5AQOA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqoA04
4AM6A 1GLLO 2KHOA 4BRLA 4CZFA 5AQMA 3VEWA 3DXKB 4WQ5C 3EKSA 1QZ5A 3A5MC 1WOQA 3S41A 3GBTA 3ZEUB 1BG3A 2Q0RA 3HBTA 2P9PB 2E88A 3LDQA 3EN9A 3I8BA 3FZHA 4H5TA 4CI6A 1ZXOA 4M63C 3WXLA 1SZ2A 5BRHA 3CJ7A 2FLOA 3QBXA 4CZEA 1RGIA 2CH5A 3CQXA 2VYPA 1R59O 4H0TB 4BRCA 3O80A 4BRDA 1BWFO 4CZKA 5FPDA 2V52B 4H0OA 3OHRA 4JD2B 1ZBSA 2V51B 4H0YB 5AQLA 5B8HA 3A0IX 3A5LC 1GLEG 3AAPA 4JNEA 4RTFD 4B1YB 4YDUA 4Z94A 5AZJA 1BA1A 4BQLA 5TKYA 2ZWHA 2PAVA 4O8KA 2VCPA 5KQ8A 1KXPA 2YI1A 2YHXA 4WQ5A 3ZETB 1OKJA 3UKRA 3A8YA 3WT0A 1SAZA 4I6MB 4DCHA 4BR4A 3FLCO 4Y0WA 5ADXH 4H0XB 1DKGD 3O6WA 5EX5A 3U9ZA 4BR7A 2GWJA 4AM7A 4ISGA 4GY2B 2P9SA 4XH4A 4KBOA 1S22A 3WEEA 1GLJO 3CJ1A 4H5WA 5BPLA 2P9UA 3H3NO 1GLFO 2P9NB 4BGAA 1HX1A 1GLDG 3GE1A 2P9LB 3LDOA 4IJAA 1BOTO 3D2FB 2IVNA 4LC9B 5AQSA 4H5NA 4E1JA 3QFUA 1U2VB 1NGEA 2ASMA 1NGDA 3J8AA 2A41A 3JS6A 5I9EB 4CZIA 1CZAN 2ZGYA 3CERA 5JMVA 1G99A 1RDWX 5AQYA 1XUPO 3QBWA 2A6AA 4ISEA 5LJWA 5AQNA 4H03B 1SQKA 2NZTA 4WQ4C 3ATUA 5AR0A 3TU5A 4QS9A 3VENA 5JLFA 1NGIA 2P9KB 4BQZA 3UKUB 3MK6A 4BGBA 3L4IA 3DWLA 3SLCA 3MDQA 4HWIA 5E26A 4PKIA 4K41A 1IG8A 1K8KB 5AZIB 2IVPA 1QQNA 4QS7A 3M3ZA 4BR2A 1Z6RA 3HSCA 1LCUA 4B9QA 4M7XA 1QQOA 1MDUB 4FWSA 1ATNA 4CZLA 1Y64A 3FR0A 2YCHA 2BTFA 3JXUA 1QZ6A 3DAWA 1NGCA 1S3XA 1NGHA 2GEMA 3VEOA 2GUPA 1NGJA 3KZBA 3VF6A 4IO8A 4NB4A 2QM1A 4JHDA 5KPZA 3SJHA 3W3DA 2BUPA 4B1WB 4YDUC 1GLBG 3FGUA 4BC5A 4FSVA 1T6CA 4IXCA 3FFKB 3I33A 1NLVA 5AQVA 3DXMA 3ENOA 3GDQA 3SK3A 4BR9A 2CH6A 2H3GX 3QICA 2NLXA 4H5RA 3BP8A 4BREA 4H5VA 3O1WA 4O5FA 2A42A 5AQHA 2P9IA 1DEJA 1LOTB 4MO5A 5JICA 2E1ZA 2FXUA 5AFUA 5AQFA 1H1VA 3GOIA 4HTLA 1T6DA 1U2VA 3CI5A 4A2AA 3IDHA 4FPBA 2A40A 4RWTA 4EIAA 4FWLA 