4EHUA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adpnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
total genus 92
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA01
4BRNA 2GWJA 2A3ZA 1OKJA 3IMXA 3QB0A 3UKRA 2Q31A 4XEIA 3VOVA 5AFUH 3A8YA 3ZX3A 4IO8A 1SQKA 3QDKA 4CZIA 1H1VA 1YXQA 2IVPA 4M7YA 3FLCO 1KAXA 3BF3A 3MMVA 3TU5A 2YHWA 5ELZA 3HBTA 4BC5A 3UKUA 1KAYA 3CQXA 5E26A 3DXMA 2YI1A 4JD2B 3CQYA 4BRIA 5AQQA 3VENA 3EL2A 4DHYA 2A5XA 4QS8A 3LDQA 4PKGA 5JLHA 5BPLA 4BRDA 3CJBA 4E1JA 1NGEA 3QICA 4FWKA 4PKHA 1NGHA 2P9KA 3QFUA 1ATSA 3CJ9A 3A0IX 3BUZB 1TUYA 4JHDA 1XC3A 3C0BA 5AFUA 4WQ4C 3EN9A 3KHYA 3GDQA 2E2PA 2ZGZA 5F2RA 5BRHA 2HMPA 3O1BA 3U4LA 3D2EA 3VETA 1RFQA 3FGUA 4BQZA 4XH4A 4J8FA 1RGIA 2Q1NA 3ENHA 4K42A 3ZEUA 2FF3B 3MDQA 4Z94A 2NZTA 3O08A 1ATNA 3DJCA 5AQRA 2I7PA 5AQUA 3FR0A 3VGMA 4BQLA 1KXPA 2WUSA 5AZIB 1HLUA 4BRHA 2AP1A 4RTFD 4H5TA 3I8BA 3FZHA 4CZMA 2QM1A 4BRCA 1BDGA 3C7NA 3GBTA 4BR9A 1X9JA 3SLCA 4CBXA 4KBOA 3M3ZA 4Y0WA 4H5RA 2ZGYA 4FWPA 4FO0A 1QZ6A 3DXKB 3CERA 3A5NC 1GLLO 1NM1A 2QWLA 4BRLA 3IFRA 3WXLA 4H03B 3EKUA 1C0FA 3CHWA 3IDHA 4BRFA 5I9EB 2ASMA 3R9PA 5ADXH 1U2VB 4A2BA 5F1XA 1V4TA 3FZLA 3H46O 3BF1A 5LJWA 3FFKB 4FWOA 1GLCG 1YUWA 3BEXA 4BC3A 3WUHA 3VERA 1GLEG 5AQLA 4EFHA 4FWQA 1JCEA 3WEEB 4H0YB 2HF3A 4XH5A 4YDUC 2HOEA 5BPNA 4BRKA 5AQOA 2IVOA 4I6MA 4BRGA 1Z6RA 1U6ZA 3O5BA 4CZKA 4BR7A 3BP8A 2FSKA 1DKGD 5JMVA 2EWSA 1TYQB 2E2QA 5ADXA 1WUAA 4K43A 4CZEA 3VEYA 2GTDA 3U9ZA 4ISEA 4CBUA 1T6CA 5AZJB 3QBWA 2KHOA 2QWNA 3WXIA 4PKIA 2PAVA 3VF2A 2BTFA 2P9LB 4EIAA 5KQ8A 1BG3A 1HKGA 4H5WA 5AQKA 1S22A 3D2FA 5FPEA 2CH5A 1GLBG 1X3MA 2A40A 2P9IB 4JNEA 1BOTO 3B8AX 4BC2A 1XQSC 1JCFA 4IZ9A 5BRFA 3GE1A 1E4FT 2A42A 4H0OA 3ZX2A 2FF6A 4EHTA 5FPDA 2ITMA 2V7ZA 2P9PA 1MDUB 4IXCA 4BRPA 4HWIA 1BO5O 4DB3A 2P9UB 2YJEA 3DXKA 4L3QA 4K25A 3G25A 1K8KB 3W0LA 4A61A 1D4XA 5AQHA 3H3NO 4FSVA 1DEJA 3CI5A 3QFPA 4A62A 4BG9A 5LJVA 4H0VB 5EVZA 1BA1A 5AQGA 