The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AQY K; 3J7Y P; 2UU9 K; 4NXN K; 4JV5 K; 5A2Q O; 2UUB K; 4DR3 K; 5IT9 O; 4DR6 K; 1XNQ K; 4GKJ K; 1FJG K; 4JI5 K; 5FLX O; 4CW7 B; 4X66 K; 4YHH K; 4V19 S; 5LMU K; 4LF8 K; 4KHP K; 4K0K K; 1IBM K; 4DV5 K; 4DR7 K; 4JI6 K; 4LF9 K; 4X64 K; 1XMO K; 4DUZ K; 1HR0 K; 4YY3 K; 4JI8 K; 3J7A P; 1J5E K; 1N32 K; 4DV6 K; 4LF7 K; 4LF4 K; 4DV1 K; 2HHH K; 2F4V K; 4DR1 K; 1IBL K; 4JI4 K; 4DV7 K; 4CVN E; 3JAM O; 4DV0 K; 1HNW K; 4X65 K; 3OTO K; 4DR5 K; 4LFA K; 1N33 K; 2VQE K; 4LFC K; 1N34 K; 5IWA K; 4DUY K; 3J80 O; 2UUA K; 2UXB K; 4DV4 K; 4B3S K; 4LFB K; 4NXM K; 5AJ3 K; 2UXD K; 1N36 K; 1HNX K; 4GKK K; 4DR2 K; 1XNR K; 2E5L K; 4JI7 K; 5LL6 Z; 1IBK K; 1I94 K; 4DV2 K; 4JI1 K; 3T1Y K; 3J81 O; 4JI0 K; 4OX9 K; 1HNZ K; 2ZM6 K; 4B3T K; 4LF6 K; 2UUC K; 4X62 K; 1XMQ K; 4DV3 K; 4LF5 K; 5BR8 K; 4JYA K; 3T1H K; 4DR4 K; 5LMN K; 4B3M K; 2UXC K; 4JI2 K; 4JI3 K; 4B3R K; 2VQF K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3K0S A; 4KFB A; 4B08 A; 3DAW A; 1ZC6 A; 2HBK A; 3GDQ A; 4CD3 A; 1RBV A; 3DLK A; 4I7F A; 5FPD A; 4ELU A; 5CZ1 A; 4A5A A; 4CIF A; 4ILJ A; 1NK5 A; 1B92 A; 4DR3 K; 3U3Y A; 5JLF A; 5I9E B; 3ZX3 A; 3CCE N; 2PY5 A; 2D0A A; 3A5M C; 5M1N A; 5HRP A; 4MO4 A; 4AHU A; 5GIN A; 1KFS A; 4CBW A; 4WF9 L; 4N56 A; 1FKO A; 4NYF A; 3NAE A; 2A6A A; 2PAV A; 4FJ5 A; 3SK3 A; 4Y1D A; 3I8B A; 4OPJ A; 1WSG A; 3TTF A; 3PLA A; 4KO0 A; 4KI6 A; 1Z25 A; 3KHY A; 4JI6 K; 4O5F A; 2X6N A; 3LZJ A; 3U6F A; 1UA0 A; 1VSK A; 4OKJ A; 3K5L A; 3AVK A; 2KZZ A; 2A41 A; 5BRD A; 5KTQ A; 1BQN A; 3HOS A; 3QBX A; 3PX4 A; 4CVN E; 4FOI A; 3QER A; 2HHT A; 5FRO A; 3SPY A; 3CC4 N; 5AQH A; 4IOC L; 1BA0 A; 3D2F B; 5MLC Q; 4BRG A; 2FSN A; 3J80 O; 3CM5 A; 1OH7 A; 3OA9 A; 1WN7 A; 2E6L A; 1U2V A; 4OGC A; 3AO3 A; 1RT6 A; 5SWM A; 2VG5 A; 3V81 A; 2F8S A; 1RBT A; 3IMX A; 1HNV A; 1W9H A; 3VQ8 A; 4H0Y B; 1DGK N; 5M1Q A; 3I33 