3MXIA

Trex1 3' exonuclease d18n familial chilblain lupus mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
219
Chain Sequence
TLPHGHMQTLIFLNLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALESQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
molecule tags Hydrolase/dna
source organism Mus musculus
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
total genus 78
structure length 219
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxiA01
1IO2A 1LWEA 2B4JA 1NJXA 3KIOA 3M8PA 3OYLA 2HHTA 3ZT0A 3QIOA 3NHGA 3V9XA 5KI6A 4DSKA 1RBVA 3CFOA 3TARA 4Y1DA 3L8BA 3IS9A 4CJWA 1NJZA 3U3YA 1BQNA 1CZ9A 3SUNA 3OS2A 2D0AA 2VWJA 4FW2A 2F8SA 4CJQA 4CEDA 3LDSA 4DSJA 3DRSA 3L3UA 5C25A 4RW9A 3NF6A 4CHNA 3OY9A 4DU1A 2HHVA 3TWHA 4CFCA 4DQIA 2Y1JA 2IS3A 3F73A 1BL3A 3RRGA 4B3OA 3MEDA 1S6QA 3G10A 5T7BA 3S3OA 3NH0A 1JL2A 4B9LA 1C1BA 5C24A 1L3SA 1IKYA 1YT3A 1Z25A 3QIPA 3OS1A 3KLGA 4JS4A 4FM1A 3PV8A 3ULDA 3DYAA 4M42A 4F3TA 4KRFA 4N76A 1FKPA 3OS0A 1X1PA 4DG1A 3LWMA 4F8RA 2PYLA 4BE2A 1KFSA 1TL1A 1NOZA 3AVHA 3AO3A 3PO4A 4FJGA 3NGIA 4E19A 3VQDA 3VQCA 1IKVA 1DTQA 1NK9A 3B6OA 1NKCA 4FK4A 1WLJA 3V4IA 4CIEA 4AHCA 4JLHA 4R5PA 4DTNA 2B6AA 2P51A 1C0UA 1Z26A 1LAWA 3C95A 2HHWA 3NDKA 1T7PA 3CM5A 1RBRA 3VQ9A 2KZMA 1J54A 4DMNA 4CJ5A 3RRHA 3ZSOA 3HSTB 3KKRA 4B08A 3NGZA 3V81A 4CEEA 1XHZA 3DOLA 1SKRA 1D9FA 4DTMA 4M3ZA 5FRNA 1J53A 1QSSA 4TSXA 3AO2A 3P83D 3VA0A 3OYNA 1J9AA 3KLHA 4E7JA 4OGEA 3KD1E 3DLEA 2KFZA 3UIQA 3SPZA 1VRUA 3AV9A 1Y97A 3P1GA 3SJJA 3KK3A 4ZTJA 1JXBA 2XY8A 1TKTA 3C6UA 4HUGA 4FJIA 1JLAA 4FLZA 4DS4A 3AO5A 4E0DA 4NYNA 1C0MA 3NE6A 4DFKA 3AVMA 3OYCA 1VSHA 1W9HA 1QQCA 4KHUA 3K58A 1N6QA 1RT7A 3EY1A 4CJTA 1BIZA 4CF1A 1KLMA 3NH2A 3O3HA 3HJFA 