5AQOA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqoA04
1K8KA 2GTDA 3GOIA 1NBWA 3MCPA 1ATRA 2FSKA 3VEZA 4L3QA 1QZ6A 2Q0UA 1TUYA 4RTFD 2QXLA 3EO3A 4LC9B 5AZJA 1Z05A 4BR9A 1MDUB 1DEJA 5FPMA 5AQQA 4XEIA 2VCPA 4FWRA 3UKRB 4BC4A 4O8KA 2YJEA 4BRGA 2CH5A 3IDHA 4BGAA 1WOQA 3DXMB 1SZ2A 5AQZA 1BWFO 3I8BA 4BR5A 1LOTB 3UE5A 4K42A 4EAHD 4B1UB 2FXUA 3G25A 4CBUA 5BRHA 3QBWA 1RFQA 2QWNA 4FSVA 5AQXA 3EKSA 1CZAN 5BN9A 3AAPA 3SLCA 1NGCA 4IJAA 4JD2B 3OHRA 1T6DA 4EHTA 3LDNA 2P9UB 2YCHA 3R9PA 4YDUA 3ZEUA 3H3OB 1NWKA 4MLEA 2KHOA 4H0OA 2FSNA 3WEEB 4M63C 1E4GT 4AM7A 3VGLA 2GWKA 2YI1A 1NGBA 4CJ7A 1ESVA 3FR0A 3LM9A 1SAZA 1GLDG 3GG4A 4BRPA 4ISEA 2YHYA 3LDOA 3WUHA 3VEXA 2ASPA 1V4TA 2HOEA 3A5MC 4BR0A 5KQ8A 1DGKN 3O1WA 4FPAA 4BG9A 5EY4A 1Y64A 3CJ9A 4FPBA 3MN5A 4QS7A 3FGUA 4XH5A 4CZEA 2QWMA 3VETA 4BRMA 5LY3A 3ZEUB 4BROA 1R59O 4DCHA 4MO4A 3FZLA 4FOEA 1GLFO 3DWLA 4CZJA 1XQSC 3RSEB 1QQMA 4C23A 3C7NA 2P9IB 1BU6O 5BRDA 4WQ5C 5AFUA 2Q36A 1XUPO 2GEMA 3KZBA 5BPMA 2QWOA 4H0PA 2ZGZA 3VGKA 4H0XB 4B1WB 4CZMA 5AQWA 4KBOA 2EWSA 1IJJA 4H03B 2P9SB 3ATVA 5AQKA 1MA9B 1Q18A 5ADXH 4M7YA 3H45C 5LJWA 3WXLA 3D2FB 3CHWA 2A3ZA 1X3MA 4QS9A 4IXCA 4BQLA 4BC2A 3A8YA 2A5XA 3JS6A 2P9KB 3P4IA 3ZX3A 1KAZA 3DAWA 3O80A 3A5LC 3VF4A 1GLJO 3A5NC 2NZTA 3O08A 4FWQA 2I7PA 3ULEB 4BRNA 1YUWA 4FWPA 4A61A 3GDQA 2BTFA 3KHYA 2IVOA 5AZIA 1GLLO 4B1ZA 1RGIA 2P9LB 3CI5A 2P9NB 4MO5A 3IFRA 3QDKA 1E4FT 1XC3A 4JN4A 4EFHA 4RWTA 3M6GA 3EN9A 2Q0RA 4K43A 3ZETA 1U6ZA 1C0FA 4FL9A 4BC5A 1JCEA 3VEYA 4RCHA 1HKCA 2FSJA 4CZHA 3BF1A 4CBWA 2PBDA 1GLEG 2ZWHA 5B8HA 2QWPA 3HI0A 3J8AA 5KPTA 1YXQA 1ZBSA 3QFUA 2ZF5O 4FWLA 4PKGA 3DXKA 4CZLA 3EZWA 4XH1A 4F9OA 1K8KB 1P8ZA 4B1XB 4DB3A 1YAGA 3VOVA 4I6MA 2AA4A 1EQYA 2CGJA 3ZETB 1NLVA 