3EO3A

Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
312
structure length
288
Chain Sequence
TLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVPKDEAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Isomerase, transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the N-acetylmannosamine kinase domain of GNE.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylman
total genus 86
structure length 288
sequence length 312
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2008-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A02
3LM2A 4YDUC 5E84A 3UKUB 1J6ZA 3FFKB 4WYBA 3O80A 3P4IA 3WXKA 3H6EA 3CJ1A 4K25A 2D0OA 4DB3A 4J8FA 3DXKB 2GWKA 3H3NO 4B1VA 1NGAA 1KAYA 3U4LA 2E2QA 2GUPA 1R59O 4BRGA 4XH1A 2WUSA 3FZHA 5AQHA 3O8MA 4FWNA 4DQ8A 4I6MB 2FSJA 2HMPA 3A5NC 3AAPA 4Y0WA 3CJAA 1BO5O 1BG3A 4IXCA 4M7XA 2V52B 4H0YB 4BR2A 4K42A 4H5RA 2EWSA 5BPNA 1NGCA 3EZWA 1X3MA 3SJHA 2IVPA 4EAHD 1H1VA 3R8EA 1BOTO 4CBWA 4BGBA 4BR5A 1RFQA 3AY9A 4CZIA 1NGJA 1NGHA 2QWMA 3TU5A 2ZF5O 2V7ZA 2P9NA 4WQ5A 3L0QA 4F9OA 5LJWA 2OANA 4JD2B 4K43A 5TKYA 4PKIA 3ENHA 2P9IB 2V7YA 1MWKA 3HZ6A 3BUZB 1U2VB 3CETA 5BPMA 2E2OA 1BDGA 4IO8A 3LL3A 3UKRA 4RWTA 3CJCA 1V4SA 4BRPA 5FPDA 4PL8A 3ATVA 4XH5A 2NLXA 1Q18A 2E1YA 1NGDA 3CQYA 2ZGZA 5BN8A 5EY4A 2H3GX 3LDNA 3O1WA 4JHDA 2QWQA 3I8BA 3VEZA 2P9KA 3CERA 3VGLA 4AM7A 4BRNA 1KXPA 2QW9A 2P9UB 2FF6A 4JAXA 1LCUA 3U8XA 4MO4A 1YXQA 4B1UB 4BR9A 5BRDA 3FLCO 3IUCA 3W3DA 3KZBA 2E88A 3ZETB 1NGFA 4FL9A 4CBUA 3UKUA 1GLAG 4JN4A 2I7NA 1Z05A 4BC2A 2PBDA 4BG9A 2Q1NA 3ID8A 3CIPA 2D4WA 3EKSA 4BRAA 3CQXA 5B8HA 4E1JA 1TYQB 3DXKA 2FSKA 1NM1A 4XH4A 3SK3A 3EKUA 3C7NB 3CJBA 2ASPA 5BRFA 5BR9A 3JXUA 3QFUA 3LM9A 3BEXA 1DGKN 4I6MA 1HKBA 2A40A 3AAQA 3FR0A 3QBWA 2CGLA 2BTFA 2E2NA 4PL7A 3HSCA 5AQFA 1K8KB 4MO5A 2GELA 2A5XA 4GY2B 5AQRA 2YI1A 1QZ6A 2ZGYA 2AP1A 3L6QA 3H1QA 1GLDG 2E1ZA 2ZWHA 4BVPA 1TUUA 3VENA 4DHYA 4HTLA 2BUPA 3W0LA 3FZFA 4XEIA 3SLCA 4C23A 3ENOA 3H1VX 5KPZA 3MDQA 4H5WA 4PKHA 3FZMA 4BROA 5AR0A 2YCHA 2P9IA 4CZEA 3A8YA 