1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
4F9OA 4H0TB 3IDHA 1R59O 1IJJA 1RFQA 2E1YA 1P8ZA 3GE1A 3M6GA 4FWMA 3A8YA 5FPNA 3ZEUB 4FWKA 2V7YA 3M1FA 3VEYA 4EHUA 1OKJA 3O6WA 4BRIA 1YUWA 3VGKA 3U9ZA 3JS6A 1G99A 3C7NA 2E2OA 1YVNA 4BGAA 1V4SA 3UKUA 1NM1A 3G25A 5AQVA 2AP1A 3WXLA 5AR0A 2QWRA 3FZFA 2QWQA 3WUHA 5AQTA 4JN4A 3VF4A 2YHYA 5F1XA 3BF3A 3QICA 2QWLA 3O1WA 3CJ7A 1QZ5A 3C0BA 4BVPA 1V4TA 2FF3B 2P9SA 4CZHA 3VEVA 1HKGA 1GLJO 3FZHA 4FL9A 2ZF5O 3A0IX 4RCHA 2YHXA 4MO4A 4RTFD 2A41A 2BTFA 1ATRA 5AQWA 5AQYA 5AQFA 1NGCA 4IJNA 2QXLA 2ZGYA 4IZ9A 3MCPA 4BG9A 2IVNA 4I6MA 3WT0A 1H1VA 3QBWA 4YDUA 2D1KA 3L4IA 2QM1A 3A5LC 3D2FA 2D4WA 4BRHA 2P9IB 4H5WA 1LCUA 3HTVA 2PBDA 5EXWA 2NZTA 2ZGZA 4WYBA 1BA0A 3ZETA 3QBXA 4JAXA 4CZIA 2IVOA 1HPMA 4BR2A 4FWSA 4B1WB 4XH1A 4A61A 3EL2A 3EZWA 3DXMA 5AZJB 1NGGA 3QDKA 5LJWA 3LDNA 1HLUA 1TUUA 2GUPA 4IXCA 3RSEB 4BRCA 4AM6A 4FWRA 5AQHA 4JHDB 4PL8A 4H5RA 2P9UA 5AQIA 4BREA 1NGIA 5LY3A 3UKRB 3U4LA 1TUYA 3MDQA 2QWOA 2J4RA 3DXKB 5AFUA 1DKGD 1T6CA 2CGKA 1T6DA 2UYTA 1LOTB 2DPNA 1QHAA 1GLDG 3DJCA 4BRKA 4LC9B 4M7XA 4B1VA 3ID8A 2P9NA 3WEEB 1CZAN 1TYQB 3FZMA 4BRQA 2FSKA 1NGBA 1NGHA 4DCHA 2VWBA 4O5FA 2CGJA 4H5NA 3EO3A 3FZLA 2IVPA 3OHRA 4GY2B 4MLEA 4CBXA 1QQMA 3QMLA 5AZIB 2V7ZA 4KBOA 2A6AA 2VCPA 4H5VA 1MWMA 4H0PA 3CJAA 3EKUA 3H3NO 2ITMA 3IUCA 3LM9A 4J8FA 1HKCA 3MMVA 3IMXA 5FPDA 3ULEA 3LDQA 1BOTO 1C0FA 2WUSA 3CIPA 4XEIA 5EOYA 3WQUA 3ENHA 3DAWA 1XC3A 2FSNA 3O80A 4BG8A 3HBTA 2HMPA 1S3XA 3JXUA 3CQXA 2A40A 2E2QA 1NWKA 2HOEA 4DQ8A 3O1BA 2CH6A 4K25A 5BRHA 3BP8A 4FSVA 3GG4A 3F9MA 5FPEA 3CI5A 4L3QA 2YJFA 1BU6O 5AZIA 1BO5O 1T44A 3VEWA 3EKSA 2FLOA 1NLVA 3KVGA 1WUAA 4H0YB 3ENOA 2CH5A 2F9TA 5I9EB 5BPNA 3U9DA 3GBTA 5TKYA 4Z94A 4BC3A 2P9KB 1BA1A 5AQXA 4FPAA 3O5BA 5LJVA 3ZEUA 4B1XB 1QZ6A 5KQDA 4EFHA 4BVOA 3VF6A 1GLEG 3ATVA 5BPMA 1KXPA 1E4GT 4BR9A 2FSJA 5F0XA 2W41A 1QQNA 4H03B 3S41A 3D2EB 1YAGA 4YDUC 