2D1KA

Ternary complex of the wh2 domain of mim with actin-dnase i
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the actin-binding function of missing-in-metastasis
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 94
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2d1kA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2d1kA04
4J8FA 4FPBA 3H1QA 1E4GT 4FOIA 4CZKA 5E84A 2GELA 4M7XA 3A5NC 2W40A 4BC3A 1S22A 4H0VB 3D2EB 1BWFO 1C0GA 2VCPA 2P9PA 4JAXA 4I6MA 2YJEA 4FWLA 4A2BA 3R6MA 3CJ9A 2QXLA 4IJNA 4FL9A 4A61A 2ZWHA 3P4IA 1DEJA 1BO5O 1GLLO 1NGHA 2E88A 3ENHA 3VGKA 2Q0RA 2IVNA 4CI6A 1NGDA 3VF2A 3AAPA 5KQ8A 3MN9A 4JNEA 1KXPA 2QWLA 3HZ6A 1JCGA 4NB4A 2CGJA 2IVPA 5BREA 3F9MA 2FF6A 3H45C 4BRLA 4H0YB 3CJAA 3VEXA 3U9DA 2Q2RA 3FZLA 3I8BA 2CGKA 3M3ZA 3SMPA 3SK3A 1HUXA 2D4WA 4K41A 2NLXA 3ULEA 1V4TA 3H3NO 3B8AX 1JCEA 1XC3A 1J6ZA 1RDWX 2QWRA 4BC2A 3LDLA 1CZAN 4E1JA 5BPLA 1WUAA 5F1XA 2QM1A 5EXWA 3O5BA 3WEEB 2AP1A 2GEMA 3C0BA 5AQUA 4BGBA 2I7PA 3FLCO 4AM7A 3D2FB 2YCHA 1DKGD 1HX1A 4WQ4A 4CJ7A 4QS8A 3VEWA 3IDHA 4RWTA 4BR2A 2P9NB 4O8KA 4BGAA 1BA1A 1KAXA 4FWOA 3QMLA 3O1WA 2NRHA 5BN8A 3WXIA 4B9QA 2P9KB 4H0TB 3EL2A 1X3NA 4RTFD 3MCPA 3BP8A 4CBXA 3UKUA 1MWKA 1MDUB 1U2VA 1SAZA 1X3MA 2YHXA 3OHRA 3VF4A 5AQIA 4BR5A 3R8EA 4CZMA 5FPEA 4CD1A 4DHYA 3H1VX 1GLBG 3KHYA 3U8XA 2E1YA 4H0PA 1YVNA 1QQOA 3BF3A 3CETA 3EO3A 5AZIA 3VEVA 3J8AA 3QFUA 3GBTA 2CGLA 1V4SA 1OKJA 3M6GA 3QICA 4BVPA 1BUPA 2NZTA 3O1BA 3WXJA 2IVOA 4CZIA 2FF3B 4A62A 5AQTA 2ASMA 3HM8A 5KPTA 1G99A 3SJHA 4QS9A 3ZETA 5AQYA 3FE1A 4FWQA 1QQNA 4BRNA 1NGIA 3RSEB 4MO5A 2FSJA 1GLFO 4FOEA 1ATSA 5BPMA 5JICA 5E26A 2P9SA 4FWPA 2P9UA 1HLUA 4EHTA 2D0OA 3DWLA 2E2OA 4H0OA 5F2RA 4H0XB 3U4LA 4RCHA 3TU5A 4EHUA 3DXKA 2P9LA 1TYQB 4WQ4C 3ZEUA 5ADXH 3FFKB 1RGIA 2YHYA 2D1KA 4PKIA 4H5RA 4H5NA 5AQWA 4FWSA 4YDUC 3D2EA 5F0XA 1T6CA 4XH5A 5AQNA 4EAHD 2QWMA 2PAVA 3FGUA 4BRCA 2Q0UA 3VGLA 4BRFA 5ELZA 1XQSC 1YAGA 4IO8A 4ISEA 4MO4A 1IG8A 1GLCG 1GLJO 1DGKN 4EIAA 