1NGDA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFNVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngdA04
2IVPA 5LY3A 4AM6A 4HWIA 1NLVA 4MLEA 3CQXA 1KAXA 2AP1A 4BRMA 4EHUA 5CE3A 4BREA 3GG4A 1CZAN 2HMPA 3QICA 3D2EA 3QFUA 3W0LA 1GLLO 4BR7A 1Q18A 2GUPA 3EKSA 2P9SB 1ZBSA 3LDLA 2EWSA 1NMDA 5BN8A 5BPLA 4WYBA 2GTDA 3UKRA 4H03B 1BWFO 3ZETB 3A5MC 4BR2A 2GWKA 1MWMA 1WUAA 3ZEUA 3CETA 4A2AA 2F9TA 4B1YB 3LDQA 1DEJA 4I6MA 3BUZB 5JLHA 4H5RA 5AQFA 3LM2A 4BR5A 1XUPO 2YHXA 1QQNA 3LDNA 2HOEA 3EKUA 3BF1A 5BRDA 5EX5A 3HTVA 3WXLA 5ADXA 2FF3B 3O80A 3GBTA 3IUCA 4BG8A 2QM1A 1U2VA 4BC5A 3A0IX 1NGIA 2FXUA 3DXKA 4DB3A 2P9NA 2FSJA 2E8AA 2CH6A 3ATVA 3U4LA 1X9JA 4A61A 3QB0A 3J8AA 3VF4A 4IJAA 5AQKA 3A5LC 3QFPA 3EL2A 1WOQA 4H0XB 2GEMA 2H3GX 4M7YA 2YJFA 1GLCG 5EVZA 3SMPA 3B8AX 4B1XB 4H5TA 1JCGA 3M1FA 2HF4A 3MCPA 5ELZA 2A40A 4BRKA 5BN9A 4BRLA 2P9LA 3AY9A 1ATSA 2E88A 3DJCA 3ZX3A 1NWKA 4H5NA 1YVNA 2F9WA 3D7EO 3VENA 3ZETA 1HX1A 4LC9B 3R6MA 3VEZA 4NO7A 2P9UB 1NGAA 1MDUB 3TU5A 1NGGA 3DXMB 3GDQA 1NGEA 4BROA 4CBXA 4K42A 1E4GT 5LJVA 4BC2A 3BP8A 2V52B 5AQZA 1ZXOA 4L3QA 1C0FA 1GLJO 4M7XA 1TYQA 2BTFA 3BEXA 1Z05A 4BG9A 4FPAA 3MK6A 2A41A 4A2BA 4PL8A 4PL7A 5LJWA 4H0YB 1YXQA 2UYTA 3HBTA 3AAPA 3H1VX 3UKRB 2QWPA 3IFRA 3CJBA 4QS7A 1X3MA 3LL3A 4DHYA 4IO8A 4DQ8A 3LDPA 5AQGA 3WEEA 3HI0A 3ZEUB 1D4XA 3QBWA 3CJ9A 1LOTB 2A5XA 4I6MB 2Q97A 3MN9A 2Q2RA 4XH1A 2GWJA 4CZGA 4ISGA 4YDUA 2PBDA 5FPEA 4FWOA 2NLXA 4AM7A 4CBWA 2CGLA 5AQIA 3OHRA 1C0GA 3KVGA 1U2VB 1J6ZA 2ZGZA 2VCPA 3DXKB 5TKYA 4PKGA 3RSEA 2E2OA 3U9DA 2P9NB 5AQRA 3JS6A 4BR0A 4KBOA 4ISFA 1QQMA 5AQNA 1KAZA 3QDKA 2WUSA 2E2QA 3ENHA 3VESA 1QZ6A 3VEVA 4J8FA 4H5VA 1TUUA 3MN6A 3ZX2A 2V7YA 5JICA 5AQWA 4BRQA 4FWRA 1RDWX 2P9IA 1NBWA 1ESVA 2YJEA 