4O8UA

Structure of pf2046
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
227
structure length
227
Chain Sequence
SRIVAADTGGAVLDETFEPIGLIATVAVLVEKPYRSAKEVMVKYANPYDYDLTGRQAIRDEVLLAIELARKVKPDVIHLDSTLGGIELRKLDEPTIDALGISDKGKEVWKELSKDLQPLARKFWEETNIEIVAIGKSSVPVRIAEIYAGIYSAKWGIENVEKEGHLIIGLPRYMEVNIKDGKIIGRSLDPREGGLYGSAEVSVPEGVKWEIYPNPVARRFMIFEIFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a novel non-Pfam protein PF2046 solved using low resolution B-factor sharpening and multi-crystal averaging methods
pubmed doi rcsb
molecule tags Unknown function
source organism Pyrococcus furiosus
molecule keywords Uncharacterized protein PF2046
total genus 57
structure length 227
sequence length 227
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.440 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8uA00
4YOWA 4YOYA 4YORA 4YOTA 4YOXA 4YOVA 4O8UA 5CHIA 4YOUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8BA 3M8PA 1SL2A 4NO7A 3SCXA 4K8XA 2YNGA 4Y1CA 3OS1A 1J53A 4BE1A 5EVZA 5HOOA 3WXMB 3W0LA 2E2NA 2YNIA 3VGMA 5D3GA 3AA3A 4KTZA 3K9JA 3I8BA 1F21A 2Q97A 4FZZA 1QTMA 1NK8A 1IJJA 3V1RA 4OPHA 1NMDA 3AGKA 1YVNA 2ZGYA 1S6PA 1T6CA 3TI0A 3S3NA 1RBRA 3CIPA 3OVNA 3HYFA 3CCJN 4PHTX 2QTDA 4CIGA 4NCGA 2RF2A 3CCQN 2OCEA 2XY5A 4JK8A 1NLVA 4E89A 1C0UA 4CGFA 2KZZA 1ZBIA 5AQUA 3LDPA 1SKWA 1JJ2M 1GLEG 4ELTA 2P9UA 3CJCA 3AVCA 3ZSQA 2G8WA 3R1XA 3G71N 2NRTA 2W6LA 3D45A 1NKEA 4YOXA 2G8HA 3FZLA 1VSKA 2AJQA 3AVBA 1R0AA 4LFBK 1C1BA 2IOCA 3QETA 1WSGA 4KREA 4H0XB 3VQ7A 3K5OA 4QS7A 2OZMA 3LDNA 2VWKA 3CJ1A 3ENHA 2P9KB 2GUIA 4FJNA 3ATVA 4RCHA 5CY4A 1HYVA 1EWQA 1RGIA 3TAMA 4XH1A 4GKKK 4W5NA 4E1MA 3WNHA 4IO8A 4CW7B 4CZJA 4CHQA 3DXMB 3M1FA 1JLGA 3MAQA 4B9NA 3KLEA 3PX0A 3DLKA 1VQ8N 2CH5A 3AO5A 3CQXA 1TKZA 3SZ2A 4KHNA 3G25A 3O3GA 1OH5A 4H5VA 4CK3A 1VSHA 4Z94A 1KSPA 1ZBUA 2DFEA 2KKZA 1WAFA 3DLRA 3L0QA 4M3XA 1KXPA 3O4QA 2YX6A 3QNOA 4Q5VA 4BRHA 4KBOA 1NKCA 3SQ1A 3WT0A 1HMVA 1WBBA 4K0KK 1JLBA 3MN6A 3CCUN 4FLUA 1IO2A 3MN9A 4YFUA 3OBYA 4U67L 3ENBA 4M3YA 4Z4HA 1VQPN 3NVKA 4HTLA 4FM2A 4MQ3A 4LF5K 5EOYA 1VAZA 1DTTA 1S1WA 3VQ5A 4CZKA 3H1QA 