2A42A

Actin-dnase i complex
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a42A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a42A04
2UYTA 5B8HA 2ZGZA 2IVPA 3DXMB 3HBTA 2FF3B 1NLVA 3EO3A 4YDUC 1BDGA 2I7NA 4IJAA 4MO5A 1QZ5A 1R59O 1HKGA 5AQSA 3VGKA 2YHYA 3L6QA 2FLOA 2QWNA 3WXIA 2FF6A 4B9QA 3H3OB 1TUYA 1BA0A 4XH4A 4BGAA 3RSEA 1T44A 5LJWA 3H45C 3W0LA 3QMLA 3VEZA 2D4WA 1SZ2A 4MO4A 4JNEA 3VEWA 4ISEA 2P9PA 3U9ZA 4ISFA 5BPLA 4BRDA 3WQUA 3H3NO 3VPZA 4H5RA 3VEOA 4BRKA 3FZKA 1HX1A 5AQOA 5AQMA 3JS6A 4Y0WA 5AQUA 3WUHA 4BVPA 1GLBG 4H5TA 5AZJA 4BRMA 2NZTA 3WT0A 5AQHA 1NGAA 3MN6A 4FWPA 5E26A 4BC3A 4CBWA 1QQOA 4IJNA 1J6ZA 1ZBSA 3QFPA 4QS8A 3LDNA 2A5XA 1BUPA 4JD2A 3UE5A 5AQIA 2P9SA 5AZIB 1GLLO 4H0TB 3UKUA 3VF4A 3EZWA 3FE1A 4BRNA 5FPMA 3CETA 3R6MA 3D2EA 1RDWX 3UKRA 2IVNA 1U6ZA 4EIAA 1NBWA 3A5LC 3QICA 4DQ8A 4BR5A 2Q0RA 5BPMA 1GLAG 5JLHA 2GELA 3ZETB 3CQXA 5BRFA 1S22A 1NGDA 3CQYA 1TYQA 3R8EA 3G25A 3VESA 1DGKN 1DEJA 4BC2A 2IVOA 3ZEUA 2CH5A 3M1FA 4FPAA 1GLFO 4GY2B 1U2VB 3VF6A 4BGBA 5FPNA 5KPZA 3C7NB 3CERA 4CZKA 5FPDA 5ELZA 4BQLA 2H3GX 2CGLA 4PKGA 4CZJA 2ZF5O 5AQTA 4BR4A 1K8KB 3ULEA 1NGBA 2E88A 3VEVA 5BN8A 3FFKB 3BP8A 2QWOA 2QWLA 4B1VA 4E1JA 4Z94A 5JMVA 3O80A 4H0YB 4B1UB 3QB0A 4BG8A 5ADXA 4FWLA 4FO0A 1HPMA 5F1XA 2QWPA 4M7XA 3FZFA 3CHWA 1LCUA 4CZMA 3S41A 1Z6RA 1X3MA 2FSKA 2GTDA 3IUCA 2YJFA 3O08A 2ASOA 2AA4A 4PKHA 5E84A 2VYPA 2Q2RA 1V4TA 2A41A 4FOIA 2Q31A 4PKIA 4BRIA 4HWIA 2DPNA 5TKYA 2P9IA 4NO7A 1NGFA 2P9LA 2WUSA 2IIRA 2KHOA 3CJBA 3LL3A 3MN5A 1Q18A 1JCEA 4QS9A 4EHUA 5LJVA 1Y64A 4BRLA 3P4IA 1LOTB 5KQ8A 2QWMA 5KPRA 1QHAA 4EHTA 3U9DA 5JLFA 4FWQA 3CJAA 4CD3A 3U8XA 5BREA 4CZLA 3UB5A 4IWVA 2V7YA 3WXKA 4BC5A 2VCPA 3A0IX 3FGUA 3SMSA 4MLHA 2D0PA 4BRCA 2FSJA 3MN7A 1DKGD 2E2QA 1NM1A 3GBTA 2PBDA 3FZMA 4CJ7A 2QXLA 3IFRA 3QBWA 3LDLA 2ITMA 2YI1A 5FPEA 2I7PA 1X9JA 3H1VX 2ASPA 2ZWHA 4LC9B 1WUAA 5BRDA 4WQ5A 4DB3A 2EWSA 4K42A 4EAHD 1KAYA 2A6AA 