5JICA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
272
structure length
269
Chain Sequence
KVGIDAGGTLIKIVQEQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus (strain mw2)
total genus 95
structure length 269
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2016-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jicA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jicA01
5AR0A 3RSEA 3BF3A 4M7XA 3CJ7A 4YDUA 4HTLA 5BR9A 3UKRA 5BN8A 4XH4A 2YHYA 4O5FA 1HKCA 4H5VA 5BPNA 2V7ZA 2F9WA 5B8HA 3R6MA 3H1QA 3W3DA 2IVNA 2P9PA 4H5RA 4Z94A 4H0YB 4I6MA 4BRCA 1BUPA 4BC4A 2I7PA 3CJ9A 4MO4A 4BR7A 3ZX2A 1YAGA 2YHXA 3EO3A 1BU6O 2P9IB 2A41A 3C7NA 3CJ1A 3KVGA 2HOEA 3UKUB 1R59O 3U9ZA 3O08A 4KBOA 5BN9A 2FLOA 3DAWA 1YXQA 4EHUA 4BRFA 2E1YA 3CERA 3QMLA 5AQHA 4C23A 3EN9A 5AQZA 3O80A 4BQLA 3LDPA 4QS8A 2QWOA 2D0PA 3M6GA 2Q2RA 3QDKA 3JXUA 4H03B 2HF3A 1HX1A 2W41A 3R9PA 4RCHA 2OANA 4DCHA 3ZEUB 1X9JA 2P9KB 1ATSA 1JCEA 3H6EA 3WQUA 1P8ZA 3LDNA 3MCPA 1GLBG 4BC5A 2P9UB 3GE1A 3KZBA 1GLJO 3I33A 3AY9A 1XUPO 5EX5A 1NWKA 3MN7A 3HSCA 1HKBA 3GDQA 4H5NA 3FZHA 4B1XB 3M3ZA 2V52B 1TUUA 5KPTA 4BR0A 1QQMA 3C0BA 2P9SA 4JNEA 3WEEB 5EVZA 1XC3A 4BVOA 5EOYA 5AZIA 3BP8A 3QFUA 3P4IA 2FXUA 2Q0RA 2ZF5O 3MDQA 3CJCA 5EXWA 3VF6A 4A2BA 1SQKA 4CD1A 2HMPA 4JAXA 4BRAA 3MK6A 5AQTA 3GL1A 5AQJA 2FSKA 3D2EB 3IDHA 3MN6A 1GLCG 3DXKB 4CBWA 1T6DA 3VOVA 2E20A 1GLFO 5JMVA 1HPMA 2GTDA 2IVPA 1WOQA 1Y64A 2E1ZA 3ULEA 1C0GA 4F9OA 1SAZA 2CH6A 3SMSA 1ZBSA 4A2AA 5JLFA 1RDWX 3GG4A 3AARA 3CIPA 3VEWA 2QWRA 3DWLA 4FO0A 1E4GT 2VCPA 5ADXH 2WUSA 4BRKA 4PL8A 5AQVA 3HBTA 2E8AA 2I7NA 1NGGA 3J8AA 4H0VB 3O1BA 1QZ5A 1WUAA 3WUHA 1CZAN 4WYBA 4BGBA 4WQ4C 4H5WA 5AQRA 3RSEB 3VF4A 5FPDA 1KAXA 3O4WA 1YVNA 2PBDA 4FOEA 1E4FT 1NGJA 4XEIA 5AQWA 4B9QA 3MMVA 3GOIA 3UKRB 3QBWA 3D2FA 3A8YA 4BG8A 2EWSA 2CGJA 2V7YA 2P9PB 5E84A 3QB0A 5BRDA 4FWMA 4I6MB 5LJVA 4B1ZA 4EIAA 2FF3B 2P9NA 4FPAA 4CZLA 3L4IA 3C7NB 3VEVA 3DXMA 2GEMA 3O5BA 2FSJA 1S3XA 2E88A 2UYTA 2Q97A 2PAVA 3SK3A 