1NGAA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINSPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngaA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngaA04
2NRHA 4BGAA 2Q97A 2KHOA 2QM1A 4Y0WA 1HJOA 2QWMA 2V51B 4QS8A 3VGKA 3A5NC 3SK3A 4JHDB 1HKCA 1BU6O 4CZGA 4IWVA 1C0GA 3HZ6A 4BC4A 1QQNA 2ITMA 4CBUA 1SQKA 1RGIA 5AR0A 2CH5A 4BQLA 3AAQA 2ASMA 3WEEB 4BVPA 3ENHA 2PAVA 4Z94A 4IO8A 3O80A 4XH1A 2FF3B 5BREA 3LDPA 5ELZA 5BR9A 5JMVA 5AZIA 4J8FA 1NGCA 2A5XA 2D4WA 2QWLA 5FPNA 2P9LA 3EKSA 3EL2A 3ENOA 3EN9A 4I6MA 4FOEA 5AQJA 3GE1A 2P9KA 4DCHA 4XH4A 5AQRA 3EKUA 4ISFA 3VETA 2D1KA 3DJCA 2NLXA 3U4LA 3FZKA 3O1WA 1MA9B 4BRIA 3BEXA 3LDLA 2VYPA 4JHDA 2IVPA 3VF2A 2GEMA 3BF1A 1KAXA 1ATRA 3EZWA 5EXWA 1Q18A 4FWPA 4FWQA 3L0QA 1E4FT 3WEEA 2I7NA 3O8MA 3VPZA 1NBWA 4EAHD 2V7YA 3IFRA 5AFUH 4F9OA 3CQXA 3D2FB 3IMXA 5AQNA 2E1ZA 1XC3A 3MDQA 2E8AA 1YXQA 3AARA 1QQMA 4BRDA 5JLHA 5KQDA 3H1QA 4EHTA 5F2RA 4IJNA 4WQ4C 1TYQB 4FWNA 3R9PA 1BO5O 4BC3A 1JCFA 2E2NA 3OHRA 3VF4A 4LC9B 4FPBA 4XH5A 4QS7A 3KZBA 1GLBG 3CETA 4FPAA 3VEXA 3QBXA 4NO7A 3CIPA 3VERA 1ZXOA 2HF4A 3CJCA 3A5MC 3D2FA 1KAYA 4MLEA 3I33A 4B1ZA 4PKHA 3H46O 1QZ5A 2GTDA 1QHAA 2YHWA 2W40A 5AQTA 1BDGA 3VF6A 1TYQA 4BROA 3H3NO 5EY4A 1NGBA 1TUYA 4DQ8A 4H0OA 3O1BA 5JICA 5E26A 2P9IB 4JN4A 2F9WA 4BG9A 3ZX2A 3O5BA 4DB3A 5F0XA 3SMSA 4RCHA 3AY9A 3G25A 5BPNA 1NGHA 1JCGA 1NGFA 5FPDA 4MO4A 1R59O 2FSKA 4FWLA 3FE1A 2ZGYA 2QWPA 3GG4A 2YI1A 5AQKA 3DAWA 4C23A 4EHUA 3CERA 2V52B 3F9MA 3O6WA 1T6DA 1SZ2A 3M6GA 2Q2RA 5AQYA 2OANA 3KHYA 3ATVA 3VEOA 1NGDA 3HTVA 4A61A 3U9ZA 2ASPA 3A5OC 4O8KA 4WQ4A 4CZFA 2P9IA 1GLDG 4B9QA 2AA4A 1U2VB 3SMPA 4L3QA 3UKUB 1G99A 4JNEA 5AZJB 5KPRA 1ATNA 4CD1A 3H45C 3TPQA 3QICA 3MN7A 4BG8A 3ZETB 2QWNA 1S3XA 4H5RA 3O4WA 4NB4A 5JLFA 