5F2RA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with amp-pcp
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'VGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f2rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f2rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f2rA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f2rA04
5AQJA 1YUWA 4CZLA 4FL9A 3VEZA 3IMXA 4GY2B 1LCUA 1YAGA 2P9IB 4BC3A 3WT0A 2Q97A 2CH6A 2Q31A 1P8ZA 4CD3A 1U2VB 1RGIA 3DXMB 3ZEUA 5B8HA 2YI1A 3SJHA 3VEVA 3SMSA 2I7NA 4BRFA 3HSCA 4FWQA 3VGKA 3JXUA 3O5BA 4A2BA 5AQFA 2QWRA 4B1WB 3WXJA 5F0XA 4H0YB 4B1XB 4B1UB 5JICA 3BF1A 3QFUA 2GWJA 3CERA 2A42A 3U8XA 3ID8A 3C7NA 2GUPA 3VF4A 3MN5A 4H5VA 4JNEA 1R59O 1BU6O 4K42A 5JMVA 1BOTO 3BUZB 3W3DA 4WQ5A 3VEOA 3ZX0A 1CZAN 4BRNA 5BPMA 4B9QA 4K43A 2YHYA 5AQQA 2D0PA 5BRFA 1X3NA 1K8KA 2ZWHA 3OHRA 4JD2A 4BRMA 4CI6A 4M7YA 4JAXA 1ZXOA 3ZX3A 2AA4A 3VF6A 4FWRA 3MMVA 1RDWX 1ESVA 4BRKA 3WXKA 3MCPA 4Y0WA 1BA1A 2QM1A 4FWLA 2BTFA 1QQOA 3WEEA 1BG3A 3O4WA 4FPBA 5ADXA 4WYBA 3WUHA 3R6MA 2A40A 2P9UB 3O1BA 5FPNA 2ZF5O 3FZHA 3CQYA 3LDLA 3WXIA 3AAQA 3VOVA 3TPQA 3ZX2A 5E84A 5AQHA 5AQXA 3EKSA 4EIAA 2Q0RA 2VWBA 4F9OA 4CD1A 2FF6A 4BQZA 1S3XA 3HI0A 1BUPA 4PL7A 4K41A 3HZ6A 4KBOA 2QWLA 3CJ7A 4H0PA 4WQ4A 3IUCA 1NLVA 3CHWA 3LDOA 4J8FA 4O8KA 4A2AA 4CBXA 2ASPA 1IJJA 3O1WA 4WQ5C 4DHYA 3VPZA 2P9NA 3GG4A 3C0BA 1KXPA 1J6ZA 1T6DA 3KHYA 1V4TA 4PL8A 1E4FT 1NGHA 5FPDA 1TUUA 3UKUA 3ZEUB 2ASMA 3DAWA 4CJ7A 3ATVA 4ISGA 4EFHA 2IVNA 2A41A 5LJWA 4BR7A 3IFRA 1BWFO 1MWKA 4H5TA 1GLFO 4LC9B 2QWMA 5BPNA 4XH5A 5AQSA 2E2QA 4CZFA 1GLJO 2HOEA 2Q1NA 3QICA 1NGAA 3L4IA 3C7NB 2A5XA 4PKHA 4H03B 5E26A 3UE5A 3H1QA 1G99A 4O5FA 4RCHA 2PAVA 5ADXH 4CZEA 5AQNA 1NGDA 1WOQA 3D7EO 4MO5A 4BRHA 4A62A 2QXLA 2GWKA 1NGEA 3QFPA 1EQYA 2V52B 