1NGA | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINSPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus	120
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngaA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngaA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngaA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngaA04

5AQGA 5ADXA 2VCPA 1BUPA 4EHTA 4A2AA 1HPMA 3MMVA 1SQKA 3VETA 3O8MA 2P9PA 4AM7A 1SZ2A 3U9ZA 4FWQA 3A5NC 3FFKB 1XQSC 3R8EA 1U2VA 3TU5A 3VEXA 4BC4A 1R59O 2CGJA 3H1VX 2QW9A 4AM6A 4B1WB 1KAYA 5EY4A 3QB0A 4MO5A 2PAVA 1NGBA 3QFUA 3HI0A 1T6CA 4FWKA 4H5NA 3H3NO 5AFUH 2NLXA 3VPZA 4BRPA 4CZHA 4F9OA 4BVOA 1KAZA 3LDQA 1BDGA 5KQ8A 3U8XA 4FWPA 2IVNA 4CD1A 4HWIA 4DQ8A 3VEZA 4M63C 1P8ZA 4BGBA 1MA9B 2E20A 5F2RA 3D2EA 2YHXA 3UE5A 5BPMA 1TUYA 3VEOA 1NWKA 1S22A 3CJ9A 1QZ6A 1WUAA 4FSVA 4B9QA 5LJVA 2HF3A 4J8FA 1QHAA 3AARA 4JHDB 1Z6RA 3RSEB 3BP8A 1RGIA 4KBOA 5AQTA 4CBWA 4RTFD 4ISEA 3DWLA 3ENOA 3VGMA 5FPDA 2E2OA 4A61A 4FL9A 1BA1A 4B1YB 4K42A 2Q0UA 2P9IB 3QDKA 2YJFA 5AQLA 2FF3B 4CBXA 4H5TA 2A41A 4I6MB 4CZFA 4CZJA 3M1FA 2V51B 3A5MC 1NMDA 1S3XA 5ADXH 1HKBA 3ZETA 3L4IA 4WQ5C 1TYQB 4BG8A 5FPNA 2GUPA 4CI6A 1K8KA 2P9KA 4L3QA 3MCPA 3BEXA 4EAHD 2FLOA 2OANA 4CZKA 3L6QA 4ISGA 3UKUB 3SLCA 5AQWA 2P9NA 3JS6A 2FXUA 3O08A 2W41A 3D2FA 4IO8A 4GNIA 5KPRA 5AQMA 4BVPA 2KHOA 4DB3A 4CZLA 5AR0A 2QWRA 1HJOA 1HLUA 4BRLA 2P9UA 4BREA 2Q97A 4BR2A 1JCGA 2FSNA 4NO7A 2YJEA 2Q1NA 3QBWA 2W40A 3WXJA 1ATSA 1X9JA 4EFHA 5EXWA 5BN8A 3ZX0A 4H0OA 4DCHA 2E8AA 3MN5A 1MWMA 3ZEUA 2QWLA 2NZTA 4FWLA 3VESA 3W3DA 3DAWA 4JD2A 1BO5O 3WQTA 3UKRB 3H3OB 3QBXA 4Z94A 3CHWA 2ZWHA 4BRAA 3CJBA 3WUHA 3VGKA 5AQJA 1HKCA 1QQOA 1GLCG 5AQFA 3FLCO 4BRKA 5AQNA 2GELA 3ULEB 3VEWA 2BUPA 3M3ZA 4CZEA 3G25A 4BRMA 5AZJA 3AAPA 5KQDA 1QQMA 2IIRA 3QMLA 1KAXA 4ISFA 1C0GA 1ATNA 3AY9A 4BC5A 2IVOA 2ZGZA 3EKSA 5JMVA 4EHUA 3QFPA 3H45C 3R6MA 5AQPA 2BTFA 1GLFO 3LM2A 4CZIA 3WQUA 1DKGD 2A42A 2QWOA 2CH5A 5BPLA 5AZIA 4C23A 3CI5A 4PL8A 4JN4A 5BRFA 3L0QA 1NGAA 1CZAN 1NGIA 2GTDA 4H5RA 