3VPZA

Crystal structure of glucokinase from antarctic psychrotroph at 1.69a
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
QFDPILVADIGGTNARFALITAFDAAKNEFVIEYNHTFPSADFGSLQNATRHYLSTVPHIKPVRACLAVAGPIKAGQVHLTNLGWHFSVSEFKQAFSFLQLEVINDFAAFAYAAPYLDSNQNVVIKAGQADENSNIAVMGPGTGFGAACLVRTAQSSAVLSSEGGHISLAAVTDLDAKLLIELRKEHPHVSLETVFSGPGIAHLYKAMAAVNGITAKHLDAAQISNLANTGECEVCDATLNQFCDWLGSAAGDLALAYGALGGLFIGGGILPRMQSRLLESRFVERFSQKGIMSQYNGQVPVTLVTQDNIPLIGAAACLHNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Crystal structure of glucokinase from Antarctic psychrotroph at 1.69A
rcsb
source organism Pseudoalteromonas
total genus 103
structure length 322
sequence length 322
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vpzA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vpzA02
1SAZA 1Q18A 3QICA 2I7PA 4FO0A 3WQTA 3KZBA 1NGHA 1NGCA 4FSVA 3QBWA 4CZEA 4CZGA 3VEWA 3VERA 1JCGA 3D2EA 5ELZA 3I8BA 3UE5A 3O4WA 3VENA 3QFPA 3S41A 1D4XA 3VGKA 5TKYA 4HTLA 1X9JA 4MLHA 4BRLA 1ZBSA 4BGBA 1DKGD 5AQLA 2YJEA 4QS7A 2D0OA 1NMDA 2HF4A 3CQXA 3MN7A 5BN8A 3CIPA 1BO5O 1QHAA 5AQVA 1HUXA 3LM2A 3CJ9A 4A2BA 2V52B 4FWOA 3IFRA 1GLFO 1MWKA 3FLCO 2QWMA 5AZJB 2IIRA 3AAPA 1TYQA 2E2OA 3B8AX 3H3OB 3FZHA 3QB0A 3CJCA 4B1YB 4XH5A 4BRHA 2PAVA 4FWQA 4KBOA 3VESA 4PL8A 1BUPA 2CH6A 4JD2B 2GUPA 4DQ8A 4JHDB 4CZHA 4J8FA 3UKUA 4FWKA 5AQHA 2ITMA 5KQDA 1T44A 3D7EO 2P9LB 2GWKA 4EFHA 4BR2A 3UB5A 4IO8A 1BA1A 1RGIA 5LJVA 4ISGA 4FWNA 1BU6O 4BR0A 3OHRA 5FPEA 2AA4A 5AQUA 5EY4A 2E2NA 2P9UB 3C7NB 4IWVA 4H5VA 4WQ5A 3O80A 3WUHA 3SK3A 3R6MA 4K43A 4FWRA 5AQJA 5ADXA 4CZFA 5F1XA 4I6MA 4A62A 1V4SA 1BG3A 1NBWA 2P9IA 3VGMA 1E4GT 4MLEA 5KPZA 1Z6RA 1KAYA 4WQ5C 2YI1A 1NGJA 3U9DA 3R9PA 4H5TA 4BRAA 3VEOA 3EN9A 4H0TB 2Q2RA 4MO5A 2E1ZA 3TPQA 4CBUA 2QWQA 1NM1A 1Y64A 3CERA 4EHTA 2IVNA 2NLXA 4B9QA 3VEXA 4IJNA 1BDGA 5E26A 3RSEB 1C0GA 2EWSA 4FOEA 4NO7A 1T6DA 3BEXA 1MWMA 1LCUA 3ENHA 3I33A 2F9TA 3HZ6A 4BRFA 3O1BA 3GL1A 4BRKA 3WXJA 1BA0A 1QZ5A 2A6AA 5EXWA 3VOVA 5AQIA 1XQSC 4AM7A 3AARA 1YAGA 3WT0A 1CZAN 3ULEB 2Q36A 5KPTA 1YXQA 5JLFA 3KVGA 5CE3A 1HJOA 2FLOA 