2D1KA

Ternary complex of the wh2 domain of mim with actin-dnase i
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the actin-binding function of missing-in-metastasis
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 94
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2d1kA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2d1kA04
1ESVA 3GOIA 1LCUA 5AQRA 1QZ5A 2A5XA 4JHDA 4MLHA 2PAVA 3UKUA 3LL3A 3SMPA 5FPDA 1QQOA 3GE1A 2P9IA 4WQ4C 2VYPA 1HKGA 4XH4A 4Y0WA 2A42A 1ZC6A 3EN9A 5AR0A 2HF3A 4H0XB 1TYQA 1QHAA 3VENA 3MMVA 4BRQA 4QS8A 5BRFA 3ZX3A 1X3NA 3WQTA 2CH6A 3IMXA 5AFUA 4BR4A 2HMPA 4BRGA 5F1XA 4E1JA 3MN9A 4DB3A 1XQSC 3UB5A 4A2BA 3A5OC 4FSVA 3IDHA 3LDQA 5KPRA 4B1XB 1NBWA 3SLCA 1E4FT 3FFKB 1BG3A 3VEOA 2GTDA 1HLUA 4H0OA 2P9UA 5EX5A 3G25A 2P9SA 2I7NA 3ZEUA 4FWSA 3CHWA 3WQUA 5AZJB 3D7EO 3VF4A 3ZETB 2Q0UA 3D2EB 3L0QA 4ISEA 4BREA 3MK6A 1T6DA 4H5TA 3ENHA 3H1VX 1T44A 3VEXA 4YDUC 1BWFO 2CGJA 2H3GX 3IFRA 4H0VB 3GBTA 1NMDA 4BG8A 4CZHA 4BC4A 3QMLA 3O1WA 4CZGA 1EQYA 3FLCO 4H0TB 3ID8A 2VWBA 3VGKA 4IXCA 3MN5A 4CBWA 4FWQA 2IVNA 5AQYA 1S3XA 2P9NB 2BTFA 2D1KA 1YVNA 1NGHA 2QW9A 4I6MB 3CJ1A 1IG8A 5EOYA 4BRHA 1GLBG 3H1QA 4CZFA 4M7XA 5JLFA 3HBTA 3ATUA 2P9KB 5AZIB 4EHTA 5AZJA 1KAYA 3D2EA 1MWMA 2W41A 4JAXA 2D0PA 2YHYA 3WEEB 2D0OA 2E1ZA 2FSJA 3FGUA 3FZLA 3MN6A 4BC2A 2P9PB 3CJ7A 4BC3A 4IO8A 1KXPA 4WQ5A 3FZHA 3H46O 4FWRA 4H5RA 3I33A 1NLVA 3VF2A 5JMVA 3WXJA 4A61A 3FZFA 2BUPA 3S41A 5ADXA 2P9NA 2IVPA 4FWNA 4B9QA 3VETA 3HSCA 2E8AA 4I6MA 1ZXOA 2QWOA 4PKGA 4GNIA 5E26A 1HJOA 3U8XA 1SZ2A 2Q1NA 3HTVA 4H03B 4DHYA 3WT0A 3W0LA 3HM8A 2V51B 5AZIA 4CZIA 4BRMA 3CI5A 4BRLA 4H0YB 1YXQA 1J6ZA 3VGMA 3WEEA 1S22A 3JXUA 3QBWA 2HOEA 2ITMA 2P9PA 4QS7A 2W40A 4BRDA 3UE5A 5FPNA 3CIPA 4BG9A 1Z05A 1XUPO 1ZBSA 1TUUA 3KZBA 5BPLA 2IIRA 4FL9A 2A41A 4KBOA 4B1ZA 4CZKA 5AQPA 4FWOA 4HWIA 4XEIA 1NGBA 3CQXA 4B1WB 4CD3A 4FWMA 4K43A 4O5FA 4K25A 3CERA 3BEXA 1NGJA 1C0GA 1HPMA 3QB0A 4H5WA 4IWVA 4PKHA 1MDUB 1YUWA 5E84A 3SK3A 