3TPQA

Crystal structure of wild-type mal rpel domain in complex with five g-actins
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
346
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVVGDEAQSKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Sensing actin dynamics: structural basis for G-actin-sensitive nuclear import of MAL
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Contractile protein/transcription
total genus 120
structure length 346
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tpqA03
1XQSC 2A5XA 1C0GA 1YUWA 4FWRA 5BPMA 4AM7A 5AQOA 1WOQA 2YHWA 4O5FA 5AFUH 1RDWX 4DQ8A 1BWFO 4H0XB 4A62A 3O8MA 2CH6A 3SMPA 3EKUA 4BRMA 3HSCA 2QWQA 5F2RA 2E8AA 2FF3B 2GELA 2FF6A 4FOEA 3VERA 4CZJA 4BRLA 3VF6A 1QQMA 2HF4A 3CJ1A 3CJAA 4YDUA 2BUPA 3A5NC 3LDQA 4CZHA 1NBWA 4BR4A 3ULEB 1DGKN 4BRHA 2IVNA 4CBXA 2KHOA 2P9LB 3CJ9A 4H0PA 3UKUA 1V4TA 2A40A 3GDQA 4WQ4C 2QWNA 1NGJA 5EY4A 2V51B 3FLCO 3WQTA 5AQHA 2ASMA 3D2EA 5FPNA 4GNIA 4J8FA 2W41A 1BUPA 1H1VA 1NLVA 4RCHA 1LCUA 4H5NA 3RSEA 4BVPA 5AQJA 4BR0A 2CH5A 2V7ZA 3MN7A 4FSVA 4ISGA 4QS9A 1G99A 1NWKA 2FLOA 4M63C 1BA0A 4BG8A 1HKCA 5AZJA 3HI0A 3QDKA 3VEYA 1BOTO 2P9KB 3WXIA 3DAWA 3EZWA 1E4GT 4FWMA 1V4SA 2Q0RA 1NGCA 2E20A 4YDUC 3HM8A 3I8BA 4JAXA 5AZIA 3GG4A 4PL7A 1MWKA 3ZX0A 4A2BA 4MLHA 4QS7A 4FPBA 5JLHA 3U9DA 3ATUA 3ZEUB 5JICA 1U2VA 4BRFA 5BRHA 4BR7A 4BRDA 3H1QA 1SQKA 3H1VX 3L0QA 4B1YB 1E4FT 4B1ZA 4H5TA 5BN8A 3U4LA 3FZFA 2P9PA 2P9NA 3VGLA 1BG3A 2Q2RA 3KHYA 3B8AX 3LL3A 3ZETB 3BEXA 4MO5A 1GLCG 2I7PA 4JHDB 3UB5A 4BREA 3D7EO 4ISFA 4WYBA 2P9IB 5AQMA 4RWTA 2PAVA 3ENHA 3MN5A 5AQWA 1CZAN 3VEXA 4Y0WA 3BF1A 2YI1A 4EHTA 3SLCA 4M7YA 3LM9A 3A5OC 4XH1A 4FOIA 5BN9A 4PL8A 5AQKA 4CZGA 4RTFD 3O80A 2FXUA 2WUSA 4BC5A 4DHYA 1DEJA 4IXCA 2YJEA 5F0XA 3A5MC 4XEIA 4FPAA 3CETA 4CZMA 3GBTA 1TYQB 5F1XA 1GLEG 2IIRA 3FZKA 3H6EA 1S3XA 4FO0A 5AQYA 2AP1A 3EL2A 4LC9B 1BDGA 1XC3A 1X3MA 2AA4A 3ULEA 2DPNA 4H0OA 2ASOA 2FSNA 3UE5A 2QXLA 2P9LA 2W40A 3IDHA 4BGAA 5AQRA 1QZ5A 3VF4A 3AY9A 4EIAA 1NGEA 