2P9UA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with amp-pnp and calcium
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
414
structure length
398
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 129
structure length 398
sequence length 414
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2p9uA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9uA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9uA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9uA04
1RDWX 1TYQB 4IO8A 2ZWHA 4M7XA 5FPNA 5AQHA 3CJAA 4FPAA 3SMPA 3EO3A 4BRGA 1D4XA 4CZFA 1HJOA 3VEOA 5AZIB 4BGAA 4JD2B 2P9SA 2D4WA 3CIPA 2A41A 3O5BA 5ADXH 3DWLA 3GOIA 3QB0A 1QZ5A 1OKJA 3FGUA 5F2RA 3SLCA 4B1XB 2PAVA 4JHDB 4MO4A 2AP1A 3DJCA 3LL3A 4JNEA 3ID8A 4FSVA 2QWOA 4BRLA 4H03B 3ZETA 4BROA 1DEJA 5JLFA 5B8HA 4H0VB 3MN5A 4BRFA 3EN9A 4B1VA 4CI6A 1WOQA 4E1JA 3WXJA 3H3NO 2VCPA 1ATNA 1LOTB 1Z05A 3H46O 1H1VA 1NGHA 4BRIA 1Q18A 2F9TA 5BPLA 4BQLA 3HBTA 1RGIA 4CBXA 5AQKA 2YHXA 3DXMA 5EOYA 4CD1A 1HKCA 3O4WA 4EAHD 2HF4A 1QQOA 2D0PA 2P9IB 2P9NB 3D2FB 5FPMA 1BU6O 3RSEA 4CD3A 3HM8A 4BR2A 4CZIA 4CZHA 1K8KA 3LDNA 3VOVA 2CH6A 5AZJB 4ISEA 3H45C 3CJ1A 1EQYA 3VGKA 4CZLA 4BG9A 3VEXA 4H5WA 4Y0WA 5BPNA 2H3GX 3VGMA 2QWQA 5AQWA 4B1WB 3HI0A 2P9PB 2P9LB 3HZ6A 1MWKA 2HF3A 2HMPA 1YXQA 5ADXA 3ZEUA 2AA4A 4K43A 3CJ9A 3SMSA 4FO0A 4EHUA 3R8EA 3WXLA 4H5NA 5BREA 4YDUC 2GELA 1JCGA 1GLJO 4BRQA 2QWRA 5BRHA 4I6MB 3WEEB 4H5RA 3IUCA 3UKUB 2ITMA 5BR9A 1TYQA 3VEZA 3HTVA 4AM6A 3I33A 5AQZA 3A5LC 4MLEA 1T6DA 5AQMA 3UKRB 4BR5A 1E4FT 3JS6A 4PKHA 3H1VX 5AZIA 3M6GA 4JD2A 3VPZA 3VF6A 2FXUA 3ATVA 4FWMA 4MO5A 3CERA 3U4LA 2KHOA 4FWPA 3BEXA 5LY3A 4JHDA 2E2OA 4DHYA 2I7NA 5EXWA 2ASPA 2YHWA 4QS9A 2FF6A 2ZGZA 1S3XA 4BGBA 1LCUA 5AQYA 4FOEA 5LJVA 3QBWA 1C0GA 3IFRA 1QHAA 4CBWA 2CGKA 5CE3A 3LDPA 1XC3A 1NMDA 4C23A 4GY2B 3A5OC 4CJ7A 1SZ2A 1ESVA 3MK6A 1U2VB 1GLAG 3AAQA 1S22A 4YDUA 3LM2A 3M3ZA 3VF4A 4EFHA 5JICA 4BVPA 1NGBA 3O6WA 1HKGA 2P9IA 2P9NA 2YI1A 3D2FA 3GG4A 1ATRA 3MMVA 2IIRA 3TU5A 