4L3QA 3D2FB 5KQDA 2FF3B 2NLXA 4J8FA 2YCHA 2QWMA 4BRPA 2QWRA 3EKUA 4Z94A 5AQUA 5AQMA 5F2RA 1X9JA 3L6QA 1NGCA 3VOVA 3LDOA 3W3DA 1QQMA 1SAZA 3AARA 3O4WA 3LDPA 4FWKA 4ISGA 1DGKN 4HTLA 4PL8A 3DAWA 1ATSA 4BR9A 3SJHA 3BF3A 4IZ9A 2WUSA 4RTFD 3FZKA 1XC3A 4A62A 5BN8A 1U2VB 3OHRA 2E2NA 4BRFA 1D4XA 3HI0A 4AM6A 3GDQA 3C7NB 3BF1A 3SMSA 4JD2B 2A6AA 1ATRA 3AAPA 3U9DA 1JCEA 2V52B 3TU5A 1GLLO 4BR0A 3ENOA 3D2FA 4B1YB 3CJBA 1P8ZA 1TUYA 1NM1A 5AFUH 3DXKB 2EWSA 2CGLA 4XH1A 1OKJA 5ELZA 2PBDA 5AQSA 3J8AA 1WOQA 2Q97A 4K41A 2A3ZA 2J4RA 5AQOA 3MDQA 3ZETA 2GEMA 4MO5A 3FR0A 2GWKA 1DEJA 4BVPA 5BRHA 1NGGA 1BDGA 2AP1A 4CZEA 3VEVA 5AQTA 2ZWHA 2QWLA 1LOTB 3H3OB 3VEZA 1V4TA 4GY2B 3ATVA 1C0FA 4BRNA 1BUPA 4BRKA 4CZJA 4IJAA 4JD2A 3CQYA 4K42A 1Q18A 4QS9A 3H6EA 4AM7A 4WQ5C 3U4LA 4CD1A 1GLCG 4F9OA 3WUHA 4BQLA 2CH5A 3FE1A 5F0XA 3M1FA 2FXUA 2AA4A 2ASPA 5CE3A 1HKBA 3LM2A 5AQZA 4B1VA 3VEYA 1GLEG 4JNEA 3DXKA 4MO4A 1X3MA 3M3ZA 2GELA 5JICA 4BR2A 3ZX2A 3LDLA 4DQ8A 4MLEA 1HX1A 1HKCA 1NGDA 5BR9A 1K8KB 3TPQA 3EKSA 1NGFA 2P9KA 1GLAG 3BUZB 4CZMA 4FPAA 3JS6A 4BVOA 2QWQA 3WXKA 4BROA 4ISFA 1QZ6A 5AQWA 3DXMB 2A40A 3LDNA 1NWKA 1Y64A 2YI1A 2P9LB 4BR7A 3A8YA 1HUXA 4NB4A 1KAZA 2HF4A 2E2OA 3CJ9A 2YHWA 3R6MA 1H1VA 4FWLA 1RDWX 5AQIA 1BOTO 1WUAA 5AQKA 5I9EB 5KQ8A 4H5VA 3R8EA 3UKRB 3MCPA 3GG4A 2FF6A 3EZWA 5ADXH 1NGIA 2D4WA 5BPNA 2V7YA 3QFPA 5AQQA 3O6WA 3H3NO 2QXLA 2QM1A 1YAGA 3A5MC 1MWKA 2FLOA 1K8KA 1RFQA 2FSKA 2CGKA 2VCPA 2Q2RA 4PL7A 3A5LC 3FZMA 3F9MA 4WQ4A 4IJNA 1GLDG 3DXMA 4EAHD 5KPZA 1SQKA 3AAQA 5BN9A 4BR5A 2E2QA 3B8AX 4BC5A 1T6CA 2P9LA 5KPTA 4RCHA 2ZGZA 3WXLA 2YJFA 3CJCA 3CETA 3QFUA 3GL1A 1G99A 3R9PA 3KVGA 2OANA 2Q36A 3O80A 4FWPA 3A5NC 3QDKA 2YHXA 3UKRA 3H45C 5BREA 2UYTA 4WYBA 5AQXA 4BGAA 2F9WA 2GUPA 4BRCA 3ULEB 1DKGD 1V4SA 3WXIA 3ZX0A 5AQJA 4YDUA 3QBXA 1NGAA 1JCFA 3VEWA 2QWPA 3RSEB 2E2PA 2ASMA 3C0BA 1BO5O 4CBXA 3DJCA 2E20A 1BU6O 3BP8A 4FO0A 3IUCA 5EXWA 4M7YA 3VGLA 3MN7A 2KHOA 1U2VA 4A2AA 2V7ZA 1E4GT 3I8BA 3C7NA 5LJWA 