4EHUA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adpnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
molecule tags Electron transport
total genus 92
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA01
4A62A 3QFUA 3EL2A 1K8KB 5F0XA 4BR9A 1HUXA 1KAYA 1NGAA 2Q0RA 3MK6A 5E84A 1NWKA 4BRAA 4BQZA 1MA9B 2HF4A 4BR7A 5AQHA 1QHAA 4RTFD 3WQTA 2E20A 3H45C 1RDWX 3R6MA 5AZIA 3DXMA 1HJOA 5AQWA 1DEJA 3UB5A 1T6CA 3A5MC 3FZKA 2ZF5O 4MLHA 1TYQB 4H5RA 4PL8A 1GLJO 3IDHA 1XC3A 2CH6A 3ENHA 5BRDA 3JXUA 3L0QA 4GNIA 4EHTA 4BRNA 3HZ6A 4BC5A 3CJCA 4H03B 1JCGA 4BQLA 5AFUH 2OANA 4B1UB 2P9IA 4WQ4C 4DQ8A 2QWNA 2P9NB 2WUSA 2IIRA 2ZGZA 3J8AA 4CZLA 5KPRA 3D7EO 3VGLA 3AY9A 5AQYA 4H0VB 2D4WA 1V4SA 2GWKA 3GE1A 4F9OA 3FFKB 3RSEA 2D0OA 3DWLA 3W3DA 2D1KA 3F9MA 3P4IA 4BVPA 3VEOA 5AQNA 3HM8A 3VETA 2E2QA 3ZX2A 3AAQA 3CQYA 5F1XA 1QZ5A 4BRGA 3QDKA 3UE5A 1SQKA 1WUAA 5EVZA 3WEEA 1KAZA 3M3ZA 4BR0A 3H1QA 3C0BA 4ISGA 4NO7A 4MO5A 3H3NO 4O5FA 4WYBA 2DPNA 2FF3B 5AZJB 2E2OA 2PBDA 4H0YB 3ULEB 3TU5A 3MN9A 2GEMA 4DCHA 2J4RA 4RCHA 2ASMA 4AM7A 2F9TA 4FWLA 3DJCA 3GG4A 3VESA 3IUCA 1ATNA 4RWTA 1V4TA 1MWMA 2Q2RA 2VYPA 3DXKA 1BO5O 4H0PA 5JLHA 1J6ZA 4BG9A 4AM6A 2AP1A 1ESVA 1ATSA 3FE1A 1P8ZA 3CJ7A 3FZMA 4IO8A 3C7NA 3WXIA 2BTFA 4C23A 5JMVA 4FWMA 3LDLA 3MN5A 1CZAN 4L3QA 2P9KB 2P9SB 3ID8A 5ELZA 2ZWHA 3FZHA 5F2RA 1HX1A 4PL7A 4BGAA 3D2EB 3QB0A 1X3MA 3HBTA 3GBTA 1YVNA 3LM9A 3UKRA 4B9QA 3VF4A 4CZKA 2W40A 1JCEA 3MDQA 4XEIA 5AQTA 1QQNA 4A2AA 3HSCA 3M6GA 4H5WA 1NGDA 4BRIA 2P9LB 1NGCA 4EHUA 3FR0A 1GLLO 1LOTB 2A41A 2GUPA 1S3XA 1BUPA 3WUHA 4HTLA 3O08A 2P9UA 3O80A 3U9DA 1T6DA 2EWSA 2YHWA 3QICA 3ZETB 3ZEUB 4M63C 2A42A 3A5OC 3KZBA 5AQLA 5AQJA 3VEXA 3CJBA 3SK3A 3D2FA 4Y0WA 1D4XA 3A8YA 4FWRA 1MDUB 5AFUA 3EN9A 