3EO3A

Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
312
structure length
288
Chain Sequence
TLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVPKDEAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylman
publication title Crystal structure of the N-acetylmannosamine kinase domain of GNE.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase, transferase
total genus 86
structure length 288
sequence length 312
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2008-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A02
4DB3A 2FSKA 1BOTO 3KZBA 1HLUA 3FZKA 2D1KA 4PL8A 3ATVA 1BG3A 2ASMA 4CZLA 1D4XA 2P9SB 4DHYA 5BRHA 4K42A 1BA1A 1JCGA 4BGAA 4AM6A 3WXJA 2UYTA 3AY9A 4CZGA 3BEXA 3DAWA 5AFUH 3FZHA 4I6MB 5KQ8A 1HX1A 5AQRA 3LM9A 3VEZA 3MDQA 4A61A 3WQUA 2I7PA 1NGJA 2A40A 1MA9B 4FWQA 3BF3A 5LY3A 2HF4A 4ISFA 1ESVA 3IMXA 4BQLA 3QDKA 1NMDA 4BRMA 2E2PA 4EIAA 2A42A 4O8KA 5F2RA 4CI6A 1TYQB 2VCPA 5FPMA 3AAQA 5AQHA 4K25A 2ITMA 5AQQA 4XEIA 1GLEG 3SLCA 3RSEB 3VEWA 4B1WB 4XH4A 2Q97A 3VEXA 2YJFA 3G25A 3GBTA 4MLHA 2E88A 5EOYA 1V4TA 5LJWA 4BC5A 4A2AA 1T44A 3A8YA 3H3NO 3M6GA 3O1BA 3AARA 2V51B 4JNEA 4NB4A 1NWKA 3D2FB 4BROA 4BRAA 5FPEA 4FOEA 4RWTA 3GDQA 4BVOA 5FPDA 4BRNA 5AQGA 2NZTA 2V52B 3ATUA 4H5TA 2EWSA 3A5NC 5BPMA 3EKSA 1KAXA 1GLDG 3WXLA 3U4LA 3O8MA 4CZJA 5AQMA 3O08A 2GEMA 4GNIA 4B9QA 4FOIA 1NM1A 4JD2A 2D0OA 4FPBA 1TUUA 2DPNA 5B8HA 2CGKA 5AQNA 2FLOA 5EVZA 4A2BA 4E1JA 2FXUA 2Q1NA 2CGLA 3H6EA 3TPQA 2YHXA 4B1VA 3GE1A 3ZX3A 1MDUB 3O6WA 5AZIA 3WT0A 3WXKA 3MN6A 1XQSC 3VGMA 3WEEB 2QWLA 3CHWA 2GWKA 1GLAG 4Z94A 1Z05A 3GL1A 3A5OC 4FWPA 2ASPA 4BC4A 2V7YA 2E2NA 2Q0UA 3EZWA 1NGHA 4IO8A 4KBOA 4M7XA 3WXIA 5AQTA 5ADXH 3I33A 1KXPA 3U9ZA 3DXKA 4IJAA 5AQUA 2A6AA 2P9IB 4H5VA 3ZX0A 4EAHD 3D2EB 3MN7A 3MK6A 4WQ4C 1P8ZA 5AQVA 3IUCA 4HWIA 2NLXA 4CZMA 5KQDA 3CJAA 5EXWA 3ULEA 3LDOA 5AQFA 1V4SA 3DXMA 4BRCA 3EO3A 3CETA 3ID8A 3M3ZA 4M63C 3ZETB 3FE1A 4BRPA 3HBTA 2E20A 4RCHA 1NGEA 3R6MA 3ZEUA 3VENA 2E1ZA 5AZJA 3EKUA 3P4IA 2VYPA 5BR9A 2HF3A 4EHTA 