3MXIA

Trex1 3' exonuclease d18n familial chilblain lupus mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
219
Chain Sequence
TLPHGHMQTLIFLNLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALESQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
molecule tags Hydrolase/dna
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 219
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxiA01
1DLOA 4DTMA 4ELVA 4B9MA 3VN5A 4JS5A 1RT5A 3CQ8A 3V81A 1JLBA 3HJFA 4CK1A 1EETA 3ZCMA 4NCGA 2Y1JA 3DM2A 1C0MA 2YNHA 1X9MA 3V1RA 1QSLA 1J54A 1JL2A 2P51A 4CF8A 4YFUA 3D0PA 1Z25A 3TAGA 4J2DA 1MU2A 1JLCA 1KLNA 3CM5A 5HRSA 4YNQA 3H08A 3OYAA 2PZSA 1RILA 4HUGA 1SL0A 2X78A 4BWJA 4CEQA 4E7HA 3ISNC 1BHLA 4FCYA 2O4IA 4C8NA 2DFHA 3KLIA 3RMBA 1SV5A 4I9LA 2OPSA 4IBNA 4K8XA 1VSIA 5HBMA 1IH7A 3OYLA 4FJMA 1RTIA 4Y1DA 4I2QA 1WN7A 2YNIA 2YV0X 3QNOA 1ZBLA 4B9LA 2HHXA 4KI6A 4J2BA 4H4OA 4FW2A 3AVCA 1IKVA 4CGIA 1UA0A 4M3UA 3AA2A 3AA5X 4CEDA 3OYKA 3NGIA 4HCBA 4IDKA 4M3XA 1NJXA 1K6YA 3S3OA 1TAUA 4R5PA 4L8RB 2QK9A 3CYMA 4B3OA 3KJVA 2ZQBA 3DOLA 2XO7A 3KK3A 1X9WA 1KCFA 4Q5VA 4DS4A 3SQ0A 1UAXA 4DTXA 3ZSYA 3NGYA 1NK7A 2QKBA 1NK8A 1TVRA 2G8UA 3VA3A 3L2WA 4DTPA 5J2NA 2HVHA 3LP3A 2HHWA 4CHZA 2NUBA 3QERA 3QEXA 1ASWA 2X6SA 3DI6A 4DTJA 3CM6A 1D9DA 3VQQA 4J2EA 5E41A 3RRHA 1D8YA 3OYMA 2WONA 1QHTA 2B4JA 3V6DA 2FBYA 1RT3A 2G8KA 1G15A 3G10A 2F8TA 3TAEA 3ZSZA 4E89A 4KRFA 4FJ9A 3V4IA 1W9HA 1ZYQA 1X9SA 3NE6A 3SNNA 1RT2A 3QINA 4RW9A 4FK0A 3TR8A 3AVLA 3RR8A 5CZ1A 3K59A 3D45A 1XI1A 4C8KA 3DLBA 3IRXA 1LW0A 2X6NA 4I7FA 4O0JA 5FDLA 4KI4A 3L8BA 4CJ5A 4KHYA 3SV3A 4DTSA 4B9NA 5D3GA 4CGHA 1BIZA 1C1AA 3AVHA 3OYEA 3HXMA 1TKZA 1S1WA 1C1CA 4FW1A 5JS2A 4CK3A 5KTQA 4AHTA 