3I33A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 2 (hsp70-2) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
MPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3i33A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3i33A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3i33A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3i33A04
3ATUA 1SAZA 3U8XA 3GG4A 5BPMA 2GELA 3D2EB 2YI1A 2P9IB 4BG8A 3VGKA 2Q0RA 4JN4A 4BRMA 3A0IX 4B9QA 5AQJA 5AZJB 1ATSA 1NMDA 2HMPA 3M6GA 4AM6A 5BPLA 4CJ7A 5FPMA 4BGBA 3CJ7A 4CBUA 2ASMA 1RGIA 1MDUB 4IXCA 1ATRA 3QBXA 1GLDG 1NGHA 5BRDA 1NLVA 2P9UA 4CZIA 5FPEA 4NO7A 2QWRA 1GLFO 5E84A 2FLOA 3O80A 4MLHA 1GLJO 3O6WA 5EVZA 4B1ZA 3U9DA 2CGKA 3BP8A 3FZKA 3FR0A 2FF6A 3W0LA 3LDLA 4K43A 2ITMA 4CD3A 3VPZA 2VYPA 4XEIA 2CGJA 3WEEA 5AQSA 4PKIA 4CZLA 4PL8A 3VEVA 3LM2A 2VWBA 3VETA 5ADXH 3VEXA 4H5TA 3EL2A 3SMPA 5FPDA 4AM7A 3FLCO 4M7XA 5LJWA 2P9LB 3HTVA 3VEYA 4RCHA 4H0YB 5BRFA 1XC3A 3IDHA 3BUZB 4EAHD 1YAGA 1Z6RA 4K25A 2QXLA 3LL3A 5AFUA 4DB3A 2E2PA 3IUCA 5AQUA 1NGGA 2Q97A 2YHXA 3C7NB 5KQDA 2W41A 3KZBA 3OHRA 2DPNA 3A5NC 3WUHA 3H6EA 4BRDA 4BR4A 1JCFA 4DHYA 3IFRA 3FZLA 2HF3A 1V4TA 1KAZA 1BG3A 1OKJA 1U6ZA 3QICA 4C23A 5JMVA 3ULEA 2IVOA 3QMLA 1TUYA 4H0TB 4LC9B 4DQ8A 5AQZA 2YJFA 3QDKA 1MA9B 4BC4A 4CBXA 4CZHA 3EKUA 4ISEA 1S22A 3CERA 2D0OA 3JS6A 4FSVA 2FSJA 3BF1A 3WXJA 4FWPA 3H1VX 5F1XA 4XH4A 3O08A 4B1VA 3D7EO 1KAXA 3CQXA 2CH5A 3RSEA 4H0VB 2CH6A 4CBWA 5E26A 4QS7A 4BQLA 3F9MA 2P9KA 4CZJA 4BRKA 1R59O 1HX1A 3VEOA 1QHAA 1HKGA 3O4WA 3ZX3A 3CJ9A 2P9SA 2P9UB 3CJBA 1MWMA 3L4IA 1KAYA 3FE1A 2HOEA 1ATNA 4FWOA 4BG9A 4BRIA 5JICA 1X9JA 2ASOA 3MN5A 4BRAA 3GDQA 2AP1A 4JD2A 5JLFA 3JXUA 2D0PA 5LJVA 4A2AA 2D1KA 2UYTA 1BU6O 5AQMA 4E1JA 5EOYA 1EQYA 3WEEB 1JCGA 3VGLA 4FL9A 1XUPO 4J8FA 5BR9A 