3W0LA

The crystal structure of xenopus glucokinase and glucokinase regulatory protein complex
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
449
structure length
426
Chain Sequence
QNEVDQILSEFHLQEEDLHVLMCRMQAEMERGLHLETNEEASVKMLPTYVRSTPDGSEVGDFLALDLGGTNFRVMLVKVGEDLEGQWKVETKHKMYSIPVDAMTGTAEMLFDYIAECISDYLDQQNMKHKKLPLGFTFSFPVRNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHHCEVGLIVGTGCNACYMEEMSNVELVEGEEGRMCVNTEWGAFGDTGELEDFRLEYDRVVDEASLNPGQQLYEKMIGGKYMGELVRLVLIKMVNENLLFGGESSEKLKTRGAFETQFVSQIEADTSDFKQTLNILRTLGVQATIGDCHAVRLACESVSTRAAIMCSAGLAGILNRMRQSRREELLRITVGVDGSVYKLHPSFKDKFHATVLKLTSGCEITFIQSEEGSGRGAALISAVAYKMAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular basis for the role of glucokinase regulatory protein as the allosteric switch for glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Xenopus laevis
molecule keywords Glucokinase
total genus 149
structure length 426
sequence length 449
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w0lA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3w0lA01
4CZJA 3QBWA 3ZETA 3IDHA 3L4IA 1BG3A 4JD2A 4RTFD 2P9PB 3A8YA 4B1VA 4DHYA 3VEYA 4ISFA 4FWNA 4LC9B 5AQNA 3S41A 4B1XB 4RCHA 5ADXA 3SMPA 4O5FA 3VGLA 4CBXA 3R6MA 2HMPA 5AZJA 3DXKB 5BPMA 3HBTA 4B1YB 5AQSA 2VCPA 4H0TB 4A61A 1V4SA 2YI1A 3RSEB 3GOIA 1ATRA 3CERA 2E8AA 3O80A 3MK6A 3W0LA 3O08A 3ZX2A 2P9PA 4H0YB 3VPZA 3WXLA 4FOIA 4M63C 4A2AA 3IFRA 3FZKA 1ESVA 1XQSC 4BRCA 4MO4A 5FPMA 2Q31A 3A5OC 1GLBG 2W40A 3LM9A 4PL7A 4BC2A 4AM7A 3DXMB 1TYQB 2QM1A 4FWPA 1HKGA 3LDQA 5AQKA 1NGCA 3LDPA 3M1FA 4PKHA 4JAXA 5AZIB 3IMXA 3LDNA 4QS7A 2IIRA 4IZ9A 3C0BA 3ATUA 4FPAA 3VETA 4CZIA 4BRPA 3VOVA 2YJFA 2J4RA 2Q0UA 3UKRB 5BPLA 2PBDA 3TPQA 1K8KA 3ULEB 2QWRA 3BEXA 2A3ZA 2QXLA 2CH5A 5AQHA 4IJAA 1TUUA 3OHRA 4GNIA 3D2EA 3DXMA 1TYQA 2IVOA 2HOEA 4BGBA 3IUCA 4FWSA 3JXUA 4BREA 2GTDA 4PL8A 1HKCA 2GWJA 3CQYA 3MDQA 4BRHA 1NGAA 1HPMA 5AQGA 1C0GA 1E4FT 3WQUA 4XH5A 3ZEUB 5AQTA 3L6QA 4FWRA 3UKRA 3KVGA 2A42A 5E26A 3A0IX 4MLHA 4FWMA 3ULEA 5LJVA 3A5NC 5CE3A 1IG8A 4WQ5C 4BR7A 3O8MA 4WQ4A 2D0PA 2F9WA 3I33A 2AP1A 4CD3A 4H5WA 4BGAA 3GL1A 1QZ5A 5AQFA 4J8FA 4BR9A 5LJWA 