3VENA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz
Total Genus 201
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
201
sequence length
571
structure length
571
Chain Sequence
b'HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTKDLRH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule tags Transferase
total genus 201
structure length 571
sequence length 571
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3venA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3venA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3venA03
2FF6A 4DB3A 2A6AA 4H0XB 2Q97A 5F1XA 3D2EA 3UKUA 1Y64A 4H0VB 2A5XA 4BC4A 2E8AA 1NGFA 4JNEA 2VCPA 5BPMA 4KBOA 3LDLA 4ISEA 4JHDA 3O6WA 1ATSA 4XH1A 4BR4A 4F9OA 4XH4A 1XC3A 3BEXA 4FOIA 2D0OA 5BN9A 1NGJA 1TUYA 3VF6A 3HBTA 2QWLA 2EWSA 5AQKA 3CJ1A 3VEZA 3A8YA 3LDNA 3H1QA 3BP8A 1WOQA 1S3XA 3VEOA 4NB4A 1LOTB 4FWQA 1JCGA 1E4FT 3MDQA 3U9ZA 2ASOA 4B1YB 1ATNA 3CHWA 3VGKA 1GLBG 3EZWA 1HPMA 2W41A 2W40A 4BROA 2IVOA 4IJAA 2BTFA 3O08A 4K25A 1T6CA 4IZ9A 1BA1A 3GG4A 3ZX2A 3D2FB 1LCUA 3EKUA 4H0OA 3QFUA 4H0PA 4PKIA 5KPZA 3KHYA 2ZF5O 3GOIA 3RSEA 4BRLA 3WXJA 1NMDA 1V4TA 1TYQB 4RWTA 2NRHA 4XEIA 1SQKA 3CJCA 2ZGZA 3AAPA 3EN9A 4BRGA 5AQIA 1X9JA 4O5FA 3O1WA 3BF3A 3DWLA 3D7EO 4DQ8A 5BREA 2QWOA 1BOTO 2GUPA 4YDUC 4Z94A 3R6MA 4H5NA 3CJBA 3VOVA 3FGUA 1DGKN 2VYPA 3DXKB 1U2VA 2P9PA 4BR5A 4K43A 3U9DA 1KAYA 4BVOA 3H3OB 1KAZA 1Z6RA 3L6QA 1MDUB 1NWKA 3VEXA 4CD3A 5KPTA 3GDQA 4FWSA 3JXUA 3A5OC 3UKRB 4CZFA 2E2OA 3QFPA 4PL8A 4B1ZA 4FWLA 5AQUA 3UE5A 4BGAA 1GLCG 3LDPA 5AQTA 3O4WA 3U8XA 5AQMA 3VENA 3WUHA 5LJWA 3WEEB 3GL1A 1QZ5A 3LDOA 3VESA 4BRDA 2FSNA 5AQXA 4CZGA 4GY2B 2Q0RA 4WQ4C 1SZ2A 4ISGA 4IWVA 2P9LA 2D1KA 3BUZB 4EFHA 3U4LA 2J4RA 1NGIA 1HX1A 4B1WB 4BC2A 2D4WA 3WXKA 2P9UB 2V7YA 5BRDA 1C0GA 2UYTA 4DCHA 1G99A 1OKJA 4GNIA 3O80A 4MLEA 5AZIA 5AQJA 3ZETB 2QWMA 3OHRA 3W0LA 1MA9B 2QM1A 1SAZA 3AY9A 3HZ6A 2CH6A 5AZJB 4BR0A 5BPNA 5F0XA 1XQSC 2P9IA 2E2PA 2HF3A 4B1XB 1QZ6A 3MMVA 2YHYA 3EKSA 5AQZA 4BC5A 2CGKA 5KQ8A 1JCFA 3EL2A 1ATRA 4CJ7A 1ZBSA 4PKGA 1QQMA 5AQFA 