1GLAG 3AAQA 2YHWA 3LDLA 5JLFA 3H46O 3U9ZA 4PL7A 5BREA 5AZJB 2VWBA 3KVGA 2VYPA 3CJAA 1U2VA 3HM8A 2Q2RA 1T6CA 2A6AA 3TPQA 1GLBG 1ATSA 4DQ8A 4BRDA 4BG8A 3I33A 4FWMA 3IUCA 3DJCA 1Z6RA 2BUPA 4NB4A 4I6MB 1NGAA 5EXWA 3JXUA 3WQTA 4H5TA 3H6EA 2E1YA 2V52B 2V7ZA 2UYTA 3BEXA 2E88A 1X9JA 1J6ZA 3UKUA 1NGGA 3QMLA 1G99A 1HKGA 1NGEA 2OANA 3GE1A 3VF6A 5ELZA 3AARA 4A2AA 3VPZA 3A5OC 5AQUA 4BR7A 4BRHA 2V51B 1HKBA 5AQPA 3LDQA 1NGIA 4QS8A 4PL8A 5AQVA 3VERA 4BR4A 4BRFA 3O4WA 3QBXA 4H5NA 1KXPA 4AM6A 2CGLA 1TYQA 3R6MA 4JAXA 1S22A 4IO8A 5AQLA 3L4IA 5JICA 3VEWA 5AQJA 4WQ4C 1QHAA 1BG3A 5BPLA 5KPRA 2HF3A 3SK3A 1HJOA 3GBTA 1BUPA 5FPNA 4ISFA 3BP8A 4XH4A 3LM2A 3ZX0A 5AQTA 3MN7A 5BR9A 5TKYA 4BC3A 5AQRA 3A0IX 1DKGD 4HWIA 1ZC6A 3W3DA 1V4SA 3MDQA 3C7NB 1KAYA 1NGHA 3FLCO 2ASMA 4B1YB 4H5WA 2QWQA 1X3NA 5LJVA 5E26A 5FPDA 5AQGA 2FF3B 4CZIA 4WYBA 4BRCA 1OKJA 2E20A 3SMPA 1JCFA 3O1BA 5F2RA 4PKHA 3L0QA 4JHDA 2GWJA 1HPMA 3MMVA 5AQYA 3UB5A 1NGFA 4B9QA 3FE1A 5CE3A 1ZXOA 4H0TB 3CERA 3LDPA 4CI6A 4CZFA 5KQDA 3M1FA 1LCUA 1BDGA 3O8MA 2NRHA 1TUUA 1T44A 3M3ZA 3ATUA 4CD3A 2P9PA 2A40A 4FO0A 2ITMA 3U9DA 4YDUC 3F9MA 3FFKB 5AQNA 1BO5O 3EL2A 3IMXA 3WT0A 4E1JA 2D1KA 1HUXA 2YHXA 1QQOA 3WXIA 4FWOA 1IG8A 4HTLA 4BGBA 4IJNA 3ID8A 5FPEA 4CZGA 4BRAA 4Z94A 2QW9A 2Q31A 3MN6A 4WQ5A 5AZIB 1GLCG 3WXKA 3UKRA 3VENA 1ATNA 2WUSA 4A62A 5ADXA 4GNIA 2IVNA 2P9PB 3DXMA 1BOTO 2D0OA 3LL3A 5AQOA 4JNEA 2GELA 4BRLA 2E2NA 4M7XA 5AR0A 1S3XA 2YJFA 2E1ZA 2IIRA 2NLXA 3CJBA 3U8XA 4H5RA 4FOIA 4JD2A 1D4XA 3B8AX 2E2OA 2P9UA 5F1XA 2W40A 3U4LA 5F0XA 5AQMA 3DXKB 3HTVA 5JLHA 3O5BA 4Y0WA 1NMDA 3WEEA 4BRQA 3H1QA 2A42A 5E84A 3VEVA 3ENOA 4FWNA 1MWKA 3HBTA 5AFUH 3VF2A 4BRIA 1C0GA 5JMVA 5I9EB 3FZKA 3ZX2A 2W41A 3VGMA 3MK6A 1H1VA 1U2VB 4IWVA 