2A42A

Actin-dnase i complex
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a42A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a42A04
3WEEB 1QZ5A 1CZAN 3WQTA 2W40A 4XEIA 4XH1A 2A5XA 1YUWA 5FPNA 3VOVA 4CZIA 5JLHA 3M1FA 4H0XB 3WXKA 2BTFA 3M3ZA 3ENOA 2GWJA 1ATRA 1LCUA 2KHOA 4FWNA 5KQDA 4FPBA 2CH5A 3VENA 4FWKA 4RTFD 4ISFA 3QBWA 1X9JA 1NWKA 3U9ZA 3WXIA 3MDQA 1HPMA 3JXUA 3CQYA 1NM1A 5BN8A 4GY2B 3MMVA 1T44A 1NGCA 2E2OA 5BRHA 1Q18A 4H0TB 4HTLA 1MA9B 5AQTA 2IVOA 4EHUA 1NGDA 4JD2A 2E1ZA 5ELZA 2PAVA 3QB0A 2FSNA 5KPTA 4Y0WA 1GLDG 3C7NA 4K25A 3H6EA 5EXWA 1JCEA 2VYPA 3DAWA 3VGMA 1ZC6A 4FO0A 1RDWX 4JD2B 5AQRA 4B1XB 1SQKA 2YCHA 1BA0A 2HMPA 2YJEA 3LL3A 5EY4A 1NGJA 3A5LC 4CZKA 1NBWA 3R6MA 5AQOA 3R9PA 1NLVA 2QM1A 3ZETB 3VESA 3CJ1A 5AQIA 4QS9A 4F9OA 3L0QA 4A2AA 4BR9A 4PL7A 4CZHA 3WQUA 3QFPA 4KBOA 3U9DA 1YXQA 4BRQA 4I6MA 3S41A 2CGKA 3VEZA 2IVPA 2GELA 3U8XA 3VF2A 3TU5A 3D7EO 4H5VA 4BC5A 2NRHA 2ZGZA 3DXMA 2P9SB 4GNIA 4FOIA 5JICA 2E2QA 4BRCA 5LY3A 5BN9A 2QWOA 2P9NB 5AQSA 4AM7A 4CBUA 2FXUA 4HWIA 3HZ6A 3UB5A 1GLEG 1BU6O 3O8MA 5AQMA 1S3XA 4IXCA 4DHYA 1Y64A 3CETA 1SZ2A 1RFQA 3FR0A 2UYTA 1T6CA 2E2PA 5AQGA 3O80A 1K8KA 3VERA 4C23A 3VF6A 3W0LA 3UKUA 1IG8A 1QHAA 3B8AX 3MN7A 1YAGA 1YVNA 4PKHA 1HKBA 3G25A 3SMSA 2FF6A 2F9TA 2EWSA 4CZFA 4EFHA 4ISGA 4XH4A 5LJVA 3ZX0A 2V51B 1G99A 2P9PA 3BF3A 3LDOA 5F0XA 3GG4A 4DB3A 5BPMA 1KAZA 2CGJA 5AQZA 3VF4A 1H1VA 1BOTO 1MWKA 4BROA 1BWFO 4M7YA 2PBDA 4H0VB 2P9IB 2ITMA 1QZ6A 3QBXA 3ZX2A 4K42A 2J4RA 2E1YA 3IMXA 1BDGA 3BP8A 4JHDA 1JCFA 2IIRA 4H0YB 5AQUA 3LDQA 5AZJA 4FWMA 2ASMA 4CBXA 4O8KA 2F9WA 4BR4A 4B1UB 1DEJA 1E4FT 3QICA 1GLJO 3J8AA 3KVGA 4CBWA 3H1VX 4BGAA 3QMLA 4IWVA 1U2VA 2OANA 3D2FA 3KHYA 3FE1A 4ISEA 2BUPA 3VEOA 1V4SA 1SAZA 1T6DA 5E84A 5AQFA 4IZ9A 4LC9B 3HTVA 3L6QA 4B9QA 3LDPA 1GLCG 4H5TA 2HF4A 3BUZB 4WQ4A 2D0OA 3QDKA 3FLCO 1JCGA 2FF3B 1IJJA 5B8HA 1BG3A 2QW9A 2A6AA 3ENHA 5AQWA 2HOEA 4BC4A 4WQ5A 5JLFA 