3MXIA

Trex1 3' exonuclease d18n familial chilblain lupus mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
219
Chain Sequence
TLPHGHMQTLIFLNLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALESQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 219
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxiA01
3IRXA 4EP4A 4KRFA 4YNQA 4KKOA 4O0JA 2A1RA 3DM2A 2Z1IA 4CEFA 4OGEA 1NK9A 3DLBA 1NKEA 4Z4GA 3NGZA 1UA0A 1S9EA 3AVGA 1TAUA 3LPUA 3AO4A 4H8KA 4CFAA 3QNNA 4FW1A 3NHGA 3KK2A 2KTQA 2D0AA 3QEPA 1KRPA 3QEVA 4CGDA 5DMRA 3MXMA 1NK8A 4DTUA 3VQCA 1C1AA 3ITHA 2X6SA 1TVRA 4KTWA 1U49A 1JL2A 1GOAA 5JS2A 3AVCA 4B08A 4J2AA 4DFJA 4TSXA 4YFUA 4E7IA 4J2BA 2X74A 2P51A 1L5UA 3VQ8A 3NCIA 4AH9A 3K5NA 3MEDA 1NJWA 4C8LA 1ZYQA 4B8AB 1NKBA 1YTUA 3SQ0A 2G8VA 2VWKA 3M8PA 1L3SA 2P5OA 3K5OA 2FBXA 4BE1A 2F8TA 3TAEA 1EP4A 2B5JA 5KGWA 4W5TA 3AA3A 1S6QA 3LWMA 4F3TA 4CEDA 3IS9A 3VA0A 1JLAA 4F3OA 4LY7A 5HBMA 3MXIA 1ASUA 4I2QA 4AHRA 4DLEA 2DY4A 4N47A 3NAEA 1CXQA 3JSMA 4FLYA 4FJ8A 1RDBA 3QERA 2VG7A 2PYJA 3LP2A 1Y97A 2G8HA 3AVJA 1Z26A 3VQAA 1KVCA 1U47A 1NK7A 1D9DA 3SV3A 3DLEA 4QAGA 1HYVA 1LWCA 3L3UA 3K58A 5J2PA 3HPHA 4LH5A 4CF0A 3LDSA 5I42A 5D3GA 4CEAA 4I7FA 4CFCA 3QINA 3QETA 1S1XA 2EHGA 1F21A 3AVKA 2HHUA 4FLUA 3DLKA 1UOCA 3VQ4A 1VSLA 3L2RA 3CFRA 1IKWA 4CEOA 4M41A 1HJRA 2ITGA 4GVMA 2IDOA 1O1WA 3VQ9A 3ZSYA 2HB5A 4CHPA 1S9GA 1C6VA 1IKYA 1CZBA 3VQQA 1NJXA 2FBYA 4Q5VA 2WOMA 3TI0A 3DLGA 3HL8A 3SQ2A 1JXBA 3B6PA 3ZCMA 2Y1IA 3S3OA 4N56A 3O3HA 3THVA 3QLHA 1L3UA 1IO2A 1X1PA 1JLQA 3KKSA 4B8CA 4CEEA 4F8RA 3NGIA 1U45A 2ETJA 1VSEA 5CZ1A 4E3SA 1D5AA 3PX0A 3SUNA 1QSSA 1KTQA 4CJQA 4DU4A 1RCHA 3LAMA 4KTZA 4AHCA 4DFPA 4E0DA 4HUFA 3TABA 4CGIA 4C8OA 2G8KA 3ZSZA 3U3YA 4E7JA 1QSLA 1EX4A 3TAFA 