2D1KA

Ternary complex of the wh2 domain of mim with actin-dnase i
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the actin-binding function of missing-in-metastasis
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 94
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2d1kA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2d1kA04
5KPRA 3DWLA 3C7NA 5JLHA 3F9MA 3O08A 1YAGA 4YDUA 1TYQA 3CJ7A 1GLAG 3HSCA 4FWMA 3ZEUB 1RFQA 4QS9A 3WXIA 1U6ZA 3IMXA 1HJOA 4WYBA 3D2FB 1BG3A 5EXWA 1P8ZA 2FF3B 2V7YA 3O6WA 3R9PA 4A2BA 2WUSA 4MLEA 2ITMA 3VGKA 3VGMA 3LDNA 5JICA 1DGKN 1IG8A 1R59O 2OANA 1MWMA 4A62A 4B1WB 2QWLA 4FWQA 3SMPA 4BGAA 5AQHA 1U2VA 4BRKA 5E26A 2CH5A 3O8MA 1MDUB 3BEXA 3H1VX 4EAHD 3O4WA 1S22A 4MO5A 3WXLA 4BR4A 2E88A 3FZMA 5AQTA 1BA0A 1KAYA 2Q31A 3UB5A 2Q1NA 3C7NB 4EFHA 4WQ5A 3FR0A 4PKGA 4B1UB 1BA1A 4QS7A 3ATVA 5CE3A 2ASMA 1E4FT 4IO8A 3MCPA 5BN8A 1HPMA 2IVNA 3SK3A 2P9SA 1QQOA 2P9KA 3CI5A 4CZIA 5KPTA 2F9WA 5AQVA 2GTDA 3EN9A 1HUXA 5BPNA 3FFKB 4FOEA 1KAZA 4JAXA 4B1YB 3QBXA 4DQ8A 3ZETB 3EL2A 3WT0A 2J4RA 3BF3A 4H0PA 3BP8A 2GUPA 5EX5A 5AQSA 1NMDA 3ULEA 2GEMA 4H0OA 4CBXA 2QWRA 1NBWA 3HM8A 1ZC6A 2P9PA 3GE1A 4CZHA 1IJJA 3U4LA 1WUAA 4CD3A 5B8HA 3ZEUA 1T44A 3EKUA 1HLUA 4CBUA 3U9ZA 1JCEA 3D2FA 3L0QA 3IDHA 4IJAA 1BWFO 2VCPA 3BF1A 3WQTA 2Q0RA 1BO5O 2A40A 4RWTA 5BRHA 4B1VA 3DXMA 2QWNA 4NO7A 3DAWA 4LC9B 3C0BA 4BRPA 4FL9A 4H5WA 5BR9A 1ZBSA 5FPNA 3LDOA 2D0PA 3SLCA 3QMLA 3SJHA 3QB0A 4H0YB 5AQXA 5F0XA 2A5XA 4H5NA 1TUYA 3WQUA 3FGUA 5AQGA 3MMVA 3A5NC 3UKUA 3MK6A 5AQPA 2AA4A 1SZ2A 4H0TB 5F2RA 3M3ZA 5AQUA 4DB3A 2P9LB 4XH1A 2Q97A 3J8AA 3LDQA 3ENHA 2D0OA 5AR0A 2FLOA 5ADXH 4A2AA 3A0IX 1V4TA 3GG4A 4BRHA 4KBOA 4H5RA 3IFRA 3KHYA 2IIRA 2NLXA 3CJBA 1MWKA 4WQ4A 5BREA 4K42A 2E2OA 4CZFA 2QWMA 5AQWA 3ZX0A 2FSKA 3DJCA 4FWKA 2F9TA 4O8KA 1WOQA 5F1XA 1J6ZA 5AQZA 3ZETA 3DXMB 4BREA 3VOVA 4BC2A 1EQYA 2YI1A 3O1BA 1ESVA 2VYPA 1YXQA 1GLEG 1NGGA 3H45C 3IUCA 4FSVA 3CQXA 3FLCO 2E2NA 1GLJO 1BU6O 4B1ZA 2HF4A 