1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
b'EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
4PKIA 5AQOA 4A2BA 4GY2B 3HZ6A 5AQGA 3VF6A 1DKGD 4B1ZA 1WOQA 1S3XA 3L4IA 4FWSA 5AQSA 4FWQA 1NGCA 3O5BA 4M7XA 4BRHA 5AQMA 3CJCA 3FZHA 3LDOA 2P9NA 3DJCA 3U9DA 5EXWA 1NBWA 5AFUA 3QB0A 4BGBA 1JCFA 2V51B 3DAWA 3D2FA 3GBTA 1T6CA 3ENHA 3HBTA 5FPMA 2P9SB 4BROA 2FSNA 3AARA 2QWNA 4BRPA 2E1YA 2QWQA 2E20A 2P9IA 2Q97A 2E2PA 3VEOA 5AQPA 5AQNA 3O08A 2AP1A 2P9UB 3VENA 5E26A 3HI0A 3QFPA 2ASPA 1KAYA 5EOYA 5BRHA 3VEXA 4H5WA 2QM1A 1HJOA 1P8ZA 2ASOA 3EN9A 2YJFA 3EO3A 3GG4A 4FWPA 3VGMA 3ZX3A 3L6QA 1NGFA 1ZBSA 5LJWA 4WQ5C 5AQQA 1BWFO 3CERA 2A3ZA 4FWKA 3CQYA 4XH1A 3FZFA 1Y64A 4H5VA 4H0OA 3BEXA 4BVOA 2A42A 2NRHA 1XC3A 2UYTA 1HLUA 2QXLA 2Q2RA 1LOTB 5BRFA 5F0XA 1C0GA 3VEVA 3HSCA 1MWKA 4BR4A 4WQ4C 2Q31A 1KAZA 4FWLA 2OANA 1K8KB 4BRGA 4C23A 4K25A 2F9TA 3EZWA 1NGEA 2EWSA 4RCHA 3W3DA 2FSKA 5JMVA 4IXCA 4M63C 1HX1A 3M6GA 3DXKB 1E4GT 4IZ9A 1T44A 1TUUA 4XH4A 1QQOA 2ZGZA 3LDPA 4AM7A 4CBUA 2D0OA 2YI1A 2AA4A 2W40A 3CHWA 3H3OB 1SAZA 2P9SA 3DXMB 5F1XA 3A5LC 3GDQA 5AQVA 4A2AA 5BPLA 5EX5A 3VEZA 1DGKN 4CZGA 1BG3A 4Z94A 3ZEUB 5TKYA 4QS9A 3GE1A 3HM8A 3WXIA 3I8BA 4K42A 4BC5A 3UB5A 5JICA 4QS8A 2P9UA 3C0BA 3A5OC 3WXKA 3J8AA 1XUPO 3MMVA 3WEEB 1X9JA 3FLCO 1QZ5A 1H1VA 2Q0RA 1YUWA 3MN9A 4IJAA 3JXUA 1RFQA 1NM1A 1HKBA 2J4RA 4DHYA 4BRAA 4CBWA 3AY9A 3GOIA 5B8HA 3WQTA 5LY3A 5KPZA 4KBOA 4B9QA 1EQYA 3RSEB 4ISGA 3UKRB 2ASMA 3FZMA 1K8KA 1NMDA 2A40A 1SQKA 3VF2A 3O8MA 2E2NA 3F9MA 1GLFO 1LCUA 4BRIA 2ITMA 3G25A 1MA9B 3DXKA 1NGDA 3O1BA 3IDHA 1CZAN 3CETA 4BRLA 5EY4A 3W0LA 3U4LA 4BRCA 2NZTA 1XQSC 3UKUB 1YVNA 3QICA 3D2EB 3O1WA 4H5RA 3EKUA 5ADXH 1X3MA 3ZEUA 4YDUC 4PL8A 2YHXA 4FWOA 5AQIA 2I7PA 3ULEB 3EL2A 1RDWX 1GLJO 1V4SA 4BR0A 3C7NB 3U9ZA 3LDQA 2D4WA 4FSVA 2GELA 1BDGA 1BUPA 1NGAA 5AQFA 4QS7A 4XH5A 4GNIA 3WEEA 2FSJA 2P9PB 4CZFA 3MCPA 5FPNA 2GTDA 4BG8A 4B1VA 4FPAA 