4O8UA

Structure of pf2046
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
227
structure length
227
Chain Sequence
SRIVAADTGGAVLDETFEPIGLIATVAVLVEKPYRSAKEVMVKYANPYDYDLTGRQAIRDEVLLAIELARKVKPDVIHLDSTLGGIELRKLDEPTIDALGISDKGKEVWKELSKDLQPLARKFWEETNIEIVAIGKSSVPVRIAEIYAGIYSAKWGIENVEKEGHLIIGLPRYMEVNIKDGKIIGRSLDPREGGLYGSAEVSVPEGVKWEIYPNPVARRFMIFEIFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Unknown function
source organism Pyrococcus furiosus
publication title Crystal structure of a novel non-Pfam protein PF2046 solved using low resolution B-factor sharpening and multi-crystal averaging methods
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein PF2046
total genus 57
structure length 227
sequence length 227
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.440 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8uA00
4YORA 4O8UA 4YOYA 4YOVA 4YOTA 4YOUA 5CHIA 4YOXA 4YOWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G8VA 3M8SA 1KFSA 3AARA 2OA8A 2RPIA 1JLGA 4JS4A 2X6SA 3M6GA 3V9XA 2QKKA 3NF7A 1TK5A 4BVPA 5KRSA 1LWEA 1N33K 2E8AA 4M3UA 3AVAA 1NJXA 3TTFA 3O1WA 1LWCA 1BU6O 3HYFA 3AVCA 5C15A 1TV6A 1T05A 4JAXA 4CIGA 3VOVA 4FYDA 3PSFA 4KHNA 4CEEA 5GIPA 2G8KA 4FL9A 5BPMA 4E7JA 3O08A 5KQDA 1VSJA 3EZWA 1NK7A 2W6KA 4DMNA 5EVZA 5FDLA 2YHWA 4Y0WA 5AQKA 2PAVA 4BR9A 4JI1K 4JK8A 1L3TA 4IFVA 4JNEA 4W5OA 5FPEA 5CYQA 4E89A 5KRTA 1U48A 1XC3A 4CF0A 1WLJA 3KLHA 4B9LA 2HVIA 2O4GA 3CD6N 4JHDB 1NBWA 4B9TA 3OJSA 3B8AX 3K5LA 1ZBHA 4OPAA 3E9LA 1RTHA 4JKGA 4F8RA 3MN7A 3I8BA 5F2RA 1S22A 3KVGA 2FF6A 4OGCA 1VQ9N 4CIEA 2V51B 3LDLA 3ISNC 3IMXA 3VEXA 3K0SA 5J2MA 2P9PB 3PV8A 3ZYYX 1FW6A 4JKEA 1YTAA 2FXUA 4BC3A 2YJEA 2WC9A 4GW6A 3TAQA 4KRFA 4B08A 5JLFA 3RR7A 1L5UA 3AVBA 1E4GT 2P9NA 2GUPA 