The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1N34 K; 5IWA K; 1HNZ K; 5A2Q O; 4DV2 K; 1HR0 K; 1IBM K; 4LF5 K; 4B3R K; 5IT9 O; 3J7A P; 4NXN K; 4JI5 K; 4JI4 K; 4LFC K; 4LF7 K; 4KHP K; 4B3M K; 5AJ3 K; 2HHH K; 4B3T K; 4JI3 K; 3JAM O; 4AQY K; 1IBL K; 4DR6 K; 4LFA K; 4X66 K; 4GKK K; 2UXC K; 5LL6 Z; 2UU9 K; 1FJG K; 1IBK K; 2ZM6 K; 4JI2 K; 1J5E K; 4DR3 K; 4JI1 K; 4DUY K; 4GKJ K; 4DUZ K; 4K0K K; 4DV5 K; 1HNX K; 2VQE K; 4JI6 K; 5LMU K; 1I94 K; 1XMQ K; 4CVN E; 2VQF K; 4YY3 K; 1XMO K; 4DV4 K; 3J7Y P; 4DR4 K; 2UXB K; 4DR7 K; 4DV6 K; 4V19 S; 4B3S K; 1HNW K; 4LF9 K; 4X65 K; 2UUA K; 4OX9 K; 2UUC K; 5FLX O; 3OTO K; 3T1H K; 2UXD K; 4DV3 K; 4DV0 K; 4JV5 K; 1XNQ K; 2UUB K; 4DR1 K; 4JI8 K; 1N33 K; 4DR5 K; 2E5L K; 4X64 K; 4JYA K; 4JI0 K; 1N36 K; 1N32 K; 4LF4 K; 3J80 O; 5BR8 K; 4DR2 K; 4NXM K; 3J81 O; 4YHH K; 1XNR K; 4X62 K; 2F4V K; 4LF8 K; 5LMN K; 4DV7 K; 4DV1 K; 4LF6 K; 3T1Y K; 4JI7 K; 4LFB K; 4CW7 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3AVI A; 3VQ9 A; 3RWU A; 3L2U A; 4EP4 A; 3WQT A; 3RVC A; 5IT9 O; 3UKR B; 1L5U A; 2IVP A; 1LWE A; 1WAF A; 1F21 A; 3H46 O; 3VN5 A; 1IBL K; 4A57 A; 4X66 K; 4DLG A; 2CGJ A; 4CD3 A; 1EWQ A; 2ASP A; 4CFD A; 1EXQ A; 3ZSZ A; 5DM7 L; 4MO4 A; 4DWI A; 1RDU A; 4A62 A; 3SUP A; 3VQE A; 5FRM A; 3B6O A; 4K41 A; 4JKE A; 1WB9 A; 3AVG A; 4O44 A; 4NCA A; 4Z4F A; 1VQ8 N; 1NWK A; 1NJZ A; 3THY A; 1SL2 A; 1KQS M; 4H5W A; 4Z4H A; 3L3U A; 3CI5 A; 3ZSO A; 1HYV A; 1ILY A; 3L8B A; 1YIT N; 3ATV A; 3ZX0 A; 4CIG A; 2BE2 A; 1Q8I A; 5T7B A; 2FC0 A; 1BG3 A; 1U45 A; 3C0B A; 2OYQ A; 4DU3 A; 1MWM A; 5AQL A; 4C23 A; 2ZGZ A; 3V6D A; 5I42 A; 3AA2 A; 2FF3 B; 3IMX A; 3ZEU B; 4IOA L; 1HQE A; 3K0S A; 5AQN A; 4BRH A; 4CIF A; 4E19 A; 3TAP A; 1W7A A; 1GLD G; 4RW8 A; 3RRG A; 3NGZ A; 3OBY A; 2DTU A; 1YIJ N; 1RFQ A; 2YJE A; 3PV8 A; 4JAX A; 4KHQ A; 1C0T A; 4DTR A; 1JLF A; 2J4R A; 4CJQ A; 4IO9 L; 4GV3 A; 4DQS