2A42A

Actin-dnase i complex
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 123
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a42A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a42A04
2E8AA 4CBWA 2VCPA 3A5LC 1OKJA 4CZLA 4CZGA 1V4SA 3I8BA 4EAHD 5EXWA 1H1VA 5FPEA 3WXIA 4XH1A 4BROA 3LDOA 1U2VB 2YCHA 4KBOA 3ULEB 3A5MC 3UKUA 4BRGA 1Z6RA 4BR7A 4BC3A 3U4LA 4HTLA 1LCUA 1NGFA 5AQOA 4A62A 2D0PA 4BQZA 5BN8A 2AA4A 4JD2B 2FF6A 5AQIA 5LJVA 5AQYA 3VOVA 4M7XA 2PAVA 2FSKA 3MMVA 4ISEA 2CGJA 1MWKA 2QWPA 5F2RA 2V52B 5EOYA 5BR9A 3FFKB 1V4TA 2E20A 4K25A 4CZFA 4O5FA 3ZX3A 1DGKN 1XQSC 3KHYA 3SLCA 1ATRA 3D2FA 2I7PA 1ZBSA 3IDHA 4YDUC 5AQWA 2P9KB 5KQDA 3UE5A 3VETA 1MDUB 3FGUA 2YJFA 4BRDA 2FLOA 3FZLA 4IJNA 4FWQA 5F0XA 3UKRB 2BTFA 3L4IA 1ATNA 4IO8A 4BRIA 4HWIA 4CZHA 3VEYA 3HZ6A 4M63C 1BOTO 2W41A 3B8AX 4J8FA 2E1YA 3H1QA 2NZTA 1LOTB 2CGLA 4WQ5A 4GY2B 3VENA 5AQMA 4XEIA 2E1ZA 1IG8A 1QQMA 2IIRA 3CJ9A 4RWTA 5AQPA 2FSNA 2P9UB 3HBTA 3JXUA 2ASMA 3QFPA 4H5RA 3VEVA 1YXQA 1KXPA 1BU6O 3P4IA 1HKGA 4BRQA 3WQUA 4BRNA 3SK3A 4BREA 4Y0WA 2D1KA 2E88A 4H03B 5AQRA 5AZIA 1D4XA 3EKUA 5AQUA 1RFQA 3WUHA 1QZ6A 3CI5A 1Z05A 3VEOA 1NBWA 1YAGA 2E2OA 3FR0A 3H6EA 3A8YA 4EFHA 5B8HA 2ZWHA 4BC4A 2F9TA 5BPLA 2H3GX 4H5NA 1JCEA 1KAXA 4FWSA 4JHDB 1NGCA 2FF3B 4A61A 3DXKB 4FWOA 2GWKA 3BF3A 5AQSA 5BPMA 4BR5A 1QQNA 2NRHA 1GLFO 4H0XB 5AQTA 3ENOA 5KPTA 2E2NA 3DWLA 2IVNA 3GDQA 4H5TA 1TUUA 3SMSA 5F1XA 4BR4A 4F9OA 3DXMB 4PL8A 4GNIA 3LDQA 1GLBG 2HMPA 4B1VA 2FSJA 2QW9A 3KZBA 5FPNA 5AZJA 1NGIA 2P9LA 4RTFD 3MN6A 3EZWA 3O80A 3QBXA 3O1BA 4YDUA 2A41A 2KHOA 3D7EO 3HTVA 4I6MB 3AAPA 1TYQA 3IUCA 1KAZA 2GUPA 4RCHA 3DJCA 4XH5A 3FZKA 2P9SA 3QMLA 1HLUA 3U9DA 1G99A 4WYBA 1S22A 2Q0RA 4DQ8A 1GLCG 3ZEUB 2E2PA 3D2EA 3ZX2A 3L0QA 1NGEA 4BRCA 4FPAA 2UYTA 2HF4A 1BDGA 4BG8A 1HKCA 3VGKA 2YHYA 1WOQA 2GWJA 1E4FT 2QWOA 1MA9B 4BC2A 1BA0A 3FZHA 3JS6A 5AQFA 1YVNA 3GBTA 3LL3A 4QS7A 4A2BA 3QBWA 3VF2A 1YUWA 4IXCA 2ITMA 