1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
5EOYA 1DGKN 3D2EB 2Q2RA 1NGHA 2E1YA 4I6MB 4FWSA 1WUAA 4FWOA 1XQSC 5AQNA 3WQTA 4CBUA 3AAQA 3FGUA 4CZEA 3U8XA 3DAWA 4LC9B 3DXMA 3EL2A 3CERA 1Y64A 3ULEA 1XUPO 3R6MA 4CZJA 2IVOA 3IFRA 2FF3B 4K25A 2GWJA 3MDQA 3MN5A 3LL3A 4H0TB 4EAHD 5KPTA 4WQ5A 1BA1A 4MO4A 4FO0A 5EVZA 1C0FA 2QWPA 3VERA 3LDOA 1SQKA 2NZTA 2NRHA 5F2RA 3VPZA 1KAZA 4B1ZA 3ID8A 1U2VA 4AM7A 5BN8A 4GY2B 3BUZB 3QBWA 2FSKA 3BF3A 2AP1A 3FZLA 4H0YB 3TU5A 1IJJA 3CETA 3GE1A 1OKJA 2P9PA 5FPMA 4JHDB 1NGIA 4GNIA 4C23A 1U6ZA 2A41A 1E4GT 1BG3A 4JN4A 5AQPA 4BQLA 3VGMA 4J8FA 4FOEA 4DQ8A 4PL8A 3GBTA 4BRPA 1GLJO 1TUUA 4M63C 4H0OA 4QS8A 5AZJA 2YJFA 4HTLA 2E2PA 2H3GX 3H1QA 2P9KB 4JD2A 2YCHA 3M1FA 1GLCG 4CD1A 5AQUA 5EY4A 1H1VA 2P9IB 5FPEA 1C0GA 2VYPA 5FPNA 1NGBA 4XEIA 1NGAA 5AQQA 5B8HA 2A3ZA 1T6CA 1NWKA 2E2QA 3MN6A 3VEXA 4F9OA 4H5VA 3CHWA 3SK3A 2D0OA 1BWFO 3AY9A 4K42A 2W41A 2E8AA 4BROA 2ASOA 2OANA 5AQRA 1EQYA 2P9SA 1HJOA 2VWBA 2Q1NA 3FZHA 3VF4A 3VEZA 4ISFA 5TKYA 4H5RA 4BRIA 3AARA 2D1KA 3M6GA 3MK6A 3R9PA 1NGCA 2ZF5O 5BPNA 3VF6A 1V4SA 4FWQA 1ESVA 3IUCA 2J4RA 4EHUA 4BR5A 3O6WA 1MA9B 2GUPA 1ATRA 4JNEA 3CJBA 4FWNA 1QQMA 4IJAA 1X3NA 5AQKA 3ENOA 2F9TA 5BRFA 4PKGA 1NGDA 4EHTA 1BOTO 2P9LA 3U9ZA 3UKRA 4IO8A 3OHRA 5LJWA 4XH1A 4QS7A 2QWNA 2I7NA 4BG9A 3CIPA 2P9PB 3H3OB 3C7NA 1RGIA 5E84A 3O1BA 2DPNA 2A6AA 3ZX2A 4ISGA 3ENHA 1J6ZA 4H03B 3ZX0A 4BVPA 1GLDG 3UKRB 4A61A 4Y0WA 3DXMB 3H45C 3H1VX 2HOEA 4O8KA 1ZXOA 4CZLA 3EKSA 2I7PA 4BGAA 1BUPA 1T44A 4H5TA 4H5NA 1QHAA 4WQ5C 3SJHA 1RDWX 1NGGA 1X9JA 2D4WA 1BA0A 4RTFD 3DWLA 3BP8A 4FPBA 3VENA 3FZKA 5ADXH 4BREA 5JMVA 1JCGA 4IXCA 2PBDA 2P9IA 1MDUB 1NGJA 3LDQA 4FL9A 1BDGA 1HKGA 1ZBSA 3UB5A 4O5FA 1QQOA 3ATUA 3VEWA 3WXJA 1U2VB 4I6MA 4JD2B 3EN9A 3VEVA 3O80A 5BRHA 4BRCA 4K41A 3O5BA 5KQ8A 4FPAA 5I9EB 1RFQA 4YDUA 3VOVA 4H0VB 5EX5A 4DHYA 3ATVA 2A40A 4M7XA 4BQZA 2P9UA 1ATSA 4BRAA 3DXKA 