5LY3A 4FO0A 4B1UB 3O08A 5AQVA 1U6ZA 3ID8A 3SJHA 2DPNA 3I8BA 4MLHA 3QFUA 1Z05A 2FXUA 1GLEG 1U2VA 3UKUA 2V7ZA 3RSEB 4CZJA 3CI5A 4FSVA 4PL7A 4EIAA 4A2BA 3QMLA 1X9JA 3QBWA 4K42A 2ASOA 1SAZA 4H0YB 3ZX0A 4BRNA 3MN9A 2E2PA 2E2OA 5LJVA 4CBWA 3ZETA 3BP8A 1BWFO 2IVNA 3HBTA 3BUZB 1P8ZA 3CQYA 4H0TB 1DKGD 5EOYA 3GOIA 1E4GT 2F9TA 1NGJA 1K8KB 3VESA 4M63C 1XUPO 3P4IA 3FZHA 4FWKA 5AQGA 3VOVA 2HOEA 5E84A 4B1WB 5AQUA 4AM6A 1HLUA 3IDHA 3CJBA 3FZMA 3VEVA 3A8YA 2E88A 3WXKA 4IJAA 4BQZA 3RSEA 4RTFD 3ZX3A 2D0PA 5AQIA 5EVZA 2Q36A 1HPMA 1V4SA 2E1YA 3UE5A 5BPLA 3FZLA 3C0BA 2CGLA 1BA0A 4BR0A 4DHYA 5LJWA 3M3ZA 3WQUA 3MMVA 4ISEA 4BR9A 3U9DA 2ZWHA 4CZIA 2YJEA 1RFQA 4FWRA 2IVOA 5BRFA 2GELA 1ZC6A 1J6ZA 4CD3A 3LL3A 3S41A 3LM2A 3LDNA 5AQMA 2AP1A 3VEWA 3FLCO 2FSJA 3HI0A 3M1FA 4BRPA 1NGAA 4FL9A 4CZLA 1RDWX 1IG8A 1DEJA 5F1XA 4BVOA 1YVNA 2WUSA 1Y64A 4WYBA 2P9SB 4FOIA 1YUWA 4IZ9A 3FGUA 3A5LC 4BGBA 1NMDA 1S22A 1T6CA 1NGGA 1X3MA 4O5FA 3VENA 5AQXA 3MN5A 3VEZA 5BRDA 4K41A 4BR7A 3UB5A 1KXPA 4CJ7A 3ULEB 1LOTB 5AQLA 1ZBSA 2P9PB 1NWKA 1Z6RA 3U8XA 3GL1A 3HM8A 4BC5A 3MK6A 4QS9A 2P9UB 3FFKB 3JS6A 2HMPA 1YAGA 4A62A 5AFUA 2P9SA 4H5VA 1T44A 4ISGA 3DWLA 3B8AX 4WQ5A 4XEIA 1KAZA 2VCPA 3QFPA 5AQSA 1WOQA 2A6AA 4GNIA 1GLJO 1NGEA 1GLFO 3AAPA 3H6EA 3ULEA 3EO3A 2QWOA 1TUUA 5TKYA 2P9PA 2NZTA 3DXMB 5BRHA 5ADXA 4BREA 2IIRA 5AQZA 2P9UA 3JXUA 2YHYA 4EFHA 4FWSA 4HWIA 3ZEUB 4H0PA 2A40A 4BR4A 5FPEA 3IUCA 5AQHA 4BC2A 5AZJA 1IJJA 2GUPA 3MN6A 4CZMA 3CJ1A 2FSNA 1BOTO 2QXLA 1HKBA 3UKRB 3LM9A 1C0FA 1V4TA 3R6MA 2VWBA 2BUPA 4CI6A 5BN8A 3DXMA 2GWJA 1JCEA 1GLCG 2CH6A 1X3NA 2W41A 4B1VA 4KBOA 3BF3A 4FWMA 3ZEUA 3A0IX 3WXIA 3MCPA 2I7PA 4H5WA 1MWMA 2EWSA 3QB0A 1GLAG 2YJFA 5AQOA 4BR2A 5CE3A 1D4XA 2Q0RA 2QW9A 1MWKA 3QDKA 3LDOA 4BRHA 3WUHA 3KVGA 4IXCA 