The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GKJ K; 1XNQ K; 2UXC K; 2UUC K; 3OTO K; 3J81 O; 4X64 K; 4JI4 K; 1FJG K; 4LF5 K; 5A2Q O; 4DV0 K; 4JI3 K; 1N32 K; 1J5E K; 4DV5 K; 4LFA K; 4OX9 K; 4JI5 K; 3T1H K; 2UU9 K; 4LF7 K; 4DV3 K; 1HNZ K; 2UUB K; 4YHH K; 2UXB K; 4B3T K; 4JI2 K; 2VQE K; 1IBL K; 2ZM6 K; 4CW7 B; 4JV5 K; 4B3M K; 5LMU K; 4DR2 K; 4JYA K; 4NXM K; 1I94 K; 1N33 K; 4GKK K; 5LL6 Z; 4YY3 K; 1XMO K; 1HR0 K; 2UXD K; 3T1Y K; 4DUY K; 4DR1 K; 2HHH K; 4X66 K; 4NXN K; 1IBK K; 4X65 K; 4X62 K; 4B3S K; 4DR6 K; 2UUA K; 4LF8 K; 4DUZ K; 4DV4 K; 4B3R K; 4KHP K; 4LF4 K; 4AQY K; 4DV6 K; 4DV1 K; 2F4V K; 1IBM K; 1N36 K; 5AJ3 K; 4LF6 K; 3JAM O; 1XNR K; 2VQF K; 4DV2 K; 4DR3 K; 4LF9 K; 4CVN E; 4DR5 K; 4LFC K; 4LFB K; 4V19 S; 1XMQ K; 4JI7 K; 5BR8 K; 5IT9 O; 5LMN K; 4JI1 K; 4DR7 K; 3J7Y P; 4DR4 K; 4JI8 K; 4JI0 K; 4DV7 K; 5FLX O; 3J7A P; 1HNX K; 5IWA K; 4JI6 K; 3J80 O; 2E5L K; 1N34 K; 4K0K K; 1HNW K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C94 A; 1SAZ A; 1YVU A; 3ZT0 A; 2O4G A; 3NDK A; 2QKB A; 1OKJ A; 1J6Z A; 1VSK A; 4KH5 A; 1T6C A; 4BVO A; 3LZJ A; 2E2O A; 1BCM A; 4K25 A; 3A5M C; 1C6V A; 4OKE A; 1NGG A; 4XH1 A; 3TAQ A; 2KZM A; 4FW2 A; 3ID6 A; 3QIC A; 3H1Q A; 3S3N A; 2JWK A; 4HUG A; 4FJK A; 3RMD A; 1RT7 A; 3VA0 A; 3HK2 A; 5EX5 A; 3NVM A; 4FJH A; 4CZJ A; 2PAV A; 3ZX3 A; 4WCE L; 4B1X B; 4DSF A; 3DWL A; 3VQ7 A; 3ZEU B; 2V7Z A; 4A57 A; 4XIU A; 4FPB A; 1HNI A; 1NGF A; 1RBT A; 4DSI A; 2WFB A; 1N33 K; 2WBN A; 2YNG A; 3JSM A; 2GWJ A; 4DLE A; 1N5Y A; 5AQX A; 4M3U A; 2P9U A; 2YX6 A; 3PUF A; 1F21 A; 4CJT A; 5GAE P; 4Y1D A; 2VCP A; 2OCE A; 3T1Y K; 4BC3 A; 4BRC A; 1U4B A; 1IBK K; 3K5N A; 1KXP A; 1S22 A; 3QES A; 4W5R A; 2P5O A; 4DR6 K; 2UUA K; 4DTP A; 4CJL A; 2E2P A; 1NJX A; 4AHR A; 3V9U A; 2NZT A; 2P9U B; 3J8A A; 3S9H A; 3CCQ N; 4EIA A; 1QQO A; 4H0V B; 1W9H A; 2O8E A; 1JLA A; 3CJ1 A; 3EYZ A; 3THY A; 3M1F