A; 4DQQ A; 3SUQ A; 4LD0 A; 1Q82 O; 3DWL A; 1ASU A; 4JKD A; 4BRN A; 1S6Q A; 3AA2 A; 3PUF A; 2E1Y A; 2QWR A; 1VHX A; 2G8F A; 2YX6 A; 2Z1G A; 4U67 L; 5BRE A; 1QHT A; 3S3O A; 2E2N A; 1JCG A; 5AQS A; 1C0M A; 5HRO A; 1Z6R A; 3H1V X; 1YJW N; 1Q81 O; 4DF8 A; 1S1X A; 1TYQ B; 4ZTF A; 4JK7 A; 2ZD1 A; 1D8Y A; 1SV5 A; 1VSM A; 3R6M A; 2GX9 A; 4F9O A; 4MDA A; 3S3N A; 4AHT A; 1T44 A; 1T6C A; 1J53 A; 4DLE A; 1JCE A; 4N76 A; 3NGZ A; 3DLE A; 1C1A A; 2OAN A; 1X9S A; 4KAZ A; 3SAH A; 3CFP A; 4FOE A; 1NKC A; 2BUP A; 4KHP K; 3ALY A; 2QEX N; 1L3T A; 1BL3 A; 3RR7 A; 2X78 A; 3OBY A; 3ATU A; 1IBM K; 2RE2 A; 4PY5 A; 1FXX A; 4CER A; 1Q7Y O; 5DM6 L; 4E7H A; 3QB0 A; 3IUC A; 4R5P A; 1KSP A; 3V1O A; 4K43 A; 1YVU A; 4PL8 A; 4DLG A; 2IVO A; 1GOA A; 3R8E A; 1N32 K; 2ZJP L; 1RIL A; 3UKR A; 3L3U A; 3OYD A; 3SJJ A; 4MO5 A; 2ZWH A; 3ZSY A; 4FLV A; 5FPN A; 4M7Y A; 4CEF A; 3WNF A; 4B9Q A; 2HST A; 3LM9 A; 3VEZ A; 2D1K A; 1QQM A; 1W0H A; 2XO7 A; 3MX5 A; 4FJL A; 2YHW A; 4J2B A; 1TK8 A; 1VQ8 N; 1Z26 A; 2F9T A; 2RHK A; 3HP6 A; 1NK0 A; 1NM1 A; 2UUA K; 4F3T A; 4DFK A; 3TAG A; 5AQR A; 3OBW A; 3O9T A; 4FSV A; 5HRN A; 3OYM A; 3O8M A; 3ZT3 A; 4IO9 L; 3CCM N; 4H5N A; 1RBU A; 3EEQ A; 3ZSQ A; 1W7A A; 4DV2 K; 4OLB A; 2P9N B; 5AR0 A; 4JI0 K; 4DTR A; 3C0B A; 4B8C A; 1Q86 O; 1UWB A; 4CF0 A; 1OH6 A; 3F5T A; 3E9L A; 3ZSZ A; 2E2P A; 1JL1 A; 1LV5 A; 1XHX A; 4FJM A; 3LPU A; 4CGD A; 5C12 A; 3OYJ A; 2KZM A; 4BRQ A; 4B9U A; 3EY1 A; 3RWU A; 4E7K A; 3SBT A; 2HW3 A; 1JLA A; 2O8E A; 1RDD A; 4CZJ A; 2WC9 A; 3CFO A; 2YKM A; 3ISN C; 3KKR A; 1ZBH A; 4DSE A; 3HSC A; 2UYT A; 4JI5 K; 1HQU A; 4X66 K; 4YOX A; 3NH1 A; 2BE2 A; 1RT1 A; 3HO1 A; 1RT3 A; 3CD6 N; 2V51 B; 1G99 A; 3MED A; 3KKS A; 2V7Y A; 1D9F A; 1X3N A; 2DTU A; 2V52 B; 3N4Q A; 4CJK A; 2KTQ A; 4CHY A; 3KJV A; 2IDO A; 2QWO A; 4CIE A; 2X74 A; 5FPM A; 4QOZ B; 3TAB A; 2Q97 A; 1CZB A; 3KTQ A; 5M1K A; 5LJV A; 4IFE A; 