4EHUA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adpnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
total genus 92
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA01
3DXKA 1V4TA 2P9SB 5F2RA 4PKHA 2FXUA 5KPTA 2ASOA 4H5RA 1MDUB 4FO0A 4IZ9A 2YHYA 4BRFA 4EIAA 3P4IA 3L6QA 1JCGA 3AARA 4BVOA 4K43A 3VETA 5BRDA 4BQLA 3QDKA 1BA0A 2VCPA 3D2EB 3VF2A 4ISFA 3WT0A 1TUUA 4BR0A 1NGEA 4BRNA 5EXWA 3DXMA 1NWKA 5BN8A 3VF4A 4GNIA 2BUPA 4IJNA 3U8XA 1NGFA 3WXJA 3VOVA 3QFPA 2HF3A 1MWKA 4PKGA 1RDWX 1QZ5A 3F9MA 2V7YA 2YCHA 3WQTA 4XH4A 2DPNA 4IO8A 2W41A 3UKUA 2E2QA 4EHTA 2E88A 4BC2A 1E4GT 3HSCA 3FZLA 4EFHA 4BGAA 1K8KB 1E4FT 1EQYA 5EOYA 4ISEA 2W40A 4FWMA 5EX5A 4CZIA 1BWFO 1NGIA 4KBOA 3S41A 3U4LA 1DGKN 3FE1A 2AA4A 5EY4A 1U6ZA 1ATNA 2NRHA 3CJ7A 5AQFA 3WXKA 4CBXA 3TU5A 4DHYA 4MO5A 3G25A 3LDOA 1YUWA 4WQ5C 3MDQA 1U2VA 5AQJA 2GELA 3EO3A 4GY2B 3LM2A 4L3QA 5JLFA 5AQNA 1Y64A 3CETA 4CBWA 4CZMA 1NM1A 1WOQA 4I6MB 4H5WA 4B1YB 1GLDG 1Z05A 3A5OC 2V51B 3L4IA 3W3DA 1ATSA 2FLOA 1NMDA 5F0XA 2ZF5O 4BRMA 4H5TA 4NB4A 2YJEA 3GG4A 1H1VA 4EAHD 4FL9A 4FWLA 1QHAA 3VEYA 1BG3A 1NBWA 2E2OA 2A40A 3C7NA 2A41A 1NGBA 2YHXA 4JD2A 2FSNA 5AQTA 5BRFA 1G99A 1KAZA 1LCUA 3GDQA 1TYQA 5AQZA 1KAYA 2Q31A 4FPAA 1NGCA 3O8MA 2P9SA 3FZFA 3GBTA 2E8AA 5AQQA 3DXKB 4FWOA 5BPMA 4E1JA 3WEEA 2P9NA 2Q0UA 4FWPA 2Q0RA 5E84A 1BOTO 4BR2A 3O4WA 5ADXA 4BR7A 2H3GX 1NGDA 2GWJA 3JXUA 3KVGA 1P8ZA 1ESVA 3A8YA 1LOTB 3ZETA 4JHDB 3MN6A 4A61A 4A62A 2AP1A 3FLCO 4BC4A 3MN7A 4M7YA 3O1WA 4QS9A 1HPMA 2ITMA 2P9IA 2YI1A 4DQ8A 1Q18A 4C23A 2V7ZA 5FPEA 1GLBG 2QXLA 1X3NA 2IVOA 2YJFA 3VENA 2GUPA 2PAVA 3FZMA 2P9NB 3VESA 2GEMA 5LJVA 2ASMA 1SZ2A 1IJJA 4B1VA 5JLHA 4A2AA 3A5NC 5AQKA 4HWIA 3BEXA 4F9OA 4H0TB 1IG8A 4A2BA 3CQYA 4JN4A 3GL1A 3HM8A 5AZIA 3ZEUA 3GOIA 1HUXA 1GLCG 1C0FA 5KQDA 1YAGA 2E2PA 2E2NA 5B8HA 3H3NO 5AQHA 3H3OB 4YDUA 3CQXA 3VEZA 1NGHA 3SJHA 1NGGA 5AFUH 4O8KA 2CGLA 2A42A 5CE3A 2NZTA 3EL2A 3ATUA 5FPMA 