1GLAG 1J6ZA 4PL7A 3VF4A 1SZ2A 3VPZA 2P9NB 4DCHA 3SMPA 2A3ZA 2P9PB 3G25A 1QQOA 3I33A 3VERA 4H0TB 5JMVA 4A2AA 5E84A 3A5NC 2A42A 5BRFA 1XC3A 1GLJO 3WQTA 4PKGA 2YHWA 3O6WA 1X9JA 3M3ZA 1K8KA 3WXLA 1GLLO 4H5VA 5BRHA 5LJWA 4BR0A 2QWLA 4CZIA 3BUZB 3MCPA 4B1ZA 3FE1A 4BRPA 3HSCA 4H5WA 1X3NA 1JCFA 3VGMA 4CZEA 2P9IB 3ZETB 2CH5A 2YI1A 4BR2A 2A40A 2WUSA 3WEEA 3VF6A 3WT0A 1R59O 3M1FA 1NGGA 1Q18A 4ISGA 2QWMA 3R8EA 3C7NA 1QZ5A 3EKSA 2IVPA 4NB4A 1NGBA 4EIAA 3GG4A 3O1WA 1RDWX 3RSEA 3R9PA 2NLXA 5KPRA 5ADXH 1X3MA 1HX1A 3UKUB 5AFUH 3CIPA 3VGLA 3U8XA 3MK6A 1GLEG 3UB5A 4FWLA 2Q1NA 3CHWA 1NGDA 2ZF5O 4FPBA 3ZX0A 3GOIA 3CQYA 4CJ7A 3O4WA 2ASPA 4CD3A 2Q0UA 1ATSA 4QS8A 2W40A 2BUPA 3AAQA 2V7ZA 3O08A 1U2VA 3D2FB 3ULEA 2QWNA 4MO5A 4XH4A 2EWSA 4BR9A 3EN9A 4JNEA 3QICA 2AP1A 1BUPA 3VEWA 5AQVA 3EO3A 4JD2A 3A5OC 1NLVA 5JLHA 3A0IX 4FWMA 3VEZA 4C23A 3FLCO 4AM7A 4BG9A 3TU5A 2Q2RA 3ID8A 4H0YB 1SAZA 4H0VB 4FL9A 4FSVA 2HF3A 2PBDA 1MWMA 3WXKA 1NGAA 5I9EB 3VEXA 2Q36A 1KAYA 4IJAA 4PKHA 2P9KA 1JCGA 3CETA 3DAWA 1TUYA 3CJCA 4WQ4C 3UKRA 1HJOA 1S3XA 1C0GA 3LDNA 2CH6A 5AZIB 5BRDA 4E1JA 2ASOA 5TKYA 2D0OA 1NMDA 3GL1A 2Q97A 3VESA 2Q31A 1HKBA 4BRLA 4BC5A 4ISFA 3SJHA 4MO4A 1C0FA 4JAXA 5E26A 5BN9A 1IJJA 2P9UA 4B1YB 1DEJA 2V51B 1HPMA 2E2QA 4CI6A 4BRAA 1T6CA 4Z94A 1T6DA 3CJBA 2VYPA 4FOEA 2CGKA 2FXUA 3MN5A 3EL2A 2A5XA 2HOEA 4FWRA 3LM2A 5AQQA 3O5BA 2QXLA 4FWNA 1T44A 3S41A 4CD1A 3QFUA 5EY4A 5KQ8A 5AZJB 3ATUA 4K42A 4AM6A 4JHDA 3LDPA 2P9LB 3DXKA 3F9MA 4EHTA 1BWFO 3QB0A 4PKIA 4BQLA 5AQZA 2GELA 1P8ZA 1HUXA 4BRMA 1NGJA 3HI0A 3KVGA 3MN7A 1TYQB 4B1UB 4NO7A 3DXMA 4CBXA 3IFRA 2P9SB 4BRHA 1BG3A 3FZFA 4EHUA 2IVOA 4IZ9A 5AQKA 5AQLA 4B9QA 3J8AA 2QWRA 4BRKA 2A6AA 2V7YA 3D2EB 3O8MA 4DHYA 1QHAA 2D4WA 4M7YA 2YJEA 4K41A 5JICA 3WXJA 1Y64A 1WUAA 5EX5A 4I6MA 5AQXA 3CJ7A 5AQJA 4JN4A 2ZGYA 4MLEA 2I7NA 1EQYA 1BO5O 3ENHA 4WQ4A 3GE1A 3MDQA 4BGBA 3CJ1A 3MN9A 4FWKA 2GTDA 5AQNA 3ZEUA 2GEMA 4CZJA 3M6GA 1ESVA 3LM9A 