1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
2ASPA 3AAQA 5AQUA 5B8HA 3EZWA 4EHTA 3L0QA 2E2OA 3IUCA 4EIAA 3UKUA 4CZHA 4H0OA 3A5OC 3GG4A 4C23A 3QICA 4CZFA 3CERA 3CJCA 3D2EA 2GEMA 4EAHD 2V51B 1XUPO 4BRLA 3VEYA 4AM7A 2YHYA 4K43A 2HF3A 1JCFA 4PL8A 4BC4A 3EL2A 4FWSA 5ELZA 4BRFA 3CIPA 1NGGA 2P9IB 4MO4A 3S41A 5LJWA 4BRNA 2ASMA 4B1VA 4H0TB 2FSNA 1IG8A 3BF1A 3SJHA 2D0PA 1YXQA 1JCGA 3SK3A 3VOVA 2CGKA 2E8AA 3WUHA 5KPTA 2E1ZA 3KZBA 3LM2A 4O8KA 4BREA 3FZLA 3G25A 2P9IA 3H46O 3D7EO 4K42A 5AQNA 3H45C 5BRDA 2P9UB 4XEIA 4F9OA 2Q31A 2QWOA 2W41A 4BR0A 2NLXA 3WQTA 4CI6A 5KQ8A 3VGMA 3SMSA 2A41A 2CH5A 5LY3A 4BR4A 5BPLA 3LL3A 1SAZA 3EKUA 3DAWA 4PKHA 5BRFA 3CQXA 2P9UA 2E1YA 5F1XA 2BUPA 3D2FB 2QM1A 1NM1A 2FF3B 2Q2RA 3VEOA 4FWPA 5AQKA 3M6GA 3VEVA 2P9SB 4LC9B 4CZJA 4FL9A 3MN6A 1V4TA 4M7YA 4Z94A 1WOQA 1ZXOA 2YJEA 3FGUA 5ADXA 1ATSA 3B8AX 1QZ5A 1NGFA 5FPNA 5JMVA 5LJVA 3UKRB 1MDUB 3D2FA 1C0GA 1U6ZA 4GNIA 2P9SA 2AA4A 1HPMA 1HX1A 3HZ6A 4HWIA 4L3QA 3KHYA 2YHWA 2D0OA 1CZAN 3BEXA 3VESA 2QWRA 3GOIA 3ATVA 1BDGA 3UKRA 1GLBG 3MMVA 5BPNA 4FO0A 4A62A 3WEEB 4BRQA 4BRPA 1Z6RA 1GLAG 5AQPA 4JHDB 2WUSA 3VGLA 1H1VA 3MCPA 1GLFO 4I6MB 3L6QA 2E2PA 3ZX2A 5BN8A 4H5VA 3EO3A 2Q36A 2FLOA 3FR0A 4BRIA 3CQYA 3BF3A 1Q18A 2HF4A 3DWLA 1QQNA 5F2RA 2VWBA 3CJAA 2P9NB 2CH6A 3WEEA 4EFHA 2E2QA 4IO8A 2QWMA 4JHDA 2D1KA 5KPZA 1BO5O 3U9DA 3H3OB 3O6WA 1DGKN 4I6MA 5EVZA 4B1YB 4JAXA 4M7XA 1GLCG 1T6CA 3LDPA 2KHOA 4FWKA 4K25A 3WT0A 3BP8A 1E4FT 4CBWA 5CE3A 2VYPA 4FWNA 1KXPA 4YDUA 3FZHA 2YI1A 2P9NA 1KAXA 4FWMA 4BC3A 3I33A 1GLLO 3JS6A 4H5RA 3VF4A 3ENHA 4BG8A 4BR2A 4BQZA 1NWKA 3QMLA 2V52B 2IVPA 4XH1A 2A5XA 2QWPA 1MA9B 3VERA 2J4RA 2GWJA 4H0PA 1X3MA 3O08A 1YVNA 2A42A 4IXCA 3FZFA 3HTVA 3R6MA 4WQ5A 3VF2A 5AQWA 2V7ZA 3EN9A 4NB4A 3W3DA 1HUXA 2ZWHA 1Z05A 1ATNA 4RWTA 3H6EA 1GLDG 1YUWA 4B1XB 3MN5A 3GBTA 3U4LA 4CD1A 4IWVA 4E1JA 1KAYA 5AR0A 4WQ4C 3FLCO 3UE5A 1LOTB 3QBXA 