4H0OA 1BWFO 3DJCA 1T6DA 4EFHA 1U2VA 3QBXA 3WQUA 2FXUA 2QXLA 3O5BA 4CZKA 2E20A 4FWRA 5KQDA 3H46O 3IFRA 4FO0A 1BA1A 3CJ9A 1HX1A 4FWLA 4WQ4A 3MN6A 1Y64A 4AM6A 2PAVA 5JLHA 1QQNA 3HTVA 5AQYA 2KHOA 4DCHA 4BC3A 4CJ7A 5AQNA 3VF4A 1V4TA 1HPMA 2IVNA 1SZ2A 5FPNA 3D2EB 3MN7A 4B1YB 5ADXH 4BRFA 3C0BA 2P9UA 4A2BA 5ADXA 1QQOA 3DAWA 1ESVA 1GLEG 4NB4A 5AQIA 3SMSA 1GLLO 1RDWX 5AQWA 2ITMA 2W41A 3AARA 4FPBA 3WXJA 2P9LB 2HF4A 1TUYA 4Z94A 2A42A 3SMPA 5EX5A 5AQKA 1SAZA 5BREA 2Q0UA 1ATNA 1TYQA 3A0IX 3KVGA 4FOIA 4FWSA 3QICA 3ULEB 2A3ZA 3LDPA 1G99A 3A5LC 1D4XA 3C7NA 4CZJA 1C0FA 3EO3A 1BU6O 4K41A 2FF3B 3CI5A 5AFUA 1SQKA 1NGIA 2J4RA 3L4IA 1KAXA 4FSVA 5E26A 5AQSA 4BR0A 1ATRA 1K8KA 3ZEUB 3WEEB 3D2FB 5AQPA 3DXMB 3VERA 4H0TB 4RCHA 1ZBSA 4BQZA 3VEWA 3D7EO 3CHWA 1EQYA 3LDOA 2D0PA 4H0PA 1OKJA 5KPRA 3QMLA 3G25A 5JLFA 4BC5A 1BA0A 5ELZA 2Q97A 2QM1A 3VEYA 4WQ5C 5CE3A 5AQGA 2P9SB 3VGKA 3EL2A 4A61A 3LDLA 4QS9A 2P9PB 5I9EB 4YDUA 1HLUA 1MDUB 5JICA 1NGGA 5LJVA 4H03B 3VESA 2ASOA 2QWRA 3VF6A 5FPEA 3MK6A 3FGUA 3HM8A 3CJ7A 3DWLA 5EVZA 3H45C 3FE1A 3VPZA 4BRQA 4M63C 3F9MA 1JCGA 3M1FA 4B1WB 4CI6A 4BGAA 3J8AA 4BREA 1YAGA 2CGJA 5EOYA 4BRDA 3UB5A 1IG8A 3VETA 1JCFA 3M6GA 3D2EA 4FWQA 1HKCA 1X9JA 1YUWA 2AA4A 3WXLA 3O4WA 1NGBA 5FPMA 3GBTA 3GOIA 1DKGD 1E4GT 4JD2A 3RSEB 2P9LA 3WQTA 4CBXA 5BRHA 5KQ8A 5AQZA 1NBWA 3O6WA 4LC9B 4QS7A 1NMDA 2F9WA 5AQUA 4A2AA 3BF3A 4O5FA 3WXIA 4BRHA 3MN5A 5F2RA 3WT0A 3ULEA 1ZXOA 2VCPA 1CZAN 5JMVA 2CGKA 4H0XB 3OHRA 3KHYA 4JNEA 4M7YA 2FSNA 4BRCA 2YHYA 4H0VB 3IDHA 1GLFO 2E8AA 3GL1A 3ZEUA 3ZX0A 4BVOA 3M3ZA 3WEEA 2Q0RA 4L3QA 5BPLA 3D2FA 3DXMA 2FLOA 2YJFA 1KAZA 4B9QA 3EN9A 2DPNA 1QQMA 1YVNA 2VWBA 3U9DA 1U6ZA 3VOVA 3JS6A 5AZJB 2D1KA 3O1BA 1P8ZA 5AQQA 2A41A 3ZETA 3O08A 2Q36A 5KPTA 2V51B 2Q2RA 3GDQA 4FPAA 4RTFD 3VEOA 1Z6RA 4CZMA 1DEJA 5EXWA 2QWLA 5AZIB 1WOQA 2GWJA 2P9SA 3ZX3A 2CH6A 3MN9A 3MMVA 2P9PA 5AFUH 1GLJO 1E4FT 3LDQA 1IJJA 1RGIA 4H5VA 1C0GA 2UYTA 3A5OC 2E2PA 4KBOA 4B1ZA 4WQ4C 4EIAA 3BP8A 4FOEA 3R9PA 4CZGA 4EHTA 2YJEA 3B8AX 1NWKA 4H5TA 1ATSA 3A5MC 4QS8A 