3VF4A

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz s530a variant in complex with carbamoyl phosphate and adp
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
566
structure length
566
Chain Sequence
b'MRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERFTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTAFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
molecule tags Transferase
total genus 194
structure length 566
sequence length 566
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf4A01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf4A02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3vf4A03
4BQLA 3VESA 4O8KA 4CBUA 2D0PA 3FGUA 4FWRA 3CJBA 5KPTA 1QQMA 4B1VA 1KAYA 2E88A 2E2PA 3IFRA 1NGDA 2P9KB 1Z05A 1YVNA 3LL3A 2P9NB 3TTCA 2E8AA 4B1ZA 5LJWA 4K41A 3U9DA 3UKRA 1C0FA 3QBXA 1R59O 2FF3B 1U6ZA 5E84A 3C7NA 5AQFA 4FWKA 4WYBA 5AQKA 3TSQA 4BRPA 5FPNA 2VWBA 2YHXA 2VCPA 3CI5A 2E2NA 1K8KA 2FXUA 3O8MA 5F1XA 5BPNA 5LJVA 5AQNA 2YHYA 3D2EA 2HOEA 4J8FA 3J8AA 4B9QA 4IWVA 4A62A 2QWRA 3HSCA 4M63C 4PL8A 3QB0A 1DEJA 2W41A 5AR0A 1BUPA 3MMVA 3ENHA 2GTDA 2Q2RA 5AQJA 4EAHD 1HUXA 3GDQA 1YUWA 3FZFA 3FLCO 4IJNA 4H03B 3EL2A 4BRKA 4IXCA 4BRHA 4BRLA 1ZC6A 5I9EB 1JCEA 3H46O 3VGLA 5AQUA 5AQOA 2FLOA 1GLCG 1X9JA 2FSJA 3AARA 4PKGA 3CETA 5EXWA 2BUPA 4BRGA 1XC3A 3UB5A 4BGAA 1QZ6A 3H1VX 4CZFA 1U2VB 3C0BA 4CBXA 1X3NA 1WUAA 1QHAA 1MA9B 3BUZB 2A42A 5TKYA 1KAZA 1OKJA 4B1WB 2A6AA 4BR7A 3BF1A 4C23A 4CZGA 3W0LA 4QS7A 3ZEUB 1IG8A 1T6DA 2P9UA 2OANA 2FSNA 4CD3A 3MCPA 1NMDA 5AQHA 3A5LC 2IVOA 4BG9A 3BF3A 1Y64A 2HF4A 3B8AX 3TSUA 4XEIA 2P9LA 3C7NB 2I7NA 3O6WA 2P9PB 3WQUA 4RWTA 2AP1A 4BR9A 4CZIA 4EFHA 1C0GA 4FOEA 1K8KB 4JD2A 1KXPA 2QWOA 4HWIA 3TTFA 1ATRA 3VF6A 5CE3A 5AZJA 3TSPA 4IO8A 1GLFO 5AZIB 2AA4A 5AQIA 5BR9A 1NM1A 4IJAA 3CJ7A 3ULEB 3WQTA 1BDGA 1E4GT 1GLBG 3R9PA 3LDQA 2QXLA 3DXKB 3QBWA 4ISEA 1SAZA 4FWLA 1T44A 2PAVA 3DAWA 3IMXA 3TU5A 4MO4A 1TYQA 3CIPA 3VERA 3WT0A 5JLFA 1BOTO 4IZ9A 4XH4A 1J6ZA 2HF3A 3ZX3A 1NGFA 1H1VA 3O1BA 2E20A 3FZMA 3GE1A 1NGCA 2ZGZA 