3I33A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 2 (hsp70-2) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
MPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
total genus 124
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3i33A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3i33A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3i33A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3i33A04
3DXMB 2EWSA 1XC3A 2ITMA 4BREA 1Z05A 4QS9A 5AQGA 5JLHA 3AAPA 4C23A 2DPNA 4DHYA 1NBWA 2HOEA 1NM1A 2PAVA 2Q97A 2D1KA 4IZ9A 2ASOA 3EL2A 4BRGA 4CBXA 4CD1A 4YDUA 5BRFA 2I7PA 5AFUA 3M1FA 5EVZA 3EO3A 3IDHA 3RSEA 4DQ8A 1ZXOA 3HZ6A 2YJEA 3MDQA 4BR0A 4J8FA 3D2FB 4B1VA 4CD3A 2YHXA 1JCGA 5AQJA 4H03B 3IUCA 4BGBA 2E2QA 5B8HA 3SMPA 4GNIA 2Q1NA 2PBDA 3FGUA 4RCHA 5BN9A 3CJ1A 4A2AA 3A5MC 2Q0UA 2A41A 4BRAA 5AZJA 3ZEUB 3S41A 3VENA 4B1XB 1T6CA 3O1WA 4HTLA 2V51B 3GDQA 4KBOA 4BRFA 2D0OA 3LM2A 1Y64A 5EX5A 3HSCA 2FSJA 2HMPA 2CGKA 2FXUA 3L6QA 2IIRA 1QQNA 4H0YB 5ELZA 5AZIA 4DB3A 2KHOA 3WQUA 1S22A 1G99A 5BRHA 3ZETA 1ATNA 1SQKA 3O1BA 3C7NA 3MN5A 3WT0A 1JCEA 3EKSA 5BPLA 3O6WA 3HBTA 2D4WA 3L0QA 1D4XA 1HKCA 2ZGZA 3H1QA 2FLOA 4LC9B 3VEOA 4ISGA 2P9SB 1GLDG 5AQXA 3FZMA 4K42A 4BRPA 3BF1A 2NZTA 3D7EO 1HPMA 2OANA 3J8AA 1X9JA 3D2EB 1TUUA 3DJCA 4MO4A 1CZAN 2V7ZA 5AQHA 3H46O 4FWSA 5ADXH 1NGHA 5BRDA 1U6ZA 3VGLA 3VPZA 2CH5A 4NB4A 3O80A 3IMXA 5TKYA 1YAGA 3ZX3A 3JXUA 4FWKA 3VGKA 4BRMA 4EIAA 1ATRA 4WQ4A 3L4IA 2YJFA 4BC4A 3AY9A 4PKIA 1BDGA 4HWIA 4IWVA 3QBWA 4RTFD 3R8EA 4GY2B 3BEXA 3EZWA 3VOVA 2J4RA 2P9PA 3A5OC 2P9KA 2P9NB 4BVPA 5FPMA 3GOIA 5CE3A 5AR0A 2V52B 3UB5A 4EHUA 3ZX0A 3BP8A 4FOIA 1BWFO 3O5BA 4XH4A 4BGAA 1KAYA 1NGBA 1QHAA 3VEWA 4EHTA 1IJJA 5FPDA 4CZLA 3JS6A 4FSVA 4MLEA 1TYQB 4H0OA 4DCHA 3W3DA 1NGCA 3KHYA 3O4WA 1HX1A 2QWQA 