2F9WA 3VGKA 2I7PA 3H3OB 4B1VA 2GTDA 3A5NC 3L0QA 3TPQA 3W0LA 3MMVA 5KQDA 4EHTA 3M1FA 3VGMA 3R9PA 1YVNA 4BR5A 5BPNA 5ADXA 3FE1A 4PKGA 2W41A 3LM9A 1HUXA 2I7NA 5KPTA 3RSEB 3UKUA 1V4SA 3MN6A 3LDLA 1NGFA 3HTVA 2FF6A 1TYQA 2AP1A 3C7NB 2QXLA 3FZKA 3BUZB 4MLEA 4IJNA 1GLAG 5BN8A 3ATVA 2YHYA 2W40A 2Q36A 4L3QA 4BC3A 5BPMA 2E2QA 1P8ZA 4XH1A 5CE3A 4CZGA 4BRAA 4DHYA 4BRIA 2FSNA 4FWKA 3VEVA 3VPZA 3ZX2A 2AA4A 2E1YA 4BROA 2ITMA 2WUSA 1GLCG 2D1KA 2QWMA 3FZMA 3UE5A 3H6EA 3D2EB 1MWKA 2D0OA 3VEYA 3VOVA 4B1UB 3M6GA 3EL2A 5AZJB 3AARA 3CJCA 1BU6O 3KVGA 3LDPA 4FL9A 5KPRA 3DXKA 1X3MA 3UKRB 2E2NA 4DQ8A 1ATRA 3ZEUA 1HKCA 3SMPA 3FZLA 2P9PA 2D0PA 4EFHA 5AQWA 1TUUA 2CGJA 3VF4A 3LDNA 2E2PA 1JCFA 3WUHA 3CHWA 2P9SB 3WQTA 3AY9A 3QMLA 1TUYA 5AQPA 3WEEB 2QWOA 4FOEA 2IIRA 2DPNA 1DGKN 1E4GT 3WXJA 4EHUA 5BREA 1KAYA 4GNIA 4MO4A 3R8EA 4H0VB 2HF3A 2P9UB 4F9OA 5JLHA 4JD2A 1WUAA 2CGKA 2CGLA 4BRPA 2QW9A 4BC4A 1QHAA 3GL1A 3R6MA 2YHWA 3IFRA 2ASOA 4H0PA 4BRKA 2FSJA 3MN5A 3WXIA 3D7EO 4A62A 5AQQA 1NGBA 3ZETA 4BRMA 3O5BA 1JCEA 4I6MA 5AQTA 4FWPA 2HF4A 3H45C 3VEXA 1HPMA 2QWNA 4BC2A 4BVPA 2Q0UA 1ESVA 2YJEA 4XH5A 3SMSA 4CZHA 2ZGZA 2QWRA 2ASPA 3U9DA 3BF1A 1C0GA 2HOEA 4J8FA 3VETA 3CJBA 5EY4A 3ID8A 3LM2A 2P9NA 2D4WA 2J4RA 4BG9A 2P9LA 1YAGA 3ULEB 3MN9A 3C7NA 3D2FA 5AQZA 1IJJA 5F0XA 4FWNA 2E8AA 3F9MA 4PL7A 3VGLA 3O1BA 2E20A 4NO7A 5AQUA 5AQGA 3CJAA 4K42A 4IWVA 3EZWA 1BDGA 5BRDA 3O4WA 2A5XA 2QWQA 3A5OC 3KHYA 4K43A 3VESA 1BO5O 1J6ZA 2Q97A 5AQIA 4PL8A 4B1XB 3AAQA 5AFUH 3H1VX 5EOYA 4FO0A 1NBWA 4MLHA 3D2EA 4EAHD 5BRFA 3U4LA 2QWPA 3UB5A 5E84A 2P9KA 3HZ6A 2GWKA 5LJVA 5FPNA 4CJ7A 1NGGA 2EWSA 2Q31A 4WYBA 2YJFA 2UYTA 4B1ZA 5ELZA 4JHDB 3VERA 5AZIA 1K8KA 3LL3A 3HI0A 3O8MA 5AQRA 5F1XA 1HKGA 1BA0A 2HMPA 4CD1A 2GELA 