4EHUA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adpnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
total genus 92
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA01
2VCPA 1E4FT 4CZJA 1NGCA 4IWVA 1BUPA 2KHOA 4PKIA 1JCFA 3WXIA 3VEVA 4XH4A 4BRNA 3BUZB 3UKRA 1NGEA 4BR4A 2I7PA 4FOEA 4XEIA 3CI5A 4EFHA 2QWQA 3VEWA 2Q97A 3O5BA 3EN9A 3O8MA 4BR9A 1KAZA 3R8EA 4FWNA 1GLBG 3D2FB 1BWFO 1RFQA 3QB0A 3ZEUB 4CBWA 4JD2A 4M7XA 1LCUA 4J8FA 3ZX3A 1SZ2A 3ENHA 4M7YA 3VESA 3VGKA 3WXLA 1ZXOA 2NRHA 1BOTO 4QS9A 1HUXA 3VF6A 1NGBA 4BQZA 2F9TA 5F0XA 4NO7A 2IIRA 2NLXA 4FWSA 3EO3A 5BR9A 1ZBSA 5AFUA 1YAGA 4BVPA 1WOQA 1BA1A 1D4XA 1ATSA 3EKSA 1JCEA 3C7NB 4GNIA 1ATNA 4O8KA 4QS8A 4DHYA 4XH1A 3MDQA 2E2QA 4BRLA 4I6MA 5FPEA 2QXLA 3WEEA 3BF1A 3ATVA 3DXKA 1ZC6A 1CZAN 2CH5A 4FWQA 2QWMA 4PL8A 2A6AA 4FL9A 5AQIA 1EQYA 4MO5A 3OHRA 4A62A 2EWSA 3LM2A 4CI6A 4MLHA 2GELA 3UB5A 4BC4A 4DB3A 2I7NA 3D2EB 2H3GX 5TKYA 5BREA 1KXPA 2W41A 1NGHA 3R6MA 1IG8A 4BR7A 3VF4A 3VGLA 2PBDA 2ZF5O 5JMVA 1QQNA 3U9ZA 4CZKA 3CETA 4BRDA 3EZWA 2YJFA 4H0PA 4FO0A 4H0XB 2P9NB 3UKUB 5BRFA 1QZ5A 2P9PA 2P9LB 4KBOA 4BRIA 2GTDA 1T44A 3W0LA 1GLCG 5F2RA 3VEOA 3FZKA 3LL3A 4BRGA 4FWMA 3SJHA 4BR5A 4CZFA 2GWJA 4EHUA 5B8HA 2HMPA 3MN5A 3AY9A 5EX5A 1E4GT 3QDKA 4BVOA 1SQKA 3A5MC 5FPMA 3FZLA 1ESVA 5AQTA 3TU5A 3UE5A 1HKBA 5BRHA 3I8BA 1SAZA 2BUPA 2YHYA 2CH6A 3FZHA 1DGKN 2ZGZA 4H5VA 4A61A 3B8AX 5E26A 3H6EA 2P9UA 2CGJA 3CJCA 4O5FA 1K8KB 2QWPA 3GDQA 4GY2B 1GLLO 2P9KA 2D0PA 1J6ZA 3A5OC 5AQWA 1BA0A 1RDWX 1MDUB 1MWMA 3S41A 2D1KA 2FSJA 2QM1A 5BPLA 4CZEA 2DPNA 4Z94A 2ASMA 3LDOA 4FOIA 3AAQA 4BC5A 3ULEA 1TYQA 3GE1A 4CZMA 1HJOA 2P9SB 3BF3A 5I9EB 3VOVA 2FSNA 3M1FA 3H3NO 4B1WB 1MA9B 3VF2A 4BREA 3GG4A 4CZGA 3A5NC 3ZETA 2A5XA 5BRDA 2D4WA 3QMLA 5AQGA 2FXUA 3ZEUA 4B1YB 4B1UB 3WQTA 1XUPO 3H1QA 5AZIB 5KPRA 5AQJA 1NGGA 1XQSC 1GLAG 3ENOA 3VEYA 2V52B 1QQMA 1YUWA 4CBXA 4RCHA 1T6DA 3C0BA 1NWKA 4H0OA 4MLEA 1KAXA 3HSCA 1DKGD 