1NGDA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
b'GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFNVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngdA04
4M63C 3VETA 1MWKA 2ASOA 4FWPA 2P9LB 3FZKA 2ASMA 4PKHA 4WYBA 4IO8A 4EHUA 2AP1A 4BQLA 3H1VX 1QQNA 5AQRA 4BR0A 1RGIA 3O5BA 1HJOA 1YAGA 4XH1A 4JAXA 2F9WA 1U6ZA 3KVGA 3VEYA 1U2VA 3DAWA 2D0PA 4WQ5A 3AAPA 5F2RA 3HTVA 3CJ7A 5ELZA 4JHDA 1NGCA 5AQPA 2P9IA 2QWQA 1C0GA 4WQ5C 4M7YA 5AQUA 1BOTO 1ESVA 4BR4A 2ZGZA 2QWNA 2WUSA 1NGAA 4FWNA 5TKYA 1BU6O 5CE3A 4ISFA 5KPZA 2FSKA 1T6CA 3FGUA 2CGKA 5FPNA 2A3ZA 4YDUA 4B1VA 3LDPA 3R9PA 1RDWX 4DQ8A 5AFUH 3WEEA 2GTDA 2E8AA 1D4XA 2FSNA 2P9PA 4B1UB 1QZ5A 4YDUC 4BVPA 4H5TA 3BF3A 1MWMA 3LDNA 4BRKA 5AQOA 1XQSC 1BWFO 3ZEUA 4CI6A 1IJJA 4B1ZA 1BO5O 5AQFA 4NO7A 4IXCA 5AQYA 4H5RA 4H5NA 4BROA 5AZIB 1ATSA 1ZXOA 1E4FT 1SZ2A 2E1YA 3VGLA 3FR0A 2ZGYA 3M1FA 2Q36A 1T44A 2ITMA 2FF6A 3QMLA 3I8BA 3AY9A 3D2FA 2AA4A 2Q1NA 3ZX0A 4O8KA 1NGEA 3WXKA 4K41A 4PL8A 3CJCA 4A61A 5AQNA 4MLEA 4BR2A 1TYQA 4F9OA 3MN9A 3ATUA 3QDKA 2YHXA 1NBWA 4FWSA 4QS9A 2E88A 3FE1A 5JLFA 1K8KB 4O5FA 3EZWA 2P9SB 4QS7A 5EX5A 4IJAA 3ZETB 1S3XA 2W40A 5BREA 3P4IA 3J8AA 1TUYA 4E1JA 3SJHA 3DXMB 5AQMA 2YCHA 3A5MC 3RSEA 4Z94A 5AQIA 3EN9A 4A2BA 2VCPA 3CERA 5KQ8A 3FFKB 5AQVA 3UKRB 3VERA 4BRFA 2HOEA 1BG3A 2P9NB 1ATNA 1CZAN 4RWTA 4BRDA 5EVZA 3W0LA 5EXWA 3AARA 3WUHA 4IJNA 4XH5A 4HWIA 1X3MA 4K43A 1XC3A 4H0YB 1R59O 3VF6A 1YVNA 1X3NA 2YI1A 1WUAA 2QXLA 4CD3A 1SAZA 5EY4A 1YXQA 3O80A 2IVPA 2V52B 2H3GX 5LJVA 1TUUA 3ID8A 3HZ6A 3HBTA 3MCPA 4BRLA 4FPAA 1HX1A 3BUZB 1GLLO 1LCUA 5BPLA 5AQLA 3A5NC 2CH6A 3QICA 2P9LA 1Z6RA 2P9UB 3ENOA 2V51B 1T6DA 4FOIA 4B1WB 4BRGA 4CZMA 1ZC6A 4A2AA 2W41A 1H1VA 3R8EA 5AFUA 1J6ZA 1V4SA 3LM2A 3O1BA 5BPNA 4CZLA 