1NGIA 1GLDG 3QICA 5AQRA 2V7ZA 2GELA 1XQSC 4BG9A 3UKUB 3GBTA 1S3XA 4FWPA 4K25A 3U8XA 5I9EB 5AQKA 3L6QA 5AQLA 4BR5A 4Z94A 3GOIA 3FZLA 1KAXA 5AQJA 3VERA 1GLFO 2W41A 1K8KB 5KQ8A 5ADXA 3FZHA 3JS6A 3LM9A 3QDKA 4FPAA 3WXKA 1NWKA 3VGLA 3CJ1A 5JMVA 1XC3A 3A5MC 2YJEA 5AZJA 3FE1A 5FPEA 4YDUC 5EOYA 2QXLA 4XH5A 2ZF5O 4BG8A 4EHUA 2VWBA 3S41A 1SAZA 2YHWA 4B1XB 3WXJA 4J8FA 4BQLA 3QFUA 3SMSA 4RTFD 2YJFA 2D1KA 3CJ9A 2CGJA 2ASPA 1NGAA 4PKHA 1H1VA 3A8YA 5AZIA 2H3GX 1LCUA 2PBDA 4MLHA 4FWNA 5AQFA 5AQMA 1NGBA 2P9LA 1X9JA 4FO0A 3R8EA 3VF2A 2Q2RA 1E4GT 4CZLA 3KZBA 3VPZA 1JCFA 4A61A 4NB4A 3TPQA 4BRAA 2D4WA 5AQNA 2E2QA 3QBWA 3H3NO 3GDQA 1NLVA 3UKRB 1QZ5A 3AARA 3CIPA 2KHOA 3HTVA 3LL3A 4WQ5C 4O5FA 5AZJB 3TU5A 1Z05A 1RGIA 2V51B 4GY2B 4E1JA 3M1FA 2A41A 2QWQA 4JHDB 4BVPA 4BRCA 1GLBG 5EY4A 4BRNA 5LY3A 4BQZA 2ZWHA 5BRFA 5AQOA 3HBTA 4FWSA 2I7NA 3H3OB 5AZIB 2YHYA 1NGJA 4B9QA 1SQKA 3FZKA 4FWOA 2GWJA 3R6MA 1K8KA 4H03B 4FWRA 2FXUA 2PAVA 1RDWX 3I33A 3CQYA 4C23A 4CZMA 4XEIA 4GNIA 4CJ7A 3O1WA 3O80A 1HKBA 1NGCA 3MN5A 3WUHA 1JCGA 3EZWA 3EO3A 2QWPA 1NGHA 3EKSA 1MA9B 4FOIA 4JNEA 2FF6A 2QWOA 2EWSA 4BRFA 5LJVA 1ATRA 4DCHA 3CETA 3AY9A 4EHTA 5JLFA 2Q36A 3A5OC 3U9DA 1NGEA 1YUWA 4RCHA 4BRLA 2YCHA 2A42A 3ZX2A 1T6CA 1ZXOA 4IWVA 4JD2A 2NZTA 1T6DA 2CGKA 2ZGYA 4HWIA 5AQQA 2GWKA 3LDLA 1Y64A 2P9IB 3CERA 5KQDA 2CH6A 3BUZB 2BTFA 5BN9A 4FWLA 2E2PA 3QFPA 3VF6A 4BVOA 2YHXA 2HF3A 4FPBA 3VF4A 3VEOA 5BRDA 5AQYA 1ATNA 1KXPA 4AM6A 3GL1A 5BPMA 2A3ZA 4I6MA 1YVNA 1V4SA 3UKRA 4BR0A 4BR2A 1GLCG 4Y0WA 3MN7A 1BDGA 1NGFA 2I7PA 2AP1A 2NRHA 3LDPA 1HKGA 4CZKA 3O5BA 2HOEA 2IVPA 4K43A 1BUPA 4H0VB 4BR9A 4ISFA 4BROA 3ATUA 2ASOA 4IJNA 3VENA 3HI0A 2V52B 5AFUH 3I8BA 4JHDA 1HX1A 4BC3A 4K41A 3MN9A 1XUPO 1TYQB 4WQ4C 1NGDA 2A6AA 3JXUA 2ZGZA 2P9NA 4L3QA 4M7XA 3DXKA 1DKGD 2P9UA 4XH4A 4ISEA 3B8AX 4MO4A 4ISGA 4CZJA 3WEEA 4CI6A 3RSEA 4JD2B 3HZ6A 1OKJA 4BRMA 1G99A 1QQNA 2FSJA 3MN6A 1X3MA 3VEXA 2E8AA 3CJAA 5BPLA 2QM1A 4H5VA 4HTLA 3VESA 2E1ZA 3H46O 4QS8A 