1C0FA 1DKGD 1DGKN 3VENA 2V7YA 3LDNA 2V51B 2QWLA 1Z05A 3FGUA 5AQKA 1YUWA 2BUPA 5ADXH 5AQOA 2QWOA 4JHDB 4BRQA 4ISFA 5EY4A 4EIAA 5EX5A 4K42A 3S41A 3U9ZA 4K43A 2YHXA 3ZX3A 3IMXA 4Z94A 3A5LC 5AQMA 4GY2B 4WQ5A 5AQIA 4JD2A 3U4LA 4I6MA 1NGHA 2Q36A 3QFPA 4FPAA 5FPEA 2VWBA 4CBXA 4FL9A 4PKIA 3A5NC 1QQMA 3ATUA 4BRDA 4NB4A 2A6AA 1GLBG 4BC2A 3EO3A 5AR0A 3CETA 1QZ6A 2E2NA 3QBXA 4JN4A 2E1ZA 1S22A 5AQPA 5BREA 1E4FT 2IVPA 1U6ZA 5KQ8A 2E2PA 4CZHA 4H5VA 1K8KA 3MCPA 3CERA 4QS7A 3FZLA 1HKGA 3BF1A 5AQUA 2Q1NA 2UYTA 3EKSA 3GOIA 5CE3A 1Q18A 3U8XA 2FSNA 3CJ9A 5KQDA 4M7YA 4CZIA 3LDOA 3UKUB 2CGJA 1Z6RA 1HKCA 1Y64A 1NGGA 4JAXA 1U2VB 1GLDG 1TYQA 2QW9A 5JICA 5E26A 2A5XA 3FZFA 2HF3A 1XUPO 2P9PB 5FPMA 2QXLA 3WXKA 1ZC6A 3FLCO 5I9EB 5BRFA 1ATRA 4B1XB 2NLXA 5EOYA 2E88A 1NLVA 4H0XB 5BPLA 4H5TA 3SMSA 4J8FA 1NBWA 4YDUA 1NM1A 2P9NA 2QM1A 5AQZA 3WXLA 1QQOA 4BREA 4CBUA 2ASPA 4PKHA 4XH4A 1R59O 3SJHA 4BRPA 4CZJA 4BG8A 2NRHA 3O1WA 3H6EA 2GWJA 3R8EA 4BRKA 5AZIB 2IVNA 3DXMB 3M1FA 1YAGA 4B1YB 2Q97A 3VF2A 1RGIA 1ZBSA 4KBOA 2YI1A 3LL3A 2FSKA 4CD3A 1HPMA 4FOIA 4BVOA 4FPBA 3VOVA 3VPZA 4BR2A 3R9PA 4FWKA 3JS6A 4B1VA 3VERA 1TUUA 5AQFA 1HLUA 5FPDA 1X3NA 4K25A 3BF3A 2P9IB 3BUZB 3WXJA 4BC4A 5AZJA 4WQ4A 3ULEA 3VEZA 3A0IX 3CHWA 4H0OA 3WQUA 3ZX0A 1ZXOA 3VGMA 3OHRA 3RSEB 4BRCA 1NGFA 4CBWA 1X9JA 2H3GX 4FWOA 5BRHA 3W0LA 1H1VA 4BGBA 4IJNA 1BA0A 3ENOA 2QWPA 4BR4A 1HKBA 4CD1A 5AQXA 2A40A 1WOQA 2FF6A 3LDPA 3AAPA 3WEEB 1G99A 4BR5A 4H0TB 4K41A 2P9KA 2P9SA 4BRLA 4EFHA 2V52B 3EKUA 4CZMA 2YJEA 4FWPA 4CJ7A 1NGIA 1RFQA 4FO0A 3D2EA 2FXUA 3VEWA 3O6WA 2NZTA 4BRMA 4LC9B 4FWSA 4MO4A 3L4IA 3CI5A 3GL1A 2YHYA 3TPQA 5B8HA 3MN6A 1TUYA 2ZGYA 2QWRA 4DB3A 3CIPA 2PAVA 2CGLA 4DHYA 1BA1A 3B8AX 3DXKB 2P9LA 4B1ZA 4E1JA 3VEVA 3SMPA 2V7ZA 