3W0LA

The crystal structure of xenopus glucokinase and glucokinase regulatory protein complex
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
449
structure length
426
Chain Sequence
QNEVDQILSEFHLQEEDLHVLMCRMQAEMERGLHLETNEEASVKMLPTYVRSTPDGSEVGDFLALDLGGTNFRVMLVKVGEDLEGQWKVETKHKMYSIPVDAMTGTAEMLFDYIAECISDYLDQQNMKHKKLPLGFTFSFPVRNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHHCEVGLIVGTGCNACYMEEMSNVELVEGEEGRMCVNTEWGAFGDTGELEDFRLEYDRVVDEASLNPGQQLYEKMIGGKYMGELVRLVLIKMVNENLLFGGESSEKLKTRGAFETQFVSQIEADTSDFKQTLNILRTLGVQATIGDCHAVRLACESVSTRAAIMCSAGLAGILNRMRQSRREELLRITVGVDGSVYKLHPSFKDKFHATVLKLTSGCEITFIQSEEGSGRGAALISAVAYKMAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase
publication title Molecular basis for the role of glucokinase regulatory protein as the allosteric switch for glucokinase
pubmed doi rcsb
source organism Xenopus laevis
total genus 149
structure length 426
sequence length 449
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w0lA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3w0lA01
3FZLA 4H5WA 4BC2A 2ASPA 3I8BA 1GLLO 5AQTA 1BO5O 3ULEA 3ATVA 4QS7A 5AQMA 4BRMA 5BREA 2P9LA 3CQXA 1T44A 4FSVA 4XH5A 5F2RA 1U6ZA 3GBTA 3UE5A 4B1ZA 3O1WA 3DXMB 5AQXA 4DQ8A 2FSNA 3A0IX 2V7ZA 3P4IA 5E84A 5AQSA 5AQJA 4CZKA 3QICA 4B1WB 2ASMA 1NMDA 3DAWA 4WQ5C 4CZGA 5BRDA 4MLHA 2VWBA 3CJCA 4CBWA 5AQRA 3WXLA 4BRGA 1HX1A 5AQKA 3CJ9A 4J8FA 5AQYA 1QZ6A 3GE1A 5AZIA 4EAHD 5EOYA 3A5OC 2IIRA 3C0BA 3D2FB 2ITMA 3HI0A 4RCHA 5JICA 4A61A 3ZEUB 4IO8A 1NLVA 2FSKA 4L3QA 3OHRA 4H5RA 2H3GX 3BP8A 4EFHA 3DWLA 3HBTA 5KPRA 4JD2A 4H0XB 1D4XA 2ZGYA 3FZMA 4XH1A 1QQMA 3WEEB 5AQVA 1JCEA 5EX5A 4I6MA 4CI6A 4C23A 4BRFA 2GWKA 3BF3A 4NB4A 1V4TA 3CERA 5EY4A 1ZC6A 4M63C 2QWLA 4QS9A 3CQYA 3RSEA 3O4WA 4GY2B 4ISEA 3F9MA 5AQPA 5FPDA 4XEIA 3CI5A 2WUSA 4FWRA 4H0VB 4H0YB 4CBXA 2Q1NA 3VPZA 2A5XA 4CBUA 2PBDA 3KVGA 4BRQA 3EKSA 3M6GA 4YDUA 5ELZA 3WQTA 4FOEA 3QB0A 1KAZA 2YHWA 3A5LC 1YXQA 1GLDG 3O6WA 4H5VA 3UB5A 4ISGA 4K41A 2UYTA 4M7XA 1JCFA 3VERA 5E26A 4BREA 3IDHA 3SLCA 2E88A 4FO0A 4BRCA 4DB3A 1SAZA 4BRAA 4WQ4C 4PL8A 3FLCO 3BF1A 5BR9A 2YCHA 4BC5A 3GDQA 4FWMA 3FZKA 1KXPA 