3MK6A 5AZJB 3VF2A 3WQTA 4B9QA 3VESA 3O8MA 2EWSA 4IZ9A 4GNIA 3A5OC 3IUCA 2A41A 4JHDB 4FWRA 3WT0A 2P9IB 1NGJA 3U4LA 4BR5A 5AQZA 3R6MA 5AQTA 3MN5A 4DCHA 4BRIA 3C7NB 5FPMA 2F9TA 2Q31A 4BRPA 3CETA 4PKGA 2E2OA 3JS6A 1X9JA 3LDOA 2DPNA 1BUPA 4CZJA 3LM9A 1QHAA 2GWJA 3IMXA 3QBWA 4EHTA 2QWPA 3QBXA 3A8YA 1JCGA 5AQGA 2YJEA 3I33A 1NM1A 4IWVA 3DXKB 1BA1A 3VPZA 3BEXA 3GE1A 3ULEB 3FZLA 3MN6A 2QWOA 4BRAA 3C0BA 4BRMA 4ISGA 4I6MA 5BN8A 3F9MA 4L3QA 2A6AA 4PKIA 3CIPA 4FWKA 1BA0A 2J4RA 1P8ZA 4XH4A 5FPDA 3U9DA 3ATVA 1NGBA 2E20A 2Q2RA 1NGIA 5LJWA 1HPMA 1MA9B 5AZIA 1QQMA 3QB0A 2GWKA 5AQSA 2Q97A 4FPBA 3EKSA 4CBUA 4JD2B 5KPRA 5AR0A 4WQ4A 3VGKA 1YUWA 2FF3B 4M7XA 1QZ6A 4CZFA 2P9KB 4EAHD 1DKGD 3GDQA 1GLBG 3SLCA 1TYQB 2BTFA 2HMPA 3UKUB 4WQ4C 4BGBA 4DHYA 4EFHA 4CBWA 1HKGA 3O4WA 3FZFA 1NGGA 5AQHA 2UYTA 1S22A 4CZKA 4PL7A 1ATRA 1DGKN 4QS8A 1K8KA 3GOIA 2P9SA 4LC9B 5BN9A 3BF1A 2CH5A 4BR9A 3ZETA 4CJ7A 1KAZA 3LDLA 4BG8A 5KPTA 1GLCG 4BVOA 3DXMA 4H0VB 2I7PA 1Z05A 3O1WA 3WQUA 2A5XA 1HLUA 4RCHA 2ASPA 3QFUA 4FWLA 2A42A 3L0QA 4H5WA 3A5LC 1V4TA 3UKRA 3UE5A 4BC3A 3D2EB 3H46O 2P9NA 2D4WA 3WXJA 3BP8A 3DJCA 3VEZA 2FXUA 3M3ZA 1GLFO 1HKCA 3H6EA 4CZEA 3AAQA 4H0XB 5E26A 4MLHA 2QW9A 4BGAA 4B1YB 2V7YA 1HKBA 4CBXA 5BRHA 5BRDA 1NWKA 4J8FA 4CZGA 4H0TB 1NGHA 1NLVA 5KQDA 3ENHA 3HI0A 3JXUA 5E84A 2Q0RA 1HUXA 2V7ZA 4BG9A 1LOTB 4H0OA 3TPQA 5LY3A 4ISEA 5I9EB 2HF3A 3VEOA 4FWOA 1XUPO 3ZX3A 1NGDA 2CGLA 5B8HA 3QFPA 3L6QA 2P9UA 2YHWA 3IFRA 1U2VB 2IVNA 5ADXA 4FOEA 2GELA 2PBDA 3GBTA 2YJFA 3CJ1A 4BQZA 5AZJA 2IVOA 2D0OA 1QQOA 4K42A 4CZIA 5JMVA 1JCFA 3CI5A 4C23A 1GLEG 3DWLA 4FL9A 1BDGA 3W3DA 4BRHA 4BC2A 3C7NA 3H45C 3IDHA 2D1KA 4Y0WA 5ADXH 1E4GT 3CHWA 3HSCA 3CQXA 5EOYA 3GG4A 4NB4A 3VENA 3WEEB 5AQQA 5AQWA 1KXPA 1NMDA 1NGFA 4FO0A 