1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
2YJEA 5FPNA 5JICA 5KQ8A 1D4XA 2YJFA 4I6MB 1RFQA 5F1XA 5AQTA 4ISGA 4BQLA 4CBXA 3LDOA 3IFRA 2HF4A 4PKIA 1G99A 4HTLA 2P9UB 3VERA 3AAQA 3ULEA 2QWMA 2J4RA 3WQUA 3MDQA 2Q31A 3G25A 4WQ5A 3FZHA 2YHWA 5AQOA 5BPLA 2UYTA 2Q2RA 3TPQA 4CZJA 1HUXA 5I9EB 4CBWA 2P9PB 1NM1A 3CQYA 3H1QA 4CJ7A 3ID8A 2QM1A 1J6ZA 4BRLA 2QWQA 4BRDA 3VOVA 3U9DA 3FFKB 1IG8A 2DPNA 2F9TA 2P9KB 1NBWA 3ZETA 3QFUA 3C7NB 1X9JA 4LC9B 3SLCA 1Y64A 4FWOA 2YI1A 4H5VA 5BRDA 1LOTB 1TYQA 1ESVA 2NLXA 2E8AA 5AQQA 3R8EA 4RTFD 5LY3A 5AQXA 4BR0A 2IIRA 2A40A 5AQZA 1ATRA 5BR9A 1BA0A 5JLHA 4PL8A 4A2BA 5ADXH 1HX1A 4BREA 5JMVA 4CZHA 3GE1A 1MDUB 3ATVA 2A6AA 2YHXA 4B1WB 5ELZA 5AQLA 2FF3B 4BC5A 4FOEA 4BR4A 3RSEA 4CD3A 4CZLA 4GY2B 3CJAA 4CZKA 2HF3A 3R6MA 5EVZA 2E88A 5AZIB 5AQVA 4BRGA 2E2OA 3CJ1A 3CETA 4IXCA 1NGJA 3S41A 1S22A 4FWPA 5EXWA 4BC2A 1JCGA 5AQIA 3VF6A 1Z6RA 3W0LA 2GTDA 2OANA 3EO3A 4CBUA 1RGIA 3EN9A 1QQOA 5AQSA 1IJJA 4H5RA 1NMDA 5AQKA 2E20A 3WUHA 2D0PA 3IDHA 2PBDA 1NGDA 4XH1A 2P9IB 3GOIA 5BN8A 4BG8A 3U4LA 3A5NC 3U8XA 3ZETB 4CZFA 1NLVA 2P9PA 1GLEG 1GLCG 1QQMA 2IVNA 4K43A 4BRAA 2P9NA 4QS7A 1ZBSA 2I7NA 3VESA 4BRFA 2F9WA 2IVPA 2ZWHA 1TYQB 1YUWA 1GLFO 2P9KA 1QHAA 3H45C 2E2NA 3C7NA 3JXUA 5BPNA 2FSKA 3ZEUB 4MLHA 1NGBA 4FOIA 3BUZB 2W41A 4EHTA 1HKCA 3CJCA 1NGGA 1DEJA 4IJNA 1NGHA 5ADXA 4GNIA 1GLAG 4WYBA 3D7EO 3FE1A 4BGAA 4BRNA 4FWSA 2CGJA 1T6DA 4E1JA 3L4IA 2ASMA 3L0QA 3UKRA 4H0TB 4B9QA 1BA1A 3MK6A 1WUAA 1BO5O 4QS8A 2EWSA 2BTFA 3HM8A 4BRCA 5FPDA 5KPRA 3TU5A 4H03B 1BUPA 5AQRA 2VCPA 4A61A 5E26A 5AZJA 2GUPA 1GLLO 3VF2A 2AP1A 1WOQA 1GLDG 5AZIA 3BF3A 4YDUC 1NGEA 2FLOA 3D2EB 5KPTA 3FLCO 3I8BA 3VETA 5JLFA 1NGIA 3A5MC 1GLJO 3WT0A 3WQTA 1OKJA 4PKGA 2E2QA 3ZX3A 1YVNA 1XQSC 1SAZA 2E1YA 5BRHA 2P9NB 3UKUB 1Q18A 3A0IX 4H0OA 4BRHA 3VEOA 2CH6A 3F9MA 2P9IA 4H5TA 5TKYA 2ZGYA 1ATNA 4IO8A 3WXLA 4AM6A 1BDGA 2Q36A 4FO0A 3WXJA 