1NGDA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFNVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngdA04
3HTVA 3O08A 3LM9A 5AQSA 4K41A 4RWTA 3D2EA 4BR9A 1JCGA 4MO5A 1RGIA 3QBWA 1Q18A 4B1YB 5BRFA 3RSEA 2V7ZA 2P9IB 1T44A 3S41A 1U2VB 3QB0A 3HZ6A 4EIAA 3QBXA 4B9QA 1Y64A 2W40A 4C23A 4CBWA 2QW9A 2P9NA 2ITMA 1HKGA 5AQIA 1WOQA 4MLHA 5AQLA 4FWKA 5FPEA 4EFHA 5EY4A 3TPQA 4BGAA 4IJNA 5KPTA 4FSVA 3CQXA 4BREA 4FPBA 5LY3A 3VETA 2P9IA 1TUUA 1U2VA 1XC3A 1Z6RA 3A5MC 2QWPA 1GLEG 2ZWHA 4FOEA 3UB5A 2PAVA 2YJFA 2IVNA 3CJ9A 2QWMA 3H3OB 5AQUA 1LOTB 4FWMA 4CZIA 3FGUA 2HF3A 3GOIA 1BOTO 5BN9A 4BROA 4BRQA 4JHDB 3ENOA 2F9TA 1X3MA 3U9ZA 3L6QA 3MN9A 3BF1A 5KPZA 4BRGA 3ZEUB 1SQKA 2ZGYA 2KHOA 3VEZA 4BRCA 3O1WA 4PKHA 3WXKA 1NGCA 2QWNA 4EAHD 5CE3A 3EO3A 4IXCA 4H5TA 3CJ1A 4H03B 1ESVA 3EKUA 2VYPA 3UKRA 3I33A 3R8EA 4GY2B 4FWNA 1NGFA 3AAQA 1HPMA 3LDLA 5AQKA 4H5NA 3BF3A 4BC2A 3ZX2A 4FWSA 4L3QA 3W0LA 1GLBG 4FO0A 2ASOA 1QHAA 2P9SB 4JHDA 4IWVA 4B1ZA 4BG8A 1QZ5A 5F1XA 3O4WA 1HJOA 5AQHA 5ADXA 1C0GA 5EVZA 5AQRA 2FF6A 3H1QA 5JMVA 2E1ZA 4NB4A 3WEEA 5AQVA 1GLLO 1K8KA 3QFUA 2YJEA 4AM7A 3CHWA 2P9PB 5BPMA 4WQ4C 3FZLA 2UYTA 3R6MA 1ZXOA 4H5RA 3D2FB 2Q97A 3O80A 4BRKA 4BC5A 4BR5A 1NGHA 4K42A 5E84A 1BA1A 2E2QA 5AQWA 3O8MA 2HF4A 4B1UB 1GLAG 3CERA 1CZAN 2QXLA 2A41A 5F0XA 3GBTA 4QS7A 4EHTA 3VOVA 5B8HA 5EXWA 4GNIA 1NGGA 4CZLA 1T6DA 2E1YA 5AQGA 1BG3A 4JN4A 1D4XA 2FXUA 4YDUC 4ISFA 4BRNA 3U8XA 2BUPA 2CH6A 4M7XA 4B1XB 4DHYA 3CJ7A 2D0PA 3VPZA 1TYQA 4A62A 2HMPA 4CZEA 3FE1A 2HOEA 3HSCA 3H3NO 3D2FA 3WXLA 3MN7A 3SMPA 3VGLA 1BO5O 1JCFA 3QDKA 2GWKA 1S3XA 4BRFA 1GLFO 1X3NA 3ULEA 2NZTA 3VESA 5AR0A 3VF4A 2E8AA 3J8AA 4BG9A 3MMVA 3U4LA 1NGEA 3M1FA 3JS6A 2ASPA 1ATSA 4XH4A 5TKYA 3H6EA 4CZFA 1YVNA 3CJAA 2E2NA 3VEVA 