1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
1WOQA 4M63C 2HOEA 5AQSA 4FL9A 4CZKA 3H3OB 4CZGA 3UKUA 3WEEA 3A5LC 2CGJA 4GY2B 1JCEA 3J8AA 4BRPA 2NRHA 2YJEA 4CI6A 2E2QA 2IIRA 3CJ7A 1SAZA 3VF2A 3FZFA 4QS9A 3D2EA 1ZBSA 2ASPA 1Z6RA 1QQMA 4MLEA 4Y0WA 5AQIA 1NGHA 4BGBA 1HPMA 4FOIA 5AQXA 1GLJO 3VF6A 4IXCA 3VF4A 4BRFA 3A5MC 4PKHA 1YUWA 3FLCO 4CZLA 1BOTO 4BRCA 3ZX3A 3IFRA 4K42A 3QICA 1BU6O 1DKGD 4H0OA 1SQKA 2DPNA 1JCGA 4BRHA 5AZJB 1J6ZA 3O1BA 2V7ZA 4BR2A 2QWNA 3H46O 3M1FA 3FFKB 4WQ4A 4BGAA 2QWPA 4BC5A 4B1VA 2D4WA 2FSJA 3CJ9A 1U2VA 3F9MA 5AQPA 5AZIA 5TKYA 2QW9A 4JHDA 3D2EB 1GLCG 4O5FA 1T44A 1T6CA 5AQZA 2E1YA 1K8KA 3AAQA 3VEYA 5F1XA 1E4FT 1DEJA 3FZKA 3EL2A 4B1XB 2ASMA 3ATVA 2P9IB 3I8BA 4IWVA 3D7EO 1XC3A 2P9KB 1P8ZA 1RFQA 3LM2A 3A5OC 1NGCA 3U9ZA 3QBWA 3EZWA 3IDHA 2VWBA 1SZ2A 3DXKB 3BEXA 3HBTA 3A0IX 3M6GA 3WXLA 4CD1A 3RSEA 5AQFA 3ZX2A 5KQDA 3CIPA 4H0YB 3VEXA 5AQNA 1U2VB 5FPEA 5KQ8A 5ADXH 2A41A 1KAYA 5JMVA 2I7PA 3FZMA 3O8MA 5BRDA 3BF1A 5AQYA 4DB3A 5AQTA 4QS7A 5JICA 3SMPA 4K41A 4BRAA 2HMPA 3WXIA 3LDLA 2QWOA 4B1UB 4BRIA 4CD3A 5EOYA 3DXMA 3ZEUB 3H1QA 1RDWX 1X3NA 2V7YA 3LM9A 3DWLA 5BRHA 1KXPA 4CZFA 3P4IA 4ISFA 5ELZA 3CETA 2E20A 2PBDA 4IJAA 5LJVA 4EHTA 3B8AX 3EKSA 4Z94A 2Q1NA 4FWLA 2QXLA 2P9PA 3VPZA 3W0LA 3H3NO 4H0TB 3MMVA 3IUCA 3GBTA 1TYQA 3WXJA 4BR0A 4BC3A 4BVPA 1NGGA 4H5TA 2E2NA 3BF3A 2D0PA 4WQ4C 5EX5A 4CZHA 1ZXOA 4BQLA 3VEVA 3CQXA 2ASOA 5EXWA 3U9DA 5BPMA 5JLFA 3O4WA 4WYBA 4MLHA 4B1WB 1E4GT 3LDNA 4FWMA 2CGKA 4FOEA 2AP1A 3O6WA 1GLFO 2CH5A 4JHDB 5AQOA 4A2BA 3LDPA 2ZWHA 1NMDA 5EVZA 3AAPA 1T6DA 3D2FB 5BRFA 2YJFA 5E26A 4BQZA 2W40A 1QQNA 3ID8A 3ZX0A 2EWSA 3FZLA 2P9UB 4FPAA 4BRNA 4CZJA 4BRKA 4J8FA 2J4RA 1ESVA 4ISGA 3GOIA 2P9KA 3QMLA 3DAWA 1KAXA 1MWKA 4GNIA 3I33A 1NWKA 4BR4A 1HKCA 1MDUB 1ATRA 2UYTA 4NO7A 1HKBA 2HF4A 3TPQA 3O08A 5CE3A 2YCHA 5FPNA 2V51B 3R9PA 1GLEG 4CBWA 3QBXA 4FSVA 4LC9B 3UB5A 3G25A 3FE1A 