2OANA 2FF6A 1DGKN 1E4FT 4K41A 2ASOA 4FPBA 5AFUH 3LDLA 3HI0A 3L0QA 5KPRA 2Q0RA 3HSCA 4FO0A 2IIRA 5E26A 3UE5A 3CERA 3KHYA 3VF2A 3MK6A 4K42A 4HTLA 4B1ZA 4BR7A 5AQJA 5AQZA 3CJ1A 2EWSA 1C0GA 3J8AA 1NGDA 1DEJA 3H45C 1QQOA 4BRPA 4BRAA 4ISEA 5AQQA 3UB5A 2Q0UA 4DHYA 1GLBG 2P9KA 4MLHA 4BQLA 2A42A 1J6ZA 4HWIA 4BROA 3CQYA 5AQOA 4K43A 1NGJA 2E2NA 5BR9A 4B1UB 2CGLA 2I7PA 1HKBA 1K8KB 3GOIA 4BRFA 3MN7A 3SMSA 3H1VX 3VESA 1SQKA 5AQRA 4IJAA 4GNIA 3H46O 3CJBA 4BGBA 2P9IA 1GLAG 4H5TA 3R9PA 2QWNA 3QFPA 5AQLA 2AA4A 5BN9A 4PKGA 4BC5A 2P9PB 5JMVA 3SK3A 3WXKA 3O8MA 4CI6A 4CZGA 2BUPA 2NLXA 3GDQA 3FZKA 5AZJA 1JCEA 3H1QA 5ELZA 1MWKA 2YI1A 3HZ6A 5AQGA 1NBWA 5EX5A 4JD2B 3CHWA 3A5OC 5FPMA 4C23A 3RSEA 1U2VB 4EIAA 4NO7A 1KAZA 4JHDA 4H0VB 2D0PA 5AQUA 5AQKA 3QB0A 3VETA 1GLFO 3UKRA 2ASMA 4H0OA 1IG8A 2Q36A 1ZXOA 5AQNA 4FWNA 3DXKA 2V52B 2E88A 1KAXA 3SJHA 4FOEA 4A2AA 4BRMA 3ATUA 5E84A 5BN8A 3C7NB 4WQ5A 5KPTA 4Y0WA 3UKUB 1RGIA 2ASPA 2P9PA 5KQ8A 1ATSA 1ZC6A 3VENA 1SAZA 4A2BA 2E2PA 1BUPA 3WEEA 4BRGA 3CJCA 4A62A 1TYQA 3VEZA 3ZX0A 5BREA 3SMPA 3KZBA 2NRHA 2QW9A 2F9WA 3SLCA 4M7YA 1WOQA 1Z05A 1BDGA 4CZEA 5KPZA 2A5XA 4O8KA 4FWLA 3D7EO 4BR4A 2KHOA 5BPLA 3L6QA 4EAHD 2P9SB 3U8XA 4E1JA 4B1YB 4FWQA 3TPQA 1Q18A 1U6ZA 4FOIA 2GWKA 4CZKA 3AARA 1Z6RA 1D4XA 3VGMA 4FWOA 5JLFA 2GEMA 4QS7A 1X9JA 2QWMA 5BRFA 2YCHA 4I6MB 5EVZA 3VERA 3D2FB 3GL1A 2E8AA 3W0LA 2E1ZA 2VYPA 2ZWHA 1JCFA 3CETA 4CD1A 2QWPA 3ZETB 3DWLA 4PL7A 3H3OB 5CE3A 2D0OA 4PKHA 3LDPA 3LM2A 3VGLA 1XQSC 3BUZB 4DB3A 2YJEA 3DXMB 1RDWX 4BR5A 4CJ7A 4QS9A 3MN6A 2W40A 1EQYA 4ISGA 1HUXA 5ADXH 2I7NA 1NGAA 2P9UB 3QFUA 3BEXA 1ATNA 1NGFA 1HJOA 4MO5A 1NGEA 2GWJA 2HF4A 3A5MC 1GLCG 3HM8A 2FXUA 3VPZA 3AAQA 3FE1A 3FFKB 4WQ4C 2Q1NA 3W3DA 3IFRA 4CZLA 2Q2RA 4BC2A 5JICA 1ZBSA 4CZFA 3D2EA 3FR0A 1X3NA 1NMDA 4BR0A 3I8BA 5AQPA 3VEOA 4WQ4A 4IWVA 3I33A 2V51B 4PKIA 3EN9A 2P9NB 5EY4A 5B8HA 5BRDA 2A3ZA 4CBWA 4EHTA 3CJ9A 4FWPA 