4CZJA 2QM1A 1BWFO 5BRDA 3QFPA 2FSKA 1WUAA 4BVOA 3KZBA 1IJJA 1NGBA 4CJ7A 3KHYA 4A2AA 5AQFA 2YHXA 3ATUA 1V4TA 4I6MB 2WUSA 2ZF5O 3BEXA 1S22A 2E20A 5BREA 2Q0UA 4WQ5A 3ENHA 4H0PA 5FPMA 1HKCA 1KXPA 5I9EB 2W41A 4FWQA 4CD3A 3CETA 4K25A 2CGJA 5AZIB 2D0OA 1DKGD 1ZC6A 1KAYA 2E88A 4BC4A 1E4GT 3LDNA 1HUXA 1GLDG 4WQ4A 1P8ZA 4CD1A 1BUPA 4XEIA 5AQMA 4B1VA 3DAWA 4I6MA 4BRAA 1MWKA 2V7YA 3LDQA 3B8AX 3CI5A 3VEXA 3HBTA 3VEWA 5BRHA 1YXQA 2V52B 1MA9B 2V51B 1NGAA 2YCHA 3D7EO 5AZIA 1RDWX 5EOYA 4DCHA 1V4SA 3DXKB 2Q1NA 3WT0A 3FR0A 4H5VA 5F2RA 1XUPO 2ASMA 2GUPA 4MO4A 3O6WA 3VEOA 1HLUA 1X9JA 2IIRA 4LC9B 2OANA 2QWRA 1KAZA 1T6CA 2I7NA 1NMDA 4BRHA 4BR2A 3VENA 4CZKA 3A0IX 4QS8A 3DXMB 1GLCG 2AP1A 3ZEUA 2E2PA 4IZ9A 3U9DA 2YHWA 4NO7A 1NM1A 3CQYA 1DGKN 5LJWA 3L0QA 3C7NB 4F9OA 1IG8A 4BC3A 4JAXA 4CZGA 3SK3A 3DXKA 4FOIA 1BU6O 2A6AA 3SMSA 3VERA 1QZ6A 2A40A 1MWMA 4Y0WA 1BDGA 3JXUA 2A5XA 3QICA 4MLEA 3ZETB 1ATRA 3CJBA 3HI0A 5LJVA 5KQDA 4IO8A 1H1VA 2P9SA 4JD2B 1J6ZA 1NBWA 1RFQA 3IDHA 4H0XB 4A61A 5JLHA 3AARA 1NLVA 1E4FT 2DPNA 3DXMA 2NRHA 3BUZB 5ADXH 3VGMA 5BPLA 2P9UB 1YUWA 2E2OA 2P9PA 3GDQA 3C7NA 1BA0A 1NGJA 1TUYA 2P9KB 5AQTA 3EL2A 3RSEB 4EHUA 4BRPA 4PKGA 5AQPA 4XH1A 3A5OC 2IVOA 3EZWA 4H0YB 4FWRA 4H0TB 5AQQA 5EX5A 5BPNA 4E1JA 5AQXA 3CIPA 4DB3A 3ZX3A 1MDUB 2CGLA 4H0VB 4JD2A 3TU5A 3AAPA 3MN5A 1DEJA 2AA4A 3OHRA 1QQMA 3GL1A 3LDOA 4K43A 3C0BA 1NWKA 3A5NC 2Q36A 2IVPA 5ELZA 4M63C 3SLCA 4A2BA 3WQUA 2P9UA 3DJCA 3FZKA 3BP8A 3FLCO 2P9KA 5E26A 1YAGA 4FL9A 3P4IA 5AQYA 4HTLA 2F9WA 1KAXA 4CBUA 2FLOA 5AQOA 3IUCA 4M7YA 2Q31A 3IFRA 4FWPA 3MDQA 3I8BA 3H1VX 4BQLA 3SJHA 2Q0RA 3CJCA 3A8YA 2VWBA 4FWLA 3FFKB 2P9LB 4Z94A 3R9PA 3M6GA 4FPAA 4BR4A 4BRDA 3LM2A 3DWLA 5AQJA 2Q2RA 3WXJA 1GLJO 2FSJA 3MK6A 3ATVA 4DQ8A 4FWOA 4PKIA 