2P9UB 3O08A 3EKUA 4KBOA 3MCPA 2E8AA 4J8FA 2FSNA 2IVPA 2A6AA 5AZJA 3VEYA 3FZLA 4IXCA 4H5TA 1HKBA 5AR0A 2QW9A 1JCEA 3VEVA 3O1BA 4IWVA 3ZX0A 1R59O 4M63C 3O80A 1MA9B 1ZC6A 1C0FA 4CZMA 2P9PA 2P9LA 3EKSA 3U8XA 5KPTA 5AQXA 3ENOA 4BRKA 2W41A 5AQNA 2P9KB 3KHYA 3LDLA 1BOTO 4FL9A 2A40A 3VGLA 4CZGA 1HPMA 2VYPA 4B1UB 3C7NB 4WQ4A 3AY9A 1NM1A 3BUZB 4FOIA 2UYTA 4BRMA 5KPZA 2FLOA 2ASOA 1TUYA 3WT0A 3D7EO 3MN9A 4I6MA 3WEEA 3ATUA 3DXKB 1NWKA 2EWSA 5AQIA 3TPQA 1KAZA 3UKUA 4A2AA 2E2NA 5AQGA 4BRDA 4FWLA 3UKRA 3U9ZA 1V4SA 3QFUA 1GLEG 3HSCA 2Q36A 5EX5A 5EVZA 2Q31A 1BO5O 4MLHA 3FE1A 1KXPA 1KAXA 1HX1A 3FZKA 3KZBA 4BRHA 1U6ZA 3VERA 4FPBA 4H0TB 4BR9A 2FSJA 2W40A 3FZHA 3MDQA 2F9WA 1BWFO 1SQKA 1E4GT 2D1KA 2CH5A 4O5FA 4WQ5C 3A5MC 1NGEA 1MWMA 1HUXA 2QWPA 3WUHA 1NGCA 1U2VA 3ZX2A 4PL7A 3CI5A 5AQOA 4H0YB 2V7YA 3QICA 2P9UA 2FF3B 2A42A 4XH5A 2ASMA 2HOEA 3LM9A 2CGJA 1JCFA 3MN6A 5EY4A 4F9OA 3U9DA 3P4IA 3SJHA 4BRAA 4RTFD 1BUPA 4XH1A 1Z6RA 1NGJA 4XH4A 4K41A 3I8BA 4H5VA 2I7PA 3VENA 2QXLA 4NB4A 5AQPA 1YVNA 4FWRA 3IMXA 5BRDA 4PKIA 1GLCG 2E20A 1X9JA 1GLLO 5AQSA 2IVNA 3EL2A 5E26A 1XUPO 4JAXA 4WQ4C 4BRPA 2E1YA 4FWNA 1CZAN 1BA1A 2ZGYA 3IDHA 3FZMA 2P9KA 4O8KA 4BC3A 3H3OB 1GLFO 3QFPA 1X3NA 3FZFA 3C7NA 4A2BA 2Q0RA 3UB5A 2QWNA 2V7ZA 3L6QA 3LDOA 4FWKA 4WQ5A 3VESA 2WUSA 1MDUB 3CJ7A 2Q97A 4IZ9A 4B1ZA 5LJWA 3ULEB 2E1ZA 2Q2RA 4BRNA 4BR0A 3DXKA 1NLVA 1GLBG 5AFUH 3GE1A 4BG8A 3W0LA 2J4RA 4B9QA 4BR4A 5E84A 3QBXA 5KQDA 4H0OA 1WUAA 3WQUA 4JN4A 1V4TA 4Z94A 3H6EA 2YCHA 3LDQA 3O1WA 4PKGA 3ENHA 3R9PA 4H0XB 4A62A 3BF3A 4IJNA 3F9MA 4LC9B 4WYBA 5BN9A 2OANA 3A8YA 1J6ZA 3SK3A 4HTLA 1DKGD 3D2EB 3CJBA 2ZF5O 3CJCA 5I9EB 3C0BA 3WXKA 1HLUA 4BVOA 3O8MA 3QMLA 1P8ZA 1XQSC 3S41A 2A5XA 4FWOA 3UE5A 4IJAA 4CZKA 1T6CA 3FFKB 4BREA 4BC4A 2E2PA 5TKYA 4ISFA 2BTFA 1GLDG 2YJEA 1ZBSA 3FR0A 2VWBA 4QS8A 5ELZA 4AM7A 1QQMA 5AQJA 4K25A 1IG8A 1NBWA 5AQLA 4DQ8A 4A61A 1T44A 2E2QA 2D0OA 3KVGA 4PL8A 4L3QA 3AARA 2IVOA 2P9SB 2GWJA 3JXUA 1YUWA 3CETA 5AFUA 1BA0A 2A3ZA 5F1XA 3B8AX 1IJJA 1DGKN 2QWMA 