2FSKA 5AZJB 1TUYA 3WXJA 5BR9A 5EOYA 4BVPA 4FOEA 2Q1NA 4H5TA 3VENA 4FPAA 5AQZA 1DEJA 3BUZB 2Q97A 3ATUA 2ASOA 3LDOA 5AQQA 3CJBA 4BR9A 5F0XA 5AZJA 1RDWX 1NMDA 3CHWA 5AFUA 4DQ8A 4BRKA 4J8FA 1K8KB 4FPBA 4FWOA 5AQLA 2IIRA 4K41A 3ENOA 1X3NA 4BVOA 1V4SA 5AQJA 2H3GX 1Y64A 4Y0WA 3M3ZA 1K8KA 5AQIA 5I9EB 1G99A 3HM8A 1TYQB 3SLCA 3LDQA 3OHRA 3QFUA 2V7YA 3LDNA 1GLJO 4FOIA 3JXUA 1J6ZA 2FF6A 2VCPA 2HMPA 5AQVA 4BQLA 3A5NC 4BRHA 3ZX3A 3IFRA 1LCUA 1NGIA 1HKCA 4JNEA 5EXWA 1NGJA 1R59O 1TUUA 2QWNA 2Q0UA 3FZKA 2FXUA 2F9WA 3FE1A 1TYQA 2D4WA 1ATRA 3FFKB 4MO5A 2W40A 2PAVA 2QXLA 3WXIA 4QS9A 2GELA 3QBWA 3O4WA 3EKSA 3UB5A 5AQRA 1IJJA 5AZIA 3W0LA 3TPQA 4BRAA 1QQMA 2AP1A 4PKGA 4XH5A 4B1WB 5BN9A 3AAPA 1C0FA 2ZGYA 3CI5A 1T44A 3TU5A 3CJ9A 3DXKB 4QS8A 3U8XA 1YAGA 1OKJA 2F9TA 5AQYA 4A2AA 2P9PA 2ZGZA 1ESVA 1RFQA 2E2NA 2P9KA 5JICA 5EY4A 3LM9A 4ISGA 3U9ZA 3DXKA 1NGDA 5AQFA 3R9PA 1MWMA 4RTFD 2DPNA 2YCHA 3MN9A 4IJNA 5E84A 2YHXA 4GY2B 2E88A 1QZ6A 4BRDA 2FSJA 3MN7A 4CZEA 3IMXA 4A2BA 2I7NA 4FWQA 2A40A 4B1UB 2P9LB 3C7NB 5EX5A 3WXLA 3ZEUB 1BU6O 1MWKA 1X9JA 4ISEA 4BR5A 1XQSC 4FSVA 5JLHA 1RGIA 3WXKA 5AQSA 3RSEB 1XC3A 3LDLA 3CJ7A 3O1BA 3DJCA 4FWLA 3GE1A 1NGCA 3SMPA 1HKBA 2P9LA 3H1VX 1NBWA 4YDUC 5AFUH 4BRCA 3C7NA 4CZIA 3MDQA 3ZEUA 4XH4A 4CJ7A 3AY9A 2E20A 1HKGA 4HTLA 3O5BA 4PKIA 4H0YB 3H1QA 5BREA 2GUPA 1QHAA 5ADXH 2CGJA 5AQTA 3O1WA 3A0IX 3RSEA 2PBDA 4MLEA 3QDKA 5KQDA 1GLEG 1T6DA 1BWFO 1BOTO 3J8AA 4B9QA 4H5NA 1SQKA 5AQGA 2YJFA 4BRMA 4CZMA 3KVGA 2CGLA 2QWQA 4B1ZA 2GWKA 5JLFA 4WQ5C 4DHYA 4CZGA 2A6AA 4ISFA 4A61A 1D4XA 1NGHA 2OANA 3VETA 4CZLA 4DCHA 1P8ZA 4MLHA 1HLUA 1NGBA 5E26A 3AARA 1BUPA 4CD3A 2QW9A 1NGEA 3A5LC 3P4IA 1S22A 3HBTA 4CZKA 4JD2B 2EWSA 3VEWA 1BA0A 4BC2A 3M1FA 3O80A 2ITMA 3VEZA 4BGAA 4KBOA 3C0BA 4CBXA 1EQYA 4H03B 2GTDA 1DKGD 2IVNA 5BRHA 1SZ2A 4FWRA 4WYBA 3QB0A 5KPRA 3ULEB 1ZC6A 5AZIB 3A8YA 3DXMB 3ID8A 4JD2A 3VGKA 3ZETB 3MK6A 3F9MA 3IDHA 