2D1KA

Ternary complex of the wh2 domain of mim with actin-dnase i
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the actin-binding function of missing-in-metastasis
pubmed doi rcsb
total genus 94
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2d1kA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2d1kA04
5AZJB 2VCPA 1KAZA 3U8XA 5AQOA 4CZHA 1NGAA 2H3GX 3DXMA 3FR0A 5E84A 5LJVA 4RCHA 3VF4A 4A2BA 3VEOA 3UKUA 2D0OA 4EFHA 3ENOA 3G25A 2WUSA 2YHWA 4CZFA 2FSKA 3I8BA 4QS7A 2P9PB 2YCHA 2F9WA 3L4IA 1S3XA 4MO4A 4FWNA 1HKCA 3FZLA 5JLFA 4L3QA 2P9SB 4FWSA 3UKRB 4CZLA 3VPZA 5E26A 3VERA 1U2VB 4E1JA 4BRIA 4CZKA 2Q1NA 3TU5A 2CGLA 1DKGD 4BC4A 3M3ZA 4DCHA 5AQVA 4A2AA 1JCEA 3AY9A 4JHDB 4BRCA 1V4SA 3M1FA 1Y64A 1BWFO 4JN4A 2E2PA 4QS9A 4FL9A 4FWMA 4BRAA 1NGGA 3EN9A 4J8FA 4CZJA 3TPQA 5BN8A 4XH5A 4H5TA 4IO8A 1OKJA 5AZIA 3EL2A 2A41A 3SMPA 3M6GA 4BRHA 2GEMA 2W41A 4FWKA 4IXCA 4FWRA 4F9OA 1P8ZA 4MLEA 3D7EO 5BR9A 4BQLA 1QQOA 1YXQA 2YI1A 1GLEG 1NGJA 5KPTA 4CBWA 1G99A 2NRHA 2QWNA 3CERA 2YHXA 2P9LA 2D4WA 5AQJA 3SMSA 1XUPO 3GE1A 3VF2A 4H0PA 5FPEA 1SZ2A 3C7NA 3I33A 3HI0A 2FSJA 3H45C 3ATVA 2GUPA 2A6AA 1CZAN 4BR0A 2P9NB 4EIAA 3D2FB 1S22A 2NLXA 5FPMA 1ZC6A 4H5WA 3P4IA 3BP8A 4BREA 3IMXA 3S41A 3IFRA 4CI6A 2A3ZA 2IVOA 5LJWA 3H3OB 4O5FA 3ZETB 1BA0A 1NGEA 4GNIA 5AFUA 3MN7A 4BRPA 3VGLA 3U9ZA 3GL1A 3GOIA 2F9TA 2ASOA 1HLUA 2PAVA 2Q31A 5AR0A 4H03B 1YVNA 4BG9A 3UE5A 1T44A 4M63C 3SLCA 4BRGA 2BUPA 4BQZA 1K8KB 4EAHD 5AZIB 5F1XA 2Q36A 4CZIA 5AQTA 3HZ6A 1EQYA 3CJ9A 3VEXA 1GLJO 4BGBA 1JCGA 4IJNA 3MN9A 3CIPA 4PKHA 5KQ8A 3EKUA 1BO5O 3LL3A 2A42A 5BPNA 3ATUA 2E8AA 1HKGA 2P9LB 5JLHA 2V52B 4BR4A 4BVPA 1NGHA 2CH5A 4BC3A 2QWLA 5FPNA 2IVNA 4WQ5A 2FSNA 4KBOA 3SJHA 3LM9A 1YAGA 3WEEB 2DPNA 3BEXA 4FWQA 1GLCG 4BRQA 4XEIA 3KVGA 4AM7A 1E4FT 1NWKA 1RGIA 3U9DA 1H1VA 4JAXA 2D1KA 4FPBA 4B1UB 5BRDA 5ADXA 3WXJA 3WXIA 3IDHA 4MLHA 2QW9A 4CBXA 1X9JA 5EVZA 1BA1A 1NBWA 4DHYA 4PKGA 5B8HA 4BG8A 5AQPA 2OANA 3GG4A 5AQWA 1BOTO 