3TPQA

Crystal structure of wild-type mal rpel domain in complex with five g-actins
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
346
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVVGDEAQSKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Sensing actin dynamics: structural basis for G-actin-sensitive nuclear import of MAL
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Contractile protein/transcription
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 120
structure length 346
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tpqA03
5AQNA 3HZ6A 2F9WA 3RSEA 4CBXA 3CJBA 3ZEUB 3CHWA 1GLBG 2YHYA 3C0BA 4BRFA 3QMLA 4BROA 4FSVA 3BEXA 2P9NA 4CZKA 4H5VA 2QM1A 4A62A 3MN9A 3W0LA 3LM9A 4CZIA 2Q2RA 3A5MC 3MN5A 3L4IA 4QS8A 4JD2A 1KAXA 5AR0A 5BRDA 2IIRA 1D4XA 5F0XA 3R6MA 3CJ1A 1OKJA 2E1ZA 5EY4A 3UKUB 4HWIA 3IFRA 2E1YA 3D2FA 2NZTA 5AQZA 2CH5A 3BP8A 4GY2B 4JHDB 4BVOA 5FPEA 2HF3A 4K42A 1JCFA 1C0GA 1QZ6A 1GLJO 2GUPA 5BN8A 3O4WA 4FOIA 4I6MA 2QWPA 4CZLA 3FFKB 5CE3A 3O1WA 4EHTA 5AQTA 3O6WA 2P9SA 3ENHA 4A61A 3WQUA 4DCHA 4CBUA 2IVOA 2ZWHA 3EO3A 4WQ5A 1NGIA 3DXKB 1KAZA 2QWOA 1DKGD 5AQFA 4ISFA 3ZX2A 5JLFA 5ADXH 4ISGA 3FE1A 3RSEB 1T6DA 1X9JA 3GDQA 3ZEUA 2YI1A 5F1XA 1SZ2A 4BRIA 2NRHA 3ULEB 1BDGA 1NMDA 3WXIA 3VGMA 4PKHA 3ZETB 5TKYA 3U4LA 4M7XA 1Z6RA 2BUPA 3O1BA 4CD1A 1C0FA 5E84A 4O5FA 1HKBA 1NGBA 1E4GT 3A5LC 3A5OC 4XH5A 1J6ZA 3O8MA 5JICA 4RCHA 3H46O 1SAZA 4BGAA 4BREA 5I9EB 4A2AA 4GNIA 1RDWX 4EIAA 5B8HA 4EAHD 3AAPA 3O08A 3IMXA 1HX1A 4BG9A 2PAVA 1QQMA 4J8FA 3VPZA 2D0PA 2A41A 5AQSA 4H5RA 2F9TA 2QWLA 2P9PB 3U8XA 2P9IB 3MK6A 3H3OB 3GOIA 3MMVA 1QQNA 3FZHA 4A2BA 4YDUC 1NM1A 1NGGA 2A3ZA 4LC9B 1MA9B 1NGJA 2ASOA 2P9LB 5FPDA 2NLXA 1DEJA 4RTFD 2DPNA 4IO8A 4JNEA 3WEEA 3LDLA 2WUSA 1IG8A 3SLCA 5BPLA 3KVGA 5FPNA 1NGHA 3VEVA 2A42A 4WQ4C 3AY9A 3VGLA 1P8ZA 1S3XA 4BRGA 4F9OA 5ELZA 4BRPA 2E2NA 3O80A 4B9QA 1ZBSA 3A8YA 2ASMA 4AM6A 3HBTA 2W40A 1BA1A 3M3ZA 4BRCA 3P4IA 2ZGZA 4WQ4A 3OHRA 4MO4A 3BF3A 3SMPA 1KXPA 1WOQA 3W3DA 3VF4A 3HM8A 3LDNA 