3D2EA 3P4IA 5LJWA 4I6MB 3VEZA 3L4IA 5FPMA 1U2VB 5FPDA 4CD1A 4PKIA 4BRDA 4IZ9A 2UYTA 5AQIA 4H0XB 4PL7A 3W3DA 4F9OA 3H1QA 1QQMA 3G25A 5EVZA 3ZX3A 1QZ6A 3VETA 4BC5A 4M63C 5AFUA 4DHYA 2FSNA 2E20A 1CZAN 4BC4A 1QHAA 3M6GA 4CZEA 1Z6RA 1X3NA 3OHRA 4BGBA 4EIAA 2HMPA 4M7YA 2Q0UA 3UE5A 1BOTO 4H5TA 1TUUA 3FZFA 4BR7A 4CZGA 2P9NB 2QW9A 2W40A 3ID8A 4IXCA 3LM2A 3DXKB 2P9SB 2P9UB 3H6EA 1C0FA 1C0GA 2P9IA 5ELZA 1LOTB 3WEEB 4BRGA 2P9KB 1Q18A 2E1YA 3A5LC 2IVOA 3AAQA 3D7EO 3RSEB 2CGLA 4BRIA 3W0LA 1HKCA 4CBWA 5TKYA 1ATSA 3VEYA 5KPZA 3MDQA 3ENOA 4AM7A 4PL8A 3AAPA 1NM1A 4BRQA 3VEVA 1DEJA 2BUPA 2DPNA 3VEWA 3D2EB 4JN4A 3KVGA 3CHWA 3ULEB 3CJCA 1GLLO 1D4XA 2P9PB 5E84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCSN 1S72N 3V4IA 3C7NA 3F9MA 3TAQA 3S3MA 5FRNA 3LPTA 3CJ7A 1QS4A 3HSCA 4FWMA 1RFQA 3WXIA 2XY8A 3JSMA 3DI6A 2QI2A 4WYBA 1BG3A 3VN5A 3CCUN 1TVRA 3ZLJA 4BDPA 1HPZA 1I3AA 4MLEA 1VSLA 4BWMA 3KLFA 1TKZA 3LDNA 1IG8A 4FCYA 5JVHL 4OLBA 3SYZA 3AVFA 3MEDA 2OANA 4CFBA 4IOAL 4DSJA 4B1WB 3NF9A 2O8FA 4FWQA 3SMPA 4BGAA 2C1GA 3O9RA 2FBVA 1U2VA 4BRKA 5E26A 5C24A 1MDUB 3NF8A 1S22A 3MXIA 1Q9YA 4BR4A 3B6PA 1LWFA 4B3MK 5AQTA 1KAYA 3HJFA 2KKZA 4CJ3A 3C6AA 5DM6L 2WONA 1NG9A 3FR0A 3ATVA 4FM2A 2ZD1A 3MCPA 1HPMA 2IVNA 3CI5A 3OYFA 5KPTA 4B3OA 2F8TA 3OYNA 3VTIA 1QVFM 3EN9A 4FOEA 4JAXA 3KWIA 3CYGA 3QBXA 4O8UA 3RVCA 3ZETB 4CFCA 4DQIA 2HHIA 4CHQA 2GUPA 4LF8K 4J2EA 3E9PA 2G8FA 4JKBA 1NMDA 1LAWA 1IKWA 4CBXA 3HM8A 1ZC6A 3LPUA 2P9PA 2Y1IA 2UUAK 1NJXA 5DK5A 1WUAA 3HP6A 1HQEA 5B8HA 3ZEUA 3L2QA 2OCEA 4CBUA 2YKMA 3CMAN 1VQ8N 1IKXA 4IJAA 1YJNN 2HMIA 4GMJB 1SL1A 3WQTA 1BO5O 1BI4B 1L3VA 4JI2K 2O8EA 4RWTA 1WN7A 4DFMA 2QWNA 3DAWA 2G8WA 4H5WA 5BR9A 4FZYA 4C1NK 2HBJA 3QMLA 5AQXA 5F0XA 3QLHA 4B9SA 2HHXA 5LMNK 4DTJA 5HROA 3FGUA 4DR6K 2AA4A 2P51A 1RILA 4XH1A 2ETJA 3SZ2A 2VWKA 3LDQA 2WTUA 3ENHA 3VQ4A 2EHGA 4JEPA 1S6PA 3AGKA 2ZJPL 3A0IX 1V4TA 3WNHA 4KBOA 4DTXA 4DSLA 4JKCA 3O3FA 2QWMA 4K8ZA 4CJLA 3CCVN 3ZX0A 2P1JA 4FWKA 4DQQA 1J6ZA 