1NGDA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFNVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngdA04
3CIPA 3BUZB 2WUSA 3BF1A 3FZMA 1KXPA 1XQSC 3VF2A 3VEWA 2EWSA 4Y0WA 1YVNA 4EIAA 4BVOA 2F9WA 4ISEA 3CQXA 3M3ZA 3R9PA 3I33A 3FZLA 1D4XA 3ZX0A 2ZGZA 3O6WA 4WYBA 4FWOA 3UKRB 1JCGA 5BN9A 4CZJA 2E1ZA 4XH5A 5AZJA 2P9KA 1HKGA 3MK6A 3WEEA 3FZHA 1GLCG 2QWOA 1JCFA 1CZAN 3SJHA 1BOTO 4FWKA 5AQGA 1U2VA 3LDNA 2CH6A 2P9UA 2VCPA 1TUYA 2CH5A 5TKYA 3GG4A 4O5FA 2A3ZA 4CZLA 4O8KA 4DQ8A 3LDLA 4BRGA 4BC3A 1EQYA 3ZEUB 1TUUA 5JICA 4MO5A 1GLAG 5AQJA 3WXKA 4B1UB 3CHWA 4CBUA 5EVZA 1BO5O 3KZBA 4I6MA 1GLBG 2QWQA 3HI0A 3WT0A 1NGIA 3R6MA 5AQMA 4B1WB 3LM2A 2I7PA 4E1JA 4BG8A 3VPZA 4HTLA 5EX5A 4A61A 3RSEA 1R59O 5AQZA 3DJCA 1NGGA 5AR0A 3QMLA 3KVGA 3J8AA 4JNEA 3WXLA 1HPMA 1X9JA 4IJNA 4MO4A 4BR9A 4CZGA 3WQTA 4PKIA 3VGKA 3IUCA 3QB0A 3O1BA 3P4IA 3H3OB 2FXUA 1GLJO 1Y64A 3FFKB 4BRNA 3UKRA 1NGAA 2YHXA 3VENA 3LDPA 3LM9A 1QHAA 1K8KA 5FPMA 4B1VA 4IWVA 2QWNA 2NLXA 5JMVA 3U9DA 4IO8A 4FWLA 5AQIA 4DB3A 3HSCA 3CJ9A 3BF3A 2Q0RA 1RDWX 1WOQA 2QXLA 3TPQA 1BDGA 5FPNA 3JXUA 3MN9A 4FWNA 5AQUA 3ATUA 1X3MA 3WXJA 3ZEUA 1XUPO 2V7YA 4CJ7A 3A5OC 1RFQA 2Q2RA 2V51B 2HMPA 3ULEB 2CGLA 1HJOA 3WUHA 4RWTA 4ISGA 5EXWA 3HBTA 4F9OA 1NGEA 2BTFA 4BR0A 4CZHA 5AZIB 4PL8A 4CBXA 2H3GX 4BC2A 4GNIA 2QWLA 4BROA 4JD2B 3VERA 3A5LC 2YI1A 4BRQA 4FO0A 4H5NA 1WUAA 3A0IX 4QS7A 4M7YA 3L6QA 3VEXA 5LY3A 3M6GA 3VEYA 3VGLA 3LL3A 3W3DA 4XEIA 2FF3B 4BR2A 5JLFA 4H5TA 5F0XA 2YHYA 3H6EA 3GOIA 3C7NB 5AQTA 1Z05A 3ATVA 2NRHA 3EO3A 4BRIA 4RCHA 4MLHA 1HKBA 4I6MB 4YDUC 4FPAA 4WQ4C 4PKGA 4LC9B 3QICA 4FWMA 3L0QA 4IZ9A 4BGBA 3UB5A 3LDQA 5BN8A 4BGAA 1NM1A 3D2FB 1ATSA 4BRKA 3R8EA 1NGHA 3ULEA 1NBWA 4BC5A 1V4TA 1IG8A 1MA9B 4BQZA 5AQNA 