2A42A

Actin-dnase i complex
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 123
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a42A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a42A04
4JD2B 3M1FA 2OANA 3DXKB 2P9IB 2ZGZA 3SK3A 4GNIA 3MN9A 1HKGA 3CJ1A 2H3GX 3AAQA 2AP1A 5JLHA 5AQNA 2Q97A 3A8YA 3R6MA 4B9QA 3CJCA 4KBOA 3ULEA 3GBTA 5BPLA 4B1VA 4H0OA 4H5VA 1X3MA 2QWPA 2E20A 3MK6A 1NM1A 4MO4A 5AZIA 4BRPA 5BREA 3WEEB 2A42A 4CD3A 4CZHA 1NGHA 3GG4A 5F2RA 2A40A 4BRCA 3JS6A 3ENOA 3VEZA 4IO8A 4B1XB 2GELA 1GLEG 3CQYA 4YDUA 4FOIA 3CETA 5FPMA 3RSEA 2GWJA 3FGUA 3D7EO 1LOTB 3U8XA 2BUPA 3L0QA 3FZMA 4I6MB 4JNEA 4BQZA 1SQKA 1TYQA 1HKBA 5AR0A 2W41A 3ZEUA 4BR5A 1NGJA 5ELZA 3D2EB 3O80A 3WQTA 1KXPA 3AARA 3G25A 1K8KA 3UKRA 3KVGA 5EX5A 1NGIA 3ENHA 2ASOA 1TUYA 2YHYA 4NB4A 3U9DA 4BRFA 4DB3A 1HUXA 1QQMA 3VEWA 4CJ7A 2FF6A 4RWTA 3MCPA 2UYTA 3BF3A 3EL2A 4CZFA 5AFUH 3LDNA 4HTLA 3FFKB 4BR7A 1HJOA 1ATNA 1BOTO 4PKGA 5AQPA 3O6WA 2PAVA 1BUPA 1BDGA 1XQSC 3KHYA 4IZ9A 2QWMA 4FWLA 5AQQA 5ADXH 3FZHA 2DPNA 5EVZA 5BRFA 2GUPA 1H1VA 4CZMA 3UKUA 2P9PA 3QB0A 4QS9A 2J4RA 3BEXA 4RCHA 3WXJA 5BRHA 3EKSA 3GL1A 1GLJO 3LM2A 4IJAA 3ZETA 1QQOA 3VGLA 2QWLA 3LDPA 3HZ6A 4BC4A 2P9UA 4FPBA 3SLCA 3TPQA 5BR9A 4BRLA 4WQ5A 1RDWX 3WXIA 3AY9A 4XH4A 5AQXA 1RFQA 4B1YB 1IG8A 3BUZB 1DGKN 1NGFA 4H0PA 4F9OA 3DWLA 4ISFA 2HF3A 3EN9A 2ZWHA 3C0BA 4BRNA 3VENA 1MDUB 4BQLA 5AQJA 3CJ9A 4B1ZA 1OKJA 4BRDA 4H5NA 1NMDA 1YVNA 1GLBG 4A2AA 1NGAA 1ZC6A 4BROA 1NGGA 2FXUA 4DCHA 2P9KA 2HMPA 3VGMA 2FF3B 3VETA 1XC3A 3GE1A 4XH1A 4BR2A 1KAZA 4BG8A 2GWKA 3FZLA 2F9WA 2HF4A 4BRKA 3MDQA 4JD2A 4E1JA 2YJFA 3B8AX 5BPNA 3DXKA 2P9IA 3L6QA 5EXWA 3ZX0A 1S22A 1T44A 5BPMA 3ATUA 2E1YA 1Y64A 1G99A 1TUUA 2QWOA 5AQKA 5EOYA 1WUAA 2Q31A 3U4LA 3CJ7A 5F0XA 3EKUA 3MN6A 4M7XA 1MWKA 1Q18A 3DXMB 5KQ8A 4BR9A 4NO7A 3A5OC 4YDUC 5AZJB 3ATVA 3O1WA 1D4XA 4H0VB 4H5TA 2YI1A 3VF4A 3WEEA 2BTFA 2WUSA 2KHOA 5KPZA 3GDQA 4MO5A 4FOEA 1P8ZA 5AQZA 