 L; 4DTM A; 1YHQ N; 1C6V A; 4GVE A; 1U04 A; 3M8R A; 4Z4H A; 3MXJ A; 1HUX A; 4H5T A; 3VTI A; 2DPN A; 1VSL A; 1HKB A; 5AQR A; 3DRS A; 2HBK A; 3H6E A; 4CZI A; 1BIS A; 3VPZ A; 4F2S A; 3EE9 A; 1ATS A; 1ILY A; 3I33 A; 1NLV A; 1CXQ A; 3WQU A; 5M1K A; 2R7Y A; 3KWG A; 2CH5 A; 2P9U A; 2ZGZ A; 3OYK A; 4XH5 A; 5M1N A; 1E4F T; 3FZH A; 2NRT A; 3TR8 A; 4IJN A; 5FPE A; 3LP3 A; 3SJJ A; 1WSE A; 1XNQ K; 3ZCM A; 3CJ1 A; 3TAP A; 3SUN A; 3VQ7 A; 2YHY A; 4A2A A; 3HPO A; 4Y0W A; 4YOW A; 5HLF A; 2WOM A; 3OS0 A; 1KXP A; 3CC4 N; 3C65 A; 4MDB A; 1MDU B; 1Z25 A; 1P90 A; 4EZ9 A; 4AM7 A; 3QEW A; 3WNH A; 3O9R A; 2IGI A; 3SQ4 A; 4HCC A; 3NF8 A; 2B6A A; 2HVI A; 1EO1 A; 4JKG B; 2P9P B; 3M1F A; 1MU2 A; 4DUY K; 4YDU A; 1NK4 A; 4NCB A; 3E9P A; 3V1O A; 1S6P A; 3EZ5 A; 1SZ2 A; 2G8H A; 2O4I A; 2RPI A; 1M90 O; 2P9N B; 1N6Q A; 1BG3 A; 4RWT A; 5AQX A; 3QET A; 3AV9 A; 3UKR A; 1CZ9 A; 4A5B A; 1B9D A; 2QA4 N; 4DR3 K; 3CXC M; 4K41 A; 4DQS A; 2HHH K; 3M6G A; 5I3U A; 2XRI A; 4HTU A; 1C0F A; 4LF8 K; 4FJ9 A; 1ASV A; 4M42 A; 5C0Y A; 2WUS A; 1D8Y A; 3M5R A; 2FLO A; 3K57 A; 3VOV A; 3PX6 A; 1VQL N; 1GLL O; 3RSE A; 3LAL A; 1KAY A; 3GL1 A; 1QHA A; 5HRO A; 3THX A; 1NK0 A; 4F3O A; 3O4W A; 1NGJ A; 4E1J A; 3AVH A; 4C1N I; 1TKD A; 3TU5 A; 3OVN A; 5BRD A; 4BWM A; 3HM9 A; 3FZF A; 2X6S A; 3L3U A; 2Y1J A; 4DTX A; 2O8F B; 4WE1 A; 4B9T A; 2UUB K; 3HYF A; 4IFE A; 3EYZ A; 4CJR A; 4GV9 A; 1OVQ A; 1Z26 A; 3WQT A; 1RT7 A; 4Y1D A; 4MFB A; 1NJI O; 4YOX A; 4N41 A; 2D1K A; 4IOX A; 4J2B A; 3VER A; 5AQG A; 1U6Z A; 4CHP A; 5HL7 L; 3A8Y A; 1WLJ A; 1NK6 A; 2RHK A; 4EFH A; 4EP4 A; 4F9O A; 4HUG A; 2Q36 A; 4FPA A; 1JLC A; 4B9S A; 1HNI A; 3ZEU B; 2DFF A; 2UUC K; 3QEI A; 2P9P A; 3KIO A; 1XHZ A; 3ZT2 A; 3J7A P; 3ZT3 A; 4FK2 A; 3FFI A; 4CW7 B; 3K9J A; 5AQH A; 3DJC A; 2ZGY A; 3VEW A; 4U7B A; 2V51 B; 5LMU K; 3U3Y A; 1NK9 A; 2OZM A; 1BCO A; 1JLE A; 3SK3 A; 4JKC A; 5IWA K; 3VGM A; 2KQ2 A; 1VSJ A; 1A5X A; 3LDO A; 2HB5 A; 1Q81 O; 1TL1 A; 4BR0 A; 4FJX A; 1RDA A; 5GAH P; 4J2A A; 1J9A A; 1CXU A; 1W9H A; 5M1O A; 4DLE A; 3CIP A; 4DQ8 A; 2BGG A; 1Q7Y O; 4PKH A; 4JI0 K; 1QZ5 A; 1JLF A; 3SLC A; 1UA1 A; 1X9W A; 2YCH A; 5KQ8 A; 3VQC A; 4CFD A; 4W5N A; 1Q18 A; 1DLO A; 4KH6 A; 3S3O A; 4WCE L; 1KVA A; 3LDQ A; 2P5O A; 3EE8 A; 4OKJ A; 2GUI A; 3TAN A; 1TK5 A; 4OLB A; 5M1P A; 1NKC A; 1QE1 A; 5CR4 A; 3T1H K; 5AQY A; 1DTQ A; 4GV6 A; 5LL6 Z; 3HVT A; 4XEI A; 2XY6 A; 3DLB A; 4BR7 A; 2QM1 A; 4O8U A; 2O8F A; 3CG7 A; 4CJU A; 1HNZ K; 4JI2 K; 3ID6 A; 3G25 A; 