3EO3A

Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
312
structure length
288
Chain Sequence
TLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVPKDEAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the N-acetylmannosamine kinase domain of GNE.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase, transferase
molecule keywords Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylman
total genus 86
structure length 288
sequence length 312
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2008-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A02
4CZIA 1BDGA 5ADXH 2QWRA 4BQLA 5KQDA 3VESA 2EWSA 2FSNA 3MN5A 1V4SA 4FWMA 5EX5A 2F9WA 3QDKA 4BRKA 3SMSA 5AQNA 5AQSA 4WQ4C 4Y0WA 4B9QA 2P9LA 1SQKA 1NGJA 3B8AX 3VF2A 4FL9A 1HKCA 4ISFA 3QICA 1SZ2A 4MLEA 2VCPA 2YI1A 3ULEB 3LDNA 3L4IA 1XUPO 2ZGZA 3CQYA 4H0XB 3CJ9A 3VEWA 2YHWA 5AZJA 1C0GA 4BR7A 1D4XA 5EXWA 1KAYA 3L6QA 3ID8A 3UKRA 4YDUA 4BR4A 1RDWX 5AQZA 5JLHA 3AAQA 5AQKA 4IXCA 2Q31A 4H5WA 3WQTA 3CJ1A 1Z05A 4IO8A 2QWPA 3CETA 2NLXA 1QQMA 2VWBA 4CBWA 1HKGA 4BVPA 3HTVA 4BQZA 2IIRA 4BROA 3WXKA 3M1FA 1TUUA 3CJAA 4FWRA 4GNIA 4K42A 3VENA 4XH4A 1BUPA 4WQ5C 5F2RA 3VEOA 5F0XA 4H5NA 3C0BA 5JICA 1NGAA 2F9TA 3LDPA 5EVZA 1HKBA 5JMVA 3GG4A 4BGBA 2P9KB 1P8ZA 5BRDA 3QBWA 2CGLA 4CD1A 4CZEA 5TKYA 3WT0A 3ZX0A 3HI0A 1GLDG 1DEJA 2A6AA 1LOTB 3HZ6A 4FWOA 1NWKA 3FLCO 3P4IA 2I7NA 5AQXA 4B1XB 4BG8A 4A2AA 3C7NA 4LC9B 2ZF5O 4CZGA 3VERA 3VPZA 1HUXA 4BRLA 4EHUA 3O80A 2V7YA 4BGAA 3ENOA 1S3XA 3R8EA 1ZXOA 1H1VA 3CIPA 3CJCA 3EKSA 3FR0A 3F9MA 1ESVA 3MMVA 5FPMA 1GLFO 4FSVA 1CZAN 4QS8A 2Q36A 5AQOA 5AQYA 5KPTA 3J8AA 3FZKA 2HF4A 2CGJA 4BRDA 3GE1A 4CI6A 4FPAA 5AQUA 2P9IB 3IUCA 3BF1A 5AQJA 1T6DA 2ITMA 2NRHA 3A5NC 2Q1NA 3WEEB 4FWPA 5AQIA 4E1JA 2YCHA 3VGLA 4EAHD 3C7NB 3IDHA 1E4FT 5F1XA 1NGCA 1Q18A 4ISGA 3WXIA 3HBTA 2HOEA 3EN9A 4CZJA 4BR0A 3S41A 5AFUH 4F9OA 1S22A 4DQ8A 3A5LC 3D2FB 1BOTO 5KPRA 4EIAA 1LCUA 3W0LA 1T44A 1NLVA 2P9NB 4BRHA 1GLJO 1U2VA 2YHXA 3M6GA 4H0PA 5AFUA 4GY2B 4BC3A 1HJOA 3WXJA 1QQOA 3WEEA 