3EO3A

Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
312
structure length
288
Chain Sequence
TLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVPKDEAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylman
publication title Crystal structure of the N-acetylmannosamine kinase domain of GNE.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase, transferase
total genus 86
structure length 288
sequence length 312
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2008-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A02
3H1VX 4ISFA 4FPBA 2A40A 1BA0A 4B1XB 3LDQA 1U6ZA 3RSEA 3W3DA 4M7YA 3VENA 3C7NB 3IMXA 3ATVA 3F9MA 4BR9A 1ATSA 3WEEB 3LM2A 3HSCA 3GBTA 3LL3A 4PL7A 4IZ9A 1GLDG 3CJ9A 1U2VA 4IWVA 3TPQA 3UB5A 1H1VA 2CH6A 2IVNA 3DXMB 1C0GA 5BPNA 1RGIA 4XH4A 4BRKA 4BREA 4B1WB 4E1JA 2FLOA 1BU6O 3CJAA 1RDWX 5BN9A 4PKGA 4BGAA 3M6GA 4I6MA 2AP1A 4MLEA 3UKRB 3FZHA 1ATNA 1HLUA 4BRDA 2FF3B 3CI5A 4FWSA 2V7ZA 1LOTB 1MA9B 3VEYA 3D2FB 4FWOA 4BR7A 2QWOA 2ZGYA 3ZX3A 3GOIA 3ID8A 2V7YA 3C7NA 2UYTA 1X3NA 3VEOA 5F1XA 4WQ4A 5CE3A 3FE1A 1MWKA 4BR4A 4H5NA 3O08A 3QMLA 5AQUA 4HTLA 3W0LA 1NGIA 3S41A 5AZIB 1HKCA 1Z6RA 3SMSA 4Y0WA 1NGAA 3IFRA 3A5LC 4EHUA 5AQWA 2YHWA 4ISEA 4FOIA 2E2PA 4PKIA 4BC3A 5F0XA 5AFUA 3QB0A 4FSVA 5ADXA 3MN5A 3GL1A 3GE1A 2Q1NA 1HX1A 3HI0A 4DB3A 2V51B 3UKRA 1JCFA 4BRLA 1QQMA 2EWSA 4FOEA 4K25A 2FSNA 4H5WA 3ZX0A 3D2FA 5AQFA 3G25A 4IJAA 2HOEA 5B8HA 3FGUA 3ULEB 4CZJA 2E2NA 2PBDA 4MO5A 1T6CA 3VEXA 2BUPA 1HPMA 4H0VB 1V4SA 2CH5A 4BRAA 1D4XA 2CGKA 4FWPA 1DGKN 2P9SB 2YJEA 3DWLA 4CBWA 5AZIA 4CZLA 1ZBSA 3D2EB 3L6QA 5AQGA 4BGBA 5JLHA 5BRHA 2IVOA 3OHRA 4Z94A 2QWNA 2NRHA 3H1QA 1DEJA 1HKBA 2PAVA 1NGJA 1GLJO 1IG8A 3KHYA 3A5NC 3LDOA 3RSEB 2P9NB 3CQXA 5AQVA 1GLBG 2VYPA 2Q0UA 5AFUH 3U9ZA 1S3XA 4CD1A 2YHYA 4BVOA 5ADXH 2QWLA 4BR5A 4CZKA 4FWMA 3LDLA 3MN6A 5AQJA 5KPTA 1TUYA 5BN8A 3H6EA 2ZF5O 3ULEA 2E1ZA 3UKUB 3LDPA 1R59O 2HF3A 4FO0A 4H0OA 4WQ5A 2ZGZA 3JS6A 2P9SA 4B1YB 4H03B 1XQSC 4H0XB 5JICA 5KPZA 3VF4A 5AQPA 3MCPA 3BP8A 5AQOA 