3M8P A; 2OPQ A; 3TU5 A; 2X6S A; 2VQE K; 3V6D A; 3HP9 A; 4DUY K; 5HL7 L; 4NCB A; 3O4N A; 1WAF A; 3VQD A; 5I42 A; 2GUI A; 3O08 A; 4MLE A; 4BE1 A; 1T7P A; 3SUP A; 1NK7 A; 5AZJ B; 3CJB A; 3SLC A; 1YJ9 N; 1K9M O; 3KLE A; 1KLM A; 3W3D A; 1SL1 A; 3HPO A; 2ITM A; 2D0B A; 2P9I A; 3LDN A; 2D0O A; 3O1W A; 4M3Y A; 2JGU A; 4OX9 K; 3BZC A; 4CJV A; 2QTD A; 4CJR A; 4B9M A; 4QS8 A; 4L3Q A; 4FWS A; 4FWQ A; 4OJR A; 2FSJ A; 3HYF A; 4YDU A; 2QXF A; 4FWK A; 3LDS A; 2IVP A; 4BRL A; 4DTO A; 3TWH A; 1VAZ A; 5AQI A; 3TAR A; 3WEE B; 5AQT A; 2B4J A; 2PFU A; 3OYC A; 4CEO A; 1BO5 O; 3AVM A; 3MN5 A; 1WSI A; 2HHX A; 3UKU B; 1TAU A; 3AA5 X; 2OA8 A; 1VQ4 N; 4KHW A; 1SL2 A; 2QW9 A; 4JKH A; 3LP1 A; 2G8I A; 3DOL A; 3HPH A; 1GLE G; 4IFV A; 3KD1 E; 4KTQ A; 3VEW A; 3T1A A; 4CW7 B; 3U3G A; 1VRT A; 4BRE A; 4FLY A; 1V4S A; 2O8B A; 3I55 N; 4LF8 K; 3LZI A; 2HMI A; 4K0K K; 3LAK A; 1NJY A; 3U9Z A; 5TKW A; 3VQA A; 3L2Q A; 2GEM A; 3C6U A; 4JS4 A; 4FLX A; 2Y1I A; 2IAJ A; 4X64 K; 1XMO K; 3CME N; 3CCV N; 1YVN A; 4LF7 K; 4DTS A; 4CJT A; 3VF6 A; 2KQ2 A; 2GV9 A; 3AGK A; 5HP1 A; 5AQK A; 3HM8 A; 2HHH K; 2ZGZ A; 5KRS A; 4YFU A; 3KK2 A; 4DV0 K; 3HJF A; 4CFD A; 5BPM A; 3SMP A; 2P9P B; 5JVG L; 3QET A; 4DU3 A; 4DQ8 A; 3BY5 A; 1KXP A; 4KV8 A; 4WE1 A; 2FSK A; 4DTJ A; 2W40 A; 4EP5 A; 4H0P A; 1X9M A; 2Q1N A; 5AJ3 K; 4CK3 A; 4FM1 A; 4DR2 K; 3D0P A; 5AZJ A; 3CQ8 A; 3EYZ A; 1Q18 A; 2IVN A; 3DRR A; 4WFN L; 2A40 A; 2PYL A; 4CHO A; 3KVG A; 3VPZ A; 1IBK K; 2FBY A; 4BRP A; 1X3M A; 3DYA A; 5J1E A; 3V9W A; 3ZET B; 2HBL A; 2A5X A; 4BE0 A; 1U04 A; 4LF6 K; 4O44 A; 2VGM A; 4E7J A; 3S41 A; 3EZW A; 1NOY A; 4DFJ A; 3BDP A; 1SS6 A; 3I0S A; 4H5T A; 5KI6 A; 5K14 A; 2OPR A; 3WEE A; 2VQF K; 2I7P A; 3ENO A; 3CQX A; 1KFD A; 3L2W A; 4B9N A; 3VTI A; 3J7Y P; 3RTV A; 5KRT A; 1T3V A; 4NO7 A; 4NXN K; 4KB1 A; 3TSQ A; 3OW2 M; 5BR9 A; 5A2Q O; 3VQE A; 3CCR N; 5I3U A; 3UKU A; 4RW9 A; 4CJP A; 