4BRMA 4BR7A 3ZX2A 2Q2RA 4B1VA 5EX5A 1QHAA 4K41A 4B1XB 2CGKA 4PL8A 3BUZB 5ELZA 1WUAA 2EWSA 3QICA 1MWKA 3EO3A 1DGKN 1YUWA 3DXKB 1ZXOA 1U6ZA 3HM8A 3MN5A 1TYQB 3EZWA 4C23A 4I6MB 5AQLA 2FF6A 2IIRA 3AARA 5LY3A 5KQDA 1MDUB 4H0YB 4BC2A 4CZEA 3O6WA 5EY4A 1DEJA 3GDQA 3QBWA 2FLOA 5AQGA 4BR2A 3D2EA 5JICA 2ASPA 3ENHA 1ZBSA 2CGJA 4QS8A 4CZMA 4NO7A 2FF3B 2A5XA 2YJEA 3ZEUA 1GLFO 1E4GT 2P9UA 3DXMB 5AQZA 3L6QA 1C0GA 3LDNA 4ISFA 2E20A 3WT0A 4BRFA 2ZWHA 3UKUB 3DAWA 1NGBA 2QWPA 3H6EA 3JXUA 3OHRA 3VF6A 4H5RA 3FFKB 1NGDA 1KAXA 2W40A 3DJCA 3H1VX 1JCFA 2Q97A 3LDQA 5BRFA 5AQIA 1V4TA 4JD2A 3FZHA 4WQ4A 3O1WA 5AQUA 1RDWX 2E1YA 1QQNA 3C0BA 5AZJA 4Y0WA 2GWJA 4BRLA 4M7XA 5F2RA 2D0PA 4CD1A 3CJBA 3FGUA 1RFQA 1MWMA 3O5BA 2BTFA 2P9PA 3IUCA 1HKBA 4H0OA 2E2NA 1HPMA 4RTFD 3U4LA 3VOVA 1BG3A 4H0TB 3UKRA 2P9SA 2P9KA 3O80A 4A62A 3H46O 4PL7A 2HF4A 1IG8A 2QWQA 1TUYA 1BUPA 3QFUA 4FO0A 4WQ5C 3QFPA 4A61A 1NM1A 4H5NA 3O1BA 3J8AA 1NGFA 1NGCA 3QDKA 1BU6O 4AM6A 3A5NC 1Z05A 3DWLA 1X3MA 4JHDA 4JNEA 2E1ZA 3WXKA 5AFUH 2V7YA 3CJ1A 3A0IX 5TKYA 3KHYA 4BRNA 3A8YA 2NZTA 3SK3A 2KHOA 2ZF5O 3VESA 4BVOA 2V7ZA 3C7NB 2YHYA 2CH6A 4ISGA 4BRDA 4HTLA 1MA9B 5EOYA 3R8EA 3CI5A 5AQYA 3ZX3A 2HOEA 3W3DA 4HWIA 4K25A 3RSEA 5AQMA 4DQ8A 3CHWA 5BRHA 5AQQA 3A5LC 5AQXA 1KAYA 3CQYA 1ATNA 2UYTA 4PKIA 5CE3A 1SAZA 3CETA 3VEYA 4B1WB 5AQHA 4XH4A 4O8KA 3VENA 5AQSA 2QWMA 4YDUA 3R9PA 3GBTA 4BROA 4FOIA 3H3NO 3JS6A 3WXLA 4FPAA 4IJAA 1NLVA 4DB3A 1GLBG 3QBXA 4H0XB 3L0QA 2HF3A 3A5OC 3HSCA 1NMDA 3FZKA 2P9NA 4K43A 4FWOA 5ADXH 3D2FA 2P9KB 1Z6RA 3MN6A 3AAQA 1GLDG 3CJAA 5EXWA 4CJ7A 2I7PA 3FLCO 3MCPA 3CJ7A 2P9IA 3A5MC 4BR9A 3WQTA 2VWBA 3ZETA 3H1QA 2AA4A 5BPLA 5JMVA 4GY2B 5F0XA 1J6ZA 2QXLA 3MK6A 4CZGA 4IWVA 1KXPA 3O4WA 1GLLO 3AAPA 3LDOA 4FSVA 4H5VA 4B1ZA 4WQ4C 3WQUA 5KPRA 1K8KA 1HX1A 2HMPA 2Q0RA 3KZBA 4CBUA 4CD3A 4BRKA 2ZGYA 3ID8A 1D4XA 4LC9B 2GWKA 3CJCA 3CQXA 3EKSA 1HJOA 2AP1A 3FZMA 2E88A 4FWLA 1ATSA 1LOTB 3ULEA 3B8AX 3VGKA 5FPDA 2Q0UA 1WOQA 4WYBA 3O08A 