1ZXOA 2CGLA 2BTFA 4DCHA 2CH5A 3JS6A 3L0QA 4LC9B 3KHYA 2VYPA 3DWLA 3R6MA 1QQNA 3ATUA 4CD1A 3RSEA 1U2VB 3UKRA 3R8EA 3BP8A 4A61A 2D0PA 2V52B 3SMPA 4JD2B 5FPDA 1V4TA 4BRKA 4FPBA 4H5TA 1GLLO 1KXPA 4MLEA 3VEYA 1YAGA 1BA1A 2YCHA 1ATNA 5KQDA 4CZMA 3ZETB 3H45C 2HMPA 4H03B 2HOEA 5FPEA 1TUYA 5JLFA 3VOVA 5CE3A 3UKUA 1QHAA 1QQMA 4JN4A 4IWVA 4EHUA 3D2EA 3MN6A 2P9LB 5KPTA 2GEMA 3CI5A 4PKGA 2IVNA 4BR7A 3HTVA 4H0YB 3R9PA 4BRFA 1BA0A 2E2OA 3CJAA 4CBXA 2VWBA 3ULEA 2KHOA 2D1KA 2QWLA 4AM6A 4E1JA 5AQKA 3QFUA 5AFUH 4MO4A 2Q0UA 4EHTA 3C7NA 5AQYA 2WUSA 3LL3A 4BQLA 4O8KA 5AZJB 3WT0A 2Q36A 2E8AA 2IVOA 3A5MC 4JAXA 3VF4A 2P9PA 5BRDA 2QWMA 4BREA 3OHRA 3VERA 2E1ZA 1OKJA 4BRQA 5BPNA 4WQ5A 5AZIB 3MDQA 3ID8A 4FWNA 4EFHA 2CH6A 3AAQA 4BR2A 4CZJA 2FXUA 3CIPA 5BR9A 1T6DA 4HWIA 4B1WB 3BUZB 2QWOA 4FL9A 4I6MB 4ISEA 2E88A 2V7ZA 3QMLA 1U2VA 2ZF5O 5BPMA 1NGBA 1JCEA 2ZWHA 4WQ4A 2P9KB 3QBWA 3FE1A 2GUPA 4JD2A 3CJBA 1GLBG 1U6ZA 4PKHA 1Z05A 1Q18A 3MN5A 3H1QA 3SJHA 2IVPA 3U8XA 4H0PA 1KAXA 3B8AX 2CGJA 1GLAG 3LDNA 3ZETA 3LM2A 3SK3A 3H46O 4FOEA 3LM9A 5BN9A 4K43A 5AQWA 3A5NC 3VPZA 5KQ8A 2P9LA 3M3ZA 5AQZA 3LDLA 4DQ8A 1ZC6A 3DXMA 5AQTA 4CZKA 4A62A 4RTFD 3A8YA 4J8FA 1BO5O 4Y0WA 5AR0A 3UE5A 1RGIA 1HUXA 4JHDB 1GLEG 2FF6A 1YXQA 4BVPA 3CJ9A 5LJVA 1NGGA 5AZJA 2Q1NA 5AQLA 4WYBA 1NGHA 4CI6A 4XEIA 2H3GX 1C0FA 4BG9A 3I33A 5AZIA 3FZKA 2F9WA 4RWTA 4FO0A 4BRNA 1BU6O 4BR5A 4O5FA 4H0VB 5JLHA 1DEJA 1ESVA 4DB3A 2A5XA 2GWJA 2HF3A 4H0XB 5AQXA 4I6MA 3VGKA 4MLHA 2PAVA 3TPQA 4BGAA 3FR0A 3ENOA 4FWRA 4K41A 3H6EA 2P9KA 3WXJA 3FZLA 4IJNA 1WUAA 2V7YA 4BR9A 2YHYA 1Z6RA 3S41A 4HTLA 2YHWA 4EIAA 3H1VX 2IIRA 3AAPA 3M1FA 2ZGYA 5EVZA 1SZ2A 5AQJA 3D7EO 5KPRA 3ATVA 1JCGA 5E84A 3O6WA 2QWRA 4CD3A 1IG8A 2QW9A 3BF3A 2HF4A 4CZIA 3EKSA 3TU5A 4NB4A 3VEWA 5BREA 4M7YA 2PBDA 5AQRA 3ZX0A 1HKCA 4L3QA 1E4FT 4YDUA 1QZ6A 3MN7A 3O80A 4BRDA 4H5NA 4CZHA 2GWKA 1TYQB 4JHDA 4CZLA 4NO7A 4ISFA 3VETA 3IMXA 2FLOA 1S22A 