3D7EO

Enterococcus casseliflavus glycerol kinase mutant his232ala complexed with glycerol
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
495
structure length
495
Chain Sequence
NYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYAFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 174
structure length 495
sequence length 495
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO01
4J8FA 1LOTB 2H3GX 3CQXA 4WQ5C 1S22A 1U6ZA 5AQUA 3WEEA 3HM8A 4K25A 3ZETA 4A2BA 3FR0A 1KAXA 2YJEA 4IJNA 5KQDA 4FWSA 3WXKA 3H3OB 2GTDA 5AQXA 2CGLA 1XQSC 2GELA 4M63C 3O4WA 4BREA 1YAGA 2NRHA 2V51B 2E1YA 2E2PA 1NGFA 4K43A 4AM7A 2EWSA 4K41A 5AQIA 1T6CA 2QWLA 4BC4A 5AQVA 4DCHA 4NO7A 4BQZA 3GG4A 4EAHD 2FSKA 3I33A 3P4IA 1GLLO 3ULEB 4BC3A 3VEYA 2QWRA 5BR9A 1RGIA 1C0GA 2Q0UA 4QS8A 1V4TA 4H0YB 4BRCA 2FSJA 5BN8A 3DXMA 3VESA 5LY3A 3FGUA 1GLDG 2Q1NA 5AZJB 2P9LA 1C0FA 2HMPA 2I7NA 3ID8A 3MDQA 3ENHA 3SJHA 2GUPA 4BR4A 3H1QA 3GL1A 4WYBA 3HI0A 4H5WA 2E20A 1GLFO 4IJAA 5AFUH 4BRLA 3FZKA 5AQNA 4IZ9A 5EXWA 3MN6A 2ZGYA 2YHWA 1IG8A 2Q31A 4JHDB 5BRHA 1MDUB 3RSEA 4BVOA 4YDUA 4BRMA 4FWRA 3ENOA 5E84A 2E88A 4H03B 4JN4A 1ATSA 5FPEA 5E26A 2QW9A 3F9MA 4FPAA 4IO8A 3EZWA 1NMDA 3H3NO 2NLXA 3W0LA 2E2QA 2CGJA 3U4LA 3TU5A 4DQ8A 4CZEA 4BGAA 1KAZA 1HLUA 2QWQA 3C7NA 3WXIA 3D7EO 3LDQA 5AQGA 5AQSA 3U9DA 1SAZA 3VEXA 1GLAG 5AZIA 3UKUB 3O80A 5BN9A 3VGMA 1TUUA 4FWNA 1BO5O 4B9QA 1R59O 3QFPA 2I7PA 3ZX0A 2P9KA 3FLCO 3HBTA 3AY9A 5KPTA 4XH4A 1HX1A 4BC5A 2ASPA 4BR9A 1BOTO 2QWPA 3LM2A 4H5NA 3ZX2A 3SMPA 4JAXA 4FWQA 5AR0A 4Z94A 2V7YA 3CHWA 3DXKB 4L3QA 3R8EA 3ULEA 3VGLA 3CJCA 3KVGA 4CZIA 4HWIA 5KPRA 4O5FA 2NZTA 3KHYA 1ESVA 1V4SA 1X3NA 4CBXA 3U9ZA 4O8KA 2A40A 4PL7A 2D4WA 3JS6A 3L0QA 4H0TB 5FPMA 1ATNA 4BRKA 4MLHA 5AZJA 5KQ8A 3WQTA 1U2VB 1QZ6A 2BTFA 2OANA 3CERA 5LJWA 4RWTA 1MWKA 