4FO0A 4ISEA 4B1ZA 1XC3A 5LJVA 5BPMA 2D1KA 2P9SB 1TYQA 2GELA 1YAGA 3QB0A 4DQ8A 2GEMA 4I6MB 4DB3A 3FLCO 1MWKA 3GL1A 3JXUA 2GWKA 3MDQA 5AQIA 4B1VA 1K8KB 1V4SA 3U9ZA 5KPZA 5EVZA 4FPAA 4BG8A 2BTFA 2HOEA 3QBWA 1WUAA 4H0VB 4KBOA 5AZIB 2A5XA 1TUUA 3QICA 4IXCA 2P9UA 1GLFO 2FSKA 4FWQA 4JN4A 3D2FB 3CQYA 1GLDG 1RGIA 2FF3B 4XEIA 3G25A 1NBWA 1NGCA 4BRHA 2QWNA 1QZ5A 2E20A 2YHWA 3WT0A 4EHUA 2HMPA 4CJ7A 3QFUA 3FZLA 4BR5A 3CJAA 4JD2B 4JHDA 3VERA 2E8AA 1V4TA 4EFHA 1JCEA 3D2EB 2QWRA 5AFUH 2YCHA 4PL7A 5BR9A 1ATSA 3HSCA 3UKUA 5BPNA 1LCUA 3CETA 1QQOA 2J4RA 4H5TA 5AQJA 4BRDA 3VEOA 4FWLA 3KHYA 3ULEA 5KPTA 1KAYA 1DGKN 4K25A 4H0XB 3CQXA 5BRFA 4BC2A 1HUXA 1MDUB 2FLOA 1XQSC 2I7PA 2AP1A 3H6EA 4H0OA 5LY3A 4BRMA 2Q0UA 4BQLA 3FZKA 3UB5A 3IUCA 1HJOA 3ZETA 1BUPA 3ATVA 1TYQB 2QW9A 4Z94A 2EWSA 4FOEA 1G99A 3FGUA 2FXUA 5BN9A 2FSJA 4B1WB 1TUYA 1NGFA 1BWFO 3A0IX 1NGDA 1QHAA 3AARA 3WUHA 2V7ZA 1SQKA 3U9DA 1BO5O 3C7NB 2Q31A 3J8AA 1GLCG 5BREA 3H3NO 3DXKA 2ASPA 5BRHA 1U2VB 3BUZB 3D7EO 5AQLA 3EN9A 5LJWA 3BF1A 3DXMA 4H0PA 2UYTA 4BR2A 4FWSA 4NO7A 4QS9A 4BC5A 1ESVA 2P9IA 5AQGA 2P9KB 3VF6A 1JCGA 2IVPA 4WQ5C 5AQQA 4CZJA 1HLUA 5JLHA 5JMVA 4M63C 2P9KA 1Y64A 3GE1A 5AFUA 3LL3A 4BRAA 5AQPA 1XUPO 1U2VA 4H0TB 1ATRA 3DXMB 2CGJA 1R59O 3VEYA 1YXQA 4B1XB 1MWMA 2ITMA 3WXKA 2P9NB 2D0OA 3ID8A 3LDPA 1S22A 4BQZA 3EZWA 3FZFA 3LDQA 3VEXA 3MN7A 3SMSA 1ZXOA 4XH4A 3VOVA 5E26A 5AQXA 3S41A 4PL8A 5KPRA 3MN6A 3R8EA 3MCPA 4JAXA 1HKGA 4CZEA 2OANA 3SK3A 5AZJA 2CGLA 3A5NC 4FWPA 1ZC6A 3CI5A 4M7YA 2GTDA 2YJEA 3ATUA 5AQOA 5AQWA 4CI6A 1YUWA 2D4WA 2P9LA 4MLHA 2Q1NA 1GLLO 3EKSA 3VEWA 3CJCA 4H5NA 4BRLA 1ATNA 3CIPA 5AQMA 4FL9A 1X3NA 3D2EA 1H1VA 4BRQA 3CERA 4QS7A 3AAQA 4IJNA 4BC3A 4C23A 3WEEB 3WQTA 3DJCA 4WYBA 1X3MA 3I8BA 5AQRA 1HPMA 4FPBA 4H5WA 5KQDA 2V7YA 3O5BA 5AQHA 2QWQA 3GG4A 3H45C 4BR7A 4O8KA 4YDUA 4IWVA 3IDHA 4BVPA 2A40A 2PBDA 4H03B 5AZJB 2E2OA 2E88A 3H1VX 4K41A 4BR0A 4BGBA 1LOTB 3HTVA 4FWRA 2V51B 4L3QA 4CZGA 4PKIA 4IJAA 4HTLA 1NGAA 3ZX0A 3B8AX 4FWMA 5AQUA 3FZMA 3VETA 4BC4A 4PKGA 4CZFA 4CZHA 3UKRB 