1HKCA 3O4WA 3TPQA 2YHXA 3DXKA 3C7NB 2WUSA 1C0FA 5BPLA 4BG8A 5ADXA 4FOEA 1TYQA 2P9LA 3ULEA 3O1WA 1Z05A 2V52B 3GDQA 3WXJA 5AZIA 4BREA 4BRGA 2Q2RA 4YDUC 2AA4A 3C0BA 3AAQA 5F2RA 4PL8A 1NMDA 3W3DA 3M6GA 5FPDA 4CD3A 2YJFA 2FLOA 4Z94A 4H5NA 2HF3A 2W41A 1QQOA 4BRKA 3CJ9A 3F9MA 4A62A 2VCPA 3SLCA 3FFKB 5EX5A 4I6MB 3HM8A 2V7ZA 4BRFA 2A42A 4A2BA 3RSEA 3SK3A 3UKRA 1XC3A 2Q0RA 5AQNA 1KAYA 4CZLA 4EIAA 4H0PA 4PKGA 1WOQA 2P9UA 5I9EB 1R59O 3WUHA 3EZWA 3DXMB 1D4XA 3CHWA 4QS8A 4RWTA 1TUUA 5BRDA 2V7YA 2Q97A 3FZLA 5F1XA 3QFUA 1NGAA 3BEXA 4O5FA 3VEXA 1V4TA 5AQPA 4BRNA 1J6ZA 4BR5A 5AFUA 1XUPO 1QQMA 2CH6A 5AQXA 1MDUB 3SMPA 2P9KA 3GL1A 2A41A 4PKIA 3A8YA 3VEYA 3CJBA 1K8KB 3ID8A 4FWPA 4FWSA 5AQQA 2ZWHA 3VPZA 3L4IA 4JN4A 2GWKA 1BA1A 3UKUB 2QWRA 5ADXH 3AY9A 3H1QA 5FPMA 3D2EA 1Z6RA 3UE5A 4BGBA 4CD1A 1P8ZA 4NO7A 3VGKA 2FSJA 3ZEUA 1BUPA 4FPAA 4B1YB 4BRDA 4BQLA 3VETA 4WQ4C 3EKSA 3VEVA 1NGEA 3CIPA 1ATNA 2GUPA 4BG9A 2P9PB 1S22A 3GBTA 4IJAA 1MWMA 2QWPA 1E4GT 4L3QA 4M7XA 4BRAA 4CZJA 3EL2A 4H0OA 2YI1A 4J8FA 3O1BA 1TUYA 3EO3A 1NGHA 4A61A 3WEEA 5AQYA 4CZGA 3EN9A 3H3NO 3DWLA 4CZMA 2A3ZA 3AAPA 1HKGA 4JHDB 4BR7A 1U6ZA 3WXLA 1NGGA 4FL9A 5AZJB 3H46O 1HLUA 2VWBA 3O5BA 3ATUA 4MLEA 1HX1A 1DGKN 2QWMA 4FWOA 1OKJA 3HSCA 3I8BA 4K41A 5EVZA 1X3NA 1C0GA 1U2VB 2QWLA 2I7PA 3A5MC 1KXPA 3D2FB 3FZMA 3LM2A 3O08A 5AFUH 5CE3A 3SJHA 3VEWA 3WT0A 4B1VA 3AARA 3ZX3A 2QXLA 4H5WA 1EQYA 3FGUA 1DKGD 4NB4A 5AQLA 5JMVA 1GLBG 4CJ7A 4BVOA 3A5OC 3MN5A 3IDHA 4FWQA 5E26A 4BR0A 2D1KA 3MK6A 2Q1NA 3O6WA 1BO5O 4CI6A 2GTDA 4BR2A 1NGIA 2Q0UA 2QWNA 1GLLO 4B1ZA 3CJAA 4CZEA 4MLHA 4IO8A 5BRFA 4DQ8A 3DXKB 5AQHA 5BPNA 3LDLA 4BVPA 3ZETA 3IFRA 1TYQB 1ESVA 2P9LB 3ULEB 4FSVA 1LOTB 2DPNA 4BRPA 5KPZA 5AZIB 1QQNA 3LDNA 2E20A 2ASOA 3H45C 1HUXA 5AQVA 4BC3A 2CGLA 4FWLA 2YHYA 3FZHA 2I7NA 1RGIA 1GLFO 3U4LA 3CI5A 4MO4A 3CQXA 3VGLA 4H5RA 2P9SA 2H3GX 1ZXOA 3P4IA 3A5NC 4MO5A 3HBTA 3MN6A 2P9NA 3MCPA 4IJNA 3R8EA 4JNEA 