3EN9A 2CH5A 2J4RA 2D1KA 3WXIA 4RTFD 1ZBSA 1QQNA 2GTDA 3H46O 4XH5A 1JCEA 4BGBA 4AM6A 3UKRB 5AQZA 2FF3B 4YDUA 3ID8A 4CI6A 2BTFA 2P9LA 3ZX0A 3LDPA 3WUHA 1XQSC 4HWIA 4JNEA 1U6ZA 2H3GX 3VF2A 1NGIA 2I7PA 3GE1A 5KPRA 2YHYA 4O5FA 3VEYA 4BQZA 2QWLA 5BR9A 1LCUA 4QS9A 2A42A 4CZHA 4ISGA 3WEEB 4ISEA 4B1WB 3LL3A 1K8KB 4BRMA 4H5WA 4CZMA 5KQ8A 1R59O 4H0OA 1SZ2A 3UE5A 3QMLA 3MCPA 2GWJA 1QQOA 2QWOA 4J8FA 3VGKA 4BR7A 2FSNA 4RCHA 2CGKA 3W3DA 1HX1A 2PBDA 4O8KA 4WQ5C 5AZJB 3KVGA 2QWQA 5AFUA 3FZHA 3UKUB 3M3ZA 3HM8A 3O5BA 1EQYA 5BN8A 2A3ZA 4BVPA 5JICA 4IJAA 1G99A 3FZMA 5FPDA 3VF6A 1TYQB 3D2EB 3MN6A 2GELA 3G25A 4PL7A 3FZFA 3WQTA 4PL8A 3L4IA 3H45C 3O1BA 5AQNA 5FPNA 3F9MA 3ULEB 1OKJA 2EWSA 5JLFA 5AZJA 1C0FA 4BRIA 4BRLA 4CBXA 3ZETA 4KBOA 3UKUA 3IMXA 2GEMA 2D4WA 2YI1A 4WYBA 1NGDA 3AY9A 4BR0A 1HKBA 2NLXA 1Z05A 2P9NB 1SAZA 5AFUH 3A5LC 3EKSA 2ZGZA 2VCPA 1ATNA 3GG4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O08A 3LM9A 5AQSA 4ZTJA 5HRSA 3D2EA 4BR9A 4M3YA 2HNYA 3M8QA 1XMOK 4PHTX 1ICAA 1ZBHA 4JKFA 4IBNA 4CJPA 5HROA 1EWQA 2P9IB 3B6PA 1QSLA 4B08A 3ENBA 3HZ6A 4B9QA 1Y64A 2W40A 4C23A 1YT3A 2P9NA 4FWKA 5FPEA 1JKHA 1OH7A 3TPQA 1N6QA 3KOXA 1TL3A 3S3OA 1WLJA 3CCEN 3PY8A 4I2PA 4CK2A 3J7AP 4IJNA 5KPTA 4DR7K 4FSVA 1W97L 4BREA 3QEIA 4FPBA 5LY3A 1WBDA 4M3TA 3K5OA 1GPSA 1U2VA 2JWLA 2AJQA 3LAMA 4QCLA 4CGHA 1GLEG 1C1BA 4DSIA 2JLEA 2JWKA 3ZSYA 3CFPA 2XRIA 1ASUA 3AVIA 3SUOA 3PSIA 4RW8A 3NGIA 3RMBA 3PLAA 4ILJA 4CZIA 1S1XA 4DUZK 1VQ4N 4F4KA 3OA9A 3ULDA 3BGRA 1N33K 3U9ZA 4UQGA 3L6QA 1NE5A 4WCEL 3AV9A 3ZEUB 1POIA 3P38A 3VEZA 3O1WA 5CE3A 4DF4A 4K8ZA 5FRNA 4H5TA 1KTQA 2VWKA 3TABA 1ESVA 3F5TA 4IFYA 4DTOA 2YNHA 4E7IA 1NGFA 1S9GA 1HPMA 3LDLA 4CHQA 3V9ZA 2E3FA 2B4JA 4FWSA 3W0LA 3OYBA 2G8FA 4B1ZA 4OO1J 5AQHA 