3D7EO

Enterococcus casseliflavus glycerol kinase mutant his232ala complexed with glycerol
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
495
structure length
495
Chain Sequence
NYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYAFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
total genus 174
structure length 495
sequence length 495
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO01
2AP1A 3O8MA 3ENOA 3DWLA 1NGBA 3FR0A 3MCPA 3SK3A 4BR7A 2D4WA 5FPEA 4FOEA 1S22A 1EQYA 3P4IA 3QBWA 2IVNA 4CBUA 1NM1A 5EOYA 3FFKB 4B9QA 1C0FA 2CGLA 2HMPA 3BUZB 4YDUC 5AQSA 1BA1A 1IG8A 2P9NA 3WEEB 2P9UA 5EX5A 1WOQA 3KVGA 4BG9A 4C23A 1KXPA 3BEXA 2A3ZA 3HM8A 1BA0A 3ZETB 2HF3A 2A40A 4ISFA 2PBDA 1X3MA 3WUHA 4NB4A 3R6MA 4GY2B 3SMPA 2P9IA 2F9TA 3H46O 3DXKB 3L0QA 3ENHA 3IUCA 5BPMA 3M3ZA 5EY4A 3SLCA 1V4SA 2V52B 1JCEA 4JD2A 1BWFO 4CZIA 2Q97A 3UKUA 4FWQA 4FOIA 2QWNA 3R9PA 3VERA 4B1XB 5AQQA 1LCUA 3H1QA 4DB3A 3DXMA 4WYBA 3MN9A 4AM6A 2H3GX 3A5OC 2FF3B 4MLEA 2ITMA 1XQSC 5AQFA 3CQYA 4BREA 5CE3A 2CH6A 4CZLA 3VESA 1RFQA 4EHUA 1XC3A 1E4GT 3VGKA 3EL2A 2D1KA 3VETA 4BRMA 5AZJB 1LOTB 4A2AA 4CZFA 1GLDG 3EKUA 5AQOA 3QICA 5AQHA 4BRDA 1HJOA 1X3NA 4I6MB 3KHYA 3FE1A 1IJJA 2E88A 4LC9B 3FZHA 4JD2B 1YUWA 2ZF5O 5F0XA 4XEIA 2I7NA 3LDOA 1GLAG 3D2FA 1TYQB 2QWQA 1NGIA 5AQYA 1NMDA 3IFRA 2D0OA 3W3DA 3WQUA 4BRKA 4CZJA 1QQNA 3DXMB 1HLUA 4BC3A 4AM7A 1XUPO 3HTVA 3FZKA 3VF2A 4JN4A 1DEJA 3QFUA 2HOEA 3LDNA 1ATNA 1E4FT 2P9NB 3WEEA 4PL7A 2P9UB 2FSKA 4JHDA 1SZ2A 1R59O 2A6AA 3AY9A 1Q18A 2AA4A 2A41A 1HX1A 3D2FB 4K43A 4RCHA 5FPNA 3CJ1A 3WXLA 3H1VX 4FWRA 1GLCG 1T6CA 4DCHA 5AFUA 3FZLA 3A0IX 2IIRA 5FPDA 1QZ6A 3FZMA 4IJAA 4BROA 4E1JA 4RTFD 5LY3A 5AQKA 3QDKA 3CI5A 4BRQA 3I33A 2E20A 2P9PB 4H03B 3EO3A 1BUPA 4IO8A 5ADXA 1HKGA 5KPRA 1BG3A 2FLOA 3GL1A 1P8ZA 5EXWA 4BR5A 1NBWA 1TUYA 4WQ4C 4BR9A 1KAZA 3GG4A 2Q31A 2E2PA 3A8YA 3L6QA 4FWKA 4QS8A 5BREA 3S41A 2GWJA 2V7ZA 2IVPA 3C7NB 1KAYA 2E2OA 1NGFA 2FSNA 3U9DA 3H3NO 1YXQA 4MLHA 5AQXA 2KHOA 4DQ8A 