1Z6RA 3SMPA 1K8KB 5AQUA 4BG8A 3HM8A 4JD2B 3A5LC 2YJFA 5AQVA 3LM9A 2QWQA 3RSEA 3A5OC 4CZMA 5F1XA 4HTLA 1NBWA 5AR0A 2P9PA 4WQ4C 3FZLA 2F9WA 5AQZA 5LJVA 4FO0A 4CZJA 3H46O 2YCHA 3EO3A 3WEEB 4M63C 4BRIA 2A6AA 2ZGYA 4BGBA 1HPMA 4BRDA 4BR5A 2GTDA 4B1YB 3UKRA 3LL3A 3CIPA 4H0OA 1HJOA 1JCEA 3BEXA 2D4WA 2FF3B 1NMDA 3S41A 5KQDA 3H3OB 1OKJA 3CJAA 3MN9A 5BPLA 5AQMA 1T44A 2YHXA 5FPEA 2QW9A 3BP8A 1BO5O 3VEWA 3QMLA 5AQTA 5AZIB 1HKCA 2E1ZA 3U4LA 2YJEA 4XH4A 4DCHA 3ENOA 3DWLA 2ASOA 1T6CA 2P9NB 2FSKA 1TYQA 3UKUB 2Q36A 4BRPA 3WXLA 3EKUA 3P4IA 1NGFA 3ZETA 3QDKA 3M1FA 3FZMA 3MN6A 1RFQA 4L3QA 5AQOA 4IO8A 5I9EB 2V7YA 3KZBA 5FPMA 4FSVA 5BREA 5JLFA 2A3ZA 3KVGA 3QB0A 4I6MA 3EN9A 1X3MA 5AZIA 4BC5A 4JN4A 3CI5A 3U9DA 3VESA 4Z94A 1HX1A 3CJCA 3DXKA 4EHTA 1NGJA 4FWNA 2Q2RA 1YXQA 4XEIA 3EZWA 1X9JA 1ZBSA 1XC3A 4FWMA 4E1JA 3I8BA 3LDQA 3RSEB 3A5MC 4EHUA 4B1VA 1GLBG 3B8AX 4IJAA 5CE3A 2P9PB 4PKGA 4BRQA 1YVNA 3O6WA 3CETA 4CZKA 2E20A 3VF2A 4CBUA 5JLHA 4H0VB 1XQSC 3G25A 4BRCA 4QS9A 4RWTA 5AQIA 1QQNA 1JCGA 3FLCO 2CH5A 2YHWA 3AY9A 1LOTB 2NLXA 4B1ZA 2I7PA 3O08A 2IIRA 1HLUA 2CGKA 3UKRB 4DB3A 3BF3A 2D0OA 4K25A 2FLOA 1DGKN 4FPAA 2ITMA 3FZFA 2E2NA 4BC4A 3D2EA 4FWKA 4NO7A 1XUPO 3H45C 5LY3A 4AM6A 3SLCA 2W41A 3M6GA 1ATNA 2EWSA 4HWIA 1H1VA 3VGLA 2DPNA 4JHDA 3JS6A 4BRGA 3DJCA 4QS7A 5EVZA 4YDUA 2P9SA 3CJ9A 5AQWA 5F2RA 4H5NA 1TYQB 4NB4A 4ISEA 1QHAA 2Q0UA 5AZJA 5AQGA 2E2OA 1KAYA 3FZKA 3QBXA 2PBDA 1HKBA 3IDHA 5AQRA 4XH1A 3VERA 4H0XB 3VENA 1SQKA 2FXUA 5EY4A 3ZETB 4MLEA 4BR4A 4EAHD 2P9KA 1D4XA 2QWNA 1C0FA 3GE1A 2HF3A 4MO4A 3VGMA 4BR2A 5BN8A 1E4GT 5BRDA 4RTFD 3FGUA 3AARA 3LDPA 2P9LA 2QWPA 4BR9A 3VEYA 5BR9A 5EX5A 2OANA 1MA9B 3D2FA 1Z05A 4H5RA 4FWPA 4BR0A 4BRAA 4A61A 4I6MB 3FE1A 5AQYA 5KPZA 3LM2A 5KPRA 2F9TA 4BC2A 3ULEA 1S22A 4BVOA 3I33A 2WUSA 3DXKB 