5AQLA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLWSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqlA04
4A2AA 4BVOA 3M6GA 4CZFA 1BOTO 3VGLA 1Z05A 3WXKA 4K43A 3A5MC 3VEZA 4M7XA 3ULEB 4CZIA 2J4RA 1HX1A 3C7NA 2A40A 4CD1A 3LDPA 3VF4A 3VEXA 4CZLA 2QWQA 4WQ5C 5TKYA 1QQNA 4B1UB 1DEJA 1E4FT 3H6EA 2FSNA 1YUWA 2AP1A 4ISFA 3SMPA 2E1ZA 2FF3B 2FSKA 3ATUA 3U4LA 4CI6A 3BEXA 4CZJA 2F9WA 2YCHA 3IFRA 1H1VA 3A0IX 5F0XA 4JHDB 4CBWA 3TPQA 3D7EO 3ZX0A 5AZJA 4JD2A 3M3ZA 5AQLA 1IJJA 2HOEA 4BC2A 4JN4A 4BR0A 4FOIA 2VWBA 2QWRA 2Q0RA 3HI0A 3ZX3A 1V4TA 5AQOA 2BTFA 3CJCA 2YHXA 2Q0UA 3UKRA 1HLUA 1CZAN 2D0OA 4BRIA 3WEEB 2ASPA 3QBXA 2FF6A 4O8KA 3J8AA 1HUXA 1ZXOA 3JS6A 3CI5A 2E88A 4C23A 3C7NB 1QHAA 3QDKA 1BUPA 3RSEB 3VF6A 3MN5A 2DPNA 2EWSA 1R59O 4Y0WA 2YI1A 2W41A 4H5VA 5JLHA 3H46O 3ATVA 4BRDA 1BO5O 4EIAA 2I7PA 3WQTA 3FZHA 1QQOA 3A5OC 1NGFA 4FWNA 4B1WB 4M63C 1MWKA 3I33A 3QMLA 4A61A 5AQIA 4BQLA 1E4GT 2HF4A 2CH5A 2W40A 3HSCA 1U2VB 4FOEA 4H0YB 4BC5A 2CGJA 4RTFD 4FL9A 5BPNA 1X3NA 3A5LC 4BRQA 2KHOA 2Q31A 3HZ6A 2Q1NA 1X9JA 1IG8A 3LM9A 4PKHA 4BR9A 5AQRA 3MDQA 4H0OA 3O08A 3EO3A 3SLCA 3HTVA 2CH6A 1YVNA 5AQUA 4BRMA 3MMVA 5AQSA 3JXUA 2A41A 4GY2B 3S41A 2Q2RA 4M7YA 4H0PA 4B9QA 4BROA 1NGAA 4FWKA 2E2NA 3VEVA 4K42A 3DJCA 4QS9A 5BPLA 4EAHD 5AQYA 1JCFA 3A5NC 3UKUB 4BR5A 3R6MA 4BG8A 2A6AA 1QZ6A 2WUSA 4JHDA 1XQSC 4ISEA 4K41A 4PKIA 1WUAA 3IMXA 3MN9A 5FPDA 1LCUA 4MO4A 5BN9A 2FLOA 3LL3A 3B8AX 2V7ZA 2ASMA 3MK6A 3I8BA 5AQFA 3EN9A 1NGBA 1GLDG 3WEEA 5F2RA 2E2PA 3GOIA 4FSVA 2PBDA 4IO8A 3VEYA 1HJOA 3CQXA 1BDGA 3EZWA 4H5TA 4WQ4C 2E1YA 5EVZA 3RSEA 1LOTB 3W0LA 4KBOA 4BG9A 2P9KA 4A62A 2IVOA 4CZKA 3BF1A 1BU6O 2QW9A 3GBTA 2QWNA 4BR7A 3AY9A 3SK3A 4BC4A 2BUPA 3CJ9A 1KAZA 1GLBG 1NGCA 3BP8A 4CJ7A 