1QQNA 1SQKA 1TUYA 1U6ZA 3FZFA 3F9MA 1GLJO 2QWOA 4RTFD 4B1XB 4F9OA 3U8XA 4ISEA 3UE5A 2P9PB 2P9SA 3JXUA 4H5RA 4PKIA 2YHWA 1SZ2A 3A0IX 5FPNA 1QHAA 2HMPA 4H0VB 3SK3A 2I7NA 1GLFO 4AM7A 4MO5A 2CH6A 4EHUA 1LCUA 3WQTA 3A5MC 2YI1A 4I6MA 4B1UB 2AA4A 4WQ5A 4CD1A 1YAGA 1RGIA 4IJNA 4CD3A 1C0FA 2P9LB 3H1VX 3LL3A 4PL7A 2ZWHA 3SMPA 3BUZB 1RDWX 4YDUA 1DGKN 3H3OB 2PBDA 3ENHA 4BQZA 5AFUA 3O1WA 4EFHA 1E4FT 1HKBA 2YHYA 4H5NA 2FF6A 1Q18A 3J8AA 4BRLA 3LDQA 1X3MA 3CERA 2KHOA 1RFQA 4IZ9A 4L3QA 1TYQA 3R8EA 4CZIA 3BF1A 3VEYA 1WUAA 3LDNA 5AQZA 2HOEA 3RSEA 1R59O 3AAPA 3C7NA 4LC9B 1LOTB 1S3XA 3M1FA 2FF3B 4FWLA 3UKUA 1G99A 3DWLA 1BO5O 2A41A 3R9PA 1XUPO 4JHDB 3VGKA 4FWRA 4B1YB 2ZGZA 1U2VA 2Q0RA 1ZBSA 4FWMA 4BRGA 3D2FA 3DJCA 2A3ZA 5AQYA 4PKGA 3VOVA 3CJ9A 3VEOA 2IIRA 1JCFA 2BTFA 1HKCA 1K8KB 5KPRA 5ELZA 1HKGA 2GTDA 3HI0A 2FSJA 4XH1A 3MN5A 4CBXA 3IDHA 4BRIA 4BR9A 4BVPA 5E84A 3FLCO 5TKYA 5JLHA 1ATSA 3MCPA 2P9KB 5KPZA 2PAVA 3UKRB 3QFUA 4FPAA 4GY2B 2E2QA 3LDLA 3FZMA 3B8AX 1NGDA 1DKGD 4CBWA 4MO4A 1HUXA 4BR0A 3VGLA 2Q31A 2FSNA 3CQXA 2QWMA 1ATRA 1BUPA 2Q2RA 4BC2A 1ZXOA 4Y0WA 2GUPA 3JS6A 3S41A 4JN4A 2D4WA 4BR7A 2P9UB 5BRFA 3EL2A 4K43A 2YCHA 1GLLO 2IVOA 1S22A 1T6DA 3O80A 3QMLA 4NO7A 4K41A 2QWRA 2F9TA 4PKHA 3SJHA 4BG8A 4CBUA 5AR0A 1SAZA 3LDPA 1J6ZA 2QXLA 3VF2A 4BRQA 1QQOA 1NGCA 5EX5A 3H46O 2P9IA 3EN9A 3VESA 3D2EA 3CIPA 2P9NB 3HSCA 2H3GX 4QS9A 5EY4A 4CZEA 1CZAN 4BR4A 5AQPA 3SMSA 3TU5A 3L0QA 1XC3A 1T6CA 4BR2A 4H0OA 3UB5A 3L6QA 3ZETA 1ATNA 5E26A 1HPMA 3A5LC 1BA0A 3W3DA 2A5XA 3H1QA 4H0TB 3GOIA 1IG8A 4H5WA 4FO0A 4QS7A 4DQ8A 2IVNA 3MMVA 3VEVA 2AP1A 5BN8A 1GLBG 1ZC6A 3O4WA 2P9PA 1H1VA 3QFPA 5AQKA 1HJOA 1MWMA 1YXQA 3QBWA 3QICA 5BPLA 4IXCA 3IFRA 4BRHA 5F0XA 2GWJA 4BR5A 2E2OA 2P9LA 3I8BA 4BGBA 1NGBA 3CI5A 4JAXA 1NGIA 3VF6A 3FR0A 3L4IA 4CZKA 2Q36A 5AQXA 3U9DA 3VETA 1BU6O 2QW9A 4A62A 4XH5A 3QBXA 4BG9A 3FFKB 1YUWA 2QWQA 3OHRA 5AQLA 5KPTA 5JLFA 3HM8A 3C7NB 3UKUB 3W0LA 4JHDA 1JCEA 3MN9A 3VPZA 1YVNA 3HZ6A 5AQSA 1NGGA 4WQ5C 5AQWA 2VWBA 1U2VB 1KAZA 2ZGYA 1QQMA 3ZX2A 1C0GA 