3IG1A 1B9FA 1WLJA 1VSIA 1JLFA 3AA5X 1D8YA 1RT3A 1RBRA 3ZT4A 1HQEA 4E7KA 3QESA 4CJ5A 4OKKA 3I0RA 4CJPA 4B9TA 5HRPA 4KHWA 1RNHA 1QHTA 2G8FA 4NCAA 4L8RB 3AO1A 4O4GA 4M3RA 4Z4CA 1LWFA 3HPGA 2E6LA 3L2WA 2Z1JA 4N76A 1X9WA 1TKTA 1NOYA 3EY1A 1ITGA 2KW4A 3RMAA 1RT6A 4JRQA 1J5OA 4FLXA 4FJGA 2HNDA 4CIFA 4OKJA 3CM5A 5DK5A 3A2FA 3DLRA 3ZSXA 4CFBA 3ZSOA 4CJVA 3ASMA 3CFOA 1HNIA 4DQQA 1I3AA 2FBTA 1BL3A 3QEIA 4FJ9A 4HCBA 4QCLA 2P1JA 3AVLA 3D45A 4CIEA 3AVIA 4B3OA 5CYMA 4CK2A 1TK0A 4DF8A 2O4IA 3OS2A 2PYLA 4PUOA 2OZSA 2HVHA 1BI4A 1RDCA 4OJRA 4E1NA 3MAQA 4PY5A 3KD5E 4AHSA 1SL2A 4DQPA 3S3MA 2DFEA 4CGHA 3M8QA 4F4KA 4CJSA 2VWJA 3TANA 4WE1A 4PA1A 4CF8A 3D0PA 4RG8A 3SZ2A 5FDLA 4K8XA 4DU1A 4M3YA 4N41A 3RTVA 4DSEA 2RF2A 3G10A 3HXMA 4EZ6A 3KKRA 4C8KA 2GUIA 3KD1E 4KHQA 4KPYA 4RW9A 5KRTA 1TKXA 3L2UA 3TARA 1MU2A 3JYTA 1U4BA 1NK6A 1QQCA 3NBPA 3WNEA 1TK5A 4JS5A 3DMJA 3K5LA 1WN7A 4FXDA 1RTIA 4O0IA 4BDYA 4HHTA 4OPJA 4DSFA 1T03A 4BWJA 2DTUA 4MQ3A 4CJUA 2KZMA 3QEWA 4CJ4A 1RT7A 2YHBA 3AVHA 3EZ5A 3F73A 4DTOA 5T7BA 1RDDA 4CCHA 4Q0BA 4CGJA 1SUQA 4KAZA 1EETA 4CGFA 1ZBHA 3SJJA 1QE1A 4DQRA 2QXFA 4FJ5A 4FZZA 1WSGA 3CQ8A 4ELTA 1XI1A 1EKEA 3SI6A 2RKIA 4CF9A 2Q3SA 4KI4A 2Y1JA 3K5MA 4Z0UA 2D0BA 4DTJA 4C8MA 4ICLA 4CECA 5HRRA 5C24A 5KGXA 4E1MA 4CF1A 3RR8A 4AHTA 3V4IA 3TAQA 4BDZA 4JLHA 2HNYA 1NJZA 2KFZA 1NK5A 4J2EA 4E89A 2IAJA 3AVBA 3DRPA 4XIUA 5J1EA 2X6NA 4KREA 1SKWA 1LW2A 1L3TA 4F2SA 3DI6A 3NF6A 2HHQA 4DTNA 4BE0A 3OYNA 2OPPA 3OYEA 3UIQA 2RPIA 4CFDA 3P5JA 5FRMA 4KO0A 3KLHA 4DTSA 1T05A 4CGGA 1ZBIA 2YNIA 3C6TA 5KI6A 1BGXT 4FW2A 4CJEA 4M42A 2AJQA 3ALYA 1JL1A 1KFDA 4CF2A 4CE9A 5C25A 4M3ZA 1GOBA 4IG0A 1GOCA 1HYSA 1BCMA 4NYFA 3TWHA 2YNFA 1BQMA 2ZD1A 1HQUA 3NF8A 3HT3A 4NCGA 3HVRA 4FLZA 1R0AA 4FYDA 