3FGUA 1U2VA 5BREA 5AQKA 2CGLA 2QXLA 2E2OA 3EL2A 4FWLA 5BN8A 5LY3A 3QFPA 1ESVA 5KPRA 1HKGA 5KPTA 4BQZA 2CGKA 1ATNA 1T6DA 2E8AA 3AARA 3UE5A 3DAWA 4I6MB 3VGMA 5JMVA 2ASOA 4BVPA 1JCGA 1GLLO 4CZGA 5AQMA 1GLFO 1NMDA 1C0FA 2IIRA 2V7YA 4CD3A 4XH1A 1KXPA 2P9IA 5CE3A 5AQVA 2FXUA 3GL1A 4H5NA 1HKCA 2P9KB 4FWOA 3UKUA 3ZX2A 4HTLA 2VCPA 3QFUA 2P9UB 3ID8A 1ZC6A 1T6CA 3VESA 1T44A 3WXIA 3ENOA 1ATSA 2QWMA 2ZWHA 3ENHA 4WQ4A 4B1VA 4CZMA 2V52B 3CJ7A 1P8ZA 5AQHA 2I7NA 4FWSA 5I9EB 3O5BA 4AM7A 4EHUA 1OKJA 3CERA 4BGAA 3FZKA 3O6WA 1BG3A 1NGEA 4HWIA 3O4WA 3O1BA 4MO5A 2UYTA 3FE1A 1J6ZA 3A8YA 3LDLA 4ISGA 3P4IA 3WUHA 4L3QA 1NGHA 2YHYA 4K25A 4DB3A 1WOQA 1GLAG 3H45C 4BRAA 1GLJO 1XUPO 3R8EA 5AQQA 2GELA 2V51B 2P9IB 1GLCG 4H5RA 2Q36A 3QICA 1U6ZA 4H0VB 4BRGA 3DXMB 5FPMA 5KQDA 1YAGA 2A5XA 1QZ5A 1V4SA 2VYPA 2QWLA 1RFQA 3C0BA 1KAYA 1G99A 1TUYA 2YHWA 3F9MA 1S3XA 3MN6A 3ZEUA 2ZGYA 3L0QA 5AFUA 1BA0A 1NLVA 2IVNA 4IJAA 4O5FA 5BR9A 1Y64A 4IZ9A 3H3OB 2GTDA 3QB0A 3D2EB 2OANA 2H3GX 2NLXA 3CQYA 2P9NB 3O8MA 2YJEA 1X3MA 4I6MA 3KVGA 2NZTA 5BRHA 3FFKB 3EKUA 3D2FB 5AQGA 4FWMA 1MDUB 1EQYA 4XH4A 5AZIB 3VGKA 2HF3A 1DGKN 3VETA 2GWJA 2AA4A 5E84A 5FPNA 5ELZA 4GNIA 5EX5A 4PKGA 2GEMA 2P9UA 1TYQB 3QBWA 4XH5A 3VOVA 5JICA 4H03B 4DQ8A 3FZFA 3CJBA 4DHYA 5KPZA 5KQ8A 5EY4A 4BRLA 5JLFA 2QWPA 1RGIA 3VF2A 3WXJA 4B1ZA 1C0GA 4XEIA 1Q18A 5AFUH 1BA1A 4CZHA 3ZEUB 2HMPA 3VENA 4F9OA 5LJVA 4PL8A 3H1QA 5B8HA 5AQNA 3FZMA 3TU5A 4BRHA 4B1YB 3G25A 5ADXA 3GE1A 4CZEA 4IJNA 2A3ZA 1KAXA 1RDWX 3LDNA 3CETA 1HKBA 4FWQA 3ZETB 4BC3A 5AQWA 5EXWA 4YDUA 4J8FA 4FWPA 3R9PA 1MA9B 1GLEG 2GWKA 2P9PB 1HPMA 4BRPA 2E2QA 5E26A 1QQMA 5AQXA 3DWLA 4MLHA 3IUCA 5AQTA 3H1VX 1S22A 3FZLA 1Z6RA 3DXMA 2A42A 3FLCO 4FPBA 1K8KB 4EFHA 4WYBA 3VPZA 2P9SA 3AAQA 2NRHA 