3D45A 1VSLA 1DT9A 1OH8A 3AO1A 4HCBA 4DUZK 5FRMA 1VSHA 3P31A 2VWKA 4BRAA 2XO7A 3AAPA 3H6EA 1KAXA 1VRUA 3VENA 5M1OA 1TYQA 2IAJA 4CZJA 3ENOA 3IRXA 4OO1J 4BRLA 1EQYA 3A5OC 3CMAN 1U2VB 4DFMA 4DSIA 1Q9YA 4I6MA 4X65K 3CCVN 4DFJA 3KD1E 4HTUA 3DMJA 3OA9A 3VQ5A 3VA3A 1W97L 2E2QA 1QE1A 2QWQA 4CF1A 4LF7K 4JEPA 4BE1A 3QB0A 3KKSA 2QXFA 3TAFA 1JLCA 1I3AA 3QESA 1OKJA 2ATQA 4DTMA 1XNRK 3D2EB 1W2BM 2D1KA 2EHGA 3IDHA 3FZMA 4Z94A 1VSFA 2P9IA 4WYBA 1RFQA 3HZ6A 5BPLA 1KSPA 1IJJA 4OLBA 4IJAA 3HOSA 4Y1CA 5M1FA 2E1ZA 3AVLA 1JJ2M 1IKYA 3GL1A 1CXUA 1U47A 4IOXA 3MX2A 3OYMA 1C0GA 1OH7A 4LF4K 3LDQA 3L4QA 4RG8A 3AVFA 5D3GA 3EEQA 3ZT4A 4CFAA 1NLVA 1X9JA 2HB5A 4JLHA 1XWLA 2VG6A 4KBOA 4DS5A 4BRPA 4FM2A 1T7PA 3AO4A 2VQFK 4N5SA 1VQ8N 4WQ4A 5AQRA 4JV5K 1YF5L 4FVMA 3KZBA 4B9NA 3IS9A 1TAUA 4GY2B 4NCGA 3K57A 4BRMA 2F96A 5J1EA 4OJRA 2BGGA 4BR5A 1NGEA 3EKSA 3SLCA 1TAQA 3OYEA 2P9KB 1D9DA 3A0IX 1VQMN 3CYMA 3CCEN 4M3ZA 3THWB 5JLHA 4CJEA 1BL3A 1M1KO 3KHYA 4GVEA 1X3NA 2QM1A 3PSIA 4WQ5C 3KWIA 3PX4A 3NVMA 3VQCA 2G8IA 4MFBA 4PHTX 3VQ6A 4FJLA 4ISGA 3G10A 1YI2N 2YNGA 4CGIA 2E1YA 4ILHA 2J4RA 4M3RA 5M1KA 4CJKA 3OYGA 4I7FA 3J7AP 3SPZA 3OYDA 4FZZA 4KAZA 3NVKA 4CJ7A 1BI4B 4B3OA 3L0QA 3NAEA 4KREA 4DU3A 1VQKN 3D6RA 3AO2A 4BC5A 1SKRA 4DTNA 1ZC6A 3NBPA 2GUIA 1VSDA 4IJNA 3O4NA 4YFUA 4YHHK 3L2RA 5J2NA 5GAEP 1LAVA 3RRHA 3WNEA 1KRPA 4BRIA 4DG1A 5C2FA 4IKFA 4Q0BA 3H1QA 4M45A 2ZD1A 3RSEB 2A3ZA 2X74A 2FLOA 1JCGA 4Z4FA 1KXPA 3HXMA 4CJ5A 3ZT2A 3FZFA 1VQ7N 2CGJA 2HW3A 4CFCA 3J7YP 1RDCA 4H0TB 1JL2A 1TVRA 4JKHA 2ZM6K 3ZSYA 1DKGD 5M1NA 4DTXA 1RGIA 1HNXK 4M41A 4NLCA 2O8FB 4XEIA 3ZT1A 4AH9A 5KGXA 2HHWA 4F4KA 3FR0A 3PX0A 4K41A 4HVJA 1EKEA 1LCUA 3ZSXA 3QEWA 3QFUA 4AILC 4NLBA 4JKDA 3HPGA 3BP8A 4LF5K 2I7NA 4GKKK 5E41A 1C0FA 1BUPA 4FK4A 1SQKA 5C10A 3LP3A 