1NGAA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINSPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngaA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngaA04
3VF4A 4IXCA 2E1YA 4BGBA 4E1JA 3O6WA 1C0FA 4CZLA 3O08A 3L0QA 4XH1A 3H1QA 4PL8A 5BN9A 2QWPA 3D7EO 3WQUA 3QBWA 1S3XA 5I9EB 5ADXA 2WUSA 2E2QA 2IVOA 1HPMA 4PKHA 2FSNA 4BR2A 3WXIA 3H1VX 2A41A 5AQFA 2PAVA 3MN9A 3WQTA 5AZIA 4YDUC 3O8MA 3JS6A 4DCHA 4H0XB 3FZFA 3ZEUB 4H5NA 5BRHA 2P9KB 2KHOA 3EKUA 2QW9A 1DEJA 2DPNA 1HKCA 1MWMA 3QFUA 4DQ8A 2Q97A 4FWRA 1U2VA 5F0XA 4BRQA 3VETA 1Q18A 4BRHA 4FSVA 1GLDG 3QICA 4RWTA 4BQLA 3VF6A 2D1KA 5AQYA 4WQ4C 4K41A 3IMXA 2QWOA 3ATUA 2P9PA 4BRMA 4HTLA 4BREA 5LJWA 2F9WA 4JNEA 5AFUH 4FPAA 5AQLA 3SK3A 2QM1A 3A5MC 4BR9A 1NMDA 3HI0A 4BG8A 5AQRA 5KQDA 3HTVA 1RFQA 1J6ZA 4JD2A 3LM9A 5FPDA 3A0IX 2YJFA 3BF1A 5BREA 3QBXA 4BRLA 4CD3A 5AQSA 3D2EA 1K8KA 4JHDB 4A61A 4CZEA 3AY9A 3LDQA 1H1VA 4FWPA 3WEEB 1QQOA 2A3ZA 3VERA 5AQGA 3ZX2A 2VYPA 1KXPA 1TYQB 4XEIA 4QS8A 2ASPA 1BA0A 4L3QA 2W41A 2D4WA 5EX5A 3R6MA 4DHYA 4B1UB 1BDGA 3DWLA 1SAZA 2UYTA 3OHRA 1OKJA 4BVOA 3EZWA 2FXUA 1Y64A 5AQQA 3C7NB 4I6MA 3SMPA 2E8AA 3A5NC 2CH5A 3UKUA 5AQJA 5AQKA 3VGKA 2BUPA 3LM2A 4BC2A 1DGKN 1GLBG 2V52B 2YCHA 5KPRA 3O80A 3R9PA 3H6EA 4FO0A 4WQ5A 4A2BA 3WT0A 3ENHA 5BN8A 4BQZA 4QS9A 3VPZA 4Y0WA 2J4RA 2P9NB 1NGEA 2ZF5O 3BEXA 1IJJA 2GWJA 5KPTA 1D4XA 3WXKA 3CJBA 4CD1A 1NGFA 1GLLO 3DXKA 2V7ZA 4BRIA 4PKGA 2Q1NA 1NGBA 1YUWA 2GELA 3GBTA 5AZJA 3EO3A 4CZJA 2FSKA 3HM8A 3WXJA 4RCHA 2BTFA 4BC3A 3AARA 1C0GA 2P9SB 2P9IA 4MLEA 2FSJA 1T44A 3TPQA 4MO5A 5BRDA 3MK6A 4BRGA 2EWSA 4AM7A 2V51B 3GE1A 2QWRA 2H3GX 3O1BA 3CQXA 5AQUA 3VGMA 2GUPA 1QQNA 3GL1A 4ISEA 3J8AA 4WQ4A 5JICA 4B9QA 4CBUA 1XC3A 4H5TA 2Q0UA 2A40A 2ITMA 3ZETB 4BR7A 4B1ZA 