2Q0UA 3H45C 4B1VA 2P9LB 5F2RA 4B1ZA 4EFHA 4XEIA 3SK3A 1DKGD 1XQSC 3MMVA 5JLFA 1QQOA 5AQOA 1HKCA 1NGJA 1YAGA 3VEOA 2ZF5O 2GELA 4H0OA 4EHTA 3FZFA 5KQDA 3ENOA 1Y64A 3EZWA 4WQ5C 3VEWA 4WQ4C 3FLCO 4FOIA 1SAZA 5B8HA 4GNIA 4QS8A 3FZHA 2CH5A 2E20A 4FOEA 1NM1A 4HTLA 3JXUA 2IVOA 1TYQB 1GLEG 4BR9A 1KXPA 4FSVA 2A3ZA 2J4RA 5AQLA 3O1BA 3H6EA 1OKJA 3MDQA 3CJCA 2Q1NA 4JHDA 1BOTO 4BGBA 4EAHD 2DPNA 2PAVA 2ITMA 2V7ZA 2CGJA 5AQSA 5AZIA 2FSKA 3WEEB 5AFUH 3VF6A 4BQZA 5AQQA 4CZKA 4H0PA 4K25A 2VWBA 4IXCA 1BU6O 2NRHA 4IZ9A 4CZIA 4JN4A 5E84A 4BRGA 4Z94A 5AQVA 3U9ZA 3VGKA 3GL1A 3FZLA 4PKHA 1K8KA 1RFQA 1G99A 4H0VB 3FFKB 2YCHA 3HSCA 5AQPA 2KHOA 4CZMA 1V4TA 3LDOA 5AQUA 1GLFO 3LM9A 3CI5A 3MN7A 3RSEB 4BC3A 5FPMA 1GLDG 3CJ1A 4FPBA 2QWQA 4BQLA 3FZKA 3VF2A 2D4WA 3WQTA 4CZLA 4ISEA 1V4SA 2E1YA 2A42A 4H5WA 3C0BA 1U6ZA 3MN5A 5AQXA 2P9IB 4MO4A 3O1WA 2VYPA 2ZGYA 3HZ6A 3SMSA 4BGAA 5AQHA 5AQMA 3BF3A 3I8BA 3D2FA 3SLCA 1BA1A 1JCEA 1E4FT 5AR0A 1MA9B 5AFUA 4C23A 3O5BA 4B1UB 5FPDA 3EO3A 2I7PA 2BUPA 4MO5A 3R9PA 3DWLA 1EQYA 4M63C 4H0TB 4FWQA 4NB4A 2ZWHA 4BC4A 3U8XA 1IG8A 3C7NA 4JD2A 4EIAA 2V51B 1T6CA 5AQJA 3FZMA 3CHWA 4JHDB 1R59O 3H3OB 1DGKN 2QWLA 2I7NA 3VPZA 2YHYA 3W3DA 5F0XA 4BVPA 3O8MA 4BRHA 5AZIB 3UB5A 5F1XA 4CZJA 4E1JA 2P9PA 1YUWA 3AAQA 2FF6A 1QHAA 4FWMA 5ADXH 3L4IA 3SJHA 2W40A 1BDGA 2D1KA 1HJOA 1BO5O 3ULEA 5FPNA 2IVNA 4FWKA 5KPTA 4XH4A 1ZC6A 2E2PA 2QXLA 1K8KB 5BRHA 4DCHA 1ATNA 2QWMA 4QS9A 2D0OA 4IJNA 4JAXA 1S22A 3O4WA 1QZ5A 4CI6A 3UKUA 4BRPA 2IIRA 3FE1A 4RWTA 1HLUA 3ZX0A 2FSNA 4PKIA 5I9EB 4CBUA 5AZJA 5BREA 3TPQA 1RGIA 3QBXA 3FGUA 1BUPA 2A6AA 3R8EA 1H1VA 4CZFA 1HUXA 3A5NC 5AQYA 4CJ7A 1TUYA 4YDUC 4FL9A 2OANA 4CZHA 3WUHA 4BRDA 3D2FB 4IWVA 3H1QA 3CQYA 5EY4A 3CJ7A 1NGFA 1HKGA 2YI1A 5BRFA 3VGMA 