5AQFA 4LC9B 5EVZA 4FOEA 4C23A 4DCHA 5B8HA 4FPBA 5FPEA 5AQHA 4FOIA 3O1BA 3ULEA 1GLJO 2FSNA 4NO7A 5AQGA 3A0IX 1RGIA 3P4IA 4CI6A 3VPZA 2ZGYA 2F9TA 2ZF5O 4EFHA 3L4IA 5JLHA 3CJAA 4EHUA 4H0PA 4EIAA 5TKYA 2Q31A 1MA9B 1GLFO 1BA1A 2ASOA 3EL2A 3RSEA 5EY4A 4RWTA 1Z6RA 5LY3A 2I7PA 4H5NA 4JHDB 3UKUB 1JCGA 1NGEA 3O08A 5BRDA 2E1YA 1CZAN 2P9IB 4XH5A 2NZTA 3O8MA 3QICA 4M63C 1KAXA 4BRAA 3DWLA 1TYQB 5AQNA 3VF6A 4CZLA 1R59O 5LJVA 4B1UB 2DPNA 4PKIA 5AQVA 3VERA 2GWJA 3O5BA 3U9ZA 4BGBA 2E88A 2IVOA 4O8KA 3VESA 5BPMA 1IJJA 4BQZA 4CJ7A 1BA0A 1QQNA 1ATNA 3M6GA 3HZ6A 3LM9A 3EO3A 3KHYA 5AQLA 1U6ZA 4CBUA 4JN4A 4BRIA 5FPMA 2P9UB 2NRHA 2P9SB 3AY9A 2YJEA 2Q0RA 3ZEUB 2QWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQON 4DQSA 1LCUA 1QZ5A 1XHXA 2A5XA 1JL1A 1Z26A 3VA0A 3LL3A 4DR4K 1NJIO 2O8CB 1HKGA 3MWPA 1OVQA 3EN9A 5SZTA 2D5RA 4H0XB 4JKBA 1RDUA 4QS8A 5LL6Z 3ISNC 1X3NA 2CH6A 4LSLA 4GV9A 3HL8A 3IMXA 4OKKA 5AFUA 5M1FA 1CXQA 1HNXK 4JI5K 4KHSA 2OCEA 2E6LA 2G8KA 4A2BA 2WOMA 2G8HA 3A5OC 3V1RA 4EP4A 3CXCM 4FSVA 3LDQA 5KPRA 3QNNA 4I7FA 1BG3A 1HLUA 3KLEA 3CCVN 2P9SA 2I7NA 3ZEUA 3K0SA 3WQUA 3D7EO 2F96A 3D2EB 2RHKA 3THVA 4ZHRA 1T6DA 4FLTA 5EU7A 3SUPA 1QTMA 1BIZA 4E7HA 4M42A 3E9PA 3CFPA 3LZJA 4ELTA 3GBTA 3WNFA 5DM6L 3O1WA 1EQYA 3FLCO 2G8WA 2VWBA 1RT3A 3D6RA 4DS4A 3OW2M 1C1AA 4N5SA 3HRGA 5AQYA 1IBKK 4JKEA 2D1KA 4CEQA 3AVGA 1FJGK 3DYAA 1HPZA 2X6SA 2HHTA 4KO0A 3ZLJA 2GX9A 3THWA 2P9KB 5GIPA 3CC7N 1WSFA 3J80O 3MEDA 3TSPA 1B9DA 2D0PA 1YJ9N 5DK5A 4CF2A 5HLFA 4DV1K 4BC3A 4IO8A 4CF8A 2OPPA 3HPOA 3K5MA 1W9HA 1XNQK 5LMNK 4FWRA 4H5RA 4CJWA 1NG9A 4CJ5A 3VF2A 2O8FB 4A61A 3EYZA 4BWJA 4CEFA 1WBBA 1HNIA 4KI4A 3RRHA 4NXNK 5KRSA 3HSCA 3PLAA 2QA4N 1SKRA 3U8XA 4E3SA 3S5TA 4KHQA 3HTVA 3SNNA 1WSHA 2BDPA 4JKGB 3HM8A 4BRMA 4CERA 3AO1A 3HYFA 1J6ZA 5JVGL 2HOEA 4F3OA 3V9UA 4A57A 3I0RA 1VQKN 4TSXA 4OPJA 1CZ9A 3UE5A 5FPNA 3CCLN 3WNEA 2ATQA 3B6PA 4CHOA 3HOSA 2IIRA 4FL9A 2NNWA 3TABA 5AQPA 4FWOA 1NMNA 3ZSYA 4XEIA 4B1WB 4N47A 4DR7K 4JI2K 