1NWKA 2V7YA 2Q2RA 3DXMB 3WXKA 3EKUA 4FPAA 4A61A 4CZJA 3GG4A 4QS8A 2FF3B 3L6QA 3ZX3A 1XQSC 3C0BA 1YXQA 3IUCA 2IVOA 4IZ9A 3P4IA 4BR0A 2FSKA 3BF3A 4PKHA 4BVOA 1X9JA 1NMDA 2P9IB 1HJOA 4BRNA 3ENHA 3QB0A 4RCHA 3CIPA 2QWLA 3O08A 3H1QA 1T44A 4CBUA 3BEXA 4FWQA 3DJCA 4BRGA 1JCGA 1RFQA 3EO3A 2F9TA 3H46O 1MWMA 5FPMA 5BR9A 4M7YA 3IMXA 3VF2A 2ZF5O 4BRQA 1BUPA 2V7ZA 1MA9B 3MCPA 1V4TA 2NRHA 5EVZA 1D4XA 1X3NA 2VWBA 3B8AX 3CJ9A 5AQKA 1C0FA 5AQXA 1HLUA 3FZFA 4K25A 4CBWA 4JN4A 1E4FT 3CETA 2E2OA 3ULEA 3ZX0A 4CZMA 3G25A 1KAXA 1Q18A 4JAXA 4C23A 3QDKA 1NGAA 1TYQB 4BRHA 4CBXA 4BG8A 5LY3A 2PBDA 4FWRA 5FPEA 4XEIA 1HKBA 5AQJA 3CQYA 3QFPA 1NM1A 2Q1NA 1EQYA 3VEZA 4WQ4A 4DB3A 4FOIA 5AQOA 4BRFA 2A3ZA 1ZC6A 1ATSA 3MN7A 1QQMA 1KAZA 1XC3A 1YUWA 3RSEA 3U8XA 4CD3A 3WQUA 4ISFA 5BN9A 5F2RA 1U6ZA 3HM8A 4A2BA 4FWOA 2OANA 1Z05A 4FWMA 5EXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MXIA 4KYPA 3AVMA 2KQ2A 5CZ2A 1EO1A 1QZ5A 2N2RA 1W7AA 4NXMK 3KLHA 3LDQA 3EN9A 3I8BA 3FZHA 3V9ZA 4H5TA 4CI6A 1ZXOA 1FXXA 1WSHA 4E7IA 1RGIA 2XHBA 3KK2A 2RF2A 3KK3A 4OLBA 4NLCA 1BWFO 1B92A 2O8BB 1JLEA 2ZJQL 1GLEG 4RTFD 2UXCK 4BQLA 4O8KA 4DTPA 2KFNA 1KXPA 2VG6A 2YI1A 1VSMA 2YHXA 4AHUA 3K5OA 3MWTA 3MEEA 4IOXA 4NCBA 2RKIA 2E5LK 4BR7A 4AM7A 4DV2K 3HO1A 1TL1A 4J2BA 3MX5A 4ISGA 3G0ZA 1KCFA 2DFFA 3CQ8A 4KBOA 2P1JA 3WEEA 3AA2A 5J2MA 5C24A 3LPTA 3GE1A 4F8RA 4MDAA 3NBPA 1BOTO 3THVA 2GX9A 3CM6A 3VQEA 5AQSA 4H5NA 4CJ3A 4E1JA 3M8RA 3S9HA 4Z4EA 3L2WA 2XY5A 1ZBHA 5EU7A 2A41A 3JS6A 5I9EB 4CCHA 1CZAN 3L8BA 1G99A 1RDWX 1WBBA 1EKEA 1XUPO 1HNZK 4IFVA 4CJKA 2HSTA 5AQNA 4H03B 1KD1O 4DTXA 3ATUA 2OTLN 4B8CA 3CPWM 5JVHL 5CR4A 4AEIA 3UKUB 4CERA 3QETA 4CJSA 2YBRC 3DWLA 3CMEN 4HWIA 1S1TA 5AZIB 1NMNA 2IVPA 4GKKK 4I9QA 1B7DA 2NY8X 