2GWKA 5LJVA 3FZMA 4BC4A 3HBTA 5AQYA 3LDPA 2E1ZA 4JHDB 4KBOA 2Q0RA 3FZFA 3VEXA 4EAHD 4O5FA 2GWJA 3W3DA 4Z94A 3ZEUA 5AQMA 1JCEA 3FR0A 4B1YB 2D1KA 3UB5A 4A62A 4BROA 5KPZA 2WUSA 3LL3A 1E4FT 3LDNA 1KAZA 2AA4A 3O5BA 3UKRB 2HMPA 2GELA 3HTVA 1YAGA 2FF6A 4QS9A 1JCFA 3HZ6A 3DXKB 3P4IA 4FL9A 4FPBA 3ZX2A 4MO5A 4CZGA 1HKGA 4ISFA 3UE5A 4H5WA 4DCHA 4PL7A 3CJBA 3H3OB 1X3MA 5AZJB 4ISEA 3CIPA 4BVOA 1TUUA 1BOTO 5EY4A 4FWRA 2A41A 4A2AA 3GBTA 4M63C 3MN7A 2PAVA 3O6WA 5BN9A 1BWFO 1ZC6A 2Q97A 1Z05A 3AY9A 1TUYA 3VGMA 3H3NO 3IUCA 3SJHA 3VGLA 5BREA 1BG3A 4B1VA 3D2EA 4FPAA 4XH4A 2KHOA 2V52B 3SMPA 3KHYA 2FXUA 3EKUA 4HWIA 1BU6O 3BEXA 4JNEA 2CGLA 4JD2A 4CZMA 4WQ4C 1SQKA 1MWMA 3VEYA 3R9PA 1T6CA 3UKUA 4H5NA 3VEZA 4BRIA 1NWKA 5AFUH 4H0VB 4PKHA 3CI5A 1HJOA 1SZ2A 3AAPA 2ASPA 1KAXA 2GEMA 4JHDA 4Y0WA 5F0XA 2QWOA 1KAYA 4K41A 2ZGZA 3O1BA 3WXKA 4BRKA 3I33A 3VEWA 2ZF5O 1MWKA 4JN4A 2A3ZA 3M1FA 4DB3A 3O08A 3JS6A 3ZX0A 3VENA 4FWQA 4WQ5C 4BQZA 2YHYA 3AARA 1HLUA 4B1UB 1LCUA 1NGFA 3DXKA 3VPZA 1U2VB 5AR0A 4FSVA 2V51B 5AQPA 3C0BA 3LM9A 1QQNA 4M7XA 2P9SB 3DXMA 4FWMA 4EHUA 2BUPA 3MCPA 4F9OA 3WEEA 3L6QA 4CZIA 4MLEA 5EX5A 1P8ZA 3HI0A 1C0GA 3FGUA 2P9LB 1EQYA 4IWVA 4EFHA 3ENHA 3J8AA 1H1VA 4JD2B 1NGCA 4J8FA 2QWPA 4BG9A 1U6ZA 4FWLA 4JAXA 2W40A 4IZ9A 3KVGA 3VGKA 3M6GA 3O4WA 1K8KA 4EIAA 1XUPO 5AQFA 3QBXA 5AFUA 4H0YB 3SMSA 3VEVA 1XC3A 3A5LC 3GL1A 3A8YA 4CI6A 2D4WA 4BVPA 3O8MA 1HKBA 2QWNA 1E4GT 3IMXA 4YDUA 4H0XB 2NZTA 4BR2A 4FWNA 3CERA 3CJ7A 3ENOA 3DAWA 3CHWA 4BRQA 3EZWA 3B8AX 3SK3A 3BF1A 1YXQA 5FPMA 4NB4A 1QZ5A 3DXMB 1V4SA 3A5OC 3D2FB 3WEEB 3KZBA 3DJCA 1ATSA 4O8KA 3H46O 1U2VA 4L3QA 2QW9A 4BRMA 2P9SA 5AQNA 4IJAA 1R59O 4B1XB 1ZXOA 2QWLA 1T44A 5LJWA 2HOEA 4MO4A 5B8HA 3WXIA 5F2RA 4M7YA 3MMVA 3CJ9A 4XEIA 1HPMA 3O80A 3CQXA 3QDKA 3MN9A 2ASOA 4CZEA 2P9LA 2Q0UA 5AQUA 3ULEB 4I6MA 1K8KB 5E84A 4BR9A 3VF4A 1DGKN 3ATUA 2IVOA 2CH5A 3EL2A 3MN5A 3QBWA 4BR5A 1RDWX 3GDQA 