4FWOA 3VGMA 3WUHA 4BC4A 1QZ5A 3H3OB 5AQXA 3VEVA 3FZKA 3QDKA 5AQVA 3TPQA 4IJAA 3MCPA 4CD1A 4FWKA 2QWPA 1HJOA 4CZLA 1GLBG 2Q31A 1JCEA 1QHAA 4H5NA 3VEXA 2W40A 4NO7A 2YHWA 4CZHA 5F0XA 4IWVA 4CD3A 4B1XB 4IJNA 4O8KA 3RSEA 1MWMA 3BF1A 4BR7A 2GTDA 1NGEA 2NZTA 4MLEA 5AQTA 2I7PA 1MA9B 3GG4A 1T6CA 3I33A 2VYPA 2P9NB 5BN9A 4ISGA 3HI0A 1GLCG 5AQJA 4FWPA 3U9ZA 1S3XA 3ATUA 4A62A 1WUAA 1XC3A 3VF2A 1S22A 5AQMA 1LOTB 1X3NA 4BRIA 3UKRB 2HOEA 2QWOA 2YHXA 2NRHA 4PKGA 4MLHA 1HUXA 2CH5A 2IVOA 3HBTA 4BRLA 4GNIA 4CZFA 2A6AA 4IZ9A 1XQSC 5LY3A 2HF3A 5AZJA 1HKGA 5AQOA 1XUPO 5F1XA 4HWIA 1T44A 3GE1A 3QFPA 4BRMA 4BR4A 4JHDB 4ISEA 2QWNA 4BG8A 4BRKA 1NLVA 3QB0A 4EHUA 2P9KB 3IMXA 3R6MA 3S41A 3FZLA 2ASMA 4BQLA 2IIRA 3UE5A 1BUPA 2F9TA 5AQLA 5AZIA 3ZX2A 4FWMA 1ZC6A 2GEMA 4ISFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSHA 2ETJA 5E84A 4DSLA 4CF1A 4EP4A 3O80A 2I5JA 3P4IA 1VQMN 2D0OA 4DB3A 1CZ9A 4B1VA 1NGAA 2GUPA 4B8CA 4BRGA 1XC9A 3AV9A 4U7BA 4FWNA 4JI0K 4CEOA 3AVMA 2VG6A 3KWIA 4IG0A 2NRZA 4JKBA 1C1AA 3L3VA 4E7KA 4FJGA 4M7XA 2WBNA 1C0UA 2V52B 1JL1A 4H0YB 4H5RA 1HRHA 1RT3A 2EWSA 3NF9A 1NGCA 2FBTA 4ILHA 3SJHA 4CIEA 3OTOK 1BOTO 3NFAA 3MX5A 1RFQA 4CZIA 1NGJA 4CVNE 3CCUN 5M1OA 5J2MA 3TU5A 1O13A 2ZF5O 4JK9A 3DRSA 1O1WA 5M1QA 4RW7A 4Q0BA 3L0QA 4F9OA 4JD2B 3L2WA 4NYNA 2BANA 3J80O 1MWKA 3BUZB 4AHTA 4JI3K 2E2OA 2WONA 1V4SA 3V4IA 4LF5K 4OO1J 4J2DA 3ASMA 1EWRA 4CGJA 2O8BA 1VSFA 4XH5A 2NLXA 4PUOA 1NGDA 4M3ZA 2ZGZA 4N56A 4IEEA 4WFAL 3LDNA 5FLXO 4JHDA 2W6KA 2QWQA 3I8BA 3VEZA 2IDOA 3CERA 5CYQA 4AM7A 4JI6K 3OYJA 1YXQA 3AVIA 4BR9A 4JKCA 3IUCA 3W3DA 3SYZA 2Y1JA 4DV7K 4N41A 4JN4A 3J7ZO 4IFVA 2I7NA 2PBDA 3CIPA 5B8HA 3CQXA 1ZBFA 1TYQB 2G8IA 3ZT3A 4XH4A 1FK9A 3EKUA 1NJYA 3CXCM 3C7NB 3CJBA 3AVAA 2AJQA 3QFUA 1RTIA 3HPHA 3LM9A 3QIPA 4MDBA 4I6MA 1HKBA 2UUCK 2VGMA 4Z4HA 3QBWA 2E2NA 1JKHA 5E41A 3HSCA 5DM7L 5AQFA 3AO1A 3BZCA 4GY2B 3MECA 4FJXA 1QZ6A 3L6QA 3RR8A 3L2RA 1GLDG 2BE2A 4KFBA 4YOUA 4JKEA 3VQQA 4F2SA 4I2QA 4DQQA 4FW2A 1T3VA 3W0LA 1XWLA 1YJWN 5KPZA 3NHGA 1J53A 1SL1A 