1XC3A 2FXUA 5AR0A 3BP8A 1WUAA 1MDUB 1JCGA 5AQHA 3VEXA 5LJWA 3H46O 1T6CA 1WOQA 3O08A 2D0OA 3SMPA 2FSKA 3A8YA 3LDQA 1KAZA 2FF3B 4BR5A 4B1WB 4BRNA 3H6EA 2GUPA 2IVOA 2BTFA 5AQLA 4H0OA 1HPMA 4B1ZA 4XEIA 3MCPA 1MA9B 1BA1A 3H1VX 4MO5A 4PKHA 5BN8A 1GLCG 2E2NA 3R9PA 2CGKA 1TYQA 4BRAA 2ZGYA 3JXUA 2AA4A 3MDQA 3VGKA 2J4RA 3ZETB 2ASOA 3O6WA 1BU6O 4QS7A 1Y64A 2W41A 5BN9A 3CJ7A 1IG8A 3O4WA 3FZLA 2PBDA 5BR9A 1IJJA 4I6MB 4BRIA 3ATUA 3ENHA 3QFPA 2I7PA 3A5MC 3GDQA 3D2EB 4FWNA 3HM8A 4FWSA 2HF3A 4CBXA 4K43A 2ASPA 4JHDB 5E84A 4WQ5A 4BC5A 2GWKA 1MWKA 3H3NO 3ZX3A 3VF4A 3FE1A 3FGUA 3H3OB 2P9KA 3DXMA 4CBUA 3O1BA 3WQUA 1KXPA 3VOVA 3ZETA 1DGKN 4K25A 3GOIA 2KHOA 3SLCA 1NGFA 1XQSC 4YDUC 5AQWA 5BRFA 1GLEG 2Q0UA 4IJAA 3SK3A 1J6ZA 4I6MA 3CERA 5CE3A 2BUPA 4HWIA 4H03B 2UYTA 4M7YA 4L3QA 4M7XA 4MLHA 4IJNA 4QS9A 1YAGA 5ELZA 3CJBA 2P9PA 3DAWA 2OANA 1ZC6A 2QWMA 4BREA 4JD2B 4BC4A 4WQ4A 1ATSA 3U9DA 1NM1A 1U6ZA 1ATRA 2E1ZA 3ATVA 2E2QA 2YJFA 1NGDA 2P9SA 2P9IA 3VEZA 4XH1A 5AZIB 5BREA 4RCHA 3W3DA 3VGMA 1RGIA 1HLUA 3AAPA 1K8KB 3I33A 4M63C 2P9UA 2QM1A 2ASMA 4JNEA 5LY3A 4B1YB 3WXLA 3OHRA 2E8AA 2H3GX 2GWJA 1QHAA 3VF6A 1YUWA 4CZLA 3DXKA 1G99A 2E20A 4DB3A 5BPNA 4BVOA 3EKUA 5E26A 1GLBG 3BEXA 2A41A 3TPQA 1HX1A 2QWOA 3D2EA 4A62A 3D2FA 3EO3A 2P9LB 2V52B 3EZWA 4O8KA 1MWMA 3SJHA 1C0FA 5KQ8A 4BRPA 4J8FA 2YHYA 3VEYA 4H0TB 4NB4A 3ULEA 1K8KA 3D7EO 3DXMB 3U9ZA 1KAXA 3ZEUA 1X3NA 3BF3A 2CH5A 3GL1A 2V7ZA 5KPZA 5FPEA 3LL3A 1YXQA 1ZBSA 1NBWA 4AM6A 1NGBA 3LDLA 1X9JA 1BG3A 3MK6A 2YJEA 3EL2A 5I9EB 4FOIA 1QQNA 4EHTA 2AP1A 5AQRA 2P9PB 4BRGA 3GBTA 4IZ9A 4BRFA 4CZKA 4CD3A 1DKGD 3QB0A 2Q2RA 5BPMA 3LDOA 1V4TA 3UE5A 3FFKB 1OKJA 1NGEA 3O8MA 4Z94A 3CI5A 5AQQA 1U2VB 2E2PA 1QZ6A 1TUYA 3G25A 3A0IX 1JCEA 3VETA 4BRMA 2D0PA 3JS6A 5BRHA 4WYBA 1YVNA 1JCFA 4RTFD 3UKRB 2E2OA 3DWLA 2D4WA 3DXKB 4CZFA 5B8HA 2Q97A 5AQMA 4BG9A 3FZMA 4O5FA 1BO5O 4H5RA 3MN9A 2VYPA 4DHYA 4FPBA 4JHDA 5FPDA 3QMLA 1EQYA 3IMXA 4C23A 1ATNA 2A3ZA 2E88A 5BPLA 2QWQA 4H0VB 3H1QA 3TU5A 4BR9A 3BUZB 4AM7A 3O5BA 2GELA 1RFQA 3KVGA 4CZMA 4PKGA 