3AAPA 3QBXA 4LC9B 2P9KB 3FE1A 5AQFA 4Y0WA 3O8MA 4BG8A 2AA4A 3IFRA 4JHDB 1BU6O 5AZJA 3CJ1A 4O8KA 5CE3A 1P8ZA 3UKRB 3LDOA 1GLEG 3VEVA 3R6MA 4FL9A 5BPLA 3MCPA 3HZ6A 2D0OA 2P9PB 3O08A 1G99A 3FGUA 1MDUB 1YAGA 4MO5A 5BN9A 3CIPA 2QXLA 2ZWHA 4CZFA 4CZEA 4RWTA 4WQ5A 3R8EA 1XC3A 5F0XA 5TKYA 5BPMA 1XUPO 1OKJA 1ZXOA 4BC4A 4BR5A 4FWOA 5I9EB 3VF4A 2P9UB 1NGDA 3BUZB 4QS8A 4JNEA 3LDNA 4RTFD 4E1JA 3MK6A 1WUAA 3SMSA 1JCGA 3UKUA 2VYPA 1J6ZA 2P9IA 2KHOA 3M3ZA 4BG9A 2QWPA 4JN4A 4PKIA 3C7NB 2YHXA 4B1UB 1BA0A 3ZETB 3HSCA 1TYQA 3CJAA 4BQLA 4A2AA 3QFPA 3WXKA 2BTFA 5FPEA 4IJAA 3B8AX 3VF2A 3L4IA 1U2VA 5JLHA 2P9SA 2HMPA 1TUYA 5LJVA 3S41A 5JMVA 3GL1A 4FWLA 3TPQA 4BGAA 2ASOA 3M1FA 4KBOA 3ULEB 1C0GA 3CHWA 2P9LB 2IVNA 3QFUA 3DXKA 1NWKA 1BA1A 4CZJA 4CZHA 4WYBA 4F9OA 2GWJA 2QW9A 3FFKB 4CD3A 3VEOA 5BRFA 4H5TA 3FR0A 2A42A 4EHTA 2YJFA 5BPNA 3LL3A 5AQWA 4H0OA 2EWSA 3CJ7A 1BDGA 1DEJA 1R59O 2A41A 2CH5A 4FPAA 4BR4A 2V7YA 2P9NA 1NGFA 1QQOA 4BRHA 2Q97A 1NGAA 2D1KA 5AZIB 4WQ4A 2GUPA 1NGEA 1E4FT 3VGMA 2CGKA 1WOQA 5BN8A 3H3OB 3FZHA 4MO4A 1QQNA 2Q36A 2Q31A 3U4LA 3VENA 1DGKN 3KZBA 3SJHA 4B1YB 4JD2B 3SK3A 2E1ZA 4AM6A 4I6MB 4Z94A 1HUXA 3H1QA 4EIAA 2E2OA 1S22A 3L6QA 4FOIA 4BVOA 1K8KA 2Q0UA 3RSEB 3GG4A 3H46O 1RFQA 1X9JA 2CH6A 1MWKA 3MDQA 1YVNA 1C0FA 4HWIA 2NLXA 1QHAA 2CGLA 3EZWA 3D2EB 3JS6A 3QDKA 4HTLA 3O80A 5AQIA 1Q18A 2W40A 1HKBA 1HKGA 3SMPA 2QWQA 1NGHA 4BQZA 3MN9A 4XH4A 1E4GT 1LOTB 3VGLA 5JLFA 4BR9A 4DCHA 2QWOA 1QZ5A 3BEXA 3LDPA 1T6DA 1Y64A 2A6AA 2ZGZA 4CZMA 3DXMA 4B1VA 4CZLA 1ZBSA 3U8XA 4BR2A 3KHYA 5AQGA 1NGIA 3VETA 3MN7A 5AFUA 2FF3B 4BRIA 2BUPA 2HF3A 3JXUA 1XQSC 2A40A 3U9ZA 1MWMA 5AQOA 3VEWA 1NGGA 3IUCA 1X3NA 3EO3A 4K43A 3D2FA 4CJ7A 1MA9B 5B8HA 4BGBA 2DPNA 2V51B 3ZEUA 5AFUH 3CJBA 4MLEA 2I7NA 2E2NA 4IXCA 3VEYA 1GLJO 5FPNA 5KQDA 4BVPA 4O5FA 3W3DA 3TU5A 3AY9A 5AQLA 2HOEA 3WT0A 3WEEA 2Q0RA 1IJJA 1BG3A 2E20A 3O5BA 1ATRA 4EHUA 1Z05A 5LJWA 2D4WA 1H1VA 2GELA 5AQZA 5FPMA 1YUWA 4H5NA 4BROA 1GLFO 4PKGA 2FLOA 4K25A 2FXUA 2YI1A 1HPMA 3ATUA 3WXIA 4PL7A 2QM1A 3W0LA 3MN5A 2CGJA 4NO7A 1SZ2A 2PAVA 1CZAN 3H6EA 1TUUA 2NZTA 2QWMA 4GNIA 3UKUB 3AARA 1KAYA 3WUHA 1NBWA 2P9IB 2Q2RA 3DJCA 1HJOA 1S3XA 