3TPQA

Crystal structure of wild-type mal rpel domain in complex with five g-actins
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
346
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVVGDEAQSKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/transcription
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Sensing actin dynamics: structural basis for G-actin-sensitive nuclear import of MAL
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 120
structure length 346
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tpqA03
4MO5A 3TU5A 3CJAA 2Q0UA 4IO8A 3SJHA 4BRHA 4BQLA 3A8YA 1HKBA 3AAPA 3CJ7A 3WXLA 5JLFA 3CQXA 3EO3A 4FWNA 3DXMB 2HF3A 4H5NA 3O80A 4DCHA 4O8KA 1BOTO 3O4WA 3IDHA 2CH5A 5AZIB 4PKGA 2FF6A 3GG4A 3C7NA 2YJFA 3BP8A 5LY3A 3ZEUB 3O6WA 3ZEUA 3O5BA 2CGLA 3HBTA 3D2EB 3H6EA 1YUWA 2EWSA 3G25A 4H0OA 1MWKA 3S41A 4CZEA 4BGAA 3FFKB 4EHUA 3FR0A 4QS8A 5KQ8A 1X3NA 3D2FA 2E2OA 1HLUA 2YHYA 4B1UB 3CI5A 2A42A 2V52B 2P9UA 1NGIA 4PKHA 1G99A 3I8BA 2D4WA 3CJ1A 5AQNA 3EZWA 3ZX2A 2WUSA 1LCUA 3ENOA 3VEXA 2HMPA 3CETA 4H0VB 2Q36A 4CBXA 3A5NC 1Y64A 1NWKA 5AQXA 3EKUA 4QS7A 3ZX3A 4BGBA 1HJOA 4DHYA 4B1XB 4FWMA 1E4FT 1GLJO 5BN9A 2IVOA 2ZGZA 4J8FA 2IVPA 4BR7A 5BREA 1IG8A 4WQ5C 3WQUA 4B1ZA 3U4LA 5AQQA 1WOQA 3OHRA 4LC9B 4BRKA 3O1BA 4RTFD 4MLHA 2BTFA 3RSEB 4IJNA 2QM1A 3RSEA 3FZFA 2PBDA 3SMSA 2E2NA 1BWFO 4BC2A 5JLHA 2W40A 1H1VA 3MCPA 4CBWA 4JNEA 4BG8A 1KXPA 3LDLA 4BRLA 4WQ5A 4EIAA 4CZMA 4EAHD 2E2PA 2VYPA 4NO7A 5FPDA 1DEJA 3C0BA 3W0LA 3W3DA 3VF4A 1GLCG 5AQJA 4H03B 3UKUA 3LDOA 1NGDA 2VWBA 4FWRA 4MLEA 2CH6A 5KPTA 1LOTB 4GNIA 3U8XA 3ZX0A 2E1YA 1HUXA 3R9PA 5AFUH 1Z05A 1U2VB 4BR5A 2ZWHA 1BA1A 1U2VA 4DB3A 1NGJA 5BRHA 3VEOA 4HWIA 3SK3A 2D1KA 1SAZA 3QBXA 4JAXA 5BR9A 4CI6A 4BC3A 3VERA 4JN4A 3VOVA 3FZLA 4BR0A 4FWKA 4FWLA 3KZBA 3LDPA 4M63C 1NGEA 3ATUA 3I33A 3LM9A 5ADXA 3HTVA 3H3NO 5AQHA 1BG3A 1OKJA 4ISFA 3VF2A 1D4XA 3FLCO 3UB5A 4BG9A 3KVGA 3FGUA 1U6ZA 1GLFO 4AM6A 1BUPA 4FPBA 4CZKA 4CZFA 5E84A 2P9KB 1RDWX 3DXMA 2P9KA 4CZIA 2E20A 