5EU7A 1HPZA 1JLAA 3HVRA 3OJUA 1LAWA 4JRQA 1TK5A 3BGRA 3PO5A 4PY5A 2HHQA 3ZSVA 2DFEA 4M3YA 1S5JA 4CIFA 4C8OA 3DLEA 1CLQA 4KHSA 5KGWA 2FBTA 1TL3A 4HUEA 2IOCA 3TANA 3SQ2A 4ELUA 4CJUA 1U47A 1WSHA 4FLWA 2HVIA 1WLJA 1EXQA 4ZHRA 1NJWA 4KFBA 4HCCA 4PQUA 1GOBA 3CG7A 1I3AA 2BE2A 3M8SA 5J2MA 1VSFA 2IAJA 3NF9A 4CE9A 2G8VA 3SQ1A 4K8ZA 2HHSA 1GOAA 2IDOA 3LALA 3ZT4A 4Y1CA 1FK9A 4PA1A 3TI0A 2KFNA 1BI4B 4OKJA 1RBVA 3LPTA 4CGGA 3FFIA 1NKBA 1RT4A 3HSTB 1VSDA 4HTUA 4DQIA 4M42A 3F9KA 3EYZA 1SL1A 1C6VA 3OVNA 3V9WA 3G0ZA 4IKFA 4I2PA 3AA4A 1BQMA 4ID5A 2DTUA 2IC3A 3K5OA 3WNFA 3LP0A 3PX6A 1JXEA 3K2PA 3RMAA 2OZMA 4FZZA 4QCLA 3PY8A 4CFAA 4FM2A 2D0BA 1HYVA 1CZBA 3THVA 3CFOA 3KKRA 1WSEA 1LAVA 5J1EA 3ZSOA 3PV8A 1LWEA 2VWKA 3TAQA 3SUOA 1R0AA 1TGOA 1ZBUA 1U45A 3AVIA 3KIOA 3NGZA 2GUIA 3QO9A 4KHUA 1VRUA 1JLEA 3OYHA 2X74A 4F2RA 1B92A 4FJKA 2B6AA 3C95A 1WAFA 4CIEA 1KVAA 3NH2A 1O1WA 4CESA 2I5JA 4ZTFA 1BL3A 1YT3A 3L2VA 4MFBA 4DSIA 2VG6A 4RW6A 4E7KA 4F2SA 1RTJA 2RN2A 4FJGA 4BDYA 4CFDA 1WSFA 1ASVA 1S1UA 1RDCA 5DK5A 5FRMA 3L2QA 3TAPA 1LV5A 1N5YA 1XC9A 4NCBA 1ITGA 1QS4A 4CERA 3P1GA 1KFSA 1QSSA 1A5XA 1JKHA 3OJSA 3LWMA 3PX0A 2G8WA 2YNGA 3DRPA 3TAMA 3VQPA 4CFCA 4N41A 3AO2A 4XIUA 1CZ9A 2OZSA 3SZ2A 3F73A 1C0TA 3E01A 3P5JA 3V1QA 4W5TA 1B9FA 4KO0A 4F4KA 4DSFA 4WE1A 3NDKA 1EX4A 3U6FA 4BDPA 3SUNA 1WAJA 2EX3A 3L2UA 1Z26A 4OGEA 3IG1A 4E7LA 4FK4A 3TARA 1DTQA 2ETJA 3VQ6A 4AILC 4GW6A 4M3TA 3UIQA 1S1TA 4BDZA 3KD1E 4DF4A 3QETA 4IG3A 1BCMA 4DFPA 3ZT2A 2F96A 3QEVA 4HVJA 3OYJA 3A2FA 4KB1A 4Z4GA 3V9SA 2E6LA 2R7YA 2GBZA 3AVMA 3ZT0A 3VQEA 1JL1A 4OPKA 2PYJA 1NOZA 3MEDA 4FVMA 5CYQA 5HRNA 3K5LA 2HW3A 4CEOA 4OKEA 4M45A 4RW7A 3QLHA 4DQRA 4FXDA 4OVLA 1KFDA 1QQCA 1JLGA 1CXUA 1UWBA 