3HBTA 5KQDA 1HPMA 5BPLA 2QWPA 3FGUA 5AQNA 3M6GA 4BC5A 1TUUA 2J4RA 3RSEA 4Z94A 1NGHA 3O08A 3VGMA 3LDQA 1J6ZA 4PKIA 3CERA 3DXKA 3O4WA 1ZBSA 1G99A 2Q0RA 5BN9A 4PKHA 4HWIA 3ZX0A 2P9LA 4K25A 2E1YA 5AQRA 4IZ9A 3MK6A 4CZHA 4A2BA 1NWKA 4RWTA 4BR0A 4JAXA 2QWLA 1MWKA 1K8KA 3WQTA 1C0GA 3LDPA 4EHTA 3UE5A 3ZEUA 4FWPA 4BC4A 1SAZA 1WUAA 3UB5A 5BR9A 5AQUA 1U6ZA 4F9OA 4BRGA 1S3XA 4IWVA 5AQZA 4B1VA 5LJWA 4CJ7A 1NGDA 3SJHA 1H1VA 3F9MA 4BGAA 1D4XA 5AQTA 3FLCO 4CBWA 2YHXA 2I7PA 3QMLA 4BRPA 1K8KB 1MWMA 4M7XA 4H0VB 3H3OB 4JNEA 3ZETA 1BDGA 4M7YA 4L3QA 2P9SB 2W40A 4B1WB 2YHWA 2ASOA 1NGEA 3CJBA 4FO0A 3ID8A 4B1YB 5BRDA 4FSVA 5FPMA 3WT0A 3U8XA 2QW9A 4GNIA 5AQMA 4H5VA 3A5MC 4CZGA 3D2EB 2FSJA 4XH4A 3H45C 2ASMA 1RGIA 3U9ZA 3RSEB 3MMVA 3LM9A 4BVPA 4CZEA 4BVOA 1MDUB 3EZWA 4QS7A 3TU5A 4BGBA 1YVNA 4YDUA 5I9EB 2P9KB 3EN9A 3WXKA 1GLJO 1MA9B 1NGAA 3VPZA 2VYPA 2YI1A 3R8EA 1SQKA 3BP8A 4MO4A 4CD3A 5LJVA 1ZXOA 2GEMA 1QHAA 1YAGA 3VF6A 3QB0A 2IVOA 4O8KA 1OKJA 3U4LA 2OANA 1DKGD 3LL3A 5BN8A 3I8BA 4XH5A 2ZWHA 1JCFA 3CJ9A 4XH1A 4K41A 3VOVA 3VF4A 3GE1A 2YHYA 2P9LB 4HTLA 3CJCA 2Q1NA 2QXLA 3JS6A 4BRLA 3IDHA 4H0OA 2CH5A 4BRNA 2E2QA 2BUPA 3O1WA 3O80A 1X9JA 1ATRA 2HF4A 3AAQA 4BC2A 2A5XA 3D7EO 3VGLA 4CBXA 2E1ZA 3DAWA 4JHDB 4EIAA 5JLHA 4BRAA 1BOTO 3J8AA 4H0TB 1T44A 2BTFA 3HSCA 2ASPA 5KPTA 1ZC6A 3VEWA 4WQ5C 2VWBA 4ISGA 2F9WA 2ZGZA 2Q36A 5AQLA 4IJNA 2QWRA 2CGJA 3QBXA 4FPBA 3GBTA 2E8AA 2E2NA 2FF6A 4QS9A 3LM2A 5AQGA 1BO5O 3B8AX 5E26A 4EAHD 5BRFA 4K42A 2D0PA 3CETA 5BPNA 1U2VA 3SMSA 3C0BA 4BR4A 4FWMA 2GELA 1DGKN 2GWKA 2NZTA 3DJCA 4H5RA 2GTDA 2QWOA 3C7NA 3CQXA 5EVZA 3MN6A 5E84A 5JMVA 3VEXA 3ATVA 2A42A 4H5TA 4EFHA 4BRCA 3GOIA 3O6WA 3ULEB 5F1XA 2W41A 3ZEUB 1T6DA 3QFPA 3BF1A 1KAXA 1QQMA 2YJFA 5ELZA 2DPNA 4FL9A 4H0XB 4WQ5A 2FXUA 3G25A 3AARA 4H5NA 2NRHA 3FZFA 5AQIA 4J8FA 4MO5A 2UYTA 5AQPA 3UKRA 4A62A 4CZMA 4A61A 1Y64A 3CIPA 3LDLA 4O5FA 2EWSA 3UKUB 2Q2RA 3TPQA 4B1ZA 4BRIA 1QQOA 4BR2A 4FWOA 3MN5A 5KQ8A 3ULEA 1ESVA 2QM1A 1NGJA 1U2VB 2V7YA 3L4IA 