A; 1NGI A; 3RR8 A; 2VWB A; 4CE9 A; 1P90 A; 2GBZ A; 3A5N C; 1EET A; 4QCL A; 4B9M A; 4CZG A; 4RW7 A; 3NF8 A; 1NK0 A; 4F3T A; 4CFC A; 5J2N A; 4W5O A; 4OGE A; 1GLF O; 3OJU A; 2YCH A; 4FJM A; 4KI6 A; 1OH6 A; 3PSF A; 2V7Y A; 1FKO A; 3AAP A; 3AO2 A; 4IFY A; 4JI0 K; 3C7N A; 2JGU A; 3VF2 A; 3AA2 A; 1M1K O; 3HM9 A; 1GLB G; 2Z1J A; 4JI6 K; 3V9Z A; 3P39 A; 1RBR A; 1S1W A; 1YTU A; 2D0A A; 4J2A A; 1NNE A; 4CBX A; 3BGR A; 4KB0 A; 2HNY A; 1KLN A; 2NRZ A; 4JKF A; 2YHX A; 1WSG A; 3WQT A; 2Q36 A; 3ZX0 A; 3SAF A; 4K43 A; 4FO0 A; 3S3O A; 1J54 A; 3LAM A; 1RT3 A; 3D2F A; 2PBD A; 5BR9 A; 1T7P A; 4O5B A; 3IFR A; 3FLC O; 3ZCM A; 1HQU A; 4FK0 A; 3SUO A; 1NJI O; 3CMA N; 1WAJ A; 4IDK A; 4CW7 B; 1SZ2 A; 3QML A; 3D2F B; 4CZI A; 4MLH A; 4FVM A; 4KB1 A; 1C1A A; 2CGK A; 3RVC A; 5GIN A; 4JK8 A; 3SPY A; 3KLE A; 3CJB A; 2FBV A; 3G6E N; 1YJW N; 4CES A; 4AHV A; 1T44 A; 4N41 A; 3H45 C; 3D0P A; 3CM5 A; 1ILY A; 4I9Q A; 3EE8 A; 4CJQ A; 4FVU A; 1NGD A; 3ASM A; 3P5J A; 4M63 C; 2VG7 A; 4BC2 A; 3A0I X; 3NGZ A; 5CHI A; 3AVA A; 1IKW A; 5HRS A; 3DXM A; 3CD6 N; 3TAG A; 1XNR K; 1ZBF A; 4JKB A; 4YOW A; 1NKC A; 4DG1 A; 2WOM A; 4CHZ A; 4OPJ A; 3LWM A; 1ZBL A; 1WAF A; 1XMQ K; 4ISG A; 4LD0 A; 3DYA A; 3LM9 A; 4JHD B; 3MWP A; 4JNE A; 4NLC A; 1T3V A; 4AH9 A; 1BA1 A; 1LWE A; 4CIF A; 1WSI A; 4FSV A; 5FPD A; 3J7A P; 4IEI A; 5LY3 A; 4N76 A; 3THX B; 3LM2 A; 3AAQ A; 4NLB A; 3OYH A; 4I2P A; 3OYD A; 2HB5 A; 2UYT A; 3F73 A; 5BN8 A; 1HJR A; 3MX2 A; 3LDN A; 4JI4 K; 3L4I A; 3TTF A; 3QEV A; 3QIP A; 3AY9 A; 2ZD1 A; 3EY1 A; 2E4L A; 5J2P A; 2YNH A; 3THW A; 1TYQ A; 4QAG A; 1WB9 A; 1A5V A; 1KAY A; 2HBK A; 5AQS A; 4RTF D; 4ICL A; 4F2R A; 1EX4 A; 2O4I A; 5FRO A; 4IFV A; 4WQ5 C; 1RDD A; 3NH0 A; 1HUX A; 3U3G A; 3CQY A; 1NKE A; 4B1Y B; 4CBU A; 2ZM6 K; 1KAZ A; 2OPQ A; 5M1P A; 3C95 A; 4JYA K; 4NO7 A; 4H0T B; 4B9V A; 3L3U A; 1YT3 A; 1ATS A; 4NXM K; 1BIZ A; 4EHT A; 4BRH A; 