1RBRA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEPCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbrA00
4WE1A 3PY8A 5J2QA 4N56A 1IH7A 4EZ6A 4KHQA 2GV9A 4QOZB 1VRUA 3CQ8A 3TAGA 3SJJA 3PO4A 4DSIA 3DOLA 2HHTA 4G1QA 2E6MA 3OYBA 3AA2A 1NJYA 3WNFA 1LW2A 1WAJA 1XI1A 4M3XA 3V6DA 3QIOA 2VG5A 2B5JA 1Q8IA 1RBRA 2FBVA 1J53A 3AVBA 2HVHA 1RNHA 3L2VA 1KRPA 3DLKA 2HB5A 4BE0A 2IOCA 3K5LA 2G8FA 2G8HA 4M3TA 1IKYA 1CXQA 5CZ2A 5HRRA 1KLMA 1L5UA 3UIQA 2D0AA 4CJUA 3V9ZA 4PQUA 5E41A 1RTJA 1JLQA 3AVIA 4BACA 4FK4A 4CJ4A 1G15A 4ZTJA 2YNFA 5C42A 1RDDA 1ZBUA 1TAQA 4BDYA 1TK8A 3OYIA 3O3FA 3NE6A 4DSEA 3QESA 4O44A 4B8AB 2BGGA 1ZYQA 1FKOA 3SQ4A 5FRNA 3NBPA 4JS4A 1C1AA 1LAWA 3OJSA 1CZ9A 3PO5A 4DQQA 4J2DA 4OJRA 3OYNA 2HHVA 2DFFA 2VG6A 2YNIA 1RDAA 4DQPA 2F96A 4H4MA 1JLGA 1NK5A 1VSIA 2FBTA 4HHTA 4DTNA 1BIZA 4M3YA 3VQ5A 3NAEA 1EXQA 4DSKA 3ULDA 4KHWA 3O3HA 2HHQA 1NK4A 3HSTB 1SL0A 3C94A 4CCHA 3AVAA 1J9AA 2XY8A 1ZBLA 3RMBA 2F8SA 3MEGA 4Z4GA 2BANA 1X9SA 4CF1A 4CFDA 3O3GA 4DU4A 4E3SA 1TKDA 4Y1DA 1ASVA 4O4GA 1VSJA 1W9HA 3OYEA 3M8RA 4DFJA 2BDPA 1I3AA 4CGGA 4BDZA 4AILC 4M3ZA 4Q0BA 4BWMA 1S6PA 4CEQA 4IG0A 1U48A 2RF2A 4I7FA 2YHAA 2QKBA 4KB1A 2HNYA 3L2QA 4HCCA 4HUFA 2EX3A 4KI4A 2X74A 4CEOA 4B9SA 4KI6A 4QCLA 2HHSA 1N6QA 3D0PA 1IKVA 1VSFA 3OYLA 3S3OA 4ID1A 3KTQA 4KHSA 1T7PA 3TAQA 5SWMA 3QERA 4FM2A 2HNZA 4OVLA 3KD5E 1RDCA 1JLAA 4E1MA 4J2BA 3QIPA 2QK9A 3DOKA 4LD0A 2F8TA 3O4QA 2WOMA 2AJQA 4ICLA 2OZMA 5J2MA 4CEDA 4CFCA 3SQ0A 3SUOA 3QEIA 3S9HA 4EP5A 4JS5A 3RMAA 4I9QA 1WLJA 3ZT1A 4YNQA 1TL3A 2PYLA 2HHUA 2DTUA 2OZSA 1CXUA 3AO1A 4CF2A 1JXBA 1HPZA 2EHGA 3LP2A 4QAGA 1W0HA 1SKRA 2PY5A 4FJIA 4KTQA 4B9MA 4Z4FA 3AO2A 4FCYA 2IDOA 1EKEA 2WONA 3KIOA 4LSNA 1WNSA 5J2PA 2G8UA 2O4IA 1TKXA 1X1PA 3ZSVA 4Z4CA 3HT3A 3NDKA 2KZMA 4EZ9A 1HRHA 3VQEA 4N41A 5HRPA 1TL1A 4JRPA 5J2NA 3TI0A 1JLFA 3CG7A 4W5QA 3OYCA 4KRFA 5JS1A 1QS4A 4FW1A 1FKPA 3VQ6A 3ZT3A 4I9LA 4FVMA 4W5TA 3SQ2A 3TANA 5T7BA 3LZIA 1BCOA 4FJXA 3KK3A 4FJJA 4FXDA 3IS9A 3V9WA 2RN2A 4FZYA 3AVJA 4CF9A 3SPZA 1NK0A 1C1BA 3LANA 1IG9A 3I0SA 3AA3A 2Y1JA 