3ZX3A 4FWOA 3QMLA 4ISFA 3S41A 5BPMA 4QS7A 3SMSA 5AQHA 3A5OC 2D0OA 1XQSC 3UKRB 4BR5A 4CZMA 3ULEB 1V4SA 3VESA 5B8HA 4B1XB 5F2RA 2CH6A 4FWQA 1WUAA 3CJ1A 3DJCA 3DXMB 4BRDA 1HJOA 4BVPA 3M3ZA 1DKGD 3I33A 3U4LA 3O1WA 4BR0A 3LL3A 3MDQA 3LDPA 5JLFA 3CETA 1ATSA 3DAWA 1ZC6A 2E88A 2W40A 1X3NA 2E1ZA 3F9MA 5BPNA 3SJHA 2P9UB 1Z05A 1Z6RA 5EXWA 4EAHD 4H0TB 4HWIA 3W3DA 2E2PA 2AP1A 3CHWA 4BR4A 4CI6A 1BWFO 5JLHA 3RSEB 4H5RA 1P8ZA 1NWKA 3MN6A 1HKBA 3A5LC 3AAPA 5ELZA 3ATVA 3FR0A 4IJAA 3ZEUA 3UB5A 1SQKA 1BG3A 2P9KA 2HOEA 3FZHA 4F9OA 1SZ2A 4CJ7A 1RDWX 3ID8A 3UE5A 2V7YA 4KBOA 3LDNA 1HUXA 5LY3A 2ZGZA 1MWKA 4FWLA 3QFPA 4EFHA 3M6GA 3VEYA 4A2AA 5BRFA 5FPEA 3WXLA 4CZHA 3CERA 2I7NA 1NGCA 4O5FA 2VCPA 1YXQA 4H5VA 4NB4A 5BR9A 3HZ6A 4BG9A 4CZKA 4PL7A 2QWNA 2P9LB 2NLXA 3MN7A 4FWMA 4FWSA 3VEOA 3SLCA 5ADXH 1ZXOA 3FZLA 2ASMA 5AFUA 3CJ9A 3D2FB 4BRCA 4B1YB 4CBWA 2IVPA 3JXUA 1BU6O 4JHDA 3VGLA 3L6QA 3WEEA 4GNIA 2ASOA 1V4TA 2QXLA 1TYQA 2YHXA 2E2OA 3VF2A 3U8XA 2IIRA 3O5BA 1BOTO 2ZGYA 2NRHA 4K25A 1MA9B 3IFRA 4YDUA 1IG8A 5AZIB 1NGHA 3QB0A 4RTFD 5CE3A 3W0LA 3M1FA 4JAXA 2YHWA 3MCPA 4MLHA 3C7NA 1JCGA 3CJAA 5AR0A 5BPLA 2A5XA 2E2NA 4BGAA 3A8YA 3VEZA 2CGJA 1JCFA 1CZAN 3U9ZA 5LJVA 4NO7A 2Q2RA 2Q31A 3IDHA 4XH5A 1ESVA 5AQXA 1U2VB 1HLUA 3ZX0A 4BRNA 1BUPA 3LDLA 2FF3B 3CJCA 1ATNA 1NGGA 3AAQA 2P9NA 1NGIA 2Q0RA 2F9TA 1LCUA 4WYBA 1GLJO 3P4IA 3GG4A 5EOYA 3U9DA 3FGUA 2P9PB 1YAGA 3R8EA 1BO5O 5EVZA 4H0VB 4BRAA 4BRPA 4C23A 5EY4A 3H3NO 1GLFO 4JD2B 3H3OB 1S22A 3VENA 2P9SA 4BROA 5TKYA 5E84A 5FPNA 4XH4A 2AA4A 2ZWHA 4K43A 5AQTA 3D2EB 1ATRA 1K8KB 4M7YA 3O4WA 2E20A 4AM6A 1U6ZA 4EHUA 1KAZA 4FL9A 2IVNA 3G25A 2VWBA 4IZ9A 4IWVA 3MN5A 3EN9A 1QQMA 4CZIA 4CZGA 3H46O 2QWLA 3H45C 4H0OA 1LOTB 2D0PA 5AQNA 1QZ6A 1X9JA 4GY2B 4I6MB 2OANA 