2HOEA 4NB4A 5FPDA 1NGIA 2D1KA 2A41A 4ISEA 2Q0RA 2J4RA 3DAWA 3ZETB 4H5NA 3W0LA 2QWPA 2QM1A 2F9WA 2ZGYA 3H1VX 2FF3B 3GG4A 3FFKB 5BN9A 4H0OA 2P9PA 5F2RA 4BR4A 3M3ZA 4FPAA 3A0IX 4BRCA 1EQYA 1GLJO 4CD3A 2IVOA 4XH1A 2D0PA 5BPMA 4ISFA 4XEIA 3HSCA 4RWTA 2I7NA 4H0VB 5ADXH 3O1WA 2Q1NA 3H6EA 2V7ZA 4IZ9A 5AQFA 3WEEB 4O8KA 3ZEUB 4MO4A 5JLHA 2YHXA 5LJWA 4FWSA 4YDUA 4K41A 1NGBA 3MN6A 4EAHD 2YCHA 4FL9A 4CBXA 1RFQA 1X3MA 3KHYA 4FWLA 3CJBA 4BREA 3MCPA 1E4FT 2UYTA 4Z94A 2AP1A 4BQZA 1K8KB 3MMVA 3F9MA 2YJFA 5B8HA 2ASOA 4B1VA 4BRIA 5F0XA 2VWBA 3VEZA 3SLCA 4O5FA 3EO3A 3ATVA 3ENOA 4H5WA 3A5NC 1KXPA 2A5XA 4CZLA 4IXCA 2D4WA 1T6CA 5AZJA 1R59O 5AQPA 5JMVA 3VETA 5AQYA 1DEJA 4BC4A 5BPNA 5BR9A 4H0PA 2VCPA 4H03B 4AM6A 5LY3A 4B1WB 1ZXOA 4BRMA 1U6ZA 3WXIA 3ZX0A 1QZ6A 4BR5A 4I6MB 3LDNA 4C23A 2QWLA 1NLVA 3FZKA 5AZIB 3WQUA 2P9LA 2ZF5O 1ATNA 2P9KB 3HI0A 1SZ2A 5AQOA 1QQNA 1SQKA 5KPRA 3A5OC 3FR0A 3QFUA 4Y0WA 5BPLA 3HM8A 2P9UA 3LL3A 3DJCA 2CGJA 3C7NA 4BC2A 2CGKA 1KAXA 3FGUA 2FXUA 1HLUA 3A5LC 2P9NA 2P9SB 4LC9B 4PKIA 2BTFA 2QWRA 3JS6A 3O08A 3ID8A 4FWPA 3CJ1A 3D2FB 4M7YA 4WYBA 3AAQA 1NGGA 2QW9A 4M7XA 2E20A 3DXKB 1BOTO 3FE1A 3EKSA 2QWOA 1U2VB 4WQ4A 3CHWA 1YVNA 4BRQA 4DCHA 2Q97A 4BQLA 4BGAA 4HWIA 2ASMA 4CZJA 1J6ZA 4BC5A 5AFUH 4BG8A 1QQMA 4BC3A 2CGLA 2WUSA 1DGKN 5AQQA 5AQTA 2FSJA 1GLEG 2BUPA 1HKCA 3M1FA 3BF3A 4BRDA 3D2EB 2VYPA 4PKGA 1BWFO 3H45C 3SMSA 2PBDA 2YHWA 3UKRA 3EL2A 1NGEA 3EZWA 3VEYA 3U8XA 4BR9A 5AQMA 3MK6A 2FSKA 3WXLA 3LM9A 2GEMA 2E88A 3DXMA 1ATSA 3JXUA 5EVZA 3C0BA 2GWJA 3EKUA 2HF3A 3H46O 5BRDA 2QXLA 1GLAG 3J8AA 1S22A 3L0QA 2DPNA 4GY2B 4PKHA 4B1ZA 3FZLA 3SMPA 1TYQB 1V4TA 4BROA 3ZETA 5AQKA 5EOYA 4EIAA 2W40A 3CJ7A 2ZWHA 3IUCA 1KAZA 3CI5A 5FPMA 2W41A 3H1QA 1C0FA 3BF1A 3GE1A 3H3NO 3WXKA 4JAXA 4B1UB 4XH4A 2E2PA 3UKUB 4A61A 1NWKA 2ASPA 5EX5A 5AQNA 3R8EA 4YDUC 5AQGA 5KQ8A 3FZFA 5AFUA 1QQOA 1XC3A 3LDLA 3ATUA 3L4IA 3MDQA 4DB3A 4EHUA 4CD1A 4BG9A 1ESVA 3ZEUA 3WEEA 2H3GX 3ZX2A 4K25A 4CZMA 3ZX3A 4RTFD 1NGAA 1IG8A 3QMLA 5AR0A 1HPMA 1TUYA 5BRHA 4RCHA 1GLBG 3LDOA 3A8YA 2Q31A 1GLDG 1RDWX 1HKGA 4F9OA 4H0YB 1K8KA 4JD2A 3QDKA 