3V6DA 5KTQA 4KHUA 3RRHA 3NDKA 3CG7A 2KFNA 4DSKA 3M8SA 1WSJA 1I39A 4Y1CA 3V9WA 2FC0A 1WSEA 1SKSA 4W5OA 3OYJA 4JS4A 4DU3A 3ZSQA 1JKHA 4QOZB 2HHVA 3LALA 2DFFA 1G15A 1VSMA 2Z1GA 1W0HA 4Z4HA 3VA3A 4I9QA 4K8ZA 2QKBA 4M3XA 3V9UA 3VN5A 1C1CA 3I0SA 2WONA 1JLGA 3LPTA 3NE6A 4DLGA 3V9ZA 2XY6A 1B9DA 1XC9A 4IKFA 4CEQA 2HHSA 4E7LA 3AVAA 1NK0A 4EP5A 4BWMA 4FJ7A 1SV5A 1TKDA 3DOLA 4DQSA 4IG3A 2YHAA 4Z4EA 5J2QA 1RT5A 3PV8A 4CIGA 4M45A 3KLFA 2G8UA 3P83D 3VQDA 3LWLA 3SCXA 2B6AA 1JXEA 3NH2A 1WNSA 3V1QA 3OJUA 3SNNA 1WAJA 4HUGA 1YTAA 4B9SA 2P5GA 1XHXA 3WNFA 4DMNA 1KSPA 5HROA 1XHZA 1WSFA 2ZE2A 4FZXC 3AO3A 3RMBA 1SL1A 4CESA 1LAVA 5KRSA 3TAPA 2OYQA 3HPOA 3RMCA 4DF4A 4LH4A 2YNGA 3LP3A 3L2QA 1RT4A 5FRNA 3OYKA 5SZTA 3E01A 4W5QA 5J2MA 4AHVA 5SWMA 2ATQA 4UQGA 1KLMA 4OGCA 4DS4A 4HCCA 1RTDA 4KHNA 1Q8IA 4N5SA 1CXUA 1DTQA 3KK1A 1WAFA 3AO2A 3VQBA 3OVNA 3V1RA 4DG1A 4FZYA 4FJXA 1QS4A 3RR7A 3RMDA 4ZHRA 2GV9A 1SKRA 3HP9A 4MFBA 4AILC 1U48A 2HHTA 4OVLA 4CJTA 4CJFA 3SQ1A 3SPZA 3SQ4A 2G8IA 4CJ3A 4CHZA 1S5JA 3VQ6A 4FLTA 2BE2A 2IOCA 2GBZA 3QIOA 1BIUA 4CJKA 2HNZA 3V1OA 4Y1DA 2X78A 4OPKA 3NH0A 5HRNA 4E7HA 2BGGA 3HSTB 5C42A 1KLNA 4PQUA 3K59A 1HRHA 1XWLA 3SUOA 2HW3A 1ZBUA 3TAGA 4FJHA 3O3GA 4FK2A 3VQEA 1A5XA 3ISNC 4DTRA 3TAMA 2E4LA 3B6OA 5HLFA 1KFSA 3ZT0A 2VG6A 2VG5A 2G8WA 1RTJA 2XY8A 3LP1A 3NF9A 4ID5A 4DTPA 3MEEA 5CY4A 4O44A 3T1AA 3MECA 1T7PA 2HMIA 2JGUA 3FFIA 4H4OA 4FJLA 4OLAA 3PX6A 3T19A 3U3GA 3OJSA 4DFMA 3EYZA 2R7YA 2HVIA 1ASVA 2RN2A 3HVTA 1NOZA 5K14A 4CJLA 2XHBA 3V81A 4DQIA 1QTMA 4FJKA 1RBTA 3LP0A 3G0ZA 3LAKA 2Z1HA 1C0TA 1TKZA 3SPYA 3KTQA 4B9MA 4DS5A 1FXXA 1TV6A 3KLEA 4FM1A 4IFYA 3HJFA 4LSLA 3NH1A 4KTQA 2KQ2A 3DLHA 5HP1A 2OZMA 4DSJA 4DTMA 1UWBA 4O5BA 3TR8A 4O55A 1LAWA 2B4JA 3OYCA 3KIOA 