5AQMA 2GEMA 3BUZB 4B1VA 4FWNA 3ZETA 4CBXA 2CGLA 3UKUB 1KAXA 3FZKA 4MO4A 4A62A 3WUHA 5AQOA 3UKRA 4JN4A 4PKIA 1GLCG 2I7PA 3KHYA 3ULEA 1TUUA 3FZMA 5F1XA 4M7XA 1YVNA 2Q36A 2FLOA 3DXMA 4EIAA 4IJNA 3CI5A 1NGDA 2YI1A 3VEXA 2QWQA 1E4FT 3GOIA 3DXKB 3KVGA 4BC4A 3VEVA 2YJEA 1NGAA 1HKGA 2HF4A 2P9UA 5AZJB 4BRKA 4J8FA 5FPMA 1R59O 3QDKA 1NM1A 2CGKA 4FOIA 3FLCO 3LDOA 3BF3A 2A6AA 1QHAA 1ZBSA 1NGJA 3BP8A 3ENOA 1MDUB 3HSCA 5AQIA 3RSEA 3VEWA 4H5WA 3EL2A 2P9IB 1E4GT 3GDQA 1G99A 4DB3A 1T6DA 1T6CA 3HBTA 2GWKA 1XUPO 4O8KA 4IO8A 4CZFA 1QZ5A 4H03B 1KAYA 2QWMA 1NBWA 2HMPA 2GTDA 3FFKB 2A42A 5AQVA 3TU5A 4M63C 2YHYA 2PBDA 4LC9B 3C0BA 5AQZA 3MMVA 1GLEG 3VOVA 1GLAG 4ISGA 5KQ8A 1NLVA 3L4IA 4EHTA 3I8BA 2HF3A 4K42A 3B8AX 1X3MA 3IUCA 5JMVA 4H0YB 1WOQA 4FPBA 4H0PA 1TUYA 5KPZA 1EQYA 1BA1A 4Z94A 3EKSA 5E26A 5AQWA 2P9LA 4BRFA 4WQ5C 4BC5A 3CJ7A 3CQYA 5AQPA 4FWKA 1JCEA 4B1WB 2NZTA 3KZBA 1RGIA 3CIPA 4FOEA 3FE1A 1HX1A 3D2FA 2FF6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HOSA 1UOCA 4PL8A 2QWPA 2HNZA 3OYAA 3G10A 4V19S 2WUSA 4OLAA 3CCSN 2YV0X 1FK9A 3L2VA 3BZCA 4JKHA 3I55N 2FBVA 1WAJA 2YILA 1VNBA 4CEOA 3ZLJA 3FZFA 5FDLA 3E9LA 1UA0A 4ELTA 1DEJA 2UUCK 3QFUA 2KSKA 2HHHK 4DQ8A 4FWRA 1A5VA 1ZBFA 5C10A 1T0ZA 1RT2A 1SKWA 4BRHA 5TKWA 4X65K 3P31A 3VN5A 1NK0A 4BQLA 2D1KA 2KTQA 4CERA 3SUQA 4K41A 3EE8A 1TKXA 3THWB 5KRTA 4OJRA 4YOVA 4BRMA 1YVUA 5LJWA 2F9WA 4JNEA 4FPAA 5GADP 1NOYA 3HI0A 4KH5A 4CJRA 2OPPA 4JKCA 1J6ZA 1Q86O 3BK3C 4DU4A 3LALA 2G8FA 1TV6A 3SUNA 1HNIA 4KYPA 4RW6A 3QBXA 4CD3A 3V9XA 3TABA 2GMOA 4CJUA 4ELVA 5JS1A 1K6YA 3LDQA 4FWPA 2O8BB 3HL8A 1QQOA 3WEEB 2A3ZA 3V6DA 2I5JA 3VERA 3THYB 5DMRA 4QS8A 2ASPA 1BA0A 4KHYA 3KLEA 4B1UB 3MXMA 1BDGA 4RW8A 4ZTJA 4RG8A 3OHRA 2O8EA 4BVOA 1Y64A 5AQQA 4M45A 2E8AA 