3HOTA 3KKRA 1I6FA 1C55A 2ATBA 3PLAA 4QS7A 3F5TA 4M3ZA 3VTIA 4BR2A 1RT4A 1YI2N 4XJXA 1ZFUA 1WB9A 1BCGA 4AHTA 4OPAA 3THWB 4B9QA 3BZKA 4M7XA 3CFRA 4QCLA 3J7YP 3R3LA 2Y1JA 1C56A 3QESA 1C0UA 4PWDA 3JXUA 3K57A 5CHIA 1CXQA 2ETJA 3P83D 1WSEA 4O8UA 1WWNA 4JHDA 1D9FA 1J53A 3SJHA 3W3DA 1R0AA 1N34K 1NRBA 3OYIA 3FGUA 4OGCA 4FSVA 1T6CA 3VQCA 4BC5A 4HVJA 3F9KA 1W97L 3I33A 3AO4A 4EP5A 2IDOA 4BR9A 2N66A 1RBUA 1K6YA 3QICA 2NLXA 4CJPA 3ITHA 3KLEA 3QEIA 4O5FA 4O55A 1RTDA 2A42A 2D56A 3T1AA 1YJNN 1DEJA 4W5QA 1LOTB 1B9DA 3PO5A 4CGJA 4K8XA 3N4QA 1H1VA 3GOIA 4HTLA 1DTTA 2ASCA 1U2VA 3IDHA 1TVRA 4IG0A 1HMVA 4PY5A 4CFDA 2I7PA 3ZCMA 4FLWA 3TPQA 4JI6K 2AJQA 3VGMA 4BR5A 4R5PA 3AO3A 1LQQA 1WAFA 3ISNC 4AB0A 4M3RA 3AVJA 1S72N 3EZ5A 2I7NA 4GVEA 2X74A 1BIZA 3RSEB 3P5JA 2YHAA 2RPIA 4DKWA 2FF6A 5HROA 3N4PA 4O4GA 3AVFA 4A5AA 4E1MA 4IJNA 2FBXA 5BN8A 2O8FB 1OMYA 2GV9A 1VQ6N 1T8EA 3OYEA 1NE5A 3TWHA 1N5YA 2E2QA 1J5EK 4DWIA 1OH7A 1BQMA 1RDBA 3VPZA 3ZX2A 1PTXA 2WUSA 2D1KA 4DS4A 3FZMA 1L4VA 2X6NA 5GADP 1NKCA 3SQ2A 4KHPK 1NJWA 4W5RA 1QVFM 3VOVA 3O3GA 2VG5A 1U49A 4U67L 4FL9A 3DXKA 1X3MA 3UKRB 4GV3A 1ATRA 4E7HA 3MCAB 1HKCA 3THXA 1VRUA 1GOCA 2P9PA 4KAZA 2FBVA 4B9SA 4EFHA 5AQWA 1QSYA 1JCFA 3NH2A 2P9SB 1T7EA 3CW4A 3VQAA 3SBGA 1E3MA 4FOEA 4JKCA 1E4GT 5BREA 1TK8A 1KAYA 1TKZA 1I94K 3U3GA 2NRRA 4F3TA 3TTFA 4DTMA 1WUAA 5DM7L 1N32K 2OZMA 3KTQA 3ASMA 3OYKA 4A62A 3E9OA 3QO9A 3ZETA 1T03A 3O5BA 2OTJN 5AQTA 3MXMA 2D0BA 4CGHA 2O4IA 4DSEA 4DTUA 1ESVA 1RT1A 4XH5A 3PY8A 4DV1K 2LY5A 3CCQN 1VSIA 2ZGZA 1FH3A 2P51A 3NDKA 2ASPA 3DLRA 1C0GA 1NK8A 3OYGA 1NK5A 4FK2A 3VETA 3QERA 1SNBA 4BG9A 2P9LA 4F4KA 5KRSA 3D2FA 5M1OA 1IKYA 4GW6A 1XC9A 4KI4A 2E8AA 2LR3A 1NOYA 1IBMK 2E6MA 3SQ1A 2E20A 2HNDA 3L3UA 2HHQA 1CZBA 3EZWA 