5LY3A 2V52B 1BUPA 3F9MA 2GELA 5AQLA 2E20A 1GLFO 4FL9A 2WUSA 4RTFD 5AQGA 3TSQA 2YHWA 1NGEA 3QDKA 3D2EB 3UKUB 4QS9A 5EXWA 3R9PA 4AM6A 4Y0WA 3CQYA 5ADXH 2QWRA 3L4IA 3O1BA 4BRAA 3H1VX 4CZKA 3TTFA 5FPNA 2CGLA 3VERA 4JHDB 4CZEA 4JAXA 5AQYA 2QWPA 4BRQA 2DPNA 3IMXA 1EQYA 1QHAA 5I9EB 3AAQA 4FWRA 3M6GA 2F9TA 2KHOA 2YJFA 5CE3A 4JN4A 2E2NA 1R59O 3EO3A 1X3NA 4IJNA 3FZMA 4CI6A 1GLDG 4FWOA 3VGLA 2D0PA 4MO5A 1U6ZA 4PL7A 1HUXA 1RGIA 3IUCA 4H5WA 3WQUA 2GWKA 1WUAA 3CJ7A 2E88A 2P9KA 2Q2RA 3LDQA 3VPZA 4BG8A 2QWQA 3QMLA 2FSJA 5AQRA 4H03B 4BQZA 3ENHA 2YHXA 5AQSA 3BF1A 4A62A 3SJHA 5JMVA 4WQ5A 3QB0A 3CQXA 3VGMA 2A42A 3B8AX 4CZHA 2HOEA 3ZX3A 1NGGA 1GLAG 4JD2A 1BWFO 2V51B 5KQDA 1IJJA 3VEVA 4BC3A 4CZJA 3AARA 4BR7A 1QQOA 2I7PA 3ZEUA 3MN7A 3DJCA 3DXMA 3HM8A 3D2FA 5AR0A 2H3GX 5EY4A 1K8KB 1U2VB 3SK3A 4H5TA 3LM9A 5ADXA 2Q0UA 2ZWHA 4H0YB 4K41A 2BUPA 4IXCA 1NGCA 3SLCA 3UB5A 4HWIA 2NZTA 4BR2A 4CBUA 3J8AA 4H0TB 5JICA 2HMPA 3DXKA 1C0FA 1KXPA 3ULEB 1E4GT 2AP1A 5AQOA 5BR9A 3O5BA 2P9LB 5AFUH 5E84A 4H5VA 5LJVA 2VWBA 2ASMA 1BU6O 1IG8A 3ZX0A 5JLFA 4BG9A 2IIRA 3I33A 5AZIB 2CH5A 3VF4A 2I7NA 1BG3A 3VTHA 4EHTA 1HKCA 1GLEG 1S22A 2P9SA 2F9WA 3C0BA 1H1VA 2P9IB 2ASPA 4I6MA 4EHUA 5AQPA 4FWPA 4J8FA 4CD1A 4MLHA 1ZXOA 5BN8A 1T44A 1DEJA 2FF3B 1XUPO 2P9NA 5F2RA 2YCHA 3WT0A 4A2AA 4BRFA 1TUUA 1V4SA 1NM1A 1ZC6A 3M3ZA 5FPEA 1YVNA 3CJ9A 2QXLA 2OANA 3CIPA 3DAWA 4FWMA 3VEWA 4O8KA 1NGAA 2AA4A 4M7YA 4FPBA 4EAHD 5EX5A 3LL3A 3H46O 3LM2A 4QS7A 4NO7A 3P4IA 4FWKA 1YAGA 1T6DA 4XH5A 3TSPA 3HTVA 4B9QA 5EOYA 4BRPA 5FPDA 4WQ4A 5ELZA 3QBWA 4AM7A 4A2BA 4HTLA 5FPMA 5KPRA 5JLHA 4BQLA 3C7NA 2GTDA 2Q1NA 4WQ5C 5AQWA 3MN9A 3ATUA 3CJAA 4L3QA 5AFUA 1CZAN 3MCPA 2FXUA 2CGJA 4DHYA 5BRFA 4CBXA 4BVPA 2GWJA 1ESVA 3FR0A 1NBWA 3ID8A 2P9KB 2A3ZA 3KVGA 5AQNA 1HKBA 2HF4A 3TTDA 4H5RA 1BA0A 1HJOA 1NGDA 3CERA 3IFRA 4IO8A 3JS6A 3FFKB 4B1UB 3TSUA 3A5MC 4CZIA 2Q31A 3CI5A 3RSEB 1MWKA 3TU5A 5EVZA 3FLCO 3KZBA 5TKYA 1KAXA 4JD2B 3VF2A 3G25A 3GBTA 3TTCA 1JCEA 3FZFA 3H45C 3MN6A 3ZEUB 3DXMB 3FZLA 1Q18A 2P9PB 2FLOA 3CETA 1Z05A 2E2QA 3MN5A 4RCHA 3S41A 1NGBA 1TYQA 5AQHA 