3EO3A

Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
312
structure length
288
Chain Sequence
TLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVPKDEAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Isomerase, transferase
molecule keywords Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylman
publication title Crystal structure of the N-acetylmannosamine kinase domain of GNE.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 288
sequence length 312
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2008-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eo3A02
2ASMA 3IFRA 3HBTA 1GLDG 2GWJA 4C23A 4A62A 5BRFA 1S3XA 3EZWA 3ATUA 4B1UB 3H1QA 1NGJA 5JICA 2GTDA 2E8AA 4YDUC 3O4WA 4FWQA 2ZF5O 3H1VX 2YHWA 2BUPA 2A42A 1NGCA 1SZ2A 3QFUA 3CJ9A 3GOIA 3HI0A 3VERA 4H5NA 1E4FT 1NGFA 2V7ZA 3RSEB 1E4GT 4H0TB 2BTFA 3C7NA 1YUWA 4JHDB 3H45C 1BA1A 3DJCA 4K25A 2ASOA 4FWRA 2NZTA 1NLVA 4XH5A 3BEXA 4I6MA 4PL8A 5AQXA 1YXQA 3SMPA 4YDUA 4BR4A 2ZGYA 5BPLA 4EHUA 4IJNA 3BUZB 3WUHA 4BR7A 4JD2B 4GNIA 3H3NO 3LDPA 2P9LB 3WXJA 5BN9A 2AP1A 3UKUB 2P9NB 2CGJA 5I9EB 2CGKA 4RWTA 4CZHA 3ENHA 3L0QA 4RCHA 5JLHA 3LDLA 3CQYA 2FF6A 5AQWA 3L4IA 3ID8A 5B8HA 2YJFA 1BWFO 4M7XA 3WXKA 3O1WA 1QZ6A 4QS9A 5FPDA 1NGAA 4CZLA 2YHYA 4A61A 2I7NA 3VF6A 5F1XA 4FWPA 2Q31A 3IDHA 5AQQA 1RFQA 4WQ4C 1TYQA 1ATRA 2DPNA 3AY9A 3VEZA 4CJ7A 5E26A 1C0FA 3R9PA 4IXCA 2QWRA 3M3ZA 4EAHD 1HKCA 3EO3A 5KPZA 5AQYA 4CZMA 2HF4A 2VYPA 4BC3A 4FSVA 3U9ZA 2H3GX 3SJHA 3DXMA 3VF4A 2Q2RA 4FO0A 5BPMA 2KHOA 3HM8A 1R59O 4DQ8A 1XUPO 4WQ4A 3VGLA 1GLJO 2V52B 2YHXA 4BRKA 1NGGA 4BR9A 1SAZA 3O08A 4J8FA 5FPNA 3AAQA 2PBDA 2QWOA 2P9SA 1GLFO 3I33A 2QWQA 5AFUA 3MN6A 5AQOA 5AZIB 4BRCA 2D4WA 1D4XA 3A5LC 3C7NB 1GLEG 4MLEA 2IVPA 3WXIA 1X3NA 1BDGA 3GG4A 2FLOA 3GL1A 4I6MB 5KPRA 4NB4A 2FXUA 2P9PA 3FR0A 2WUSA 5AQRA 2W41A 1G99A 3FZHA 4BVOA 2FF3B 2P9KB 3ATVA 2P9UA 4FWLA 2FSJA 3MMVA 3VEWA 4H0YB 1TUUA 4BR2A 5AQMA 2ITMA 3OHRA 4IJAA 4EFHA 3U4LA 1GLCG 4DHYA 1V4SA 4H0VB 3O80A 4A2AA 3LDQA 2CH6A 2YI1A 2E1YA 2QWPA 3ZEUA 