4EFHA

Acanthamoeba actin complex with spir domain d
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
364
Chain Sequence
b'VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMHTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMQKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-1
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/transport protein
total genus 127
structure length 364
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4efhA03
4M7XA 2D1KA 1S3XA 4IO8A 4WQ5C 4QS9A 4CZIA 1ATRA 1KAYA 1U2VB 2HF3A 2QWQA 3CHWA 3QFUA 4BRKA 4CZHA 3D2EB 5LJVA 2J4RA 2E88A 4O8KA 3IDHA 3U9DA 3AAQA 4PL8A 3FZMA 1X9JA 3WXKA 4BR5A 2QWMA 4O5FA 5AQHA 4EHUA 2Q31A 3QDKA 2E2NA 2E8AA 5EVZA 1JCFA 2QW9A 2ZGYA 5EX5A 3FGUA 2ZGZA 4BGAA 4CZEA 3FZFA 5AR0A 3HZ6A 5AZIB 1SZ2A 1MWKA 4HWIA 3J8AA 3LDNA 5B8HA 4H0XB 4Z94A 5KQ8A 3ZX2A 2VCPA 1XC3A 4H0YB 1RGIA 1MA9B 2A42A 1R59O 5AQWA 1OKJA 1IJJA 2V51B 4CZFA 1T6DA 1EQYA 1Y64A 3H3OB 4IWVA 3ZEUB 3QB0A 4BRNA 4GY2B 1WOQA 2ASMA 2DPNA 2PBDA 1SQKA 2E20A 1MDUB 5AQGA 4YDUC 1KAZA 2E2QA 4K43A 5CE3A 4IJNA 4WQ4C 2ZF5O 4RTFD 5AFUA 3C7NB 3U4LA 3H1VX 3LDPA 4MLHA 1WUAA 3CERA 4PL7A 4BRQA 1HKGA 3ZETB 1MWMA 1BO5O 1NGBA 3CJ1A 4MO5A 3ULEA 1YVNA 2HMPA 3I8BA 2AP1A 3MDQA 4BR9A 3IUCA 4WYBA 3MCPA 4BRFA 2P9IA 4PKIA 5JLFA 3KVGA 5AZJB 1NGDA 1QQNA 5AQVA 3CJCA 1NLVA 3CQXA 2P9PA 1DKGD 5BRHA 3CJBA 2ITMA 5FPNA 4FOEA 3LL3A 3EL2A 1BG3A 1K8KB 3UKUB 4CZKA 5JICA 3L4IA 4M7YA 2D0OA 3EO3A 3SK3A 3DXKA 1GLJO 1QQOA 2ASPA 3R8EA 4BR7A 1QZ6A 1IG8A 3VGKA 4F9OA 3LDOA 3QBWA 2Q1NA 2ZWHA 3DXMA 3ZX3A 5AQFA 1GLDG 3HM8A 4KBOA 1YUWA 3G25A 1HKBA 3IFRA 3OHRA 4BVPA 5AQKA 1GLAG 2VYPA 1SAZA 1T44A 3FZLA 3F9MA 2CGJA 2WUSA 4BC5A 2GTDA 5AQYA 1Q18A 2F9WA 2BUPA 2P9SA 1Z6RA 5KPZA 5AQPA 3CI5A 5EXWA 5JMVA 4I6MA 4CD1A 1GLLO 1GLBG 3P4IA 4ISFA 4J8FA 3H6EA 4B1YB 1HLUA 