3UIQ A; 1NGJ A; 4FWP A; 4AF1 A; 1KVA A; 2UXD K; 3GDQ A; 5AQH A; 4F3O A; 1VQ8 N; 2KHO A; 4XH5 A; 3DOL A; 4O5F A; 4OO1 J; 1VQ7 N; 2PYL A; 2ZJR L; 1EO1 A; 4H5N A; 5M1N A; 4QS7 A; 1H1V A; 1T03 A; 2ITM A; 2EX3 A; 3VTI A; 5KTQ A; 2HVI A; 4DV6 K; 4CJF A; 3E9P A; 2W42 A; 3I8B A; 5JVH L; 3ZSV A; 4LF6 K; 3QEP A; 1VSJ A; 2I5J A; 2PY5 A; 1TGO A; 3FZM A; 1HLU A; 2BUP A; 4LFC K; 2W40 A; 1ASU A; 4BY9 C; 1QHA A; 4DMN A; 1MU2 A; 2NRX A; 5SZT A; 3RTV A; 1K8K B; 4DTS A; 1SL1 A; 5KRS A; 4CJS A; 4KRF A; 3HL8 A; 4CIE A; 5AQK A; 2WUS A; 4FYD A; 3QBX A; 4KTQ A; 2YI1 A; 3EZW A; 4DV7 K; 3O08 A; 1S1V A; 1QVG M; 1J5O A; 1XC3 A; 3I33 A; 4XEI A; 2HBM A; 4EZ6 A; 1L3S A; 1QZ5 A; 5HP1 A; 1U47 A; 3DLK A; 4FOI A; 4FM2 A; 4R5P A; 3BP8 A; 4PL7 A; 4YFU A; 3A5O C; 3MEG A; 4ISF A; 1JLE A; 1IKV A; 4DTR A; 4FJX A; 5FDL A; 4B9Q A; 3GL1 A; 2OAN A; 4PQU A; 1IKX A; 3VTH A; 5C10 A; 2UU9 K; 4IO9 L; 3SV3 A; 1CXQ A; 4BR0 A; 3QIO A; 4FLX A; 4M3W A; 2XY5 A; 2HF3 A; 3SK3 A; 3CJC A; 1S72 N; 3K5L A; 5BPL A; 2VQE K; 4MFB A; 3HYF A; 2DTU A; 3TTD A; 4M3X A; 3ZT1 A; 2XO7 A; 4DR2 K; 5AZI A; 4I6M B; 4O4G A; 2ZWH A; 3AO3 A; 4DTN A; 1U49 A; 5AQM A; 2OZM A; 5JLH A; 3CIP A; 2RPI A; 3FZF A; 2GUI A; 5LL6 Z; 4YY3 K; 4M3T A; 4Z4F A; 1HR0 K; 4C8N A; 3ATV A; 4N56 A; 2X74 A; 4X65 K; 4YOY A; 1BWF O; 3HP9 A; 2NRW A; 4FK2 A; 3MEE A; 4KFB A; 4CEF A; 2LSN A; 3AVG A; 5I42 A; 1RBS A; 4A61 A; 4LF8 K; 3SMP A; 3QNO A; 4DU4 A; 4DSL A; 4Y0W A; 1Y64 A; 2O8B B; 4A5B A; 2KQ2 A; 5CE3 A; 2D0O A; 4F8R A; 4J2E A; 3ZSW A; 4W5T A; 4CFA A; 1B9D A; 3KWG A; 4JS5 A; 4IWV A; 1RTJ A; 4G9Z A; 4FJ7 A; 4K42 A; 3T19 A; 4CZL A; 1VQM N; 4PWD A; 1WLJ A; 3EN9 A; 3V1O A; 2IOC A; 4IO8 A; 3R9P A; 1WSH A; 3HPH A; 2IVP A; 4AM6 A; 3R1X A; 4OGC A; 4CHP A; 4KHQ A; 1TKZ A; 4KPY A; 1BDG A; 3OW2 M; 2O8F A; 3O9Q A; 2V51 B; 1Q81 O; 1BA0 A; 1QS4 A; 3AVH A; 4J2B A; 3CPE A; 2HF4 A; 3BEX A; 3CCV N; 1XNQ K; 4H4O A; 