3EN9A 3M6GA 2ITMA 1MDUB 1BO5O 3W0LA 5EX5A 3CI5A 3O08A 3VEOA 4CZEA 5AQNA 3VOVA 3WXKA 1MWMA 5JMVA 4A61A 3U8XA 4H03B 3O1BA 4K42A 1NGBA 1QZ6A 3QMLA 4IWVA 5AQUA 4BRIA 1GLBG 1MA9B 1ATNA 4CBUA 4CBWA 2Q0UA 4B9QA 4JD2B 4CI6A 4FWKA 5BREA 4H0VB 1HKGA 3WEEA 4FWPA 4M7XA 5CE3A 3AARA 4BRKA 4FL9A 1KAZA 4B1XB 3R6MA 3CJCA 4BR9A 4IZ9A 1X9JA 2NLXA 3ZEUA 2A41A 3C0BA 4BR2A 4CZLA 3WQUA 4CZFA 3DXKB 5AQGA 3O6WA 3ENOA 4BR5A 3VGKA 4EFHA 2E1ZA 1T6DA 2GWKA 3QB0A 3DXMA 5LJWA 4B1WB 2QWLA 4I6MB 5ADXA 1GLFO 2V7YA 3LDOA 3A8YA 5FPMA 4ISEA 1NMDA 2ASPA 3ZETA 4A2AA 1LOTB 2YHYA 4JHDA 3BF3A 4PKHA 4BC4A 5LY3A 5E26A 2QW9A 3FZMA 3DWLA 2P9IA 3M3ZA 1YVNA 1KAXA 4AM6A 2ZF5O 4DCHA 3WXJA 3CERA 2ZWHA 3FZHA 3GL1A 2Q1NA 2A6AA 3TU5A 3FGUA 3HBTA 3CJ7A 5I9EB 3UKRB 4GY2B 4FWNA 1C0FA 3H3NO 2YJFA 4FWSA 4B1VA 5KQ8A 4MO4A 1K8KB 1JCFA 5ADXH 4BROA 1RGIA 3WXLA 1QQOA 3BUZB 4B1UB 4FWLA 2YCHA 1GLLO 1NGAA 3QBXA 3QFUA 1ATSA 1ESVA 1HLUA 5B8HA 1KXPA 1TYQA 5AQPA 5KPRA 2HOEA 2NRHA 3O5BA 1NGHA 1R59O 1ZBSA 3H46O 1NM1A 2P9SB 2H3GX 3MCPA 1GLAG 2ZGYA 3CHWA 1IG8A 4C23A 5KPTA 2D4WA 3KVGA 4DB3A 5AQXA 1X3NA 2P9UB 1SAZA 3JXUA 4Z94A 2GUPA 3VESA 1Z05A 5BPLA 4K41A 4CJ7A 3R9PA 2ZGZA 1XUPO 3VEVA 2BTFA 2CGJA 1GLDG 4HTLA 5EXWA 2Q36A 4H5RA 4JD2A 4O8KA 2GEMA 1WUAA 1ATRA 3G25A 5TKYA 4CZIA 3VENA 2I7NA 5FPDA 2FSKA 4BRAA 2F9TA 4H5VA 4HWIA 2E88A 2YHXA 4FWQA 3EO3A 1ZXOA 2QM1A 4NO7A 2E2OA 2IVPA 5KPZA 2QWOA 4XH5A 1Y64A 3A5LC 2EWSA 3D2FB 2QWRA 4H0TB 3DXKA 5JLFA 3MK6A 3IFRA 1NGDA 3SK3A 5KQDA 1HPMA 3HZ6A 4BQZA 3FR0A 3MN9A 3QFPA 1Z6RA 4L3QA 4WQ5A 3SMSA 3AAPA 2P9KA 1YXQA 5AQLA 3R8EA 1QHAA 4I6MA 3DJCA 3H3OB 2QWMA 4CD1A 1OKJA 2A42A 2J4RA 1YAGA 3C7NB 3O4WA 2A3ZA 4NB4A 1KAYA 3P4IA 3EKSA 2NZTA 3WT0A 2D1KA 5AQFA 2VCPA 3A0IX 3HTVA 3ATVA 3MMVA 1BA1A 3GOIA 2D0PA 4K25A 5AQSA 4F9OA 1P8ZA 3AAQA 3FE1A 3QICA 3FZLA 3KZBA 5AQIA 4EAHD 1TUYA 1JCGA 1JCEA 3BP8A 5AQVA 5FPEA 5EOYA 3UKRA 2IVOA 2E2NA 5AR0A 1NGGA 1TUUA 2PBDA 1GLJO 3I33A 1T6CA 3OHRA 3LDPA 4BC3A 1BU6O 1K8KA 4IJNA 1J6ZA 4WQ5C 1EQYA 5AQZA 4IJAA 4JNEA 4BRPA 3CQYA 3ID8A 