2GWKA 1HX1A 1BA0A 3WT0A 3CJCA 2ITMA 3L4IA 5AZIA 4M7YA 3DXKB 1DGKN 5AQOA 4BRIA 3LM2A 5KPZA 4I6MB 4I6MA 1SQKA 3HZ6A 3IUCA 3D2EA 3BUZB 5EXWA 2VCPA 4L3QA 2FF3B 4A62A 3EN9A 4CD1A 2FSKA 1X9JA 3QB0A 4H5RA 3VGLA 2P9SB 4IZ9A 4K25A 2E88A 1HKGA 2P9SA 1MA9B 2HOEA 5AQPA 2AP1A 2Q97A 4GY2B 4PKIA 3LDNA 3H1VX 1MWMA 3AY9A 5CE3A 4IXCA 1JCEA 3CQYA 4ISEA 5AQTA 1HPMA 4PL7A 1CZAN 5AQZA 1XUPO 3D7EO 2QWMA 4NB4A 2UYTA 4XEIA 3ATVA 3CERA 1NM1A 3HM8A 4CZJA 2J4RA 2ZGYA 2W41A 1GLBG 1Q18A 5E26A 5BRFA 4K42A 1NGHA 5EOYA 5I9EB 2E2QA 1C0GA 2F9WA 2ZF5O 1NGCA 2A3ZA 1TYQB 3H3OB 1TYQA 1NMDA 2NLXA 4H0XB 4WQ4A 1EQYA 1Z6RA 1S3XA 1RFQA 5F1XA 5FPMA 3H1QA 4EHTA 5AQGA 1J6ZA 5JICA 1ESVA 3WXIA 3WXKA 4CD3A 4M7XA 4A2AA 1DKGD 3VEWA 3VGKA 2A40A 2E1ZA 3R8EA 2GELA 3CHWA 3EKSA 4BRCA 1QQNA 4CZHA 4BQZA 3UKRB 3CIPA 5FPNA 1JCGA 5BPMA 2FSJA 3SLCA 1GLLO 4BRNA 4K41A 4BRAA 4BVPA 3MN6A 2OANA 3GL1A 4PL8A 1KAYA 1TUYA 2YJEA 1R59O 3FE1A 3WQTA 4BRQA 3U9DA 4IWVA 1BO5O 1IJJA 4CBUA 4FWPA 3P4IA 2ASMA 3AARA 5EX5A 3A5OC 3VEVA 5AQLA 1WUAA 2CGJA 3FZMA 2GTDA 2DPNA 2QWNA 3VESA 1P8ZA 4XH4A 2YHWA 2YHXA 3MMVA 3VGMA 5B8HA 3EL2A 4FWSA 5KPRA 4JHDB 1RGIA 3HSCA 1BDGA 1YAGA 4A61A 2A5XA 3L0QA 4BROA 5AZJB 5AZJA 2GWJA 1GLAG 3BF3A 3ID8A 2F9TA 4C23A 2KHOA 1GLEG 2PAVA 3SMPA 1T6DA 4BRDA 3IMXA 5TKYA 3U9ZA 4FPAA 3DJCA 4FO0A 3QDKA 4Y0WA 4F9OA 5BPNA 1V4TA 4YDUA 3VENA 2GEMA 4FOEA 4B1VA 4FSVA 2YCHA 3O8MA 3QFPA 2V7YA 3BF1A 5KQDA 1ZC6A 2P9IB 3M3ZA 4MO4A 2P9IA 1XC3A 2H3GX 3DXKA 3FZHA 4BRMA 4CJ7A 2I7PA 4H0PA 5ADXH 3H46O 5AQUA 4BR2A 4FWOA 2QWPA 1MDUB 4H5VA 2QWOA 3WXJA 5AQVA 2D0OA 4BR4A 1X3MA 2IVNA 3QFUA 3GDQA 1T6CA 3KHYA 4Z94A 3FZKA 2V7ZA 3AAQA 4XH1A 5EY4A 5ELZA 5EVZA 3HI0A 1ATSA 2NRHA 4XH5A 4DQ8A 3C7NB 4O5FA 4WQ4C 1QQMA 3M6GA 3VETA 3VF6A 1K8KB 1ATNA 1K8KA 4H0TB 2GUPA 4HTLA 2V51B 4BR9A 2QWQA 2ASPA 3LDQA 2CGKA 2A6AA 1C0FA 3D2FB 5AQIA 5AQWA 3WEEB 3WEEA 1BU6O 5LJWA 2P9UB 1T44A 5AQFA 2P9LB 1NGGA 3JS6A 2YI1A 2P9LA 1NBWA 4ISGA 1V4SA 2A41A 3CJBA 5F2RA 1QZ6A 3GE1A 2QWLA 3J8AA 2HF4A 3MK6A 3UE5A 3CJ9A 4CZGA 4E1JA 1ZBSA 3F9MA 