3O6WA 2YHXA 3SK3A 2E2OA 2P9NA 1DKGD 4H5TA 4A61A 4WQ4C 4CZEA 2YJFA 4F9OA 1TYQB 2ASPA 5FPDA 4M63C 4O5FA 2P9PB 5LJVA 4FWLA 4BG8A 2CGJA 2QW9A 5AQTA 1YVNA 1JCGA 1G99A 3WXIA 3D7EO 4O8KA 3LDNA 2P9LB 4FL9A 3UKUA 2YCHA 3FFKB 1J6ZA 4K41A 4JHDB 1JCEA 4K42A 4FPAA 1ZXOA 3UE5A 1P8ZA 5EX5A 5BREA 2I7NA 2ZWHA 4L3QA 3QDKA 5AQLA 3WXLA 4B1VA 3HZ6A 2Q2RA 4A2AA 1BWFO 4MO4A 5AQIA 1E4GT 1WOQA 3M1FA 4NO7A 2E1YA 2GELA 5JMVA 3B8AX 1RFQA 1TYQA 3A8YA 1KAYA 3H46O 4BRHA 5FPNA 3HM8A 2P9PA 2A41A 1MWMA 2J4RA 4CBUA 3I33A 4B9QA 1NGGA 2QWQA 1GLLO 1QHAA 5AQNA 3H45C 1NM1A 5FPEA 2P9LA 2VWBA 3AAQA 3VF2A 4CBXA 5KPRA 3EZWA 4JHDA 4ISGA 3VEWA 1ESVA 3VEVA 4BQZA 1ZC6A 5EY4A 5AQQA 2W40A 2GUPA 5AQYA 4AM6A 3DAWA 3FZKA 2KHOA 4K43A 3ENOA 1NGCA 3MK6A 4KBOA 1QZ6A 5AQRA 4BC5A 2E2QA 2QWRA 3O1WA 4NB4A 4WQ5C 3ZETA 5AQZA 5AR0A 3L4IA 4FWQA 2E8AA 3QBWA 1NGFA 3R9PA 1SQKA 1SZ2A 3BF1A 3ENHA 1QQOA 2D0OA 1GLAG 1BOTO 4EAHD 1QZ5A 4XH5A 1NGDA 3CETA 3U4LA 3HTVA 3VF6A 2GEMA 3VGKA 3DJCA 3WXJA 3I8BA 4GY2B 4IO8A 4PKHA 4BROA 3VERA 2A3ZA 5AQSA 3U8XA 3VEZA 3WT0A 4JD2B 2QM1A 3IDHA 3VESA 5AQKA 3ZEUB 4YDUA 3VPZA 3CIPA 2ITMA 1YXQA 5E26A 5FPMA 2A42A 3SLCA 3A5MC 3O1BA 1XC3A 3M3ZA 2AA4A 4CZIA 4EHTA 4DCHA 1NLVA 4CZHA 3MDQA 4DQ8A 2HMPA 1NBWA 3QFPA 3KZBA 1BUPA 3EL2A 3QICA 1C0FA 4GNIA 4AM7A 2P9UB 3O4WA 2GWKA 3CERA 5JLFA 3A5OC 5AZJB 1EQYA 4DHYA 4H0TB 2NLXA 2BTFA 5BRDA 4JD2A 3H3OB 4CZMA 2A6AA 3ZEUA 2P9KB 4BRPA 3WXKA 3O5BA 4BR0A 5AQHA 1ATRA 3FLCO 4BRNA 2W41A 3CHWA 3P4IA 3SMPA 4J8FA 4BRGA 4XEIA 2FXUA 5BRFA 2ASMA 4PL8A 4BRQA 1NMDA 1SAZA 2NZTA 3VGLA 5BPLA 3H3NO 4BQLA 3CJBA 3WUHA 1YAGA 3ATUA 3O80A 2GWJA 3MMVA 3BEXA 1V4TA 2VCPA 4HWIA 2FSJA 2IIRA 5BPMA 1KAZA 2P9UA 2E88A 3O8MA 1X3MA 3FZLA 5AZJA 1XUPO 2D1KA 3L0QA 3ZETB 3EO3A 2P9IB 1S22A 3CJ7A 3EKSA 4CZFA 3C0BA 4FWRA 1IJJA 1HUXA 2D0PA 3A0IX 1NWKA 2P9KA 3GG4A 1BDGA 4BG9A 3QFUA 4BRMA 2V52B 3MN7A 3QBXA 4MLHA 1HKGA 4QS9A 3DXKB 3JXUA 1YUWA 5TKYA 3J8AA 2QWMA 2A5XA 1HJOA 2I7PA 1QQNA 4JN4A 5AQXA 4B1UB 5EOYA 4YDUC 3EKUA 3WEEA 4WYBA 5EVZA 4RWTA 1TUUA 2OANA 4H5VA 3DXMA 