2D1KA

Ternary complex of the wh2 domain of mim with actin-dnase i
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the actin-binding function of missing-in-metastasis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 94
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2d1kA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2d1kA04
5FPEA 3CJCA 1NGFA 3OHRA 3ZX3A 5JLHA 4PKIA 2W41A 3CJ9A 3ZETA 2FLOA 2W40A 2IVNA 3CI5A 4O8KA 5AQHA 3HZ6A 2DPNA 3CJAA 5AZIA 3WXIA 2GUPA 1ATSA 1SAZA 1SZ2A 2P9NB 3DXKB 3EKUA 5AQXA 4FSVA 1GLLO 2QW9A 4JD2B 1YAGA 4H5TA 4FO0A 4EHUA 4M7YA 4B1WB 2E8AA 4JN4A 5TKYA 1C0FA 4H0PA 3H6EA 1ESVA 5AQKA 3A5LC 2V7ZA 4BC3A 2P9UB 3JS6A 4RTFD 4JNEA 5AFUA 4BRQA 1DKGD 1GLCG 2D1KA 5AQJA 5EXWA 4EHTA 2A5XA 1ZBSA 4BC4A 5FPMA 5EVZA 5JMVA 1H1VA 1HLUA 2HMPA 1CZAN 1HPMA 3DAWA 3H1QA 2V51B 3QICA 5AZJA 5KPTA 3ULEA 1U6ZA 5E26A 4CBUA 4EIAA 1QZ6A 1QZ5A 3VEWA 3M1FA 5AQQA 1NMDA 4WQ4C 3VEYA 3R6MA 4QS8A 5LJVA 3UKRA 4AM6A 1MWMA 1NM1A 1BDGA 3RSEA 2A6AA 2P9LB 2Q0UA 4Z94A 5AQZA 4FWRA 4FWNA 4B1VA 4FOIA 3QB0A 1G99A 3VERA 4PL8A 3H45C 2I7NA 5AQPA 1U2VA 2BTFA 3QDKA 3ENHA 4GY2B 3WQUA 2E1ZA 5AQNA 4CZFA 1KAZA 2GTDA 4MLEA 4FWMA 2QWMA 3CJ7A 1BA1A 3QBWA 3G25A 3VESA 1ATNA 1JCEA 3VENA 5BRDA 3KVGA 3U8XA 4CD3A 1MWKA 4BR7A 4CI6A 2QWOA 3SMSA 4MO5A 2IVOA 3JXUA 3D2EB 4EAHD 3MN9A 1T6CA 4FPAA 3LDPA 3F9MA 1BOTO 2QWPA 3MN6A 2Q97A 3WEEA 2YHYA 2ZGZA 3AAQA 3R9PA 2Q2RA 5BREA 3I8BA 3WUHA 1NGAA 5KPZA 2ZF5O 3S41A 3GL1A 2ZGYA 1NGEA 1Q18A 1GLFO 4XH4A 5AQRA 3ZEUB 4BGAA 2FF6A 3O80A 3A8YA 3D2FA 2P9SB 1ATRA 3QBXA 4BRGA 4BVOA 2FSNA 4C23A 1KAXA 4H0OA 4FWOA 2VCPA 4BRCA 3B8AX 4FOEA 3LDQA 2YCHA 3L6QA 4BREA 3CERA 3HSCA 3HBTA 3R8EA 5BR9A 5BPMA 1QHAA 3FZMA 3DXMA 2P9IA 3MN7A 3O5BA 2QWNA 4H5WA 1HUXA 2FSKA 4YDUA 3UKUB 2A41A 3AY9A 3CJ1A 3EKSA 3O1WA 4IXCA 2ASMA 3MK6A 4K43A 3VEVA 2E2PA 3EN9A 3ZX2A 2YI1A 5B8HA 1TUYA 3A5NC 1MDUB 1IG8A 3VGLA 2A42A 3L0QA 1Y64A 4BG8A 3M3ZA 5KQ8A 3FLCO 2P9NA 1TYQB 3DXKA 5AFUH 1YUWA 3LL3A 3EL2A 