3D7EO

Enterococcus casseliflavus glycerol kinase mutant his232ala complexed with glycerol
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
495
structure length
495
Chain Sequence
NYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYAFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
total genus 174
structure length 495
sequence length 495
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO01
2P9KA 1GLBG 4CD3A 1YVNA 4CZIA 3UKRA 2EWSA 1R59O 4FOIA 1MWKA 2QWOA 1ATNA 2YHYA 5CE3A 5AQTA 3WT0A 2P9UA 3D2FB 3UB5A 2ZGZA 3EO3A 5AQQA 3JXUA 3R9PA 4PKGA 3VPZA 5F0XA 2V7YA 4EIAA 3FZLA 4BRAA 3WXJA 1E4GT 3GL1A 2IVPA 4FO0A 3BF1A 4RTFD 5EOYA 1TUYA 2P9LB 4K25A 2QWMA 3OHRA 3W0LA 3O5BA 4H5TA 1K8KA 2ASPA 1NGJA 4DB3A 5AQFA 2GWJA 3WXKA 3VGMA 3W3DA 2E20A 4O8KA 4B1UB 4FSVA 4BRHA 4BR2A 1QQNA 5AQUA 3EKUA 3QBWA 1XC3A 3FGUA 4FWSA 1QZ5A 1QHAA 3U9DA 5F2RA 5E84A 3DAWA 2GTDA 4FWOA 1V4TA 3C7NB 2VYPA 5EVZA 4XEIA 2ZGYA 3FZMA 3O80A 4FWQA 3EL2A 4KBOA 1BA0A 2ITMA 1HKBA 2E88A 3ID8A 4BC4A 1NGGA 3H3OB 1LCUA 4CZEA 3D7EO 1SZ2A 3QICA 5AQSA 1V4SA 3L0QA 4HTLA 4FPBA 4YDUA 2GEMA 5FPEA 3DWLA 2P9SB 2I7PA 4M63C 4A2BA 4CZKA 3EN9A 5BREA 2A5XA 1X9JA 4EHUA 4FWKA 2P9KB 2HOEA 3U9ZA 3MMVA 3H45C 5AQMA 3UKRB 4H5WA 1MWMA 4BG9A 2P9UB 3HI0A 4BRMA 1QQOA 2QWLA 3A5OC 3O8MA 3VEVA 4BGBA 1NLVA 2VCPA 1T6CA 2HF3A 5KQDA 4JN4A 1BDGA 5KPRA 1U2VA 3WQTA 4Y0WA 1OKJA 1HKGA 1Q18A 1GLCG 1T44A 3VEWA 1BWFO 1K8KB 4FOEA 2DPNA 2NLXA 3MCPA 3I8BA 3MN6A 1BOTO 1S3XA 4K41A 4IXCA 4PL8A 2ZWHA 4H0PA 3LDQA 2YCHA 1G99A 3BUZB 1HLUA 3MN5A 3GE1A 1ESVA 3G25A 4H5RA 4CZFA 4CZHA 3SMPA 2D0OA 2QW9A 3HSCA 3QB0A 3GDQA 1KAXA 5JLHA 3UKUA 3VEYA 1KAZA 1WUAA 2QWPA 1KXPA 2AP1A 1NBWA 1NGFA 5ADXA 3KHYA 2Q36A 5AFUA 2GUPA 4JHDA 3WEEA 4BR0A 2E1YA 4BRDA 3BP8A 5AQKA 4B1WB 3L6QA 3H1QA 4B1ZA 3ULEA 1NGCA 5B8HA 2CGJA 4BROA 3HBTA 1D4XA 4CBWA 1BA1A 1NMDA 2V7ZA 5AQWA 5AQOA 2E2PA 2Q0UA 1C0FA 3CJ9A 2CH6A 1BU6O 3VOVA 3CIPA 5JMVA 3BF3A 3ZX0A 2BUPA 3FZKA 4H5VA 3D2EA 4WQ4C 5FPDA 4E1JA 1ATRA 4BR5A 