4A2BA 5EVZA 4BR7A 5BR9A 1J6ZA 1QQNA 3TPQA 3BUZB 1JCEA 2ZF5O 1ESVA 3BF3A 1IJJA 3WT0A 1K8KB 3B8AX 4CD3A 3HBTA 1NGFA 4XH5A 4BRFA 2CGKA 2HF4A 3A5OC 3CJ1A 4IWVA 1YUWA 3O6WA 2QM1A 1ZBSA 3U4LA 5AQIA 3HTVA 2P9SA 2A5XA 1RFQA 4JAXA 5LJWA 2E1ZA 4BRHA 3D2FB 3FZKA 3H6EA 3WEEA 1T6DA 3VEYA 5AQKA 3DXMA 3W0LA 5KPTA 2D4WA 4CJ7A 3LDLA 1HKGA 2WUSA 4BR0A 4FWOA 3MN7A 4MO4A 2AA4A 4BR9A 1U6ZA 2QWQA 5E84A 4H0PA 3CQXA 2P9LB 1NGHA 5EOYA 2ITMA 4BQZA 2YHYA 3CERA 2QWPA 3SMSA 2IVPA 1NGGA 4FWRA 4BQLA 4BRCA 1QZ5A 3C7NB 2ZGYA 4JNEA 2ASOA 1GLAG 3FZHA 1X3MA 2Q31A 3HM8A 4XEIA 1NGJA 3ATUA 4CZGA 1KXPA 5JLFA 3SMPA 3BF1A 3GOIA 4FWMA 4H03B 4WQ4A 4B1ZA 2P9PB 1SAZA 5BRDA 1U2VB 4QS8A 3EZWA 1DEJA 3IFRA 2E1YA 2QWMA 5FPMA 1X3NA 1G99A 4BRNA 3SK3A 4H5VA 1MDUB 4K25A 3FR0A 5EX5A 3GE1A 4JHDA 4FOEA 3EKUA 4QS9A 2ASMA 3ID8A 2V52B 3CIPA 1NGCA 2GWKA 2QXLA 5AQUA 2E88A 5AQZA 3VERA 1V4SA 1NM1A 5KPZA 5BPNA 3JXUA 1NLVA 3EN9A 4BR4A 1XUPO 2FSKA 3D2EB 5AQRA 3A8YA 2GEMA 1GLLO 4XH4A 4FOIA 3P4IA 1HUXA 3MK6A 4H0TB 2P9IA 3I33A 2J4RA 4A62A 4E1JA 3LDPA 1EQYA 3CETA 1LOTB 4CZMA 5F0XA 2F9TA 4I6MA 3GL1A 3A5LC 5AQQA 3HSCA 2E2QA 4B1XB 3GG4A 3ATVA 5AQHA 2VWBA 3H1QA 4K41A 1DGKN 3CJ7A 3CQYA 3LDOA 3LDNA 3KHYA 1TYQA 2E2PA 3I8BA 4LC9B 1V4TA 3O5BA 2QWNA 4CBUA 3O1WA 3IMXA 3AAQA 5JLHA 1T44A 4IJNA 3C0BA 2FSJA 1YVNA 1YXQA 3UKUA 4GY2B 4PKIA 4XH1A 3HZ6A 4EIAA 2Q2RA 3UB5A 5BREA 4BRIA 5FPEA 1Z05A 3ZETB 3DXKA 3A0IX 2I7PA 3LL3A 5BRHA 1C0FA 2I7NA 2P9KB 4K43A 1HX1A 1MWKA 4PKHA 2E2NA 2CH6A 3CJCA 3UKRA 3SJHA 2P9NB 5AQOA 4RWTA 2ASPA 4B1UB 2DPNA 3EL2A 3MN9A 2V7YA 3QICA 3KVGA 4HTLA 2FF6A 2D0OA 3R9PA 2P9UB 3O80A 1NGEA 5F1XA 4BRGA 3ULEA 1GLEG 2D0PA 1ZXOA 3J8AA 3O1BA 1GLJO 5B8HA 3M6GA 3VENA 3ZEUB 4BC3A 4YDUC 4BR5A 4NB4A 4JD2B 1RDWX 2GWJA 4FPAA 3ZX3A 4YDUA 3CJAA 2V7ZA 4FO0A 1WOQA 4BRQA 4O8KA 2D1KA 3WXIA 3IDHA 4FWSA 1XC3A 4BRDA 4IJAA 5JICA 3KZBA 2YHWA 2AP1A 1GLBG 4IXCA 4Y0WA 5AQVA 3VF4A 1Y64A 4O5FA 4BG9A 4WQ4C 1BOTO 3EO3A 5AZJB 5AFUA 4BROA 3WXKA 4PL7A 4B1VA 2UYTA 3ZX2A 5AQYA 2YCHA 2VYPA 5LY3A 3S41A 3WXLA 4MLEA 2CGLA 3FZMA 