1YVNA 4E1JA 3I33A 4CD3A 4BR9A 4DHYA 1Q18A 1IJJA 1CZAN 3KZBA 1BG3A 5AQYA 2KHOA 1BOTO 3QDKA 1BA0A 4MO5A 2V52B 2VYPA 2Q36A 3LM2A 3ENOA 2FF6A 3GBTA 4Y0WA 2VWBA 3DAWA 5KQ8A 4FWKA 1Z05A 5EXWA 1T6CA 3H1QA 3JS6A 1U6ZA 2CGKA 2HF4A 4BR4A 1T44A 3TPQA 3F9MA 1GLAG 3VENA 3ZX3A 3QBXA 3L0QA 3VF2A 2A6AA 4BRKA 4H0YB 5FPMA 3EL2A 2W41A 3VESA 3VGKA 3LDOA 3DWLA 3UKRA 4IZ9A 3R9PA 3CJ9A 4BRNA 3WXLA 2YJFA 1HKCA 2Q0RA 4K43A 1EQYA 2AA4A 3HI0A 4FWOA 3SJHA 5EX5A 2QWMA 4AM7A 2VCPA 2P9PA 5AQVA 3L6QA 2P9UB 2QXLA 1BU6O 3CJ7A 4CZMA 4FWNA 2IVNA 2E2PA 2I7NA 2E2QA 2Q97A 5EOYA 2H3GX 3M6GA 4B1UB 1NLVA 3WXJA 2YHXA 4RWTA 2CH6A 4XH1A 1NWKA 2ZGYA 4NB4A 3FR0A 2FSNA 3UE5A 2ZF5O 1GLEG 3QFPA 3VEZA 3TU5A 5AZIA 4B1YB 3EKUA 5F2RA 2GWJA 1K8KA 5AQKA 5ADXA 3C7NA 4MLEA 1RFQA 1NGEA 1E4FT 4CBWA 3M1FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DR3K 5AQNA 2HNYA 4CBXA 4FM2A 4WF9L 3O9TA 3TAMA 4A57A 4OVLA 1QE1A 5KGXA 4CE9A 1GLBG 2D0AA 4LSNA 4BRFA 3L4QA 1HPZA 3TTFA 4F2SA 2QM1A 3W0LA 5C0YA 3LM9A 3P31A 4FJKA 4DS5A 4JD2A 5AR0A 5BRDA 4IKFA 4NCBA 4DQQA 1XHXA 2KTQA 3LPUA 4DF8A 1QTMA 3IKMA 3ULDA 1BI4B 1TL1A 3P38A 3IFRA 3J80O 4C8OA 4Z4GA 1RT2A 1W7AA 5AQZA 4ELUA 2CH5A 3RMDA 4GY2B 4AF1A 4BVOA 1YF5L 1S1TA 5J2PA 3TR8A 4OKJA 2Y1JA 4IDKA 4JLHA 4FLUA 3HOTA 3O1WA 5AQTA 3O6WA 3ENHA 4A61A 4DCHA 3WQUA 4CBUA 3CCLN 2O8BA 2ZWHA 3EO3A 1K9MO 1KAZA 4DU1A 5M1OA 4ISFA 3OBYA 4EZ6A 2O4IA 1L5UA 3ZX2A 4N56A 1BCMA 1UAXA 2XHBA 3RSEB 1SKRA 4NXNK 4FJ9A 1NK0A 2YI1A 1VQ9N 3AA5X 3ZETB 3K2PA 2BUPA 3O4QA 4JKBA 5E84A 4CD1A 4O5FA 1NGBA 1E4GT 3A5LC 3A5OC 1T05A 4LD0A 4DSKA 3AVMA 1SAZA 5KTQA 4CJLA 5I9EB 4A2AA 4PA1A 4B9UA 4N76A 4IG3A 3ZLJA 3VPZA 4LF7K 1WN7A 1FW6A 4OGEA 3NVKA 5AQSA 4QAGA 1VSKA 2F9TA 1YHQN 3MK6A 3VQ8A 3GOIA 3MMVA 3FZHA 4FJNA 4YDUC 5FROA 1D9DA 4JS5A 4YOVA 5FPDA 4LFCK 4JYAK 4WFAL 4C8MA 3CYGA 4JI0K 1VQMN 4OLBA 1TL3A 1NKBA 1JLGA 3VEVA 2HHQA 3AA4A 1P8ZA 5KRSA 3IAYA 4JK9A 1E3MA 2VGNA 2HHXA 3HK2A 3CF5L 2RN2A 4DTXA 3J7ZO 3AVNA 4HHTA 2G8HA 1BIUA 4FW2A 1U49A 4CHNA 4LF5K 4DUZK 3ZSVA 1BQNA 3W3DA 1IG9A 3LDNA 