A; 1NGH A; 3CER A; 3OY9 A; 4E1J A; 4CZF A; 1MDU B; 3WXM B; 1DKG D; 4FO0 A; 1NJX A; 4BGA A; 1S1V A; 1ZXO A; 5M1Q A; 1YTA A; 5M1K A; 1VSF A; 2HST A; 3H08 A; 4CJK A; 4YOW A; 2D0O A; 5AZJ A; 4GMJ B; 4OPK A; 3QBX A; 4M3X A; 3EY1 A; 1LOT B; 2X74 A; 3LAL A; 1BQM A; 4F4K A; 1D5A A; 4U67 L; 1A5V A; 3ENB A; 1MWK A; 4I9L A; 3VOV A; 3I33 A; 5KQD A; 3HSC A; 1NGC A; 4CW7 B; 1N34 K; 5IWA K; 1YI2 N; 1CLQ A; 4E7I A; 1W2B M; 4FCY A; 3LL3 A; 1BQN A; 4EHT A; 2P9L A; 2QW9 A; 3VQ4 A; 4AHC A; 1DT9 A; 5J2M A; 3M8S A; 1QQN A; 4IJA A; 5CYQ A; 3QEV A; 3N4P A; 3NVK A; 1WLJ A; 2A40 A; 4A5B A; 1QE1 A; 4DTS A; 4FJJ A; 3KD1 E; 4W5T A; 4QS8 A; 2D0A A; 2A1S A; 3OHR A; 4E7H A; 1RNH A; 5CZ2 A; 2HBK A; 5J1E A; 4FWO A; 3H6E A; 3HK2 A; 2B5J A; 3HOS A; 1Y97 A; 3WXK A; 3KD5 E; 1XMO K; 3PLA A; 1VRT A; 2YJF A; 5M1F A; 3PO5 A; 4F2S A; 2A6A A; 3SLC A; 3VQ7 A; 3S3O A; 1RBU A; 3KTQ A; 2OPP A; 1P8Z A; 4E0D A; 4FZY A; 3KK2 A; 4WQ5 C; 4M3Z A; 3ENO A; 3DLL L; 5JVG L; 1HLU A; 3AVJ A; 3L0Q A; 2V51 B; 2O8E B; 4CJR A; 5AQT A; 5AQU A; 2Y1J A; 4BC2 A; 3TAR A; 2VYP A; 1GOB A; 3HRG A; 3E9P A; 3CPW M; 4BRK A; 3ULD A; 2QWQ A; 3ULE A; 3ZT1 A; 1VSK A; 1W97 L; 2OPS A; 1R59 O; 3VF2 A; 1JJ2 M; 3VQ5 A; 4OJR A; 3UKU A; 2KTQ A; 3CCU N; 4FJ9 A; 4HTU A; 4KH6 A; 1JLQ A; 3B6P A; 3VTI A; 4JRP A; 3O9R A; 2HHT A; 1S9E A; 1U47 A; 4KPY A; 4FWS A; 5KRS A; 3TAB A; 3ZT3 A; 2E5L K; 4X64 K; 3J7Z O; 2O8C A; 4QCL A; 3BZC A; 3MK6 A; 2YHW A; 3KLE A; 5HRS A; 3VA3 A; 4H5N A; 4NXM K; 5C2D A; 4CJ3 A; 2PYL A; 3J81 O; 1Z25 A; 3THW B; 5JLH A; 4FJX A; 3CQ8 A; 1KD1 O; 3EL2 A; 2YCH A; 3OYA A; 4CJE A; 2GTD A; 5CE3 A; 5LMN K; 1X9J A; 1ASW A; 4DV1 K; 2P51 A; 1RBR A; 4M45 A; 1JLB A; 4CJ5 A; 2V7Y A; 4JI7 K; 3MWP A; 4KAZ A; 1XHX A; 4DTX A; 3K57 A; 5DMR A; 4FK0 A; 2RPI A; 4DV2 K; 4HWI A; 4B3R K; 3I0S A; 4Y0W A; 2O8B A; 4YDU A; 4LFC K; 1IO2 A; 1KFS A; 3AVM A; 4JK8 A; 3P31 A; 2E2N A; 4IG3 A; 