3CJ1A 3G25A 3VENA 4BC3A 4H5RA 4A2BA 4EFHA 2E1YA 3VGMA 4GY2B 4H0PA 3I8BA 1HPMA 1D4XA 3WXIA 5AQHA 5AQOA 5AQGA 4FWNA 4A62A 3ZETA 4MO4A 2V52B 3FFKB 3R6MA 2PBDA 3UKUA 1KXPA 1JCEA 1NM1A 3EZWA 4BVOA 3GE1A 1Y64A 4XH5A 1YXQA 3ENHA 4H0OA 1QZ6A 1T6DA 4M7YA 4HWIA 3CJAA 2HF4A 3FZHA 1BWFO 2OANA 4KBOA 1C0GA 4QS8A 2V51B 5BPNA 1BA0A 3ULEB 4BR7A 4BRFA 2I7PA 2E2QA 3SK3A 2GUPA 2P9PA 4FWMA 1QZ5A 4K41A 5ELZA 1SZ2A 4HTLA 3FGUA 4B1WB 2W40A 1XQSC 2YHWA 3L0QA 4BROA 5F2RA 3MMVA 1WUAA 4FO0A 1IG8A 4IJNA 4EIAA 3VF6A 3AAQA 1NGJA 3QFUA 1DKGD 5AQTA 2QWOA 2FSKA 2GEMA 3CQYA 5AQRA 3DXMA 3RSEB 4O5FA 5CE3A 4ISFA 4BR0A 5AQYA 5AQVA 1NBWA 4BRCA 2ZGZA 2ZF5O 2QM1A 4A61A 5JLHA 4IWVA 2P9KB 3CJCA 3VF4A 1HUXA 2A40A 2FXUA 4H0XB 5KPTA 3A5MC 4MLEA 1BA1A 2P9SB 2Q31A 4PKGA 5AQWA 1Q18A 3DXKA 5AQIA 3R8EA 3A5OC 3VF2A 1NGFA 5AQXA 4F9OA 2A6AA 3WT0A 3BEXA 2D4WA 4JD2B 2CGLA 5AQNA 2E88A 3UE5A 5ADXA 4BR2A 4O8KA 1IJJA 3O1BA 3CHWA 3CETA 3S41A 4BR5A 4CZFA 4Z94A 2EWSA 2J4RA 1YUWA 4PKHA 4FWQA 4IO8A 2QWMA 4JHDA 1NGBA 1H1VA 1LCUA 4BQZA 3H1QA 4BVPA 5BRHA 3DWLA 4H5NA 3H45C 1GLEG 1NGDA 3ENOA 4BRHA 3EKSA 4RTFD 1U2VA 3TPQA 3TU5A 2YHYA 5AZIA 1RDWX 1BO5O 4BRQA 3MN9A 2GTDA 3M1FA 3BF3A 4WQ4C 3GOIA 2Q36A 2E20A 1WOQA 1TYQA 4BRLA 1G99A 3ZETB 3IMXA 2V7ZA 1Z05A 3D2FB 4QS9A 5B8HA 5EXWA 3UKUB 3QB0A 1DGKN 3UB5A 1E4FT 2QWQA 4FPBA 1BDGA 2KHOA 3MCPA 3I33A 3CI5A 3SLCA 3AY9A 1V4SA 2BUPA 4NB4A 2Q1NA 2GWJA 3UKRA 4BREA 1HJOA 4CZKA 3M3ZA 5F0XA 4I6MA 3KHYA 2P9PB 4PL7A 5AR0A 2A5XA 4FWLA 4FOEA 4IZ9A 1DEJA 4CZEA 1NWKA 4GNIA 4CI6A 3J8AA 3LM9A 3ZEUA 3FZFA 1K8KA 5AQFA 1GLCG 2QWPA 2FSNA 3DAWA 3EO3A 3HBTA 5EY4A 3LDOA 3O8MA 2P9NA 1C0FA 5AFUH 4RWTA 3DXMB 3SMSA 3D2FA 2ZGYA 2QWNA 3WXLA 4H5VA 2E8AA 4WYBA 2E2NA 4MO5A 5BN9A 3U9ZA 3WXKA 1GLBG 2FF3B 3ZX0A 4Y0WA 1NGEA 5AQPA 1YVNA 3LDNA 3P4IA 3GL1A 3B8AX 