2P9SA 5LJVA 2Q97A 3UKUB 3WEEB 3TPQA 4BRCA 1HJOA 3MDQA 3LDNA 2FSJA 5E84A 4BQLA 3WUHA 4FWOA 3VEWA 3ZX2A 1HX1A 1D4XA 3D2EB 1ZC6A 1DKGD 4BRGA 2P9UA 2HF3A 3MN6A 3W3DA 4H0YB 2VWBA 3M1FA 3RSEB 5AQTA 5AQQA 3J8AA 3L6QA 3F9MA 5AZJB 2E1YA 4CZKA 5BRDA 2CGLA 3CQXA 4BGBA 5EVZA 5ELZA 4MLEA 1NGIA 2OANA 3DXMB 4KBOA 3VPZA 3CIPA 3CJBA 4CD3A 1NGFA 2CGKA 2VYPA 1SZ2A 3H45C 5AZIB 3O1WA 4PKIA 3IUCA 3LM2A 4XH4A 5BR9A 5BPNA 2F9WA 3FFKB 4IO8A 1HKBA 3U9ZA 1U2VB 3LDLA 2E2QA 4BRNA 4E1JA 3ZX3A 4K43A 4JN4A 3D2FA 3GE1A 4EHUA 3IMXA 3JS6A 1IJJA 3VETA 1T44A 2GTDA 2V52B 5AFUA 1S22A 4H5WA 3VF2A 1HUXA 4QS8A 4PKGA 4BRQA 2GWJA 3L4IA 2P9PB 2P9NB 2UYTA 3QBWA 3S41A 2Q31A 2HMPA 3C7NA 1QQNA 4WQ4A 1U6ZA 4BVOA 2D0OA 2E2PA 3VEZA 4BG9A 1RFQA 2QWPA 4BC2A 1Q18A 3SJHA 3VGMA 5BRFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNXK 1C0GA 1YUWA 1EX4A 4AM7A 4YY3K 5AQOA 1TK0A 1RDUA 1WOQA 1RDWX 4CJRA 4G9ZA 2BDPA 4IOAL 4A62A 4K8XA 3SMPA 5F2RA 2E8AA 2GELA 3VERA 4DQIA 2HF4A 1JJ2M 4ZHRA 3CJAA 2BUPA 4LFCK 4RW4A 1TVRA 3AVKA 4CZHA 3OW2M 1NBWA 1KFSA 2PZSA 4J2DA 4YOUA 4GMJB 3QEIA 3AVMA 3CJ9A 2HHIA 3KKSA 4KH6A 2QWNA 1RT4A 4WQ4C 5EY4A 1XNRK 3FLCO 1JXEA 3WQTA 5AQHA 3TAFA 4OPAA 4LF4K 1BUPA 1H1VA 4H5NA 1VSHA 3IAYA 1TAUA 2FLOA 4BG8A 1HKCA 3QDKA 4EP5A 3U6FA 3VEYA 4FK4A 3WXIA 4RW7A 3J7ZO 1E4GT 4IDKA 4Z4GA 2FC0A 3KJVA 3ZSZA 1NGCA 4DR3K 1J5OA 4FZXC 3IS9A 4YDUC 5EU7A 3PUFA 5AZIA 3PV8A 3GG4A 4PL7A 4A2BA 4FVUA 4MLHA 3S3OA 4QS7A 4FPBA 5M1NA 3U9DA 1JLGA 4BRFA 2HB5A 3TTDA 2QKKA 5C12A 3OYCA 4OPKA 1SQKA 3RMDA 4Y1CA 4B1YB 2O8EB 3T19A 1QSSA 1D9DA 2X6NA 5BN8A 3D45A 5HLFA 3U4LA 1BCOA 3FZFA 4JI5K 3VGLA 1HPZA 3NMUA 5JVGL 1BHLA 3BY5A 3S5TA 5J2NA 2I7PA 3M8SA 3UB5A 3NVKA 4ISFA 1VRUA 4WYBA 4YHHK 3RMAA 5AQMA 1X9SA 5JENA 1VSEA 4Q0BA 1CZAN 4Y0WA 3K58A 4O55A 1CXQA 2YI1A 1JL2A 1GOBA 5AJ3K 3SLCA 3AVJA 4M7YA 3LM9A 2Q3SA 4CZGA 2FXUA 2WUSA 3HVTA 4A57A 2HHHK 5F0XA 3KIOA 2FBTA 4FPAA 5F1XA 2UUAK 1S3XA 2AP1A 3EL2A 2ZJRL 4B3OA 1XC3A 4IG0A 4FYDA 2ASOA 2FSNA 4B9UA 2QXLA 1CZBA 2W00A 5AQRA 4FLZA 3VF4A 4DTMA 3SJJA 