3W0LA

The crystal structure of xenopus glucokinase and glucokinase regulatory protein complex
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
449
structure length
426
Chain Sequence
QNEVDQILSEFHLQEEDLHVLMCRMQAEMERGLHLETNEEASVKMLPTYVRSTPDGSEVGDFLALDLGGTNFRVMLVKVGEDLEGQWKVETKHKMYSIPVDAMTGTAEMLFDYIAECISDYLDQQNMKHKKLPLGFTFSFPVRNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHHCEVGLIVGTGCNACYMEEMSNVELVEGEEGRMCVNTEWGAFGDTGELEDFRLEYDRVVDEASLNPGQQLYEKMIGGKYMGELVRLVLIKMVNENLLFGGESSEKLKTRGAFETQFVSQIEADTSDFKQTLNILRTLGVQATIGDCHAVRLACESVSTRAAIMCSAGLAGILNRMRQSRREELLRITVGVDGSVYKLHPSFKDKFHATVLKLTSGCEITFIQSEEGSGRGAALISAVAYKMAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular basis for the role of glucokinase regulatory protein as the allosteric switch for glucokinase
pubmed doi rcsb
source organism Xenopus laevis
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase
total genus 149
structure length 426
sequence length 449
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w0lA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3w0lA01
1DGKN 1BDGA 3SMPA 3HBTA 2V7YA 3VERA 4DHYA 4EIAA 4A2BA 3ULEB 2QWRA 1YXQA 4QS9A 2FSJA 4JD2B 2W41A 2IVPA 3ID8A 3W0LA 1ZXOA 5BRFA 5TKYA 2A40A 3EZWA 4AM6A 4BG8A 2E2PA 3OHRA 2AA4A 4IO8A 3CETA 1YAGA 4B1YB 4CZGA 5E84A 4M7YA 3IUCA 2NRHA 2V52B 4FO0A 5BN8A 3ENHA 3ZEUB 2HF3A 4H5TA 3CQXA 3RSEA 4BRCA 2VCPA 4FOIA 4CZJA 3G25A 1NGCA 2ZGYA 4B1XB 3QBXA 3ATUA 1HUXA 1TYQB 5BR9A 1H1VA 2E8AA 1NGAA 4H0VB 1NGHA 1EQYA 3VENA 3MN5A 4B1UB 3O5BA 3O8MA 3A5OC 2E2NA 1NGGA 4FWQA 5ADXH 3C7NA 2P9PA 2WUSA 4B1VA 4BREA 1NGBA 4DB3A 4A62A 3EKSA 3UKRA 2FSNA 4BGAA 4E1JA 2ASPA 1WOQA 2VWBA 3O4WA 3UB5A 4BVOA 1LCUA 3HZ6A 1BU6O 3CJ7A 2P9SB 4BGBA 5AR0A 4J8FA 2D4WA 2Q97A 1U2VA 2ASOA 2QWNA 3U9ZA 4CBWA 1NLVA 2A41A 5BRDA 3U9DA 2F9TA 3BUZB 3FGUA 1BA1A 5AQIA 1X3MA 3FZHA 1BWFO 4RWTA 3WXKA 4ISEA 3AARA 1V4SA 4H0OA 4XH4A 5AQYA 1Q18A 5LJVA 4BVPA 2YI1A 3MCPA 1GLBG 2PAVA 5JLFA 2E2OA 3WUHA 3QFPA 1MDUB 3LDPA 5E26A 4PKHA 5AZIB 2P9UB 3H1QA 2YHWA 5JLHA 3U4LA 2QW9A 2ZWHA 5F2RA 2FLOA 1NWKA 2Q0UA 3LM2A 3EL2A 4DQ8A 5BPNA 2Q0RA 4H0XB 3ZX3A 3A8YA 3LDQA 3VF2A 1HKCA 1J6ZA 