1ATSA 4LC9B 4BQLA 5BN9A 2HF4A 3VEVA 4FWPA 4B1WB 4GNIA 4BRMA 1HX1A 2F9TA 4FWNA 4BR4A 3DWLA 4JAXA 5E84A 2PAVA 3A5OC 2QWLA 3ENHA 1BDGA 2QM1A 3VF6A 1RDWX 1NGJA 1NGAA 2FF3B 2I7PA 3MN9A 5BR9A 5AQMA 3TPQA 3MK6A 1NWKA 3AY9A 1X3NA 3ULEB 4CZLA 4MO4A 1NM1A 2P9IB 2VWBA 4BRAA 3RSEA 2IVNA 2FXUA 2P9UA 4BREA 2FSJA 3WQUA 4H0PA 2QXLA 5BRFA 5AQLA 4BR0A 3BUZB 1V4SA 4JNEA 3GL1A 3MN6A 4XH5A 3WEEA 2P9LA 3CJAA 5AQNA 3VEZA 4C23A 3QICA 3WT0A 3WXLA 1S22A 3A5MC 2IIRA 1J6ZA 3SMSA 3M1FA 4H5VA 3UKRA 3WQTA 5KPTA 4RWTA 1BA0A 3L0QA 4IXCA 2P9KA 5AFUH 4A62A 1D4XA 3VEOA 5BPLA 1ZXOA 1DEJA 3FE1A 3KZBA 3UE5A 4JHDA 1BOTO 5AQTA 1QZ5A 5LY3A 3DXMB 3MN7A 4CD3A 4BVOA 3AARA 3QMLA 1V4TA 2Q36A 1HKCA 3KHYA 1ESVA 4CJ7A 4DHYA 3HBTA 3W3DA 4XH4A 4A2AA 3CQYA 1KAXA 4A61A 3VF2A 3QBXA 2CH5A 3WXJA 2YCHA 1TUUA 3WXIA 1T6CA 5BN8A 2NZTA 4QS7A 3S41A 4JN4A 4H03B 3EKSA 3D2FA 4CBUA 1LOTB 2H3GX 2YHWA 5ELZA 3CJ9A 5EY4A 1NBWA 4K25A 3CJ7A 2V52B 3FZKA 4QS8A 1JCGA 3LM2A 4I6MB 2IVOA 3HSCA 2FSKA 4H0OA 3UB5A 3W0LA 4BC3A 4BC2A 2Q0UA 1GLCG 2IVPA 2GWJA 5JLHA 3R6MA 1HPMA 5KPRA 1QQMA 2V7YA 3H46O 3VERA 3GBTA 1YXQA 4PKHA 2YJFA 3SMPA 2Q0RA 5EOYA 3CETA 5AQXA 1GLFO 2NLXA 3BF3A 2FSNA 3DAWA 4Y0WA 1CZAN 4BRPA 5AQOA 1YAGA 2A3ZA 3FZHA 4B1XB 3O1WA 3M3ZA 3RSEB 3I33A 2P9UB 5I9EB 1ATNA 1XQSC 4FOIA 3U9ZA 1ZC6A 2V7ZA 2FF6A 2EWSA 3WUHA 3WEEB 4BRHA 4ISEA 5AZJA 2UYTA 2CGLA 5ADXA 3VENA 1HJOA 4FWRA 1GLEG 4FSVA 4DB3A 3BEXA 3UKRB 3O80A 1U6ZA 4CZMA 1ZBSA 3D7EO 1BUPA 4BGBA 4H5WA 1E4FT 5AQSA 2CH6A 1K8KA 1X3MA 3A0IX 2ASOA 4JHDB 4B1VA 4B1UB 2QWPA 4JD2A 5FPEA 1XUPO 3HI0A 2A41A 1NMDA 2YHXA 4FPAA 5FPDA 4BG8A 4FPBA 3GG4A 3ATVA 4CBWA 4EIAA 5F1XA 3BF1A 2P9PB 3SLCA 2E2PA 2E1YA 2GUPA 3JXUA 3O1BA 4BRCA 5TKYA 4FL9A 1TYQA 1DGKN 3VEXA 2Q2RA 4MLEA 4NB4A 4BC4A 4XH1A 3D2FB 5BPNA 3VF4A 5LJWA 2YI1A 3ID8A 5AQIA 5AQZA 1NGEA 4EFHA 3VETA 5AQJA 