3HM8A 4B9QA 1NGJA 3LM9A 3J8AA 4DHYA 1TYQB 4BR7A 2J4RA 3VF6A 2F9TA 1KAXA 3IMXA 3O1BA 1U2VB 4M7YA 2QWRA 2P9SB 1GLCG 5EXWA 3G25A 5KQ8A 3LDLA 5AQNA 3EKUA 3WQUA 1GLAG 4A62A 2I7PA 1EQYA 3FZFA 5AQHA 3U9DA 4H0PA 3I33A 1X3MA 2HF4A 4AM7A 2AP1A 4H03B 2GTDA 1RGIA 2P9KA 3CETA 3DXKB 2FF6A 4BRDA 2F9WA 2V52B 4IJNA 3GOIA 4JHDA 3WXJA 3H3NO 3ZX3A 3QMLA 1NGBA 4A2BA 5KPZA 3VOVA 3D2EA 4IZ9A 3ZX0A 5F1XA 5ADXA 1NGCA 2FSJA 4BC3A 3AAQA 3UKRA 4BRKA 2P9NB 3LM2A 3VGKA 4BRNA 3LDQA 3H1VX 5AQUA 3MN6A 2P9PA 1HLUA 4B1XB 3EN9A 4CZIA 4FPBA 5ADXH 3HTVA 2E2QA 5EVZA 5KPTA 1Z6RA 4FWSA 4YDUC 5AR0A 1RDWX 2E8AA 3QBWA 2QWNA 2OANA 2YJEA 2VCPA 2P9UA 4H0TB 4BRPA 5BRHA 4JAXA 4IWVA 4ISFA 2ZF5O 3ENHA 3ENOA 1ESVA 3VEZA 4BR0A 1V4SA 1SQKA 3D7EO 1IG8A 2E1YA 4PKHA 4FWPA 1BUPA 3A8YA 2IVOA 1HKCA 4FWNA 1LCUA 3C7NA 1K8KB 3EL2A 3ZETA 4K42A 1DKGD 2IVPA 2A3ZA 3L0QA 4CD1A 1T6CA 5AQQA 3A5MC 2E2PA 1NM1A 3VEXA 2YHYA 1ATSA 3H45C 2W41A 5LY3A 4BRLA 4FWKA 3ZX2A 3ID8A 3A5NC 5AZJB 1BOTO 1GLBG 2D0PA 1BWFO 4FWQA 3MMVA 3R9PA 2GEMA 3VESA 1ATNA 2NRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5WA 3T7ZA 3I8BA 3SZ2A 1FW6A 2P9LA 3CQXA 1DTQA 4ICLA 4BE0A 4H4MA 4XH5A 3CCJN 1RCHA 4B1ZA 2VG6A 3OYMA 4ILJA 2FSNA 4CZKA 2E5LK 4KV8A 3VA3A 1KSPA 2HNYA 1KTQA 3D6RA 5AQKA 1VSDA 3TAPA 1QZ6A 4X65K 4CF9A 3D2FB 4TSXA 5J1EA 1OH6A 3OW2M 1WAFA 4A61A 3ZEUB 5GAHP 2H3GX 1EP4A 3NMUA 1S1TA 1LW2A 3TTCA 3WEEB 4KAZA 2G8FA 4FJIA 4I6MA 4RG8A 3TSQA 4B8AB 3HJFA 3BF3A 4DR3K 3QO9A 3ZSXA 3MCAB 4CFCA 2FBXA 3O4WA 4GY2B 4ISEA 2OYQA 1EX4A 1SKWA 3CI5A 3NHGA 2NNWA 2WUSA 4FWRA 4H0YB 4K0KK 2Q1NA 2A5XA 2G8HA 4BRQA 3ASMA 3WQTA 5ELZA 1KAZA 2YHWA 4FLZA 4Q5VA 4E7LA 5JS1A 2ZM6K 3HVRA 4K41A 4DLGA 4DF4A 1VRTA 2QTDA 4YHHK 1JCFA 3VERA 3SYZA 3NH0A 4KTQA 4BREA 3VQCA 3IDHA 1DT9A 3SLCA 4EP5A 1BIZA 4LSNA 3TR8A 3OVNA 3E01A 3J7ZO 4PL8A 2OPPA 3PY8A 3K9KA 2WTUA 4LD0A 4LC9B 4K8XA 3DRSA 4GV3A 5AQFA 3IFRA 1BU6O 3CJ1A 5CE3A 2VWKA 2HNZA 3I0RA 1P8ZA 3LWMA 4FLTA 4W5TA 3WNEA 3DLEA 5BPLA 3MCPA 3MWPA 3RMCA 1J53A 4QOZB 1G15A 1LWFA 4CZFA 4CZEA 1QSYA 2BGGA 4KHYA 4O4GA 1TVRA 3DLBA 1RT1A 3IKMA 4DFPA 1N6QA 4CECA 3V4IA 3MEEA 5C25A 4ID5A 3AVCA 2Y1JA 3KK7A 1NKCA 4Z4GA 3AO3A 4OPJA 