3MXIA

Trex1 3' exonuclease d18n familial chilblain lupus mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
219
Chain Sequence
TLPHGHMQTLIFLNLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALESQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
source organism Mus musculus
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
total genus 78
structure length 219
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxiA01
3VN5A 3WNEA 3AVHA 3OS0A 1ASUA 4CEAA 4F3OA 4FZZA 3ZT0A 1T7PA 4QAGA 3TABA 1QQCA 4CF2A 1NK0A 3AVFA 1D5AA 3K5LA 4HTUA 2HHVA 2GUIA 3NF6A 2ZQBA 1IKVA 4KI4A 1HNIA 4N76A 1ITGA 1LW2A 4KB1A 5FRNA 2IDOA 3KLGA 4E1MA 1Z25A 3ZCMA 4CJFA 3OJSA 1IKYA 4JLHA 4DLEA 1RDBA 3VQPA 4W5QA 2F8TA 1JLQA 1HRHA 3LDSA 4RG8A 3MXJA 2G8HA 2QKKA 4KHSA 2HHWA 4FJMA 4KREA 3ZSZA 3O4QA 3HT3A 4OGCA 4AHSA 3JSMA 2HMIA 2XY8A 3V9UA 4E19A 1X9SA 2HHXA 4I9LA 4JRPA 1RDAA 4ELTA 1UOCA 3BDPA 3KK3A 4CGIA 4KHYA 1GOBA 1U04A 3L2WA 3HP9A 3M8RA 1HQUA 1WSGA 4DSEA 1TKZA 4Z4HA 3M8SA 4DMNA 1VSJA 2YKMA 2ZD1A 3ZT4A 3JYTA 1TK0A 2G8WA 4DSIA 2YNHA 3RMDA 4FJKA 3AO2A 2Q3SA 1C1BA 3NH2A 3V9WA 3VQBA 4M3UA 3NHGA 3OYBA 2O4GA 2OPPA 4KRFA 1S6PA 1W9HA 2F8SA 3ALYA 1T8EA 3ZSWA 1JLFA 2PYJA 1F21A 3KLHA 2Y1IA 2PYLA 4LH5A 1HYSA 1S1VA 5SZTA 1QSLA 4HHTA 2D5RA 3NDKA 1L3VA 3I0SA 4FJ8A 3S9HA 3VQ9A 1CXQA 1RCHA 2JLEA 1RBRA 3ZSYA 1SKSA 4EP4A 4OPKA 2EX3A 4ICLA 2VG6A 3RMCA 3LALA 4CF0A 4B9SA 2OZSA 4YFUA 3ZSOA 4FCYA 4FLVA 1QTMA 5J2PA 3M8PA 4W5RA 3SJJA 4CEZA 4F4KA 4CHPA 1LAWA 3TI0A 4KAZA 4FZYA 3AVCA 1RT3A 4DQQA 4M3WA 2HNYA 2QXFA 1BI4B 5HBMA 4Z4GA 3DRRA 1ASVA 4IFVA 3V6DA 1CXUA 1A5WA 1U45A 3L2RA 2D0BA 2OYQA 4CFAA 3TARA 3PX6A 2HHQA 4HCBA 3L2UA 3IAYA 1SL0A 2F96A 1RBTA 3CFRA 3SUNA 1RDDA 