4GKK K; 1RT4 A; 3AO5 A; 3DXM B; 4HVJ A; 3TAG A; 3D2E A; 5BRE A; 1TAQ A; 3PIO L; 2NRV A; 4WQ5 A; 4CJF A; 1T8E A; 2FSN A; 2VWB A; 3QML A; 2F7T A; 1X9M A; 4ILG B; 2OTL N; 1KFD A; 3VER A; 3KIO A; 5AQV A; 4NB4 A; 2HHS A; 1EKE A; 3OYG A; 1A5X A; 4AIL C; 3SK3 A; 1TYQ A; 3O9Q A; 4L3Q A; 3EEQ A; 5EU7 A; 1KAX A; 3TSU A; 1BI4 B; 1N5Y A; 1J6Z A; 2ZD1 A; 4DB3 A; 5F1X A; 1NK7 A; 4PL8 A; 5E84 A; 1QSS A; 4W5N A; 1U2V B; 4AHV A; 3AY9 A; 2FXU A; 3LAM A; 1RDW X; 3W3D A; 3P4I A; 2QI2 A; 1SL1 A; 1CZ9 A; 3K9J A; 4QS9 A; 1YVN A; 4WCE L; 3M1F A; 4JHD A; 2FBT A; 4R5P A; 4FJK A; 4FVM A; 3WNF A; 4FJH A; 1NGF A; 1VQ9 N; 3UKR A; 4QOZ B; 5FPE A; 3OS1 A; 1RT5 A; 3I8B A; 1YT3 A; 4I9Q A; 3JYT A; 3OW2 M; 5J2Q A; 2OAN A; 1B9F A; 4OLA A; 1TK5 A; 3FFK B; 3O08 A; 1IKW A; 4FWM A; 5HRP A; 4BG8 A; 4YOU A; 3GBT A; 3BGR A; 1LWF A; 3RMC A; 3MXM A; 3FZH A; 4Z4G A; 1JXB A; 1C6V A; 5BPN A; 2QKK A; 2P5G A; 3AVH A; 3HVT A; 3VQQ A; 3RRH A; 1NM1 A; 5HLF A; 3M5R A; 5AQW A; 2OPR A; 3VQB A; 3VQC A; 4E1N A; 1NKE A; 3KZB A; 1KVA A; 2HNY A; 2IVO A; 3AVF A; 2DPN A; 3MX5 A; 4CF1 A; 1S1T A; 4FWP A; 1BIS A; 3ZET A; 3M8Q A; 3CQX A; 4HHT A; 4HUG A; 3THY B; 2P9L B; 5GAD P; 4FW2 A; 4H0T B; 4JKA A; 1TVR A; 4CZH A; 1VRU A; 4CJP A; 4ELU A; 4A5A A; 1Q86 O; 4RW7 A; 4KHU A; 1ZBH A; 1U2V A; 2Q36 A; 4WFA L; 2E2O A; 3DLK A; 1TKT A; 4B08 A; 2YHB A; 2UXB K; 3DRS A; 2PZS A; 2XO7 A; 5GAG P; 5C42 A; 2AA4 A; 4EZ9 A; 1QZ5 A; 3A8Y A; 1L3U A; 5JMV A; 1TUY A; 4BR4 A; 3OYL A; 2HHX A; 3W0L A; 1QZ6 A; 3DXK B; 3F5T A; 3QLH A; 3M8R A; 3HO1 A; 3E01 A; 1S9G A; 4M3U A; 1J9A A; 3LPU A; 2KZZ A; 1NJI O; 2D1K A; 4BRO A; 4CEC A; 3HXM A; 1XNQ K; 3EN9 A; 3F9K A; 2Z1G A; 1N6Q A; 1BHL A; 3D7E O; 4BWJ A; 4AHR A; 4M42 A; 4CBX A; 3LDO A; 4GNI A; 1BL3 A; 3NHG A; 4I2P A; 4DS5 A; 4FLY A; 4DFK A; 4CZL A; 3CJC A; 1KXP A; 3OYJ A; 1XNR K; 3O3H A; 2IIR A; 4XH1 A; 2B6A A; 4LF8 K; 4WQ4 A; 3ZET B; 4DV7 K; 