1T44A 3O8MA 2D0PA 3VF6A 5KPTA 1BG3A 1KAXA 5AQSA 3ZETA 3ZEUA 4BC3A 2AA4A 3VEYA 3I8BA 2ASOA 1C0GA 3HTVA 2QWMA 3C7NB 1EQYA 4H5NA 2Q31A 3LDQA 3LM2A 4QS9A 4XH5A 5LJVA 2CH5A 5AQQA 3SLCA 1E4GT 4MLEA 1YXQA 4IJAA 2GELA 1SAZA 4JNEA 3UKRB 4QS8A 3O5BA 4FOEA 3VGKA 2IVOA 4HWIA 3HI0A 4JHDA 1NGBA 4CZGA 5BPMA 1IJJA 3CJ1A 1JCFA 4IWVA 2I7PA 4BROA 4WQ5C 1BU6O 2P9UB 4EAHD 2Q0UA 1BOTO 2FLOA 2YCHA 2ITMA 1BDGA 1IG8A 1GLCG 3AARA 3H3OB 5JLFA 3BEXA 3O1BA 4CI6A 2HOEA 3D2FB 5BR9A 1NMDA 1NGJA 3QBWA 3WT0A 3KHYA 4CZEA 5AQGA 5LY3A 2QWQA 3G25A 5AQRA 3I33A 1KXPA 3MMVA 3O4WA 4ISEA 1GLFO 5BN9A 2E8AA 3L6QA 3MN7A 1NGEA 2A3ZA 5KPZA 1GLEG 5FPNA 1OKJA 4A61A 2W41A 4M7XA 4BRHA 3GDQA 4A2BA 3UKUA 2KHOA 1XQSC 5TKYA 4IXCA 4JD2B 1U2VA 4FWQA 4XH1A 3KVGA 4CZFA 1MWKA 5BPNA 3DAWA 4I6MB 4IZ9A 2VCPA 1BWFO 1LCUA 2I7NA 2P9PA 3EZWA 5BN8A 3QMLA 5ADXA 3H46O 1GLAG 3H1VX 4O8KA 3ATVA 2E1YA 2CGKA 1SZ2A 2HMPA 3BP8A 3CJAA 4FSVA 4BRFA 5AQVA 5LJWA 4FWNA 2GTDA 5EXWA 3CQXA 4B1WB 2YJFA 4PKGA 3IFRA 4YDUC 2FSJA 2F9WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1X9WA 5GIPA 3QFUA 3EL2A 2FBVA 3TAPA 2KW4A 4Q5VA 3DRSA 3RR7A 1MA9B 3WNGA 4BR7A 3R1XA 3KKRA 4RTFD 5AZIA 1HJOA 4OPJA 4JKEA 3NGZA 4MLHA 4PL8A 3I0SA 4JI3K 3IDHA 3V9XA 5BRDA 1J53A 3K2PA 4IBNA 3HZ6A 2E6MA 3V1QA 3OTOK 1W0HA 4Z4EA 4AF1A 1YJ9N 4KHYA 3F9KA 3SQ0A 4R79A 4BQLA 2KZZA 3AA5X 4JS4A 4GVMA 3P5JA 4DQ8A 3DLBA 2WUSA 3T19A 3LP2A 4C1NI 2IIRA 3HT3A 4ZTJA 3M8SA 3AY9A 2HHWA 1DT9A 2GWKA 2VQFK 3V9WA 1JJ2M 3RSEA 3CMEN 3O9RA 3D6RA 4JKGA 4BVPA 4KTZA 1G15A 3VETA 2E2QA 4LF7K 3B6OA 3OYIA 2F4VK 1QSLA 1D5AA 4FW1A 4X64K 3ZLJA 2G8WA 4JYAK 4JK8A 2OPSA 1BQMA 3H1QA 2WC9A 4NO7A 3OS1A 2DPNA 1WAJA 2FF3B 2W6KA 4V19S 1ZBFA 3TU5A 3VTIA 4CIEA 3J7ZO 3DJCA 4BE0A 3NF9A 2X78A 1ATNA 3OA9A 