4EHUA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adpnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
total genus 92
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA01
1GLCG 3L0QA 3ULEA 2E1ZA 2Q36A 3WQUA 1QZ5A 3MCPA 1QQMA 2IVPA 3D7EO 3LDOA 1BWFO 4CZGA 3VOVA 2D0PA 3VF2A 1TUYA 2P9NB 2P9LB 2YHWA 4BRCA 2QWMA 4IO8A 5JLHA 3ZEUB 1IJJA 3QICA 1U2VB 3A5MC 3QDKA 1X3MA 3VEOA 2GWKA 1K8KA 4H5VA 4F9OA 1IG8A 4DB3A 3ULEB 2I7PA 3AARA 2HOEA 3LM2A 3MN5A 3O5BA 3ZETB 5ADXA 5FPEA 1T6DA 1TYQB 5BRHA 3O8MA 3IUCA 4A2BA 3VGKA 4BC4A 3A0IX 4MO4A 3CJBA 3FFKB 5AQFA 4RWTA 4BR7A 3A5NC 3AY9A 3LDPA 3O6WA 3U8XA 3AAQA 4J8FA 3H45C 3JXUA 3CJ9A 1Z05A 4BR5A 4RTFD 1BDGA 2GUPA 3HZ6A 3BEXA 3ZX3A 3FE1A 4MO5A 5B8HA 3DXKA 4GNIA 4BRLA 1U6ZA 2P9SA 4XH4A 4CZFA 2QM1A 5AQSA 1NGBA 3VF4A 1EQYA 2ZF5O 4MLHA 3LDNA 4BRMA 3KZBA 1JCEA 4BROA 1Q18A 3EZWA 4B1WB 4BC3A 3FR0A 2QWNA 3CHWA 4GY2B 3VENA 3QB0A 4FPBA 5LJVA 5AQRA 3VERA 2P9LA 3H46O 4QS9A 1HKCA 5ADXH 1TYQA 5AQOA 1C0FA 2CH5A 4PKIA 4WYBA 3R8EA 2E8AA 2OANA 3MDQA 3R6MA 4JAXA 3FZKA 3B8AX 3WQTA 4K25A 2QWQA 2IVNA 1HUXA 3O08A 5E26A 2QXLA 5AQQA 3MN9A 4BR2A 2Q2RA 5AQTA 3VETA 3UE5A 3CJCA 2H3GX 3CJ1A 3ZEUA 1NGAA 2QWPA 3QFUA 1CZAN 4NB4A 4L3QA 4H0YB 1V4SA 5KQ8A 2W41A 2A6AA 3IDHA 2A5XA 4IWVA 4O8KA 4BRAA 4CBWA 1H1VA 5BRFA 2YJFA 3H6EA 1GLEG 3O1WA 3C7NB 1Z6RA 2V7YA 2P9IA 1NBWA 3MMVA 3VGMA 3MK6A 5BPNA 3U9DA 2FF6A 3BF3A 3KVGA 2A41A 1RDWX 4FO0A 1DEJA 3DXMA 2E2PA 4H0OA 4CI6A 4YDUA 5F1XA 4H5WA 5BPMA 2P9SB 3EL2A 1NGGA 1YUWA 3UKRA 4FWSA 2ASPA 5AZIB 4CZIA 4EFHA 3D2EA 2P9KA 4DCHA 1QQOA 4FWOA 4BRIA 4IJAA 1GLBG 3CQYA 3DWLA 3GE1A 2IIRA 2A40A 5BRDA 3H1QA 4WQ5C 1C0GA 4FWPA 5AQKA 4M63C 5AQNA 4DHYA 5AFUH 4JHDB 4BR4A 3FZFA 4EIAA 2YI1A 3FZMA 2V51B 2E2QA 2NRHA 1LCUA 3VPZA 3ZETA 2VYPA 3SMPA 1QZ6A 4IZ9A 2P9UB 3O4WA 4E1JA 3AAPA 1HPMA 2ZGYA 1ZC6A 1K8KB 4PKHA 4B1XB 5AQVA 3VF6A 3GDQA 2A42A 4BRGA 4BGBA 1G99A 4Y0WA 3QBWA 2QWLA 4M7XA 5AQHA 1T6CA 4NO7A 3VEYA 