4PKGA 4WQ5A 4FPBA 1BU6O 2A3ZA 3D7EO 1E4FT 3RSEA 1JCFA 1BG3A 5AQXA 5AZIB 1LCUA 1NBWA 3FE1A 5BN9A 2Q36A 2A40A 3FGUA 3U9DA 3VF6A 4BGAA 3DJCA 4H0XB 1Q18A 2Q0RA 3VGLA 4M7XA 2A6AA 3DXKB 1YAGA 4H0VB 4DHYA 1E4GT 4RCHA 3OHRA 4M7YA 3MN6A 1BWFO 4BC2A 1NGDA 3F9MA 3GDQA 5ELZA 2HMPA 3VF2A 4H5WA 3VEVA 4QS7A 3FZFA 1GLDG 3FZLA 2HOEA 3O4WA 5I9EB 3ENHA 4H0YB 4FWNA 2F9WA 2P9LA 2P9SB 2EWSA 1D4XA 5E26A 1BA0A 1ATRA 1OKJA 1IG8A 3H46O 5TKYA 3WEEB 3C7NA 3VOVA 1ZC6A 2NRHA 3DXMB 4WYBA 4IZ9A 2PBDA 1H1VA 1TUUA 2YI1A 3LM9A 5CE3A 5AQSA 3MDQA 4MLHA 3IUCA 3GBTA 2H3GX
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3C95A 2ZJQL 3HOSA 3OYLA 1SL0A 4DU1A 1SZ2A 4JKDA 4BROA 3R8EA 3TU5A 4NXNK 1LW2A 1U2VA 3O3FA 3VQ8A 5EY4A 2GUIA 2PAVA 3QFUA 1RILA 3HI0A 1T6CA 4FWKA 4CJWA 4F9OA 4CD1A 3Q7CA 3BZCA 4HWIA 1C0UA 4E7HA 4B3SK 4M63C 3IG1A 4HTUA 3VQQA 1MA9B 1WN7A 1CN2A 3KD5E 3NHGA 3E01A 2KZMA 5HOOA 1SEGA 2YHXA 4DG1A 3KWGA 3UE5A 3OYEA 3VEOA 4RW9A 3CJ9A 2N66A 1OH8A 4FSVA 2HF3A 1DQ7A 1NRAA 4JHDB 1Z6RA 5D3GA 3P31A 2GX9A 3O3GA 2F96A 4RTFD 3OYHA 2W6LA 3DWLA 2W00A 2HNDA 3TR8A 1HNZK 3ENOA 5FPDA 2LR3A 4A61A 4FL9A 3PSIA 1PX9A 1BA1A 4KHPK 1TAUA 2JWLA 4BE7B 2P9IB 1P0AA 5AQLA 4CJ3A 1XRSB 1D9FA 4A5AA 3SJJA 3A5MC 4O4GA 1EWQA 4X62K 1QTMA 1HKBA 3AVFA 3BY5A 3I8DA 4DTNA 4BG8A 3MXIA 1K8KA 2IDOA 1RDAA 3MCPA 4QOZB 1UGLA 1TKZA 2B6AA 3BEXA 2UUBK 4J2EA 2FLOA 4CZKA 5CY4A 2F7TA 4GW6A 4AH9A 2PFUA 3JS6A 2ZM6K 1Q7YO 5M1FA 2W41A 3D2FA 3KJVA 4ELUA 2G2KA 4DB3A 4FVMA 2Z1GA 5KRTA 3ZSXA 1HJOA 4QCLA 2SN3A 2Q97A 2Q1NA 4MDAA 2W40A 1ATSA 2KLAA 4EFHA 5BN8A 4H0OA 1KV0A 4CIGA 4FYDA 2LN8A 4DKWA 2QWLA 2NZTA 3JYTA 2O4IA 3DAWA 2XY8A 1JZBA 1BO5O 3WQTA 3UKRB 1NMNA 1MYNA 2YIOA 2UXCK 2KFNA 4JS5A 3DI6A 2Y1JA 4OLBA 1S9GA 1VHXA 5I3UA 1QVFM 5AQFA 1N34K 1KQSM 1KFDA 2BUPA 1U4BA 1UAXA 1NK6A 4GV3A 1Q9XA 1BIZA 5SWMA 4CERA 2DTUA 2A1SA 3AVNA 4EHUA 3E9OA 3TAMA 4Z0UA 1VRTA 4YY3K 1ASUA 4ID5A 1EX4A 3WQUA 2A42A 4Y1CA 3TAGA 4OLAA 5CZ2A 4HUFA 2PYLA 4M3TA 3KK2A 1OMYA 1B3CA 3HL8A 5EVZA 4EZ6A 1FK9A 4BR7A 2HBMA 4CIFA 1J6ZA 1QQNA 4CJUA 2X6NA 