3CQXA 4H0VB 3A0IX 3M6GA 4Y0WA 3ZX0A 4JD2A 1LCUA 4F9OA 2I7PA 4BRMA 4B1ZA 4RWTA 4FWLA 2Q1NA 3VGMA 1GLEG 4BC5A 3CIPA 5AQSA 3GBTA 2QWRA 4CJ7A 3ENOA 4B1UB 4JHDB 4NO7A 2CGKA 4M7XA 3ATVA 5BPNA 2P9UA 1NGIA 2P9PB 5BN8A 4HTLA 2P9KB 5ADXH 5LJWA 3TU5A 2YJEA 4H5NA 3MCPA 1GLDG 2D4WA 1NBWA 4NB4A 3C7NB 2D0OA 5ELZA 4BRDA 4BQZA 5BRFA 2HF3A 3SMPA 3MDQA 4A62A 2EWSA 1XUPO 4BROA 1NGBA 4BRPA 4B1XB 4M63C 4IWVA 1S22A 3H3NO 5FPNA 4H0TB 4I6MB 4CZIA 4BRAA 1JCGA 5F1XA 2CGLA 4A2AA 2PBDA 4L3QA 4BR0A 1DEJA 4QS9A 4ISFA 3HTVA 1YXQA 5AQWA 2P9LA 4WQ4A 2ASPA 1K8KB 2YHWA 4H03B 4BR4A 3CJBA 1MA9B 3W3DA 1DGKN 1NGHA 3IUCA 4DB3A 2OANA 3SLCA 2GWJA 1T44A 5AQMA 2GEMA 5I9EB 4FWKA 4WQ5C 1NLVA 1YVNA 3U9DA 5F2RA 4LC9B 4BC2A 5KQDA 4XEIA 1RDWX 2FSJA 3IFRA 4H0YB 3VEOA 1HJOA 3GDQA 4BRHA 5EY4A 3SK3A 4CZGA 2J4RA 4IO8A 3D2EA 3W0LA 2KHOA 3P4IA 4BVPA 1IJJA 3VEZA 3L4IA 2E20A 3QMLA 3H46O 4A2BA 3LDLA 1R59O 2E2OA 5AQYA 1QQMA 4K25A 1RGIA 2NLXA 3IDHA 3KZBA 2GELA 3U9ZA 2IIRA 3ZEUA 1X9JA 2QWLA 1HX1A 2P9SA 1HKCA 2NZTA 3MN5A 4O5FA 4AM7A 2Q36A 1QQOA 5AQLA 1NWKA 3O4WA 5BN9A 5KPRA 4CZEA 3LM2A 4BR9A 3WXLA 3VF6A 4CZJA 5AQOA 1NGJA 1KAYA 4DCHA 4BR2A 1GLAG 3EZWA 3ZETB 4K42A 1V4TA 2AP1A 3IMXA 4ISEA 2YHXA 2A40A 5AZIB 4K41A 1E4FT 3UKUA 2VYPA 3BEXA 1SQKA 4QS7A 3UB5A 2PAVA 1KXPA 4B9QA 3CHWA 3FE1A 3FZKA 2QM1A 5E84A 3VF2A 5AQUA 4MLHA 3VEXA 4JAXA 1X3NA 3HI0A 3MMVA 3AARA 3LDOA 2QWQA 3LDNA 5AQFA 5BPLA 5AR0A 4BRLA 1X3MA 1ZC6A 4E1JA 4DHYA 2IVPA 2E88A 3BF1A 4PKHA 2FF3B 3WXJA 1TYQA 4CZLA 3A5OC 3GOIA 4IJAA 2BUPA 3UE5A 3FZLA 4CBXA 3D7EO 1BUPA 1NGDA 1C0GA 1Z6RA 1ZXOA 3O8MA 4PKGA 3BF3A 5AQGA 1J6ZA 2FXUA 4BR5A 3EO3A 2WUSA 1JCFA 1P8ZA 1V4SA 4IZ9A 3C0BA 2Q0RA 3QFUA 5AZJB 5BRHA 2E2NA 4MO4A 3ULEB 4JHDA 2ASOA 3FGUA 3FFKB 2HOEA 4FWQA 2CH5A 2P9PA 3WT0A 4GNIA 2F9WA 2P9KA 4BG9A 3UKRB 1NGCA 3RSEB 4FL9A 4WYBA 1BU6O 4IJNA 3BP8A 3C7NA 4BGBA 4BRFA 1XQSC 4B1YB 3LM9A 1RFQA 1NGGA 2D0PA 3VPZA 5JLFA 3AAPA 1U2VB 2YJFA 2H3GX 4CD1A 5AQIA 5ADXA 4I6MA 1HKBA 3O1BA 3VOVA 4FWSA 