5FPDA 3L4IA 4M63C 3H3NO 3CJ1A 2ZF5O 4CBUA 2A3ZA 4QS7A 3FZMA 1E4GT 3ULEA 1JCEA 2P9PB 1QQOA 2BTFA 4PL7A 3DXMA 4H5WA 4RCHA 1NGAA 4NO7A 2IVOA 1NLVA 2P9KB 4IJAA 3ZETA 1HJOA 3HI0A 1BA1A 4H0VB 1U2VB 5AQXA 4BR7A 4AM6A 4BC5A 2Q0RA 3GDQA 3GL1A 2HOEA 4EHUA 5TKYA 3A5MC 3VEXA 3VF6A 1WUAA 5AQHA 5AQOA 4BGBA 4BG9A 3VPZA 2NZTA 2I7PA 2UYTA 4BROA 1U2VA 3I8BA 1S3XA 3HSCA 3QFPA 2NRHA 4O5FA 1ZBSA 3UKUB 4DB3A 4H0XB 4BRGA 3WQUA 3ZX0A 4WQ4A 1KAZA 3O8MA 4JN4A 3R8EA 4IZ9A 3D2EB 5FPMA 5AQMA 2QWLA 5FPEA 1BG3A 5BPMA 3CETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZTJA 4BY9C 5CZ2A 1YTAA 2E2OA 3PO4A 3TANA 1S1XA 4JI7K 2HVHA 4B9UA 3V9XA 3QICA 1TAQA 3K9KA 4Q5VA 1BQNA 3E9OA 3D2EA 1G15A 4EAHD 4GV9A 4WCEL 1XMOK 3NDKA 4BRLA 3HPOA 1VSJA 4W5NA 3ZT1A 4PWDA 4JKGB 1C0TA 4PL8A 4FWSA 1XNQK 4M3ZA 3SJHA 2D0PA 3DLBA 1T8EA 1JCGA 4DV6K 4DTUA 4CF1A 2CGKA 3WUHA 5KPTA 3LM2A 4JS4A 3EE8A 3HP6A 4CGDA 2BGGA 2P9UB 3CCMN 3PO5A 3KJVA 4F9OA 3TAFA 3L2WA 1JLFA 4BR0A 2ATQA 3SMSA 3M5RA 3I55N 4O5BA 5BPLA 3LL3A 1SL2A 4PKHA 3G10A 2HHVA 2BANA 5BRFA 1RTJA 1Q81O 3JSMA 1UWBA 5F1XA 4N56A 4FJMA 3HT3A 3S3NA 1NM1A 4YOWA 5GADP 3V9WA 1KFDA 1BIUA 3VQ5A 3V1QA 1I3AA 2NRVA 4LC9B 4CEBA 3MN6A 3FGUA 5ADXA 4JRQA 2HMIA 1NGFA 4JRPA 5FPNA 1NG9A 5LJVA 4Z4IA 4I9QA 2E5LK 1U6ZA 4GNIA 4OGEA 4DTRA 3SV4A 4FLYA 4H8KA 1HPMA 2X78A 1CZAN 3BEXA 1B9FA 4FJNA 3HO1A 2QWRA 3GOIA 4CCHA 1BDGA 4V19S 3UKRA 3OYIA 1L3TA 3MXIA 4BRPA 3G4SN 1GLAG 3VQPA 3VGLA 4HTUA 4OLAA 3L2RA 4ICLA 4I6MB 5BN8A 1I94K 1BIZA 4DU4A 3P1GA 4C8LA 2HW3A 1S72N 3BF3A 3ZLJA 2HF4A 3DWLA 1QQNA 1TAUA 2P9NB 1B92A 4EFHA 4F3TA 2E2QA 4IO8A 4C8MA 4JHDA 2D1KA 3NGYA 1BO5O 4IOCL 1S6QA 3AO5A 5CYMA 4E7HA 3H3OB 3O6WA 1DGKN 1VSMA 3OJUA 2G8UA 4JI8K 4B1YB 4FJKA 3WNHA 1XC9A 3LDPA 5JS2A 4C8NA 1E4FT 5CE3A 1CLQA 3FZHA 4JS5A 1A5WA 1LWEA 1TKZA 3OYFA 1T7PA 4BC3A 3I33A 2YKNA 4IG3A 3EY1A 1HNIA 4LSLA 1Q82O 3CG7A 5J2QA 3CCQN 1MA9B 4TSXA 2J4RA 1HNVA 