3UKRA 1LCUA 4H5TA 4JD2B 4WQ5C 2Q1NA 4PKGA 5EX5A 3LDQA 2E20A 2PBDA 1K8KA 3VEYA 2ZGZA 4BRGA 4H03B 5AQQA 4PL8A 3C7NB 1HUXA 2QWRA 4YDUC 2GWKA 4H0XB 1XQSC 2FF6A 4A2AA 4K43A 3TU5A 3WXLA 5I9EB 1OKJA 2HF3A 5KPTA 1NGIA 3SLCA 3GDQA 4H5NA 3DXKB 5ADXH 5FPMA 4BRKA 1HX1A 2A3ZA 4JD2A 3FZFA 3L6QA 4BRQA 4BRCA 4BRFA 4CZHA 1NM1A 4PKIA 3D2EB 1CZAN 4CZEA 5B8HA 5KPZA 3CJ9A 1WUAA 3CJ7A 3J8AA 1QQOA 2ZF5O 1ESVA 1EQYA 3C7NA 2FLOA 4FWOA 5BPMA 3W3DA 3HSCA 2CGJA 2YHXA 3R8EA 2A41A 2P9NB 4BRLA 4AM7A 3FR0A 3D7EO 4M7YA 3GBTA 1BA1A 3VGLA 2A42A 3DXKA 4MO5A 3VGMA 4BRAA 4GY2B 2YCHA 2BTFA 1BUPA 1QZ6A 4JAXA 3ATUA 2QWQA 2Q0UA 4BR5A 1H1VA 2E2QA 3D2EA 4B1YB 2Q31A 3H1VX 4HTLA 1MDUB 4B1XB 4BRMA 1GLLO 2CGKA 1HKGA 4M7XA 1NLVA 4CZKA 4RWTA 2H3GX 3CHWA 4YDUA 3H3OB 5BN9A 1ATSA 2P9NA 4H0VB 3WQTA 4K25A 2UYTA 2D0OA 5AZIB 5AQFA 4CBXA 5KQ8A 2J4RA 3WXJA 1DGKN 2P9LB 4I6MB 3WT0A 3L4IA 5AQPA 5AQWA 1BG3A 4E1JA 3W0LA 2P9KB 3CJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X6NA 2YNFA 4BGAA 2Q97A 2V51B 2YKNA 4B9SA 1VK0A 1IO2A 3ZSRA 3SUQA 3TR8A 4JHDB 2UU9K 3R3LA 3OS0A 4CBUA 2X74A 2ASMA 4Z94A 4IO8A 1RT3A 3AGKA 4XH1A 5BREA 3LWMA 5BR9A 5AZIA 4J8FA 3DLEA 1NU0A 2D4WA 3EKSA 2P9LA 3HM9A 3ENOA 4FOEA 4Z4HA 1KSPA 1WSHA 2P1JA 2VY6A 5AQJA 3SAHA 1RTJA 1W97L 1XMQK 2D1KA 3RMDA 2NLXA 2P5OA 3CFRA 3BEXA 4M3XA 3LDLA 4PY5A 2VYPA 1WSIA 1VSDA 3BF1A 4DV5K 4BWJA 3CCRN 4KHWA 1ATRA 3M8PA 4H4OA 3DLKA 4FJJA 4FWPA 4FWQA 1YT3A 3L0QA 4DQSA 3S3MA 4FJ5A 4B8AB 2LY5A 4FW2A 3WEEA 1A5WA 2F96A 4O5BA 1KVAA 3SCXA 4F9OA 3IFRA 4Q0BA 2KYQA 3CQXA 3D2FB 5AQNA 4ILJA 2E8AA 3KK1A 4UAFE 3AARA 5KQDA 4EHTA 4IJNA 1RBSA 3RWUA 1S6PA 1BO5O 4BC3A 4IOCL 2OPPA 3SBTA 4CHYA 3OYKA 5SWMA 4QS7A 3P5JA 4FPAA 3VEXA 3JSMA 3QBXA 3VERA 3NVMA 4I2PA 2HF4A 2AJQA 3A5MC 3CPEA 1KAYA 3I33A 4PKHA 