2Q1NA 4NO7A 4H0PA 1GLBG 2P9UA 4BR7A 1NGAA 2FSJA 1CZAN 3QB0A 1QZ6A 1DKGD 2I7PA 2FSNA 3H6EA 4K25A 3QICA 5AQHA 3H1VX 3QFPA 4RCHA 5KQDA 2V7YA 3GG4A 5CE3A 1X3NA 3LDQA 1V4TA 2H3GX 2NRHA 4BGBA 3DWLA 3QMLA 4CD1A 3O1WA 5AQGA 2D0OA 4XH5A 3EKSA 4DHYA 4B1ZA 1S3XA 2E2PA 4BRPA 4K42A 3BP8A 3OHRA 2QWRA 2CGKA 3FZKA 3FZLA 3HSCA 3U9ZA 5FPEA 4C23A 3MN6A 4BC3A 5AQWA 4FWKA 2A5XA 4RWTA 2A42A 5BRFA 1C0FA 1MA9B 3LDLA 3M3ZA 4WQ4A 2V7ZA 5AQJA 2VYPA 3D2FA 4DQ8A 3LM2A 2YCHA 5EOYA 5BPMA 1KXPA 3RSEB 4AM7A 2VWBA 2ITMA 2QXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YJEA 4OKJA 3ID6A 3CCVN 2QEXN 3VQQA 4B9MA 4I6MB 4IDHA 5AQTA 1VK0A 3TTFA 4HVJA 1TKXA 4JS5A 3LDOA 2HF4A 4PKIA 3OYIA 3VERA 4DWIA 3OYFA 3LALA 5AQOA 2HHWA 3KKRA 2D0BA 1VQ8N 2G8KA 1N32K 3NGYA 2P9PB 4CEAA 3H1QA 3RR8A 2QM1A 3OYEA 2QWQA 3FFKB 4CJWA 2DPNA 2HVIA 5C24A 3QFUA 1X9JA 1EETA 4M3ZA 3U3GA 1N6QA 3SCXA 3PSIA 4BE0A 1TYQA 1WB9A 3KLIA 3L2RA 2QK9A 5AQZA 5BR9A 4CHNA 1K73O 4PL8A 4A2BA 5M1PA 3TAMA 2YHXA 5ELZA 2FF3B 3T3FA 1JLEA 4BR4A 1REVA 4LFCK 1JXBA 1KRPA 4FLYA 1N5YA 5M1QA 4DR1K 3R6MA 5SZTA 5EVZA 3K0SA 2E88A 4FJGA 2E2OA 3WXMB 3CETA 4X62K 1RBVA 4BEBA 2GTDA 1NJYA 5FRNA 2WC9A 2UUCK 5AQSA 3AA4A 3JAMO 3VQDA 3KD5E 2KFZA 1RBTA 4IOXA 4GW6A 3IDHA 2BE2A 4DV3K 1NOZA 4WFAL 5FDLA 4BG8A 3U8XA 4CEOA 2P9PA 5GAGP 2P9NA 1ZBSA 2ZWHA 3NFAA 1GLFO 1QHAA 3H45C 3SPZA 1IKWA 4PA1A 2GBZA 2YNGA 1HQEA 3AO3A 4HTUA 4IJNA 3NHGA 1WLJA 3TSQA 3QLHA 4GNIA 1GLAG 1O1WA 4OLBA 2PYLA 3VTHA 3D7EO 3FE1A 3OBYA 3L4IA 3L0QA 3ASMA 3B6PA 3TABA 1NK7A 5HOOA 1VHXA 1BA1A 2WONA 2NNWA 2YX6A 2IOCA 3HM8A 5KPRA 3V1RA 1BUPA 4RW9A 4DR3K 5C10A 5GIPA 2F8TA 2GUPA 4Y1DA 4C8NA 3VF2A 3HL8A 3BF3A 4YDUC 4C1NK 2FLOA 1T8EA 3O4NA 2LSNA 3K9KA 4O4GA 4NCBA 2O8FB 1HYVA 3VN5A 1NGIA 5JENA 3AVFA 1VSIA 1TAQA 1WNSA 3WQTA 2E2QA 1IV0A 3DLEA 1U4BA 1S1XA 1YVNA 1KFSA 2HMIA 3OYJA 3A0IX 5M1FA 4DTJA 4KHUA 2QI2A 4CIFA 4O0IA 2GWKA 3T1HK 4CIEA 4KBOA 