4EHUA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adpnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
total genus 92
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA01
3H46O 2F9WA 3VETA 1ATRA 1NGCA 1E4GT 3IMXA 1ZXOA 1QQOA 5KPRA 1X3MA 3MMVA 1NBWA 3U4LA 3FZHA 5AQUA 1HJOA 5KPZA 5EVZA 4H03B 4IWVA 3ATVA 1CZAN 4B1ZA 5BRHA 1K8KA 3QB0A 4HWIA 3WT0A 3R6MA 3H1VX 3CI5A 2HOEA 4FPBA 2P9LB 4B1YB 4BRCA 3SJHA 3CQXA 2P9NB 5B8HA 3B8AX 3VPZA 3R9PA 5BREA 1YXQA 3A5LC 1BWFO 3ZETA 4CZHA 2E88A 5CE3A 3JS6A 3QDKA 4BR9A 1X3NA 3D2EB 4QS7A 3IFRA 4IJNA 1HKCA 3LDPA 1JCGA 3UB5A 2D0PA 4H0YB 4FWOA 3SMPA 2GWKA 3RSEB 1NM1A 1GLLO 5AQMA 3LM2A 5AQHA 4JN4A 4BRGA 4IXCA 4FO0A 4YDUA 5TKYA 2J4RA 5AQZA 4BGAA 1H1VA 3M3ZA 3FZFA 4M63C 1NGGA 3ULEB 3J8AA 3O1WA 3F9MA 1KAYA 1WOQA 3R8EA 4H5RA 5AQVA 4CD3A 5ADXH 3VESA 3EL2A 4BRAA 4CZMA 2HF4A 4RTFD 5JMVA 3QFUA 4XEIA 4B1UB 5KQ8A 4FWLA 2AP1A 4FWSA 5ADXA 3MN7A 2Q1NA 2Q0RA 4WQ5C 4PL7A 5AQXA 3FFKB 2HF3A 2Q2RA 4WQ4C 4BROA 3G25A 4CJ7A 1TUUA 4BRQA 3GOIA 4F9OA 3D7EO 2VCPA 2IVOA 4L3QA 4FWPA 3WEEB 2FSJA 4I6MB 3UE5A 3EZWA 2FF6A 3LDQA 3HTVA 3LL3A 2IVNA 3TU5A 3VOVA 3VEZA 3QICA 4CBWA 3LDLA 3VGLA 3ZEUB 5AQRA 4IZ9A 1HPMA 1BO5O 3GE1A 3EN9A 1J6ZA 4H5VA 2A40A 3VEXA 4CZKA 1ATNA 4H5TA 2E2NA 3JXUA 2QM1A 2WUSA 1ATSA 1WUAA 3ENHA 3W3DA 1NGEA 2FF3B 1DKGD 2VWBA 3L6QA 1BUPA 2NZTA 1BG3A 4M7YA 3MN5A 3UKUA 5FPEA 4A2BA 4CZFA 3BEXA 3S41A 4JNEA 4FWRA 2P9SA 4FSVA 5AZIB 4NO7A 5BR9A 5KQDA 2E8AA 2ASPA 5AFUH 3QMLA 1BU6O 2F9TA 2D4WA 4ISFA 3OHRA 3W0LA 1DEJA 4DHYA 4EHUA 2BTFA 2YHXA 3VF4A 2QWOA 4CBUA 3IUCA 1RGIA 1NGBA 1U2VB 3WQTA 5AFUA 3CERA 3O80A 2W40A 3H3OB 4FL9A 3FGUA 3VEWA 4BR2A 3SMSA 3VENA 1JCFA 1SAZA 4K43A 4AM6A 2YJFA 4PKHA 3A8YA 2I7PA 4BR0A 3P4IA 1ESVA 2CH5A 4C23A 4BG9A 2QWQA 4CZEA 1HKGA 3AARA 1S3XA 3C7NA 1Z05A 5AQYA 3HI0A 5AQFA 3CJCA 2UYTA 1T6CA 3IDHA 3BP8A 2QWLA 4CD1A 1OKJA 2E2QA 5BPNA 3MK6A 5ELZA 5I9EB 4ISGA 4BRFA 4BC5A 2A42A 3SLCA 3CIPA 1QZ6A 