1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
3GOIA 1NGDA 4I6MB 4J8FA 4BG9A 5B8HA 5LJWA 5FPDA 2QXLA 1GLBG 3AY9A 5AQJA 4DB3A 2YHWA 4PL8A 1QQMA 1X9JA 2GELA 1Q18A 2P9KB 4IXCA 4XH5A 5AQVA 1WUAA 2YHXA 2V52B 4JD2B 2NLXA 4BRAA 2Q1NA 2GTDA 3EN9A 4JHDB 3C7NA 3UKRB 2V7ZA 4WQ4C 4JHDA 5EY4A 4CZFA 1SAZA 1NLVA 4EFHA 4JNEA 3O4WA 3SJHA 1HKCA 3QFPA 2NRHA 1HKBA 5AZIB 4CJ7A 3MN5A 5AQKA 4CZHA 2E2QA 1JCFA 2P9LA 4BREA 2HF4A 3FZMA 4AM6A 4H0OA 2PBDA 2P9IB 5AZJA 3ULEB 4WQ4A 2P9IA 1OKJA 1ZC6A 2A40A 4BR7A 5AQLA 2ZGYA 2P9PA 4BROA 4WYBA 4K43A 1NGFA 4H0TB 4FOIA 3A8YA 1IJJA 1HLUA 5AQWA 1MWKA 3IUCA 4A62A 4BRPA 2GWKA 5BRHA 4B1XB 2BUPA 5KPRA 1HJOA 2V7YA 2FLOA 4XH4A 4GY2B 1JCGA 2PAVA 5AQYA 1NMDA 5I9EB 3D2EA 2VWBA 3CETA 3WT0A 3C0BA 3O5BA 2W40A 4EHTA 2V51B 2E1YA 4BVPA 4Y0WA 3MN7A 2CGJA 4GNIA 4AM7A 5JMVA 4F9OA 4PL7A 1MWMA 4EIAA 3QMLA 4FOEA 2QWNA 3SK3A 4CZGA 4MO4A 3ZX3A 2IIRA 3H6EA 3WXLA 4WQ5C 2FXUA 1SZ2A 1HUXA 2QWQA 3LL3A 4BC5A 2ZGZA 2IVOA 1NBWA 3FZLA 3O6WA 4FWLA 5FPMA 2E20A 4BR2A 4CZMA 3DXKA 1GLLO 3WQTA 4BRDA 1NGJA 1XUPO 4A2AA 4FWOA 2EWSA 4FWSA 2BTFA 3MN6A 3IMXA 4CBWA 3U4LA 3VF2A 2D0PA 3HM8A 4BRFA 3D2FB 1NGBA 4H0YB 5KPZA 3ENHA 5EX5A 3VF4A 2I7NA 5AR0A 4BRNA 3BF3A 2D4WA 4QS7A 3SLCA 2FSJA 3QBXA 1NGIA 1D4XA 3BUZB 2DPNA 3CQYA 3I8BA 1YUWA 5AQZA 4H5WA 4YDUC 3VEWA 4MLHA 3RSEB 4BRKA 1T6DA 3RSEA 2A3ZA 4H0VB 1Z05A 2ITMA 4BC3A 4CBXA 2Q2RA 4K42A 1SQKA 4PKIA 1J6ZA 4A61A 2UYTA 4QS9A 3TPQA 5KQ8A 1T44A 1U2VA 3CJBA 5CE3A 5ADXA 4YDUA 3U8XA 3L6QA 4PKHA 3FZHA 2AP1A 3JS6A 4KBOA 2H3GX 4L3QA 1MA9B 1NWKA 3VESA 5BN8A 2E2NA 5JLFA 3FZFA 4ISGA 2YJFA 5BR9A 4MLEA 2P9UA 3HBTA 4K41A 3M6GA 4BR4A 5AQTA 3C7NB 3ZEUA 1BU6O 2CGKA 2HMPA 3GG4A 4E1JA 4FL9A 4IO8A 4JN4A 3KZBA 5F1XA 1RGIA 2Q31A 3KHYA 1DKGD 5BREA 3EKUA 2W41A 3BP8A 2CH6A 3ATVA 3O08A 3QFUA 1V4TA 4CZJA 2P9LB 2GWJA 3EO3A 4BGBA 2YHYA 2QWPA 5JICA 5AZJB 5F2RA 3GL1A 1YVNA 1E4FT 4DHYA 3GBTA 2WUSA 1BUPA 