3D2FB 3VPZA 3O1BA 4FWNA 5E26A 3OHRA 3S41A 2D4WA 2E2QA 4FWPA 1MA9B 4BR0A 4IJNA 1GLLO 3IDHA 5AQYA 3QICA 5FPDA 4I6MA 5AQIA 1WOQA 3MMVA 2NRHA 2IIRA 3CJAA 5FPEA 4XH5A 1HKCA 2CH5A 5AQOA 3H1VX 3J8AA 4EAHD 3AAPA 4H5WA 3IMXA 4J8FA 2E2PA 3TU5A 4K43A 3D2EA 5JMVA 1GLFO 4FL9A 5LJVA 3CERA 5AQRA 4AM7A 4ISGA 1NWKA 4AM6A 4FWMA 1GLCG 2NZTA 2VCPA 4FO0A 4BREA 3P4IA 5AQMA 3LDQA 2ZGYA 2QW9A 2V52B 5I9EB 4BC3A 3H6EA 1BU6O 4C23A 1JCGA 2P9NB 2Q0UA 4M63C 3LM9A 2Q1NA 1HLUA 1NGDA 3HM8A 2ITMA 1EQYA 4BC5A 1U2VB 3H3OB 4H0XB 4DQ8A 2FSJA 4H0TB 4WQ4A 2QWRA 3QFUA 2IVNA 4BRAA 5BRDA 5AQGA 3LL3A 2P9LB 4Z94A 4L3QA 3DAWA 2P9SB 1YUWA 2E88A 3SMPA 4BR4A 4EIAA 2W40A 4MLEA 2A5XA 3QDKA 5AQTA 4CI6A 5F1XA 3VOVA 3EZWA 2Q36A 5AQFA 1RGIA 2PBDA 3I8BA 4HWIA 5EY4A 1ZXOA 3FLCO 4A61A 4CZJA 3I33A 3H46O 3VGKA 1J6ZA 4BGBA 2I7PA 4PKIA 1T6CA 1HX1A 2QWQA 3ID8A 4CZGA 1ATSA 4JHDB 3WT0A 4JHDA 3O08A 2F9TA 4JAXA 5TKYA 2QXLA 5CE3A 1E4FT 2A3ZA 2CGLA 2QWNA 2I7NA 4CZEA 5KPTA 3IUCA 3MN7A 4EHUA 1BWFO 3CI5A 4BVOA 5BN8A 4BRGA 1IJJA 1LCUA 5JICA 4BRHA 1SZ2A 2IVPA 1JCFA 4EFHA 3VEYA 3HSCA 4FPAA 3A5MC 1BO5O 4O8KA 3R8EA 3L4IA 3F9MA 2YCHA 3M3ZA 3EO3A 3A0IX 3C7NB 4PL7A 5E84A 3DXMA 3GOIA 4ISEA 2E8AA 3CIPA 5AZJA 3H45C 3QFPA 4B1UB 1QHAA 2E2NA 3H3NO 3DJCA 2ASMA 3QMLA 1ESVA 2FLOA 3D2FA 2V7ZA 4PL8A 3ULEB 5KQDA 4CBXA 3W3DA 3HTVA 2Q0RA 3IFRA 4Y0WA 4EHTA 1GLAG 1S3XA 5JLFA 2CGKA 4JN4A 3VESA 3UE5A 5KPRA 3FZFA 3VEOA 5AQUA 1ATRA 1SAZA 5AZIB 4LC9B 5AQSA 1BG3A 5AQHA 1NGBA 2Q2RA 3A5LC 2EWSA 4IXCA 3HI0A 3CHWA 2E1ZA 3UB5A 1NGEA 4RTFD 4A2BA 4FSVA 2FSKA 3RSEB 4FWQA 1QZ5A 4H03B 4B1WB 5AFUA 1C0GA 1TYQB 3ZX3A 1X3NA 1DKGD 4K41A 2QM1A 3ZEUB 4WQ4C 4BC2A 4BRIA 2ASPA 3SMSA 4BRMA 4CD1A 5ADXA 3M6GA 2A41A 3CJBA 2P9NA 3MN5A 2D1KA 4M7YA 4QS8A 5FPNA 1K8KB 3UKRB 3WQUA 5B8HA 3ZX2A 1T6DA 2V51B 5AQWA 1U2VA 4CZLA 4H0YB 1GLDG 2A6AA 2D0PA 4IWVA 1KAYA 4BRQA 3O5BA 2CH6A 1DEJA 4WQ5C 4DHYA 2P9LA 3LDLA 2YJEA 4XEIA 3VF2A 2ZF5O 2P9SA 3O8MA 3HBTA 1V4SA 