3A5MC 3L4IA 3QBXA 3FZMA 4FWRA 1E4FT 3O4WA 2QWRA 2GELA 3CQYA 4NB4A 3G25A 3O8MA 4B1VA 3LM9A 1GLBG 3ZETB 1KXPA 3KVGA 3WXKA 2Q0RA 1S22A 2WUSA 3DXKB 5AQHA 5AQIA 4IJNA 4FOIA 3LM2A 5KPRA 2NLXA 3WQUA 3A5NC 3C0BA 4MLHA 4YDUC 5AQFA 4EIAA 5BR9A 4JHDA 2CH6A 3I8BA 3HSCA 1R59O 3HI0A 3LDPA 5AZIA 3BEXA 1GLFO 1JCFA 3QMLA 4A62A 5JLFA 2ITMA 1HLUA 1GLEG 4ISEA 3FLCO 4QS9A 1BU6O 4B1YB 3QDKA 4BR7A 4BR2A 3VGLA 4BRGA 3H46O 2E2OA 1JCEA 5F0XA 1MWMA 4B1UB 1DEJA 3EO3A 4CZGA 5BPLA 3WXLA 1P8ZA 4HWIA 1ATNA 4IZ9A 4FWKA 2CGJA 4MO5A 5FPDA 4BG8A 2GEMA 3C7NB 2P9KA 1HPMA 1HUXA 3EZWA 4XH4A 3WEEB 2A42A 3QICA 3A0IX 5BRDA 5AQJA 4EFHA 5AQLA 4CD3A 3ZX3A 3QFUA 2HMPA 3HBTA 3SMPA 2BTFA 3RSEA 1G99A 2VCPA 1TUYA 5AQGA 4PKIA 2YI1A 3VEOA 3UE5A 3D7EO 1D4XA 2E20A 5AQZA 1HKCA 5CE3A 1LCUA 3ULEB 3UKUA 2P9NB 1WOQA 2PAVA 4RCHA 4BRHA 3R8EA 4CBWA 3CJCA 5JICA 3KZBA 4BRDA 3F9MA 3VGKA 4B1XB 4FSVA 2AA4A 4CI6A 5AZIB 1NLVA 2D0PA 3D2EA 3CJ9A 2ZGYA 2QW9A 2BUPA 1GLAG 1TYQB 3L6QA 2CGKA 2CH5A 5AQSA 1T6DA 3KHYA 1QQNA 4K43A 1NMDA 4BR9A 5F1XA 3MCPA 5AQMA 2F9WA 3SLCA 1K8KA 2YHYA 2FXUA 4FWMA 5ADXA 4B9QA 4Z94A 2YHXA 3MN7A 4BRKA 2Q97A 1SAZA 3HZ6A 1NBWA 1CZAN 4H5WA 3QB0A 5AFUA 5ELZA 4PL7A 2HF4A 3MN9A 2FLOA 3CJ1A 4WQ4A 3IMXA 2ASPA 5AFUH 4BRQA 1QZ6A 2IIRA 4A2BA 3ZEUB 4JAXA 1ZC6A 2FSNA 3FR0A 5AQVA 3MMVA 2W40A 1K8KB 2YHWA 3HTVA 3UKUB 5JLHA 4L3QA 5AZJB 4MLEA 3HM8A 3O08A 1LOTB 5E26A 3M3ZA 1BO5O 4M7YA 3H6EA 2ZWHA 2E1ZA 4CZIA 1MWKA 1KAYA 3VESA 1GLLO 4E1JA 1YVNA 1HKBA 1Z05A 2Q36A 3CJ7A 5AQXA 2E2NA 2QWOA 4H0PA 4RWTA 3EKUA 2CGLA 3A8YA 3JXUA 4NO7A 1IG8A 3SMSA 2ZGZA 3LDNA 5EXWA 3ZEUA 5BPMA 3AAPA 4CZKA 3I33A 3WEEA 5AQWA 2QWQA 5AR0A 2KHOA 1YUWA 3CJAA 4XH5A 3VETA 4B1WB 5KQDA 4PKHA 1DKGD 4BRMA 3LDLA 4DB3A 4CZMA 1V4TA 4KBOA 3RSEB 3FZFA 5LY3A 2QXLA 3D2FA 2QWMA 1NGFA 1HX1A 3L0QA 3BF1A 3A5LC 4BC2A 2GTDA 2P9NA 3CI5A 4BVOA 1NGEA 3B8AX 2QM1A 4WYBA 4BC5A 4FWLA 3VF2A 2GWKA 1Z6RA 3GOIA 2FSJA 2P9LB 