4BC4A 1YXQA 2Q0RA 3VPZA 2Q1NA 1NLVA 4WYBA 1TUUA 2AA4A 4QS9A 1QHAA 3VEZA 2FSNA 4RWTA 5LJVA 3UKRA 4BVOA 1QZ5A 3MN7A 3O08A 2QWRA 1YVNA 1E4GT 4FL9A 4B1YB 3LL3A 5JMVA 3ZETB 4RCHA 5F0XA 3ZETA 3MN9A 1GLDG 4BRPA 4H0YB 3R6MA 2P9NB 2Q31A 2P9NA 4FWQA 2ASOA 1NGFA 3MDQA 1NGAA 4FOIA 3H45C 3DWLA 3VEYA 3GOIA 5BN8A 5AFUA 4H5WA 4BRGA 2Q2RA 3IFRA 3MN5A 4IJAA 2NZTA 1S22A 5AQMA 1XQSC 3ENHA 3BEXA 3TPQA 3O1WA 1ATRA 5AQKA 4CZLA 4AM7A 3UKUB 4B9QA 3JXUA 1HKCA 3QMLA 1QQOA 3QBWA 5FPEA 2IIRA 3L6QA 3QICA 4JHDA 3A5LC 1NGBA 4YDUC 5AQRA 2D0PA 3A0IX 5AQYA 3ULEB 1KAZA 2FXUA 3ULEA 2FLOA 3B8AX 3WUHA 4BRFA 5AR0A 5BRDA 4H5TA 2I7NA 2QXLA 5AQSA 4K43A 1KAXA 3A5MC 4KBOA 3GBTA 4B1WB 2P9PB 1SZ2A 4EFHA 2P9PA 4A2BA 3M1FA 2E8AA 3DAWA 4BREA 1JCFA 1ZXOA 5BPLA 2QW9A 4JD2B 4BC5A 4JD2A 2BUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDBA 4MO5A 3TU5A 4HUGA 4BQLA 3A8YA 3AAPA 3I0SA 4FJLA 3QNNA 3CQXA 5BR8K 4YOWA 3QIOA 3O9UA 1BOTO 3O4WA 1RT7A 2VGMA 1P90A 2WOMA 4FW1A 4PKGA 2JWLA 4OLBA 3GG4A 3ZT0A 1KTQA 3BP8A 3UIQA 3O6WA 4E89A 3C6HA 3S3MA 1XHZA 1HYVA 2B6AA 4O5BA 4OKEA 3FFKB 4EHUA 1YJ9N 3F73A 3AGKA 3FR0A 5GAEP 1UAXA 1VQPN 4Y1CA 1X3NA 1N8RO 4IDHA 1XMQK 3NFAA 4FXDA 4HCBA 2YNFA 3NMUA 4JKGA 4QAGA 3NH1A 1RTIA 2D4WA 3ZSRA 2HHSA 4EP4A 2WUSA 2OZMA 3ZSVA 3RRHA 3E01A 2UUAK 4CF1A 3CETA 4H0VB 4CBXA 3A5NC 3AO3A 4M42A 4DR7K 5AQXA 4B9NA 3OY9A 3CM5A 4O4GA 5IWAK 1C1BA 2ATQA 4DTOA 2ZGZA 3V9UA 4J8FA 3CG7A 4R79A 3P39A 4CHQA 4FM0A 4WQ5C 3G71N 4B1ZA 4ILHA 3CCQN 4BRKA 1YHQN 4BY9C 4J2AA 3HK2A 3T19A 4MLHA 1D5AA 3O3GA 1HJRA 3RSEA 3I8DA 3D45A 3H08A 1BWFO 3HSTB 3K9JA 3CFPA 3MCPA 1H1VA 1KXPA 4CZMA 1DEJA 2FC0A 3W0LA 3C0BA 1YVUA 3VF4A 4DTJA 1VQ9N 4FJNA 3UKUA 4H03B 3LDOA 3CQ8A 1C0UA 4W5NA 4LFCK 1UOCA 3OJSA 2QKKA 3RMBA 3U8XA 1HUXA 3TTDA 1HR0K 3HVTA 3R9PA 1Z05A 1YI2N 3VN5A 1U2VA 4DB3A 3OYDA 1NGJA 3OYLA 3DYAA 3HXMA 4FJXA 4M41A 1SAZA 4E7LA 4AH9A 4JAXA 4BC3A 3VERA 3ITHA 4JN4A 1C1AA 4L8RB 3NVKA 1TV6A 4OVLA 4DFJA 4KB0A 2P5GA 4CGIA 3MAQA 3LDPA 3M8QA 3I33A 4RW4A 3HTVA 3M8RA 2WC9A 5AQHA 3VF2A 4DR4K 1WAFA 