4CJSA 1NOYA 3OYHA 1D9DA 3T19A 1Q9YA 4CGDA 5DK5A 3LP0A 4OLAA 3V1QA 4HHTA 4CEFA 1MU2A 4CHYA 4Y1CA 4M3RA 2PZSA 4OKJA 3HVRA 4KI6A 1JLEA 3SUQA 3QINA 3ZT3A 1S1WA 3DLRA 2G8KA 3AVKA 3LP1A 4HUEA 1KVBA 1RTIA 4UQGA 4DFPA 1JLFA 4DF8A 4JRPA 4IBNA 4OJRA 4C8LA 4RW6A 3ZSWA 3L2VA 1ZBFA 4HUFA 4KO0A 3VQ7A 3ZSQA 4CF8A 3LANA 4CIGA 4KHSA 4DU4A 1IG9A 1REVA 4CEBA 2QKBA 3TAFA 3NAEA 2A1SA 1NK8A 3QETA 4DTXA 1GOBA 3KJVA 4W5NA 2KFNA 4CFBA 1XC9A 1RT3A 4CCHA 4J2AA 1SKSA 1CLQA 1RDAA 3D45A 2P5OA 3PY8A 4LD0A 1RT2A 4FW1A 3LWLA 3OVNA 1TAQA 1X9SA 3ZSXA 2QKKA 4E7HA 2OPSA 4NCAA 4CIFA 1UOCA 1IKWA 1HNVA 4FLWA 4M45A 3MXIA 3HPGA 1NK7A 2YHBA 1QTMA 1WAJA 3OYKA 4CJFA 3SQ0A 5CZ2A 3K5LA 3OYGA 4FLYA 1LW2A 4Q5VA 3L2RA 2XY7A 3O4QA 2ITGA 3KTQA 4B8AB 2XRIA 4FLVA 1EX4A 4LSNA 3V6DA 2NUBA 1B92A 2JLEA 1FKOA 3OYBA 4KB1A 4ICLA 2ZQBA 1D5AA 3OYIA 4KHNA 2BDPA 4CHQA 2P5GA 4FCYA 1FXXA 3EYZA 1RTHA 3AO4A 2VG6A 1NK5A 1JLBA 1I39A 4J2EA 2XHBA 3I0SA 4BE0A 3V9WA 3E01A 2E6MA 3MEEA 3CM6A 3V9UA 3QEXA 1EETA 3VQBA 2XY5A 1HYSA 4F4KA 3DLHA 2HVIA 3PX6A 4WE1A 2QK9A 2IDOA 3TR8A 4CEQA 4FJMA 2HNZA 2IGIA 4EZ9A 1BI4A 4J2DA 3ZT4A 4CGGA 3L3VA 1NK0A 3HO1A 5KTQA 4DTSA 1VSEA 1YTUA 5DMRA 2O4IA 2R7YA 1KLNA 3KLEA 2WONA 3DLBA 4BE1A 1C1CA 1WSHA 4CERA 1BIUA 4HTUA 2HNYA 5HP1A 3FFIA 4CECA 4CHOA 2E4LA 3ZSZA 1GOAA 3F9KA 4K8ZA 1RNHA 1QHTA 3OYAA 4MFBA 4OGCA 3L2QA 2X74A 4Q0BA 1TK0A 1LWCA 3AVAA 3VQPA 1RBSA 3VQAA 4ELTA 1GOCA 4E1NA 4LSLA 2G8HA 4B9TA 3LPTA 1KVCA 1G15A 3V1RA 3NFAA 3KLFA 3AA5X 4M3WA 2HVHA 5SWMA 1J5OA 2E6LA 3LAMA 5FDLA 4J2BA 5KRTA 3AO1A 3K5OA 1A5WA 2JGUA 4RG8A 3OYDA 2F8TA 3VQEA 3CG7A 4N41A 1CXUA 1HQUA 1TGOA 3QEPA 1WSGA 3IG1A 3P5JA 4KKOA 3RMCA 3SNNA 4CJPA 3RMDA 4DSIA 5KGXA 1L3UA 3CFPA 4DQSA 3ZT1A 4FJ5A 1BGXT 4CEAA 