1NGHA 4JNEA 3VOVA 4RTFD 1BG3A 1GLBG 3WXIA 1NGCA 2QWNA 4FWPA 4BR4A 2P9KA 1HPMA 2ASPA 3AARA 3KZBA 4RCHA 1T44A 1S3XA 2Q0RA 3C7NB 1SZ2A 4MLHA 3O08A 4JD2B 1MWKA 5KPZA 4BRAA 3G25A 3VEXA 4B1WB 5JMVA 3IMXA 4FWLA 4F9OA 2Q31A 3UE5A 1JCFA 1T6DA 5AQTA 4BRIA 2P9PB 3WQUA 3CJAA 2P9SA 5BPMA 3WXKA 3FR0A 1ATRA 5BR9A 4O8KA 3VERA 4CD1A 4A62A 1NGDA 3ULEB 5EXWA 4K43A 3ATUA 4O5FA 3EN9A 3QMLA 1LCUA 2E2NA 2Q36A 3WT0A 4FWNA 3IDHA 3M3ZA 4K41A 3A5OC 3ID8A 3KHYA 4BRNA 3UKUB 4BRCA 3D2EB 3S41A 5BPNA 3CIPA 3F9MA 2QW9A 3DAWA 4WQ5A 4CZEA 4WQ4A 4FWSA 5AZJB 3I33A 2ASMA 1NGBA 4BVOA 4FO0A 1IJJA 3L6QA 1HKBA 2YHWA 3P4IA 5KPRA 3O6WA 3CERA 2AA4A 1SQKA 3WXJA 3HM8A 5EOYA 5KQ8A 3VGLA 1X3NA 2FLOA 3A8YA 5E26A 2E1ZA 3VEYA 2W41A 3VETA 4XH5A 1KAYA 2HF3A 2QWOA 3L0QA 3GOIA 1Z6RA 1XC3A 2CGKA 2NZTA 3GE1A 4Y0WA 2D0PA 4GY2B 2ASOA 2P9KB 4CD3A 4BRFA 4B9QA 1BA0A 2P9UA 2QWRA 3DXMA 3M6GA 3H46O 3H3NO 1P8ZA 1GLAG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2N2QA 4CVNE 1M1KO 3LPTA 4FW1A 3K5NA 4ICLA 4KHNA 2AP1A 1CZAN 2HMPA 4JI0K 1RT4A 4M41A 2GUPA 4DV6K 4FK4A 1T8EA 1JJ2M 3SZ2A 2P9SB 3THXB 1T7EA 1NMDA 4IO9L 2HW3A 5BN8A 2GTDA 2XY7A 4KHYA 3C6UA 3ZETB 3A5MC 2I61A 2HNZA 2GWKA 4JKBA 1NMNA 1DEJA 4I6MA 3BUZB 5CYMA 5AQFA 3LM2A 3EKUA 1DTQA 3BF1A 3F9KA 2MBKA 2XRIA 1YF5L 1W7AA 3S5TA 4RW6A 3SJJA 1XI1A 2X6NA 2YKNA 3PX6A 2E8AA 3LAMA 3KLHA 1OZZA 5DMRA 3J8AA 2KBKA 5GAHP 3QERA 1QSYA 3TABA 4CGIA 2WTUA 2GEMA 1CXQA 2KZMA 2YJFA 1VQLN 1GLCG 1I3AA 4U67L 1JCGA 4ILJA 4CQKA 5BN9A 1BMRA 3G71N 2E88A 3DJCA 1TK5A 4JI5K 4CERA 5KGWA 2IDOA 5DK5A 1U49A 1NGAA 4BROA 3TAMA 3OYAA 1E4GT 4EP4A 4DTUA 3SQ2A 1I39A 4L3QA 1C0FA 4M7XA 1TAUA 1TYQA 3EY1A 3BEXA 1Z05A 2HSTA 4BG9A 3Q7CA 4PQUA 4FPAA 4DSIA 3MK6A 2A41A 4A2BA 3PO4A 2FC0A 1S1TA 4CJLA 1RBTA 