3FE1A 3GE1A 1H1VA 4CI6A 4RWTA 1BU6O 4JD2B 3U9ZA 1U2VA 4BRIA 2HF4A 3TU5A 2QW9A 4A2BA 5EXWA 3WEEB 1MWKA 1OKJA 1V4TA 2V7YA 1GLAG 3HTVA 5I9EB 2YHWA 5KPTA 4FWLA 4WQ5C 2ASPA 3EN9A 2IVNA 3FZFA 1BO5O 4H5TA 2P9KB 4BC5A 4H5WA 3C7NB 3FR0A 4BRCA 2GEMA 5AQTA 3WEEA 1RGIA 5AQRA 1QQOA 3MMVA 4Y0WA 3RSEB 2GELA 4K43A 5BN8A 1DEJA 4BQZA 2VYPA 4BROA 4JHDA 4PKGA 5JICA 3OHRA 3MN6A 2FF6A 3F9MA 2E2NA 3A0IX 4K41A 1HKGA 4BR9A 4FWOA 1KAXA 2Q31A 3VERA 4BR4A 3ID8A 2VWBA 5AQPA 1S3XA 5AQIA 2Q0RA 3QICA 3CQXA 1WOQA 3WXIA 1JCFA 4CZIA 4I6MA 1DGKN 4BR5A 5AQWA 1DKGD 4CZEA 1GLEG 3CERA 4O5FA 3VF4A 4FWMA 2A6AA 3WXKA 3G25A 5AQZA 1X3NA 2A42A 2VCPA 3VEXA 4AM6A 1QZ5A 3SK3A 5AQOA 4EAHD 3H3NO 5E84A 3CI5A 2P9NA 2IVOA 3IFRA 5BPNA 2A40A 1BA1A 2P9UA 4B1ZA 3U8XA 1KXPA 3O8MA 4FWRA 3HI0A 1NGGA 4BR2A 5F0XA 3FZLA 2I7NA 2AP1A 5LJWA 3ULEA 3WXLA 5LJVA 4CZJA 2BUPA 2IVPA 3BF3A 1GLCG 4BRHA 3LDQA 1YVNA 1J6ZA 1YXQA 1BUPA 4CZKA 2BTFA 3R6MA 4L3QA 3LM9A 2GUPA 1U2VB 3I33A 4IJAA 4BRKA 3QB0A 5F2RA 3D2EA 3ULEB 1NGDA 5AQKA 3UKRB 3VESA 3B8AX 4FPAA 2QM1A 1NGEA 2P9IB 3WXJA 1Z6RA 2UYTA 3KVGA 4BC3A 1IG8A 3VF6A 4M7YA 1NGAA 3I8BA 1RFQA 1NMDA 4H0PA 4BG8A 1YUWA 2GTDA 5ADXA 2E1YA 3C0BA 1QZ6A 2Q36A 4FWQA 1SZ2A 3H1VX 3CJCA 1NGFA 3H6EA 3CJ7A 5AZIB 3FZKA 4H0TB 2FSKA 1LOTB 5KQDA 3MN9A 2ZF5O 3QDKA 1GLJO 5AZJB 3MCPA 3D2FA 5EOYA 2FF3B 1XQSC 4MLHA 2W41A 3UKRA 2QWMA 4XEIA 1GLLO 4CJ7A 3CJAA 4XH5A 2QXLA 3MN7A 1C0GA 3R9PA 1HLUA 3LDPA 5AQQA 1SAZA 4FL9A 1TYQA 3CJ9A 5AQYA 4MO5A 3ATUA 2YI1A 4A61A 1LCUA 1MWMA 3ATVA 4M7XA 3FLCO 4FO0A 4ISFA 3A5LC 1ZBSA 1MDUB 4B1YB 3W0LA 2NRHA 3GBTA 3ENOA 1EQYA 4A62A 4FWNA 2F9TA 2P9IA 1BA0A 3SJHA 1GLFO 5AQUA 1K8KA 3DWLA 4ISEA 3ENHA 2E88A 4B1UB 4H0VB 1BG3A 1R59O 3M6GA 4IO8A 4BVOA 2P9UB 3GG4A 4QS7A 4I6MB 1RDWX 3ZETB 1X3MA 2P9LB 3ZEUA 3FFKB 2P9LA 4K25A 4WQ5A 1ATSA 3VEYA 4O8KA 