3H46O 4IDHA 4CJLA 2BE2A 4BACA 4O8UA 1QSSA 1TYQA 3OVNA 4E19A 2B3CA 3O1BA 3DLGA 2G8IA 5E26A 4BECA 4JI6K 3ZX2A 1RT5A 3LPUA 2YNHA 1LWFA 5F0XA 4CF0A 1E3MA 4G9ZA 4RCHA 3AO4A 3AY9A 4GVEA 5GINA 1JCGA 1NGFA 5FPDA 3QIOA 4Z4EA 2ZGYA 3I55N 3ZSZA 2VGNA 4OJRA 2NNWA 4DTXA 1BIUA 4C23A 3NGZA 1VNBA 4JKDA 4EHUA 3CERA 4DSJA 3F9MA 3O6WA 1TKZA 3M6GA 3K5LA 5DM6L 1NMNA 2OANA 3KHYA 4A61A 3OJUA 4OLBA 4DFKA 1C6VA 2JDQD 4B9QA 2VWKA 4HVJA 1JL1A 4JNEA 5KPRA 4CD1A 4DTNA 1EWQA 5GADP 1SS6A 3TPQA 3NH2A 2DFFA 3SYZA 1S1UA 3THXA 2QWNA 4H5RA 3CCEN 5LY3A 1U47A 3TSQA 3O08A 3KD1E 4K8ZA 2IAJA 1U6ZA 3ID8A 1ZVEA 3DRPA 4LFBK 2DPNA 3I8BA 4MLHA 1XC9A 4E1MA 5LMNK 3U3GA 2KFZA 1VSJA 3CC2N 1GLEG 1U2VA 3RSEB 1TKXA 3SPYA 4CZJA 1TK0A 4PL7A 4CEAA 3AO1A 4A2BA 3QMLA 3QBWA 1C56A 4NYFA 4DSFA 3TTDA 1SV5A 3O9UA 4YOVA 3ZETA 3BP8A 3PSFA 4CFDA 1BWFO 1RT6A 3K59A 4DSEA 4YOYA 1N8RO 4KI4A 3L8BA 5EOYA 1YTAA 4JS5A 4ID5A 1ZBLA 1XUPO 4DTPA 1IKWA 3VOVA 4B1WB 3VQBA 2XY7A 1WNSA 3IDHA 4JKGB 3CJBA 2ZJQL 4AB0A 3ZYYX 1XWLA 1WAFA 1BGXT 3Q7BA 3PIPL 2LSNA 2KJAA 3QEVA 3FZLA 3C0BA 3L3UA 1BI4B 5C2FA 1Q81O 4NXNK 2KBJA 1OVYA 4DU3A 4CK1A 3MMVA 4ISEA 3ZSWA 4B9UA 1XI1A 3KHWA 3OBYA 1B92A 2YHBA 3PX6A 3D6RA 1NK0A 2HBKA 5CY4A 4CJ4A 4FWRA 4NLBA 4KHPK 2UXCK 5AQMA 4IFVA 4AHVA 1FH3A 5GAEP 2WONA 5C15A 2OTJN 1YJ9N 2C1GA 1JLAA 4FL9A 3KK2A 1IG8A 1DEJA 4BVOA 2WUSA 1QQCA 1D9FA 2P9SB 3SUPA 5HRPA 4X66K 3LZIA 3FGUA 1X9WA 4BGBA 1NMDA 3M8QA 1SNBA 4W5QA 3DRRA 1NGGA 4YOXA 4DTRA 1SKWA 4DR2K 2SN3A 3HP9A 3AA4A 3HRGA 3MEGA 5JENA 4BR7A 3V81A 4M3YA 3KTQA 2ETJA 3V9XA 2EX3A 4MDAA 3AVFA 2P9PB 4GV3A 1JKZA 4OKJA 2ZJRL 3V9UA 2OPSA 2NRZA 2B4JA 1KVCA 3C6UA 3L2QA 1GPSA 2DFHA 4JKEA 2ZM6K 4B9TA 2UXDK 2ZE2A 2GBZA 3DWLA 4O0IA 1FK9A 1ASWA 3QFPA 1AYJA 2JWKA 2NRXA 1KQSM 3QEXA 2VWJA 1X1PA 1LW0A 