1C0GA 3GDQA 1KAXA 1HKGA 3U9ZA 4IJNA 3VETA 2P9IA 4H5WA 2NRHA 1WUAA 4PKIA 1SAZA 4BVPA 2E8AA 3CQXA 3EL2A 2IVOA 1NGGA 3VEXA 1GLAG 1NGIA 2BUPA 3O8MA 1NGBA 1U2VA 3HBTA 1TUYA 3DXMA 2H3GX 1BDGA 2HMPA 5EXWA 1DKGD 4FWSA 2FSJA 3ATUA 5AFUA 4CZGA 3CJBA 3TU5A 3MN7A 4CZHA 4FOEA 5KQ8A 3M3ZA 2CGJA 3L0QA 4BRLA 5KPTA 3AAPA 4BG9A 4YDUC 3L6QA 1DEJA 4MLHA 1GLEG 3FR0A 3GL1A 2HF4A 2VCPA 2E88A 3A5NC 2GELA 1BA0A 2ZGZA 3CJ1A 4H0TB 2GEMA 2D1KA 5AQPA 2KHOA 1ATRA 2VYPA 5BN9A 1MDUB 5BRHA 3D2EB 1NGCA 2FSNA 2V51B 3O80A 4C23A 1KAZA 1QQMA 4GNIA 4BQLA 3HTVA 3ENHA 5EOYA 1Y64A 3A0IX 3H3NO 3J8AA 4CBWA 4JHDB 2V7ZA 4ISFA 5ELZA 3SK3A 2P9SB 2AP1A 5AZJB 1QZ6A 3H1VX 2UYTA 4BREA 3MK6A 1MWMA 4DQ8A 4FWOA 1JCFA 1SZ2A 2IVPA 3QBWA 2NZTA 1Q18A 3LDNA 4M7XA 5TKYA 1GLDG 2P9KB 4IZ9A 3WQTA 1V4SA 3A8YA 2W40A 3R9PA 5AQKA 2E1YA 1NWKA 1IG8A 1HUXA 4CZIA 3FFKB 1GLLO 2P9LB 2P9UA 3W0LA 1U6ZA 3H6EA 3R8EA 3F9MA 3D2FB 5AFUH 4IXCA 3MDQA 3GBTA 4QS8A 4AM7A 1GLCG 1NM1A 2J4RA 4BGAA 4FOIA 2CGLA 1ATSA 5AQLA 2E2PA 3GOIA 3WQUA 1ZC6A 3UB5A 4BROA 2QWOA 4IWVA 3ULEB 1QZ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQJA 4M3YA 4FL9A 2E3FA 4DQRA 1JKHA 1YAGA 4JKGB 2G8WA 3KIOA 3WT0A 2CH6A 3C65A 4YFUA 1VSLA 4OPJA 3SJHA 1ZYWA 3VEVA 3SMSA 3K59A 4CF2A 1NK9A 1U45A 4RW6A 3C6HA 3HSCA 1LWFA 4F4KA 2HNDA 3VGKA 4AHUA 3J7YP 4DSIA 4PWDA 5AQFA 4B9UA 3TABA 1WSJA 2FBYA 5F0XA 4H0YB 3CCMN 2O8FA 1TAQA 3BF1A 1HNWK 4UAEF 2A42A 5CZ2A 2IDOA 3CXCM 3I56N 3NCIA 4KHNA 2JWLA 1FK9A 1POIA 4C8MA 1BOTO 1EP4A 3BUZB 3CFOA 5JMVA 4Y1CA 3THXA 3K57A 4J2EA 1CZAN 4BRNA 4Z4CA 4YOYA 4IOCL 1X9MA 4AHRA 1W0HA 5BRFA 1Q9YA 3KKRA 1SUQA 3DM2A 4M7YA 5JENA 2DFHA 2AA4A 3K5MA 3MMVA 1OH7A 2RE2A 1S6PA 2Z1IA 1ASVA 3MCPA 5D3GA 3VN5A 2QM1A 3P5JA 5ADXA 3ZT1A 4BDZA 4RW8A 3KTQA 3O1BA 2O8BB 4OGEA 1EKEA 4RW9A 4EP5A 4ID1A 4N76A 1S1WA 