5AQVA 5LY3A 1C0FA 3BF1A 4WYBA 4H5RA 3JXUA 1E4GT 4FWKA 2IVOA 4BGAA 3UKUB 2NLXA 1KAXA 2P9PB 1YAGA 3QBWA 4QS7A 3W0LA 2YHWA 4CBUA 4BG9A 4A62A 2HOEA 1HPMA 3ZETB 2VYPA 3WXKA 1CZAN 4GY2B 4CZKA 3FR0A 2P9UB 3WUHA 3A5NC 3VF6A 4FWRA 1Z05A 2VWBA 1V4TA 3U9ZA 4BVPA 4PKHA 2GTDA 1JCEA 3KZBA 4FWSA 1ZBSA 4FWOA 4K25A 1BA0A 3FZKA 1XUPO 3VEXA 1MWMA 3H1QA 1BA1A 1NBWA 4MLHA 3R9PA 2AA4A 5LJWA 1U6ZA 3O4WA 1QQNA 2E2OA 1NGCA 2CGJA 1Z6RA 3LDOA 3QBXA 3SJHA 4O5FA 1QZ6A 2FSNA 1YXQA 2D0OA 1X9JA 3WXLA 4K42A 2YHXA 3CQXA 3FE1A 3VEVA 2GEMA 2V7YA 3VERA 5BN9A 1R59O 2P9KB 5AQLA 4CBWA 1NLVA 3BP8A 3C7NA 4CZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT1A 3M1FA 4CESA 3IAYA 1WSEA 2OANA 1HKGA 2H3GX 5JLHA 3QETA 4PQUA 2HHXA 1IG9A 4ILHA 4Z4IA 4DV2K 3VQ8A 4CJPA 4O4GA 4ZTJA 4CEQA 1GOBA 3KKSA 2HBMA 2F7TA 5GAEP 1C0UA 1NM1A 5BREA 3WEEB 2UXCK 1BHLA 1VQPN 3E9OA 4NLCA 3CQ8A 3AVNA 4IOXA 2PFUA 4IO8A 1WSFA 2GELA 1IKXA 3S3NA 5FPMA 4NLBA 4X62K 4JNEA 4NYFA 2HMIA 3QO9A 4O55A 4DWIA 3QINA 3HK2A 3ZEUA 4CGJA 3PV8A 4BR5A 1JLEA 1NGJA 3WNHA 2Q3SA 4DV7K 3V9SA 3G25A 1K8KA 3OTOK 4CFCA 3E66A 5AJ3K 3ENHA 2ASOA 4JS5A 2VQEK 3VQPA 3CCRN 5J1EA 1VK0A 3AO2A 2UYTA 3BF3A 3FFKB 4BR7A 1XI1A 4PKGA 2ETJA 2ZE2A 4JKDA 3O6WA 5AQPA 3ZT3A 1BUPA 3KLFA 1XQSC 1HPZA 1Z25A 3P38A 4AHTA 5ADXH 2B6AA 1TL1A 2VG5A 4CZMA 1LW0A 5KGXA 1KC8O 4RCHA 3WXJA 3SCXA 3TAMA 3NGZA 5J2NA 4IJAA 1WB9A 2UXBK 4WF9L 4J2EA 1QQOA 3HO1A 4AHUA 1NNEA 2P5OA 1I3AA 4FPBA 2KFZA 5BR9A 3N4QA 4AHSA 1S72N 1RT7A 4NXNK 3K57A 1LAVA 4A59A 2YNGA 1EO1A 1QHTA 4XH4A 3OS0A 4PWDA 3BUZB 3E1YA 4F9OA 3DWLA 4ISFA 1VSHA 2HF3A 3C0BA 4OPJA 2YX6A 3HXMA 3KLGA 3BY5A 4B1ZA 3K9KA 5KTQA 3SAFA 1GLBG 4A2AA 4ILJA 5C24A 1NGGA 2FXUA 4DCHA 4FZYA 4KHWA 4C8LA 1XC3A 4XH1A 4BR2A 1YJWN 1EKEA 2HHTA 2DFHA 3FZLA 4B9MA 4FZZA 2F9WA 4MDBA 3MDQA 4JD2A 3CG7A 4E1JA 3B8AX 5BPNA 4OJRA 2P9IA 5EXWA 3AVJA 4B9TA 3ATUA 3QEPA 3TTCA 1J9AA 3U4LA 5EOYA 1SKRA 2F96A 4FJNA 4HUGA 4CEOA 3AVMA 4B9VA 3EKUA 4M7XA 