4CZMA 1NGDA 3FLCO 2NRHA 5AQVA 2WUSA 5LJWA 2Q31A 3FZFA 3VGLA 1U2VB 4BC3A 5I9EB 2P9PA 4CZGA 1XQSC 3ZX3A 3R8EA 1RGIA 3DJCA 4H03B 2W40A 1GLLO 3U4LA 3J8AA 3QFPA 4QS9A 1TYQA 3A0IX 5BRHA 3HTVA 4EAHD 1HPMA 1X3NA 3WUHA 3VEZA 4BRFA 1ZXOA 2V52B 3GG4A 1Z6RA 3B8AX 4C23A 1EQYA 3DXMA 3M1FA 1BG3A 4BR9A 4BRQA 4IWVA 2IVOA 1NM1A 1BO5O 1NGIA 2YI1A 1IJJA 2D0PA 3UKUB 4PL7A 1U6ZA 1C0GA 1BUPA 4PKIA 2IIRA 4FWLA 2P9NA 4RCHA 5JICA 4XH4A 4JNEA 2CGLA 4JHDB 3WEEB 2P9IA 4BR7A 2A3ZA 2H3GX 2QWRA 5BRDA 2YHXA 4BC5A 2GELA 5JLFA 1HKCA 3MK6A 3VENA 5BPLA 2IVNA 2VWBA 3CQXA 3I33A 3ULEB 2QWQA 3R6MA 2FSKA 4AM6A 2ZF5O 4MLHA 4BRKA 3A8YA 2QWNA 2E1ZA 3SLCA 2ASMA 3F9MA 2NZTA 2Q0RA 5AQPA 4NB4A 2E8AA 1DKGD 5EXWA 1JCFA 3CJ7A 1HJOA 2FXUA 3VEXA 3HZ6A 3MN9A 3FFKB 1NGHA 2E2QA 3AARA 3ENHA 4IO8A 3CQYA 3EZWA 4ISGA 4M7XA 2OANA 5AQJA 5TKYA 2PBDA 3D2EB 2QM1A 5KPTA 4O5FA 3CJBA 3H1VX 3HM8A 3IDHA 3JS6A 3IFRA 4QS7A 2CGKA 1GLJO 2KHOA 1LOTB 4AM7A 1E4FT 1QZ6A 1S22A 5BPNA 5AZIA 4GY2B 5LY3A 2P9PB 3C0BA 5E26A 3IUCA 3FR0A 2FF6A 2F9TA 2Q2RA 1NWKA 1X3MA 4J8FA 3QMLA 1GLEG 1KAYA 3O6WA 3UE5A 3VETA 1TYQB 5AQZA 4CZLA 1YUWA 5AZJA 3QFUA 4PKHA 5KPZA 3SK3A 1JCGA 1DGKN 4B1VA 3H46O 3DXMB 3VESA 1MDUB 1RFQA 3VERA 3O4WA 1T6DA 1HUXA 3EKSA 4H0VB 1JCEA 5FPNA 3TU5A 3DXKA 2CH5A 1NGBA 4B1XB 4RWTA 2V51B 4CBUA 3ZETA 3IMXA 3H3NO 5FPMA 4BREA 3RSEA 4XH5A 2P9NB 3CI5A 3VF2A 5BN8A 4K42A 2P9IB 3MN7A 3WQUA 3LDNA 4JAXA 4I6MA 3ZEUA 4DHYA 3VGKA 5ADXH 3CJ1A 5AFUH 5BN9A 3LL3A 1GLDG 4FWNA 2YJEA 2QXLA 2E2NA 4FPAA 3KZBA 3WXLA 4BGAA 1GLFO 3ZX2A 3WXIA 4FWMA 2AA4A 3O1WA 4WQ4A 4CJ7A 1XUPO 5AQGA 3AY9A 3KVGA 2A6AA 4JD2A 3S41A 1QQMA 4MO5A 2BTFA 4B9QA 4WYBA 4IJNA 3MDQA 5BR9A 3SJHA 1YAGA 3ATVA 1H1VA 2FF3B 2W41A 4M7YA 4YDUC 4BVPA 5AZIB 5BRFA 4BRIA 4LC9B 3M6GA 4XH1A 3TPQA 1SAZA 4FWPA 2FSJA 4L3QA 5AQNA 1Z05A 4A2AA 1NGAA 4EFHA 1GLAG 5AZJB 4CZJA 3LM9A 4A61A 4DQ8A 2HF4A 1ZC6A 4HWIA 4B1YB 3VF6A 4CBXA 4BRNA 2D1KA 1NGEA 3CETA 4BRPA 4BG8A 3LM2A 3D2FA 4Z94A 5F1XA 5LJVA 3A5MC 1J6ZA 4WQ5C 4BRCA 1IG8A 5AQIA 