4AM7A 3A5NC 3HM8A 1NGJA 2E1YA 4FPAA 3DXMA 4BC4A 5JICA 5AR0A 1NGFA 5BPMA 2E2OA 2EWSA 2YJEA 3CJ1A 1GLEG 1D4XA 2GEMA 3UKUB 4RWTA 2P9KB 1BDGA 1RFQA 3DAWA 1YUWA 4B9QA 5BN9A 1NLVA 4FWNA 3ID8A 3O8MA 3DXKA 3A5MC 4JHDB 3CJ9A 2H3GX 2PBDA 2QWNA 4YDUC 2DPNA 2Q31A 5AZJA 4IJAA 4BVOA 4MLHA 3EKUA 3FZLA 3HBTA 5EOYA 4JAXA 2GWJA 3FR0A 3ZX2A 3BF1A 3CJAA 5F2RA 2HMPA 2FXUA 2IIRA 2CGJA 3UKRA 1V4TA 1DGKN 2YHYA 4XH5A 1YVNA 1NMDA 3GG4A 4GY2B 5LY3A 1K8KB 2ZWHA 3VERA 5EX5A 3H3NO 3U9DA 2I7NA 3I8BA 2ZF5O 5F0XA 3WXKA 1T44A 4FOEA 1LCUA 3SK3A 4BQZA 3CETA 2P9IA 3CHWA 3FZMA 3ZETB 1V4SA 5AQLA 4FWQA 1QQMA 3BF3A 3MCPA 3C0BA 4MO4A 3U8XA 1XUPO 3MDQA 4BREA 1LOTB 2YHWA 3VEOA 4WYBA 2CGLA 2NLXA 4MLEA 4CZJA 1BA0A 2IVPA 3VF2A 3AY9A 2QXLA 4PKGA 2FLOA 1NGIA 3FLCO 4BRNA 4B1VA 3DWLA 5BN8A 4KBOA 1QZ5A 2ZGZA 2ITMA 1HX1A 3WXIA 3A5OC 3M6GA 1P8ZA 2QWRA 5F1XA 3GBTA 3MN9A 3ATUA 5KPTA 4H0OA 1R59O 5AQKA 1GLFO 2AA4A 1MWMA 2V52B 4BRKA 4CBXA 1QQNA 2OANA 5AQOA 2QWPA 4H0TB 2QW9A 3EO3A 4M7XA 3WUHA 1SQKA 5EY4A 4FWMA 5AQWA 3ULEA 2CH6A 1SZ2A 3LM9A 2V51B 5E26A 3VEVA 3O5BA 1Z6RA 4QS8A 4BC2A 2ASMA 1HUXA 1GLAG 4O8KA 1XQSC 4K42A 4CZLA 2A3ZA 4BVPA 1EQYA 5AQSA 1BA1A 4CZGA 4H0XB 4A61A 4XH4A 4BRIA 2A6AA 5LJVA 4K25A 3LDNA 4A62A 1TUYA 2CGKA 2Q0UA 3GDQA 2P9IB 3EKSA 2W41A 3O6WA 1T6DA 1TYQA 5BRDA 1QHAA 3WEEA 3I33A 1NWKA 4I6MA 5AQGA 2FSNA 3AAQA 3CJBA 4EAHD 2E1ZA 1NGHA 1MWKA 4BRHA 1JCEA 3QBXA 5AQIA 4EHTA 3KVGA 4H5NA 3WQUA 3ZEUA 3QBWA 2P9PA 3D2FA 4BR7A 1G99A 2P9SB 2VYPA 3O08A 4E1JA 4H0VB 4ISEA 4K41A 3ZX0A 1MA9B 5AQQA 4BGBA 2YCHA 2A5XA 3ZX3A 1IJJA 2GTDA 3CQYA 4Z94A 5FPNA 3BUZB 5JLFA 3QFPA 4BRMA 1HLUA 5AQNA 4DCHA 3GL1A 3VEYA 4H0PA 4WQ5A 5FPDA 4WQ4A 5AZIA 5BPLA 4BR4A 3WXJA 2P9UA 4BQLA 3CJ7A 4NB4A 1NGAA 3C7NB 1GLCG 2A41A 4BR5A 1GLJO 1Y64A 4JD2A 4RCHA 1RDWX 4HTLA 1U2VA 3KZBA 3VF6A 4O5FA 2Q97A 2ASOA 3H1QA 1S22A 4H5WA 1TYQB 3O4WA 1Q18A 4J8FA 1MDUB 2YI1A 4BRDA 3HSCA 4FWKA 4BG8A 5EXWA 1ZC6A 1BOTO 2NRHA 5FPMA 3DXMB 