3RSEB 3FZKA 4BR0A 4BR5A 4B1WB 3EO3A 1KAZA 3P4IA 2GUPA 2E88A 3WEEA 2GTDA 3FZFA 1D4XA 3B8AX 2P9NA 3VGLA 2YHXA 4BROA 4HTLA 1TYQA 5AQQA 2P9KB 5EVZA 3MMVA 4AM7A 3IMXA 1K8KA 3CJ1A 1BO5O 4JAXA 4BRIA 5LY3A 5AFUH 2IVNA 1E4FT 1X3NA 2GEMA 4BR2A 1XQSC 3FZLA 2I7NA 3VEWA 2YJFA 1RDWX 3CJAA 3VESA 3AAPA 3R6MA 1NMDA 2E20A 1QQOA 4WQ5C 1GLDG 4BRPA 4CZHA 1ZBSA 1ZC6A 3VEYA 5AQXA 2ZGZA 3L6QA 2CGKA 3GBTA 3H3OB 4H5NA 4HWIA 4JD2A 4WQ4C 4B1ZA 5BPMA 3ZX2A 1ATRA 3WQTA 3IDHA 2QWQA 2Q36A 1P8ZA 1GLJO 2I7PA 4JHDB 2UYTA 3SK3A 4CD3A 2NLXA 3GL1A 4QS8A 5KPTA 4CZKA 3EKUA 3A0IX 2P9SA 5FPNA 5AFUA 1IG8A 3O1WA 4EHUA 3LDNA 3D2EB 4WQ5A 1ATSA 4BRFA 2FF6A 3QICA 3SMSA 3H6EA 4PL8A 4PL7A 1E4GT 1HPMA 3ZETA 3QFUA 3CJCA 3CIPA 1SZ2A 5BRHA 3GE1A 2ITMA 3ZEUA 2CGJA 4YDUC 4BRKA 2DPNA 3BF3A 3VEOA 3H45C 3VF6A 4EAHD 2E1ZA 2Q31A 3H46O 4BRLA 4PKGA 5CE3A 5KQ8A 4RTFD 4LC9B 3C0BA 3ATVA 1T44A 3DWLA 4BRHA 1TUYA 3F9MA 2CH5A 3GG4A 3UE5A 5BPLA 3M6GA 4IJAA 2P9IA 3IFRA 1BUPA 5AQGA 3HSCA 1QZ5A 4FWRA 3H3NO 4EHTA 4FWKA 2HMPA 3D2FB 3QMLA 1KAXA 1MWMA 5AQOA 3WXIA 3VETA 4BG9A 4FPBA 4BQZA 3FE1A 4CI6A 4L3QA 1MA9B 4Y0WA 2P9LA 3LM9A 3MN7A 2EWSA 4FWNA 1T6DA 2BUPA 3CJ9A 1DKGD 2IVOA 3FFKB 4FWOA 3JS6A 3HM8A 3BEXA 4JNEA 5EOYA 3UKRB 2V7ZA 4BC5A 3AAQA 2D1KA 3VF4A 1Z05A 2AP1A 3LDLA 3VEVA 4WQ4A 3CHWA 4I6MA 2P9KA 3VGKA 1LOTB 2F9WA 1K8KB 3O1BA 5JICA 3QBWA 3H1VX 3M1FA 5ELZA 5ADXA 3VPZA 4BRAA 3ENOA 2H3GX 5KPZA 3TPQA 2Q2RA 2HF4A 1GLFO 1TUUA 1JCEA 2YJEA 3A5NC 1YUWA 1RFQA 4YDUA 3MK6A 4H5VA 3O6WA 5AZJB 3W3DA 1C0FA 4XEIA 3BP8A 5EX5A 1SQKA 1QQMA 4FWPA 5FPEA 3UKUA 3QB0A 5AQJA 4CZFA 2KHOA 1S3XA 1R59O 2FF3B 1OKJA 4GY2B 4IJNA 4IWVA 4NO7A 4JHDA 3DXKB 5AQFA 3WQUA 4NB4A 1BOTO 1QZ6A 1YVNA 4K25A 4PKIA 3KVGA 4H0TB 4ISGA 4BR7A 1GLCG 1IJJA 5AQHA 5AZIA 4M63C 2YHYA 4FWMA 4BRDA 1ESVA 2Q1NA 3ZETB 4XH1A 3VGMA 1Z6RA 3U8XA 2IIRA 2VYPA 3FR0A 4MO5A 4IXCA 3A5MC 1HKGA 5FPDA 5BREA 1T6CA 2QWLA 4FWLA 4CZMA 4FL9A 1XUPO 3MDQA 2E1YA 4BQLA 3HI0A 2A6AA 2P9IB 4BR9A 4H0PA 4MLHA 2D0PA 5AQLA 1RGIA 3EN9A 4BRGA 2ZF5O 3D2FA 3VEZA 3ZX0A 4A2AA 3MN9A 3WXLA 1NGDA 4DCHA 1X9JA 4H03B 3CQYA 3DAWA 1NGJA 3DXMA 4CJ7A 1SAZA 4O5FA 2QWPA 3O80A 4CZEA 2E2QA 1NBWA 2GWJA 2FSKA 2A5XA 3VOVA 