2NLXA 4CHYA 3R6MA 4DF8A 2VGNA 4H4MA 5E26A 5LY3A 2RHKA 4BR7A 2G8UA 4CBWA 2I5JA 3MXMA 1JLQA 1DEJA 3K9KA 4N76A 3O4WA 3DXKA 1ITGA 4B9UA 2HNZA 1QVFM 1RTJA 1NMNA 3V9ZA 4RW4A 4FWOA 4O5BA 3OYJA 3QMLA 3PO4A 2RF2A 3WNGA 4CJPA 2D0BA 3K9JA 1G15A 3CMEN 1UA0A 1C1CA 3ZEUB 3MCAB 3WXMB 1TK8A 4LSNA 1CZ9A 1DLOA 1NU0A 4DSKA 3HVTA 4CEAA 3VTIA 3OYBA 4OGEA 3DYAA 4EAHD 4JKGB 2JWLA 4YY3K 3VESA 3SPYA 3GDQA 1WAFA 1VK0A 1EWRA 3CG7A 1N5YA 2OZMA 1NKBA 3VEOA 3ZT0A 4CJSA 4AHVA 2HHQA 1S1UA 1JL1A 3CCUN 4JRPA 4W5NA 5DMRA 2CH6A 3O4QA 2YJFA 2GBZA 2HBMA 4YNQA 5AR0A 2DY4A 2P9NB 4BACA 1WSEA 4OKEA 4OX9K 2O8DA 1RBTA 4BRGA 3TPQA 2EX3A 2P9PA 4IO9L 4J2BA 4M7XA 1NOYA 4JKAA 1LV5A 2ZJQL 1YVUA 5KI6A 1VRTA 4CJQA 2P5OA 4I6MB 3DLRA 1VSKA 4OPHA 2NRVA 4BY9C 1V4TA 4CEOA 1FJGK 5EOYA 3SNNA 3MWTA 4ILGB 3CETA 3SBTA 3N4QA 5CZ2A 3LM9A 3IFRA 3L2UA 4BE2A 1HYZA 2P9IB 3TTDA 3OW2M 3KTQA 4JYAK 2QWPA 2RE2A 4JKFA 2ZGYA 3HT3A 4FWQA 5LMUK 4FXDA 2ASPA 1O1WA 1GLJO 3NGYA 4DV0K 4B3MK 3SAFA 1HMVA 2O4IA 3EY1A 5BRFA 4M3WA 4CBUA 3D2EA 3QNOA 2KW4A 5CZ1A 2Q1NA 4B1VA 2P9SB 4FCYA 3V1OA 3CPWM 4CK2A 1RTDA 3QNNA 5HOOA 3K59A 3KK2A 4PKIA 2DFEA 1RDDA 1QQOA 4CJVA 1BO5O 1UOCA 4ILJA 3CFOA 3ZSOA 2OPQA 3WQTA 1WUAA 1NK8A 1SAZA 2Z1HA 3DM2A 2D0OA 3RWUA 4DLGA 4KFBA 1RNHA 4FJXA 3WXKA 5AQGA 2A42A 5DM7L 3M8PA 2NZTA 2UXDK 5JVGL 2V7YA 3F9KA 2V7ZA 3P39A 5AQJA 4DB3A 3LANA 5H1SQ 3RMAA 4MLHA 2Q0UA 5AQOA 3JXUA 4JKBA 4J2DA 3WNHA 3CPEA 2P9KA 1T8EA 4MO5A 5C2DA 4HUFA 1RBSA 4M42A 3CJ7A 1RDBA 3THWA 3DLLL 3KLIA 4LFCK 4UY8O 1ASUA 3EE9A 4V19S 2ZQBA 3O6WA 2F8TA 4FM0A 4ISEA 3DI6A 4A2AA 4WQ5A 2QTDA 1LW0A 1NKEA 1J9AA 3D0PA 2O8CA 1QQMA 4CZMA 3WXJA 1Q81O 1VSMA 2WFBA 3RMCA 2NRWA 4FO0A 3R1XA 3J7ZO 2ZGZA 5HLFA 4PUOA 3LAKA 4JS5A 4C8LA 5F1XA 1FKPA 4FJJA 1WSJA 4GMJB 4H0XB 4MLEA 4A62A 3QDKA 2UUCK 