5AQRA 4EIAA 4EHTA 3G25A 2GTDA 5JMVA 1NGIA 3ZETB 1YAGA 1NGAA 4CZEA 3VEWA 4B1YB 5BN8A 3VETA 4RWTA 4GNIA 3VF2A 3W3DA 2BUPA 2QWLA 4DB3A 1ZXOA 4DCHA 5FPEA 2CGLA 5AQQA 3GBTA 1KAYA 2FSKA 2NRHA 3R6MA 4HWIA 4FWSA 1BDGA 1NGDA 3DXMB 1QQNA 3A0IX 3GDQA 3ULEA 4BQZA 1BG3A 1QZ6A 5AQFA 3RSEB 5FPDA 3CHWA 3H1QA 1TUUA 3OHRA 1K8KB 1G99A 3BP8A 3WQTA 3L4IA 3EZWA 4BRCA 2GWKA 4BC5A 3GL1A 2Q0UA 3M1FA 5AQTA 2GEMA 4QS7A 4H0PA 5KPRA 3MN7A 2E88A 1NGFA 2GUPA 2NZTA 2YJFA 5AQVA 2Q1NA 3WXIA 4CZJA 3CQXA 3ZX3A 3L0QA 5KQ8A 1Y64A 4RCHA 3D2EA 3FLCO 4BR7A 2YHYA 4ISGA 5AQUA 3AAPA 5BRFA 3ZEUB 4CBUA 1NGGA 3QDKA 3BF1A 1RFQA 4NO7A 4BC2A 2PBDA 1ATSA 1SAZA 2NLXA 2V52B 5F0XA 4XEIA 3A5NC 5BPMA 4K42A 4M7YA 3J8AA 3CQYA 5JLHA 4FWQA 2V51B 2DPNA 2QM1A 3DAWA 1X3MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDWX 3N4PA 4DTXA 4GKJK 4FPAA 3EO3A 3P1GA 4M45A 3AO3A 4BRGA 1D4XA 1WAFA 4BGAA 2P9SA 3O5BA 1QZ5A 1QSYA 3DRRA 4LF5K 3CC4N 3ALYA 3DJCA 3LL3A 5CR4A 4BROA 1C1BA 3SYZA 4LY7A 4HVJA 4LH5A 1RBSA 5GIPA 2KW4A 1VSFA 1W0HA 2OA8A 1M90O 2DTUA 3MECA 2UXCK 3ZT4A 4PHTX 1Z26A 5DM6L 1LAVA 1Q8IA 4DTRA 5C12A 4CBXA 4CD1A 4GVEA 1QQOA 3EE8A 4AHCA 4CFDA 1VQKN 4UQGA 1R0AA 1VSEA 4CD3A 4ILHA 3HM8A 1QVFM 1NJIO 4FJHA 3VQQA 1UA1A 5D3GA 1U49A 4WFAL 3H45C 1RDBA 1FKPA 3VGKA 2OTLN 1EWRA 3AVIA 4CZLA 5J2PA 4Q0BA 4JKFA 3CMEN 2H3GX 3JSMA 3HI0A 3A2FA 1Y97A 1KLNA 2OYQA 3RR8A 1MWKA 4FJJA 1YXQA 5ADXA 2VQFK 4E7JA 1IH7A 3ZEUA 3IS9A 4K43A 4EHUA 3WXLA 3BZKA 1SKWA 1BISA 2GELA 3CYMA 1GLJO 3MEDA 1IBKK 4CHOA 1DTQA 5BRHA 3K58A 4I6MB 4CCHA 1NU0A 4ZTFA 1S5JA 2ITMA 1BIZA 5AQZA 4DSKA 4MLEA 5AQMA 4BR5A 3CFRA 3CCVN 4PKHA 4DUZK 5AZIA 4JD2A 2HVIA 4PY5A 4NLCA 3CPEA 3P31A 1Q81O 4MO5A 3CERA 4DFJA 4I9LA 5LY3A 3OA9A 4C8KA 3DI6A 4OPHA 3AVHA 2BE2A 4FM0A 5M1FA 3S9HA 4KKOA 1SL1A 2YHWA 4DSIA 4OLAA 2UUCK 1TKTA 4QS9A 3K5OA 1S3XA 4RW7A 1LCUA 4JS5A 3TTFA 3IFRA 4CEBA 4XIUA 1XC3A 3Q7CA 4C23A 4GY2B 4CJ7A 1J9AA 3TTDA 1SZ2A 4RW6A 2HBKA 1WNSA 4C8LA 1ESVA 3MK6A 5CY4A 4PA1A 5DMRA 3VF4A 4YDUA 3M3ZA 5LL6Z 4U7BA 1L3VA 4JV5K 1NGBA 