3AARA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila in complex with amppnp
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
352
structure length
352
Chain Sequence
HSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
source organism Legionella pneumophila
molecule tags Hydrolase
total genus 111
structure length 352
sequence length 352
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aarA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aarA02
1P8ZA 4BRFA 3AARA 2A40A 1SQKA 2Q0UA 3DJCA 4B9QA 1X3MA 1NLVA 2YJFA 4H0TB 4CZHA 3VENA 2F9TA 2IVNA 3QFPA 2QWLA 4EHUA 1XQSC 2E20A 2FF3B 3H45C 3ZEUB 2E88A 1SAZA 2P9IB 4MO5A 3DWLA 5BPLA 5E84A 3BUZB 2ASMA 1NGGA 4M7YA 1NWKA 4E1JA 3QICA 4Z94A 2EWSA 4FWMA 4DB3A 1D4XA 3ENOA 3G25A 3MN9A 2I7PA 4A62A 4BRAA 3ZX3A 3DXKB 3ZX0A 3SK3A 4BC2A 5ADXA 4FWPA 3O4WA 4M7XA 1K8KA 3EKUA 3CJBA 4MLEA 4BR9A 1KXPA 1NGIA 3FFKB 1T6CA 2PBDA 4BR2A 1HX1A 2CGJA 3CETA 3UKUA 1U2VA 1T6DA 3VEOA 5LJVA 2E2QA 2P9UA 3O8MA 3ATVA 1X3NA 3DXMA 4K42A 4CZEA 2FSJA 3CJ7A 3RSEB 2QWOA 3LM2A 2HOEA 2YHXA 4XEIA 4PKIA 3ZEUA 2BTFA 2VYPA 1MWKA 4IJAA 1NGHA 3EZWA 5AQLA 4CD1A 4HTLA 1GLBG 1WUAA 2KHOA 4Y0WA 3CHWA 3WQTA 2NRHA 3A5OC 1HPMA 4BC5A 4CZLA 1LCUA 1NGEA 2A6AA 5AQKA 3GOIA 3H6EA 3LDNA 3EL2A 3CQXA 5AQRA 4FWSA 1YAGA 2W41A 1NBWA 4O5FA 2D1KA 4BR7A 5F0XA 1BA1A 2CH5A 4JHDA 2GTDA 3IMXA 2E2NA 5AQUA 4BG8A 4BQZA 3GBTA 4K43A 1ATSA 5LJWA 1ATRA 3A5LC 1QQMA 4EHTA 1GLDG 2ASOA 4WYBA 3VF4A 4RTFD 5AZIA 5AQMA 4BVPA 5KQDA 3WQUA 2D0PA 1BWFO 1GLJO 2P9SA 2FSKA 2IVPA 3CERA 4L3QA 5F2RA 4CZIA 4CZFA 3I8BA 4GNIA 3FZHA 2Q0RA 4JAXA 3R6MA 3A5MC 5AQJA 3VETA 2P9LA 4QS7A 4F9OA 1RFQA 3EKSA 3CJ1A 5EY4A 2FSNA 4BRQA 4BRIA 1K8KB 2Q2RA 3FR0A 2A3ZA 4H0YB 2QWMA 4XH5A 1SZ2A 1QZ6A 5AQGA 1YVNA 1R59O 1NGDA 3UKUB 1U2VB 3SMPA 3ULEA 3W0LA 1NM1A 1HKCA 2P9UB 1C0GA 2W40A 4NB4A 3UE5A 3BF1A 3QDKA 2QWPA 5BN9A 3DXMB 3AAQA 5AQVA 2OANA 3P4IA 4BREA 1DEJA 2PAVA 3CJ9A 3UKRA 1S22A 3GG4A 1V4TA 4H5NA 3A5NC 5TKYA 2GWKA 5KPZA 2D4WA 3VEWA 2IVOA 5BRDA 1GLLO 