3C7NB 4H5RA 2GWKA 2J4RA 1KAYA 5AQKA 1JCFA 3L0QA 3S41A 3ULEA 4MO4A 1KXPA 1NGIA 3D7EO 5JMVA 2HOEA 3SLCA 4B9QA 1DEJA 5AQMA 1GLAG 1HX1A 4JN4A 3I33A 3WT0A 4XH5A 1CZAN 1C0GA 1GLLO 4FOEA 3FLCO 3J8AA 5AQWA 4BRMA 5F0XA 3HTVA 5AQSA 3D2EA 2A42A 3I8BA 4QS7A 4FPAA 3QDKA 5AQVA 4CZIA 2A3ZA 3CERA 4WYBA 3R8EA 5FPMA 5B8HA 3FZMA 4BRQA 5KPRA 5AQTA 1JCGA 1QHAA 3DJCA 1Y64A 2BTFA 4M7XA 3TU5A 3R9PA 4BR4A 5AZJA 2FXUA 3BF1A 1NGFA 1MWKA 1HLUA 4CBUA 4BC3A 5AQZA 4CD1A 4EFHA 2D0OA 2CGLA 4K43A 3UKUB 2QXLA 4F9OA 3DXKA 4BC4A 5KQDA 1BA0A 5EY4A 5LJWA 3LDOA 3JXUA 5AQNA 3AY9A 4FSVA 3CJBA 3VEXA 3L4IA 2P9UA 1BG3A 2W40A 4H5WA 1XC3A 3A5LC 3KHYA 4RCHA 1HKBA 2QWOA 2P9LB 2NZTA 4C23A 1GLEG 2PBDA 4BRNA 4GNIA 4K42A 3GDQA 5AQUA 2P9PB 3M3ZA 3GOIA 1V4TA 1NM1A 1WUAA 4Z94A 5EXWA 3WEEB 1HJOA 4BC2A 3LL3A 2YCHA 4CZLA 4CBXA 3MN6A 4ISFA 1ATNA 2P9NB 4I6MB 5I9EB 2QWMA 4IZ9A 1NGEA 2ASMA 2CH6A 2GELA 4K41A 3SJHA 1U6ZA 5AQRA 1U2VB 2V51B 4FWSA 4A61A 5AQPA 3KZBA 3O08A 4KBOA 1S22A 2OANA 4MLEA 1QQNA 3CI5A 4O8KA 2QM1A 5BN9A 3DXMB 1G99A 5F1XA 3WXJA 4H0YB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BDGA 4DHYA 4A2BA 4AILC 4A57A 4AHUA 3M8QA 2QWRA 1KSPA 2ZD1A 4JD2B 4FK0A 2FBYA 1DTQA 4AM6A 3S9HA 3ZSVA 5CHIA 3LP3A 3K9JA 3NGZA 3O3FA 1REVA 3AO2A 4B3RK 2QI2A 1RTHA 4BWMA 2OPRA 3HJFA 3ENHA 4ID5A 3J7YP 4DS5A 5C25A 3G0ZA 2XY8A 4B1XB 3VQPA 4RG8A 1W7AA 3F9KA 1HUXA 5BR9A 3T69A 1C0UA 4CGIA 1NGHA 4EP4A 4M41A 3VENA 2NNWA 3MN5A 1IKVA 3S3NA 4I9LA 4W5QA 4M42A 3O8MA 3ZT4A 2YNFA 4FJ9A 5FROA 4M3UA 4FWQA 1T05A 4Z4GA 4DTPA 1Y97A 4LH4A 1ZBIA 1JL2A 3A2FA 4BGAA 3OYEA 3AO3A 3E1YA 5E41A 1VAZA 3NVMA 4F3TA 2KTQA 3O4WA 4E19A 4J2AA 1YF5L 4BVOA 1LCUA 3CJ7A 3CMEN 5C24A 2A41A 1NJYA 3EY1A 3C95A 3KLHA 2ZE2A 1RDCA 3FGUA 1BA1A 4LF4K 4U7BA 3OS0A 5AQIA 3C6TA 3S3OA 3WXKA 4ISEA 3OYGA 4XH4A 4IDHA 4KKOA 4E7IA 3MWPA 4JKBA 1S5JA 3NGIA 2YI1A 4CJRA 3K5LA 4YOTA 1J54A 5BR8K 4M45A 1MDUB 3LDPA 5E26A 3AGRA 3H1QA 2YHWA 4CK3A 3OYLA 4PWDA 2OZSA 2ZWHA 3SQ4A 4F3OA 1JL1A 2Q0UA 4LSLA 2YHBA 4AHCA 3EL2A 4WFBL 3ZLJA 1FKPA 1J6ZA 2NRZA 4FJ5A 3MEEA 4BR5A 2NRTA 1W9HA 3P4IA 3RMBA 3HO1A 3OY9A 2XO7A 2GUPA 4B9TA 5H1SQ 3B8AX 3QERA 2YHXA 4M3XA 5EVZA 1VSKA 3OTOK 3O9SA 5CZ1A 