1Q18A 2NLXA 4FWQA 2A3ZA 3BP8A 4BQZA 3ZETA 3GOIA 4Z94A 3RSEA 2VYPA 3ZX0A 3M3ZA 4FWMA 1DGKN 3DXMA 4EHUA 3ID8A 2P9SA 3VEVA 4RTFD 2Q0UA 2D4WA 2QM1A 3A5OC 3VETA 5F0XA 2P9UB 2NRHA 4O5FA 2D0OA 4WQ4C 1NGIA 1QQNA 4QS9A 2P9IA 1ATSA 4CZLA 3HZ6A 3SLCA 4H5NA 4DCHA 3FZKA 3VGMA 4DHYA 1TUUA 2P9LB 4BR5A 1S3XA 5ELZA 4H0TB 4B1YB 3HM8A 2GEMA 1P8ZA 3BEXA 2IIRA 4FWNA 3D2FA 4CJ7A 4BVPA 4PKHA 2HMPA 2YJFA 1YAGA 3DJCA 5AQWA 4K43A 4B1UB 4EHTA 4BREA 5AZJB 2A40A 3ATUA 1S22A 1ESVA 5AQZA 1JCGA 3SJHA 3HBTA 3QDKA 4BRQA 1YXQA 5AQMA 3U4LA 3LDLA 5AQQA 4BC5A 2F9WA 3UKUA 5JICA 4QS8A 1KAXA 1V4SA 3R8EA 3VEWA 2E2QA 3EKSA 1HKCA 4BRDA 1NGAA 3MN9A 2NZTA 4H5VA 3QFUA 4JAXA 4AM7A 1TUYA 1D4XA 2E1YA 2ZF5O 3WXJA 1XQSC 5KPZA 3H3NO 5BRHA 4WQ4A 3QFPA 2QWQA 2IVNA 3MN6A 2A5XA 3CJCA 5KPRA 5FPDA 4WQ5C 2YCHA 4AM6A 4BR0A 2PBDA 3KHYA 3FZLA 3TPQA 4YDUC 3ZETB 4CBWA 3FFKB 3RSEB 3UE5A 4CD1A 4CZEA 3UKRB 3DXMB 5BRDA 1RFQA 2P9KA 3KZBA 4KBOA 2DPNA 2P9NA 3AAPA 3LDNA 3F9MA 3O1WA 3M1FA 3D7EO 4K42A 2ASMA 4BGBA 1LOTB 3CERA 4A2BA 2QWPA 1MWMA 5BREA 4JNEA 3O80A 3VF2A 4FPBA 3D2EB 3WXLA 3H45C 2KHOA 3TTDA 4FWSA 3VTHA 3SMSA 5JMVA 3CJAA 4BR4A 4PKIA 3D2FB 3SK3A 5AFUH 3QMLA 4A2AA 3VGKA 4BRMA 4FOIA 4BRNA 5ADXH 2V7YA 5EX5A 4I6MA 1ZBSA 4DQ8A 3O5BA 2W40A 2IVPA 3IDHA 3W3DA 4CZJA 4WQ5A 5AQSA 4EIAA 2ZWHA 3S41A 2CH6A 4GY2B 4A61A 2Q31A 3A0IX 3UKUB 3ATVA 3LDOA 1QZ5A 2FSKA 3CQXA 3O4WA 4JN4A 4YDUA 2Q36A 5AQYA 1BA1A 3A5MC 3U8XA 3ENOA 3ZX2A 2E2OA 1HKBA 3L4IA 3IUCA 2V7ZA 4BROA 1ZXOA 3WUHA 1MDUB 1HLUA 4BR2A 4BG8A 2QWLA 3MK6A 4H5WA 3H1QA 3WEEA 3O08A 2Q97A 3P4IA 5BN9A 3CQYA 1U2VA 3R6MA 4FPAA 1MWKA 3LM2A 1GLLO 1RDWX 1CZAN 1JCFA 1SQKA 4DB3A 3FR0A 1SZ2A 2Q1NA 4ISGA 3OHRA 5EVZA 4FSVA 4M7XA 4BRCA 4JHDA 4PL7A 2ASPA 4XH1A 3WXIA 3ZEUA 5LY3A 4BVOA 3SMPA 3EN9A 1NGEA 4FO0A 5EY4A 5B8HA 3JS6A 3HTVA 3MN5A 2CGLA 4BRAA 3EKUA 5AQXA 2A41A 2D1KA 2GUPA 3QICA 4JD2B 4MLHA 1HPMA 2YJEA 5AQPA 5BRFA 2P9PA 2CGKA 1NGHA 2CH5A 3EZWA 1BWFO 2QWMA 5AQGA 2QW9A 4BRFA 4XH5A 3MDQA 5KQ8A 1G99A 3KVGA 2BTFA 3A8YA 3CHWA 1EQYA 2EWSA 1E4FT 4BC3A 1NBWA 4BC2A 3I33A 3VEXA 1GLEG 1GLJO 4I6MB 