1KC8O 1BDGA 3O4WA 2A5XA 1HQUA 1Y97A 4F3OA 3O4QA 4LH4A 3KWIA 1BO5O 1J6ZA 5C25A 3OYJA 3VTHA 5AFUH 5EOYA 4ICLA 4FO0A 4DV0K 1GPTA 4EAHD 3SPYA 3HZ6A 2R7YA 3V81A 3ZT0A 4A5BA 3LP0A 4B1ZA 3HXMA 3T7ZA 2HHSA 4CJQA 3E9PA 5FROA 1TL3A 1C1CA 3C94A 3DXMB 2LI7A 2NRZA 4FPAA 3CPEA 1LWFA 4QS8A 4CE9A 4E19A 4W5OA 3NF8A 1XQSC 1MR4A 1TAUA 3TAPA 1NPIA 1ZYVA 2KLAA 1C1AA 3OYHA 3HK2A 2FSKA 3M5RA 4PKHA 4GKJK 1J54A 1F21A 1S5JA 4BRNA 3BDPA 2RN2A 3SAGA 4CVNE 4AAZA 3CIPA 3H1QA 2D0CA 3QEXA 4CBUA 2YIOA 3BEXA 4BRGA 1RFQA 3QIPA 3H46O 5LL6Z 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MXI A;  4KYP A;  3AVM A;  2KQ2 A;  5CZ2 A;  1EO1 A;  1QZ5 A;  2N2R A;  1W7A A;  4NXM K;  3KLH A;  3LDQ A;  3EN9 A;  3I8B A;  3FZH A;  3V9Z A;  4H5T A;  4CI6 A;  1ZXO A;  1FXX A;  1WSH A;  4E7I A;  1RGI A;  2XHB A;  3KK2 A;  2RF2 A;  3KK3 A;  4OLB A;  4NLC A;  1BWF O;  1B92 A;  2O8B B;  1JLE A;  2ZJQ L;  1GLE G;  4RTF D;  2UXC K;  4BQL A;  4O8K A;  4DTP A;  2KFN A;  1KXP A;  2VG6 A;  2YI1 A;  1VSM A;  2YHX A;  4AHU A;  3K5O A;  3MWT A;  3MEE A;  4IOX A;  4NCB A;  2RKI A;  2E5L K;  4BR7 A;  4AM7 A;  4DV2 K;  3HO1 A;  1TL1 A;  4J2B A;  3MX5 A;  4ISG A;  3G0Z A;  1KCF A;  2DFF A;  3CQ8 A;  4KBO A;  2P1J A;  3WEE A;  3AA2 A;  5J2M A;  5C24 A;  3LPT A;  3GE1 A;  4F8R A;  4MDA A;  3NBP A;  1BOT O;  3THV A;  2GX9 A;  3CM6 A;  3VQE A;  5AQS A;  4H5N A;  4CJ3 A;  4E1J A;  3M8R A;  3S9H A;  4Z4E A;  3L2W A;  2XY5 A;  1ZBH A;  5EU7 A;  2A41 A;  3JS6 A;  5I9E B;  4CCH A;  1CZA N;  3L8B A;  1G99 A;  1RDW X;  1WBB A;  1EKE A;  1XUP O;  1HNZ K;  4IFV A;  4CJK A;  2HST A;  5AQN A;  4H03 B;  1KD1 O;  4DTX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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