1S22A 2QWLA 1NGDA 3QMLA 5ADXA 1XQSC 4H5VA 1QZ5A 4BRFA 4BR5A 4BC2A 4KBOA 1DKGD 3H3OB 3UKRA 3LL3A 3VEVA 3MDQA 3FE1A 2E88A 2P9IA 3ZX2A 4H5WA 4B9QA 4BR0A 3MN9A 4FL9A 3O6WA 5BRHA 4FOIA 2Q0RA 3VETA 4K41A 4H0OA 4JAXA 1NGBA 3L6QA 4NO7A 3CJBA 4CD1A 1KXPA 3G25A 2D0PA 4FWOA 4WQ5C 3ULEA 3D2EA 3M1FA 4PKGA 5EXWA 1K8KB 3B8AX 1HLUA 3S41A 4L3QA 4FPAA 3VENA 4RTFD 2I7PA 5AZJA 4Y0WA 3VEYA 3IMXA 1X3MA 3J8AA 3R6MA 1U2VA 4HWIA 3QB0A 2E2NA 1V4TA 4FWMA 4B1XB 5BR9A 3WEEB 2ZWHA 4BC5A 5FPMA 3A8YA 1P8ZA 3ZETA 1GLLO 2A41A 2QW9A 5AQKA 4QS8A 3U8XA 4CZKA 2VCPA 3WQTA 4WQ5A 3QICA 2A5XA 5ADXH 2EWSA 3W3DA 2E2QA 1RDWX 5EX5A 2Q36A 3EL2A 3MCPA 2P9UB 3HTVA 4CI6A 5LY3A 2GELA 2GEMA 1ZXOA 4JN4A 3DAWA 4EIAA 1NBWA 4AM6A 1HKBA 4Z94A 5KPTA 4BRAA 4BC4A 3MK6A 5BRDA 1X9JA 4CZJA 3QDKA 1HX1A 4QS7A 5AQUA 3RSEA 4FOEA 3A5OC 5F0XA 5KQ8A 3U9DA 2CGLA 3M6GA 3ZEUB 5BPNA 2W40A 1ZBSA 5AQIA 4XH1A 1GLBG 3VF2A 1BOTO 3ZX3A 4BVPA 1Z6RA 3SLCA 1YVNA 5LJWA 3D2FA 5BREA 4BRQA 3UKRB 4BQLA 2PAVA 4ISFA 2GWKA 1WUAA 2P9IB 2CH5A 3C0BA 5FPEA 2P9NA 3AAPA 3VEOA 4CD3A 4BRHA 1HPMA 3FFKB 1NGIA 3DXKA 3EKUA 4BRGA 1C0GA 5E84A 4LC9B 1KAZA 5ELZA 1CZAN 2YCHA 3I8BA 5EOYA 3TU5A 1JCGA 2E20A 2V51B 1T6CA 4H0XB 4BRNA 2J4RA 4BGAA 2FSKA 4B1WB 3D7EO 2A40A 1BU6O 5AR0A 4E1JA 1JCFA 4BRMA 4BRIA 3WT0A 1LCUA 1DGKN 2HF3A 5AZJB 2D0OA 4M7YA 5KQDA 3FLCO 3LDOA 1WOQA 4BG8A 1U2VB 5EVZA 3F9MA 3WXLA 3CIPA 4DB3A 4GY2B 4B1ZA 4MO5A 2QXLA 4FPBA 5BN8A 2ZGZA 4B1YB 3TPQA 4CBWA 1KAYA 2YJEA 2Q0UA 4FWKA 5JLFA 1TYQB 3VOVA 1SQKA 1T6DA 4BRLA 3LM2A 3JS6A 1U6ZA 3FGUA 3CI5A 3HSCA 3IUCA 4B1VA 3MN5A 1H1VA 2UYTA 1NGHA 3GE1A 3LM9A 4IO8A 5LJVA 5AQLA 4WYBA 3WQUA 3VPZA 5AFUH 1QQMA 3ENOA 3LDNA 1MA9B 1MWMA 1DEJA 4FWNA 3GDQA 3CJAA 5AQGA 3DXMB 2VWBA 1LOTB 5AZIA 1QHAA 5AQSA 3A5MC 3O5BA 3A0IX 4BGBA 2OANA 1KAXA 4XEIA 1HJOA 4F9OA 1Y64A 4AM7A 3H6EA 3VEXA 5AQFA 4H5RA 1BG3A 3KVGA 4PL7A 3GBTA 4XH4A 1TUYA 3CHWA 5TKYA 4CZGA 5JMVA 4A2BA 4H03B 2P9SB 4CZEA 3CJCA 3MN7A 3P4IA 2NRHA 3D2FB 2AA4A 4BREA 2P9KA 3BF1A 3JXUA 2NLXA 3UE5A 2HMPA 3CQXA 4CBUA 1EQYA 1GLAG 3CJ1A 2D1KA 4FWSA 