3CIPA 3VERA 2Q31A 4DQ8A 3IDHA 4CI6A 4BRLA 2V52B 1NGJA 3H3NO 3D7EO 3LDQA 5KPRA 5EOYA 4BRHA 4FWLA 3O6WA 3VESA 4XH1A 3ATUA 4FSVA 1BUPA 3LM9A 2YHWA 3FLCO 3IUCA 5AQNA 4JHDB 2E2PA 3W3DA 1X9JA 1BU6O 3R9PA 5AR0A 3EO3A 3UB5A 2HF4A 4WQ4A 1NGBA 1Z6RA 3ENHA 4BR5A 5ADXH 2H3GX 3J8AA 1G99A 4RWTA 4FWKA 5AZIB 4JD2A 4IJNA 3FZKA 1GLEG 4H5VA 3LL3A 3VEYA 1E4FT 2P9SB 4BC3A 1NGAA 2F9WA 5FPMA 4FPAA 5AQOA 3FZMA 3BP8A 4EFHA 1ESVA 3A0IX 3MN5A 3TU5A 2IIRA 2J4RA 1TUYA 4DHYA 1HJOA 2E2OA 3WXLA 3FZLA 3VEZA 4BR0A 2P9LB 3F9MA 2GELA 4YDUA 1LOTB 1IG8A 3SLCA 5BR9A 1ATNA 2P9KA 5AQZA 4C23A 4A2BA 3OHRA 1ZBSA 1XC3A 2YJEA 4EAHD 1J6ZA 1GLFO 4DCHA 2WUSA 4H0VB 4WQ5A 4CZJA 3CI5A 3H46O 3O1BA 3MN7A 4HWIA 3ULEB 4CZMA 1JCGA 4B1WB 5AFUA 2QWNA 3O1WA 2YCHA 1YUWA 1V4SA 3D2FA 4XH4A 2CGLA 3UKRB 3HTVA 4FWNA 4H03B 2P9PA 4H5RA 3HSCA 5EVZA 4FWOA 4CBXA 2QXLA 4K41A 1NMDA 3GE1A 2ZF5O 4H0OA 3SMSA 4I6MA 4MLHA 2E1ZA 3LDLA 5EX5A 2YI1A 5EXWA 1OKJA 1RGIA 2GWJA 4KBOA 1QZ5A 2A5XA 1QHAA 4BR4A 1HLUA 5FPNA 1XUPO 4CZKA 3C7NA 3GL1A 2CH6A 1Q18A 2Q1NA 2FLOA 2ZGZA 2ZGYA 3WEEA 4FOIA 3WUHA 3ZX2A 4NO7A 1TYQA 3U9DA 2Q97A 1TUUA 4FWQA 4LC9B 3M3ZA 4QS9A 3QB0A 3QFUA 5JICA 1JCEA 3HZ6A 2HF3A 4ISGA 2ZWHA 5KQ8A 3JS6A 5AQQA 3QMLA 3WXIA 1GLCG 4JD2B 3H1QA 3MMVA 5BRFA 4BGAA 4CJ7A 3HBTA 5AQSA 1NGFA 5BN8A 2E8AA 4O8KA 3GDQA 4BRMA 4B1UB 1KAZA 1MDUB 4AM6A 2I7NA 5F1XA 1ZC6A 2P9NA 3CJCA 2CGKA 5AZJA 4MO4A 3FZFA 5JLHA 2V51B 5FPEA 4A2AA 3MDQA 2P9KB 3B8AX 3DAWA 3KVGA 3MCPA 1DKGD 3VEXA 5BREA 2GEMA 4WQ4C 3CJAA 4CD3A 3A8YA 3HI0A 2AP1A 3C0BA 3VGMA 3FGUA 4BRCA 3M6GA 1GLAG 3QBWA 5BPNA 2UYTA 1BG3A 4B1VA 4JN4A 4PL8A 3L0QA 3H1VX 2NZTA 4BC4A 4FOEA 3I33A 3VGLA 1H1VA 3D2FB 3S41A 3U8XA 3JXUA 4BRNA 1KAYA 3U9ZA 2Q36A 3FE1A 4M63C 4H0XB 4H0PA 2P9PB 4IO8A 5AQYA 2E1YA 3VPZA 3VGKA 2D0OA 3D2EA 3WT0A 5B8HA 1U6ZA 5E26A 4B1XB 3VF2A 1HKGA 1RDWX 1HUXA 3L6QA 4YDUC 2A42A 4FWRA 4I6MB 2V7ZA 4H5TA 4PKGA 2QW9A 4WQ5C 5LY3A 3C7NB 4BG9A 1MA9B 2HMPA 3KZBA 3O5BA 4H5WA 4IXCA 3WXKA 3TPQA 4CBWA 1E4GT 4A61A 3WEEB 4BRKA 3H3OB 2P9IA 3O08A 