5AQLA 4FWMA 2HF4A 4EFHA 2A41A 3KZBA 4GNIA 2FSNA 4FPAA 5KQDA 4JN4A 1ZC6A 4B1UB 3VEZA 2V7ZA 3HBTA 3D7EO 4H5TA 5LY3A 2E2NA 3L0QA 5FPMA 1P8ZA 1IJJA 5JMVA 2ASOA 4WQ5C 5AZJB 3A5LC 3LDOA 3QDKA 3AY9A 4B1XB 3VEOA 3HTVA 5KPRA 5I9EB 2GTDA 2QWQA 2GUPA 1BDGA 5EX5A 2AA4A 3IMXA 1KAYA 1HKCA 3D2FA 3CJCA 4JHDB 2P9IB 3VGMA 2FLOA 1JCFA 5AQGA 3EZWA 2P9NA 4BR7A 3QBXA 3UE5A 3VENA 5TKYA 1HKBA 4BROA 4PL8A 1K8KA 1TUYA 4BRAA 2VYPA 4MLEA 2P9KA 1RFQA 4YDUA 1E4FT 5BPNA 3UKRB 2ZGZA 4BRHA 1GLEG 4CZLA 2PBDA 1QZ6A 3AARA 4BRDA 2GWKA 3VETA 2CH5A 2GWJA 4WYBA 3A5MC 4IJAA 1ESVA 5AR0A 3W0LA 5AQZA 1T44A 4BR9A 5AQOA 3U9ZA 4CZFA 5B8HA 4JD2B 3C7NB 1NGGA 4BRIA 2D0PA 3UB5A 4BG8A 1Q18A 4FWRA 4WQ5A 4PKGA 3UKUB 4M7YA 3GOIA 1WOQA 2F9WA 3GE1A 2EWSA 4FWNA 3ENOA 5AQMA 4CZEA 3MK6A 5EVZA 3GG4A 1GLAG 4CD3A 4NO7A 5LJVA 5BRHA 2I7NA 2A3ZA 3BEXA 4MLHA 1ZXOA 1NWKA 1QZ5A 3RSEA 4O5FA 1D4XA 5EOYA 4L3QA 4K42A 5AQVA 3JXUA 4BQZA 4HWIA 1MWMA 1X9JA 3FZKA 4K43A 4QS7A 1TYQA 5LJWA 3L6QA 5AQHA 3H3OB 3LM2A 4BG9A 5AQRA 2Q31A 2V52B 3EKSA 4BC5A 1GLDG 3LDPA 3MDQA 3A0IX 1Z6RA 3WT0A 5BRFA 4BRMA 3M1FA 3DXMB 3CIPA 5BN9A 3ATVA 4BRQA 4GY2B 3O80A 5AQPA 3JS6A 4DQ8A 1SQKA 2J4RA 1C0FA 4AM6A 3WXKA 5ADXA 3H6EA 3WUHA 5AQJA 1R59O 5AFUA 4A2AA 1HPMA 3LL3A 1Y64A 4BRPA 2E2QA 2OANA 4H5WA 3O6WA 3VOVA 2A42A 4C23A 4DB3A 1NGJA 2KHOA 2W41A 2QW9A 5AQXA 4XEIA 3BUZB 1QHAA 2QWOA 3H46O 4HTLA 1BOTO 2F9TA 3ZX2A 4M63C 5AZJA 2P9PB 3WQUA 3MMVA 2A5XA 2VWBA 4I6MB 4PKHA 3EKUA 4PL7A 5AQFA 5CE3A 3IFRA 1ATNA 4Y0WA 3CQYA 1Z05A 3CJ7A 4ISFA 1ATRA 3AAQA 4IXCA 1BU6O 2ASPA 2A40A 2CH6A 3WEEA 2Q1NA 4BRGA 4IZ9A 2Q97A 3ID8A 3HSCA 4JHDA 2P9IA 4BR0A 4CZJA 3I33A 3G25A 4BR4A 3CHWA 5AQSA 3ZX0A 1H1VA 3LM9A 4FO0A 3GL1A 5FPDA 4BC4A 5BR9A 1HJOA 2HOEA 1HKGA 3BF1A 3W3DA 3O08A 1NBWA 2DPNA 4H5VA 3UKRA 3CQXA 4CZGA 3R9PA 4B1ZA 3ULEB 1S3XA 5EY4A 2IIRA 4BREA 3LDNA 1NGFA 1NMDA 4BVOA 4FSVA 4CBUA 3DAWA 2FSKA 3VESA 1KAZA 3FZFA 2V7YA 5BRDA 2H3GX 1NGCA 2E8AA 4XH4A 2QWNA 4KBOA 3WQTA 1NM1A 5KPZA 4JD2A 1ZBSA 