2FBVA 4JKEA 1HKGA 2P9NA 1ATRA 4DV3K 2IIRA 2P9UB 3AO5A 3O08A 3EKUA 4CESA 4CF2A 3MCPA 2YHAA 2E8AA 4BWMA 2FSNA 4I7FA 3RMDA 1A5XA 2A6AA 5J2NA 2QEXN 1XMQK 3G71N 2VG5A 3KWIA 4IXCA 3VEYA 5IWAK 4W5QA 1YTAA 2YNHA 2UUBK 4FJMA 1RDCA 4CHQA 3ZT3A 2QK9A 4F3OA 1ZC6A 4CZMA 3PX4A 2FBTA 3U8XA 5KPTA 4DV0K 4CJPA 3ENOA 3VTIA 3ZSQA 1NOZA 2R7YA 3DLBA 3KHYA 1TK0A 4FL9A 1TK8A 3QEXA 3OBWA 4KB1A 3PX6A 2FLOA 3L3UA 2ASOA 3WT0A 4CJVA 3KKSA 3WEEA 4N47A 5LMNK 3ATUA 3DXKB 3TPQA 5AQGA 4BRDA 3C94A 3AVMA 4FWLA 4PQUA 5K14A 3U9ZA 1Q82O 1WSFA 3QFUA 4GVMA 4BE2A 1U4BA 3HSCA 5EX5A 5M1QA 1BO5O 4KRFA 3ZT2A 2OPPA 3THYA 3KZBA 2B6AA 1U6ZA 4BR9A 1JLEA 3OVNA 1T03A 3FZHA 2F9WA 1BWFO 4J2EA 1SQKA 3K0SA 4E7IA 2O8DA 3QEIA 2G8UA 3BDPA 3TARA 4FW1A 4FJ8A 4JI5K 1HUXA 4O8UA 2QWPA 4ZTJA 1NGCA 1UWBA 4FLYA 3SQ1A 4ILJA 4FZYA 1VRTA 2UU9K 2FF3B 4KHWA 3AGRA 4DTMA 2A42A 3HPGA 4XH5A 4DV6K 2O8CA 1JCFA 1YT3A 1C6VA 3U9DA 5M1KA 3OY9A 4RTFD 3QO9A 2F96A 4JKBA 3SAHA 2ATQA 4IG3A 1BQNA 5AQPA 1RT4A 3IMXA 1GLCG 3ZCMA 5T7BA 3OW2M 5C25A 4DQPA 4JKGA 3G10A 3T1YK 1X9SA 4BRPA 4FWNA 3IDHA 3VQBA 3PUFA 1GLFO 1RTDA 3QFPA 3O3FA 4KHUA 4M3XA 4WQ5A 3VESA 2P5GA 2WUSA 3CJ7A 4IFYA 4GMJB 3NMUA 1IBLK 1IKXA 2UXDK 3P38A 4BR0A 5JENA 3GE1A 4JKCA 4OKEA 4LF9K 5GINA 4GV3A 4YOYA 3V4IA 1XNQK 4H0OA 2KFZA 4JN4A 4ELVA 3HT3A 3CC7N 1V4TA 4B9MA 3LDQA 3O1WA 4C1NK 3ENHA 4A62A 4E1NA 1CZ9A 4IJNA 3F9MA 2XO7A 3B6PA 3T1AA 3LWMA 1Q9YA 3DLKA 4CJFA 3SK3A 2ITGA 3HYFA 1DKGD 3MCAB 1FW6A 2G8FA 4DS4A 3Q7BA 1JLFA 3I8DA 1SUQA 3LPTA 4BVOA 3OYEA 5J1EA 4FM2A 5SWMA 1XQSC 3RWUA 4FWOA 1DT9A 4IJAA 4FJ5A 1N34K 3F2KA 1YITN 1GLDG 2YJEA 4CGJA 3UIQA 3NF7A 4DUYK 5AQJA 4HCCA 1IG8A 1NBWA 1WSJA 2WFBA 2HVHA 2D0OA 4L3QA 2ZJQL 3OS1A 2BGGA 2A1SA 3CETA 1GOCA 1ASUA 2B4JA 1VQLN 1DGKN 4M3ZA 2QWMA 4OGEA 3E9LA 1YJNN 5JMVA 1RTHA 2LSNA 2BANA 3OS0A 1N6QA 3VEWA 3VETA 3D0PA 4RWTA 4GNIA 1IG9A 1RTJA 1VSMA 1UOCA 1NKBA 2QWLA 4J2BA 1ZXOA 4DCHA 5FPEA 1SL0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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