3DLKA 4C8MA 2NRVA 3NMUA 3SNNA 3JYTA 4DV5K 4F4KA 1ESVA 1P8ZA 1RTJA 3FZMA 4E7IA 2RKIA 1K8AO 2VQEK 2BTFA 3MN5A 4FJHA 3V4IA 4L3QA 2IDOA 2P9SB 3MAQA 3S3NA 3WXMB 4CJ4A 5F2RA 5HRPA 1L3UA 3D2EB 3KK2A 5CZ1A 2O8FA 3HBTA 1YVNA 3UKRA 1NMNA 4M3YA 4LH4A 3MDQA 4XEIA 4ILJA 4OLBA 3K0SA 4CVNE 4A2AA 2BH1A 2NUBA 4H5WA 3EE8A 4CJQA 4JKHA 1WN7A 1S9EA 2GUPA 4IDHA 3SI6A 3THYB 2P9UA 3L2VA 2F8SA 1C0UA 4DLGA 1T6DA 2EWSA 3C6AA 4RG8A 3QICA 1RT1A 4FK4A 4M63C 2XY7A 2A42A 4YY3K 2HHTA 4I2QA 3TWHA 3CJBA 3SK3A 2HSTA 4EZ6A 4NCAA 2HHVA 1D4XA 1U4BA 4ID5A 4KH5A 3EN9A 4O4GA 3TAMA 4KRFA 2Z1GA 4CJWA 1DGKN 2OZMA 1RT2A 3TABA 1BI4A 2QWLA 5ADXH 4M3ZA 4U67L 3D45A 4ISFA 4K42A 3U9ZA 3DI6A 3L2QA 1JL2A 4DWIA 4JI5K 2DY4A 4PKIA 3A5NC 5GAGP 4Z4FA 3ATUA 4BDZA 3VQ5A 2A6AA 1QSYA 1D8YA 3P38A 3MX2A 5AR0A 1QZ6A 1Q9YA 3QBXA 5CY4A 1FKPA 5AQPA 2BDPA 4TSXA 1E4FT 2DTUA 2ITGA 4H5VA 2XHBA 3KD1E 3PO5A 1JLQA 3VQPA 3BF1A 3GOIA 3EKSA 5CE3A 1Q18A 3C6UA 4X66K 4IOAL 4HUFA 3MX5A 4CZIA 3MEDA 4E19A 2CGJA 1Z6RA 3CFPA 4N47A 1KSPA 1NGGA 4YORA 3HM9A 2QW9A 2P9PB 5FPMA 3IS9A 4W5OA 1ZC6A 3FLCO 4W5TA 5BRFA 1LW0A 5EOYA 4PA1A 2E88A 2X6NA 3RMDA 4KAZA 2P5OA 2WOMA 5BPLA 3NDKA 3SMSA 3P39A 1ASWA 3HYFA 5C15A 1TK8A 5C42A 4Z4GA 1NBWA 4YDUA 3OYLA 1NM1A 4M3TA 4KFBA 2QM1A 3L3UA 1R59O 3SJHA 4BRPA 2UUCK 2JLEA 4CZJA 4FLYA 4ELUA 1A5WA 4FCYA 3HL8A 3ZSZA 3H6EA 4CEQA 3DOLA 1HNWK 2JWLA 3M8PA 1RTHA 3M8RA 3CFOA 4BRKA 2W6LA 4FJMA 2IVNA 3ZSOA 3ZSQA 5HBMA 4Z4CA 1P90A 1RGIA 1ZBSA 3LL3A 4R5PA 2FSKA 2D0AA 4JK9A 2KKZA 2Q3SA 3DLGA 4CGFA 4BVOA 3JAMO 4DQRA 1NJZA 2YHBA 3VPZA 4M3RA 1S1WA 2FBYA 1L3TA 4O0JA 5AQFA 3MCAB 4GKJK 4DSEA 1RDCA 3BF3A 2QK9A 4WQ4A 3VEZA 5AJ3K 3P31A 4CFBA 4O44A 4JV5K 4C8NA 1JLFA 4H0OA 4GV6A 1NJXA 3QLHA 3ZSXA 3ZX0A 5DMRA 1ITGA 5GAEP 4EP5A 1NGFA 