4B1XB 5AQGA 4H0OA 5CE3A 5AQHA 3AARA 3C0BA 1XUPO 4B1WB 3H45C 3QDKA 3IMXA 2YHXA 3ATVA 3AY9A 3HM8A 4L3QA 1K8KB 2DPNA 1RGIA 3U9ZA 5ADXA 4QS9A 5AFUA 4IWVA 5FPDA 4CZMA 1DKGD 3BF1A 1SQKA 3H1VX 4BRFA 1NWKA 3BEXA 4BVPA 2ZGZA 3H3NO 3TPQA 1ZC6A 2P9NA 2VWBA 2P9PA 3LDLA 3CQXA 3BP8A 5FPMA 4H0PA 3L6QA 4BGAA 4WQ5C 3WEEB 2OANA 3FZMA 4FWPA 4LC9B 5BPNA 1NGHA 5KPZA 1GLDG 1CZAN 2QWQA 3C7NB 4CBUA 2QM1A 2F9WA 5BREA 3R6MA 1U6ZA 1ZXOA 4MLHA 5EVZA 3RSEB 3CERA 4K43A 5AR0A 3OHRA 5LY3A 5JLFA 1NM1A 4DB3A 2P9IA 5ELZA 3W0LA 1BA1A 3W3DA 3ZETA 1E4GT 3CJAA 4FO0A 4CZKA 3H3OB 4O8KA 4BVOA 3H46O 4FOIA 2J4RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZGA 5DK5A 3WXIA 4JKBA 4CF8A 3KD5E 1U2VB 1J54A 3A5MC 4WF9L 4BR7A 3QIPA 2XO7A 4YOTA 1B9FA 4HTLA 4A62A 1NGFA 4BQZA 1RDBA 5FROA 2FF6A 4OKKA 5AQIA 4M7XA 1N8RO 4KV8A 3O9QA 4KTWA 3VQQA 5F2RA 4CGHA 4CZFA 4O5FA 3PSFA 2YHBA 3QEXA 4FM1A 2GBZA 3WNGA 3SLCA 4DG1A 1ZBSA 3K9KA 1S1XA 4R5PA 4CK2A 3BGRA 2FLOA 3FZLA 3MX2A 4IJNA 2HVHA 4E7KA 3CCLN 3K9JA 2UXDK 2VG6A 3HYFA 5C2DA 4LFAK 1ATNA 5EU7A 4YOXA 1LW2A 3HVTA 3A2FA 3VEYA 3VQ8A 1WB9A 4M63C 1BOTO 3B8AX 1YHQN 1LOTB 4WQ5A 1TL3A 4GY2B 3VENA 4XEIA 2E1ZA 3CJ9A 5AQPA 1VHXA 2F96A 2P9UB 3JSMA 1VRTA 1QVFM 4IOAL 3L2UA 1YXQA 3P4IA 2F8TA 1D4XA 4CF2A 1Q9XA 1N33K 4E72A 4OO1J 4ILJA 3WUHA 3HPHA 3IAYA 1YAGA 3PX6A 5LMUK 3FR0A 4KI6A 2BGGA 2F9TA 3DLRA 5C10A 4OPAA 4PA1A 3CC4N 4C8MA 1UA0A 3VQDA 3SAFA 2W6LA 3HPOA 4FWOA 3D45A 1WBDA 1QQNA 1YJWN 2NRHA 1GLFO 1EWQA 2EHGA 3ENOA 1YVUA 2X78A 3GDQA 3HM9A 3QLHA 4TSXA 4GNIA 1GLBG 2HMPA 3TTFA 1J9AA 3AVLA 3TSQA 1WSFA 3J80O 4YOUA 3SPZA 4E3SA 2BH1A 2HBKA 3KK3A 1BIZA 3MN6A 4CF9A 4B9UA 4DTNA 3SAGA 1EETA 1RT3A 1VK0A 4GW6A 3TAGA 1K73O 4CGFA 4YDUA 1IO2A 2HMIA 3AAPA 1TYQA 3IUCA 2HB5A 3DJCA 3V1OA 3CYGA 3T69A 3U3GA 1NU0A 3O3FA 4QCLA 2Q0RA 3D0PA 3TR8A 1GLCG 1Q82O 2B6AA 2YKNA 1RT6A 4A5AA 4FPAA 3J7AP 4DR1K 5C12A 4L8RB 3B6OA 4M3UA 1KLMA 5KGXA 2YHYA 4CHYA 5CZ1A 4E19A 1MA9B 1VSIA 1BA0A 