1QQNA 3VEOA 5AQYA 3QBXA 4H5NA 5BN9A 3WQTA 2Q36A 1ZXOA 4FPBA 5EY4A 2FSJA 4H0PA 4BREA 2QXLA 3A5OC 3LL3A 4JN4A 4BR0A 1MWKA 4CZFA 3SJHA 4K41A 3HI0A 5AQVA 3UKRB 3O1WA 4QS9A 1GLDG 4BROA 4CZGA 3ENOA 3QMLA 2VWBA 2P9SA 4FWMA 3HZ6A 5TKYA 5CE3A 3O8MA 2D1KA 3HTVA 5LY3A 1X3NA 3O4WA 3ULEB 3ZETA 4NO7A 4FOEA 5KPTA 1GLFO 5FPMA 4B1ZA 1GLJO 3KZBA 3SMSA 4MLHA 5KPZA 3AARA 5AQMA 3UKUB 3LDOA 2GUPA 3VGKA 2QWOA 2NLXA 4YDUA 1ZBSA 4EHUA 3DXMB 2FLOA 3RSEA 1R59O 2P9NA 3KVGA 3LM9A 5AQJA 5AQXA 4C23A 3U8XA 3VF6A 1ESVA 4H5VA 1NGCA 3F9MA 5E84A 3OHRA 5JLFA 3HM8A 3H45C 4CD3A 2P9KB 3J8AA 4FOIA 4NB4A 4FWLA 2YCHA 1QQMA 2CH6A 4JHDB 2CGLA 2E1ZA 4CZJA 4B1WB 5BN8A 3CETA 2F9WA 4M7XA 3MN5A 1TUUA 2P9IA 2QWMA 5AQZA 3VGLA 3ZEUB 5FPNA 4FL9A 1Y64A 5EX5A 4JD2A 3JXUA 2E8AA 3GG4A 3H6EA 4CBWA 3DAWA 5AQIA 3H3OB 3LDLA 2W40A 4B1XB 2E88A 2IIRA 3CIPA 3P4IA 4EAHD 2QWRA 2GEMA 1NBWA 3M1FA 1NGDA 3A5LC 5KQDA 3L4IA 4BGBA 4WQ5C 3VEWA 4BR5A 3C7NB 4BR4A 4LC9B 4BGAA 2Q0UA 1G99A 2HF4A 3MN6A 3S41A 4B1UB 1LOTB 1HX1A 3WQUA 4CJ7A 5BR9A 1Q18A 1GLAG 1J6ZA 1SZ2A 4WQ4A 2UYTA 1QZ5A 2H3GX 4MLEA 3WXJA 4XH1A 4B1VA 2CGKA 2E20A 3L0QA 3R8EA 4BVOA 2BUPA 2AA4A 2QWQA 1NGFA 5AZIA 2VCPA 4IJAA 2OANA 4BVPA 1V4SA 2V51B 3O80A 5AQPA 1HKCA 5F0XA 2DPNA 4RCHA 2D4WA 3VF4A 4F9OA 5AQFA 3LDNA 4IWVA 1HUXA 2NRHA 3ULEA 4BC4A 1CZAN 3H1QA 1BA0A 2CGJA 2ZF5O 4BRAA 2FXUA 4H0TB 3FZKA 4QS7A 3CJAA 4BG8A 4FWSA 2Q2RA 3ATUA 1IJJA 3AAPA 1T44A 3LDPA 4I6MB 1KAZA 4AM6A 5AQNA 1HJOA 1MA9B 3MCPA 4A2AA 4BR2A 3M6GA 1U2VA 4BRQA 4CZHA 5BRDA 2PBDA 5B8HA 3MN7A 1ZC6A 3CJ1A 4JAXA 2ASOA 1S3XA 1DGKN 3L6QA 3VESA 4GNIA 2A6AA 2ZWHA 3R6MA 1C0GA 4ISGA 4PL7A 3WEEA 1P8ZA 3VEVA 3W3DA 3WXKA 1NGGA 1YAGA 1HPMA 1XUPO 2F9TA 2J4RA 4ISFA 5EXWA 2E1YA 4DQ8A 1BWFO 2YHYA 3EZWA 3GL1A 2YHXA 2QWPA 3AAQA 4FWRA 4O5FA 3D2FB 1NWKA 3JS6A 2GELA 1NMDA 1BU6O 1T6DA 2I7NA 5AQWA 1LCUA 3MK6A 4HTLA 3CJ7A 4DCHA 3IUCA 1TYQA 3WT0A 1EQYA 2D0OA 2Q0RA 3I33A 4PL8A 5AR0A 1NGJA 4M63C 2YJFA 4MO5A 