4NB4A 3RSEB 3FZFA 4MO5A 4B9QA 1R59O 1GLAG 1HUXA 4H0VB 4XH1A 1ATRA 1C0FA 3LDLA 4BGAA 2J4RA 3BF1A 2A40A 1LCUA 3WEEA 5BREA 1XQSC 3W0LA 5I9EB 4FWPA 1T6DA 3BF3A 1XC3A 1T6CA 5BN9A 1IJJA 3WUHA 4BR5A 5AQRA 3MMVA 4ISEA 3VEZA 4BC5A 1NGIA 3FE1A 4RWTA 1X3NA 1BDGA 2GTDA 1TUUA 1ESVA 1U2VA 1QZ5A 2VYPA 4M7YA 3HTVA 2QM1A 2E2OA 2P9IB 2IVPA 3UB5A 3D2EB 2FXUA 3R6MA 3HBTA 5AQFA 3LM2A 3DXKA 2ZGZA 3F9MA 3VGMA 2GELA 3ZEUB 2QWOA 1TYQA 3QB0A 5AQKA 5AQNA 4I6MA 2P9UB 2V51B 3VEWA 4EHTA 2ITMA 4EHUA 5KPZA 3VEVA 3MDQA 2QWRA 4YDUC 4K42A 4IZ9A 2I7NA 1Q18A 3QMLA 3ULEB 4Z94A 1QQMA 2E2QA 3O8MA 1SQKA 2ASMA 3LDPA 2YJFA 4JD2B 4FOEA 3VETA 3ZX0A 4B1YB 1QZ6A 5BPMA 2PBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J2QA 1VQNN 3NAEA 2WOMA 4FJGA 4CHPA 4DQRA 3DLEA 3I8BA 1N6QA 4HVJA 5KGXA 2YCHA 3O3GA 3HPGA 4LFBK 4B3SK 4M41A 4CK1A 4KB0A 1Q7YO 2NRZA 5CZ2A 4WE1A 3LPUA 2CGLA 1TKZA 1K8AO 3QESA 4A2AA 1JCEA 3AY9A 1V4SA 1NJZA 1Y64A 1QVGM 3AVHA 3BZKA 4BRAA 1NGGA 4LF4K 4O8UA 4DUZK 5BN8A 4XH5A 5C2DA 3KIOA 2A1RA 2E4LA 4Y1CA 4FJ9A 2GEMA 1RTJA 1RNHA 4FWRA 2W6LA 3ITHA 2HHSA 3D7EO 2F8TA 5BR9A 1QQOA 4GKJK 4CBWA 4N41A 3CERA 2P9LA 3MEEA 3NH0A 2YNFA 1W9HA 1O1WA 3KJVA 3VF2A 4CJKA 3JYTA 3OYLA 5FPEA 1SZ2A 5MLCQ 3I0SA 3QEPA 3I56N 3ATVA 4IEEA 1JLQA 2A6AA 4KHNA 4C8LA 4NCGA 2IS3A 4WFBL 1QHTA 4DR3K 3HM9A 4DTOA 4ELVA 2Z1HA 2KFZA 1WSEA 4J2AA 4CIGA 3DLGA 4CFBA 3KD1E 1NK9A 3L3VA 3TWHA 3IKMA 4CI6A 4CW7B 3HXMA 4H4MA 5LJWA 1BA0A 3CQ8A 4YOXA 3U9ZA 2VGMA 2PYLA 1YIJN 1IG9A 5C2FA 3SBTA 3KD5E 4B3RK 2F9TA 5LMUK 4KKOA 4R5PA 2RF2A 2BUPA 1A5XA 1RT7A 5AZIB 4DFJA 1GLJO 4BGBA 4IJNA 2FC0A 3NMUA 3HRGA 3CIPA 4IOXA 1BISA 3KK2A 1TKXA 4ILJA 4DV3K 3G6EN 4DG1A 5C42A 2FBVA 2A42A 5BPNA 1WAJA 2VWKA 4BR4A 3U3GA 2CH5A 1GOAA 2QWLA 5FPNA 2IVNA 3L2QA 4DR6K 3LM9A 3VQEA 3WXMB 3BEXA 4FWQA 4YOVA 3T3FA 4E7HA 4GV6A 4WCEL 4JAXA 4J2EA 2D1KA 4FPBA 3AA4A 1HQUA 1S5JA 2FBYA 4Z4EA 3U6FA 3V9ZA 3OS2A 1X9JA 1BA1A 5B8HA 3GG4A 1A5VA 4LF6K 4IFVA 4BR7A 2O4IA 2HNYA 5EX5A 1KFSA 3P5JA 