2N2QA 4CEQA 3LP3A 3H1QA 5JMVA 3CPWM 4E3SA 4JKHA 5AQVA 3QI7A 4X66K 3VQ8A 4H4MA 4B9VA 3FZLA 3CCSN 3THXB 4E72A 2Q97A 3D2FB 3R3LA 4YHHK 4K42A 2O8DA 2E2QA 3HYFA 2O8CB 1JLFA 1C1AA 4B1UB 1WT7A 4LY7A 2QXLA 2A41A 1ASWA 3OYEA 2YC1C 4QS7A 3U3GA 2C1IA 4YFUA 1BG3A 2BUPA 2IGIA 3KWGA 4DHYA 3TTFA 1SS6A 2QKKA 3ZT0A 2HOEA 5GADP 3V1OA 3ZT1A 4IFVA 2IC3A 5HP1A 3O3FA 3VGLA 4CJSA 1BO5O 5J2NA 3HK2A 1BMRA 4Q5VA 4BRFA 1GLFO 1B92A 3RMCA 2NZTA 3IKMA 2LY5A 4KHYA 3NE6A 3MMVA 3BDPA 3M1FA 4H4OA 1ATSA 3SF4D 3G4SN 4W5TA 4FM1A 1YVNA 4E7LA 5BRDA 2FSKA 4B3RK 2HVHA 2Y1JA 1IJJA 4CJ7A 3AGKA 1GOBA 4I6MB 1CLQA 4K8XA 3HJFA 2ZF5O 1S22A 2HVIA 2Q0UA 4H0PA 1ITGA 4DV0K 1B9DA 3P1GA 1LV5A 1J5OA 3OVNA 1FXXA 4FW2A 4JI2K 4OPJA 2ZJQL 4DQRA 1MR4A 1ZC6A 2E88A 4BC4A 2YNFA 4DR1K 2HNDA 4B9SA 3K59A 4WQ4A 1N4NA 3NDKA 2N69A 4XEIA 1J53A 1HQUA 4E7HA 4JI8K 4KFBA 2O8FB 4BRAA 4G9ZA 3LDQA 4TSXA 1UOCA 4YOTA 4DSFA 3HBTA 1B3CA 3VEWA 1RDBA 2O4IA 3NF9A 3EYZA 5JVGL 3IS9A 1IBLK 3TARA 4DLGA 1UA0A 5EOYA 1T7EA 4DCHA 1I2UA 3DLRA 3FR0A 2SN3A 2ASMA 5F2RA 3QIPA 2NRWA 1RDDA 3VEOA 3ID6A 1HLUA 2O4GA 2OANA 2QWRA 3QNOA 5J2MA 1P0AA 1BQNA 1EP4A 3SBGA 4FJGA 2YKNA 5IWAK 4AF1A 4Z4EA 2E0HA 4PY5A 3MX2A 2AP1A 3ZEUA 3TTCA 3OTOK 4IZ9A 3RVCA 3WNFA 1VHXA 3MEDA 1NM1A 3SAFA 1DGKN 5LJWA 1N32K 4CEDA 4F9OA 3O3GA 1XC9A 3PX4A 4G1QA 5KRSA 4CZGA 2OZSA 1LWEA 3DXKA 2MBKA 1QZ6A 3J7YP 1NH5A 2MZ0A 3AVNA 3ZSZA 4M3UA 1BDGA 2QTDA 3JXUA 1HQEA 5SWMA 1JXBA 4MLEA 3AO4A 5EU7A 3CJBA 5LJVA 4IO8A 2E2FA 1FKOA 3AVAA 3TI0A 2KZZA 1KCFA 1NBWA 1RFQA 2X6NA 2E6MA 4H0XB 4A61A 5JLHA 1BI4A 4DQIA 3AARA 1KLMA 3DXMA 4DQPA 4FZYA 1U49A 2NRHA 4LSLA 3VGMA 1BISA 3ZCMA 1A5XA 4CF9A 1TUYA 3EL2A 2KLAA 4HUGA 2KKZA 4BRPA 4FJ7A 3A5OC 3EZWA 1S1WA 1TGOA 2O8CA 1KRPA 2B3CA 3IRXA 2OPPA 5BPNA 1NK4A 5AQXA 