5LY3A 3CQYA 2AA4A 4A61A 3J8AA 5AQTA 3HM8A 4H5RA 3FZHA 4BQLA 3VETA 3BUZB 1BG3A 3I33A 4ISGA 4H0XB 1K8KA 5AQVA 5CE3A 1GLBG 3GG4A 4FWPA 2QXLA 4KBOA 3DJCA 3WXKA 4CZKA 3ID8A 1WOQA 2GWKA 1WUAA 3O08A 3FZFA 3H1VX 3CETA 4WQ5A 1D4XA 3WEEB 2VWBA 4BRIA 5FPDA 3VF4A 4DQ8A 5F0XA 1LOTB 2A3ZA 2NRHA 3TPQA 4HWIA 2CGJA 3SJHA 3VGKA 3D2FB 2ITMA 1BO5O 1EQYA 5JICA 3H3OB 4RCHA 4EFHA 4BRKA 1QQNA 1XC3A 2V52B 4XH1A 2E2QA 1Z05A 3A5MC 3ATUA 2HF4A 4CZMA 4BRNA 3O6WA 1GLJO 3QFPA 4YDUC 4CBWA 1T6DA 1S3XA 2P9IB 3DXMB 5EOYA 2ZWHA 1HKGA 1OKJA 2F9TA 1BWFO 3FR0A 1E4GT 4H5VA 4XH5A 4FPBA 5EX5A 1TUUA 2UYTA 3KHYA 3GE1A 4CZHA 3DWLA 3U4LA 4J8FA 4PL7A 3WQTA 2Q31A 2V7YA 2E1YA 1BA0A 2CH6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F5TA 4LFBK 3KLHA 4KTZA 1NGFA 1JLGA 5JLHA 3CJ9A 1QVFM 2FLOA 1NJIO 3L3UA 1N36K 4IKFA 2HHHK 3CI5A 5JVGL 3HPOA 2OPQA 5AZIA 3HZ6A 3C6HA 3WXIA 2BE2A 1RDUA 2ZJRL 1BIUA 2P9NB 4Z4EA 4FM1A 4NLCA 1NK8A 1GLLO 3QIOA 4KV8A 4JD2B 1HNIA 3MCAB 1W0HA 1TK5A 2Y1IA 3JAMO 4H4MA 3LP0A 4JN4A 2VQEK 2UXCK 3RMCA 2NRVA 1S9EA 3CD6N 1D5AA 2V7ZA 3VQ4A 1OH7A 2HHVA 2P9UB 4RTFD 1WAJA 1ZBIA 1GLCG 2D1KA 1KVBA 3AA4A 3NHGA 5FPMA 5JMVA 4GV6A 5C10A 2KFNA 4N56A 3DAWA 3TR8A 2V51B 2W42A 4HTUA 3QINA 3MAQA 3L2VA 3S3NA 1EXQA 5LMUK 5AQQA 5CYQA 3R6MA 4QS8A 3UKRA 1O13A 3R3LA 1QSLA 1T8EA 1BDGA 3VQ9A 3TAQA 2HHTA 1VSEA 3AVKA 4FWRA 4FWNA 4H4OA 4NCBA 3T1HK 4M3ZA 3VERA 3H45C 1NJYA 5AQPA 1U2VA 3OYKA 3CCEN 4CEBA 3QDKA 2OYQA 3SQ0A 4B3OA 4JKGA 4DWIA 4CZFA 4EZ9A 5GAEP 4OPJA 4DSIA 3VESA 4C1NI 1ATNA 1OVQA 3DLLL 3VA3A 3U8XA 3AVMA 4CD3A 2PYJA 1MWKA 1RBTA 2IS3A 3SI6A 1S6QA 3AA3A 4FPAA 2E6LA 3RR8A 1GOCA 1KRPA 2RF2A 4OLAA 2Q2RA 4DSEA 4DFKA 2ZF5O 3S41A 3DLBA 1NGEA 5AQRA 3QO9A 3L2QA 2FF6A 3O80A 2G8VA 3D2FA 3EZ5A 1ATRA 4PWDA 3AVCA 1BISA 3QBXA 5HROA 4BRGA 4BVOA 2FSNA 3G6EN 1WSGA 3MX2A 1XMOK 4KTWA 5C15A 5SZTA 3SBTA 2YCHA 2D0BA 1LAWA 4BREA 3HBTA 4DV1K 2UUCK 4IEEA 2FBVA 3CCSN 1IH7A 3LP1A 3N4QA 1TK8A 4H5WA 2O8BB 3TABA 1HUXA 3UKUB 2A41A 1VHXA 3CJ1A 4EP4A 