3G0ZA 5I42A 2DTUA 5FROA 4DU3A 2G8IA 1F21A 3ISNC 4LH4A 3D0PA 2VG7A 3TAMA 2PY5A 4FJXA 2YNFA 3L2UA 1U49A 3LP2A 4KPYA 3ZSRA 4DLGA 4O5BA 2OPRA 1RILA 1TVRA 4NCBA 2FBVA 4E1MA 4BWMA 3DLKA 2AJQA 4BWJA 3CFRA 3JYTA 2D5RA 1S1TA 3VN5A 1QSYA 3TAEA 3KKSA 4W5QA 4BDPA 1RDCA 3AVCA 4OPJA 4M3XA 3MEGA 4DFMA 3A2FA 4CEOA 4I2QA 4Z0UA 4DTOA 4F3OA 2VG5A 1VK0A 3SQ1A 2D0CA 4CE9A 1NK4A 3ALYA 4CGIA 3KK1A 1RT1A 1S1VA 5HROA 5CY4A 4DTRA 2OZSA 1L3VA 3LALA 3OJSA 1LWFA 4KREA 3WNEA 4DLEA 3S9HA 4CJ4A 1SKWA 2XY6A 3PO5A 2IOCA 1WSEA 1TKXA 3M8RA 3V9ZA 1IH7A 5JS2A 4CHZA 4FJJA 1L3TA 3ZSVA 4FK0A 4KTQA 4OKKA 2PYJA 4DF4A 1FK9A 1UA0A 4JRQA 1KVAA 2B5JA 2X6SA 1NK6A 4QOZB 2FBXA 2BE2A 3OJUA 3IRXA 3SQ4A 4KFBA 1A5VA 4I7FA 1NKEA 1VSJA 4CJRA 4W5RA 4KTWA 3LP3A 3SUOA 3SV4A 4KHQA 1DTTA 1UWBA 4Z4FA 4I9LA 4AHTA 4CF0A 3LPUA 4ID1A 1BISA 4FJ7A 4ZHRA 3S3NA 3NGYA 1KTQA 4DQQA 4CJKA 4N5SA 3QERA 4FJKA 1SL2A 1KFDA 3CYMA 3QNNA 3H08A 3L2WA 1S6PA 4DTJA 2Z1HA 1TKZA 4IDKA 1HNIA 2GUIA 3OYMA 2YNIA 4FLUA 3K2PA 4DSEA 2HMIA 5E41A 1RBUA 3OYEA 1EKEA 4DS5A 4I9QA 1JL1A 4E7IA 1QS4A 1TL3A 4B9MA 4Z4IA 4CF2A 4IKFA 3RR8A 2Z1GA 3PUFA 1U45A 1ZBLA 3NBPA 4KV8A 3SI6A 3DI6A 4C8KA 4C8OA 4ELVA 4QAGA 5HBMA 4JS5A 2BANA 1HJRA 3RMAA 2A1RA 1UA1A 4B9VA 1BHLA 1U04A 4DQRA 4LY7A 4CJEA 4QCLA 2HHSA 5FRMA 4PQUA 3T3FA 4DQPA 3SQ2A 2YKMA 5J1EA 1WSFA 3SUPA 1U4BA 1ZBUA 1KCFA 3VQ4A 2FBTA 3K57A 2DFHA 4M3TA 4M3YA 3DLGA 3C94A 4FYDA 4LH5A 3AA3A 1ZBIA 3NCIA 5HRSA 3TAQA 1SUQA 4CJ3A 1WSIA 2LSNA 5KRSA 3TABA 3I0RA 1XHXA 5J2QA 3RMBA 3RR7A 4CK1A 3V1OA 1KRPA 4Z4EA 1A5XA 3C6TA 1WNSA 2EHGA 3ZSYA 1IKXA 4CEZA 3JSMA 2OZMA 4KHWA 4FJ8A 1R0AA 3O3GA 3MXMA 2VWKA 4C8MA 1LAVA 3HL8A 1VRTA 2DFEA 4E89A 3M8QA 3HYFA 4O0JA 2YNHA 3HP6A 3AA2A 3AVFA 3WNHA 5CYQA 