1BUPA 4A61A 4AM6A 1NGJA 1SZ2A 3SK3A 3P4IA 4BRKA 1YVNA 2YJEA 4K43A 3TU5A 5AQZA 3GOIA 3EN9A 4FSVA 3RSEB 3TPQA 1GLFO 4WQ4A 4BG8A 1NGFA 1XQSC 3DJCA 5AZJA 3F9MA 3MN7A 5BN8A 1GLLO 2Q31A 2QW9A 5AFUA 3VGLA 5E84A 3L6QA 3W3DA 2FLOA 3WEEA 5F0XA 4I6MA 3FLCO 3ZX2A 4CZHA 3D2FB 2YHXA 4CZEA 3HSCA 5BPLA 4RCHA 1RGIA 4BRPA 5JLFA 1KAZA 3R9PA 5EY4A 4K41A 1ATRA 3H3NO 4BVPA 5F2RA 4BREA 5KPZA 5JICA 1NGIA 5EOYA 1NGCA 2P9KB 3HI0A 4BRFA 3CQXA 4XEIA 4FWRA 3GBTA 1WUAA 3WXKA 4FOEA 3HTVA 1HJOA 4CD1A 4A2AA 1HLUA 3RSEA 4BRHA 1KAYA 3DAWA 4DQ8A 3SJHA 4JN4A 2PBDA 4H0TB 3WEEB 3HBTA 2EWSA 1XUPO 2D4WA 2NLXA 3M3ZA 4BQZA 3WT0A 3H3OB 4BRDA 1BOTO 3M1FA 1HKGA 4B1ZA 4FPAA 3MN6A 3G25A 2CH6A 1LOTB 3ID8A 2GEMA 4CZMA 3JS6A 4JD2B 2VWBA 1MA9B 4EHTA 4FOIA 3WXLA 3UKUA 2E1YA 2BTFA 3A8YA 1ZBSA 1Y64A 2P9PA 4O5FA 5AQPA 3QFPA 5AQJA 5KPTA 4BQLA 2ASMA 5AQYA 3U9ZA 4H0XB 5AQGA 2VCPA 4ISFA 2Q0RA 4LC9B 4CD3A 2P9PB 3IFRA 2UYTA 4QS7A 1S22A 4JNEA 5KPRA 4H5NA 4BC5A 3UKUB 1J6ZA 2J4RA 2D1KA 2QWRA 5AQIA 4A62A 2GELA 4CZKA 2P9UA 2CGLA 5LJWA 1E4FT 2KHOA 2NZTA 3J8AA 3UB5A 1MWMA 3S41A 4B9QA 1GLAG 1TUUA 2FSJA 3GL1A 3M6GA 1QHAA 4MLEA 5EVZA 4HWIA 3OHRA 4FL9A 1HX1A 2D0OA 4PL7A 1BU6O 4PKGA 3SMSA 2AP1A 5AZIA 5I9EB 3C0BA 4EHUA 4JD2A 3FZLA 5AQLA 3LDLA 1DKGD 4H5TA 2DPNA 2FSKA 3BUZB 3O80A 1DGKN 4CBUA 3O1BA 1ZXOA 4BGAA 5JMVA 3LM9A 1NMDA 2IVOA 3A5LC 3QMLA 1YXQA 3ENOA 3DXKB 1WOQA 3UKRB 3ENHA 2E88A 1X3NA 3I33A 4HTLA 3BF1A 3CETA 4CZLA 2P9IB 5FPNA 3HM8A 4B1UB 3WXJA 4JHDA 4B1VA 2YCHA 1NWKA 4H0PA 2ZWHA 3KHYA 3WUHA 1BA1A 1RFQA 5EXWA 3IMXA 4QS8A 3VEZA 2Q97A 4WQ5A 5AQUA 3CJAA 4BRNA 4H03B 2FF3B 4FWQA 3EKSA 3D2EB 3ZX0A 1R59O 4KBOA 5TKYA 4BRQA 5BR9A 2HMPA 4M7YA 1MDUB 3CJ7A 5AZJB 3W0LA 3LDQA 4ISGA 5FPMA 1HKBA 2WUSA 4ISEA 2A3ZA 1T44A 3ATVA 1YAGA 1GLJO 2E2OA 5BREA 1V4TA 2ITMA 4FWNA 4YDUC 4K42A 3VESA 2HF4A 5AQMA 4BR9A 4Z94A 1KAXA 2GTDA 1E4GT 5FPDA 1U2VA 5LY3A 2Q0UA 4BG9A 3U4LA 3LL3A 1BA0A 2CGKA 2FSNA 2V52B 1P8ZA 3C7NA 5CE3A 