1Q18A 2JGUA 3DXMB 3SUNA 1EETA 4NO7A 4YDUC 3O1WA 1N36K 2HHWA 1VQ5N 3GDQA 1SL0A 1L3VA 4FOEA 3C95A 3AVFA 3D6RA 4FWNA 3S41A 5E26A 4ILGB 4Z4FA 4MDAA 2E2QA 4FWPA 1C1CA 3VA3A 4OVLA 1MA9B 4IJNA 1GLLO 1R0AA 3QICA 4DU1A 4I6MA 4IFEA 2O8EA 3CJAA 1P90A 1J5OA 4NCAA 3TI0A 3D2EA 1D5AA 2HNDA 2Z1IA 3OYHA 5AQRA 4AM7A 1NWKA 4FWMA 4KHNA 2VCPA 3KLEA 3QEXA 5AQMA 2GBZA 4CEBA 4M45A 4C23A 1N6QA 5M1FA 2P9NB 2Q0UA 2AJQA 3LM9A 2YHBA 1XHXA 3OBYA 3HM8A 4E72A 1L5UA 2JWKA 3H3OB 5LMNK 4JKBA 2QWRA 3EZ5A 2IVNA 4BRAA 4FVMA 4LF4K 3V9WA 2NRVA 2P9LB 3NDKA 4OPAA 3DYAA 2P5GA 4BR4A 4EIAA 1WAFA 4YNQA 4LF6K 5AQTA 3ZT4A 1L3TA 3T1HK 1RILA 4DV5K 4RW7A 3G0ZA 3F9KA 4DFKA 1Q8IA 2A1SA 4N5SA 1RCHA 2JWLA 2G8VA 3ID8A 4E89A 1QSYA 4FJLA 1KQSM 1VQ6N 4JHDA 3SBTA 3M8QA 1KFDA 3I0RA 5CE3A 1S9EA 3V1QA 2QWNA 3CFOA 3T19A 3NFAA 4CK2A 4WE1A 3CCUN 3KKRA 1LCUA 3EE9A 3SV4A 3PY8A 3QEWA 1JCFA 4FLTA 5HRRA 3V9UA 4KV8A 4EFHA 3K9JA 4FLZA 4YOTA 4IDKA 3HSCA 4N56A 2W42A 3EE8A 3DLEA 2OPSA 3G71N 4B9NA 3VQBA 4JEPA 3R8EA 1IO2A 3L4IA 3RMBA 3Q7BA 4C8KA 1C0MA 2RN2A 1LV5A 1T03A 4DR5K 2XO7A 2G8KA 2XY7A 5AZJA 3H45C 2FC0A 4Q5VA 4JI7K 3H3NO 3DJCA 4DS5A 4FVUA 1W2BM 1YF5L 3B6PA 3AO5A 2O8FA 1RT4A 3D2FA 2V7ZA 5KQDA 4YOUA 4FYDA 4FJ8A 3CMAN 3IFRA 4EHTA 3O9SA 3S5TA 5FLXO 1S3XA 3LP2A 3LP1A 3IRXA 4KH5A 1ZBLA 3JAMO 3PX4A 1VSEA 4DQSA 4GVEA 4E7IA 2P51A 1UA0A 1NGBA 3OYDA 3A5LC 1JLFA 3DI6A 4CK1A 3UB5A 2E1ZA 2RF2A 1BQMA 5FRMA 2C1IA 3AGRA 3IKMA 4RTFD 4FSVA 5AFUA 3AVBA 1K8AO 1CLQA 3H08A 2VG6A 3OBWA 3RWUA 1DKGD 5HLFA 4K41A 2QM1A 3ZEUB 4BRIA 3SMSA 3SQ1A 2A41A 2ZJQL 1T8EA 1LWFA 3HSTB 3MN5A 1K8KB 3OYMA 3L2UA 1IV0A 4FK4A 4F2SA 5AQWA 4BWJA 4KB0A 4H0YB 3ZT2A 2HHSA 1KVAA 2D0PA 4N41A 4LF8K 1RTIA 4W5RA 1KAYA 1K73O 2CH6A 4WQ5C 2F4VK 1YITN 3V81A 3AV9A 3OY9A 4ELTA 3VF2A 1KD1O 3O8MA 2BE2A 5C15A 1REVA 1TKDA 4K0KK 5AQVA 3T7ZA 5C2DA 5CYQA 4FW1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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