1TYQB 4BRPA 2DPNA 2ITMA 3ZETB 4B1YB 4CBUA 5ELZA 1CZAN 5BPMA 2AA4A 4J8FA 5FPDA 4FL9A 4FO0A 1QQNA 1Z05A 3U4LA 3BEXA 3EN9A 3KHYA 4RCHA 3VF6A 1QQOA 1EQYA 3ID8A 3DXKA 4EIAA 5KPTA 1BDGA 4IWVA 4PL7A 4PKHA 1C0FA 2BUPA 3M1FA 1DGKN 5JMVA 1Y64A 3CQYA 4JNEA 5JLFA 1WOQA 4BRGA 2GUPA 5AFUH 3LDPA 1BA0A 3L4IA 4K25A 2P9NB 5AZJB 4CZGA 1JCFA 3WXJA 2YHYA 2NLXA 4BQLA 3O80A 4GY2B 3LDOA 3RSEA 1IJJA 4B1ZA 3AAPA 3MN6A 1KAXA 2VCPA 2FXUA 3VEVA 5CE3A 5AQIA 5AQXA 3MK6A 1YXQA 3ZETA 1HKBA 3VOVA 3IFRA 3R8EA 1S3XA 4BGBA 5BRHA 1BOTO 1MWMA 5AQHA 1NGCA 4QS8A 3HM8A 2V7YA 1BO5O 4FPBA 5AQWA 5AQPA 2QWQA 2QWRA 5I9EB 3SJHA 3AY9A 2VWBA 2FF6A 4ISFA 2QM1A 4IZ9A 3BF3A 3QBXA 2A41A 4ISEA 5AQTA 3D2EB 1T44A 4BVOA 4AM7A 1ZXOA 5AQFA 4BROA 4BRDA 2ASPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y1IA 4KV8A 3LWMA 2A40A 4YOYA 1NLVA 3E9LA 5GINA 5BR8K 3PX6A 3VQAA 4NLBA 3G71N 5FROA 1RNHA 2ETJA 3G6EN 1X9MA 1BHLA 3NGZA 2QWLA 1XQSC 3MEEA 3K58A 3KLFA 2JWKA 2RF2A 3CPWM 1NKCA 4M7YA 1N36K 1RBRA 2DFHA 1W7AA 3QICA 3TAQA 3SAGA 1D4XA 3OYCA 4A62A 3MN9A 3G0ZA 3ZX3A 3DXKB 1JL1A 5ADXA 4FWPA 4JI2K 4M7XA 1K8KA 3AVBA 3EKUA 4JRPA 2WTUA 3NFAA 3O3FA 4BR9A 1KXPA 1NGIA 4CGDA 2VQFK 1U2VA 5LJVA 1VQLN 4IFVA 2P9UA 3M5RA 1LW2A 3ATVA 3UIQA 4OPHA 1VRTA 2GV9A 1MU2A 3G10A 4CZEA 3LP0A 4BDZA 3RSEB 2QWOA 4AQYK 1HQEA 2BTFA 2VYPA 2O4GA 1MWKA 2E6MA 1NGHA 2YX6A 1GLBG 4KO0A 1BI4A 4BC5A 1HPMA 1LCUA 2O8BB 1WSEA 2A6AA 5KGWA 3H6EA 3EL2A 1X1PA 4DTJA 2GUIA 3NH1A 3OYEA 3KJVA 2W41A 1NBWA 1W2BM 3J7AP 1NU0A 3L4QA 2CH5A 3JAMO 1VQNN 3THXA 1D5AA 3JSMA 4CJTA 3HK2A 1L3SA 3KD5E 3BZCA 4CGHA 1JLQA 4EHTA 1HNIA 2ZJRL 4W5RA 3VF4A 5AQMA 4BVPA 5KQDA 2D0PA 4CHYA 3CERA 1SL1A 4J2DA 3AA5X 4FJJA 1KFSA 3P83D 2JLEA 3I8BA 4IG0A 2W6KA 3T3FA 3R6MA 3PY8A 3KIOA 3TAPA 4C1NK 4IEEA 5SZTA 4BE0A 2O8EB 1JLEA 3N4QA 4GKJK 1LWCA 3HOSA 3P38A 4I9QA 1WAFA 4YORA 2OTJN 5HRRA 1NGDA 4MFBA 5KGXA 3W0LA 1TKDA 1C0GA 4DSEA 2HBKA 1NJIO 1W97L 2XY5A 3UKRA 4HTUA 3KKSA 4BWJA 4W5OA 1J5EK 2F7TA 4NXMK 4B9NA 2GWKA 1I94K 3CC2N 1K73O 4M42A 3VEWA 