3MXIA

Trex1 3' exonuclease d18n familial chilblain lupus mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
219
Chain Sequence
TLPHGHMQTLIFLNLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALESQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase/dna
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
total genus 78
structure length 219
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxiA01
3LPUA 5J2PA 4OVLA 2FBXA 4BDPA 4DF8A 2LSNA 1RT1A 4OKKA 4CF8A 3SQ1A 4AHCA 5I42A 1BI4B 1HRHA 1LW2A 1RBTA 1VSKA 2X78A 5FROA 3VQEA 2HMIA 5C42A 1IG9A 1NKBA 1S1UA 4CE9A 4C8KA 1Q9YA 4FZZA 2P1JA 3U6FA 2X6NA 3V9WA 4DTSA 1QE1A 1ASWA 3HYFA 4CF9A 3PUFA 3VQPA 4GW6A 1RDBA 3HVRA 3ZT0A 1T7PA 5DMRA 5C25A 4JRPA 3TAGA 3AA5X 1K6YA 1L3TA 4JRQA 3LP0A 4O5BA 1N6QA 1NJYA 2EX3A 3DLEA 4H4OA 3DLHA 4KHNA 4ZTJA 1QHTA 1WSGA 1KVBA 5JS1A 1TVRA 2O4GA 4CJTA 1WSJA 1U45A 1X9SA 4FJ9A 1HMVA 1QTMA 3C6TA 3ZT1A 1HNIA 3OVNA 2HNYA 2QKKA 1BQMA 3TANA 2F96A 1RDDA 1KCFA 4OKEA 4CF1A 3AO4A 3O3FA 3K5NA 1ZBUA 4Y1CA 3L2QA 2IAJA 3CM5A 4CGGA 2OA8A 3KD1E 4F2RA 4Z4HA 4KREA 1C1AA 3AVNA 2F8SA 4DFPA 2G8WA 3L3UA 4DTMA 1BL3A 4KTQA 3SUQA 1TAQA 3ZT4A 1X1PA 4M3RA 3KK3A 4Z0UA 3QEWA 4B9TA 1GOBA 1UA0A 3SQ4A 4CHOA 3RMDA 4Z4FA 4E7JA 1B9FA 1JL1A 3VQ4A 4Q5VA 3F73A 1DTQA 4ELUA 4CJRA 1RT7A 5KGXA 4IKFA 3TAMA 2DTUA 2YNFA 4DSFA 4F2SA 3ZSYA 1VSJA 1BIUA 3LP2A 1BHLA 2Z1HA 3M8QA 4B9VA 4J2AA 4FK0A 3WNFA 1WSFA 3RRGA 3VQDA 1J53A 1SV5A 4FLZA 4E7LA 4DQIA 1TV6A 2W42A 4M3UA 2IGIA 3KIOA 3SV3A 1XHZA 1T03A 3HPOA 4J2BA 1U49A 1NJXA 1CZ9A 3AVHA 4FLWA 1KFDA 3QO9A 2Y1JA 3S3MA 1T8EA 1RT4A 4FJIA 4IG0A 1RBSA 1WSHA 3LANA 1FKPA 2Q3SA 4W5RA 4J2EA 4DSJA 2O4IA 3CFPA 1JL2A 3OS1A 3OYGA 4M3YA 4DTOA 3TAEA 3AV9A 