1ZBSA 3A5LC 3DXKB 3D2EA 5AQLA 4B1YB 3A8YA 2P9IA 4B1UB 4BC2A 2Q0UA 2E1ZA 1BUPA 3WQUA 5AZJA 4XH1A 4ISGA 4JNEA 3ZX2A 2BTFA 1TUUA 4YDUC 3ATVA 5EX5A 3GBTA 2V7YA 2QW9A 5AQQA 4WQ4A 4WQ5C 1NGCA 1T6CA 1QQOA 3WQTA 1P8ZA 2NRHA 5BREA 4DCHA 3CIPA 4FWRA 3VEZA 5TKYA 2YJEA 3SJHA 2A3ZA 4JHDB 3VEWA 1E4GT 3HM8A 3VESA 3AAPA 3MN6A 2QWLA 3H3NO 3C0BA 1J6ZA 1NGAA 3KVGA 4H03B 4B1XB 2GWKA 1SQKA 1U2VB 5KPRA 1ZXOA 4K42A 5AZIB 3LDQA 3R9PA 3O5BA 3VERA 2AA4A 1QQMA 1GLAG 4FOIA 1LOTB 3H3OB 2E2OA 1ZC6A 3W3DA 1TYQB 3FZMA 1BOTO 4CZMA 4FWKA 1MWKA 3AARA 4IJAA 2VCPA 1CZAN 4EHUA 4CD1A 2IIRA 2Q2RA 5FPNA 3VOVA 2NLXA 2IVNA 1QQNA 2P9LA 1HLUA 2ZWHA 3MK6A 4EHTA 5I9EB 1S3XA 5KQ8A 2NZTA 1GLLO 1RFQA 3L6QA 2A42A 4FPAA 4BR9A 2PAVA 4L3QA 3LDPA 3UKRB 4JAXA 2YCHA 1HKCA 4BRPA 3EN9A 4I6MB 2IVPA 3HZ6A 3C7NA 3MN7A 2I7NA 3QBWA 4M63C 5AQKA 5LY3A 2F9TA 2A41A 3ZEUB 1K8KB 4BC5A 4H5WA 2P9NB 4BGAA 1T44A 1HKBA 1NGIA 3HI0A 3HSCA 2H3GX 3MDQA 3ID8A 3H46O 3O1WA 3QFPA 2WUSA 4YDUA 5KPZA 5BN8A 1ESVA 4CZGA 4BRNA 1X3MA 4WQ5A 2F9WA 3U4LA 4FWSA 4BRGA 3DJCA 2ASPA 1X3NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ATUA 1SAZA 1XRSB 3GG4A 4N47A 1IKWA 4R79A 4G1QA 1IV0A 4YOUA 2YI1A 1VSMA 3VGKA 2Q0RA 4AHCA 1RDBA 4JN4A 3ISNC 4BRMA 3TR8A 4FLXA 3RRGA 2JGUA 1ATSA 1LAWA 1NMDA 2WOMA 1L5UA 5DM7L 2UUBK 4CBUA 4F2SA 1RGIA 4IXCA 3RWUA 4DQPA 5BRDA 3J7AP 4CZIA 2LKBA 4LH5A 2QWRA 2Q3SA 1U45A 4KB0A 1B3CA 1P0AA 2NRVA 1GLJO 4HUGA 1YJNN 3D45A 3VQ6A 3QEIA 4B1ZA 4K8XA 3KK1A 4JI2K 3FZKA 3AVHA 3TTCA 1JXCA 1DJTA 3I56N 3RTVA 2KZZA 2UXCK 3DRPA 3KP0A 4EP5A 1VK0A 3IRXA 1OMYA 4CZLA 4PL8A 1KLNA 4FW1A 3O9SA 2KBKA 4FLVA 3VEVA 2UXDK 1ILYA 1JLEA 1RT5A 1T8EA 3CFPA 4O44A 4YOYA 3NGIA 3MXIA 5LJWA 1JJ2M 3HTVA 3VEYA 4CEDA 4H0YB 3AVGA 4JKEA 2NRWA 3IDHA 4E7JA 3KOXA 2QXLA 1IKVA 5AFUA 4ELVA 4JKAA 2YHXA 2X6SA 