4LC9B 5KQ8A 5LJWA 3ZX2A 2Q0RA 4EIAA 1K8KB 2QXLA 3AY9A 2WUSA 4BRCA 1E4FT 4A62A 4CI6A 2ASOA 1KAXA 2P9IA 5E84A 2D4WA 2HF4A 2QWPA 4XH1A 3LM9A 1Z05A 3MN9A 1Y64A 3HBTA 1NGHA 4H0PA 3WQTA 2DPNA 5EXWA 3VOVA 3DXKA 1OKJA 2Q36A 1T6DA 3CJ1A 4BRIA 4C23A 3AARA 4FWKA 5AQMA 3BF3A 2GTDA 3EN9A 2CGLA 4IXCA 2FF6A 1GLFO 2YI1A 1GLEG 1LCUA 2F9TA 1KXPA 3FZFA 1WUAA 2FSKA 3U9DA 3IUCA 1GLCG 1K8KA 5F2RA 4BC4A 1CZAN 1X9JA 4RCHA 4CZGA 1BA1A 4FWNA 3R6MA 4H0YB 3AAPA 1MDUB 3CJCA 3CQYA 4IJNA 4M7XA 4BC2A 4BVPA 5BR9A 4A2BA 4QS8A 2IVPA 1U2VB 3VGMA 3KVGA 4CD3A 1NGBA 4CJ7A 5ELZA 4BR2A 3FZMA 4EFHA 1BG3A 1NGEA 2F9WA 3R8EA 2H3GX 4JAXA 4BRFA 3TU5A 2E20A 5I9EB 2Q97A 4RTFD 3WQUA 1BO5O 4B1ZA 1T44A 3GDQA 4QS7A 1Q18A 2Q31A 4JNEA 4H5RA 4I6MB 3VETA 3FR0A 5KQDA 5LY3A 3SJHA 3D2EA 3BUZB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H1VX 1ILYA 1S72N 3RSEA 4BE0A 4M7YA 1VQ6N 4JRQA 4FJLA 2G8UA 1WN7A 3MX5A 3F9MA 1U47A 1NKCA 3GBTA 1W2BM 4B3MK 2UXCK 1H1VA 2CH6A 3DLRA 1C0GA 5BPNA 5M1KA 4M3TA 1GOCA 3H08A 1ZBIA 4KV8A 2VG6A 4BREA 2O8DB 4H8KA 4W5QA 5GAHP 2P51A 4BGAA 3M6GA 1JKHA 3I8DA 1IBLK 3P5JA 1NK5A 5JS2A 4KB0A 3ZX3A 3KLGA 3GOIA 4ICLA 1YI2N 4KHPK 3C7NA 4NYNA 3J7YP 2UYTA 2YNGA 3B6OA 4H4MA 1VQKN 5CE3A 3PUFA 1MWKA 4YOTA 2FC0A 3QMLA 1HNXK 4HTLA 5J2NA 3SMSA 3A5LC 2YHWA 1NK9A 4I7FA 4ELVA 3AA3A 5GIOA 3GE1A 2Q1NA 1D9DA 1L5UA 3MWPA 1D5AA 2EWSA 4JI2K 4ILHA 1XC9A 3U3YA 3G25A 2QKBA 2XY7A 4NLBA 5B8HA 3ULEB 2E2NA 2VQEK 3VQDA 5M1PA 1D4XA 2CGKA 3M8SA 3DWLA 5AZIA 2HB5A 5KI6A 3OHRA 2OPSA 3TAMA 2QWNA 3KKSA 3S3NA 1HKBA 4CEOA 3SUQA 4FLZA 1IG8A 3RSEB 2D0BA 2R7YA 2Q0UA 4LD0A 4FJ5A 4C8OA 2YHYA 4BVOA 1QVFM 1RT1A 3LDLA 3V9XA 1KC8O 2DTUA 4U7BA 1TUYA 4B8CA 3DLHA 2ZF5O 4DFJA 3LDPA 4F3TA 3J81O 3SBGA 2HNDA 4KFBA 4JI3K 3F73A 1HNZK 2P9SA 4PWDA 4JKHA 3J7ZO 4DSJA 2HNYA 1OH6A 4ID5A 3BP8A 3CCQN 4JKFA 5KGXA 5AQOA 4CK2A 2QTDA 2P9NA 3OYBA 3CCVN 2YJFA 3NF9A 4LSNA 4M63C 3L4QA 1FXXA 2B5JA 2P9PB 5LJVA 3F2KA 5CR4A 1YIJN 1A5XA 5AQTA 1YVNA 4KKOA 1G99A 3WXIA 4FJGA 3JYTA 3LDNA 3HP6A 2P9LB 1D9FA 3ZSWA 2YCHA 1JCEA 