5F2RA 2IVNA 4IO8A 1NGDA 3VGLA 5B8HA 3S41A 3OHRA 4MO4A 4H0XB 1BA1A 2FLOA 4PKGA 4CBUA 1C0FA 2D1KA 4BRGA 2A40A 2OANA 4EIAA 4HTLA 1NGBA 4JN4A 4AM7A 2IVPA 3CQYA 1Y64A 3W3DA 4PKIA 4BROA 2FF3B 2P9SB 4A2AA 5AQGA 2GELA 3UKRA 4DQ8A 1GLLO 3VEOA 4O8KA 1NGJA 3VEWA 4AM6A 1KAZA 3O1WA 2A3ZA 3AY9A 5AQVA 3VEZA 1BUPA 2Q0RA 1DGKN 5AQKA 1C0GA 3H45C 5AZIB 1NGFA 2V52B 3U4LA 2GEMA 3ZETA 5EY4A 2Q31A 3ULEB 1QZ6A 5BN8A 4RTFD 2E1ZA 2P9LB 3DXMB 3WUHA 3ZEUA 2E2OA 1MA9B 2FSKA 2F9TA 3O5BA 2GWJA 5AFUA 3KHYA 3GL1A 3R8EA 5FPMA 2QM1A 3MN5A 3LDOA 4K43A 2NZTA 4BVOA 3M3ZA 3WQTA 4HWIA 4A61A 2YI1A 3GG4A 4JD2B 2ITMA 5LJWA 2P9PB 4PL8A 4L3QA 5BN9A 4BG9A 3CJBA 4H03B 4FWQA 4WQ5A 3UKRB 2E8AA 1R59O 1D4XA 1XUPO 4YDUA 2BUPA 5KPZA 1IG8A 3C0BA 5KPTA 1NGEA 3DJCA 2E88A 4FWNA 1G99A 1ATNA 3L6QA 2P9LA 1RGIA 3GE1A 1QZ5A 4C23A 1WUAA 2Q97A 3ZETB 3ULEA 4BR9A 4B9QA 3IMXA 4FWSA 1YVNA 3VETA 1LCUA 4YDUC 3HSCA 1BO5O 4ISEA 5AQMA 2HF3A 4NB4A 1X3MA 1YXQA 2CH6A 3MN9A 4WQ5C 3CJAA 1QQOA 4H5WA 1LOTB 3ENOA 3JS6A 5AQUA 3SMSA 2P9SA 2P9NB 4H0VB 3UE5A 2Q0UA 4BRDA 3VGMA 3DXKA 5AR0A 4EHUA 3TU5A 5AQRA 5AQLA 2F9WA 2D0OA 3H1VX 1GLBG 5BPLA 2BTFA 2QWMA 3VOVA 4E1JA 3JXUA 4FWKA 3KVGA 3CJCA 1CZAN 2AA4A 1BDGA 2GTDA 3MDQA 2QWLA 2YHYA 1S3XA 1K8KB 2CGLA 2I7NA 3H6EA 3CERA 3MCPA 3O80A 3HM8A 1HX1A 4CJ7A 1GLDG 1OKJA 1H1VA 1XQSC 2W41A 3D2FA 5ADXA 3R6MA 4FWRA 3HTVA 4A62A 4IJNA 4IZ9A 2YHXA 1JCFA 4B1ZA 5BREA 1NGIA 2E2PA 2H3GX 3WXKA 1X9JA 1HUXA 1V4TA 5LY3A 3L4IA 5AQHA 4RCHA 4BR7A 4JAXA 3BP8A 4H0PA 2GWKA 1BA0A 4KBOA 2QWQA 3MN7A 4DHYA 3RSEB 4CZMA 1IJJA 3FZHA 2FSNA 1EQYA 5KPRA 4K25A 4CZEA 1NBWA 5JLHA 3CI5A 3MN6A 3GDQA 1HLUA 1BWFO 4JNEA 4H5VA 3WQUA 5E84A 4BG8A 4B1YB 3CJ1A 2ZF5O 1U6ZA 4FWPA 4XH5A 4XEIA 3QFPA 3QB0A 1YAGA 2WUSA 2FF6A 1ATSA 2FXUA 2P9IA 1NLVA 4XH4A 1TUYA 3LL3A 1TYQB 4RWTA 1Z05A 2ZGZA 3SJHA 3VERA 2P9NA 2PAVA 1HKGA 4BREA 3WT0A 3BUZB 4BC4A 3FGUA 2A6AA 5AFUH 3EKUA 3KZBA 5BR9A 2A42A 1Q18A 