1L3V A; 3GOI A; 1HRH A; 4IFE A; 3QNN A; 5BPN A; 4CD3 A; 4ID1 A; 3LP0 A; 2A5X A; 1WN7 A; 2YNI A; 3T1A A; 3ENO A; 3FZK A; 3KKR A; 4H0P A; 3HP6 A; 3V1R A; 3V4I A; 1HX1 A; 4FJ8 A; 4OX9 K; 1TVR A; 5ELZ A; 5JVG L; 1V4S A; 1DKG D; 3N4Q A; 4YNQ A; 4FLU A; 3SLC A; 1JCF A; 1RT1 A; 3KHY A; 3LP3 A; 2QWN A; 4CZM A; 3LZI A; 1UOC A; 2QEX N; 1KTQ A; 2ZQB A; 3TSQ A; 2ASO A; 3QIN A; 3L2R A; 2GEL A; 5FPE A; 4C8O A; 2RKI A; 1DGK N; 4CEQ A; 4BRQ A; 2G8K A; 5AR0 A; 3OS0 A; 5C24 A; 3VQB A; 1SKW A; 4DUY K; 5JLF A; 1BGX T; 2IDO A; 1ZBH A; 4E19 A; 3KD5 E; 4OKJ A; 1VSM A; 4Q5V A; 3C65 A; 3HVT A; 3C6H A; 3SQ0 A; 3HZ6 A; 3FFK B; 1SL2 A; 3WXJ A; 3NE6 A; 4RCH A; 5FPM A; 3HT3 A; 1YIT N; 3DRP A; 4OLA A; 4EAH D; 4WF9 L; 5JIC A; 4DU3 A; 2RF2 A; 5C2D A; 4CZE A; 3JYT A; 3KLI A; 5M1Q A; 3PY8 A; 2P9K A; 4LF9 K; 3VMF B; 4W5Q A; 4Z4E A; 2FC0 A; 1C0F A; 1X1P A; 1NM1 A; 2HMI A; 2E1Y A; 2G8H A; 1HYZ A; 2WC9 A; 2AJQ A; 2B5J A; 4H5W A; 1CLQ A; 4JI1 K; 3LDS A; 3FE1 A; 3FZH A; 1VSF A; 1C0G A; 4MO5 A; 4CGF A; 5GIO A; 1NK8 A; 5FRN A; 3OBW A; 3BZC A; 3VGK A; 3WXL A; 4J8F A; 4Z94 A; 1TL1 A; 3MMV A; 3VA3 A; 3MN7 A; 1IH7 A; 3CET A; 3L2W A; 4NCB A; 2QWO A; 3THV A; 1EP4 A; 1A5W A; 2H3G X; 2FLO A; 2OTL N; 3U6F A; 1UA0 A; 5F0X A; 1C1C A; 1KCF A; 1FW6 A; 3S3M A; 1TK0 A; 1JLQ A; 1IO2 A; 4IOC L; 2F96 A; 3K5M A; 3D45 A; 1IG9 A; 1NGH A; 5AQY A; 1TAQ A; 2W6L A; 4DTU A; 4B9U A; 3C6T A; 4I2Q A; 5C12 A; 1GLD G; 4YHH K; 4E7K A; 1WUA A; 3VPZ A; 2YHA A; 3BUZ B; 3E01 A; 3TAF A; 4PA1 A; 2ZGZ A; 4XH4 A; 4M3Z A; 3O1W A; 3VEN A; 4UQG A; 1HMV A; 2ATQ A; 3FGU A; 3O3G A; 3PIP L; 4OPH A; 4HTL A; 4O8K A; 3LP2 A; 4CZF A; 1VQN N; 1ESV A; 3PX6 A; 1NKB A; 4WYB A; 1G99 A; 4BR7 A; 4DFJ A; 1XMO K; 3MXJ A; 3P31 A; 5E84 A; 4FWK A; 3CCE N; 4B8C A; 2DFF A; 4CHY A; 2B4J A; 4B3S K; 2I7P A; 3VQD A; 2DFE A; 3HRG A; 4JKG A; 4C8L A; 5KQ8 A; 3SBT A; 3ENH A; 2WON A; 3MEC A; 4CJV A; 3KVG