1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
b'EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
5E84A 4IJAA 3U9DA 1GLAG 4CD3A 2A5XA 1IJJA 1YVNA 5FPNA 1Z6RA 4CZMA 5AZIB 4BC4A 1X9JA 3SLCA 4BR9A 1DKGD 4CJ7A 4BR4A 4H0PA 3VGKA 1RDWX 3H6EA 4FWRA 5EX5A 3CI5A 3AAPA 4K43A 4QS9A 2VYPA 2ITMA 5BN9A 1YAGA 3VEWA 2GELA 3DJCA 2YHYA 1NGDA 3CHWA 4H5VA 1KAZA 1Y64A 3SK3A 3QBWA 5F2RA 3VGMA 1HKBA 2CH6A 3ENOA 1SZ2A 3L0QA 3WXJA 4MO4A 3CJAA 3BUZB 1NGJA 1ZXOA 4CZHA 3DXKA 5BPMA 5CE3A 1TYQB 3CETA 3D2EA 2E1ZA 3CJ9A 5AQTA 3UKRB 1HKCA 5AQIA 3HM8A 3RSEB 4H5WA 4JAXA 4BVPA 3LDPA 2IVPA 2P9IA 3L6QA 2Q36A 1GLEG 4KBOA 3UB5A 5JLHA 4XH1A 1GLFO 3DXMA 2I7PA 3LDOA 4H5RA 3W0LA 4CD1A 5LJVA 3ZETB 3MCPA 1QQMA 4BROA 4JN4A 3CJ7A 2P9PB 4BRGA 3A5LC 4BRAA 4DCHA 1JCEA 1WOQA 4CZJA 2BUPA 1ATNA 2P9KB 4BR2A 2YJFA 4CBUA 3VETA 4MLHA 2QWPA 1RFQA 3CQXA 2QWOA 2P9UB 5BPNA 2FSJA 3ZEUB 4JNEA 3G25A 4BGAA 4CZLA 2AP1A 2QXLA 3D7EO 4H0XB 4B1UB 4BC3A 4DQ8A 2GEMA 1HX1A 1KXPA 3DWLA 3QBXA 1TUUA 4XEIA 5F1XA 3BF1A 1V4TA 3WEEA 2UYTA 2QW9A 3AARA 3DXMB 2QWRA 1WUAA 1XQSC 3HI0A 4Y0WA 5F0XA 4EHUA 4BRPA 4RCHA 1LCUA 3IDHA 2E2PA 3CQYA 4FWQA 3I33A 3A5NC 5AQKA 2YCHA 2I7NA 2P9SB 5KPZA 3ULEB 3WQUA 2E8AA 2BTFA 3R6MA 2IVNA 2IIRA 3IFRA 2VWBA 2ASMA 2Q31A 3ATUA 2PBDA 4FL9A 3ZEUA 1RGIA 2QM1A 2DPNA 4IJNA 3QDKA 3LDLA 1Q18A 4H5TA 3EKSA 4MO5A 2Q0RA 4FOIA 3VESA 3O80A 4FWLA 4BRDA 2FF3B 5AZIA 1NGHA 3RSEA 2E2NA 3J8AA 1HUXA 3TPQA 1U6ZA 4QS8A 4H0TB 4XH5A 3HTVA 2HOEA 3EKUA 4EFHA 5AFUA 4BRKA 4A62A 5AZJB 3FZKA 3GG4A 3FZHA 4FWPA 3A5MC 4IO8A 3GDQA 4BC5A 4BRMA 4CBXA 4BQLA 3LM9A 2F9TA 3KVGA 4JHDB 4CZFA 4PKHA 2E1YA 4H0VB 2ASOA 4B1WB 4BR0A 4RWTA 3ID8A 2P9NB 5AQVA 1S22A 2VCPA 3JS6A 2F9WA 3C7NB 4CZGA 4I6MB 4WYBA 1C0GA 3WXLA 1K8KA 4FPAA 2QWNA 4B9QA 1R59O 4ISFA 4A2AA 4FPBA 1GLDG 4FWMA 4FOEA 5TKYA 1YUWA 1IG8A 5AQHA 3UE5A 2YI1A 3KZBA 1P8ZA 2P9LB 5AR0A 2A6AA 2GTDA 1HJOA 1ATSA 1OKJA 3R9PA 5BR9A 3U4LA 2ZWHA 