3HP9A 4Z4GA 2NRRA 3O9UA 2KFZA 1Q9XA 3C6UA 4WF9L 3E1YA 2H3GX 5GIOA 2GTDA 3VGKA 4FSVA 1XC9A 4IOAL 3WXLA 3OYHA 3R3LA 4ID1A 4CVNE 5KPRA 2O8BB 3RSEA 4WE1A 3VF2A 3CFRA 5ADXA 5AQMA 4DV1K 3G71N 3VA0A 3U3YA 4FW2A 3BDPA 4EZ9A 5HP1A 1XUPO 3CM6A 4DR6K 3ZLJA 4Z0UA 3WXIA 2OZSA 4BDPA 1RTIA 4AHSA 5JMVA 1EXQA 1TGOA 5CYMA 2UXCK 3NF6A 1ATSA 4H0VB 4B9SA 2HOEA 1S9EA 2WONA 3N4PA 3I33A 1F21A 2B6AA 4O8UA 2FBYA 1S1VA 5AZJB 2DTUA 3PUFA 1RILA 1RCHA 4CK1A 1RT7A 1IKVA 4EFHA 1K8AO 3EO3A 3VGMA 4A5BA 2FSKA 4FJ5A 2NRXA 3A5LC 4DTJA 1HQUA 3BZCA 3QETA 4E1JA 4Z4HA 2YI1A 2E20A 4M63C 3DXKB 2Q3SA 1S9GA 3MWPA 1BOTO 1BCMA 2GELA 3C95A 3ASMA 3C94A 3SJJA 1JLEA 1GLBG 4WCEL 1X1PA 3CQ8A 3K5OA 3MN5A 3HM9A 2YV0X 1ZYQA 4FLWA 1ASVA 1TKZA 3O9SA 3E9PA 1WNSA 3NE6A 1XHXA 4Z4IA 2LSNA 3CJ9A 4CJRA 3ZSVA 2VYPA 3VQ7A 1UA1A 2UU9K 3JAMO 3LPTA 1KC8O 2BDPA 3RR8A 1NKCA 3OYNA 3QEXA 4KI6A 4B8CA 1GLDG 3P5JA 3ZETA 3SV4A 3H1VX 1OVYA 1B9DA 3K2PA 2KQ2A 3ZEUA 5JS1A 4NYNA 1ATNA 3NHGA 5I42A 4FWNA 4DQ8A 3OYIA 1S72N 1XQSC 4B3RK 4GV3A 4FOEA 1BA1A 3OS1A 2IVNA 2GX9A 3EL2A 1NGHA 1NK6A 1KD1O 3BY5A 4MDBA 5EX5A 4BG9A 1QZ5A 1OH6A 3NF9A 2HBLA 3QBWA 4H5WA 2NNWA 2ZWHA 4H0YB 3EKUA 2O8DB 4NXMK 3E66A 1Q82O 4BWMA 3NCIA 2QW9A 4CZHA 3THXB 3R8EA 1VQLN 1MA9B 4PY5A 3CERA 3D2FB 2Y1JA 4LH5A 3RMDA 4IO8A 1ILYA 3OTOK 1SZ2A 1U45A 1D8YA 3MCPA 4DV2K 5KQ8A 4CCHA 5AQNA 4CZFA 4BC4A 3ITHA 3DOKA 1RBUA 3JYTA 2HHHK 1O13A 3CC2N 4B1XB 3A2FA 3DLGA 4XH5A 5C25A 3TABA 2QKBA 2YHAA 3HJFA 3ZX0A 4PL8A 4B9QA 3E01A 4CJTA 4X62K 4IG3A 2XY5A 2UUBK 3IAYA 2QA4N 3T1YK 1D9FA 5BPNA 3BF3A 3C0BA 1RDWX 3T1AA 3SQ4A 2E2NA 1VQPN 3ZSRA 1KVBA 5KPTA 5EXWA 3VF6A 4B9VA 3M5RA 5K14A 5AQIA 5AQLA 4B9MA 1J53A 3AV9A 3CCLN 4CJLA 2WTUA 4YDUC 2OCEA 4DR2K 4W5RA 3S3OA 4R79A 3V6DA 5AQZA 3D7EO 3V1QA 1BIZA 4FLZA 4H0PA 5BN8A 2RKIA 