2P9PB 3MMVA 3QB0A 3MDQA 2KHOA 3WXKA 5BRFA 1QQNA 2FF6A 1KXPA 1BWFO 3ID8A 5ADXH 1K8KB 2P9SB 1ESVA 1K8KA 2I7PA 2P9SA 5E26A 3SMPA 1H1VA 4BGAA 2AA4A 2HOEA 3VEOA 4O5FA 4EAHD 4EHUA 3EZWA 3HI0A 3D2EB 1C0GA 5BPNA 3CJ1A 3AAPA 4M7YA 1BO5O 2VCPA 4BG8A 3EKSA 5AQSA 3LDNA 4DCHA 2E2PA 4CZEA 5FPEA 1BA0A 4ISFA 1RFQA 2J4RA 1NGCA 2E8AA 1Z6RA 1GLAG 1GLJO 3HTVA 5AFUA 2F9TA 3ZX2A 2D0OA 2E2OA 4O8KA 5AQHA 2QWMA 1GLEG 1NGEA 5E84A 5AQUA 4BRMA 1WOQA 1E4GT 5TKYA 2VYPA 3DWLA 2A5XA 3CI5A 3WEEA 3DXKB 5EVZA 1KAXA 1R59O 1ATNA 1IG8A 4H5VA 1BA1A 4FWQA 4FSVA 3CERA 3ZETA 4BRLA 3HZ6A 3B8AX 3H45C 1HPMA 3R9PA 1QZ5A 1V4SA 4RTFD 5AQGA 3IFRA 3LDQA 4H5TA 3VEYA 4FO0A 1RDWX 3D7EO 3A5OC 4BRHA 3U9ZA 3AARA 2ASMA 4M7XA 4FPAA 3LDPA 2E1ZA 4IJAA 1DEJA 4DQ8A 4JAXA 2IVNA 3LM9A 3H1VX 5AFUH 3QBWA 3L4IA 1U2VB 3A0IX 4NB4A 3CJCA 1C0FA 5EOYA 3BF1A 2P9NA 4RCHA 3UE5A 4IJNA 3A5NC 4IWVA 2ZF5O 2GUPA 3VGMA 3VPZA 3ENOA 3LDOA 3BEXA 2E88A 1GLCG 2Q97A 5AQIA 4BC4A 1ATSA 2A6AA 3AAQA 4PKGA 1NGHA 2P9UB 4B9QA 4BRCA 3ZEUB 1QZ6A 2ASOA 2A41A 1BG3A 1XC3A 5KPTA 2OANA 4HWIA 1YAGA 4NO7A 5FPNA 3MCPA 3UKUB 2QWLA 4B1ZA 4I6MA 3UKUA 3R8EA 5BRDA 2IVPA 1T6CA 4CD1A 5AQXA 4BR9A 3LM2A 3FLCO 2ASPA 2YCHA 3VGKA 3CJ9A 2P9KA 4BRQA 5BPLA 3CHWA 5AQFA 3QDKA 4XH1A 4Z94A 4H5RA 1TYQB 4JD2A 3J8AA 1TYQA 2Q0RA 3VF6A 1CZAN 3JXUA 3UKRA 1KAZA 3FGUA 1XQSC 2CGLA 4CZKA 3VERA 4BRIA 3VENA 3FE1A 2ZWHA 1ZXOA 2Q0UA 4IZ9A 2GEMA 5AZIA 3WUHA 4BR0A 3WXIA 2FF3B 2D1KA 1YXQA 3L0QA 4H0XB 5AQQA 3ATUA 2QW9A 1NGGA 3ULEA 1U6ZA 2CH5A 3FZKA 3CJAA 3GDQA 1NM1A 3O8MA 4ISEA 4B1VA 1P8ZA 5ELZA 3H3NO 1JCEA 3CJ7A 3VETA 4BRGA 3I33A 3FFKB 5KQDA 1TUYA 1DGKN 2FSNA 5AQNA 4FPBA 5AQRA 3A5LC 4B1WB 3WXJA 3ZX0A 1MDUB 3WEEB 1S3XA 2FSKA 3R6MA 1G99A 3UB5A 1X3MA 3DAWA 3DXMB 3H46O 3M3ZA 3W3DA 3DXMA 3VGLA 3ZETB 2F9WA 2QM1A 3KVGA 4K25A 4BQLA 4BQZA 3VEZA 3F9MA 3H1QA 2A42A 2NZTA 1BOTO 3HSCA 5F0XA 4FWRA 4FWMA 2QWOA 3VOVA 3CIPA 1ZBSA 1GLDG 4FWNA 