3OHRA 4FWSA 3VEOA 3A5NC 5AR0A 4H5WA 5AZJA 3WXJA 3A5LC 4PKGA 5ADXH 1HKCA 2P9IB 4M63C 2VCPA 3VENA 3CJ7A 2WUSA 4CI6A 1ATSA 3KZBA 3O1BA 3UKRB 4B1UB 1QZ5A 5B8HA 3JXUA 3ATUA 2NLXA 1GLFO 3EKSA 3ZX3A 4ISEA 3CJAA 1V4TA 2CGKA 5JICA 4PL8A 4BQLA 3O5BA 5AQJA 4WQ4A 1GLLO 3M1FA 2Q0UA 3AAPA 4IXCA 5AZIB 3H6EA 1Z05A 4FWLA 1HUXA 2QWMA 5AFUH 3VEYA 2YJEA 1HKBA 2P9PA 2P9KA 2ZGYA 4CD1A 5KPZA 5AQWA 5BRHA 1TYQA 3MDQA 1NLVA 3VEVA 3HI0A 1NGCA 1BU6O 4H0YB 2PAVA 4CZKA 3MN7A 1JCGA 1CZAN 3D2EA 2V51B 3CHWA 1NGGA 2P9SA 4FPAA 3W0LA 4NO7A 4DHYA 4H0PA 1RDWX 3ZX2A 5F2RA 5AZIA 3WXIA 4BRHA 4BQZA 4Y0WA 2GUPA 3BF3A 4I6MA 1GLEG 4KBOA 4FWNA 5AQVA 4BG8A 3IMXA 3GDQA 5JLFA 3HZ6A 1GLBG 4BRFA 5TKYA 1Z6RA 2YCHA 3VEZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2AP1A 3CYMA 3ENOA 4YNQA 3PO4A 3DWLA 3F9KA 5CYQA 2A1RA 3SK3A 1RDUA 2D4WA 4IG3A 1BCOA 1S22A 3ALYA 1WAFA 1NM1A 2RHKA 2HMPA 1A5XA 2O4IA 3K57A 1NK4A 1VQNN 1WOQA 2P5GA 3ZT0A 4O4GA 2PBDA 4CK3A 4JI8K 1FXXA 4CF9A 1FKPA 3JAMO 3RMDA 5CZ2A 4C8KA 1SKSA 3TAMA 3VQBA 1SV5A 3L0QA 3IUCA 1XHZA 3OYHA 5BPMA 3S3MA 1V4SA 2UUAK 3I0RA 2KKZA 3LALA 3UKUA 1IBMK 4J2DA 1WSIA 1BIZA 3P38A 1NK8A 4B08A 4B1XB 4KHQA 4JS4A 1D5AA 3H1QA 3P31A 3V1RA 3T1YK 4KAZA 4KREA 4AM6A 2OTLN 3DLHA 4E3SA 1QVFM 3A5OC 4KHWA 4MLEA 4GW6A 2ITMA 1XQSC 2DTUA 5AQFA 3CQYA 2CH6A 4CZLA 2ZJQL 1NK5A 3WNFA 3VQCA 4DU1A 1E4GT 1Z26A 1NJYA 3VETA 4BRMA 2X6NA 4C1NK 2O8CB 4HHTA 1RDDA 5E41A 3O9UA 1X3NA 4FK2A 1IJJA 4YOUA 3KK3A 1Y97A 3QEPA 5M1KA 1B92A 1XC9A 3EE9A 1RTDA 2D0OA 3D45A 1N36K 2HHHK 3VQEA 3WQUA 1GOCA 5I3UA 2YNGA 3PUFA 5EU7A 3DXMB 1HLUA 3E1YA 4AM7A 1XUPO 3V6DA 2O8CA 3L3VA 3IKMA 4JI0K 5HP1A 4FK4A 3FZKA 5GAHP 4FLYA 4CJVA 1DEJA 1CZBA 3WEEA 1KTQA 4PL7A 4FLTA 3AA2A 3SZ2A 1J5OA 5BR9A 4I7FA 5FPNA 1Q18A 2X6SA 2PY5A 1QSLA 4FWRA 5M1NA 4BDPA 3PY8A 5HOOA 4DCHA 2WBNA 4OGCA 4FLWA 1VQ6N 1YTUA 5J2MA 2IIRA 3C94A 3OYIA 1FW6A 4CF1A 4DLEA 1TKDA 1NOYA 4WF9L 1C0UA 2Z1JA 2O8DA 1IV0A 5DK5A 2HMIA 3CC2N 4I9QA 1HNIA 4DV5K 5AQKA 4BRQA 4AILC 4H03B 3ZSZA 4DFMA 