4ELUA 4BE0A 4RTFD 1HNWK 3CM5A 3IG1A 2P9SA 5CE3A 2PY5A 2PZSA 2OPPA 4DR5K 4YOUA 2HHXA 1XMOK 2X6NA 3VQQA 3UIQA 3H3NO 3AA5X 2A41A 3LDNA 4KTZA 4AHUA 4BVOA 4H5TA 1MU2A 1K6YA 5FRNA 2IVOA 5LL6Z 4EIAA 3DWLA 4A2BA 3ZX2A 3O9QA 5LJVA 2Q2RA 4I9QA 3PIPL 2A40A 5HROA 3OS2A 5KPZA 5KGWA 2IOCA 1V4SA 3K5NA 1OH5A 5C0YA 1SKWA 2O8CB 3P38A 4I2PA 1QZ6A 3NFAA 3AO5A 1IBKK 3K58A 1ZBLA 4AF1A 2ZJPL 4PQUA 4FJ9A 3HL8A 1NGIA 4J2EA 3LP1A 4KH5A 3MK6A 1BIUA 1GOCA 1WSHA 2YNHA 4CZLA 3O9RA 4CZIA 4PL7A 2GEMA 3QO9A 3C7NA 3VPZA 1CLQA 4CGGA 3U3GA 4B3SK 4DR4K 1ATRA 1SL1A 3SUPA 1QS4A 1LW2A 3HBTA 2YKMA 4DV6K 2GWJA 1T6CA 2CH5A 3A8YA 3HI0A 2O8BA 2ASOA 3HSTB 5LJWA 3FZLA 4BRQA 4H8KA 2ZF5O 1L3VA 3O1BA 3I56N 4CFBA 5FPDA 1KQSM 2FSJA 1U4BA 3DLEA 4RW9A 4FPAA 1T44A 3TAMA 1NK9A 1HQEA 1NGBA 2ETJA 4CEFA 3I0SA 4E7KA 4KB0A 1CZBA 3HM8A 3KK1A 5SZTA 3SZ2A 4ZHRA 1S5JA 1WBDA 3NGZA 2UUAK 3EE8A 5AZJA 1NGCA 1NGFA 3VTHA 3QINA 2Q0RA 3C6HA 5ADXH 2VGMA 3GOIA 4RW6A 4IEIA 5B8HA 4FJ8A 3VQAA 3B6PA 1BQMA 4DLEA 3CJAA 1ZBUA 2EWSA 4H4OA 1A5WA 4LH4A 5FPMA 3VETA 4CIFA 2UXBK 4EP4A 4BG8A 1YTUA 3OYKA 4B1UB 3CJCA 1HPMA 1HYVA 4QS8A 3ZETB 3V81A 4RW8A 2PBDA 5AQSA 2E2PA 1FK9A 1NM1A 2HF4A 4U67L 3PO5A 3QBXA 5AQPA 1G99A 4ZTFA 4KHQA 4CJUA 4DQQA 2HHUA 3TWHA 4E3SA 4FJMA 2KTQA 1X9WA 3PY8A 1NK4A 1WBBA 4DS4A 3QICA 3O9TA 4KV8A 3MEDA 4K8XA 3TSPA 1VQNN 4RCHA 4YORA 5KTQA 3CQYA 1RBRA 4IDHA 1N32K 1S6QA 3VGLA 3S9HA 3S41A 4WFAL 4BRCA 2E2OA 3AA2A 4DQSA 3J80O 3TR8A 3CQXA 4DTSA 4FLVA 3TANA 2P9LB 1W9HA 2E5LK 1KCFA 5BRDA 3THXA 4IZ9A 1NJIO 3F5TA 1CZAN 2FC0A 3DJCA 3IUCA 4OPJA 1NK0A 2JGUA 3D2FA 1JKHA 4U7BA 4M3TA 1UAXA 3O3FA 2AP1A 4FZXC 1J5OA 3OBWA 1U6ZA 1HRHA 4ELVA 1UWBA 5J2PA 1R59O 1B92A 3AA3A 1SKSA 3TSUA 4C1NI 1NK5A 3GBTA 5HBMA 3OYLA 3B6OA 4TSXA 2WUSA 1MWKA 2W42A 3RMBA 3ZX3A 4GNIA 