1OKJA 3H1VX 1T44A 2FF6A 2ZF5O 4BRNA 3KZBA 2W41A 4XEIA 3WUHA 4BGBA 1DGKN 2ITMA 2WUSA 3A5MC 3MN5A 3WXLA 1HJOA 2J4RA 4BR2A 2VWBA 3UKRB 4I6MB 3O8MA 3MCPA 3QFUA 4JHDA 4K42A 1K8KB 1BA1A 1GLCG 3CI5A 3CJBA 4BG8A 4IXCA 3S41A 4BRHA 2IIRA 1H1VA 3FZMA 5FPDA 1TYQB 2D0OA 3BF3A 5B8HA 4BRGA 5EY4A 4H5VA 4CBWA 3A0IX 3BUZB 1EQYA 4WQ5A 4BQLA 3I8BA 2CH5A 3WXJA 1BU6O 4BRDA 3VEWA 3M6GA 4FWMA 4H0PA 1KAYA 3A8YA 1TUYA 3MK6A 4Y0WA 2AP1A 5JMVA 3MN7A 4FOIA 3QMLA 4BRQA 5ADXA 3A5OC 4B1VA 2UYTA 3SLCA 2VCPA 1BWFO 4H0VB 3L4IA 2HF4A 2E1ZA 3UKUA 2W40A 3WQUA 3IFRA 4XH1A 5AQZA 1RDWX 3HSCA 1DKGD 1JCGA 4DHYA 1NGDA 4RTFD 2VYPA 3JXUA 1Y64A 3BP8A 3EKUA 2GEMA 3VEZA 2D0PA 3CETA 1S3XA 3WT0A 4BROA 4WQ4A 2A3ZA 3M1FA 1YXQA 3LL3A 1E4GT 3O5BA 3H45C 4CI6A 1MA9B 1IJJA 4MO5A 5JICA 1NLVA 1D4XA 3GOIA 2P9PA 4EFHA 3DXKA 1HUXA 4MO4A 4BR7A 3FZLA 3ZEUA 5BRDA 4PKHA 2QWOA 1NBWA 5AQYA 1WOQA 3CQYA 4FWOA 2QWMA 3AAQA 3D2FA 3O08A 4BC2A 4CZGA 4F9OA 4FO0A 3QICA 3MN9A 2P9UA 4ISFA 2P9SB 3UE5A 2D1KA 2Q2RA 2QWNA 4B1XB 4A61A 3O6WA 1U2VA 3HZ6A 2FSNA 5F2RA 4CD3A 3TPQA 2PBDA 3DXMB 4M7XA 5EVZA 4HTLA 1BA0A 3LM9A 3IDHA 4PKIA 4BRFA 3O1WA 5AQLA 3CJ9A 5AQQA 2PAVA 5AFUA 3VETA 3O1BA 4H0XB 4B1ZA 2AA4A 5AQKA 2E2OA 3C0BA 2P9NB 3CJ1A 4CZJA 2QXLA 4LC9B 4I6MA 4H0OA 1K8KA 1QZ5A 2FF3B 2GWKA 5TKYA 5AQTA 4DB3A 3BF1A 2YHXA 2V52B 3HTVA 4CJ7A 2P9IB 4JD2B 3A5NC 4MLEA 1GLJO 3EL2A 2F9TA 5CE3A 1NGCA 2YJFA 1YUWA 2BUPA 1NGBA 3MMVA 2A5XA 3ATVA 2YHYA 3ATUA 4PL8A 3VOVA 3OHRA 1BUPA 4B1WB 3AARA 2A42A 4BR0A 3W3DA 3C7NB 5JLHA 5AQWA 3H6EA 4JNEA 1ZC6A 5AQPA 3QB0A 4BR5A 1HPMA 1DEJA 3CJ7A 4EHUA 5KPZA 4H5RA 1P8ZA 3FZHA 5AZIB 1HKGA 5AQJA 2F9WA 3GDQA 3IUCA 1HKCA 3DAWA 3QBXA 3LDPA 2P9KB 4B1YB 5EOYA 3L6QA 5EX5A 2IVPA 4M7YA 4KBOA 2CH6A 4FWKA 4CZFA 1XUPO 3FFKB 1XC3A 1CZAN 1NM1A 4FSVA 2A41A 3DJCA 1LCUA 2IVOA 3VF6A 4CZMA 4GY2B 