2Q1NA 3CJ9A 4IXCA 2D1KA 3WEEA 4H0PA 3D2FB 4H5VA 1G99A 3MDQA 3DXKB 3JXUA 5BN9A 4I6MA 3L4IA 3SMPA 4B1XB 3WXLA 3ZX2A 3WQTA 4FPBA 1KXPA 4CBUA 1MWMA 3GL1A 1YXQA 2E1YA 2QWQA 2D0OA 3O4WA 1NGIA 2FSNA 4B1WB 3AAQA 1BU6O 2YCHA 3IDHA 5EVZA 3QDKA 1IG8A 1NGHA 3BUZB 3RSEB 2V52B 1KAXA 3ID8A 1T6CA 1X3NA 5AQNA 2NLXA 1MWKA 2QM1A 3VOVA 4CZHA 3C7NA 3M6GA 2E1ZA 3VEYA 4J8FA 2A3ZA 2VWBA 2P9NA 3VGMA 1YAGA 3AAPA 4FWSA 1YVNA 2P9PB 4BC4A 1V4SA 4AM7A 1YUWA 1BWFO 3O1BA 3CJCA 2Q0UA 1ATNA 5AQRA 3B8AX 3CJ7A 4JN4A 4WQ5C 4FOEA 4CZIA 4CZGA 3MCPA 5AZJB 3H46O 4WQ4A 5ADXH 2A42A 1S3XA 4O5FA 3D7EO 2P9KA 4FSVA 2FXUA 4BREA 4BR0A 1CZAN 3O8MA 3R9PA 4M7YA 4H0VB 2HMPA 4EFHA 4BRHA 4JD2B 3ZX3A 4F9OA 4C23A 3LM2A 3CIPA 2P9SB 3WXJA 3CJ1A 2GWKA 3DJCA 3FZLA 4KBOA 4JHDA 3BEXA 3UKUB 1P8ZA 3LM9A 3MK6A 3O1WA 2GUPA 5AQYA 1ZC6A 2P9UA 2PAVA 3ENHA 5EOYA 4FL9A 1SAZA 3A5NC 3D2EB 4A2AA 3UKRB 4QS7A 3A5MC 1E4FT 2E2OA 1TUUA 3F9MA 2E20A 1HKCA 3KHYA 4PL8A 1TYQB 3GOIA 4BRFA 2NRHA 3ZEUB 3DXMA 4M63C 3SLCA 4RWTA 3HTVA 1NWKA 3VENA 1HJOA 4A2BA 1C0GA 4FWRA 2E2NA 4XH1A 5AQGA 4CZEA 2QW9A 4DCHA 4MLEA 1QZ6A 3HM8A 4H03B 1IJJA 3ULEB 1QQNA 3FR0A 4WQ4C 5AQKA 5AQJA 2E8AA 3LDPA 2F9WA 5AR0A 3I8BA 2CH6A 3ATVA 1D4XA 3ENOA 3MMVA 3HZ6A 3HSCA 2CGJA 1KAZA 2A40A 1XC3A 1GLEG 1RFQA 4PL7A 3EKSA 4B1ZA 3VF2A 3I33A 2Q97A 1BG3A 1SQKA 3QFUA 4K43A 5F2RA 4BRGA 2YHXA 2P9IB 2P9LB 3HI0A 1BOTO 4NB4A 4GNIA 4A62A 4CZFA 5AZIA 4BR2A 4WYBA 5AQPA 4ISGA 3CI5A 3J8AA 5KQDA 3A8YA 4IO8A 1MDUB 4BG9A 1NMDA 3GE1A 4H0XB 3ATUA 5AQLA 4HTLA 4CBXA 3VETA 3ZETA 5I9EB 1HUXA 3VERA 1NGCA 4XEIA 5AQQA 1C0FA 4FWNA 4BRAA 1U2VA 4BROA 3DAWA 1JCGA 3SJHA 1ATRA 1BA1A 5JICA 1JCFA 4XH5A 1ESVA 1OKJA 3M3ZA 5AQFA 1EQYA 2F9TA 2HOEA 1K8KA 4FWKA 4FWMA 3KZBA 3MN9A 4O8KA 1E4GT 3FZHA 2OANA 4RCHA 5AQWA 5F0XA 3WEEB 1MA9B 3SK3A 1HKBA 3AARA 3EL2A 1QQMA 1HLUA 3BF3A 4I6MB 4L3QA 5CE3A 5EY4A 4BRPA 1BO5O 2V7ZA 2GWJA 2W41A 1GLJO 2HF4A 5EX5A 1T6DA 3C0BA 1ZXOA 1NGGA 4BRQA 