3F73A 1BUPA 4TSXA 2FLOA 5C25A 3V81A 2RF2A 3J81O 3VTHA 3TSPA 4KO0A 1NBWA 3K5NA 1KAZA 4G9ZA 3DLLL 1D8YA 4FWKA 4GVMA 5GAEP 3CCQN 2QKKA 1NGFA 4DS5A 5CYMA 4ZTFA 1VSKA 4DTNA 4DV1K 3HP9A 3OYDA 4KTWA 1OVYA 4OPAA 1C1CA 4B9MA 5KGWA 1NGHA 3LDQA 1J6ZA 3RMCA 4X62K 2P9LA 4O5BA 4K25A 4FZYA 1NWKA 4CEBA 1KVCA 4RWTA 4BR0A 4YORA 4JAXA 4YY3K 4ELVA 4Q0BA 1GOBA 2OCEA 3IG1A 5BR8K 1HYVA 4J2AA 3MAQA 3CCLN 4FLUA 4Y1CA 4F9OA 3NF7A 4BRGA 3HL8A 3U6FA 1WNSA 1JLBA 2HBJA 4CJ7A 1NGDA 1CZ9A 4DQRA 2NUBA 1GOAA 4FVUA 1NKBA 2YHXA 3QMLA 4BRPA 4IFEA 2BE2A 4OJRA 1MWMA 4JNEA 1BDGA 2P9SB 1L3TA 4DQIA 4L8RB 2OA8A 1TVRA 4CERA 5BRDA 3SUQA 2XY5A 4AHTA 1SL1A 2HBLA 3HO1A 4DR6K 1S5JA 1VQPN 2YHBA 1WLJA 1RT1A 4CZGA 3D2EB 2FSJA 4JKBA 4KTQA 2ASMA 2NRTA 4E1NA 4MQ3A 1RGIA 4FJJA 3RSEB 4CE9A 1MDUB 4EP5A 2P51A 1JLGA 4UY8O 2VG6A 4WFAL 5HBMA 3V1OA 3BDPA 2IS3A 2E6LA 3VPZA 2VYPA 3TTFA 3CM5A 4DQQA 1ZXOA 2GEMA 3VQAA 4BDZA 3U3GA 1OKJA 2O8EB 4KH4A 3SPZA 3I8BA 4JI5K 1IH7A 2HVHA 3VOVA 1YJ9N 3GE1A 3HK2A 3CJCA 4BRLA 2R7YA 4FM0A 1BI4B 4BRNA 2BUPA 1VSEA 1BCMA 3VGLA 4B3RK 4OLBA 3V9XA 1BOTO 4DKWA 3OS2A 2F7TA 4LSNA 3KWIA 3HSCA 3LP3A 2ASPA 2RKIA 3R1XA 4KFBA 4ISGA 3OS0A 2Q36A 2QWRA 3RRHA 1WSGA 1O1WA 1I3AA 2E2NA 4DV4K 4CFAA 4JKCA 3L3UA 1BO5O 4LF4K 5E26A 5GIOA 1TKXA 4B9LA 3SMSA 4ELTA 1XNQK 3RTVA 3THWA 1LWFA 3C95A 3AVLA 1ASVA 2NZTA 4H5RA 3CQXA 2BGGA 4M3RA 2G8IA 4FYDA 4X65K 3KKSA 3ZSYA 1VQ8N 4XIUA 4GV6A 3NH2A 1QQMA 3M8RA 1VK0A 2D0BA 2QXFA 4HVJA 1LAWA 4H5NA 5AQIA 4MO5A 3P1GA 5AQPA 4C8NA 3TPQA 3MN5A 3AVBA 5KQ8A 3SYZA 3O9TA 4J2BA 1VHXA 1NGJA 4O44A 3MX5A 3VEOA 1TL1A 2EHGA 3HT3A 2HHXA 3MXIA 4CFCA 2PYLA 4R5PA 4M41A 2NRRA 2NNWA 4JI6K 2G8HA 5IWAK 4IKFA 3KZBA 3O1BA 2XY8A 4MDBA 3EKSA 1GLFO 3S3OA 3NH0A 2OZSA 5IT9O 1WAJA 3Q7BA 4PL8A 4BQLA 4DSJA 4QOZB 1RILA 5AQJA 4JK7A 4CEDA 4CJFA 4FVMA 4DQSA 3AVFA 4CIGA 1VQ5N 4IXCA 3QIPA 3H6EA 4LY7A 1HUXA 4QCLA 3OJSA 4CIEA 1S1WA 2HHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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