2Q97A 1MWMA 3W0LA 3CJ7A 1NGDA 2IVPA 2D4WA 3BUZB 3D7EO 3D2EA 4MLHA 3O6WA 4H5VA 2FLOA 2HF4A 4GY2B 4BVPA 3HSCA 2CH6A 4NO7A 4H0YB 4CD1A 4BQZA 2A41A 1QZ5A 3WQUA 2QWLA 1BA0A 2GUPA 3RSEA 3CJCA 4BREA 2P9IA 4FWSA 4K41A 2CGKA 3UKUB 1JCGA 3CJ1A 4H0VB 3R8EA 4IZ9A 3GL1A 3D2EB 4EHUA 5BN8A 2FF6A 5AQIA 2ZGYA 3FZMA 1NM1A 5EOYA 4PKIA 2P9SA 3FZFA 2PAVA 3SMSA 3CETA 1TYQB 3D2FA 2E2PA 5BRFA 5AQFA 3C0BA 4J8FA 3AY9A 2D0PA 2Q1NA 3CQXA 2P9KA 4BRKA 1HLUA 2E2QA 4A2BA 5AQSA 3VEOA 2I7NA 3WXJA 3QICA 4EIAA 3EKUA 1RDWX 3ULEA 2F9TA 4BR2A 1YVNA 4CBXA 4O5FA 1NGJA 5EX5A 2DPNA 3BF3A 3ENHA 3L6QA 4BVOA 1QQNA 3QFPA 3QB0A 1SQKA 2P9LA 3MN9A 2P9NA 4ISGA 4K25A 3FZHA 4FWKA 2ASOA 3CQYA 2QWRA 3CIPA 2V7YA 4DHYA 4JHDB 4CZKA 2H3GX 3S41A 2AP1A 3HZ6A 2E8AA 1WUAA 1KAXA 5KPZA 3SJHA 2HMPA 4WQ4A 5AQHA 3TU5A 2QM1A 1BA1A 2J4RA 3H1VX 1HX1A 3H3NO 5BPNA 3VESA 4B1VA 2F9WA 5EVZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K8KA 3O9RA 3MAQA 5FROA 4BECA 3OS0A 2FSKA 3VEZA 4L3QA 3DLRA 1BMRA 3K57A 3S5TA 2QXLA 3OA9A 4CHYA 3DLHA 4ZHRA 3HOSA 3PSMA 1LV5A 1MDUB 4FK4A 1DEJA 4E7IA 3V9ZA 2Z1GA 4XEIA 3ZCMA 3PSIA 1C0UA 4AHVA 1OH8A 2YJEA 2CH5A 3C65A 4BGAA 1TV6A 2A1SA 1OH7A 1K8AO 1WSFA 3M8SA 4CJSA 4CBUA 4Z4GA 1HYVA 1KC8O 4UAFE 4GV3A 3VN5A 4JS4A 4FSVA 1NGCA 4IJAA 4FJHA 3THWB 4FZZA 2YCHA 4CHPA 3F9KA 3CCLN 4CJQA 3SJJA 4CGJA 4CJKA 3IAYA 3L8BA 3MWTA 2FSNA 3WEEB 4M63C 1E4GT 3SAFA 3HRGA 1ZYQA 3ZSVA 2YI1A 4C8LA 1SAZA 5J2MA 4BRPA 4FM2A 2C1GA 5MLCQ 4DQIA 4KB0A 3ULDA 4DS5A 4LF8K 3CG7A 3QEWA 1KRPA 4QS7A 3OYGA 2PYJA 3U6FA 2QWMA 3QEIA 4QOZB 4LF5K 3ZEUB 2XRIA 2G8HA 1RTIA 3CPWM 4MO4A 3FZLA 4CGHA 3OBWA 1HYSA 3DLKA 4CZJA 1ZVEA 1SNBA 4YORA 3C7NA 5IWAK 2P9IB 4DU4A 3KP1A 4WQ5C 3KD5E 3OYIA 3F2KA 2WBNA 2GEMA 4FLYA 5HRRA 4H0PA 