4BRDA 3MK6A 4BR9A 4JAXA 3VEXA 3UE5A 3UKRA 2PBDA 5AQOA 1HJOA 4BRGA 3A0IX 1C0GA 2D1KA 1QZ6A 3QICA 4CD1A 5BPLA 3I33A 5FPDA 4JHDA 1T6DA 1XQSC 2D0PA 2QWRA 1SQKA 2HMPA 3DWLA 5AQRA 3VGLA 4EHUA 3JS6A 5AQPA 1QQNA 3CJCA 3UKUB 5JICA 3O80A 2CH5A 4BRKA 4IJAA 3VGMA 4K41A 1HX1A 4PL8A 5ADXH 3LDPA 3CJ1A 3O08A 5JMVA 3EKSA 1BA1A 2E1YA 4FWNA 4H03B 4AM7A 2P9UA 2QM1A 3M1FA 4MO4A 1GLEG 2A5XA 2P9LA 2F9TA 3J8AA 3KHYA 4FWRA 3IUCA 3UKRB 1TUYA 4DB3A 2P9KB 4FWSA 2YHWA 2E20A 3ZX3A 3EN9A 4IWVA 2J4RA 3WXLA 4BREA 1CZAN 3A5MC 3DJCA 4JNEA 4Y0WA 5BRHA 5KPZA 5BPNA 3VEVA 5I9EB 1XC3A 5AQMA 3WQUA 3D2FA 2CGKA 2ASPA 3QFUA 3TPQA 3O5BA 4CI6A 4CZGA 3O1BA 4FWQA 3FGUA 3FZKA 1GLLO 1KAXA 2D4WA 3VEOA 3ZX0A 3RSEB 2IIRA 2VYPA 1S3XA 3M3ZA 2GWKA 2ZGZA 1HKGA 4QS7A 3MCPA 3U9DA 4CZFA 4K42A 2IVNA 2P9LB 4NO7A 3HTVA 2P9IB 1U2VB 3HBTA 1NGAA 3SMPA 4BC3A 3ULEA 3KZBA 1XUPO 2ZGYA 1MA9B 3ZETB 1GLJO 1J6ZA 2UYTA 5LY3A 3MN5A 3H1VX 2QWLA 4BG8A 2Q2RA 1QQMA 3WUHA 2VWBA 4I6MA 3FZHA 2BTFA 2FF3B 1NLVA 3BF1A 1RGIA 5BREA 5KPRA 4BRHA 4H0OA 5LJWA 4RTFD 4BQZA 4FOIA 4YDUC 3R9PA 4LC9B 1GLAG 2P9PA 4B1UB 4ISGA 4FOEA 1T44A 5AQLA 3HI0A 3QBWA 3HZ6A 3C0BA 2QWMA 3BP8A 4BVPA 4BR4A 3I8BA 3U9ZA 4CZKA 3VPZA 4BG9A 3CJ9A 3ID8A 4H5VA 3L0QA 3D2FB 4CJ7A 3BF3A 1ZBSA 3D2EA 3R8EA 4MLEA 5AZIB 3ZEUB 1DKGD 3M6GA 1BO5O 3IMXA 4WYBA 1JCEA 4CZLA 4H0VB 2Q97A 4BRCA 3VF6A 1HKBA 4BR5A 2P9KA 3DXMB 2CGJA 2QW9A 3OHRA 3ZX2A 1BU6O 1YVNA 2FSKA 3H1QA 5BN9A 3R6MA 2OANA 4H0XB 2GTDA 5AQIA 5AQGA 4XH1A 1ZXOA 1V4SA 5BR9A 2A6AA 1D4XA 2A3ZA 2CH6A 3VEWA 5TKYA 5KQ8A 1RFQA 3SLCA 1R59O 3W0LA 4FSVA 2QWQA 1JCFA 4BRQA 4WQ5A 4QS8A 3ENHA 3MMVA 3VERA 3EZWA 5AZJA 1X3MA 4B1WB 4BRAA 3WEEB 4B1ZA 2Q36A 4WQ4A 3CJBA 2EWSA 1ZC6A 3D7EO 4BRLA 5ELZA 3H6EA 4CZEA 5AZJB 4BRPA 4PKIA 4FWKA 3GE1A 4M63C 1GLFO 2QWNA 1YXQA 1MWMA 3SK3A 1OKJA 3BUZB 5AQUA 3DAWA 1TYQB 3VGKA 4PL7A 4AM6A 5AR0A 2HOEA 3QBXA 4BRIA 3IFRA 5F1XA 5AQXA 3CHWA 2FSJA 3LDQA 3B8AX 1Z6RA 1HLUA 3EKUA 3LM9A 5AFUA 