3DXKB 2W41A 2QWNA 3MN5A 2P9NA 3EZWA 4FO0A 1TUYA 3CIPA 2FLOA 4ISGA 3VEWA 4FWLA 4FWKA 4RCHA 4CI6A 4AM7A 4IJAA 1U2VA 1Z05A 1JCEA 3IMXA 3QFPA 3D2EA 4BR2A 4DQ8A 4B1ZA 4B9QA 5FPMA 2GELA 4BG9A 4FWOA 4FWSA 3H1QA 3ATUA 2W40A 1NGGA 4BRGA 4WQ5A 1NGCA 2CGKA 1G99A 2P9SB 4FWMA 1BA1A 3O5BA 3ZX0A 1BWFO 1NGIA 3MMVA 5AZIA 4L3QA 3O08A 4E1JA 1C0FA 5AQRA 2HOEA 4M63C 5AQUA 4H0VB 3VGLA 3VGMA 4BRLA 4IZ9A 2D4WA 3O6WA 2BTFA 1H1VA 3AAPA 4BROA 4H5RA 3TU5A 2E2OA 2Q97A 4EHTA 2QWOA 3LDLA 4H5TA 1E4GT 4A2BA 3FLCO 1C0GA 2A40A 2E1ZA 4BRDA 3EKUA 3JS6A 2A5XA 4AM6A 2OANA 3ZEUA 3VEYA 4XEIA 3FFKB 3L6QA 5BRDA 1HUXA 3VESA 1P8ZA 3GDQA 3H3NO 4JD2B 5F2RA 3M6GA 4H0TB 3ENOA 3R9PA 4PKGA 5BPMA 2I7NA 1RFQA 4HTLA 2KHOA 3LM9A 4H5NA 5KQDA 3A5NC 3C7NA 4CZGA 2QWRA 3VPZA 4EAHD 3ZETA 1QHAA 4DCHA 1NGFA 4FWQA 1BU6O 2YJEA 3VOVA 3A8YA 3H45C 1TYQB 3EN9A 3HTVA 3BP8A 1NGHA 4CZJA 4K42A 5ADXH 1LCUA 2P9LB 3GE1A 3GOIA 3A5LC 4YDUA 3O8MA 4WQ4A 4K41A 2GWKA 4CBXA 2YHYA 5BREA 2AA4A 5AQQA 2GEMA 4NO7A 2D0PA 3B8AX 2A6AA 3C0BA 2P9KB 2P9NB 1KXPA 3DJCA 3LDQA 5E26A 4BQZA 3UKUA 3SJHA 3O4WA 3U8XA 2NRHA 5F0XA 3FR0A 4BRIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M7XA 1HR0K 1HJRA 5HRRA 4JK9A 4CZIA 1TAUA 2QWQA 4CZHA 4XIUA 3THWB 3D2EB 4R5PA 1VQ4N 4O8KA 2E88A 4L8RB 4DR2K 3IDHA 3AVAA 4NCBA 3AAQA 3KKRA 2FBVA 1X9JA 3WXKA 4BR5A 2PYLA 3ZSVA 1VRUA 3V9UA 3T69A 1OH6A 2Q31A 2E2NA 4FVMA 2O8DA 1RBSA 4NCAA 1JCFA 1VQPN 2OTJN 1LAWA 5C0YA 3R3LA 4J2DA 4JI3K 5T7BA 1S1UA 3B6PA 3FGUA 4FW1A 4W5QA 4FJGA 4CZEA 3SV4A 3QEPA 5AR0A 4O0IA 2OPQA 2KFZA 4I2QA 3QEWA 3P31A 4CEBA 4HWIA 3KWIA 2HHSA 3C94A 4JV5K 2G8UA 2AJQA 3ZX2A 1NJYA 1UWBA 2IDOA 1XC3A 4H0YB 1MA9B 4DV6K 2V51B 1EQYA 1Y64A 3H3OB 3ZT3A 1NOYA 3P1GA 2JWKA 4M3UA 1WOQA 2DPNA 2YNFA 2PBDA 2QXFA 4CEAA 3J7ZO 2Q3SA 4CJ3A 2E20A 1MDUB 3AA5X 1S9EA 5CE3A 4JKAA 4IJNA 4KB1A 2ZF5O 