1JCEA 2YJEA 3RSEB 4NB4A 2GELA 2HF3A 5AQPA 1HLUA 3HZ6A 5AZIA 4FWRA 2Q1NA 4FWPA 4A62A 1GLEG 3BP8A 4EAHD 1KAXA 1S3XA 1K8KB 4JD2A 2GWKA 3VEVA 4K25A 1T6CA 3AAQA 3IFRA 4H0XB 2P9PB 3UKUB 2BUPA 3EKSA 3KHYA 2GWJA 5EOYA 1J6ZA 4IJAA 4B1YB 3DXKA 1NGBA 3FZFA 3C7NA 4CZFA 5AQFA 1BU6O 2GTDA 4RTFD 4WQ5A 3ZETB 5KPRA 1QQOA 2D0PA 3VGMA 4FSVA 3CJBA 3EZWA 3UE5A 2AA4A 2D4WA 4BR4A 3DWLA 1GLLO 2Q31A 3D2FA 3ENHA 3MDQA 4FL9A 2AP1A 3O1WA 2E2NA 4CD1A 3CETA 3DXMA 1X3NA 2ITMA 2DPNA 2D0OA 5BRFA 5BRHA 2ASMA 1NGDA 3S41A 3BEXA 5AFUH 2E8AA 2FSNA 5AQRA 1SZ2A 5AQLA 2E2PA 2ZF5O 3MMVA 3FZKA 5AQYA 1RGIA 2QM1A 1DGKN 3I8BA 2A40A 1ZC6A 1LCUA 3ID8A 2UYTA 5ADXH 2GEMA 2P9PA 3UKUA 2GUPA 2A41A 2P9IB 4GY2B 4BRLA 2F9TA 3SMPA 3MCPA 3FE1A 4A2BA 3U4LA 1BA1A 4B1XB 4JAXA 3H1QA 5KPTA 3FLCO 5BPMA 1KAYA 1YAGA 2E2OA 2PAVA 2A42A 4XH4A 3ZETA 4BRMA 1C0FA 4FOIA 3CJ7A 1LOTB 3F9MA 5BR9A 1NGJA 3OHRA 4BRAA 4CZKA 3CI5A 2HF4A 4CI6A 2E2QA 4BRDA 3D2EA 1NWKA 3JS6A 2VYPA 4XH1A 1HX1A 3QFPA 5AQXA 3ZX3A 3O5BA 3D7EO 2KHOA 1E4FT 3WXIA 5AQHA 5BRDA 4PKHA 4BREA 5FPDA 4BVPA 3IDHA 4M7XA 2W41A 5F2RA 2OANA 3U9ZA 1Z6RA 4BRFA 3O80A 2E20A 4A2AA 3FGUA 1ATRA 1XC3A 3DXKB 3MN6A 2A6AA 3HM8A 4ISFA 2P9LB 4JHDB 2P9IA 5LJWA 5KPZA 4BQLA 1ZBSA 2P9NB 4BRCA 4CZMA 2IVNA 3DAWA 4H03B 5AQSA 2YHWA 3A5NC 4CD3A 2VWBA 3DXMB 3SLCA 1V4SA 1S22A 2FF6A 2ZWHA 3ENOA 4PL7A 1HKCA 3AAPA 2YCHA 3A5MC 3EL2A 1ZXOA 5BPLA 2Q36A 3VETA 3H3NO 4J8FA 1OKJA 3CERA 2HOEA 2FSKA 3C0BA 3VOVA 3CJAA 3H1VX 5AQWA 5BREA 4HWIA 2CGKA 4B9QA 1H1VA 5AQOA 1ESVA 2I7NA 4H0PA 4EHTA 3EN9A 1T6DA 4H0YB 2QWMA 2IVPA 4BR5A 3GL1A 1DKGD 3GE1A 3O8MA 2P9LA 2V52B 4JHDA 3L4IA 3WQUA 1MWKA 3SMSA 3A8YA 2P9NA 3AARA 3GDQA 3U8XA 4FPBA 1BG3A 2ASPA 3D2EB 3EKUA 3VESA 4AM6A 2E1YA 2IVOA 2W40A 3IMXA 3AY9A 3G25A 