4ISEA 5LJVA 5AJ3K 5BPMA 1TK5A 1TYQA 1YAGA 3QB0A 4KHPK 3HYFA 1VQNN 4DB3A 3FLCO 4FJJA 4DTNA 2GWKA 2YKMA 5HBMA 3MEGA 1SL2A 1X9WA 5FRNA 2BTFA 3ASMA 4DTJA 2E5LK 4IXCA 2P9UA 3AVAA 5GIOA 2IS3A 1RTJA 4GMJB 1NOZA 3D2FB 2YHAA 1KVCA 2O4GA 5CYQA 2VWKA 4E1MA 1NK9A 3VQDA 3C95A 3KK2A 4BRHA 3AV9A 4JK7A 4BR5A 3L2WA 3CJAA 4JD2B 1BL3A 4E1NA 1OVQA 2E8AA 1V4TA 3U3YA 1JCEA 4CIFA 5AFUH 2YCHA 5BR9A 3TWHA 2FC0A 2HBMA 3WNEA 3ULEA 5HL7L 3HT3A 5CY4A 4L8RB 3CQXA 1N32K 4F3TA 3I0RA 3TSUA 5J1EA 4NLBA 2AP1A 3H6EA 4FK2A 4H0OA 1NJXA 4BQLA 1L3UA 4E7JA 4KHNA 1JJ2M 3IUCA 4RW6A 2O8DA 3ZETA 4JI8K 4Z94A 2EWSA 4FOEA 1G99A 4F2RA 2JWKA 3JYTA 3AARA 2PYLA 5CZ1A 1U48A 5BREA 3SUNA 3FFIA 1S6QA 4E0DA 5BRHA 3TAPA 1U2VB 3BUZB 4EZ9A 4Z4HA 5LJWA 1VAZA 1S1XA 3DXMA 4H0PA 4CEDA 3I8DA 4W5QA 1NKEA 1NJZA 4BC5A 4C8KA 2P9IA 4KB0A 2P9KB 3AGRA 2HMIA 1VSDA 4WQ5C 1IBLK 1U04A 2GV9A 4U67L 1LW0A 5JMVA 2WONA 3TANA 4FLVA 3GE1A 4JRPA 2G8VA 3LL3A 3N4QA 2P51A 4IEIA 4H0TB 1ATRA 1JKHA 3E9OA 4I7FA 2ITMA 3CCQN 3LDSA 5BR8K 1B9DA 4JRQA 2D0OA 5SWMA 1X9MA 4ZTFA 3THWA 3FZFA 4DR7K 3T19A 4IFEA 4C8NA 3F73A 4BACA 3VEXA 4KPYA 1ZXOA 4OJRA 1R0AA 5AQXA 3NGIA 4PL8A 1JL2A 2ZJRL 4JAXA 3F5TA 2OANA 1RBRA 4QCLA 4YOYA 1TKDA 1ZC6A 3VQ9A 4E89A 2OYQA 2D4WA 4CJFA 4QOZB 3SPYA 4JKCA 2Q1NA 4N41A 4JI5K 1ATNA 5AQMA 4CJVA 4M3ZA 1H1VA 2Z1GA 4GV3A 2E4LA 4IJNA 4BC3A 4CF0A 4JI6K 4H5WA 2V7YA 3O5BA 4DFMA 4KHYA 4YDUA 3NH1A 1D8YA 4RW7A 4BWMA 4BVPA 4OO1J 3AO5A 1J5OA 3OJSA 5CHIA 2BE2A 4DF4A 2HBKA 3H1VX 1NJIO 1WSGA 4K41A 4BR0A 2RHKA 3V81A 1VQ6N 4FWRA 4DSIA 2V51B 4PQUA 4CIGA 1DLOA 3AVGA 3VQ6A 4CZFA 1XMOK 1DT9A 3UKRB 3VQ4A 1YIJN 1YVNA 4E1JA 1YVUA 1IJJA 3K59A 3MCAB 4CJKA 3NF8A 4KFBA 2VG5A 1KQSM 4O8UA 1RNHA 3BZCA 3QERA 1C1CA 4B9SA 2FF6A 3GBTA 3PV8A 3G71N 1HYZA 1BQMA 3B6OA 5KQ8A 4ILGB 3NGYA 3JS6A 4IOXA 5C10A 2HF4A 1T8EA 2RE2A 4WCEL 4J2BA 4FLYA 4ELVA 2XO7A 2W41A 5IWAK 3UKRA 2D0BA 3DWLA 3CJ9A 1EETA 5H1SQ 1M1KO 4CHPA 3TTDA 1EQYA 2AA4A 3OYMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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