1KLNA 2ZD1A 4FLWA 1NJZA 4CF8A 4L8RB 4IBNA 3K5NA 1YT3A 3ISNC 3ITHA 2R7YA 3RMDA 3LAKA 3DI6A 3M8PA 3KLFA 1NK8A 4CIFA 2D5RA 4W5RA 1RBUA 2E4LA 3I8DA 3EY1A 1HNIA 1Z25A 1DLOA 3CFOA 4J2AA 1ASWA 4RW9A 3ZT0A 4CERA 4CHYA 3SUPA 4DU1A 4DTRA 3VQBA 3OS1A 3V9XA 4F2SA 1L3VA 3PV8A 4FLXA 3HVTA 4PA1A 3OYHA 3F73A 3KD1E 2KW4A 3L2UA 1QSSA 4JLHA 1QSLA 2G8VA 1BHLA 4DFKA 5J1EA 4W5OA 3HJFA 1S1UA 1B9FA 1UWBA 3T19A 2FC0A 3M8QA 3KLEA 4PUOA 1U49A 3NGIA 3ZSOA 3DRRA 3LAMA 4CGHA 3VA3A 4KAZA 4CGIA 4H4OA 1C0TA 1RBVA 1RTHA 2KTQA 1HYSA 4Z4HA 4FM0A 4N76A 2LSNA 3OYMA 4DF8A 2G8KA 3AVMA 4OKEA 1NOZA 4CJRA 3NH0A 4W5NA 4MFBA 1MU2A 1D9FA 1KVAA 3AVCA 4CFBA 3HL8A 3KLIA 1ZBIA 1HJRA 4FJ9A 1Y97A 1U4BA 1RT7A 4FJHA 3DYAA 5C24A 5KGWA 2Z1GA 4E89A 3LPTA 2P5OA 3JSMA 3BDPA 1IKXA 3AVNA 1JXEA 3DRSA 4B8CA 4ZHRA 3MAQA 2KFNA 3V9SA 3NFAA 1D9DA 1K6YA 3SZ2A 4CK1A 3OYKA 4F3OA 4K8ZA 2A1SA 4FM1A 3LP1A 1CLQA 1YTAA 1QHTA 4I2PA 4RW4A 4CEBA 4EP4A 4HVJA 4M3UA 4CJWA 4B08A 4CGJA 2XRIA 1YTUA 1BIUA 4KTWA 4FJNA 1HQEA 4AHCA 4FLYA 1SV5A 4CEAA 3BGRA 3HPOA 3EZ5A 3LP3A 3NH1A 2VWJA 3SV3A 4FLTA 5FRMA 4LH5A 1QE1A 1WN7A 3LP0A 1KFSA 4Z4EA 2DFEA 4OPKA 2PZSA 3U3GA 4FJLA 4FJ7A 1RCHA 4ELTA 3T1AA 1RTDA 2E6LA 4Z0UA 4CJ3A 1X9WA 4MQ3A 1ZBHA 3HO1A 4B3OA 3NH2A 3C6UA 4Y1CA 4OGEA 1BI4A 3U6FA 3OJUA 3DLGA 3TAPA 2KFZA 3TAMA 3DMJA 3RWUA 3AVHA 2HHWA 3TABA 1U45A 4CHQA 4CJQA 1C0MA 4DTUA 3TARA 1XHZA 3HVRA 2NUBA 4I2QA 4E7IA 3RMCA 1IKWA 1S9GA 3WNHA 1EETA 5CY4A 4FJKA 4NCAA 3VQAA 3K5OA 1YVUA 1SKSA 4IFYA 3ZSXA 4OGCA 3PX6A 4C8MA 4DF4A 1UOCA 5SZTA 2P51A 4HUGA 3TAFA 4R5PA 1SL2A 1HQUA 1TGOA 3RTVA 1J54A 2YKNA 3ASMA 2A1RA 1O1WA 3LDSA 4DQIA 5HRSA 4ELVA 4FJMA 1JL2A 2OA8A 4FK0A 1EP4A 4CJVA 4DLGA 3LZJA 3WNEA 4CECA 4ZTFA 1KSPA 4RW6A 3OYDA 3NF7A 3CFRA 1L3SA 4NCBA 4F3TA 3ZCMA 1JL1A 1WSJA 2YNGA 4KFBA 4NYFA 4CGDA 4HUEA 2D0BA 4H8KA 3HXMA 1GOAA 1RDBA 2Z1JA 3AVKA 4DSLA 4FZZA 4CEZA 5KGXA 4DTOA 1QSYA 3VQ8A 1WAFA 4IDKA 4CJTA 4CJPA 3AA5X 3L3VA 2HVIA 2ATQA 4KKOA 3QNNA 3VQDA 4E7KA 2ETJA 4DS4A 4B9UA 4IG3A 1S9EA 1RBTA 2GBZA 4NCGA 3VQ4A 1CZBA 2O4GA 1D5AA 1KVBA 2YV0X 3QINA 3OYFA 