3BUZB 3UE5A 4CZEA 3VEXA 1D4XA 4K43A 3VGLA 4J8FA 2P9LA 2Q31A 5F1XA 1BOTO 2IVOA 4IXCA 4BRQA 3A5NC 5AQKA 4L3QA 2D0OA 4BRMA 3ENOA 4GY2B 1ATNA 1GLEG 4WQ5C 4CBUA 1HLUA 3EKSA 1H1VA 4YDUC 3TPQA 4WQ5A 3JS6A 5AQQA 1EQYA 3WT0A 1RGIA 1ZC6A 1NGCA 4BRLA 4CZIA 3MN5A 4DB3A 5BRHA 4B1UB 5FPNA 2BUPA 4FL9A 3HTVA 5AQFA 2A3ZA 3CETA 3SLCA 5LJWA 5ADXA 4MLEA 3BEXA 1QQOA 4XH1A 5JLHA 1X3MA 1KAYA 5AQSA 2QM1A 2QWMA 1J6ZA 3DJCA 3QFPA 1NGHA 5AQLA 1MDUB 3FE1A 2VYPA 3A5LC 2P9SB 2QWPA 5AZJA 3OHRA 3U4LA 5BREA 5F0XA 3LM2A 2E2NA 4FWPA 5AQIA 5AZIB 3ATVA 4DHYA 2A40A 3CJBA 4FOIA 1ATRA 4LC9B 5CE3A 2A5XA 4BRPA 5JICA 2D1KA 4ISFA 1HJOA 3O1WA 4PKGA 1BO5O 1NBWA 4CZHA 4CZGA 4H0OA 4K41A 1X3NA 2YHWA 1KXPA 2KHOA 4IO8A 3VENA 4BR9A 1NGAA 4BR2A 4JD2A 5LY3A 3ZETA 1S22A 4IJAA 5FPMA 1MWKA 3SMPA 2H3GX 4MLHA 5KPZA 3HZ6A 3ULEB 3EZWA 2FSNA 1TYQA 1Z6RA 4NB4A 4AM7A 3VPZA 3LL3A 2GWJA 5TKYA 3LM9A 1RFQA 3H45C 3MN9A 4BREA 3B8AX 5E26A 4CZJA 1GLDG 4H0TB 1QQNA 1K8KA 1NMDA 5F2RA 2ASMA 5AQXA 3VEOA 2VWBA 2ZWHA 2CGLA 1BDGA 3WXKA 4FWSA 4EFHA 1JCFA 3F9MA 4BG9A 4WQ4A 5BPLA 3FR0A 4JHDA 2ASOA 4XH5A 2YCHA 3GBTA 3ZX3A 3FGUA 1TUYA 2CH5A 3D2FB 3FZMA 2YI1A 3ENHA 2QWNA 4B1VA 1U2VA 4IWVA 4QS9A 4BRHA 4FWQA 4PKIA 1YUWA 2P9NB 1XQSC 3SJHA 3FZFA 2E2PA 3QICA 3W0LA 3ZX0A 3ID8A 1JCGA 2NZTA 3DXMB 4RTFD 3S41A 3WXLA 2A6AA 4JN4A 4CI6A 1QHAA 4Y0WA 4FWRA 5AQPA 1Q18A 4O8KA 4BRNA 4H0XB 5BPMA 3H1VX 3BF1A 1GLLO 5KPRA 2ZGZA 3CQYA 4FWOA 3AAQA 1T6CA 3IMXA 3QBXA 4BRIA 1BWFO 1NGDA 3D7EO 5AQMA 4GNIA 2A42A 4CZKA 1G99A 2P9LB 1SZ2A 5AFUH 3LDQA 4A62A 2NRHA 3O6WA 2D4WA 4FWLA 2GWKA 5AQUA 2P9IA 5AQOA 3A5MC 2F9TA 4M63C 5AQNA 3A0IX 4B1WB 4BROA 3R8EA 3H3NO 1LOTB 4K25A 3UKUA 4FWNA 4AM6A 1U6ZA 4PKHA 1NGFA 4FSVA 2QWLA 1QZ6A 2W40A 1HUXA 3L0QA 3O8MA 1V4SA 3UB5A 3U9DA 1ESVA 3HM8A 1NGBA 4NO7A 3FFKB 4A61A 4CZMA 3VETA 4BR5A 2NLXA 3CI5A 2FF6A 4BQZA 4ISEA 2AA4A 2BTFA 2ZGYA 4CJ7A 1HKGA 1OKJA 4MO5A 3KHYA 2Q0UA 1GLAG 3ZEUA 1KAZA 3IFRA 2P9KA 2CGKA 5AZJB 3IUCA 1MA9B 1V4TA 3G25A 2QWQA 3EL2A 3VESA 3ATUA 