2B4JA 3DXMB 3VOVA 3OTOK 4LD0A 1RT4A 4WCEL 4JRPA 2E2NA 4CEZA 1GLJO 4OPKA 2HHTA 2HVIA 3J80O 4KHWA 2PFUA 2V7ZA 2GELA 4FLTA 2NRZA 1E3MA 1S3XA 5I9EB 3ZSVA 4Z94A 3GOIA 1XMQK 4H4OA 1KAXA 1GLFO 4YNQA 4B9VA 3NMUA 1NKBA 3AA3A 1WB9A 4C8KA 3SAGA 2BGGA 3HK2A 1QSYA 4JI8K 5AZJA 5FPEA 3KLEA 2QXLA 3HRGA 1WAJA 1XHXA 4BG8A 4KTZA 5DM7L 3PUFA 4JI3K 4CIEA 3VQDA 3TAMA 4PKHA 4CHOA 3A8YA 5J2PA 4M42A 3CC2N 3ID6A 2ATQA 5AQMA 1NGBA 3O9TA 4RW6A 1N34K 4FO0A 3MXJA 3IS9A 1KLNA 3SAFA 3OYJA 3VPZA 4YOYA 1WLJA 3TPQA 5FROA 2D4WA 1J53A 1ZBHA 2UXBK 3CMEN 4DTMA 1SKSA 4AHUA 1WNSA 4B3TK 3CCQN 3UKRB 4WFBL 1QZ5A 3AARA 2KHOA 1CLQA 4C8OA 3AO2A 3AO3A 2P5GA 1Z05A 3NFAA 3AVHA 4AILC 4GY2B 1RDUA 3D6RA 5HP1A 4JHDB 4BRNA 4N41A 4BQZA 4Z4CA 3CXCM 4FWSA 2I7NA 2HHVA 1EETA 1NGJA 4B9QA 2X6SA 3THWA 3SCXA 2GX9A 4DV7K 2GWJA 5HRNA 4M3UA 3R6MA 1K8KA 4H03B 3I8DA 2UU9K 4FWRA 1VHXA 2IAJA 1NKEA 2F96A 1NMNA 2PAVA 3RR7A 3I33A 3BY5A 4ICLA 2O4IA 1O1WA 4CJ7A 3LP3A 1QE1A 3O1WA 4CJUA 4EZ9A 4FVMA 1NGCA 3SBGA 1JCGA 3EEQA 2IOCA 1MA9B 4JNEA 2QWOA 1D8YA 1Q86O 1ATRA 3DRSA 2RF2A 2Q36A 3I55N 3V9XA 4O5BA 1XHZA 4RCHA 1YJ9N 4YORA 3PO4A 2A42A 4OJRA 2ZGYA 4NYFA 5AQQA 3S5TA 3SJJA 4DKWA 3LDLA 3CERA 4CCHA 3WNFA 4FWLA 4HUGA 4GVEA 3HVRA 4IEIA 3VA3A 3DRRA 3DLGA 3MEGA 3MX5A 5BPMA 4AM6A 1NJYA 1T8EA 1YVNA 1V4SA 1HQUA 5HL7L 2O8BB 4Y0WA 3G6EN 2AP1A 2NRHA 4CZKA 1L3TA 2HOEA 4K43A 4BROA 5MLCQ 3KD1E 5AFUH 4N47A 3KK3A 1YIJN 3DLKA 1YVUA 4A57A 1VSKA 4BE1A 3MN9A 3CCJN 4I2QA 2A6AA 3RMBA 4NCAA 3K9JA 4MO4A 1S6QA 2LSNA 1CXQA 3RSEA 3VQQA 3C65A 3SPYA 3CPWM 4DR7K 1QQNA 1S1UA 1IO2A 2FSJA 3E66A 2E8AA 5BPLA 3ZSQA 4W5TA 4H5VA 1LV5A 3QETA 2O8FB 3VEZA 5J1EA 4JRQA 3L4IA 1JXBA 1U2VB 5FPMA 3QEWA 5FPDA 1VSIA 1KSPA 4BRDA 4OKEA 4DTUA 1C0TA 5AQIA 4JI7K 3W3DA 2KQ2A 4F9OA 1QQMA 3SUPA 2OA8A 4BC5A 5AFUA 4DHYA 2FSNA 1YJWN 2E20A 1KRPA 4CZEA 4BGBA 3TSPA 1X3NA 4Z0UA 2O8CB 4F2RA 3NVMA 1BIZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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