3K57A 3V9SA 4CJTA 3G0ZA 4E1NA 3ZT2A 3EY1A 3O4NA 2FC0A 3K58A 4PQUA 4Q0BA 1UA0A 2KW4A 4EP5A 2WONA 4R5PA 4KO0A 3V1OA 3NH0A 3BGRA 4RW6A 3L2QA 1VK0A 4BDPA 1RNHA 1D9DA 1WN7A 4LSNA 4YNQA 4M3XA 1ZBFA 2VWJA 1DTTA 1RILA 4J2AA 5JS1A 4RW4A 4Y1DA 2Z1IA 2BANA 2VG7A 4AHUA 4DTMA 1D9FA 2YV0X 3C6TA 3NBPA 3TAPA 3H08A 1VSHA 4KV8A 4KHWA 4CEFA 1RDCA 3F73A 3CG7A 1SUQA 3DLBA 1SL2A 3IS9A 3EYZA 1JXEA 1L3TA 4N41A 1TAUA 3ISNC 4DTJA 4OPJA 3CFPA 3NF8A 3HL8A 5DMRA 3OJUA 4J2EA 4CFBA 1FXXA 2XY5A 3OYFA 4CJEA 2P5GA 3AVGA 5HRSA 3C95A 1KLMA 3V1QA 3VQDA 4AHRA 4DQSA 4M3YA 3HPOA 1BCOA 4KHQA 1NK6A 1BIUA 3V81A 4DTRA 4KTZA 4CGGA 1X1PA 1LV5A 1KVAA 3OYJA 3SUPA 4CEQA 4GMJB 3TAFA 1WSJA 1J53A 5KTQA 3UIQA 3AO5A 3DMJA 3VQ6A 4CGHA 4E7JA 4W5TA 1GOCA 4DWIA 4F3TA 3AVAA 1S5JA 1YTAA 1RT7A 4WE1A 3ZSRA 4CHOA 3KLEA 3KJVA 5I42A 4QOZB 1KFDA 2OPQA 1KLNA 4O5BA 2VWKA 1DTQA 1VSEA 2YHAA 1LWEA 3P83D 3EZ5A 4DSFA 4DSKA 4FK2A 2BGGA 1HYZA 1EKEA 3DLGA 3OVNA 2GV9A 1KSPA 4H4MA 3THVA 1NJXA 3OY9A 1EETA 1KCFA 3A2FA 4DU1A 3SYZA 1C0UA 4AILC 3L2VA 4I9QA 4M3ZA 4AHCA 1A5VA 3V9ZA 4CIEA 5C25A 5T7BA 1S9EA 3AVJA 1NOZA 4CGDA 4LH4A 4CK1A 1JXBA 2EHGA 3PX4A 1IG9A 4CIFA 2XO7A 2HNZA 3KKRA 1U49A 1EXQA 2E6MA 2IOCA 1U47A 4LSLA 1S1UA 4DQRA 2ITGA 3DOKA 3QIOA 4E7LA 3ULDA 3KD1E 3OYEA 3D45A 2Z1HA 4RW7A 2HHUA 2BE2A 3AV9A 1ZBLA 1SKRA 4F2RA 4RW8A 4FJ5A 2G8IA 1EX4A 3DLKA 3O3FA 1NJWA 3OYGA 3MECA 4KTWA 3K5NA 3PUFA 2JGUA 3QEVA 1VSLA 3AO3A 4CHZA 1NOYA 4HVJA 1T05A 3AA4A 3NE6A 4DTXA 1IH7A 2E6LA 3VQ5A 4ZTJA 4ZHRA 1JKHA 3QNNA 4DFPA 3RR7A 3MEEA 4CGJA 4BWJA 3LPUA 4I2PA 4O0JA 3OYLA 3QEIA 3QO9A 3WNFA 1B9FA 4OKJA 3CFOA 4DF8A 3DRPA 4CJPA 1REVA 1T03A 1G15A 3ZSVA 4BE0A 1O1WA 4FLZA 4BDYA 1QHTA 1RT1A 2HVHA 1U48A 1C1CA 2X6SA 3KK2A 1WSHA 