2P9NA 3FGUA 4FWLA 5AQWA 1ESVA 5AQXA 3FZHA 1ATNA 3QBXA 2CGJA 3EKUA 3H1VX 3I8BA 4CJ7A 1BO5O 1SAZA 2FXUA 3WXIA 3VEVA 3A5OC 1OKJA 3GG4A 2W40A 4EAHD 2I7NA 1NLVA 1XC3A 1NGDA 4H0VB 1BG3A 2BUPA 2Q1NA 3CERA 4CBXA 2E20A 5BN9A 3CI5A 3BP8A 3DXMB 3CIPA 1NGEA 3VEXA 4FWMA 2PAVA 2QWOA 3EO3A 1NGHA 1SQKA 5ELZA 2F9WA 2HF3A 2YHYA 4C23A 4IXCA 1D4XA 1QQNA 4IJNA 2ASOA 1KXPA 1S3XA 1MWKA 3L4IA 2E2NA 4B1YB 2GWJA 2F9TA 4XH1A 4WQ4C 5AR0A 3D2FA 1X9JA 4BVOA 4CZJA 5EX5A 1NM1A 4I6MB 4XH5A 2ZGZA 4BR0A 4AM7A 3VEWA 5KQDA 4BC2A 4FWKA 1GLDG 1ATSA 3ATUA 2V7ZA 1JCFA 2AA4A 4PL8A 4H5RA 1JCGA 3SLCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E1ZA 3CCMN 1QZ5A 3NDKA 2EHGA 2IVPA 3LDOA 3E9OA 1U45A 4CW7B 1TUYA 1B9DA 2YNIA 3ZEUB 3ASMA 4FJKA 1Q9XA 5IWAK 4Z4IA 1RTHA 3A5MC 1TVRA 3SBTA 2GWKA 4CEOA 4F9OA 3THXB 4AH9A 3SQ4A 1BQNA 3ULEB 2QXFA 3SV3A 1RDBA 3MN5A 3O5BA 4PWDA 2XO7A 5FPEA 4IFEA 2P5OA 4H4MA 4A2BA 4BC4A 3TANA 2XY8A 3PSFA 3ID6A 3HPOA 3LDPA 1U47A 4LF8K 1HJRA 3G0ZA 1Z05A 4DTMA 2Y1JA 4OGEA 2GUPA 3CCQN 1S1WA 1RT2A 1NJZA 1S6QA 3L4QA 3HYFA 3V1RA 3OYEA 3HVTA 4JS5A 4FVMA 1OH8A 2X6NA 2ZF5O 3LDNA 4JI3K 1Z26A 1YJWN 4RW9A 3J7ZO 3KZBA 1JCEA 1S72N 3FR0A 3CHWA 3F5TA 1SL1A 4DG1A 4FPBA 5LJVA 2QKKA 4CERA 3VERA 3O3HA 2G8WA 1D9DA 4PKIA 2ATQA 3R8EA 3HL8A 5JVGL 1D5AA 2E6LA 3NVKA 2KFZA 2QWQA 4B9SA 4N5SA 1L3VA 3L2VA 5AQQA 2OYQA 2W6LA 4BR2A 1C0TA 4DLEA 1DTTA 1QQCA 3CJCA 1OH7A 4CK3A 4CJQA 4H0YB 1V4SA 3ZSVA 1WBDA 4CBWA 4O8KA 4BRAA 1WSEA 3H6EA 1GLEG 5CHIA 4DV1K 4FJ7A 4FK4A 3O9SA 3MK6A 5CR4A 5HRNA 5BPNA 2FC0A 1Q82O 2A41A 1VSLA 4IFVA 5MLCQ 4FO0A 4CJUA 4JI8K 1KVCA 3KKSA 3MEDA 1J9AA 2P9SB 4ELUA 4YNQA 1VHXA 1YUWA 4I7FA 4OKJA 3AA5X 4CZIA 3OS0A 2KQ2A 2KTQA 4J2BA 3THYA 5CYMA 2A1RA 3SUNA 4IJAA 4GVEA 2YNFA 2QTDA 2F96A 5AQKA 3OYBA 4M63C 1IKXA 3QO9A 4FW1A 4N76A 3I0RA 5HP1A 2I5JA 1J54A 2WC9A 2YI1A 3FZMA 2V51B 3SAGA 1RBSA 3O9QA 3G6EN 3VPZA 4CIGA 2NRVA 2RF2A 4IZ9A 2P9UB 2W42A 3Q7BA 3KIOA 1UA1A 3E66A 