4BRNA 3AAQA 1XC3A 4BRHA 3O6WA 3FE1A 4A2BA 3SMPA 2NZTA 5E26A 3F9MA 3D2FA 3LL3A 2W40A 4HTLA 1NGBA 4BRFA 5B8HA 4WQ5A 2FXUA 3M1FA 5EVZA 3MN7A 1BG3A 1BUPA 2V52B 5BRHA 1HLUA 2CGKA 2WUSA 3BP8A 2QWQA 1BU6O 3GBTA 4MLEA 5AQOA 4Z94A 4B1YB 5LY3A 3WUHA 3VEZA 3VERA 3HBTA 3MN5A 5JICA 1T6CA 3VPZA 2P9SA 4EAHD 2V7YA 3QB0A 4M63C 2ASPA 2GWJA 3C0BA 3KHYA 4GY2B 4AM6A 5ADXH 3DXKB 1ESVA 3H46O 4WQ4A 4C23A 4B1XB 3CJCA 3HSCA 3IMXA 3ZX0A 1NGAA 3CIPA 4JD2A 4J8FA 2V7ZA 5FPEA 3ATVA 4BGBA 3VEOA 3D2FB 2Q1NA 3QFPA 5AQLA 5AQPA 1D4XA 2QWMA 4DB3A 1NGEA 2YHWA 4IWVA 2Q97A 1T6DA 1S3XA 4O5FA 4BRCA 5AZJA 2E2QA 3ZX2A 1V4SA 1KAYA 2OANA 4BR5A 2H3GX 1LOTB 4FO0A 3WXKA 4HWIA 2A42A 3H1VX 3MMVA 3CJBA 3O08A 2D0OA 3AY9A 2V51B 5ADXA 3WXIA 4FWOA 3C7NA 3S41A 1JCFA 3VEYA 3H45C 4ISGA 4B1VA 2A3ZA 4JD2B 3VENA 1SQKA 3W3DA 1BWFO 1GLLO 3A5OC 3EL2A 4H5NA 4L3QA 2P9LA 5FPMA 1YXQA 4B1ZA 5JMVA 1MWKA 3FZFA 4F9OA 1Z05A 4YDUC 3VEVA 3A0IX 3OHRA 1NWKA 3P4IA 4H0YB 2Q2RA 3LM2A 3ZX3A 3H3OB 2A41A 3FLCO 1EQYA 4BQZA 4RTFD 2PAVA 5EOYA 1QQOA 2FSNA 1NGGA 4I6MA 4NO7A 5AQXA 1KAXA 3QICA 4BRIA 4AM7A 4FWNA 2NLXA 3ULEA 4EHTA 3FGUA 5AQNA 3FZMA 4LC9B 2ZF5O 3M6GA 5JLFA 2QWLA 2NRHA 3CJ1A 4H0OA 1U2VB 5KQ8A 1NMDA 3VF2A 5AQQA 3VGLA 2ZGYA 3LDQA 2P9IB 2KHOA 1J6ZA 2GUPA 2HF3A 4O8KA 3WQTA 5BRFA 3EZWA 4XH4A 2YJEA 3A8YA 3HZ6A 4WQ5C 3R8EA 4CI6A 1GLCG 3O1WA 2FLOA 3FFKB 4IXCA 1G99A 3WT0A 5BREA 4E1JA 2E2OA 2P9PA 1E4GT 2HF4A 3BF3A 1BA1A 3JXUA 5ELZA 5AQMA 2ZGZA 4PL8A 5AQFA 4M7YA 4BRLA 2EWSA 3FR0A 4CZEA 5KQDA 1X3MA 4EIAA 4JHDA 2FF6A 4K41A 1CZAN 1QQNA 2CGJA 3O8MA 4WQ4C 4BRQA 3B8AX 1HPMA 2AA4A 3O5BA 1NBWA 3MK6A 3U9ZA 1HKGA 3MDQA 3QFUA 3QMLA 3VEXA 5BN8A 3H3NO 4IZ9A 3VF4A 1X3NA 1QHAA 3UKRA 3BEXA 4PL7A 4K25A 3L4IA 2E20A 4PKGA 2W41A 1NGIA 1ZBSA 3ENHA 5EXWA 2J4RA 1BDGA 1E4FT 5AQZA 5AQWA 2D4WA 1NM1A 2HMPA 3I8BA 4ISEA 5FPDA 3TU5A 3ZETA 2GWKA 4PKIA 1BO5O 3CERA 1GLJO 1BA0A 3VF6A 4BVOA 2FSKA 5BPLA 5AFUH 3U8XA 1TYQA 5AQUA 