4B1WB 1ESVA 3WUHA 4Z94A 3VEZA 3CETA 2GWKA 4B9QA 3AARA 3LL3A 4BRNA 2E20A 3QFPA 4CZMA 2ASMA 4NO7A 3QFUA 3TPQA 1T44A 5AQVA 3FZHA 1BOTO 3DAWA 2NLXA 2AA4A 2YHYA 5BPMA 2FSNA 3UKUA 1C0FA 3U4LA 3A8YA 4WYBA 3GL1A 1WUAA 4BQLA 2CGJA 2ZGYA 1NLVA 3QMLA 3M3ZA 2HF3A 1MA9B 2QWPA 5AQLA 1TUYA 2P9SA 3VETA 5AQNA 3QBXA 5F1XA 4PL8A 1E4GT 2GWJA 1E4FT 4CBUA 1GLBG 1ZC6A 3H3OB 2F9WA 3DXKA 4H5NA 3AAQA 2CH6A 1HUXA 2H3GX 1NGJA 3SMSA 4FPBA 5KPRA 5BR9A 3CQYA 3BUZB 3CHWA 1QQMA 5AFUH 3U9DA 3VGMA 2E8AA 3LDLA 2Q2RA 5AQMA 2QWLA 1P8ZA 4EFHA 1V4SA 4JN4A 4WQ4C 1K8KB 5KPZA 2A5XA 2P9PB 4JD2A 5BREA 1T6DA 2WUSA 3SLCA 3O08A 5FPNA 4IXCA 4PL7A 2QWNA 3VEVA 3CIPA 4CZHA 2E2PA 2E1ZA 2A3ZA 3CJBA 4BR7A 5JMVA 4AM7A 4H5VA 3HM8A 4YDUC 1HJOA 5FPEA 2E2OA 4IJNA 2D0PA 4CZFA 1NGIA 5LY3A 3P4IA 3KZBA 4M63C 5KQ8A 5AQSA 2W40A 4H0XB 4BC2A 2QWOA 4E1JA 1XUPO 4QS8A 3WQTA 3LDOA 3ZX2A 3A5NC 3DXMA 4CZGA 4FWPA 4PKHA 1HKBA 2CGLA 4XH1A 3EKUA 3UE5A 2QWRA 4BG9A 4CBWA 3UKUB 2ZWHA 1NWKA 5JLFA 3MK6A 1KAZA 4JNEA 4BRDA 4JHDB 4BRQA 3DXKB 3H45C 5E26A 3VF2A 4BRLA 2YCHA 4F9OA 4JAXA 5EY4A 4FOEA 1Q18A 5AQFA 4H5RA 3LDNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QVGM 1Z05A 3WNFA 4Z4EA 3LALA 2DPNA 3SPZA 4DHYA 1B92A 1NBWA 1NM1A 1XMQK 4C1NK 1QSSA 4IZ9A 2WC9A 4BRGA 2E5LK 4CBXA 5BRFA 2OPSA 1TI5A 3SV4A 2E6MA 1M1KO 5FLXO 3KLEA 4KHUA 2GMOA 3IDHA 4K8ZA 2YC1C 2YJEA 3OYKA 4AHTA 2BE2A 4YY3K 4B1VA 3AO2A 3E9LA 5CZ1A 5SZTA 3D0PA 4M3ZA 2PZSA 2Q1NA 3G0ZA 5HROA 1NK0A 1LAWA 4DR3K 3QNNA 4O55A 1XNQK 5EU7A 5TKWA 3S41A 1LWCA 4KFBA 4KTWA 2RF2A 1YJWN 2G8VA 2V51B 3GDQA 1BCGA 1I6GA 4DQRA 4DR4K 3SI6A 5EX5A 4FJ5A 4C8KA 3KKSA 3U3GA 2LY6A 1K8BA 2B5JA 3SAHA 1QQNA 4NLCA 3DLRA 1CN2A 2M8BB 4O44A 4LSLA 2N69A 5J2QA 3JYTA 3ZETA 1ATNA 1SQKA 3OYHA 3WT0A 2A1RA 3THYB 2YEOA 3DI6A 1JCEA 5BPLA 1QE1A 3O6WA 2O8FA 1VSJA 1N4NA 1W9HA 