5AQOA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqoA04
2GWKA 2Q2RA 4JAXA 4BQLA 1BDGA 2CH5A 5BRFA 3MN6A 3QB0A 3EO3A 1OKJA 3O5BA 3AAPA 3MDQA 3J8AA 2FSKA 1RDWX 1E4FT 3HI0A 2Q0RA 4IJAA 2W41A 3UB5A 4M7YA 3W0LA 3UKUB 5LJWA 2CGJA 4CZIA 1BUPA 4BR5A 4CZHA 5AQZA 4B1WB 2GUPA 1NMDA 2F9TA 4B1VA 3C7NA 3EN9A 5AQLA 4FWPA 3DAWA 1Y64A 1ATRA 3LDNA 1BA1A 5AQKA 3A5LC 3QFUA 2GTDA 3L0QA 3HM8A 3FZHA 4FWSA 4BC5A 2A5XA 5EXWA 2A41A 2CH6A 4BRKA 5KQDA 4AM7A 3ZX3A 1G99A 2E2QA 4QS7A 4CBWA 4CD3A 1C0GA 1HPMA 4H5VA 2D0OA 3FR0A 1NGAA 3VEXA 3R9PA 5AQTA 1WUAA 2Q36A 4JN4A 2P9NB 1T6CA 4A2BA 2HMPA 5AQGA 3ZEUB 5JMVA 2E20A 3RSEA 4BVOA 1X3NA 4E1JA 5BPLA 1TUYA 2P9PB 3H1QA 3MCPA 4CZLA 1T6DA 4XH5A 4QS8A 5F0XA 4DB3A 1RFQA 3H6EA 4RCHA 4WQ5C 3MN5A 5KPTA 3CJ7A 4BRAA 4BRDA 2ASPA 3UKUA 3FE1A 1U2VB 4A62A 2ZGYA 4BR9A 5ELZA 2FLOA 1DEJA 3QFPA 1YXQA 3MK6A 3O08A 1KAXA 4DQ8A 4CZGA 4FWNA 2FSNA 2J4RA 4JD2B 1ZXOA 5BREA 2D4WA 2FF3B 4H0PA 4FWLA 1HKCA 2FF6A 3EKSA 1SQKA 3VESA 4H0XB 2VYPA 3BF1A 3VF2A 3VERA 5LY3A 4NO7A 3CQYA 3HTVA 5E84A 3C7NB 3D7EO 1ZBSA 4J8FA 3TPQA 5BRDA 4L3QA 3H46O 1JCEA 4H0YB 1D4XA 4IO8A 1NM1A 4BC4A 3S41A 2P9NA 4FWOA 3ATVA 2DPNA 4RTFD 4YDUA 3ZEUA 4RWTA 3O4WA 1GLJO 2P9PA 3FZMA 3U9DA 3ZX0A 2QWQA 1HLUA 4BGAA 4DCHA 2QWLA 2YI1A 4F9OA 4IXCA 4CZMA 1GLCG 3VETA 3CETA 4BR4A 1WOQA 1U2VA 5CE3A 3M3ZA 1NGDA 5AQHA 1IG8A 2V7ZA 1NGHA 1MDUB 2YJEA 2IVNA 2OANA 2FXUA 4JD2A 4JNEA 4K42A 3R6MA 3WQUA 3GE1A 4PKHA 4BQZA 1NGCA 5AZJA 3FZKA 3W3DA 3DJCA 4H03B 3VPZA 5AZIB 4CZEA 3BUZB 3H3NO 2BUPA 1U6ZA 3LL3A 4BR7A 4BRGA 2E8AA 2GEMA 3ULEB 3LDQA 2NRHA 3AARA 1BO5O 4FWRA 3JXUA 1GLFO 2A40A 2F9WA 1S22A 3EL2A 1GLAG 4FL9A 3KVGA 3L6QA 4H0VB 4K41A 1TYQB 3CJ9A 2I7NA 3D2EB 1ESVA 2E2NA 4ISFA 4C23A 3O1WA 3A8YA 2VCPA 2IIRA 3VF6A 2EWSA 3SMPA 4MO4A 5AQWA 