3RVCA 3ZX2A 1IKXA 3PV8A 4CJWA 1VK0A 1MDUB 3VGLA 4AF1A 5TKWA 2DTUA 4BG8A 4E89A 4CF0A 5KQ8A 3NVMA 3FLCO 5AFUH 2PZSA 4KKOA 3M6GA 1DTQA 1TV6A 1U47A 1IV0A 4BRMA 4CVNE 4B1ZA 2IC3A 3ITHA 1GLEG 1QVGM 5AQSA 3V4IA 3P38A 4CF8A 3S5TA 3LWMA 3L3VA 5BPNA 3SPYA 3T69A 2UXBK 4KI4A 4H5NA 4JYAK 4N5SA 1JLBA 4CGFA 4Q0BA 5C2FA 4BRDA 4CERA 1HPZA 4AHVA 3QETA 4X64K 4IOCL 4BRPA 4B1XB 4IWVA 5FPNA 4CGGA 1CZ9A 2OPSA 4IG0A 2GX9A 4FK0A 4OKKA 4L3QA 4FJHA 1A5VA 4A57A 3L8BA 2OPPA 1VRUA 3LAKA 4NXMK 4YOXA 3CJBA 3RMBA 3O3GA 4BWMA 4RW8A 1RILA 5HRSA 4JKDA 4PA1A 4FWKA 4WQ5C 4Z0UA 4CJQA 2NRTA 3U9DA 2QKBA 3RRGA 5F2RA 4FLVA 4C8OA 4BC2A 3V1OA 3NDKA 4CEDA 2FC0A 3CCUN 4E1NA 5KQDA 1RDWX 1HJOA 5FRNA 2G8IA 3L2WA 2VGMA 5GAGP 3I0RA 2KTQA 4K8ZA 4CZGA 1X9WA 4IO8A 4F2SA 3D2EA 4HCCA 2KHOA 3KTQA 3SAFA 3NMUA 2E20A 3SAHA 4DUYK 1QQMA 2X6SA 2KKZA 2QK9A 2O8CB 4M42A 4YOWA 4KH4A 2X6NA 4WFAL 3J80O 1JXBA 4DR1K 2O8EA 1X9JA 1W9HA 1HX1A 4M3YA 2NZTA 4CF1A 3MN5A 4O5FA 4W5TA 2YNIA 5AQLA 4KB1A 4ZTFA 4A5AA 3K9KA 4IFYA 5KPRA 4G9ZA 4CEEA 2FBXA 2E5LK 5CYMA 3M5RA 5AQOA 4X66K 4KHWA 2XHBA 1HNWK 1VSHA 2FBTA 4BR2A 3G71N 1J5EK 4LF5K 2AP1A 4CHPA 2HBLA 1Q8IA 2VYPA 3BEXA 4CIEA 2PAVA 1KXPA 5DMRA 4B9QA 3A2FA 3U6FA 4FW1A 3OYHA 5E84A 5M1NA 1ZBLA 4MLHA 3SUQA 4CJEA 3M8RA 1X3NA 3HI0A 3LDOA 3F2KA 4CIFA 5BPLA 5AR0A 1IBKK 1X3MA 4K0KK 4E1JA 3OYNA 3PIOL 4FJIA 4J2BA 3RMDA 2E88A 1JL1A 4DV2K 3WXJA 1TYQA 5A2QO 3A5OC 4IJAA 3KD1E 3MEGA 2QTDA 1C0GA 3AO5A 4IG3A 4PKGA 1VQON 3BF3A 4JKEA 1N5YA 1S1UA 4BR5A 3EO3A 1L5UA 3THXB 1RNHA 1P8ZA 4ELUA 1L3VA 3SPZA 3P39A 4B3MK 2ASOA 5CZ2A 4HUEA 2HOEA 4FWQA 3J7ZO 3KKSA 4DV3K 4GNIA 2F9WA 3E01A 1U48A 1P90A 5SWMA 1NGCA 4BDPA 2ZQBA 3HVRA 1BU6O 1YJWN 4BGBA 4GVEA 1XQSC 4BWJA 1HR0K 1J5OA 4B1YB 5C24A 5HOOA 4LF8K 5JLFA 3DRSA 2YJFA 2H3GX 4CD1A 2VQFK 3TI0A 3NAEA 4LF9K 1RBSA 2AA4A 3O3FA 3QEWA 4JRQA 4DF8A 3HM8A 3FZHA 4BQLA 3NGZA 2XO7A 1HNXK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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