3ATUA 3FLCO 4BR2A 4FWPA 1Z6RA 3SMSA 2FF6A 3O1WA 1ATRA 5EY4A 4IO8A 3O80A 5LJWA 3CIPA 1GLJO 4FPBA 4JNEA 3ID8A 2P9IA 1MWKA 2NZTA 4K25A 2J4RA 3FE1A 2HF3A 1Z05A 3F9MA 1Q18A 1U2VB 2F9WA 2IVNA 1C0FA 2E8AA 3MK6A 3TPQA 3ZX0A 3CJAA 3A8YA 4BRFA 1V4TA 5AR0A 3ZX2A 4DQ8A 2UYTA 3MN7A 3SLCA 1WUAA 3LM9A 1TUYA 3DXMA 1YVNA 2V7YA 4BRMA 4BRKA 5BPMA 3L0QA 4BRAA 3A5LC 3FR0A 1YXQA 4IJNA 5KPTA 2QWNA 1Y64A 4BC3A 4A2AA 4BG8A 3VGMA 3QBWA 5KPZA 4WQ4C 4EHTA 2A40A 3WEEB 3DXKB 4ISEA 4EAHD 2VWBA 4BC2A 4FWKA 5AZJA 3A0IX 3MCPA 4WYBA 2YI1A 1R59O 1RGIA 1GLDG 2GEMA 5AQLA 3HM8A 3U8XA 2E88A 5AFUH 3BP8A 3SK3A 4JN4A 5AQRA 4B1XB 3M6GA 4CZIA 5BN9A 3MN6A 5BPNA 2CGKA 5AQXA 4PL7A 4JHDA 1C0GA 4K41A 4HTLA 5AQOA 3IUCA 5E84A 2WUSA 5AQNA 3R9PA 4IZ9A 1QQOA 3SMPA 4Y0WA 3HTVA 3VENA 4H03B 4NB4A 1QZ6A 2P9PB 1BO5O 3MN9A 5AQQA 2Q36A 3DJCA 4H0VB 1HX1A 1NGAA 5AQZA 3CHWA 3RSEA 4AM6A 5FPNA 4PKHA 3CJ9A 3EL2A 5ADXH 3M3ZA 4K42A 4H0YB 3H45C 2PAVA 3QFPA 3QBXA 5JICA 1U6ZA 4M63C 1IJJA 2P9SA 1V4SA 5ELZA 5AQMA 3D7EO 2E20A 2Q0RA 5KQDA 1T6CA 2QWLA 1H1VA 4FWOA 4JAXA 2P9UB 3LDNA 3MMVA 3QFUA 1HLUA 3LDLA 2A42A 4IJAA 3D2FA 4BQLA 2P9KB 3KHYA 1NGFA 4IXCA 4FWRA 4FWLA 3WT0A 2V7ZA 1X3NA 3WQUA 2YHWA 1NGJA 3VETA 2BTFA 4CJ7A 4RTFD 2D0OA 2E2PA 5AQKA 3ULEB 1LOTB 1TYQB 2E1YA 4DCHA 1NGDA 5BN8A 4H5NA 4BRHA 3UKRB 4C23A 4HWIA 5LJVA 3G25A 4E1JA 2HOEA 3J8AA 1KAYA 5AQHA 4LC9B 5AQFA 3O1BA 2ITMA 3GL1A 3ZETB 1TUUA 3C7NA 2E2OA 4YDUC 1HKGA 5EOYA 3GBTA 4RWTA 1U2VA 3P4IA 5CE3A 5JLHA 2CGLA 1BU6O 1OKJA 2AP1A 4JD2B 2YHXA 3AARA 4CBUA 1BG3A 4B1VA 3IFRA 4BRPA 3HBTA 2A3ZA 2Q0UA 4H0TB 2YCHA 2ZGYA 1NBWA 3HI0A 3WXJA 3I33A 5LY3A 2VYPA 4BR0A 3L4IA 4WQ5C 5FPDA 3D2EA 5EVZA 5AQUA 2FLOA 4PKGA 4FPAA 2HF4A 3FFKB 3FGUA 4B9QA 3JS6A 4QS7A 2GWKA 2W40A 4FSVA 1GLEG 4ISFA 2P9IB 1BDGA 3JXUA 4YDUA 2Q31A 3BEXA 2A41A 2P9NA 3UKUA 4I6MB 2FSKA 2P9LA 4BRCA 1G99A 5AQSA 4CD3A 5AQYA 4CZHA 3EKUA 2IVPA 4EIAA 2OANA 4WQ5A 3CERA 3IDHA 1X9JA 5ADXA 3DXMB 3O6WA 3VPZA 