2Q0RA 2C1IA 4DG1A 5DMRA 3AVLA 4Z94A 2D1KA 3UB5A 3CCUN 4BROA 5IWAK 1W2BM 3LDNA 4BDPA 3G10A 2AA4A 1MU2A 3O5BA 4IEIA 3UKRB 3SUNA 1L3SA 4Z4EA 2GELA 1Q8IA 3LP1A 1YAGA 2FF6A 4HCCA 1JCFA 1WSIA 3HZ6A 5CY4A 1L3VA 4FPBA 3PO5A 1S6QA 2W00A 4FJXA 1SV5A 4DTPA 4MO5A 4CZGA 4DSKA 4CVNE 4PL7A 3H3OB 3O9SA 3OS2A 1O13A 3B6OA 5EY4A 1ASUA 3SQ0A 4NYNA 2VGNA 1ZC6A 2Q97A 1Z05A 1TK8A 2GUIA 1NJZA 4CFAA 1BG3A 4B1VA 4JI2K 2KTQA 3LWLA 4LF5K 1FKOA 1S9EA 3NF6A 3L2WA 4FM0A 3ENBA 4FJNA 4YOWA 5M1NA 4YOTA 3THYB 2Y1JA 4FZXC 2P5GA 3ISNC 4DFJA 1YJWN 2OZSA 4V19S 4F4KA 1NWKA 5AFUH 4H0VB 1QVFM 4PKHA 4R5PA 3AAPA 1KAXA 4QCLA 3KLGA 4ID1A 3P39A 2PYJA 1N36K 3DLBA 3SV3A 1N33K 4JN4A 3M1FA 4AH9A 4KTQA 4AQYK 4CJRA 4FWQA 4BQZA 2YHYA 3J80O 1HLUA 5CHIA 4B1UB 3MXMA 4CJ4A 3ALYA 1U2VB 2WBNA 4FSVA 1CLQA 4OO1J 4JKCA 3AO2A 4E7KA 1QQNA 4M7XA 4B3OA 3HT3A 4HHTA 4RW6A 3SQ4A 3OS1A 2YNHA 1T3VA 1X9WA 5DM6L 4CK1A 2NRVA 4F3TA 3HI0A 1EQYA 4IWVA 3THXB 3NGIA 3CXCM 2QWPA 2OTLN 3I8DA 1U6ZA 3TAQA 4IZ9A 3C6TA 1IBKK 4N76A 3ZSYA 1U47A 1QHTA 2FBYA 2O8CB 1K8KA 4Y1CA 3CCEN 2ZD1A 3KK7A 1HPZA 2BGGA 3GL1A 3CC4N 5HRRA 4C8OA 2ZM6K 1XNQK 3SUOA 2D4WA 2QWNA 1XMOK 2XY5A 2G8IA 3IMXA 4YDUA 1HYSA 1HMVA 1BIZA 3CCQN 5J2MA 3B8AX 4KHNA 2O4IA 3J7ZO 3PIOL 4YOVA 2W6LA 1YXQA 5FPMA 4DF4A 4NB4A 3DXMB 2RHKA 2HBJA 5HBMA 3WEEB 2ZJPL 3DJCA 1U2VA 4L3QA 4B9NA 1F21A 4CJKA 1TKZA 4BRMA 1IBMK 1LWEA 1QVGM 4IJAA 1LWCA 4B1XB 3ZT3A 1ZXOA 1T44A 4KPYA 4JI5K 3WXIA 4XEIA 1TL3A 4E3SA 5M1OA 5HRPA 2F96A 4M3UA 2Q0UA 4CEBA 1BHLA 3THXA 3BZCA 4BR9A 1IKVA 4DTUA 3LP3A 3AVHA 1DGKN 3ATUA 2OPSA 1NNEA 1TK0A 1RDWX 3AA3A 2Q1NA 2P9UA 5A2QO 2BDPA 2OA8A 2FSJA 1CZAN 4XJXA 2O8CA 1QZ6A 1DKGD 1XHZA 2FSNA 4WFNL 1Q7YO 3QFPA 1NMNA 2XY8A 2HSTA 4I2PA 5CE3A 3LDQA 3ZSRA 3VTIA 2H3GX 3PX4A 1VRUA 3T19A 2D0OA 5AQGA 3L8BA 4JI3K 1XWLA 3MX2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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