5JICA 3QB0A 4BRKA 5AQIA 2W40A 4YDUC 2QM1A 4DCHA 4H0YB 4FWOA 2OANA 2IVPA 4BC3A 4JD2B 2NRHA 4H03B 1K8KA 2F9WA 5BREA 5BPNA 1X3NA 2WUSA 3CJ1A 3CQYA 4FWNA 1QZ5A 4BRFA 4WYBA 2V7ZA 2QWNA 5AZIB 2P9KA 4WQ4A 4MLEA 4B1ZA 3UKRA 4H0PA 1BDGA 3WEEA 3HTVA 2ASOA 3VF4A 1X9JA 1NGFA 1WOQA 3C0BA 4FWKA 3VERA 5AQOA 1QZ6A 4CZHA 3CJ7A 4H0XB 4M7YA 2E8AA 4FL9A 3KHYA 1BWFO 2W41A 3O5BA 5I9EB 3H45C 5LJVA 1Y64A 2P9UA 1NLVA 1NBWA 2CH5A 3DXKB 5F1XA 2YJEA 3ENOA 4FWSA 2CGJA 5CE3A 4FSVA 1IJJA 3D7EO 2D0PA 4HTLA 5BN9A 5ADXA 2BUPA 4J8FA 1KAYA 2J4RA 3CJCA 1EQYA 1MWKA 1NGAA 3ULEB 1GLCG 1E4GT 2ZF5O 1OKJA 5AQJA 3DXMB 1DEJA 2P9NA 4ISGA 4C23A 5JMVA 4BREA 5BRDA 3GG4A 2GELA 2E1YA 3LM2A 4IWVA 3BP8A 4QS8A 4O5FA 1Z6RA 3KVGA 4CZFA 3FZLA 2QWPA 3FGUA 3WUHA 3ZEUB 4CJ7A 5AZJB 4BRDA 3CJBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DB3A 4GKJK 2FSKA 3KK2A 1BQMA 2GV9A 4DUYK 3ATVA 2UU9K 3QETA 3M5RA 4CJVA 4DR5K 4DHYA 4BGAA 3T1HK 3CC4N 3AY9A 3EE9A 4XIUA 3V9WA 2XY8A 3BEXA 3DAWA 5AFUH 1N5YA 4I6MB 1IKXA 1EKEA 3T3FA 3LM9A 4A61A 1UWBA 3WQUA 3SV4A 1L3VA 2OCEA 4M3YA 3VA3A 4FWQA 3BF3A 3RMCA 1RDDA 4B3SK 1RBVA 1N6QA 1GOBA 1DTTA 4CJPA 1NMDA 4BRMA 1TKZA 2A42A 4O8KA 3SAFA 1KD1O 5M1QA 2VCPA 4C8OA 4KHPK 3SLCA 1KFDA 1IO2A 3GBTA 2ZJQL 3JAMO 2QA4N 4MLHA 1QSYA 5GAHP 4CFCA 3O1BA 3NF6A 3RVCA 4U67L 1C1CA 1TGOA 3ULDA 1VQON 4BVOA 5FPDA 1Y97A 4BRNA 3P5JA 1OH5A 3T1YK 4DTRA 4KHWA 3VQDA 1KAXA 4N56A 3QNOA 1GLDG 3WXLA 4DV0K 2GEMA 4B9QA 1IV0A 4CGJA 3DLKA 3C65A 3AA4A 3TTDA 4DTMA 3ALYA 1HQUA 4B9SA 5AQNA 1SL1A 2KZZA 4ILJA 3H6EA 4NCGA 3HPGA 4B1VA 3GE1A 4FJIA 3WXKA 1J5EK 4ILHA 3WEEB 2QWLA 3KLHA 3RR8A 3CHWA 1HNXK 1Q7YO 1Z05A 4FWPA 4CF9A 1S1WA 2V7YA 2E2NA 1JLEA 3THWB 3DYAA 5JS2A 4AHTA 3TARA 3WXIA 5ADXH 4CJ4A 4MDAA 3DLBA 2I5JA 2BANA 4G9ZA 4KHQA 5AQUA 5KTQA 2A6AA 2O4GA 1X1PA 1HRHA 3ZT3A 4BDZA 2NLXA 3I55N 5KQDA 2HNZA 3ULEA 3SNNA 4FJ5A 2F8TA 4QCLA 3LDOA 4PA1A 3CETA 1TVRA 3I56N 2O8BB 4RCHA 1RDCA 3K2PA 2UXBK 3ZEUA 3NH2A 1NJYA 1Q82O 4JKGA 3LAMA 4CF8A 3Q7BA 3NF8A 3L4QA 1U6ZA 3FZFA 2UUCK 5IT9O 1RNHA 1GLJO 