4B8CA 3EZ5A 3K5MA 3DMJA 1K6YA 4EZ6A 4FZYA 4L8RB 2RN2A 4GVMA 3QO9A 2EX3A 2YNGA 1VSDA 3BGRA 3NF9A 3ZT2A 3QNOA 1KSPA 3HT3A 4HCCA 3HPHA 3MXJA 1RTJA 4W5TA 3LZIA 1BQMA 4ELUA 1EXQA 5CYMA 4E7KA 3TAPA 4H4MA 2HHUA 4RW7A 4ZTFA 4KI4A 3NH1A 2Y1IA 4O55A 4M3UA 3PX0A 4CFAA 3VQ8A 3MECA 5C42A 1T8EA 2ZD1A 5D3GA 1S5JA 3AA4A 3BDPA 4CESA 4B9UA 2XO7A 1Q9XA 1UAXA 2GV9A 4FJLA 3KK2A 1N5YA 1WAFA 1CXQA 4F2SA 5K14A 4O4GA 1X9MA 4DSLA 4FZXC 4OLBA 1S1XA 2ETJA 2Q3SA 4EP5A 4NYFA 3THVA 2O4GA 2QXFA 3CQ8A 1HRHA 2KW4A 4K8XA 1LW0A 1WSJA 4IG0A 1ASWA 1WN7A 4IFVA 4H8KA 3K5NA 4I2PA 3V9SA 3I8DA 3AVGA 3IAYA 4PUOA 3WNGA 2KTQA 2FBYA 1BCOA 1W0HA 1VSIA 1ASVA 4RW4A 4FM0A 1L5UA 1TAUA 1ZBHA 1C1AA 5CZ1A 3HXMA 2G8WA 1ITGA 2YV0X 3HVTA 4NCGA 1O1WA 4B9SA 4FJ9A 4ID5A 1U48A 1JLQA 1JKHA 1Q8IA 2HB5A 3K59A 1NJYA 4EP4A 4XIUA 5JS1A 1S1UA 2OPQA 1T03A 5I3UA 1YVUA 2W42A 1JLCA 3KLIA 2OA8A 2OYQA 1B9FA 4N56A 2GBZA 1HYZA 4W5OA 5EU7A 3AVLA 2RKIA 1NJWA 4CHPA 2ZE2A 4AHRA 4BDYA 1ASUA 2OPPA 5HRRA 5HRPA 4GMJB 1HYVA 3HM9A 2YKNA 1U47A 3OYFA 1C0TA 1QSLA 2G8VA 4YFUA 1RT6A 1SL0A 4Z4CA 4KHYA 1RTDA 2BGGA 4O44A 1HPZA 3AVJA 3LAKA 2Z1JA 4PA1A 2G8UA 4F2RA 5J2MA 4DTPA 3SV3A 3HP9A 4FJNA 3ITHA 1RDBA 4G1QA 4AHSA 3SYZA 2HHXA 2FC0A 2KQ2A 3ZCMA 3PX4A 3S3MA 5HLFA 3RWUA 3HK2A 4IFYA 4C8NA 3MAQA 2KZZA 4CK2A 1YTAA 3U3GA 4CGFA 3O4NA 5SZTA 4GW6A 3QLHA 4AHVA 4DSFA 4DTUA 1SL1A 1T05A 2G8FA 1ZYQA 1S9EA 4OVLA 1HMVA 4FLTA 1LV5A 4FVMA 1XWLA 2Z1IA 4CK3A 1XI1A 1TK5A 1TK8A 4BACA 4KAZA 1I3AA 1BI4B 1RDDA 4FK2A 4FXDA 4OPKA 3NF7A 1VSFA 3QEVA 2P1JA 4CFDA 3VQQA 4FZZA 1D8YA 3RTVA 3B6PA 4HVJA 3VA3A 3VQ6A 4OKEA 4AH9A 3DRPA 4Z4GA 1CZBA 3ASMA 3DOKA 2RF2A 3SPYA 4DFJA 4DWIA 4MQ3A 5J2PA 2WOMA 2HHQA 5HRNA 3VQ5A 4E7LA 1HQEA 4HCBA 4CJVA 4RW8A 1NKBA 