4B8AB 3DRPA 2OPPA 1WAJA 3TPQA 5E84A 3K58A 5AQXA 2R7YA 1EO1A 5M1QA 4LY7A 3AVBA 5DMRA 4KHYA 5JS1A 4BQZA 4E7KA 1WT7A 4PL7A 3D6RA 4H0PA 2QWLA 1RNHA 4CGIA 1UA0A 4A57A 1S9EA 2YEOA 1N32K 1IJJA 1RBRA 4DTPA 3BY5A 4HUFA 2P9NA 4M45A 1J6ZA 3KHYA 4BDPA 1U49A 1TUUA 5CY0A 4LSLA 2A41A 5CYMA 4N56A 1T7EA 3TSQA 5J2NA 1NKBA 3I0SA 1TL3A 1KQSM 2F7TA 5J2PA 4LSNA 2JLEA 1LV5A 3HL8A 2OZMA 3MCAB 2E2QA 1L3VA 2O8FB 4DV5K 1TKDA 3MEGA 3QIOA 5E26A 4DV7K 1LQQA 1G99A 1VQPN 1HQEA 2D56A 3G10A 5ADXH 3THXB 1NGDA 1D5AA 2BH1A 3ZT4A 5GIPA 2GWKA 1KLMA 4GVMA 4HVJA 2QA4N 1JL2A 5AQUA 1SKWA 4JRPA 4C8LA 1XHXA 3N4PA 4Z4IA 1YTUA 4B9LA 4DTXA 1IH7A 3R3LA 3V9XA 4HUEA 4FO0A 3TR8A 4FYDA 1B3CA 4CHPA 1LWCA 3K5OA 2KQ2A 3CCVN 2ZGYA 4BGBA 1D8YA 4X62K 4E7HA 4UAFE 4B1YB 4ILJA 3HSTB 3LL3A 3SUPA 4JEPA 4Y1DA 1HJOA 1IBLK 4CJKA 5T7BA 2FF3B 3EZ5A 2XY5A 3S41A 5KQDA 5HRSA 3QNOA 3OYEA 3ZT3A 5AQTA 3QEIA 1ZVEA 2E1ZA 1IKVA 1C0UA 3U4LA 4H8KA 2YJEA 5TKWA 1LQIA 2P9NB 5CYQA 3SI6A 5H1SQ 5HROA 1TYQA 1JZAA 3T7ZA 3EKUA 3RRGA 1T1TA 3THWA 2X74A 1KVCA 1TV6A 1LAWA 4FJKA 3LDSA 4BE0A 4JKHA 1RFQA 4JI5K 3IG1A 2ZJPL 5AQOA 2OPRA 3DLLL 4FZYA 4ZTJA 4AAZA 2P51A 5BREA 1CN2A 1A5VA 5JLFA 4I6MA 4RW4A 4DSLA 2F96A 1OVQA 4GW6A 2UU9K 5AZIA 4BC5A 4E1MA 3EEQA 3M8QA 3DXKA 4EHTA 3OYAA 4FWNA 5C2FA 4YOTA 4CHQA 2HW3A 4IFYA 3EZWA 5K14A 1ZBSA 3RR7A 3D0PA 3LDQA 3ZCMA 3C94A 4EHUA 4B1VA 4DR7K 3NVKA 4DFJA 2VGNA 3QI7A 3V1QA 3KLGA 1ICAA 4PKGA 4IBNA 1T3VA 3O6WA 4HTUA 3CETA 2EHGA 5AJ3K 1VRUA 4BE2A 4H0VB 3WNGA 4BWMA 4R5PA 2KBHA 4I9LA 2E4LA 5AQIA 1MYNA 4DFPA 4W5OA 4EP4A 3RMDA 3U3YA 5BR8K 4B1ZA 4AEIA 1BIUA 1CXQA 3HP9A 2CGKA 2YKMA 1RT6A 1S1UA 3SQ2A 4K25A 4LFCK 3THYA 4BC4A 4DSKA 4KAZA 2HHQA 4FWKA 4QAGA 4CECA 1XUPO 2HHSA 4C8NA 5C25A 3U6FA 2XY8A 5FRNA 3KD5E 2AJQA 4LF9K 2ZJQL 3VGLA 1SL1A 3PIOL 1RTDA 3OYLA 3QEXA 