1WSIA 1IKYA 3O4QA 3O3FA 3TAFA 3RR7A 4HUFA 3VQ9A 4FM0A 3JYTA 1KVBA 1SL2A 3QIPA 4KB0A 4DSKA 4DU1A 3S9HA 1BQNA 4CCHA 1QSYA 3AV9A 1VSLA 3AVGA 1QE1A 4ID1A 2RKIA 4DTRA 3KKSA 2G8HA 4OKKA 1HMVA 4DQQA 2PY5A 4IFYA 5HROA 4B9TA 4DLGA 1S6PA 4FYDA 3LZJA 1Q9XA 4PWDA 1TV6A 4IG0A 5KI6A 3VQAA 1Q8IA 2RF2A 3SPYA 1FXXA 4FLZA 2DFFA 2VG7A 3DRSA 1RT6A 4JLHA 3DLRA 1SUQA 4RW8A 5SWMA 3RMCA 3SJJA 4CEBA 3PX4A 5HP1A 1ZBFA 4TSXA 3DLHA 4AHUA 4MQ3A 4DSEA 4DG1A 4CJPA 5C25A 1XHZA 1T7PA 1YTAA 3I0RA 4CEEA 1VSMA 4C8LA 2HNZA 4LSLA 2O4GA 1L3VA 2WOMA 2HNDA 1BGXT 4UQGA 3CFPA 4NYFA 1HNIA 1RT7A 4JS4A 1HRHA 3C94A 3HYFA 4HHTA 3HL8A 1TK8A 2HMIA 3AVNA 2BDPA 2IGIA 3ZSXA 1RBUA 4DSLA 3OYCA 3KTQA 4KTWA 3V9XA 4N76A 2JLEA 4DU3A 4F3OA 3HK2A 3LDSA 2FC0A 2FBVA 1A5WA 4FJXA 4CEAA 3M8QA 4EZ6A 3B6OA 4O5BA 3T1AA 3DOKA 4E19A 2ZD1A 2HHVA 1IO2A 4BE0A 4CEFA 3BDPA 4Q0BA 3AVKA 3JSMA 1BISA 1QTMA 4CJLA 5KGXA 1YVUA 4LH5A 1RTHA 1HQEA 4FZXC 1C1BA 4NCAA 3QIOA 2AJQA 3ALYA 3ZT1A 3RTVA 1S1XA 4CJQA 4E3SA 2XY5A 4OJRA 1U49A 2ZE2A 1L5UA 4M3ZA 3L3VA 2DY4A 1T05A 1WNSA 1NKCA 3VQBA 1N6QA 3L3UA 2KTQA 2A1SA 2OA8A 1Y97A 2D0CA 2ITGA 1TL1A 5FRNA 2KZZA 3DLKA 4CFBA 2P5GA 1WSGA 4BE1A 3KLGA 2W42A 2P5OA 4BE2A 1NK0A 2KW4A 3S3NA 4EZ9A 4FJ8A 3MECA 2VWJA 2HHTA 1KTQA 1JXBA 1A5VA 3DMJA 3NF8A 4CJEA 4F8RA 4FZYA 4CHOA 4OLBA 2LSNA 1HNVA 4W5OA 1TKDA 5FROA 1NJYA 3WNGA 5J2PA 3HO1A 1TKTA 1U04A 2Y1IA 5C24A 3OYBA 4DQPA 4I9QA 4KV8A 2YNFA 1HJRA 3OS0A 1RBRA 3TABA 4ELTA 3ASMA 1XHXA 1NK6A 3OY9A 4FLYA 4B9UA 1HYZA 1LW2A 4DF8A 1XWLA 3KD5E 1SKSA 1I39A 4FJNA 4E7JA 4CJWA 3EZ5A 3OS2A 4FJIA 3DYAA 3T19A 1IKWA 2HNYA 4M3RA 4CJSA 3HT3A 3SUQA 3DRRA 1U4BA 3HPOA 3SUPA 2D0AA 1ASUA 1RCHA 2IS3A 4AHCA 2F8SA 2OPRA 3LWLA 4KHQA 5CYMA 4DTOA 2Z1IA 