3GE1A 4AM6A 3CERA 3JS6A 4M63C 5AR0A 2YHWA 3RSEB 3UKRB 2D0PA 4B1WB 3LM9A 3HI0A 5AQJA 3EKUA 3OHRA 2P9UB 4BRHA 5BREA 3IUCA 1X3MA 4BQZA 2NZTA 1NGBA 4H03B 4BRIA 2Q31A 4K43A 5AQKA 4JAXA 4BRMA 2Q36A 5BR9A 2E88A 1NGFA 3CJ7A 5KPRA 1GLAG 3MN9A 1ZBSA 1HJOA 2FSKA 1XQSC 4YDUA 4EAHD 3GOIA 3I33A 2D4WA 2P9KB 2ZF5O 5TKYA 4BRLA 5KQ8A 2ZGYA 2QWQA 2E8AA 4EHTA 3ATVA 3DJCA 4QS7A 4XH5A 2AP1A 2GEMA 3FZFA 3D2EB 3BF1A 2IVNA 3H3OB 2A40A 5EOYA 4RCHA 1ATSA 4DCHA 2ASPA 3ZEUB 4FWRA 2P9IA 3CJCA 1KAXA 4WQ5C 4BC2A 2NLXA 5LJWA 3KZBA 4E1JA 3FZKA 2E2NA 1WUAA 4WYBA 3A0IX 5FPEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1J53A 4YORA 1QZ5A 4YOUA 4XEIA 4M3ZA 1YUWA 4CJPA 5JS2A 4LF8K 1VRUA 1Q82O 4KRFA 3DI6A 5JLHA 3RTVA 4H0XB 3WXKA 3M3ZA 3SV4A 2KHOA 3OJUA 2DFFA 4FWKA 2VQFK 3C6TA 2GX9A 3U9ZA 1KQSM 2Y1IA 3LALA 2JLEA 3SQ2A 2B4JA 5KGXA 3HOTA 1LWFA 1Q18A 2UXCK 4DTRA 1QTMA 2IVOA 1I94K 2HBKA 5HL7L 4IFEA 4OKEA 3P39A 2OPPA 3NF8A 3QB0A 4DU1A 4JKCA 4Y0WA 1GLDG 4K25A 1VSIA 1RTDA 2HHHK 1SL2A 2O8FA 1SQKA 4LF5K 4CEFA 3MEDA 4J2DA 3A5LC 3J80O 4B9TA 1NK4A 4KHYA 4M41A 4AHCA 3THWB 4E89A 4KAZA 2HHVA 2OZSA 3L0QA 4CZHA 3WQUA 1VAZA 3U9DA 1NJXA 3CFOA 3V6DA 4I6MA 3S41A 4MDBA 2IGIA 4DF4A 1VSFA 4N56A 3D7EO 4H5VA 2QI2A 2NRHA 3P31A 1VRTA 4CVNE 4FLYA 2P51A 3M8QA 2P9SB 1JLEA 5MLCQ 3KLFA 5E41A 2E2QA 5LY3A 2QWOA 4AM7A 4HWIA 5DK5A 2YHAA 1ZBFA 4KPYA 5AQMA 1S3XA 4IXCA 3PO4A 3I8DA 1VK0A 4M45A 3FR0A 2E2PA 2BGGA 3O80A 2HNYA 5KRTA 3W0LA 4GKJK 4A59A 3OJSA 2Q3SA 3L8BA 1IG8A 3L2QA 4GW6A 4PA1A 1YAGA 1HKBA 1S6PA 3G25A 5C12A 4JK9A 4LD0A 5J2QA 1JLGA 2FF6A 2ZJPL 1KLNA 2F9TA 3UIQA 4G9ZA 4AF1A 3L4QA 3KLHA 5FDLA 4NYNA 2P9PA 3BF3A 3M5RA 2VQEK 3KLIA 1QQCA 3VF4A 3ZT1A 1BOTO 1SV5A 2OZMA 3HOSA 2VWJA 2PBDA 1FXXA 4CJRA 4OPAA 2AJQA 2E6MA 3QBXA 4E7IA 3LP0A 5KTQA 2VWKA 4K42A 2X6NA 3LZJA 2E1YA 1GOAA 3IMXA 3T7ZA 3CMEN 4FVUA 1RT4A 4IEIA 1IO2A 2IOCA 4FWMA 3TR8A 4CBXA 3SAFA 1DEJA 3CYGA 4DTSA 4B9UA 4KHNA 1U2VA 3D2FA 