2P9PB 2QM1A 3H1QA 2Q0UA 2A40A 4BC4A 4AM6A 3MN7A 3S41A 3DXKA 3FZHA 3VGMA 3U9ZA 1MDUB 3ZEUB 1G99A 4RTFD 3ULEA 1IG8A 4H5VA 1WOQA 4BREA 5F1XA 4BRCA 4FWMA 4KBOA 5F0XA 4I6MB 4BR7A 3GL1A 3O6WA 2QWLA 1SQKA 4XEIA 2ZF5O 2BUPA 3EKUA 3A0IX 2GEMA 4H0PA 1GLDG 3D2FB 2YHYA 1KAXA 3D7EO 3SMSA 3H3OB 3LL3A 3VF4A 4CD1A 1C0FA 2I7NA 4HTLA 3ZX2A 3KHYA 4JD2A 4BC5A 2E1ZA 1ZBSA 2IIRA 4DB3A 2GUPA 3WXIA 3EO3A 3G25A 1GLJO 3MMVA 2E2NA 3LDQA 1Y64A 2P9KA 4H03B 3M6GA 1DEJA 4A62A 3UKUA 3TU5A 4K25A 3EL2A 4B1XB 5AQKA 3VOVA 5BR9A 3KZBA 4MO4A 4FSVA 3B8AX 3HM8A 2NRHA 3CJ9A 3SMPA 3O08A 2VYPA 3H3NO 3FZMA 3L4IA 2FLOA 2HF4A 4GY2B 3RSEB 4BRQA 3U8XA 3VEVA 3CJAA 3FLCO 5BRFA 1Q18A 1KAYA 2FSJA 4BRNA 2CGJA 4AM7A 4MO5A 2ZWHA 2OANA 3CQYA 2NZTA 3WXLA 2KHOA 4CZHA 2E2PA 5JICA 3D2EA 4JN4A 4EIAA 2PAVA 2NLXA 2E2QA 4FWQA 3VEWA 1GLAG 3CJBA 3UB5A 1EQYA 5JLHA 2QWRA 5BPMA 5AQJA 1JCEA 1OKJA 2VWBA 5FPEA 3MDQA 1RFQA 3SK3A 3VEXA 2QWMA 3OHRA 5AQXA 4JNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M63C 3VETA 4FWPA 1JXBA 1FXXA 4IO8A 3TWHA 3HOSA 1M1KO 4FZXC 3P5JA 3VTHA 3EE9A 1OH5A 1U2VA 3DAWA 2D0PA 4WQ5A 2YC1C 3DRSA 1RT4A 1NE5A 4DQRA 4JHDA 5J1EA 5SWMA 5AQPA 2OTLN 4M3XA 1BI4A 4KH4A 4M7YA 4BR4A 2ZGZA 2QWNA 2WUSA 1NGAA 1RT5A 5CE3A 4E7HA 3SUNA 5C24A 2FSKA 3KLEA 2D0BA 4YDUA 3LP2A 2W42A 1U45A 4DWIA 4I2PA 3R9PA 5C2DA 4FJ9A 4B1UB 1SKRA 4BVPA 4H5TA 3T1YK 4BEBA 5AQOA 3ZEUA 4LF9K 2BRZA 3ZSRA 4CEFA 2NRTA 4YOXA 4IXCA 1QSYA 1I3AA 1AHOA 3I8DA 4NLCA 5AZIB 1ATSA 4YOWA 4B9UA 4Z4IA 3FR0A 4MFBA 3J7YP 1T44A 2ITMA 3QMLA 2HHTA 4IOAL 1A5VA 2AA4A 1KRPA 4O8KA 4PL8A 1RTJA 4MLEA 4CJTA 3SF4D 4F9OA 3KTQA 4YY3K 4CJRA 1VSDA 1NBWA 3CFOA 1K8KB 2P9SB 3OYFA 2KFZA 3CW4A 3ZSZA 5EX5A 3Q7CA 4IJAA 4CF2A 1S3XA 4B9SA 5I42A 3J8AA 1TUYA 3TARA 2F4VK 1JL2A 1IKWA 