4IWVA 4LC9B 1JCEA 4AM6A 2ITMA 4E1JA 3WQUA 1ZBSA 1YXQA 3WT0A 2F9TA 3W3DA 3CHWA 2P9LA 3BUZB 3M1FA 4MLEA 3GDQA 1BWFO 4Z94A 3D2EA 3VEOA 2IVPA 3HM8A 2E20A 2P9NA 4RCHA 2D1KA 3VERA 4BREA 4BRFA 1NM1A 3OHRA 1DKGD 3WXLA 3O80A 5ADXH 4QS7A 3MCPA 1ATRA 3D2FA 4BRNA 5AQPA 3LDOA 5AZIA 4JAXA 4WQ5A 4CBUA 3UB5A 5AQZA 4NB4A 3VEWA 3EKSA 3L6QA 2YJFA 3DXKA 3KZBA 1TYQA 5AZJB 4JD2B 5EOYA 3MN7A 1NGGA 2Q97A 5FPEA 2QWOA 2FSJA 3SMSA 4BGBA 4H0XB 4BR2A 3O1WA 1NGIA 4JNEA 2ZF5O 3L4IA 3GG4A 3H3NO 5BRDA 5AQJA 1SAZA 3ULEA 2P9SB 1TUUA 3LDQA 3UKRB 3BF3A 2PAVA 5AR0A 1D4XA 4BR4A 4BRCA 4RWTA 3FR0A 1NGDA 2GUPA 2P9LB 4NO7A 4YDUC 3U8XA 5BRFA 1SZ2A 3CIPA 3LM2A 4IXCA 3CJ1A 3KHYA 2QM1A 4CBXA 5F1XA 1NGJA 1SQKA 3ZETA 3IDHA 4QS8A 4FPAA 4FWRA 4BRKA 2D4WA 3CJAA 2P9PA 3U9DA 1MWMA 3U9ZA 1NBWA 1NWKA 4DCHA 4EHTA 4H0TB 1XC3A 5LJWA 4FO0A 3HBTA 4H5WA 2D0PA 5BPMA 4PL7A 1K8KA 3DXKB 3SJHA 4A2BA 3AAPA 4B1XB 2ZGZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SAGA 4BVOA 3PSIA 1VQ8N 3M5RA 4K43A 1D9DA 3A5MC 3VEZA 1TAUA 4R79A 4FK4A 2J4RA 1RILA 3DRSA 3BZKA 4WQ5C 3H6EA 3CC7N 3E9PA 2AP1A 4CHNA 1YIJN 2E3GA 3SMPA 2FF3B 1UA0A 4J2AA 4CZJA 2NRZA 3IFRA 2HHWA 3SUNA 2ATQA 1D8YA 4KHUA 3HJFA 2WONA 3D7EO 3ZX0A 2LY6A 2YBRC 1UA1A 4GV9A 2KFNA 2OTJN 4FOIA 2HSTA 5CY4A 4CEQA 4V19S 3C6HA 1SKRA 2VY6A 4RW6A 2YHXA 1RDCA 3UKRA 3VQDA 1CZAN 2O8EB 2P1JA 3G0ZA 3QBXA 4YOVA 3OYKA 2Z1JA 1HUXA 1VSDA 3JS6A 3VF6A 3KC6A 1L4VA 1J5OA 2DPNA 1R59O 3ALYA 4Y0WA 1FKPA 2HBMA 4BDYA 2W41A 4BRDA 4L8RB 2I7PA 3FZHA 3SI6A 2GMOA 3A5OC 3SQ4A 3ITHA 3K9KA 4B1WB 2PZSA 3QMLA 1VQON 1U2VB 4H0YB 3V9XA 3LP2A 3RMAA 4BRQA 1OVQA 3PSMA 4CEEA 4U67L 4O44A 1TAQA 4B3SK 3OTOK 5AQRA 4H0OA 3O08A 2D5RA 4JEPA 1T7BA 4CGHA 3IAYA 1BGXT 1RT4A 3HTVA 3SLCA 1NK9A 4M3TA 4K0KK 1IBLK 