3NGIA 1VK0A 2E6MA 4KAZA 3DLGA 3RMBA 2P5OA 4BE0A 4HVJA 4CIFA 3ZSWA 3DOKA 3KTQA 3THVA 3K2PA 4KO0A 5D3GA 2HHQA 1B9DA 3CQ8A 3ULDA 1TKDA 3CG7A 4L8RB 2DY4A 3DLRA 1C1CA 4IFVA 1J5OA 1WLJA 4B8AB 4FJMA 4W5QA 1D9FA 4BDYA 4I9LA 1RDCA 4CIEA 3NDKA 5C24A 4DS4A 3DRSA 1XC9A 3MEEA 4DTRA 5HLFA 3L3VA 5HRRA 4Z4GA 2A1SA 2YNIA 1JKHA 2R7YA 1EXQA 1RDAA 3TAPA 1HJRA 1RBVA 3HXMA 4CGIA 1VSEA 4O44A 4CFAA 2Y1IA 4OJRA 3AVJA 3EY1A 1S1WA 4FJNA 1RT5A 1Y97A 4UQGA 1IKVA 4EP5A 4BDZA 4DLGA 3M8SA 3HPGA 3P1GA 3F9KA 1A5VA 1JLGA 3CFRA 3P83D 3G0ZA 4HCBA 1F21A 1BI4A 1NK5A 4FLXA 3ZSXA 4CF2A 1LWCA 3L2RA 4CFDA 5J1EA 1W0HA 1MU2A 1W9HA 1KLNA 4Z4IA 3C94A 3IAYA 1S9GA 4B9MA 3HJFA 4QCLA 4CK3A 4FLTA 3NF6A 4KHYA 1Q9XA 3KKSA 2RKIA 2HB5A 4OKJA 4DQRA 5J2NA 1TK8A 3LAKA 1S1TA 1JLAA 4ZTFA 3ZSQA 1S6QA 3WNEA 3AVGA 4AHSA 4W5TA 3A2FA 3V9XA 1VSFA 1QSYA 3QEPA 3SUOA 2GBZA 2Z1IA 3VQ6A 3OYAA 1HYSA 4CJSA 2HHSA 2YKMA 2PYJA 3NF9A 4DSLA 4R5PA 3SQ0A 3AVBA 4E19A 3SI6A 4E7KA 2G8VA 4CHYA 4F3OA 1EX4A 3O3GA 1WN7A 3QERA 4FJXA 4KHSA 4M3ZA 4DS5A 4CEAA 2HVHA 3RRHA 1HQUA 1UA1A 4FJGA 1VSDA 1WNSA 4CHNA 3JYTA 1IKWA 4DTXA 3L2WA 3EZ5A 5E41A 3V6DA 3HPHA 4FCYA 1LV5A 4M42A 2IC3A 2D0BA 3P5JA 5DK5A 3NF8A 3U3GA 3OYMA 1HYVA 4DF4A 4CFBA 1ITGA 2KTQA 3HP6A 4N47A 1TKZA 1S6PA 5HRSA 3LDSA 3AO1A 1SKSA 4B9UA 1LWFA 1NKEA 4K8ZA 3ISNC 3RWUA 1JXEA 4DG1A 1JLQA 4M45A 3S3NA 3QEVA 2VG6A 4H8KA 2KZZA 1LW0A 4AHVA 4DSIA 5CYMA 4YNQA 4BWMA 4DQQA 4LD0A 3T1AA 3ZT3A 3BDPA 2B6AA 4CJEA 4B08A 1NK9A 1NOZA 2KFZA 3PY8A 4FJ5A 1R0AA 3NBPA 4M41A 3AA3A 2HNDA 4CGDA 3ZSVA 4E7IA 1S5JA 1QSSA 4K8XA 3QIOA 1D8YA 1EKEA 3DLBA 1ASUA 1LAVA 2P5GA 1C0MA 3AVAA 4CERA 4OPKA 2PYLA 2Z1JA 4KHWA 2QKBA 1FK9A 3NGZA 3WNGA 3OYFA 4I7FA 2G8IA 4CJPA 5I3UA 1RILA 2OPSA 