1NGEA 2HF3A 2YJEA 5BR9A 3ZX0A 5LY3A 2GEMA 2J4RA 3U4LA 3TPQA 2Q36A 4CD1A 3EN9A 2ZGYA 3QBXA 2E2PA 4RTFD 4K25A 3GDQA 3VEXA 5BPNA 5BRHA 3BF1A 1ATSA 3AY9A 5EXWA 3L0QA 4YDUA 2P9NB 1H1VA 2W40A 4H5NA 3W3DA 3LDOA 4K41A 4BR9A 3LDQA 4FWOA 1WOQA 2ASMA 3O6WA 1GLCG 1XQSC 3KVGA 4DHYA 5KPTA 5AQVA 3DWLA 4BQZA 2P9KB 4H0OA 3TU5A 2QWRA 3O5BA 3GG4A 5AQXA 1Z05A 4A61A 3H6EA 5AFUH 3H1QA 4JHDB 4IZ9A 4B1YB 1RGIA 4JAXA 2P9UB 3EKUA 4AM6A 2CGKA 3A5OC 2BUPA 5AQZA 1GLDG 1XUPO 3OHRA 4BR7A 3FLCO 3IMXA 4BVOA 2YHWA 2V51B 2BTFA 3VGLA 4CI6A 3D2FA 5AFUA 3DXKA 4H5WA 2AP1A 1NGJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCVN 3TSQA 3LWLA 3T1YK 2I7NA 4BE2A 4H4MA 1QZ5A 1FKPA 3RR8A 2QWNA 3QINA 2FF6A 1JXBA 3H3OB 4B8CA 4KTQA 2ZD1A 4XH4A 4Z4GA 4BGAA 2OYQA 3G71N 3OYCA 4B8AB 3W0LA 2D4WA 3CMEN 4JNEA 2O8CA 3VEWA 2Y1IA 3U9ZA 3H3NO 1M90O 3D0PA 4C1NK 3RMDA 1OVYA 3K2PA 3CC2N 1ZBHA 3I0RA 5FDLA 1BISA 4GKJK 3JS6A 4Y0WA 3WUHA 3S9HA 1GLBG 4KHSA 4FLXA 3PSIA 3KWGA 3L2WA 3HL8A 3CCJN 1WAFA 3SJJA 1XNQK 4FWPA 4M3UA 3KD1E 1QQOA 4IJNA 1J6ZA 1ZBSA 4IBNA 3NHGA 2VG7A 4DV1K 3VQ8A 1RT6A 2VG5A 4DV4K 2XY6A 5AZIB 4H0TB 2OZSA 5J2NA 2XY8A 4LF8K 2NUBA 1J9AA 5FPMA 1VSMA 3AVMA 2O8BA 3OYHA 4CJ4A 3OW2M 1U6ZA 4CJKA 4BR5A 4CF2A 3ZETB 1RT1A 3THWA 1ITGA 3CQYA 4JYAK 4LD0A 1D9FA 3ZEUA 3U3YA 2I5JA 3QEWA 4IG3A 4GY2B 1U2VB 4BGBA 5FPNA 5KPZA 4BDZA 3C65A 4CZKA 3RTVA 3SV3A 4BQLA 1QVFM 3TSPA 1WSFA 2RKIA 3ULEA 4N47A 3O9QA 2E88A 1U4BA 4JKCA 4OGCA 1WSJA 3BP8A 2F4VK 1UA1A 5JS2A 4KRFA 1ASUA 3AO5A 1TAUA 3QB0A 3RMAA 4BG8A 3U3GA 1YI2N 5F1XA 4W5QA 4FJMA 4DSIA 3AV9A 1LCUA 1X3MA 2JWKA 1NNEA 1VK0A 3L4QA 1BQMA 2Q31A 4CK3A 2HHUA 4PKIA 4BRIA 4HWIA 3KK2A 2DPNA 2P9IA 3NDKA 2P9LA 3IG1A 4GVEA 2FBYA 3TAFA 5C12A 2PY5A 4LF4K 3O3FA 4IOAL 4DSKA 3PX4A 2YKMA 4C8MA 4JI7K 1IKVA 4BRLA 1BGXT 1LOTB 4Z4CA 3LAKA 5KQ8A 5KPRA 3IKMA 2KW4A 5JLFA 2RE2A 1Q82O 4IEEA 3NF6A 4K8XA 2QKKA 3CCQN 3UB5A 5LL6Z 3WXKA 4E19A 4MLHA 1HNXK 3C94A 4O5BA 