1J6ZA 1QQOA 4K42A 4MLHA 3CERA 2E1ZA 3DXKB 4HTLA 4PKIA 2GUPA 2P9PB 4BQZA 1BA0A 1XC3A 3O8MA 2A3ZA 3QFPA 5AQVA 3ZX0A 3DWLA 2IVNA 5AQZA 2E2PA 4CZIA 4CZFA 3EKSA 3FZFA 3QBXA 4O5FA 3A5NC 2E2OA 4M63C 2F9TA 1HUXA 1ATNA 4ISEA 4BRDA 1NMDA 3VGKA 3FZKA 3SMSA 1NGEA 3BP8A 4JHDA 5CE3A 5AQTA 3H46O 3HZ6A 4O8KA 3AARA 2IVOA 1Q18A 5AQPA 4EHTA 2QM1A 4MO4A 5AQHA 4BROA 2A6AA 1OKJA 4JD2A 1JCEA 2Q97A 1T44A 2V7YA 3FZLA 2Q1NA 3VESA 2P9LA 1BUPA 3UKUA 3W0LA 4BG9A 2F9WA 3R8EA 1K8KA 5F2RA 1MWKA 1YAGA 1QQNA 3EN9A 4DCHA 3UB5A 2ASPA 4PKHA 4IWVA 4H5TA 1Z05A 4BRPA 1BO5O 3CETA 2QWNA 1ZC6A 4JNEA 3QBWA 1IJJA 2FSNA 4K43A 5AQNA 5EY4A 3ULEB 1HKGA 3CJ7A 3D2EB 3WEEA 2QWMA 3VGMA 2HOEA 1NM1A 1RGIA 4IZ9A 3KZBA 2IIRA 3FZMA 1ATSA 3BF3A 4H0PA 1MDUB 4ISGA 3SK3A 3O1BA 5AQJA 1NWKA 3KHYA 1ESVA 3ZETB 1IG8A 4CBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HBTA 3S9HA 1U4BA 1GOCA 4IKFA 4C23A 1VQMN 1BI4B 3ATUA 3C95A 2QK9A 4YDUC 4PQUA 3O4WA 4FWQA 5J2QA 1RTDA 2ZF5O 4DMNA 4IOCL 2YHWA 4ID1A 2A42A 2DFHA 4O8UA 3U3GA 4KHPK 1SZ2A 3QFUA 1HYVA 4H5NA 3HT3A 5LMNK 4R5PA 1UA1A 1CXQA 3MXMA 1GOAA 4CGGA 1E4GT 4CFCA 1VQKN 3DJCA 4K25A 3RWUA 1A5WA 4FWRA 1IG9A 4LFAK 4PL8A 5AQXA 4M3UA 1BQNA 3NF8A 4IDKA 4E7HA 3HP9A 4O4GA 1VQ4N 4IJNA 4BR7A 1NJYA 3C65A 1VQON 2HHTA 4AHSA 4Z4HA 2P9NB 5IT9O 3NGYA 4CEQA 4FM1A 1D9FA 3ENHA 1Q7YO 3CQYA 1IO2A 4IEIA 5B8HA 1BWFO 4CGFA 3P83D 1QZ6A 3HL8A 4CCHA 3KK1A 4WCEL 1BHLA 3SQ0A 3CF5L 4DLEA 4FWPA 2Q31A 4CW7B 1NNEA 3IDHA 5AQQA 2ZJQL 4CF2A 4G1QA 5E26A 3TARA 4YOYA 3AA3A 2DTUA 4CIFA 2ITGA 3SUQA 4A57A 1VSKA 3M3ZA 4IDHA 1RBSA 1JL1A 3T1HK 4M41A 4CJVA 2GBZA 4RW4A 1U04A 1RDAA 3THWB 2O8EB 1HRHA 4YOVA 3VGLA 2F8TA 4IOAL 1JL2A 4BRKA 1NGGA 3OYCA 2PYLA 4J8FA 4GW6A 1GLFO 1S1WA 3O3GA 1D4XA 3A5LC 3L8BA 4M3RA 2QXFA 3WXIA 3CC2N 5SWMA 4HUEA 3HJFA 3F5TA 1UAXA 4CFDA 2FLOA 4CEFA 3UIQA 4BACA 1LAWA 3ZCMA 4NB4A 1LW2A 1KTQA 2HHUA 1VSLA 4CK1A 2W41A 1G99A 3K5NA 1TKZA 3RRGA 4KI4A 3EY1A 3ATVA 5KGXA 2FSJA 4DR5K 4LF6K 4FK4A 2O8BA 5HRNA 4DQIA 4CIEA 3OHRA 3SQ4A 3V1QA 3U4LA 2JGUA 2FBXA 4A2AA 5M1QA 2YI1A 