2VYPA 3MK6A 2IVOA 5BPNA 3C7NA 1NM1A 3HI0A 3QDKA 3VENA 4CZIA 2QWRA 3A5NC 3VESA 1MWMA 5F0XA 4EAHD 3AARA 3ENHA 4BR5A 1TUUA 3EO3A 3SLCA 3ATUA 2KHOA 4FO0A 5AQWA 4CBXA 5FPDA 2Q36A 4FWOA 3UKUB 3WEEB 3LDQA 4MO5A 2YHWA 1S22A 4EFHA 1V4SA 3HZ6A 1NGAA 4BRMA 5AQJA 2A5XA 5AQQA 3EN9A 4PL7A 3FR0A 3QFUA 1HJOA 2P9UA 4BRQA 4F9OA 2NLXA 2ZGYA 4M7YA 5I9EB 4FPBA 4I6MA 1GLAG 4H5RA 4QS8A 3SK3A 4JD2A 3U8XA 4BC2A 4H5NA 1ZC6A 4I6MB 3C7NB 4M7XA 2Q2RA 3VGKA 1BG3A 1QHAA 3L0QA 4XH1A 4BRLA 2VCPA 3A8YA 4DCHA 5AZJA 2GUPA 3CHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WFAL 3E1YA 1WOQA 2IC3A 2O8CA 4FL9A 3LAMA 4CZGA 4GY2B 1SKRA 2E2QA 3TSQA 4DV6K 2QKBA 3AA3A 1SAZA 5M1KA 2OA8A 1N36K 4QS9A 5I42A 4C1NI 4ILJA 4FJ8A 1T8EA 4CEQA 4MLEA 5K14A 4Y0WA 4CK2A 1RCHA 5C15A 2YNFA 4FOIA 4BE2A 2O8EA 1IBKK 4FYDA 4IXCA 3OY9A 3ULDA 4BRFA 1BOTO 3P5JA 3MX5A 3DRPA 5J2MA 4FJ7A 1WBDA 4K8ZA 3PX4A 5BR8K 2QWNA 3AA5X 4ID5A 3H46O 3M1FA 3HK2A 3FFKB 4WQ4A 4OKKA 4B3SK 4BC5A 1U2VA 2HHXA 3F9KA 4E3SA 1WBBA 2QW9A 4DV5K 3D2EB 3CPEA 3NF8A 5SZTA 5AQZA 2E1YA 3TTFA 1DEJA 4C8NA 4DR5K 3I8BA 3KLIA 3KWGA 1S1VA 3VQDA 3LM2A 1RDBA 3A5OC 4BEBA 3U9ZA 3QBWA 1SZ2A 3DXKB 4B9VA 3BEXA 3HBTA 4DSKA 5KQDA 3ZT2A 4H0YB 3LDSA 5ADXH 2O8FB 4OPAA 4MDAA 3O8MA 4FCYA 4R5PA 3C65A 5HL7L 4QS7A 3L8BA 5GAEP 5JICA 2C1IA 2HMPA 2QWOA 2OTJN 4BRIA 1EWQA 3H1QA 1RDWX 3DWLA 1KXPA 4IOCL 3F2KA 3P4IA 1A5VA 2B5JA 3CETA 3ZLJA 3OYBA 2PBDA 5GIPA 4Z94A 2Q1NA 2QXLA 1LV5A 4OX9K 3W0LA 4PY5A 4KHUA 3IUCA 3GBTA 1JL2A 4BC3A 4CJQA 4H5TA 4RW4A 2RKIA 4BQLA 1VQ5N 4KTQA 3MAQA 1UAXA 5EXWA 2HB5A 2WTUA 4MLHA 3LAKA 1E3MA 4LSLA 2PYJA 4FWMA 2CGKA 3V9UA 3VQQA 2AP1A 3N4PA 5AQOA 3SCXA 4A2BA 4CF0A 1N34K 3DLKA 3K5OA 3TSUA 1T6DA 3L4QA 3D2FB 4HUFA 4DR2K 4DTOA 2YJFA 2W40A 3ZX0A 4YHHK 1OH8A 3PY8A 3FZLA 2P9UB 4CEBA 3ZYYX 4BRNA 3SBTA 4CHOA 3AVNA 4ISGA 3GOIA 3QO9A 1NWKA 4BR4A 1SKSA 1ATRA 2Y1IA 5HBMA 4AHUA 3AVFA 3RRHA 1HKBA 4JI8K 1RDDA 