1BOTO 1ZC6A 4QS7A 1MA9B 2P9KA 4FSVA 1TUYA 1GLBG 1ATRA 5AQSA 3SJHA 4DHYA 1MWMA 1DEJA 2CGLA 2P9UA 2YHXA 4YDUA 2IVOA 3EN9A 1U2VA 4NB4A 1QZ6A 4BG8A 5KPRA 3UKUB 3O1BA 4H03B 1SAZA 4M7XA 3FZLA 1H1VA 3WEEB 1NLVA 2CH5A 3GOIA 4BR7A 1QZ5A 5AQGA 5BRDA 4A61A 3LDNA 3VOVA 1DGKN 4BG9A 1C0FA 3H1QA 2P9NA 1JCGA 4CBWA 3GE1A 1T44A 4CZKA 2Q0UA 2A40A 4GNIA 3MN9A 1XUPO 1K8KB 5EY4A 2E88A 4K42A 5LJWA 5AQYA 3EO3A 3M3ZA 3DAWA 5AQRA 4BREA 1NGCA 4FWSA 5AQJA 1NGFA 2D0PA 3O4WA 1MDUB 3D2EB 3GL1A 5KPTA 2D1KA 3SMSA 3UKUA 4CZIA 4BC2A 4FWKA 3IUCA 3MN6A 5I9EB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S3NA 3U9DA 4DR3K 3VQBA 3V4IA 4O0JA 5FPNA 1C0UA 4BC4A 4NXNK 4JI8K 4FJMA 5KGWA 2DTUA 2DFEA 2ITGA 4BR4A 4FWRA 5EX5A 4QS9A 3SJJA 1SV5A 2VYPA 1YAGA 1J5OA 2NRWA 1Z25A 3KLGA 2GELA 4H4MA 4DU4A 1NNEA 3CMEN 3DJCA 4W5TA 3CHWA 4NCAA 4H5VA 2XRIA 4IG0A 2YNIA 5IT9O 1RBTA 3L3VA 3L0QA 2FBTA 4MO4A 1SKSA 4CIGA 5H1SQ 1RT4A 3HP9A 1ZXOA 4CZHA 4F3OA 4DR2K 2E1ZA 1YITN 1RT3A 3WNEA 3RSEB 3QESA 4JAXA 1Q9XA 1S1TA 1VQON 2P9IA 3L6QA 5JLHA 4CEDA 4ICLA 1GLFO 2GX9A 3ZT2A 3SYZA 2I7PA 3LDOA 4H5RA 4CD1A 5TKWA 4CJRA 3ZETB 2G8VA 5HRSA 3V9ZA 3SV3A 4AHVA 4B9SA 1O13A 1QQMA 4JN4A 4CEOA 1S9GA 1VHXA 3K58A 3CJ7A 4DR1K 2P9PB 3QLHA 2P5GA 4BRAA 4DCHA 4YNQA 4DR7K 3KLEA 4BE1A 1KVCA 1S1UA 1RT1A 1W9HA 4JKAA 1RTJA 4FJHA 2BUPA 3G10A 1ATNA 4BR2A 3O3FA 1NMNA 4C8MA 3C94A 2YJFA 4RW7A 1ZBHA 3AVKA 4FVUA 3RWUA 2QWOA 3TTFA 1NJWA 3AA3A 1CZBA 3VTIA 1VQ5N 3E9PA 3P1GA 4FJJA 3D7EO 4B1UB 3ZSYA 3TI0A 1KXPA 1HRHA 3TAPA 3QBXA 3K0SA 4H4OA 3BF1A 3WEEA 2VGNA 1WUAA 2UUAK 4EHUA 3RMBA 4AHUA 2WOMA 1XC9A 3IDHA 1NOYA 2QEXN 4YOWA 3A5NC 3L4QA 3SBGA 4KHUA 3M8QA 4Z4CA 1JLAA 5JS2A 3VA0A 3T3FA 3PX0A 5KPZA 3ULEB 2E8AA 2BTFA 2JGUA 2IIRA 3LDSA 4DS4A 3IFRA 4JKFA 2ASMA 2Q31A 2O8FB 1ASUA 2UXDK 3MXIA 2QM1A 4Z4FA 2R7YA 1FK9A 2XO7A 2YV0X 3VN5A 4CJTA 3NH2A 5HROA 3NH0A 1VSEA 4CIEA 1M1KO 3RSEA 3QIOA 4FJKA 4JKEA 1HUXA 2Y1JA 3EKUA 