3AAP A; 2VG7 A; 1F21 A; 1WSH A; 2WBN A; 5HRR A; 4DTX A; 4AHC A; 1S22 A; 2NRZ A; 1S1T A; 2GWJ A; 4HCC A; 1SQK A; 3DLB A; 3HPG A; 2ZJQ L; 3ZT0 A; 4CES A; 3ZYY X; 1YIJ N; 2YHX A; 1BOT O; 4JS5 A; 4V19 S; 1ZBL A; 3K5O A; 4M7X A; 4JKB A; 3QNN A; 4KH5 A; 3K9K A; 1I39 A; 3MCA B; 3CF5 L; 1S3X A; 1GLL O; 1J54 A; 1E4F T; 4DUZ K; 4YY3 K; 3K59 A; 2AJQ A; 2HVI A; 4LSN A; 4DSL A; 4CEZ A; 2YI1 A; 4CJQ A; 3UE5 A; 3CXC M; 1W97 L; 4J2E A; 2G8H A; 4M3R A; 2PYJ A; 4JI4 K; 3T19 A; 4X65 K; 4MDB A; 4BG9 A; 3SNN A; 3DXK B; 3SJH A; 2P9P A; 4C23 A; 5AFU A; 3LAN A; 3AO5 A; 3EKU A; 1NGF A; 2VCP A; 1ESV A; 3IRX A; 3ZX2 A; 1LAW A; 2WUS A; 4F2R A; 3R9P A; 5AZI B; 4O8U A; 1GLC G; 1LCU A; 1Z05 A; 4IEE A; 2FF3 B; 2WON A; 5EOY A; 4BE2 A; 1TUY A; 3CC7 N; 3K5N A; 5D3G A; 2PZS A; 5EX5 A; 1BCO A; 4H0T B; 4BC3 A; 3C65 A; 3G0Z A; 3PSF A; 1C0G A; 3CCL N; 5LY3 A; 4OPK A; 1D9D A; 4B1U B; 2DY4 A; 1WBD A; 2AA4 A; 1VSJ A; 4DV3 K; 2YJE A; 4LF5 K; 1P90 A; 3T3F A; 3GE1 A; 4FM2 A; 4PKG A; 5AFU H; 3EO3 A; 2B5J A; 2RN2 A; 3VA0 A; 1NJZ A; 3DOK A; 3SQ4 A; 1HJR A; 2W6K A; 4FJ8 A; 3SAF A; 1HKB A; 3CCU N; 1ITG A; 4FWO A; 4CJ5 A; 3VQ4 A; 4BRF A; 5KPT A; 4RTF D; 1N5Y A; 3AA3 A; 1NMN A; 1RT5 A; 1QQN A; 4LSL A; 4B9S A; 1Q9Y A; 4CEA A; 3LWM A; 4FXD A; 2BAN A; 3L2R A; 3NFA A; 4BVP A; 1LWC A; 5GIP A; 4CHN A; 4BC2 A; 4CHZ A; 4GVE A; 5AQO A; 3I8D A; 2QKK A; 4IDH A; 3CJC A; 4WQ5 A; 5M1F A; 4FWM A; 3GL1 A; 1QTM A; 4NCA A; 4HVJ A; 1XC9 A; 4CEC A; 3QEW A; 5HBM A; 4FM0 A; 1GLA G; 1RDW X; 1NJX A; 2HNZ A; 3HST B; 2JLE A; 1YUW A; 4CEQ A; 1TGO A; 4H0O A; 5E41 A; 1KC8 O; 3KLH A; 5E84 A; 1HMV A; 3P38 A; 4A2B A; 1IBL K; 3DRP A; 3AO1 A; 3O4Q A; 4BVO A; 2I7N A; 1HNW K; 4KTW A; 3DXK A; 4EFH A; 3PO5 A; 4LFA K; 1LWF A; 4IFY A; 1KLN A; 1TK0 A; 4O4G A; 4CZI A; 1NKB A; 1BG3 A; 2O4G A; 3O9S A; 1IG9 A; 5AZI A; 4BRH A; 4A57 A; 4M45 A; 2W6L A; 3P31 A; 3VEX A; 3EN9 A; 2O8F B; 2CGL