1MA9B 1MDUB 1BG3A 4CD3A 3MN5A 4BRLA 3ZX3A 5ADXA 3H6EA 3BF1A 4CZJA 2Q97A 2P9LB 3ZX2A 3R6MA 4XH5A 1Y64A 1S22A 4BRDA 3AY9A 4BQZA 1X3MA 3A5NC 2Q31A 3M3ZA 4NB4A 4XH4A 4CZMA 3LDOA 3ULEB 3O08A 1K8KA 4ISFA 4JNEA 1JCGA 3WXIA 4QS8A 3WQTA 2PAVA 5AQMA 5AQSA 1ESVA 4WQ5C 3WXJA 2GELA 3TU5A 2YHWA 3FGUA 4BC4A 4RWTA 3LL3A 3R8EA 2H3GX 4M63C 1XUPO 3MN9A 5F2RA 3VOVA 1BWFO 2HF3A 3AAPA 4IO8A 1SZ2A 3VEXA 5JLHA 3P4IA 3B8AX 2E20A 1YXQA 3O4WA 2P9LA 4AM7A 2GTDA 4CBUA 4H0XB 4JD2A 4BRNA 1GLLO 4B9QA 1KAYA 1U2VA 3FLCO 1HX1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F4KA 1QTMA 4CFDA 3WXMB 1IJJA 3AVHA 1OVQA 1Z26A 3M6GA 2D0BA 5FPNA 5DMRA 4FWKA 3LP1A 3M1FA 5AJ3K 3ALYA 1VHXA 1TKXA 1DT9A 3OBWA 5HOOA 1YUWA 1NKBA 1NK4A 1BCOA 3C7NA 1NM1A 4O4GA 5M1NA 2Y1IA 1BISA 3TSPA 1NK7A 4FJJA 1UA0A 3LPUA 3AVMA 4K8XA 3AVGA 5C2DA 3NH0A 1M1KO 1D9DA 2KW4A 2QWLA 3O1WA 4O8UA 4JI3K 4PWDA 3VQ4A 5C12A 4F8RA 3FZHA 1BIUA 4AHTA 2YHXA 1REVA 4RTFD 5AQWA 3LZJA 4IJNA 5J2MA 4CF1A 2D1KA 3L4IA 5M1QA 3RMAA 3A5LC 4BRHA 3LAKA 2P9IB 1LCUA 4L8RB 4DQQA 2A1SA 2DFFA 4DR4K 2IOCA 3QBXA 2IVOA 2Z1HA 2RKIA 4BR2A 3EZWA 3P83D 1NGGA 5LJWA 3LDNA 1HLUA 4N5SA 2GUPA 4IXCA 3V6DA 1HQUA 1GOCA 4AM6A 3DLHA 4JHDB 4PL8A 4H5RA 3WNFA 3IRXA 4CHZA 5AQIA 1KFSA 1NGIA 1ZBHA 1HJRA 1SL0A 1HNXK 1KQSM 1XHZA 2O8BB 1WNSA 3I8DA 1N34K 2YNGA 3LP2A 3HT3A 3OYMA 2YHBA 1RNHA 4FM2A 1QS4A 4UQGA 4DFPA 2HNYA 3K5NA 3BZKA 3WEEB 1CZAN 3NAEA 3SV4A 5LL6Z 1VSHA 3FZMA 1RDDA 1KVBA 4DV0K 3KKSA 2HHXA 2CGJA 4H5NA 3EO3A 3DOKA 2IVPA 3FZLA 4X66K 3CMEN 4FK4A 1YF5L 4CBXA 3G0ZA 1J9AA 3DRRA 4FW2A 4E7LA 3TAPA 4H0PA 1U49A 2JGUA 1LAVA 3L2WA 5J1EA 4IG3A 4ELUA 3IMXA 1C0FA 2WUSA 4XEIA 3ENHA 1XC3A 2FSNA 4BG8A 3SQ0A 2HMPA 3RMBA 3CQ8A 1YITN 3MX5A 3KLIA 3PX4A 2CH6A 5BRHA 1WN7A 3ZCMA 3RRHA 4L3QA 3OYIA 4ILHA 3HXMA 1Q8IA 3THVA 1BO5O 1T44A 3TSUA 1J5OA 4I9LA 3MEDA 4GVMA 2WFBA 2FLOA 3L2UA 2KFNA 5D3GA 4JYAK 4DU3A 2NRXA 1HYSA 3P39A 1VSLA 