1VSJA 5GINA 3UB5A 1VSEA 4PWDA 3K57A 1GOBA 3FGUA 4CZFA 4AM6A 1NNEA 1KCFA 2ZE2A 4CZIA 3LWMA 3I56N 1IBKK 4CEQA 2F7TA 1SKRA 2OPSA 3DXKB 1DGKN 5GIOA 3OS1A 1BIZA 1WBBA 2UUCK 4CHZA 3DM2A 1SQKA 2HW3A 3HZ6A 1N33K 3HT3A 3AA5X 2VCPA 3V1RA 4FM1A 4DQPA 1JL1A 3TSPA 1HKGA 2HOEA 5AQPA 4M3XA 4PKIA 2Q3SA 3LDNA 4CFBA 2QA4N 3AY9A 4CJUA 1S9EA 3AV9A 4KHUA 4ILGB 1HPMA 5FDLA 1L3TA 4IOCL 2QWMA 2UYTA 4DLEA 2G8UA 4GKKK 3DRSA 5BRFA 1R0AA 4DU3A 4K8XA 4B9MA 3PUFA 3MXJA 4DQSA 3H3OB 3WNHA 4B9SA 1S3XA 1RFQA 5F1XA 2O8CB 2O4GA 5AQGA 3OYHA 4KH6A 4CHPA 1SL0A 4CD3A 3HVRA 1SL2A 3RR7A 2W42A 2JWKA 3VEWA 5CYMA 3CXCM 1K8AO 2GELA 3CHWA 1S5JA 2O4IA 3V1QA 4FJ8A 1JLFA 4BQZA 2DFHA 3B6OA 3T7ZA 4LH4A 4JI2K 3SLCA 1GLLO 1VQKN 5KTQA 3DMJA 4Z4EA 4W5RA 2OTLN 4K41A 4BRAA 4CK3A 2OANA 5HROA 3GL1A 4PL8A 3SQ1A 3U9DA 2BDPA 4IWVA 3S5TA 4C8NA 1IJJA 4FWPA 2Y1JA 2X6SA 1QVFM 3OYJA 3ZYYX 3VEVA 5AQLA 2E5LK 4LF5K 3TI0A 1NU0A 1B9DA 3SUOA 3QERA 5B8HA 5KPRA 1J9AA 2XY5A 4YNQA 5HOOA 1BDGA 1YAGA 2ZJRL 2O8FB 1OVYA 4BROA 4BEBA 4HUEA 2GWJA 2R7YA 3ID8A 4C23A 2KHOA 1QVGM 4CJWA 5CY4A 2YKMA 4I9LA 1NJYA 2YNHA 1T3VA 3CC4N 1W0HA 3IMXA 3KKSA 3NF8A 4IOAL 1Q8IA 4B9VA 1HNIA 1KC8O 1V4TA 3TSUA 1KQSM 4B1VA 2PY5A 1U48A 4CEOA 4ID5A 1ZC6A 4DR5K 1JKHA 2P9IA 3DXKA 3FZHA 4FJMA 5M1PA 4DSIA 4OKJA 1CXUA 1ITGA 1X1PA 5MLCQ 2PZSA 2ZD1A 2XY7A 1EX4A 2D0OA 1RDUA 4U67L 1WSJA 1SKWA 2IVNA 5LL6Z 4KHYA 3QFUA 3DI6A 4C8KA 2WTUA 4F8RA 4E7HA 2NRHA 3C7NB 4FJJA 2OA8A 2QEXN 3M6GA 4O55A 3VETA 1TK8A 2KTQA 1LV5A 4H0TB 2GUPA 1W97L 1OH7A 2V51B 1OH6A 2CGKA 1KFSA 3DLRA 3CPEA 4I9QA 4FJ7A 1QSLA 1NGGA 2P9LA 2HNDA 1V4SA 2A41A 4X64K 4RW6A 5I42A 3B6PA 3MK6A 1XI1A 3DLEA 3CD6N 3MWPA 4F2RA 3VQQA 2Q1NA 2AA4A 3HP6A 2P1JA 2FSNA 4RWTA 3AVIA 4BVOA 1QZ5A 2VQFK 4KPYA 4O8UA 3LL3A 2OCEA 1Q81O 3JAMO 4CE9A 3ZETA 3O9TA 3VA0A 1GLDG 4H0YB 3QEPA 2P9NA 1NGAA 1XNQK 4FOIA 3L2QA 2EHGA 4JKBA 3VEYA 3GOIA 2XO7A 1VSHA 5AFUA 2D0CA 2Q2RA 5M1NA 2NZTA 3SBTA 4E1MA 3P5JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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