4JNEA 3BF1A 3CJ7A 3IFRA 5F2RA 3WXLA 3QDKA 2BUPA 5ELZA 3VGLA 5ADXA 3MK6A 1R59O 3ZX2A 1J6ZA 4EAHD 4BRMA 2P9NB 1MWMA 3A0IX 4IO8A 2A41A 4B1XB 2CGKA 2E2QA 2A6AA 3D2FB 3FGUA 1NGIA 3KZBA 2I7NA 1NLVA 3VESA 1HPMA 2P9IB 5BN8A 4CJ7A 3O4WA 3FFKB 2FF3B 4FWMA 4CZEA 1X3NA 1IJJA 3CQXA 5I9EB 1NWKA 1D4XA 4PL7A 4BC3A 4H0TB 3H3NO 4FOIA 3WUHA 3KVGA 4BC4A 1G99A 3GL1A 1GLDG 1ATRA 2W41A 5AQHA 1MDUB 2NLXA 3P4IA 1BOTO 1HKGA 4BQZA 3QBXA 2QWPA 4F9OA 3SMSA 2YJEA 2VCPA 1ATSA 5AQUA 4B1UB 2DPNA 4B1YB 1GLCG 3SLCA 3WQUA 1TYQA 4BC2A 1NGJA 3IUCA 4MO5A 3CJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L3VA 4DFJA 3CD6N 5AQGA 2GUIA 1RBVA 4B1ZA 1S3XA 3KJVA 4FWSA 1NGCA 3NH2A 3KK1A 3LDOA 4B3RK 3U9DA 1JLFA 1NBWA 2IC3A 3DAWA 2ZJPL 3D2FA 3ENHA 1WSHA 4FK4A 3O4NA 1Q9XA 2P9IA 3AVJA 3VEOA 5GADP 2P5GA 3CXCM 2OTLN 3QFPA 1BI4A 3R3LA 3CM6A 2ASPA 3TSQA 5BRHA 5FROA 1ZYQA 4H5WA 4O0JA 3EO3A 3SQ2A 4JK8A 4X65K 3OYEA 2A3ZA 4LFCK 3CQYA 3FZFA 4H5VA 5FLXO 3U3GA 1JLBA 3NE6A 2UXCK 4H4MA 2OTJN 1RNHA 3K5OA 1LW0A 2VWJA 1NNEA 2OANA 1NJIO 3V9WA 4BRGA 1VHXA 3PIPL 2F9TA 3EZWA 2W00A 2EWSA 1ZBUA 5JMVA 4HVJA 1HX1A 2KFNA 4X62K 1E3MA 4WFBL 3NF6A 1E4GT 1T44A 4CFCA 4XH4A 4IEEA 4CBUA 3V9SA 4O4GA 1HNXK 4DQQA 5EX5A 3VEZA 4Z4GA 4Z94A 3LDSA 3RR7A 3ALYA 3F5TA 3HM8A 3WXIA 4CIGA 2ITGA 4M3RA 4RW6A 3UB5A 3NH1A 4QS8A 3SUPA 4DTRA 4IFVA 1RDDA 4HUEA 1J5OA 1VSMA 3WEEB 3HXMA 3T7ZA 4ZTJA 3TAMA 3C6HA 3F2KA 4B9UA 4WF9L 1HKBA 4ILJA 4DHYA 1UA1A 3DOKA 3LP1A 4CBWA 3GOIA 1JLCA 3QESA 1KRPA 5B8HA 1TKXA 2D5RA 5LY3A 4KBOA 1UAXA 4ISGA 2GX9A 1Q86O 5JVGL 1SQKA 3VF2A 4OJRA 4AH9A 3EEQA 1BQMA 1VQ9N 4DV1K 4CHPA 3HRGA 4J2AA 3NHGA 1U4BA 2Y1IA 3W0LA 5C2DA 3F9KA 3UKUB 5KTQA 3DLBA 3CCVN 1LWEA 2DTUA 3QICA 4LF4K 4QCLA 5HRRA 1X3MA 4V19S 1T8EA 4FWOA 5AQIA 5KRTA 4AF1A 3CF5L 4F2SA 4BR0A 1EETA 2B5JA 1TVRA 4CECA 3HL8A 2G8UA 1BDGA 3DRSA 1NGAA 3L3VA 3ZSRA 5AQFA 5TKWA 2PZSA 3WEEA 4CVNE 2P9PB 4DTNA 4BG8A 2R7YA 4M3UA 1TAUA 1RT6A 