1NK7A 1NJWA 2PYJA 3RRGA 3DRPA 3RR8A 3JYTA 4DU3A 2QXFA 1B92A 4DTPA 1DTTA 3CM5A 2P5GA 1VSLA 4O0IA 5C25A 1GOCA 4CK3A 3HK2A 1NKBA 1A5WA 1LW0A 3AVFA 1KFDA 3H08A 2XY6A 3ZSZA 1S1VA 5EU7A 4CJKA 2FBYA 3M8SA 4KHUA 3RRHA 3DLBA 3QNOA 3AV9A 3FFIA 3SYZA 4YFUA 1TV6A 3KKSA 2OPSA 3VQQA 3OVNA 3KLGA 3EYZA 4FYDA 4FLZA 3AVGA 3HP6A 4C8NA 1XC9A 3L8BA 4KO0A 1RT3A 4FJGA 3MXIA 3SV4A 2Y1IA 4DTSA 3MECA 3LWMA 3AVLA 4CFAA 3IG1A 1KCFA 3HPHA 3OYJA 1HMVA 1C0UA 1RTIA 3AO4A 4M41A 4CEFA 4Z4IA 3V9UA 4C8LA 3VQPA 3K58A 2BE2A 4FW2A 1UA1A 4RW7A 1NK9A 3I0RA 4E7LA 3TWHA 3QEWA 1NKCA 3QEPA 5I42A 2VWKA 1LAVA 3SUQA 5HP1A 4O5BA 1KVCA 4CIGA 1ASUA 4C8OA 2OPPA 3NF9A 4E7JA 2HNDA 3L2RA 3K57A 4FLVA 3OY9A 4F4KA 3C95A 3CFPA 1TKTA 3QLHA 3F9KA 3QETA 1NOYA 4HCBA 3ALYA 4DS5A 4DTJA 1Q9XA 1HYVA 2IC3A 3L2WA 4HTUA 2D0CA 4O0JA 3VQ9A 3LWLA 1U47A 4FJ8A 3PX0A 3VN5A 2ZQBA 4F8RA 4CGFA 1Z26A 3P1GA 3NF8A 1RT1A 3PUFA 4LY7A 1LWCA 3WNGA 1VRTA 4CK2A 1VK0A 3NGZA 4K8XA 5HBMA 4UQGA 3MXMA 3L3UA 3SPYA 3SCXA 4KPYA 2Z1IA 1D8YA 1UAXA 2B6AA 3LPUA 3S3NA 4DSJA 2RPIA 4OKKA 3QEVA 1BI4B 1JLEA 1RT2A 3B6OA 4CE9A 3QEXA 1WSEA 4GVMA 4ID5A 3A2FA 2Q3SA 4PWDA 1TVRA 3ZT2A 3B6PA 1WSHA 3ZSRA 2DY4A 1WSFA 4KTZA 1S6QA 2Z1HA 5KTQA 3HP9A 4E0DA 1LWFA 1U04A 1SKWA 2KQ2A 4ELUA 2OPQA 4KV8A 4BE2A 3G0ZA 4DTXA 4CF0A 3ZSYA 4NYNA 1JKHA 3NHGA 1F21A 4DTMA 3V1QA 5KI6A 3VQCA 1T03A 1N5YA 4B9TA 4KHNA 1DTQA 1C1CA 4CEEA 1S1TA 3KK2A 1QQCA 3ZT4A 4DQRA 5HLFA 4FJ5A 4PY5A 1VSKA 2X78A 1C6VA 4DLEA 1Q9YA 4XIUA 1HNVA 5JS2A 1L3UA 1BQMA 4OLAA 4BDPA 1XHXA 5CYMA 2DFHA 4O55A 2ZE2A 3TR8A 3V1RA 3O4NA 4C8KA 1WSGA 4CJFA 1TKZA 4GMJB 4DWIA 1FXXA 1SUQA 2P1JA 3KKRA 3SI6A 1TK5A 3SQ1A 1TK0A 3NCIA 3AO3A 1NKEA 1JLCA 3DLEA 2G8WA 2IAJA 1WSIA 1EX4A 2YKMA 3K59A 1FK9A 3S3MA 3MEEA 1A5VA 1VSHA 4DFMA 1T8EA 3TAEA 4OLBA 2VG7A 3MXJA 4J2EA 4F2RA 4BWJA 4CHNA 4CESA 3VA0A 4KREA 1BGXT 2YHBA 4JRQA 2XY5A 1A5XA 1S5JA 5CYQA 4AHUA 3HPGA 5FDLA 4AHSA 4AHVA 4CIEA 3V81A 3QO9A 3PX4A 1X9MA 2IGIA 1B9DA 2X6NA 4N5SA 1XWLA 4AHRA 3OYAA 3AO5A 4AH9A 4E7HA 4M3RA 2JLEA 4DQSA 4LH4A 4CHOA 5HROA 3K2PA 4BE1A 1BCMA 1BISA 