5E84A 3BP8A 4FOIA 4BRPA 4JHDA 2ZGZA 4CZIA 2Q0UA 2E2QA 3G25A 1G99A 3GBTA 1NGFA 3CQYA 1ATRA 2P9IB 3MN9A 2V51B 3VGLA 1WUAA 1XUPO 4JN4A 1P8ZA 2HMPA 1TUUA 3MN5A 4DHYA 2GTDA 4FWMA 1H1VA 4QS8A 3P4IA 3M6GA 5AQRA 4JNEA 4K42A 3W3DA 2NZTA 5AQSA 3O8MA 3VF2A 2KHOA 3LDPA 3O5BA 5AQWA 3CJAA 4PL7A 4BVPA 4GNIA 2A40A 3U4LA 1X3NA 2IVPA 2P9NB 1MDUB 1Z05A 3AY9A 1YUWA 3VF6A 5BRFA 1MA9B 3SJHA 3O6WA 3U9ZA 4E1JA 1GLLO 2CH5A 5AZIA 2NRHA 2OANA 3VPZA 1NGDA 1LOTB 3A5MC 3FZMA 4BVOA 3HBTA 4IJAA 3HTVA 3QBXA 3L6QA 3IMXA 1ZC6A 1WOQA 2P9KA 4H0XB 5I9EB 2FF6A 2E1YA 2GELA 5AQZA 4M63C 4CBWA 2FSNA 2YHYA 2A42A 3GDQA 4L3QA 2QWNA 5AQXA 3GOIA 3IDHA 5JICA 3BUZB 4BR7A 3LDQA 1IJJA 3RSEA 1JCEA 2P9SA 4CJ7A 1HKBA 4BRNA 4WQ4C 1OKJA 3UKRB 2V7YA 2P9PB 1HX1A 4QS9A 3D2FA 4B1XB 4H5RA 3VF4A 1S3XA 3DXKA 4A2AA 3CETA 3DXMB 3TU5A 4CZKA 1U2VA 3VEVA 2A3ZA 4CI6A 4FPBA 5BREA 1JCFA 4BRGA 1GLCG 5FPNA 3ULEA 2E8AA 3DWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BDYA 4DTNA 1O13A 2I7PA 4B8CA 4C8OA 1VQ9N 4OLBA 1SV5A 1UA0A 4FO0A 4CZEA 3VERA 4FJGA 1JCGA 3UE5A 1FXXA 3VENA 3CF5L 4M3ZA 1VSIA 5J2NA 5TKYA 4Y1DA 1NK6A 1DT9A 3ZT3A 2GUIA 4JS5A 3HPHA 1RNHA 2YKMA 3V9WA 3S3MA 4CGIA 3OYAA 2YNGA 3MN7A 3CIPA 4FJIA 3CJ9A 4DTPA 3CCMN 3H08A 3IFRA 3HP6A 4CJQA 3QB0A 1KCFA 3B8AX 4DV1K 1ASWA 4NXMK 4EZ9A 1RTHA 1SL0A 1BL3A 4Q0BA 3VQCA 2PAVA 4FWQA 5JS1A 1BUPA 5HLFA 4DTOA 2W42A 3TAGA 2GUPA 1D9DA 1RTJA 3ZSQA 3PV8A 2G8FA 3LP2A 5AQHA 1SKSA 2P9LB 1VQNN 3SZ2A 2RE2A 4MDBA 3SAGA 3G6EN 4OO1J 1EWQA 1N6QA 2HHUA 4FWNA 4E1NA 5FPEA 3OHRA 3LZIA 2AA4A 1VQON 4Z4GA 5AQUA 3K9KA 4RW4A 1CLQA 4H5VA 4I9LA 4M3WA 1S5JA 4DR1K 3WUHA 5GADP 3SK3A 4KHNA 1J5OA 3SBTA 4A59A 3RMDA 4A62A 4KHUA 1V4SA 4GKKK 4KAZA 1C1CA 4MLEA 4DLGA 3HRGA 5KPZA 3TI0A 2FBTA 4AHRA 4KHPK 3TTDA 1Y64A 3R3LA 3NH1A 1BDGA 3WNGA 5E26A 1QQCA 2RN2A 4OKJA 1S9EA 4FOEA 3WNFA 3BEXA 3I33A 4K8ZA 2F9TA 4BRFA 4BRKA 3GL1A 1YJ9N 3WXJA 1BA0A 2XO7A 2YHBA 1C1BA 1ASUA 3QO9A 3AARA 2O4GA 3KWGA 4RW7A 4DMNA 3AO2A 3CPWM 5JLFA 1NK4A 1HJOA 2HHWA 1YF5L 4ISEA 3MX2A 2J4RA 4YOUA 4H5NA 3JYTA 1TV6A 2QWPA 3THXB 2A1SA 2F9WA 2ZGYA 1TK5A 5M1FA 5F2RA 4DQPA 