2O8CB 2HB5A 5LY3A 3OBYA 1QTMA 2IVNA 4HTUA 1X3NA 4CESA 4CIFA 1XQSC 5D3GA 2PFUA 1RDWX 4KHUA 3VESA 3CC2N 3PSFA 4CK1A 3OYBA 4WQ5C 2PZSA 1GLDG 4BRPA 1KTQA 1N32K 3AVIA 4NYFA 4W5TA 1DLOA 3P31A 5SWMA 4FLVA 4CHYA 1VQ8N 4B1ZA 3ZX2A 4JHDB 2Q36A 2UYTA 1ASUA 4CZKA 2YNGA 2P9SA 5EU7A 1LWEA 3AO1A 5AFUA 1BI4B 4WFAL 4CCHA 3O9RA 3D2EB 4WQ5A 3THXB 1T8EA 4CGJA 1RT4A 5IWAK 3SMSA 4KREA 3CJCA 3MCAB 1RBUA 1SZ2A 2NUBA 2CGJA 3VN5A 4W5OA 3VEOA 2O8FB 3H45C 3TTFA 4EAHD 4LF6K 3VTHA 4CE9A 4BRLA 3OW2M 1VSHA 4PKGA 5MLCQ 4C8NA 3AO4A 5HOOA 4FZXC 1IH7A 2KW4A 4FW2A 1X9SA 3SV4A 5GIOA 4IJAA 4GV6A 3IFRA 5AQGA 3HSCA 3OYAA 1X1PA 1JLGA 4FWKA 5AQOA 3WXIA 2OPQA 3C6UA 3OVNA 1ZBHA 4BQZA 1TAQA 3IS9A 3CCVN 1N8RO 2I5JA 4CI6A 1MA9B 4Y0WA 3V9UA 3MN7A 3SAFA 3AVGA 3TI0A 5HL7L 1WN7A 4FWOA 3FFKB 3I0RA 2HNZA 1HNWK 2O8EB 4AHTA 2AP1A 3VQAA 5GINA 4EZ9A 4WQ4A 1TK5A 2F9WA 4CGGA 3V1QA 3OYMA 3O1BA 4C1NI 1IKYA 3M1FA 4DR1K 4WFNL 2NRWA 3LP1A 3TPQA 1JLAA 3PO5A 2Q2RA 2HF4A 1GLFO 4X66K 2YJEA 1XI1A 1D5AA 4H5VA 1KD1O 5IT9O 2JWLA 3SV3A 4XEIA 2DTUA 5EX5A 4DR5K 1NKCA 4DV4K 3QB0A 2KHOA 1S3XA 4GY2B 4NO7A 4IOXA 4IJNA 3OYNA 2VQFK 3DXKB 3ZSQA 1BOTO 1QZ6A 4ILHA 4K25A 4PKIA 3OYFA 1Q7YO 2G8FA 2IC3A 5FRNA 2W6LA 4ISGA 2UUAK 1GLCG 5AZIA 3OA9A 1TVRA 2Y1JA 4BRDA 5HROA 3ZETB 2VGNA 4E3SA 1TAUA 1Z6RA 3U8XA 4C8OA 2BGGA 3V1OA 3O3GA 4DR3K 3MX2A 3MXJA 3LWMA 1HKGA 3CC7N 4QOZB 1S1UA 1X9WA 5M1KA 1WSIA 1XNRK 4FWLA 4LD0A 4X65K 4DS4A 4FL9A 4BQLA 2E1YA 5KRTA 1FJGK 2F8TA 2P9IB 3KK1A 4NYNA 1D8YA 4DU1A 3PV8A 5AQLA 4DG1A 3L2VA 3TR8A 4CFAA 3ZX0A 4A2AA 3MN9A 5TKWA 3WXLA 3LALA 4N47A 3THWB 1NGJA 2E2QA 3BGRA 3THYB 2A5XA 2GWKA 2J4RA 3P38A 3MEDA 3P5JA 5AQKA 3THVA 3M8RA 3S41A 4MO4A 1NGIA 3CD6N 2HOEA 2YNIA 3CFPA 4B9UA 4Z4EA 3LP0A 1HX1A 2X6SA 1RDDA 5AQWA 2RE2A 1XMQK 5HBMA 2ZJPL 3I8BA 1VQ9N 3SUNA 3CCSN 4DV1K 3SJJA 4JV5K 3QEVA 4DQPA 1T7PA 2HBLA 3NDKA 1YHQN 4CFBA 3PUFA 3DLLL 2RKIA 5AQTA 1QHAA 2X74A 3VQ4A 3KD1E 4CEOA 2FXUA 5M1OA 1Q8IA 4B3MK 4BC3A 4EFHA 1UWBA 1NKEA 2D0OA 2CGLA 4KV8A 2QXLA 4HUEA 4NLCA 3OJUA 4BC4A 5KQDA 1QE1A 5LJWA 4ZTJA 3SQ2A 3KLIA 4O55A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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