3NHGA 3V9WA 4CJ7A 4YHHK 4KRFA 5HROA 4BRMA 1ASVA 3AAQA 2HNZA 2VQEK 3SMPA 3HP9A 1SKRA 4FM1A 3RMAA 4FJHA 4WQ5C 4BR5A 1B9FA 3WXKA 1HNVA 3A5NC 3KLIA 4CEOA 4IDKA 3ISNC 3V1QA 1FKOA 3D2EB 3QFUA 3CETA 3V1OA 4WFBL 3MMVA 4IFYA 3BF3A 4OPJA 3HO1A 2YNHA 4HWIA 1JXBA 3VETA 1Q82O 1YITN 2FF3B 4B08A 3ZSYA 4XH5A 2NNWA 1IKWA 3M8RA 3O5BA 2P9PA 2RN2A 1KLMA 5T7BA 3S3OA 4O4GA 3HSCA 2OZSA 5AQSA 5AJ3K 2QWOA 5DM6L 5F1XA 4JHDB 4CF8A 5KGWA 3DJCA 3T19A 1I94K 1WSIA 4FJKA 3CXCM 2UUBK 4RG8A 1LW0A 3CQ8A 3R6MA 4JI1K 4BR2A 5FDLA 1DTQA 4YOYA 1BHLA 1ZBFA 3OTOK 1IBKK 3E66A 4DV4K 1NJZA 1D9FA 3UKRA 3O3FA 3G4SN 3OYKA 1WSFA 3VQQA 2P9IB 3U9ZA 3AVIA 4DTJA 3DXKA 2WOMA 4DQQA 1MWKA 3CC4N 4B1YB 1DGKN 4LD0A 1HYSA 5AZIB 1J5EK 4KB1A 1MU2A 3C7NA 4KHWA 4BR9A 4CGDA 1O1WA 4A2AA 2XY7A 4AH9A 4W5QA 5E41A 3GL1A 5CZ1A 4EHUA 1TUYA 2P9NA 2E6LA 5GIPA 3L8BA 3A5OC 3NCIA 1HRHA 3QEXA 4IDHA 3K5MA 3AARA 1NJWA 2O8DB 4DHYA 1S1XA 2PFUA 4KPYA 4JKGB 2XY8A 4M3RA 3QIOA 3AO2A 3ZETA 5K14A 5AQGA 4O8UA 2Z1JA 3OHRA 3AA5X 3AA4A 2ZGZA 3TSQA 3MDQA 1BU6O 5JVGL 3VQDA 1L5UA 1TGOA 4FJXA 4CZMA 1BCOA 4PKGA 2GWJA 4DTPA 3VQCA 2FSKA 4CJ5A 4DQIA 2D0OA 3V9UA 1TL3A 3KHYA 1P90A 2EWSA 2HNYA 1ZBLA 1HYZA 2X6SA 1WN7A 1VSMA 1UA1A 5KPTA 4EAHD 3PO4A 4N47A 4BVOA 1TK8A 4CBXA 4DCHA 1VQMN 3B6PA 1K6YA 3MN5A 1ITGA 1DLOA 5AFUH 1CZ9A 3BZKA 4KB0A 3LANA 1T05A 2V7ZA 1HNXK 4X62K 1Z26A 3P4IA 1A5XA 1RT7A 1UAXA 5BRFA 1ATNA 2P9SB 3DI6A 3OYGA 1CZBA 1LAWA 2PAVA 4F9OA 4DV3K 2RKIA 2UYTA 4B3MK 5J1EA 5BN8A 1Z25A 5J2QA 3DAWA 3U6FA 4DSEA 1BIUA 3JS6A 3QIPA 1CXQA 1SL1A 3KK1A 2G8UA 4BQZA 1OKJA 1GLCG 4DS4A 4DTUA 4E1NA 3OYBA 2Q0RA 3DMJA 1EETA 2D0CA 2IDOA 2EHGA 4HUGA 4FJLA 1TAUA 2P51A 3SNNA 4BC5A 1NGFA 1YIJN 4IKFA 4HTUA 4CBWA 4Z0UA 4JI8K 4YDUC 3WNEA 5GADP 3FLCO 4J2EA 2Z1IA 1RDUA 3C6HA 5BPLA 3EY1A 2NRVA 1TV6A 4CEEA 1VQKN 3K57A 3THWA 2BANA 3OYNA 1NGEA 1S1TA 3C65A 2P5OA 3H3OB 2IVNA 4PL7A 1WOQA 4B9LA 4Z4FA 3CQYA 4G1QA 1NG9A 3FE1A 2FF6A 1KRPA 4UQGA 4WQ5A 3J7ZO 2E8AA 3P38A 4C1NK 3FZHA 3TABA 5AFUA 4M41A 4DFJA 3HPHA 4BRLA 2I5JA 3MX2A 4DTXA 3H1VX 3H45C 3IDHA 1ZC6A 4JKDA 4DSLA 1BA1A 1ATRA 2F7TA 3RRGA 2VGNA 4CJSA 4DSJA 1QQOA 1YJ9N 4CZHA 3VEYA 