1RDBA 4PL7A 1KFDA 4H0YB 2ZQBA 4YNQA 2NRZA 5M1NA 1JKHA 3UKRB 3IFRA 3CCRN 1WB9A 4OJRA 2KZZA 1X3MA 1O13A 4DHYA 4CJEA 1FK9A 3N4QA 4QOZB 3WEEA 5C12A 4UJ0A 3TARA 4FJXA 1W9HA 3R2VA 3MN9A 3ZT3A 4HUFA 4ISGA 3VQCA 4YDUA 1JXEA 2PZSA 4FWOA 4FM1A 4X64K 4BWMA 4M3TA 1ZBHA 1C0GA 1U2VB 1OMYA 4CHPA 2VCPA 5TKYA 4PKGA 3MXJA 2LR3A 2E2OA 3E7UX 3VQPA 3TTDA 4JRQA 3JS6A 4DWIA 4KBOA 4IBNA 1KAZA 3KD1E 2WUSA 3D0PA 4CF2A 4FLTA 2W6LA 3VESA 4H5VA 2V7YA 5AQWA 3QNNA 1RDUA 2YJEA 4FJIA 1B3CA 4AB0A 3O3FA 4E7JA 4B1VA 4CEEA 2OCEA 2P9LB 5F2RA 3ZSVA 3VTIA 4B1ZA 1VQPN 1DKGD 4OPJA 4KYPA 5JLFA 3IKMA 3KTQA 1IKVA 3VEOA 3CCQN 3PIOL 4BE0A 1HNWK 3ENOA 4FOIA 1SAZA 3P39A 1C56A 4AHSA 3AA3A 4E7HA 3AVKA 1NM1A 1WBBA 4ELVA 1VQ6N 2O8DB 1KXPA 1SUQA 1KC8O 4NLCA 4FSVA 5AQLA 1ZBLA 5EU7A 1OKJA 3AA4A 4BE7B 1CZ9A 5HRSA 2PYJA 2G8HA 4YOWA 5AQSA 2KGQA 4NLBA 3VA0A 1E3MA 4A59A 3BY5A 3VF6A 4BQZA 1UA1A 4F8RA 4MDAA 5AQQA 3CFOA 4CZKA 2VWBA 1GPTA 4JN4A 4BRGA 2RF2A 4DU1A 3H08A 2OTLN 3VGKA 2QK9A 2Y1JA 3FZLA 1SV5A 4PKHA 4OPHA 1K8KA 3M5RA 2YCHA 2G8KA 5AQPA 3L56A 3RSEB 4BC3A 5FPMA 1GLDG 2HBKA 2GX9A 4BQLA 1NNEA 1TI5A 3FZKA 1LAWA 1NRAA 1ZYVA 4M3YA 4C8MA 5KK4A 3HP6A 1S6QA 4CZLA 4ISEA 2NRWA 3BDPA 4WFNL 4DTJA 2A42A 5GADP 4H5WA 4IOAL 1U6ZA 1X9MA 2QA4N 4MO4A 3DM2A 2YX6A 2YIOA 2VYPA 3HPHA 4JI6K 1HJRA 4LF7K 3AVBA 5AQHA 3I8BA 1XMOK 3D2FA 4JYAK 3TTFA 1HNXK 3NF8A 1MA9B 5AR0A 4CHYA 1PTXA 3CCLN 3O5BA 5J2NA 2WBNA 1JL1A 4C1NK 4BE1A 2O8CB 1YJWN 3R9PA 1ZYWA 1XC9A 2OTJN 1TV6A 3OS2A 4E3SA 4XJXA 1I2UA 2ZWHA 4A5AA 4BC4A 5HLFA 4EIAA 2V51B 2DY4A 3FZMA 3SQ0A 4JHDB 1Z25A 1R59O 3H3OB 1DGKN 4TSXA 4F3TA 3VPZA 1N36K 1HNIA 5F0XA 2D5RA 3WNEA 1T7PA 1F21A 3OW2M 3IS9A 3QEXA 3DRSA 3UB5A 4E1JA 2P9PA 1T7BA 3AAQA 2FF6A 1QHAA 2XHBA 1EETA 5ADXH 1IO2A 1BDGA 1N33K 