2J4RA 1IG8A 2P9UA 3WQTA 1NM1A 1NLVA 1LCUA 1ZXOA 4BVPA 2GUPA 5AQGA 2DPNA 1NGEA 3VF2A 3LDOA 2QW9A 3VEYA 4FWKA 4BC3A 3WXIA 4IJNA 3CHWA 3VERA 4PL7A 1C0FA 5I9EB 1Z05A 3U8XA 4QS7A 3CJAA 3WEEA 2QXLA 2GELA 1IJJA 4JD2B 4CBXA 1DKGD 3ZETB 4CD3A 4E1JA 4BC2A 4BR4A 3M1FA 5ELZA 3L6QA 1MWMA 3H3OB 1BG3A 4FPBA 4DQ8A 4H5TA 1NGIA 4H0PA 4IZ9A 3H46O 1T44A 1TYQB 3FZLA 1BA1A 3HI0A 3CQXA 3LDLA 3TU5A 3FZKA 2V51B 5AFUA 1DGKN 4CZFA 1DEJA 5FPEA 4HWIA 3D2EA 4B1YB 1K8KB 4M7YA 3EKUA 2E2QA 3DXKA 3AAPA 4RWTA 1BA0A 4K42A 4BRDA 4BRGA 5AQYA 3WXJA 2YJFA 2IIRA 2Q1NA 4JHDB 3VEZA 3FLCO 2Q36A 2YJEA 5EY4A 2AP1A 2ASPA 2E2OA 3I8BA 3A5OC 4EAHD 5KQ8A 4BGAA 3VGMA 3VGKA 1U2VB 5KQDA 2ITMA 2HF4A 4EHTA 5BRFA 4ISGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KKOA 2DY4A 1SUQA 3CJ7A 3K5LA 4W5QA 3TAFA 4B9UA 3VQEA 4IOAL 4XH4A 1HKCA 5BPNA 3CCQN 3R6MA 3W3DA 2QTDA 2IVNA 4DQIA 3SUNA 3F5TA 3KK3A 3DMJA 3ZSRA 3CJ9A 4MO4A 4RW8A 4BR7A 4DV0K 1YAGA 3VMFB 2P9IB 3KVGA 1U47A 2HOEA 4ICLA 1KLMA 4J2DA 3P5JA 3TWHA 1HNVA 2RHKA 4FJ7A 5JS2A 3V9UA 3PY8A 3DAWA 4BRFA 2KW4A 4O8UA 2DFFA 3QMLA 4N41A 3KWIA 1YIJN 3O80A 2XY7A 4Y1DA 5BR8K 4LF9K 3AVCA 3CCVN 1UA1A 2HBMA 2KFNA 2OANA 4CVNE 2UU9K 4CERA 4CJVA 5DM7L 1P8ZA 3MCPA 3ZT3A 3OY9A 4BC5A 2P9UB 4CJUA 3GE1A 4KO0A 1XC9A 3EYZA 3S3MA 1HNWK 4B3OA 1GLJO 1XUPO 1ZBLA 3ZSZA 3HSCA 4H5NA 3TANA 3KWGA 4B1XB 1TKDA 4IFEA 5KPTA 3LZIA 4KHPK 1BI4B 4CFCA 4JS5A 5GIOA 4M41A 1O1WA 3C0BA 3AGKA 5J1EA 2O8FB 3K9JA 1SL1A 4UQGA 3WNEA 1VSLA 3P4IA 1S9EA 3MDQA 3CJCA 3AVBA 1LAVA 2PYJA 1SKWA 1J54A 4Y1CA 1SQKA 1NJWA 1VAZA 2JLEA 3S9HA 3T19A 2BGGA 5HRNA 3MK6A 4NXNK 1BL3A 1KVAA 3THXB 4X62K 3T3FA 1I39A 3HP9A 1GLCG 4X65K 2O8CA 2HHWA 2G8KA 4I2PA 5KRSA 3QERA 1HNZK 1Y64A 2E1ZA 3CCMN 4F9OA 5JLFA 1RDWX 3IS9A 3WNGA 3PSIA 4JK7A 1E4GT 3HPHA 5KGXA 2IOCA 2WUSA 3G71N 3WNHA 4M3ZA 1NGGA 5MLCQ 3O1BA 4I2QA 4FZXC 4DSJA 4H4MA 3WUHA 4U67L 4GKJK 2WC9A 4WYBA 4BGBA 1RDDA 5AQRA 3VF4A 5LMNK 3NGYA 1KAXA 2PBDA 3AVKA 1NGJA 1C0MA 1JXBA 3GOIA 4E7LA 4A5AA 1YTAA 4NCBA 3AVGA 