5F2RA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with amp-pcp
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
VGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f2rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f2rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f2rA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f2rA04
5ELZA 4I6MB 2FF3B 4H5RA 4H0PA 1BU6O 4BRLA 2ZF5O 2GEMA 3IFRA 3S41A 4PL8A 3KVGA 3MMVA 5I9EB 3VEXA 4FWRA 2CH6A 2KHOA 4H0TB 5CE3A 2WUSA 4DB3A 1JCFA 3SJHA 3VEVA 2P9UA 3DXKB 3VF2A 5AQNA 3O08A 4CZHA 4CD3A 3CHWA 3W3DA 3WXLA 1NGJA 5AQZA 2HOEA 4BC5A 3CI5A 2PAVA 3DWLA 1S3XA 3L4IA 2NZTA 3JXUA 2HF3A 3JS6A 4FOIA 4JD2B 2QWQA 3IMXA 1NGIA 5AQMA 4MLEA 4H0YB 1HKCA 1IG8A 2A41A 4K25A 3O8MA 4FSVA 2PBDA 5AQUA 3VERA 1BWFO 4BRHA 4ISFA 2A40A 4IJAA 3R6MA 4B1WB 5F1XA 3WEEA 1YXQA 3DJCA 3TU5A 4WYBA 2Q97A 2ASPA 5F0XA 1GLEG 5BRFA 2IVNA 4ISGA 2CH5A 2E2NA 3HI0A 1YUWA 4QS9A 1P8ZA 2QWLA 4MO5A 5TKYA 3SLCA 3I33A 2ZGYA 3GDQA 4XEIA 4J8FA 1NM1A 2YHWA 4RTFD 4L3QA 4CZLA 5ADXH 2EWSA 2FF6A 2ASOA 3HM8A 4BRMA 3GOIA 3C7NA 4WQ4A 4IWVA 3GL1A 5EOYA 3VOVA 3BF1A 3AARA 3HZ6A 4I6MA 4XH1A 1MA9B 1GLBG 5B8HA 3A0IX 3RSEB 2GWJA 1TUUA 3CJBA 5JLFA 2P9NB 2VYPA 3CJ1A 3LDLA 4QS8A 3LDQA 4BGAA 3FGUA 1GLFO 3DXKA 2V52B 3QICA 3ATUA 4BQZA 3A5NC 2NRHA 4E1JA 1BOTO 2GWKA 1BO5O 4PKGA 4BRFA 2IIRA 3MN5A 5BRDA 3HTVA 2F9WA 5E26A 3WT0A 1T6DA 4JD2A 3UE5A 3H45C 3QMLA 4Y0WA 4A62A 2W40A 3CERA 3P4IA 1BDGA 3EL2A 4WQ5A 2HF4A 3L0QA 2IVOA 3H1QA 1QQMA 3VPZA 2F9TA 2E1YA 5AQLA 3C0BA 4CZJA 1DGKN 5AR0A 4H0OA 3ZETA 4CJ7A 3EO3A 4WQ4C 4NB4A 1S22A 4O5FA 3FZMA 1Z6RA 5AQXA 2I7NA 1NGCA 3VEZA 2QWPA 3FFKB 4FWOA 3A5MC 4FWPA 3WXJA 1NBWA 5FPEA 1HJOA 2J4RA 2A3ZA 3RSEA 1X3NA 1YVNA 5FPNA 5ADXA 2P9NA 2QM1A 4B1YB 3WUHA 3H46O 1Q18A 4B1UB 3LDOA 2Q1NA 4JHDB 1QHAA 