1J6ZA 5J2QA 1WSHA 1QS4A 3CMAN 1BI4B 2QWPA 3ZETB 3LP0A 1S6QA 3IG1A 3HVTA 4F3TA 4FJXA 1NK4A 3VF2A 2G8KA 3QNNA 3RR7A 1WSJA 3V1RA 4DV5K 3CXCM 1W97L 3C94A 1WSGA 5LMNK 4JKEA 2ASOA 1TAUA 2X6SA 4KBOA 4FZYA 3HM9A 2WFBA 4M45A 3CHWA 2P9LB 3AVLA 4C1NK 5J2MA 3DXKA 3HP9A 1JLAA 4WYBA 4F9OA 1TKXA 5BRFA 1C0MA 1XMOK 2YJFA 5BPNA 5AQWA 4H0OA 3CJ7A 4FPAA 1NK6A 2V7YA 5IT9O 5GIOA 1RDDA 4IG0A 3C65A 1QQOA 4CJKA 3PX4A 3F2KA 3HK2A 4U67L 3LDSA 2OTLN 2DTUA 1SUQA 5A2QO 4FJ9A 4LY7A 1X1PA 3VQ6A 4MO4A 4WF9L 3M8QA 2YNFA 2Q31A 3U4LA 4RW9A 3V1QA 4NYNA 3AVAA 3SK3A 2IOCA 1A5VA 1C1BA 1KFDA 4AM6A 4I6MB 3V81A 1VQ6N 4DSFA 2JWKA 4EIAA 4FOIA 4FCYA 1HPZA 1S1WA 1RFQA 1X9JA 2CH6A 3C6UA 3MDQA 2ZD1A 3SPYA 5AJ3K 4WCEL 4CGHA 2NUBA 1QHAA 3TAQA 3OYEA 4DR2K 1NK0A 3EZWA 1LWCA 4KRFA 4DV0K 4YORA 5AQIA 2Q3SA 3KLIA 3EYZA 2W40A 1HKGA 3MN9A 1IKWA 2YHBA 5JLFA 3V9SA 5EU7A 4BR9A 2D0AA 3LDPA 4DG1A 5KTQA 2ZGZA 2E6LA 1Q7YO 2XO7A 4B1VA 3OBWA 1OH8A 3U8XA 4DTXA 5AQGA 4DS4A 4H8KA 4MDBA 4X64K 2HF3A 3HYFA 1QHTA 3VEWA 3B6PA 3AO4A 4DSEA 3IUCA 3TI0A 3EO3A 4FK4A 4FXDA 4CJ7A 1JXEA 3AVNA 5B8HA 2P51A 1NMNA 1BGXT 5AFUH 3K5NA 1VK0A 2A1RA 3AGKA 2G8VA 4FW2A 2ITGA 2IC3A 4BVPA 2Z1GA 3OTOK 3TU5A 4CEEA 3RRHA 4FM0A 3PO5A 3AY9A 4B9VA 3AGRA 3AVHA 4C8MA 4I9QA 1NJWA 3QEXA 4B3OA 1ATRA 2RF2A 3K2PA 1H1VA 4JI2K 4YOTA 3OY9A 4AHSA 1JL2A 5HL7L 4B9NA 4KHQA 4CK3A 3ATUA 3WXIA 4PL7A 3W0LA 1VQ4N 2CGJA 4JI8K 4R5PA 2PAVA 3H6EA 4DSLA 1VSMA 2QWMA 1JLEA 2Q2RA 1YTUA 3DJCA 1S1VA 4CHOA 1S9GA 2NRRA 2D5RA 4YOUA 2FC0A 4BR7A 4OLBA 1KAXA 3IMXA 3O1BA 2QWRA 4FJNA 4DU4A 2HHVA 3AA3A 5EXWA 3G25A 3WNGA 1RTDA 5AQNA 1K9MO 1EO1A 3PX0A 5CYMA 4F8RA 3FZFA 3ZCMA 3U9DA 2NRVA 3THVA 3OYBA 3CCLN 2GTDA 4IEEA 1SL2A 2P9KA 3CETA 3DMJA 3DXKB 4IOXA 3CG7A 4IJNA 3GOIA 3CCRN 3VOVA 1I94K 2ZJQL 5F1XA 2FSJA 3UKRA 4PQUA 4AHCA 4BRKA 3LM2A 3VGKA 4X66K 3NCIA 2KZZA 5AQUA 1QQCA 2P9PA 1VQ5N 3EN9A 1KVCA 2JGUA 1WSFA 3ZYYX 3HTVA 4CJRA 3SPZA 1IBKK 4JI3K 2AJQA 5EVZA 4FWSA 4DFKA 4B9MA 2E8AA 2QWNA 2OANA 3ZT2A 4FLYA 2BDPA 4B9UA 2VCPA 4JAXA 2G8WA 3ENHA 1HMVA 4AH9A 1QE1A 1V4SA 3MAQA 3OBYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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