1GOC A; 1GLF O; 5HRP A; 5E41 A; 2IVN A; 4EZ6 A; 3MWT A; 4NB4 A; 3HZ6 A; 3S3M A; 1IJJ A; 1VQ8 N; 1NGI A; 1LAW A; 1DGK N; 5C25 A; 2NRW A; 2ZJP L; 4L8R B; 5F2R A; 1SS6 A; 1VHX A; 5E84 A; 4DTJ A; 3VQ8 A; 3UB5 A; 3L3V A; 4ID1 A; 1ZBL A; 2HND A; 2HW3 A; 1SL1 A; 3IMX A; 3NVM A; 5JMV A; 2HMP A; 4WYB A; 3FLC O; 3ISN C; 3WXL A; 1VQ5 N; 4F3T A; 4IFV A; 2UUA K; 2ZD1 A; 4UQG A; 1YI2 N; 4DV4 K; 3OJU A; 2VYP A; 2Z1J A; 3ZYY X; 4MQ3 A; 4FLZ A; 1Q8I A; 1N8R O; 3MWP A; 1VQM N; 3LP2 A; 4DR4 K; 1HX1 A; 3QO9 A; 4M3Y A; 4Z4E A; 4HVJ A; 2P9I A; 2VG7 A; 3ZEU A; 3KK2 A; 1Y97 A; 2F8T A; 3HT3 A; 4BVP A; 3L4I A; 3THY A; 4LD0 A; 3PX4 A; 5HP1 A; 3C7N B; 1RT2 A; 5DM7 L; 3DLE A; 1S3X A; 4PL7 A; 1U47 A; 1IKV A; 4R5P A; 2ZE2 A; 4GKK K; 5C42 A; 3QML A; 3H45 C; 4K43 A; 1YJN N; 3V9W A; 2XY7 A; 3DXM B; 3G4S N; 4OVL A; 3LPU A; 4K8X A; 1KTQ A; 4FL9 A; 3O8M A; 4FZZ A; 4E1M A; 1IBM K; 2E8A A; 1BUP A; 4WFN L; 3SI6 A; 1GLJ O; 1RBS A; 4DSL A; 4O8K A; 1N5Y A; 4CF1 A; 4E3S A; 2HHW A; 3P4I A; 3ENH A; 1QQC A; 5LJV A; 4KHW A; 4BE0 A; 1BGX T; 2WFB A; 5C24 A; 1T8E A; 3HXM A; 4JEP A; 4H4O A; 2A6A A; 4B9L A; 3C6T A; 2W40 A; 2ZQB A; 3CCS N; 1RBU A; 3C95 A; 4CF8 A; 1LV5 A; 3HST B; 4KB1 A; 4YNQ A; 4JRP A; 4AHC A; 2NRV A; 5ADX A; 4H5V A; 1N34 K; 1S1X A; 3LM9 A; 3CCR N; 3MDQ A; 2XY8 A; 2E6L A; 4RW7 A; 3SQ1 A; 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4FJN A; 2QKK A; 4AHU A; 4BQL A; 1VQ9 N; 2OAN A; 2IOC A; 1M1K O; 1VQ4 N; 4YOR A; 3TAG A; 2ZM6 K; 3Q7C A; 5DK5 A; 3RRG A; 1H1V A; 3OYG A; 4FJ7 A; 4DTO A; 2E5L K; 1GLC G; 1D5A A; 4E89 A; 4CJL A; 3V9X A; 4BRO A; 3L2W A; 1TUU A; 5EOY A; 1RIL A; 4CJV A; 4FVU A; 1T44 A; 3O1B A; 4CE9 A; 3O4Q A; 4JHD A; 5AFU A; 1HKC A; 3QNN A; 1TYQ B; 4ISE A; 5AZJ A; 3CD6 N; 2E1Y A; 3CQX A; 4FWP A; 2A41 A; 1LAV A; 3PLA A; 4FM0 A; 2D0C A; 1KSP A; 2YNH A; 4B1V A; 3CPE A; 3HSC A; 2E6M A; 4A62 A; 4BVO A; 1NKB A; 4E7K A; 1ZBS A; 2HHQ A; 4EAH D; 1QS4 A; 5F0X A; 3OBW A; 3KK7 A; 4CEO A; 3A5O C; 5BR8 K; 3DAW A; 4V19 S; 3VQQ A; 3NH0 A; 2PBD A; 3NF9 A; 4IZ9 A; 1BL3 A; 4M7Y A; 4HHT A; 2F7T A; 3CQ8 A; 5HOO A; 3HL8 A; 5H1S Q; 1K9M O; 1ZXO A; 3WXJ A; 1JLQ A; 3E66 A; 3ZT0 A; 2QTD A; 3L4Q A; 1K8K B; 4OPK A; 5KPR A; 4CK3 A; 3GBT A; 3ENB A; 3CET A; 2A40 A; 3SBG A; 3SUO A; 1YTA A; 2CGK A; 1U2V B; 4YFU A; 3ZX3 A; 3C94 A; 2AJQ A; 1A5V A; 1R59 O; 1SL0 A; 2ASM A; 3K5M A; 2O8E B; 3GG4 A; 4AF1 A; 5JIC A; 1XWL A; 3TAE A; 4C8M A; 4H0X B; 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