5BR9A 4CBUA 3AAPA 4GNIA 4YDUC 5AZJB 2YHYA 4B1ZA 4B1VA 5AQSA 1KAZA 3CJAA 2P9KB 1NGAA 4FWLA 5KPTA 3GG4A 1U6ZA 3CJCA 4DQ8A 3IUCA 1ZBSA 4BC3A 4CZKA 5BN8A 3TPQA 3J8AA 1XC3A 1YAGA 3M1FA 4WQ5C 3VETA 4M7XA 3WQUA 4BC2A 5EXWA 3EKUA 2P9IB 4XH4A 2W41A 3SMPA 3R8EA 5BPNA 4BRIA 3BEXA 3MN6A 1QQOA 1HX1A 2A42A 4BRKA 1BUPA 4IJNA 1C0FA 1X3MA 1D4XA 4M63C 3MDQA 3BF3A 2AP1A 3O6WA 3ZX2A 4FL9A 4LC9B 3BP8A 5AQIA 1T6CA 1BG3A 2Q36A 5AQYA 4CZIA 2YHXA 2BUPA 4BROA 1HKBA 1CZAN 4BRDA 3A5OC 3LM9A 4K41A 3ZETB 1GLDG 4EHUA 3D2EB 4JN4A 3CJ7A 4RWTA 3SK3A 4C23A 3DXMB 4DCHA 2FSJA 1RFQA 2P9LB 2FSNA 3VF4A 5AQGA 4GY2B 2V7YA 5JMVA 4JHDA 3H1VX 2AA4A 4FOEA 1WUAA 3O4WA 4PKIA 1H1VA 5AZJA 5EVZA 3A8YA 2D0OA 2GELA 2P9KA 5BRHA 4AM6A 3GE1A 4BR4A 1OKJA 5F2RA 3ENOA 4BR5A 4DHYA 3O5BA 1SZ2A 2VCPA 2A6AA 3BUZB 5AQQA 1NGFA 3VF6A 3CQYA 2P9IA 2BTFA 1HUXA 4MO4A 3MCPA 5AQTA 2P9PB 4CZEA 3ATVA 4BGBA 4A61A 2E1ZA 3FZLA 4BREA 5KPRA 1K8KA 4M7YA 1NLVA 3H6EA 1ATNA 1C0GA 2QXLA 5EY4A 3U9DA 3FZHA 1NGGA 1V4SA 3GBTA 3O1BA 2E8AA 4QS7A 4NO7A 3SMSA 4A2AA 1NGDA 3UB5A 1QQNA 2D4WA 3DAWA 3KHYA 2CGLA 5AQKA 2V51B 3D2EA 4H5NA 3D7EO 4B1XB 4BR2A 2E88A 3M3ZA 2Q2RA 3MN9A 5AQWA 3DXMA 3W0LA 3EKSA 4BG8A 4H5TA 4BC4A 5KQDA 3VGKA 5LY3A 1R59O 3FZKA 4FWNA 3UKUB 2P9LA 2D1KA 3AAQA 3UKRA 4FPAA 2OANA 2H3GX 4EHTA 1MDUB 2Q0RA 1GLAG 2CGKA 5FPDA 2Q31A 5EX5A 3D2FB 1HPMA 4MLHA 4BRAA 2DPNA 3CQXA 4CZFA 5AQJA 1TYQB 3FLCO 1U2VA 1KAXA 3O1WA 1NGHA 4PKHA 2QWOA 4H0VB 4JNEA 1IJJA 5BN9A 2ZWHA 4XH5A 1NMDA 1XQSC 3VEOA 4O8KA 1TUYA 5AQFA 5BPMA 4B9QA 3ENHA 3U4LA 3VGLA 1NWKA 3QBXA 1LCUA 4BRGA 3U9ZA 2P9PA 3VEWA 4IXCA 1JCGA 3H3NO 5JLHA 5LJVA 2YCHA 4HWIA 2QWRA 3FR0A 3QDKA 4IO8A 3R9PA 2QWNA 1XUPO 4K43A 2E2OA 3CETA 4BQLA 1ZC6A 1J6ZA 4Z94A 3AY9A 2NLXA 3EZWA 1QZ5A 1K8KB 1KAYA 4BRCA 1BA0A 2VWBA 1Z05A 2ITMA 3QB0A 3MN7A 1ZXOA 1HLUA 