3KLGA 1RILA 5JS1A 1BCOA 3LZJA 4IFVA 4CK1A 4KHYA 1B92A 2O4GA 1CLQA 3OYFA 3ULDA 3OYDA 3RWUA 1QSYA 3AVMA 4BE2A 1RT2A 1RBSA 3ZSVA 4DWIA 1RT1A 1YVUA 4PWDA 3OYGA 3V9XA 2XY7A 3HP6A 4OLBA 4F2RA 1X9MA 1RBVA 3OS0A 4CHNA 3L3VA 1LWEA 2FBVA 1TAQA 3LZIA 3OY9A 3C6UA 2JLEA 3DRSA 3VQ5A 4CJRA 3MXJA 4FM0A 4DTXA 4G1QA 3PO5A 1U04A 3HM9A 3WNGA 1Z25A 3L8BA 1Q9XA 3QIPA 4EZ9A 4HUEA 3C95A 1IKXA 2ZQBA 4RW4A 2W42A 3BGRA 4CK3A 3T3FA 1ZBLA 1IG9A 4CEBA 1N6QA 1W9HA 2BDPA 3KLIA 1JLCA 4FLVA 3QNOA 4DSIA 4AHUA 1KVAA 1L3VA 1KCFA 4FLWA 4FJMA 3K57A 4W5RA 4ZTJA 3RRGA 4Z4FA 3ZT1A 3IAYA 1SL0A 1EXQA 3KK3A 1IH7A 3AVFA 4KI6A 5CYQA 3SUPA 2KZZA 3PUFA 1VSFA 3OYHA 3NFAA 4ELVA 4KB0A 3BDPA 4FK4A 3C94A 3OYLA 4CJWA 1NK4A 4Z4IA 4FVMA 4J2DA 1ZBFA 2HHWA 1J53A 1VRUA 3KJVA 1C0UA 4ZTFA 3OYMA 1N5YA 1HPZA 1TL3A 2OPSA 3AO5A 3MEGA 3O4QA 3S3NA 3AA2A 1S1TA 3QEXA 3SUQA 1LV5A 4ELUA 5E41A 1VSDA 1YT3A 1UA1A 1BISA 3QO9A 1C0MA 2NUBA 4FJNA 4HVJA 4KFBA 2HHXA 3U6FA 1J54A 2OPRA 1UAXA 4IDKA 4FJJA 1S1WA 4IBNA 4DSLA 2PZSA 4C8NA 3NF7A 1FKPA 3I8DA 5J2NA 4DFKA 1NJYA 4B9VA 4KB1A 4M3UA 3CYMA 1RTHA 3LANA 3OYIA 1VSJA 3HYFA 5EU7A 2BANA 3VQPA 4B9NA 1BQNA 4FCYA 1IKVA 4NCBA 2XY5A 1D9FA 4FJIA 1BHLA 2IS3A 1C1BA 2YV0X 2YKNA 3OYBA 3V9SA 2QKKA 4M3WA 5HRSA 2A1SA 2OPQA 4GMJB 1J9AA 3K2PA 3DYAA 4RW6A 4KHSA 3HO1A 3DOKA 1CZ9A 1FKOA 2PY5A 3L2VA 1LW0A 4BDPA 1HNVA 2XO7A 2I5JA 4KV8A 4I9LA 1VSHA 3ZSWA 3OYAA 4B9LA 1K6YA 4E19A 1WSIA 5FROA 1VSKA 2D0CA 4H4MA 4JRPA 1REVA 4W5NA 2YKMA 4CHQA 1RBUA 1BIZA 2IGIA 3NGYA 3HK2A 2QK9A 1RDAA 3AA4A 3CM6A 1DTTA 3CFPA 2F96A 4GW6A 3OS1A 3ZSRA 2XRIA 4RW7A 1S1VA 4FM2A 2YNHA 3H08A 2LSNA 4ID1A 2E6MA 3AVNA 3AV9A 2DFHA 4CEZA 3PX4A 4LD0A 4CERA 4BACA 1A5WA 1VRTA 2EX3A 3ZT3A 1Q9YA 4B9UA 3P1GA 3S9HA 1HYZA 1S1UA 1JLEA 4OKEA 