2YNHA 1YVNA 4CGGA 4CFAA 4C8NA 3CG7A 3QBWA 4YY3K 3B6PA 3CFOA 2ITGA 3VF2A 4CHOA 4E7HA 4W5NA 3U3YA 2ITMA 1J6ZA 3H08A 3O9SA 3PO5A 3PIOL 4N76A 2P9NB 4JK9A 3NF9A 2A3ZA 2P9PB 3VERA 3I33A 3I8DA 5JMVA 1TKXA 4A2AA 4Z0UA 3A5NC 1TKTA 4CHNA 2OPPA 2D0AA 3WQTA 5CR4A 1GOBA 5JS2A 4O0JA 1HJRA 4OLBA 4KPYA 3Q7BA 3AO4A 3LWLA 3BUZB 3MCPA 4I9QA 4RW8A 3THWA 1X3NA 3M5RA 3WNHA 3ISNC 4ICLA 2W42A 4YNQA 4PUOA 2F7TA 4CJWA 3THYA 2WUSA 3WEEA 3VF6A 4E89A 4DV3K 4ISGA 4E7LA 2YNGA 3R8EA 4IFVA 3AA4A 3SUOA 3C7NA 1QZ5A 2NUBA 4Z4CA 4YHHK 5CYMA 4NB4A 4M42A 3OBWA 2NLXA 2KFNA 1HX1A 3CIPA 3E9LA 3VGLA 2F8SA 2HSTA 2HHWA 3WXMB 1U4BA 3DI6A 4DTSA 2LSNA 3GOIA 5C25A 2B4JA 3MXJA 2ZQBA 2ASPA 5M1OA 3OYCA 2W40A 4BDZA 2BUPA 3KTQA 4YFUA 4F3OA 3TTCA 4KFBA 1U2VA 3D2FB 3THVA 3OYGA 3EN9A 3ZSVA 4JI6K 1RBTA 3S3MA 3C94A 1FKOA 3A0IX 4R79A 3CCVN 2Q2RA 1T05A 3HSTB 3QERA 4FL9A 3I55N 4WE1A 2HF3A 2FBTA 1RDDA 3VTHA 4DFMA 1N34K 4YOYA 2NRTA 4IJAA 4PKHA 4BY9C 1JCGA 2QXFA 4DTPA 1FK9A 2HHTA 5M1NA 4X65K 3AGKA 1ASVA 2IAJA 2Z1HA 1NMNA 2YNIA 5AZIB 2HBMA 3MWPA 5KI6A 3V1QA 5TKYA 4KB1A 3QNOA 3CXCM 3CCJN 3GL1A 2Q97A 1J5EK 2XY8A 1RTDA 4BWMA 1C6VA 1HKBA 1C0MA 2HHUA 4JAXA 2P9UA 3ID6A 4CHPA 4FW1A 3CJBA 4ELTA 4FOEA 3MN5A 3EL2A 4RW7A 2HOEA 2FBXA 4LF8K 3LM2A 1TK0A 3O5BA 1CZ9A 5HRSA 4XJXA 3N4PA 4CD1A 3QFUA 5KQ8A 5AZJB 4OGCA 4KREA 4RG8A 1HQEA 1BWFO 3DYAA 5AQZA 3CPEA 1DLOA 2KQ2A 4JI0K 4DSEA 2GELA 2VG5A 4BRMA 3KVGA 3MN7A 3IFRA 2OTJN 4BRHA 3Q7CA 2IVOA 4JK8A 5I42A 2ATQA 4JKCA 4B9QA 5AJ3K 2QWRA 5J1EA 4FLXA 4DHYA 1TKZA 2OZMA 1VRUA 2D4WA 4M7YA 2YJEA 5JICA 1RTJA 1SKSA 3T3FA 3T7ZA 4H4MA 4O0IA 5AQXA 3VQ9A 3CJ7A 4HUGA 1N32K 2YNFA 5GAEP 4E7JA 2IC3A 4MLEA 5GAGP 1BO5O 4WQ4A 3MDQA 4CJTA 4PQUA 3CF5L 1JLBA 3BZCA 5AQNA 5IWAK 4CZJA 2D5RA 3CCSN 4B8AB 1Q8IA 3MXMA 4FLTA 5AQGA 4H0OA 3C0BA 4CERA 3QO9A 4B1WB 4GVEA 3QDKA 4NLBA 3ATVA 1JXBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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