4Y0WA 1KAZA 3MN6A 2GUPA 2E20A 3ENOA 2P9LA 4PKIA 3FE1A 2FSKA 2P9NA 1KAXA 1KXPA 3M1FA 4QS9A 2P9PB 3D2FB 3HZ6A 3H6EA 2GELA 1HKBA 2QWMA 4B1XB 4B1WB 4MO5A 5AQPA 1GLBG 3D2EA 5AQJA 3DXKB 3A0IX 5JLHA 4EIAA 3L4IA 2KHOA 3U9ZA 2V7ZA 2BUPA 3RSEA 3H45C 4XH1A 1IG8A 4FOIA 5AQTA 4GNIA 4DQ8A 3DJCA 3L0QA 5AZJB 2P9KA 3TPQA 1U6ZA 2D1KA 5LJWA 1ZBSA 4A2AA 4BRLA 3O1BA 3KHYA 1NGDA 3UKRB 2E2PA 2Q36A 3AAPA 2P9UB 5E84A 3FZKA 2D0OA 4IO8A 4JHDA 4DB3A 1X9JA 1C0FA 4CI6A 4BRPA 2PAVA 1XC3A 3WXLA 4CZIA 3VGKA 2ZGYA 4BC3A 1YAGA 1GLDG 1C0GA 4JD2B 4EFHA 1E4FT 2V7YA 4PL8A 5BRFA 3LDOA 4LC9B 3VGMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATRA 4CIEA 1OVQA 2R7YA 3HVTA 3PIOL 1D8YA 2O8DB 3U4LA 4E7LA 2GV9A 5AQUA 1HJOA 1VRTA 3OYIA 4B1ZA 1K8KA 3NE6A 1N34K 4OPHA 1LW0A 3HL8A 3WT0A 3H1VX 3QIOA 1SL0A 3LZIA 3CQXA 2EX3A 3R3LA 4KREA 3B8AX 3VPZA 4YY3K 1BWFO 4CZHA 1U45A 1HJRA 4LF9K 4BR9A 1JKHA 3ZCMA 1UA1A 4E1MA 1HKCA 3ZSWA 2KFZA 3SMPA 4UQGA 2GWKA 4I2QA 2FBTA 4BY9C 2YNFA 4FO0A 4YDUA 1H1VA 1HNWK 1VSLA 3SQ2A 3OYHA 4CF0A 5HRRA 3ULEB 2HBKA 3R8EA 4JS5A 4FVUA 4GVEA 1SL2A 4AHCA 3VQ5A 2OPSA 3V9XA 3RR8A 5KRSA 4B3MK 1L3TA 4CJWA 3QFUA 3QNNA 1I39A 4B1UB 1KTQA 2B4JA 3G10A 1EKEA 1C0TA 1TKDA 4EP5A 3VQ6A 2Q0RA 1T3VA 2HF3A 2Q2RA 1WSFA 4OPAA 4F9OA 1L5UA 2VCPA 4FLWA 3HRGA 3JYTA 2YV0X 3G6EN 4Z4CA 3WEEB 4FJ8A 3OVNA 2HW3A 4I6MB 1X9WA 2KQ2A 1KRPA 3LDQA 4DSEA 2O8CB 1S6QA 4CBWA 3BZKA 3VGLA 5MLCQ 4IZ9A 3DMJA 2NRVA 1BO5O 1J6ZA 1BIUA 3VEXA 4X62K 3OYBA 1KD1O 4H5TA 1IBMK 3AO3A 2D0BA 1WUAA 3WXMB 3RRGA 4LF6K 2FF3B 1EP4A 4HUGA 4M3TA 2Q3SA 1JLBA 4C1NI 3BEXA 4JRQA 1JLFA 5AZIB 3VA3A 3AVMA 3O4NA 4KTZA 3IS9A 4GKKK 5C25A 3LAKA 4OKJA 2HVIA 1DT9A 2NRRA 2YHXA 3IUCA 2UUBK 1RBRA 3WQTA 5AFUA 3VQ7A 1VQ9N 3P5JA 2W40A 3FGUA 3SMSA 1SAZA 4AM6A 1CZBA 4PKHA 3TAPA 4ID1A 2JLEA 3P4IA 1S72N 4BG9A 1HKGA 1WAFA 2HBJA 3J7AP 4M3RA 3ZT1A 5AQFA 1T6CA 2IOCA 1Q81O 3ZT3A 4N41A 2DFHA 3VQ9A 3CC4N 4B9VA 2KTQA 1JJ2M 5BPNA 5I9EB 3SAGA 