2X74A 1RDAA 4FLVA 2RPIA 1C1CA 4MQ3A 4C8MA 2YCHA 2P9IA 3QO9A 4CZEA 2O8FB 3NGIA 3KLFA 4EFHA 3OYHA 1S5JA 3I0RA 3OYIA 3OS1A 4FJ5A 3SAGA 3UIQA 1T8EA 4NLBA 5IT9O 1BA1A 4WQ4A 1Z26A 4AM6A 2RKIA 3TI0A 4OLAA 2IOCA 3HTVA 2JLEA 4NLCA 4YOTA 1ZYQA 4CJ7A 4ELVA 3VF4A 1HPMA 5FPNA 4BRFA 3C0BA 1K73O 5IWAK 1JLQA 1W0HA 5AQIA 4E7JA 4CF9A 1XHXA 1BCOA 5H1SQ 1VRUA 1TUYA 3DLGA 3AVGA 4Z94A 3CCVN 3DI6A 5HBMA 1KFDA 4O8UA 4FM2A 1ATNA 3ULEB 4BE1A 4KH5A 3EO3A 1FW6A 3SBGA 1NG9A 3L4IA 4JLHA 4KTQA 3L2VA 4DTXA 1KCFA 1K8KA 1OVQA 3I55N 3ZEUB 3PO4A 2O8CB 1HYSA 4IFYA 5AQPA 2WTUA 3TWHA 5LMNK 5AJ3K 1HPZA 2D0PA 4H0PA 3HRGA 3QMLA 3VA0A 1BA0A 3DLEA 2NRVA 2P5OA 1RDCA 4WQ5C 4DR2K 2HHHK 3PX0A 3SCXA 1ITGA 4B9VA 2P9PB 5I9EB 3ZSYA 4NCBA 4LF7K 5JICA 3NCIA 3THYB 3CYMA 4LY7A 2QWRA 4JI2K 3KTQA 3PX4A 3MXIA 3VQ6A 1X9WA 4M63C 1KLMA 1JLAA 3NH0A 4Z4IA 4FK4A 1VQ7N 4CFAA 1KSPA 4BDPA 4C1NI 4BGAA 3J8AA 4BREA 1K9MO 4G9ZA 1S1WA 4B9UA 4OPHA 4BDYA 2YNFA 2QI2A 2OTLN 2WOMA 4FWQA 3TAMA 1HKCA 1HNIA 3O4WA 1NGBA 4Z4CA 1N32K 3K57A 3GBTA 1BHLA 1E4GT 4KHUA 2P9LA 3T7ZA 3WQTA 4UY8O 1VSMA 2HVHA 1Q86O 3O6WA 2F9WA 4A2AA 1QSYA 3WXIA 3MN5A 5F2RA 4CGFA 4KPYA 1FXXA 1Q9YA 1VQ4N 4FVMA 1JLEA 3NVMA 2CGKA 4H0XB 4B9MA 3TSPA 4DMNA 1L5UA 2HNDA 4JNEA 4B9NA 3ZCMA 4BRCA 1GLFO 3ZX0A 2B4JA 3WEEA 1VQ5N 3ULDA 5BPLA 3Q7BA 1QSSA 2YJFA 1KAZA 3DYAA 2DPNA 1QQMA 1VQ8N 3U9DA 3VOVA 1U6ZA 2O8DA 4MDAA 1YVUA 3O1BA 1W9HA 2A41A 3F73A 4DLGA 1QVGM 3R3LA 1VQKN 1C1BA 2Q2RA 4RTFD 1BI4B 4FM1A 5EXWA 3K2PA 4CERA 3SPZA 4CJPA 4O44A 4DTRA 2P9SA 5C42A 3AO3A 3VQDA 1NKCA 4FZZA 3MMVA 1Q7YO 3CPWM 4V19S 2UXCK 3CF5L 4JI5K 4KAZA 4O5BA 1K6YA 4H5VA 4M3YA 2RF2A 3F9KA 3A5OC 4QCLA 1OH6A 4CZGA 4CEAA 5HROA 1WN7A 4FWOA 3THXA 3HYFA 3S3NA 3NMUA 3B6OA 3WUHA 4OKKA 1T05A 2PY5A 5AQXA 4WFNL 4FLYA 4B3MK 3CC7N 1T7PA 5AQVA 4I2PA 5CZ2A 4ELUA 1C6VA 1HJOA 3J7YP 2VQFK 2Q31A 2IAJA 4DSIA 3OVNA 3K5OA 3VEXA 2G8VA 4NO7A 2YHWA 2YX6A 5F0XA 2W42A 4PHTX 4IJNA 3BF1A 1RBSA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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