2D1KA 1HJOA 4KTZA 3U6FA 3NDKA 5FPNA 4FXDA 3TANA 2QXLA 3LP3A 2NNWA 2D0CA 4DTRA 1EWRA 1R0AA 1WSGA 4FVMA 4FLUA 4LF4K 4CFCA 1RDAA 3O9TA 4AHRA 3O4WA 3AVGA 3E1YA 1S9EA 3L2WA 1S1UA 1C55A 4B3TK 4FJNA 5CZ1A 3ZX0A 1JZBA 4OKEA 3LP1A 3FGUA 1WLJA 3R8EA 1BIZA 1RDDA 2G8UA 3N4PA 4WF9L 3OYDA 2VQFK 2OANA 2YV0X 1L4VA 2YHAA 5MLCQ 3O3HA 3THVA 3H1QA 4DSJA 4J2BA 5EY4A 1RBRA 4KI6A 3KWIA 3VGMA 2VQEK 4DF4A 4LFCK 1EWQA 4RTFD 1BG3A 1NGCA 2GMOA 2P9KA 1LV5A 3BZCA 1IG9A 1GPSA 4W5RA 2HHIA 2O8BA 3C7NB 5C10A 3GKUA 3O08A 3AA5X 4FCYA 3CFRA 1RT6A 3VEXA 3CM6A 4FWLA 4CJUA 1RILA 4B3MK 1JCFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2N2Q A;  4CVN E;  1M1K O;  3LPT A;  4FW1 A;  3K5N A;  4ICL A;  4KHN A;  2AP1 A;  1CZA N;  2HMP A;  4JI0 K;  1RT4 A;  4M41 A;  2GUP A;  4DV6 K;  4FK4 A;  1T8E A;  1JJ2 M;  3SZ2 A;  2P9S B;  3THX B;  1T7E A;  1NMD A;  4IO9 L;  2HW3 A;  5BN8 A;  2GTD A;  2XY7 A;  4KHY A;  3C6U A;  3ZET B;  3A5M C;  2I61 A;  2HNZ A;  2GWK A;  4JKB A;  1NMN A;  1DEJ A;  4I6M A;  3BUZ B;  5CYM A;  5AQF A;  3LM2 A;  3EKU A;  1DTQ A;  3BF1 A;  3F9K A;  2MBK A;  2XRI A;  1YF5 L;  1W7A A;  3S5T A;  4RW6 A;  3SJJ A;  1XI1 A;  2X6N A;  2YKN A;  3PX6 A;  2E8A A;  3LAM A;  3KLH A;  1OZZ A;  5DMR A;  3J8A A;  2KBK A;  5GAH P;  3QER A;  1QSY A;  3TAB A;  4CGI A;  2WTU A;  2GEM A;  1CXQ A;  2KZM A;  2YJF A;  1VQL N;  1GLC G;  1I3A A;  4U67 L;  1JCG A;  4ILJ A;  4CQK A;  5BN9 A;  1BMR A;  3G71 N;  2E88 A;  3DJC A;  1TK5 A;  4JI5 K;  4CER A;  5KGW A;  2IDO A;  5DK5 A;  1U49 A;  1NGA A;  4BRO A;  3TAM A;  3OYA A;  1E4G T;  4EP4 A;  4DTU A;  3SQ2 A;  1I39 A;  4L3Q A;  1C0F A;  4M7X A;  1TAU A;  1TYQ A;  3EY1 A;  3BEX A;  1Z05 A; 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