1RT4A 1S1WA 4GW6A 1JLBA 4RW8A 5K14A 3V1OA 4DG1A 1L3TA 4FLUA 3U3YA 1UA0A 2RKIA 4AHTA 1RT6A 4RG8A 4E19A 4M45A 4CJEA 2YNHA 1GOBA 3HM9A 4Q5VA 3KK1A 3VQ7A 4CJSA 2W42A 4KB0A 4FK2A 2G8IA 4N47A 3ZSQA 3P83D 1BL3A 4OKJA 5DK5A 3T3FA 2B4JA 4M3WA 3NGYA 1S1XA 2FBXA 2GUIA 4IFVA 1J5OA 1QTMA 1VSDA 3G10A 2JGUA 3D45A 3THVA 1HYZA 4B9NA 3NF6A 4KHYA 2ITGA 1BQNA 1REVA 1RILA 1LV5A 3AA4A 3ZSWA 3DLHA 5KRTA 2HHXA 3DM2A 3CYMA 4B9VA 4FZXC 1VSEA 3K5MA 2KZZA 1T05A 3RR7A 3KLHA 2XHBA 1RBSA 3IAYA 5I3UA 3IRXA 4E1NA 4B9LA 1TAUA 3LALA 1ZBFA 1VSMA 1ITGA 1LWEA 1R0AA 3SUNA 3MEDA 1SL1A 5DMRA 4M42A 2HW3A 2XY7A 3SNNA 2OPRA 3CM6A 4CJLA 3OS0A 4LSLA 2QKKA 3C6TA 3OS2A 4DMNA 2OYQA 4IKFA 3HYFA 4DFPA 5HRNA 1RT5A 2HMIA 2XO7A 4DSFA 1I39A 3DLRA 1IO2A 5KRSA 3V4IA 4CHPA 2X6SA 2I5JA 1NK6A 1KTQA 3KJVA 2IS3A 5CZ1A 3OYGA 3E01A 4CHZA 3P5JA 1NJXA 4OPJA 5FROA 4TSXA 4CJ5A 5D3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRIA 5AQQA 4OO1J 2GV9A 4QOZB 1IBMK 3WNFA 1WAJA 3V6DA 4CVNE 3GE1A 2VG5A 2B5JA 1Q8IA 1HNWK 3AVBA 1J53A 1RNHA 2FF3B 3L4QA 2IOCA 4K42A 3RVCA 3K5LA 2G8FA 3A0IX 3ENHA 1K9MO 4PQUA 3ZEUB 4BRMA 2Q36A 4BACA 4ZTJA 1G15A 4BDYA 1TK8A 3O9UA 4IJAA 4CBUA 3VF6A 4B8AB 3SQ4A 4BQZA 1U2VB 3PO5A 1C1AA 3UKUB 1CZ9A 4OJRA 2HOEA 2HHVA 2YNIA 4BGBA 1YIJN 4DQPA 2O8BB 1TUUA 1E4GT 2F96A 3MWPA 4NXNK 2O8EB 2ZM6K 1NK5A 1VSIA 4M3YA 2UU9K 4KHWA 3WQTA 2IVNA 3HSTB 4FWSA 4OPAA 5IWAK 4K41A 3FZHA 5M1KA 3O3GA 1VQ7N 4Y1DA 1VSJA 3O6WA 4CZJA 1NMDA 4DQ8A 3D2FA 4BWMA 1S6PA 4CEQA 4IG0A 1U48A 2RF2A 4BRNA 3VEZA 4KB1A 4HCCA 2FSJA 4KI4A 1N6QA 3D0PA 1IKVA 3A5OC 3S3OA 4KHSA 4BVPA 5SWMA 3QERA 4E1MA 4OPHA 3THXA 4JI1K 3KK7A 3L4IA 2KLAA 5LMNK 3LDQA 1VQLN 3TTDA 2NZTA 3RSEB 3RMAA 4FWLA 5B8HA 3ZT1A 1IJJA 1TL3A 2OZSA 3AO1A 4QAGA 5AQKA 4KTQA 4FJIA 1XMQK 4BR9A 1X3NA 1N8RO 3AO2A 3WUHA 2IDOA 3KIOA 5F1XA 1WNSA 2G8UA 2O4IA 4Z4CA 3SBGA 4NLCA 3HT3A 3VQEA 4YY3K 2PBDA 4WFAL 1P90A 4JRPA 3CF5L 1JLFA 3OYCA 5JS1A 3FZKA 4KRFA 1HNZK 1QS4A 4W5TA 4GV9A 1ATSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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