3VEZA 5AZIA 2ITMA 5AQTA 3H3OB 2GWJA 1WOQA 4E1JA 2F9TA 4RCHA 4ISFA 2YI1A 1TYQB 4H0XB 4H5RA 4B1XB 3VENA 4H0VB 1QQOA 3DXKA 2ZGYA 5AQLA 3H6EA 5BN8A 2J4RA 4FL9A 3VEYA 1BG3A 4MLEA 3A5NC 1BA0A 3G25A 3LDPA 1HKGA 4L3QA 3L0QA 5FPMA 3AAQA 1GLAG 5BPLA 1IJJA 3VPZA 4Y0WA 3ULEA 2CGJA 4BC4A 3WEEB 2Q0RA 2E1ZA 1XUPO 2I7PA 3HI0A 1T6CA 4H0OA 5E26A 5BPMA 5AQRA 2P9SB 1X3MA 4BRIA 5JLHA 4CZHA 2V52B 3MN7A 3EO3A 3LM9A 3I8BA 2V51B 1HJOA 2P9IB 4JHDB 4K25A 1BO5O 4CI6A 4H0PA 1NWKA 3VOVA 1BU6O 2YHWA 1LCUA 3JXUA 4NB4A 2WUSA 5F2RA 4H0YB 3CJ9A 4FWOA 3GG4A 3L6QA 4LC9B 5AQVA 2FF6A 1Z6RA 5FPEA 4HTLA 3VF4A 3U9ZA 2GELA 1NGBA 1V4TA 5AFUA 3FE1A 4GNIA 4H5TA 3VEOA 5ADXA 2H3GX 4MO5A 2GWKA 4NO7A 2UYTA 3DWLA 3GL1A 2ASOA 1NLVA 1DKGD 3GBTA 4M7YA 1NGGA 2QWNA 1ATNA 1GLDG 1RGIA 5EOYA 5KQDA 3AY9A 4F9OA 1NGJA 1HX1A 4CZKA 3FZHA 3M6GA 3WXKA 4CZMA 3CJ1A 4FWPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CBUA 3FGUA 4FWRA 4AHSA 3CJBA 5KPTA 4FJ5A 1X9SA 2E2PA 3QEVA 4LF7K 1C0MA 1YVNA 2G8IA 5LJWA 1C0FA 3OYIA 5E84A 1Q81O 3C7NA 3E66A 3VA3A 3I8DA 4GVMA 2VG7A 3L7VA 1W97L 5FPNA 3KWIA 2YHXA 2UUBK 1IV0A 1NG9A 3CM5A 2E2NA 4CJSA 2FXUA 3O8MA 4M3RA 4CJWA 3MCAB 5CZ1A 5F1XA 5LJVA 5AQNA 1RBSA 2YHYA 1NK8A 3M8SA 3O3HA 1U04A 4B9QA 1DTQA 4QOZB 3HSCA 3OYBA 1DEJA 4KHWA 1KRPA 4DFJA 4B9UA 2GTDA 4GVEA 2F7TA 2RISA 1ASVA 4LD0A 5DK5A 3T3FA 4P8JA 4BRKA 3P5JA 1J54A 3H46O 3CYMA 3O9TA 1YF5L 4K0KK 5AQOA 1N8RO 1GLCG 3RRHA 3AARA 2AJQA 1PVWA 1S9EA 4DU4A 1XC3A 4FJGA 1QZ6A 5D3GA 4CZFA 3C0BA 3L3VA 4R79A 4IFVA 4RW6A 4I2QA 1LAVA 4ILHA 1WSFA 4CHQA 1XMOK 1M1KO 4F2RA 4OPAA 1WSHA 3L3UA 3PX0A 1KAZA 2A6AA 2BE2A 2IDOA 2NUBA 5J2NA 3WXMB 4DTNA 2UXDK 4CD3A 3PUFA 1J5EK 3Q7CA 5I42A 2F8TA 2HF4A 4XEIA 3C7NB 4EZ9A 4B9LA 2P9PB 4HUFA 1JCUA 1C0GA 4HUEA 1QSSA 4OLAA 2O8DA 4ZTJA 2QWOA 1Q82O 3LZIA 4ILGB 2O8EA 4DFMA 1YITN 2XHBA 4JI4K 2XRIA 4DUZK 4N41A 3K58A 5CHIA 4KAZA 4BWMA 2F4VK 3CJ7A 4BDZA 3WQTA 2RKIA 2QXLA 3LAMA 4CJFA 4OPKA 3VQDA 4M3ZA 1TYQA 3O4QA 4DSEA 1BOTO 4I9LA 4OVLA 2HF3A 3I0SA 1YI2N 3L2UA 1K7JA 1UAXA 1EKEA 4X65K 3FFIA 1TK0A 3FZMA 5C25A 2ZJRL 2O8BA 5SWMA 