5EVZA 4H5NA 5AQYA 4RWTA 2I7PA 1QQOA 2I7NA 4CD3A 2IVPA 3CJAA 3AAQA 3AAPA 4DCHA 2Q1NA 3RSEA 4M7XA 4JD2B 2QWPA 4CZJA 1HKCA 4RCHA 3C7NB 3LDLA 4MLHA 2QWOA 2HF4A 2ZWHA 3MN9A 1BUPA 1S22A 3H45C 2P9PB 4K25A 4WQ4C 4BC5A 3QMLA 1X9JA 5FPNA 4XEIA 1WUAA 3WXIA 4B1XB 3IDHA 4H0YB 2KHOA 4H0PA 3SMSA 3FFKB 3FR0A 4Z94A 4J8FA 3CI5A 2FF6A 3CIPA 4CZHA 4O5FA 1KXPA 3CERA 3ENOA 2P9UB 5AQSA 4CBUA 3LDNA 1DEJA 1T6CA 4FPBA 4BROA 5E26A 4BGBA 4XH5A 1K8KA 3ATVA 2F9WA 4B9QA 3QB0A 2V52B 2WUSA 1NGJA 2E1ZA 3AY9A 5AQVA 1BDGA 4IXCA 3A5LC 3O6WA 4HTLA 2NLXA 1ATRA 5AQWA 3LL3A 3ULEB 2D0OA 3UB5A 1SAZA 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MEEA 1V4TA 1RDCA 1D9DA 2HBJA 4JI2K 2JGUA 1XNRK 2OPQA 3AVKA 1BQMA 4H5RA 2RF2A 2XHBA 1VQNN 4LF5K 3L6QA 1NMNA 3AARA 3I8DA 3MXJA 3QIPA 4OX9K 3VA0A 1TUUA 4DU4A 3DXMA 1YJ9N 2ZE2A 4B3RK 5IT9O 4IJNA 3D0PA 4RW6A 3R1XA 3U8XA 4DU1A 3WXJA 2WONA 2KZMA 3MXIA 3WNEA 2HF3A 1VSKA 1C1AA 1RDWX 2PY5A 3VN5A 2E2QA 4EHTA 2E88A 1L5UA 1E4GT 4EFHA 3RR7A 4CERA 1W7AA 3MAQA 4JKEA 4FWMA 4LF9K 3OYKA 1HYSA 4FJXA 5HLFA 2QEXN 4YOVA 5FRNA 1CXQA 1DGKN 3CCUN 1Z25A 2AA4A 4OGEA 4LF6K 5EY4A 2NRHA 3CJ7A 3EZ5A 3TU5A 1VQPN 4DHYA 3DLLL 4WQ5C 1U2VA 5AQJA 1JLAA 3NF9A 3LPUA 1XNQK 2E4LA 2GELA 3QLHA 2ITGA 3H08A 3HPHA 1T3VA 4L3QA 2YX6A 3ZT4A 4CBWA 1S1TA 1WOQA 4B1YB 4KB1A 3VTIA 3A5OC 4CHPA 3O3FA 1ATSA 2FLOA 2HB5A 3KWGA 4AHVA 1NMDA 5F0XA 4X64K 4FL9A 4YOXA 3VQQA 5LMUK 3VEYA 3OYIA 4DTSA 4I9QA 1I94K 1T03A 5M1FA 1NOYA 1VQ4N 2WC9A 2X6NA 1VHXA 2FSNA 5AQTA 3VQDA 4CFCA 3GDQA 1TYQA 4PUOA 2ZJRL 1J5EK 5C2DA 4J2EA 3GBTA 3DXKB 4M42A 4O8UA 4CHOA 4CEEA 1TVRA 2P9NA 2Q0UA 1RT7A 1QHTA 2G8UA 4FLTA 2B6AA 4BR2A 3O4WA 2BDPA 4FJJA 2QA4N 3M8SA 2VWJA 4C1NI 4CF8A 3C6AA 3DRRA 2GWJA 4OJRA 3JXUA 3SV4A 3CPEA 4E7LA 4DTMA 3PSFA 2JLEA 3K57A 1BIUA 3MN7A 1HPMA 2O8FB 3KLHA 3UIQA 3L3UA 1I39A 5J2MA 5FPEA 1GLBG 3KTQA 1X3NA 4JKHA 3D6RA 2IVOA 4Z0UA 1VQON 4JI0K 4Z4FA 3VENA 2GUPA 2PAVA 5J2PA 1RBRA 2ASMA 4CJKA 