2A40A 2J4RA 4A62A 4BR4A 4FL9A 2F9WA 4MLEA 2PAVA 4BC2A 1ZBSA 2E2OA 3CJCA 3DXKB 2YJFA 3ENOA 3ZETB 3VEOA 3FZHA 3RSEB 4BRGA 4H5NA 4MO4A 1Y64A 2P9LA 3GOIA 3O08A 4IJAA 3LDPA 2YHWA 3BEXA 4EHTA 1DEJA 1RDWX 4I6MB 4FWRA 3ZEUB 3VF4A 4CD1A 4WQ5A 4BQZA 1TUUA 1HX1A 4QS8A 2Q1NA 3CJAA 4BQLA 4CI6A 1YXQA 3H6EA 4K43A 1CZAN 2D4WA 5AQHA 1SQKA 1MA9B 3U8XA 4H0XB 5AQXA 2FLOA 2HMPA 3M3ZA 3FE1A 3O1BA 3L4IA 3A5NC 2ASOA 2Q97A 4ISEA 4H0TB 2A41A 3C7NA 3CERA 1WOQA 3GBTA 3QBXA 4F9OA 4H0OA 5EY4A 4BRLA 5AQRA 4IZ9A 1P8ZA 2UYTA 5KQ8A 4JD2B 5ELZA 3A5LC 4BVOA 4DCHA 2A42A 3CHWA 3AAQA 4H0YB 5AQLA 3ATUA 3AAPA 2I7NA 2GWKA 5BPMA 5AQYA 3LDLA 2P9SA 3P4IA 3LDOA 3QDKA 4GNIA 4NO7A 5AR0A 2FSNA 1ATSA 4ISFA 5EX5A 3SMSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W2BM 2P9KA 4DLEA 1GLBG 4CD3A 1YVNA 3P83D 3DLGA 3THWA 4KRFA 4FOIA 3OYAA 3V6DA 1UA1A 5CYQA 3ITHA 4AHVA 4OX9K 5AQTA 3WT0A 2P9UA 4CE9A 4H4OA 3KKSA 3EO3A 3JXUA 4PKGA 1WBBA 1TV6A 3ZSYA 4AQYK 1RDBA 4U7BA 3FZLA 3QNOA 3N4PA 4FJ9A 3MAQA 2OTLN 1HPZA 2IVPA 3BF1A 4RTFD 4DU4A 1U49A 1TUYA 4CJEA 3OHRA 3W0LA 3O5BA 4FM1A 2ASPA 3TANA 3AVFA 4ILJA 5AQFA 4B9UA 1Y97A 3WXKA 1RT7A 2ITGA 1TL3A 3B6OA 5J2QA 2E20A 3SUNA 1SKSA 5HROA 2VG6A 3CFPA 4B1UB 3F2KA 2HBKA 4BRHA 1LAVA 1HNZK 4O5BA 4CEQA 3DYAA 3QESA 5E84A 3DAWA 5EVZA 3LPTA 4OO1J 2A1RA 4KBOA 3WNGA 3S3MA 3EEQA 4DMNA 2BANA 4CZEA 3E66A 2QXFA 1SZ2A 4DF4A 1V4SA 4HTLA 4LFAK 2GEMA 5FPEA 3TAQA 1ZBIA 1NNEA 5C2DA 2NRWA 2I7PA 4A2BA 4B8AB 2DFEA 2HBLA 3CCLN 2A5XA 1FK9A 4FWKA 4YOWA 3EYZA 4OGCA 3TAFA 3DRPA 4I9LA 3AVBA 4H5WA 4RW8A 4CEFA 1WBDA 4BG9A 1ZBHA 4FJ7A 3LALA 3M5RA 3DLRA 1L3VA 1QQOA 4BGBA 1NKCA 3PY8A 3G0ZA 3BGRA 4JN4A 1JLQA 3VN5A 3ZSVA 1HKGA 3MEDA 2UXCK 4B3OA 5C24A 4FJJA 3QEXA 3MEEA 3TAMA 3T69A 1VSLA 3B6PA 1BOTO 3SUPA 3J7ZO 2E4LA 2XY8A 4DF8A 1HLUA 3GE1A 3G25A 4H5RA 1OH6A 2JLEA 3M8SA 3RMBA 3GDQA 2QEXN 3UKUA 5IT9O 2AP1A 1NBWA 3DLKA 4JHDA 4C8NA 1NJXA 1CZ9A 5GAEP 3L6QA 1U47A 4B1ZA 3THXB 2IDOA 4DR2K 3ENBA 3HT3A 1BIUA 1QVGM 3RMCA 4DV3K 5AQWA 1C0TA 4NYFA 