4A2AA 4FSVA 4IJNA 1E4GT 4BR0A 1V4TA 4FOIA 3VEZA 4K43A 2V7YA 3AAQA 1KXPA 1QQNA 4FOEA 1S3XA 3A0IX 5I9EB 1DGKN 1JCFA 3WUHA 2W40A 3WQTA 2BTFA 5AQUA 4FO0A 2I7PA 3U8XA 1NGFA 1ZC6A 4M63C 3U9ZA 1Q18A 4WQ4C 2QWMA 3G25A 3VF4A 2E88A 3H45C 2ZF5O 3DXMB 4H5WA 4BRCA 5AZIA 1HJOA 4B9QA 1ATSA 4H0OA 5AQRA 3KHYA 5AQOA 3DXKB 3TU5A 1NLVA 1LCUA 3ULEA 4I6MB 3GOIA 4CD1A 4BRNA 3VGLA 2QXLA 4EAHD 2QWNA 2NZTA 5BPMA 4BC2A 1YAGA 5BRHA 1QHAA 2P9UB 5AZJB 4FWQA 3JS6A 2Q97A 1HKBA 1TYQA 4FWKA 4WYBA 4XEIA 2ASOA 5E26A 4CBUA 5AQJA 3D2EA 4LC9B 4KBOA 3WT0A 2QWRA 3LDOA 4BC3A 1MWMA 4BREA 3CERA 3IDHA 2YJFA 5AQQA 2Q31A 3ID8A 5TKYA 3SJHA 2HOEA 4IWVA 3D2FB 1BG3A 3WXJA 2IVOA 3FLCO 3LDLA 4H5NA 1X9JA 2P9LB 5KPZA 2ASMA 2PBDA 1NGJA 3MN9A 2YHXA 1R59O 3BP8A 5AQXA 2E1ZA 3A5NC 4FPBA 4HWIA 3GG4A 5BPNA 4BRQA 2KHOA 1BWFO 3CJ1A 2GELA 2P9IA 3WXKA 3DXMA 3QBWA 1HX1A 4BG8A 1QQOA 4A61A 3ENHA 2VWBA 2QW9A 3OHRA 4PKIA 2QM1A 2D0PA 4O8KA 4Y0WA 1XQSC 3UKRA 5AQYA 5AQVA 4QS9A 3ZETB 3DXKA 4NB4A 1HKGA 3GDQA 1YVNA 4PL8A 4XH4A 4XH1A 2HF3A 1T44A 5FPDA 4I6MA 4B1XB 2H3GX 3WEEA 4BGBA 2E2PA 2WUSA 5B8HA 1MA9B 2V51B 2P9UA 5FPNA 1GLLO 5AQIA 1GLDG 4ISGA 2YCHA 4JHDA 4WQ4A 3VEYA 4EIAA 4FPAA 5EVZA 4WQ5A 1V4SA 3IMXA 2FSJA 4BRIA 4EHUA 1ATNA 1KAYA 4AM6A 3DWLA 3CI5A 2Q1NA 1TUUA 5AQFA 3U4LA 4ISEA 4O5FA 1GLEG 4BRMA 3WXIA 3D2FA 2A42A 1H1VA 3VGMA 1K8KA 1QQMA 2P9LA 5AQNA 3MMVA 2A3ZA 5AFUA 3GL1A 4BRLA 4CZFA 2YHYA 3M6GA 4EHTA 3R8EA 4CBXA 3A5OC 1Z05A 4H0TB 3BEXA 4PKGA 3EZWA 4MLEA 2Q0UA 5BR9A 5KQ8A 3GBTA 5EY4A 2P9SB 1KAZA 3B8AX 5BN8A 1NGIA 5LJVA 5JLHA 2GWJA 1SAZA 4BR2A 5FPMA 4YDUC 1NGBA 3AY9A 3CIPA 4BRHA 2HF4A 5F1XA 3C0BA 3FZLA 3QMLA 4K25A 1J6ZA 3ZETA 1YUWA 3I33A 2E1YA 1BA0A 2AA4A 5AFUH 4DHYA 2A6AA 3CJCA 3P4IA 1P8ZA 3WXLA 1NBWA 3CJAA 2P9IB 4BRPA 3O1BA 1X3MA 3HBTA 