4ILJA 4ID5A 4FWQA 4BQZA 1HYZA 4Q5VA 4WFNL 1KTQA 1DGKN 3PSFA 2HHQA 1QSYA 4AH9A 4CEZA 2NRHA 4F2SA 5C10A 3E9OA 4FZYA 1NGIA 1UWBA 1ATSA 2GBZA 4CF1A 4AILC 3HZ6A 4DU3A 5KGWA 4CCHA 3B6OA 3QETA 4DSLA 4FLWA 3VGMA 2E6MA 1C1AA 2VGMA 4DTPA 4H0TB 4B1YB 3AJEA 4CK1A 1L3SA 4PKHA 2G8VA 3DJCA 3PV8A 4K43A 3K57A 5M1OA 3C95A 2A40A 1C0TA 5AQZA 4ZTFA 4JI6K 4I9QA 4B3RK 1YXQA 3ZT2A 4ELTA 2WBNA 4CFBA 4Y1DA 3ULDA 4DR4K 2F9WA 4C8NA 5JICA 1V4SA 4JK7A 1BQNA 1VSHA 5FROA 3VEWA 1VQ8N 1JLBA 1HKCA 1NGAA 3MN9A 4QCLA 4JAXA 3MXMA 1TUYA 1EETA 1D4XA 4U7BA 4OJRA 1SL1A 5M1QA 3HPHA 4B9SA 2A5XA 3EE9A 3SAGA 4IEIA 4WQ5C 1KVBA 4BR0A 3JAMO 3LDSA 3S3OA 1RDUA 1YHQN 1SKRA 3THYB 3FZLA 3TPQA 3ZT1A 5CYQA 3FFKB 4FJXA 4CZEA 2G8WA 1S1VA 5CYMA 2P9KA 2W6LA 4KBOA 1Q7YO 4P6PA 1A5XA 4YOYA 1NK9A 4JYAK 3P83D 2P9NA 5C0YA 3V81A 3NH0A 3SYZA 1BHLA 3V9WA 3D7EO 4K42A 2ASMA 3AVMA 4M3TA 3THVA 5TKWA 2QWPA 1IEZA 1L5UA 2FBTA 3BZCA 1WBBA 4KHSA 3H45C 1HQEA 3O9SA 3BZKA 3VTHA 4YOUA 3CJAA 3MEDA 4LH4A 2Z1JA 3ID6A 3QMLA 4DTXA 5J2QA 1RT1A 5ADXH 4FLXA 3AA2A 4B9VA 5FDLA 5HRRA 1VAZA 4W5NA 1U4BA 2G8UA 4A5BA 4GY2B 1RBRA 4CF8A 3ATVA 5M1PA 2PYJA 1LWFA 5C15A 2YHAA 1BA1A 1VQ4N 3A5MC 3DLHA 2F8SA 3ENOA 5J2MA 3SUQA 1ZXOA 5HBMA 3WUHA 5M1KA 2FBVA 1OH8A 3SUPA 2QEXN 3O3GA 3NVKA 4BR2A 4KHPK 1I94K 3WEEA 3P4IA 3O9QA 3CQYA 3R6MA 3G10A 1HNZK 1GLLO 2HNYA 2P1JA 1KSPA 3NGYA 4DTOA 1N36K 2Q1NA 5KI6A 2DFHA 3QEWA 5C2DA 1IBLK 4IEEA 1ZYQA 4PL7A 4XH1A 3PO4A 1QVFM 2KLAA 4FO0A 5B8HA 1UA0A 3V1OA 2FBYA 3JS6A 3TAEA 1FKPA 4CHYA 3T1AA 1RTIA 5KRSA 3RMBA 2YJEA 2CGKA 4DTJA 2CH5A 1VSMA 3F2KA 3AO1A 5KQ8A 2G8KA 1BL3A 3T1YK 4FJJA 3SQ4A 2IGIA 1NKBA 3A8YA 3CHWA 2EWSA 1CXUA 4OGEA 4IDKA 3TANA 4FYDA 1DLOA 4LFBK 3VEZA 3C65A 2ITMA 3M8PA 2GWJA 5GADP 5BR8K 2F9TA 2HB5A 4DV2K 1NJZA 3LWLA 4H0XB 4B1XB 1NOZA 1VSKA 3AO2A 4XIUA 2ITGA 5K14A 3DYAA 3DXKA 4KO0A 1LWEA 3OYEA 2ZGYA 4UY8O 3H6EA 4MLEA 3CCLN 4DR7K 4ELVA 1EX4A 5FPMA 1S5JA 4B8AB 3E9PA 3RRGA 3ULEA 3WEEB 3V9UA 3ZLJA 4Z4GA 4CF2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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