2YHAA 4O4GA 2HSTA 3ZLJA 3VF6A 1N33K 3GDQA 4JK8A 4M41A 2PFUA 4CGFA 2QA4N 3V1OA 4BGBA 4Y0WA 3L8BA 2QWLA 1T6CA 4FLVA 1VSIA 3VEYA 1ASWA 4Z0UA 4R79A 1SZ2A 3P4IA 4BRKA 4K43A 3K2PA 3TU5A 3K5LA 5AQZA 5EU7A 3VQBA 1QSSA 2O4IA 1KFSA 4FSVA 1GLFO 3M8SA 1NJXA 4BG8A 2OPQA 1XQSC 3DJCA 3F9MA 4LH5A 3KLGA 1TK5A 5E84A 3SQ1A 3L6QA 4PHTX 3TSPA 4I6MA 3FLCO 4FVUA 3SZ2A 3LALA 3DYAA 4RCHA 1WAFA 5JLFA 3SNNA 1KAZA 1J5EK 2UXBK 5EY4A 1DTQA 4K41A 4BVPA 2PYJA 3VQAA 4BREA 4AQYK 4DR5K 5EOYA 4M3XA 2P9KB 3OYNA 2VQFK 1WNSA 4JKGA 3VA0A 3K5NA 2OZSA 4NLCA 2O8EA 3CCVN 4CD1A 4DQ8A 3ZCMA 1KAYA 1RTJA 1W9HA 2PBDA 3SPYA 4BDPA 3V9WA 3SAFA 3HBTA 3NF7A 1QSYA 4AHRA 1EKEA 3H3OB 3JSMA 1ZBUA 3HT3A 4IEEA 4BE1A 4B9UA 4OPAA 2NUBA 3M1FA 4J2EA 1TKTA 1HKGA 4B1ZA 3T1YK 2UU9K 1EWRA 2CH6A 2HBLA 1RBVA 3O3GA 1QVGM 4JD2B 1IKVA 4LF9K 3TARA 1CXQA 3UKUA 4FW2A 3KD1E 1Y64A 3LAMA 3QFPA 5KPTA 2ASMA 3U9ZA 2DTUA 2X6SA 2UXCK 2VCPA 3T3FA 3V9SA 4JI6K 5KPRA 2P1JA 2J4RA 1JLEA 2D1KA 3NF8A 1RBTA 3CC7N 3DM2A 5GINA 3J8AA 2X74A 1SL2A 2DY4A 5EVZA 4E7HA 3OHRA 2D0OA 3ZSRA 4PL7A 1RTDA 4B3SK 3S3NA 1BU6O 3O9TA 4MDBA 4JI4K 4X66K 1HQEA 4H5TA 4ID5A 3O80A 4JRQA 2X78A 2E5LK 1ZXOA 3R1XA 5JMVA 4CJLA 3OYLA 5H1SQ 3TAQA 2Y1IA 3QMLA 1HR0K 2QI2A 4CJVA 3DXKB 3DOLA 3ISNC 3I33A 1X3NA 4O0JA 4GKKK 4FLUA 2QK9A 3WNHA 5E41A 4B1VA 1NWKA 1LWFA 1S9EA 4YOVA 3CPWM 2ZWHA 1BA1A 1T03A 5EXWA 2XY7A 4FJNA 2Q97A 4WQ5A 3AV9A 4B9TA 4GV6A 3OBYA 3CJAA 4BRNA 1KTQA 4FWQA 3T19A 4DR4K 1NG9A 3D2EB 3IRXA 1TL1A 3W0LA 1MDUB 3O9UA 3DRPA 5FPMA 2FBXA 4ISEA 3MECA 1T44A 4IFYA 3LPUA 5HBMA 4CJRA 4JYAK 1RBUA 4H4OA 3HO1A 1IBKK 4FWNA 4K42A 3QETA 4KB0A 1KAXA 3K5OA 2HHVA 1U2VA 3V9ZA 4CJ4A 4F4KA 3LL3A 1BA0A 2CGKA 3C7NA 5CE3A 3PO5A 4LF6K 3FGUA 5SWMA 1M1KO 1ESVA 5HRSA 4CJ7A 5K14A 4DR7K 3V9XA 4B9NA 4KH4A 4DSIA 2I7NA 3K9JA 3OYIA 4FM1A 1BG3A 3OYKA 4CBXA 2G8FA 2BGGA 4I9LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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