3MXMA 1XI1A 3NAEA 4CF2A 1H1VA 4IJNA 1WLJA 3O3GA 4A57A 4CD1A 4DFMA 4WFBL 3WEEB 2O8EB 2KLAA 1G99A 4YOUA 1HYSA 4BRLA 2P9SA 4HVJA 1RFQA 2IS3A 1NK9A 3D2EA 2NZTA 4MO4A 1EXQA 3L4IA 3GL1A 2YHYA 4KH4A 3TPQA 3QETA 3TAQA 3MN6A 2FBXA 2RF2A 4B9LA 3TTCA 1U47A 3OYCA 5CYQA 4DHYA 4N56A 3B8AX 3PIPL 3VQBA 3THYA 1N33K 1WSEA 2D0PA 3NF8A 1BG3A 4BC3A 1IV0A 3I8BA 2QWMA 3DOKA 2HHQA 3ASMA 3LDQA 4B8CA 2ATQA 4LY7A 4XH5A 5AQQA 4CJVA 3SLCA 3H08A 1YXQA 3LANA 2GELA 4JNEA 3O5BA 4FOEA 3QERA 3CCSN 3KK1A 4CZGA 3AA3A 2Y1IA 1IJJA 1C1AA 3MXIA 2VG7A 2P5GA 4B3TK 1RBVA 1BHLA 1T03A 5C2FA 3HXMA 1C1CA 1BDGA 2KFNA 1LWCA 4DSKA 3CPEA 1IG9A 2HOEA 4FJIA 1VQ5N 1QE1A 5C12A 3JSMA 4DR6K 5AQGA 3ISNC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5BPM A;  1IKW A;  4JKA A;  1JCF A;  1BL3 A;  1NOY A;  4LFA K;  4BRO A;  4WQ5 C;  1BU6 O;  2P9U B;  4EAH D;  4CCH A;  1BOT O;  2FLO A;  1OVY A;  2YCH A;  3VQA A;  4IEI A;  2DFH A;  3AO4 A;  5JLF A;  3O1B A;  4CI6 A;  3EZ5 A;  2OA8 A;  2KFZ A;  4B3O A;  1HYZ A;  3M8Q A;  1NGJ A;  3QBW A;  3LWM A;  4OLA A;  4LFB K;  3MXJ A;  4CZE A;  5GAD P;  4FJK A;  1EX4 A;  4DFK A;  4JI6 K;  1BI4 B;  2Z1J A;  4WCE L;  4CEO A;  3L6Q A;  4JI0 K;  2A3Z A;  1VSF A;  5KPZ A;  1GLE G;  1HRH A;  5FPN A;  2ZJP L;  1TL1 A;  2W41 A;  4J2D A;  4NCB A;  4BRH A;  1JLE A;  3PY8 A;  4DV4 K;  1XQS C;  2VWK A;  4YNQ A;  3QEI A;  5BPN A;  3N4Q A;  3DAW A;  1XMO K;  3NFA A;  3QML A;  3CYM A;  5ADX A;  4CIG A;  4YOT A;  3H1V X;  4O8K A;  4KTQ A;  2E1Y A;  3ZT2 A;  4CHP A;  3FFI A;  4CGH A;  1TKZ A;  3CJA A;  1YHQ N;  4DV3 K;  1UWB A;  2GTD A;  4LH5 A;  5EXW A;  3CQX A;  4PKG A;  2F9W A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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