4B1VA 3FE1A 2GEMA 3WXLA 1P8ZA 4M7XA 2YI1A 1X3MA 4FPAA 2Q36A 2E1ZA 5E26A 4CZMA 5AQQA 3L0QA 4BRKA 4FO0A 4BRIA 4FOEA 1K8KA 2IVPA 3VEYA 4BRNA 3HI0A 4K42A 4PKHA 1HLUA 3HSCA 4MO4A 2ITMA 3UKRA 4ISFA 4FSVA 4BGBA 5AQVA 4E1JA 3WQTA 4CZLA 4CBWA 4FWNA 3A5NC 3SMPA 2QWNA 3H6EA 3WEEA 1YXQA 3FZHA 1BDGA 4LC9B 1QQNA 4BRHA 3ULEA 1YUWA 2P9SB 2E1YA 1RFQA 1GLLO 4I6MB 4YDUA 5BRHA 2A41A 3A5LC 4BRCA 1D4XA 3MK6A 2V7ZA 3QBXA 2FSKA 3GE1A 1NGHA 3I8BA 4M63C 1J6ZA 2IVNA 2P9NB 2P9UA 2PAVA 3TPQA 3VETA 5B8HA 3W3DA 1BO5O 1MWMA 3ZETA 3A0IX 3O8MA 2NLXA 4WYBA 4BR9A 3IDHA 4EIAA 5AZJA 3SMSA 1GLJO 1RDWX 3QICA 4BRMA 5BPLA 4A61A 2ZGYA 3M1FA 1NLVA 1DKGD 3ENOA 2PBDA 1HKGA 4BREA 3FZKA 3R8EA 4C23A 2A40A 3H3NO 4QS8A 2YJEA 3ATVA 2QW9A 3C7NB 3WXIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2A6AA 2X78A 5F1XA 4O0JA 3F73A 2NUBA 3TI0A 3VQDA 2E8AA 1NGFA 1J53A 4JNEA 3K58A 1L3TA 4JK8A 1VRUA 3SCXA 4JI3K 3CFOA 4CGIA 4B8AB 3O6WA 4DQSA 4XH1A 4DFPA 3R3LA 4Y1CA 4F9OA 4XH4A 4LF9K 4V19S 5BN9A 3AA3A 4LH4A 3PX6A 3MEDA 2EWSA 4DTXA 3A8YA 3LDNA 3H1QA 3ZYYX 1S3XA 4CHQA 2JGUA 1QHTA 2RN2A 3U9ZA 3BDPA 4DSLA 3VGKA 4Z4IA 1HPMA 1YTUA 1NJWA 4DSFA 2W40A 2RIUA 2HNZA 1BA1A 3E9PA 2OPSA 3THXA 3QFUA 4YORA 3KHYA 3RSEA 4BRLA 3WXJA 4OLBA 4JKEA 1NMDA 4ELTA 1V4TA 1VSIA 2NRHA 4XEIA 1OVQA 3CJCA 3AAPA 4BRGA 5AQIA 1X9JA 5HOOA 2ZJPL 3D7EO 5BREA 4C1NI 1VQLN 4Z94A 3R6MA 1J54A 3FGUA 1DGKN 3LALA 2X6NA 4F8RA 3U9DA 1B92A 1RT3A 4DSJA 5D3GA 3L6QA 3LDSA 1NWKA 4CD3A 5KPTA 1HR0K 2G8IA 4LF6K 1TKSA 4FWSA 4CFAA 3A5OC 2E2OA 1VQ4N 1RBRA 4KO0A 1C1BA 1GLCG 3LDPA 1WLJA 5KGXA 4GW6A 4B9NA 3ZSWA 1IKVA 3GL1A 3J7AP 3LDOA 3LANA 3PO4A 2ZJQL 2FSNA 4WE1A 1SZ2A 2B4JA 3CCQN 2O8EB 3BUZB 4CHZA 3U4LA 4FK2A 2Z1HA 4BC2A 4OPKA 1RBUA 4IEEA 4E3SA 1FKOA 1G99A 2D0CA 2F8SA 1SAZA 4BR0A 1NMNA 2G8UA 3L2RA 1SKWA 2P9IA 4CJFA 3VN5A 4BC5A 2CGKA 1JCFA 1GOBA 2RPIA 5C2DA 3DRSA 1GOCA 1QQMA 3HT3A 5I42A 3VQ9A 1KCFA 1HQEA 2OZMA 4NCAA 2UXDK 5JS1A 4PQUA 4HUEA 4NXNK 2YHWA 2O8CA 1S5JA 1UWBA 4QS9A 2BH1A 3N4QA 1VSFA 4JI8K 3CQYA 5FDLA 2X6SA 1S6PA 3H1VX 4O4GA 1VQNN 3VERA 3OY9A 1FJGK 3F2KA 4JAXA 2QWPA 