1VQL N; 4ICL A; 2Q1N A; 3QIO A; 3F2K A; 4DQI A; 3TTC A; 4E89 A; 4BGB A; 3SAG A; 4YFU A; 3G10 A; 3FLC O; 1VSH A; 4O5F A; 3MN5 A; 5TKY A; 3SQ2 A; 1VK0 A; 4W5R A; 4H0X B; 4FOE A; 4OPH A; 5C2F A; 1LW0 A; 5E26 A; 1REV A; 4GW6 A; 4LF7 K; 1E3M A; 2OTJ N; 1S1U A; 5AQK A; 3GL1 A; 4JI3 K; 3E1Y A; 1FK9 A; 2G8V A; 4BRA A; 3A0I X; 1Q9Y A; 4FL9 A; 3CFO A; 3V1O A; 5EVZ A; 4H5R A; 1SQK A; 1WSH A; 1Y64 A; 1IG8 A; 1HKB A; 2HBM A; 3JSM A; 1S3X A; 4DR3 K; 4U7B A; 1VSI A; 3BF3 A; 4FWN A; 4H4M A; 3KLF A; 3T7Z A; 5GAE P; 3C6A A; 5CHI A; 4BRF A; 3IG1 A; 3SBT A; 2PBD A; 3MEE A; 3QFP A; 3LDP A; 4BY9 C; 1VQM N; 4KH5 A; 1CXU A; 1KRP A; 4JS5 A; 4FK4 A; 2JWL A; 3M8P A; 4O55 A; 4CJW A; 1O1W A; 3G6E N; 1V4T A; 3WNH A; 4IXC A; 5EXW A; 1OKJ A; 3UIQ A; 2QWM A; 3K59 A; 1NGB A; 4M3Y A; 4IO8 A; 2HOE A; 4K25 A; 1DEJ A; 4DTM A; 3D2F A; 1C0M A; 3OTO K; 4DHY A; 4KH4 A; 4E7J A; 4MDA A; 4CER A; 2Q0U A; 3KLI A; 2O8B B; 3OS2 A; 4CGH A; 3PX0 A; 2HBJ A; 2NRT A; 2NLX A; 4PA1 A; 1KTQ A; 4B8A B; 1ATS A; 2WON A; 4FYD A; 3VEZ A; 2YNF A; 4F2R A; 3MCP A; 3PSI A; 4H5T A; 5CYM A; 5FRO A; 4R79 A; 3RR8 A; 4C8N A; 3L3V A; 1EP4 A; 3MMV A; 3CFP A; 4LD0 A; 3T1Y K; 5JLF A; 2G8W A; 2PYJ A; 4GVM A; 3IKM A; 5TKW A; 2G8U A; 1HNZ K; 1HR0 K; 2F9W A; 4B8C A; 3LP1 A; 1KLN A; 2A3Z A; 3VEO A; 3KVG A; 1IKX A; 2P9P A; 4FXD A; 3ZSX A; 4BWM A; 3P5J A; 1TAU A; 2P9P B; 2BGG A; 1K8A O; 3BY5 A; 1LV5 A; 4IZ9 A; 3EZW A; 2HVI A; 3ZYY X; 4B9T A; 4K43 A; 1Q82 O; 4WYB A; 5FPN A; 3RMB A; 1TK8 A; 4JI6 K; 3VTH A; 1X3N A; 3D6R A; 1NU0 A; 1C1B A; 2ZWH A; 1WSE A; 4CBW A; 4CEQ A; 3I0R A; 4YOT A; 4DTJ A; 3NH0 A; 4ZTF A; 3NF9 A; 4V19 S; 1S1X A; 4E3S A; 1OVY A; 3TSQ A; 4DTN A; 3P39 A; 1QVF M; 4ID5 A; 4DS4 A; 3SUO A; 1YF5 L; 4CF0 A; 2O8F A; 3PX4 A; 1BU6 O; 1VSE A; 1SKS A; 4CK3 A; 4AHU A; 4O0J A; 5AQS A; 4FPA A; 4OO1 J; 3O4Q A; 2BUP A; 4A2B A; 4JI8 K; 3P83 D; 1TK0 A; 4KRF A; 3A5O C; 1VQN