3FZFA 1Y64A 2GTDA 3A5LC 3ZX3A 2QWMA 1RGIA 4IZ9A 1MWKA 3VESA 4H03B 3UKUA 3L6QA 4H5VA 1RDWX 1SAZA 2QW9A 2Q0UA 3MK6A 5AFUH 1NGBA 3QFPA 3D2FA 4EAHD 3LDNA 1LOTB 1BA1A 1TYQA 2I7PA 3UKRB 3LDPA 3ZEUB 1ATSA 1HKGA 1MWMA 3WXIA 3I8BA 5AQHA 4CD1A 1EQYA 4CZGA 4AM7A 2P9SA 1U2VB 3ULEA 5KQ8A 2FXUA 4PL7A 5BREA 1E4FT 3LL3A 5AZIB 2CGJA 2GUPA 4FWQA 5JICA 1ATRA 2IVPA 3LM2A 3F9MA 4BR9A 2E20A 2ASMA 4EIAA 3CJ9A 3HSCA 5FPMA 2A5XA 2YJEA 3ID8A 4RCHA 4KBOA 3WQTA 3EN9A 3O80A 4FWKA 3WXKA 3VENA 2V7ZA 1GLLO 3M6GA 3QFUA 5LJWA 5AQRA 1QZ6A 2HMPA 5BPLA 4FPBA 2P9UB 4EFHA 4BVOA 1G99A 4CI6A 5E84A 4YDUA 1T44A 3ZX0A 3H3OB 3U8XA 4F9OA 1DEJA 3G25A 4BRNA 4BR0A 4H0XB 3HBTA 1KXPA 1SQKA 2YJFA 4CZMA 3CIPA 4BR7A 4FO0A 3B8AX 3KZBA 4CBWA 2E2PA 4BG9A 2YI1A 3IDHA 3ZEUA 1NGEA 2ZGZA 5AQOA 5KPZA 3QBWA 5AFUA 4A2BA 1GLCG 3VEYA 4FWMA 3WEEB 4BVPA 1WOQA 2FSKA 3OHRA 1GLJO 2FLOA 4BRPA 4JAXA 4HTLA 5AZIA 4BRQA 1DKGD 1JCEA 2P9SB 4K42A 3ULEB 1V4TA 5AQVA 1X9JA 4H5WA 4FWSA 2D0PA 3FE1A 4ISEA 2UYTA 5AQPA 1ESVA 3C7NB 3VGMA 4CBXA 1E4GT 2E2QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ELZA 4I6MB 1WSEA 4LF9K 1BU6O 4J2AA 1RCHA 3S41A 4PL8A 3KVGA 1C56A 3ID6A 3VEXA 4KB0A 4FWRA 4OLAA 4H0TB 2X6NA 1ZYQA 1JCFA 3VEVA 4RG8A 3CF5L 3W3DA 3KLHA 2E2FA 4X65K 3IKMA 5SWMA 5AQZA 1TL3A 4BC5A 3VTIA 1S3XA 1VSEA 4N56A 2EX3A 2ZJQL 3OBWA 4JD2B 4O55A 4EZ9A 4MLEA 5AQMA 1JLBA 4K25A 1XI1A 2HVIA 2PBDA 3VERA 4CECA 1TAQA 4ISFA 2A40A 4CEZA 3SZ2A 1SKWA 1W2BM 1N34K 3R6MA 4B1WB 5F1XA 3N4QA 3WEEA 3VQPA 2O4IA 3TU5A 3RR8A 1VSKA 3D45A 4WYBA 1VQLN 2ASPA 5HRRA 3LPTA 5BRFA 2CH5A 2E2NA 1VAZA 4QS9A 1P8ZA 1ASWA 4MO5A 5TKYA 3SLCA 2N2QA 4J8FA 1NM1A 1N4NA 4NYNA 3K5LA 4RTFD 4DV1K 4DSEA 4CZLA 2FF6A 3HM8A 3V9SA 4CHOA 2G8KA 4HCCA 4XH1A 1MA9B 2A1RA 3IRXA 3A0IX 3RSEB 2IAJA 2GWJA 3CJBA 4IDKA 4KKOA 2P9NB 3KD5E 4IBNA 