3AVLA 4DTOA 1NM1A 3GBTA 2PBDA 4MDBA 4J2EA 2ITMA 3TAPA 4CIFA 4FJIA 1J5EK 3CCUN 1WUAA 5BRDA 2EWSA 5E41A 1WN7A 4AILC 3T69A 2A6AA 5AJ3K 3CJ9A 3MX5A 3AO1A 4H0PA 3D2FB 3MDQA 3DLGA 1S72N 1JLCA 4B1XB 3ZX2A 4FPBA 2KZMA 3K57A 3GL1A 1T03A 3I56N 2QWQA 4DF8A 2QKBA 1I94K 4EP5A 4OPKA 5J2QA 1D8YA 4B1WB 3S5TA 3PO5A 4WFNL 1IG8A 3RSEB 4Q0BA 3AVNA 1T6CA 4B9MA 2YNHA 2NLXA 3ALYA 4MFBA 4CEAA 1W7AA 3ZLJA 3V4IA 1OH6A 3P31A 3VEYA 2VWBA 4OLBA 4JRPA 1S9EA 4BC4A 3NBPA 4AM7A 1YUWA 1YTUA 3ZSWA 3OYAA 4ILGB 3T19A 4WQ5C 2E5LK 4CJ5A 3TWHA 2KQ2A 4X64K 5AZJB 4FZYA 2P9KA 2FXUA 2HHIA 3R9PA 2HVIA 2HMPA 3LWMA 3N4PA 4JD2B 4F9OA 4C23A 2WONA 3CIPA 1YJWN 2GUIA 4KBOA 3TI0A 4JHDA 3DM2A 3MCAB 2GUPA 5CYQA 3NGZA 1ASWA 4ZHRA 1SAZA 4AH9A 1HNVA 2YHBA 4A2AA 3CC4N 3UKRB 4J2AA 1WB9A 3ENBA 1E4FT 1WBDA 1W9HA 1TUUA 1N34K 1IO2A 1HKCA 4KHUA 2KTQA 3PUFA 3KHYA 1S6QA 3ZSXA 1A5XA 4X65K 1QSLA 1RTHA 2HHTA 4M63C 3VENA 5FLXO 1C0GA 4FWRA 2E2NA 3PY8A 4CZEA 4DCHA 1QZ6A 1TKDA 1ASVA 1IJJA 4WQ4C 5AQJA 3ZSZA 4QOZB 4EZ6A 2F9WA 2O8FB 4BE7B 2O4IA 1KFSA 2R7YA 1D4XA 3V9UA 3HSCA 4G1QA 2CGJA 1ZBLA 1XC3A 1GLEG 3LZJA 3NH1A 1VQON 4JS5A 4PL7A 1Q8IA 3DLLL 2YHXA 2WC9A 3NCIA 4LH5A 5AZIA 2Q3SA 5GADP 3CI5A 3NE6A 1J5OA 4FJJA 1XI1A 4DR1K 2JLEA 3GE1A 3KK7A 3ATUA 4JRQA 4E0DA 4CBXA 1B9DA 4DU4A 1MU2A 3ZETA 1HUXA 1SL0A 4LF5K 3OTOK 3HPGA 3MEEA 3ASMA 1U2VA 3E9PA 4BROA 3DAWA 2RN2A 3SYZA 1ATRA 1BA1A 2D0BA 4FZZA 4XJXA 4FLYA 3OVNA 1ESVA 1JLQA 1OKJA 3ZSVA 4JKGB 1GOCA 1EQYA 2F9TA 2HOEA 3PSFA 2G8UA 4FWKA 2UXBK 3MN9A 3K5LA 3WEEB 4YNQA 4U7BA 1BO5O 2V7ZA 4DF4A 4A5AA 5EX5A 3MXMA 1TKZA 4AF1A 1NGEA 4BRQA 2KZZA 2HF3A 2J4RA 3TPQA 1YTAA 1C0UA 4KH4A 3QBXA 1NJZA 3VEXA 1VSHA 5BPNA 5BRHA 2KLAA 5GINA 1LWCA 3HM9A 3L0QA 3O9TA 4FK4A 3V81A 3ZYYX 1CLQA 3W3DA 4DFPA 1XC9A 4BR9A 4OLAA 5M1KA 1WOQA 3O6WA 1GLCG 1RBVA 4I9LA 1VRTA 3E01A 2HB5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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