2IVOA 3HPHA 4DQ8A 3C65A 3MX5A 4CEZA 4CHPA 4KFBA 2HW3A 1BIZA 1NGJA 3TABA 2O8CA 5J1EA 4FWLA 1BGXT 2IGIA 3TTCA 3AO2A 1LAVA 3FLCO 4YNQA 4Z4IA 3CMAN 5AR0A 4K8ZA 3VQCA 3PX0A 3UB5A 4M3TA 1CLQA 3EZ5A 1IG9A 1NGBA 1SKSA 1N32K 3C94A 3OS2A 4KHYA 1G99A 5AZIB 2ATQA 4DTOA 1VQPN 4IJNA 3O9SA 4DV7K 1J54A 4H5VA 3LL3A 2VG7A 2QI2A 3AVHA 1NGAA 2F9WA 4JKFA 1I3AA 5AQOA 4EFHA 2Z1GA 3OYMA 2PYJA 2E2OA 4BR0A 2OYQA 2B6AA 2HHUA 2YHBA 1JLBA 5J2NA 1K9MO 3K5OA 4C23A 3QIPA 1JLFA 4DTRA 1XC3A 2EHGA 4EAHD 3NDKA 2BANA 5H1SQ 4QOZB 1IKXA 5CYQA 3AA4A 3MN7A 3ULEB 4IO9L 1S5JA 1IV0A 5AFUA 2QWNA 1T3VA 1EWRA 2YCHA 1YTUA 1NKBA 3THWB 3NVMA 4BWMA 3MAQA 3SAFA 4H03B 4FWOA 4FLZA 4CBXA 2KZMA 1VQ9N 3RR8A 3JYTA 4FJ8A 2NRTA 2ZF5O 3SMSA 3KLIA 1IKYA 4I6MA 3LDLA 5M1KA 5EXWA 5TKWA 1S1XA 4KBOA 4C1NI 3OJUA 2D0AA 5GIPA 1XWLA 4BR4A 4CEFA 3KK2A 3C7NA 3MX2A 4CIGA 3DLBA 4A5BA 1QSSA 2Q1NA 4AHSA 4FOIA 3AVKA 2OPSA 4U7BA 3M3ZA 2HHQA 4QS9A 3QB0A 4YOWA 2HF3A 4ISGA 4V19S 2KTQA 3S9HA 4JYAK 2RKIA 4OKKA 4J2BA 2WC9A 3HYFA 4CJ4A 2FBVA 1GLCG 3H1QA 3LZIA 5BRFA 1NG9A 4B9LA 4B08A 4CJ7A 3PIPL 3HBTA 1LAWA 1NGFA 5BN8A 3T1HK 4O8KA 1XMOK 4BRMA 4CVNE 4FLWA 1HJRA 3E9OA 3CJCA 1B92A 4RW8A 5AZJA 1TKTA 2DY4A 4Y1CA 2QKKA 2HHWA 1RT7A 3FZFA 1WSGA 1UAXA 3ULDA 2V51B 5FPEA 2O8FA 4A2AA 4BDYA 3P1GA 4GV9A 4L8RB 2P9KB 4OKEA 3V4IA 2UXDK 4WQ4C 4FJIA 1FJGK 3CJAA 3HI0A 4BRCA 5BPNA 1RT5A 2YKMA 1QVGM 4FLVA 4PL8A 3ZT1A 5GAGP 2NZTA 4DV3K 3L2UA 1NJYA 2OPPA 3S41A 3RMBA 4IG3A 4BRNA 4FJMA 2NRWA 4M3XA 4H0PA 3TSPA 3DMJA 2E1YA 3HM9A 1ZBFA 2ZJQL 2KQ2A 5E41A 3RVCA 1Y97A 1HNZK 5LMUK 3RRHA 5C12A 4H5TA 1IBLK 3PX4A 4WQ5C 4LSLA 4YHHK 1MA9B 4H5WA 2HVHA 4M41A 4JLHA 4A61A 3WEEB 4BRKA 3NGIA 3CC7N 3O08A 1NJWA 4BRPA 3MECA 4B1YB 5ELZA 4JI8K 3I55N 5DM6L 1N6QA 1Z05A 4CJVA 3VF6A 4RCHA 1QQOA 2I5JA 1RCHA 3BDPA 3V1OA 3DXKA 1XNQK 1FW6A 5KPTA 1BDGA 2YV0X 4IWVA 4CESA 3M1FA 1VK0A 4Z4CA 3IS9A 2UXBK 5JLFA 4LH4A 3NBPA 3CCLN 3J81O 1ASWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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