3DYAA 4Z4GA 3G4SN 1BI4A 3J7ZO 4U7BA 2O8CA 4LC9B 3L6QA 1UAXA 4BDZA 2HF4A 5GADP 3L2WA 2D0OA 2VGNA 1JCGA 5CYQA 3K57A 3JSMA 4JEPA 3B6OA 4DTXA 5D3GA 4CJ3A 4LF6K 1DT9A 3DRPA 3QLHA 5JLFA 4GV9A 3S3NA 3DXKA 2R7YA 2WC9A 4BE0A 1C0FA 1U04A 5BPLA 2VG6A 5ADXA 1TYQA 2P9LA 5JS1A 4JLHA 4ELVA 4M3WA 3SCXA 2O8FB 4RW7A 3OS0A 1HNZK 1KCFA 3O4QA 2VG5A 3C0BA 3AAQA 3D6RA 1WB9A 1NMDA 2P5GA 2YJFA 4CJWA 2W00A 2W41A 1HNWK 3AVBA 3CPWM 2EX3A 2VCPA 1WAFA 4I6MB 2V7ZA 3RSEA 4CFAA 3TTDA 4DG1A 2ZJRL 5AQNA 2QEXN 1NK9A 4H0PA 1R59O 3EZWA 1U45A 1IG9A 1D4XA 3CHWA 4QS8A 3OYBA 2WFBA 1S1UA 3E9OA 1TUUA 4J2BA 1RTIA 3MECA 1VSMA 2I5JA 2V7YA 3CXCM 3T19A 1C1CA 4J2EA 2Q97A 5J2PA 4GMJB 1TKZA 1VQLN 5AQPA 3VQ7A 2DTUA 2CH6A 2KQ2A 1IBKK 3NH1A 1NJWA 4PKIA 3CJBA 4FWPA 1BQNA 5AQQA 3NE6A 5HRPA 1HNXK 3J81O 3UE5A 3KWIA 4CEBA 3V1OA 1P8ZA 4NO7A 1RT2A 3BGRA 1C1BA 3AA4A 4BQLA 4DFJA 2D0BA 3PIOL 3VQ5A 4CGHA 3CIPA 4B9SA 4FK4A 2P9PB 4IJAA 3GBTA 4E72A 1MWMA 4CZJA 5M1PA 4J8FA 3SUPA 2ATQA 1TUYA 2YKMA 3AO1A 1ILYA 3HVRA 4FJHA 3TARA 3EN9A 4FVMA 3DWLA 3QIOA 1YF5L 4CJ5A 1N6QA 2IS3A 1NGGA 4FL9A 3H46O 1KLMA 2VWBA 4BY9C 3MWTA 4CF0A 2QWMA 4F2RA 4FWOA 3I56N 4RW4A 1WSHA 4JKFA 1U2VB 5AFUH 2QWLA 3D2FB 2HNDA 1KXPA 1BI4B 1RT6A 3VEWA 1HYVA 3WT0A 5HRNA 5M1KA 4CCHA 2O8CB 1C6VA 1L5UA 1DKGD 4NB4A 1CXUA 3TAMA 4DFKA 1KVCA 5JMVA 1T8EA 4BVOA 3A5OC 3IDHA 3BZKA 2D1KA 1VSKA 3AO4A 1NGIA 3AA5X 5HOOA 4FLTA 4IO8A 1XWLA 3ZSWA 1TVRA 4IBNA 3DXKB 5TKWA 5DM6L 3HP9A 4CF9A 3D45A 3NGZA 3SZ2A 3LWLA 4LFAK 4JKGA 4BVPA 2WOMA 1TYQB 2P9LB 4BRPA 3DLBA 1QQNA 1NKCA 3OYHA 2Z1IA 2E20A 3H45C 1RT3A 1HUXA 3OYGA 4FWLA 3ID6A 1C0UA 4CHQA 3DLKA 3V81A 4CK2A 1IKYA 3CM5A 1WAJA 4AH9A 3CMAN 1TK0A 1ASUA 3VGLA 1OH7A 3WNFA 4MO5A 3NGYA 3HBTA 3MCPA 2G8WA 4KTWA 4AM6A 2HBMA 3RSEB 1I3AA 4B1WB 3DMJA 3TSPA 3QNOA 3P38A 4IG0A 1VQ7N 2NZTA 3VQ6A 3QESA 3K58A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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