1BWFO 3FR0A 1Q18A 3CJCA 1IJJA 1YXQA 2A5XA 1KAZA 3ZX2A 5JLHA 4M63C 4BRPA 4L3QA 1NGCA 1QQMA 4EFHA 2YJFA 4DHYA 4K43A 1BA0A 2J4RA 4H0OA 2QWPA 1E4GT 4QS9A 5FPEA 1QZ6A 2IIRA 3GBTA 4WQ5C 4CBWA 3O08A 5CE3A 2D1KA 4H0VB 4C23A 3O4WA 3MN7A 2Q97A 1GLDG 1SQKA 4CZIA 3HTVA 2NZTA 4DCHA 1P8ZA 1NGFA 4BG9A 1HUXA 4H0TB 4BRHA 2P9SB 3VF4A 1ATNA 5BPNA 5AQKA 5I9EB 1TYQB 4AM7A 4BC4A 4KBOA 3W0LA 5KQDA 1C0GA 3CQYA 4H5WA 3M1FA 4FWQA 4H5VA 4FWSA 4QS8A 4YDUA 3TU5A 4WQ4A 5E26A 5ELZA 2ZGYA 3H46O 3VEZA 1DEJA 2PBDA 5AFUA 2FSJA 2QW9A 5AQVA 5EY4A 1T44A 3QFUA 3LDOA 3QBWA 5F1XA 1MDUB 4Z94A 1NLVA 1SAZA 4MLEA 5AZJB 5ADXA 2P9KB 3WEEB 3SK3A 4B1ZA 4H5RA 4FOEA 5B8HA 2Q0UA 2FLOA 3H45C 1U2VB 2ASOA 3B8AX 1QZ5A 2P9UB 3VF6A 1NMDA 1YUWA 1U6ZA 3CJ1A 4JN4A 1GLFO 4EHUA 2QWRA 2CGJA 2V7ZA 4K41A 2P9SA 4K42A 5AQQA 4BR7A 1QQNA 4IXCA 4NO7A 1MWMA 3VEOA 1TYQA 3QDKA 5LJVA 1G99A 3MN5A 5KQ8A 5E84A 1BUPA 4CZEA 2E88A 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT6A 4O4GA 2O8EA 2Z1HA 3BUZB 4IG0A 2WUSA 4DV0K 3V9XA 4JI4K 1YVNA 1VQ7N 2PYLA 3PY8A 3CMAN 4GVEA 1BQNA 3FZLA 1D4XA 3OYLA 4WYBA 3HM9A 1SV5A 1T03A 3OYGA 3QETA 3ZSZA 4XH5A 3MK6A 4B9TA 1TL3A 1YIJN 3SJHA 2YV0X 4KO0A 2FC0A 4OVLA 3DI6A 3O3FA 4E7KA 1EETA 3RR7A 2HW3A 1SUQA 1VHXA 3GG4A 4KHYA 4FLVA 4BRGA 4BC3A 1RBVA 1TUUA 3QI7A 2N69A 4CBUA 1IKXA 2QWQA 1N6QA 3WT0A 4AHUA 3ZT2A 1RBSA 4JKBA 1RILA 4DKWA 4IEEA 4RW7A 2HHVA 2HSTA 1WSEA 4KH5A 4Z4HA 4WCEL 3SNNA 4Y1DA 4OLAA 4JNEA 3THWA 1IV0A 1LW2A 4F3TA 4BE0A 2B5JA 4JI1K 1XNQK 1T7BA 3O3HA 4Z4CA 3P4IA 3CFOA 2FXUA 3H3OB 1Y64A 2E0HA 4IFYA 3UKRA 1NGAA 1ASUA 3HXMA 1SS6A 1WAFA 5FPMA 4B1VA 4GKKK 1ZVEA 3U9DA 1ZYVA 5AQIA 4UY8O 1TVRA 2O4GA 4E89A 5KRTA 3P5JA 2LJMA 1NKCA 2BRZA 3TPQA 1BDGA 4UJ0A 1N4NA 5JS1A 2RF2A 4FWNA 4OGCA 3KD1E 