3KWIA 3EEQA 3SJJA 4DUZK 4CJKA 3OHRA 3SCXA 3A5NC 3SUOA 3T3FA 3FFIA 4B9VA 3J7ZO 1DQ7A 4KH4A 4GW6A 2HF3A 1Y97A 1OKJA 1U6ZA 4IFEA 3VQDA 3DRRA 1TUYA 4H0TB 4KHNA 1KC8O 4LC9B 4DQ8A 4B3TK 4CBXA 1MU2A 5C24A 4GV9A 2HVIA 4XIUA 5KK4A 2BRZA 3C65A 1T3VA 4B08A 4CK1A 3LWMA 1JLBA 2DFEA 1BHLA 5DK5A 4DFJA 1VQ8N 3D7EO 3RSEA 2GBZA 1IH7A 4JK9A 4KTZA 4I7FA 4CBWA 5E26A 4QS7A 1BQNA 3BDPA 1VSEA 3F9MA 4CZJA 4YNQA 1R59O 1TL1A 1HX1A 3TTFA 3VEOA 2UUCK 4YORA 1HKGA 4DMNA 3ZX3A 4CEZA 2EHGA 4BWMA 1I2UA 3ZYYX 5LL6Z 3HVRA 3PSFA 3K9JA 4FWOA 5JICA 4BDYA 1X9JA 1ASWA 4GKJK 2EX3A 2G8WA 3TAGA 3JXUA 2D0PA 3VQ8A 3MX5A 4A2AA 3QIOA 2OZMA 1Z26A 5AQMA 4JKHA 2P51A 1TV6A 3PX0A 1WSFA 5EOYA 1EQYA 3WEEB 3CQ8A 2ETJA 2JWKA 3E66A 2I5JA 1JCGA 1D9DA 4WE1A 2MBKA 3CJ1A 3IKMA 1XMOK 4BC3A 3KD5E 1B9DA 3RMDA 2KYQA 1B7DA 1YITN 4OGCA 3OY9A 3OYAA 3WXIA 4FJ9A 3CYGA 3ZETA 4FM2A 4DLEA 1K8AO 3FFKB 1ZVEA 3V6DA 1XNRK 3K2PA 1RT2A 2PBDA 4DTXA 4IKFA 2NNWA 3EZWA 3GE1A 2N69A 4CGFA 4F8RA 2HHWA 3ENHA 3DLBA 3CCJN 4FJHA 1KFSA 4FK0A 3C95A 1LV5A 4DU1A 1HNWK 4A59A 3FZHA 2OANA 4NCGA 4KBOA 1BA0A 3KK3A 4BR7A 2I7PA 4GVMA 5IWAK 1ITGA 3HYFA 2P9PA 4CJWA 1JL1A 3FGUA 4B1WB 2W40A 4HTUA 4LFAK 2YHWA 3SQ2A 4BROA 5KRSA 3E9OA 5F2RA 4JI0K 1SL0A 1WUAA 4FO0A 2Z1GA 1IG8A 4M3RA 4EIAA 3VF6A 2X74A 1DKGD 3M8PA 3VTIA 3CQYA 3OYBA 2YILA 4DR2K 4O5FA 3PX6A 4BR0A 3WNEA 2A7TA 1RBRA 3D6RA 3SV4A 5GAEP 1NK8A 1CLQA 5JLHA 3CJCA 3THWB 4PHTX 2FXUA 3P38A 3A5MC 3DI6A 3WNFA 2P9SB 3R3LA 3KC6A 1SL2A 5AQWA 4DV7K 3OYHA 5CZ1A 3A5OC 1NGFA 4FJNA 2LY5A 4JKGA 2D4WA 4M3UA 2CGLA 1VSDA 4DQSA 5AQNA 2G8KA 2BDPA 2NRXA 5ADXA 4KHUA 4O8KA 4LFCK 5JS1A 3CETA 3S41A 4DR4K 2KBJA 2XY7A 3AA2A 4CF8A 2EWSA 5SWMA 2W00A 2QWMA 5HP1A 5CZ2A 4EZ6A 4BQZA 3H1QA 2F4VK 4OPAA 4BRHA 1O1WA 3LANA 4CJFA 4AQYK 3VQAA 3SUNA 1HNVA 4LD0A 3QETA 2W6LA 2VQFK 