2UUBK 3WNEA 3H1QA 1VQNN 1NE5A 1YVUA 4DUZK 3H08A 4ISGA 2UU9K 4B9SA 1TKDA 1VQLN 3ZSQA 4DR6K 1HPMA 5KRTA 3M5RA 3TAQA 1LWEA 1TUUA 1CZAN 4CJRA 2E4LA 2WOMA 2N2RA 3VQ8A 3T3FA 3NFAA 3SPYA 3V4IA 3VQ5A 4MDAA 4E7LA 3NAEA 5J2MA 1UGLA 3IMXA 4GVMA 4OPKA 3PSIA 3KOYA 3TWHA 1YAGA 3THYA 1QS4A 1I39A 3KC6A 3VGKA 1SS6A 1ATRA 2KLAA 2ZJQL 4KRFA 4IWVA 3R8EA 4GY2B 3NGZA 1TL3A 4DUYK 3EZWA 4C8LA 2J4RA 3A5OC 3F5TA 2P9KA 2YIOA 3BDPA 3VTIA 1JLCA 3KLHA 2LY5A 4FJNA 4V19S 4X66K 3B6OA 1QVFM 5AR0A 1ZVEA 1KCFA 3C95A 3LAMA 4DR5K 1S9EA 1W7AA 3NBPA 3WNGA 4AHCA 3KLGA 1BGXT 4BGAA 3VQ4A 2HHHK 4EHTA 3WXMB 3JS6A 4FSVA 1TYQB 4W5TA 4BE2A 3MECA 3QIPA 1NGCA 4RWTA 3O4WA 1HX1A 4FM1A 4OKKA 3QINA 1BU6O 4KHSA 1TAUA 3U9ZA 5FROA 2PYJA 1NNEA 4JRPA 3ZSYA 4F3TA 1I2VA 1V4TA 1EX4A 2DFEA 3OBWA 2ASPA 1SKSA 2HBKA 1BO5O 1L4VA 3Q7CA 4H5TA 4ZHRA 1VRTA 4LFCK 2RHKA 4J2BA 1JJ2M 5AQRA 1IKVA 3LAKA 5BN8A 3HP9A 4DF4A 3L3UA 3RMAA 5KI6A 1HKGA 4BR9A 3HPGA 4FWOA 1T7EA 3HL8A 2VWBA 3HRGA 4OJRA 1S3XA 3MWPA 4FLVA 1I6FA 2O8DB 1EWRA 4KHQA 3K9JA 2Q3SA 4JI3K 3CERA 3VF4A 2A6AA 4O4GA 2GUIA 5LL6Z 4AM6A 2LR3A 3BZCA 3SK3A 3L2UA 5AQOA 3H3NO 3T1HK 2F96A 4CEZA 3I56N 1RTDA 1T03A 2A40A 1C1AA 3SQ2A 1J9AA 1TV6A 1KXPA 1W0HA 3HYFA 3MXIA 5F0XA 2I7NA 1Q82O 1YJNN 2G8WA 2VG5A 4M3YA 4CZJA 4JS5A 2JDQD 2IVPA 3L2VA 5HP1A 1VNBA 1BUPA 4CZKA 4XIUA 4N47A 3LM9A 2Y1JA 3I33A 4CK2A 5GINA 2Z1GA 4DQQA 1NRAA 3SUNA 1POIA 1UAXA 4DQPA 4E7IA 4A57A 4JYAK 3UKRB 1W97L 5C2FA 1OMYA 3I0RA 3RMCA 4LF4K 3OYMA 1HPZA 4M3UA 4OO1J 1NGEA 4UADE 3E7RL 3BZKA 1NMNA 4JKDA 1SN4A 3O9TA 3HPOA 1VHXA 2JGUA 3SUPA 3CCVN 2LSNA 4BG8A 1T3VA 3C0BA 4DSIA 2Z1HA 1ASUA 4OLBA 4MFBA 3IAYA 1QZ6A 3NF9A 4CQKA 4CHNA 2P5GA 2BANA 1RT6A 4DTRA 4ZTJA 4B9NA 4B9VA 1LOTB 3VN5A 3QEWA 2ZF5O 5AZJB 4DU3A 3MCPA 2JWKA 5EOYA 4MLHA 1KLNA 3M8PA 3UKRA 1GLLO 3P31A 1BHLA 3CPEA 