5I3UA 1BI4B 1TK8A 1JLBA 4NYNA 1ASWA 3PY8A 2IC3A 1HMVA 3PO4A 3VQ7A 3DRRA 1T8EA 3F9KA 1NKCA 1TL1A 1A5VA 1DLOA 3M8RA 3WNHA 4FK0A 4R5PA 3O3FA 4M3TA 4RW8A 1WSHA 4CHYA 4I2PA 1VK0A 4LSNA 1S6PA 1TGOA 4HTUA 2F8SA 3ZT2A 1FK9A 3O4NA 1KVBA 3SYZA 3SV4A 2D5RA 4CHOA 2OA8A 1X9SA 5CZ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DM2A 2E1ZA 3NGZA 4DR4K 3QNNA 3P39A 3NHGA 2KTQA 2D0AA 5BREA 1C1AA 3IUCA 4KTWA 4WQ4C 1GOAA 4JKCA 2RE2A 2KHOA 1DT9A 1YUWA 3ID6A 2IVPA 1D4XA 1GLBG 2WUSA 5KQ8A 1L5UA 3NCIA 4DR1K 3K9JA 1NKBA 4B8AB 1YTUA 3SQ0A 2VWKA 5FPMA 1L3SA 3CCRN 3K5OA 4KHPK 4B3SK 4CEDA 3VERA 3A5LC 5AQXA 4LY7A 4JKGA 4J8FA 1ASUA 3MXIA 3VEXA 3AAQA 3LDPA 4NXNK 1CXQA 4FLYA 4FJ8A 1RDBA 1YAGA 3QERA 2VG7A 2PYJA 3AVJA 1U47A 3CQYA 1YJWN 4CEAA 4CFCA 4AQYK 1ILYA 4B3MK 3CERA 1BUPA 2FXUA 3AVKA 4BRDA 3M5RA 1SZ2A 1UOCA 3VQ4A 1VSLA 4QS8A 1O1WA 4O8KA 4M7XA 3ZETA 2E20A 1C6VA 1IKYA 1J5EK 4Q5VA 2WOMA 3TI0A 3O8MA 3SQ2A 3C7NB 4O8UA 3P31A 4Y0WA 1QQMA 3QLHA 2ZGYA 3NVKA 5BRDA 3SAGA 5FPNA 4BVOA 1RCHA 3LAMA 4DFPA 4KH5A 3EEQA 2UXDK 5HL7L 4E7JA 3TAFA 2V7ZA 3G25A 3O9TA 5AQUA 1RT3A 1S3XA 1HQEA 3FR0A 2O8FB 4K43A 4OKKA 5HRPA 4KHWA 4L8RB 4Z4CA 2E6LA 4BG9A 4C1NI 2QWPA 2Z1JA 1NOYA 3EY1A 2ZWHA 2KW4A 1OH8A 4FJGA 4OPHA 5DK5A 3ZSXA 4CFBA 1X3MA 4FJ9A 1I3AA 1BL3A 5AFUH 3AVLA 4CIEA 4B3OA 1W7AA 5CYMA 1TK0A 5AR0A 4LFBK 2EWSA 2OZSA 2HVHA 1RDCA 4OJRA 1YITN 2ASOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1BIU A;  4E7H A;  4FPA A;  3K59 A;  1XWL A;  1HKC A;  1DKG D;  2GWJ A;  4FK2 A;  1A5X A;  2UYT A;  4DTR A;  3B6O A;  2E8A A;  2VG6 A;  4GKK K;  3LP1 A;  3MEE A;  3T1A A;  3MEC A;  2O8C B;  2JGU A;  4OLA A;  3PX6 A;  3EYZ A;  4IOC L;  5K14 A;  2ZJR L;  4FJK A;  4DQI A;  3V81 A;  1QTM A;  1RBT A;  3R1X A;  