5AZIA 2I61A 1BO5O 4BRQA 3ZSVA 2NRRA 2WBNA 3RR8A 2XY5A 1KV0A 4AAZA 1WOQA 1G99A 4CESA 3IMXA 2YV0X 4QS9A 4RW6A 5EXWA 3OYKA 3HOTA 1RDDA 5FLXO 4JI5K 1HYZA 2E3FA 3HPOA 4BE2A 1C1CA 3I33A 4B9SA 4RW9A 1V4SA 1VSJA 4IBNA 2GWJA 2VQEK 4KHQA 1TL3A 5CYQA 3G0ZA 4A5AA 1WLJA 4KKOA 4CI6A 3MCAB 3O3FA 1GOAA 4RWTA 3D2FA 5HL7L 4E7KA 4UAFE 2QWNA 3WXLA 2PZSA 4WYBA 4B9TA 3V9WA 4CJQA 1QSYA 4LF9K 3WXKA 3ZT4A 3OYDA 4Y0WA 3V9ZA 3VTHA 1NRAA 4EP4A 1QVGM 4DV2K 3P4IA 3VQ5A 3DXKB 1KD1O 1QSLA 3KLIA 4BC2A 1WSGA 4GV6A 1JZAA 4JI6K 4N5SA 4IFVA 2JDQD 3AVAA 3ASMA 1BUPA 5T7BA 4UJ0A 4JNEA 4W5RA 3MX2A 2QW9A 1X1PA 3C6HA 4HUEA 1TVRA 2IS3A 1VQ4N 4O8UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ATU A;  1SAZ A;  1XRS B;  3GG4 A;  4N47 A;  1IKW A;  4R79 A;  4G1Q A;  1IV0 A;  4YOU A;  2YI1 A;  1VSM A;  3VGK A;  2Q0R A;  4AHC A;  1RDB A;  4JN4 A;  3ISN C;  4BRM A;  3TR8 A;  4FLX A;  3RRG A;  2JGU A;  1ATS A;  1LAW A;  1NMD A;  2WOM A;  1L5U A;  5DM7 L;  2UUB K;  4CBU A;  4F2S A;  1RGI A;  4IXC A;  3RWU A;  4DQP A;  5BRD A;  3J7A P;  4CZI A;  2LKB A;  4LH5 A;  2QWR A;  2Q3S A;  1U45 A;  4KB0 A;  1B3C A;  1P0A A;  2NRV A;  1GLJ O;  4HUG A;  1YJN N;  3D45 A;  3VQ6 A;  3QEI A;  4B1Z A;  4K8X A;  3KK1 A;  4JI2 K;  3FZK A;  3AVH A;  3TTC A;  1JXC A;  1DJT A;  3I56 N;  3RTV A;  2KZZ A;  2UXC K;  3DRP A;  3KP0 A;  4EP5 A;  1VK0 A;  3IRX A;  1OMY A;  4CZL A;  4PL8 A;  1KLN A;  4FW1 A;  3O9S A;  2KBK A;  4FLV A;  3VEV A;  2UXD K;  1ILY A;  1JLE A;  1RT5 A;  1T8E A;  3CFP A;  4O44 A;  4YOY A;  3NGI A;  3MXI A;  5LJW A;  1JJ2 M;  3HTV A;  3VEY A;  4CED A;  4H0Y B;  3AVG A;  4JKE A;  2NRW A;  3IDH A;  4E7J A;  3KOX A;  2QXL A;  1IKV A;  5AFU A;  4ELV A;  4JKA A;  2YHX A;  2X6S A;  3KWI A;  3EEQ A; 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