5CZ2A 1YT3A 1T05A 4IDKA 3DLKA 1SL0A 4AH9A 2D0AA 1KVCA 3OS2A 4GMJB 1JLEA 1ZYQA 1RT3A 1CLQA 2BANA 3NHGA 3PX6A 3OYIA 3L2VA 1JLFA 3TI0A 3PO5A 1J9AA 1RNHA 3SCXA 3EYZA 4CEQA 3TABA 1U48A 2HHXA 3KLEA 3AVFA 1XI1A 3NE6A 2GUIA 2QXFA 4CCHA 3LP1A 5HRNA 1NK6A 4LH5A 3TAFA 4H4MA 4CHZA 3OYKA 1B92A 1RBRA 3M8RA 3HP9A 1RCHA 2OPQA 3CFOA 3SPYA 4CEBA 2DFHA 1XHXA 3L8BA 1YVUA 4CJ4A 2G8FA 3NGYA 3LPTA 3KK1A 4NCAA 4W5NA 1TK0A 3NFAA 4C8MA 1RT2A 4N56A 1GOAA 1EP4A 2D5RA 4F3TA 4NCBA 4ZHRA 4C8LA 3IS9A 3ZSOA 3V4IA 1NJZA 1RTHA 3LWLA 3QLHA 3HK2A 3VA0A 3VQ5A 2KQ2A 3DM2A 1WSIA 2X6SA 3U3YA 2OZSA 4HUEA 3L2UA 3MECA 4CJLA 3HM9A 1UAXA 1X9MA 2VWKA 5J2QA 4CEZA 2FBYA 1VSMA 2DFFA 4CEFA 4HHTA 1ZBLA 4KPYA 3VQAA 4KTWA 4FJKA 1VSHA 3NH1A 1SL2A 4AHRA 1BIZA 2BE2A 2KW4A 2YNGA 4NYNA 3O3HA 2PY5A 4N76A 4CGJA 3OYCA 1RBUA 3D45A 4CIGA 3KLHA 3NAEA 3ZSZA 2ZE2A 3OYHA 1HPZA 3TAQA 2ITGA 4KRFA 3AVCA 4HUGA 5CY4A 2DFEA 4G1QA 3M8PA 2HNZA 4CECA 1UOCA 1WSEA 4LSNA 1BISA 4C8NA 1QQCA 4FK2A 1L3UA 1NK8A 4CJ3A 4CHPA 2A1RA 4I9QA 1I3AA 3LP3A 4KFBA 1IH7A 2GV9A 5CZ1A 2E6LA 3OY9A 3NCIA 1KRPA 2HHTA 1VSIA 4DU1A 5SWMA 2XY8A 3HT3A 4DU4A 4DSKA 2XY5A 2I5JA 4CJKA 5J2MA 2OPPA 1NOYA 4FJHA 5HRPA 4PUOA 1ASVA 4JS5A 1HNVA 1ZBFA 3OJUA 4ID1A 2YNHA 3TWHA 3AVLA 1KLMA 4GVMA 4KTZA 4FLYA 4DFKA 3V1RA 4CJFA 4RW8A 2OPRA 4ELVA 1SKWA 4J2DA 1RTIA 1TL1A 1L3VA 4KI4A 4KI6A 4B9LA 4FJLA 4F4KA 4DTPA 1CXUA 1IKXA 4I2PA 4FJ8A 2ETJA 4WE1A 3RMCA 3LAMA 3ZSRA 4B9SA 4Q0BA 4CFCA 3AO3A 1GOCA 4LY7A 5T7BA 3MAQA 3O4QA 3ZCMA 4FLUA 3VQ9A 2G8HA 1NKCA 1BCOA 3OYJA 4O0JA 3AO2A 1Q8IA 3AVIA 4BE1A 5FRNA 3IG1A 2ATQA 4EZ9A 3C95A 3ASMA 3HSTB 1YTUA 3AVMA 1I39A 3OJSA 1QS4A 4OLAA 1IKYA 5FDLA 1KFSA 3O4NA 1DLOA 3LZIA 1LWEA 4QOZB 4FW2A 3D0PA 3KK2A 1NK7A 