1YT3A 4ILJA 1QSSA 1KTQA 4BRCA 4ILGB 2XY6A 3VA3A 2IVOA 4CE9A 4CIGA 3TAQA 1KQSM 2DFFA 5AQFA 4O8KA 4MO4A 1KC8O 3AVMA 4YDUA 5AJ3K 1VSDA 4DQRA 1NGBA 4HVJA 4EAHD 5HRRA 2QXFA 2YCHA 4CHYA 3CC2N 1NMNA 1X3MA 1VQ5N 3HO1A 4FWLA 3THWB 3V9SA 5HP1A 2AP1A 3E9LA 4BQZA 3J80O 3F9MA 3CFRA 2YJFA 4B1VA 4HUGA 1N32K 3KIOA 3V4IA 4OJRA 3IAYA 4H5WA 3SUNA 3A5NC 4FK0A 2HB5A 1BIZA 1K73O 5A2QO 4DWIA 2D4WA 1T6CA 5DMRA 3OS2A 5AZJA 4KREA 3O3GA 5AQYA 4DR4K 2X78A 5BR9A 2VCPA 3THYA 3OYHA 2VQFK 4AF1A 1KSPA 3ITHA 3KLFA 1QZ6A 1DLOA 4GVMA 4BE1A 1RDAA 3NF7A 4CJRA 3WQUA 3B6OA 1LV5A 4KI6A 3OYIA 4BDPA 2NRXA 1ATNA 1RILA 1N34K 1RDCA 1OVQA 3O9RA 3DLLL 3QFUA 4Y0WA 3MECA 1YTUA 3HM8A 1JLGA 2P51A 4DFMA 2YV0X 1I94K 4CJ3A 3NE6A 1C0UA 2A1RA 4AHCA 3A5LC 3DOLA 4B08A 4F2RA 3ID8A 5JVHL 4W5TA 3KK3A 3D2FB 4WYBA 1HR0K 1NGGA 1TKXA 5BR8K 3ZLJA 1BOTO 4N56A 3SJJA 3NFAA 2O8DB 1U2VB 4BE2A 3OYMA 1QE1A 1IV0A 4BRQA 2F4VK 3T1YK 4O5BA 3MXMA 2ASMA 2ATQA 4CFCA 3DI6A 4WF9L 3IG1A 2YNHA 4Z0UA 4ZTFA 5CYMA 4FVUA 3THVA 4C8KA 1GLEG 1IBKK 3CC4N 3BGRA 2JLEA 4BRDA 3M8QA 2Y1JA 2VYPA 1A5VA 4DTXA 2PBDA 3OJUA 2WTUA 3U8XA 4BR9A 5AQMA 1VSJA 2DFHA 3LM9A 4DR3K 3A2FA 4CF9A 3C0BA 3OTOK 4IDKA 4JKAA 1WAFA 1RT1A 1WLJA 3ZCMA 4GV6A 4UY8O 4RW9A 5KRSA 4FJXA 1HQUA 3SUOA 4M3RA 1HNXK 3I56N 1BI4B 2OTLN 3DOKA 4HUFA 4KHQA 1KAZA 1KD1O 3CFPA 1C0FA 3GE1A 1RBSA 4JAXA 2OYQA 3C95A 3TAMA 4CEBA 3RR7A 4DTSA 1YI2N 3R8EA 5H1SQ 5AFUA 1QQOA 1XC3A 1JXEA 4EHUA 1Q86O 4CD1A 2X6SA 3QEIA 1QSLA 2BGGA 3CD6N 4GW6A 4O44A 3WEEA 2H3GX 3ZX2A 3VA0A 1YTAA 3V1QA 4FZXC 5SWMA 2E5LK 3U3GA 1L3SA 1TUYA 3SV4A 1QVFM 4RCHA 1S6QA 4I7FA 4NXNK 1ASVA 1VSKA 1RDWX 3ZT4A 4H0YB 4JI6K 4JD2A 1JKHA 3BP8A 4FOIA 5DM7L 2ZGZA 3VQ7A 2KFNA 3NCIA 4JK7A 1ATRA 1XUPO 3MXJA 4LH5A 2KKZA 3MN5A 1TUUA 3V9ZA 4FWMA 4FZZA 3L8BA 3M6GA 5AQRA 3O8MA 3VF2A 1FJGK 1HYZA 3O5BA 5GINA 1T05A 3CJAA 3ZT2A 4BVPA 3J7AP 4R79A 4QCLA 3U4LA 1L3UA 1X3NA 2HNDA 4M3TA 1MDUB 1Z05A 2RPIA 3VF6A 3O6WA 5KGXA 4RW8A 3OYNA 3KTQA 1WSFA 3T7ZA 1GLLO 4CGJA 3E01A 4LF8K 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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