2ITMA 3KD5E 4JI6K 3M8QA 2GV9A 4JI2K 3CCRN 1ASWA 1HLUA 3SAHA 1A5XA 1TUYA 2QWOA 4K43A 2P9UB 2OTJN 2PYLA 2HHVA 2IS3A 2KZZA 3NGIA 5J2QA 4QOZB 2RN2A 2IDOA 4YOTA 4GVMA 3MAQA 4FJ7A 3LP0A 2YCHA 4CGFA 3MMVA 4CGHA 3HRGA 2QXLA 3H46O 4YDUA 3LWMA 3CFPA 3KIOA 1ZBIA 3G0ZA 4KB1A 1K73O 4C8KA 1T03A 4YOXA 3VEYA 3DOLA 2QWNA 2I7PA 2F8SA 5AZIB 3O5BA 3SAGA 1N8RO 3GG4A 4KTQA 2AJQA 1EX4A 1Z25A 3SV3A 1J54A 4PA1A 2HHTA 3I0RA 1ESVA 1YXQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4YOR A;  4O8U A;  4YOY A;  4YOV A;  4YOT A;  4YOU A;  5CHI A;  4YOX A;  4YOW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2G8V A;  3M8S A;  1KFS A;  3AAR A;  2OA8 A;  2RPI A;  1JLG A;  4JS4 A;  2X6S A;  3M6G A;  3V9X A;  2QKK A;  3NF7 A;  1TK5 A;  4BVP A;  5KRS A;  1LWE A;  1N33 K;  2E8A A;  4M3U A;  3AVA A;  1NJX A;  3TTF A;  3O1W A;  1LWC A;  1BU6 O;  3HYF A;  3AVC A;  5C15 A;  1TV6 A;  1T05 A;  4JAX A;  4CIG A;  3VOV A;  4FYD A;  3PSF A;  4KHN A;  4CEE A;  5GIP A;  2G8K A;  4FL9 A;  5BPM A;  4E7J A;  3O08 A;  5KQD A;  1VSJ A;  3EZW A;  1NK7 A;  2W6K A;  4DMN A;  5EVZ A;  5FDL A;  2YHW A;  4Y0W A;  5AQK A;  2PAV A;  4BR9 A;  4JI1 K;  4JK8 A;  1L3T A;  4IFV A;  4JNE A;  4W5O A;  5FPE A;  5CYQ A;  4E89 A;  5KRT A;  1U48 A;  1XC3 A;  4CF0 A;  1WLJ A;  3KLH A;  4B9L A;  2HVI A;  2O4G A;  3CD6 N;  4JHD B;  1NBW A;  4B9T A;  3OJS A;  3B8A X;  3K5L A;  1ZBH A;  4OPA A;  3E9L A;  1RTH A;  4JKG A;  4F8R A;  3MN7 A;  3I8B A;  5F2R A;  1S22 A;  3KVG A;  2FF6 A;  4OGC A;  1VQ9 N;  4CIE A;  2V51 B;  3LDL A;  3ISN C;  3IMX A;  3VEX A;  3K0S A;  5J2M A;  2P9P B;  3PV8 A;  3ZYY X;  1FW6 A;  4JKE A;  1YTA A;  2FXU A;  4BC3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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