4BRNA 2UYTA 5BN9A 3GL1A 2A5XA 1QZ5A 3A5OC 2YJEA 4AM6A 4BRLA 3WT0A 4BGBA 5AQYA 3W3DA 2ASMA 3CQXA 1S3XA 4BR0A 2QWLA 4BC4A 2EWSA 3IDHA 2IVNA 3J8AA 2P9UB 3GDQA 3TPQA 1SZ2A 3W0LA 2V52B 4CBXA 3VEYA 4DCHA 4BR4A 2HF3A 4H0XB 4WQ4C 1YAGA 1Q18A 3WXIA 3GG4A 1KAXA 3P4IA 2FF6A 2Q0UA 5BREA 3JS6A 3WUHA 1X3MA 2IVPA 3ZETA 4CZHA 2Q31A 1XC3A 3FFKB 4FWPA 3DJCA 2E88A 3QFPA 4BRFA 4CZFA 5KPZA 2V7ZA 1YXQA 4IWVA 3S41A 5AQTA 4BC3A 5LJVA 4A2AA 3O1WA 3U4LA 4CJ7A 2P9SB 5AQOA 3H3NO 3U9DA 2V7YA 1TYQA 3D2FB 3FE1A 2V51B 1NM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D2EB 2Q2RA 2X6NA 3K9KA 1KQSM 1LWFA 3R1XA 4CBUA 2QKBA 4C8OA 5HL7L 3VQEA 3HOTA 3EY1A 2F7TA 1NK0A 3QEIA 3DAWA 3T7ZA 3LZJA 3ZSOA 4IDKA 3R6MA 1Q9XA 1BIZA 4O5BA 3F2KA 4A5BA 3HP9A 1JXEA 4IFEA 3C95A 4KTQA 1RTDA 3CYGA 4MO4A 3VPZA 2NRHA 4X62K 3V1RA 2YNHA 4AM7A 5BN8A 2P1JA 4E0DA 2XO7A 5LL6Z 3V6DA 1IKXA 4H0YB 4I2QA 3CETA 1VSJA 2YV0X 1ASVA 3AO4A 4RW4A 3V4IA 4KRFA 1HYSA 3M5RA 4FZYA 1E4GT 4G9ZA 5AQPA 4FK4A 2NUBA 4DSKA 4J8FA 3GBTA 3CC2N 1GLJO 3DM2A 4CK2A 1N6QA 2YJFA 3SCXA 2ITGA 2B6AA 4JI2K 1RILA 4DV2K 1TK8A 2H3GX 3KLEA 1VQKN 2P9KB 4IKFA 5CZ2A 4FLUA 1WSEA 1HJRA 5FROA 3NCIA 4CD1A 3IAYA 3DMJA 5AQUA 4FLWA 5EY4A 4CGJA 3LZIA 2P9IB 2P5GA 5FPNA 1NGBA 3AGKA 4XEIA 1NGAA 2DTUA 1T6CA 1SL1A 2E2QA 3E01A 3TTFA 3CHWA 3IG1A 2D0OA 4FW2A 2E8AA 1OVYA 5AQRA 4CF8A 3FZHA 2HBKA 3AVGA 4ISFA 3LAMA 1B92A 1YHQN 2W6LA 2PYLA 3M6GA 1IBLK 5H1SQ 4PA1A 4FWQA 4DLEA 4BR5A 1ATRA 1KVBA 3HK2A 5IT9O 3CJBA 4DTPA 1JXBA 3DOKA 1QQMA 4FJ7A 1ITGA 3ENOA 2F9TA 4B3MK 3NH0A 1HNIA 1YVUA 4O55A 2A1RA 1BOTO 4DFMA 3V9UA 4DLGA 1YJNN 3HXMA 2QEXN 3LDSA 4JI0K 1Q8IA 1BIUA 2RHKA 1J9AA 5LJWA 1Y97A 2I7NA 3T1AA 3SQ0A 1XMOK 1RGIA 3ZX2A 4ISGA 4BVPA 4H03B 4W5OA 1ZBHA 4C8KA 2HOEA 2HW3A 5E41A 1SKRA 4CIFA 3OW2M 1RCHA 2C1GA 4OLAA 4M3TA 3HSTB 3SJHA 3BP8A 4ILJA 4WFNL 5ADXH 5C2FA 3VQQA 2RF2A 1JCGA 2P9IA 4FL9A 1HKGA 3UB5A 3SV3A 4I6MA 4FJIA 