4BRQA 1JLCA 3IMXA 3VTIA 1ZBHA 3CCMN 5HRNA 1QTMA 2YJFA 2P51A 5CE3A 2OTJN 1R59O 1SKSA 4IJNA 3SYZA 3OS1A 1HUXA 4H5WA 3V9UA 2FBVA 3MAQA 4JKFA 2HHHK 4FM0A 4B3TK 1BQNA 4O0IA 4F2RA 4Q0BA 2FSJA 4X66K 4FM1A 2YHXA 1VAZA 4JI4K 3THXB 4RW9A 1SV5A 3T1HK 3TAPA 1JLBA 3CQXA 3VGMA 2A42A 2HOEA 3CCLN 4M42A 4KV8A 3DMJA 4JD2A 4GKJK 3THWA 1J9AA 4DR7K 5KQDA 1IJJA 3VEVA 2HHTA 1RDDA 3AARA 1NJXA 2VQFK 3P31A 3ISNC 3KWIA 5GINA 3HM8A 4OKJA 3DLGA 3LM9A 3OYCA 3WNEA 5FRNA 1S72N 3ID6A 2OPPA 4K41A 1D9FA 3UB5A 4NXMK 2NZTA 4CHPA 4A5AA 1VQKN 4CGDA 3J8AA 4KH5A 3CMAN 1BIUA 2B6AA 1N5YA 3DLEA 3DXKA 4JKGA 1C0FA 4JI0K 4IOXA 2MX1A 4P77A 2AP1A 4M3RA 4KHQA 5LMNK 3O9RA 4OGEA 5AFUH 5E84A 3MGZA 3OBWA 4DF8A 4WCEL 2OZSA 1IG8A 1CZ9A 3VA3A 3I33A 4C8OA 4CFDA 1SUQA 4DTUA 2I7NA 4JKDA 4OPHA 4C8KA 1IBMK 1S22A 2P9IB 2I5JA 2RE2A 3I0SA 4FWPA 3AO2A 4CD1A 3K57A 1T44A 3O3GA 5F2RA 1EWQA 2YCHA 1K49A 1TUUA 2QI2A 4JI1K 1TKZA 3T69A 3SUQA 4IKFA 3QNOA 4I14A 3KWGA 2PYLA 3ZT2A 3CPWM 4MDBA 1YITN 3PSIA 1ZBFA 4FWMA 1IKXA 5C42A 1SNNA 2O8CB 4DFMA 3H46O 3SUOA 4FLZA 2YHAA 3CM5A 4NO7A 3P4IA 4K8ZA 3MWPA 4DLEA 1T6DA 3TSPA 3HTVA 4BRPA 3HJFA 2KW4A 4A2BA 4CF1A 4JRQA 2PY5A 4H4MA 4JKAA 4WQ5C 5LL6Z 1RBSA 3G0ZA 4FJLA 4L3QA 5J2MA 4KH4A 1CZAN 4LF8K 3E01A 4E7HA 3S3OA 2FXUA 4FJKA 4OKEA 2EHGA 4BVPA 2UXCK 1ESVA 3OYAA 3HPGA 3O3HA 3D0PA 3EEQA 3MXIA 4CEQA 1IEZA 3DYAA 1NGDA 1JL2A 1K4LA 3JS6A 1RDUA 3FFKB 3TSUA 1O13A 2NRVA 4LFBK 2F7TA 3U6FA 3CI5A 4DV3K 3NVKA 1C1AA 4M41A 3KZBA 1YF5L 1L5UA 1QSLA 4JD2B 3CC7N 3VF2A 4FJJA 1VQ7N 4MFBA 5M1OA 1RDBA 2HVHA 2ETJA 4X64K 3K2PA 3K9KA 5SWMA 3FZLA 4DV5K 2VWJA 4IBNA 1Q82O 2FLOA 3CETA 4OVLA 3MN5A 1ZBIA 2F4VK 4CHYA 3K5LA 3OYNA 4CJEA 3SQ0A 3L7VA 2A1SA 2FC0A 3E9LA 4CJ3A 4F4KA 1YJNN 2YI1A 5HL7L 1IBLK 5C15A 4CCHA 4WFNL 4B3MK 2E1ZA 4CZMA 1IO2A 1NJIO 4FJGA 1K8KA 4JKGB 2HBKA 4JI6K 1O1WA 2VG6A 5HLFA 1RTDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4GKK K;  3T7Z A;  4CJL A;  4NLB A;  1GLJ O;  3QIN A;  4CEC A;  3K5M A;  2KFN A;  4CGJ A;  2ZGY A;  4HHT A;  1HKG A;  3LP2 A;  1KVA A;  4IDH A;  4JS4 A;  3FZK A;  3R8E A;  5GIO A;  2ITG