2W41A 4BC2A 3G10A 2YHBA 4JS5A 3ZSXA 4A61A 4CGJA 3BY5A 3NE6A 4ELVA 2IIRA 2OTJN 2IVPA 2Q1NA 4H4MA 3PSFA 1HNWK 1LWEA 3UKUA 3OA9A 5AQTA 4A62A 5AQRA 4CJFA 4DV1K 2E1YA 2WONA 3MCPA 4OVLA 4RWTA 1S1UA 4DLEA 4N5SA 4BGAA 1XC9A 3M5RA 4FVMA 2R7YA 3VERA 3C6UA 4DR5K 1BWFO 1VQ6N 1TK5A 4H0VB 4DV2K 1W2BM 2UXBK 2QW9A 1OH8A 1YUWA 1E3MA 5C25A 3KIOA 1YTAA 3ZT4A 4YNQA 4W5RA 1RTJA 4CFDA 3UIQA 3BF1A 3S41A 4BR4A 4CHPA 1GOCA 3O08A 3F2KA 4A57A 1Y97A 2E20A 4E0DA 4W5OA 1D8YA 3NF8A 2E6MA 3SQ0A 4FK0A 2D5RA 3SUNA 1NK6A 3AVAA 3MEEA 3TR8A 1ATSA 5AQJA 3I8DA 1QQCA 3THVA 3N4QA 4JKFA 3EN9A 3U8XA 3U3YA 4F4KA 1CZAN 1XNQK 3Q7CA 4YORA 5HP1A 5FLXO 3E1YA 3E9PA 4JRQA 2FXUA 2QI2A 3EKSA 5FROA 3ENOA 1G15A 3HM8A 3WNFA 4DB3A 4C1NI 5HBMA 3HT3A 3FZFA 4JKCA 4CHNA 4DFKA 4M3UA 3SV4A 4CFAA 1Q9XA 3VMFB 4YOWA 2YJFA 4FZXC 1Q9YA 1S1VA 2GV9A 3LDQA 3S3MA 1S22A 5DK5A 3GBTA 2E1ZA 2O8CB 1X9JA 4JK7A 3ZX0A 1M1KO 1ASUA 3A8YA 3IFRA 4IXCA 3VF4A 2V7YA 1D9DA 2CGJA 4GNIA 3G6EN 3CJAA 3NH1A 4E7KA 4FJJA 5J2MA 1NGGA 4H8KA 2RE2A 4DU3A 1ZYQA 2Z1HA 2ZE2A 3OYCA 4FW2A 1EXQA 4JI3K 4BRGA 2F9TA 1TL1A 5FPNA 3K5LA 3LP2A 4E7HA 4CJPA 4BRDA 3HK2A 3CJ7A 1HKGA 1BCMA 3ZCMA 3JSMA 5DM7L 4CBUA 3VQEA 2B5JA 1REVA 5C2DA 5JLFA 4LC9B 5JS2A 1HQUA 1J6ZA 1QHAA 2CGKA 1N5YA 4CFBA 3AVJA 1HR0K 2A1SA 3WEEB 3VA3A 1TKDA 1JXEA 1YVUA 3QLHA 3OYEA 1QE1A 3HOSA 3CD6N 3BZCA 3AVGA 1SQKA 1YF5L 3EZ5A 3E9LA 4YDUA 3F73A 2GX9A 5AQYA 4M3ZA 1ASWA 4KHQA 4O5FA 4GKJK 2DFHA 4DV7K 2DPNA 2XY6A 4OPKA 5LMNK 3THYB 3QICA 4CD3A 3DRRA 4YY3K 1YI2N 1QSLA 3SI6A 3J80O 2IAJA 4B1VA 4J2BA 3PIOL 4B9TA 1HUXA 4BY9C 2YHAA 4GV9A 1DKGD 2OA8A 1NNEA 1EP4A 2A3ZA 4BREA 4FVUA 1Q86O 2P9LB 4OJRA 4BRQA 2GTDA 2VG5A 3LM9A 3QDKA 1I3AA 4XEIA 2P9KA 4J8FA 2H3GX 3CF5L 3TTDA 1GLDG 3WQUA 4FSVA 3NH2A 4JI0K 3LAMA 1NK5A 3ITHA 1BO5O 4NYFA 4DF8A 1EQYA 2J4RA 3FGUA 3K9KA 1IG9A 1IV0A 3TTFA 5SWMA 1X9WA 4O0IA 3HI0A 3DXMA 1FW6A 4FWRA 3IAYA 4CJUA 2OTLN 3GE1A 4CHZA 3FZKA 1QZ5A 4DR3K 1QZ6A 2Y1JA 2HNDA 3SYZA 3RMBA 1RT3A 4ILHA 3AVFA 4KH4A 4DU4A 1SL0A 4YOTA 4IZ9A 1SV5A 2G8KA 1JLFA 2YKMA 1RNHA 2FSNA 3T69A 5BREA 4GV3A 4OO1J 4WFAL 1L3SA 4MO4A 4DV6K 4DTNA 3KVGA 3ZLJA 3P83D 1Q18A 