3U6FA 2IC3A 1VSKA 3HPOA 4IG3A 3O3FA 3SZ2A 4M41A 1TV6A 1C6VA 2I5JA 3AVNA 4AILC 3DM2A 4N47A 1S9GA 4Z4HA 4PWDA 4H4OA 2DFFA 2F96A 1SV5A 2HW3A 2DY4A 4FLXA 1TKDA 3M8SA 4CF9A 3TI0A 3AVIA 2HNDA 3AVBA 4YNQA 3DRRA 4CJLA 3SCXA 1X9WA 3KD5E 1JLGA 2YHAA 4AHUA 2X6NA 3TANA 1RT4A 1VSLA 4FM2A 5J2NA 4KB0A 1RT5A 4O0IA 1RBTA 2IAJA 3LZJA 4B9NA 2RPIA 4BDZA 3OYJA 1DLOA 1QE1A 3T1AA 3WNFA 5KGWA 1BCMA 1RCHA 3NF8A 4CJUA 4E3SA 3TAGA 4FJHA 2D0BA 3QEWA 1B9DA 4CGJA 2ATQA 2X78A 4KTZA 4CGHA 1EP4A 1JXEA 1VSMA 3QEIA 4PY5A 3QESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCVN 3OYLA 4NO7A 2A6AA 3NHGA 3V9XA 2YHWA 5KI6A 3IS9A 1X3NA 1BQNA 1CZ9A 1U2VA 3SUNA 1SS6A 3CCUN 4BRIA 1T6DA 4FW2A 2F8SA 1ZBSA 3NF6A 4DU1A 3K0SA 4DHYA 3TWHA 2Y1JA 3G6EN 1BL3A 3F73A 1S6QA 5T7BA 1JL2A 5C24A 1L3SA 1Z25A 2V51B 3CMEN 1IV0A 4LF4K 1JCGA 3TTFA 3AO3A 4FJGA 3H3OB 3VQDA 3FFKB 4NLCA 1JJ2M 5ADXA 3N4PA 4CIEA 4JLHA 3CJAA 1Z26A 4BGBA 1T7PA 3CM5A 4U7BA 3VQ9A 2KZMA 4DMNA 3RRHA 4CJ5A 1SKRA 3HSTB 5FRNA 5LJWA 2ZJPL 4M3ZA 4TSXA 3AO2A 3P83D 1J9AA 1WOQA 3UIQA 3SPZA 1VRUA 1Q9XA 3SJJA 4ZTJA 4FJIA 4A2BA 3C6UA 3THWA 4CZFA 4FLZA 4WQ4A 4DR2K 3LM2A 1W9HA 4NB4A 1N6QA 4CJTA 3HJFA 4CJSA 3OYHA 1D9DA 4LFBK 2QI2A 1Q9YA 4DV0K 2V7YA 4Y1CA 4M3RA 4KI6A 3P39A 1JLEA 3IUCA 2KHOA 4DV2K 4MDAA 3KHYA 1S1WA 2G8KA 3LP1A 1KVBA 4UQGA 2W6KA 5E26A 3W3DA 4JRPA 1MA9B 4RW6A 4X62K 2RHKA 4KHSA 4KO0A 3VQ7A 3LANA 4DU4A 2W6LA 2A1SA 2QWRA 4DTXA 2HF4A 4JKEA 1GOBA 4W5NA 1WBDA 2VWBA 4CFBA 3QFUA 5AQVA 4LD0A 3CJ7A 4E7HA 5ADXH 4NCAA 3VPZA 4FLWA 3CERA 3EKSA 1XNRK 3P38A 1YXQA 2ZWHA 3UKRB 3L2RA 3EL2A 4DR5K 4FLVA 5C0YA 4AM7A 2NUBA 3SBTA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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