5BREA 1BDGA 4ISEA 1Z6RA 5LJVA 4YDUC 2P9SA 4WQ4C 1NGAA 3FZFA 4FPBA 1SQKA 3R6MA 4QS9A 3IMXA 1QQOA 3D2EB 3FE1A 1ZBSA 3B8AX 4BRIA 1QQMA 1T6DA 1ZXOA 3CJAA 1HKBA 3VEVA 5AQHA 3WEEB 3ZETB 3H46O 4EHTA 5JLFA 4BRAA 4FWLA 3G25A 1NGGA 1KXPA 3EO3A 1QHAA 2YCHA 4BRPA 3EN9A 3SK3A 4ISGA 2FLOA 3LDNA 3VPZA 5BPMA 3J8AA 1GLBG 4B1UB 2P9NA 1ATRA 4IWVA 1GLEG 2ZWHA 4PKGA 4CD1A 1WUAA 2DPNA 4CBUA 4FWPA 4FL9A 3VGKA 2E8AA 5AQOA 5FPNA 2Q36A 1X3MA 3U8XA 5AQFA 2ZGZA 2P9IA 4JD2A 4NB4A 4RCHA 4E1JA 1X9JA 2V7ZA 4FOEA 1Z05A 4A2AA 1QQNA 3BEXA 2FXUA 2GWJA 1JCFA 3LDOA 3SMSA 3VF2A 4CZKA 1Q18A 2CGKA 4BG9A 2P9LB 5ELZA 5F0XA 3GE1A 1NGEA 1MWMA 1NGIA 5BRFA 4GNIA 2E2NA 2ASOA 3LDLA 3M3ZA 3QDKA 2IVNA 1RFQA 2HF3A 2YI1A 3DWLA 4H5TA 4QS7A 3ZX3A 3GBTA 3UKRA 2Q0RA 2HOEA 5BPLA 5AQRA 4CZLA 1SZ2A 1JCEA 5I9EB 1J6ZA 1NWKA 1TYQA 4C23A 1BG3A 1G99A 3RSEB 5F1XA 3A5LC 3VF4A 4CZHA 3CIPA 5BPNA 2ASMA 3VERA 4A62A 1E4FT 3AAPA 4XH5A 2KHOA 2Q97A 3VENA 4EIAA 5AQMA 3EKSA 2P9PB 3UB5A 2QM1A 3QBWA 3ZEUB 1YVNA 4BVPA 1NGHA 3R9PA 3D2FB 5ADXH 2A6AA 1NGJA 3VEOA 2P9UB 4AM6A 3D2EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4J8FA 4Z4CA 2H3GX 4E1NA 3KJVA 3HM8A 3OA9A 3FR0A 4CW7B 1S5JA 1U48A 1OVQA 4HUGA 3VQ7A 1NJYA 2GTDA 1QSSA 4CGIA 3P5JA 4AH9A 4LF4K 2EWSA 5CZ1A 4K41A 1KVCA 2NRXA 1WSJA 1N36K 4DCHA 1DTTA 4BQZA 1TKZA 3P4IA 1WAJA 2EX3A 2KLAA 1UAXA 1QQCA 3CMEN 3LAMA 4I7FA 3OYNA 2P9LA 3G0ZA 2P51A 2GV9A 2I7NA 4M45A 4FLYA 1VQLN 2RHKA 5HRPA 4QOZB 4WYBA 4EZ6A 2E20A 4DUZK 1NK5A 3C65A 4DS4A 1QSYA 1WSIA 4R79A 1L5UA 5EXWA 3KKSA 4E7LA 4BDPA 3MN6A 4DV6K 4CJPA 3PX6A 2F7TA 4PHTX 1VSKA 4BRMA 4F3TA 3VQAA 4CFDA 3G4SN 1ATSA 2KFZA 2JGUA 2QW9A 1T7PA 3TSPA 4JLHA 4FPAA 3SCXA 4CK2A 3SQ2A 3J7AP 2P1JA 2Y1IA 2W6KA 4WF9L 4IEIA 2OA8A 2QWQA 3AVNA 5AQSA 4WFBL 4ZHRA 1LW0A 3ZT1A 3O9RA 1JL2A 1GLAG 3O80A 3U3GA 5BN9A 1TUUA 