2CH5A 3LM2A 4LH4A 1GLBG 2YNHA 2OTJN 1VQ5N 1EX4A 3H6EA 3S5TA 1ZVEA 1QSYA 1S72N 1TKDA 4KHWA 4TSXA 3OTOK 1A5WA 1HR0K 1Y97A 4Y0WA 1YIJN 4CJFA 3K5OA 3BEXA 1IJJA 4KTWA 3OYDA 1D4XA 4BDZA 3KKSA 4DU3A 3KLFA 1NGFA 5M1PA 2V7ZA 3CPWM 2UU9K 4JKAA 4PKGA 1JKZA 1ZBHA 1YUWA 1JLEA 3VA0A 4AHCA 3QNNA 1LWFA 3I0RA 4LF9K 3K58A 3WXJA 4CJ4A 4ILHA 4DV2K 4KHPK 4J2EA 4M3RA 4JV5K 3WNEA 1HNXK 2P9IA 3DYAA 4MLEA 3PX0A 3RWUA 2VY6A 1TI5A 3KP1A 1JL2A 3TPQA 1Q9XA 4MO5A 5BRDA 2XO7A 1T7PA 4CVNE 4BRGA 4YOUA 3GE1A 4JI0K 3R1XA 4CGJA 4NCGA 2NRVA 2H3GX 3AA4A 5GIPA 4FK4A 3LP2A 2LR3A 2LJ7A 4I9LA 1LW2A 4ISEA 2ZE2A 3KK1A 4CBUA 4DV0K 2Q0UA 4KHQA 4C8LA 3S9HA 3L3VA 4CHPA 3ZCMA 3QINA 2Z1GA 4B1ZA 1U45A 3ISNC 4FWOA 1EP4A 4ISFA 3S41A 4QS7A 3ZX3A 3HOTA 2UXDK 3A5OC 1NNEA 4CJTA 1W0HA 1U04A 3KIOA 5F2RA 3OYMA 1RILA 3K9JA 3DJCA 3DXMB 1POIA 4JKGB 4HTUA 5HLFA 1HJOA 4XJXA 3HP9A 4JRPA 3NBPA 2W40A 3OYGA 2E3GA 1C56A 5H1SQ 1Q8IA 4HWIA 2E2PA 2AP1A 4K0KK 4CE9A 3KK2A 1JLBA 4CGHA 4H5RA 4DSFA 2HHVA 3A5LC 3RRHA 5ELZA 4IJAA 1JZBA 3UB5A 4CIFA 3O4QA 1YTUA 1BG3A 2HOEA 1VQ8N 4CQKA 3C6HA 1ZBLA 3K0SA 2OPRA 3VQCA 1MWKA 2GV9A 1HYSA 3QFPA 3SBGA 5HRSA 4IO9L 1SN1A 1FXXA 1JLAA 3THWA 4M3ZA 3AA2A 2Q3SA 4LY7A 1RTIA 5E41A 3DMJA 1L3SA 1BCMA 3RR8A 1RBTA 4OO1J 4DQSA 4U7BA 1LWCA 5BR9A 3LPUA 3HXMA 4PL7A 2NLXA 2ZQBA 5D3GA 3VEOA 3SLCA 1ZXOA 3FZLA 2YNGA 4AHVA 2NRTA 4HUEA 1L4VA 2VQFK 1NJZA 4BRCA 4PQUA 1BI4B 3ZYYX 1YJ9N 2IVPA 3JXUA 1BU6O 3KP0A 4JLHA 2O8BA 3WEEA 5M1FA 4GNIA 1P0AA 4Y1DA 3THYA 2X74A 2E2OA 3MAQA 2OCEA 3O5BA 3S3NA 3J81O 1AYJA 4K25A 3MEEA 2NRZA 1MA9B 3IFRA 2ITGA 3QB0A 5KI6A 4OGCA 3M1FA 4JAXA 2KJAA 3G0ZA 2XY7A 1WSJA 1JCGA 3KLGA 4DS5A 5AR0A 1ZBIA 2R7YA 4BGAA 3VMFB 4LF4K 3VEZA 2I61A 1CZAN 4KHSA 3T1YK 5LJVA 4M3WA 2Q2RA 1SEGA 4V1DC 3DM2A 4DUYK 1U2VB 