3VENA 4CJ7A 2NLXA 3H3OB 3IUCA 3O6WA 2YHWA 3O80A 3M1FA 2P9KB 3UKRB 2QWOA 1Z6RA 3LM9A 4MO5A 5AQPA 4MLHA 2V52B 3ATUA 3SLCA 3VEVA 5BN9A 4BRFA 1EQYA 5AQSA 2AP1A 3KZBA 3MN7A 4HTLA 3L4IA 3WEEB 3EKUA 4CZKA 2D1KA 3I8BA 3ENOA 5AR0A 4PL7A 5KPRA 3VEWA 1XUPO 3QBXA 4FWMA 4JHDB 1BU6O 3A5MC 4EFHA 2E2OA 5EX5A 3F9MA 2ITMA 1DKGD 3HSCA 4IZ9A 1NGGA 1C0FA 1QZ5A 5JLFA 1GLBG 4BROA 3QDKA 1IJJA 1MWKA 2IVPA 2P9SA 4B1ZA 5F2RA 3IFRA 1K8KB 4M7XA 3VGKA 1CZAN 3CJBA 3UE5A 1XC3A 3ZX2A 1RGIA 3CQXA 4CI6A 2PAVA 2UYTA 3O8MA 4B1YB 3HZ6A 3FGUA 5ADXA 2ZWHA 2CGKA 1NWKA 1BOTO 1QZ6A 3VOVA 4BG9A 1HUXA 2P9KA 4Z94A 3FFKB 2ZGZA 3LDPA 4GY2B 3SMSA 1JCGA 3FZFA 3BF3A 3VEOA 4B1UB 3H1VX 5JICA 4GNIA 3CHWA 1NGEA 5EOYA 4CZJA 4H5RA 1LOTB 2CGLA 5ADXH 5AQMA 1SZ2A 4BVPA 3QICA 2QWPA 4H5TA 5FPEA 3LM2A 3RSEB 3SK3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OPPA 2Q2RA 1I2UA 1BDGA 1JKHA 4JKGA 3ZSOA 5BRFA 3QB0A 3EO3A 1OKJA 2VWJA 1RDWX 1E4FT 1AHOA 3OYDA 5GADP 3RVCA 4CZIA 2O8EA 4KH4A 4BR5A 5AQZA 4DU3A 1NMDA 2F9TA 5AQLA 1TL1A 3K9JA 4YNQA 3CQ8A 1BCGA 3IKMA 2IC3A 4CJ3A 1BA1A 1SKRA 3HM8A 4Z4FA 3VQEA 4FWSA 4BC5A 3VMFB 1DTQA 3SQ0A 5JENA 3J7YP 5EXWA 4FJGA 3D6RA 1MR4A 1G99A 3DRRA 4QS7A 1BQNA 4H5VA 3B6OA 4PA1A 1EP4A 3LAKA 1RNHA 2D0OA 3C65A 4JRQA 2UXDK 1O1WA 3LP0A 3R9PA 3VEXA 3M8QA 5AQTA 3ISNC 4GVMA 4CK1A 2O8FA 1WWNA 2LY5A 1SL0A 5JVGL 1T6CA 3AO5A 3TAQA 4A2BA 4BACA 4DSEA 4GKJK 3KD5E 4PHTX 4CZLA 1RTJA 3V1OA 1T6DA 1OH7A 4DB3A 3WNEA 4DTRA 2F8SA 2VQFK 3CMEN 1C6VA 3CJ7A 4BRAA 1SNBA 4BRDA 5GAHP 3PUFA 4FJNA 3FE1A 4A62A 2O4IA 5FRMA 5HOOA 4QAGA 3QFPA 1YXQA 3WNGA 4FJ7A 1RDAA 2J4RA 4CJ5A 3S3MA 1ZXOA 3B6PA 3NGYA 2HHQA 4GW6A 1HKCA 1C56A 3O9SA 3I8DA 3K58A 4OX9K 1Z26A 3VESA 4H0XB 2VYPA 4E7KA 4IG3A 2NNWA 3VF2A 3TARA 3VERA 5C2DA 5E84A 1TL3A 3D7EO 1JLBA 