5AQOA 2E2PA 2Q0UA 5MLCQ 1C0FA 3CJ9A 3TSUA 5JMVA 4IEIA 3CMAN 3J7AP 4FVUA 2NUBA 1CXQA 2D0CA 1C0MA 4BDYA 3U6FA 4PA1A 5HRRA 2VG7A 4KHNA 2O4GA 4CJKA 3ZSRA 3FLCO 3N4QA 2WUSA 5LJWA 1RTHA 2Q31A 3AVHA 3VGLA 4BC3A 4CVNE 5I9EB 2PYLA 4CZGA 3IKMA 1A5XA 4YORA 4K8ZA 3K59A 3HRGA 3Q7CA 3S3OA 3PO5A 2W40A 4JI4K 1GLLO 2GX9A 3V9XA 1VQ7N 4GV9A 1GOCA 4DU3A 3TAPA 2V52B 3MXJA 1EQYA 4JKGA 4CECA 1KRPA 3SQ2A 3HYFA 3EZ5A 4N76A 4BR9A 1JJ2M 2IVOA 1BO5O 5DM7L 3K9JA 1IJJA 1K8AO 4CF8A 5KTQA 4FWLA 1RDDA 2B4JA 4JKAA 4DSKA 2YHXA 2HNZA 4BC5A 1WSHA 4HUGA 3THYA 1ZBFA 4LSNA 1HKCA 2X6SA 3TWHA 2IVNA 3CQXA 3ULEB 4LF5K 2ZF5O 4CJUA 3CPEA 3NH1A 3NF6A 2QWNA 3SLCA 3F9MA 3KD5E 3SQ4A 4UQGA 3UIQA 1I39A 3BZCA 4CJSA 2E8AA 1HJOA 4W5TA 1EKEA 3CXCM 3O3FA 1NGHA 3AARA 3CQYA 4ISGA 2OANA 3ZT3A 3BZKA 2PBDA 1VQLN 4KTQA 4LF8K 4RW7A 2O8BB 4IEEA 1XMOK 3CJBA 1KVCA 3IDHA 1T8EA 3JS6A 1BL3A 4NXNK 1NMNA 2KHOA 2RE2A 2O8DB 4F4KA 1BCOA 5AZIA 4GY2B 4DR4K 4E7KA 1JKHA 5E26A 2FF6A 3OBWA 2F9TA 3OA9A 1Q8IA 3E9PA 4C1NI 3RVCA 1X3MA 4J8FA 3T3FA 1ASUA 1GLEG 3VETA 3CCSN 4BWMA 5KPZA 3SK3A 3BY5A 4CHQA 1NK9A 3H46O 2O8EB 1RTJA 3DMJA 2D0AA 5HLFA 4JYAK 3EKSA 3L3UA 1JCEA 2B6AA 3DXKA 1NGBA 4RWTA 4CJTA 3ZETA 5FPMA 4BREA 1HNWK 2KKZA 3F9KA 4XH5A 2P9NB 3NH0A 4JKHA 3NDKA 4K42A 1J9AA 3VQ4A 2P9IB 3LDNA 3AA5X 4I6MA 3ZEUA 2EHGA 1BI4B 4DHYA 4Z4FA 1R0AA 5ADXH 1RBTA 4DR1K 3C65A 4W5NA 3AO4A 3DRRA 1NKEA 3AO5A 3K5NA 2QXLA 2E2NA 2P5OA 4CF0A 4NCGA 4CFCA 3EY1A 2VWJA 3F73A 2IS3A 3JYTA 3SBTA 3AVIA 4J2DA 3SJJA 3CD6N 3NF7A 3AY9A 2A6AA 3RMDA 1F21A 3V9SA 1VSFA 3SJHA 3ZT1A 3CCUN 2E6LA 4BVPA 4WFNL 3P5JA 3KLGA 5CHIA 2OPPA 4XH1A 4CGFA 1KVAA 3TPQA 4M3RA 3K5LA 5BR8K 3L2WA 4ELTA 2UU9K 2KZZA 1GLAG 1B9DA 4ID5A 4DQ8A 4A61A 4DFPA 4HWIA 3VF6A 4BRNA 2D1KA 4NLBA 4NLCA 3F5TA 5F1XA 4BRCA 4NYNA 3VQ7A 3CCRN 4MLEA 2PAVA 4ZTJA 5JVGL 4DFKA 3KJVA 4FJGA 1RDAA 3FZHA 4BRGA 3AV9A 4FM2A 4JS5A 4H5NA 3NGYA 3PX4A 2WTUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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