1RDUA 3HOSA 2QA4N 1JLAA 1WNSA 4DR4K 2B5JA 2OTJN 1HMVA 3P31A 4FPAA 1RFQA 3SQ1A 3VOVA 1HR0K 2PZSA 4H0VB 1Z26A 5EX5A 2IGIA 1REVA 4DV3K 2NNWA 1U4BA 4B9MA 1XNQK 1ATSA 4DQPA 3JYTA 1YI2N 1TGOA 3DXKA 3NE6A 3QBXA 2WONA 4DQSA 3FZMA 1TKXA 1C1AA 2QWRA 2GELA 1N5YA 4KO0A 1JLCA 3K0SA 4JKFA 4CF1A 3KVGA 4LFAK 2O8FA 4QAGA 3CCMN 4Z4FA 1TV6A 3V9WA 5AQIA 1C1CA 1DLOA 1BISA 1IH7A 3OYHA 4MLHA 5HOOA 4EIAA 3DRSA 4E1MA 3THWB 1NJZA 3HI0A 3CFRA 4KB1A 4QS9A 4BR2A 4BRGA 4B1YB 3QDKA 4BR7A 2E2OA 3H46O 4CZGA 4KI6A 5T7BA 2Y1IA 3O9UA 1ATNA 3HJFA 4JS5A 4MO5A 5FPDA 1ASUA 3TARA 1HPMA 1HUXA 3A2FA 2G8VA 4XH4A 1EKEA 4JV5K 2A42A 3M8PA 3A0IX 3OYJA 4Q0BA 2IS3A 4BDZA 5HRNA 1LW2A 3ZX3A 3SMPA 3SUNA 4IG3A 3OVNA 3AA3A 4B08A 3RSEA 2VCPA 2G8WA 4KTWA 5AQGA 3SAHA 4PKIA 3VEOA 2Z1IA 4LH5A 1LWCA 3E66A 1JKHA 1VQ9N 1LAVA 4CJ4A 3NGYA 2O8CA 3O9QA 4RCHA 3R8EA 1X9SA 3LANA 5JICA 1YIJN 3C6HA 3F9MA 4CFBA 3PIOL 2YKMA 2VGNA 5HRRA 2HHIA 4YOUA 3G4SN 5CHIA 3D2EA 3SAGA 3PY8A 2QW9A 4OPAA 3L6QA 2OCEA 3L2RA 1QE1A 1UWBA 1K6YA 1NMDA 2ZM6K 1A5XA 4KHQA 3PSIA 4KHWA 5CYQA 1B9DA 3SLCA 2YHYA 5ADXA 2HVIA 3HL8A 1WAFA 4HCCA 4PHTX 2Q97A 1IKWA 1BHLA 1VHXA 5J1EA 4CJSA 3TAMA 1XHXA 4CHPA 3RMCA 1BCOA 4B8CA 2FLOA 2G8IA 4Q5VA 4V19S 4WQ4A 3IMXA 1RT6A 3PIPL 3SPZA 4CJLA 3CF5L 3ZEUB 2FSNA 2JWKA 2BANA 5AQVA 3O4QA 4K8ZA 3CD6N 3P1GA 3THXB 2YHWA 2XRIA 3ZCMA 1FJGK 1YT3A 5GIOA 4MLEA 3HM8A 1WAJA 4YORA 5E26A 3C6TA 1BO5O 3NGIA 3H6EA 3ZSWA 3QNNA 2E1ZA 4HUFA 4CZIA 2BGGA 3VESA 3K59A 1YVNA 1Z05A 4NCAA 2HBMA 4DV7K 2QWOA 4DQRA 3MEGA 1IG8A 2ZQBA 1NNEA 1A5VA 4ELTA 4M45A 4CHOA 5HP1A 4DU4A 4NCGA 2RE2A 3CCVN 4JRPA 2G8HA 1VRTA 4I2PA 4B9TA 3WNGA 1IO2A 1S9GA 4RW6A 3NF8A 5AR0A 5CYMA 2O8BA 2KHOA 4XH5A 2DY4A 3VETA 1Q81O 4PKHA 1DKGD 4BRMA 3PX0A 1KVCA 4JKBA 2QTDA 3TI0A 3D2FA 3TSPA 5KGXA 2Z1GA 1R0AA 3LP1A 3KK3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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