4KV8A 1IV0A 1RBTA 3LWLA 5LMNK 3OYDA 3I55N 3ZT4A 3VQQA 1PX9A 2YCHA 1I6GA 5AQIA 4A2BA 4DUZK 1CZBA 2IDOA 4JKDA 1SN1A 5AQVA 3OYIA 1DJTA 1TKXA 2HOEA 2VG6A 4E3SA 2O8BA 3EEQA 3V9UA 3CXCM 4IDHA 4DTOA 3PIOL 3NH0A 2VG5A 1ZBUA 1T7PA 1R59O 3VF6A 4X62K 4JRPA 4JS5A 3KLHA 2QXLA 4CD3A 3CCRN 4C1NI 5J2NA 1YXQA 3O80A 4Y1DA 4FJMA 5JS2A 3VQ9A 4J2AA 3MCPA 3AVCA 1LCUA 1HJRA 5AQLA 2CH6A 4ID1A 2GV9A 1XMOK 2HBJA 2P9LA 3AVHA 3ITHA 2GX9A 5M1PA 3OYGA 2V51B 3BZKA 3KD5E 1VSHA 4F2RA 1VQ7N 1J6ZA 1L4VA 3WNFA 2WFBA 2VWKA 2PFUA 3RMDA 3ZLJA 2PYLA 4AHVA 3THYB 5AZJB 1NRAA 2E6LA 4DTRA 3VESA 4KHUA 3E9PA 3A5OC 5C42A 2YNIA 3AGRA 3KWIA 2P9IB 3SV3A 1NGJA 3R6MA 3IS9A 4BRIA 3AVKA 3C7NB 5FPMA 2F9TA 4KI4A 3CETA 5TKWA 3JS6A 4DSEA 4IFEA 4CZJA 1S6QA 3TSQA 1W9HA 2OYQA 3IMXA 3P38A 4EHTA 2G8VA 4BE7B 3QBXA 3OS0A 5M1KA 4UAEF 4B3TK 4FK2A 2BANA 4AHTA 3DRRA 1XI1A 1ZBLA 5D3GA 1BMRA 4CJ4A 3F9MA 4L3QA 4BWMA 1NOZA 2WOMA 3PO5A 4C8KA 2ITGA 4PY5A 3L3UA 3NVKA 1NGBA 4ID5A 3BGRA 4Z4CA 1QQMA 3OYHA 5HROA 3EKSA 1KV0A 4CGDA 5AR0A 3M8SA 3L2VA 4WFAL 5JVHL 4DS5A 3H08A 1P00A 4B08A 4CZFA 4CK2A 4EAHD 4FW2A 3SBTA 1L5UA 1OZZA 1LQHA 4BGBA 4EFHA 1HNWK 4CHZA 4JKCA 4CHQA 1LQQA 4OPJA 1B92A 4CZKA 4KPYA 3GOIA 4FJIA 4LC9B 4CJ7A 2CH5A 3ZETA 4Z4HA 4YNQA 1X9WA 5CHIA 4BDZA 4YORA 4DSIA 4AHSA 1VK0A 4DF4A 3V1QA 4DFPA 4H0VB 1Q82O 1VSLA 3VQ8A 3RMAA 4FLWA 3QFUA 2QI2A 4B3MK 3THXB 2A42A 4CF0A 4H5WA 4B9LA 2P5GA 5LMUK 3DJCA 1YVUA 1HKCA 3H6EA 4LSLA 1NG9A 4DTJA 1DT9A 5E26A 4MLHA 4CIGA 2QW9A 1NKBA 2V7YA 3VA0A 2HNZA 5BRDA 1TAQA 4KTQA 3G71N 4CERA 1NGHA 5KQDA 3MXMA 3HI0A 1W2BM 3JXUA 1NNEA 3MXJA 3VQ4A 5GAHP 4A5AA 4UAFE 3CYGA 2ASCA 4MDAA 5I9EB 3AVJA 1T7EA 1UOCA 1HMVA 3VEOA 4M41A 4C8LA 4ILJA 4IEIA 3QFPA 4BDPA 3L6QA 3RMBA 1VNAA 3QIPA 3K5LA 5ADXA 1KVBA 2E4LA 2GELA 1T8EA 