1ZXOA 4OLBA 3AVIA 2CH5A 4FJ7A 4LC9B 3HOTA 3KHYA 3DWLA 1YITN 1JLEA 4J2DA 1TKZA 1FW6A 1U2VB 1EX4A 4A61A 4CJSA 1RDAA 3SMPA 2EHGA 5HOOA 1V4TA 4FPBA 2HVHA 3T3FA 3VTHA 4ILHA 1RCHA 1ATNA 1C1BA 4DR4K 4H03B 1W9HA 5FPEA 4KFBA 4CF2A 4JI4K 3OBWA 3QNNA 3UKUA 1QHAA 4CIFA 3CFOA 5KPTA 1NU0A 2GEMA 2BGGA 2I5JA 3TWHA 1CXUA 4BRFA 3R9PA 1BA0A 3CJAA 3THWA 1EO1A 4CBXA 2KHOA 1VAZA 2F4VK 4N47A 1RTJA 4H4OA 3MEEA 5LMUK 5AQYA 3OYLA 4KH5A 1QTMA 2HMIA 3LL3A 2XY7A 3WT0A 4WCEL 2E8AA 2QTDA 1VSJA 2P9PA 1Q81O 5BRDA 1NOYA 4CF9A 3AA2A 1XC9A 4FJMA 1N32K 2B4JA 3VERA 4CK1A 1OH6A 1SL0A 4M3XA 5AZIB 1I3AA 3Q7CA 2XRIA 3S5TA 2HSTA 3KK7A 4CZJA 2E4LA 3AA3A 4HWIA 3BUZB 1VSFA 2V7ZA 1U2VA 2ZF5O 3AVAA 5BPMA 4DWIA 2ZWHA 3SBTA 3FE1A 4AHVA 2ZQBA 1RT5A 4X64K 1U6ZA 3MN5A 3H1QA 4NCGA 3SJHA 4PUOA 3OJSA 4CHQA 4YOYA 3K57A 2NRXA 3TAQA 3G0ZA 1KTQA 4FOEA 3J80O 3VQ4A 3QETA 4MDAA 3NVMA 3OYIA 5KQ8A 5C24A 3CG7A 1O13A 3TANA 3M3ZA 4DQ8A 4DSEA 1ZC6A 3TTDA 5AQTA 3LAKA 4RTFD 3EYZA 3A8YA 2OYQA 2YV0X 3JAMO 1HUXA 4JHDB 1BCMA 1XHXA 4HUGA 3ZCMA 5HRSA 4GKJK 4KO0A 1YXQA 1NGGA 5H1SQ 5AQLA 1KFDA 1Q7YO 3CCSN 4FM0A 4BE0A 1YJNN 1VQ4N 5M1KA 4IDKA 5DK5A 5AZIA 4CHNA 3FZKA 4BR5A 3TI0A 4O5FA 5JLHA 1DEJA 4E7KA 4DB3A 2A5XA 4OKEA 1Z25A 4OPKA 2FBXA 1RDCA 2PAVA 3OYMA 3M5RA 1XHZA 4ELVA 3CMAN 1VQ8N 2YHBA 3E01A 4M41A 4N5SA 1SKRA 2VQEK 4HTLA 3AAPA 4LSNA 3ATVA 1JCGA 4DR2K 4DV7K 2QWRA 4B3TK 1BHLA 3BF3A 1J5EK 3THXB 3PX0A 1M90O 4ID1A 3OS0A 5BREA 4FJHA 1VSEA 5AQRA 4N76A 1HKCA 4W5TA 4CEFA 4YDUA 2W6LA 4PY5A 4ZTFA 4CZHA 2GWKA 4JHDA 4CZLA 1UOCA 4LF6K 3VETA 4NYFA 3BF1A 5F2RA 4CF8A 1D8YA 1I39A 5KI6A 3K0SA 2HHIA 1EWRA 3OYCA 1VQLN 4DQPA 1MWMA 3A0IX 4R79A 4B1XB 3AV9A 3SUNA 2A1SA 4WFAL 1RBRA 5CR4A 5D3GA 1JL1A 4A57A 3DI6A 3BGRA 3L2VA 4NCBA 4RW9A 1BIZA 3O4WA 1IG9A 4FVUA 2FF3B 4LFBK 4CZEA 1IJJA 1C0UA 3CM5A 4B08A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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