1HYSA 2XY6A 4DTMA 3H1VX 3I0SA 3ZSQA 3KJVA 4J2AA 2E6LA 4BRQA 1HKGA 4HCBA 1MWMA 4EZ9A 1SL2A 4KTZA 2NUBA 3LP0A 1FW6A 3MXMA 3ULEA 4DSLA 4BRFA 4CEOA 3IUCA 4WYBA 1GOAA 3Q7BA 4PKIA 3ZCMA 3F9KA 5E41A 5AZJB 3RRGA 3BZKA 5AQVA 1NLVA 4CJTA 2NRZA 2P9PA 4O44A 4CJFA 2RHKA 2KQ2A 3I0RA 3O9RA 2Z1HA 4FJNA 4O8UA 2ZE2A 3L4IA 3K5LA 1X9WA 1RNHA 5LMUK 3DM2A 1GLJO 4BWMA 3HM9A 3AVCA 3K9JA 4JEPA 5JVGL 5AQFA 4JS5A 3THXA 1C0UA 1C6VA 3CCUN 5CR4A 1YUWA 3NF9A 1HKBA 4DSEA 4B9UA 5AQKA 3S5TA 1GLAG 1SAZA 1T44A 4E1NA 3PX4A 3SZ2A 3F9MA 2CGJA 1J5OA 1ILYA 1JLAA 1RT1A 4JK7A 3PO5A 4CIEA 3DRPA 5TKWA 2NRVA 3SUNA 3ENBA 5EXWA 1GLBG 2HBMA 4J8FA 4WE1A 2HB5A 4CESA 1MU2A 4CECA 3TSQA 4B1WB 4GKKK 2F9TA 1WAJA 4IFYA 4E19A 4JAXA 5E84A 3UIQA 3DYAA 3A5OC 3ENHA 4DR1K 3HSTB 4DQSA 5C24A 3ZT2A 5BR9A 4BDPA 3QERA 4H4MA 3AY9A 2Z1IA 4CZLA 4DQRA 4MO4A 3A2FA 4KH5A 1TK5A 3G71N 1IKWA 2P9UA 4NCGA 4BREA 2FSJA 2QXLA 3F5TA 4NLBA 2VQEK 3EZ5A 4BR0A 4JNEA 4M3TA 3GL1A 3MN6A 3WEEA 3SI6A 3SYZA 2QTDA 3CJAA 3DMJA 5GAGP 4C23A 4JI1K 1DT9A 2IIRA 3HRGA 4ICLA 1OH5A 4LF9K 3CPWM 3WQTA 5SZTA 2LSNA 5KTQA 4NXMK 3QNOA 4C8KA 1DEJA 4H4OA 4FW2A 5CHIA 1FKPA 1G15A 5LY3A 3DXMB 4CD3A 4HHTA 1HNXK 3AARA 3QMLA 2Q36A 2X74A 2XO7A 3THWA 1YF5L 3CFRA 5HLFA 1Z25A 3CCSN 3CQYA 4LSLA 3V1OA 3E01A 3ZT1A 2NRRA 1CZBA 4O4GA 4CK1A 3WXIA 3CPEA 2OPSA 3CC2N 4DSKA 3EKSA 2UXCK 1BIUA 2HNZA 2O8BA 3HPOA 4BDZA 3D2FA 2H3GX 5IT9O 3CJ9A 1NBWA 2V52B 1HQEA 2UXDK 4I6MB 1VQON 3HSCA 4OX9K 3W0LA 4BC3A 4LY7A 2Q0UA 4DFMA 2IVPA 3OS2A 2GWJA 2HBLA 4I7FA 4FJXA 5KPRA 2V7YA 4OPAA 3VERA 4IO9L 5LL6Z 3LPTA 2WC9A 4JKGA 3SMPA 3OYLA 2Q0RA 4I2PA 3CETA 3RMAA 1GLFO 1RDCA 4M3RA 5M1PA 5GINA 3M5RA 4C1NI 2ZJQL 5DM6L 4M3YA 4CF9A 3VA0A 5GIPA 3FZHA 4ZHRA 1R0AA 1ATNA 2O8CA 2Z1JA 1ZC6A 3NF8A 4RW6A 4N56A 4Y1CA 2GV9A 4HUGA 1VQ6N 1J54A 4ISEA 3CM6A 3TAMA 5AZJA 4DKWA 1DLOA 4KB0A 4Z4CA 