2ASCA 2UU9K 3CIPA 2BANA 1JLCA 1IKWA 2LSNA 1DEJA 2AA4A 1VSKA 1QQMA 4CGIA 3DLLL 1NWKA 1D9DA 1L3SA 4M42A 3EZ5A 1ZU3A 1VQ5N 4DR4K 4Z4GA 3RR8A 1QVFM 1LAVA 1ZUTA 1LW2A 1N36K 2P9KA 4DR5K 3KK3A 2KYQA 1TL1A 1NKCA 4KH6A 1CHZA 2D0AA 5HRNA 4DS4A 3HT3A 4FWPA 4FJKA 3I8BA 4JRQA 3WXMB 3K5LA 4FVUA 1TAQA 3HSTB 1DQ7A 3CJCA 3CCUN 4CERA 3A8YA 3MX5A 3SUNA 3KIOA 4Z94A 4ELUA 1JLQA 4FPAA 4RW4A 2Q2RA 5GIOA 2HHIA 3MK6A 1VAZA 5C2FA 3ATVA 4DTXA 1RBSA 3O4QA 3LPTA 4FCYA 4F3TA 3MXMA 4OJRA 1REVA 4JLHA 4RTFD 4DLEA 2F4VK 1YJ9N 5M1KA 4M3RA 1JCEA 4AM6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O08 A;  3LM9 A;  5AQS A;  4ZTJ A;  5HRS A;  3D2E A;  4BR9 A;  4M3Y A;  2HNY A;  3M8Q A;  1XMO K;  4PHT X;  1ICA A;  1ZBH A;  4JKF A;  4IBN A;  4CJP A;  5HRO A;  1EWQ A;  2P9I B;  3B6P A;  1QSL A;  4B08 A;  3ENB A;  3HZ6 A;  4B9Q A;  1Y64 A;  2W40 A;  4C23 A;  1YT3 A;  2P9N A;  4FWK A;  5FPE A;  1JKH A;  1OH7 A;  3TPQ A;  1N6Q A;  3KOX A;  1TL3 A;  3S3O A;  1WLJ A;  3CCE N;  3PY8 A;  4I2P A;  4CK2 A;  3J7A P;  4IJN A;  5KPT A;  4DR7 K;  4FSV A;  1W97 L;  4BRE A;  3QEI A;  4FPB A;  5LY3 A;  1WBD A;  4M3T A;  3K5O A;  1GPS A;  1U2V A;  2JWL A;  2AJQ A;  3LAM A;  4QCL A;  4CGH A;  1GLE G;  1C1B A;  4DSI A;  2JLE A;  2JWK A;  3ZSY A;  3CFP A;  2XRI A;  1ASU A;  3AVI A;  3SUO A;  3PSI A;  4RW8 A;  3NGI A;  3RMB A;  3PLA A;  4ILJ A;  4CZI A;  1S1X A;  4DUZ K;  1VQ4 N;  4F4K A;  3OA9 A;  3ULD A;  3BGR A;  1N33 K;  3U9Z A;  4UQG A;  3L6Q A;  1NE5 A;  4WCE L;  3AV9 A;  3ZEU B;  1POI A;  3P38 A;  3VEZ A;  3O1W A;  5CE3 A;  4DF4 A;  4K8Z A;  5FRN A;  4H5T A;  1KTQ A;  2VWK A;  3TAB A;  1ESV A;  3F5T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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