2GWJA 2F8SA 1HNXK 4OKKA 3CXCM 3SQ4A 1NK0A 1QSLA 1TKTA 1TK0A 5I42A 4WQ5A 4GVMA 4KTQA 3TR8A 3L8BA 1HYSA 2V7ZA 3EN9A 1Z05A 3LALA 2UUAK 4CJEA 1TVRA 3H6EA 1YUWA 1OH8A 1QHTA 2OPPA 1K6YA 3U4LA 4CD1A 3OJSA 1KVCA 1KFSA 3NBPA 3QBXA 3O3FA 4DSKA 3RTVA 1K73O 1WSFA 4CIEA 1RTHA 4BVPA 4OLBA 4GKKK 2KZZA 3BUZB 3SPZA 2VG6A 4YOVA 2KZMA 4DTOA 3RMCA 1YJ9N 2P51A 5F0XA 4JI3K 4FLZA 1WLJA 1NKCA 5AFUA 2PYJA 4BE7B 4BRKA 1K8KB 1Z26A 1YVUA 2RF2A 5K14A 4FWOA 5AQLA 4CHOA 1SKWA 3DMJA 2IOCA 1X3NA 3ZT3A 4AF1A 1MU2A 1RDBA 5AQJA 5J1EA 4GKJK 3LPUA 2ZQBA 1EWRA 4U7BA 4E7KA 3M3ZA 4KHNA 3LDQA 3QFUA 3OYHA 3KTQA 3RRHA 5C2DA 3LDNA 1GLJO 1XHZA 1J6ZA 3EYZA 4RW8A 2VCPA 4DLEA 5AQVA 1NGIA 4JNEA 1BGXT 3OY9A 5C42A 3TTDA 1NGJA 5GAHP 2UUCK 2FXUA 3FE1A 3M8QA 5C10A 4K8ZA 4MO5A 4DSLA 3T3FA 3WXIA 3J7ZO 4OPAA 2GELA 5J2MA 3O4WA 4QAGA 3OYBA 1VRUA 4IFEA 4DTMA 2OA8A 3V1OA 5A2QO 4FW1A 2AP1A 4B1WB 4NYNA 2KQ2A 1VQON 2ZGYA 2Z1GA 2HHWA 2HBJA 1T44A 5C0YA 3U3YA 1YAGA 2B5JA 5SWMA 4PUOA 2E2NA 1LAVA 5JICA 2ZM6K 3KKSA 5EY4A 3LM9A 1VRTA 3V1RA 1A5XA 1NGDA 1W2BM 4DQQA 3ID6A 3PV8A 4I9LA 1QZ6A 4BRDA 5FROA 1L3SA 2VQFK 4LD0A 4B3MK 4CZEA 3EZ5A 4NYFA 3J80O 4OKEA 1CXQA 1MWKA 1N32K 1X9JA 4F8RA 1EXQA 1XHXA 3P39A 1E3MA 5T7BA 3S5TA 3RR8A 5AQSA 2O8FB 2PZSA 1NGCA 3BGRA 3OA9A 1HKBA 1JL2A 1NBWA 1BI4B 1LW2A 2IAJA 3I56N 3AV9A 1WB9A 3CCEN 4I2QA 3O9QA 3H1QA 3NVMA 1NJYA 1QHAA 3HOTA 3LDSA 2RHKA 3O1WA 4B9LA 1T3VA 3TSQA 2WFBA 1FXXA 3AVCA 1BWFO 4H5NA 3K57A 3TABA 4Z4FA 4BRMA 4BWMA 5BR8K 3TAEA 4JKFA 2GWKA 4B1ZA 4NCBA 1VQMN 4CZGA 3SV3A 1TGOA 3V6DA 1IO2A 4DSIA 3VQBA 1P8ZA 2VG5A 1HLUA 3CCRN 1ASVA 1NGBA 2RPIA 1S9GA 3A5LC 3ASMA 3O9SA 2O4IA 1VK0A 4ZTFA 4JD2B 2VQEK 1QVGM 4N41A 3M1FA 3O80A 3O9TA 2ITMA 3HYFA 4FZZA 2D0CA 4KBOA 4K8XA 5KTQA 4WYBA 1NK8A 3OVNA 1FKPA 3ULEB 1ZC6A 1UAXA 2HBKA 5M1QA 3MK6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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