4C8LA 1L3TA 1HYZA 4K42A 3ZT2A 3ENBA 5I3UA 1NJXA 1X9SA 2I7NA 4DSEA 4CHPA 4BWJA 3WXLA 3CCSN 4A2AA 4LF5K 2YKNA 3E9LA 4MO4A 2O8BA 1BCOA 1RDBA 5FPNA 3ASMA 3PY8A 3OYGA 2J4RA 4CHYA 4B9QA 1QHAA 2E6MA 5AQNA 2G8KA 2NRVA 5GIPA 1JLBA 2VWBA 3E9OA 4AHRA 2W40A 4KHSA 1SKWA 2GUPA 3DYAA 1N36K 3ZSXA 4MDBA 3RMAA 5SWMA 4JS5A 3ENOA 3Q7BA 3KD5E 4AHVA 1BI4B 4NB4A 3KJVA 4GW6A 3MX2A 5AR0A 3L4IA 3SPYA 5K14A 1SL2A 4FWQA 4LF8K 4X65K 1SQKA 4DUZK 4DTOA 2D0OA 4KRFA 3RR7A 1I39A 3HTVA 4CIEA 2XY6A 3WXJA 1VQNN 3VQ5A 3KTQA 4YHHK 5FRMA 4IOCL 1NOZA 1RTDA 3TI0A 1S6PA 4YDUA 3VPZA 4E7JA 1OH5A 1KFDA 3QO9A 3DOKA 2YX6A 1JJ2M 1IKVA 4JI5K 1SKSA 4CZIA 4E19A 3OYMA 3U6FA 3HYFA 1I3AA 3MDQA 1RTHA 2HMPA 2E4LA 1C0TA 1BUPA 3THWB 3QICA 3EL2A 5JVGL 4GNIA 2EX3A 1KD1O 2RF2A 3VQQA 2VWJA 3VQEA 3NF6A 2HVHA 4CJEA 2NLXA 4CZMA 2KFNA 1WAJA 3ZT4A 2P9KB 4CEZA 4MFBA 4BR0A 1RDAA 1BIZA 4ILJA 3FLCO 3RMBA 1ZBLA 3CHWA 2ZJPL 4KTWA 4CJPA 4BRGA 1RNHA 1EP4A 2FXUA 3NH1A 2ASMA 4FVUA 4W5RA 3VGLA 5BPLA 5HBMA 4FLWA 3H3NO 4J2EA 2YHAA 3SAGA 2VCPA 3AVLA 4RW9A 4BY9C 4Z4CA 3CYMA 1NK0A 3AVMA 2IIRA 2P9UA 1OVYA 3CCRN 1ZBHA 2D1KA 4Z0UA 4DV7K 1S1TA 2D0PA 3A0IX 1NWKA 5E41A 4CIFA 4IG3A 4WF9L 2V52B 5DM6L 4HUEA 2VGMA 4DR7K 1HKGA 2KW4A 2BE2A 3DLLL 2QWMA 3E01A 1QQNA 2OTJN 5EOYA 4X62K 4YDUC 3EKUA 1IKXA 3WEEA 1Y97A 2Z1GA 1TKTA 3QINA 2OANA 1U48A 4DS5A 2Q0RA 4IDHA 3LZJA 3T1HK 2P9IA 1KAXA 4YFUA 4FJ8A 3VQAA 4PQUA 3MN9A 1K8AO 2WC9A 4LSLA 3VQPA 3NH0A 3L2QA 4CEQA 4O0IA 5EXWA 1S1UA 4DLGA 4NLCA 4DV3K 4AQYK 3DXKA 3P38A 4I2PA 2YNIA 1VSLA 3MXIA 1T6DA 4O5BA 1VQPN 4ELTA 3V1QA 4BRIA 3AARA 4J2BA 4CK1A 2F96A 4YNQA 2OPQA 2OZSA 3OYDA 4GV3A 1GLEG 3OS0A 1LCUA 1NG9A 3FZFA 1IBKK 4FJNA 3IUCA 1GLCG 4OPAA 4BC4A 2O8FA 3AGRA 2EHGA 4FWNA 3LWMA 5BR9A 1MDUB 4IJNA 3CQYA 4BC2A 4K8ZA 3NBPA 4J2DA 4Z4GA 3TAGA 3HVTA 1VSMA 3CQ8A 1U2VB 3V9ZA 4I9QA 2QKKA 3EE8A 4O8UA 5H1SQ 3K0SA 5ELZA 3TSQA 2F9WA 1VQ8N 2UXDK 4RTFD 3CFPA 3GDQA 2Q31A 4JNEA 4PHTX 1J5OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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