1LW0A 4GVMA 4FM0A 4N56A 3QESA 1J54A 3SQ1A 1NJZA 4MQ3A 4E7HA 1QSYA 5EU7A 1QE1A 3NF7A 1BHLA 1X9MA 4M42A 1WSFA 4OVLA 1JL1A 3RRGA 3TAMA 1QS4A 3KD5E 3AVLA 4ZTFA 4DF4A 1CLQA 1XWLA 1RT4A 1YVUA 5J2MA 3SCXA 4KHUA 3QERA 1HNVA 3DLRA 1TL1A 3HSTB 2Y1JA 1RBUA 2A1SA 4IKFA 4DG1A 4DTUA 3QEXA 1TKDA 1I39A 4K8ZA 2B5JA 4FJLA 1MU2A 2BDPA 4KHNA 2LSNA 2GBZA 1TKTA 2X78A 3OYNA 1XI1A 2P1JA 1NK8A 1RT6A 2XRIA 2YNIA 4GW6A 4H4OA 4CE9A 1S9GA 5E41A 3RMBA 4FJ9A 2ETJA 2PY5A 4M3RA 4CHQA 2D0CA 1BGXT 4MFBA 5I3UA 4LD0A 1SKWA 2HNDA 1L3UA 1A5XA 4DFKA 4FJHA 5FRMA 4DFMA 3HO1A 1S1WA 3NFAA 1JLGA 4Z0UA 4FLXA 3PO4A 4CEEA 3U3YA 1HJRA 1Y97A 4CIGA 4JRQA 2I5JA 1S1TA 5CY4A 2DY4A 2Z1GA 2XY7A 4RW9A 3OYMA 4ID5A 4IFYA 3OYIA 5HROA 1NKEA 2RN2A 2R7YA 3O3HA 3LANA 2IAJA 4FXDA 1QSSA 1HMVA 4FJJA 4DTSA 2P5OA 4NCAA 4IDKA 1C1AA 2G8KA 1U4BA 1R0AA 3LWLA 2KZMA 3DYAA 4FJGA 4CHYA 1D8YA 4EZ6A 1Q8IA 4I7FA 1ZBHA 1VSIA 2XY6A 1RT2A 2G8VA 4E89A 2HVIA 1K6YA 4DLGA 1ASWA 3TAQA 4B9NA 3LZJA 3MXMA 2KFNA 3SQ2A 4DSJA 3CQ8A 4E7KA 2X74A 3D0PA 3U3GA 3HP6A 2KTQA 2FBXA 4N47A 2O4IA 3ASMA 4CJKA 1HQEA 4FK0A 4AHTA 4PWDA 3LP3A 3NGYA 4Y1CA 5HP1A 2RKIA 3P5JA 3PX0A 4FYDA 1EP4A 3ZSXA 4L8RB 4BWMA 3QEPA 3AVIA 4Q5VA 1JLAA 4CJVA 4BDZA 2RPIA 1TK8A 4F2SA 5FROA 1J9AA 2B6AA 4CEDA 2IGIA 2P51A 4HUFA 3S3NA 2DFFA 1RTDA 4Z4EA 4B3OA 3QEWA 4DTOA 3VQEA 1WLJA 4DSLA 3CM5A 3PY8A 4BE1A 3AVNA 1JLBA 1UAXA 2HB5A 3L3VA 1BCMA 3DOLA 3V1RA 3QNOA 4ELVA 3RWUA 4FLWA 1IKWA 1S6QA 3AO1A 1CZ9A 4B8CA 4LY7A 3KK1A 3SV4A 3NCIA 2QK9A 4NCGA 3QIPA 4M3TA 1WAFA 3IG1A 3LPTA 4FM1A 1UWBA 5HLFA 4EZ9A 3B6PA 1WNSA 3F9KA 1C0TA 4PA1A 1XC9A 3HJFA 3SUQA 3HK2A 1UA1A 4B8AB 3VA0A 3V4IA 1WSEA 3VQ8A 3K59A 1KVCA 4NCBA 1TVRA 2D0AA 3KKSA 4E3SA 4DS4A 5CZ1A 3U6FA 2YHBA 