4BQZA 1HJOA 4KBOA 2QWMA 2E20A 3EL2A 5AQPA 4BC3A 3AAPA 1RDWX 2ITMA 1NGBA 4PKGA 3ZEUA 4A62A 1XC3A 4JNEA 4M7YA 1NGHA 4JN4A 3SLCA 2NRHA 1X3MA 4BC4A 5KPRA 1GLEG 5BN8A 4CBUA 1LOTB 2ZF5O 4FL9A 5KPZA 3FZMA 1DKGD 3QFUA 3U8XA 2D1KA 5JLFA 3R9PA 5FPEA 1MA9B 2V7ZA 1BWFO 3DJCA 3ID8A 4WYBA 3DWLA 3P4IA 3QB0A 4CZLA 4FWQA 5FPDA 1R59O 5EXWA 3VEZA 5AQYA 5AQIA 1D4XA 1ZBSA 5AFUH 4B1WB 3L0QA 2EWSA 4ISEA 1BU6O 5ADXH 1ATNA 1YXQA 2Q2RA 3GE1A 3J8AA 3AARA 4CZFA 2UYTA 2CGLA 1RFQA 5BREA 5FPNA 2E2OA 3WEEB 3CJ9A 3CJ7A 4EAHD 3WT0A 1BUPA 4K25A 4E1JA 3BF1A 1MWMA 5AQVA 3MN5A 4AM6A 4Z94A 3ENHA 3FZLA 5EVZA 3EZWA 5LY3A 3A5MC 5F0XA 4FOEA 2D0OA 3CI5A 4XH1A 1OKJA 2FF6A 4BRDA 2IVNA 1SAZA 2H3GX 1G99A 1Z6RA 2Q0RA 2FXUA 1NMDA 1ZXOA 3MN7A 4BR0A 4BRGA 4K41A 3DXKA 4DQ8A 4B1UB 4A2BA 2FLOA 3WEEA 4BROA 4CZKA 1BOTO 3ZX3A 3EKUA 4IWVA 2GEMA 4H5VA 3RSEA 4CZMA 1NGGA 4B1ZA 3H6EA 4F9OA 5B8HA 1WOQA 4C23A 3H45C 5BRDA 2ZGYA 1LCUA 3HTVA 3WXJA 4IXCA 4CZGA 4WQ4C 2QWLA 2Q36A 4YDUA 1BA1A 1SQKA 1H1VA 1NM1A 1U2VB 3M6GA 3FGUA 1GLCG 4H0PA 2FSKA 5AZIA 1NGFA 3VEWA 3LM2A 4XH4A 2QWOA 3JS6A 4H0OA 4O8KA 1X3NA 1P8ZA 5EX5A 1HX1A 2E88A 3W3DA 3CJBA 3UKUB 3G25A 2E2NA 4QS9A 4QS8A 5BR9A 5BRFA 1KAYA 3M3ZA 5KPTA 4PKIA 3CIPA 2ASMA 3A5LC 1CZAN 2A41A 3CJAA 4H5NA 4NB4A 1MDUB 2HF4A 1U6ZA 2W41A 2D4WA 1GLLO 2IVPA 3LDLA 1U2VA 3VEOA 4BRNA 1Q18A 4H5TA 2GUPA 4CZHA 2E1YA 1ZC6A 3H1QA 4CI6A 2GWKA 2ZWHA 3I8BA 2GELA 3LL3A 5EOYA 2AA4A 4HTLA 2E2PA 3UKUA 1EQYA 4MLEA 3FFKB 1YUWA 4MO5A 2BUPA 2KHOA 4FWKA 1T44A 4DCHA 5AQQA 2ASPA 3R8EA 1DGKN 2FSNA 2QWPA 3KHYA 2A6AA 3VGKA 5JICA 3SMSA 2CGKA 1S22A 3U9ZA 1NGIA 4EHTA 1GLDG 4H03B 3UB5A 3H1VX 4JD2B 2VYPA 3MN9A 4EHUA 3AY9A 4DB3A 5BPNA 3VF6A 1BA0A 2I7PA 3QBXA 1YAGA 4BG9A 4CZEA 3LDOA 1X9JA 3O1BA 4BRAA 3BP8A 5F1XA 1TUYA 2QWNA 5BN9A 4NO7A 2VWBA 3CJCA 3UE5A 4H5RA 1QQMA 1GLAG 2P9LB 5E84A 5AFUA 3ATVA 5JMVA 5AQZA 4CJ7A 3EKSA 1J6ZA 3CHWA 1BO5O 1HKBA 3SJHA 1NGDA 5EY4A 2P9IB 3GG4A 1GLJO 4JHDB 2PAVA 4I6MB 4YDUC 4EIAA 3C7NB 2P9UB 2QWQA 2HF3A 1XUPO 3ZX0A 1IJJA 4FWLA 4BVPA 3CJ1A 3F9MA 3EN9A 5AQJA 3HI0A 2OANA 2P9LA 1RGIA 3D7EO 5F2RA 5AQXA 3SK3A 2P9NB 3QMLA 2V7YA 4BR2A 3VF4A 3GDQA 2YHYA 1K8KB 1HLUA 1ATSA 2ZGZA 