3SAGA 2V7YA 3CCLN 3A5OC 5KGXA 3NH2A 1S9EA 4KTWA 1Z25A 3QIPA 3WUHA 1WBDA 3K57A 3SYZA 4MDBA 5JVHL 4BR0A 3S3NA 2LY6A 4FW1A 1WSIA 5FLXO 3JAMO 4GNIA 1DLOA 4LSLA 3NGYA 1KSPA 1TL1A 4BRQA 4CEEA 4FO0A 1DTTA 1UA1A 1VAZA 1UOCA 3QERA 3VEYA 3VGLA 4CFBA 2LJ7A 2KBHA 3L56A 3HL8A 3EO3A 3BZCA 3HPHA 1NK9A 2KFZA 4RCHA 3R3LA 4I6MB 3PSIA 1S72N 4LC9B 3QICA 3PO5A 2O8BB 3M5RA 1NJYA 4BGAA 3D6RA 3D2FB 4EZ9A 1QSSA 1KFSA 4AHCA 1ASWA 5LMUK 3M8PA 3N4QA 4NB4A 4HHTA 2HF3A 2DY4A 4BWJA 5AZIA 2Q1NA 4Z4GA 4R79A 3ASMA 4WFAL 4OO1J 2RN2A 3BY5A 4CJTA 1K8KB 4B8CA 1BRZA 1DQ7A 2UXCK 3SV3A 3CCUN 4DV2K 5EOYA 1T7AA 4DF8A 3HO1A 5M1QA 1BU6O 4RTFD 1NK0A 2KGQA 3E7UX 2HHHK 2D4WA 4BR4A 3QEXA 4CJWA 4M3RA 2Q31A 3VQ4A 4CF8A 3ENHA 4CHOA 2E2NA 3CETA 2ITMA 3G4SN 4H8KA 1G15A 4CHZA 4E1NA 1NJXA 1SKRA 4BDZA 1I2VA 1NGDA 1C6VA 3S41A 2FBYA 2KKZA 1J53A 5AQLA 2E2PA 3MMVA 1HNXK 4CJ3A 4NCAA 3FZKA 3SCXA 3Q7BA 1DGKN 3CM6A 2NY9X 1LCUA 2UYTA 2P9PA 3UKUA 5KTQA 2XY8A 5C10A 3SMPA 1KFDA 3FE1A 3MCPA 4OPHA 3I0RA 4B1XB 2F4VK 3H1QA 3OYAA 1VSEA 1HJRA 5CYQA 1XWLA 4B3RK 5DMRA 3TSUA 3ZETA 4BRMA 4DTNA 4QAGA 1NGJA 4CZKA 4LF9K 3CI5A 1RBTA 2F8SA 2E2QA 3D2EA 1LWEA 3JS6A 4XH1A 1RT2A 4E7JA 5AQXA 3ZX3A 3O5BA 3LWMA 3TR8A 1YITN 2KHOA 4U7BA 3V4IA 5AQHA 1OH5A 3AA3A 5M1OA 5BRDA 4DV5K 4QCLA 1IBLK 2D0AA 4PKHA 5GAGP 4YOVA 3VA0A 3CYMA 1J54A 1HYVA 1VNAA 4M7XA 4CEZA 3AO3A 5F2RA 3L4QA 4M41A 1JLEA 4AQYK 3EE9A 4G1QA 3CFRA 3TAQA 4A2AA 3FGUA 3THYB 3T19A 3DLBA 2YHAA 3HPOA 3GKUA 3I56N 1NJWA 4LFCK 4YORA 4JS4A 4JHDB 2P9IA 5LJWA 1Q8IA 1YF5L 4FM2A 2HHUA 2NRVA 3A5NC 4CD3A 5C0YA 3AVHA 3Q7CA 2BH1A 3ZSQA 1VNBA 3NF8A 3C6AA 1VK0A 2HVIA 2D56A 2EX3A 2IDOA 4AILC 1S22A 3L3UA 2GUIA 3LPTA 3BGRA 3AA4A 3ENOA 4KI6A 4I2QA 3G6EN 3PX4A 1M1KO 3A5MC 3BZKA 1K6YA 4MFBA 3KKSA 3EZ5A 