3CJ7A 3KZBA 4CZLA 3O4WA 4H5TA 3IMXA 3KVGA 4ISGA 2V51B 4BGAA 3CQXA 4A2BA 2ZWHA 3WXKA 4MO4A 2E2NA 4BROA 4H5WA 2ASOA 5AQPA 3CJ1A 3LDPA 1QHAA 5EXWA 3L6QA 3FZMA 2GUPA 4WQ4A 3VERA 1GLFO 1X3MA 2QWRA 2QW9A 4H5RA 3GOIA 3U4LA 1K8KA 5AZJB 3O08A 2IVOA 3VEZA 1DEJA 3H3OB 3LDQA 3QICA 3VEXA 3CJBA 2ASPA 3H1VX 4K43A 5KQ8A 1P8ZA 3U9DA 2QWOA 5JLFA 3FZFA 2YJEA 4JHDB 2AA4A 5F1XA 3AAPA 3H46O 3WUHA 3HZ6A 1NLVA 1JCGA 3DAWA 3W3DA 4CD1A 4BGBA 3CQYA 1HPMA 1NMDA 1NGIA 3DWLA 5AQVA 2FF3B 4L3QA 3RSEB 4AM7A 2Q1NA 1S3XA 4BG9A 1XC3A 2Q2RA 1NM1A 1S22A 4F9OA 4BRQA 4B1ZA 1HKCA 4XH5A 5AZIA 2E1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PIOL 5J2QA 1E4FT 1YJWN 1Q8IA 1S6PA 1BUPA 3VA3A 4EP4A 1WAFA 4XH4A 4BRNA 2ZE2A 3BUZB 4IDKA 1JJ2M 1NKCA 4BR4A 3BDPA 4FOEA 4LSNA 3ITHA 4N56A 1T7PA 1W97L 1VRUA 4EFHA 3V9WA 4JI3K 2QWQA 2Q97A 3DLGA 3CC7N 1T05A 1NJWA 3TSPA 3V9UA 4F3OA 3D2FB 3QB0A 3ZEUB 2BDPA 4M7XA 3C6TA 1HYVA 3WXLA 4FJ7A 1VQ9N 3LAKA 1BOTO 1NK8A 3THWA 2HBKA 4JKHA 5F0XA 3OYMA 3HO1A 4KRFA 4KTQA 4CFAA 3EY1A 4FJKA 3CCJN 3NF8A 1C1CA 4FWSA 5BR9A 5AFUA 1BA1A 1K73O 3ZSOA 4GNIA 3THVA 1TGOA 5GAEP 1BI4B 4X62K 3F73A 1TL3A 2O8BB 4RW7A 1NJIO 3SUQA 3R1XA 4CEBA 3MDQA 1BIUA 3K9KA 3DI6A 2QKBA 4I6MA 2QXLA 3DXKA 1S9EA 3OYKA 4PL8A 2A6AA 2FC0A 4MO5A 3KWIA 4MLHA 5TKYA 2H3GX 4DUYK 1NJZA 3QIOA 4KHUA 1KXPA 4Y1CA 2W41A 3CC4N 4W5RA 4CHPA 3VF4A 1WB9A 2PBDA 4L8RB 4DR1K 3CETA 4TSXA 3AVLA 3EZWA 2HHXA 3NF9A 2Z1GA 1D9DA 4N41A 4YNQA 3M8QA 4FJIA 1GOBA 4CERA 3D0PA 3PIPL 4NCBA 2Z1JA 3NH0A 4BDYA 1WAJA 2GTDA 5M1NA 4YOVA 3LL3A 2PYJA 2OYQA 1A5VA 2HMPA 4OGCA 3AY9A 4CK1A 1E4GT 5CHIA 3DLKA 5FPMA 3SYZA 3FZLA 4DQQA 5AQTA 4M42A 4JS4A 2BUPA 2YHYA 1XNQK 1RILA 1RBRA 4AHRA 4BDPA 2OPRA 2NRRA 3SQ0A 4FLTA 1VAZA 1DTQA 4KI4A 2G8KA 2P9UA 1W7AA 4JKBA 4KHQA 2CGJA 2NRXA 3CJCA 4M3UA 1XI1A 4GY2B 4I2PA 2GBZA 4IKFA 3C6HA 1IKWA 1S1UA 2X6NA 5AQWA 2OCEA 3HVRA 1QSLA 1IBKK 1QVFM 2DFEA 2QM1A 4Z4HA 4CHQA 4CZEA 3LDOA 1QE1A 2E6LA 