4KI4A 4Z4IA 4HUEA 3U8XA 4CEEA 4J2DA 3OS2A 4YFUA 2P9PB 3E9PA 3SZ2A 2YHAA 3DLGA 3NCIA 1J54A 1SZ2A 3T69A 3A0IX 4FLUA 4BACA 4AM7A 4MO5A 1EP4A 4B1UB 2YV0X 1YAGA 1B9DA 4KB0A 2P9LB 2HW3A 2O8EB 3H1VX 4MFBA 3VQAA 3SMPA 4KI6A 3K9KA 3HP9A 1DGKN 1MU2A 4JK8A 2PBDA 3ENHA 5AFUA 4G1QA 4Y1CA 4EFHA 1E4FT 1HKBA 1NK4A 2FF6A 3NHGA 1S5JA 2KHOA 4IZ9A 3K0SA 1VQMN 4CEOA 3OYNA 1NK0A 3G71N 3PX6A 3R8EA 1XMQK 5AQZA 2HOEA 3CXCM 1R59O 2HHHK 1D8YA 3WNFA 3CCMN 3M1FA 3M8QA 3UKUA 1R0AA 3OBWA 4JHDB 5JVGL 3MWTA 4F4KA 4B1YB 5HRSA 2NRZA 3CD6N 4GKKK 1U2VA 2XY5A 3SJJA 2Q0RA 1C6VA 4W5OA 1ZBSA 4OKEA 3D2FA 4E7JA 2A3ZA 4KH4A 5M1FA 1LAWA 4GVMA 1BCMA 3OBYA 2BTFA 5KGXA 4OJRA 3OYBA 2B6AA 1HKGA 3KKSA 4F8RA 3OYKA 2GTDA 3HI0A 3OYJA 2NUBA 1D9FA 3IDHA 4Z4FA 1KVAA 5E84A 4C8LA 5JLHA 1VQ9N 3MCPA 4CHQA 2P5OA 4Q0BA 3QFUA 4FPAA 4DMNA 2VG6A 4EP5A 2E2QA 3OYGA 3AVNA 3FZMA 4I9QA 5M1KA 3L2VA 3VGLA 1JKHA 4BE1A 1HYZA 4JKBA 4IG3A 1M1KO 3AVCA 1ATRA 1BUPA 4CHNA 4CECA 5SZTA 1HJRA 4Y0WA 1ZXOA 5GINA 3QIOA 3TI0A 4I7FA 4JN4A 3S41A 4BR7A 5BRFA 2G8WA 3EL2A 4CGGA 2YCHA 1WLJA 5A2QO 3VTIA 4IOAL 4OGEA 3V1OA 2W42A 2G8FA 4PKHA 3TSPA 4BG8A 3V81A 3SQ0A 1J6ZA 2QXLA 1G15A 4OKJA 1QQOA 4KHSA 2P9IA 4FM0A 3EN9A 3CM5A 4CFDA 3D2EA 4B3RK 3HSCA 4DV5K 3AVIA 3NVMA 3C95A 4CZEA 1TL3A 2E6MA 4DV6K 3CYMA 1K6YA 4IDHA 3CC2N 3HJFA 2P1JA 2BGGA 3MX5A 4WFBL 4KO0A 4HUGA 1HPMA 4FJ8A 4CGDA 2A5XA 3H1QA 2RPIA 3K9JA 4ZTFA 2HBJA 4IDKA 2QKKA 3HK2A 3MMVA 3VEVA 5BN8A 3K5OA 4F3OA 1C1BA 3O4WA 3O3GA 4B8CA 1RT4A 4MDBA 2PYLA 3SBTA 4JI6K 4IXCA 3NH0A 3AGRA 3NBPA 1RT6A 3IKMA 3THYA 1TKDA 1K9MO 3OS1A 1YITN 4DV7K 4LF8K 3VETA 1BU6O 2QW9A 3CQ8A 3RMAA 3SUOA 2HNDA 1HNZK 3DOKA 1WAJA 5KPTA 4PUOA 3HM8A 1WN7A 1VQ4N 1UA0A 3UKUB 4DLGA 4CW7B 2X74A 2NRWA 3U3YA 2XRIA 4PY5A 1LW0A 1YVNA 1NGGA 5AQWA 4E0DA 1U2VB 4ELTA 1OH6A 4BRKA 1HMVA 2W40A 1ZBFA 4GV3A 4E7LA 3L2UA 4BC3A 4AH9A 3HSTB 4JD2B 4C1NI 5E41A 3L3VA 2WUSA 3CQYA 4FWNA 4U7BA 4CF2A 1W2BM 1HR0K 2Z1JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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