2IS3A 2ZD1A 3ZEUA 4YHHK 4CJ4A 5C10A 4JI3K 4H5VA 3WNEA 5TKWA 3I8DA 3KKRA 3H3OB 1JKHA 1N34K 4KI6A 1X9MA 1KC8O 3WXMB 4B9QA 3N4QA 1VQ8N 3MN9A 3PLAA 3G10A 3P38A 1LWFA 3WNFA 3O6WA 5BRHA 4FOIA 4E1MA 4XIUA 1Q8IA 1RTHA 1SS6A 1Y97A 4FLTA 4NO7A 3MEDA 1DLOA 4ELVA 3TABA 4IG0A 3BDPA 1TAQA 1XHXA 5HL7L 2BANA 3T19A 3M1FA 1K8KB 2NRRA 1HLUA 3B8AX 3DLLL 4E7IA 3CCMN 3DRSA 5AZJA 2I7PA 2G8VA 3HPGA 4WF9L 3IMXA 4M45A 2JWKA 3SAHA 1U2VA 1JXEA 1XMOK 4DFMA 1V4TA 3G71N 2X78A 2ZWHA 3E9LA 4BC5A 1HQEA 4QOZB 2A41A 4YOUA 3CCVN 1NJWA 1VRTA 4LY7A 3QICA 2BH1A 3MCPA 5C42A 3CFRA 3VQ5A 3HTVA 2OPQA 1ZXOA 4EIAA 4OGCA 5KPTA 3CCSN 4DKWA 4QS7A 4LSNA 3LZJA 1OH7A 5I3UA 5KQ8A 4N41A 2UU9K 1LW0A 5BPNA 3NDKA 3AV9A 5CR4A 3K59A 3CC4N 4KHNA 5LJWA 1YVNA 2HB5A 3DOLA 3QETA 4FJHA 1XNQK 4A59A 3IS9A 4CJSA 5C24A 1NKCA 3KD5E 3RR7A 2QA4N 5M1OA 1VSDA 2P9IB 3C0BA 3LALA 3VEOA 4BRHA 5LL6Z 4NLCA 1M1KO 1J5OA 4MDBA 4N76A 2FBYA 1VQNN 1Z25A 4FJ8A 5DM7L 5ELZA 1HNXK 4HCBA 4GVEA 4PUOA 4LF7K 1YTAA 2V51B 4OVLA 1RT4A 2NRXA 4H0XB 2OTJN 1VQ7N 4BGAA 1F21A 3V9SA 1JLBA 4OJRA 4AQYK 3WT0A 1LCUA 1DGKN 3VQBA 1NU0A 3J7AP 2UXDK 3FLCO 1WOQA 2IAJA 1EP4A 3ID6A 3CCRN 1XNRK 2D0CA 3CIPA 4DSEA 1VSIA 4FPBA 5BN8A 1ILYA 4B1YB 1I3AA 1KAYA 4JLHA 3CCQN 4PWDA 1RCHA 2P1JA 4BRLA 3LZIA 3JS6A 3L2VA 4RG8A 3HPOA 4ZTJA 2IOCA 2NRTA 4JKCA 1NGHA 4IO8A 4HCCA 3VA3A 3AA4A 3AVLA 5AFUH 4BWJA 1IBMK 3ENOA 2HVIA 4U7BA 2HHXA 3ZSWA 1WSJA 3CJAA 2HBLA 3DXMB 1HJRA 5FROA 1QHAA 4WE1A 1KLMA 4DSJA 4C8LA 2HSTA 5CZ1A 1Y64A 3H6EA 5AQFA 3TAGA 1BG3A 3QNOA 2F4VK 2IC3A 4ID5A 2P9SB 4FJ7A 4CZEA 4CJRA 3KK2A 3CJCA 2X6SA 3P4IA 3D2FB 4DR4K 4FJMA 4ELUA 4DR3K 1QSLA 4C1NI 3NH2A 3OYIA 4Z0UA 3V6DA 4HTLA 1EWRA 2O8DB 2P9PB 5E41A 3KWIA 1T03A 1D5AA 3SBGA 4BE1A 5AQVA 3DWLA 2E2PA 3AVKA 3OYEA 1KQSM 3OBWA 1C1AA 4M63C 1X9SA 4FXDA 1RDUA 1G15A 3E66A 2RF2A 4LH4A 4FLVA 2Z1IA 4ICLA 1NJXA 3K0SA 4W5QA 3RMCA 4C8MA 3H46O 3HZ6A 5CY4A 2VGMA 2WONA 3LPUA 3O4NA 5AQPA 2QM1A 4MO4A 4BROA 4PY5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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