A;  4JI7 K;  2G8H A;  2FBT A;  3C7N B;  2HMI A;  3O9T A;  2FF6 A;  4O8U A;  1Y64 A;  4H0V B;  3V9S A;  2PYJ A;  3T1A A;  2DFE A;  3AVB A;  4LSL A;  4F3T A;  1NK9 A;  4KI6 A;  3P5J A;  3K5N A;  4JHD A;  1ATS A;  2HB5 A;  4I9Q A;  2UU9 K;  1JLG A;  1XC3 A;  4LF7 K;  3BEX A;  4R79 A;  2LSN A;  3UIQ A;  4OJR A;  4JKC A;  2D0O A;  4FLT A;  1NGJ A;  3AA5 X;  3HVT A;  3VF6 A;  4CGH A;  3KK3 A;  4AHV A;  3PLA A;  5KGW A;  3BP8 A;  1E3M A;  5GAE P;  1WSI A;  1LOT B;  1VSE A;  2WOM A;  3DLR A;  3QEP A;  4QOZ B;  2IGI A;  4KKO A;  3KLH A;  2W41 A;  3N4P A;  1LWC A;  2G8V A;  3OA9 A;  3MXJ A;  3SAF A;  2IVO A;  2UUB K;  3OYH A;  2BTF A;  1S1U A;  4DUY K;  3ZX2 A;  4CK2 A;  3NAE A;  1WSF A;  3D2F B;  4H0O A;  3EKU A;  5KPZ A;  3SZ2 A;  1J5E K;  1JKH A;  4CJW A;  1TYQ B;  1TK8 A;  4RWT A;  1SQK A;  5K14 A;  4JKB A;  1U49 A; 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 3MWT A;  5ADX H;  2IC3 A;  3O1B A;  4BRA A;  5FPN A;  2CGL A;  4JHD B;  1X9W A;  4AHS A;  3CCU N;  3NVM A;  1ITG A;  3O4N A;  2KZM A;  1LW2 A;  2ZD1 A;  3P83 D;  1NOY A;  1IG9 A;  5J2Q A;  2E2N A;  4N76 A;  3CCE N;  3L3V A;  1GLD G;  4FWO A;  1VK0 A;  3O3F A;  2O8F A;  1S1X A;  1VQP N;  1RGI A;  1WSJ A;  3AVN A;  4C8N A;  3WQU A;  2GWK A;  2YX6 A;  2E88 A;  4G9Z A;  1HQU A;  1A5X A;  4OPA A;  4CGG A;  1X9S A;  3ULD A;  4RW7 A;  1BHL A;  3OYM A;  1HMV A;  4Z4H A;  2HW3 A;  5CR4 A;  4BWJ A;  1T03 A;  4FJN A;  5DMR A;  4WFA L;  5JMV A;  4WQ5 A;  3QB0 A;  4FM2 A;  3AO3 A;  1QSY A;  1NGG A;  3L8B A;  3TAE A;  2HHW A;  3THV A;  1K4O A;  1GLA G;  5HP1 A;  3HM9 A;  4E7J A;  4CJQ A;  1VQ5 N;  5KRS A;  3G4S N;  3M8S A;  5AR0 A;  5EY4 A;  4L8R B;  4H5T A;  1F21 A;  3MEG A;  3OYB A;  4GVM A;  1JLA A;  2VGN A;  4KTW A;  2BUP A;  4IXC A;  1NGC A;  4FCY A;  3SLC A;  3WNH A;  3RRG A;  4EP5 A;  1HNZ K;  4BR2 A;  2ZM6 K;  1S6Q A;  4H0T B;  3RMC A;  1TAU A;  2HMP A;  4CGF A;  3ULE B;  1E4G T;  3DLK A;  1M90 O; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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