3WQUA 1X3NA 3VEVA 5LY3A 3SMSA 5LJVA 4RWTA 3LDLA 2HF3A 3MN9A 3P4IA 1NGAA 3H3OB 1LOTB 1GLFO 3O1WA 4MO5A 1HX1A 2YJEA 3O1BA 4H0PA 4B1UB 3OHRA 4M63C 4WQ5A 5EXWA 3D2FA 1LCUA 3W0LA 4BR5A 2P9NB 4BVOA 4HTLA 3A5MC 1KAYA 4H03B 2QWRA 3M1FA 3GE1A 3G25A 3TU5A 4CBUA 5JLHA 1EQYA 1TUUA 5BPMA 4BC2A 4FWPA 3MK6A 3QICA 3IDHA 4XEIA 3DJCA 4A2BA 3FR0A 1QHAA 3S41A 5AQPA 1S22A 2Q36A 3U9DA 4C23A 4LC9B 4B1YB 2YI1A 4CD3A 1ATRA 1Y64A 5AQMA 3EL2A 3O80A 3CQXA 4QS8A 5AQOA 4CI6A 3VEXA 1BDGA 1QQOA 5BN9A 4FWKA 4H5NA 4CZLA 4CZIA 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGDA 5B8HA 1TL1A 4DB3A 3SV4A 4F3TA 3G4SN 1X9JA 2GELA 2OTLN 4IXCA 4V19S 4PY5A 3K58A 3RMBA 4BRAA 2XY8A 3AO1A 2QTDA 4OX9K 2GTDA 3EN9A 4JHDB 3NH2A 3UKRB 5EY4A 4WQ4C 1IV0A 3VMFB 2YV0X 2VGMA 1NLVA 4EFHA 1WSEA 3O4WA 3QFPA 3KLHA 3LPTA 4YY3K 4CZHA 5IWAK 2PFUA 1N34K 4BREA 3Q7BA 4GVEA 4DTXA 2PBDA 5C12A 2P9IB 3OYFA 3KK7A 4WQ4A 1E3MA 4FW2A 4BR7A 2HHIA 2P9PA 1WBBA 3RRGA 1KC8O 1NGFA 4GV6A 5M1OA 1OH6A 4YOYA 4CFBA 3IUCA 1VQ6N 4JKGA 5KPRA 4GV3A 2V7YA 5SWMA 4XH4A 3IS9A 4GY2B 1OVQA 5CY4A 3L2QA 1D5AA 5C2FA 4CGIA 4EHTA 4JI5K 2E1YA 2ZM6K 4CF9A 2FBVA 3HPOA 5K14A 2C1GA 3SV3A 3WNEA 1ZBLA 4DV3K 3VQDA 3THVA 3B6OA 2CGJA 2KLAA 5JMVA 4F9OA 3LAMA 4PL7A 1TK8A 2QWNA 1U04A 4WFAL 1A5VA 3ZX3A 1TKTA 3ASMA 4PHTX 2YKNA 4WQ5C 3CCLN 2QWQA 3LL3A 3G6EN 4E3SA 4HUFA 1NBWA 5FPMA 2E20A 3SUOA 3DXKA 1GLLO 1NGJA 4KTQA 4FWOA 4FWSA 3EYZA 3QEIA 4WF9L 4BEBA 4CBWA 4FVUA 1BCOA 3TAGA 3D2FB 2FC0A 3AVAA 2UXDK 3ALYA 3ENHA 4DQQA 3BF3A 2D4WA 1LWCA 4QS7A 3J80O 3SLCA 4M3UA 3FFIA 3CQYA 5CR4A 4YDUC 1C0UA 4BRKA 3PSIA 1T6DA 4OPJA 3RSEA 2A3ZA 2ITMA 3CMAN 2X6NA 4CBXA 4OKJA 3HT3A 1NOZA 1T44A 1HYZA 1U2VA 3CJBA 2WOMA 5CE3A 4CJRA 3AA3A 4YDUA 3L6QA 4LSLA 4Z0UA 3T69A 3CQ8A 1W2BM 3DLGA 4L3QA 4JKHA 3VESA 1RT6A 5KGWA 2E2NA 4DWIA 1Q9XA 4MLEA 4K41A 3M6GA 4BR4A 4FL9A 4DTUA 4JKFA 3RWUA 2YHBA 3AVKA 1T8EA 4Z4CA 4A5AA 3K5LA 2O8DA 4R79A 