3EO3A 1JCGA 2P9PB 3FZMA 3EKSA 2QW9A 3LM2A 1SAZA 4WYBA 5JICA 5AZJA 1NLVA 2VYPA 3D7EO 4B1YB 3H1VX 3VPZA 1QHAA 1NGIA 1NGAA 2P9LA 3A5MC 4WQ5A 3O6WA 2V52B 3SMPA 3U9DA 2W41A 2IVNA 3D2EB 1QQOA 5AQTA 3FE1A 3TPQA 4AM7A 3VEZA 3MN9A 5AQSA 3UB5A 2V7YA 4GY2B 3ID8A 1YVNA 4MO4A 4BRMA 4IJNA 3UE5A 1HKBA 2FSNA 1ATRA 4CD1A 2A41A 2E2NA 1MWMA 2GWKA 2P9UA 2Q97A 2P9SB 1NGBA 4CZLA 3HSCA 3DWLA 3SK3A 1K8KA 3ZX0A 4CI6A 4FWNA 3VEXA 3ZETB 2ASPA 1E4GT 4RWTA 1WOQA 4O8KA 3ATVA 2D0PA 1Z05A 4H0XB 5BREA 5KPRA 3CJCA 3AY9A 1RDWX 4FPAA 5BPMA 1BUPA 5EOYA 2E2OA 3FZFA 3GOIA 1IG8A 2P9NB 3RSEB 4B9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TKXA 2GWJA 2OPRA 4M41A 4LFCK 3KD1E 3IMXA 4XEIA 5M1PA 4E7IA 4BY9C 4CEEA 1L3VA 3JAMO 4N41A 3A8YA 4AILC 3ZX3A 4CFAA 3TABA 1YXQA 4KTZA 4BE0A 4DFKA 3FLCO 1S72N 3DLBA 3MMVA 4DSIA 4FLVA 5FDLA 2YHWA 3CCRN 3AO5A 3MWPA 1TAUA 1KAYA 2QA4N 3KLIA 4RW8A 4CEAA 3A2FA 4QOZB 5FRNA 1TGOA 4CEZA 3VENA 2XO7A 3LDQA 1LW0A 3M8SA 2KZZA 5DM6L 1VQLN 1XI1A 3IAYA 3QFUA 1ATSA 4Z4FA 3SUNA 1RT1A 4WQ4C 3C94A 3EN9A 4KTQA 2E2PA 3VTHA 3U4LA 3D2EA 1N34K 3AV9A 4I7FA 4XH4A 5GINA 4K42A 2ZE2A 4Z4GA 1E3MA 2NZTA 1ATNA 5AQRA 1KRPA 1HYVA 3CF5L 2X6NA 4CEDA 3JYTA 3VGMA 3RRHA 2WUSA 5AZIB 4CIGA 4BRHA 2AP1A 3TAEA 4CIFA 3I8BA 3I0RA 2QM1A 1ZBLA 1BDGA 3GBTA 1X9JA 4IEEA 3I8DA 4JI0K 2NRWA 4KO0A 3KK1A 2KZMA 1QZ6A 3AVKA 3KK3A 3ZCMA 3A5NC 2R7YA 3IFRA 3HVTA 1VSFA 3OA9A 3WXLA 4DSFA 2HHWA 4OPKA 1NJXA 5ADXH 5C25A 1U04A 5FROA 1NK4A 4KAZA 2YNIA 1M1KO 3FZLA 5LL6Z 4H4MA 3L8BA 1LAVA 4Z0UA 4O0JA 3WUHA 4EFHA 1BISA 4CGHA 1HYSA 3LAKA 3O9RA 2ITGA 1ZYQA 4BE2A 1UA0A 3M8RA 2KW4A 3J80O 3NE6A 5AQOA 3OYDA 4ILGB 3PUFA 4CJQA 3M8PA 4JKGB 3MEEA 4NYNA 2OA8A 3LP0A 4BR7A 4CZKA 3S3MA 2FSKA 3OYEA 1LW2A 3BGRA 1VSEA 5GIOA 3AVFA 4B3MK 4CJSA 1U48A 2BGGA 3OYHA 4CBUA 4CF2A 1T6CA 4JV5K 4J2EA 3QBWA 3KLFA 1FW6A 4YNQA 3V4IA 1BCMA 4RW6A 4ZTJA 2PAVA 3VF2A 4DU4A 4X62K 3AA2A 2CH5A 1GLBG 2VWJA 4FJ5A 1SKRA 2OYQA 1QVFM 3P1GA 