4FWQA 2IVNA 4JN4A 4CZHA 4FOEA 3ZEUB 3H45C 2QXLA 4PL8A 4B1VA 1QZ5A 3FZHA 2A40A 2WUSA 2A5XA 3ZX2A 4FO0A 1NGGA 2QWNA 5AQFA 3A5OC 3LM2A 4ISEA 3I8BA 3UKUA 4JD2A 4PKIA 3L0QA 3R6MA 4H0YB 4CJ7A 3AARA 3O1WA 2DPNA 3QFUA 1SAZA 2P9SB 3IFRA 1GLAG 2P9NA 5AZIA 4JAXA 3U8XA 3RSEB 1Z6RA 4BC2A 4XH5A 5EY4A 4BRCA 4RWTA 5AZJB 3QBXA 1R59O 1BWFO 2GTDA 3FZFA 1E4GT 2Q0RA 3M3ZA 2E1YA 2ZWHA 4FWLA 4K41A 1X3MA 2CH6A 3U4LA 2PAVA 2HMPA 2QW9A 3LM9A 2V51B 3CQXA 3VEVA 3UKUB 4EFHA 3CHWA 2D1KA 1NGHA 4A2BA 4BR2A 2IVPA 4FWKA 1NGIA 3DJCA 3MN7A 4KBOA 4B1UB 2FSJA 1GLLO 4H5VA 3WUHA 4MO4A 1BA0A 2QWLA 5FPNA 2NZTA 4IWVA 3KZBA 2FLOA 5AQVA 3RSEA 5JLFA 4DCHA 1TYQB 5AQGA 3MN6A 5EOYA 5ADXA 2FF6A 3UB5A 2W40A 1NMDA 4H5TA 4PL7A 4NO7A 2GEMA 2P9UB 5AQPA 5AQTA 3AY9A 4BRQA 2A42A 4HTLA 5LJVA 3KHYA 3HSCA 4A61A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HP1A 2UU9K 4HTUA 5E41A 3N4PA 4FWMA 2OZSA 2F9WA 3QDKA 3ZT2A 4PWDA 2FBVA 2P9LA 4PHTX 1TVRA 4RG8A 4FJJA 1K73O 4CJRA 1CXUA 4ISFA 1J54A 3ULEB 1Q82O 2E6LA 1XUPO 3CQYA 4X66K 5EXWA 3O4NA 2YKMA 4B9SA 1C6VA 3ZT4A 4HCBA 4IXCA 2DTUA 2Q31A 3C6HA 3VMFB 1YI2N 1A5XA 1LAWA 4DV1K 5J2MA 4IOAL 2KQ2A 4F2RA 1RDDA 5JVHL 4UY8O 3LWMA 4BROA 3OBWA 5EU7A 4YOUA 2HNYA 2RF2A 4XH4A 1HYZA 1CXQA 2OCEA 5F2RA 4AHSA 3WXMB 5DK5A 3NF8A 3HO1A 1EXQA 5M1NA 3ISNC 3LDPA 5EVZA 1HKBA 4JKDA 5BR8K 4OVLA 4FLZA 3HI0A 2A6AA 2F96A 3HZ6A 2HBKA 4LC9B 3WNEA 4JI4K 3AVMA 3E66A 4JKEA 1ZBFA 1J9AA 1LW0A 2YKNA 4E7HA 4JI7K 3EKSA 3RWUA 1GLFO 3AVNA 1BCOA 4JK9A 3G6EN 1TKXA 5GIOA 3KLHA 5D3GA 3VQ7A 4CI6A 4CFDA 3BF1A 1T6DA 2NRHA 2WC9A 3NCIA 4YOTA 3KWGA 4E1JA 3PX6A 3P5JA 1TV6A 4DF8A 4EAHD 2OPPA 3L3VA 1NKBA 4X62K 4ISGA 3WXIA 2WFBA 5M1KA 4AHCA 3AVCA 1WN7A 1S22A 4DQ8A 3A5LC 4ILJA 3OYKA 3D2FB 1BOTO 1W9HA 2KTQA 4KHNA 1VK0A 1LCUA 4ZTFA 2P9NB 2Y1IA 3TR8A 3KTQA 3WXJA 3WEEA 1XC3A 3NMUA 3SUNA 4FJ7A 1FKPA 5CYMA 2KZZA 5AQHA 1JLAA 2HVIA 4FLYA 5LJWA 1EETA 1WOQA 2HBJA 2D0OA 1JKHA 5DM6L 1JLCA 1BQMA 1MU2A 3LDQA 1KAZA 4B1WB 3P31A 4BRNA 2LSNA 3VQBA 2IVOA 5HRSA 2BTFA 4DUZK 3K5NA 4LH4A 3VQEA 1E3MA 4M3WA 1GLCG 