A; 1YHQ N; 3ULD A; 3K57 A; 1YF5 L; 4EIA A; 1GOB A; 3WXL A; 3VGM A; 1RTI A; 1VQO N; 1FKP A; 4LC9 B; 4H5V A; 1QSS A; 4FJG A; 1HYZ A; 1EQY A; 4BAC A; 3O9R A; 5GIO A; 4R79 A; 3AVI A; 2P5O A; 3C94 A; 1ZBS A; 2IC3 A; 3IKM A; 4EP4 A; 3LP3 A; 2G8K A; 4B3M K; 1S6P A; 4K25 A; 1VSD A; 3OS1 A; 1IKX A; 3CJA A; 3BF1 A; 2A1S A; 1UOC A; 1E3M A; 3RMA A; 5AQN A; 4B3R K; 3WUH A; 3MXM A; 1FW6 A; 1NK9 A; 1JLE A; 4O0J A; 2Q36 A; 1BIU A; 3MDQ A; 4UQG A; 1NU0 A; 3L4I A; 4CGG A; 3IS9 A; 1SUQ A; 1YI2 N; 4RCH A; 2H3G X; 2DFF A; 2P9K B; 4YDU C; 4A5B A; 2E6M A; 5HOO A; 4RG8 A; 4U7B A; 2OYQ A; 5AQP A; 3O9U A; 1VSE A; 2WTU A; 4KHN A; 1FJG K; 5C25 A; 1VK0 A; 3LP0 A; 3EE9 A; 3CMA N; 1NJW A; 3QO9 A; 1EKE A; 4YHH K; 4W5Q A; 4DTM A; 4DU1 A; 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3ZSO A; 3PIO L; 3WNG A; 5EXW A; 1NGJ A; 4CFA A; 4CJ3 A; 3PV8 A; 1KAX A; 3MN7 A; 4NYN A; 5J2Q A; 2VWB A; 5J2P A; 1CZ9 A; 4DFM A; 1RDA A; 3CFR A; 4G1Q A; 3CET A; 1TYQ A; 2NLX A; 1L3V A; 3PSI A; 1NGB A; 4PL7 A; 1RDU A; 1YJN N; 4NB4 A; 3ZX0 A; 3A5O C; 5GAG P; 3O3H A; 4BDZ A; 4Z4I A; 3G6E N; 4IEI A; 2I5J A; 3THW A; 4FJ7 A; 4MQ3 A; 1RCH A; 1LW2 A; 4DTN A; 3KK3 A; 4J2A A; 1NBW A; 4C8L A; 2ATQ A; 4CFC A; 3JAM O; 1RBS A; 4M63 C; 2D0P A; 3JS6 A; 4DR5 K; 3FFK B; 2HBM A; 1TKT A; 4DSK A; 4JKG A; 4I9L A; 1N34 K; 4OLA A; 1QVF M; 5AQJ A; 1BUP A; 4B3S K; 4RW4 A; 3WNE A; 4ISF A; 1EWR A; 3DLH A; 3VQP A; 2P9S B; 3WXK A; 4KPY A; 1RDC A; 4GNI A; 4FWL A; 1A5W A; 3KLI A; 1U45 A; 1ATN A; 5M1P A; 3KLG A; 4FJK A; 1L3S A; 1TUU A; 3CPE A; 4QS9 A; 3J81 O; 2P51 A; 3N4P A; 2B6A A; 5JS2 A; 3MEG A; 2UUC K; 2ZE2 A; 1RT2 A; 3HTV A; 4X62 K; 1TL1 A; 4HUE A; 2HHU A; 1KAZ A; 2UXC K; 3ZSX A; 3AAQ A; 3E01 A; 3DMJ A; 2E88 A; 4KHS A; 4IG3 A; 3BUZ B; 5C24 A; 3CG7 A; 5DM7 L; 4O8K A; 4K8X A; 1TKD A; 1QQO A; 4H5R A; 2P9L B; 4BQL A; 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