4UJ0A 4BGAA 1WT7A 4IKFA 5M1QA 3QICA 3AVFA 4JS5A 4FM1A 1S1UA 1MYNA 2QEXN 3RMDA 2O8CA 2NRHA 4KAZA 1RT6A 5M1PA 4NYFA 4M3UA 3HTVA 2KBJA 1S6QA 1XRSB 3WT0A 2KLAA 2IS3A 3EE9A 1T6DA 4CGJA 5JS2A 3O9QA 3KP1A 2JLEA 3QMLA 3TSUA 1LW2A 1EWRA 2KTQA 2DFHA 3P4IA 4DR2K 1ZUTA 5T7BA 3VPZA 1C55A 4CJVA 3EE8A 4CZJA 4KFBA 1QQCA 2ZM6K 4FM0A 3ZETA 4DV2K 3HOSA 3EYZA 4B9LA 1S22A 3WNGA 4DTNA 3VEZA 1TK5A 3A5MC 2O8EB 4MDAA 4FLZA 3L2UA 4FJ7A 1GOBA 3CCRN 3DLHA 2J4RA 2A3ZA 4DFJA 3G4SN 2BGGA 3J7YP 4CK3A 3MXIA 4BACA 2YKNA 4OPKA 3H46O 4PA1A 1Q18A 1HNVA 1YF5L 2Q1NA 1QHAA 1SN1A 3CPEA 4CBUA 4HVJA 5BR9A 4CGHA 2VGNA 4JK8A 4OGEA 3L3VA 5AQSA 4O0JA 1KAZA 3CJAA 5SZTA 2E6LA 3LAKA 4BECA 4FZXC 4FXDA 4DQSA 4DFPA 4BC3A 1JLAA 4CJRA 4FM2A 3QETA 4M7XA 4BC2A 1WB9A 1XHXA 3HO1A 4FVUA 2WONA 4CF2A 1VNAA 4XH4A 2HHXA 2W41A 4DMNA 2G8UA 3SMPA 4BRIA 1L3TA 1QQOA 2A42A 1BUPA 1RDCA 1C0FA 1D4XA 3MDQA 3B6PA 1NKEA 5CYMA 3BF3A 4KTQA 4CF9A 3ZSYA 3ZX2A 3C6UA 3IG1A 3DMJA 1CZAN 3A5OC 4H4MA 4E72A 4K41A 1I2VA 1GLDG 4LH4A 4OPJA 4EHUA 4JN4A 2HVHA 3CJ7A 4RWTA 2F8SA 1NPIA 1N8RO 3E1YA 1ZBIA 2B5JA 3ISNC 5HOOA 1WWNA 3UIQA 3SQ4A 2WFBA 2V7YA 4JHDA 1LWEA 2AA4A 4DR5K 1H1VA 4KO0A 1UA0A 4W5TA 5M1KA 1UWBA 4FLWA 2UUBK 4I9LA 3V1QA 1HYSA 2FC0A 2A6AA 4JI4K 1Q8IA 2I61A 4CJFA 3VQBA 3ZSZA 3SI6A 3BDPA 5GAEP 1U04A 2ATQA 4MO4A 2O8DA 2P9PB 3T3FA 1NOYA 3ATVA 4FZYA 1RT2A 1K8KA 3OBYA 4M7YA 1VQ8N 3TTDA 4YOYA 4IG0A 3PIOL 4KI4A 2O8FA 3SUNA 1OVQA 3FZHA 1DTQA 4M3XA 4YHHK 1A5XA 2X74A 1NGDA 4DFMA 1LV5A 4B9UA 2D4WA 3OJSA 4E3SA 2XY5A 1BK8A 3K5NA 3MN9A 4BC4A 5KQDA 5LY3A 3D6RA 4W5OA 2NUBA 1T7PA 3FZKA 4FWNA 3SNNA 3THXA 1IH7A 2KJAA 1VSMA 2OANA 2R7YA 1POIA 3T1HK 1GLAG 2ETJA 4FLTA 2RF2A 3C65A 3D2FB 4BRAA 1XNQK 2DPNA 1FKOA 1U2VA 1NGHA 3CCMN 3KLIA 1GPTA 1Z26A 2QWOA 4JNEA 3AA5X 5BN9A 3VEOA 1TUYA 5AQFA 4Y1CA 4B9QA 2FBVA 