1FXXA 1N5YA 4MQ3A 3PX0A 4HCCA 4PWDA 4W5OA 4CGFA 1ZBIA 1C0TA 1TL3A 4O0IA 2Z1GA 3VQBA 4EZ6A 3OYLA 4F8RA 4KHQA 1A5WA 1JXBA 1KSPA 1Z25A 5KRSA 4CJVA 4XIUA 4B8CA 4RW6A 4AILC 3MXJA 4FLVA 3DMJA 3AA4A 3WNHA 5HP1A 4ELTA 2ZQBA 3VQ7A 5KI6A 4Z4CA 2QK9A 2YKNA 4BWJA 4FZXC 3V9UA 4YFUA 4E0DA 3VQ8A 2RF2A 3MEDA 4CF0A 2IS3A 5HBMA 4Z4EA 3RMAA 2AJQA 4LH4A 4DLEA 3SV4A 4BE2A 4IG3A 3SYZA 3SUPA 4FYDA 3V1OA 3RTVA 3SQ2A 5HROA 2G8UA 1WAFA 3B6OA 4CEDA 3SZ2A 2HHWA 5K14A 3VQQA 4IFYA 3OYDA 4CHQA 3K5LA 4BACA 3PO4A 3I0RA 1S1VA 4M3TA 1ZBHA 1EETA 4FVMA 1L3SA 3I0SA 2XHBA 1WAJA 4MFBA 1C1BA 4FXDA 1U47A 4PY5A 1HYZA 1VRTA 2JLEA 4O55A 1SKRA 3RR7A 1YTAA 1X9WA 3QNNA 1NK4A 5JS2A 3OYEA 3S9HA 4OPJA 2XY6A 3KLIA 1SUQA 4FK4A 2B5JA 1XWLA 3KLGA 3V1QA 2VG5A 3MXIA 4QAGA 3VN5A 4KB1A 4PQUA 1TKXA 1RTDA 4DMNA 2XO7A 5SZTA 1Z26A 3BGRA 4ICLA 3QEIA 1KTQA 2WONA 3K58A 4KHUA 4E7HA 2E4LA 4AHTA 1G15A 4DSEA 1JLBA 4HTUA 4DTNA 4Y1DA 4JS4A 2VG7A 1LAWA 2BDPA 1U04A 3ITHA 5FRMA 4CJWA 3OYNA 4AHUA 3LWMA 3LZJA 4FM0A 2P51A 3RR8A 3AVKA 2YHBA 4NCGA 3PV8A 2HW3A 2JGUA 3NH2A 3PX4A 4B9NA 4FW1A 3DRRA 4CK2A 4DWIA 3TR8A 1CXQA 2YV0X 5EU7A 3K5MA 3TARA 4LSLA 1NJWA 2ZD1A 4M3XA 3K59A 4CEEA 1VSLA 1RTJA 2PZSA 1JLCA 3IRXA 4CESA 4HUFA 3KD5E 3QETA 3KKRA 5KRTA 1TK5A 3G10A 2XRIA 1VRUA 4N41A 3DOLA 2OZMA 3NF7A 4OGEA 4N5SA 4DQSA 2G8KA 2BGGA 3UIQA 1TAUA 3T3FA 4CJ5A 3HL8A 3CM6A 4OLBA 3DI6A 2EHGA 3V9SA 2FBVA 2NUBA 2OYQA 4C8OA 4DQPA 2KZMA 3T19A 3LALA 3KLFA 4O4GA 4E1NA 3SJJA 3NH0A 1SL1A 3OS0A 1UWBA 4PA1A 1HQEA 3ALYA 3ZT2A 1REVA 2XY7A 4DTJA 3FFIA 1D5AA 4TSXA 1NK0A 4CEOA 3VA3A 3AO5A 4RW9A 1C6VA 3S3OA 3K57A 3SPZA 2IOCA 4CJQA 3MEGA 4KV8A 2HHVA 2KFNA 2RN2A 3HVTA 4I2QA 4CJUA 3V81A 2HVIA 4E3SA 2RPIA 3AA2A 4E89A 3QNOA 3V9ZA 