4CHYA 1NK4A 3LP1A 4CJTA 3HP6A 4FLXA 2XRIA 3QEPA 1NK5A 1SKRA 1NOYA 4CECA 1S6QA 5HRPA 3KK1A 3O3HA 3IAYA 2KFZA 3ZSWA 5J2QA 2YKNA 4W5QA 5CY4A 4CF2A 1Q9YA 1VSJA 3I0SA 3SI6A 3NH0A 1KRPA 2B5JA 2ATQA 4EP5A 4E1MA 3QEWA 4E0DA 3T3FA 5HLFA 3NCIA 1SKWA 4KHNA 2YKMA 4GVMA 4W5RA 3EY1A 5I42A 4B08A 3HVTA 2PYLA 3PO4A 3MEGA 4DSJA 4Z4FA 1IKXA 2Z1HA 4M3WA 3C6UA 3QESA 4AHVA 2VG5A 4LH4A 5DMRA 3LAKA 4AHSA 4CJ4A 1TK0A 1WSJA 4CF9A 3OYFA 4JRPA 3MXJA 4FJLA 4J2AA 2HHUA 3KLFA 4KKOA 3RRGA 3AA3A 3KK2A 1BIUA 4IFVA 1RDBA 3VQ5A 3K5MA 1L3SA 1J5OA 1RTDA 1BI4A 4CJFA 4O4GA 1J53A 1TAQA 2P1JA 4DLEA 2RPIA 3NF7A 1ZBIA 3NBPA 4O44A 4CJVA 3NH1A 3LZIA 4DS5A 4CGFA 3DLGA 3SQ4A 3C6TA 4CHPA 3LPUA 4B9SA 4QOZB 4KTQA 1REVA 5CZ2A 2BGGA 4FJJA 1EKEA 2FBXA 3AO3A 4DMNA 4CF0A 1UA1A 1RDDA 4AH9A 3U3GA 3L2RA 4N56A 4RW4A 3QEIA 4ICLA 4M41A 4Z4IA 1HQUA 3VQ4A 4BACA 2QKKA 3AO1A 5JS1A 4E1NA 3LP2A 3MEEA 3CFRA 2Q3SA 2BANA 1S9GA 3HP9A 5KRTA 1D5AA 1W0HA 4O0IA 4QAGA 4DFKA 2YHBA 4OGCA 4FJHA 3HPHA 3WNEA 4F3TA 4OLAA 4E7IA 2XY8A 4FJ7A 5SZTA 1FKOA 1S1VA 1GOCA 4N47A 1U48A 3NF6A 5I3UA 4DFMA 1NKEA 4KAZA 4DQSA 1T03A 3SCXA 4C8MA 3OYIA 4FLTA 2XY7A 4H4MA 3O4NA 3M8RA 3V1OA 1FKPA 1IG9A 4LSNA 3B6PA 3ZSQA 1EP4A 3AO5A 3WNHA 3MXIA 5HRRA 2A1RA 3K58A 3P83D 1L3UA 2G8FA 4N5SA 4B9VA 1X1PA 1JLFA 2KQ2A 3HPGA 4CGJA 3VQCA 3ZT3A 4RG8A 4KHWA 1RBSA 4DTUA 3VQDA 3OS1A 3M8PA 3U3YA 1YTUA 4PUOA 1KSPA 1RDAA 4G1QA 1L3TA 3RMDA 4Z4HA 1NK9A 3ULDA 1RT1A 2XY6A 3KLEA 5KRSA 3O3GA 1CXQA 3QNNA 1RBTA 4W5NA 3LANA 4DWIA 4FJ5A 2QXFA 5K14A 4CJ3A 4CIGA 4CJRA 1UOCA 1VSEA 4KTZA 3NFAA 1DTTA 3K57A 4OPJA 3OYDA 1BCOA 2GV9A 4BWMA 4FM1A 3VA0A 4CF1A 3OYGA 2E6MA 3V9ZA 1LWCA 4CEZA 1C0UA 4FLUA 3SV4A 2Z1GA 3VQ7A 4KPYA 2YHAA 1LWFA 3ZSRA 4Z4EA 