1L3TA 2GWJA 3EO3A 1DTTA 4JKEA 3DLLL 5JICA 4FK4A 1IO2A 5F2RA 1J9AA 4CJQA 3PX0A 1YVNA 2VGNA 1SS6A 1BUPA 1SKSA 4YOTA 3QNOA 4J2AA 3NF8A 4RW6A 3AVFA 2FF6A 1VSEA 3L2WA 1WLJA 4CF2A 5E26A 2QEXN 1H1VA 1NU0A 2HOEA 2KFNA 3DMJA 3KJVA 3OY9A 3HI0A 3D2EB 3K9KA 4CE9A 3K5NA 2HHHK 3VQ7A 4DUZK 4KRFA 1T3VA 4HCBA 3ZT2A 5AQSA 4FZZA 3LDNA 4CF8A 1UA0A 1GLAG 4BWJA 1GLJO 4FLTA 4JK9A 3ZX2A 5HRNA 2D0OA 3F5TA 2E2OA 4DR3K 1NGEA 1IBKK 1WOQA 4DU3A 4F2RA 2VYPA 3V4IA 4IKFA 2A5XA 3J7YP 3TAMA 2DFFA 3U3GA 1QVFM 4EZ6A 2HHSA 2ZJRL 4FSVA 3ZETA 3QETA 4Z4EA 1FXXA 1HPMA 3CYMA 3R9PA 1EETA 4FM1A 1V4SA 2KW4A 2P51A 3OYAA 1NNEA 4BE7B 1RDWX 2P5GA 4CFCA 1T03A 1G15A 4FJ9A 4DU4A 5EU7A 1RCHA 3AV9A 4BE1A 1S1TA 1F21A 4FVMA 2VWKA 2DFEA 2E1ZA 3SAGA 3QLHA 2HSTA 1SL0A 3O9QA 4ICLA 3H1VX 5C0YA 2UU9K 3A0IX 1T05A 2QA4N 1KFDA 1RT7A 4RCHA 2YKMA 5FROA 1XNRK 2HBLA 5C2DA 2ZF5O 4DMNA 4CIEA 3BEXA 4EP5A 3HOTA 2A6AA 3AAQA 4DV4K 2P9UB 1U4BA 1X9SA 4E72A 3ZEUB 1XC3A 3KLIA 2XRIA 1XHXA 1VHXA 4FJIA 2OANA 3I0SA 4DS4A 1NOYA 3V1OA 3UKUB 4DV2K 2QWLA 1HYVA 4JKDA 3ISNC 4FW1A 4I6MA 4CW7B 1KSPA 4JI6K 4Y1DA 4CJFA 2QKBA 4B9SA 4N76A 5AQXA 2RF2A 1KVBA 3WNGA 2YCHA 4BRQA 3M8PA 1C1CA 3J7AP 1N32K 3OBYA 1RT3A 2Q0RA 4KHSA 3VF6A 4WFNL 3CFOA 3FGUA 3DI6A 3AA5X 3ZSWA 4CZKA 4BRIA 1TVRA 3TSUA 3AVLA 2OYQA 4K8XA 4L8RB 2Q0UA 4PUOA 3OYNA 2D1KA 4JI8K 3T1YK 3PX6A 2GX9A 3KLEA 4CHQA 1HNZK 3ULEA 2CH5A 4BY9C 3GDQA 4CF1A 1NM1A 1I39A 1P8ZA 4FJLA 5ELZA 3CJ7A 1FJGK 1JL1A 2ZJPL 2F96A 3LP2A 3P39A 5AQNA 4FJ5A 4FJ7A 2GUIA 1UWBA 4KTZA 4MFBA 3ZX0A 4WCEL 1TK5A 1VSJA 1HNIA 3WEEB 3LDSA 1G99A 3UB5A 3DXMB 3DAWA 1XWLA 1J54A 5KRTA 4IO9L 1RDCA 5GIPA 4FLUA 3VGLA 2O8EA 4JKBA 3OJUA 3KVGA 4CF0A 3DRPA 4J2DA 2C1IA 4FWRA 4B3RK 4HCCA 1ZBSA 3PIPL 3I55N 3VEVA 1WBDA 2QI2A 3PO4A 3P4IA 5CYMA 3H3OB 4GV9A 3MAQA 1ZBFA 3V6DA 2RE2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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