2P9IB 1BOTO 4DR5K 4KPYA 4DG1A 1XQSC 1EXQA 3B6PA 5JVHL 1O13A 1OH5A 4CJUA 3I56N 2A42A 4H0OA 3ZX2A 1K8AO 2ITMA 4GKKK 1HQEA 4JI2K 3CCQN 3NF6A 4HWIA 4OPAA 4CEBA 4DB3A 4MFBA 2P9UB 4F3OA 4L3QA 1VQKN 2F4VK 1A5XA 4RW4A 4A61A 3NAEA 4CJRA 4FJ7A 1U4BA 3OYJA 1DEJA 1HMVA 4IOXA 5LJVA 2YNFA 4H0VB 1BA1A 2VG7A 4FZXC 5KRTA 1TK5A 3QBXA 3WQTA 1ZBIA 4BREA 4BR0A 3LL3A 1I94K 2HHQA 2YKMA 5C2DA 3UKRB 5AQVA 1GLDG 2P9SA 3CC7N 1ASUA 5TKYA 3O8MA 1X3NA 3AVNA 3KLEA 5KPTA 1GLFO 4YFUA 2OPPA 3L2QA 3KZBA 3SMSA 2O4IA 1J54A 5HRSA 3VGKA 3O4NA 2NLXA 4EHUA 4K8XA 4EZ6A 3KVGA 2RPIA 4C23A 3PIOL 1QSSA 3NVMA 2DFFA 3V1OA 4FXDA 2O4GA 4B9UA 1Q9XA 3NF9A 4FJIA 4IG0A 2P9KB 1RBSA 5GADP 1VSJA 4YOUA 3CFOA 2QTDA 2CGLA 1REVA 3TR8A 3CETA 4M7XA 3MN5A 1JXBA 4N47A 3QEPA 4JI8K 1JL2A 4W5NA 2RF2A 4JK7A 1XWLA 2W6KA 1DT9A 5EX5A 1W0HA 4CBWA 1F21A 5AQIA 4DFPA 1HNXK 3SQ0A 1YJNN 1IKYA 2GUIA 2QWRA 1NBWA 3M1FA 3OBYA 3A5LC 2O8DB 3L4IA 1YF5L 1D9FA 2KKZA 2HHUA 1G99A 3G6EN 3HL8A 3VA0A 4M45A 3TSUA 4JI4K 4OVLA 5J2NA 1B92A 1RTJA 1EP4A 1QZ5A 3EE9A 3KWIA 4XH1A 4EP5A 2CGKA 3L0QA 3R8EA 3DLHA 5C24A 2Z1HA 4B3OA 5AZIA 3CFRA 4BVPA 1V4SA 4FM0A 3O80A 3K5OA 1HKCA 4WFBL 2JLEA 3RRGA 4JKBA 3KWGA 5HRRA 4BC4A 1CZAN 3IG1A 3C65A 4OGCA 1KC8O 1BA0A 4JK9A 2ETJA 3MX2A 4B3RK 2FXUA 4FLYA 1VRTA 1HNIA 4BG8A 4DTPA 2UUCK 3G71N 1IJJA 3PX6A 1NU0A 3M8QA 2ZJPL 3MCPA 1I39A 4BR2A 1XNQK 1GOCA 1S6PA 5BRDA 2PBDA 1ZC6A 3CJ1A 1S1XA 3L6QA 1CLQA 3VN5A 2A6AA 1MU2A 3QERA 4Z4IA 1YAGA 3O9QA 1LWFA 1TL3A 2E1YA 4DQ8A 1EWQA 4B8CA 4ZTFA 3KKRA 1VSMA 4FLXA 4E7LA 1N6QA 4OPJA 4JKGA 2F8TA 2RKIA 4DTNA 4F3TA 4JKHA 4FLWA 4M3YA 3WT0A 2D0OA 1NGJA 1WB9A 1JKHA 3AO2A 3PY8A 4B9NA 4MO5A 1JCGA 2P9PB 3EKSA 5KGXA 3QEXA 4FM1A 5C42A 4KI6A 4B1YB 3VPZA 3CFPA 1NGIA 1NGAA 3LZIA 2V52B 4ID1A 3SMPA 4H4OA 1N32K 3D2EB 3JSMA 4DV5K 4KH5A 2IGIA 4PHTX 3O9SA 4CECA 4GY2B 4YHHK 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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