3C7NA 3A5OC 3SMSA 3O4WA 1K8KB 4ISGA 3ATUA 4B1YB 5JLHA 2YHWA 4IWVA 3A8YA 2YJFA 3L4IA 2FXUA 3VPZA 2ZF5O 5JLFA 3DJCA 2Q36A 1EQYA 5FPNA 1U2VB 3CERA 3S41A 2A6AA 5AQKA 3MN6A 3CJBA 4DCHA 2ZGYA 3EN9A 2QWPA 3IUCA 4B1VA 2V51B 3LDQA 1MA9B 4BQLA 3MN7A 4CZHA 3FZHA 4XH1A 2YI1A 1SZ2A 1BG3A 3SLCA 1BA0A 4B1WB 2E20A 1T6DA 5AZIB 1LCUA 3ZX3A 4Z94A 3QBWA 1TUUA 2HF3A 4BRKA 2E1ZA 3MN5A 3CI5A 1YUWA 3VEYA 4F9OA 3KVGA 4LC9B 2E2PA 2WUSA 3HI0A 3DXMA 3ZETB 4H03B 1NGEA 1QQMA 2HMPA 3O8MA 2BTFA 1U6ZA 2UYTA 3FZMA 2P9SB 3QFPA 3VF6A 3GDQA 2P9UB 1LOTB 2ITMA 3CJ1A 3VERA 1XUPO 1NGBA 4FWKA 1YXQA 3TPQA 4K25A 4CBWA 3FR0A 3ZEUB 3DXKB 2P9LB 1NLVA 5AQQA 5AFUH 1NGAA 3QB0A 2BUPA 3WXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JL2A 1ASUA 3TAEA 3H1QA 1E4GT 4FOIA 5JVGL 3C65A 4CZKA 2GELA 4DTXA 4H0VB 3D2EB 2VCPA 1VSKA 1WSJA 2YJEA 4A2BA 4B9SA 3OYEA 3L3UA 1NOZA 3TABA 1KD1O 3LDSA 4B9TA 4LFBK 5HRPA 2XHBA 3VGKA 2PYJA 4CI6A 4V19S 1IKWA 1NGDA 3AAPA 3VF2A 1YI2N 1CXUA 3MN9A 2QWLA 4FM0A 4M3YA 3MEDA 3PX0A 3F9MA 2FF6A 4BRLA 3VEXA 4LF5K 2Q2RA 3FZLA 3OJUA 3I8BA 3L2WA 3SMPA 4FK2A 2OZSA 5KRSA 2NLXA 1MU2A 1XC3A 1QS4A 3THWB 3KTQA 1XMQK 1C0MA 3WEEB 5AQUA 4Y1CA 4JK9A 2O8CA 2XRIA 1I3AA 2YCHA 4B8AB 2O8BB 3L2QA 4CJLA 3VQ8A 4O8KA 3P38A 3MXIA 3L8BA 1HNZK 4B9QA 3EL2A 3T3FA 2BH1A 4CBXA 3UKUA 1MWKA 1MDUB 1X3MA 4FW2A 3R8EA 4CZMA 4F3OA 4CD1A 4LF9K 2Y1IA 1P90A 1S1UA 3LAMA 4IKFA 4KTWA 3H08A 4LFAK 3BF3A 1S72N 3ZSYA 4CEQA 4FM2A 5I42A 3QFUA 3GBTA 1L3SA 3CC4N 2CGLA 1OKJA 1W0HA 3NF7A 3M6GA 1JLQA 2ZQBA 3AGRA 1VQPN 4A62A 2DTUA 4RW7A 3HM8A 1G99A 5AQYA 4YOWA 4BRNA 1J5OA 1NGIA 3RSEB 2FSJA 4CGGA 1X9MA 4CFCA 4IO9L 1ATSA 4KH6A 5FROA 2VGNA 3DM2A 2P9UA 4FWPA 3S3OA 2ZE2A 5CYQA 4JKGB 5C2DA 3DLBA 4B9VA 4DV3K 4B9NA 4WQ4C 3ZEUA 4KHUA 4PKIA 5AQWA 4JS5A 3HJFA 1CZBA 2FBXA 2E5LK 3F5TA 1YJ9N 3D2EA 4XH5A 4R79A 3WXMB 5AQNA 5M1FA 3OYGA 4EAHD 1U47A 2PAVA 4BRCA 4CW7B 1VSLA 3LZIA 3EE9A 3VGLA 4BRFA 4IO8A 1GLJO 1GOAA 2B4JA 1QSSA 3M8QA 4CJWA 4OPJA 2BGGA 2RN2A 2HF4A 3KZBA 