1C1AA 3CQ8A 5AQUA 4OKEA 1TKDA 1EWRA 3MMVA 4M7YA 1NRAA 2A1SA 4H0PA 4B9LA 1RDAA 1NGAA 2E2NA 4EAHD 3DJCA 1TL1A 4GW6A 4QS9A 3VQQA 1FXXA 1JCFA 3A5NC 4BR5A 3QIPA 4BWJA 4BG8A 3T19A 4FXDA 1LCUA 2FLOA 3G4SN 4Z4CA 2O8DB 4BE7B 2QTDA 5C2FA 5AQFA 1L3VA 4FJIA 5H1SQ 3V4IA 2MN5A 4FYDA 1JKHA 2F7TA 3BGRA 3ZSRA 3VEYA 3CQXA 3RR7A 1A5VA 2F8SA 4EP5A 3CYGA 1HYSA 4KBOA 4FCYA 5HLFA 2GV9A 2P9KA 4KHWA 1TL3A 2KYQA 4E7JA 4FLUA 4CJUA 2HHQA 3KWGA 3RRHA 1BMRA 2OTLN 3TAMA 1CLQA 3ZYYX 2NNWA 3AVBA 3TTCA 2BUPA 3L2UA 1C56A 3DLHA 2KW4A 1GLBG 2KBJA 3ZSOA 1I6FA 3BP8A 3T7ZA 3FGUA 1NK4A 2OZSA 4JI6K 1UAXA 3SYZA 4DR7K 5IWAK 4JI2K 3G71N 5AQKA 3U6FA 2QXLA 3ZT3A 3AVAA 3JSMA 3HL8A 3EL2A 3TAQA 4FWLA 4FLTA 4KHQA 5AJ3K 3SF4D 1HKGA 2OZMA 5KPTA 1TI5A 2LN8A 5CR4A 1TK8A 1W0HA 1ATNA 2RHKA 4KHPK 3AVKA 4DLGA 1EO1A 2E8AA 2KSKA 1W9HA 4AQYK 3UE5A 4B9NA 2D0AA 2RE2A 5JMVA 4BVPA 1GLLO 3DYAA 4EZ6A 2F4VK 1UWBA 1I2UA 4MDAA 4YOTA 1RTDA 3GL1A 3SV3A 1GOCA 4H5NA 3DLRA 2P9KB 3R2VA 3EYZA 3QFUA 3S3OA 1T6CA 1T44A 4CFAA 3ENOA 1ATSA 2QWMA 1CXQA 3AO1A 1BI4B 2F96A 3MEDA 4LY7A 4CZMA 1LV5A 4E7LA 2HHIA 5AQHA 4HCBA 1GOAA 3KK1A 4N76A 3CG7A 4CK3A 4CGIA 3F73A 1DTTA 3DLKA 5E41A 5KI6A 2UYTA 2R7YA 4GKKK 3PSFA 1ZUTA 5GADP 3LWLA 2BDPA 3O3FA 1NGHA 1GLAG 3H45C 1XUPO 5AQQA 2GELA 4IFEA 1HNWK 4JKGB 1NJXA 1BHLA 1Z26A 1ZBLA 4IG0A 1YAGA 2A5XA 1QZ5A 1V4SA 1C55A 5KRSA 4DQIA 1XMOK 2QWLA 1KAYA 3AA2A 5GIOA 4B9VA 2ZGYA 2VWJA 4MQ3A 5BR9A 2IVNA 3TWHA 4DMNA 1Q81O 2NRVA 2GTDA 2G2KA 4NYFA 3NGZA 4IFYA 4JKHA 2NLXA 1SS6A 4W5RA 1WN7A 4I6MA 1ZU3A 4FJ7A 3KVGA 3MWPA 2KBHA 2E2FA 4HVJA 5BRHA 4JI1K 1S72N 4BE0A 2O8CA 3EKUA 1B9FA 1KCFA 3G6EN 4XH4A 1NK5A 4OKKA 2ZJPL 4M3WA 1BISA 4YFUA 2AA4A 1JLBA 3K0SA 5FPNA 4GNIA 5EX5A 4PKGA 1C1CA 2GEMA 4XH5A 1X9MA 3AVGA 3QBWA 1ZBIA 