1PE4A 1RT6A 1X1PA 4IFEA 4IO8A 1CZBA 5M1OA 4LSNA 4ELTA 1VRTA 4YDUA 3THWB 4OLBA 3T1AA 5DK5A 2P9PA 1DLOA 4CECA 4DCHA 4NCAA 1TAQA 3PX6A 1NH5A 2ATQA 3AA3A 1FJGK 3KOXA 3VETA 2OPSA 3DLGA 1C1BA 3CETA 1YF5L 1WSJA 3K9KA 3ZT0A 1VSJA 1U2VA 3M3ZA 3AGRA 3CM5A 1NGHA 4FZYA 4W5OA 2OANA 2LY6A 3J7AP 2FXUA 3NF7A 3GE1A 1NGCA 4EP4A 4YOWA 4CJWA 1NPIA 3V9UA 3AVMA 3MWPA 4CF0A 4CGIA 1NJWA 4B3TK 4H03B 3HP9A 5AZIB 1OH5A 3L8BA 3C95A 4BR7A 4BRGA 3ULEB 3LDQA 4KH5A 4X65K 1YTAA 4FWRA 3JXUA 1GLFO 2F7TA 3AVCA 1S22A 3EL2A 4JKCA 5CY4A 4M3UA 4DR2K 4K41A 4PY5A 1LAVA 1TYQB 3THVA 3D2EB 4J2BA 1ESVA 3IG1A 1FKPA 2EWSA 1P00A 1VQPN 4C8OA 4BR0A 3VEZA 1EWQA 4CEEA 3P83D 3OYIA 1N5YA 4CHOA 2IAJA 2NRTA 1QQNA 3ULDA 1DGKN 3QEXA 4UADE 3DLHA 3WUHA 3VQ5A 1RDBA 2I7PA 3U8XA 3U9ZA 4HUEA 1Q18A 4WQ4C 1BHLA 4DU1A 3OBWA 5C0YA 1FKOA 4CERA 3DXMB 3OVNA 1KQSM 4BRCA 3CMAN 4AHVA 4FLWA 1HJOA 4B9QA 4MDBA 5KI6A 4C8KA 4BE7B 2MN5A 4UAEF 3RTVA 1RILA 4E3SA 3LANA 3TSQA 1NLVA 4C8LA 4BECA 3MXMA 4DSIA 1RBRA 4YOYA 4BRNA 4EAHD 3NH0A 1LAWA 3HVTA 1VSMA 4EZ9A 3KLGA 1QS4A 3PLAA 4KBOA 2QWRA 3M8PA 3OY9A 4BREA 2O8CB 3PIOL 1HNIA 3AVFA 2YNHA 4X66K 5CZ2A 1RDUA 3FLCO 2P9LB 4CF9A 3EYZA 4F4KA 1S1XA 4CJUA 4MFBA 2BRZA 3HYFA 5IT9O 1R59O 3BP8A 5T7BA 4FPBA 3ITHA 3HO1A 2JWKA 3CJ1A 4Z4IA 2P9IA 1ZU3A 4CHQA 1WNSA 4DLGA 1NK5A 2KFNA 4BG8A 1BCOA 3G10A 2HHTA 3PV8A 4E1MA 4M3XA 2VWBA 2QW9A 1QE1A 5HRRA 2QM1A 2M8BB 2N2RA 3KP1A 3TABA 4A59A 2IGIA 1YJNN 4QS9A 5AQVA 3QI7A 3DXKA 1UA0A 4XH4A 1N8RO 1L3TA 1T44A 3E66A 3WEEA 1T0ZA 2WUSA 5B8HA 1JXEA 5FPNA 5AQIA 4HCCA 4ISGA 4JI8K 4WQ4A 5M1FA 5JS1A 1ZYQA 4EHUA 4FLVA 4Z4CA 2LJMA 3MEEA 3CCSN 1QQCA 1QVGM 1K8BA 5AQFA 4LH5A 4AHRA 3DMJA 4O5FA 3WXIA 1BI4A 3D45A 1QQMA 5AQNA 3VQ6A 3MMVA 5AFUA 1KCFA 4BRLA 4CIGA 2B4JA 3LP2A 1IKVA 4H0TB 1D5AA 1HQUA 4ZTFA 