4M3WA 3KP1A 2B4JA 2FSKA 4OKKA 3H1VX 1C0TA 5BREA 2HBLA 1W2BM 1ESVA 5D3GA 2I7NA 1P0AA 2HMIA 3K0SA 1T6DA 3SUQA 1VQKN 4BR5A 4HUGA 3GL1A 4KYPA 1QSYA 3ZSXA 5LL6Z 3OJUA 3MXMA 3AVKA 3O8MA 4YFUA 2P9LA 3L4IA 1FW6A 1LW0A 3GDQA 4UAFE 3AARA 1NNEA 2YNHA 1TAUA 3VESA 3B6OA 2W40A 1EO1A 3IMXA 2KYQA 1BMRA 3OA9A 3J7ZO 4A5AA 4DSJA 2IAJA 1GOCA 1Q18A 3K58A 1BGXT 1IJJA 4DTOA 1KAZA 3ZX2A 1NGCA 1QQMA 2HBJA 3AV9A 4EFHA 4DHYA 4JV5K 4DV6K 3ZT0A 4KH6A 3J7AP 4DR4K 1CZBA 4KHSA 4CJEA 1F21A 3ZSRA 2IIRA 3GBTA 1JZBA 4WQ5C 1LV5A 4IFEA 1GPTA 3O9TA 1NRAA 1YJNN 1NKBA 1HNWK 3KLIA 3CM5A 1NJZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RT6 A;  4O4G A;  2O8E A;  2Z1H A;  3BUZ B;  4IG0 A;  2WUS A;  4DV0 K;  3V9X A;  4JI4 K;  1YVN A;  1VQ7 N;  2PYL A;  3PY8 A;  3CMA N;  4GVE A;  1BQN A;  3FZL A;  1D4X A;  3OYL A;  4WYB A;  3HM9 A;  1SV5 A;  1T03 A;  3OYG A;  3QET A;  3ZSZ A;  4XH5 A;  3MK6 A;  4B9T A;  1TL3 A;  1YIJ N;  3SJH A;  2YV0 X;  4KO0 A;  2FC0 A;  4OVL A;  3DI6 A;  3O3F A;  4E7K A;  1EET A;  3RR7 A;  2HW3 A;  1SUQ A;  1VHX A;  3GG4 A;  4KHY A;  4FLV A;  4BRG A;  4BC3 A;  1RBV A;  1TUU A;  3QI7 A;  2N69 A;  4CBU A;  1IKX A;  2QWQ A;  1N6Q A;  3WT0 A;  4AHU A;  3ZT2 A;  1RBS A;  4JKB A;  1RIL A;  4DKW A;  4IEE A;  4RW7 A;  2HHV A;  2HST A;  1WSE A;  4KH5 A;  4Z4H A;  4WCE L;  3SNN A;  4Y1D A;  4OLA A;  4JNE A;  3THW A;  1IV0 A;  1LW2 A;  4F3T A;  4BE0 A;  2B5J A;  4JI1 K;  1XNQ K;  1T7B A;  3O3H A;  4Z4C A;  3P4I A;  3CFO A;  2FXU A;  3H3O B;  1Y64 A;  2E0H A;  4IFY A;  3UKR A;  1NGA A;  1ASU A;  3HXM A;  1SS6 A;  1WAF A;  5FPM A;  4B1V A;  4GKK K;  1ZVE A;  3U9D A;  1ZYV A;  5AQI A;  4UY8 O;  1TVR A;  2O4G A;  4E89 A; 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