4A59A 4JRPA 2QK9A 4LSNA 3CCEN 4LF8K 4DSIA 4HUFA 5BN9A 1BISA 1YAGA 4JD2B 4CEBA 4BVPA 4KO0A 5M1FA 3THXB 4BG9A 4B3RK 1K8KB 1N36K 2DY4A 5M1NA 4YOVA 5AQWA 4FOEA 5HLFA 3AVKA 3PV8A 4IG0A 5AZJA 2Z1GA 4H0OA 2ASMA 4FLTA 4FLYA 4O8KA 4M3TA 1XI1A 4ILGB 4H5RA 4ISGA 1VSFA 3MN7A 3LDOA 1ZBHA 1VQ5N 1EKEA 4R79A 4DTOA 4FWMA 3MCAB 4BR7A 1T7PA 4CJLA 1W0HA 4GY2B 3AV9A 4DUZK 5KQ8A 3D2EA 3HJFA 1RT2A 3LM2A 4AHUA 3EZWA 3SUQA 2QWNA 3J7AP 4OKEA 3DRPA 4ELUA 4FJ5A 3PX4A 4KHSA 3QO9A 1J9AA 3Q7BA 5JVHL 4ZHRA 4ID1A 2HMPA 5M1PA 1NU0A 3HBTA 1K73O 3ZSWA 4CF1A 1MDUB 2QXLA 4B1WB 3QEIA 2ZWHA 3V81A 4K25A 3SJHA 4BDYA 4JHDA 2YCHA 3NGYA 3OYAA 1JLAA 4CEZA 2FBVA 3SK3A 3TU5A 4OPAA 4CF9A 1TK0A 2VQFK 4LY7A 1WLJA 1U47A 2G8FA 1HNIA 4IWVA 4CFCA 1S6QA 5BRHA 4CJ4A 2P9IA 4GV6A 1TKTA 1T03A 4CZLA 4XH4A 3CFPA 4FLZA 5EY4A 5B8HA 5AZIA 3N4PA 5C2FA 5CHIA 5I9EB 1VQLN 1VRUA 4F8RA 1LAVA 3VEOA 1DEJA 3MXJA 3J7YP 3LP1A 4DU1A 4IFVA 1CLQA 2PBDA 5LL6Z 5LY3A 4ICLA 4B9SA 4PA1A 2PYJA 2QEXN 5KGXA 1GLAG 2O8DA 1KD1O 2IS3A 4OKJA 3RMDA 1NGDA 3KZBA 3O80A 4C8MA 3CMEN 4B9QA 4DKWA 4FK4A 4JKGA 2E2PA 4IEEA 3JXUA 4ZTJA 1TAQA 3A5LC 3RMCA 1XNRK 3HL8A 3KWGA 4K43A 3SPZA 2HBKA 3O3HA 1IBMK 4JV5K 4DQRA 4K41A 1Y64A 3U9DA 3QFPA 1ZXOA 1J54A 4C8OA 1VQON 1S72N 1XUPO 3KKRA 1LW2A 1BG3A 4O0JA 4O55A 3DLEA 3SUOA 1N34K 3F5TA 5CR4A 4WF9L 4Q0BA 1V4TA 1S5JA 4BR0A 4IJNA 4J2DA 2A42A 2KW4A 3VF2A 3ZEUB 3WNGA 2HHHK 1X9SA 1LOTB 3SBTA 5C10A 4JI5K 2HW3A 1Q8IA 1S9GA 4C23A 5AQLA 5IWAK 2P9SA 4CE9A 3TAFA 4DUYK 3UB5A 2ZJPL 1NOYA 3MEDA 1I39A 3CM6A 5F0XA 3ZX3A 3LZJA 4FLWA 4N76A 4QS8A 4JI4K 3F9MA 4AHVA 1HPMA 1SKSA 4CEDA 3SAHA 3TPQA 3AA2A 2Q3SA 3P1GA 3CFRA 3DYAA 1MWMA 4Z4CA 3M8QA 4H0YB 4OKKA 4CCHA 1U2VB 2QWPA 3QBWA 5BRDA 1NK0A 1RDAA 1N32K 1GOAA 5AQOA 1KLNA 4M7XA 1W97L 3DRSA 2QM1A 3CC2N 1NGIA 3TSUA 1X1PA 2KQ2A 4R5PA 4CEQA 4MDBA 5KI6A 3TTCA 1WAJA 4IEIA 2QWRA 5ELZA 3SQ2A 5M1OA 4F2SA 2HF4A 2QWLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4YOW A;  4YOY A;  4YOR A;  4YOT A;  4YOX A;  4YOV A;  4O8U A;  5CHI A;  4YOU A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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