2YCHA 2WFBA 2XHBA 3R9PA 3VMFB 3OYGA 3KTQA 1GLEG 4E72A 4A5BA 3FE1A 1T7PA 1LWEA 2IVNA 2HHQA 3TAEA 3MEDA 4CERA 3NGIA 3AVGA 4CFCA 2FLOA 4ZTJA 4PKGA 4DQPA 1QVGM 4X64K 4BE1A 1NK0A 1QS4A 3THYB 4FJ9A 4CJTA 4CHPA 1NGBA 4OPHA 1YJWN 2F7TA 2IVPA 3CQYA 4PKIA 3HRGA 2FF3B 4BROA 1N6QA 4CECA 3CCJN 1KTQA 4A2AA 5AQGA 5MLCQ 4JI4K 1NK7A 2VGMA 3I56N 1JLQA 3PUFA 1GLLO 3VEOA 5DM6L 4O8KA 1NK6A 3F5TA 4KRFA 4CF2A 3VN5A 3CQ8A 3PLAA 4X66K 1XHZA 1VQMN 2Q0RA 4BACA 3HOTA 2KQ2A 3TAQA 1JJ2M 5EY4A 1HQEA 2HNYA 2Q31A 1QZ6A 1FJGK 2O4IA 3FFIA 1TKTA 4Z4IA 5JVGL 2E2OA 1DTQA 4CHQA 1TKZA 3D45A 1Q7YO 3EE9A 3GL1A 1GOAA 3K57A 4K43A 3SBGA 4BVOA 1HMVA 3M3ZA 4Y1DA 3GG4A 2ITMA 2ZQBA 4PHTX 4DWIA 1VSJA 4QAGA 3G4SN 3UKRB 1R59O 1VSHA 3NMUA 3C6AA 4KV8A 2BUPA 2B6AA 4FLYA 3MWTA 3NFAA 5KPTA 4F2RA 3OYLA 3TAGA 4LF9K 1N8RO 4MDBA 4F8RA 4JEPA 3IMXA 4B9QA 4M3YA 1HJRA 4YDUC 5HOOA 3LWMA 1ITGA 4RG8A 3OYAA 5HROA 1X3MA 3A2FA 3AO4A 3CYMA 3CJAA 4XJXA 1QQOA 4H5WA 4RW9A 3AVIA 4H0VB 4BRDA 3PIPL 1HYSA 3DXKA 4E0DA 5KGWA 5HRNA 4TSXA 5AQRA 4DTUA 2D0OA 1IBLK 4Q5VA 4JKEA 3C94A 4JI7K 4GVMA 4C8LA 4Z0UA 3JXUA 3QEWA 4FWKA 3NF7A 5J2QA 1CZAN 5HRRA 3WNGA 2GTDA 2OZMA 5J2NA 2QWLA 2YHYA 2CGLA 2I7NA 1BQNA 3OS2A 3L2UA 3MCPA 5KRTA 1C0MA 2XY7A 1U48A 4KHNA 5A2QO 3CCVN 1XQSC 3D2FA 3UIQA 4JYAK 3J81O 4DFKA 4IJNA 4FLWA 3J80O 3WXKA 2ETJA 4IOXA 3AVHA 1HUXA 1V4TA 4M45A 2G8WA 1T05A 4LY7A 4JAXA 3HOSA 1BI4A 1L3SA 1DT9A 4DHYA 3L3VA 1IG9A 2O8BB 3QERA 2NUBA 4K25A 3V1QA 1VHXA 3OTOK 1X9SA 1HLUA 4DTJA 5C2DA 4W5TA 3WQUA 4KPYA 4DFMA 3CJ1A 2VG6A 3HSTB 4FWPA 1QHTA 4XH5A 4IG3A 2VQEK 4BWMA 1YI2N 2FF6A 2NNWA 4LF6K 1X9WA 1QTMA 1TUYA 1TYQB 4DV1K 4N47A 3IRXA 1HNWK 1QQCA 4EZ6A 2QI2A 3BUZB 4BC4A 2BH1A 1KVBA 2A42A 1Q18A 4AHRA 4F3OA 3ISNC 1B9DA 3TANA 1NM1A 1T03A 4CZIA 1RILA 4JKGA 4CJVA 3JAMO 4B3OA 5F0XA 2YKMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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