5BRHA 3U4LA 1WUAA 1YVNA 2F9TA 2Q1NA 3O5BA 1NGEA 2P9IA 4K43A 3D2EB 4JHDA 2BTFA 3BUZB 4BRLA 3VEXA 3VERA 1JCGA 4I6MA 5AR0A 5AQWA 3VENA 3C7NA 1NWKA 2YHWA 2P9UA 4FSVA 2NLXA 3HM8A 3H3NO 3VESA 4BRFA 1NBWA 4BR4A 2I7NA 5AQOA 2P9NA 2A40A 3FR0A 3U9DA 4IO8A 4GY2B 1S3XA 3VGMA 3B8AX 5AQLA 2Q97A 3O4WA 5AQRA 3GBTA 5AQMA 1V4TA 3TU5A 4BC5A 4BVOA 1QQOA 3FZFA 1DEJA 4FO0A 2FSJA 3MMVA 3HSCA 3MN6A 3WUHA 5JLHA 4BR5A 1KXPA 3WQTA 4CD1A 1T6CA 1GLFO 4BRKA 2P9KB 4HWIA 3O1WA 4ISGA 2P9SB 5AQUA 3QICA 1MWKA 2CH6A 3FZHA 3EO3A 2WUSA 1QQNA 4BRMA 1JCFA 3D2FB 4BQLA 1NGJA 3BF3A 1E4GT 1NLVA 1KAXA 2YJEA 4XEIA 4Y0WA 3O6WA 1SZ2A 4L3QA 5TKYA 3WXIA 4BRQA 3H46O 3VF2A 2DPNA 1JCEA 1T6DA 4IJNA 1Z05A 3ZETB 1C0FA 3H3OB 3DAWA 3MCPA 5ELZA 3AAQA 4BG8A 4RWTA 2E1ZA 4FWOA 2P9KA 1BDGA 4M7XA 2P9SA 5I9EB 4BRIA 2ASOA 3FLCO 3KZBA 3CETA 4K42A 4EFHA 2QW9A 3FE1A 1Y64A 2CGJA 1KAZA 2A5XA 5AZJB 5KQDA 3D2FA 2NZTA 4H0XB 1QZ6A 1HUXA 4CBWA 5KQ8A 4WQ5A 3HZ6A 3VEVA 2V51B 2YCHA 2E2QA 3CQXA 2YHXA 2V52B 1QHAA 3ENOA 3QFPA 4B9QA 4H0VB 4FPBA 2FF3B 3QDKA 3WXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZJA 3ZETA 4HUEA 1EP4A 1WN7A 1CXUA 4JD2A 3V1QA 5HROA 1HQUA 1KVCA 2IAJA 3JAMO 4DHYA 4DV7K 4LC9B 3S41A 4LSNA 3SMPA 3VGLA 4MDBA 4FCYA 4GVMA 4JKGA 4O8UA 5BPMA 3MX5A 2VWJA 4OKEA 4CHQA 4FJNA 1V4SA 3GOIA 1GOBA 2ZM6K 2O4IA 1I39A 1W7AA 3K5LA 2Z1IA 2OZSA 4ZHRA 4H0YB 4FOIA 4A2AA 4HTUA 4BRCA 3A5OC 3J81O 1Q82O 1TGOA 2W40A 3LM9A 5J2NA 1U47A 3DXMB 1C1AA 1ILYA 1EWRA 5GIOA 1HR0K 3LDPA 4M3XA 1BI4B 4X64K 1TKZA 5J2PA 4QS7A 4JS5A 3DM2A 4FPAA 4CZIA 3V1OA 2KFNA 1N33K 4GV9A 4OKKA 3E01A 3CC7N 3DLKA 3DRPA 3NH1A 3V9XA 5AQHA 4MQ3A 1BHLA 4IJAA 3VTIA 3D2EA 3HPHA 3IUCA 1C6VA 3NBPA 4JEPA 4JI5K 1NK8A 4KI6A 1HKCA 3ISNC 4OX9K 3MDQA 4BRHA 4AHUA 1UWBA 4CEEA 3WQUA 2OTLN 3HL8A 3ZEUB 3EEQA 3L6QA 3QLHA 3QEWA 3G6EN 2HHXA 3WNEA 1IG9A 5E26A 2ZQBA 4MLHA 3ULEA 5DK5A 1NK7A 3A5NC 1VSIA 4J2BA 4WQ5C 3VQAA 5HRSA 4WQ4A 2D0PA 3I33A 1YTAA 1BISA 4O4GA 1S72N 4M3TA 1QTMA 5LJWA 4BQZA 3NH2A 1N8RO 5AQPA 1XNRK 2F8SA 3O4NA 4BC3A 3ZCMA 3SI6A 2ITMA 4IBNA 2RF2A 3C6TA 4M7YA 1NGHA 1X9MA 3NF6A 4C8KA 1GLEG 5BN8A 2ZF5O 4RW6A 4YFUA 1NK9A 4DV3K 2O4GA 1BQNA 4IO9L 3R9PA 4IEIA 2BH1A 