3G10A 5M1QA 1T03A 3L2VA 3C95A 2P9SB 4JEPA 2A1SA 4DV4K 3H3NO 3K58A 4BREA 1N8RO 3QMLA 2KFNA 1Q82O 1OH5A 1XUPO 5KPRA 5AZIB 3ZSRA 5AQJA 3T3FA 1WSGA 3ZSZA 1HYZA 3VEYA 3HVTA 3V9XA 3CM6A 2NRTA 3BZKA 4RCHA 1SS6A 3J7YP 1DKGD 3ATUA 3P31A 1Z6RA 1S9GA 4CJPA 2YV0X 4PHTX 3AA2A 1BL3A 4I9QA 3ENBA 1ATRA 5EY4A 4IO8A 5HRRA 3O80A 1GLJO 3ID8A 1MWKA 5FLXO 1RCHA 4KREA 1VQ8N 4JI0K 3O4NA 5T7BA 3K5LA 1C0FA 2E8AA 4FLYA 1YI2N 3MK6A 3ZX0A 4B3SK 4ELUA 4KO0A 4KHWA 4DQ8A 2O8FA 3SLCA 1WUAA 2NNWA 3OYNA 1FKOA 3DXMA 3RMAA 2V7YA 3DLBA 4BRAA 3FR0A 3VGMA 1NOZA 3SZ2A 4WQ4C 1O13A 3WEEB 3ISNC 4CJ4A 4CJEA 3DRPA 2OPSA 3T1YK 1OVYA 2IOCA 3ZSXA 1QTMA 4FWKA 5AZJA 3A0IX 4Z4CA 2YI1A 1RGIA 5CYMA 3NMUA 3O3HA 3AA4A 1LW0A 3U8XA 4IFVA 1DTTA 3AO3A 3BP8A 4DMNA 3OS1A 2UUBK 3SK3A 4AQYK 3M6GA 3T7ZA 4CZIA 1TK0A 3RVCA 1NK4A 4IOXA 5BPNA 4JKCA 4DTRA 1LWEA 1C1BA 2E6MA 3IUCA 5AQNA 4NXMK 4DV5K 1QQOA 1N33K 3SMPA 3VENA 3LWMA 3IG1A 3QEVA 1TL1A 5AQQA 3RSEA 2IGIA 1HX1A 3CHWA 4FJNA 4PKHA 3S3NA 3EL2A 2RN2A 4Y1DA 4W5QA 4HUEA 1J5OA 5CYQA 1UAXA 2PAVA 1ITGA 3QBXA 1HNIA 1BQMA 3DYAA 5GADP 5HP1A 4B9UA 4LF5K 5ELZA 5LMUK 1SL2A 4C8LA 2QWLA 1H1VA 5KRTA 4JAXA 1TKTA 3HSTB 3G6EN 5C12A 1RBTA 4BDZA 3M5RA 1HLUA 4AH9A 1KCFA 2A42A 2YHBA 3HYFA 5D3GA 3BGRA 5I42A 4KHPK 4IFEA 1VSJA 4O5BA 1D9FA 2V7ZA 3VETA 2XY8A 4RW4A 1LWFA 2B5JA 3UIQA 2E1YA 1Q81O 5BN8A 4BRHA 3UKRB 4C23A 3HK2A 2JGUA 3AO5A 5A2QO 4DU4A 3THYB 5LMNK 5AQFA 3VMFB 2I5JA 3OYJA 4Z0UA 3C7NA 1HYSA 3L2QA 5EOYA 3GBTA 4RWTA 2CGLA 3TABA 1BG3A 3E1YA 3KKSA 4DV3K 4BE1A 2HHHK 4DR7K 2OZMA 3L4IA 3G4SN 4JV5K 3D2EA 5AQUA 4OKKA 3ZSQA 4DV2K 1KVBA 3FGUA 2D0AA 3JS6A 2GWKA 2ZJRL 1C1AA 3ZT2A 1GLEG 3KJVA 2P9IB 2O8DB 4FJJA 2Q31A 2HB5A 4CEAA 4HCBA 3OYBA 4OJRA 2ZQBA 3THXB 4FVUA 1G99A 4CD3A 5AQYA 4EIAA 1HNVA 5M1OA 4WQ5A 2ZM6K 2QXFA 1HQEA 4DQSA 4OPJA 3KZBA 2VGMA 4H5TA 2JWKA 2V51B 3CQXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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