4CJPA 2Y1JA 1ILYA 1NJYA 3C6TA 2F8SA 1XNQK 3MEGA 1S9EA 4DFPA 2P5OA 1M90O 2WTUA 5HRPA 3U9DA 3NGZA 1YAGA 1BHLA 3ID6A 4C23A 1D9FA 4DR4K 1K9MO 2IDOA 2JGUA 4CF9A 4DQQA 2RHKA 3H3OB 4MDBA 3CCJN 3VENA 1I39A 3P38A 2G8UA 2KKZA 2AA4A 1LW0A 1VQPN 4GVEA 3ZSXA 4M7YA 3J7ZO 3G71N 5CHIA 4WCEL 3TSUA 4IWVA 1JXEA 3NF6A 2XHBA 1EWRA 4CZIA 4FLVA 1BRZA 1LWEA 4BEBA 3NH0A 3OS2A 3DLHA 1X9JA 4GY2B 5AQMA 4B1VA 4FWNA 3QIOA 1KD1O 4CBXA 1KAXA 3FZKA 4A62A 3WUHA 2B6AA 4DTNA 2Y1IA 1GLCG 3FZMA 3SAGA 3SUOA 3ITHA 3ALYA 4J2BA 1RT4A 3DXMA 4JKGA 1VQ9N 1ZYVA 3CI5A 3KLHA 4E72A 2ASCA 1OZZA 3KWGA 3SJJA 1HKGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HOS A;  1UOC A;  4PL8 A;  2QWP A;  2HNZ A;  3OYA A;  3G10 A;  4V19 S;  2WUS A;  4OLA A;  3CCS N;  2YV0 X;  1FK9 A;  3L2V A;  3BZC A;  4JKH A;  3I55 N;  2FBV A;  1WAJ A;  2YIL A;  1VNB A;  4CEO A;  3ZLJ A;  3FZF A;  5FDL A;  3E9L A;  1UA0 A;  4ELT A;  1DEJ A;  2UUC K;  3QFU A;  2KSK A;  2HHH K;  4DQ8 A;  4FWR A;  1A5V A;  1ZBF A;  5C10 A;  1T0Z A;  1RT2 A;  1SKW A;  4BRH A;  5TKW A;  4X65 K;  3P31 A;  3VN5 A;  1NK0 A;  4BQL A;  2D1K A;  2KTQ A;  4CER A;  3SUQ A;  4K41 A;  3EE8 A;  1TKX A;  3THW B;  5KRT A;  4OJR A;  4YOV A;  4BRM A;  1YVU A;  5LJW A;  2F9W A;  4JNE A;  4FPA A;  5GAD P;  1NOY A;  3HI0 A;  4KH5 A;  4CJR A;  2OPP A;  4JKC A;  1J6Z A;  1Q86 O;  3BK3 C;  4DU4 A;  3LAL A;  2G8F A;  1TV6 A;  3SUN A;  1HNI A;  4KYP A;  4RW6 A;  3QBX A;  4CD3 A;  3V9X A;  3TAB A;  2GMO A;  4CJU A;  4ELV A;  5JS1 A;  1K6Y A;  3LDQ A;  4FWP A;  2O8B B;  3HL8 A;  1QQO A;  3WEE B;  2A3Z A;  3V6D A;  2I5J A;  3VER A;  3THY B;  5DMR A;  4QS8 A;  2ASP A;  1BA0 A;  4KHY A;  3KLE A;  4B1U B;  3MXM A;  1BDG A; 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