3VGKA 3AA5X 1VK0A 3HPHA 3D0PA 5FDLA 3NH1A 1N6QA 4OO1J 2HHUA 5AQKA 3S3MA 4GKKK 3PIPL 4V19S 1I6GA 3OTOK 1VQ8N 3CHWA 4BQLA 2WOMA 3HT3A 3CYMA 2A5XA 2P9KB 1KAZA 3HK2A 3DAWA 4FZYA 3A5LC 1BIUA 1GLJO 3NAEA 3SUNA 3A5NC 1I94K 2MZ0A 2HHQA 3CFRA 2NZTA 4DSJA 2BANA 2NRVA 4FWQA 3LALA 3F73A 3ULEB 1N5YA 2IDOA 5C24A 3THYB 4A5BA 1YI2N 3KHYA 2VGMA 2IVOA 1CZBA 1GLLO 4B08A 4B1ZA 1ASWA 4NLBA 1T05A 3ISNC 1BI4A 2UUAK 3IFRA 1E4FT 1XC3A 3AVIA 4JN4A 1QSYA 4KH4A 1U6ZA 1C0FA 1YT3A 1FKPA 4Z4IA 4BC5A 4RG8A 3ALYA 4CBWA 3U3YA 2PBDA 3CQ8A 4DTNA 4BWJA 2QWPA 3V1RA 4JI5K 3VQ6A 1YF5L 1ZBSA 2ZF5O 1Q9XA 4DTOA 4N56A 2FBXA 4N41A 2YX6A 4DB3A 4JI7K 4JI6K 1EQYA 1X9WA 3ZETB 4LSLA 1J9AA 1GLAG 3AAQA 3LDLA 2E0HA 5JLFA 2ASCA 1ZYWA 3U9ZA 1SL0A 3JAMO 5AZJB 5M1KA 3JYTA 2O4IA 5JVHL 2N2QA 1REVA 3HM8A 3TPQA 1T6CA 3H08A 2BDPA 4CJUA 3KIOA 2O8DA 2HVHA 3HJFA 1EX4A 4PQUA 1NOZA 4DV7K 4JI0K 1VSHA 2HBKA 5DM6L 3I33A 4CESA 1J5OA 4EP4A 4I6MB 1NGAA 3OS2A 3JXUA 1WSEA 2D0BA 3SAGA 2V52B 2VG6A 3L4QA 2QXFA 1L5UA 4BE0A 4UAEF 3KLIA 2E88A 1X9JA 1NGGA 5C2FA 2OANA 3LPUA 3VPZA 3A5OC 3VQEA 3NF9A 4BRHA 2V51B 1VQLN 2VQFK 1NGIA 1IG9A 3I0SA 1J5EK 2VGNA 3O4QA 5AQVA 4CF0A 1QTMA 4BR4A 1KD1O 1CLQA 3O4WA 3VQAA 1VSFA 3CCMN 3PUFA 2CGLA 4JKFA 5C42A 4Z4EA 1WN7A 2X6NA 5AQLA 4CGDA 3L4IA 1BIZA 4KTWA 4G9ZA 2NUBA 2F8SA 1NH5A 2HF3A 4Z0UA 2B3CA 1TKTA 1ZBFA 1HJOA 4WFBL 4DR2K 4NLCA 5HL7L 4XH4A 3HP9A 5AQTA 4JKGA 4KHUA 1OZZA 4BC3A 1ZC6A 3ZSYA 3MDQA 1UWBA 4GVMA 4JS5A 1SUQA 3FLCO 4IOXA 1YVUA 1X3NA 1WBDA 5E26A 3V1QA 4C8OA 3T3FA 2FF3B 4CZIA 1VSIA 4WYBA 4BRCA 1OKJA 4XJXA 4HUFA 3O1BA 4NCBA 2BH1A 4CHQA 5F2RA 1CZ9A 1SS6A 3L0QA 1RTDA 2GWJA 1LW0A 3PSFA 5I3UA 3D6RA 3L2QA 4ID1A 4JK8A 4GMJB 2ZQBA 4FW1A 4DUYK 4F3OA 1NGFA 2ZJRL 4BEBA 5CE3A 3MXMA 1BCGA 