N; 4JI0 K; 3THV A; 4PKI A; 1ATR A; 3AO3 A; 2GEM A; 1HX1 A; 4XH5 A; 3QDK A; 1YJ9 N; 3VA0 A; 2X6S A; 2JLE A; 4G1Q A; 1EWR A; 3SPY A; 4ILH A; 5SWM A; 4JS4 A; 2YX6 A; 3WXI A; 4OKJ A; 2O4G A; 4FLU A; 4CFC A; 4CZK A; 3IS9 A; 4LSN A; 1T7P A; 3LAK A; 1J5O A; 4JN4 A; 3LAN A; 1LCU A; 3NF7 A; 2CH5 A; 4JKF A; 3O6W A; 4UQG A; 1SZ2 A; 4GY2 B; 1J53 A; 3EE9 A; 4BRM A; 3ZCM A; 2DFF A; 1VSL A; 1IBM K; 3LWM A; 2HND A; 4PKG A; 3V1R A; 4HUF A; 4DF4 A; 1OH8 A; 4Y1C A; 1NK6 A; 1D9D A; 1JLA A; 4CGG A; 5EY4 A; 4DR6 K; 4CBU A; 1D9F A; 4BDY A; 4BDZ A; 3AA5 X; 2XHB A; 3THX B; 3JXU A; 5KPT A; 5EX5 A; 3KLH A; 4YOV A; 3AV9 A; 3ZSY A; 5BN9 A; 4DSK A; 2FSJ A; 2GWJ A; 4FLV A; 4B9Q A; 4PQU A; 4Z0U A; 2Q97 A; 3UB5 A; 1U48 A; 2QKB A; 4I2Q A; 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4BRD A; 4O0I A; 2GBZ A; 2HMP A; 2FBX A; 5C15 A; 2FBY A; 3LDQ A; 3R1X A; 4DTP A; 1HJO A; 2P9S B; 4CZE A; 1X1P A; 1ZBU A; 1NK8 A; 1H1V A; 5KGX A; 4LF9 K; 3PIP L; 1L3V A; 1VQ5 N; 4RW4 A; 4CEE A; 4KTZ A; 3S41 A; 4JKH A; 3ENH A; 4ZHR A; 3T1H K; 1SKR A; 4JD2 B; 2JWK A; 3CIP A; 4JV5 K; 1IJJ A; 4CHP A; 3ALY A; 3U9Z A; 5LJW A; 3HI0 A; 1BWF O; 5JVH L; 5AQQ A; 1Z6R A; 4PHT X; 1N36 K; 3MN9 A; 4H0Y B; 4ISG A; 5I9E B; 4DG1 A; 5LY3 A; 3WQU A; 3FZK A; 3AVA A; 4B1X B; 3NE6 A; 3HTV A; 4YHH K; 4H5V A; 5JS1 A; 3QES A; 5B8H A; 1JCE A; 2KQ2 A; 2ZGY A; 3SV3 A; 4H0P A; 3HT3 A; 4RG8 A; 3O1W A; 2O8F B; 1RBV A; 2ZJP L; 5AZI A; 3ASM A; 2IDO A; 1TYQ B; 4NYN A; 3V4I A; 1DGK N; 3SJH A; 4BR7 A; 3RMD A; 4E7L A; 1TGO A; 3K5O A; 4O5B A; 2LSN A; 1JCF A; 3AVL A; 1XI1 A; 3L2V A; 3VGM A; 5AJ3 K; 2EWS A; 3HP9 A; 5HOO A; 2KFN A; 4AHS A; 3T69 A; 4B3O A; 3EO3 A; 3HST B; 3ISN C; 1OVQ A; 1IV0 A; 2YNH A; 3H1Q A; 4FWR A; 4DSI A; 1NJW A; 3R6M A; 3ATU A; 2YHA A; 3O8M A; 4DFJ A; 1NLV A; 2HBL A; 1JLC A; 1NGD A; 4Q5V A; 2CH6 A; 3DWL A; 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