4O55A 4AHRA 1TKXA 3MAQA 4NYNA 3VQ8A 3OYNA 2JGUA 3SYZA 2D5RA 4DFJA 2HB5A 1KLMA 2EHGA 1VSKA 3TWHA 3V9UA 4CHQA 4ZTJA 3LAMA 4LY7A 3PUFA 4B8AB 3KLHA 1VRTA 2E4LA 1F21A 4Z0UA 3S3MA 4CGDA 1J9AA 3SPZA 3RWUA 4DTNA 3MXMA 5T7BA 3AVBA 3I8DA 2OPPA 4CK2A 1VK0A 3NHGA 1S9EA 1JLQA 4CJKA 3NAEA 4CHNA 2OYQA 1RNHA 4FK2A 1B9DA 1KVCA 3AVJA 2G8IA 4Z4CA 2KZMA 2OPQA 1NJZA 3AO4A 3ITHA 4KREA 3HM9A 1HYSA 2XHBA 3AVAA 4GMJB 5C42A 4FLVA 3AVFA 4H8KA 1D9FA 4EP4A 1T8EA 3K5NA 4B8CA 4DU4A 1VSHA 1ZBHA 2Z1JA 4LD0A 3IS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KPZA 3VN5A 1RT5A 3V81A 1JLBA 4CK1A 3TPQA 4NCGA 4CVNE 2P51A 4JKGB 4YOXA 3BEXA 2UXBK 3RVCA 3GOIA 3ATVA 1KLNA 5HRSA 3NVMA 3IDHA 1CZAN 4A62A 1JCGA 4U7BA 4EAHD 3KHYA 4I9LA 1C0GA 4IBNA 4K8XA 3OYLA 4JKFA 2W6LA 4Y1DA 2YV0X 4H4OA 2WTUA 1IKVA 1YI2N 1QZ6A 1R59O 5IWAK 1NJXA 1K6YA 1RGIA 4DB3A 3S3OA 5AZJA 4B9QA 3A5LC 4B3OA 3TSUA 3DOLA 4OO1J 3SAGA 2O8BA 2YHXA 4IOXA 1Q82O 2G8UA 3GBTA 3SLCA 5J2NA 1Q18A 3LP3A 2NUBA 2X6SA 4DV1K 4DTJA 3ID8A 3OHRA 4J2EA 1QZ5A 3RRHA 1D8YA 2WONA 1VQ9N 1G15A 5BN8A 4GNIA 3SNNA 1RT2A 2VCPA 2V7YA 4FK0A 4LF9K 3AVLA 5CZ1A 5JVHL 1P90A 3D45A 3CJ9A 2NRWA 2FSKA 4JHDB 5D3GA 3OYEA 1TKZA 1GLEG 5KTQA 4FWSA 1TK8A 3PV8A 3IFRA 1JLAA 2P9KB 3OJUA 1LAWA 4JRQA 1J5EK 3BGRA 3PO5A 4PY5A 1QQMA 3J7YP 5AFUH 3DLEA 5KGWA 1TL3A 3FLCO 2IOCA 4GKJK 3VF6A 2BE2A 1HNWK 1VSFA 5M1OA 5MLCQ 3GL1A 3SQ1A 4DV2K 1I94K 3O8MA 3THWA 3ZT4A 4Y1CA 3TI0A 2KFNA 5M1KA 1NKBA 2ZGZA 4HTUA 1HPMA 3EYZA 2DTUA 4ID5A 2IC3A 3K5OA 1XQSC 4JKHA 4FWPA 4QCLA 1IBMK 1HYVA 1CZBA 3KKRA 5J1EA 4CJ7A 4A57A 3C7NB 1R0AA 3TTCA 4JK9A 1NGHA 3DXKB 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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