2IC3A 4C8NA 4BE2A 4FJNA 4FW2A 4C8MA 3C6UA 1L3SA 2Z1JA 4CK2A 3KLFA 4KFBA 4HCCA 3C94A 1LWCA 1RTJA 3LAMA 1TK5A 1BI4A 4DFJA 4IBNA 4E0DA 5DK5A 3PV8A 3VQ4A 3OS1A 1NK5A 3FFIA 3AA5X 4C8LA 1HPZA 3AVBA 2VG5A 3HVTA 3NF9A 3T19A 4CK3A 3V9XA 1Z26A 1NKCA 4CCHA 2KFZA 2OPSA 3TR8A 3VQQA 4UQGA 1GOAA 4CFCA 2XHBA 3K5MA 4DS5A 1N6QA 3RR8A 4KTQA 1C0MA 3L8BA 1TGOA 4IG0A 2FBTA 1XHZA 3HYFA 2HW3A 1BISA 1B9DA 3MEGA 1HYVA 1ZYQA 1LWFA 2YKNA 3M8QA 5J2QA 3SQ0A 1TKXA 1CZBA 1S1XA 4OGEA 3SZ2A 1J5OA 1BQNA 1WSIA 3QINA 2ZE2A 4OJRA 1X9WA 4B9UA 4FLUA 3WNHA 3CM6A 4HUEA 4DU4A 1LAVA 3WNGA 4NYNA 4CEOA 1RTIA 4JS4A 3DLEA 4Z4CA 2KQ2A 3OYAA 4FJIA 4G1QA 1WAJA 1ZBUA 3HVRA 3VQAA 3OYDA 1Q9XA 3TAEA 5C42A 1BL3A 2OA8A 4DQIA 4CERA 4FJ7A 3VA3A 5KRSA 1FKPA 3E01A 1VSDA 3DRSA 4CJRA 1VSFA 1NK4A 1KFSA 3PO5A 1KRPA 4ELUA 4Z4IA 2DFHA 3SPYA 2NUBA 3LZIA 2A1RA 3DM2A 4K8XA 1XHXA 4PUOA 4CEBA 4FM2A 4M41A 1IO2A 1W0HA 4FLTA 2AJQA 1RBVA 3LP0A 4CESA 1IKXA 3OYCA 2QKBA 3OYHA 3QETA 3AVMA 5KGWA 2IS3A 3B6OA 5SWMA 4DU3A 3TAGA 3S3MA 4CJ5A 4CF9A 4HUGA 3ZT1A 2E4LA 4O4GA 4PY5A 4QCLA 1VSKA 1NK9A 4BACA 2DTUA 1JLEA 3T1AA 2FBVA 4CHNA 3SQ4A 1DLOA 2ATQA 4C8OA 2OZMA 3LP1A 1I3AA 2RF2A 1ZBIA 3DI6A 4O44A 4W5NA 4J2BA 4FK4A 3K5OA 4CF1A 1C6VA 4CJQA 3AA3A 4CJUA 3SI6A 4KPYA 4Z4FA 1YTUA 4KI6A 3CYMA 1L5UA 1VRUA 1VRTA 2OPRA 3HPHA 3KLIA 4CGFA 2DFEA 4CJLA 3OS2A 3MXIA 3NGZA 3RMAA 3G10A 3HPGA 4B9TA 1SV5A 3KTQA 3KIOA 4TSXA 3AO4A 1B92A 1VSMA 4FZXC 1FKOA 4CJ3A 3SPZA 3I8DA 1YT3A 5KGXA 4CJWA 5J2NA 4CJSA 3RRHA 4OLBA 1TL3A 3AVKA 4O55A 3TANA 1RBSA 1TAQA 2WOMA 4F8RA 4B9VA 4B9MA 1JLCA 2HHTA 3NAEA 2YNGA 3QLHA 1RTHA 3HXMA 3RTVA 3NGIA 5KI6A 5KRTA 4W5OA 3SUOA 4XIUA 3P1GA 3HM9A 4E7IA 1NKBA 5JS2A 4CJ4A 3LP2A 3ZSQA 4O0IA 1RT5A 3LWMA 3ITHA 