5M1QA 4ISGA 4BRFA 4BC5A 1LWFA 2A42A 3SLCA 5HL7L 4AM7A 3A5NC 3VMFB 3HM8A 2E1YA 3B6PA 2GBZA 3TAEA 1WLJA 1VQON 1C0MA 4F4KA 4B9QA 5M1FA 2HBMA 4GVMA 4CHQA 1S1WA 2OTJN 5BN9A 4O0IA 4FWNA 3ID8A 3A5MC 3CJ9A 2H3GX 3ZSVA 1UA0A 2PBDA 4J2EA 4JI8K 3K59A 3EKUA 3QLHA 4KHSA 3FZLA 3HBTA 3OS1A 4DR4K 2GWJA 4Y1CA 1CZ9A 3E01A 2UUCK 2AJQA 2HMPA 2IIRA 1QSYA 3V9SA 2WC9A 3ZYYX 4CK2A 1N32K 1V4TA 4CK3A 1DGKN 2PYLA 1RT7A 3CPWM 3RMBA 4CESA 4NCAA 2G8UA 3C6UA 3I8BA 2ZF5O 3KK7A 5J1EA 3WXKA 1IG9A 2IDOA 1LCUA 3SK3A 3CETA 2P9IA 3FZMA 4WFBL 3ZETB 5AQLA 2UXBK 3TARA 3HVRA 1QQMA 3K0SA 3K9JA 4Q5VA 3CF5L 3NVMA 4FW2A 3MCPA 3K5MA 3U8XA 1LOTB 1Q9YA 1RDBA 2CGLA 1BA0A 1LAVA 3VF2A 4AHVA 2FLOA 4BRNA 3CCLN 3VN5A 3NCIA 5M1OA 4IG3A 1RDAA 3O9UA 2ITMA 1M1KO 3A5OC 4C1NK 3M6GA 4M3ZA 1P8ZA 2F8SA 2O4GA 1D9DA 4QCLA 3ATUA 4AQYK 2JWLA 3OYFA 4BE0A 1SKWA 1W7AA 2OANA 3VA0A 2QWPA 2RKIA 4M7XA 1K6YA 1XNRK 3D45A 3DI6A 4FWMA 3ULEA 4NLBA 3VEVA 1HPZA 1Z6RA 4QS8A 2ASMA 1XQSC 4CZLA 5JS2A 4B9MA 4XH4A 3SV3A 5HRSA 4A62A 2Q0UA 2QK9A 3V6DA 3NBPA 4JLHA 3GDQA 3EKSA 2ZQBA 4MFBA 3O6WA 1T6DA 4IFYA 4E3SA 5J2PA 5BRDA 3KWIA 3WEEA 1XWLA 2X6NA 4CGDA 4I6MA 4W5TA 4DU3A 3CJBA 4KI6A 5GAGP 4MDBA 1HYVA 4BRHA 5J2MA 5CZ1A 3P38A 4PQUA 3OBYA 4HCCA 2XRIA 3F5TA 3CC2N 3KLHA 1S5JA 4BR7A 5EU7A 3KLFA 4FJIA 2GX9A 4B3OA 3P39A 2VYPA 1RTIA 2HHTA 5GAEP 3LZJA 4H0VB 4K41A 4CJ3A 1HR0K 3AO4A 1B92A 4DMNA 2YCHA 2A5XA 4Z4IA 3KLGA 1KLNA 4GV6A 4NCBA 3HM9A 3AVIA 5JLFA 2Z1JA 1NKBA 1HLUA 4V19S 2WONA 5AZIA 1ZBUA 5LMUK 3T1HK 2A1RA 4UY8O 4DSKA 4JS4A 3ASMA 1S1XA 1TL1A 4GV3A 1JL1A 1ASUA 2G8IA 3T19A 3PSFA 4E7KA 3NH0A 1O1WA 1A5XA 3KZBA 4C8KA 4KHYA 3H1QA 1S22A 1D9FA 4DTPA 2PY5A 3HXMA 2OYQA 3DXMB 2XHBA 2GUPA 4YOXA 4BDYA 1YI2N 2P9LA 2FSKA 3M1FA 1Q86O 3H6EA 2GELA 3ZT0A 1HKBA 4C8OA 2PFUA 5LL6Z 4FJGA 5AQPA 3PY8A 3RR7A 3S9HA 4RW8A 5JLHA 1TK8A 3C6TA 1WSEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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