1NKBA 4E7KA 2FBVA 3DLLL 3CPWM 3ZLJA 1JZAA 1N36K 4N41A 5BRHA 1WT7A 2YHYA 1U45A 4FWSA 3THWA 2HHSA 4H0PA 4DR6K 2N2RA 1BCMA 3NHGA 4M3ZA 2XY5A 3IUCA 4KH5A 2GUPA 3CJ1A 2GMOA 4PUOA 4DLGA 1WBBA 1TV6A 1SN1A 4CFAA 4G1QA 4DLEA 3UKRB 1C1BA 3F73A 2HHVA 3VN5A 2BUPA 3R2VA 1LWCA 1B7DA 1NRAA 3EYZA 2CH6A 4ICLA 1X3NA 4KB1A 4M45A 3KKRA 3QESA 1SEGA 4KTZA 4I9LA 2KGQA 1Q82O 4E7IA 1D4XA 2Q0RA 3B6OA 2B5JA 1R0AA 3CMEN 3OYBA 3QDKA 3SQ2A 4CJ3A 3CC4N 1KC8O 3P83D 1LCUA 5M1NA 2G8WA 1K8KA 4XJXA 2ZGZA 2QI2A 4H03B 5AQQA 3OS1A 1J5OA 2Z1HA 1HUXA 3AVGA 4Q5VA 1KTQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2X6N A;  2YNF A;  4BGA A;  2Q97 A;  2V51 B;  2YKN A;  4B9S A;  1VK0 A;  1IO2 A;  3ZSR A;  3SUQ A;  3TR8 A;  4JHD B;  2UU9 K;  3R3L A;  3OS0 A;  4CBU A;  2X74 A;  2ASM A;  4Z94 A;  4IO8 A;  1RT3 A;  3AGK A;  4XH1 A;  5BRE A;  3LWM A;  5BR9 A;  5AZI A;  4J8F A;  3DLE A;  1NU0 A;  2D4W A;  3EKS A;  2P9L A;  3HM9 A;  3ENO A;  4FOE A;  4Z4H A;  1KSP A;  1WSH A;  2P1J A;  2VY6 A;  5AQJ A;  3SAH A;  1RTJ A;  1W97 L;  1XMQ K;  2D1K A;  3RMD A;  2NLX A;  2P5O A;  3CFR A;  3BEX A;  4M3X A;  3LDL A;  4PY5 A;  2VYP A;  1WSI A;  1VSD A;  3BF1 A;  4DV5 K;  4BWJ A;  3CCR N;  4KHW A;  1ATR A;  3M8P A;  4H4O A;  3DLK A;  4FJJ A;  4FWP A;  4FWQ A;  1YT3 A;  3L0Q A;  4DQS A;  3S3M A;  4FJ5 A;  4B8A B;  2LY5 A;  4FW2 A;  3WEE A;  1A5W A;  2F96 A;  4O5B A;  1KVA A;  3SCX A;  4F9O A;  3IFR A;  4Q0B A;  2KYQ A;  3CQX A;  3D2F B;  5AQN A;  4ILJ A;  2E8A A;  3KK1 A;  4UAF E;  3AAR A;  5KQD A;  4EHT A;  4IJN A;  1RBS A;  3RWU A;  1S6P A;  1BO5 O;  4BC3 A;  4IOC L;  2OPP A;  3SBT A;  4CHY A;  3OYK A;  5SWM A;  4QS7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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