1BGXT 1BO5O 4FJGA 3QFPA 1CZ9A 3ZX0A 4J2DA 5J2PA 3FLCO 2UUCK 2X78A 4KH6A 1VHXA 5KPTA 4XH4A 4GV3A 3VMFB 3SPZA 1W0HA 4H5NA 3RVCA 2E6MA 4JAXA 2WONA 4FWQA 1KSPA 2IC3A 3OW2M 2DFHA 3VGLA 3CJCA 3KVGA 1NJXA 4DSLA 2O8BA 5KPRA 1WNSA 4CEZA 3T3FA 2VG5A 2RF2A 4FJNA 1V4SA 2HVHA 1LAWA 4O8KA 2A40A 1SL2A 3ASMA 2D4WA 4KHSA 2NRTA 3P38A 1ATNA 1K9MO 3MEEA 2Q3SA 2OPSA 2O8FB 2HNDA 1QZ6A 2PYJA 4JKGB 2OANA 3KLEA 5LJWA 1B92A 4JS4A 2FF6A 3KZBA 2W41A 4BGBA 1LWEA 3H08A 3MN5A 5CYMA 1ASUA 1HJOA 3CM5A 3THVA 4JI0K 3O8MA 4EP4A 4JHDA 4K42A 4KI6A 1GLCG 3CJBA 4CHZA 3CYMA 3SYZA 3NF8A 2IIRA 3QESA 1H1VA 3SUQA 1X9SA 2D0OA 4CGJA 3THXA 1RTIA 1XWLA 1HNZK 3OYCA 4H5VA 1OH8A 2OPPA 3LZIA 3A0IX 3L2UA 2CH5A 3WXJA 4CEDA 4GV9A 4LF8K 2VWKA 2VG6A 3MK6A 4Y0WA 3RMCA 5JMVA 5KI6A 3T19A 4BRQA 5ADXA 3A5OC 4DS5A 3DI6A 2X6SA 3VQEA 4W5TA 1QTMA 4NXNK 3L4IA 4EP5A 3Q7CA 2BDPA 4O4GA 2XHBA 4CJ4A 1JCGA 4RTFD 5I3UA 4HCBA 3EKUA 3ZT2A 2D0PA 4DTSA 5GIPA 5E41A 3KLFA 3U6FA 4B3TK 2XY8A 2HBMA 1IBLK 4IEEA 3K59A 2VQEK 4CJVA 2XY7A 3DLRA 2X74A 4MO5A 3GOIA 2P9PA 4EFHA 2DFFA 3SBTA 3HOTA 3FZLA 4JK7A 1NBWA 2A1SA 3DLBA 4AILC 3AAQA 3O08A 4BWMA 1REVA 2IOCA 4JI5K 2YV0X 3OYFA 2P9SB 1BCOA 4CF2A 2D1KA 3SQ1A 4KHUA 2Q2RA 1EWQA 1OH5A 1J9AA 4KTQA 3CC4N 3E9OA 2D5RA 1NJIO 3UIQA 5F2RA 4TSXA 4DTUA 4M7XA 2F96A 5HP1A 1Q86O 1BA0A 3V6DA 3MWPA 2GUIA 3HP6A 4CFCA 1W97L 4DTPA 3OYDA 4H0XB 2XY6A 1VSJA 2E2OA 2FBVA 3C0BA 1Q81O 2F8TA 1NKEA 2OTJN 2G8WA 4H0OA 1HNIA 1QZ5A 1NOYA 2GWKA 5TKYA 2Z1GA 4DU1A 1WBDA 1S9EA 2AJQA 4YHHK 3THWB 2YHXA 1XHZA 4X64K 4GMJB 1TL3A 4JD2B 1RDBA 2O4GA 3A5NC 2HHSA 4MLEA 5IWAK 1GOAA 3RRGA 1YT3A 5JVGL 2YJFA 2BUPA 3KWGA 2YKNA 2ZJRL 2PYLA 2YHYA 1RT2A 1GOBA 3SUNA 3AARA 2A42A 4BR0A 1I39A 3C7NB 3KLIA 3H6EA 4DR4K 4N47A 1OVYA 1YITN 1ZC6A 1HPMA 1DEJA 3CJ7A 5KPZA 4KB1A 4B9VA 4OPAA 5AQJA 3CCEN 1EO1A 2FBXA 3IUCA 