4KHYA 3TAPA 1Q81O 1BISA 2IVOA 2Z1HA 3RR8A 3E7UX 2HMIA 3SQ1A 1C56A 4OPAA 4H4OA 1W0HA 1BDGA 3W3DA 2O8DB 3CMAN 4Y0WA 2KW4A 5EOYA 5HLFA 3CCQN 4N41A 2P9PB 1OH7A 3CMEN 2NY8X 3NE6A 3K58A 2O8EB 4AM6A 4ILHA 3MN7A 3S5TA 2GMOA 4Q5VA 4AF1A 1BQMA 4LSNA 3HXMA 4H5VA 5F1XA 4QAGA 4KB1A 4BRCA 4FWMA 4IG3A 3SUPA 3O6WA 4DFJA 2ZF5O 1ZBHA 3A0IX 3K0SA 5CY0A 4FZYA 1RBVA 3D7EO 1X9MA 1KC8O 2NRZA 3LL3A 3VF4A 4CD1A 4HTLA 2X74A 4JI3K 4KI6A 3LP3A 4JD2A 2E1ZA 3KKRA 4DR3K 3RRGA 5CR4A 3EO3A 5JS1A 3G25A 1GLJO 2E2NA 1Y64A 2P9KA 3O9RA 4H03B 3M6GA 2ZJQL 1QVGM 1KLNA 3L4QA 1U04A 1YHQN 5HRSA 3TU5A 1I6FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M63 C;  3VET A;  4FWP A;  1JXB A;  1FXX A;  4IO8 A;  3TWH A;  3HOS A;  1M1K O;  4FZX C;  3P5J A;  3VTH A;  3EE9 A;  1OH5 A;  1U2V A;  3DAW A;  2D0P A;  4WQ5 A;  2YC1 C;  3DRS A;  1RT4 A;  1NE5 A;  4DQR A;  4JHD A;  5J1E A;  5SWM A;  5AQP A;  2OTL N;  4M3X A;  1BI4 A;  4KH4 A;  4M7Y A;  4BR4 A;  2ZGZ A;  2QWN A;  2WUS A;  1NGA A;  1RT5 A;  5CE3 A;  4E7H A;  3SUN A;  5C24 A;  2FSK A;  3KLE A;  2D0B A;  4YDU A;  3LP2 A;  2W42 A;  1U45 A;  4DWI A;  4I2P A;  3R9P A;  5C2D A;  4FJ9 A;  4B1U B;  1SKR A;  4BVP A;  4H5T A;  3T1Y K;  4BEB A;  5AQO A;  3ZEU A;  4LF9 K;  2BRZ A;  3ZSR A;  4CEF A;  2NRT A;  4YOX A;  4IXC A;  1QSY A;  1I3A A;  1AHO A;  3I8D A;  4NLC A;  5AZI B;  1ATS A;  4YOW A;  4B9U A;  4Z4I A;  3FR0 A;  4MFB A;  3J7Y P;  1T44 A;  2ITM A;  3QML A;  2HHT A;  4IOA L;  1A5V A;  2AA4 A;  1KRP A;  4O8K A;  4PL8 A;  1RTJ A;  4MLE A;  4CJT A;  3SF4 D;  4F9O A;  3KTQ A;  4YY3 K;  4CJR A;  1VSD A;  1NBW A;  3CFO A;  1K8K B;  2P9S B;  3OYF A;  2KFZ A;  3CW4 A;  3ZSZ A;  5EX5 A;  3Q7C A;  4IJA A; 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