1VQ4N 5SWMA 2E2NA 4DR4K 2ZGYA 1HR0K 3CM5A 2J4RA 1BU6O 4IO9L 1D5AA 1KSPA 2W41A 4YFUA 2HHTA 3ZLJA 4GMJB 4M3RA 4EP5A 1HNWK 5BR9A 3DM2A 1YT3A 5C42A 3RVCA 3D2EB 3LPUA 4DSIA 2EX3A 4CHOA 3SNNA 1HNVA 4CBXA 5E84A 5CY4A 4WQ5A 4BC5A 1VSIA 4O8UA 3JSMA 1JL2A 1L3TA 3FE1A 2DFEA 4FZZA 4DQPA 4CBUA 3AVIA 1ASUA 3O1BA 3WQUA 3ZETA 2VWKA 1WAFA 2Q3SA 2X6NA 5FRMA 3GOIA 4W5TA 2KHOA 3SLCA 4YDUC 5AQWA 1NK4A 1S9EA 3G71N 3CERA 3QO9A 5CE3A 4HWIA 4DFPA 4H03B 4NXNK 3AV9A 4MLHA 4QS9A 3VQDA 5KI6A 4IDHA 2D0AA 3K5LA 1ZC6A 3F73A 2QWMA 3T69A 4CJPA 1XWLA 4BC4A 4WQ4A 1FW6A 1S5JA 4KI6A 3U3GA 2O8DB 4FLUA 2P9IA 4XH1A 4RCHA 1ZBUA 3VGMA 3HRGA 3AAPA 4M63C 2P9UA 2QM1A 5LY3A 4LFAK 2P5OA 3J81O 1HQUA 2E8AA 3VF6A 3OS2A 1EO1A 1UOCA 3MXJA 1FKOA 2HNDA 5BPNA 4DB3A 3L2VA 5GAHP 4WFBL 4FJ9A 3EKUA 1Q8IA 3BEXA 2A41A 3TPQA 2XY7A 3G4SN 2QWOA 3R3LA 4DR1K 4L8RB 4A62A 3EO3A 3PUFA 2YHAA 3EZWA 4Z4EA 4CEEA 1MWMA 3SJHA 2GUIA 5KQ8A 3O9TA 2VG6A 3OYJA 2WOMA 2W42A 4H0TB 1VSMA 3SJJA 4FJHA 3D7EO 2HHQA 4RW6A 1A5VA 4CEDA 2CH5A 2Z1IA 1KFDA 1DTQA 1FK9A 3LL3A 4AM6A 4DU3A 2JGUA 1X9JA 3KK7A 4FVUA 3MX2A 4CHNA 4JEPA 3VQPA 2D0BA 2QK9A 4UQGA 2P9PB 3QESA 3GBTA 4CGIA 3NAEA 4CD3A 4DV7K 2Q2RA 1QQCA 2VG7A 4NYFA 4FJXA 3D0PA 4BE1A 1KVCA 1VQMN 2O8BA 1B92A 2E2PA 1QZ6A 4V19S 2B5JA 4CFCA 4B8CA 1CZBA 3M8QA 3VETA 5BRHA 1YVNA 1JLEA 2E2OA 5J1EA 2D4WA 3BZKA 4CZFA 5J2PA 5B8HA 5AQMA 3OVNA 3FZMA 4QCLA 4M42A 4WE1A 1KCFA 4DTJA 2RN2A 1VAZA 4LF7K 1WSIA 2VYPA 2UUCK 4CEBA 3DMJA 1TK5A 3RMBA 2W6KA 1N5YA 1ATNA 3SPYA 3DLHA 3M8SA 4LFCK 1RT2A 3ZSZA 3THVA 4NCAA 4DV0K 1W7AA 1RT3A 4CZMA 4PKGA 4CZHA 1XNRK 1T05A 1Q7YO 4LF4K 2JLEA 3AO2A 1HQEA 3M5RA 3MWTA 4JKHA 2A40A 3MXMA 1Q81O 2A5XA 3L8BA 1C1BA 2G8WA 1NGGA 2QWNA 1M90O 1YJNN 3SQ0A 3A5OC 1JJ2M 3L0QA 3S3OA 5CR4A 4H0YB 2HBLA 3CCSN 3O1WA 3V9UA 4DQIA 2YX6A 1QTMA 1TL1A 1HMVA 4BWJA 2P9SB 1VSDA 1XNQK 3PSFA 5AZIA 3KLEA 4O0IA 1BGXT 4BC2A 4Z4IA 3SBTA 4RWTA 3QBXA 4JKCA 1R59O 4C8NA 3MEDA 4FWLA 1YITN 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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