4K41A 1WUAA 1MWKA 1CLQA 3HM8A 3L4QA 1S1VA 1WSHA 1ILYA 1TYQB 2XY7A 4I6MB 5AQLA 2VGNA 3HPOA 3THYA 4KPYA 3NH2A 4EZ6A 2EHGA 3O6WA 1I3AA 3OJSA 3S5TA 1DEJA 3OBWA 2BDPA 1VQ6N 5AJ3K 4BR2A 3D2EA 5JICA 4FLYA 3KLHA 2CGJA 3M8PA 4QS8A 4CGJA 4CZMA 4OGEA 4NO7A 4U7BA 3MXIA 4GV3A 4LH4A 4N5SA 3V1RA 1YJWN 5HROA 4M45A 3CCSN 4DV5K 3DXMB 2P9UA 4KHPK 5GAGP 3LDNA 4ISFA 3ULDA 2Z1JA 5M1FA 1C1BA 1NGDA 3DJCA 3HPHA 3L2UA 1SKSA 1VK0A 3LDQA 3V6DA 2D0BA 3KWIA 4RW7A 4KFBA 5J2PA 1J9AA 4YY3K 3V9XA 1D5AA 2E1YA 3EZ5A 3C0BA 2ATQA 1U04A 4E7KA 3O4NA 1TKDA 2GWJA 4I2QA 5KRTA 4M7XA 2D0PA 3Q7BA 3AO3A 3MX2A 1JJ2M 3FGUA 1RFQA 3O5BA 2BTFA 2P9PA 1TAUA 4CF8A 3THXA 2E6LA 1IV0A 4FJKA 3BZCA 3CCVN 3ZSVA 4DR2K 4FVUA 4KTZA 1EXQA 2P9KA 2HF4A 1QSLA 4QOZB 3SZ2A 4CHQA 2HMIA 2QWQA 4DTRA 2VG5A 1BUPA 2WFBA 2D0CA 4FO0A 4CHZA 1NK0A 3OS1A 5JS2A 3J7ZO 4JNEA 1VQ4N 4JK8A 1IH7A 2V7YA 3ZSYA 3CCEN 4Y1DA 4O55A 3SK3A 1IKXA 1WSJA 2V7ZA 1VSLA 2YHYA 4BRDA 1MA9B 3DOLA 1N34K 3ALYA 1NOYA 4FLXA 3W3DA 1IBLK 4HWIA 1UA0A 3CHWA 3VQBA 4YNQA 4HUGA 3A5LC 1KAYA 2UUCK 4PKIA 4DF4A 1SAZA 3HVTA 1EWQA 3CETA 3VEYA 4B1WB 3T69A 3VENA 1KFDA 1S1TA 4YDUA 3R9PA 5I3UA 3C65A 3WXLA 1QS4A 3AGRA 1J54A 3L0QA 4DSFA 3KLFA 1ZBHA 3FZKA 3DI6A 4GMJB 3K57A 1OH8A 4CJ5A 3HYFA 4B8CA 1Z6RA 4W5NA 1RDCA 4B9LA 4J2BA 4CJ7A 2I7PA 1RBUA 3FLCO 4IG3A 1HYSA 1B92A 4GVEA 3KK7A 1NK4A 3E9LA 3AVGA 2AA4A 5BPLA 2QXLA 2X6SA 4AHRA 3TAGA 4CEAA 1KXPA 3O4WA 4DU4A 3LDOA 4CGGA 2OYQA 4CFAA 4CJSA 2G8HA 4DLEA 1L3UA 4JRQA 1K8KA 1HX1A 2HMPA 2Q0RA 3I8DA 4IOCL 4LFAK 1HRHA 1RDAA 1RT6A 1LWEA 3TTCA 3DLKA 4DU3A 3ZT0A 3FZMA 3DLHA 2E88A 1ZBUA 4IO9L 1LOTB 1J5EK 1XMQK 4KRFA 4B9UA 5JS1A 1HPZA 2I5JA 4MO5A 3THWA 1RT4A 4XH1A 1WBBA 1C0TA 5FROA 1T8EA 2A40A 3TARA 1LCUA 3WEEA 5BREA 3VQPA 3CCMN 4E89A 4LH5A 3CF5L 1XC3A 1T6CA 3QIPA 1CXUA 3K9KA 4FLUA 4KI4A 3FE1A 4DTNA 4HCBA 3MXMA 1TGOA 3L3UA 5HLFA 4DSIA 2VYPA 3HTVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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