1LWFA 2A1SA 1NK6A 4ELVA 4KB0A 3GBTA 5EY4A 5HP1A 1KAZA 4LSLA 5FPMA 4LH4A 5C15A 1GPTA 4JI5K 1XC9A 2PY5A 5FRNA 3O3FA 4DR6K 1WAJA 3HVRA 2E3GA 4GV3A 4YOTA 3HBTA 2NRXA 4I2QA 1C0UA 3F2KA 4H4MA 5LL6Z 3SPZA 1WAFA 3O80A 1NK9A 5J2QA 2OZSA 3R2VA 3DLBA 4MO5A 4DF8A 3VEVA 2LJ7A 1XHZA 4CEDA 3L4IA 1HJRA 1TKZA 1VSEA 3DLEA 3M8SA 2HHXA 3ENOA 2HHWA 2HHIA 4FJHA 3I0RA 3A5MC 4CJRA 1EX4A 1GOBA 3KK3A 2W6LA 2WC9A 3SAHA 3I0SA 4IZ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1SZ2 A;  4BVP A;  3QIC A;  2QWP A;  4H5T A;  5FPE A;  3LM2 A;  3RSE B;  3SK3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OPP A;  2Q2R A;  1I2U A;  1BDG A;  1JKH A;  4JKG A;  3ZSO A;  5BRF A;  3QB0 A;  3EO3 A;  1OKJ A;  2VWJ A;  1RDW X;  1E4F T;  1AHO A;  3OYD A;  5GAD P;  3RVC A;  4CZI A;  2O8E A;  4KH4 A;  4BR5 A;  5AQZ A;  4DU3 A;  1NMD A;  2F9T A;  5AQL A;  1TL1 A;  3K9J A;  4YNQ A;  3CQ8 A;  1BCG A;  3IKM A;  2IC3 A;  4CJ3 A;  1BA1 A;  1SKR A;  3HM8 A;  4Z4F A;  3VQE A;  4FWS A;  4BC5 A;  3VMF B;  1DTQ A;  3SQ0 A;  5JEN A;  3J7Y P;  5EXW A;  4FJG A;  3D6R A;  1MR4 A;  1G99 A;  3DRR A;  4QS7 A;  1BQN A;  4H5V A;  3B6O A;  4PA1 A;  1EP4 A;  3LAK A;  1RNH A;  2D0O A;  3C65 A;  4JRQ A;  2UXD K;  1O1W A;  3LP0 A;  3R9P A;  3VEX A;  3M8Q A;  5AQT A;  3ISN C;  4GVM A;  4CK1 A;  2O8F A;  1WWN A;  2LY5 A;  1SL0 A;  5JVG L;  1T6C A;  3AO5 A;  3TAQ A;  4A2B A;  4BAC A;  4DSE A;  4GKJ K;  3KD5 E;  4PHT X;  4CZL A;  1RTJ A;  3V1O A;  1T6D A;  1OH7 A;  4DB3 A;  3WNE A;  4DTR A;  2F8S A;  2VQF K;  3CME N;  1C6V A;  3CJ7 A;  4BRA A;  1SNB A;  4BRD A;  5GAH P;  3PUF A;  4FJN A;  3FE1 A;  4A62 A;  2O4I A;  5FRM A;  5HOO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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