3O9UA 3VQQA 4DQRA 3DAWA 3V9UA 3HM9A 3LDPA 3L3VA 4FLZA 3CCQN 3L6QA 4YNQA 2ITGA 2HNZA 2IVPA 4B8AB 1T05A 2D0AA 3FFKB 1XC3A 2A41A 3AGKA 2IVOA 4JS5A 2BANA 2BE2A 3OYGA 1U04A 3AA2A 3L2RA 4GY2B 5BREA 1T03A 4C1NI 3VQPA 3N4PA 4ISEA 1JLBA 3F9KA 4FPBA 3TTCA 1SQKA 1YTUA 3AGRA 3D2EB 3ZSOA 2OCEA 1N6QA 3VEVA 4GKKK 1KLNA 4K0KK 2BGGA 5JLFA 4HCCA 2HHUA 3ZLJA 1D8YA 1JKHA 3TARA 4BRPA 4Z4FA 2QK9A 2FLOA 4B1UB 4CFBA 3M8QA 3MXJA 3VQBA 4CHQA 5C0YA 2HNYA 2E8AA 5AQOA 1IBKK 3NBPA 2Q36A 5FRMA 5GAEP 1X3MA 1RBTA 3HPHA 5T7BA 3EYZA 4RW9A 1RCHA 1RTHA 3AVKA 2V7ZA 3BEXA 4CZKA 3SMSA 3OTOK 3V1OA 2Z1JA 5ELZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4J8F A;  1LOT B;  2H3G X;  3CQX A;  4WQ5 C;  1S22 A;  1U6Z A;  5AQU A;  3WEE A;  3HM8 A;  4K25 A;  3ZET A;  4A2B A;  3FR0 A;  1KAX A;  2YJE A;  4IJN A;  5KQD A;  4FWS A;  3WXK A;  3H3O B;  2GTD A;  5AQX A;  2CGL A;  1XQS C;  2GEL A;  4M63 C;  3O4W A;  4BRE A;  1YAG A;  2NRH A;  2V51 B;  2E1Y A;  2E2P A;  1NGF A;  4K43 A;  4AM7 A;  2EWS A;  4K41 A;  5AQI A;  1T6C A;  2QWL A;  4BC4 A;  5AQV A;  4DCH A;  4NO7 A;  4BQZ A;  3GG4 A;  4EAH D;  2FSK A;  3I33 A;  3P4I A;  1GLL O;  3ULE B;  4BC3 A;  3VEY A;  2QWR A;  5BR9 A;  1RGI A;  1C0G A;  2Q0U A;  4QS8 A;  1V4T A;  4H0Y B;  4BRC A;  2FSJ A;  5BN8 A;  3DXM A;  3VES A;  5LY3 A;  3FGU A;  1GLD G;  2Q1N A;  5AZJ B;  2P9L A;  1C0F A;  2HMP A;  2I7N A;  3ID8 A;  3MDQ A;  3ENH A;  3SJH A;  2GUP A;  4BR4 A;  3H1Q A;  3GL1 A;  4WYB A;  3HI0 A;  4H5W A;  2E20 A;  1GLF O;  4IJA A;  5AFU H;  4BRL A;  3FZK A;  5AQN A;  4IZ9 A;  5EXW A;  3MN6 A;  2ZGY A;  2YHW A;  1IG8 A;  2Q31 A;  4JHD B;  5BRH A;  1MDU B;  3RSE A;  4BVO A;  4YDU A;  4BRM A;  4FWR A;  3ENO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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