3VA0A 4DUYK 4YORA 3TAGA 4BRGA 3NGZA 3CG7A 3HRGA 4DV4K 1ZYWA 3DLEA 4IXCA 3SF4D 3VQ6A 1WLJA 3FR0A 3R9PA 1WN7A 1XUPO 1RDUA 3BZKA 1QZ5A 1KAYA 1ZBUA 4BE0A 2X6SA 1CZ9A 1VRUA 3NCIA 3PV8A 3MN7A 1YJ9N 2QKKA 3CQ8A 1Y64A 3F73A 4OKEA 2GTDA 4OPAA 4AAZA 2QWMA 4C8MA 3AVKA 3KLEA 1P0AA 2HHQA 3VESA 3UKUA 2GUIA 5HLFA 4IOAL 3CM5A 3LP2A 1NGBA 1S1XA 1J53A 4JKDA 4ID1A 2DTUA 1X1PA 2NRZA 3HP6A 2I7PA 1BA1A 3K58A 3CCQN 1MWMA 4CJKA 2WOMA 3MXMA 2Z1HA 3ZSWA 1RT1A 5AQHA 4TSXA 1IBKK 4CHYA 2UXDK 4HUEA 2P9SA 4BEBA 3TABA 3OY9A 1N5YA 3LL3A 4IFYA 5AZIB 2CGJA 3SPZA 1ATRA 4E89A 2YILA 3F9MA 4PY5A 1BCOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5ELZ A;  4I6M B;  1WSE A;  4LF9 K;  1BU6 O;  4J2A A;  1RCH A;  3S41 A;  4PL8 A;  3KVG A;  1C56 A;  3ID6 A;  3VEX A;  4KB0 A;  4FWR A;  4OLA A;  4H0T B;  2X6N A;  1ZYQ A;  1JCF A;  3VEV A;  4RG8 A;  3CF5 L;  3W3D A;  3KLH A;  2E2F A;  4X65 K;  3IKM A;  5SWM A;  5AQZ A;  1TL3 A;  4BC5 A;  3VTI A;  1S3X A;  1VSE A;  4N56 A;  2EX3 A;  2ZJQ L;  3OBW A;  4JD2 B;  4O55 A;  4EZ9 A;  4MLE A;  5AQM A;  1JLB A;  4K25 A;  1XI1 A;  2HVI A;  2PBD A;  3VER A;  4CEC A;  1TAQ A;  4ISF A;  2A40 A;  4CEZ A;  3SZ2 A;  1SKW A;  1W2B M;  1N34 K;  3R6M A;  4B1W B;  5F1X A;  3N4Q A;  3WEE A;  3VQP A;  2O4I A;  3TU5 A;  3RR8 A;  1VSK A;  3D45 A;  4WYB A;  1VQL N;  2ASP A;  5HRR A;  3LPT A;  5BRF A;  2CH5 A;  2E2N A;  1VAZ A;  4QS9 A;  1P8Z A;  1ASW A;  4MO5 A;  5TKY A;  3SLC A;  2N2Q A;  4J8F A;  1NM1 A;  1N4N A;  4NYN A;  3K5L A;  4RTF D;  4DV1 K;  4DSE A;  4CZL A;  2FF6 A;  3HM8 A;  3V9S A;  4CHO A;  2G8K A;  4HCC A;  4XH1 A;  1MA9 B;  2A1R A;  3IRX A;  3A0I X;  3RSE B;  2IAJ A;  2GWJ A;  3CJB A;  4IDK A;  4KKO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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