2R7YA 3SUNA 4YNQA 1O13A 3CFOA 4FWMA 2RPIA 3DMJA 1OH5A 2P1JA 3AVMA 3QB0A 3OBYA 4YOTA 3CD6N 2HNZA 4DTJA 1YUWA 1KVAA 3G6EN 4EP5A 2FF3B 1IBLK 5KI6A 1NU0A 2NLXA 4J8FA 3DLBA 2YCHA 5AQMA 3Q7CA 1YITN 1NGCA 3LDOA 5C42A 4JRPA 4LH5A 4CHPA 2ZQBA 4IZ9A 2Y1JA 5DM7L 4W5OA 5FRNA 4ID5A 4I9QA 4ILJA 4G1QA 2HMIA 3VTIA 4IEIA 2JLEA 4BRFA 4J2AA 1RT5A 5HRSA 1BCMA 1N6QA 2YHAA 4CJPA 3MCAB 1WN7A 4JD2B 3THYA 1YTAA 3AAPA 4FLWA 4Z4FA 2B4JA 2NRXA 1TK5A 3TU5A 4PY5A 1GLLO 4DMNA 4AH9A 2QTDA 4BR0A 1VQLN 4B8CA 4H4OA 3CJBA 2RN2A 2YHBA 3SQ2A 1IH7A 2HHHK 2EWSA 2CGLA 2P51A 4ELUA 5AQSA 3J8AA 1J54A 5C24A 3WNGA 4K41A 2O4GA 1C0UA 4DTUA 3MDQA 3J81O 4MO5A 2OPRA 4BVPA 1NGGA 1BDGA 5AQTA 3SPZA 2QWLA 1LOTB 4HTUA 5JS1A 3ATVA 4X62K 1C0FA 2KZMA 3K9KA 1TL1A 4CZJA 1C0TA 1SS6A 2OA8A 4CFCA 4QS9A 3H6EA 4RW7A 4CD1A 2DFFA 3QIPA 3PO4A 4WE1A 3FE1A 2X74A 4CK2A 3P39A 4BE2A 3OYMA 1HKBA 4DF8A 4B1VA 4M3YA 4JYAK 3WXMB 3LDLA 3S9HA 3U3GA 1HX1A 3KLHA 3TPQA 3EKSA 3PSIA 5JS2A 3JS6A 1KFDA 3VQEA 3QESA 1N8RO 4ISFA 3RVCA 3DXMB 1NWKA 1ASVA 4Q0BA 5CHIA 4N56A 2OTLN 3LALA 3A8YA 3V4IA 3CYGA 2E2OA 1D9DA 4CIEA 3E01A 1S6QA 4DV7K 4H5VA 3R8EA 4OJRA 5I42A 2P5GA 3NE6A 1IO2A 3EZWA 2BANA 5K14A 3AVFA 2V7YA 3H3NO 1SKWA 2QXLA 3ZT3A 2QM1A 1YAGA 3A5MC 4C8MA 1K8KA 4BE1A 4JS5A 4PL7A 3OY9A 3F9KA 4IJNA 3LDSA 4CECA 3N4QA 2QEXN 2YKMA 1SQKA 1S1WA 4GKKK 5BN9A 1SV5A 4BC5A 4WCEL 5MLCQ 1N5YA 2O8BB 3CYMA 4IG3A 3QFUA 1JLEA 1JLQA 4R5PA 3M8SA 2OANA 2Q36A 5JENA 2KZZA 2YHXA 3QEPA 5BREA 3K59A 2UYTA 2X78A 4WYBA 2KQ2A 2LSNA 3G4SN 4WFNL 1E3MA 3SAHA 4IDKA 5M1QA 4FK4A 1A5XA 4CW7B 1VSJA 2FBYA 5AQJA 3QBXA 1EP4A 4PHTX 1SUQA 3HPGA 1DTQA 4LSNA 3J7YP 3ASMA 3V81A 4KTQA 2E2PA 5CR4A 2ASMA 4CBXA 3DJCA 2E20A 4JK7A 2QKBA 2VG6A 5M1NA 2HHVA 3DOLA 3L2WA 4A5AA 3MN7A 2X6NA 4FXDA 2KHOA 1U2VA 5H1SQ 2V7ZA 5GINA 4CF1A 4C8KA 2IDOA 4DCHA 5FPEA 2RE2A 5AQHA 4IOCL 5FDLA 2W6LA 4HCBA 4FOIA 5AQGA 3A0IX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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