3QEXA 1KVAA 3QIPA 4CK1A 3SNNA 1BCMA 1S9EA 1A5XA 4DFMA 3DRPA 2FBTA 4IBNA 3CYMA 4ID5A 3E01A 3HO1A 2B4JA 1J54A 4FJJA 4B3OA 5CYQA 4DFJA 1BGXT 4RW4A 4KKOA 3DYAA 2HHUA 1BQNA 3I8DA 3OYBA 1C0UA 3B6PA 3K5OA 5KGWA 1TGOA 3VQCA 1U4BA 4FZYA 5KTQA 2VWJA 4RG8A 1CZBA 4E1MA 2X74A 3JSMA 3SUNA 4M3WA 2D0CA 4DTUA 3QINA 1FKOA 2FC0A 4RW7A 1IO2A 4FM2A 2WOMA 2YHAA 4JLHA 1L5UA 1S1XA 3KJVA 1D9DA 4OGCA 4DU3A 4FM1A 4KB0A 3MXMA 4NYFA 4CGHA 4EP4A 3QESA 1QSLA 2F8TA 3C6UA 1RT6A 2IDOA 1TKTA 3H08A 1O1WA 4FJ7A 1DTTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FZMA 3KK7A 2ZJPL 1BOTO 4OVLA 4DF8A 1RT1A 5AQNA 4H5VA 4CF8A 4O5FA 3CCLN 1VSKA 3O1WA 3GOIA 4JKDA 2EWSA 1IG9A 1NGGA 3MX5A 3U6FA 3HYFA 4CZIA 4JI3K 4CZEA 5C25A 5AQQA 4BR5A 4JEPA 5AZJB 3DLHA 2OTJN 4FWPA 1X9SA 1HMVA 4FWMA 3C6TA 1HNIA 1BQMA 5JICA 1KCFA 3KD1E 1GLDG 3F9MA 4AF1A 1HKCA 2G8WA 4DTMA 5IT9O 2A40A 4Z0UA 4IOAL 1JL1A 1VHXA 1DTQA 3SK3A 4IKFA 2ITMA 3THXB 4DSFA 3SMPA 3CCRN 3ZETA 4B9VA 2NRXA 4PKIA 1SV5A 1S72N 5BPMA 3J8AA 3LDQA 3TSQA 5FPDA 2BTFA 1T8EA 4IG0A 1WSHA 1FKPA 2Q3SA 2P9IA 3VGMA 4B3MK 3THWB 4M3YA 3TAEA 3AV9A 4LF4K 4KAZA 5KQ8A 3PIPL 3DLGA 2P5OA 4H5WA 4BGAA 3ZSWA 4H0OA 2UUCK 2CH6A 1B9DA 3HSCA 1DKGD 1TKDA 4I6MB 3DLRA 4GKJK 2O8FA 4CZHA 4FJMA 4W5QA 4I9LA 4CIEA 4DS4A 3DRSA 3MEEA 5AQLA 5HLFA 2A1SA 1JKHA 2R7YA 2I7PA 2HSTA 1QVGM 4CFAA 2W41A 2ZJQL 3O80A 4UQGA 3VESA 4BDZA 4GV3A 3HPGA 1JLGA 3P83D 3P39A 1XNQK 1BI4A 3MDQA 4CF2A 3DXKA 3L2RA 4CFDA 3AGKA 4ILHA 1W0HA 1KLNA 3IAYA 1NGDA 3WQTA 3NF6A 3O08A 3KKSA 2RKIA 1TK8A 3ZSQA 1XQSC 3AVGA 3A2FA 3FZHA 3V9XA 3QEPA 2GBZA 3VQ6A 3WEEB 4JAXA 3CJ1A 2HBJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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