1WSGA 2E4LA 5MLCQ 5EXWA 4ELVA 4KRFA 5C24A 5AQIA 4YOTA 4OPAA 4CF8A 4FLWA 1ZBSA 4DLEA 3THWB 1SKWA 4W5TA 3LP0A 1SL1A 1L5UA 5ADXH 1ATNA 3AARA 4M42A 2P51A 3VMFB 1RBVA 4OLBA 3CJ9A 4EAHD 2G8VA 1U4BA 1WSEA 2KLAA 4B3OA 4EZ9A 3FZLA 4N56A 5EVZA 3EZWA 2IOCA 4HCCA 3TSUA 5LY3A 4F4KA 2HBLA 2OPRA 3A5MC 3AV9A 4X62K 2RHKA 3I0SA 2OTJN 3L2QA 3ZSZA 4JK8A 3DOKA 4K8ZA 1DTQA 3L3VA 4E3SA 1IV0A 2FXUA 1SL2A 4CGGA 1KLMA 4DQ8A 3WEEA 4BROA 3OJUA 3VQEA 4CK2A 4BACA 3HO1A 5HBMA 2OPSA 4B8AB 3IS9A 1VSMA 3M8QA 4IFEA 4B9TA 1S1XA 1QSSA 4YORA 1QVFM 1Q7YO 3H6EA 3OY9A 3MCAB 1WOQA 3DLRA 4B3TK 1ASUA 3CMAN 1C0MA 4BE0A 4EP4A 4IXCA 4CZGA 2QWLA 1SQKA 1H1VA 4NYNA 2OZMA 5J1EA 2E6MA 4B3MK 3M6GA 1KD1O 1VSDA 2D0AA 3VEWA 1P90A 4ZTFA 1JKHA 4H0OA 1W0HA 1P8ZA 4EZ6A 1HX1A 3W3DA 3UKUB 3G25A 4WCEL 1LAVA 5BRFA 3M3ZA 4NXMK 4PKIA 2ASMA 4KO0A 1CZAN 4NB4A 3RTVA 4JK9A 1ZYQA 3TAGA 1JXBA 3LDLA 4CJLA 4JKDA 4FLZA 1NK0A 3H1QA 5JVHL 4CI6A 2YKNA 4FK2A 4CJKA 5EOYA 2AA4A 4CHPA 3HP6A 3IRXA 2G8UA 1IKWA 1JLCA 1RDCA 2BUPA 5HRNA 3R8EA 3OBWA 3KHYA 4AF1A 1VSHA 3SMSA 3OYBA 3U9ZA 4W5QA 3AVNA 1BGXT 4EHTA 4YNQA 3H1VX 4EHUA 4FJ5A 3AY9A 4NXNK 3D6RA 4KPYA 4FVUA 4QAGA 1BA0A 3Q7CA 4C8NA 3PX6A 1X9JA 3O1BA 3BP8A 3MWTA 4AHSA 5C42A 1L3VA 2QWNA 1FW6A 4NCGA 3ZYYX 2VGMA 4Z4EA 4OPJA 3UE5A 4FZZA 1KVAA 4DR5K 5FROA 1RT5A 1M1KO 3A2FA 4JKAA 5JMVA 5TKWA 4HVJA 3R3LA 3CHWA 1VQMN 3ZSRA 1HKBA 1BIUA 2YV0X 4FJGA 4ILJA 2P9IB 1EKEA 4X66K 4E7LA 4DQPA 4EIAA 4E89A 1VQ8N 2D0CA 1TV6A 3C7NB 3IG1A 4DR1K 2HF3A 1I3AA 1XUPO 1IJJA 4LFCK 3F9MA 5JS2A 3AVMA 3D7EO 5F2RA 3SK3A 3F9KA 2O8BB 2P9NB 3QMLA 1WAJA 1K6YA 1WUAA 1NGEA 4LH4A 2QKKA 4JHDA 3BUZB 3VQ8A 3OJSA 4RW9A 4DQIA 4I6MA 1VQPN 1XMOK 1NWKA 2UUBK 2P9UA 4QOZB 3KKRA 3H3NO 4CJWA 4DV0K 3NGIA 3PUFA 4FLXA 4QCLA 2YKMA 3CPWM 1RTIA 2D5RA 3U9DA 4CHZA 1S3XA 4J2EA 3LALA 5AQRA 3F5TA 4BC5A 3SJJA 1OH6A 3MXJA 4WF9L 4LF5K 1NK6A 3TAEA 3CPEA 3MN6A 3MMVA 3JYTA 4YOYA 4AHVA 1WLJA 3DYAA 3WQTA 2X6SA 1GLFO 4C8LA 2P9SB 3OYCA 3CYMA 3P31A 4OVLA 4YY3K 3SQ2A 4BRMA 3D2FB 2AJQA 2XY6A 4B9VA 3C94A 1NLVA 5KI6A 3V4IA 4BRQA 3OYHA 1VQ9N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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