3TSPA 4IOCL 2QXLA 1C0GA 2NRTA 3R9PA 2P1JA 1CLQA 3CC2N 2NRZA 4IBNA 3LDPA 1NJWA 3V1OA 1Z25A 3SUQA 4FL9A 5KGWA 1VQMN 3ZLJA 1KRPA 4Q5VA 1VQON 1N34K 2OCEA 3RMBA 3ATVA 2W00A 3FLCO 4FO0A 4FLYA 1L3UA 1GOAA 4E89A 1ZBSA 1KVAA 1MDUB 2N66A 2P51A 1X9SA 1OH6A 2QTDA 3SV3A 3CCUN 2F9TA 4DS4A 1BA0A 3DWLA 5AQUA 3OS0A 4FM2A 3MCAB 1BL3A 4EZ6A 1NK7A 1R59O 3LWLA 4IO8A 3TSQA 4AQYK 3QNOA 4FJXA 4FLZA 5C0YA 4HHTA 1B9DA 4JKBA 4QS7A 4DV3K 4I6MB 1OVYA 4KH6A 3CQ8A 3LP1A 2P9LB 1LW0A 3T7ZA 4YOVA 4B3SK 4DSEA 1TKZA 4RG8A 1CXUA 3KP1A 1MYNA 2FBTA 3KOWA 4CGFA 4B9QA 1TL1A 4JLHA 3LL3A 3AO4A 1BQMA 4ICLA 4BRNA 3OTOK 2WTUA 4KTZA 5HL7L 2ASMA 4NO7A 4W5QA 3J80O 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QVG M;  1Z05 A;  3WNF A;  4Z4E A;  3LAL A;  2DPN A;  3SPZ A;  4DHY A;  1B92 A;  1NBW A;  1NM1 A;  1XMQ K;  4C1N K;  1QSS A;  4IZ9 A;  2WC9 A;  4BRG A;  2E5L K;  4CBX A;  5BRF A;  2OPS A;  1TI5 A;  3SV4 A;  2E6M A;  1M1K O;  5FLX O;  3KLE A;  4KHU A;  2GMO A;  3IDH A;  4K8Z A;  2YC1 C;  2YJE A;  3OYK A;  4AHT A;  2BE2 A;  4YY3 K;  4B1V A;  3AO2 A;  3E9L A;  5CZ1 A;  5SZT A;  3D0P A;  4M3Z A;  2PZS A;  2Q1N A;  3G0Z A;  5HRO A;  1NK0 A;  1LAW A;  4DR3 K;  3QNN A;  4O55 A;  1XNQ K;  5EU7 A;  5TKW A;  3S41 A;  1LWC A;  4KFB A;  4KTW A;  2RF2 A;  1YJW N;  2G8V A;  2V51 B;  3GDQ A;  1BCG A;  1I6G A;  4DQR A;  4DR4 K;  3SI6 A;  5EX5 A;  4FJ5 A;  4C8K A;  3KKS A;  3U3G A;  2LY6 A;  1K8B A;  2B5J A;  3SAH A;  1QQN A;  4NLC A;  3DLR A;  1CN2 A;  2M8B B;  4O44 A;  4LSL A;  2N69 A;  5J2Q A;  3JYT A;  3ZET A;  1ATN A;  1SQK A;  3OYH A;  3WT0 A;  2A1R A;  3THY B;  2YEO A;  3DI6 A;  1JCE A;  5BPL A;  1QE1 A;  3O6W A;  2O8F A;  1VSJ A;  1N4N A;  1W9H A;  2UUB K;  3WNE A;  3H1Q A;  1VQN N;  1NE5 A;  1YVU A; 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