3RRHA 3AO2A 3BDPA 4EZ9A 1XI1A 3HPHA 4JN4A 3VEZA 2HNDA 1N34K 3RWUA 1RTJA 2E2NA 3R3LA 5FPMA 3RRGA 5JMVA 2P1JA 2ASOA 1XNQK 2UUAK 3HP9A 5TKWA 3LDOA 3QDKA 3AY9A 4MQ3A 4DF8A 4OKJA 5KPRA 1WN7A 2GTDA 3MWTA 2GUPA 4CGJA 3NE6A 4E7HA 3THWA 1IG9A 1D8YA 3OYJA 4NLCA 3LZJA 1ZBLA 2DFEA 3CJCA 1IKYA 2P9IB 2O8BA 3CYGA 2FLOA 4CJEA 1FW6A 3ASMA 1KLMA 5AQGA 4Z0UA 3P31A 2VGMA 5TKYA 4BROA 4PL8A 4H8KA 4YY3K 4MLEA 1RFQA 4A5AA 1TV6A 4FJKA 4C8MA 3UKRB 4CZLA 3NF9A 3OVNA 4OLAA 3P83D 4E7KA 3P39A 4IJAA 5AR0A 4WE1A 4M3ZA 1A5VA 3TSUA 4M45A 3CC2N 1LWCA 4JD2B 3I8DA 3C7NB 2IC3A 3ZT4A 3JSMA 4BRIA 5DM7L 4FLTA 3V9SA 5JVHL 4FWRA 3T19A 4WQ5A 5M1NA 3HP6A 4CEZA 3GOIA 4CZEA 5AQMA 4A59A 4G1QA 3CCVN 1GLAG 2EHGA 5LJVA 4CF8A 1VSEA 1LW0A 1IKXA 2I7NA 1SKSA 4JKCA 3BEXA 1C0UA 4MLHA 5GAEP 3K2PA 3RSEA 4O0JA 1OH5A 4MFBA 2GUIA 5AQVA 4M3UA 1TKXA 4C8OA 4XJXA 3JXUA 2JGUA 4F4KA 1NK5A 1VQ6N 4E1NA 4JKGA 3THXB 1RBSA 1T7PA 4IEIA 4K43A 2X74A 3L6QA 4HHTA 4DTRA 5FRNA 3L2UA 5DK5A 3AA2A 5J2PA 4KHWA 4BG9A 4LH4A 4CF0A 4ZHRA 1UA0A 2XY8A 4DFMA 3VQCA 2Q31A 3MX2A 4BC5A 2KQ2A 5BRFA 3CMAN 2WTUA 3EZ5A 3SI6A 3NCIA 2QKKA 4BRQA 1RTIA 1Q81O 4AM6A 1C0FA 3V1QA 5ADXA 4OX9K 5C0YA 4A2AA 3CMEN 1Y64A 4KHPK 3AVJA 4KHYA 3O6WA 3VOVA 3OBYA 1NGJA 2KHOA 3TAPA 1A5XA 1IBMK 2F9TA 3THYB 3S3MA 3MMVA 2VWBA 2B5JA 3C6AA 3EKUA 4PL7A 1VRUA 4JEPA 3IFRA 2KFNA 3CJ7A 1VQKN 1BIUA 3AAQA 4DUYK 3MCAB 1N36K 2Q1NA 4DMNA 2Q97A 1OH8A 3HSCA 2P9IA 4BR0A 3G25A 3SZ2A 1IKVA 2VG7A 1B92A 5FPDA 4CHOA 1C1AA 3C95A 2HOEA 4DS4A 4PWDA 3AO1A 3UKRA 4W5TA 3SQ1A 4A5BA 4CJKA 3ULEB 5EY4A 1EWRA 1VSIA 3S5TA 3DLKA 1X9SA 2V7YA 2XY7A 4CJ5A 4I9LA 1NM1A 4JD2A 3C7NA 3CPWM 1KLNA 3PO5A 3B6PA 3SMSA 4DS5A 3AVFA 3ATUA 5BR8K 3K0SA 1L3TA 2O4IA 3HOSA 4AHVA 3SJJA 2UUCK 2FXUA 3DJCA 5GADP 3SYZA 2JWLA 1U2VB 3ULDA 5AQKA 3HVRA 4DCHA 3DRPA 3LPTA 1RDBA 4FJ9A 4B1VA 2V51B 4M3WA 4F2SA 4H4MA 4NCAA 2C1GA 3K5OA 4W5OA 3THXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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