2YNFA 4JS5A 5J1EA 4CFDA 3NH1A 4FLYA 1NJYA 5D3GA 4AHVA 5FDLA 4B08A 2W42A 3MAQA 4DQPA 3L3UA 3S3OA 2FBYA 4ID1A 1BQMA 3VQ7A 4J2DA 3AA2A 4H8KA 5HRPA 3IRXA 1KTQA 3SNNA 5CYQA 5HRNA 1NK7A 2X6NA 4OLAA 4N5SA 3DLHA 1TV6A 5HRRA 3K2PA 4KB0A 3O3GA 3OYKA 4KKOA 1JL2A 1Q9YA 5CYMA 2G8FA 4NYFA 4C8KA 1FK9A 1BIZA 3T3FA 5CZ2A 3ZT3A 2B4JA 4DTNA 4OKEA 2G8UA 4B9LA 1KVBA 3VQCA 4FJXA 4DTPA 4M45A 3SV3A 3I0RA 4FVMA 5K14A 4CECA 3MEDA 4IG3A 1N5YA 4I2QA 4FW1A 4OKKA 4AH9A 2PZSA 2KZZA 3LAKA 2HHSA 4CF8A 3TWHA 1SL1A 5C24A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VN5A 1ASUA 4CEAA 4DUZK 1EO1A 1QQCA 4DCHA 3AVFA 2GUIA 4BR2A 2ZQBA 5AQGA 1T44A 4BC4A 2Q36A 2V51B 2IDOA 3KLGA 2W41A 4CJFA 4JNEA 3FFKB 3ID8A 1OVQA 4DLEA 3SAFA 3MXJA 3S41A 3O4QA 3JSMA 1EQYA 2XY8A 4JKBA 1RDAA 1WOQA 1UOCA 1GOBA 1BUPA 5AQWA 4CVNE 3M8RA 3DXMB 4Z4HA 4DMNA 2YKMA 3ZT4A 3JYTA 2D0OA 4K25A 4FJKA 2Q3SA 3NH2A 3OYBA 2OPPA 1W9HA 1JLFA 3KLHA 2Y1IA 2PYLA 1HYSA 1S1VA 5SZTA 5BPLA 4HHTA 2D5RA 2NLXA 2WBNA 3EN9A 3RSEB 2E5LK 2EX3A 4B9SA 2OZSA 2OANA 3W3DA 4YFUA 1QTMA 1Q81O 5J2PA 3SJJA 4Y0WA 3TI0A 1LAWA 4FWQA 3PIPL 3CCMN 4M3WA 3D7EO 2HNYA 3CCJN 4Z4GA 4X62K 3IKMA 1CXUA 3FE1A 5AFUH 2QWQA 1E4FT 1U45A 3TARA 4JD2A 5FPEA 1RBTA 4JKAA 3SUNA 4E1NA 4OX9K 1RFQA 3KK7A 4R5PA 1MWKA 4CZIA 1VK0A 4LF8K 4H5RA 1NM1A 4KHPK 4J2AA 4AHUA 3U9ZA 1K8KA 1S3XA 4FO0A 3E1YA 5AQRA 5F2RA 3F73A 3DLBA 1ZXOA 3CCLN 1TAUA 3KWGA 3MWTA 5AQIA 1WBBA 3HL8A 3OJUA 4J2EA 4BQZA 4JEPA 3OYFA 2P9NA 5HRSA 3C95A 4AHRA 1NK6A 4KTZA 3OYJA 2NNWA 4CEQA 4GMJB 5EXWA 1DT9A 3UIQA 4H0OA 3CC7N 4F3TA 4WE1A 1RT7A 3KJVA 4QOZB 4DSKA 1VSEA 2BGGA 1YUWA 4FK2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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