4H0TB 4M3YA 3TSQA 4DLEA 3O8MA 1T44A 2P9PA 2EX3A 1W9HA 3OS1A 1NJIO 2ITMA 3U9DA 1JZAA 3F9MA 3NDKA 5AQNA 2YNHA 3V9WA 3EL2A 3IMXA 4ILHA 3CYGA 1HUXA 3ZT2A 1QQOA 3WXIA 4CF1A 3RWUA 5D3GA 2HNYA 1T03A 4FWOA 3VQ9A 4HCCA 2OTJN 5FPEA 4CZGA 4Z94A 2Q31A 4WQ5A 5AZIB 2KKZA 1NKEA 4KTQA 4A62A 3QO9A 4GNIA 2IVNA 3C6AA 2D0OA 3LL3A 2O8EB 3DRPA 5C15A 2GELA 1WBBA 3VQ7A 2E2NA 1IH7A 4JKEA 1BQMA 4KRFA 4AHCA 3E66A 4O8UA 5JS2A 4Y1CA 2IIRA 4JI1K 2NLXA 3HYFA 2KSKA 3B8AX 4NCAA 2E2OA 3CC7N 4BDZA 1PX9A 2P9UA 4FJLA 4UY8O 1Q9YA 3HO1A 4CJ4A 1KVCA 4A59A 2F4VK 4Y0WA 3KLFA 4HHFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1K8K A;  3O9R A;  3MAQ A;  5FRO A;  4BEC A;  3OS0 A;  2FSK A;  3VEZ A;  4L3Q A;  3DLR A;  1BMR A;  3K57 A;  3S5T A;  2QXL A;  3OA9 A;  4CHY A;  3DLH A;  4ZHR A;  3HOS A;  3PSM A;  1LV5 A;  1MDU B;  4FK4 A;  1DEJ A;  4E7I A;  3V9Z A;  2Z1G A;  4XEI A;  3ZCM A;  3PSI A;  1C0U A;  4AHV A;  1OH8 A;  2YJE A;  2CH5 A;  3C65 A;  4BGA A;  1TV6 A;  2A1S A;  1OH7 A;  1K8A O;  1WSF A;  3M8S A;  4CJS A;  4CBU A;  4Z4G A;  1HYV A;  1KC8 O;  4UAF E;  4GV3 A;  3VN5 A;  4JS4 A;  4FSV A;  1NGC A;  4IJA A;  4FJH A;  3THW B;  4FZZ A;  2YCH A;  4CHP A;  3F9K A;  3CCL N;  4CJQ A;  3SJJ A;  4CGJ A;  4CJK A;  3IAY A;  3L8B A;  3MWT A;  2FSN A;  3WEE B;  4M63 C;  1E4G T;  3SAF A;  3HRG A;  1ZYQ A;  3ZSV A;  2YI1 A;  4C8L A;  1SAZ A;  5J2M A;  4BRP A;  4FM2 A;  2C1G A;  5MLC Q;  4DQI A;  4KB0 A;  3ULD A;  4DS5 A;  4LF8 K;  3CG7 A;  3QEW A;  1KRP A;  4QS7 A;  3OYG A;  2PYJ A;  3U6F A;  2QWM A;  3QEI A;  4QOZ B;  4LF5 K;  3ZEU B;  2XRI A;  2G8H A;  1RTI A;  3CPW M;  4MO4 A;  3FZL A;  4CGH A;  3OBW A;  1HYS A;  3DLK A; 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