1HJOA 1JL1A 4DB3A 3BEXA 2OPPA 3OYJA 4CW7B 4YY3K 1TL1A 3OBWA 4JI6K 1W7AA 4JHDB 2ITGA 1P90A 4ELVA 4YNQA 4JD2A 3MWTA 4CEZA 1BQMA 4KH6A 2YHXA 3V9ZA 5DK5A 5EU7A 4BG8A 3VTIA 1VSLA 3GG4A 1BL3A 4CBWA 1J5EK 2HMIA 3BF1A 3JXUA 2GUPA 4RG8A 4BRCA 5TKYA 4FL9A 4FK0A 2GUIA 3TAPA 4NB4A 4O5BA 5LJWA 4N76A 3ID8A 4OKJA 1SUQA 3VETA 3DXKB 3K5OA 4B9NA 1EWQA 4YORA 1KD1O 4Y1DA 4DTNA 2HBKA 1NK4A 3EZWA 4E3SA 4LF4K 3CIPA 2FLOA 3VEWA 4FWLA 4JKFA 4AM7A 4CERA 4IJAA 1U2VA 1Z05A 3IMXA 5JS1A 5DM7L 5JVHL 4B9QA 5FLXO 1L3SA 1EETA 1NK0A 3MX2A 1XWLA 3CFPA 2DTUA 1NGGA 1IKXA 4CHPA 4DFJA 4FWMA 1BQNA 3O5BA 4O55A 3MMVA 4FJHA 3K59A 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2RKIA 3CMEN 3ZETB 5BR8K 4YFUA 1JJ2M 4DUYK 1YTUA 1ITGA 1T05A 3CJ1A 1T7PA 4DUZK 2HMPA 3I8BA 2AP1A 3MDQA 4BR9A 4BY9C 5JLFA 3VQDA 3KVGA 5FRMA 1ZBHA 4DU3A 1XMOK 3D6RA 3CJCA 4C8LA 3LPUA 5BRHA 1BGXT 3CJBA 3K5NA 4CGJA 1DTTA 5FPNA 2E6MA 4J2BA 3KK1A 3K57A 1K8KB 4FM1A 5JICA 3CCEN 2IS3A 1SV5A 3EO3A 1RDDA 4JS4A 3DXKA 1I39A 4YOYA 1IG8A 4B9VA 3VGKA 4F9OA 4JKEA 4DTUA 3K0SA 3MAQA 4E7JA 3QINA 3LDSA 2VGMA 4DTOA 4XJXA 3VQEA 4KBOA 3VQQA 3V1QA 4BVPA 2FBXA 1K6YA 1Q8IA 3CD6N 2VYPA 4W5OA 3Q7CA 4RW9A 4PWDA 1C1AA 4CGIA 4YHHK 4CJPA 2WUSA 1K73O 3DLHA 3ID6A 2ZJRL 4GVEA 1Q18A 1WSFA 1N5YA 3DOLA 1YJ9N 4B9TA 2B4JA 1DTQA 3HVTA 4AHVA 5JMVA 1OH8A 2HHTA 2UUBK 1GLLO 3P4IA 3L2RA 1X9MA 3H6EA 1HLUA 1KVAA 1NK9A 5CZ2A 1RTJA 4BQLA 4FWPA 4BRMA 3THYB 1NKBA 4FWNA 1Q81O 3DWLA 3CCLN 3OJSA 3U6FA 2PAVA 2QWLA 3KK3A 4EP5A 4B08A 1RDWX 4CEDA 4BE2A 1KCFA 3MN9A 4CJSA 1TK8A 3V9SA 5I42A 3SJJA 1SL0A 1IG9A 2P9IB 3SAGA 3RSEA 2FXUA 3K9KA 4CHOA 2G8KA 3OYIA 1N32K 5BRFA 5AQLA 3ZSWA 1U4BA 2G8IA 3K5MA 2G8HA 1IBLK 2P9LA 1IKVA 3FFIA 3SBTA 5AQNA 3VEZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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