4E7HA 4WE1A 4J2EA 3U8XA 1YVUA 3HPOA 4H03B 4K42A 1VQ7N 1VAZA 1QZ6A 3QMLA 5A2QO 1YJ9N 1GLBG 1ATNA 1QQCA 4YOVA 2KW4A 1VSIA 4B9NA 1TKTA 5BREA 5DM7L 4H0VB 5HRNA 1HKGA 3U3YA 5K14A 3OTOK 5CE3A 1SKWA 3LPUA 4LF7K 3AARA 3K5MA 1XHXA 3KLHA 3K9JA 4EP4A 1RBVA 5M1KA 4BR2A 1JLAA 4NXNK 3O6WA 3VGKA 3NCIA 3V9UA 2X6SA 4H8KA 2O8EA 3QB0A 5LJWA 3HP6A 4B1WB 3AA5X 2QWLA 5E41A 1BI4B 2G8UA 4XJXA 5M1FA 3LDOA 1S9GA 4NCGA 3SYZA 2EHGA 3VTHA 4E1NA 3G71N 4DF8A 1C1BA 4ILGB 4JRQA 4PKHA 5C24A 3K5NA 2BH1A 4NLCA 3M3ZA 1YVNA 1KAXA 2VG7A 5C10A 2ZF5O 5HRSA 1HNVA 3VQ9A 2ZQBA 5GIPA 3VQPA 4E19A 1NNEA 4WFNL 4OKEA 5GIOA 3RRGA 4N47A 3CJ7A 5I9EB 2HHUA 3SQ0A 4FK2A 3MECA 4W5QA 3UKRB 3P31A 4O4GA 4KTQA 3CMAN 1A5WA 4DMNA 3T1YK 3RVCA 4OGCA 5KQ8A 4LFBK 3MX2A 4IEIA 4ICLA 4DSEA 2NUBA 3OYNA 1ESVA 1HLUA 4FJMA 5KPRA 3O5BA 4UQGA 1NM1A 3AA3A 3MAQA 3AO2A 1TKZA 1VQ9N 1QE1A 2GUIA 1KSPA 5M1PA 4KHSA 3KVGA 4DB3A 2P5OA 1X3NA 2I5JA 1LWCA 4FW2A 5MLCQ 2F8SA 2OTJN 2GUPA 1N36K 1Z05A 3L3UA 2Z1HA 3R9PA 2ZGZA 2HHVA 2NRVA 3F9KA 4O0IA 5EXWA 2GEMA 3G25A 4C1NI 2I7NA 3OYEA 4FCYA 3PX6A 1C6VA 3QEPA 1S5JA 1XI1A 3EO3A 1ZXOA 4KHWA 5FROA 4FM2A 1F21A 3V9ZA 4C8OA 2IVPA 5KPZA 1FW6A 3E66A 3HSTB 3K2PA 2QWRA 3KLIA 5JLFA 4NCBA 3MK6A 3IFRA 5KQDA 1HPMA 1KFDA 4DV6K 3FR0A 1Z6RA 2HSTA 4WQ5A 1RBTA 1VQPN 4CFBA 1BCMA 1R0AA 3PO5A 1YXQA 1MU2A 2ZE2A 3CCJN 1BI4A 3DJCA 3G4SN 3NF8A 4DV7K 3OS1A 4W5TA 3OBYA 2A3ZA 3OYAA 3EKSA 5I42A 1HYZA 2ITGA 3ZSRA 4CJPA 1SL2A 1L3VA 1BA1A 1K8AO 4IDHA 3V1OA 4X62K 3EY1A 1VQ4N 3QICA 3E1YA 3TSQA 4EAHD 2O8CB 1JCGA 5DK5A 1VQLN 2NRXA 3UKRA 2E2NA 2PBDA 3CMEN 3V1RA 5D3GA 3OHRA 4BC3A 2ATQA 1BU6O 1EO1A 2JGUA 4OKJA 1Q82O 3CPWM 4CGIA 2KKZA 1WAFA 1VSFA 2O8DB 4DR2K 2QTDA 1N32K 2KLAA 3WEEB 3UKUB 1KQSM 3TPQA 2HHXA 1HJOA 3LDNA 5CY4A 4FWOA 2GX9A 3ZX2A 4NXMK 1D4XA 4JKDA 1ZC6A 3T3FA 2HF3A 3W3DA 4H0YB 3M1FA 3L2QA 4B9TA 3C95A 1NKEA 1CZ9A 2IAJA 3F9MA 4G1QA 5AZJB 4CZKA 1RT1A 2CGLA 3IG1A 4C8MA 3J80O 1BL3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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