1SZ2A 4WFBL 3OS1A 5CZ2A 4B1VA 5JLHA 5GINA 1HYZA 1C1CA 4F9OA 1NJZA 3E1YA 4CJWA 4A2BA 3CQYA 3BZKA 4CJFA 3HM8A 4JI6K 5AZIA 3ZEUA 4DR2K 1VRUA 1HPZA 1YAGA 1WBBA 5B8HA 4R79A 4JYAK 2D0CA 4DTPA 1K8AO 4AF1A 3CQXA 1BISA 1B9DA 5FLXO 3ATUA 4OGCA 2QXFA 4BRDA 3HPOA 3F2KA 3UE5A 3UKRA 2GBZA 4DTOA 5AQOA 5C25A 4BRGA 1JLCA 1C0GA 3A0IX 3QICA 4CD1A 1LAVA 1SS6A 4DU3A 4XIUA 4DR5K 4NCAA 3DWLA 3TAPA 3J81O 5AQPA 3O3HA 3O80A 4BRKA 1NK6A 5J1EA 4K41A 5M1KA 4IOCL 4FK4A 3LDPA 1TL1A 3CJ1A 4JKFA 4A57A 5JMVA 1C1BA 3V81A 3EKSA 4DR1K 4FWNA 3M1FA 1U49A 4JI8K 2OPPA 2A5XA 3KHYA 3OYHA 3R3LA 3HYFA 3S3NA 3K0SA 4FZZA 5J2NA 2P9KB 4FWSA 4BE2A 1B92A 2JWLA 1JLBA 3VTHA 3AVBA 3EN9A 4IWVA 4CIEA 3KWIA 1CZAN 3DJCA 1NK5A 3KKRA 2VG5A 5BPNA 2W42A 4DQPA 1XC3A 3D2FA 1G15A 4DV1K 4HTUA 3TPQA 4CZGA 1VQ8N 3FGUA 4ELTA 3Q7CA 2D4WA 4CK3A 2WTUA 2UXCK 4N76A 4IFEA 2GWKA 1P90A 4B8AB 4YOWA 3VQ9A 2F7TA 4QS7A 3MCPA 1X1PA 4BE0A 4A5AA 3ULEA 4M3RA 3DI6A 2QK9A 3TAMA 2ZGYA 3CCVN 1S9EA 5LY3A 2UYTA 4LFAK 4JK9A 3H1VX 4Q0BA 2XY8A 3THWA 2D5RA 3CCQN 2F96A 3FZHA 4B9NA 1HMVA 3BF1A 1HNZK 1KSPA 4NLBA 1Q86O 3T1YK 3C95A 5HRSA 4BRHA 4H0OA 5LJWA 1KLMA 2RHKA 3RR8A 4CF0A 2NRTA 1GLAG 1RILA 4BY9C 4CIGA 1RBUA 4KHUA 5GAGP 4JK8A 4ZTFA 3O9SA 3AVHA 3M8PA 4BVPA 1HYVA 3I8BA 1YHQN 1U04A 1IKVA 4A5BA 3NVKA 5JVHL 1CXUA 3KD1E 3C6TA 1DKGD 3M6GA 3O9UA 1BO5O 1JCEA 2OCEA 4H0VB 4BRCA 1WAJA 3VF6A 1GOBA 4Z4GA 4HVJA 5C15A 3DXMB 3IAYA 2HSTA 4JKCA 3F73A 4BDPA 3L2WA 3OHRA 1RT5A 2OANA 2GTDA 3VQCA 4XH1A 1ZXOA 2Q3SA 1HNIA 4L8RB 4F8RA 3OYDA 1NK9A 4DV3K 3S3OA 5TKYA 1RFQA 1R59O 4FSVA 2P1JA 4FK0A 2D0AA 3QEVA 4WQ5A 4EZ6A 3CCMN 3ENHA 3VERA 3EZWA 1X3MA 4B1WB 2NRZA 4DSLA 4WQ4A 3D7EO 2EWSA 3NBPA 3H6EA 5AZJB 5CR4A 2Z1HA 3SBTA 1SL0A 1OKJA 2RPIA 4I7FA 3NE6A 3RRGA 2O8DB 5HBMA 1RBSA 4AM6A 5AR0A 4DR7K 3AVGA 4BRIA 3LZIA 3VMFB 5F1XA 3B8AX 1KD1O 5M1PA 4IDKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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