2Z1H A;  1TKZ A;  4DS5 A;  3FZM A;  1M1K O;  2V52 B;  3KLE A;  5AQG A;  2UUC K;  3MMV A;  2OZM A;  2A40 A;  1UWB A;  3OTO K;  4Z94 A;  3KIO A;  5JS1 A;  1EWQ A;  4CK1 A;  3OA9 A;  2O4G A;  1CLQ A;  4MLH A;  3PIP L;  3ULD A;  3OYD A;  1QSY A;  3AVM A;  4BE2 A;  1RBS A;  3MN7 A;  1RT1 A;  1BDG A;  1GLF O;  1NGI A;  1YVU A;  2FSJ A;  3HP6 A;  3L3V A;  1LWE A;  3LZI A;  3OY9 A;  3WXL A;  3DRS A;  3CCS N;  2P9U A;  4CJR A;  4FM0 A;  4DTX A;  1NJI O;  1U04 A;  2P9I B;  4EZ9 A;  1Z25 A;  3O9R A;  3MX5 A;  4V19 S;  4HUE A;  3T3F A;  3BGR A;  1GLL O;  4FLV A;  1KVA A;  3RSE B;  4BC2 A;  3T1Y K;  3ZT1 A;  4JKD A;  3KK3 A;  5CYQ A;  3DXM B;  1VSF A;  3NFA A;  5AQY A;  4CJW A;  1ZBF A;  1E4F T;  1MWK A;  1WBB A;  1N5Y A;  4BR5 A;  3O4Q A;  1LV5 A;  3QFU A;  1YT3 A;  4BQZ A;  3VF2 A;  1BIS A;  3QO9 A;  2P9L B;  4HVJ A;  4KFB A;  2W6K A;  4IDK A;  4FJJ A;  2PZS A;  1FKP A;  3LAN A;  4H5W A;  3VQP A;  1VQL N;  4NCB A;  5JVH L;  1BHL A;  2YV0 X;  3N4Q A;  2QKK A;  1NGG A;  4GMJ B;  4JI1 K;  1TYQ B;  3K2P A;  4H0P A;  4IO8 A;  4RW6 A;  4AM6 A;  1WUA A;  1VQM N;  1FKO A;  3H1V X;  4WFA L;  4B9L A;  3LDL A;  4IOX A;  4CZF A;  1K6Y A;  4E19 A;  1WSI A;  2PAV A;  3VGK A;  1QZ5 A;  2A41 A;  4JRP A;  1G99 A;  4BRF A;  3CQX A;  1RDA A;  3AA4 A;  3TTD A;  5BR8 K;  4JK8 A;  3CHW A;  3VGL A;  1S1V A;  4FM2 A;  2YNH A;  4ID1 A;  3PX4 A;  3AAR A;  4DHY A;  4BAC A;  1VRT A;  4DQ8 A;  3P1G A;  5AZJ B;  3THW A;  3PY8 A;  4GY2 B;  2H3G X;  1K8K A;  3F9K A;  3M8R A;  1GLE G;  4CHY A;  4LSN A;  3FZK A;  3ZT2 A;  1XQS C;  2P9N B;  1T6C A;  3SV4 A;  2IVN A;  1X9S A;  2A6A A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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