4HHFA 4NXMK 3K59A 1QSLA 3OW2M 3WXJA 4FJGA 3VTHA 1MR4A 4CZHA 2D56A 1BA1A 2G8UA 3IRXA 4FJKA 3AVIA 1QS4A 5AQNA 3U3YA 1P90A 1KLNA 1BQMA 4IG3A 4E19A 1VNAA 4BRHA 2KQ2A 4B1YB 4IJNA 4KREA 4JKEA 4CF2A 1KAXA 4DSIA 3ZETB 5EXWA 4YDUA 3QEVA 4JI0K 4FWPA 3DOLA 3KP1A 3R9PA 1MA9B 2GWKA 4CVNE 2ZD1A 3VQ8A 4QOZB 3AVHA 3MECA 1HQEA 2E2QA 3MXMA 4CJTA 5E26A 4DF4A 1NK8A 1K8KB 4F2SA 4WYBA 1I39A 4AHCA 4IWVA 4PQUA 2ITMA 3VQAA 4E1JA 2EX3A 1SL0A 3W3DA 1NRBA 3VQ4A 4MLEA 3ZSYA 1U49A 3GDQA 4RW9A 3HPHA 3D2EA 2IVPA 4GKJK 1SL2A 2YX6A 3J81O 1DLOA 3HRGA 4M3RA 2HHSA 4XIUA 1ATRA 2YV0X 3LDOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3SAG A;  4BVO A;  3PSI A;  1VQ8 N;  3M5R A;  4K43 A;  1D9D A;  3A5M C;  3VEZ A;  1TAU A;  4R79 A;  4FK4 A;  2J4R A;  1RIL A;  3DRS A;  3BZK A;  4WQ5 C;  3H6E A;  3CC7 N;  3E9P A;  2AP1 A;  4CHN A;  1YIJ N;  2E3G A;  3SMP A;  2FF3 B;  1UA0 A;  4J2A A;  4CZJ A;  2NRZ A;  3IFR A;  2HHW A;  3SUN A;  2ATQ A;  1D8Y A;  4KHU A;  3HJF A;  2WON A;  3D7E O;  3ZX0 A;  2LY6 A;  2YBR C;  1UA1 A;  4GV9 A;  2KFN A;  2OTJ N;  4FOI A;  2HST A;  5CY4 A;  4CEQ A;  4V19 S;  3C6H A;  1SKR A;  2VY6 A;  4RW6 A;  2YHX A;  1RDC A;  3UKR A;  3VQD A;  1CZA N;  2O8E B;  2P1J A;  3G0Z A;  3QBX A;  4YOV A;  3OYK A;  2Z1J A;  1HUX A;  1VSD A;  3JS6 A;  3VF6 A;  3KC6 A;  1L4V A;  1J5O A;  2DPN A;  1R59 O;  3ALY A;  4Y0W A;  1FKP A;  2HBM A;  4BDY A;  2W41 A;  4BRD A;  4L8R B;  2I7P A;  3FZH A;  3SI6 A;  2GMO A;  3A5O C;  3SQ4 A;  3ITH A;  3K9K A;  4B1W B;  2PZS A;  3QML A;  1VQO N;  1U2V B;  4H0Y B;  3V9X A;  3LP2 A;  3RMA A;  4BRQ A;  1OVQ A;  3PSM A;  4CEE A;  4U67 L;  4O44 A;  1TAQ A;  4B3S K;  3OTO K;  5AQR A;  4H0O A; 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