5BPNA 3P31A 2KQ2A 1ZBUA 4Z94A 3CC2N 3VTIA 4KH4A 4IKFA 4FPAA 3TTDA 3ZLJA 1JL2A 5LJVA 3OBYA 5FRMA 4JLHA 4BVOA 1GLEG 3ATVA 4NYFA 1VQMN 1VQNN 4GKJK 4YDUC 2OANA 3VQCA 5I3UA 3HL8A 4DR5K 4JK7A 3BY5A 3VQBA 2IIRA 4OPJA 3JAMO 1DTQA 3MK6A 4KAZA 1KD1O 4BR7A 3G6EN 1ILYA 4DTOA 3L4QA 1IBLK 2OPQA 4BRAA 5AQQA 4CGJA 1JXEA 2IAJA 4DHYA 3G4SN 4DMNA 3PSIA 1UWBA 4W5NA 4KH6A 4PA1A 1RDAA 3HK2A 2E2NA 3JSMA 3LZIA 1Q81O 3NF9A 1RT7A 2CGLA 3GOIA 4M3WA 1KVCA 4BRFA 4DTXA 3SMSA 3H1VX 3VESA 1SQKA 1Q86O 3H46O 5C2FA 2HB5A 3AGKA 4AHCA 2P9IA 3R9PA 3QFPA 5AQLA 4W5QA 3F5TA 4U67L 3KJVA 1IKWA 2P9PB 5JMVA 3MXJA 2JWKA 1T03A 3TTFA 4BE1A 4CZGA 2NLXA 1A5VA 1KRPA 5FRNA 2YI1A 4FJKA 3EZ5A 1NKCA 4NCBA 4DSEA 4KHSA 3CHWA 3MCAB 2B5JA 2W42A 1U2VB 2KZZA 4NO7A 1KAZA 2VQFK 4JHDA 4CJ4A 4CJPA 3DOLA 4NXMK 3VETA 1NK0A 5SZTA 3QNOA 1HPZA 3CM5A 4DSFA 4IFEA 4FWNA 4JRQA 2O8BA 4FJ5A 4DUYK 3SJHA 4FOEA 4X64K 4CGHA 5BN8A 2EHGA 4WQ5A 4B3RK 2ASPA 1NOYA 4JEPA 3QIOA 1SAZA 1RT4A 3WEEA 4BRGA 2XO7A 4A62A 3VEZA 5BREA 1HYVA 1K73O 1U45A 1IG9A 1OH8A 3QNNA 2F9WA 4FLYA 2OZMA 5KPZA 2A5XA 3PSFA 3KD1E 1C1CA 1EWQA 2KHOA 5BPLA 3L6QA 5C15A 4PQUA 1XWLA 3Q7CA 2OTLN 3PX6A 3G71N 4B9LA 3DLKA 4FOIA 3OS0A 2GWKA 4CZKA 3C6TA 3QEIA 4FZYA 2ZQBA 5BRFA 4DSKA 2WOMA 4I6MB 1T7PA 3OVNA 2Z1GA 1GOBA 1NU0A 2E8AA 4RW4A 2XY7A 3CETA 2FBVA 4ID5A 3KLEA 3NGYA 5IT9O 3DWLA 3H3OB 5CE3A 2UUAK 4NXNK 3TAMA 2KLAA 1LW0A 3BUZB 3Q7BA 2YJEA 3V9ZA 1BQMA 1QSLA 1EQYA 4ISGA 3VQ5A 1NJIO 1EETA 2GWJA 2HF4A 4JKGB 3AVLA 4CGFA 3AAQA 1RDBA 3FFKB 2Q1NA 3THYB 4CK2A 2Q2RA 4DR7K 2D5RA 2KKZA 1U4BA 3SZ2A 3I8BA 5AQPA 1RBVA 3I55N 3O9SA 1WBBA 4JRPA 3E9PA 3HSTB 1E3MA 5B8HA 3ID6A 4JKHA 4HHTA 4DQIA 4FWPA 5M1PA 3KK2A 3SAGA 2PYJA 1BG3A 1VSKA 4KI6A 2KFZA 3QIPA 3ZX3A 2EX3A 3H6EA 4I7FA 3BF1A 4CZJA 3D6RA 2E4LA 1S6QA 3O9QA 4OJRA 2VG7A 1VAZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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