4KB1A 1RT2A 5J2QA 1TAQA 1K8KB 3BZKA 5DM6L 1T05A 1LAVA 1YTAA 1L3TA 4CJSA 4G1QA 1YUWA 3R2VA 1ZBSA 3ZSQA 4OPJA 3L2UA 3RR7A 5M1PA 3L8BA 4DF4A 4DMNA 3CCSN 4BRHA 3VTIA 3D2FB 1KLNA 3K5MA 3OA9A 3WEEA 3L2VA 3VQ4A 1PE4A 5KPTA 5J2MA 3LZIA 4CHPA 3G0ZA 2D4WA 2I61A 1T7AA 2YKNA 4FWOA 3MN7A 1SUQA 2AA4A 4PA1A 4BR9A 1C0MA 1U6ZA 2QWQA 4CJ5A 4FK4A 4H0PA 1J53A 3CERA 1W97L 5KK4A 3SMSA 2IVPA 4LF7K 4DLEA 1QE1A 4BQLA 2ITGA 3GKUA 4JRQA 2ZGYA 1GLAG 4M3ZA 3FZHA 3DLLL 1WWNA 2MN5A 1I3AA 1LWEA 3SMPA 3GOIA 1M1KO 2OYQA 3ZT2A 3KLEA 5BRDA 3EZWA 2EX3A 1RDUA 1ZVGA 4KFBA 4AILC 1NKCA 2QWMA 3H08A 3SK3A 4H5VA 5GIPA 4I7FA 1IKYA 5J2PA 1T8EA 3GE1A 4QS9A 2ASMA 1IG9A 2HHIA 4CGJA 4UAEF 3CIPA 1NGCA 1BCMA 1RT5A 3EY1A 4FJ8A 5AQZA 1K6YA 2E88A 3VERA 1LWFA 5GINA 1V4SA 3OS2A 3RR8A 1W7AA 2FSKA 3D2EB 5AQRA 3NDKA 4OO1J 1GLLO 1XHXA 4XH4A 4B3RK 4BECA 3U3GA 1JL1A 3I33A 4E1JA 3LDPA 3NH0A 1EQYA 3CETA 4GV9A 5F0XA 1J54A 3A5LC 1S1VA 1YI2N 3UIQA 2GL1A 4JK9A 2BANA 3Q7BA 3ATVA 5C25A 4LF6K 4W5QA 3CJ7A 4JKGB 1HYVA 4KV8A 3I8BA 3HM9A 1YIJN 3O5BA 4B8CA 4DR5K 1S1WA 2HSTA 5KGWA 4IJNA 2RN2A 4YFUA 3T1YK 2QTDA 1N32K 1YXQA 3UKUA 4KPYA 4XH1A 5GADP 4M42A 3ZSVA 4EIAA 3NGIA 1ZBHA 3ZETB 3A0IX 3LP3A 4DV4K 4H4MA 3QEPA 3KD1E 3HVTA 4B9UA 2D0AA 3KK1A 3QLHA 4CHQA 4KHSA 1WBBA 3DRSA 4PQUA 4PKHA 4DV6K 2OCEA 1B9DA 5M1QA 3RMDA 3MN9A 2V7YA 3I55N 3U3YA 4Q5VA 2KYQA 2D0OA 3THYB 3R9PA 3NH2A 4BRGA 1GLEG 2YIPA 2Y1IA 3QEWA 1N36K 3PUFA 2E3GA 1NJYA 2A7TA 4YDUC 4BR5A 4NYNA 1A5WA 2KBJA 3DOKA 4NB4A 3AVIA 5IT9O 2G8VA 3CJAA 3KP0A 1DLOA 2D1KA 3WXIA 3IDHA 2NRVA 3QEXA 1L3VA 5JICA 3KLFA 1C1BA 3VF4A 2O8DB 4KRFA 4WQ4C 4CVNE 3AO2A 5AZJB 3HK2A 1NH5A 4DR6K 3ZX2A 2VYPA 2MZ0A 4CE9A 2OTJN 4IFVA 1ASVA 4MLEA 3DLBA 2KPYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3AAP A;  5KQD A;  1QQM A;  2IIR A;  3QML A;  1KAX A;  4ISF A;  1C0G A;  1ATN A;  3AY9 A;  4BC5 A;  2IVO A;  2ZGZ A;  3EKS A;  5JMV A;  4EHU A;  3QFP A;  3H45 C;  3R6M A;  5AQP A;  2BTF A;  1GLF O;  3LM2 A;  4CZI A;  3WQU A;  1DKG D;  2A42 A;  2QWO A;  2CH5 A;  5BPL A;  5AZI