4WFAL 4DTXA 2V7YA 4ID1A 5E84A 4Z4GA 5BRDA 4FWMA 1BGXT 5LJVA 4B1ZA 1IKYA 2HNZA 2D0CA 5SWMA 4CZLA 3L4IA 4BWMA 4B9MA 4I7FA 2QK9A 3M5RA 2UUBK 2Q97A 3SJJA 4DSLA 4YORA 4CJRA 4DSEA 3UE5A 3TARA 4IBNA 3VEXA 1RT3A 4K43A 3MXIA 4CE9A 4AILC 3E9PA 3PX0A 3CC2N 3TSUA 4DFKA 2Q31A 2IVOA 3MWTA 4DFPA 3OJUA 1IV0A 2G8FA 1I3AA 3OYEA 3V81A 4DTRA 3AVFA 1ATNA 4WQ5C 1NOYA 1BQNA 1TV6A 3JS6A 2ZE2A 2ATQA 1LW0A 2O4IA 3E9OA 4BRLA 3O4NA 3O9QA 4DB3A 1NKEA 2NRTA 4ID5A 4FL9A 5FDLA 3HTVA 5AQFA 3P31A 2A3ZA 3CETA 4OKJA 1ZBUA 4MLEA 1Q9XA 1LAWA 5JLHA 1X3MA 3ITHA 5AQSA 2QM1A 2QWMA 3OYFA 2LSNA 1VSIA 5FRNA 4C8NA 1NGHA 3C6UA 3CFOA 5M1OA 3U4LA 1OH5A 5JVGL 3LM2A 2E2NA 4DTOA 3AA2A 1YT3A 5T7BA 5J2PA 2A40A 2GBZA 4FLVA 5CE3A 1K6YA 1HJOA 3J7YP 1YJWN 2DTUA 4MQ3A 1U04A 2HB5A 1CZBA 4RW9A 2IGIA 4BY9C 1EKEA 1F21A 3HPOA 1HPZA 3VENA 1RBVA 2G8IA 4O55A 4KTQA 3ZETA 1QE1A 3IAYA 3OS0A 1NKBA 3DLEA 1MWKA 3LZJA 2O8CB 3TTCA 3ID6A 3HZ6A 3THWA 4OGEA 1TYQA 4DQRA 1S1VA 3HJFA 4MDBA 2G8UA 2OZSA 3MN9A 3B8AX 1RBRA 3L2UA 3P83D 4PQUA 4FJIA 3OYJA 3AO4A 2ASMA 1OH8A 5AQXA 5HOOA 2XO7A 4F8RA 1BDGA 3O4QA 3VQBA 1JCFA 4BG9A 4JHDA 4DG1A 4XH5A 3A2FA 3ZX3A 3D45A 1T3VA 3MECA 1EO1A 4DUZK 2QWNA 5K14A 3QNNA 3VQ4A 1N34K 4CJFA 5J2NA 4QS9A 4M42A 1ZYQA 4KRFA 5HRSA 4B8AB 1DLOA 3SBGA 1C1AA 1JLBA 4PKIA 2NRXA 1XQSC 3QICA 3L2RA 3HVTA 3ZX0A 1JCGA 2NZTA 4CGIA 1D9FA 3S41A 4IFYA 3OYGA 4CI6A 3KLIA 2PYLA 3H1VX 3ZSVA 4CF0A 1RT7A 2ZGZA 4G1QA 3CQYA 3AAQA 3MEDA 4AH9A 2OCEA 1BWFO 2PZSA 1EWRA 1NK7A 1G99A 2NRHA 3O6WA 2D4WA 1M1KO 3VQCA 4CEEA 1RT1A 3A5MC 3A0IX 3UKUA 1LOTB 4FWNA 4PKHA 4JI2K 4FSVA 1DTQA 2WTUA 3U9DA 1S9GA 3B6OA 4DFMA 2BDPA 4AHVA 3HM8A 4IEEA 1NGBA 4NO7A 4A61A 4KREA 5GAGP 3QO9A 3K5OA 2Z1GA 5M1FA 2Y1JA 1WBBA 4E89A 1QQCA 4LFCK 4CJ7A 1HKGA 2UXCK 3NH2A 4CCHA 2HHTA 5JVHL 1Z26A 5C2FA 4GW6A 5M1PA 3ISNC 4KH6A 3IFRA 2P9KA 2CGKA 1MA9B 3ATUA 1NK9A 4KAZA 4KH4A 1NLVA 4BWJA 1LCUA 1JLFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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