1RTJA 4QS7A 5EVZA 3CJ9A 3CG7A 5AQWA 4H5NA 1TYQB 4NB4A 1QHAA 4DG1A 5CY4A 5KGWA 4CEQA 4W5QA 2PBDA 3THWB 3E9OA 3IDHA 5AQRA 1VSKA 3VENA 4H0XB 1YJ9N 1UA1A 5EY4A 4CJFA 3SAFA 2DFFA 2QWNA 3EYZA 5KGXA 2HF3A 4KRFA 4BR2A 4RTFD 4YHHK 3F73A 4BR9A 1Q7YO 1W9HA 5BR9A 3VQ9A 1ZUTA 1VSJA 2RKIA 3SV3A 4H5RA 1CZBA 1WSFA 2B5JA 4FWPA 4DTRA 4BRAA 1C55A 4I6MB 3FE1A 4ELTA 5FROA 5KPZA 4KKOA 3OY9A 3ISNC 3OS0A 3OYBA 5GAGP 3NDKA 3I33A 3DXKB 5J1EA 4FLVA 3U9ZA 4JS5A 1LW2A 2P9IA 1NOZA 3VQAA 2ZQBA 2FBXA 4DSEA 2BUPA 3MEDA 4UJ0A 1EXQA 1NGBA 2ETJA 4U67L 4NLBA 1TUYA 3LP1A 4CEDA 2F8SA 2DY4A 2PZSA 3ATUA 5AFUA 4CZGA 3SNNA 2OCEA 4B9MA 3V9WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5AQJ A;  4M3Y A;  4FL9 A;  2E3F A;  4DQR A;  1JKH A;  1YAG A;  4JKG B;  2G8W A;  3KIO A;  3WT0 A;  2CH6 A;  3C65 A;  4YFU A;  1VSL A;  4OPJ A;  3SJH A;  1ZYW A;  3VEV A;  3SMS A;  3K59 A;  4CF2 A;  1NK9 A;  1U45 A;  4RW6 A;  3C6H A;  3HSC A;  1LWF A;  4F4K A;  2HND A;  3VGK A;  4AHU A;  3J7Y P;  4DSI A;  4PWD A;  5AQF A;  4B9U A;  3TAB A;  1WSJ A;  2FBY A;  5F0X A;  4H0Y B;  3CCM N;  2O8F A;  1TAQ A;  3BF1 A;  1HNW K;  4UAE F;  2A42 A;  5CZ2 A;  2IDO A;  3CXC M;  3I56 N;  3NCI A;  4KHN A;  2JWL A;  1FK9 A;  1POI A;  4C8M A;  1BOT O;  1EP4 A;  3BUZ B;  3CFO A;  5JMV A;  4Y1C A;  3THX A;  3K57 A;  4J2E A;  1CZA N;  4BRN A;  4Z4C A;  4YOY A;  4IOC L;  1X9M A;  4AHR A;  1W0H A;  5BRF A;  1Q9Y A;  3KKR A;  1SUQ A;  3DM2 A;  4M7Y A;  5JEN A;  2DFH A;  2AA4 A;  3K5M A;  3MMV A;  1OH7 A;  2RE2 A;  1S6P A;  2Z1I A;  1ASV A;  3MCP A;  5D3G A;  3VN5 A;  2QM1 A;  3P5J A;  5ADX A;  3ZT1 A;  4BDZ A;  4RW8 A;  3KTQ A;  3O1B A;  2O8B B;  4OGE A;  1EKE A;  4RW9 A;  4EP5 A;  4ID1 A;  4N76 A;  1S1W A;  4B8A B; 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