A;  4C23 A;  3CI5 A;  4PL8 A;  4JN4 A;  5BRF A;  3L0Q A;  1NGA A;  1CZA N;  1NGI A;  2GTD A;  4H5R A;  4A2B A;  5EVZ A;  4BR7 A;  5BR9 A;  1J6Z A;  1QQN A;  3TPQ A;  3BUZ B;  1JCE A;  2ZF5 O;  1ESV A;  3BF3 A;  1IJJ A;  3WT0 A;  1K8K B;  3B8A X;  4CD3 A;  3HBT A;  1NGF A;  4XH5 A;  4BRF A;  2CGK A;  2HF4 A;  3A5O C;  3CJ1 A;  4IWV A;  1YUW A;  3O6W A;  2QM1 A;  1ZBS A;  3U4L A;  5AQI A;  3HTV A;  2P9S A;  2A5X A;  1RFQ A;  4JAX A;  5LJW A;  2E1Z A;  4BRH A;  3D2F B;  3FZK A;  3H6E A;  3WEE A;  1T6D A;  3VEY A;  5AQK A;  3DXM A;  3W0L A;  5KPT A;  2D4W A;  4CJ7 A;  3LDL A;  1HKG A;  2WUS A;  4BR0 A;  4FWO A;  3MN7 A;  4MO4 A;  2AA4 A;  4BR9 A;  1U6Z A;  2QWQ A;  5E84 A;  4H0P A;  3CQX A;  2P9L B;  1NGH A;  5EOY A;  2ITM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3C95 A;  2ZJQ L;  3HOS A;  3OYL A;  1SL0 A;  4DU1 A;  1SZ2 A;  4JKD A;  4BRO A;  3R8E A;  3TU5 A;  4NXN K;  1LW2 A;  1U2V A;  3O3F A;  3VQ8 A;  5EY4 A;  2GUI A;  2PAV A;  3QFU A;  1RIL A;  3HI0 A;  1T6C A;  4FWK A;  4CJW A;  4F9O A;  4CD1 A;  3Q7C A;  3BZC A;  4HWI A;  1C0U A;  4E7H A;  4B3S K;  4M63 C;  3IG1 A;  4HTU A;  3VQQ A;  1MA9 B;  1WN7 A;  1CN2 A;  3KD5 E;  3NHG A;  3E01 A;  2KZM A;  5HOO A;  1SEG A;  2YHX A;  4DG1 A;  3KWG A;  3UE5 A;  3OYE A;  3VEO A;  4RW9 A;  3CJ9 A;  2N66 A;  1OH8 A;  4FSV A;  2HF3 A;  1DQ7 A;  1NRA A;  4JHD B;  1Z6R A;  5D3G A;  3P31 A;  2GX9 A;  3O3G A;  2F96 A;  4RTF D;  3OYH A;  2W6L A;  3DWL A;  2W00 A;  2HND A;  3TR8 A;  1HNZ K;  3ENO A;  5FPD A;  2LR3 A;  4A61 A;  4FL9 A;  3PSI A;  1PX9 A;  1BA1 A;  4KHP K;  1TAU A;  2JWL A;  4BE7 B;  2P9I B;  1P0A A;  5AQL A;  4CJ3 A;  1XRS B;  1D9F A;  4A5A A;  3SJJ A;  3A5M C;  4O4G A;  1EWQ A;  4X62 K;  1QTM A;  1HKB A;  3AVF A;  3BY5 A;  3I8D A;  4DTN A;  4BG8 A;  3MXI A;  1K8K A;  2IDO A;  1RDA A;  3MCP A;  4QOZ B; 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1NGAA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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