3CQ8A 4U67L 5J2MA 1W7AA 4CJPA 1JXBA 1RDBA 4CBXA 3MXJA 4CEEA 4JHDB 4JI1K 2G8UA 2E1YA 4BR0A 4HVJA 4OJRA 3ID8A 4KRFA 1N6QA 4CEQA 3ZSWA 1CXQA 5FROA 4O4GA 4CZGA 1JLFA 4I6MB 4WYBA 4CCHA 1IBKK 4DQPA 4ELUA 4LH5A 4AHCA 4FPBA 1XHZA 3CFPA 4DUZK 5TKYA 2F8SA 2KZZA 1YUWA 3UE5A 4DR6K 3L3UA 3KZBA 2P9LB 1B9DA 5AR0A 2A6AA 1HJOA 1ATSA 2YNHA 4BE0A 2BDPA 5BR9A 3U4LA 3U3YA 3NVKA 3AAQA 3HRGA 1XC3A 4GVEA 3SV4A 5HRPA 4IKFA 3O6WA 1BCOA 4E19A 3T1HK 1VSMA 2O8BA 3WNGA 1C1AA 3SMPA 2JWLA 4JKCA 4C1NI 5C0YA 4A5AA 2FXUA 3LAKA 4ELVA 1RDCA 3V1OA 2V52B 4MLEA 3BP8A 2QWQA 3GBTA 4Z94A 3WUHA 3HBTA 3I8DA 3O9UA 1T6CA 1DTTA 3CC2N 1NK9A 1BISA 2HNZA 2ASPA 1U47A 4B9VA 2NRVA 1OVQA 1VRUA 5MLCQ 1IKWA 3LZJA 3PIPL 4B1XB 3NF8A 3CIPA 2RE2A 2V7ZA 4E3SA 4B9NA 3ATVA 3IAYA 3G4SN 3CYGA 3S5TA 3VEOA 3OTOK 5KTQA 5AQLA 5AQPA 5C2DA 3TWHA 1HJRA 4AQYK 2O8DB 4DB3A 1J53A 4CGIA 4JKHA 1VSIA 1HQEA 2F8TA 4DLGA 2E2QA 4CK1A 2OANA 3QEIA 3OYKA 4M41A 3UIQA 3NBPA 3D45A 3O9TA 3EY1A 3SUNA 3PY8A 2A42A 4FWOA 3CCVN 5LMNK 4JS5A 5KRTA 4CJWA 2A3ZA 2PYJA 1GLLO 3EL2A 3M8SA 2RPIA 3ALYA 1BI4A 2OTLN 4GW6A 4JV5K 2GV9A 4ID5A 3H3OB 3FLCO 1WSFA 4BQZA 4RTFD 2FSNA 5KGXA 1LWEA 2Q3SA 2B5JA 5AQXA 3E1YA 1QHTA 1C6VA 1K9MO 1EXQA 3DLLL 4CEBA 3KK7A 3N4PA 4FWNA 3HXMA 1QSYA 4IOAL 4DTRA 5AQNA 4N76A 3M6GA 5JLFA 5HRNA 2QWLA 2OA8A 5M1PA 5FLXO 3CJ1A 4H0OA 3K5NA 4M45A 5AQQA 1J6ZA 2GUPA 1J9AA 3L2VA 1QVFM 3EZWA 4YOTA 4KHNA 2PYLA 3HZ6A 1C1BA 3O1WA 5LMUK 3AVCA 4R79A 4FJXA 3CM6A 4E1JA 4DFKA 2P9PA 3JXUA 3JSMA 4BRLA 5AQFA 4M7YA 4CGJA 3NVMA 3NF9A 4CHPA 3L2RA 2YKNA 3FR0A 1YJWN 4CZEA 4JI5K 3OYDA 1X3MA 4DTJA 4YOVA 4JHDA 1S6QA 3KLFA 3L8BA 2F96A 5KI6A 3OYLA 5AJ3K 1RTIA 3LP0A 3O5BA 1NBWA 1SKWA 1Y97A 4HHTA 3D6RA 4IEIA 4CESA 5BN8A 3V1QA 3OYNA 2X6SA 1YJ9N 4BY9C 4K25A 4J2BA 4CJEA 1EETA 1NGIA 1ZBSA 3ENHA 4CJUA 4PHTX 2J4RA 4QAGA 4JRQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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