A; 1YJN N; 3JAM O; 4YOX A; 1JL1 A; 3WNE A; 4FJN A; 1QVF M; 3OYL A; 1U48 A; 2KKZ A; 1DT9 A; 1CZA N; 3AAR A; 1LAV A; 4C23 A; 5IT9 O; 3O4Q A; 5CYQ A; 4A62 A; 2ASM A; 4CD1 A; 3J7Y P; 4FXD A; 1EQY A; 4BRK A; 3O5B A; 1X3M A; 3AVJ A; 3VQ4 A; 2P5G A; 5FLX O; 5IWA K; 4LSL A; 5BRH A; 4BRA A; 4K0K K; 4B8A B; 4CED A; 3E9L A; 1MWK A; 3TWH A; 4MQ3 A; 2O8E B; 2QWL A; 4Z0U A; 1XWL A; 3THY B; 1D9F A; 3SZ2 A; 3HJF A; 4GVE A; 3AVM A; 3HI0 A; 4GMJ B; 2Q1N A; 4H5T A; 2ZJQ L; 4WQ4 A; 3KLH A; 3HO1 A; 4JKD A; 4WQ5 A; 2CH6 A; 3CCU N; 5KGW A; 4DTX A; 3SCX A; 3T1H K; 2E6L A; 3L3V A; 4DQR A; 3R6M A; 2NRV A; 4MO4 A; 2Q31 A; 2YHW A; 3AA3 A; 2NRH A; 1VRT A; 5AQQ A; 3C7N B; 4BRP A; 4JI2 K; 4E89 A; 3ULD A; 5AQT A; 3O9S A; 1BO5 O; 4CJ4 A; 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1NK5 A; 3W0L A; 5CYM A; 2B6A A; 4B08 A; 5GIP A; 3M8P A; 3ZT2 A; 4WQ4 C; 3VES A; 5AQO A; 4U7B A; 1BIU A; 5K14 A; 1RBV A; 2IS3 A; 5AZJ A; 5CY4 A; 4CJP A; 4BVP A; 1MDU B; 3THW B; 3OBY A; 1TYQ B; 3BF1 A; 2HHV A; 1MA9 B; 2GV9 A; 4GV9 A; 1WSJ A; 4X62 K; 1NJZ A; 4K8X A; 2D0P A; 3VQC A; 4AM7 A; 3I0S A; 3CJ7 A; 1W2B M; 2P9L A; 3F9K A; 1HPM A; 4QS8 A; 5JMV A; 1D5A A; 3N4P A; 2XY6 A; 3PX4 A; 1SQK A; 1D4X A; 3VQA A; 1Q7Y O; 3M8Q A; 3IKM A; 5AQP A; 3ULE A; 3MWT A; 3OS2 A; 3EKU A; 4E7J A; 4FWQ A; 4DWI A; 1YUW A; 4Z4G A; 5F2R A; 1O1W A; 3VEX A; 2Q0U A; 1JKH A; 5AQZ A; 4BE0 A; 4GNI A; 3IAY A; 4BWM A; 2E2N A; 3QFP A; 2QTD A; 4PY5 A; 4BE2 A; 3IDH A; 1Q9Y A; 3DLE A; 3BDP A; 3F9M A; 4JRQ A; 1FKP A; 3ITH A; 4I7F A; 3TAP A; 1TAU A; 1C0T A; 1HNX K; 5T7B A; 3AVL A; 4LH4 A; 2OPP A; 4ID5 A; 1HNW K; 3E9O A; 5KQD A; 4MDB A; 3OYE A; 1CXU A; 2P9S A; 3I56 N; 3K5O A; 3KLG A; 1TUU A; 3VQ6 A; 1YIJ N; 4CEB A; 1RIL A; 4BRN A; 4CK1 A; 4DHY A; 4CK3 A; 1IJJ A; 4OVL A; 4DFM A; 1JLG A; 4CGI A; 3SNN A; 4JKC A; 2XRI A; 2QI2 A; 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